View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14784_low_61 (Length: 305)

Name: NF14784_low_61
Description: NF14784
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14784_low_61
NF14784_low_61
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (1-273)||(23999431-23999703)
chr1 (1-277)||(19899589-19899865)
chr1 (1-277)||(46931491-46931765)
chr1 (1-274)||(27763131-27763404)
chr1 (1-274)||(51128942-51129214)
chr1 (2-277)||(27227307-27227581)
chr1 (1-277)||(30254503-30254778)
chr1 (1-290)||(2959817-2960103)
chr1 (1-278)||(28564604-28564878)
chr1 (3-290)||(15383002-15383286)
chr1 (1-277)||(32267114-32267389)
chr1 (3-274)||(25160715-25160985)
chr1 (1-277)||(10922807-10923082)
chr1 (3-266)||(8222219-8222480)
chr1 (1-276)||(9902875-9903149)
chr1 (1-275)||(16415728-16416001)
chr1 (1-274)||(28769735-28770008)
chr1 (1-274)||(37451369-37451640)
chr1 (1-277)||(238334-238609)
chr1 (2-277)||(15752109-15752383)
chr1 (3-274)||(30326775-30327045)
chr1 (1-277)||(32216135-32216410)
chr1 (1-260)||(4330378-4330636)
chr1 (2-260)||(47682316-47682573)
chr1 (1-277)||(7078884-7079159)
chr1 (26-274)||(18422734-18422981)
chr1 (2-277)||(27267022-27267295)
chr1 (3-261)||(38823310-38823567)
chr1 (1-277)||(10181828-10182104)
chr1 (1-261)||(15168192-15168451)
chr1 (1-277)||(47279269-47279544)
chr1 (1-277)||(42721119-42721391)
chr1 (1-277)||(27563726-27564001)
chr1 (1-261)||(27532803-27533060)
chr1 (1-277)||(34012203-34012473)
chr1 (1-277)||(11742189-11742446)
chr1 (1-277)||(3309227-3309508)
chr1 (1-278)||(3535011-3535278)
chr1 (1-262)||(22170806-22171066)
chr1 (1-261)||(14758137-14758387)
chr1 (2-275)||(39393465-39393738)
chr1 (8-277)||(37618729-37618990)
chr1 (53-261)||(33725472-33725680)
chr1 (1-163)||(1359756-1359917)
chr1 (1-220)||(1547416-1547626)
chr1 (1-277)||(41926243-41926511)
chr1 (1-261)||(40884909-40885168)
chr1 (1-163)||(48353737-48353897)
chr1 (7-261)||(31621376-31621633)
chr1 (50-276)||(38759610-38759840)
chr1 (79-277)||(48620717-48620906)
chr1 (1-143)||(21289817-21289955)
chr1 (7-118)||(31962855-31962965)
chr1 (231-275)||(1359933-1359977)
chr1 (1-29)||(18422971-18422999)
chr1 (213-277)||(21289752-21289816)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (1-273)||(32912431-32912703)
chr4 (1-277)||(34361343-34361618)
chr4 (1-277)||(19089305-19089580)
chr4 (1-277)||(37663593-37663868)
chr4 (1-273)||(42199817-42200090)
chr4 (1-277)||(28002838-28003113)
chr4 (1-275)||(55477743-55478016)
chr4 (1-261)||(6864135-6864394)
chr4 (1-253)||(1815409-1815660)
chr4 (1-277)||(33341483-33341757)
chr4 (1-274)||(50697329-50697601)
chr4 (1-238)||(3042742-3042978)
chr4 (1-274)||(19440500-19440772)
chr4 (1-275)||(879400-879673)
chr4 (1-278)||(25184196-25184472)
chr4 (1-277)||(17167797-17168072)
chr4 (1-277)||(29584052-29584327)
chr4 (1-277)||(34947947-34948224)
chr4 (1-277)||(35020883-35021162)
chr4 (1-275)||(36493541-36493813)
chr4 (1-277)||(17173374-17173649)
chr4 (1-278)||(25700908-25701185)
chr4 (1-277)||(55240957-55241231)
chr4 (1-278)||(27396699-27396973)
chr4 (1-264)||(47253845-47254099)
chr4 (1-277)||(23761156-23761430)
chr4 (1-261)||(46888010-46888268)
chr4 (1-220)||(7703650-7703868)
chr4 (1-277)||(37775753-37776017)
chr4 (2-261)||(49376067-49376325)
chr4 (1-238)||(17272087-17272323)
chr4 (46-261)||(38011954-38012169)
chr4 (1-277)||(32592177-32592443)
chr4 (1-245)||(32579562-32579805)
chr4 (1-173)||(33816368-33816539)
chr4 (1-277)||(50764814-50765079)
chr4 (1-277)||(5047818-5048092)
chr4 (1-164)||(26896284-26896447)
chr4 (1-163)||(7152056-7152217)
chr4 (1-220)||(37287867-37288087)
chr4 (1-220)||(30002493-30002702)
chr4 (7-275)||(4934071-4934327)
chr4 (1-219)||(46883966-46884177)
chr4 (1-274)||(9139332-9139586)
chr4 (1-277)||(4598076-4598341)
chr4 (1-133)||(39400236-39400367)
chr4 (1-99)||(35025418-35025515)
chr4 (1-129)||(4205216-4205343)
chr4 (84-220)||(35025530-35025666)
chr4 (5-90)||(23431826-23431910)
chr4 (78-266)||(54499166-54499354)
chr4 (57-118)||(56050173-56050234)
chr4 (175-261)||(33816558-33816644)
chr4 (1-55)||(38012568-38012621)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (1-273)||(5627479-5627751)
chr6 (1-277)||(1945918-1946194)
chr6 (1-275)||(6091007-6091281)
chr6 (1-278)||(3879764-3880040)
chr6 (1-277)||(4318647-4318923)
chr6 (2-261)||(20768184-20768440)
chr6 (1-273)||(21016943-21017208)
chr6 (1-261)||(7234857-7235118)
chr6 (103-273)||(7055141-7055311)
chr6 (1-261)||(29182263-29182520)
chr6 (26-277)||(8513317-8513562)
chr6 (1-273)||(33892837-33893098)
chr6 (1-261)||(33618934-33619192)
chr6 (26-277)||(6088992-6089237)
chr6 (75-277)||(30353256-30353458)
chr6 (1-108)||(7054597-7054704)
chr6 (103-261)||(15491715-15491873)
chr6 (1-34)||(33724084-33724117)
chr6 (1-29)||(6089227-6089255)
chr6 (1-29)||(8513552-8513580)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (1-278)||(24211799-24212076)
chr7 (1-277)||(30055586-30055861)
chr7 (1-274)||(37109934-37110208)
chr7 (1-274)||(17842411-17842685)
chr7 (1-266)||(31578891-31579155)
chr7 (1-277)||(18797386-18797661)
chr7 (1-277)||(11071265-11071537)
chr7 (1-277)||(9355653-9355928)
chr7 (6-274)||(27283806-27284073)
chr7 (1-277)||(32820880-32821155)
chr7 (1-275)||(15612586-15612859)
chr7 (1-273)||(23111253-23111526)
chr7 (6-277)||(10481664-10481934)
chr7 (1-277)||(21991695-21991961)
chr7 (3-261)||(41764907-41765164)
chr7 (1-264)||(10359041-10359303)
chr7 (1-275)||(32432513-32432786)
chr7 (65-274)||(38258607-38258816)
chr7 (1-277)||(7334853-7335127)
chr7 (2-277)||(5657309-5657583)
chr7 (1-275)||(37347083-37347355)
chr7 (2-220)||(37703326-37703543)
chr7 (2-273)||(4582982-4583252)
chr7 (2-243)||(15672587-15672830)
chr7 (6-220)||(46480961-46481174)
chr7 (1-277)||(8861344-8861619)
chr7 (1-243)||(6546612-6546853)
chr7 (4-238)||(12165850-12166074)
chr7 (1-261)||(48928124-48928382)
chr7 (1-184)||(35353260-35353442)
chr7 (1-260)||(22687315-22687565)
chr7 (1-275)||(31520568-31520823)
chr7 (22-290)||(33688110-33688375)
chr7 (1-277)||(29173599-29173856)
chr7 (46-277)||(43686099-43686330)
chr7 (1-277)||(25691371-25691646)
chr7 (8-261)||(44598741-44598994)
chr7 (1-274)||(26980385-26980640)
chr7 (1-217)||(26587919-26588126)
chr7 (1-271)||(43925167-43925429)
chr7 (2-144)||(44411368-44411509)
chr7 (8-160)||(32593040-32593191)
chr7 (1-131)||(37704387-37704516)
chr7 (3-290)||(12390478-12390743)
chr7 (106-252)||(37704241-37704387)
chr7 (46-160)||(38053637-38053751)
chr7 (108-277)||(27421313-27421481)
chr7 (1-118)||(34362005-34362121)
chr7 (84-261)||(48928473-48928649)
chr7 (147-275)||(44413351-44413479)
chr7 (1-44)||(38258870-38258913)
chr7 (180-278)||(38053544-38053634)
chr7 (28-93)||(27421219-27421283)
chr7 (175-260)||(32593189-32593273)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (1-273)||(11366224-11366496)
chr2 (1-277)||(43648089-43648364)
chr2 (1-262)||(41960939-41961199)
chr2 (1-275)||(2325222-2325487)
chr2 (1-277)||(3177023-3177298)
chr2 (1-277)||(4763715-4763990)
chr2 (1-277)||(33550827-33551105)
chr2 (1-277)||(33709076-33709351)
chr2 (2-277)||(4167006-4167280)
chr2 (3-274)||(37905795-37906067)
chr2 (1-275)||(44913748-44914026)
chr2 (2-275)||(19289168-19289440)
chr2 (1-235)||(35959023-35959251)
chr2 (2-277)||(39167214-39167482)
chr2 (1-264)||(31570578-31570840)
chr2 (1-260)||(41465602-41465860)
chr2 (1-265)||(31861948-31862211)
chr2 (67-273)||(17071646-17071852)
chr2 (1-290)||(26357650-26357936)
chr2 (1-277)||(29241989-29242257)
chr2 (1-277)||(33660221-33660487)
chr2 (26-277)||(44286033-44286283)
chr2 (1-263)||(18494125-18494385)
chr2 (7-290)||(4263926-4264207)
chr2 (1-277)||(27349792-27350057)
chr2 (67-275)||(17054005-17054213)
chr2 (8-275)||(4478455-4478717)
chr2 (56-264)||(45327817-45328025)
chr2 (1-261)||(19424486-19424731)
chr2 (56-277)||(36642070-36642293)
chr2 (1-163)||(19500759-19500920)
chr2 (1-274)||(13711551-13711818)
chr2 (1-277)||(5881623-5881888)
chr2 (1-160)||(7006782-7006940)
chr2 (1-261)||(43770692-43770942)
chr2 (21-264)||(19313949-19314186)
chr2 (87-277)||(41463779-41463969)
chr2 (108-277)||(33902150-33902319)
chr2 (69-221)||(18258198-18258350)
chr2 (1-118)||(41051144-41051259)
chr2 (2-73)||(18257383-18257453)
chr2 (1-88)||(41463434-41463520)
chr2 (175-290)||(7006938-7007051)
chr2 (178-258)||(19501760-19501839)
chr2 (1-58)||(33902317-33902373)
chr2 (224-261)||(41051271-41051308)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-273)||(21009627-21009899)
chr3 (1-277)||(47481597-47481873)
chr3 (1-277)||(42505901-42506176)
chr3 (1-269)||(54505891-54506158)
chr3 (1-277)||(34133010-34133285)
chr3 (1-277)||(26941086-26941361)
chr3 (1-274)||(40552085-40552357)
chr3 (1-277)||(46297588-46297863)
chr3 (1-261)||(53228978-53229237)
chr3 (1-275)||(52040748-52041021)
chr3 (1-273)||(7327308-7327579)
chr3 (1-238)||(22622544-22622780)
chr3 (1-261)||(39282743-39283002)
chr3 (4-266)||(46994490-46994751)
chr3 (1-277)||(4761474-4761750)
chr3 (1-277)||(4015535-4015809)
chr3 (1-264)||(33378611-33378873)
chr3 (1-275)||(48355018-48355291)
chr3 (1-277)||(37203142-37203418)
chr3 (1-261)||(44891588-44891847)
chr3 (1-264)||(24707941-24708205)
chr3 (1-290)||(3362317-3362605)
chr3 (1-238)||(33698267-33698503)
chr3 (1-277)||(24488788-24489063)
chr3 (6-274)||(3655031-3655300)
chr3 (8-277)||(32373545-32373813)
chr3 (1-261)||(37157798-37158058)
chr3 (1-261)||(22451059-22451318)
chr3 (1-277)||(2008008-2008289)
chr3 (1-261)||(11357207-11357449)
chr3 (1-261)||(22445891-22446150)
chr3 (1-218)||(1089827-1090043)
chr3 (1-277)||(21193681-21193957)
chr3 (3-264)||(25579827-25580087)
chr3 (1-272)||(38591778-38592048)
chr3 (1-265)||(43975718-43975977)
chr3 (20-263)||(54828546-54828788)
chr3 (1-245)||(36012244-36012489)
chr3 (36-261)||(45174596-45174821)
chr3 (1-277)||(29099430-29099696)
chr3 (46-238)||(43348371-43348563)
chr3 (26-277)||(11466899-11467142)
chr3 (3-148)||(51212599-51212743)
chr3 (26-258)||(29163912-29164134)
chr3 (1-264)||(44186343-44186589)
chr3 (1-238)||(14586506-14586732)
chr3 (1-264)||(40936079-40936323)
chr3 (1-264)||(27480184-27480467)
chr3 (36-243)||(11835494-11835695)
chr3 (97-277)||(35844401-35844581)
chr3 (19-142)||(50475021-50475143)
chr3 (116-277)||(53176129-53176290)
chr3 (68-184)||(20373136-20373252)
chr3 (150-277)||(51212955-51213082)
chr3 (1-163)||(11356984-11357137)
chr3 (46-147)||(53811604-53811701)
chr3 (191-277)||(20373311-20373397)
chr3 (1-44)||(20373089-20373132)
chr3 (1-29)||(11467132-11467160)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (2-273)||(145842-146113)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (8-277)||(30654421-30654690)
chr8 (1-277)||(1149464-1149739)
chr8 (1-273)||(8803648-8803913)
chr8 (1-277)||(1205010-1205285)
chr8 (1-274)||(16222949-16223221)
chr8 (1-277)||(9864231-9864506)
chr8 (1-277)||(16446707-16446982)
chr8 (1-277)||(37970351-37970626)
chr8 (1-274)||(7890789-7891061)
chr8 (1-278)||(43643427-43643703)
chr8 (2-278)||(5299779-5300054)
chr8 (2-257)||(27082671-27082925)
chr8 (1-277)||(6098345-6098625)
chr8 (1-261)||(11727123-11727382)
chr8 (1-277)||(36694798-36695073)
chr8 (1-261)||(1953820-1954081)
chr8 (2-235)||(4132519-4132750)
chr8 (1-277)||(12876192-12876468)
chr8 (1-277)||(23854263-23854538)
chr8 (1-256)||(33906316-33906568)
chr8 (1-277)||(10555037-10555309)
chr8 (1-277)||(35459543-35459818)
chr8 (1-277)||(34895050-34895320)
chr8 (1-261)||(38644077-38644336)
chr8 (1-266)||(31933718-31933982)
chr8 (7-277)||(40862503-40862771)
chr8 (1-277)||(44869580-44869855)
chr8 (5-261)||(39098955-39099210)
chr8 (1-277)||(465925-466190)
chr8 (46-273)||(13307710-13307936)
chr8 (5-163)||(1149756-1149909)
chr8 (1-130)||(12587812-12587940)
chr8 (1-210)||(18259233-18259437)
chr8 (76-261)||(41910895-41911079)
chr8 (1-134)||(35859160-35859292)
chr8 (1-133)||(34951889-34952020)
chr8 (1-179)||(24823226-24823395)
chr8 (90-242)||(43025820-43025972)
chr8 (1-100)||(33198062-33198160)
chr8 (155-290)||(1150090-1150223)
chr8 (168-273)||(41362602-41362707)
chr8 (46-130)||(34463704-34463785)
chr8 (167-277)||(34952028-34952138)
chr8 (83-160)||(7998478-7998555)
chr8 (2-59)||(41362723-41362779)
chr8 (167-243)||(7998411-7998488)
chr8 (123-179)||(12585297-12585353)
chr8 (206-261)||(33197948-33198003)
chr8 (1-44)||(43025989-43026032)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-277)||(7971-8246)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (1-277)||(699234-699509)
chr5 (1-264)||(38528053-38528314)
chr5 (1-274)||(22255269-22255541)
chr5 (1-277)||(31786462-31786737)
chr5 (1-274)||(31705428-31705699)
chr5 (1-266)||(22980888-22981152)
chr5 (1-274)||(35504452-35504724)
chr5 (3-274)||(5829988-5830249)
chr5 (1-275)||(35826302-35826572)
chr5 (1-290)||(22973898-22974184)
chr5 (1-274)||(7208680-7208951)
chr5 (1-278)||(27330387-27330663)
chr5 (1-266)||(30969140-30969404)
chr5 (1-275)||(8741701-8741975)
chr5 (1-277)||(27318304-27318578)
chr5 (1-274)||(17157847-17158118)
chr5 (1-277)||(5837639-5837914)
chr5 (1-277)||(15992356-15992631)
chr5 (1-264)||(12910452-12910714)
chr5 (2-273)||(40133473-40133743)
chr5 (10-238)||(13956187-13956414)
chr5 (1-277)||(19119943-19120218)
chr5 (1-261)||(33908333-33908591)
chr5 (4-261)||(35933995-35934252)
chr5 (1-277)||(25500742-25501017)
chr5 (1-277)||(35511298-35511568)
chr5 (2-277)||(36866846-36867120)
chr5 (1-277)||(36860507-36860783)
chr5 (1-277)||(23116046-23116313)
chr5 (1-213)||(2888261-2888472)
chr5 (1-277)||(24886188-24886446)
chr5 (1-277)||(39572903-39573170)
chr5 (2-275)||(8437052-8437323)
chr5 (1-277)||(15724574-15724847)
chr5 (1-277)||(43308476-43308743)
chr5 (1-290)||(7693303-7693580)
chr5 (1-277)||(21088585-21088857)
chr5 (1-274)||(9200320-9200583)
chr5 (9-160)||(1428983-1429136)
chr5 (1-275)||(22019718-22019982)
chr5 (1-261)||(14409157-14409401)
chr5 (1-238)||(42342854-42343080)
chr5 (1-277)||(32563233-32563499)
chr5 (1-210)||(25669737-25669935)
chr5 (33-277)||(6824329-6824572)
chr5 (2-147)||(25889584-25889728)
chr5 (1-277)||(14919355-14919619)
chr5 (26-261)||(23954636-23954864)
chr5 (92-277)||(26268158-26268343)
chr5 (1-157)||(8466931-8467085)
chr5 (122-277)||(5112250-5112404)
chr5 (1-100)||(28416367-28416465)
chr5 (3-96)||(26269074-26269166)
chr5 (149-290)||(28416490-28416629)
chr5 (1-62)||(43254154-43254214)
chr5 (176-260)||(8466845-8466929)
chr5 (175-277)||(1429134-1429236)
chr5 (222-264)||(11898099-11898141)
chr5 (122-163)||(11898152-11898193)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-274)||(408255-408526)
scaffold0002 (1-277)||(218-487)
scaffold0002 (8-132)||(93933-94056)
scaffold0002 (124-277)||(94331-94484)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (2-275)||(44043-44314)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (2-275)||(154473-154744)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (6-260)||(12010-12263)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (46-261)||(267384-267600)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (15-140)||(100948-101058)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23999703 - 23999431
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999703 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 23999604  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  23999603 aaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattat 23999504  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999503 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 23999431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 19899589 - 19899865
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19899589 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 19899688  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  19899689 gaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattat 19899788  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19899789 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagt 19899865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 46931765 - 46931491
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931765 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 46931666  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||    
T  46931665 aaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattat 46931568  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  46931567 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagt 46931491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 27763131 - 27763404
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27763131 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttg 27763230  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||     
T  27763231 gaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattag 27763330  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27763331 attaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaac 27763404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51129214 - 51128942
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51129214 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 51129116  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  51129115 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattat 51129016  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51129015 attaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaac 51128942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 27227307 - 27227581
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27227307 attcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttga 27227405  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |    
T  27227406 catctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 27227505  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27227506 ttaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 27227581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30254778 - 30254503
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30254778 gattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 30254680  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||     
T  30254679 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattag 30254580  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30254579 attaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 30254503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2960103 - 2959817
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2960103 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 2960005  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  2960004 gcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 2959905  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||    
T  2959904 attaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt--gggatgttact 2959817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 28564604 - 28564878
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28564604 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 28564702  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||| | || |||||||||     
T  28564703 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattag 28564800  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28564801 attaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagta 28564878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15383286 - 15383002
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15383286 ttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgga 15383188  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||    
T  15383187 atctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagat 15383088  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  15383087 taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggt--gggatgttact 15383002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32267389 - 32267114
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32267389 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttg 32267291  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||  |||||||||     
T  32267290 gaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 32267191  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32267190 attaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 32267114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25160985 - 25160715
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25160985 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgga 25160887  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||  ||||||| | ||    
T  25160886 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagat 25160787  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  25160786 taagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaac 25160715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10923082 - 10922807
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||      
T  10923082 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtca 10922984  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| ||||||| |     
T  10922983 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataag 10922884  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10922883 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 10922807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8222480 - 8222219
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8222480 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-ta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgga 8222383  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||| | ||    
T  8222382 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagat 8222283  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8222282 taagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccatt 8222219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 9902875 - 9903149
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9902875 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttg 9902973  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  9902974 tcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattag 9903073  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacag 276  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  9903074 attaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacag 9903149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16416001 - 16415728
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16416001 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 16415903  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  16415902 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 16415803  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16415802 attaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaaca 16415728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28770008 - 28769735
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28770008 gattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagta-attcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 28769910  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  28769909 aaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaatta 28769810  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
     ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||    
T  28769809 gattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaac 28769735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37451640 - 37451369
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37451640 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 37451542  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| ||   |||||||||     
T  37451541 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattag 37451442  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37451441 attaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 37451369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 238334 - 238609
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  238334 gattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatcgttg 238432  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  238433 gcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 238532  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  238533 attaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 238609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15752383 - 15752109
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||     
T  15752383 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttgg 15752285  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
    ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |    
T  15752284 aatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattaga 15752185  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15752184 ttaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt 15752109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30327045
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttgga 30326873  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||| | ||    
T  30326874 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagat 30326973  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  30326974 taagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaac 30327045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32216410 - 32216135
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  32216410 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 32216312  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||      
T  32216311 gaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttg 32216212  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  32216211 attaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagt 32216135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4330636 - 4330378
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4330636 gattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgta-attcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttg 4330538  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  4330537 acatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 4330438  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgat 260  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4330437 attaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgat 4330378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 47682316 - 47682573
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47682316 attcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagta-attcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttga 47682414  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | | ||||||||||      
T  47682415 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagt 47682514  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgat 260  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  47682515 ttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgat 47682573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 7078884 - 7079159
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  7078884 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttg 7078982  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  7078983 gcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 7079082  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7079083 attaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 7079159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18422981 - 18422734
Alignment:
Q  26 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||   || |    
T  18422981 tgattaatgatcaatagta-attcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggt 18422883  T
Q  126 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||    
T  18422882 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctga 18422783  T
Q  226 tgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18422782 tgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 18422734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 27267022 - 27267295
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27267022 attcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttga 27267120  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| |||  || |||||| |    
T  27267121 catctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattaga 27267219  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  27267220 ttaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagt 27267295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 38823567 - 38823310
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||      
T  38823567 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggc 38823469  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  38823468 atctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagat 38823369  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  38823368 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatg 38823310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 10181828 - 10182104
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca-ggtactattttatcgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  10181828 gattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgtt 10181926  T
Q  100 gaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  10181927 gtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 10182026  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10182027 gattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 10182104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15168451 - 15168192
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15168451 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttg 15168353  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  15168352 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 15168253  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  15168252 attaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 15168192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47279544 - 47279269
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47279544 gattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagta-attcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttg 47279446  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| |||  |||||||||     
T  47279445 gcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattag 47279346  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  47279345 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagt 47279269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42721391 - 42721119
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42721391 gattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagta-attaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg 42721293  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  42721292 ---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 42721196  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| | | ||||||||||    
T  42721195 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagt 42721119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 27563726 - 27564001
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  27563726 gattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttt 27563824  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||  |||||||||| |||  |||||||||     
T  27563825 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattag 27563924  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27563925 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagt 27564001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 27532803 - 27533060
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27532803 gattcatttttaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 27532900  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||| |||||| | | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||  ||||||||      
T  27532901 gcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-g 27532999  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  27533000 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatg 27533060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 34012203 - 34012473
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  34012203 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttg 34012301  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||     |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||     
T  34012302 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattag 34012396  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34012397 attaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagt 34012473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 11742189 - 11742446
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11742189 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 11742287  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||                 |||||||||| |||  |||||||||     
T  11742288 acatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttaca-----------------cttaaaacaaggtaagataaaattag 11742370  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11742371 attaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 11742446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3309508 - 3309227
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3309508 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatcgttg 3309410  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt--tgtag---ggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aa 194  Q
      ||||||||||| |||| | ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||  |||||||||||||   | ||    
T  3309409 gcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaa 3309310  T
Q  195 aattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||  || | ||||||||||    
T  3309309 aattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt 3309227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3535278 - 3535011
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3535278 gattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttg 3535180  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||         ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |  |||||||||     
T  3535179 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattag 3535089  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  3535088 attaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagta 3535011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22171066 - 22170806
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||    
T  22171066 gatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagta-atttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttg 22170968  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||  || ||||||     
T  22170967 acatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattag 22170868  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgt 262  Q
    |||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22170867 attaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatgt 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14758387 - 14758137
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14758387 gattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 14758289  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||         ||| | ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  14758288 gcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa---------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 14758198  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  14758197 attaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatg 14758137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39393738 - 39393465
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  39393738 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattgg 39393640  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaattat 200  Q
     |||||||||||| ||| | ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  || |||||||     
T  39393639 catctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattag 39393540  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    || ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||  | ||||||||||| || | ||||||||    
T  39393539 atgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaaca 39393465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618990
Alignment:
Q  8 ttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatacta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctt 37618827  T
Q  108 taacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagt 207  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||         ||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  37618828 taacatgcaaacagagttgatgatattatatg---------agtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagt 37618918  T
Q  208 gtagtcttgttaacccgatgaattgatgatat--tatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37618919 gtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagt 37618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 261
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725680
Alignment:
Q  53 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 152  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  153 ttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaa 252  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33725572 ttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaa 33725671  T
Q  253 cttttgatg 261  Q
    |||||||||    
T  33725672 cttttgatg 33725680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 1359756 - 1359917
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1359756 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagta-attcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttg 1359854  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 163  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1359855 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgt 1359917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1547626 - 1547416
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1547626 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 1547528  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||        | ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||     
T  1547527 gtatctttaac--------agagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattag 1547436  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaa 220  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  1547435 attaagtgtatttttgttaa 1547416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41926511 - 41926243
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41926511 gattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttg 41926414  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |      ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||     
T  41926413 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaa------taagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattag 41926320  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  41926319 attaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagt 41926243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40885168 - 40884909
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  40885168 gattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcg 40885070  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |  |||||| ||||||||||  ||  |||||| ||     
T  40885069 gcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactag 40884970  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||| | ||||||||| | |||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||    
T  40884969 attaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatg 40884909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48353897 - 48353737
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48353897 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataata-attcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttg 48353799  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 163  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48353798 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgt 48353737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 261
Target Start/End: Original strand, 31621376 - 31621633
Alignment:
Q  7 tttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatct 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  31621376 tttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtag-ttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatct 31621474  T
Q  107 -----ttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
         |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| || | |||||||||| |||  ||||||||| |    
T  31621475 ttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacac-ttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattaga 31621573  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  31621574 ttaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatg 31621633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38759840 - 38759610
Alignment:
Q  50 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  38759840 atctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatagtctcaa 38759741  T
Q  150 gtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatga----g 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||   |||||||||||||||||| ||         
T  38759740 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacgaagact 38759641  T
Q  246 ggctgaacttttgatgtcattctacaaacag 276  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38759640 ggctgaacttttgatgtcactgtacaaacag 38759610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620717
Alignment:
Q  79 tacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgctta 178  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacactta 48620816  T
Q  179 aaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48620815 aaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 48620717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21289955 - 21289817
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  21289955 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataata-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttg 21289857  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatag 143  Q
      |||||||| ||||||| | |||   ||||||||||||||||    
T  21289856 gcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31962965 - 31962855
Alignment:
Q  7 tttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatct 106  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||  |||    
T  31962965 ttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtag-ttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttct 31962867  T
Q  107 ttaacatgcaaa 118  Q
    ||||||||||||    
T  31962866 ttaacatgcaaa 31962855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 275
Target Start/End: Original strand, 1359933 - 1359977
Alignment:
Q  231 tgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1359933 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcattatacaaaca 1359977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 18422999 - 18422971
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgat 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422999 gattcatttttaaattgttgattaatgat 18422971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289752
Alignment:
Q  213 cttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 21289752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 32912431 - 32912703
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912431 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 32912530  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  32912531 aaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattat 32912630  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32912631 attaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaa 32912703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 34361343 - 34361618
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34361343 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttg 34361442  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  34361443 gaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattat 34361542  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34361543 attaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatga-ggctgaacttttaatgtcattctacaaacagt 34361618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 19089305 - 19089580
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089305 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 19089403  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||  |||||||||     
T  19089404 aaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattag 19089503  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19089504 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagt 19089580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 37663593 - 37663868
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663593 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 37663691  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  |||||||||     
T  37663692 gaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattag 37663791  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37663792 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 37663868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42200090 - 42199817
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca-ggtactattttatcgtt 99  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42200090 gattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgtt 42199991  T
Q  100 gaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  42199990 ggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaatta 42199891  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42199890 tattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaa 42199817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 28002838 - 28003113
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28002838 gattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 28002936  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  28002937 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 28003036  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28003037 attaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 28003113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 55477743 - 55478016
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  55477743 gattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttg 55477841  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||  |||||||||     
T  55477842 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattag 55477941  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55477942 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaaca 55478016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6864394 - 6864135
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  6864394 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttg 6864296  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||     
T  6864295 taatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaa 6864196  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  6864195 attaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatg 6864135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1815660 - 1815409
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1815660 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 1815562  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  1815561 gaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattag 1815462  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaac 253  Q
    | ||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1815461 agtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33341757 - 33341483
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33341757 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 33341659  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  33341658 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattat 33341559  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33341558 attaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 33341483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50697601 - 50697329
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50697601 gattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttg 50697503  T
Q  101 aaatctttaacat-gcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
     |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  50697502 gaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatta 50697403  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  50697402 tattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaac 50697329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3042978 - 3042742
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3042978 gattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatacta-attcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttg 3042880  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  3042879 aaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattat 3042780  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  3042779 attaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgata 3042742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 19440500 - 19440772
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19440500 gattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattg 19440598  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||  |||||||||     
T  19440599 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattag 19440698  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  19440699 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaac 19440772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 879400 - 879673
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  879400 gattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataata-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtca 879498  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||     
T  879499 gaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 879598  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  879599 attatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaaca 879673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25184472 - 25184196
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  25184472 gattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 25184374  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||     
T  25184373 gaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 25184274  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25184273 atcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagta 25184196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17168072 - 17167797
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17168072 gattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagta-attcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 17167974  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  17167973 gcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 17167874  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||| |||  | |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17167873 attaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 17167797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 29584052 - 29584327
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  29584052 gattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttg 29584150  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||     
T  29584151 aaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattag 29584250  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29584251 attaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagt 29584327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 34947947 - 34948224
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  34947947 gattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtat-ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 34948045  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagt--gttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatt 198  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||  ||  ||||||||    
T  34948046 gcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaatt 34948145  T
Q  199 atattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34948146 agattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagt 34948224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 35020883 - 35021162
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtata----ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35020883 gattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaata-tatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 35020981  T
Q  97 gttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  35020982 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaa 35021081  T
Q  197 ttatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| || |||| |  ||||||||| | || | ||||||||||    
T  35021082 ttagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagt 35021162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 36493541 - 36493813
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36493541 gattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagta-attcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttg 36493639  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  36493640 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattag 36493738  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36493739 attaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaaca 36493813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17173649 - 17173374
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17173649 gattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagta-attcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 17173551  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  17173550 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 17173451  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||| |||  | |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17173450 attaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 17173374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 25700908 - 25701185
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  25700908 gattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagta-attcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttg 25701006  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtaggg-tgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  25701007 acttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 25701106  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
     ||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25701107 gatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagta 25701185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 55240957 - 55241231
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55240957 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagta-atttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 55241055  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  55241056 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattag 55241155  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||| || | | ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55241156 attaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 55241231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27396973 - 27396699
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  27396973 gattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttg 27396877  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| |  |||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  27396876 acatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaa 27396777  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27396776 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagta 27396699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47254099 - 47253845
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  47254099 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttg 47254001  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  47254000 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaa 47253901  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    |||||||||| ||||||||| |        |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47253900 attaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 47253845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23761430 - 23761156
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23761430 gattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataata-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttg 23761332  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  23761331 gtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattag 23761233  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23761232 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagt 23761156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 46888010 - 46888268
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46888010 gattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 46888108  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  46888109 gcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtc-taagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 46888207  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||    
T  46888208 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatg 46888268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7703868 - 7703650
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7703868 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttg 7703770  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  7703769 gcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 7703670  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaa 220  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  7703669 attaagtgtattcttgttaa 7703650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37776017 - 37775753
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  37776017 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 37775919  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  37775918 gtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 37775828  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||| || | ||||||||||    
T  37775827 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaaacagt 37775753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49376325 - 49376067
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49376325 attcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagta-attcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttga 49376227  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    |||||| ||| | | |||||||||| |    
T  49376226 catctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattaga 49376127  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    | ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  49376126 tcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 49376067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17272323 - 17272087
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17272323 gattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttg 17272225  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  17272224 aaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 17272125  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    |||||||||| |||  |||| | |||||||||||||||    
T  17272124 attaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgata 17272087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011954
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgag 245  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggg 38011970  T
Q  246 ggctgaacttttgatg 261  Q
    | ||||||||||||||    
T  38011969 gactgaacttttgatg 38011954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32592443 - 32592177
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  32592443 gattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagta-attcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtag 32592345  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  32592344 acatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaa 32592254  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32592253 attaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagt 32592177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32579805 - 32579562
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32579805 gatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 32579707  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | || ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |  ||| |||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  32579706 acatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 32579607  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgag 245  Q
    |||||||  |||| |||||| | |||||| |||| ||| ||||||    
T  32579606 attaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatgag 32579562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 33816368 - 33816539
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33816368 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttg 33816466  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 173  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33816467 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattac 33816539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50765079 - 50764814
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  50765079 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 50764981  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | ||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||          | |||  |||||||||     
T  50764980 acatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttac----------acgtaggataaaattag 50764891  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  50764890 attaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagt 50764814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 5047818 - 5048092
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5047818 gattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataata-atttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttg 5047916  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  5047917 gcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttg-cgggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 5048015  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  5048016 attaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagt 5048092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26896447 - 26896284
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt-ggacttacaggtactattttatcgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26896447 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgtt 26896348  T
Q  100 gaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgta 164  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26896347 gaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgta 26896284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 7152056 - 7152217
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7152056 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttg 7152154  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 163  Q
    | || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7152155 acatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttgt 7152217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37288087 - 37287867
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37288087 gattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagta-attcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 37287989  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaatt 198  Q
      ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||   | ||||||    
T  37287988 gcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaatt 37287889  T
Q  199 atattaagtgtagtcttgttaa 220  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  37287888 agattaagtgtattcttgttaa 37287867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 30002493 - 30002702
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  30002493 gattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttg 30002591  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||  |||||||||     
T  30002592 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 30002682  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaa 220  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  30002683 attaagtgtattcttgttaa 30002702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Original strand, 4934071 - 4934327
Alignment:
Q  7 tttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatct 106  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||           |||||||||||||||||||  ||||    
T  4934071 ttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaa-attcatctattaatgcgtgcaacat-----------aggtactattttatcgttgtcatct 4934158  T
Q  107 ttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaag 206  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  4934159 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 4934258  T
Q  207 tgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| || | ||||||||    
T  4934259 tgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaaca 4934327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 46883966 - 46884177
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||    
T  46883966 gatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttg 46884060  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||  ||| |||||||||     
T  46884061 gaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaattag 46884158  T
Q  201 attaagtgtagtcttgtta 219  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  46884159 attaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9139586 - 9139332
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  9139586 gattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagta-attcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttg 9139490  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||| ||                |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||     
T  9139489 gcatctttaacatgcaaacagagtttat----------------cttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattag 9139406  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||| | |||||||    
T  9139405 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaac 9139332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4598341 - 4598076
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  4598341 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagta-attaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttg 4598243  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||     
T  4598242 gcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac-aagcaggataaaattaa 4598153  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||   || | || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4598152 attaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 4598076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 39400367 - 39400236
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  39400367 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtc-attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttg 39400269  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatat 133  Q
      |||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  39400268 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 35025418 - 35025515
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35025418 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4205343 - 4205216
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4205343 gattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagta-attcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 4205245  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatg 129  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||    
T  4205244 gcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025666
Alignment:
Q  84 gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaaca 183  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaaca 35025629  T
Q  184 aagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 220  Q
    |  ||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35025630 agataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaa 35025666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23431910 - 23431826
Alignment:
Q  5 catttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactat 90  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23431910 catttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagta-attcatctactaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 266
Target Start/End: Original strand, 54499166 - 54499354
Alignment:
Q  78 ttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgctt 177  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| ||| | ||||  | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  54499166 ttaccggtaccattttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacactt 54499264  T
Q  178 aaaacaaagtataat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||    
T  54499265 aaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcatt 54499354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050173
Alignment:
Q  57 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaa 56050173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 261
Target Start/End: Original strand, 33816558 - 33816644
Alignment:
Q  175 cttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  33816558 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatg 33816644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 38012621 - 38012568
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctag 55  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38012621 gatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagta-attcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5627751 - 5627479
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5627751 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 5627652  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  5627651 aaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattat 5627552  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5627551 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 5627479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1946194 - 1945918
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1946194 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 1946095  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  1946094 gaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattat 1945995  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1945994 attaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 1945918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 6091007 - 6091281
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6091007 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttt 6091105  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
     ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6091106 gaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaatta 6091205  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
     |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6091206 gattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaaca 6091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 3879764 - 3880040
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3879764 gattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 3879862  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||  |||||||||     
T  3879863 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattag 3879962  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    | ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3879963 aataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagta 3880040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 4318647 - 4318923
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  4318647 gatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttg 4318745  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaatta 199  Q
    | |||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |||||||    
T  4318746 acatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaatta 4318845  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4318846 gattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 4318923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20768440 - 20768184
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20768440 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttga 20768342  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  20768341 catctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaga 20768242  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||  ||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20768241 ttaa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatg 20768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21016943 - 21017208
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||    
T  21016943 gattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagac------gtactattttatcgttg 21017035  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||  |||||||||     
T  21017036 acatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattag 21017135  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    ||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  21017136 attaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaa 21017208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 7234857 - 7235118
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatg---attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7234857 gatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcg 7234955  T
Q  98 ttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaat 197  Q
    |||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  7234956 ttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 7235055  T
Q  198 tatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7235056 tagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatga-gactgaacttttgatg 7235118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 103 - 273
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055311
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatat 7055240  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7055241 taagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 7055311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29182520 - 29182263
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  29182520 gattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcagta----attcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttg 29182425  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
      ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||    
T  29182424 gcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaatta 29182325  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
     |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  29182324 gattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatg 29182263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8513562 - 8513317
Alignment:
Q  26 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| | ||||    
T  8513562 tgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagtt 8513464  T
Q  126 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacccg 224  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||  || ||||||| || ||||||| |||||||||   |    
T  8513463 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatg 8513370  T
Q  225 atgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8513369 atgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 8513317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 33892837 - 33893098
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33892837 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttg 33892935  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| |||  |||||||||     
T  33892936 gcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattag 33893026  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||| || ||||| ||||||    
T  33893027 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaa 33893098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33619192 - 33618934
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgat---taatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33619192 gattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcg 33619094  T
Q  98 ttgaaatct-----ttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat 192  Q
    |||  ||||     |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||         |||  ||    
T  33619093 ttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcacac-ttctagggtgttacact--------ggtaggat 33619003  T
Q  193 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  33619002 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatg 33618934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6089237 - 6088992
Alignment:
Q  26 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||    
T  6089237 tgattaatgatcaatagta-attcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagtt 6089139  T
Q  126 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacccg 224  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||      ||||||||| |||  || ||||||| || |||  || ||||||||| | |    
T  6089138 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctg 6089045  T
Q  225 atgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6089044 atgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagt 6088992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 277
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353458
Alignment:
Q  75 gacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacg 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  175 cttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||||  | ||||||| | |||| || | |||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  275 agt 277  Q
    |||    
T  30353456 agt 30353458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 7054597 - 7054704
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7054597 gattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttg 7054696  T
Q  101 aaatcttt 108  Q
     |||||||    
T  7054697 gaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15491873 - 15491715
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    ||||||||||| |||| | | ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||  ||||||||| ||    
T  15491873 atctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagat 15491774  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15491773 taagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatg 15491715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 33724084 - 33724117
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatg 34  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33724084 gattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 6089255 - 6089227
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgat 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6089255 gattcatttttaaattgttgattaatgat 6089227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 8513580 - 8513552
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgat 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513580 gattcatttttaaattgttgattaatgat 8513552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24212076 - 24211799
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24212076 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttg 24211977  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  24211976 gaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattat 24211877  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24211876 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagta 24211799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30055861 - 30055586
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055861 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 30055763  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||     
T  30055762 gaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattag 30055663  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30055662 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 30055586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37110208 - 37109934
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37110208 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 37110110  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtata--ataaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  37110109 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaatt 37110010  T
Q  199 atattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37110009 atattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaac 37109934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 17842411 - 17842685
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17842411 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 17842509  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtata--ataaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  17842510 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaatt 17842609  T
Q  199 atattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  17842610 atattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaac 17842685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 31578891 - 31579155
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31578891 gattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 31578989  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||  |||||||||     
T  31578990 gaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattag 31579089  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31579090 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcatt 31579155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18797661 - 18797386
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18797661 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcg 18797563  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||  |||||||||     
T  18797562 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattag 18797463  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18797462 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 18797386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11071537 - 11071265
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11071537 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg 11071439  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
       |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  11071438 ---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 11071342  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11071341 attaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 11071265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 9355653 - 9355928
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9355653 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagca-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 9355751  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || ||||||     
T  9355752 gcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattag 9355851  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||| ||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  9355852 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagt 9355928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27284073 - 27283806
Alignment:
Q  6 atttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 105  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27284073 atttttaaattattgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatc 27283975  T
Q  106 tttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaa 205  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||| |||||    
T  27283974 tttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaa 27283875  T
Q  206 gtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    || |||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27283874 gtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaac 27283806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 32820880 - 32821155
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32820880 gattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 32820978  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||     
T  32820979 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaa 32821078  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32821079 attaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt 32821155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 15612586 - 15612859
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15612586 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaata-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattg 15612684  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  15612685 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaa 15612784  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  15612785 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaaca 15612859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23111526 - 23111253
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  23111526 gattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagta-attcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttg 23111428  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtat--aataaaatt 198  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23111427 ttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaatt 23111328  T
Q  199 atattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||| ||||||    
T  23111327 agattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaa 23111253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10481934 - 10481664
Alignment:
Q  6 atttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 105  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  10481934 atttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagta-attcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatc 10481836  T
Q  106 tttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaa 205  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||| |||||    
T  10481835 tttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaa 10481736  T
Q  206 gtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10481735 gcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagt 10481664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21991961 - 21991695
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991961 gattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagta-attcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 21991872  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  21991871 acatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 21991772  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21991771 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagt 21991695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Original strand, 41764907 - 41765164
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||      
T  41764907 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataata-attcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggc 41765005  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||    
T  41765006 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagat 41765105  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  41765106 taagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatg 41765164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 10359041 - 10359303
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10359041 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaat-catttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttg 10359139  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  10359140 acatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattag 10359239  T
Q  201 a-ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  10359240 atttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtca 10359303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32432786 - 32432513
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32432786 gattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataata-attcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttg 32432688  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||    
T  32432687 gcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattat 32432588  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    ||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32432587 attaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaaca 32432513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258607
Alignment:
Q  65 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  165 gggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 38258617  T
Q  265 ttctacaaac 274  Q
    || |||||||    
T  38258616 ttgtacaaac 38258607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7335127 - 7334853
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  7335127 gattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcg 7335029  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||     
T  7335028 gaatctttaacattcaaacta-gttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattag 7334930  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7334929 attaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 7334853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 5657309 - 5657583
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  5657309 attcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgg 5657407  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5657408 catctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaa 5657507  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||| | |||||||   ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5657508 ttaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 5657583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37347355 - 37347083
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  37347355 gattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagta-attcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattg 37347257  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  37347256 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattag 37347158  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    ||||||||||||| ||||||    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37347157 attaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaaca 37347083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 37703326 - 37703543
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37703326 attcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttga 37703424  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||  ||| ||||||||| |    
T  37703425 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattaga 37703524  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaa 220  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  37703525 ttaagtgtagtcttattaa 37703543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4583252 - 4582982
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||    
T  4583252 attcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagta-attcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttga 4583154  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  4583153 catctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaga 4583054  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4583053 ttaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 4582982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 15672587 - 15672830
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactatt---ttatcgt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||    
T  15672587 attcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgt 15672685  T
Q  99 tgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatt 198  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  15672686 tggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 15672785  T
Q  199 atattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatg 243  Q
    | |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  15672786 agattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Original strand, 46480961 - 46481174
Alignment:
Q  6 atttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  46480961 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatc 46481059  T
Q  106 tttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaa 205  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||    
T  46481060 tttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaa 46481159  T
Q  206 gtgtagtcttgttaa 220  Q
    || ||||||||||||    
T  46481160 gtatagtcttgttaa 46481174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8861619 - 8861344
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8861619 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtat-ttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 8861521  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||  |||||||||     
T  8861520 gtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 8861421  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||| | ||||||| | ||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||| || | ||||||||||    
T  8861420 attaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagt 8861344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6546853 - 6546612
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6546853 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttg 6546755  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  6546754 gcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 6546655  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatg 243  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  6546654 attaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 6546612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165850
Alignment:
Q  4 tcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtca 12165976  T
Q  104 tctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatatt 203  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  12165975 tctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagatt 12165885  T
Q  204 aagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  12165884 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 12165850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 48928124 - 48928382
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48928124 gatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttg 48928222  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  48928223 gcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 48928322  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||    
T  48928323 attaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatg 48928382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35353442 - 35353260
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35353442 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtg-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttg 35353344  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaa 184  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  35353343 acatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaa 35353260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22687565 - 22687315
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22687565 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 22687467  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||| |||||        | ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  22687466 gcatccttaac--------agagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 22687375  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgat 260  Q
    |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  22687374 attaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgat 22687315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 31520568 - 31520823
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31520568 gattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagta-attcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 31520666  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||| |||| |||||||||     
T  31520667 gcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtatgataaaattag 31520749  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31520750 attaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaaca 31520823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 33688110 - 33688375
Alignment:
Q  22 ttaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataa 121  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |     
T  33688110 ttaatgtttaatgatcaatagca-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacag 33688208  T
Q  122 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 221  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| | ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  33688209 agttgctgatatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaat 33688308  T
Q  222 ccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    | ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||| || |  ||||||||||  ||||||||||    
T  33688309 ctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagta--ggatgttact 33688375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29173856 - 29173599
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29173856 gattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 29173758  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||                 |||||||||| |||  |||||||||     
T  29173757 gcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtaaca-----------------cttaaaacaaggtaggataaaattag 29173676  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29173675 attaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 29173599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686099
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgag 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||| |||  |    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagg 43686131  T
Q  246 ggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43686130 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagt 43686099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 25691371 - 25691646
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||     
T  25691371 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatcgtta 25691469  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | ||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||  |||||||||     
T  25691470 acatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 25691569  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||| | |||||||   ||||||||||| ||| ||| ||  ||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  25691570 attaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagt 25691646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44598994 - 44598741
Alignment:
Q  8 ttttaaattgttgattaat---gattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaat 104  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||    
T  44598994 ttttaaattgttgattattattgattaatgatcaatagt---ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcat 44598898  T
Q  105 ctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatatta 204  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  44598897 ctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagatta 44598798  T
Q  205 agtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    | |||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||    
T  44598797 aatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatg 44598741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26980640 - 26980385
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26980640 gattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaata-attcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttg 26980542  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||                 |||||||||| ||| ||||||||||     
T  26980541 acatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagaataaaattag 26980459  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||    
T  26980458 attaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 26980385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26587919 - 26588126
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26587919 gatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 26588017  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||        | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  26588018 gcatctttaac--------agagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 26588109  T
Q  201 attaagtgtagtcttgt 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26588110 attaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43925429 - 43925167
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||    
T  43925429 gattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtattattttatcgttg 43925337  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||  |||||| | |||||||||| |||| |||||||||     
T  43925336 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattag 43925237  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctaca 271  Q
    |||||||||| | ||||||  | ||| | ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  43925236 attaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtaca 43925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 44411368 - 44411509
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  44411368 attcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttgg 44411466  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagt 144  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44411467 catctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 32593040 - 32593191
Alignment:
Q  8 ttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctt 107  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  32593040 ttttaaattgttgattgctgattaatgatccatagta-atttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctt 32593138  T
Q  108 taacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 160  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32593139 taacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 32593191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37704516 - 37704387
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37704516 gattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagta-attcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 37704418  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgat 131  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37704417 gcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 290
Target Start/End: Original strand, 12390478 - 12390743
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||      
T  12390478 ttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagta-attcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggc 12390576  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||                 ||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  12390577 atctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtg--agtcttaagtgttaca-----------------cttaaaagaaggtagaataaaattagat 12390657  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||    
T  12390658 taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagt--gggatgttact 12390743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704241
Alignment:
Q  106 tttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaa 205  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 37704288  T
Q  206 gtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaa 252  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  37704287 gtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053637
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  146 ttaagtgttacactt 160  Q
    |||||||||||||||    
T  38053651 ttaagtgttacactt 38053637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421481
Alignment:
Q  108 taacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagt 207  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||  ||||||||| |||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27421412  T
Q  208 gtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||| ||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27421413 gtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 27421481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 34362005 - 34362121
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34362005 gattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagta-attcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttg 34362103  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaa 118  Q
    | || |||||||||||||    
T  34362104 atatttttaacatgcaaa 34362121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 261
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928649
Alignment:
Q  84 gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaaca 183  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |  |||||||| ||||||| |    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaata 48928572  T
Q  184 aagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    | |||  ||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||    
T  48928573 atgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatg 48928649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 275
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413479
Alignment:
Q  147 taagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagg 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||||  |    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  247 gctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
     | ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaaca 44413479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 38258913 - 38258870
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagta 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38258913 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta 38258870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38053634 - 38053544
Alignment:
Q  180 aacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||        | ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38053634 aacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgtta--------atttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagta 38053544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 93
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  28 attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactatttt 93  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattat-ttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 260
Target Start/End: Original strand, 32593189 - 32593273
Alignment:
Q  175 cttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgat 260  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||    
T  32593189 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgat 32593273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 11366224 - 11366496
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366224 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 11366323  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||| ||||||||||    
T  11366324 aaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattat 11366423  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11366424 attaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaa 11366496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 43648089 - 43648364
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43648089 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttg 43648187  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||     
T  43648188 aaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattag 43648287  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43648288 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagt 43648364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41961199 - 41960939
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41961199 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg 41961101  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  41961100 gcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 41961001  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgt 262  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  41961000 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 41960939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 2325222 - 2325487
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2325222 gatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 2325320  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||     
T  2325321 taatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattag 2325420  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||||||||||||||        | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  2325421 attaagtgtagtcttgtta--------atttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaaca 2325487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3177298 - 3177023
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3177298 gatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagta-attcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttg 3177200  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  3177199 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattag 3177100  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3177099 attaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 3177023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4763990 - 4763715
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4763990 gattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagta-attcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgtta 4763892  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||     
T  4763891 gcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattag 4763792  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4763791 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 4763715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 33550827 - 33551105
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatga----tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  33550827 gattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagt-tattcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatc 33550925  T
Q  97 gttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  33550926 gttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaa 33551024  T
Q  197 ttatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33551025 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 33551105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 33709076 - 33709351
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  33709076 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattg 33709174  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  33709175 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33709274  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||  | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  33709275 attaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagt 33709351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4167280 - 4167006
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4167280 attcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagta-attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttga 4167182  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |    
T  4167181 catctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 4167082  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4167081 ttaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt 4167006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37906067 - 37905795
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |    
T  37906067 ttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagta-attcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattgga 37905969  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt--agggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||     
T  37905968 atctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 37905869  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37905868 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 37905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44914026 - 44913748
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcat---ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44914026 gattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagta-attcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcg 44913928  T
Q  98 ttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaa 196  Q
    |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  44913927 ttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaa 44913828  T
Q  197 ttatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgaggg-ctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    ||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44913827 ttagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaaca 44913748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Original strand, 19289168 - 19289440
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |     
T  19289168 attcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcgg 19289266  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||| |    
T  19289267 aatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattaga 19289366  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| | ||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  19289367 ttaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaaca 19289440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35959251 - 35959023
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  35959251 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacat----gtactattttatcgttg 35959157  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || |||||||    
T  35959156 aaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattat 35959058  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatg 235  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  35959057 attaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg 35959023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 39167214 - 39167482
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39167214 attcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagta-attcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttga 39167312  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  39167313 catctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaga 39167406  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39167407 ataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 39167482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 31570578 - 31570840
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  31570578 gattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttg 31570676  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  31570677 gcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattag 31570776  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  31570777 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtca 31570840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41465860 - 41465602
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41465860 gattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagta-attcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 41465762  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  41465761 gcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 41465662  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgat 260  Q
    |||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  41465661 attaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31862211 - 31861948
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  31862211 gattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcg 31862113  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||     
T  31862112 gaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattag 31862013  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcat 265  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||| ||||    
T  31862012 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgatatcat 31861948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 67 - 273
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071852
Alignment:
Q  67 acatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagg 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  167 gtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    ||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  267 ctacaaa 273  Q
     ||||||    
T  17071846 gtacaaa 17071852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26357936 - 26357650
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  26357936 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttg 26357838  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  26357837 gcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 26357738  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    |||||||||  |||||||||   ||||||||||| |   ||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||    
T  26357737 attaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt--gggatgttact 26357650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 29241989 - 29242257
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29241989 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagta-attcatctagtaattc-------atcttggacttacaggtactattgtatcgttg 29242080  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  29242081 acatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 29242180  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  || | ||||||||||    
T  29242181 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagt 29242257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 33660221 - 33660487
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33660221 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttg 33660319  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||          |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  33660320 acatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg---------ggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33660410  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| || |||||| |  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33660411 attaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 33660487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44286033
Alignment:
Q  26 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagta-attcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagtt 44286185  T
Q  126 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccga 225  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||    
T  44286184 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctga 44286085  T
Q  226 tgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || | ||||||||||    
T  44286084 tgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagt 44286033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 18494125 - 18494385
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18494125 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagca-attcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 18494223  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||| ||||| |||| |||  |||||||||     
T  18494224 gcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattag 18494322  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtc 263  Q
    || ||||||| ||| || || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18494323 atcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 18494385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264207
Alignment:
Q  7 tttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatct 106  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||  ||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattat-ttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatct 4264024  T
Q  107 ttaacatgcaaataaagttgatgatattatgt-gatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaa 205  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||  ||||||||| |||||    
T  4264025 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 4264124  T
Q  206 gtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    ||||| |||| ||||   ||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||    
T  4264125 gtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt--gggatgttact 4264207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 27349792 - 27350057
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27349792 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttg 27349890  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||||||||| |||||| | ||||  |||||| |||||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||   |||||||||     
T  27349891 gaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattag 27349981  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27349982 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 27350057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054213
Alignment:
Q  67 acatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagg 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  167 gtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    ||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  267 ctacaaaca 275  Q
     ||||||||    
T  17054205 gtacaaaca 17054213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478455
Alignment:
Q  8 ttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagca-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatctt 4478619  T
Q  108 taacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaattatattaag 206  Q
    ||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||     ||||||| |||||||||| |||  || ||||||| ||||||    
T  4478618 taacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaag 4478524  T
Q  207 tgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || | ||||||||    
T  4478523 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaaca 4478455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327817
Alignment:
Q  56 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  156 cactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaactt 255  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaactt 45327826  T
Q  256 ttgatgtca 264  Q
    |||||||||    
T  45327825 ttgatgtca 45327817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 19424486 - 19424731
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||              
T  19424486 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat---------- 19424574  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
        |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  19424575 ----ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattag 19424670  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  19424671 attaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatg 19424731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642070
Alignment:
Q  56 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  156 cactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat--aaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaac 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||  ||||||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 36642094  T
Q  254 ttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||    
T  36642093 ttttgatgtcactgtacaaacagt 36642070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 19500759 - 19500920
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||     
T  19500759 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgtta 19500857  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 163  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19500858 acatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt 19500920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13711818 - 13711551
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13711818 gattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctg 13711720  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||     || |||||||||     
T  13711719 gcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaac-----atgataaaattag 13711625  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||| || || |||||||||||||| | |||||||    
T  13711624 attaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaac 13711551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5881888 - 5881623
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5881888 gattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttg 5881790  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||         |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||| || ||||||     
T  5881789 acatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgat-aaattag 5881700  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| || | || || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  5881699 attaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagt 5881623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 7006782 - 7006940
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7006782 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaa-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 7006880  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 160  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7006881 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgttacactt 7006940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 43770692 - 43770942
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  43770692 gattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaa-attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttg 43770790  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||         |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | |  |||||||||     
T  43770791 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaa 43770881  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  43770882 attaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatg 43770942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19313949
Alignment:
Q  21 attaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta---caggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaa 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19314186 attactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaa 19314088  T
Q  118 ataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgt 217  Q
    | | ||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19314087 acatagttgctgatatcatgtgat-------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgt 19313995  T
Q  218 taacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  19313994 taatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtca 19313949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 277
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463969
Alignment:
Q  87 ctattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaag 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaag 41463878  T
Q  187 tataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41463879 tatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt 41463969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902150
Alignment:
Q  108 taacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagt 207  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||  ||||| |    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaat 33902220  T
Q  208 gtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||||||| | |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33902219 atagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagt 33902150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 18258198 - 18258350
Alignment:
Q  69 atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggt 168  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18258198 atcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggt 18258297  T
Q  169 gttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 221  Q
    ||||| ||||||| || |||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  18258298 gttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaac 18258350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 41051144 - 41051259
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  41051144 gattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataaca-attcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttatccttg 41051242  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaa 118  Q
      || |||||||||||||    
T  41051243 gcat-tttaacatgcaaa 41051259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Original strand, 18257383 - 18257453
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 73  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257383 attcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataata-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 41463434 - 41463520
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtact 88  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||    
T  41463434 gattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagta-atttatctattaatgtttacaacatcttagacttagaggtact 41463520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 290
Target Start/End: Original strand, 7006938 - 7007051
Alignment:
Q  175 cttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||| |||| |  || |||||||||||  | | |||||||    
T  7006938 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaac 7007037  T
Q  275 agtacgggatgttact 290  Q
    |||  |||||||||||    
T  7007038 agt--gggatgttact 7007051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 258
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  178 aaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttg 258  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||   | |||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33902373 - 33902317
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 58  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  33902373 gatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataata-attcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 261
Target Start/End: Original strand, 41051271 - 41051308
Alignment:
Q  224 gatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41051271 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 41051308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21009627 - 21009899
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21009627 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttg 21009726  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||    
T  21009727 gaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattat 21009826  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009827 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 21009899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47481873 - 47481597
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47481873 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttg 47481774  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  47481773 aaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattat 47481674  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47481673 attaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagt 47481597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 42505901 - 42506176
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505901 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 42505999  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  |||||||||     
T  42506000 gaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattag 42506099  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42506100 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 42506176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 54506158 - 54505891
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  54506158 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttg 54506059  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  54506058 gaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattat 54505959  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  54505958 attaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatga-ggctgaatttttgatgtcattcta 54505891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34133285 - 34133010
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133285 gattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 34133187  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  34133186 gcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattat 34133087  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||| |||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34133086 attaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 34133010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 26941086 - 26941361
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26941086 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 26941184  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||     
T  26941185 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattag 26941284  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26941285 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagt 26941361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 40552085 - 40552357
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40552085 gattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttg 40552183  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||  ||  |||||||||     
T  40552184 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaa 40552283  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40552284 attaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 40552357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 46297588 - 46297863
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46297588 gattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttg 46297686  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||      
T  46297687 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttg 46297786  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| || | || |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  46297787 attaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagt 46297863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 53228978 - 53229237
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  53228978 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatacta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttg 53229076  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||  |||||||||     
T  53229077 gcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattag 53229176  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  53229177 attaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatg 53229237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 52040748 - 52041021
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52040748 gattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatc-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 52040846  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  52040847 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 52040946  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||||||||    
T  52040947 attaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaaca 52041021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 7327308 - 7327579
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7327308 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttg 7327406  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| || |||  |||||| ||     
T  7327407 gcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataa 7327506  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  7327507 attaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaa 7327579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 22622544 - 22622780
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22622544 gattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 22622642  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||     
T  22622643 acatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattag 22622742  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  22622743 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39283002 - 39282743
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  39283002 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttg 39282904  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  39282903 acatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 39282804  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  39282803 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatg 39282743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994751
Alignment:
Q  4 tcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaa 46994588  T
Q  104 tctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatatt 203  Q
    |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||| |||  ||||||||| |||    
T  46994589 tctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatt 46994688  T
Q  204 aagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46994689 aagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 46994751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 4761474 - 4761750
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |    
T  4761474 gattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagta-attcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttattgtcg 4761572  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||| |||  |||||||||    
T  4761573 gaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaatta 4761672  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4761673 gattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 4761750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4015809 - 4015535
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4015809 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttg 4015711  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| || |||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  4015710 gcatctttaacatgcaaacaa-gttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 4015612  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    | ||| | || |||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4015611 actaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagt 4015535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 33378611 - 33378873
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33378611 gattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttg 33378709  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  33378710 acatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33378809  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  33378810 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtca 33378873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48355291 - 48355018
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  48355291 gattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataata-attcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcg 48355193  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||     
T  48355192 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattag 48355093  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  48355092 actaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaaca 48355018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37203418 - 37203142
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37203418 gattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggta-attcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattg 37203320  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataa-agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    | ||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| || |||  |||||||||    
T  37203319 acatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaatta 37203220  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37203219 gattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 37203142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44891847 - 44891588
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  44891847 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttg 44891749  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  44891748 acatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 44891649  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  44891648 attaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatg 44891588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 24707941 - 24708205
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24707941 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagta-atttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttg 24708039  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  24708040 gcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 24708139  T
Q  201 at--taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  24708140 atcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtca 24708205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3362605 - 3362317
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  3362605 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttg 3362507  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||  |||||||||     
T  3362506 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattag 3362407  T
Q  201 atta--agtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || | |||||| |||  |||||||||||    
T  3362406 attaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagt--gggatgttact 3362317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33698503 - 33698267
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33698503 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttg 33698405  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  33698404 gcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33698305  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  33698304 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 33698267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 24488788 - 24489063
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||    
T  24488788 gattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagta-atgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttg 24488886  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  24488887 gcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattag 24488986  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24488987 attaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagt 24489063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 274
Target Start/End: Original strand, 3655031 - 3655300
Alignment:
Q  6 atttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcat--ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| || ||    
T  3655031 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagta-attcatatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaa 3655129  T
Q  104 tctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatatt 203  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||| |||  ||||||||| |||    
T  3655130 tctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagatt 3655229  T
Q  204 aagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3655230 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 3655300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32373813 - 32373545
Alignment:
Q  8 ttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32373813 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaa-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctt 32373715  T
Q  108 taacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagt 207  Q
    ||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  32373714 taatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagt 32373615  T
Q  208 gtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||||||  ||  |||  |||||||||||| || | ||||||||||    
T  32373614 gtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacagt 32373545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37158058 - 37157798
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  37158058 gattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggta-attcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattg 37157960  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataa-agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
      ||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||  |||||||||    
T  37157959 gcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaatta 37157860  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
     |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  37157859 gattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatg 37157798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22451318 - 22451059
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22451318 gattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataata-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttg 22451220  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||     
T  22451219 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattag 22451120  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  22451119 attaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 22451059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2008289 - 2008008
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgatta-------atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactatttt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2008289 gattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattat-ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactatttt 2008191  T
Q  94 atcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataata 193  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| | |||  |||    
T  2008190 atcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtg-tacacttaaaacgaggtaggata 2008092  T
Q  194 aaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2008091 aaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt 2008008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 11357207 - 11357449
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11357207 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 11357305  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||| || |||  |||||||||     
T  11357306 gtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaataaggtaggataaaattag 11357388  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11357389 attaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatg 11357449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 22445891 - 22446150
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22445891 gattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttg 22445989  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  22445990 gtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt-gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 22446088  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgaggg-ctgaacttttgatg 261  Q
    ||||||||||||||| || |   ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  22446089 attaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatg 22446150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1090043 - 1089827
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  1090043 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttg 1089946  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtaggg-tgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  1089945 gcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 1089846  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgtt 218  Q
     ||| | ||||||| ||||    
T  1089845 gatttaatgtagtcctgtt 1089827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21193957 - 21193681
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||      
T  21193957 gattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagta-attcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtga 21193859  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
     ||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||  |||| | | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  21193858 gaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 21193759  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21193758 gattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagt 21193681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25580087 - 25579827
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  |||||||||||      
T  25580087 ttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggc 25579989  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||  ||||||||| ||    
T  25579988 atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagat 25579889  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    |||||||| | ||||||| |  || || |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  25579888 taagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtca 25579827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38592048 - 38591778
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  38592048 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-atttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttg 38591950  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||| ||| ||||||  ||  |||||||||     
T  38591949 tcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattag 38591850  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaa 272  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  38591849 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaa 38591778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 43975718 - 43975977
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43975718 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttg 43975816  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataa---agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaat 197  Q
      |||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| |||       ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||    
T  43975817 gcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgat-------agtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaat 43975909  T
Q  198 tatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcat 265  Q
    || |||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  43975910 tagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcat 43975977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828788
Alignment:
Q  20 gattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaat 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||     
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaac 54828644  T
Q  120 aaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgtta 219  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| || || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  54828645 atagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttc 54828744  T
Q  220 acccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtc 263  Q
    |   ||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||||||    
T  54828745 atatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtc 54828788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36012489 - 36012244
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36012489 gatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttg 36012391  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataa-agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaatt 198  Q
      |||||||||||| ||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||| |||  || ||||||    
T  36012390 gcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaatt 36012291  T
Q  199 atattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgag 245  Q
    | |||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  36012290 agattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174596
Alignment:
Q  36 tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatatta 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| |||||| |    
T  45174821 tcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatca 45174723  T
Q  136 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgat 234  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  45174722 tattatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgat 45174623  T
Q  235 gatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  45174622 gatactatggggactgaacttttgatg 45174596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29099696 - 29099430
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  29099696 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgtta 29099598  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |         |||||||||||| ||||||||| ||||||| || | |  |||||||||     
T  29099597 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaa---------gttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaa 29099507  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| || | || ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29099506 attaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagt 29099430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348371
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 43348371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11467142 - 11466899
Alignment:
Q  26 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| | ||||    
T  11467142 tgattaatgatcaatagta-attcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagtt 11467051  T
Q  126 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccga 225  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||    
T  11467050 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 11466951  T
Q  226 tgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| || | ||||||||||    
T  11466950 tgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagt 11466899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Original strand, 51212599 - 51212743
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  51212599 ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcgga 51212697  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtctta 148  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51212698 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29164134 - 29163912
Alignment:
Q  26 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||    
T  29164134 tgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagtt 29164036  T
Q  126 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccga 225  Q
    | |||||| |||||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| |||| | ||    
T  29164035 gctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctga 29163945  T
Q  226 tgaattgatgatattatgagggctgaacttttg 258  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  29163944 tgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 44186343 - 44186589
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  44186343 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattg 44186441  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||                |||| |||||||||  ||||||||| |||  |||||||||     
T  44186442 gcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag----------------ttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattag 44186525  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    |||||||||| | |||||||   ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  44186526 attaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 44186589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 14586506 - 14586732
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14586506 gatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttac-cgtactattttatcgttg 14586603  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||  |         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||     
T  14586604 gcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttag 14586694  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  14586695 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 14586732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40936323 - 40936079
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  40936323 gatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttg 40936225  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||||||||   ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||                  ||| |||||   ||||||||||    
T  40936224 gcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt------------------aaaaaaagttggataaaattat 40936143  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40936142 attaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 40936079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 27480184 - 27480467
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttg----caacatcttggacttacaggtactattttatc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||     ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27480184 gattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagta-attcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatc 27480282  T
Q  97 gttgaaatctttaacatgcaa----ataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----tgt--------agggtgttacgcttaa 179  Q
    ||||  |||||||||||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||         ||||||||| |||||    
T  27480283 gttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttacacttaa 27480382  T
Q  180 aacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    ||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  27480383 aacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 27480467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 243
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835695
Alignment:
Q  36 tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatatta 135  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||      ||||||||| |||||||||||| |    
T  11835494 tcaatagta-attcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatca 11835586  T
Q  136 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaa-attatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||| | |||||||   ||| |||||||    
T  11835587 tgtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgat 11835686  T
Q  235 gatattatg 243  Q
    |||| ||||    
T  11835687 gatactatg 11835695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35844581 - 35844401
Alignment:
Q  97 gttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaa 196  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||    
T  35844581 gttgacatctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaa 35844483  T
Q  197 -ttatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  35844482 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagt 35844401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 50475143 - 50475021
Alignment:
Q  19 tgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  50475143 tgattaatgattaatgatcaatacta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaa 50475045  T
Q  119 taaagttgatgatattatgtgata 142  Q
     | | ||||||||||||| |||||    
T  50475044 cagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53176290 - 53176129
Alignment:
Q  116 aaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtctt 215  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||  | ||   ||||||||| |||||||||| ||||    
T  53176290 aaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatctt 53176191  T
Q  216 gttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  53176190 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagt 53176129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Original strand, 20373136 - 20373252
Alignment:
Q  68 catcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtaggg 167  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||     
T  20373136 catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatggga 20373235  T
Q  168 tgttacgcttaaaacaa 184  Q
    | ||||||||| |||||    
T  20373236 tattacgcttataacaa 20373252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 277
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213082
Alignment:
Q  150 gtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggct 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  250 gaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagt 51213082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 11356984 - 11357137
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||         | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  11356984 gattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagta---------attaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattg 11357074  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 163  Q
      || |||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11357075 gcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttgt 11357137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Original strand, 53811604 - 53811701
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  53811604 attcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgc----aaagttgatgatattatgtgatagtc 53811699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 277
Target Start/End: Original strand, 20373311 - 20373397
Alignment:
Q  191 ataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20373311 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 20373397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 20373089 - 20373132
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagta 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20373089 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta 20373132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 11467160 - 11467132
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgat 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11467160 gattcatttttaaattgttgattaatgat 11467132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 145842 - 146113
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  145842 attcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttgg 145941  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  145942 aatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattata 146041  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  146042 ttaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaa 146113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 30654421 - 30654690
Alignment:
Q  8 ttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctt 107  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30654421 ttttaaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttt 30654520  T
Q  108 taacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagt 207  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  30654521 taacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagt 30654620  T
Q  208 gtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30654621 gtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagt 30654690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 1149464 - 1149739
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149464 gattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 1149562  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||     
T  1149563 gaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattag 1149662  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1149663 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagt 1149739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 8803648 - 8803913
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8803648 gattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 8803747  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8803748 gaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattat 8803847  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8803848 attaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtcattctacaaa 8803913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1205285 - 1205010
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1205285 gattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtta 1205187  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||     
T  1205186 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattag 1205087  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1205086 attaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 1205010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16223221 - 16222949
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  16223221 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattg 16223123  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | |  |||||||||     
T  16223122 gaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattag 16223023  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16223022 attaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 16222949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9864506 - 9864231
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9864506 gattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagt-tattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttg 9864408  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  9864407 gcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattat 9864308  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||| |||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9864307 attaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 9864231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 16446707 - 16446982
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16446707 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattg 16446805  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  16446806 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaa 16446905  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16446906 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagt 16446982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 37970351 - 37970626
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  37970351 gattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaa 37970449  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||     
T  37970450 ggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattag 37970549  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37970550 attaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagt 37970626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 7890789 - 7891061
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  7890789 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttg 7890887  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||     
T  7890888 gaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactag 7890987  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||    
T  7890988 attgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaac 7891061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 43643427 - 43643703
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  43643427 gattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 43643525  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||     
T  43643526 gaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 43643625  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43643626 atcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagta 43643703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 5299779 - 5300054
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  5299779 attcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgt 5299877  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||   ||||||||| |    
T  5299878 tatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattaga 5299977  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  5299978 ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagta 5300054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 27082671 - 27082925
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27082671 attcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttga 27082769  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||  |||  ||||||||| |    
T  27082770 catctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattaga 27082869  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaactttt 257  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27082870 ttaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 27082925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 6098345 - 6098625
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat----- 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||         
T  6098345 gattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtattgtat 6098443  T
Q  96 cgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaa 195  Q
    |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  |||||    
T  6098444 cgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaa 6098543  T
Q  196 attatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6098544 attagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 6098625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11727382 - 11727123
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  11727382 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttg 11727284  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||  |||||||||     
T  11727283 gcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 11727184  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11727183 attaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatg 11727123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 36694798 - 36695073
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36694798 gatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagta-attcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttg 36694896  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  36694897 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 36694996  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36694997 attaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 36695073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 1953820 - 1954081
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1953820 gattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttg 1953918  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtaggg-tgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    | | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  1953919 acaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaatta 1954018  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgat-gatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
     ||| ||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1954019 gatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatg 1954081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 4132519 - 4132750
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4132519 attcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgg 4132617  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  4132618 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacactt-aaacaaggtagaataaaattaga 4132716  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  4132717 ttaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12876468 - 12876192
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12876468 gatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagta-attcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 12876370  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  12876369 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaatta 12876270  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     ||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12876269 gattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 12876192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 23854263 - 23854538
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23854263 gattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcg 23854361  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||  |||||||||     
T  23854362 gaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattag 23854461  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||||| ||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23854462 attaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagt 23854538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33906568 - 33906316
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33906568 gattcatttttaaatt--tgattgctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 33906472  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  33906471 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattag 33906372  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttt 256  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  33906371 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 10555037 - 10555309
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtata-ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  10555037 gattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtc 10555133  T
Q  100 gaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||  |||||| |||||| ||||| |||  |||||||||    
T  10555134 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaatta 10555231  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10555232 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 10555309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 35459543 - 35459818
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |    
T  35459543 gattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcg 35459641  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| || ||||||  ||| |||||||||  |||||||||     
T  35459642 aaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattag 35459741  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  35459742 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaatcagt 35459818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34895320 - 34895050
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  34895320 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttg 34895222  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||     |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||     
T  34895221 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattag 34895127  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34895126 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagt 34895050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 38644336 - 38644077
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38644336 gatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattg 38644238  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | ||||||||| |||||| | ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  38644237 acatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 38644138  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  38644137 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatg 38644077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 31933718 - 31933982
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  31933718 gattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataata-attcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttg 31933816  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||     
T  31933817 gaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattag 31933916  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||    
T  31933917 attaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcatt 31933982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40862771 - 40862503
Alignment:
Q  7 tttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatct 106  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40862771 tttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 40862673  T
Q  107 ttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaag 206  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  40862672 ttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaag 40862573  T
Q  207 tgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||| | ||||||    ||  |||||||||||  |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40862572 tgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttgatgccattgtacaaacagt 40862503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44869855 - 44869580
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44869855 gattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttg 44869757  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaatta 199  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    || |||||||||| |||  || |||||||    
T  44869756 acatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggacaacacttaaaacaaggtaggataaaaatta 44869658  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44869657 gattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagt 44869580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 39098955 - 39099210
Alignment:
Q  5 catttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaat 104  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  39098955 catttttaaattattgattattaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacat 39099053  T
Q  105 ctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatatta 204  Q
     ||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||||||  |||  ||||||||| ||||    
T  39099054 atttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagatta 39099153  T
Q  205 agtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39099154 agtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatg 39099210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 466190 - 465925
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  466190 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattg 466092  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  466091 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgata-tatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattag 466002  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || | || ||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  466001 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagt 465925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307710
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgag 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| |    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggg 13307738  T
Q  246 ggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  13307737 gactgaacttttgatgtcactgtacaaa 13307710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149909
Alignment:
Q  5 catttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaat 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaat 1149854  T
Q  105 ctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  1149855 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactttgt 1149909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12587940 - 12587812
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12587940 gattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttg 12587842  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatga 130  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12587841 acatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18259437 - 18259233
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18259437 gattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaata-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 18259339  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | || |||||||||||||| || ||| ||||||  |||||    |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||| |||||||||     
T  18259338 acatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga----cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaa 18259243  T
Q  201 attaagtgta 210  Q
    ||||| ||||    
T  18259242 attaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 261
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41911079
Alignment:
Q  76 acttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgc 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttgca-tctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacac 41910993  T
Q  176 ttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||    
T  41910994 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatg 41911079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35859292 - 35859160
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  35859292 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttg 35859194  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatatt 134  Q
      |||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  35859193 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 34951889 - 34952020
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34951889 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 34951987  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatat 133  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  34951988 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 24823226 - 24823395
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24823226 gatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 24823324  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaa 179  Q
      |||||||||        | ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  24823325 gcatctttaac--------agagttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacacttaa 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025820
Alignment:
Q  90 ttttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtat 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| || |||     
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtag 43025873  T
Q  190 aataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattat 242  Q
     ||||||||| ||||| |||| |||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  43025872 gataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattat 43025820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 33198160 - 33198062
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  33198160 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttg 33198062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 290
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150223
Alignment:
Q  155 acactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaact 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  255 tttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagt--gggatgttact 1150223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362602
Alignment:
Q  168 tgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattc 267  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |     
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  268 tacaaa 273  Q
    ||||||    
T  41362607 tacaaa 41362602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34463785 - 34463704
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatga 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34463785 attcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 277
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952138
Alignment:
Q  167 gtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||| |    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  267 ctacaaacagt 277  Q
     ||||||||||    
T  34952128 gtacaaacagt 34952138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7998555 - 7998478
Alignment:
Q  83 ggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7998555 ggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 41362779 - 41362723
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaat 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41362779 attcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagta-attcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998411
Alignment:
Q  167 gtgttacgcttaaaacaaagtataataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatg 243  Q
    ||||||| |||||||||| |||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatg 7998411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12585353 - 12585297
Alignment:
Q  123 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaa 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  12585353 gttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacacttaa 12585297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33198003 - 33197948
Alignment:
Q  206 gtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  33198003 gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatg 33197948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 43026032 - 43025989
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagta 44  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  43026032 gattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagta 43025989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8246 - 7971
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8246 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 8148  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  |||||||||     
T  8147 gaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattag 8048  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8047 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 7971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 699509 - 699234
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  699509 gattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 699411  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||| |||||||||     
T  699410 gcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattag 699311  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  699310 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 699234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 38528053 - 38528314
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38528053 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 38528151  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  38528152 atatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattag 38528251  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  38528252 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtca 38528314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22255541 - 22255269
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255541 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 22255443  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||   ||||||||     
T  22255442 gaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattag 22255343  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  22255342 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaac 22255269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 31786462 - 31786737
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31786462 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 31786560  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||     
T  31786561 gcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattag 31786660  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31786661 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt 31786737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 31705428 - 31705699
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  31705428 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttg 31705526  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||     
T  31705527 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattag 31705626  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31705627 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaac 31705699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22981152 - 22980888
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22981152 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataata-attcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttg 22981054  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  22981053 gcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 22980954  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  22980953 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 22980888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35504724 - 35504452
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35504724 gattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagta-attcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 35504626  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||  ||||||||||    
T  35504625 aaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattat 35504526  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  35504525 attaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaac 35504452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5830249 - 5829988
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5830249 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgga 5830151  T
Q  103 atctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatat 202  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||| | ||    
T  5830150 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagat 5830051  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  5830050 taagtgtagtcttgtt---------aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaac 5829988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 35826302 - 35826572
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35826302 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 35826400  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  35826401 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattag 35826498  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    ||||| ||| || |||||||  | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35826499 attaaatgtggtattgttaa-tctatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaaca 35826572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 22973898 - 22974184
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  22973898 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 22973996  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||     
T  22973997 aaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattag 22974096  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  22974097 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagt--gggatgttact 22974184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 7208680 - 7208951
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7208680 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataata-attcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttg 7208778  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||     
T  7208779 gaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattag 7208878  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  7208879 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaac 7208951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27330663 - 27330387
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  27330663 gattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttg 27330565  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  27330564 aaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 27330465  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagta 278  Q
    |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27330464 attaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagta 27330387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 30969140 - 30969404
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  30969140 gattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagta-actcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttg 30969238  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||     
T  30969239 acatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattag 30969338  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcatt 266  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30969339 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 30969404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 8741701 - 8741975
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8741701 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtat-ttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttg 8741799  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatatt-atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  8741800 acatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaatta 8741899  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
     ||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8741900 gattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaaca 8741975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 27318304 - 27318578
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaa-ttgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||    
T  27318304 gattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagta-attcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttatcgtt 27318400  T
Q  100 gaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaatta 199  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  27318401 gaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaatta 27318500  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27318501 gattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagt 27318578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 17157847 - 17158118
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17157847 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataata-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttg 17157945  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || |||  ||| ||||||    
T  17157946 aaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattat 17158045  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| | | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  17158046 actaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaac 17158118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5837914 - 5837639
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5837914 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttg 5837816  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||  || ||||||     
T  5837815 tcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattag 5837716  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  5837715 attaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagt 5837639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 15992356 - 15992631
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15992356 gattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttg 15992454  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||| ||| ||| ||||||||||     
T  15992455 gcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattag 15992554  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15992555 atcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 15992631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12910714 - 12910452
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  12910714 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttg 12910616  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  12910615 gcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 12910516  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12910515 attaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtca 12910452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40133743 - 40133473
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  40133743 attcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagta-attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttga 40133645  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |    
T  40133644 catctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 40133545  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 273  Q
    |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  40133544 ttaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaa 40133473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 13956187 - 13956414
Alignment:
Q  10 ttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatcttta 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13956187 ttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatcttta 13956285  T
Q  110 acatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgt 209  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||| ||||||||     
T  13956286 acatgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtga 13956385  T
Q  210 agtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  13956386 agttttgttaatctgatgaattgatgata 13956414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19120218 - 19119943
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  19120218 gattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttg 19120120  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||  |||||||||     
T  19120119 gcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattag 19120020  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19120019 agtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 19119943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33908591 - 33908333
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33908591 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagta-att-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 33908494  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||     
T  33908493 gcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattag 33908394  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33908393 attaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 33908333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35934252 - 35933995
Alignment:
Q  4 tcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  35934252 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataata-attcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgaca 35934154  T
Q  104 tctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataat-aaaattatat 202  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  || |||| || ||    
T  35934153 tctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagat 35934054  T
Q  203 taagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||    
T  35934053 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatg 35933995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 25500742 - 25501017
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25500742 gattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtat-ttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttg 25500840  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  25500841 gcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaa 25500940  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||  || || ||||||||||| || | ||||||||||    
T  25500941 attaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagt 25501017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 35511298 - 35511568
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35511298 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttg 35511396  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||     |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||     
T  35511397 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattag 35511491  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35511492 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagt 35511568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36867120 - 36866846
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36867120 attcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagta-attcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttga 36867022  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |    
T  36867021 catctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 36866922  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36866921 ttaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt 36866846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36860783 - 36860507
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  36860783 gattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagta-attcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 36860685  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaa-gtataataaaatta 199  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||    
T  36860684 acatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaatta 36860585  T
Q  200 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     ||||| |||| ||||||||    ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36860584 gattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 36860507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 23116046 - 23116313
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116046 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtc---------agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 23116136  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||     
T  23116137 acatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 23116236  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||  || | ||||||||||    
T  23116237 attaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagt 23116313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 2888261 - 2888472
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2888261 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 2888359  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||  ||| |||||| ||| ||||||||||     
T  2888360 acatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattag 2888459  T
Q  201 attaagtgtagtc 213  Q
    |||||||||||||    
T  2888460 attaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24886446 - 24886188
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24886446 gattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttg 24886348  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||| || || |||  |||||||||     
T  24886347 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttataataaggtaggataaaattag 24886265  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24886264 attaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 24886188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39573170 - 39572903
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  39573170 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattg 39573072  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||        | ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  39573071 gcatctttaac--------agagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 39572980  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  39572979 attaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagt 39572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8437323 - 8437052
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8437323 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgg 8437225  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    |||||||||| | |  ||||||||| |    
T  8437224 catctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattaga 8437125  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||  |||| |||| || | ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8437124 ttaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaaca 8437052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15724847 - 15724574
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15724847 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagta-attcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttatagttg 15724749  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||  ||||||| || ||| ||||||||||     
T  15724748 acatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaa 15724649  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  15724648 attaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagt 15724574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 43308476 - 43308743
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  43308476 gattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcg 43308574  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||  | ||||||||||        ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||     
T  43308575 gaatctttaacatgcaagaagagttgatgat--------atagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattag 43308666  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  43308667 attaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt 43308743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7693580 - 7693303
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  7693580 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttg 7693482  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  7693481 acatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattag 7693391  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    |||||| ||| || |||||| |  |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||    
T  7693390 attaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt--gggatgttact 7693303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 21088585 - 21088857
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||   |||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  21088585 gattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagta-attcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttg 21088680  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||| |||     
T  21088681 gcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttag 21088780  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||| ||||||||    ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21088781 attaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 21088857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9200583 - 9200320
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  9200583 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttg 9200485  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  9200484 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 9200394  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    ||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  9200393 attaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaac 9200320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429136
Alignment:
Q  9 tttaaattgttga---ttaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 105  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatc 1429081  T
Q  106 tttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429082 tttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 1429136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22019982 - 22019718
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22019982 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttg 22019884  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || |||  |||||||||     
T  22019883 gcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtg---------agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 22019793  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||| |||||||| || | || || |||||||||||||| | ||||||||    
T  22019792 attaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaaca 22019718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 14409157 - 14409401
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14409157 gattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagta-attcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 14409255  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||               ||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  14409256 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagt--------------agttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 14409341  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  14409342 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatg 14409401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42343080 - 42342854
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  42343080 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttg 42342982  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||         ||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||  |||||||||     
T  42342981 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaac-aagtaagataaaattag 42342892  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgata 238  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  42342891 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 42342854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32563499 - 32563233
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32563499 gattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataata-atttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 32563401  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||  |||||||||     
T  32563400 gcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 32563310  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  32563309 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagt 32563233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25669935 - 25669737
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  25669935 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttg 25669837  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||         |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||     
T  25669836 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattag 25669747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 277
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824572
Alignment:
Q  33 tgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgata 132  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| | |||    
T  6824329 tgatcaatagtatct-catctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-ata 6824425  T
Q  133 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattg 232  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||    
T  6824426 tcttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattg 6824525  T
Q  233 atgatattatgagggctga--acttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||| ||||| | ||||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  6824526 atgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagt 6824572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25889728 - 25889584
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  25889728 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttgg 25889630  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtctt 147  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25889629 tatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 14919355 - 14919619
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||      | |||||| ||||||||||||    ||| ||||||| ||||    
T  14919355 gattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gta-attcatct------gattgcaatatcttggactta----tacaattttattgttg 14919442  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || || |||  |||||||||     
T  14919443 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattag 14919542  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14919543 attaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagt 14919619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Original strand, 23954636 - 23954864
Alignment:
Q  26 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |     ||||||| |||||||  || |||||||||||||  || ||||||||||||| | ||||    
T  23954636 tgattaatgatcaatagta-attcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagtt 23954728  T
Q  126 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||    
T  23954729 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatga 23954828  T
Q  226 tgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatg 261  Q
    ||||||||||||| ||||    ||||||||||||||    
T  23954829 tgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatg 23954864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26268343 - 26268158
Alignment:
Q  92 ttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataa 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |    
T  26268343 ttatccttgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatga 26268244  T
Q  192 taaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||   ||||||||||    
T  26268243 taaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagt 26268158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8467085 - 8466931
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||     
T  8467085 gattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgtt- 8466988  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 157  Q
    | | |||||| ||| ||| | ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8466987 acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttaca 8466931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 277
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112404
Alignment:
Q  122 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaat 5112348  T
Q  222 ccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
       |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5112349 ttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 5112404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 28416367 - 28416465
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28416367 gattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagta-attcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttg 28416465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 26269166 - 26269074
Alignment:
Q  3 ttcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26269166 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagta-atttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatc 26269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 290
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416629
Alignment:
Q  149 agtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggc 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || | | |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |  |      
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagat 28416589  T
Q  249 tgaacttttgatgtcattctacaaacagtacgggatgttact 290  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||  |||||||||||    
T  28416590 tgaacttttgattccactgtacaaacagt--gggatgttact 28416629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 43254214 - 43254154
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43254214 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8466929 - 8466845
Alignment:
Q  176 ttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgat 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  8466929 ttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgat 8466845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 277
Target Start/End: Original strand, 1429134 - 1429236
Alignment:
Q  175 cttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||| || | |||||||    
T  1429134 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaac 1429233  T
Q  275 agt 277  Q
    |||    
T  1429234 agt 1429236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11898141 - 11898099
Alignment:
Q  222 ccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtca 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  11898141 ccgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtca 11898099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11898193 - 11898152
Alignment:
Q  122 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 163  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11898193 agttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgt 11898152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 408255 - 408526
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  408255 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 408353  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||     
T  408354 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 408453  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaac 274  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  408454 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaac 408526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 218
Alignment:
Q  1 gattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||    
T  487 gattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtactattttatcgttg 395  T
Q  101 aaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattat 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  ||  |||||||||     
T  394 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattag 295  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
    ||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  294 attaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 93933 - 94056
Alignment:
Q  8 ttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  93933 ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagca-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctt 94031  T
Q  108 taacatgcaaataaagttgatgata 132  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||    
T  94032 taacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 277
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94484
Alignment:
Q  124 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaaccc 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatct 94430  T
Q  224 gatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagt 277  Q
     |||||||||||||| |||| || |  ||||||||||| || | ||||||||||    
T  94431 catgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagt 94484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44314 - 44043
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44314 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttga 44216  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  44215 aatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattata 44117  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  44116 ttaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaaca 44043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Original strand, 154473 - 154744
Alignment:
Q  2 attcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  154473 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttga 154571  T
Q  102 aatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattata 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  154572 aatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattata 154670  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaaca 275  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  154671 ttaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaaca 154744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12263 - 12010
Alignment:
Q  6 atttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  12263 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatc 12165  T
Q  106 tttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaa 205  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||    
T  12164 tttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaa 12065  T
Q  206 gtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatgagggctgaacttttgat 260  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12064 gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgat 12010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 267600 - 267384
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  267600 attcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 267501  T
Q  146 -ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaaagtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgaattgatgatattatga 244  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||      
T  267500 tttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatag 267401  T
Q  245 gggctgaacttttgatg 261  Q
     | ||||||||||||||    
T  267400 agactgaacttttgatg 267384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100948
Alignment:
Q  15 ttgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatg 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||            ||||||| |||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagta-atgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttac------------atcgttggaatctttaacatg 100974  T
Q  115 caaataaagttgatgatattatgtga 140  Q
    |||| | |||||||||||||||||||    
T  100973 caaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University