View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1477_low_7 (Length: 398)

Name: NF1477_low_7
Description: NF1477
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1477_low_7
NF1477_low_7
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (13-366)||(16735242-16735595)
chr3 (187-366)||(40272814-40272994)
chr3 (201-366)||(26869696-26869861)
chr3 (186-366)||(22609741-22609920)
chr3 (187-366)||(1217065-1217243)
chr3 (187-366)||(13628792-13628975)
chr3 (187-366)||(39203491-39203669)
chr3 (188-366)||(13730604-13730785)
chr3 (189-366)||(29366722-29366902)
chr3 (188-366)||(46421036-46421218)
chr3 (187-366)||(8247688-8247871)
chr3 (192-366)||(22122919-22123092)
chr3 (188-366)||(52926221-52926391)
chr3 (188-357)||(6411833-6412002)
chr3 (188-366)||(12914037-12914216)
chr3 (186-366)||(5173721-5173904)
chr3 (186-366)||(7696894-7697068)
chr3 (187-366)||(26573103-26573282)
chr3 (188-295)||(10870025-10870132)
chr3 (188-366)||(4495678-4495845)
chr3 (241-366)||(31592878-31593002)
chr3 (197-355)||(34420656-34420815)
chr3 (187-348)||(9607178-9607342)
chr3 (252-366)||(54484730-54484846)
chr3 (220-366)||(516417-516567)
chr3 (189-366)||(25517172-25517353)
chr3 (215-364)||(7942993-7943143)
chr3 (240-366)||(10795425-10795554)
chr3 (187-315)||(45620881-45621010)
chr3 (197-358)||(45948848-45949012)
chr3 (197-366)||(53996567-53996737)
chr3 (261-366)||(15797271-15797375)
chr3 (275-366)||(34771366-34771457)
chr3 (244-366)||(14986989-14987114)
chr3 (223-348)||(33926094-33926220)
chr3 (197-366)||(25944455-25944625)
chr3 (214-349)||(30928166-30928302)
chr3 (258-366)||(45786216-45786327)
chr3 (274-366)||(353351-353445)
chr3 (223-366)||(54032573-54032705)
chr3 (257-366)||(49013475-49013587)
chr3 (258-337)||(47624088-47624167)
chr3 (210-364)||(19731000-19731155)
chr3 (223-366)||(45139480-45139624)
chr3 (227-348)||(54374365-54374488)
chr3 (187-293)||(12525385-12525489)
chr3 (186-366)||(33235504-33235686)
chr3 (274-348)||(9276327-9276400)
chr3 (199-358)||(829452-829611)
chr3 (218-349)||(8410886-8411016)
chr3 (245-354)||(43114882-43114994)
chr3 (244-364)||(55401208-55401330)
chr3 (191-303)||(21874999-21875106)
chr3 (197-364)||(44403559-44403727)
chr3 (306-366)||(24851303-24851363)
chr3 (210-364)||(19751576-19751731)
chr3 (308-366)||(30452892-30452950)
chr3 (313-366)||(10484618-10484671)
chr3 (250-366)||(50624955-50625072)
chr3 (210-267)||(53062036-53062093)
chr3 (262-362)||(26292382-26292481)
chr3 (323-366)||(47624211-47624254)
chr3 (197-271)||(35417902-35417975)
chr3 (274-366)||(31904858-31904951)
chr3 (214-302)||(39211992-39212081)
chr3 (187-227)||(9276249-9276289)
chr3 (191-271)||(26782345-26782425)
chr3 (238-359)||(52428479-52428609)
chr3 (210-366)||(28904941-28905098)
chr3 (327-366)||(40390357-40390396)
chr3 (191-228)||(23871418-23871455)
chr3 (327-366)||(14266374-14266413)
chr3 (257-366)||(31831244-31831341)
chr3 (329-366)||(23871484-23871521)
chr3 (293-366)||(24577917-24577990)
chr3 (293-366)||(24578007-24578080)
chr3 (325-366)||(43956474-43956515)
chr3 (188-232)||(39430465-39430509)
[»] chr4 (100 HSPs)
chr4 (187-366)||(5648212-5648391)
chr4 (186-366)||(6430628-6430808)
chr4 (186-366)||(20224936-20225115)
chr4 (187-366)||(48598827-48599005)
chr4 (187-366)||(30639333-30639512)
chr4 (187-366)||(5306662-5306845)
chr4 (188-366)||(47528532-47528709)
chr4 (207-366)||(40915802-40915961)
chr4 (188-366)||(11054150-11054327)
chr4 (195-366)||(16408603-16408777)
chr4 (191-366)||(16911519-16911697)
chr4 (188-366)||(23501747-23501922)
chr4 (188-365)||(21646918-21647098)
chr4 (226-366)||(29207900-29208039)
chr4 (188-354)||(37494805-37494972)
chr4 (207-366)||(44363132-44363294)
chr4 (214-366)||(54175043-54175198)
chr4 (188-366)||(55766468-55766647)
chr4 (212-366)||(9832315-9832468)
chr4 (199-366)||(8473622-8473790)
chr4 (187-317)||(14590790-14590922)
chr4 (191-366)||(14983791-14983967)
chr4 (193-366)||(30352582-30352767)
chr4 (188-366)||(13256401-13256578)
chr4 (210-366)||(35567146-35567303)
chr4 (215-364)||(39077800-39077948)
chr4 (186-357)||(54730201-54730376)
chr4 (214-348)||(17043414-17043549)
chr4 (238-366)||(47443961-47444090)
chr4 (188-366)||(55830723-55830902)
chr4 (209-358)||(19027823-19027973)
chr4 (251-366)||(20639660-20639777)
chr4 (188-366)||(20405047-20405222)
chr4 (212-366)||(30690178-30690340)
chr4 (220-349)||(25463108-25463238)
chr4 (212-366)||(32478794-32478942)
chr4 (191-292)||(17315375-17315476)
chr4 (189-365)||(54966977-54967151)
chr4 (188-365)||(10660358-10660538)
chr4 (188-365)||(10874503-10874683)
chr4 (34-142)||(40403899-40404007)
chr4 (199-358)||(47441540-47441699)
chr4 (252-366)||(7909282-7909397)
chr4 (198-357)||(30496333-30496491)
chr4 (219-344)||(32629293-32629418)
chr4 (274-366)||(25629090-25629182)
chr4 (217-355)||(41018807-41018945)
chr4 (257-347)||(49796821-49796911)
chr4 (217-345)||(7385499-7385628)
chr4 (258-358)||(51865048-51865149)
chr4 (278-366)||(20225119-20225209)
chr4 (200-348)||(49938613-49938759)
chr4 (246-363)||(21489099-21489218)
chr4 (238-366)||(10277759-10277886)
chr4 (210-348)||(39029080-39029220)
chr4 (188-355)||(20908649-20908818)
chr4 (197-365)||(36589708-36589876)
chr4 (199-293)||(42164224-42164317)
chr4 (197-359)||(487135-487306)
chr4 (306-366)||(11394925-11394985)
chr4 (306-366)||(11404652-11404712)
chr4 (306-366)||(38755910-38755970)
chr4 (246-364)||(9987838-9987957)
chr4 (197-348)||(30581485-30581638)
chr4 (211-349)||(3580859-3580994)
chr4 (297-366)||(38786673-38786742)
chr4 (306-366)||(33836489-33836549)
chr4 (198-304)||(25343152-25343258)
chr4 (307-366)||(32484307-32484366)
chr4 (307-366)||(40553939-40553998)
chr4 (222-366)||(7038041-7038185)
chr4 (191-264)||(5313099-5313172)
chr4 (274-366)||(36816386-36816479)
chr4 (306-366)||(25388249-25388309)
chr4 (306-354)||(47482864-47482912)
chr4 (29-75)||(26736016-26736062)
chr4 (191-231)||(18969698-18969738)
chr4 (212-366)||(23580210-23580365)
chr4 (318-366)||(35532077-35532125)
chr4 (210-292)||(43035224-43035307)
chr4 (307-366)||(44718641-44718700)
chr4 (197-299)||(49938508-49938610)
chr4 (197-271)||(54640437-54640510)
chr4 (269-366)||(12711451-12711548)
chr4 (189-265)||(20373898-20373974)
chr4 (306-366)||(50555658-50555718)
chr4 (275-349)||(9037772-9037847)
chr4 (311-366)||(12666859-12666914)
chr4 (275-359)||(16494259-16494345)
chr4 (197-271)||(12257691-12257764)
chr4 (277-366)||(2813169-2813261)
chr4 (187-232)||(29879634-29879679)
chr4 (197-304)||(51420537-51420645)
chr4 (197-261)||(50856344-50856407)
chr4 (274-366)||(48327765-48327859)
chr4 (308-366)||(19027986-19028044)
chr4 (306-364)||(28494224-28494282)
chr4 (317-366)||(56322984-56323033)
chr4 (306-354)||(8820581-8820629)
chr4 (274-337)||(35894492-35894556)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (187-366)||(13160655-13160834)
chr8 (186-366)||(28817628-28817809)
chr8 (188-366)||(12670252-12670429)
chr8 (185-366)||(30454099-30454279)
chr8 (186-366)||(36720748-36720929)
chr8 (188-366)||(45071219-45071397)
chr8 (188-366)||(35261633-35261812)
chr8 (187-366)||(39460996-39461178)
chr8 (188-363)||(29521690-29521866)
chr8 (188-362)||(44530103-44530278)
chr8 (183-364)||(18164764-18164945)
chr8 (188-366)||(7136529-7136710)
chr8 (192-362)||(20284075-20284250)
chr8 (186-366)||(17823528-17823709)
chr8 (192-362)||(21070703-21070879)
chr8 (187-366)||(2626472-2626655)
chr8 (187-366)||(6760776-6760957)
chr8 (188-345)||(20869523-20869677)
chr8 (203-366)||(12625858-12626023)
chr8 (188-366)||(26954086-26954268)
chr8 (193-366)||(8897766-8897940)
chr8 (197-366)||(28407379-28407536)
chr8 (187-366)||(25250475-25250657)
chr8 (211-349)||(24365078-24365218)
chr8 (240-366)||(5135292-5135418)
chr8 (197-355)||(44781517-44781677)
chr8 (216-366)||(31457155-31457305)
chr8 (274-366)||(29877135-29877227)
chr8 (197-359)||(8483947-8484109)
chr8 (188-348)||(24245405-24245564)
chr8 (238-358)||(389647-389770)
chr8 (269-366)||(10857865-10857962)
chr8 (274-366)||(20869964-20870058)
chr8 (210-356)||(22598133-22598279)
chr8 (189-365)||(44742521-44742698)
chr8 (243-363)||(5689640-5689761)
chr8 (275-366)||(19729382-19729473)
chr8 (220-366)||(23000230-23000365)
chr8 (197-354)||(42083712-42083870)
chr8 (189-300)||(11748254-11748366)
chr8 (294-366)||(26102578-26102650)
chr8 (213-331)||(35105902-35106022)
chr8 (274-362)||(16225060-16225150)
chr8 (280-361)||(26457776-26457855)
chr8 (197-347)||(14017989-14018140)
chr8 (245-365)||(17250879-17251001)
chr8 (210-347)||(11000970-11001109)
chr8 (308-362)||(27507985-27508039)
chr8 (187-231)||(23286431-23286475)
chr8 (306-366)||(35107313-35107373)
chr8 (187-366)||(40604908-40605087)
chr8 (323-366)||(27468094-27468137)
chr8 (260-318)||(23286375-23286432)
chr8 (197-271)||(30962871-30962944)
chr8 (306-362)||(16013529-16013585)
chr8 (307-366)||(36486568-36486627)
chr8 (312-366)||(40444845-40444899)
chr8 (274-321)||(43942365-43942414)
chr8 (188-225)||(42840863-42840900)
chr8 (313-364)||(18595918-18595969)
chr8 (189-263)||(27634983-27635058)
chr8 (324-366)||(30962773-30962815)
chr8 (198-226)||(5688801-5688829)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (187-366)||(38879534-38879716)
chr5 (187-366)||(41014272-41014451)
chr5 (188-366)||(24448844-24449023)
chr5 (188-366)||(8169986-8170163)
chr5 (191-366)||(43334159-43334337)
chr5 (188-366)||(35710267-35710444)
chr5 (191-366)||(4619106-4619284)
chr5 (221-366)||(32703411-32703555)
chr5 (188-366)||(1565385-1565564)
chr5 (189-354)||(2838733-2838899)
chr5 (191-348)||(27328709-27328869)
chr5 (186-298)||(37024626-37024737)
chr5 (186-348)||(22600406-22600569)
chr5 (197-355)||(19142956-19143113)
chr5 (16-143)||(39225847-39225980)
chr5 (249-365)||(7368413-7368528)
chr5 (238-359)||(43574610-43574732)
chr5 (197-359)||(208936-209098)
chr5 (243-366)||(13801769-13801895)
chr5 (191-366)||(22861671-22861844)
chr5 (194-364)||(30006285-30006456)
chr5 (258-356)||(7097772-7097870)
chr5 (199-366)||(12006330-12006500)
chr5 (218-358)||(1850624-1850764)
chr5 (274-366)||(16880649-16880741)
chr5 (186-293)||(23974733-23974840)
chr5 (279-366)||(34154816-34154903)
chr5 (293-366)||(16957374-16957447)
chr5 (185-304)||(22187236-22187356)
chr5 (197-359)||(39301087-39301249)
chr5 (217-366)||(1405170-1405320)
chr5 (210-366)||(28516435-28516593)
chr5 (193-302)||(31299591-31299700)
chr5 (211-366)||(3771318-3771472)
chr5 (43-142)||(4979313-4979412)
chr5 (257-366)||(29334418-29334529)
chr5 (252-366)||(12575662-12575779)
chr5 (257-366)||(20135627-20135739)
chr5 (219-320)||(22907913-22908014)
chr5 (257-366)||(5873324-5873433)
chr5 (306-366)||(25622533-25622593)
chr5 (306-365)||(21784335-21784394)
chr5 (289-359)||(13774921-13774991)
chr5 (212-349)||(24323724-24323862)
chr5 (212-349)||(24360348-24360486)
chr5 (210-359)||(24903705-24903855)
chr5 (309-366)||(16028626-16028683)
chr5 (214-346)||(34074584-34074717)
chr5 (188-232)||(19438703-19438747)
chr5 (308-364)||(39801591-39801647)
chr5 (197-303)||(10634211-10634317)
chr5 (238-340)||(41425952-41426055)
chr5 (306-348)||(10306494-10306536)
chr5 (284-356)||(12477132-12477205)
chr5 (309-366)||(30877566-30877623)
chr5 (317-366)||(32354211-32354260)
chr5 (197-253)||(39079882-39079937)
chr5 (311-366)||(29184063-29184118)
chr5 (187-226)||(41956885-41956924)
chr5 (226-358)||(42924840-42924977)
chr5 (199-264)||(17419879-17419944)
chr5 (283-366)||(11657701-11657785)
chr5 (306-346)||(21542489-21542529)
chr5 (275-358)||(9794388-9794471)
chr5 (229-291)||(22025538-22025601)
chr5 (283-355)||(3176770-3176839)
chr5 (312-366)||(10943847-10943900)
chr5 (274-356)||(31694120-31694202)
chr5 (293-354)||(18426099-18426160)
chr5 (326-363)||(18684366-18684403)
chr5 (209-250)||(31362454-31362495)
chr5 (209-300)||(18698586-18698675)
chr5 (314-366)||(19093894-19093946)
chr5 (293-364)||(39079755-39079827)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (188-366)||(8455318-8455497)
chr2 (186-366)||(14530270-14530453)
chr2 (188-366)||(9671134-9671312)
chr2 (187-366)||(21779263-21779441)
chr2 (186-366)||(25079719-25079901)
chr2 (189-366)||(10543653-10543833)
chr2 (191-366)||(25249740-25249915)
chr2 (188-358)||(12023929-12024099)
chr2 (187-366)||(23397719-23397897)
chr2 (190-366)||(11514392-11514568)
chr2 (189-366)||(24200625-24200805)
chr2 (187-337)||(22371010-22371158)
chr2 (225-366)||(10546153-10546296)
chr2 (190-366)||(17896215-17896393)
chr2 (225-366)||(14444720-14444861)
chr2 (200-366)||(39914308-39914475)
chr2 (205-366)||(17623535-17623697)
chr2 (205-366)||(17667973-17668135)
chr2 (188-366)||(5840982-5841163)
chr2 (194-366)||(27573581-27573753)
chr2 (197-348)||(99285-99434)
chr2 (198-364)||(24859992-24860157)
chr2 (190-356)||(19977726-19977893)
chr2 (250-366)||(36871509-36871624)
chr2 (197-366)||(44643486-44643656)
chr2 (189-366)||(14544018-14544199)
chr2 (209-366)||(40416873-40417031)
chr2 (188-364)||(7214488-7214667)
chr2 (197-365)||(4516354-4516522)
chr2 (210-366)||(21377076-21377232)
chr2 (188-358)||(26684630-26684803)
chr2 (188-304)||(17705449-17705566)
chr2 (189-349)||(32781307-32781467)
chr2 (219-358)||(25641487-25641626)
chr2 (212-331)||(5450263-5450384)
chr2 (197-359)||(17380247-17380407)
chr2 (210-349)||(33795261-33795401)
chr2 (257-366)||(40762236-40762346)
chr2 (212-348)||(31158459-31158598)
chr2 (223-356)||(19614981-19615116)
chr2 (274-366)||(25632550-25632642)
chr2 (274-355)||(24890452-24890533)
chr2 (211-365)||(45235820-45235976)
chr2 (210-330)||(23145736-23145857)
chr2 (210-330)||(23557526-23557647)
chr2 (219-348)||(31821363-31821491)
chr2 (206-287)||(44604826-44604907)
chr2 (185-233)||(39189557-39189605)
chr2 (257-356)||(30826060-30826158)
chr2 (307-366)||(40579751-40579810)
chr2 (243-366)||(15296408-15296533)
chr2 (306-363)||(23488556-23488613)
chr2 (267-356)||(39499242-39499331)
chr2 (282-366)||(13245097-13245181)
chr2 (307-366)||(41409936-41409995)
chr2 (223-344)||(44449407-44449529)
chr2 (308-366)||(34080176-34080234)
chr2 (308-366)||(34766330-34766388)
chr2 (257-358)||(30864427-30864528)
chr2 (238-358)||(17471552-17471675)
chr2 (228-312)||(2003592-2003678)
chr2 (323-366)||(22371202-22371245)
chr2 (210-304)||(29419949-29420048)
chr2 (323-364)||(124918-124959)
chr2 (313-366)||(8575975-8576028)
chr2 (188-233)||(27466266-27466311)
chr2 (197-348)||(44521393-44521544)
chr2 (297-348)||(24059016-24059067)
chr2 (298-365)||(31525771-31525838)
chr2 (197-355)||(35017781-35017942)
chr2 (314-366)||(3633710-3633762)
chr2 (211-366)||(4795730-4795888)
chr2 (238-321)||(12315699-12315782)
chr2 (189-271)||(17472926-17473008)
chr2 (306-348)||(19185763-19185805)
chr2 (306-366)||(1289095-1289156)
chr2 (192-271)||(4852312-4852388)
chr2 (193-242)||(39499341-39499390)
chr2 (326-366)||(23052967-23053007)
[»] chr1 (94 HSPs)
chr1 (187-366)||(34725100-34725278)
chr1 (188-365)||(46991781-46991959)
chr1 (188-366)||(46247955-46248134)
chr1 (188-366)||(32632559-32632737)
chr1 (188-366)||(38478284-38478461)
chr1 (188-366)||(18944620-18944802)
chr1 (187-366)||(27474257-27474436)
chr1 (187-366)||(14617014-14617194)
chr1 (194-366)||(30395728-30395903)
chr1 (188-366)||(20004092-20004273)
chr1 (191-363)||(23768325-23768498)
chr1 (193-365)||(45402077-45402251)
chr1 (188-356)||(47214488-47214655)
chr1 (188-366)||(10668197-10668383)
chr1 (207-364)||(6925096-6925254)
chr1 (192-366)||(19414420-19414593)
chr1 (188-364)||(45812541-45812716)
chr1 (187-366)||(27201623-27201805)
chr1 (197-366)||(6983813-6983980)
chr1 (198-349)||(11596501-11596651)
chr1 (185-366)||(41319808-41319990)
chr1 (225-366)||(35253189-35253329)
chr1 (194-366)||(12126839-12127010)
chr1 (188-333)||(22930104-22930248)
chr1 (187-366)||(8197019-8197199)
chr1 (198-349)||(18724564-18724715)
chr1 (193-366)||(18741959-18742137)
chr1 (197-358)||(2435796-2435958)
chr1 (274-366)||(4349702-4349794)
chr1 (187-366)||(19932755-19932934)
chr1 (194-366)||(9939443-9939620)
chr1 (227-366)||(35005139-35005281)
chr1 (210-359)||(35117774-35117927)
chr1 (187-359)||(44485119-44485290)
chr1 (211-346)||(25468285-25468421)
chr1 (252-366)||(31382216-31382330)
chr1 (198-359)||(20036208-20036369)
chr1 (198-319)||(33222971-33223093)
chr1 (197-356)||(19701557-19701717)
chr1 (197-366)||(50811926-50812096)
chr1 (197-365)||(10378738-10378896)
chr1 (197-364)||(35019217-35019383)
chr1 (245-361)||(31442396-31442515)
chr1 (188-314)||(4430080-4430207)
chr1 (197-354)||(17470361-17470517)
chr1 (197-366)||(15511150-15511322)
chr1 (186-263)||(34714598-34714675)
chr1 (274-366)||(1517313-1517405)
chr1 (197-364)||(22327086-22327250)
chr1 (278-349)||(15505632-15505703)
chr1 (243-367)||(22324925-22325050)
chr1 (274-366)||(42304209-42304303)
chr1 (197-359)||(23371111-23371271)
chr1 (276-366)||(43768205-43768295)
chr1 (190-255)||(40424721-40424786)
chr1 (257-366)||(23796511-23796621)
chr1 (191-289)||(25290143-25290244)
chr1 (221-366)||(31272383-31272522)
chr1 (197-365)||(52910204-52910379)
chr1 (274-366)||(20999852-20999944)
chr1 (306-366)||(50606499-50606559)
chr1 (197-304)||(50760290-50760397)
chr1 (192-348)||(18335308-18335465)
chr1 (222-366)||(19974076-19974221)
chr1 (257-338)||(21723730-21723811)
chr1 (245-356)||(45264411-45264524)
chr1 (199-367)||(34679216-34679388)
chr1 (189-311)||(24564322-24564445)
chr1 (242-349)||(30682845-30682951)
chr1 (301-363)||(4587568-4587630)
chr1 (269-345)||(20982773-20982849)
chr1 (211-365)||(39214961-39215117)
chr1 (274-345)||(21910673-21910743)
chr1 (202-269)||(22151495-22151562)
chr1 (197-346)||(27136673-27136823)
chr1 (197-267)||(2435995-2436064)
chr1 (287-353)||(4430014-4430080)
chr1 (189-271)||(21723642-21723723)
chr1 (306-359)||(30555211-30555264)
chr1 (274-348)||(6358185-6358260)
chr1 (308-355)||(33594144-33594191)
chr1 (291-348)||(4249463-4249520)
chr1 (291-348)||(4249787-4249844)
chr1 (291-348)||(4250111-4250168)
chr1 (188-229)||(10163736-10163777)
chr1 (215-348)||(49722593-49722726)
chr1 (204-298)||(14987989-14988084)
chr1 (282-348)||(20169109-20169175)
chr1 (197-271)||(25554820-25554893)
chr1 (273-354)||(43207558-43207640)
chr1 (274-359)||(46859130-46859216)
chr1 (187-215)||(4349675-4349703)
chr1 (192-252)||(21006125-21006185)
chr1 (314-358)||(25554752-25554796)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (188-366)||(21172011-21172188)
chr7 (186-366)||(32758213-32758392)
chr7 (182-366)||(2541021-2541207)
chr7 (168-366)||(35334818-35335014)
chr7 (187-366)||(48735124-48735303)
chr7 (195-366)||(10693075-10693245)
chr7 (187-366)||(42805477-42805659)
chr7 (188-366)||(47716413-47716594)
chr7 (194-366)||(40463837-40464009)
chr7 (188-366)||(42798623-42798802)
chr7 (187-366)||(34626210-34626389)
chr7 (195-366)||(11617590-11617762)
chr7 (188-366)||(43557426-43557608)
chr7 (216-366)||(42391102-42391251)
chr7 (196-366)||(27629596-27629767)
chr7 (238-367)||(18512454-18512583)
chr7 (208-364)||(33871914-33872070)
chr7 (187-348)||(28078152-28078313)
chr7 (199-366)||(19426892-19427059)
chr7 (188-364)||(47077859-47078034)
chr7 (188-339)||(46354148-46354302)
chr7 (187-366)||(42476826-42477004)
chr7 (199-366)||(19265781-19265946)
chr7 (188-366)||(22698969-22699151)
chr7 (188-349)||(13805057-13805217)
chr7 (200-356)||(39123857-39124018)
chr7 (238-366)||(7879642-7879771)
chr7 (187-288)||(42495916-42496017)
chr7 (188-346)||(2662958-2663112)
chr7 (192-358)||(14732831-14732999)
chr7 (197-359)||(28362155-28362316)
chr7 (189-291)||(18326989-18327091)
chr7 (197-366)||(23419676-23419845)
chr7 (210-366)||(29907393-29907551)
chr7 (213-366)||(11741774-11741926)
chr7 (197-347)||(19266414-19266564)
chr7 (257-360)||(38604550-38604654)
chr7 (197-350)||(48123502-48123655)
chr7 (220-366)||(18747472-18747620)
chr7 (285-366)||(27889318-27889399)
chr7 (189-354)||(8148960-8149126)
chr7 (238-366)||(31591111-31591238)
chr7 (211-366)||(6736867-6737020)
chr7 (188-271)||(7193039-7193122)
chr7 (210-344)||(14099030-14099165)
chr7 (210-344)||(14409047-14409182)
chr7 (259-366)||(35787271-35787378)
chr7 (210-366)||(16341254-16341412)
chr7 (225-366)||(38262198-38262340)
chr7 (197-366)||(3469177-3469350)
chr7 (189-304)||(5180221-5180337)
chr7 (193-290)||(7794582-7794682)
chr7 (187-304)||(12473257-12473375)
chr7 (217-366)||(32233137-32233286)
chr7 (209-343)||(7644931-7645066)
chr7 (250-366)||(23231573-23231690)
chr7 (246-364)||(1408469-1408588)
chr7 (197-353)||(42101899-42102056)
chr7 (194-304)||(1423974-1424085)
chr7 (238-359)||(21566439-21566562)
chr7 (197-348)||(44123642-44123792)
chr7 (191-363)||(25198679-25198856)
chr7 (285-366)||(45018925-45019010)
chr7 (188-271)||(21447544-21447627)
chr7 (274-366)||(23065927-23066019)
chr7 (276-343)||(33500556-33500625)
chr7 (209-366)||(22065563-22065720)
chr7 (286-358)||(36267827-36267900)
chr7 (238-338)||(15108427-15108527)
chr7 (326-366)||(36602540-36602580)
chr7 (275-366)||(23618979-23619070)
chr7 (191-242)||(29140487-29140538)
chr7 (261-366)||(13792152-13792257)
chr7 (265-355)||(21139761-21139851)
chr7 (238-348)||(35203443-35203556)
chr7 (187-252)||(5814424-5814489)
chr7 (317-365)||(42495865-42495913)
chr7 (189-233)||(45019012-45019056)
chr7 (276-366)||(39093441-39093532)
chr7 (310-366)||(11888414-11888470)
chr7 (325-357)||(25434112-25434144)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (188-366)||(1346918-1347095)
chr6 (188-366)||(1354759-1354936)
chr6 (187-366)||(29355857-29356040)
chr6 (198-366)||(12221916-12222088)
chr6 (187-366)||(9161076-9161257)
chr6 (190-361)||(3815084-3815256)
chr6 (188-366)||(1941809-1941988)
chr6 (188-366)||(15866041-15866218)
chr6 (193-366)||(2166412-2166587)
chr6 (193-366)||(2178045-2178220)
chr6 (187-301)||(8409196-8409311)
chr6 (198-366)||(24097545-24097710)
chr6 (252-366)||(26097178-26097291)
chr6 (252-366)||(25557743-25557856)
chr6 (189-365)||(13904984-13905158)
chr6 (239-357)||(33138838-33138957)
chr6 (197-355)||(7947384-7947543)
chr6 (187-271)||(14975178-14975262)
chr6 (244-348)||(32579436-32579540)
chr6 (188-330)||(6024187-6024332)
chr6 (220-366)||(23240826-23240971)
chr6 (186-344)||(22967123-22967287)
chr6 (186-344)||(23821106-23821270)
chr6 (179-357)||(20400612-20400791)
chr6 (212-321)||(28007604-28007714)
chr6 (192-366)||(23930129-23930303)
chr6 (219-362)||(18277199-18277343)
chr6 (191-278)||(12063424-12063511)
chr6 (197-366)||(12889390-12889560)
chr6 (199-346)||(14553477-14553626)
chr6 (192-341)||(24734591-24734752)
chr6 (296-366)||(13267788-13267858)
chr6 (188-270)||(33922927-33923009)
chr6 (306-366)||(6808468-6808528)
chr6 (238-366)||(15865859-15865987)
chr6 (191-366)||(32728159-32728334)
chr6 (306-366)||(12885986-12886046)
chr6 (306-366)||(12892082-12892142)
chr6 (291-366)||(383762-383837)
chr6 (200-366)||(3116131-3116299)
chr6 (308-366)||(10734907-10734965)
chr6 (210-304)||(2755488-2755583)
chr6 (204-263)||(8417442-8417501)
chr6 (308-358)||(11395836-11395886)
chr6 (306-364)||(14975094-14975152)
chr6 (280-366)||(17432393-17432481)
chr6 (274-367)||(18254559-18254652)
chr6 (206-304)||(27855501-27855601)
chr6 (315-364)||(30786378-30786427)
chr6 (274-306)||(14341132-14341164)
chr6 (249-359)||(19340843-19340954)
chr6 (198-233)||(19649303-19649338)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (188-366)||(30533-30710)
[»] scaffold0258 (2 HSPs)
scaffold0258 (190-366)||(13026-13202)
scaffold0258 (189-231)||(17507-17549)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (191-366)||(10052-10226)
scaffold0187 (191-366)||(20380-20554)
scaffold0187 (186-253)||(8897-8964)
scaffold0187 (186-253)||(19225-19292)
[»] scaffold0057 (5 HSPs)
scaffold0057 (197-366)||(46794-46964)
scaffold0057 (187-366)||(24774-24949)
scaffold0057 (247-366)||(43672-43791)
scaffold0057 (280-348)||(46727-46796)
scaffold0057 (197-255)||(46997-47054)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (193-366)||(58936-59112)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (197-363)||(10773-10940)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (195-366)||(11093-11262)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (196-364)||(1591-1758)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (187-317)||(226456-226588)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (243-366)||(48636-48758)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (196-366)||(72869-73034)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (188-318)||(35067-35200)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (281-366)||(24135-24220)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (193-331)||(4117-4258)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (187-262)||(83828-83903)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (250-366)||(3560-3677)
[»] scaffold0194 (2 HSPs)
scaffold0194 (189-265)||(24619-24695)
scaffold0194 (281-366)||(24696-24781)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (192-287)||(43085-43182)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (188-281)||(8848-8938)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (197-349)||(23567-23715)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (298-346)||(58651-58699)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 16735242 - 16735595
Alignment:
Q  13 aatatattgttgaactctgaatttgaggctcatgttgctgattttggacttgctaagttcttgcaagataatgggaattcagaatgcatgtcttctattg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16735242 aatatattgttgaactctgaatttgaggctcatgttgctgattttggacttgctaagttcttgcaagataatgggaattcagaatgcatgtcttctattg 16735341  T
Q  113 ctggttcttatggatatattgctccaggtacatactttaatacaaaattctcaaatatataaaatcattttcattgaggggtaaccttggcgcaactggt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16735342 ctggttcttatggatatattgctccaggtacatactttaatacaaaattctcaaatatataaaatcattttcattgaggggtaaccttggcgcaactggt 16735441  T
Q  213 aaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16735442 aaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 16735541  T
Q  313 ggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  16735542 ggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgccct 16735595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40272994 - 40272814
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  40272994 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 40272895  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40272894 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 40272814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 201 - 366
Target Start/End: Original strand, 26869696 - 26869861
Alignment:
Q  201 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26869696 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 26869795  T
Q  301 caccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26869796 caccaaatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 26869861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 22609741 - 22609920
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22609741 ttgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 22609839  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22609840 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 22609920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 1217065 - 1217243
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1217065 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 1217163  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1217164 ggctgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 1217243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13628975 - 13628792
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaa-aaacagggt 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||    
T  13628975 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 13628876  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13628875 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 13628792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 39203491 - 39203669
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39203491 tgaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 39203589  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39203590 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 39203669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13730785 - 13730604
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13730785 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13730686  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13730685 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 13730604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366722
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  288 gctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgccct 29366722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 46421218 - 46421036
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  46421218 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46421119  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt-ggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  46421118 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgccct 46421036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8247871 - 8247688
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  8247871 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 8247772  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt-ggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  8247771 aggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccct 8247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 192 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122919
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctg 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgt-gtaaaacagggtaaggctg 22122994  T
Q  292 cgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  22122993 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccct 22122919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926221
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |        |||||    
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--------gtaag 52926300  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  52926299 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccct 52926221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411833
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 6411903  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccg 357  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6411902 gctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12914216 - 12914037
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  12914216 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 12914117  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12914116 ggcggcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgccct 12914037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5173904 - 5173721
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||  ||    
T  5173904 ttgaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaaagt 5173805  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| ||| | |||||||||   ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5173804 aaggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 5173721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7697068 - 7696894
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  7697068 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgt-gtaaaacagggta 7696970  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||| |||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  7696969 aggctgcgtacaatacaccaaatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtttccct 7696894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 26573103 - 26573282
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggta 285  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  26573103 tgagggggacccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggta 26573201  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  26573202 aggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccaggctgccct 26573282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10870132 - 10870025
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10870132 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 10870033  T
Q  288 gctgcgta 295  Q
    ||||||||    
T  10870032 gctgcgta 10870025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4495845 - 4495678
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||   |||||||||||||    
T  4495845 gaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaa 4495746  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4495745 ggctgcgtacaatacaccaaatggtg------------ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 4495678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 366
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31593002
Alignment:
Q  241 acgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcg 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggactccttcccggaccctgcatatgcg 31592976  T
Q  341 ggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  31592977 ggagctctagtgcaccgggttgccct 31593002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34420815 - 34420656
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  34420815 ccttggcgcaacag-taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 34420717  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  34420716 ccatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcac 34420656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 348
Target Start/End: Original strand, 9607178 - 9607342
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9607178 tgaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgta-aaaaacagggt 9607276  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  9607277 aaggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 9607342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484846
Alignment:
Q  252 tcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 54484829  T
Q  350 gtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||    
T  54484830 gtgcaccgggttgccct 54484846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516567
Alignment:
Q  220 ttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa---tggtggga 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  316 ccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 516567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25517353 - 25517172
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagt--cctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagggt 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | | |   ||| |||||| ||||||||  | ||||||| | |    
T  25517353 agggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagat 25517254  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25517253 atggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgccct 25517172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943143
Alignment:
Q  215 agttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgg 313  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatcaaatggtgg 7943092  T
Q  314 gaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    || ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7943093 gatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcc 7943143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 240 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795425
Alignment:
Q  240 cacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgta 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgta 10795455  T
Q  337 tgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  10795454 tgcgggagcttcagtgcaccaggttgccct 10795425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45621010 - 45620881
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggt 284  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  45621010 tgagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggt 45620912  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtggga 315  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45620911 aaggctgcgtacaatacaccaattggtggga 45620881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45949012 - 45948848
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgta---acgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgc 292  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |   | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  45949012 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgc 45948914  T
Q  293 gtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45948913 atacaatacaccaattggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 53996737 - 53996567
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  53996737 ccttggcgctac-ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgctta 53996639  T
Q  296 caatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53996638 caatacaccaaaatggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccct 53996567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 366
Target Start/End: Original strand, 15797271 - 15797375
Alignment:
Q  261 cagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggt 360  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  15797271 cagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggt 15797369  T
Q  361 tgccct 366  Q
    ||||||    
T  15797370 tgccct 15797375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771366
Alignment:
Q  275 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgccct 34771366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 366
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987114
Alignment:
Q  244 ggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcg 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcg 14987088  T
Q  341 ggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14987089 ggagctttagtgcaccgggtttccct 14987114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 348
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926220
Alignment:
Q  223 tcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggtgggacccctt 321  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccataatggtgggacccctt 33926193  T
Q  322 gccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
     | ||||||||| |||||| |||||||    
T  33926194 cctggaccctgcatatgcgagagcttt 33926220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Original strand, 25944455 - 25944625
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||| ||||||| ||    
T  25944455 ccttggcgcaacag-taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgta-aaaaactgggcaaggctgagt 25944552  T
Q  295 acaatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||    
T  25944553 acaatacaccaaaatggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcaccaggctgccct 25944625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928166
Alignment:
Q  214 aagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtg 312  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||| || ||| |||||||| | ||| |    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaattggcg 30928203  T
Q  313 ggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30928202 ggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctttg 30928166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45786327 - 45786216
Alignment:
Q  258 aaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  45786327 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgca 45786228  T
Q  355 ccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||    
T  45786227 ccgggttgccct 45786216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 353445 - 353351
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  353445 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032573
Alignment:
Q  223 tcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacccctt 321  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccgaatggtggg------- 54032613  T
Q  322 gccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54032612 -----accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 54032573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 49013587 - 49013475
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgc 353  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  49013587 gaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagtgc 49013488  T
Q  354 accgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||    
T  49013487 accgggttgccct 49013475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 337
Target Start/End: Original strand, 47624088 - 47624167
Alignment:
Q  258 aaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtat 337  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  47624088 aaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgtgtat 47624167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 364
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731155
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    |||||| ||||||||| |||| || || ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19731099  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||| || || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19731100 ggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccgggctgcc 19731155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139480
Alignment:
Q  223 tcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggacccc 319  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  320 ttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || || || ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  45139524 ttcccaga-cctgcgtatgcgggaacttt-gtgcaccgggctgccct 45139480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374365
Alignment:
Q  227 gtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgcc 324  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaaaatggtgggaccccttccc 54374389  T
Q  325 ggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  54374388 ggaccctgcatatgcgggagcttt 54374365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 293
Target Start/End: Original strand, 12525385 - 12525489
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  12525385 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaa---gttgtcatatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggta 12525481  T
Q  286 aggctgcg 293  Q
    ||||||||    
T  12525482 aggctgcg 12525489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 33235504 - 33235686
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac-tgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagg 282  Q
    ||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||| || |  ||| ||||||||||  | |||||||||    
T  33235504 ttgagcggaaaccttgatgcagctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagg 33235603  T
Q  283 gtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | | |||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  33235604 gtaagactgtgtacaatacactaaatggtgggacccctcg-cagaccttacgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccct 33235686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 9276327 - 9276400
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9276327 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt-ggaccctttcccggaccctgcgtatgcgggaacttt 9276400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 829611 - 829452
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaa-aacagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| || || | | || |||||||| || |||||| ||||||||  ||| ||||  |||| | ||||||||    
T  829611 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaa-gacccgagttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtaca 829514  T
Q  298 atacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  829513 atacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410886
Alignment:
Q  218 tgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacc 317  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctcgtgta-aaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaactggtgggacc 8410918  T
Q  318 ccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
     |||  | |||||||| || |||| |||||||    
T  8410917 tcttctcagaccctgcataggcggaagctttg 8410886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114882
Alignment:
Q  245 gttcaagtcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagggtaagg-ctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccc-tgcgtatgcg 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaatggtgggaccc-ttcctggacccctgcgtatgcg 43114896  T
Q  341 ggagctttggtgca 354  Q
    |||||||| |||||    
T  43114895 ggagctttagtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 364
Target Start/End: Original strand, 55401208 - 55401330
Alignment:
Q  244 ggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgg 341  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  55401208 ggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaaaatggtgggaccccttctcggaccttccgtatgcgg 55401307  T
Q  342 gagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||  ||||||||| ||||    
T  55401308 gagcttttttgcaccgggctgcc 55401330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875106
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaagg 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| | || |||||| |||||  |||  ||||| |||||||||    
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-------acgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  289 ctgcgtacaatacac 303  Q
    |||||||||||||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacac 21875106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44403727 - 44403559
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||  || ||||| |||| ||||||| | || ||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |    
T  44403727 ccttggtgcaac-ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcgga 44403629  T
Q  296 caatac-accgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
     ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  44403628 gaataccacaaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggctgcc 44403559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24851363 - 24851303
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24851363 aatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 24851303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 364
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751731
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    |||||| || |||||| |||| || || ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19751675  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||| || || |||  || ||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  19751676 ggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcaccgggctgcc 19751731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 366
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452950
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 30452950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10484671 - 10484618
Alignment:
Q  313 ggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10484671 ggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 10484618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 50625072 - 50624955
Alignment:
Q  250 agtcctcgaaacagcctcttgtaga-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||  ||||||||||||||   ||||||||| |||| | || ||||||||| | |||||||||    
T  50625072 agtcctagaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatttggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagcttt 50624973  T
Q  349 ggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||||||||| ||||||    
T  50624972 agtgcaccgggctgccct 50624955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062093
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctc 53062093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 26292382 - 26292481
Alignment:
Q  262 agcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggtt 361  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  26292382 agcctcttgt-gtaaaacagggtaagaccgcgtacgatacaccaaatgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccgggtt 26292480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Original strand, 47624211 - 47624254
Alignment:
Q  323 ccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47624211 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 47624254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Original strand, 35417902 - 35417975
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  35417902 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgt 35417975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31904951 - 31904858
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtggga-ccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || || | | ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  31904951 aaaaacagggtatgactgcgtacaatacaccaaatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagctttagtgcaccaggctgccct 31904858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 302
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212081
Alignment:
Q  214 aagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaa-aacagggtaaggctgcgtacaataca 302  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Original strand, 9276249 - 9276289
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9276249 tgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatg 9276289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 271
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782425
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgt 26782425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 52428609 - 52428479
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtc-ctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgg-------gaccccttgccggac 328  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||        |||||||  |||||    
T  52428609 gtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatagtggaaccccaaaccccttctcggac 52428510  T
Q  329 cctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  52428509 cctacgtatgtgggagctttagtgcaccggg 52428479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905098
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||  ||| ||||||  | ||||| |||||||  ||||  ||| |||||| ||| ||||| |||||| ||    
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |  |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||| ||||||    
T  28905041 ta-tgggaccctttcccggaccctgcgtaagcgggaactttagtgtaacgggctgccct 28905098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 366
Target Start/End: Original strand, 40390357 - 40390396
Alignment:
Q  327 accctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40390357 accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 40390396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 228
Target Start/End: Original strand, 23871418 - 23871455
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23871418 gggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgt 23871455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14266413 - 14266374
Alignment:
Q  327 accctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14266413 accctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgccct 14266374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Original strand, 31831244 - 31831341
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||           ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  31831244 gaaacagcctcttgt-gtaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggt-----------ccggaccctgcatatgcgggtgctctagtgcacc 31831331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 23871484 - 23871521
Alignment:
Q  329 cctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23871484 cctgcgtatgcgggaactttagtgcaccgggttgccct 23871521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Original strand, 24577917 - 24577990
Alignment:
Q  293 gtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||  |||||||||| || || || |||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24577917 gtacaatacactaaatggtgggatcctttcccagaccctgcatatacgggagctctagtgcaccggattgccct 24577990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Original strand, 24578007 - 24578080
Alignment:
Q  293 gtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | || || |||||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  24578007 gtacaatacactaaatggtgggactctttcccagaccctacatatgcgggaactctagtgcaccgggttgccct 24578080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43956515 - 43956474
Alignment:
Q  325 ggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43956515 ggacccagcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgccct 43956474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 39430465 - 39430509
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 232  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39430465 gaggggtaactttgacgcaactggtaaagttgctgtcatctgact 39430509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 100)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 5648212 - 5648391
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5648212 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 5648311  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  5648312 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgccct 5648391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6430808 - 6430628
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6430808 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 6430709  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6430708 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccct 6430628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 20224936 - 20225115
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  20224936 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgt-gtaaaacagggta 20225034  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20225035 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 20225115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48599005 - 48598827
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48599005 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 48598907  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  48598906 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgccct 48598827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 30639333 - 30639512
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  30639333 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaacagggtaa 30639432  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30639433 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccct 30639512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5306845 - 5306662
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  5306845 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatcagggtaa 5306746  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatg----cgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5306745 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgccct 5306662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47528709 - 47528532
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47528709 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaag 47528611  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  47528610 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgccct 47528532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 207 - 366
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915961
Alignment:
Q  207 actggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 40915901  T
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  40915902 atggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccct 40915961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11054327 - 11054150
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  11054327 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgt-gtaaaacagggtaag 11054229  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11054228 actgcgtacaatacaccaaatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 11054150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16408777 - 16408603
Alignment:
Q  195 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16408777 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 16408678  T
Q  294 tacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16408677 tacaatacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 16408603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911697
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtaga-aaaacagggtaaggc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  290 tgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgccct 16911697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 23501747 - 23501922
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  23501747 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 23501840  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23501841 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 23501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 365
Target Start/End: Original strand, 21646918 - 21647098
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||    
T  21646918 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaa 21647017  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21647018 ggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 21647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 226 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207900
Alignment:
Q  226 tgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccg 325  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 29207941  T
Q  326 gaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29207940 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 354
Target Start/End: Original strand, 37494805 - 37494972
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  37494805 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 37494904  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37494905 ggttgcatacaatataccaaatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 207 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363132
Alignment:
Q  207 actggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||     
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  306 aa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 44363132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 214 - 366
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175198
Alignment:
Q  214 aagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaa-cagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggt 311  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggt 54175142  T
Q  312 gggacccctt-gccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  54175143 gggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccct 54175198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766468
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacggg-ttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||  | |||||||  ||||||    |||||||||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgtgtaaacagggtaa 55766548  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  55766547 ggctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgccct 55766468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832315
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggt 311  Q
    |||| ||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 9832370  T
Q  312 gggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  9832369 gggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgccct 9832315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8473790 - 8473622
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||    
T  8473790 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtttaacagggtaaggctgcatacaa 8473692  T
Q  299 tacaccgaatggtgggacccctt-gccgga-ccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8473691 tacaccaaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 8473622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 317
Target Start/End: Original strand, 14590790 - 14590922
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggt 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  14590790 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 14590889  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacc 317  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  14590890 aaggctgcatacaatacatcaaatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983967
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggc 289  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||     
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  290 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  14983891 tgcctacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccatgttgccct 14983967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352582
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt------agaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||      | |||||||||||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  287 g----gctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccct 30352582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13256578 - 13256401
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |    ||||||||||   |||||||||||||    
T  13256578 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctgg----agcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13256483  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13256482 ggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 13256401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567303
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacaccaaat 35567245  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35567246 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgccct 35567303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077800
Alignment:
Q  215 agttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtggg 314  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggttgcgtacaatataccaaatggtgag 39077850  T
Q  315 accccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||  ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39077849 acatctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 39077800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 357
Target Start/End: Original strand, 54730201 - 54730376
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacaggg 283  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||     
T  54730201 ttgatgggtaactttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaatagga 54730300  T
Q  284 taaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccg 357  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54730301 taaggctgcgtataatacaccaataatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 54730376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 214 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043414
Alignment:
Q  214 aagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtg 312  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 17043450  T
Q  313 ggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  17043449 ggaccccttcccagaccctgcatatgctggagcttt 17043414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 238 - 366
Target Start/End: Original strand, 47443961 - 47444090
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgt 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47443961 gtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgta-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcat 47444059  T
Q  336 atgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  47444060 atgcaggagcttcagtgcactgggttgccct 47444090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830723
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgg-gttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||    |||||||||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgtgtaaacagggtaa 55830803  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  55830802 tgctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccaggatgccct 55830723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 358
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027973
Alignment:
Q  209 tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa 307  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19027923 tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 251 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639660
Alignment:
Q  251 gtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 20639678  T
Q  349 ggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||||||||||||||||    
T  20639677 agtgcaccgggttgccct 20639660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 20405047 - 20405222
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||       ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20405047 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 20405139  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||  ||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20405140 agattgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgccct 20405222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690178
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa--------cagggtaaggctgcgtacaatacac 303  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||        |||||||||||||| ||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  304 cgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  30690240 caattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgccct 30690178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 349
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463238
Alignment:
Q  220 ttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccc 318  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacaccaaatggtgggaccc 25463207  T
Q  319 cttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25463208 cttcccggaccctgcatatgcgggagctttg 25463238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478794
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||     |||||||| ||||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaacagggtaaggctg-----aatacaccaaatggt 32478848  T
Q  312 gggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32478847 gggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagcttt-gtgcaccgggtggccct 32478794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315375
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggct 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaacaaggtaaggct 17315377  T
Q  291 gc 292  Q
    ||    
T  17315376 gc 17315375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 365
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967151
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaag 287  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| || |||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  54967076 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgccc 54967151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 365
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660538
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgta-aaaaatagggta 10660456  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt-ggtgcaccgggttgccc 365  Q
     |||||| |||||||||||   ||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  10660457 tggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccc 10660538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 365
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874683
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgta-aaaaatagggta 10874601  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt-ggtgcaccgggttgccc 365  Q
     |||||| |||||||||||   ||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  10874602 tggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccc 10874683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40404007 - 40403899
Alignment:
Q  34 tttgaggctcatgttgctgattttggacttgctaagttcttgcaagataatgggaattcagaatgcatgtcttctattgctggttcttatggatatattg 133  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  40404007 tttgaagcccatgttgctgattttggacttgctaagttcttgcaagattctggaacttctgaatgcatgtctgctattgctggttcttatggatacatag 40403908  T
Q  134 ctccaggta 142  Q
    |||||||||    
T  40403907 ctccaggta 40403899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47441699 - 47441540
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  47441699 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtaca 47441601  T
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||||    
T  47441600 atacaccaaatggttggaccccttcccggaccctgagtaagcaggagctttcgtccaccgg 47441540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909282
Alignment:
Q  252 tcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgc-gggagctttgg 350  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttag 7909298  T
Q  351 tgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| |||||||||||    
T  7909297 tgcatcgggttgccct 7909282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30496491 - 30496333
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  30496491 cttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaacac-gggtaaggctgcataca 30496393  T
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccg 357  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  30496392 atacaccaaatggggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcaccg 30496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629293
Alignment:
Q  219 gttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggacc 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||| ||||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgtaaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaaattggcgggacc 32629320  T
Q  318 ccttgccggaccctgcgtatgcgggag 344  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  32629319 ccttcccggaccttgcgtatgtgggag 32629293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Original strand, 25629090 - 25629182
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25629090 aaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 25629182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018807
Alignment:
Q  217 ttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggac 316  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaatagtgggac 41018846  T
Q  317 cccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    ||||| || |||| ||||||||  || ||||| ||||||    
T  41018845 cccttcccagaccttgcgtatggaggggctttagtgcac 41018807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 49796821 - 49796911
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctt 347  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  49796821 gaaacagcctcttgtgttaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 49796911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  217 ttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtggga 315  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||  ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatggtggga 7385529  T
Q  316 ccccttgccggaccctgcgtatgcgggagc 345  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  7385528 ccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865048
Alignment:
Q  258 aaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgcacc 51865050  T
Q  357 gg 358  Q
    ||    
T  51865049 gg 51865048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 366
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225209
Alignment:
Q  278 acagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 20225209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49938759 - 49938613
Alignment:
Q  200 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaat 299  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||   | |||||||    
T  49938759 tggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacggggtaag---gtgtacaat 49938663  T
Q  300 acacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  49938662 acaccaaaatggtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagcttt 49938613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 363
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489218
Alignment:
Q  246 ttcaagtcctcgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcggg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgta-aaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggg 21489197  T
Q  343 agctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  21489198 agctttcgtgcactgggttgc 21489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10277886 - 10277759
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtat 337  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||||| |||    
T  10277886 gtcacgggttcaaatccttgaaacagcctcttgtataaaat-aggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgaaaccccttcccagaccctgcatat 10277788  T
Q  338 gcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| | | ||| ||||| |||||||    
T  10277787 gcgggagttctagtgaaccggattgccct 10277759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029080
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa- 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||  |||||||| | | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaaaa 39029121  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39029120 tggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagcttt 39029080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20908818 - 20908649
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaac-gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggta 285  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||  ||||||||| | |||||| | |||| |  |||||  | ||||    
T  20908818 gagggggagccttggcacaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggta 20908720  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20908719 aggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 20908649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 365
Target Start/End: Original strand, 36589708 - 36589876
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||   |    
T  36589708 ccttggcgcaac-ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttga 36589805  T
Q  296 caatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    || |||||| || |||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36589806 cagtacaccaaaatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgccc 36589876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42164317 - 42164224
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcg 293  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42164317 ttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcg 42164224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 487306 - 487135
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtaga-aaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||  | |||||| ||||| ||||||||    
T  487306 ccttggcgtaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgta 487208  T
Q  296 caatacac---------cgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||||          | |||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  487207 caatacactaaaatggtgggatggcgggaccccttcccggattctgcgaatgcgggagctttagtgcaccggg 487135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 11394925 - 11394985
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11394925 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 11394985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 11404652 - 11404712
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11404652 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 11404712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755910
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38755970 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 38755910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987838
Alignment:
Q  246 ttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaa-aacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggag 344  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggag 9987858  T
Q  345 ctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||||  ||||||||| ||||    
T  9987857 ctttaatgcaccgggctgcc 9987838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30581638 - 30581485
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  | |||  || |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||  | ||||||||||||||| || ||    
T  30581638 ccttggcgcaac-gctaaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgt 30581540  T
Q  295 acaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  30581539 acaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagcttt 30581485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580859
Alignment:
Q  211 gtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccgaatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||   |||||||  |||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtc-tggaaac---ctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacaccaaatg 3580899  T
Q  310 gtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
     | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3580898 ctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctttg 3580859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 366
Target Start/End: Original strand, 38786673 - 38786742
Alignment:
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38786673 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 38786742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33836549 - 33836489
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33836549 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgccct 33836489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 304
Target Start/End: Original strand, 25343152 - 25343258
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||| || |||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  25343152 cttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 25343250  T
Q  297 aatacacc 304  Q
    ||||||||    
T  25343251 aatacacc 25343258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484366
Alignment:
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 32484366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553939
Alignment:
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 40553939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 366
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038185
Alignment:
Q  222 gtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggtgggacccc 319  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcct-gaaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaaaatggtggggcacc 7038139  T
Q  320 ttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |  ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  7038140 tacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgccct 7038185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5313172 - 5313099
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagc 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||    
T  5313172 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctgaaaacagc 5313099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36816479 - 36816386
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat-ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36816479 aaaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaaggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgccct 36816386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388309
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgccct 25388309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47482912 - 47482864
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47482912 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 47482864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 75
Target Start/End: Original strand, 26736016 - 26736062
Alignment:
Q  29 ctgaatttgaggctcatgttgctgattttggacttgctaagttcttg 75  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26736016 ctgattttgaggctcatgttgctgattttggacttgctaagttcttg 26736062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 231
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969738
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 18969738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580210
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatg 309  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||   |||||||||| ||| |||||||  |||||||  ||||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaaaatg 23580266  T
Q  310 gtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | | ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  23580265 gcgagaccccttcttgga-cctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgagctgccct 23580210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532125
Alignment:
Q  318 ccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 35532125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035307
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaa-aaacagggtaaggctgc 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgc 43035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718700
Alignment:
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgccct 44718700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49938610 - 49938508
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||||| | ||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  49938610 ccttggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtcc 49938511  T
Q  297 aat 299  Q
    |||    
T  49938510 aat 49938508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54640510 - 54640437
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54640510 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgt 54640437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12711548 - 12711451
Alignment:
Q  269 tgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||||||||| | |||| |||||||  ||||||||    
T  12711548 tgtaaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgcacccagttgccct 12711451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20373974 - 20373898
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcc 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |||||  |||||| |||| |||||||||    
T  20373974 aggggtaactttggcgcaactggtcaagttgttctcatatgactgaaatgtcacatgttcaattccttgaaacagcc 20373898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 50555718 - 50555658
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  50555718 aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccgggctgccct 50555658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 9037772 - 9037847
Alignment:
Q  275 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacccc-ttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||    
T  9037772 aaaatagggtaagactgcatacaatacaccgaatggtaggaccccttttccgaacactgcgtatgcaggagctttg 9037847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12666914 - 12666859
Alignment:
Q  311 tgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  12666914 tgggaccccttgtcggaccatgcgtatgcaggagctttagtacaccgggttgccct 12666859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 359
Target Start/End: Original strand, 16494259 - 16494345
Alignment:
Q  275 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  16494259 aaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtgtaccggg 16494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12257764 - 12257691
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  12257764 ccttgacgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgt 12257691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813261
Alignment:
Q  277 aacagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt-ggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccctttcccgaacgatgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggattgccct 2813261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29879679 - 29879634
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 232  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29879679 tgaggggtaacattggtgcaactgataaagttgttgtcatgtgact 29879634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 304
Target Start/End: Original strand, 51420537 - 51420645
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacggg-ttcaagtcctcgaaacagcctcttgtaga-aaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||   | |||||||| | |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||    
T  51420537 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggt 51420635  T
Q  295 acaatacacc 304  Q
    ||||||||||    
T  51420636 acaatacacc 51420645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 50856407 - 50856344
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaac 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || || |||||||||||||||||| |||||    
T  50856407 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaac 50856344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48327859 - 48327765
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||| ||| ||| ||||  | ||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  48327859 aaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccgggttaccct 48327765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 366
Target Start/End: Original strand, 19027986 - 19028044
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19027986 tggtgggactccttcccggaccccacttatgcgggagctttagtgcaccgggctgccct 19028044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 364
Target Start/End: Original strand, 28494224 - 28494282
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  28494224 aatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcc 28494282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 366
Target Start/End: Original strand, 56322984 - 56323033
Alignment:
Q  317 cccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56322984 cccttcccggaccccggatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 56323033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 354
Target Start/End: Original strand, 8820581 - 8820629
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  8820581 aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgca 8820629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 35894556 - 35894492
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtat 337  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  35894556 aaaaacacggtaagtgtgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggatcatgcgtat 35894492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 13160655 - 13160834
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13160655 tgaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 13160754  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  13160755 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgccct 13160834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28817809 - 28817628
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggt 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  28817809 ttgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 28817710  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28817709 aaggctgcgtacaatacacccaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccct 28817628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12670429 - 12670252
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12670429 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaag 12670331  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  12670330 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttaccct 12670252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 185 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30454279 - 30454099
Alignment:
Q  185 attgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||    
T  30454279 attgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacaaggt 30454181  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30454180 aaggctgcgtacgatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 30454099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 36720748 - 36720929
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggt 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  36720748 ttgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 36720847  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  36720848 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgccct 36720929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 45071219 - 45071397
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45071219 gaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 45071318  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45071319 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 45071397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 35261633 - 35261812
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  35261633 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 35261732  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35261733 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 35261812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39461178 - 39460996
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||    
T  39461178 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagta 39461079  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39461078 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 39460996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29521866 - 29521690
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  29521866 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaa 29521767  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29521766 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 29521690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 362
Target Start/End: Original strand, 44530103 - 44530278
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  44530103 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 44530202  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttg 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44530203 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttg 44530278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18164945 - 18164764
Alignment:
Q  183 tcattgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagg 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  18164945 tcattgaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagg 18164846  T
Q  283 gtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | || ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18164845 gtaaggttgcgtacaatacaccaaaggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 18164764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7136710 - 7136529
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  7136710 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaa 7136611  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7136610 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttaccct 7136529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20284250 - 20284075
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt---agaaaaacagggtaagg 288  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  20284250 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaagg 20284151  T
Q  289 ctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttg 362  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20284150 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 20284075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 17823528 - 17823709
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |    
T  17823528 ttgaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggat 17823627  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17823628 aagactgcgtaaaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgccct 17823709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21070879 - 21070703
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt----agaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    | ||||| ||||||||    
T  21070879 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaag 21070780  T
Q  288 gctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttg 362  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21070779 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 21070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 2626472 - 2626655
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt----agaaaaacagg 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    | |||||||||    
T  2626472 tgaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacagg 2626571  T
Q  283 gtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  2626572 gtaagactgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccagattgccct 2626655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 6760776 - 6760957
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  6760776 tgaggggtaac-ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 6760874  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6760875 aggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 6760957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869523
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaag 20869579  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagc 345  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20869578 gctgtgtacaatacacc--aaggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 366
Target Start/End: Original strand, 12625858 - 12626023
Alignment:
Q  203 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||| |||||||    
T  12625858 cgcaactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaata 12625957  T
Q  301 caccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12625958 caccaaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 12626023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 26954086 - 26954268
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  26954086 gaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 26954185  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26954186 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccct 26954268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8897940 - 8897766
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctg 291  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||| || |||||  |||||  |||||||||||     
T  8897940 gtaaccctggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggcta 8897841  T
Q  292 cgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  8897840 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgccct 8897766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Original strand, 28407379 - 28407536
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||            
T  28407379 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaagg-------- 28407470  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
        |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28407471 ----caccaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgccct 28407536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 25250475 - 25250657
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| ||||||    
T  25250475 tgagaggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggta 25250574  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25250575 tggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgccct 25250657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365078
Alignment:
Q  211 gtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaaat 24365119  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24365118 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttg 24365078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135292
Alignment:
Q  240 cacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatg 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatg 5135319  T
Q  339 cgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  5135318 caggagcttt-gtgcaccgggctgccct 5135292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44781677 - 44781517
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||    
T  44781677 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgta 44781579  T
Q  296 caatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    |||||||||   |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44781578 caatacaccaaaaatgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457305
Alignment:
Q  216 gttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtggga 315  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatcaaatggtagga 31457254  T
Q  316 ccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  31457255 ccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgccct 31457305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Original strand, 29877135 - 29877227
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  29877135 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgttagtgcaccaggctgccct 29877227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8484109 - 8483947
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| || ||||||  || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  8484109 ccttggcgcaac-ggtaaagcggttgccacgtgacttaaatgtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgta 8484011  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8484010 caatacaccaattggtgggaccccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 24245405 - 24245564
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |     |||||||||||    
T  24245405 gaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttat---gtaacagggtaag 24245500  T
Q  288 gctgcgtacaatacacc---gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
     || |||||||| ||||    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24245501 actacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt 24245564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 358
Target Start/End: Original strand, 389647 - 389770
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt---agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcg 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  389647 gtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatgatgggatccctttcctgaccctgcg 389746  T
Q  335 tatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    |||||| ||||||| |||||||||    
T  389747 tatgcgagagctttagtgcaccgg 389770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 366
Target Start/End: Original strand, 10857865 - 10857962
Alignment:
Q  269 tgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10857865 tgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaattggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 10857962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Original strand, 20869964 - 20870058
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20869964 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 20870058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 356
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598279
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||| | |    
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaatt 22598232  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  22598233 ggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcacc 22598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742521
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||| | |||||||| || ||||||  ||| |||   ||||||||||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  288 gctgcgtacaatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcaccggggtgccc 44742521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 363
Target Start/End: Original strand, 5689640 - 5689761
Alignment:
Q  243 gggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgg 341  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||    
T  5689640 gggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgg 5689739  T
Q  342 gagctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  5689740 gagctttagtgcaccggtttgc 5689761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 366
Target Start/End: Original strand, 19729382 - 19729473
Alignment:
Q  275 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||||| || |||||||    
T  19729382 aaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgcactggattgccct 19729473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000230
Alignment:
Q  220 ttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacccc 319  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacacggtaaggttccatacaatacaccaaatggtgggacccc 23000268  T
Q  320 ttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || ||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23000267 ttcccgg---------atgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 23000230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42083870 - 42083712
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||  ||| |||||||||||    
T  42083870 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgta 42083772  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    || || |||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  42083771 cagtataccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgca 42083712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 300
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748366
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaag 287  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  288 gctgcgtacaata 300  Q
     | ||||||||||    
T  11748354 acagcgtacaata 11748366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 366
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102650
Alignment:
Q  294 tacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 26102650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106022
Alignment:
Q  213 aaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatgg 310  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacaccagaatgg 35106001  T
Q  311 tgggaccccttgccggaccct 331  Q
    ||||||| ||| | |||||||    
T  35106002 tgggacctcttcctggaccct 35106022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Original strand, 16225060 - 16225150
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttg 362  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16225060 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttg 16225150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 361
Target Start/End: Original strand, 26457776 - 26457855
Alignment:
Q  280 agggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggtt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26457776 agggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcaccgggtt 26457855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14018140 - 14017989
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || || |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||   ||||||||||| || |||||||    
T  14018140 ccttggcgcaac-ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgta 14018042  T
Q  296 caatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctt 347  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||| | |||||||||  |||||| |||||    
T  14018041 caatacactaaattggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagctt 14017989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17251001 - 17250879
Alignment:
Q  245 gttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgg 341  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| || ||| ||||||||||||  |    
T  17251001 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaag 17250902  T
Q  342 gagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  17250901 gagctttagtgca-cgggttgccc 17250879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000970
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcct-ct-tgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| | ||  ||||| ||| || |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacaccaaa 11001010  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctt 347  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||  ||||| |||||||    
T  11001009 tggtgggacccctacccgaaccctgtttatgcaggagctt 11000970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 362
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508039
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttg 362  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttg 27508039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23286475 - 23286431
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286475 tgaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 23286431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35107373 - 35107313
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35107373 aatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgccct 35107313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40605087 - 40604908
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |   | | ||||||||||| | ||||||  || ||||   |||||  || ||    
T  40605087 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggata 40604988  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| ||||||||||||||  |||| | ||| ||||| |   ||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  40604987 aggttgcgtacaatacactaaatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgaattgccct 40604908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27468137 - 27468094
Alignment:
Q  323 ccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27468137 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 27468094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23286432 - 23286375
Alignment:
Q  260 acagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccc 318  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23286432 acagcctcttgt-gtaaaacagggtaaagctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 23286375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30962944 - 30962871
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| || || ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  30962944 ccttggcgcaac-ggaaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgt 30962871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 362
Target Start/End: Original strand, 16013529 - 16013585
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttg 362  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16013529 aatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttg 16013585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36486627 - 36486568
Alignment:
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  36486627 atggtgggacctcttcccggaccttgcgtatgcaggagctttagtgccccgggttgccct 36486568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 40444845 - 40444899
Alignment:
Q  312 gggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||    
T  40444845 gggaccccttgccggaccctgcgtatgttggagctttagtgcaccgagctgccct 40444899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Original strand, 43942365 - 43942414
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggacccctt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43942365 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccctt 43942414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Original strand, 42840863 - 42840900
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtca 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42840863 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtca 42840900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 364
Target Start/End: Original strand, 18595918 - 18595969
Alignment:
Q  313 ggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18595918 ggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagttttagtgcatcgggttgcc 18595969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 27634983 - 27635058
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtc-atgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacag 263  Q
    ||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  27634983 aggggtagccttggcggaaccagtaaagttgttttttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacag 27635058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30962815 - 30962773
Alignment:
Q  324 cggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  30962815 cggaccctgcgtatgcgggagatttagtgaaccgggttgccct 30962773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 226
Target Start/End: Original strand, 5688801 - 5688829
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5688801 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 5688829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 38879534 - 38879716
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38879534 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 38879633  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38879634 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 38879716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 41014272 - 41014451
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41014272 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 41014371  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41014372 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 41014451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449023
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||  |||||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgccct 24449023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8170163 - 8169986
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  8170163 gagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgt-gtaaaacagggtaag 8170065  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8170064 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgccct 8169986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334337
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctc--ttgtagaaaaacagggtaagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  289 ctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcg-atgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 43334337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710444
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaatagggtaag 35710365  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35710366 gctgcgttcaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 35710444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619106
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  290 tgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccct 4619106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 366
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703555
Alignment:
Q  221 tgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacccct 320  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccct 32703509  T
Q  321 tgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32703510 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 32703555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 1565385 - 1565564
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||   ||    
T  1565385 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatta 1565484  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  1565485 aggctgcgtacaatgcaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagc-ttagtgcaccgggttgccct 1565564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 354
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838899
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacg-tcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||   |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaaacagggtaag 2838832  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2838833 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagcatcggtgca 2838899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 348
Target Start/End: Original strand, 27328709 - 27328869
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggc 289  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  27328709 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 27328808  T
Q  290 tgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27328809 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 27328869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37024737 - 37024626
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37024737 ttgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggta 37024639  T
Q  286 aggctgcgtacaa 298  Q
    |||||||||||||    
T  37024638 aggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 348
Target Start/End: Original strand, 22600406 - 22600569
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggt 284  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||   | ||||  |||| |||||||    
T  22600406 ttgaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggt 22600505  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22600506 aaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagcttt 22600569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19143113 - 19142956
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  || | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19143113 ccttggcgcaa-tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtac 19143015  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  19143014 agtacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcac 19142956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39225980 - 39225847
Alignment:
Q  16 atattgttgaactctgaatttgaggctcatgttgctgattttggacttgctaagttct---tgcaagata---atgggaattcagaatgcatgtcttcta 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    ||||| ||| |||||||||||||| |    
T  39225980 atattgttgaactctgagtttgaggctcatgttgctgattttggacttgctaagttcttgctgcaagatactggtgggacttctgaatgcatgtcttcca 39225881  T
Q  110 ttgctggttcttatggatatattgctccaggtac 143  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39225880 ttgttggttcttatggctacattgctccaggtac 39225847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 249 - 365
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368528
Alignment:
Q  249 aagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctct 7368511  T
Q  349 ggtgcaccgggttgccc 365  Q
     ||||||||||||||||    
T  7368512 agtgcaccgggttgccc 7368528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Original strand, 43574610 - 43574732
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtaga-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgta 336  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43574610 gtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgta 43574709  T
Q  337 tgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  43574710 tgcgggagctttagagcaccggg 43574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 209098 - 208936
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | |    
T  209098 ccttggcgcagc-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcattc 209000  T
Q  297 aatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  208999 aatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801769
Alignment:
Q  243 gggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgc 339  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  340 gggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccgggttgccct 13801769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861671
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggct 290  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||  ||||| ||    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgt-gtaaaaca-agtaagact 22861747  T
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||  |||||||| | ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  22861746 gctcacaatacatcaaatggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgaattgccct 22861671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 194 - 364
Target Start/End: Original strand, 30006285 - 30006456
Alignment:
Q  194 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaa-aacagggtaaggctgc 292  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||  | |||||||||   ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||     
T  30006285 taacattggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgt 30006384  T
Q  293 gtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30006385 gtacattacactaaatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30006456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7097870 - 7097772
Alignment:
Q  258 aaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7097870 aaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 7097772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12006500 - 12006330
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacggg-ttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  12006500 ttggcgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgta-aaaaatagggtaaggctccata 12006403  T
Q  296 caatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12006402 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccct 12006330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 358
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850764
Alignment:
Q  218 tgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacc 317  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgtaaaaacagaataagggtgcgtacaatacatcaaatggtgggacc 1850723  T
Q  318 ccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
     ||| | |||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  1850724 acttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccgg 1850764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16880741 - 16880649
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16880741 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttccct 16880649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 293
Target Start/End: Original strand, 23974733 - 23974840
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||| |||||    
T  23974733 ttgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggt 23974831  T
Q  285 aaggctgcg 293  Q
    |||||||||    
T  23974832 aaggctgcg 23974840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 279 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34154903 - 34154816
Alignment:
Q  279 cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  34154903 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgccct 34154816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957447
Alignment:
Q  293 gtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16957374 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 16957447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 304
Target Start/End: Original strand, 22187236 - 22187356
Alignment:
Q  185 attgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacaggg 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| |     
T  22187236 attgaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatga 22187335  T
Q  284 taaggctgcgtacaatacacc 304  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  22187336 taagactgcgtacaatacacc 22187356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Original strand, 39301087 - 39301249
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtaga-aaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | | |||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  39301087 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgta 39301185  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
     ||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  39301186 taatgcaccaaaaaggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405320
Alignment:
Q  217 ttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtggga 315  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||  || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacaccaaatggtggga 1405269  T
Q  316 ccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| || | | ||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  1405270 ccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgccct 1405320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516435
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaataca-ccgaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||| |  ||    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaaaa 28516494  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  28516493 tggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgccct 28516435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299700
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgc 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgtattaaaacagtgtaaaactgc 31299690  T
Q  293 gtacaataca 302  Q
    ||||||||||    
T  31299691 gtacaataca 31299700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 3771318 - 3771472
Alignment:
Q  211 gtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatgg 310  Q
    |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| |||| ||||| |  |||||| || | ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  3771318 gtaatgttgttctcacgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcatgtaaacagtctgt-gtaaaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaattgg 3771416  T
Q  311 tgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3771417 tgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccct 3771472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Original strand, 4979313 - 4979412
Alignment:
Q  43 catgttgctgattttggacttgctaagttcttgcaagataatgggaattcagaatgcatgtcttctattgctggttcttatggatatattgctccaggta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  4979313 catgttgctgattttggacttgccaagttcttgcaagattctggaacatctgaatgcatgtctgctattgctggttcatatggatacatagctccaggta 4979412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Original strand, 29334418 - 29334529
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  29334418 gaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccagaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaatgca 29334517  T
Q  355 ccgggttgccct 366  Q
    ||||| ||||||    
T  29334518 ccgggctgccct 29334529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575662
Alignment:
Q  252 tcctcgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||| ||||||||||||||  || | ||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagcttt 12575680  T
Q  349 ggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  12575679 ggtgcaccgggctgccct 12575662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Original strand, 20135627 - 20135739
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgc 353  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  20135627 gaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttcagtgc 20135726  T
Q  354 accgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||    
T  20135727 accgggttgccct 20135739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907913
Alignment:
Q  219 gttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccc 318  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaaggttgcatacaatacaccaaatggtgggaccc 22907915  T
Q  319 ct 320  Q
    ||    
T  22907914 ct 22907913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5873433 - 5873324
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5873433 gaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggctaagtacactacaccaattggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagctttagtgcatc 5873334  T
Q  357 gggttgccct 366  Q
    ||| ||||||    
T  5873333 gggatgccct 5873324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 25622533 - 25622593
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25622533 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccct 25622593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21784394 - 21784335
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  21784394 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccgagttgccc 21784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 359
Target Start/End: Original strand, 13774921 - 13774991
Alignment:
Q  289 ctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13774921 ctgcgcacaatacaccaaatggcaggatccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 13774991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323724
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatgg 310  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||   |||||||| || |||||| ||||||||  |||| ||||||||||  |||||| ||||| || ||| |    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24323763  T
Q  311 tgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  24323762 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagctttg 24323724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360348
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatgg 310  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||   |||||||| || |||||| ||||||||  |||| ||||||||||  |||||| ||||| || ||| |    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24360387  T
Q  311 tgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  24360386 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagctttg 24360348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24903855 - 24903705
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||  ||||||||  ||||||||| ||||  |||||  ||||||||  || ||||||| |||| | |    
T  24903855 ggtaaatttgttgtcacgtgactgaaaagtcatgggcacaagtcctgaaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaatt 24903756  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  24903755 ggtgagaccccttcccggacactgcatacgcgggaactttggtgcaccggg 24903705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028626
Alignment:
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 16028626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074584
Alignment:
Q  214 aagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtg 312  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||      
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacaccaaatggca 34074618  T
Q  313 ggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagct 346  Q
    || |||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  34074617 gggccccttcccaaaccctgcgtatgggggagct 34074584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 19438703 - 19438747
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19438703 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgact 19438747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 364
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801647
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 39801647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10634317 - 10634211
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||  |||    
T  10634317 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaaggctcggta 10634219  T
Q  296 caatacac 303  Q
     |||||||    
T  10634218 aaatacac 10634211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 340
Target Start/End: Original strand, 41425952 - 41426055
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgta 336  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | | ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||| |    
T  41425952 gtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccagactctgcgga 41426051  T
Q  337 tgcg 340  Q
    ||||    
T  41426052 tgcg 41426055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10306536 - 10306494
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10306536 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 10306494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12477205 - 12477132
Alignment:
Q  284 taaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  12477205 taaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggattctgcgtatgcaagagctttagtgcacc 12477132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30877623 - 30877566
Alignment:
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  30877623 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgccct 30877566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 366
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354260
Alignment:
Q  317 cccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 32354260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39079937 - 39079882
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtc 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  39079937 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtc 39079882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29184118 - 29184063
Alignment:
Q  311 tgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29184118 tgggactccttgtcagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 29184063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Original strand, 41956885 - 41956924
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41956885 tgaggggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcat 41956924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924840
Alignment:
Q  226 tgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttg 322  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||  ||||| | ||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||| ||| | |||||     
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttc 42924878  T
Q  323 ccgg--accctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    || |  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42924877 ccagacaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccgg 42924840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Original strand, 17419879 - 17419944
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagc 264  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17419879 ttggcgtaactggtaaaattgttgtaatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcctggaaacagc 17419944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11657785 - 11657701
Alignment:
Q  283 gtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||  | |||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  11657785 gtaaggctgcatacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcacacgcgggaactttagttcaccgggctgccct 11657701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21542529 - 21542489
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagct 346  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21542529 aatggtgggaccccttcccggactctgcgtatgcgggagct 21542489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794388
Alignment:
Q  275 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaaatagtgggatcccttcacagacccagcatatgcagaagctttagtgcaccgg 9794388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 291
Target Start/End: Original strand, 22025538 - 22025601
Alignment:
Q  229 gactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctg 291  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22025538 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 22025601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3176839 - 3176770
Alignment:
Q  283 gtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  3176839 gtaaggttgcgtacaatacaccaactggtgggacccc---ccggactctgtgtatgccggagctttagtgcac 3176770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10943900 - 10943847
Alignment:
Q  312 gggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10943900 gggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgccct 10943847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31694202 - 31694120
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| | || |||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  31694202 aaaaataggctaaagctgcatacaatacacctattgatgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggagatttagtgcacc 31694120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 354
Target Start/End: Original strand, 18426099 - 18426160
Alignment:
Q  293 gtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  18426099 gtacaatacatcgaatggtgagaccccttttcgaactctgcgtatgcgagagctttagtgca 18426160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 363
Target Start/End: Original strand, 18684366 - 18684403
Alignment:
Q  326 gaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18684366 gaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 18684403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  209 tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 300
Target Start/End: Original strand, 18698586 - 18698675
Alignment:
Q  209 tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 300  Q
    ||||||| | ||||||| |||| || |  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  18698586 tggtaaaatggttgtcacgtgattgaacggtcacgggttcaagtactgaaaacagcctcttgt--aaaaacaaggtacggctgcatacaata 18698675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 366
Target Start/End: Original strand, 19093894 - 19093946
Alignment:
Q  314 gaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  19093894 gacccctacccggaccctgcgtatgttggagctttagtgcaccgggctgccct 19093946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39079827 - 39079755
Alignment:
Q  293 gtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  39079827 gtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccatgtgtatacgggagttttagtgcacagggctgcc 39079755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8455497 - 8455318
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  8455497 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaa 8455398  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8455397 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgccct 8455318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 14530270 - 14530453
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14530270 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggt 14530369  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14530370 aaggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 14530453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671312
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaac-gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 9671232  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9671233 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 9671312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21779441 - 21779263
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  21779441 tgaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 21779343  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21779342 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 21779263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25079901 - 25079719
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacaggg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||  | ||||||| ||    
T  25079901 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaagg 25079802  T
Q  284 taaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  25079801 taaggatgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgccct 25079719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 10543653 - 10543833
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  10543653 aggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 10543752  T
Q  288 gctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10543753 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 10543833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25249915 - 25249740
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggct 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  25249915 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgtacaaacagggtaaggct 25249816  T
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25249815 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgccct 25249740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12024099 - 12023929
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12024099 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 12024000  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  || ||||||  ||||||||    
T  12023999 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatttggaagctttaatgcaccgg 12023929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 23397719 - 23397897
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  23397719 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaatagggtaa 23397817  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23397818 ggctacgtacaatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 23397897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 190 - 366
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514568
Alignment:
Q  190 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||||  ||||||    
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  289 ctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccct 11514568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200625
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  288 gctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgccct 24200625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 337
Target Start/End: Original strand, 22371010 - 22371158
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  22371010 tgaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt--aaaaacagggtaa 22371107  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtat 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22371108 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgtgtat 22371158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 225 - 366
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546296
Alignment:
Q  225 atgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttg 322  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 10546252  T
Q  323 ccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10546253 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 10546296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 366
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896393
Alignment:
Q  190 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  | ||||| ||||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgccct 17896393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 366
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444861
Alignment:
Q  225 atgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgcc 324  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacgatacaccaaatggtgggaccccttccc 14444819  T
Q  325 ggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14444820 ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccct 14444861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 200 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39914475 - 39914308
Alignment:
Q  200 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || |||||| |||||  |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  39914475 tggcgcatctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtaca 39914376  T
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39914375 atacaccgaatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccct 39914308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 366
Target Start/End: Original strand, 17623535 - 17623697
Alignment:
Q  205 caactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17623535 caactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17623634  T
Q  304 cgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||| ||||||| ||| | |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||    
T  17623635 caaatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgccct 17623697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 366
Target Start/End: Original strand, 17667973 - 17668135
Alignment:
Q  205 caactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17667973 caactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17668072  T
Q  304 cgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||| |||||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17668073 caaatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgccct 17668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841163
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| |||||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || ||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccct 5841163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573753
Alignment:
Q  194 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||  | |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgtataaacatggtaaggctgcg 27573680  T
Q  294 tacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  || ||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27573681 tacaatacaccaaatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgccct 27573753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 99434 - 99285
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  99434 ccttggcgcaacag-taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgta-aaaaacatggcaaggctgcgtac 99337  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  99336 aatacaccaaatggtggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagcttt 99285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24860157 - 24859992
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  24860157 cttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaacatggta-ggctgcgtaca 24860059  T
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24860058 atacaccaaatggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcc 24859992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977726
Alignment:
Q  190 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctc--ttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||    
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgta-aaaaataggataag 19977795  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  19977794 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcacc 19977726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871624
Alignment:
Q  250 agtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctgcgtatgcgggagcttta 36871607  T
Q  350 gtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||    
T  36871608 gtgcaccgggttgccct 36871624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Original strand, 44643486 - 44643656
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  44643486 ccttggcgcaa-tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgt 44643584  T
Q  295 acaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  44643585 acaatgtaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgccct 44643656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544199
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||| || || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  287 ggctgcgtacaata--caccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||| |||||  ||   |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgccct 14544199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416873
Alignment:
Q  209 tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| |     
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || |||||||| ||   ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40416931 tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccct 40416873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Original strand, 7214488 - 7214667
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaa 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  7214488 gaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaa 7214587  T
Q  287 ggctgcgtacaatacac--cgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||||||||||    ||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  7214588 ggctgcgtacaatacacaaaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcaccaggttgcc 7214667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4516522 - 4516354
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||   ||||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  4516522 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgta 4516424  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||    
T  4516423 caatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccgggctgccc 4516354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377076
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| | |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcaccaaat 21377133  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  21377132 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagcttt-gtgcaccgagctgccct 21377076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684630
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacag-cctcttgt--agaaaaacagggt 284  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  |||| |||||||  |||||| ||||||||  | ||||| | |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatactaaatggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccgg 26684630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 304
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705566
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaa-aacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc 304  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacacc 17705566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32781467 - 32781307
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaag 287  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||| || |||||| |||||||||   |||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  32781467 agggggaaccttggcgcaa-tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 32781369  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  32781368 actgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagctttg 32781307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 358
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641626
Alignment:
Q  219 gttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccc 318  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||   |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgtgaaaacagggtaaagttgcgtacaatacaccaaattgtgggaccc 25641586  T
Q  319 cttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  25641587 cttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccgg 25641626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450384
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatg 309  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaagg 5450362  T
Q  310 gtgggaccccttgccggaccct 331  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  5450363 gtgggaccccttcctggaccct 5450384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17380407 - 17380247
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||  | ||||||||||||| || || |    
T  17380407 ccttggcgcaa-tggcgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaacagggtaaggttgtgtgc 17380309  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17380308 aatacaccaaatgatggaaccccttcctggaccctgcggatgcgggagcttt-gtgcaccggg 17380247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 349
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795401
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgtac-aatacaccga 306  Q
    |||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggta-aaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc-t 33795358  T
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  33795359 atggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagctttg 33795401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40762346 - 40762236
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40762346 gaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcac 40762247  T
Q  356 cgggttgccct 366  Q
    |||||||||||    
T  40762246 cgggttgccct 40762236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158459
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-- 307  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||      
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgta-aaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaa 31158500  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31158499 tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttt 31158459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615116
Alignment:
Q  223 tcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggacccc 319  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||   ||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  320 ttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 19615116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Original strand, 25632550 - 25632642
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25632550 aaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 25632642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 355
Target Start/End: Original strand, 24890452 - 24890533
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24890452 aaaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235820
Alignment:
Q  211 gtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||| || || ||||||||||| |||  |||||||  |||    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacacaaaat 45235877  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||| |||  |||||||    
T  45235876 ggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtgtaccaagttgccc 45235820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||| |  |||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23145758  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccc 330  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  23145757 ggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||| |  |||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23557548  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccc 330  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  23557547 ggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31821491 - 31821363
Alignment:
Q  219 gttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccc 318  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  31821491 gttgttatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccgtgtgta-aaaaatagggtaaggttgtgtacaatacaccaaatgatgggaccc 31821393  T
Q  319 cttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  31821392 ctttccgaaacctgtgtatgcgggagcttt 31821363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Original strand, 44604826 - 44604907
Alignment:
Q  206 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  44604826 aactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaag 44604907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39189605 - 39189557
Alignment:
Q  185 attgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189605 attgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg 39189557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Original strand, 30826060 - 30826158
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  30826060 gaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggt-ggaacccttcccagaccctacatatgcgggagctttagtgcacc 30826158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579751
Alignment:
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 40579751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296408
Alignment:
Q  243 gggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcg 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||  ||||||||||||||| |    
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaaaatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgtg 15296434  T
Q  341 ggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | ||||||||||| || || ||||||    
T  15296433 gaagctttggtgcgccaggctgccct 15296408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 363
Target Start/End: Original strand, 23488556 - 23488613
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23488556 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgc 23488613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39499331 - 39499242
Alignment:
Q  267 cttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39499331 cttgtataaaaatagggtaaagctgcgtacaatacatcaaatggtgggatcccttttcgaatcctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 39499242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13245181 - 13245097
Alignment:
Q  282 ggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  13245181 ggtaaggctgcgtacattacactaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatacgggagctttagtgtatcgggttgccct 13245097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409995
Alignment:
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 41409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 44449529 - 44449407
Alignment:
Q  223 tcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggtgggacccct 320  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||| ||||  ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  44449529 tcatgtaactgaaaggtcacgagttcaa-tcctaaaaacaacctcttgaatgaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaaatagtgggacccct 44449431  T
Q  321 tgccggaccctgcgtatgcgggag 344  Q
    | ||||||||||||| || |||||    
T  44449430 tcccggaccctgcgtttgtgggag 44449407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 366
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080234
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgccct 34080234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 366
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766388
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttccct 34766388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30864528 - 30864427
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || || || ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30864528 gaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaagggtgcgtacaatataccaaatggtaagatcctttcccaaaccctgcgtatgcggaagcttcggtgcacc 30864429  T
Q  357 gg 358  Q
    ||    
T  30864428 gg 30864427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 358
Target Start/End: Original strand, 17471552 - 17471675
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt--agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcg 334  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||| || |||||||| || ||||||||     
T  17471552 gtcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaatgatgagaccccttccctgaccctgcc 17471651  T
Q  335 tatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  17471652 tatgcgggagttttagtgcaccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2003678 - 2003592
Alignment:
Q  228 tgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtg 312  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2003678 tgactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaacaaatggtg 2003592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Original strand, 22371202 - 22371245
Alignment:
Q  323 ccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22371202 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 22371245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419949
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagg----gtaaggctgcgtacaatacacc 304  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 124959 - 124918
Alignment:
Q  323 ccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  124959 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 124918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 366
Target Start/End: Original strand, 8575975 - 8576028
Alignment:
Q  313 ggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8575975 ggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccaggttgccct 8576028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27466311 - 27466266
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27466311 gaggcgtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg 27466266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44521544 - 44521393
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||||| || | ||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||| ||    
T  44521544 ccttggcggaac-ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcata 44521446  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
     |||||||| ||||| |||| ||||| || |||  ||| ||| ||||||||||    
T  44521445 taatacaccaaatggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagcttt 44521393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24059067 - 24059016
Alignment:
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24059067 aatacaccatatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgtgggagcttt 24059016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 365
Target Start/End: Original strand, 31525771 - 31525838
Alignment:
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  31525771 atacaccaaatgatgggaccctttgccagaccctgcatatgcgggagctttagtgtaccggattgccc 31525838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Original strand, 35017781 - 35017942
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac-tgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaa----cagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctg 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||  |||    ||||||| | || ||| ||| |||||   ||    
T  35017781 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctgaaaacagccagcctcatataaaaagacatggtaaaattg 35017879  T
Q  292 cgtacaatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35017880 cctacaatacaccaaaatggtgggacccc-tgccagactctgcgtatgc-ggagctttagtgcac 35017942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3633762 - 3633710
Alignment:
Q  314 gaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3633762 gaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccct 3633710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 4795730 - 4795888
Alignment:
Q  211 gtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||| ||||| |  |||||||||| |  ||| ||||||| | | || |||||| |||||||||  ||    
T  4795730 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaagtcacttgttgaagtcttgaaaacagcctcatgcgtaaaaaaacaagattagactgcgtgcaatacaccaaaa 4795829  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||  || ||||||| || |||||| | |||||| |||||  ||||||||||    
T  4795830 tggtgggaccttttcccggaccttgtgtatgccgaagctttagtgcagtgggttgccct 4795888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12315782 - 12315699
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacccctt 321  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  12315782 gtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttattaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaaatagtgagactcctt 12315699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 17472926 - 17473008
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| || || |||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||    
T  17472926 aggggtaaccttgacgcaactaataaagttgttgtcaaatgattgaaaggtcacgggttcaggtcttagaaatagcctattgt 17473008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19185805 - 19185763
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19185805 aatggtggaaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt 19185763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 1289095 - 1289156
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagc-tttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  1289095 aatggtgggaccccttcccggatcatgcatatgcgggagcttttagtgcaccggattgccct 1289156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4852388 - 4852312
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||| | || |||| |||||||||||||  |||||| |||||||    
T  4852388 ggtaaccttggtgcaactggcaaagttgt---catgtgaccgaaaagtcaggggttcaagtcctgcaaacagtctcttgt 4852312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39499390 - 39499341
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcac 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||    
T  39499390 gtaatcttggcgcaactggtaaagttgttatcatgtgattttaaggtcac 39499341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23053007 - 23052967
Alignment:
Q  326 gaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  23053007 gaccctgcgtatgcaggagcttttgtgcaccgggctgccct 23052967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 94)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34725278 - 34725100
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34725278 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 34725180  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34725179 ggctgcgtacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 34725100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 188 - 365
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991959
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccc 46991959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247955
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgccct 46247955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32632737 - 32632559
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32632737 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 32632638  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  32632637 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttccct 32632559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38478461 - 38478284
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38478461 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaag 38478363  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38478362 gctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 38478284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 18944620 - 18944802
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18944620 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 18944719  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagc-tttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18944720 ggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccct 18944802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 27474257 - 27474436
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  27474257 tgaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggcaa 27474356  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27474357 agctgcgtacaatacactgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccct 27474436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 14617014 - 14617194
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaa-aacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  14617014 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggta 14617113  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14617114 aggttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttaccct 14617194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395728
Alignment:
Q  194 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  293 gtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccct 30395728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20004273 - 20004092
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  20004273 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgta-aaaaacaaggta 20004175  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20004174 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 20004092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23768498 - 23768325
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggc 289  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23768498 gggtaacctcgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 23768399  T
Q  290 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  23768398 tgcgtacaatacaccaaatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagcggattgc 23768325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 365
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402251
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggt--aagg-c 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||  |    
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggttcaagttc 45402175  T
Q  290 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45402176 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 45402251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 356
Target Start/End: Original strand, 47214488 - 47214655
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  47214488 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgt-ttaaaacagggtaag 47214586  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  47214587 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 47214655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 10668197 - 10668383
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-----ctgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cag 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||     
T  10668197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaa 10668296  T
Q  282 ggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10668297 ggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 10668383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 207 - 364
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925254
Alignment:
Q  207 actggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacaccg 6925195  T
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6925196 aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgcc 6925254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 366
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414593
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctg 291  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttat-gtaaaacaggttaaggctg 19414518  T
Q  292 cgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19414519 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 19414593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45812716 - 45812541
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  45812716 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgt-gtaaaagagggtaag 45812618  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45812617 gctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 45812541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 27201623 - 27201805
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||    
T  27201623 tgaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggta 27201722  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  27201723 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgccct 27201805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6983980 - 6983813
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||    
T  6983980 ccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcgtata-aaaaacagggtaagtatgcgtac 6983883  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6983882 aatacaccaaatggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgccct 6983813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 349
Target Start/End: Original strand, 11596501 - 11596651
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  11596501 cttggcgcaac-ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtata 11596599  T
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11596600 atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttg 11596651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 185 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41319990 - 41319808
Alignment:
Q  185 attgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacaggg 283  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||    
T  41319990 attgaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaggg 41319891  T
Q  284 taaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  41319890 taaggctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgccct 41319808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 225 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253189
Alignment:
Q  225 atgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgcc 324  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 35253231  T
Q  325 ggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  35253230 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgccct 35253189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126839
Alignment:
Q  194 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcg 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||| || |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcg 12126912  T
Q  294 tacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  12126911 tacaatacaccaaattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgccct 12126839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 188 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22930248 - 22930104
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  22930248 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaacagggtaag 22930149  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgc 333  Q
    | || | |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  22930148 gttgtg-acaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgc 22930104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 8197019 - 8197199
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||  |||||||||   ||||||| ||||    
T  8197019 tgaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggta 8197118  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  8197119 aggctacgtacagtacaccaaatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgccct 8197199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 198 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18724715 - 18724564
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  18724715 cttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtac 18724617  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18724616 aatacaccaaatcttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttg 18724564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741959
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcct-cgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggtaaggc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || |  ||||||| || |||  || ||||||||||||||||    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  290 tgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttccct 18741959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2435958 - 2435796
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||    
T  2435958 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgta 2435860  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  2435859 caatacaccaaaatggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Original strand, 4349702 - 4349794
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4349702 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 4349794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19932934 - 19932755
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct-tgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  | || ||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  19932934 tgaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacctttgtgta-aaaaacagggta 19932838  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  || | || ||||||| |||||||||    
T  19932837 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcaccaggttgccct 19932755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Original strand, 9939443 - 9939620
Alignment:
Q  194 taaccttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaa-aaacagggtaaggctg 291  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||| ||||||| ||    
T  9939443 taaccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttg 9939542  T
Q  292 cgtacaatacacc--gaatggtggga-ccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| |||||||||   |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9939543 cgtgcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttaccct 9939620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 366
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005281
Alignment:
Q  227 gtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgc 323  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| |    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcc 35005238  T
Q  324 cggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35005239 cggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgccct 35005281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117774
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacc--ga 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgt-atgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccggg 35117774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44485290 - 44485119
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggta 285  Q
    ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||| |||||| || |||||  |||| ||| ||||    
T  44485290 tgagggggagccttggcgcaacag-taaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggta 44485192  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44485191 aggctgcgtacaatacaccaaatggttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagcttt-gtgcaccggg 44485119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468285
Alignment:
Q  211 gtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatg 309  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatg 25468322  T
Q  310 gtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagct 346  Q
    || ||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  25468321 gttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagct 25468285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382216
Alignment:
Q  252 tcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggt 351  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  |    
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttact 31382231  T
Q  352 gcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||||||||    
T  31382230 gtaccgggttgccct 31382216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 359
Target Start/End: Original strand, 20036208 - 20036369
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| | | | ||||||||  |||||     
T  20036208 cttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgtt 20036306  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  20036307 caatacaccaaatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggag-ttttgtgcaccggg 20036369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 319
Target Start/End: Original strand, 33222971 - 33223093
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  33222971 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggaaaggttgcgtaca 33223070  T
Q  298 atacacc-gaatggtgggacccc 319  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  33223071 atacaccaaaatggtgggacccc 33223093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 356
Target Start/End: Original strand, 19701557 - 19701717
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| || |||    
T  19701557 ccttggcgcaacag-taaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggta 19701655  T
Q  296 caatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19701656 caatacaccaaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 19701717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Original strand, 50811926 - 50812096
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||| ||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  50811926 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgt 50812024  T
Q  295 acaatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  50812025 acaatacaccaaaatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgccct 50812096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10378896 - 10378738
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||||         ||   ||||||||||||||||||||||    
T  10378896 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaa---------gtgagaaaacagggtaaggctgcgtac 10378807  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10378806 aatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccc 10378738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 364
Target Start/End: Original strand, 35019217 - 35019383
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || ||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||    
T  35019217 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcata 35019315  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  35019316 caatacaccaattggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgcc 35019383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31442515 - 31442396
Alignment:
Q  245 gttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgg 341  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||    
T  31442515 gttcaagtcttagaaacagccttttatgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgg 31442416  T
Q  342 gagctttggtgcaccgggtt 361  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31442415 gagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4430207 - 4430080
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |  ||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  4430207 gagggttaatcttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaa 4430108  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtggg 314  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
T  4430107 gactgcgtacaatacaccaaatggtggg 4430080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17470517 - 17470361
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17470517 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 17470419  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| || || || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  17470418 caatacaccaaaatagtgggacccgtt-cctga-cctgcgtatgtgggagctttagtgca 17470361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15511322 - 15511150
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcg-- 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||   || ||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||      
T  15511322 ccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgga 15511224  T
Q  294 tacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  15511223 tacaatacaccaaaatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgccct 15511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 263
Target Start/End: Original strand, 34714598 - 34714675
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacag 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||    
T  34714598 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacag 34714675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1517405 - 1517313
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1517405 aaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgccct 1517313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 364
Target Start/End: Original strand, 22327086 - 22327250
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||    
T  22327086 ccttggcgcaac-ggcaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgta 22327184  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    | || ||||  |||||||||     || ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22327185 cgatgcaccaaaatggtggg----gttcccgaactctgtgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgcc 22327250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 349
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505703
Alignment:
Q  278 acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttg 15505703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325050
Alignment:
Q  243 gggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcg 340  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||  |||| | || |||||||||||||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgt-cccgaccctgcgtatgcg 22325023  T
Q  341 ggagctttggtgcaccgggttgccctg 367  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||    
T  22325024 ggagctttagtgcaccaggctgccctg 22325050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304209
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgccct 42304209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Original strand, 23371111 - 23371271
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||   |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||  ||| |||| || ||||    
T  23371111 ccttggcgcaacag-taaagttgttttcgcatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaacgggcaaggttgtgtac 23371209  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  23371210 aatacaccaaatgctgggacccctt-ccagaccctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 366
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768295
Alignment:
Q  276 aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgccct 43768295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 255
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424786
Alignment:
Q  190 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Original strand, 23796511 - 23796621
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23796511 gaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagtgcac 23796610  T
Q  356 cgggttgccct 366  Q
    |||| ||||||    
T  23796611 cgggctgccct 23796621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 289
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290244
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaa--acagcctcttgt-agaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 25290242  T
Q  288 gc 289  Q
    ||    
T  25290243 gc 25290244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272383
Alignment:
Q  221 tgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacccct 320  Q
    ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||          
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacatggtaaggctgcgtacagcacatcaaatggtggg------ 31272429  T
Q  321 tgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  31272428 ttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtggactgggctgccct 31272383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 365
Target Start/End: Original strand, 52910204 - 52910379
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||    
T  52910204 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgt 52910302  T
Q  295 acaatacaccga------atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    |||||||||| |      ||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||| |||| ||||||| || |||||    
T  52910303 acaatacacctaatggttatggtgggaccccttcctggaacctccgtatgtgggaactttagtgcaccaggctgccc 52910379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20999944 - 20999852
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20999944 aaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacaccaaatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgccct 20999852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 50606499 - 50606559
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50606499 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 50606559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 50760397 - 50760290
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtaga-aaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  50760397 ccttggcgcaaa-ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgta 50760299  T
Q  296 caatacacc 304  Q
     ||||||||    
T  50760298 taatacacc 50760290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18335465 - 18335308
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggct 290  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| || |||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||||||| | |    
T  18335465 ggtaaccttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagtt 18335366  T
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||| || |  |||| || |||| ||||||||||    
T  18335365 gcgtacaatacatcaaatgatgggaccctttcctagaccatgtgtatacgggagcttt 18335308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19974221 - 19974076
Alignment:
Q  222 gtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggtgggacccct 320  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||||  ||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |    
T  19974221 gtcacgtgactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaatagggcaaggttgcgtacaatacaccaaaatgatgggacccat 19974122  T
Q  321 tgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  19974121 tcccggactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgccct 19974076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 338
Target Start/End: Original strand, 21723730 - 21723811
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatg 338  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||  || ||||||||||||||||    
T  21723730 gaaacagcctcttgtataaaaatagggtaaggctgagtacaatacaccaaatggtagaaccttttcccggaccctgcgtatg 21723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45264524 - 45264411
Alignment:
Q  245 gttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcggg 342  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  45264524 gttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaaaatggtgggaccccttctcagaccctgcatatgcggg 45264425  T
Q  343 agctttggtgcacc 356  Q
    |||||| |||||||    
T  45264424 agctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34679388 - 34679216
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||| | |||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||     
T  34679388 ttggcgcaac-ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtact 34679290  T
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggac----cctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccctg 367  Q
    ||||| | ||||||||  |||| | || |||    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  34679289 atacatcaaatggtggagccccgttccagacccggcctgcgtatgcgggagctttagtacaccgggctgccctg 34679216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 311
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564445
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| || || ||| | | |||||||| | |||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggt 311  Q
    | |||||||||| |||| ||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaaatggt 24564445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 349
Target Start/End: Original strand, 30682845 - 30682951
Alignment:
Q  242 cgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgg 341  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||| ||||||  || ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30682845 cgggttcaaatcctgaaaatagcctcttgtgtaaaaacaaggtaagattgtgtaca-tacaacaaatggtgggaccccttcccggaccgtgcgtatgcgg 30682943  T
Q  342 gagctttg 349  Q
    ||||||||    
T  30682944 gagctttg 30682951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4587630 - 4587568
Alignment:
Q  301 caccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4587630 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgc 4587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20982849 - 20982773
Alignment:
Q  269 tgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagc 345  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  20982849 tgtaaaaaaatagggtaaggctgccaacaatacacctaatggtgggatctcttctcggaccctgcgtatgcgggagc 20982773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214961
Alignment:
Q  211 gtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-t 308  Q
    |||||||| |||||| ||||||  || ||| |  |||||||| || |||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||  || || |    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaaaat 39215018  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||    
T  39215017 ggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgccc 39214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21910743 - 21910673
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagc 345  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||    
T  21910743 aaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctacgt-tgcgggagc 21910673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 269
Target Start/End: Original strand, 22151495 - 22151562
Alignment:
Q  202 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt 269  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  22151495 gcgcaactgataaagttgttgtcatctgactgtaaggtcataggttcaagttctggaaacagcctctt 22151562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27136823 - 27136673
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || || | |||| |||||||| || | |||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||||||    
T  27136823 ccttggcacaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgta 27136725  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagct 346  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |  || | || |||||||||||||    
T  27136724 caatacaccaaaatggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggagct 27136673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2436064 - 2435995
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctc 267  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2436064 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctc 2435995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4430080 - 4430014
Alignment:
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgc 353  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  4430080 ggctgcgtacaatacaccaaatggtggaacccctttctggatcctgtgtatgcgggagctttagtgc 4430014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 21723642 - 21723723
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  21723642 aggggtaaccttcgcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaagttc-agtcctggaaacagcctcttgt 21723723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 30555211 - 30555264
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30555211 aatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 30555264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 6358185 - 6358260
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||    
T  6358185 aaaatcagggtaaagctgcgtacaaaacaccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcaggatcttt 6358260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33594191 - 33594144
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33594191 tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 33594144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249463
Alignment:
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagcttt 4249463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249787
Alignment:
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagcttt 4249787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250111
Alignment:
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagcttt 4250111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Original strand, 10163736 - 10163777
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10163736 gaggggtaacattggcgcaactgataaagttgttgtcatgtg 10163777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49722726 - 49722593
Alignment:
Q  215 agttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtggg 314  Q
    ||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| || || ||||||||  ||||||||||| |  || ||||||     
T  49722726 agttgttgtcacgtgaatgaaaggtcacgggtttaagtcatgtaaacaacctcttgtaaaataatagggtaagattgcgtacaatatattgattggtgga 49722627  T
Q  315 accccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||| ||  ||| |||||||| || ||||||    
T  49722626 accccttcccaaaccttgcgtatgtggcagcttt 49722593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14988084 - 14987989
Alignment:
Q  204 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||  |||||||||||  ||||||  |||| |  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  14988084 gcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaagtcacaagttcaagtcctgaaaacagtatcttatgtaaaatacaggataaggctgcgtacaa 14987989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20169175 - 20169109
Alignment:
Q  282 ggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||| ||| ||||||||| || |  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20169175 ggtaagactgtgtacaataccccaatcggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt 20169109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25554893 - 25554820
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  25554893 ccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgt 25554820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 354
Target Start/End: Original strand, 43207558 - 43207640
Alignment:
Q  273 gaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  43207558 gaaaaacagggtaagacggcatacaatacaccaaattggtgggacctcttcccagaccctatgtatgcgagagctttagtgca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 359
Target Start/End: Original strand, 46859130 - 46859216
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||  | | || |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  46859130 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaatggtgggactcattttcaggccttgcgtatgtgggagttttagtgcaccggg 46859216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 215
Target Start/End: Original strand, 4349675 - 4349703
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4349675 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaa 4349703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 252
Target Start/End: Original strand, 21006125 - 21006185
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagt 252  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||    
T  21006125 ggtaaccttgacgcaaccggtaaaattgttgtcatgcgactgaaaggtcaaaggttcaagt 21006185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25554796 - 25554752
Alignment:
Q  314 gaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25554796 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcattagtgcaccgg 25554752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21172188 - 21172011
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21172188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaag 21172090  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21172089 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 21172011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 32758213 - 32758392
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32758213 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggta 32758311  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32758312 aggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 32758392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2541207 - 2541021
Alignment:
Q  182 ttcattgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacg-tcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-c 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |    
T  2541207 ttcattgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaac 2541108  T
Q  280 agggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2541107 agggtaaggctgcgtactatacaccaaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttccct 2541021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 168 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35335014 - 35334818
Alignment:
Q  168 tatataaaatcattttcattgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctc 267  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  35335014 tatataaactcagtttcat-gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctc 35334916  T
Q  268 ttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  35334915 gtgta-aaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48735303 - 48735124
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcg-aaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  48735303 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgt-gtaaaacacggta 48735205  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48735204 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 48735124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 195 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10693245 - 10693075
Alignment:
Q  195 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  10693245 aaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaagagggtaaggctgcgt 10693147  T
Q  295 acaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  10693146 acaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgccct 10693075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 42805477 - 42805659
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  42805477 tgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 42805576  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42805577 aggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 42805659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716594
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 47716594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464009
Alignment:
Q  194 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcg 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgtaaaaactgggtaaggctgcg 40463936  T
Q  294 tacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  40463937 tataatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgccct 40464009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 42798623 - 42798802
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||   ||||||| |||||    
T  42798623 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 42798722  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  42798723 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgccct 42798802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34626389 - 34626210
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| | |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  34626389 tgaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaacagggtaa 34626290  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  34626289 ggctgcgttcaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgccct 34626210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11617762 - 11617590
Alignment:
Q  195 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcg 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  11617762 aacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 11617663  T
Q  294 tacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  11617662 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccct 11617590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 43557426 - 43557608
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  43557426 gaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 43557525  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagc-tttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43557526 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccct 43557608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391102
Alignment:
Q  216 gttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtggga 315  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 42391153  T
Q  316 ccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42391152 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 42391102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 366
Target Start/End: Original strand, 27629596 - 27629767
Alignment:
Q  196 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  27629596 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgt 27629695  T
Q  295 acaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  27629696 aaaatacaccaaatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgccct 27629767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 238 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18512583 - 18512454
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtat 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18512583 gtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtat 18512484  T
Q  338 gcgggagctttggtgcaccgggttgccctg 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18512483 gcgggagctttggtgcactgggttgccctg 18512454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 208 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871914
Alignment:
Q  208 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaa 33871971  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  33871970 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgcc 33871914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28078313 - 28078152
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  28078313 tgaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgtaaaaaaacagggtaa 28078214  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    || ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||    
T  28078213 ggttgcatgcaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagcttt 28078152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19427059 - 19426892
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||    
T  19427059 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtaca 19426960  T
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  19426959 atacaccaaatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgccct 19426892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47078034 - 47077859
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| || ||||     
T  47078034 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgt-gtaaaatagagtaaa 47077936  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  47077935 gttgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggattgcc 47077859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 339
Target Start/End: Original strand, 46354148 - 46354302
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  46354148 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46354247  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgc 339  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  46354248 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 42476826 - 42477004
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| | |||||| |||||    
T  42476826 tgaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgt-gtaaaacaaggtaa 42476924  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | | |||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  42476925 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 42477004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 366
Target Start/End: Original strand, 19265781 - 19265946
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| | || |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  19265781 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgtaaaaagagggtaaggctgcgtacaa 19265879  T
Q  299 tacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19265880 tacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgccct 19265946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22699151 - 22698969
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| |||| || |||||||   |||||||||||||    
T  22699151 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 22699052  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  22699051 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 22698969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 13805057 - 13805217
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacaggg-taa 286  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||| |||    
T  13805057 gagggggagccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggt-gtaaaacaggggtaa 13805154  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13805155 ggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagctttg 13805217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 39123857 - 39124018
Alignment:
Q  200 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggt----aaggctgcgta 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||    |||||||||||    
T  39123857 tggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaacagggtagggaaggctgcgta 39123955  T
Q  296 caatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcacc 356  Q
     ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39123956 aaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcacc 39124018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 238 - 366
Target Start/End: Original strand, 7879642 - 7879771
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgta 336  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7879642 gtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgta 7879741  T
Q  337 tgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7879742 tgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 7879771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42496017 - 42495916
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42496017 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaacagggtaa 42495918  T
Q  287 gg 288  Q
    ||    
T  42495917 gg 42495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662958
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaatagggtaag 2663016  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagct 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  2663015 gctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttttcagaccctgcatatgcgggagct 2662958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732831
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcct--cttgtagaaaaacagggtaaggc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgta-aaaaacagggtaaggc 14732901  T
Q  290 tgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    ||||| |||||||||   |||||||  || |||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  14732900 tgcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccgg 14732831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28362316 - 28362155
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |  ||||||||||||||    
T  28362316 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgta 28362218  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28362217 caatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagcttt-gtgcaccggg 28362155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 291
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327091
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaagg 18327088  T
Q  289 ctg 291  Q
    |||    
T  18327089 ctg 18327091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23419845 - 23419676
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  23419845 ccttggcgcaac-ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 23419747  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  23419746 caatacaccaaatggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcgggctgccct 23419676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907551
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgt--catgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-g 305  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| || |||||||||||| |||||||||      
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29907493 aatggtgggaccccatcccggaccct--gtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 29907551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 366
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741926
Alignment:
Q  213 aaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtg 312  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||| ||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagt-gtaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 11741872  T
Q  313 ggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| ||||| |||||  ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11741873 ggatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 11741926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 347
Target Start/End: Original strand, 19266414 - 19266564
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||  ||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  19266414 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgta-aaaaacagggtaaggctgcgt 19266511  T
Q  295 acaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctt 347  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19266512 acaatacaccaaattgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 19266564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Original strand, 38604550 - 38604654
Alignment:
Q  257 gaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt-ggtgcac 355  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  38604550 gaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcac 38604649  T
Q  356 cgggt 360  Q
    |||||    
T  38604650 cgggt 38604654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48123655 - 48123502
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaa-aacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||| ||    
T  48123655 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcata 48123557  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttgg 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  48123556 caatacaccaaatggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggaggtttgg 48123502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747620
Alignment:
Q  220 ttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacc 317  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaattggtgggacc 18747571  T
Q  318 ccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18747572 ccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgccct 18747620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 285 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27889399 - 27889318
Alignment:
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27889399 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgccct 27889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148960
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||  |||||  |||  ||||| |||||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 354  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||| ||| ||| |||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaga-cttgcgtatgcgagagttttagtgca 8148960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 238 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31591238 - 31591111
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtat 337  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  31591238 gtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgt-gtaaaacagagtaaggctgcgtacaatacaataaatggtgggaccccttcccggaccttgcatat 31591140  T
Q  338 gcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31591139 gcgggagctctagtgcaccgggttgccct 31591111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6737020
Alignment:
Q  211 gtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatgg 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtataaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaaatgg 6736966  T
Q  311 tgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | ||| || || ||||||| |||||| |  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  6736967 t-ggagcctttcccggaccttgcgtacgaaggaccttt-gtgcaccgggctgccct 6737020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 271
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193122
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgt 7193122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099030
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14099066  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggag 344  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  14099065 ggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggag 14099030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409047
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14409083  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggag 344  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  14409082 ggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggag 14409047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787271
Alignment:
Q  259 aacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcaccgg 35787279  T
Q  359 gttgccct 366  Q
    ||||||||    
T  35787278 gttgccct 35787271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341412
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaa 307  Q
    |||||||||||| ||||||   || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaaaa 16341353  T
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| || ||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16341354 tggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgccct 16341412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262198
Alignment:
Q  225 atgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgc 323  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  | ||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacaccaaatgatgggaccccttcc 38262241  T
Q  324 cggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38262240 cgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccct 38262198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3469350 - 3469177
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt---agaaaaacagggtaaggctgcg 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||  |||||||   | |||||||||||| || ||||    
T  3469350 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcg 3469252  T
Q  294 tacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3469251 tacaatacaccaaaaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccct 3469177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180221
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  288 gctgcgtacaatacacc 304  Q
     ||| |||||| |||||    
T  5180237 actgtgtacaacacacc 5180221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794582
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt---agaaaaacagggtaaggc 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaaaaacagggtaaggc 7794583  T
Q  290 t 290  Q
    |    
T  7794582 t 7794582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 12473257 - 12473375
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  12473257 tgaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggta 12473356  T
Q  286 aggctgcgtacaatacacc 304  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  12473357 aggatgcgtacaatacacc 12473375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233137
Alignment:
Q  217 ttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggac 316  Q
    |||||||||  |||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||     
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggcagcgtatattacaccaaatggtgggat 32233187  T
Q  317 cccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||| ||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32233186 tccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgccct 32233137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 343
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645066
Alignment:
Q  209 tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-ga 306  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||   ||||||||||||||  |    
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaaa 7645030  T
Q  307 atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcggga 343  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7645031 attgtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcggga 7645066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Original strand, 23231573 - 23231690
Alignment:
Q  250 agtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23231573 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 23231672  T
Q  349 ggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||||||| ||| ||||    
T  23231673 agtgcaccgagtttccct 23231690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 364
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408588
Alignment:
Q  246 ttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggag 344  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |     
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcagaat 1408568  T
Q  345 ctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||| || |||||| |||||    
T  1408569 ctttagttcaccggattgcc 1408588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42102056 - 42101899
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||   ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||    
T  42102056 ccttggcacaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgta-aaaaacagggtaacactgcgt 42101959  T
Q  295 acaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgc 353  Q
    ||| ||| |  || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  42101958 acagtactctaaagtggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1424085 - 1423974
Alignment:
Q  194 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgc 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||    
T  1424085 taactttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgc 1423986  T
Q  293 gtacaatacacc 304  Q
     |||| ||||||    
T  1423985 atacactacacc 1423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566562
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgt 335  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||  ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||| |    
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaaaatggtaggaccccttcccgaaccctgcat 21566538  T
Q  336 atgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  21566539 atgcgggagctttagtgcaccggg 21566562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44123792 - 44123642
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| |      
T  44123792 ccttggtgcaac-ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggttgcatga 44123694  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||||  ||  |||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  44123693 aatacaccatataatgggacccgttctcggacactgcgtatgcaggagcttt 44123642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 363
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198856
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttc---aagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||| ||   ||||| | ||||||| || |  |||| ||||||| ||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    || | ||||| ||| |||  |||||| ||| ||||| || |||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  25198779 agaccgcgtataatgcactaaatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgc 25198856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45019010 - 45018925
Alignment:
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaa----tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| ||| ||    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45019010 aaggctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccct 45018925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 271
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447627
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || || ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgt 21447627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23066019 - 23065927
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23066019 aaaaacaggataaagttgcgtacaatacaccatatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccggattgccct 23065927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 343
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500625
Alignment:
Q  276 aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcggga 343  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 366
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065720
Alignment:
Q  209 tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || |||| | ||||||||  | |||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||    
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaaatagggtaaagctgcatacaataaagcaaat 22065662  T
Q  309 ggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
     ||| |||||||| ||| ||  || |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  22065663 agtgagaccccttcccgaactatgtgtatgcaggagttttagtgtaccgggctgccct 22065720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36267900 - 36267827
Alignment:
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccc-cttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36267900 aggctgcgtacaatacaccaaatggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgg 36267827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15108527 - 15108427
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtat 337  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||  |||||| ||||    
T  15108527 gtcacgagttcaagtcctggaaacagtttcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatcaaatagtgggatcccttcccaaaccctgtgtat 15108428  T
Q  338 g 338  Q
    |    
T  15108427 g 15108427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 326 - 366
Target Start/End: Original strand, 36602540 - 36602580
Alignment:
Q  326 gaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36602540 gaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 36602580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23619070 - 23618979
Alignment:
Q  275 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| |||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23619070 aaaacagagtaagcttgtgtacaatacatcaaatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcagcgggttgccct 23618979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29140538 - 29140487
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcac 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  29140538 gggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcac 29140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13792257 - 13792152
Alignment:
Q  261 cagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 359  Q
    ||||||| |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  13792257 cagcctcgtgta-aaaaacttggtaagactgcatacaatacacccaaatggcgggaccccttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccgag 13792159  T
Q  360 ttgccct 366  Q
     ||||||    
T  13792158 ctgccct 13792152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139761
Alignment:
Q  265 ctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    |||||||  |||||||| |||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaacagagtaaggttggatacagtacaccaaatggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 348
Target Start/End: Original strand, 35203443 - 35203556
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcg 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||   ||||||||| |||| |||||||||||| |||   |||||||||| ||||| | | || || ||    
T  35203443 gtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcctgaactctacg 35203542  T
Q  335 tatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||||||||||    
T  35203543 tatgcgggagcttt 35203556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 252
Target Start/End: Original strand, 5814424 - 5814489
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagt 252  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  5814424 tgagaggttaccttggcgcaatcggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagt 5814489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42495913 - 42495865
Alignment:
Q  317 cccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  42495913 cccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccccgttgccc 42495865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45019056 - 45019012
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  45019056 aggggtaaccttggcgcaactggtaaaggtcctgtcatgtgactg 45019012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 276 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093441
Alignment:
Q  276 aaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacaccataatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccgggctgccct 39093441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 366
Target Start/End: Original strand, 11888414 - 11888470
Alignment:
Q  310 gtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  11888414 gtgggacccctttctggaccctgtgtatgcaggagcttcagtgcactgggttgccct 11888470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 357
Target Start/End: Original strand, 25434112 - 25434144
Alignment:
Q  325 ggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25434112 ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 25434144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347095
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgt-gtaaaacagggtaag 1347016  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1347017 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 1347095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354759
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaag 1354838  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1354837 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 1354759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29356040 - 29355857
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaag-ttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaa-aaacagggt 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||    
T  29356040 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 29355941  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29355940 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 29355857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12222088 - 12221916
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  12222088 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 12221989  T
Q  297 aatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagc-tttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12221988 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccct 12221916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 9161076 - 9161257
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9161076 tgaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaa 9161175  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  9161176 ggctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccct 9161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815084
Alignment:
Q  190 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||   ||||| | |||| |     
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  289 ctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggtt 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941988
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaa 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| || ||||| |  ||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  287 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | || ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgccct 1941988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866041
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggta 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagta-aaaaacagggta 15866120  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||| | ||||||||    
T  15866119 aagctgcgt--aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcactgagttgccct 15866041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2166587 - 2166412
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctg 291  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||    
T  2166587 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2166489  T
Q  292 cgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2166488 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgccct 2166412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2178220 - 2178045
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctg 291  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||    
T  2178220 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2178122  T
Q  292 cgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2178121 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgccct 2178045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 301
Target Start/End: Original strand, 8409196 - 8409311
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  8409196 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggta 8409295  T
Q  286 aggctgcgtacaatac 301  Q
    ||||||||||||||||    
T  8409296 aggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 366
Target Start/End: Original strand, 24097545 - 24097710
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggtaaggctgcgtac 296  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  24097545 cttggcacaactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttac 24097644  T
Q  297 aatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||    
T  24097645 a----accaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgtcccaggttgccct 24097710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097291
Alignment:
Q  252 tcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggt 351  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 26097276  T
Q  352 gcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||    
T  26097277 gcaccgggttgccct 26097291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557856
Alignment:
Q  252 tcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggt 351  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 25557841  T
Q  352 gcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||    
T  25557842 gcaccgggttgccct 25557856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13904984
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||   ||||||||||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccc 365  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| |||||| || ||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||    
T  13905059 gctgcatacaattcaccaaatggt-ggaccctttcccgaaccctgcgtatcacggagcttt-gtgcaccgggctgccc 13904984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 357
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138957
Alignment:
Q  239 tcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtat 337  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttccggaccctgtgtat 33138937  T
Q  338 gcgggagctttggtgcaccg 357  Q
    || | |||||| ||||||||    
T  33138938 gcagtagctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7947543 - 7947384
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||   ||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7947543 ccttggcgcaac-ggtaaagttggtgttgcgtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgta 7947445  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcac 355  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  7947444 caatacaccaaaatggtgggcccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcac 7947384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14975262 - 14975178
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt 271  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14975262 tgagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgt 14975178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 348
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579540
Alignment:
Q  244 ggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcggga 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtataaaaatacggtaagcctgcgtacaataccccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcggga 32579535  T
Q  344 gcttt 348  Q
    |||||    
T  32579536 gcttt 32579540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 330
Target Start/End: Original strand, 6024187 - 6024332
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 286  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  6024187 gaggggtaattttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaa 6024286  T
Q  287 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccc 330  Q
    | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  6024287 gactgcgtacaatacaccaataatgatgggacctcttcccggaccc 6024332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240826
Alignment:
Q  220 ttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacccc 319  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaattggtgggacccc 23240873  T
Q  320 ttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||   ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  23240872 ttctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctgccct 23240826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 344
Target Start/End: Original strand, 22967123 - 22967287
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| | ||||||  ||||| ||| ||    
T  22967123 ttgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggata 22967222  T
Q  286 aggctgc------gtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggag 344  Q
    |||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  22967223 aggctgcatacaaatacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 22967287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23821270 - 23821106
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 285  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| | ||||||  ||||| ||| ||    
T  23821270 ttgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggata 23821171  T
Q  286 aggctgc------gtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggag 344  Q
    |||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  23821170 aggctgcatacaaatacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 23821106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 357
Target Start/End: Original strand, 20400612 - 20400791
Alignment:
Q  179 attttcattgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaa 277  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  | ||||||  |||||||   ||||    
T  20400612 atttttatagagaggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaa 20400711  T
Q  278 acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccg 357  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  ||| | ||||||| || ||| ||||| ||||||| | | |||| ||||||||    
T  20400712 acagggtaagactgcgtacagtacactaaatagcgggacccttttccgaaccctacgtatgcagaaactttagtgcaccg 20400791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 321
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007714
Alignment:
Q  212 taaagttgttgtcatgtgac-tg-taacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatg 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgt-gtaaaacagggtcaggctgcgtacaatacaccaaatg 28007702  T
Q  310 gtgggacccctt 321  Q
     |||||||||||    
T  28007703 ctgggacccctt 28007714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23930303 - 23930129
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttc-aagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggc 289  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||  || |||||| |||| ||||| | ||||||| ||| |||  ||||| || | ||  |     
T  23930303 ggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagata--gt 23930206  T
Q  290 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23930205 tgcgtacaatacaccagatggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgccct 23930129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277199
Alignment:
Q  219 gttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacc 317  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaaatggtgggacc 18277244  T
Q  318 ccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttg 362  Q
    |||| |  ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18277243 ccttcctagactctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttg 18277199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 278
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063511
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa 278  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaaa 12063511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Original strand, 12889390 - 12889560
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||    
T  12889390 ccttggcacaac-ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcata 12889488  T
Q  296 caatacacc-gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||  || | ||||||||||| |||||||||  || || ||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  12889489 caatacacctaaacgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgccct 12889560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 346
Target Start/End: Original strand, 14553477 - 14553626
Alignment:
Q  199 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggctgcgtaca 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||   ||||| |||||||||||| ||| |    
T  14553477 ttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtata 14553575  T
Q  298 atacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagct 346  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||    
T  14553576 atacaccaaaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 24734591 - 24734752
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt----------agaaaaacag 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| |||| |||||| ||||||||          | ||||||||    
T  24734591 ggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaaaacag 24734690  T
Q  282 ggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgg 341  Q
    ||||||| ||||||||||||| |   || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24734691 ggtaaggttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgg 24734752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 366
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267858
Alignment:
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13267788 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 13267858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33923009 - 33922927
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttg 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  33923009 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcctagaaacgtcctcttg 33922927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808528
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808468 aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 6808528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15865987 - 15865859
Alignment:
Q  238 gtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctctt--gtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgt 335  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15865987 gtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttacgtaaaaaaacagggtaaagctgcgta--atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgt 15865890  T
Q  336 atgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||| || || | |||||| | ||||||||    
T  15865889 ttgcgtgatctatagtgcactgagttgccct 15865859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32728334 - 32728159
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctct--tgtagaaaaacagggtaagg 288  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||  | |||||| |||||  |||| ||||||||||||||     
T  32728334 gggtaaccttggtggaacgagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgta-aaaaacagggtaaga 32728236  T
Q  289 ctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||| |||||||| ||| ||| || || ||| || || |||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  32728235 ctgtgtacaatataccaaatagt-ggtccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcaccatgttgccct 32728159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 12885986 - 12886046
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12885986 aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccct 12886046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 12892082 - 12892142
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12892082 aatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 12892142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 383837 - 383762
Alignment:
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  383837 gcgtacaatacaccaaattgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgccct 383762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3116299 - 3116131
Alignment:
Q  200 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-------ctgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgc 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||       ||| || |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||        | ||||    
T  3116299 tggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgagttgcgactgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaat-------gactgc 3116207  T
Q  293 gtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  3116206 gcacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgccct 3116131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10734965 - 10734907
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  10734965 tggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccgggctgccct 10734907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755488
Alignment:
Q  210 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||| |  ||||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacacc 2755488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 263
Target Start/End: Original strand, 8417442 - 8417501
Alignment:
Q  204 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| | |||||||    
T  8417442 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacag 8417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 358
Target Start/End: Original strand, 11395836 - 11395886
Alignment:
Q  308 tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgg 358  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11395836 tggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgggagctttagtccaccgg 11395886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14975152 - 14975094
Alignment:
Q  306 aatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14975152 aatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcc 14975094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 366
Target Start/End: Original strand, 17432393 - 17432481
Alignment:
Q  280 agggtaaggctgcgtacaatacaccgaa--tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||  || ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17432393 agggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagaccttttcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 17432481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 367
Target Start/End: Original strand, 18254559 - 18254652
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccctg 367  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||  | ||| || |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18254559 aaaaacagggtaaagctgcatacaatacccaaaatagtgggaccccttcacagactctacgtatatgggagttttggtgcaccgggctgccctg 18254652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27855601 - 27855501
Alignment:
Q  206 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctc--ttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||| ||||||   ||||||| ||   |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27855601 aactggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtataatacac 27855502  T
Q  304 c 304  Q
    |    
T  27855501 c 27855501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30786427 - 30786378
Alignment:
Q  315 accccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30786427 accccttcctggaccgtgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30786378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14341164 - 14341132
Alignment:
Q  274 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14341164 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccga 14341132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 359
Target Start/End: Original strand, 19340843 - 19340954
Alignment:
Q  249 aagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagct 346  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||  |||||||||| || || ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  19340843 aagtcctagaaccagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgca-acaatacaccaaaatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagct 19340941  T
Q  347 ttggtgcaccggg 359  Q
    || ||||| ||||    
T  19340942 ttagtgcaacggg 19340954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19649338 - 19649303
Alignment:
Q  198 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19649338 cttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactg 19649303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30710
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtagg 30631  T
Q  288 gctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30632 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 30710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 190 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13026
Alignment:
Q  190 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggc 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  13202 ggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaacaaggtaaggc 13103  T
Q  290 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13102 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgccct 13026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17549 - 17507
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 231  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17549 aggggtaaccttaacgcaactgctaaagttgttgtcatgtgac 17507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10052
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggct 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagagtaagact 10128  T
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  10127 gcgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20380
Alignment:
Q  191 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggct 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagagtaagact 20456  T
Q  291 gcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  20455 gcgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 253
Target Start/End: Original strand, 8897 - 8964
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8897 ttgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 253
Target Start/End: Original strand, 19225 - 19292
Alignment:
Q  186 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19225 ttgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Original strand, 46794 - 46964
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaac-agggtaaggctgcgta 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||  ||||||||| ||||||    
T  46794 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgta 46893  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46894 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 46964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24949 - 24774
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||     |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  24949 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 24855  T
Q  286 aggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24854 aggctgcgtacaacacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgccct 24774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 366
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43791
Alignment:
Q  247 tcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgc-cggaccctgcgtatgcgggagc 345  Q
    |||||| || |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgt-gtaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagc 43770  T
Q  346 tttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    | | |||||| | ||||||||    
T  43771 tctagtgcactgagttgccct 43791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46796 - 46727
Alignment:
Q  280 agggtaaggctgcgtacaatacaccgaa-tggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46796 agggtaaggatgcatacaatataccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttt 46727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47054 - 46997
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcct 255  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  47054 ccttggcgcaa-tagtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcct 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 366
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59112
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgta-gaaaaacagggtaaggctg 291  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  292 cgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccct 59112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 363
Target Start/End: Original strand, 10773 - 10940
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||     
T  10773 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtc 10872  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgc 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10873 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgc 10940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 366
Target Start/End: Original strand, 11093 - 11262
Alignment:
Q  195 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| |    
T  11093 aaccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacaaagtaaggctgctt 11190  T
Q  295 acaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  11191 acaatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 11262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 196 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1591
Alignment:
Q  196 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  1758 accttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgt-gtaaaacaggataaggctgcata 1660  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 364  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1659 caatacaccaaatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcc 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 226588 - 226456
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttg--tagaaaaacagggt 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  226588 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 226489  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggacc 317  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  226488 aaggctgcatacaatacatcaaatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48636
Alignment:
Q  243 gggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcggg 342  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggg 48660  T
Q  343 agctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||| | |||||||||||||||||    
T  48659 agctctagtgcaccgggttgccct 48636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 73034 - 72869
Alignment:
Q  196 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaaca-gcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||||| || |||||||||||     
T  73034 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgt-------gtcacgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcc 72942  T
Q  294 tacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  72941 tacaatacaccaaatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccct 72869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35200 - 35067
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttg-ttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtaga--aaaacagggt 284  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||     ||||||||||    
T  35200 gagggataactttggtgcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggt 35101  T
Q  285 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccc 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35100 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 35067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24135
Alignment:
Q  281 gggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgccct 24135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 4117 - 4258
Alignment:
Q  193 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctg 291  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||    
T  4117 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 4215  T
Q  292 cgtacaatacacc---gaatggtgggaccccttgccggaccct 331  Q
    |||||||||||||    | |||||||||||||| |||||||||    
T  4216 cgtacaatacaccaataattggtgggaccccttcccggaccct 4258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Original strand, 83828 - 83903
Alignment:
Q  187 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaaca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||    
T  83828 tgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaaca 83903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3677
Alignment:
Q  250 agtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagcttt 348  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3560 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 3659  T
Q  349 ggtgcaccgggttgccct 366  Q
     |||||||| ||| ||||    
T  3660 agtgcaccgagtttccct 3677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24695
Alignment:
Q  189 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcc 265  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc 24695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 366
Target Start/End: Original strand, 24696 - 24781
Alignment:
Q  281 gggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccct 366  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||  |||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||    
T  24696 gggtaagactgcgtataatacaccaaatagtggaccccctttccagaccctgcgtatacgggagcttcagtgcacctgattgccct 24781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Original strand, 43085 - 43182
Alignment:
Q  192 ggtaaccttggcgc--aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 287  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  43085 ggtaaccttggcgcgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaag 43182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 281
Target Start/End: Original strand, 8848 - 8938
Alignment:
Q  188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacag 281  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||  ||||||||    
T  8848 gaggggtaaccttgacgc---tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaacag 8938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 349
Target Start/End: Original strand, 23567 - 23715
Alignment:
Q  197 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaa-acagggtaaggctgcgta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||||||| || |  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  23567 ccttggcgcaac-ggtaaagttgt----atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgta 23661  T
Q  296 caatacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagctttg 349  Q
    ||||  | | |||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
T  23662 caatgtagcaaatggtgggaccccttcccagaccttgagtatgtgggagctttg 23715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 58699 - 58651
Alignment:
Q  298 atacaccgaatggtgggaccccttgccggaccctgcgtatgcgggagct 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  58699 atacaccgaatggtgagaccccttctcggaccctgtgtatgcgggagct 58651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University