View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14791_low_1 (Length: 523)

Name: NF14791_low_1
Description: NF14791
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14791_low_1
NF14791_low_1
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (214-509)||(5615693-5615988)
chr7 (214-509)||(31824298-31824593)
chr7 (214-509)||(13285982-13286276)
chr7 (214-509)||(41027119-41027415)
chr7 (214-509)||(42594932-42595228)
chr7 (214-487)||(12827556-12827830)
chr7 (214-468)||(15988866-15989121)
chr7 (214-398)||(25441775-25441959)
chr7 (237-453)||(40701558-40701775)
chr7 (214-456)||(33090822-33091065)
chr7 (214-364)||(26348338-26348481)
chr7 (214-364)||(26363373-26363516)
chr7 (214-364)||(5382004-5382147)
chr7 (214-364)||(5391642-5391785)
chr7 (214-364)||(5926865-5927008)
chr7 (214-364)||(6544535-6544678)
chr7 (214-364)||(8500779-8500922)
chr7 (214-364)||(8511249-8511392)
chr7 (214-364)||(46496844-46496987)
chr7 (214-364)||(46507456-46507599)
chr7 (214-303)||(9535429-9535518)
chr7 (214-303)||(9545712-9545801)
chr7 (214-303)||(16132103-16132192)
chr7 (214-303)||(16142652-16142741)
chr7 (214-364)||(32098110-32098253)
chr7 (214-364)||(32108547-32108690)
chr7 (215-364)||(43983207-43983349)
chr7 (214-303)||(6534290-6534379)
chr7 (216-415)||(9006586-9006776)
chr7 (214-364)||(11626553-11626696)
chr7 (214-303)||(44897101-44897190)
chr7 (214-303)||(44907504-44907593)
chr7 (214-277)||(42620989-42621052)
chr7 (214-263)||(14944131-14944180)
chr7 (214-263)||(15371724-15371773)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (214-509)||(522415-522710)
chr4 (214-509)||(17421519-17421814)
chr4 (214-509)||(26457925-26458219)
chr4 (214-509)||(30651139-30651432)
chr4 (214-509)||(16057803-16058115)
chr4 (214-414)||(41525532-41525730)
chr4 (214-364)||(5293284-5293427)
chr4 (214-364)||(5302943-5303086)
chr4 (214-364)||(16249176-16249319)
chr4 (214-364)||(27680947-27681090)
chr4 (214-364)||(27690602-27690745)
chr4 (214-364)||(6691948-6692091)
chr4 (214-364)||(6702354-6702497)
chr4 (214-364)||(21845833-21845976)
chr4 (214-364)||(21855425-21855568)
chr4 (214-364)||(21901696-21901839)
chr4 (214-364)||(21911288-21911431)
chr4 (214-364)||(40921573-40921716)
chr4 (214-364)||(16253142-16253285)
chr4 (214-303)||(17985060-17985149)
chr4 (214-303)||(18105611-18105700)
chr4 (214-303)||(3487818-3487907)
chr4 (214-303)||(3497141-3497230)
chr4 (214-263)||(6406019-6406068)
chr4 (214-364)||(15668917-15669060)
chr4 (214-317)||(14600899-14601002)
chr4 (214-277)||(16241871-16241934)
chr4 (214-364)||(13403232-13403375)
chr4 (214-263)||(13793255-13793304)
chr4 (214-263)||(26331049-26331098)
chr4 (214-263)||(52498955-52499004)
chr4 (217-261)||(1293182-1293225)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (214-509)||(1974902-1975197)
chr1 (212-509)||(1982266-1982563)
chr1 (214-509)||(1989686-1989981)
chr1 (214-509)||(41208104-41208400)
chr1 (214-418)||(52955486-52955689)
chr1 (294-471)||(13403943-13404121)
chr1 (214-415)||(34822706-34822898)
chr1 (288-471)||(19868880-19869065)
chr1 (214-364)||(16154613-16154756)
chr1 (214-364)||(25019198-25019341)
chr1 (214-364)||(1186608-1186750)
chr1 (214-364)||(21458358-21458501)
chr1 (214-358)||(22956292-22956428)
chr1 (214-364)||(21886043-21886186)
chr1 (309-415)||(30210492-30210597)
chr1 (328-415)||(18062516-18062600)
chr1 (214-277)||(2115810-2115873)
chr1 (214-277)||(30549793-30549856)
chr1 (214-263)||(8540075-8540124)
chr1 (328-415)||(21782371-21782455)
chr1 (214-263)||(41544298-41544347)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (214-509)||(997-1292)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (214-509)||(5317-5612)
scaffold0313 (214-509)||(19474-19769)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (214-509)||(34764905-34765200)
chr6 (214-509)||(22223788-22224084)
chr6 (214-509)||(22249623-22249919)
chr6 (214-509)||(8563438-8563734)
chr6 (250-509)||(24370554-24370812)
chr6 (214-471)||(9761643-9761901)
chr6 (214-364)||(20912012-20912155)
chr6 (214-303)||(24922188-24922277)
chr6 (214-303)||(24931224-24931313)
chr6 (215-364)||(31357290-31357432)
chr6 (215-364)||(31367018-31367160)
chr6 (212-364)||(16897676-16897821)
chr6 (212-364)||(16908329-16908474)
chr6 (214-364)||(12454783-12454926)
chr6 (214-364)||(3285575-3285718)
chr6 (214-415)||(27787756-27787948)
chr6 (214-364)||(14791333-14791476)
chr6 (215-303)||(18159845-18159933)
chr6 (215-303)||(18169657-18169745)
chr6 (214-254)||(24361891-24361931)
chr6 (237-274)||(28092396-28092433)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (214-509)||(20957758-20958053)
chr5 (214-509)||(20947369-20947664)
chr5 (214-509)||(19548666-19548962)
chr5 (14-217)||(38462305-38462508)
chr5 (214-509)||(36315937-36316233)
chr5 (214-364)||(27411878-27412021)
chr5 (214-364)||(32070170-32070313)
chr5 (214-364)||(18361007-18361150)
chr5 (214-364)||(21753173-21753316)
chr5 (214-364)||(21762460-21762603)
chr5 (214-364)||(26192189-26192332)
chr5 (214-364)||(26202793-26202936)
chr5 (214-364)||(33939047-33939190)
chr5 (214-364)||(33949447-33949590)
chr5 (237-364)||(18389964-18390084)
chr5 (214-303)||(8765553-8765642)
chr5 (214-303)||(11411297-11411386)
chr5 (214-415)||(21484223-21484414)
chr5 (338-471)||(31105036-31105168)
chr5 (214-263)||(22244538-22244587)
chr5 (214-263)||(23378771-23378820)
chr5 (214-263)||(31105236-31105285)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (214-509)||(49387571-49387866)
chr3 (214-509)||(24873455-24873751)
chr3 (214-509)||(24793026-24793322)
chr3 (217-422)||(17733773-17733980)
chr3 (217-422)||(19035042-19035249)
chr3 (217-471)||(21542479-21542733)
chr3 (435-509)||(17732440-17732514)
chr3 (435-509)||(19033671-19033745)
chr3 (237-471)||(29709504-29709734)
chr3 (214-303)||(6422086-6422175)
chr3 (214-364)||(1685446-1685589)
chr3 (214-364)||(5655821-5655964)
chr3 (286-336)||(8435868-8435918)
chr3 (286-336)||(8439413-8439463)
chr3 (214-364)||(8972576-8972719)
chr3 (214-364)||(8983131-8983274)
chr3 (214-364)||(9536865-9537008)
chr3 (214-364)||(9547191-9547334)
chr3 (214-303)||(6432526-6432615)
chr3 (267-345)||(11044673-11044751)
chr3 (214-364)||(12182-12325)
chr3 (214-303)||(4371161-4371250)
chr3 (214-303)||(4380880-4380969)
chr3 (214-277)||(16335636-16335699)
chr3 (214-263)||(55478238-55478287)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (214-509)||(27160129-27160424)
chr2 (214-509)||(27170498-27170793)
chr2 (214-509)||(22901661-22901957)
chr2 (214-509)||(22908981-22909277)
chr2 (214-509)||(19341870-19342154)
chr2 (214-509)||(23721496-23721784)
chr2 (216-416)||(40409231-40409430)
chr2 (347-458)||(15475617-15475729)
chr2 (214-364)||(2998803-2998946)
chr2 (214-364)||(4457925-4458068)
chr2 (214-364)||(4467550-4467693)
chr2 (214-364)||(17488420-17488563)
chr2 (214-364)||(45014462-45014605)
chr2 (214-364)||(45024539-45024682)
chr2 (309-471)||(16135423-16135581)
chr2 (214-364)||(18650948-18651091)
chr2 (214-364)||(18663066-18663209)
chr2 (215-364)||(5337242-5337384)
chr2 (215-364)||(5347095-5347237)
chr2 (214-303)||(9502867-9502956)
chr2 (214-303)||(9514233-9514322)
chr2 (214-364)||(24696691-24696834)
chr2 (454-509)||(15479203-15479258)
chr2 (214-263)||(29423189-29423238)
chr2 (328-364)||(72429-72465)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (214-509)||(14436950-14437246)
chr8 (214-509)||(26362557-26362852)
chr8 (244-483)||(12841725-12841965)
chr8 (237-507)||(18536171-18536441)
chr8 (214-411)||(37295552-37295749)
chr8 (214-415)||(5867578-5867770)
chr8 (214-364)||(21988126-21988269)
chr8 (214-364)||(21997660-21997803)
chr8 (214-364)||(9325222-9325365)
chr8 (214-364)||(21203000-21203143)
chr8 (214-364)||(21213416-21213559)
chr8 (214-364)||(21334028-21334171)
chr8 (214-364)||(791466-791609)
chr8 (214-277)||(37816670-37816733)
chr8 (348-415)||(20098494-20098559)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (214-509)||(1117-1413)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (214-471)||(3728-3986)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (283-509)||(1173-1399)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (267-487)||(40842-41063)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (338-509)||(267239-267410)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (214-423)||(241880-242089)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (214-303)||(19571-19660)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (214-364)||(8038-8181)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (214-364)||(234184-234327)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (214-364)||(8100-8243)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (214-364)||(93048-93191)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (454-509)||(14118-14173)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (285-413)||(29027-29145)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (214-358)||(198888-199024)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (267-364)||(28630-28727)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (285-412)||(65370-65488)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (214-263)||(17482-17531)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (214-317)||(216376-216479)
scaffold0005 (214-277)||(310214-310277)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (214-277)||(21351-21414)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (214-277)||(15658-15721)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (214-272)||(74913-74971)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (328-415)||(15062-15146)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (214-263)||(13645-13694)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (237-265)||(13146-13174)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 5615693 - 5615988
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5615693 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 5615792  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5615793 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 5615892  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  5615893 tcttagtcatgtacttttcttggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 5615988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31824593 - 31824298
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824593 atgatttgtaagacttgtaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 31824494  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824493 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 31824394  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  31824393 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttatgggcttggttcttgatgt 31824298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 13285982 - 13286276
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285982 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 13286081  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13286082 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtattgaatgaacattgaagatgccccttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattga 13286181  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  13286182 tcttagtcatgtacttttctgggcttttatttaagccacgtgaaccttgcatgttcttcaatt-gttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 13286276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41027415 - 41027119
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41027415 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaatatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 41027316  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41027315 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagttttgaatgaacattgaagatgccccttttgactttaatcaaataaatgtctttattccttgattga 41027216  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  41027215 tcttagtcaatgtactttactgggcttttatttaaatcacgtgaaccttgcatgctcttcatttggttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 41027119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 42595228 - 42594932
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42595228 atgatttgtaagactcttaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagtatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 42595129  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  42595128 attcttaattttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgtcctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgactga 42595029  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  42595028 tcttagtcaatgcactttactgggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgggcttgattcttgatgt 42594932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 214 - 487
Target Start/End: Original strand, 12827556 - 12827830
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827556 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacattgatgaagtgcaacatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 12827655  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12827656 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcatttattgcttgattga 12827755  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaat 487  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12827756 tcttattcaatgtactttactaggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaat 12827830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 214 - 468
Target Start/End: Original strand, 15988866 - 15989121
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15988866 atgatttgtaagactgttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacattgatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttgatggaat 15988965  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15988966 attcctaatgttttgtacttcaaatattcatagtcttgaatgaatattgaagatgccccttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattga 15989065  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgtt 468  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15989066 tcttagtcaatatactttactgggcttttatttaagtcacgtaaaccttgaatgtt 15989121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 214 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25441959 - 25441775
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25441959 atgatttgtaagacttgtaattaatataatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcaacatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 25441860  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgctt 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25441859 attcctaatgtcttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgctt 25441775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 40701775 - 40701558
Alignment:
Q  237 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaa 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  40701775 atgtaatcaaatcctaataatgaaacatcattgaagtgcagtgtgtataacatctagaatgatattcttgatggaatattcctaatattttgcacttcat 40701676  T
Q  337 ttgttcat-agtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatcttagtc-atgtacttttctg 434  Q
    | |||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  40701675 tcgttcataaatcttgaatgaacactgaagatg-tctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatctaagtcaatgtactttactg 40701577  T
Q  435 ggctttcatttaagtcacg 453  Q
     | ||| ||||| ||||||    
T  40701576 agtttttatttatgtcacg 40701558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33091065 - 33090822
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  33091065 atgatttgtaagactctcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacattgatgaagtgcagtatatgtaacatctaggatgatattcttgatagaat 33090966  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttca-tagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaa-tcaaataaatgcttttattccttgatt 411  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  | || | || ||||||  |||||| |||||||    
T  33090965 atttataatgttttgtacttcaaatgttcattagtcttaaatgaacaataaagatgcc--ttttgaaataaatttaattaaatgtctttattgcttgatt 33090868  T
Q  412 gatcttagtc--atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtga 456  Q
    | ||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33090867 gttc-aagtcaaatgtacttttctgggcttttatttatgtcacgtga 33090822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 26348338 - 26348481
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  26348338 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 26348437  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26348438 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 26348481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 26363373 - 26363516
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  26363373 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 26363472  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26363473 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 26363516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 5382004 - 5382147
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  5382004 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 5382102  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5382103 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 5382147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 5391642 - 5391785
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  5391642 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 5391740  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5391741 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 5391785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5927008 - 5926865
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  5927008 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 5926910  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5926909 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 5926865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6544678 - 6544535
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  6544678 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 6544580  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6544579 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 6544535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8500922 - 8500779
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  8500922 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 8500824  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8500823 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 8500779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8511392 - 8511249
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  8511392 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 8511294  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8511293 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 8511249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46496987 - 46496844
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  46496987 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 46496889  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46496888 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 46496844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46507599 - 46507456
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  46507599 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 46507501  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46507500 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 46507456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 9535429 - 9535518
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||||    
T  9535429 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattc 9535518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 9545712 - 9545801
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||||    
T  9545712 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattc 9545801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 16132103 - 16132192
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||||    
T  16132103 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattc 16132192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 16142652 - 16142741
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||||    
T  16142652 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattc 16142741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32098253 - 32098110
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  32098253 atgatttgtaagactatcatttgatgcaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 32098154  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32098153 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 32098110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32108690 - 32108547
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  32108690 atgatttgtaagactatcatttgatgcaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 32108591  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32108590 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 32108547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43983349 - 43983207
Alignment:
Q  215 tgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  43983349 tgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 43983251  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43983250 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 43983207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6534379 - 6534290
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  6534379 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 6534290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 9006776 - 9006586
Alignment:
Q  216 gatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatat 315  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||       ||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  9006776 gatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagaagtgattgcaacatctaggatgatattctctttggaatat 9006677  T
Q  316 tcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatc 415  Q
    | |||       ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||   ||||| | |||||| |||||||||||    
T  9006676 ttcta-------gtatttcaagtgttcatagtcttgaatgaacattgaatat--cctttttgacattaatcttgtaaatacctttattgcttgattgatc 9006586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 11626553 - 11626696
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  11626553 atgatttgtaagactatcatttgatgcaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 11626651  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11626652 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 11626696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44897190 - 44897101
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  44897190 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 44897101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44907593 - 44907504
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  44907593 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 44907504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42621052 - 42620989
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  42621052 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcag 42620989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14944180 - 14944131
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14944180 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 14944131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15371773 - 15371724
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371773 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 15371724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 522415 - 522710
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  522415 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 522514  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  522515 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 522614  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  522615 tctcagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 522710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 17421519 - 17421814
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421519 atgatttgtaagacttgtaattgatgtaatcaattcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 17421618  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17421619 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgtcctttttgactttaatcaaataaatggttttattccttgattga 17421718  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17421719 tcttagtcatgtacttttctaggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctggacttggttcttgatgt 17421814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26458219 - 26457925
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26458219 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaactcctaatagtgaaacatttatgaagtgctgcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 26458120  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26458119 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttggatgaacattgaagatgctctttttaaatttaatcaaataaatgcctttattccttaattga 26458020  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  26458019 tcttagtcatgtacttttatgagcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcattt-gttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 26457925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30651432 - 30651139
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30651432 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaattctaatagaggaacattgatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 30651333  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
       || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30651332 ---cccaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcgtttattccttgattga 30651236  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  30651235 tcttagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcacgtgaaccttgtatgttattcatttggttcatgaatttctgggtttggttcttgatgt 30651139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16058115 - 16057803
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16058115 atgatttgtaagattcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtggaacattgatgaaaaacagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 16058016  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacat----------------tgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgct 397  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16058015 attcccaatattttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacatagtcttgaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcc 16057916  T
Q  398 tttattccttgattgatcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggact 496  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||  |    
T  16057915 tttattccttgattgatcctagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcacatgaaccttgtatgtccttcatttggttcatgaatttctgggtt 16057816  T
Q  497 tggttcttgatgt 509  Q
    |||||||||||||    
T  16057815 tggttcttgatgt 16057803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41525730 - 41525532
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||| |  | || ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||  |||||    
T  41525730 atgatttgtaagacatccatttgatgtaattaaatcctaatagtaaaacataaatgaagtgcatcatgtataacatttaagatgatattcttataggaat 41525631  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcat-agtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaat-caaataaatgcttttattccttgatt 411  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||   |||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||||    
T  41525630 attcctaat-atttgtaattcaattgttcataagtctttaatgtacaatgaatatgc---ttttgacttttatccaaataaatgtctttaatccttgatt 41525535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 5293284 - 5293427
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  5293284 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 5293383  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5293384 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 5293427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 5302943 - 5303086
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  5302943 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 5303042  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5303043 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 5303086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16249319 - 16249176
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  16249319 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 16249220  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16249219 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 16249176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 27680947 - 27681090
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  27680947 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 27681046  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27681047 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 27681090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 27690602 - 27690745
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  27690602 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 27690701  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27690702 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 27690745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6692091 - 6691948
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  6692091 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 6691993  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6691992 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 6691948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6702497 - 6702354
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  6702497 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 6702399  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6702398 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 6702354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21845976 - 21845833
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21845976 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21845878  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21845877 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21845833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21855568 - 21855425
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21855568 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21855470  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21855469 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21855425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21901839 - 21901696
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21901839 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21901741  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21901740 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21901696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21911431 - 21911288
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21911431 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21911333  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21911332 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21911288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40921716 - 40921573
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  40921716 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 40921618  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40921617 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 40921573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16253285 - 16253142
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |     |||||||||||||||||| | |  |||||    
T  16253285 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtaattttaacatctaggatgatattcccttgtggaa 16253186  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16253185 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 16253142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 17985060 - 17985149
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||||    
T  17985060 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattc 17985149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 18105611 - 18105700
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||||    
T  18105611 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattc 18105700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 3487818 - 3487907
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    |  |||||||||||||||||||    
T  3487818 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgctattaacatctaggatgatattc 3487907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 3497141 - 3497230
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    |  |||||||||||||||||||    
T  3497141 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgctattaacatctaggatgatattc 3497230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Original strand, 6406019 - 6406068
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6406019 atgatttgtaagacttctatttgatgtaatcaaattctaatagtgaaaca 6406068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15669060 - 15668917
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||       |||||||||||||||||| | |  |||||    
T  15669060 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttgtggaa 15668961  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15668960 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 15668917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Original strand, 14600899 - 14601002
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtg-aaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||| |     |||||||||||||||||||  | |||||    
T  14600899 atgatttgtaagacttgtacttgatgtaatc-aatcctaatagtgaaaacataattgaagtgcagtaattgcaacatctaggatgatattcacattggaa 14600997  T
Q  313 tattc 317  Q
    |||||    
T  14600998 tattc 14601002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16241934 - 16241871
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16241934 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcag 16241871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 13403232 - 13403375
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattct-taatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||       |||||||||||||||||||  |  |||||    
T  13403232 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagaacagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 13403331  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13403332 tattccta-------gtacttcaat-gttcatagtcttaaatgaacattgaa 13403375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Original strand, 13793255 - 13793304
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13793255 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 13793304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26331098 - 26331049
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26331098 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 26331049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 52499004 - 52498955
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  52499004 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 52498955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1293225 - 1293182
Alignment:
Q  217 atttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaa 261  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1293225 atttgtaagacttgtacttgatgtaatc-aatcctaatagtgaaa 1293182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 1974902 - 1975197
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1974902 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 1975001  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1975002 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 1975101  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  1975102 tctcagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 1975197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 212 - 509
Target Start/End: Original strand, 1982266 - 1982563
Alignment:
Q  212 gaatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatgga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982266 gaatgatttgtaagacttgtatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaagcatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatgga 1982365  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgatt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982366 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgatt 1982465  T
Q  412 gatcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  1982466 gatcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 1982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 1989686 - 1989981
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989686 atgatttgtaagacttgtatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaagcatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 1989785  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989786 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 1989885  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  1989886 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttcagggcttggttcttgatgt 1989981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41208400 - 41208104
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41208400 atgatttgtaagacttgtaatttatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 41208301  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  41208300 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgccctttttgactttaattaaataaatgcctttatttcttgattga 41208201  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  41208200 tcttagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcatatgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 41208104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 214 - 418
Target Start/End: Original strand, 52955486 - 52955689
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52955486 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaattctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcgtggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 52955585  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52955586 attcctaatgttttgtacttcaaatattcatagtcttgaatgaacattaaatataccctttttgactttaatcaaataaatgcctttatt-cttgattga 52955684  T
Q  414 tctta 418  Q
    |||||    
T  52955685 tctta 52955689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 471
Target Start/End: Original strand, 13403943 - 13404121
Alignment:
Q  294 gatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcat-agtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaat-caaata 391  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||||    
T  13403943 gatgatattcttataggagtattcctaatgttttgtacttcaattgttcataagtctttaatgaacaatgaatattcc--ttttgacttttatccaaata 13404040  T
Q  392 aatgcttttattccttgattgatct-tagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 471  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||   ||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  13404041 aatgcctttaatccttgattgatctaaagtcatagtcttttctggacttttatttatgtcatgtgagccttgaatgttctt 13404121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34822898 - 34822706
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |    ||||||||| ||||||||||   | ||||    
T  34822898 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagtgcagtgtttgtaacatctagtatgatattctctttagaat 34822799  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    |||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||   ||||| | |||||| |||||||||    
T  34822798 attccta-------gtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacaatgaagat--cttttttgacattaatcttgtaaattcctttattgcttgattga 34822708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 471
Target Start/End: Original strand, 19868880 - 19869065
Alignment:
Q  288 atctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcat-agtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaat- 385  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||   ||||||||||| ||     
T  19868880 atctaggatgatattcttagaggaatattcctattg-tttgtaattcatttgttcataagtctttaatgaacaatgaatatg-tttttttgacttttatc 19868977  T
Q  386 caaataaatgcttttattccttgattgatct-tagtcat-gtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 471  Q
    ||||||| ||  |||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  19868978 caaataagtgtctttaatccttgattgatctaaaatcatagtacttttctggacttttatttatatcatgtgagccttgaatgttctt 19869065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16154756 - 16154613
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  16154756 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 16154657  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16154656 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 16154613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25019341 - 25019198
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| | |  || ||    
T  25019341 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcccttgtgaaa 25019242  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25019241 tattccta-------gtacttcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 25019198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 1186608 - 1186750
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||       ||||||||||||||||||||   ||||||    
T  1186608 atgatttgtaagacttccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagagattgtaacatctaggatgatattctctttggaat 1186707  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||| |||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1186708 atttcta-------gtacttcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 1186750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21458501 - 21458358
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21458501 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21458403  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21458402 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21458358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22956428 - 22956292
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaa-catttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||   ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22956428 atgatttgtaagacttgtatttgatgtaaacaa-tcctaatagtgaaaacataactgaagtgcagtgattgcaacatctaggatgatattcttattggaa 22956330  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaac 358  Q
    |||||       || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22956329 tattc-------ttagtacttcaa-tgttcatagtcttaaatgaac 22956292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21886186 - 21886043
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||       |||||||||||||||||| | |  |||||    
T  21886186 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttgtggaa 21886087  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21886086 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21886043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30210597 - 30210492
Alignment:
Q  309 ggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcata-gtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatc-aaataaatgcttttattcct 406  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||| ||||   |||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||    
T  30210597 ggaatattcctaatgttt-gtacttcatttgttcgtaagtctttaatgaacaatgaatatgca--ttttgacttttatccaaataaatgtctttaatcct 30210501  T
Q  407 tgattgatc 415  Q
    |||||||||    
T  30210500 tgattgatc 30210492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Original strand, 18062516 - 18062600
Alignment:
Q  328 gtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatc 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |  |||||||  |||||| ||| |||||||    
T  18062516 gtacttcaat-gttcatagtcttaaatgaacattgaatat--cctttttgacattaaccttataaatgtctttattgcttcattgatc 18062600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2115873 - 2115810
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  2115873 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcag 2115810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 30549793 - 30549856
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  30549793 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcag 30549856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8540124 - 8540075
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8540124 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 8540075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21782455 - 21782371
Alignment:
Q  328 gtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatc 415  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||   ||||||| |||||| |||||||||||    
T  21782455 gtacttcaagtgtttatagtcttgaatgaaccttgaaga---cctttttgacattattcttgtaaatgcctttattgcttgattgatc 21782371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Original strand, 41544298 - 41544347
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41544298 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 41544347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 997 - 1292
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  997 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 1096  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1097 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgtttttattccttgattga 1196  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  1197 tctcagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5612 - 5317
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5612 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 5513  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5512 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgtttttattccttgattga 5413  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  5412 tctcagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 5317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19769 - 19474
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19769 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 19670  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19669 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgtttttattccttgattga 19570  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  19569 tctcagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 19474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34765200 - 34764905
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34765200 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 34765101  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34765100 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgtttttattccttgattga 34765001  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  34765000 tctcagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 34764905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 22223788 - 22224084
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22223788 atgatttgtaagacttttaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 22223887  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22223888 attcctaattttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgtcctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttaattga 22223987  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  22223988 tcttagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 22224084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 22249623 - 22249919
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22249623 atgatttgtaagacttttaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 22249722  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22249723 attcctaattttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgtcctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttaattga 22249822  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  22249823 tcttagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 22249919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 8563438 - 8563734
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8563438 atgatttgtaagactcttaattgatgtaatcaaatcctaatattgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 8563537  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8563538 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtctagaatgaacattgaagatgtcctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattga 8563637  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||  |||||||||    
T  8563638 tcttagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgggcttgactcttgatgt 8563734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Original strand, 24370554 - 24370812
Alignment:
Q  250 ctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtct 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24370554 ctaatagtgaaacatttatgaagtgcaacatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtct 24370653  T
Q  350 taaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagt 449  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24370654 tgaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgtctttattccttgattgatcttagtcatgtacttttctgggcttttatttaagt 24370753  T
Q  450 cacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||    
T  24370754 cacgtgaaccttgcatgttcttcattt-gttcatgaatttctgggcttggttcttaatgt 24370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 471
Target Start/End: Original strand, 9761643 - 9761901
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9761643 atgatttgtaagatttctatttgatgtaatcaaatcttaacagtaaaacatcaatgaagtgcagtgtgtataacatctaggatgatattcttagaggaat 9761742  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcat-agtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatc-aaataaatgcttttattccttgatt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||| ||| ||||| |||  ||||  ||||||||    
T  9761743 attcctaatgttttgtacttcaattgttcataagtctttaatgaacaatgaatatgcc--ttttgacttttatcaaaatagatgtctttaacccttgatt 9761840  T
Q  412 gatcttagtcat-gtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 471  Q
    ||||| ||| ||  || |||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9761841 gatctaagttataataattttttggacttttatttatgtcacgtgagccttgaatgttctt 9761901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20912155 - 20912012
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  20912155 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 20912056  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20912055 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 20912012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 24922188 - 24922277
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  || |||||||||||||||||||    
T  24922188 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaataataacatctaggatgatattc 24922277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 24931224 - 24931313
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  || |||||||||||||||||||    
T  24931224 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaataataacatctaggatgatattc 24931313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31357432 - 31357290
Alignment:
Q  215 tgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || |||    
T  31357432 tgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaat 31357333  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31357332 attccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 31357290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31367160 - 31367018
Alignment:
Q  215 tgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || |||    
T  31367160 tgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaat 31367061  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31367060 attccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 31367018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16897821 - 16897676
Alignment:
Q  212 gaatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgg 310  Q
    |||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||    || |||||||||||||||||| |||  ||     
T  16897821 gaatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagaacagtgataataacatctaggatgatattcctttgtga 16897722  T
Q  311 aatattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16897721 aatattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 16897676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16908474 - 16908329
Alignment:
Q  212 gaatgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgg 310  Q
    |||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||    || |||||||||||||||||| |||  ||     
T  16908474 gaatgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagaacagtgataataacatctaggatgatattcctttgtga 16908375  T
Q  311 aatattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16908374 aatattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 16908329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12454926 - 12454783
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  12454926 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 12454828  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12454827 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 12454783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3285718 - 3285575
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgata-ttcttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  |  |||||||||||||||| ||| |  || ||    
T  3285718 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaaaactaacatctaggatgatatttccttgtgaaa 3285619  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3285618 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 3285575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 415
Target Start/End: Original strand, 27787756 - 27787948
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattct-taatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||       |||||||||||||||||||  |  |||||    
T  27787756 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcatatcctaatagtgaaacaacaatgaagagcagtgattgtaacatctaggatgatattcccttttggaa 27787855  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattg 412  Q
    ||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |   ||||||| |||||| ||||||||    
T  27787856 tattccta-------gtacttcaat-gttcatagtcttaaatgaacattgaatat--cctttttgacattaaccttgtaaatgcctttattgcttgattg 27787945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14791476 - 14791333
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||       |||||||||||||||||| | |  |||||    
T  14791476 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttgtggaa 14791377  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14791376 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 14791333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18159933 - 18159845
Alignment:
Q  215 tgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  18159933 tgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 18159845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18169745 - 18169657
Alignment:
Q  215 tgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  18169745 tgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 18169657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Original strand, 24361891 - 24361931
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaat 254  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24361891 atgatttgtaagacttttaattgatgtaatcaaatcctaat 24361931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28092433 - 28092396
Alignment:
Q  237 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28092433 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacatcaatgaagtg 28092396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20958053 - 20957758
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20958053 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 20957954  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20957953 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 20957854  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  20957853 tctcagtcatgtacttttctaggccttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 20957758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20947664 - 20947369
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20947664 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 20947565  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20947564 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 20947465  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  20947464 tctcagtcatgtacttttctaggccttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggtttggttcttgatgt 20947369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 19548666 - 19548962
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19548666 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcaacatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 19548765  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19548766 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgacttaaatcaaataaatgtctttattccttgattga 19548865  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  19548866 tcttagtcaatatacttttctgggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgggtttggttcttgatgt 19548962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 38462305 - 38462508
Alignment:
Q  14 atgaacacaacagaccaacaagctagcaaacacagaatctgctgaaactacaaaccaggacagcagatatcaaaagtaaaggccagacttctactgagac 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38462305 atgaacacaacagaccaaaaagctagcaaacacagaatctgctgaaactacaaaccaggacagcagatatcaaaagtaaaggccagacttctactgagac 38462404  T
Q  114 tgacatccagcagctgctaaaagaattagaccagatcatacaatgccacatcagaacaaaatcttcgttttggtaaatctttgtggttacccctttctga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38462405 tgacatccagcagctgctaaaagaattagaccagatcatacaatgccacatcagaacaaaatcttcgttttggtaaatctttgtggttacccctttctga 38462504  T
Q  214 atga 217  Q
    ||||    
T  38462505 atga 38462508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36316233 - 36315937
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36316233 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtggaacatcgatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 36316134  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36316133 attccaaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgtctttattccttgattga 36316034  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  36316033 tcttagtcaatgtactttactgggattttatttaagtcatgtgaaccttgtatgttctttatttggttcatgaatttttgggtttggttcttgatgt 36315937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27412021 - 27411878
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  27412021 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 27411922  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27411921 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 27411878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32070313 - 32070170
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  32070313 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 32070214  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32070213 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 32070170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18361150 - 18361007
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  18361150 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 18361052  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18361051 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 18361007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21753316 - 21753173
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21753316 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21753218  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21753217 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21762603 - 21762460
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21762603 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21762505  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21762504 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21762460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 26192189 - 26192332
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  26192189 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 26192287  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26192288 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 26192332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 26202793 - 26202936
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  26202793 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 26202891  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26202892 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 26202936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33939190 - 33939047
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  33939190 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 33939092  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33939091 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 33939047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33949590 - 33949447
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  33949590 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 33949492  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33949491 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 33949447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18390084 - 18389964
Alignment:
Q  237 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaatattcctaatgttttgtacttc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||       |||| ||    
T  18390084 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaaatattccta-------gtacatc 18389993  T
Q  335 aattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18389992 aa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 18389964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 8765553 - 8765642
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  8765553 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 8765642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 11411297 - 11411386
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  11411297 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 11411386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 415
Target Start/End: Original strand, 21484223 - 21484414
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtg-aaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||| ||       |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  21484223 atgatttgtaagacttgtatttgatgtaatc-aatcctaatagtgaaaacataactgaagtggagtgattgcaacatctaagatgatattctcattggaa 21484321  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattg 412  Q
    |||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| || |||| |   ||||||| |||||| ||||||||    
T  21484322 tattccca-------gtacttcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgcatat--ccttttttacattaaccttgtaaatgcctttattgcttgattg 21484411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31105168 - 31105036
Alignment:
Q  338 tgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgat-cttagtcatgtacttttctggg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||   ||||||  |||||| |||||||||| | ||   ||||||||| ||||     
T  31105168 tgttcatagtcttaaatgaacattgaatat--cctttttggcattaatcttgtaaatgactttattgcttgattgatccataccaatgtactttactgga 31105071  T
Q  437 ctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 471  Q
    | || ||| | |||||||| |||||| ||||||||    
T  31105070 catttattcatgtcacgtgtaccttgcatgttctt 31105036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22244587 - 22244538
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22244587 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 22244538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Original strand, 23378771 - 23378820
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    ||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23378771 atgatttgtaagacttccatttgatgtaatcaaatcgtaatagtgaaaca 23378820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31105285 - 31105236
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31105285 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 31105236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 49387571 - 49387866
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49387571 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 49387670  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49387671 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgtcctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattga 49387770  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  49387771 tcttagtcatgtacttttttgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 49387866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 24873455 - 24873751
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873455 atgatttgtaagacttgtaatttatgtaatcaaatcctaatagtgatacatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 24873554  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24873555 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgtcctctttgacttttatcaaataaatgcctttattccttgattga 24873654  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  24873655 tcttagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcacatgaaccttgcatgatcgtcttttagttcatgagtatctgggcttggttcttgatgt 24873751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24793322 - 24793026
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24793322 atgatttgcaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatagaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 24793223  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24793222 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgtcctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattga 24793123  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  24793122 tcttagtcaatgtattttactgggtttttatttaagtcatgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 24793026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 217 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17733980 - 17733773
Alignment:
Q  217 atttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatatt 316  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17733980 atttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcataatagtgaaacatttatgaagtgtagcatggaaagcatctaggatcatattcttaatggaatatt 17733881  T
Q  317 cctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccct--ttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgat 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17733880 cctaatgttttgtacttcaaatgttcataatcttgaataaacattgaagatgccctttttttgactttaaccaaataaatgtctttattccttgattgat 17733781  T
Q  415 cttagtca 422  Q
    ||||||||    
T  17733780 cttagtca 17733773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 217 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19035249 - 19035042
Alignment:
Q  217 atttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatatt 316  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19035249 atttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcataatagtgaaacatttatgaagtgtagcatggaaagcatctaggatcatattcttaatggaatatt 19035150  T
Q  317 cctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccct--ttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgat 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19035149 cctaatgttttgtacttcaaatgttcataatcttgaataaacattgaagatgccctttttttgactttaaccaaataaatgtctttattccttgattgat 19035050  T
Q  415 cttagtca 422  Q
    ||||||||    
T  19035049 cttagtca 19035042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 217 - 471
Target Start/End: Original strand, 21542479 - 21542733
Alignment:
Q  217 atttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatatt 316  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| || || |||   ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  21542479 atttgtaagactctcatttaatgtaatcaaatcctagtagtgtaacatcaatgaaatgtagtatgtgtaacatctaggatgatattcatgatcgaatatt 21542578  T
Q  317 cctaatgttttgtacttcaattgttc-atagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaat-caaataaatgcttttattccttgattgat 414  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21542579 cctaatattttgtactttaaatgttcaaaagtcttaaatgaacattgaagatgcc---tttgactttaatccaaataaatgcctttattcctttattgat 21542675  T
Q  415 cttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 471  Q
    || |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||    
T  21542676 ctaagtcaatgtacttttctaggcttttatttatgtcatgtgagccttgcatgttctt 21542733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17732514 - 17732440
Alignment:
Q  435 ggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  17732514 ggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttgcttcttgatgt 17732440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19033745 - 19033671
Alignment:
Q  435 ggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  19033745 ggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgaatttctgggcttgcttcttgatgt 19033671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 471
Target Start/End: Original strand, 29709504 - 29709734
Alignment:
Q  237 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaa 336  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  29709504 atgtaattaaatcctaatagtaaaacgttaatgaagtgcaatatgtataacatctaggatgatattgtgagaggaatattcttaatgttttgtacttcat 29709603  T
Q  337 ttgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaat-caaataaatgcttttattccttgattgatct-tagtcat-gtacttttct 433  Q
    | ||     ||||| |||||||| |||| |||  | |||||| ||| || |||||||| |  |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  29709604 tcgt-----gtctttaatgaacaatgaatatg--cattttgaattttatccaaataaaggtctttaatccttgattgatctaaagtcataatacttttct 29709696  T
Q  434 gggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 471  Q
    |  |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  29709697 gaacttttatttatgtcacgtgagccttggatgttctt 29709734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6422175 - 6422086
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  || |||||||||||||||||||    
T  6422175 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaataataacatctaggatgatattc 6422086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 1685446 - 1685589
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  1685446 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 1685544  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1685545 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 1685589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 5655821 - 5655964
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  5655821 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 5655919  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5655920 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 5655964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 336
Target Start/End: Original strand, 8435868 - 8435918
Alignment:
Q  286 acatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8435868 acatctaggatgatattcttagaggaatattcctaatgtattgtacttcaa 8435918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 336
Target Start/End: Original strand, 8439413 - 8439463
Alignment:
Q  286 acatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8439413 acatctaggatgatattcttataggaatattcctaatgtattgtacttcaa 8439463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8972719 - 8972576
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  8972719 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 8972621  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8972620 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 8972576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8983274 - 8983131
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  8983274 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 8983176  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8983175 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 8983131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9537008 - 9536865
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  9537008 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 9536910  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9536909 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 9536865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9547334 - 9547191
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  9547334 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 9547236  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9547235 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 9547191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6432615 - 6432526
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |  || |||||||||||||||||||    
T  6432615 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaaaagcagtaataataacatctaggatgatattc 6432526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Original strand, 11044673 - 11044751
Alignment:
Q  267 atgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcata 345  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  11044673 atgaagtgtagtatgcataacatctaggatgatactcttagaagaatatttctaatgttttatatttcaattgttcata 11044751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 12182 - 12325
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatga--aaaacatctaggatgatatt-cttaatgg 310  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||    |||||||||||||||||| | |  |||    
T  12182 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagca--atgattttaacatctaggatgatattcccttgtgg 12279  T
Q  311 aatattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12280 aatattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 12325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4371250 - 4371161
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    |  |||||||||||||||||||    
T  4371250 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgctattaacatctaggatgatattc 4371161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4380969 - 4380880
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    |  |||||||||||||||||||    
T  4380969 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtgctattaacatctaggatgatattc 4380880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 16335636 - 16335699
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16335636 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcag 16335699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Original strand, 55478238 - 55478287
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  55478238 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 55478287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 27160129 - 27160424
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160129 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatctatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 27160228  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160229 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 27160328  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  27160329 tctcagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgagtttctgggcttggttcttgatgt 27160424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 27170498 - 27170793
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27170498 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatctatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 27170597  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27170598 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 27170697  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  27170698 tctcagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttagttcatgagtttctgggcttggttcttgatgt 27170793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22901957 - 22901661
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22901957 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcaacatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 22901858  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22901857 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcataatcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaattcatttattccttgattga 22901758  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||   |||||||||||||    
T  22901757 tcttagtcaatgtactttactgagcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttatgggtctggttcttgatgt 22901661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 22908981 - 22909277
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22908981 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaataatgaaacatttatgaagtggagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 22909080  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22909081 attcctaattttttatacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgccatttttgtctttaatcaaataaatgcctttattccttgattga 22909180  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  22909181 tcttagtcaatgtactttagttggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttgattcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 22909277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19342154 - 19341870
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||| ||||    
T  19342154 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacattgatgaagtgcaacatg------------gatgatattcttaatagaat 19342067  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19342066 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgacctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattga 19341967  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  19341966 tctcagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcacgtgacccttgcattttcttcatttggttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 19341870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23721784 - 23721496
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||       ||| ||||||||||    
T  23721784 atgatttgtaagactcttatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcaacatggaaaatc-cta-------attattaatggaat 23721693  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23721692 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgctcctttggactttagtcaaataaatgcctttattccttgattga 23721593  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23721592 tcttagtcaatgtactttacggggcttttattaaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 23721496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 416
Target Start/End: Original strand, 40409231 - 40409430
Alignment:
Q  216 gatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatat 315  Q
    |||||||||||||   | || |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40409231 gatttgtaagactctcatttgatgtaatcaaactctaatagtgaaacatcaatgaagtgtagtatgtgtaacatctaggatgatattcttgatggaatat 40409330  T
Q  316 tcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatc 415  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40409331 tcctaatgtttcctacttgaattgttcatggtcttgaatgaacattaaagatg-tctttttgactttaatcaaataaatggctttattccttgattgatc 40409429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 458
Target Start/End: Original strand, 15475617 - 15475729
Alignment:
Q  347 tcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatcttagtc-atgtacttttctgggctttcattt 445  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  15475617 tcttgaatgaacattgaagatgctcattttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattgatcttagtcaatgtacttttctggacttttattt 15475716  T
Q  446 aagtcacgtgaac 458  Q
    | |||||||||||    
T  15475717 atgtcacgtgaac 15475729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 2998803 - 2998946
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  2998803 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 2998902  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2998903 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 2998946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4458068 - 4457925
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  4458068 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 4457969  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4457968 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 4457925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4467693 - 4467550
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  4467693 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 4467594  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4467593 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 4467550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17488563 - 17488420
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgata-ttcttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||| |||||  || ||    
T  17488563 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatatttctttgtgaaa 17488464  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17488463 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 17488420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45014605 - 45014462
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  45014605 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 45014506  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45014505 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 45014462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45024682 - 45024539
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  45024682 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 45024583  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45024582 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 45024539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 471
Target Start/End: Original strand, 16135423 - 16135581
Alignment:
Q  309 ggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcata-gtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaata-aatgcttttattcct 406  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||  |  ||| |||  ||||  |||||||||    
T  16135423 ggaatatttcaaatgtattgtacttcaaatgtttataagttttaaatgaacattgaagatgcccttt--gaaatagatccaattgaatgtctttattcct 16135520  T
Q  407 tgattgatcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 471  Q
    | |||||||  |    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16135521 taattgatcaaa----tgtacttttctgggcttttatttatgtcacatgaaccttgaatgttctt 16135581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18651091 - 18650948
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  18651091 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 18650993  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18650992 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 18650948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18663209 - 18663066
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  18663209 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 18663111  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18663110 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 18663066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Original strand, 5337242 - 5337384
Alignment:
Q  215 tgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  5337242 tgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 5337340  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5337341 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 5337384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Original strand, 5347095 - 5347237
Alignment:
Q  215 tgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  5347095 tgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 5347193  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5347194 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 5347237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 9502867 - 9502956
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  9502867 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 9502956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 9514233 - 9514322
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  9514233 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattc 9514322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 24696691 - 24696834
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||       |||||||||||||||||| | |  |||||    
T  24696691 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttgtggaa 24696790  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24696791 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 24696834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 15479203 - 15479258
Alignment:
Q  454 tgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  15479203 tgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgaacttggtttttgatgt 15479258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29423238 - 29423189
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29423238 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 29423189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 364
Target Start/End: Original strand, 72429 - 72465
Alignment:
Q  328 gtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  72429 gtacttcaagtgttcataatcttaaatgaacattgaa 72465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14437246 - 14436950
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14437246 atgatttgtaagacttgtaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttgatggaat 14437147  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14437146 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattctttgattga 14437047  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttca-tttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  14437046 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgtatgttcttcattttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 14436950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 26362557 - 26362852
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26362557 atgatttgtaagacttgtaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaagcatttatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 26362656  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |    
T  26362657 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaataaaataaatgctcttattctttgattta 26362756  T
Q  414 tcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  26362757 tcttagtcttgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgcatgttctttatttagtacatgagtatctgggcttggttcttgatgt 26362852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 483
Target Start/End: Original strand, 12841725 - 12841965
Alignment:
Q  244 caaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttca 343  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12841725 caaagcctaatagtgaaacattgatgaagtgcagtatatgtaacatctagcatgatatccttgatggaatattcctaatgttttgtacttcaaatgttca 12841824  T
Q  344 tagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatcttagtc-atgtacttttctgggctttca 442  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || |    
T  12841825 tagtcttgaaggaacattcaagatgccctttatgaacttaatctaataaatgtctttatttcttgattgatctaagtcaatgtactttactgggccttta 12841924  T
Q  443 tttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcat 483  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  12841925 tttatgtcacgtgagccctgtatgttcttcatattgttcat 12841965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 237 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18536441 - 18536171
Alignment:
Q  237 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaa 336  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18536441 atgtaatcaaattctaatagtgaaacatcaatgaagtgcactatgtataagatctaggatgatattcttgatggaatattcataatattttgtacttcaa 18536342  T
Q  337 ttgttcat-agtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatcttagtc-atgtacttttctg 434  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | || || || ||| ||     
T  18536341 ttgttcataagtcttgaatgatcattgaagatg-cctttttaactttaatcaaataaatgtgtttattctttgattgatctaattcaatatagtttactc 18536243  T
Q  435 ggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgat 507  Q
    | |||| ||||| | ||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  18536242 gacttttatttatgccacgtgatccttgaatgttattgataaagttcatgaatttttgggctt-gttcttgat 18536171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37295749 - 37295552
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |  |    ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37295749 atgatttgtaagactaccatttgatataatcaaatcctaatagtgaaacgttgataaagtgcggtgtatgtaacatctaggatgatattcttaatgaaat 37295650  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgatt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37295649 attcctaatgttttgtacttcaaatgtccatagtcttgaatgaacattgaagatgtcatttttgaacttactcaaataaatgcatttattccttgatt 37295552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 415
Target Start/End: Original strand, 5867578 - 5867770
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||   |    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5867578 atgatttgtaagactctcatttaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatcgatgaagggcaatgtttgtaacgtctaggatgatattcttattggaat 5867677  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  5867678 attccta-------gtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacattgaagat--cctttttgactttaatcctaaaaatgcctttattccttgattga 5867768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 21988126 - 21988269
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  21988126 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacagtaatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 21988225  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21988226 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21988269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 21997660 - 21997803
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    || |||||||||||||||||| |||  || ||    
T  21997660 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacagtaatgaagagcagtgataataacatctaggatgatattcctttgtgaaa 21997759  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21997760 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21997803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 9325222 - 9325365
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  9325222 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 9325320  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9325321 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 9325365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 21203000 - 21203143
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21203000 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21203098  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21203099 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21203143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 21213416 - 21213559
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21213416 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21213514  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21213515 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21213559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21334171 - 21334028
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  21334171 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 21334073  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21334072 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 21334028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 791609 - 791466
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||       |||||||||||||||||| | |  |||||    
T  791609 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagagattttaacatctaggatgatattcccttgtggaa 791510  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  791509 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 791466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37816733 - 37816670
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  37816733 atgatttgtaagactctcatttgatgtaatcaaattctaatagtgaaacatcaatgaagtgcag 37816670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20098559 - 20098494
Alignment:
Q  348 cttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatc 415  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  20098559 cttaaatgaacattgaatat--cttttttgacattaatcttgtaaatgcttttattgcttgattgatc 20098494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 1117 - 1413
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1117 atgatttgtaagactcttatttgatgtaattgagtcttaatagtgaaacattgatgaagtgcagcatggaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 1216  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1217 attcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcatgaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattta 1316  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  1317 tcttagtcaatgtactttactgggcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatattcttcatttagttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 1413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 214 - 471
Target Start/End: Original strand, 3728 - 3986
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3728 atgatttgtaagactcttattaaatgtaatcaaatcgtaatagtgaaacaatgatgaagtgcatcatggaaaacatctaggatgatattcttgatcgaat 3827  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3828 gttcctaatgttttgtacttcaaatattcatagtcttgaatgaatattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcctttattccttgattga 3927  T
Q  414 tcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 471  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3928 tcttagtcaatgtactttactgagcttttatttaagtcacgtgaaccttgaatgttctt 3986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 283 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1399 - 1173
Alignment:
Q  283 aaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgacttt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1399 aaaacatctaggatgatattcttgatggaatattcctaatgttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaagatgccctttttgacttg 1300  T
Q  383 aatcaaataaatgcttttattccttgattgatcttagtcatgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttca 482  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1299 aatcaaataaatgtctttattcactgattgatcttagttatgtacttttctgcgcttttatttaagtcacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttca 1200  T
Q  483 tgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  1199 tgaatttctgggcttggttcttgatgt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 267 - 487
Target Start/End: Original strand, 40842 - 41063
Alignment:
Q  267 atgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaaga 366  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40842 atgaagtgcaatatgaaaaacatctaggatgatattcttaatgaactattgcgaaggttttgtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacattgaaga 40941  T
Q  367 tgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatcttagtc-atgtacttttctgggctttcatttaagtcacgtgaaccttgaat 465  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  40942 tgccttttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgctcttagtcaatgtactttattgggcttttatttatgtcacgtgaaccttgcat 41041  T
Q  466 gttcttcatttagttcatgaat 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  41042 gttcttcatttggttcatgaat 41063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 338 - 509
Target Start/End: Original strand, 267239 - 267410
Alignment:
Q  338 tgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatcttagtc-atgtacttttctggg 436  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||    
T  267239 tgttcatagtcttta-tgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatacctttattccttgattgatcttagtcaacgtacttcactggg 267337  T
Q  437 ctttcatttaagtcacgtgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  267338 cttttatttatgttacgtgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgagtttatgggcttggttcttgatgt 267410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 423
Target Start/End: Original strand, 241880 - 242089
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaat 313  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| | ||||  |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||  | |||    
T  241880 atgatttgtaagacttctatttgatgtaatcagatcctaatagtaatacatcaatgaagtgtagtgtgtataacatctaggatgatattcttagagaaat 241979  T
Q  314 attcctaatgttttgtacttcaattgttcat-agtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaat-caaataaatgcttttattccttgatt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||  ||||  ||||||||    
T  241980 attcctaatgttttgtacttcaattgttcataagtcttaaatgaacattgaatatgcc--ttttcacttttatccaaataaatgtgtttaaaccttgatt 242077  T
Q  412 gatcttagtcat 423  Q
     |||| ||||||    
T  242078 aatctaagtcat 242089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 19571 - 19660
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattc 303  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  || |||||||||||||||||||    
T  19571 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaatgatgaagagcagtaataataacatctaggatgatattc 19660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 8038 - 8181
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  8038 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 8136  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8137 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 8181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 234184 - 234327
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag-catgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatgga 311  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||  || |    
T  234184 atgatttgtaagactatcatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgatg-ataacatctaggatgatattcctttgtgaa 234282  T
Q  312 atattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  234283 atattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 234327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8243 - 8100
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||       |||||||||||||||||| | |  |||||    
T  8243 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaattatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttgtggaa 8144  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8143 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 8100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 93048 - 93191
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatatt-cttaatggaa 312  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||       |||||||||||||||||| | |  |||||    
T  93048 atgatttgtaagactactatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcagtgattttaacatctaggatgatattcccttttggaa 93147  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    ||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  93148 tattccta-------gtacatcaa-tgttcatagtcttaaatgaacattgaa 93191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 14118
Alignment:
Q  454 tgaaccttgaatgttcttcatttagttcatgaatatttggacttggttcttgatgt 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  14173 tgaaccttgcatgttcttcatttggttcatgaatttctgggcttggttcttgatgt 14118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 413
Target Start/End: Original strand, 29027 - 29145
Alignment:
Q  285 aacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||       ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  29027 aacatctaggatgatattctcattggaatattgcta-------gtatttcaat-gttcatagtcttaaatgaacattgaatat--cctttttgacattaa 29116  T
Q  385 tcaaataaatgcttttattccttgattga 413  Q
     |   ||||||| |||||| |||||||||    
T  29117 ccttgtaaatgcatttattgcttgattga 29145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 358
Target Start/End: Original strand, 198888 - 199024
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaa-catttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||   ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||    
T  198888 atgatttgtaagacttgtatttgatgtaaacaa-tcctaatagtgaaaacataactgaagtgcagtgattgcaacatctaggatgatattcttattggaa 198986  T
Q  313 tattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaac 358  Q
    ||||| ||       ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  198987 tattcata-------gtacttcaa-tgttcatagtcttaaatgaac 199024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 364
Target Start/End: Original strand, 28630 - 28727
Alignment:
Q  267 atgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcat-agtcttaaatgaacattgaa 364  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  28630 atgaagtgcaacatgtataacatctagaatgaaattctttgatgaatattcctaatg-tttgtacttcatttgttcataagtctttaatgaacaatgaa 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 65488 - 65370
Alignment:
Q  285 aacatctaggatgatattcttaatggaatattcctaatgttttgtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||       ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||| ||||    
T  65488 aacatctaggatgatattcttgttcgaatattccta-------gtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacactgaagat--cttttttgacattaa 65398  T
Q  385 tcaaataaatgcttttattccttgattg 412  Q
    ||   ||||||  |||||| ||||||||    
T  65397 tcttgtaaatgtatttattgcttgattg 65370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Original strand, 17482 - 17531
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17482 atgatttgtaagactaccatttaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 17531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 216479 - 216376
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtg-aaacatttatgaagtgcagcatgaaaaacatctaggatgatattcttaatggaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||| |     |||||||||||||||||||  | |||||    
T  216479 atgatttgtaagacttgtacttgatgtaatc-aatcctaatagtgaaaacataattgaagtgcagtaattgcaacatctaggatgatattcacattggaa 216381  T
Q  313 tattc 317  Q
    |||||    
T  216380 tattc 216376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 310214 - 310277
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  310214 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcag 310277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 21351 - 21414
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    ||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21351 atgatttgtaagaataccaattgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcag 21414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15721 - 15658
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaagtgcag 277  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  15721 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaagagcag 15658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Original strand, 74913 - 74971
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaacatttatgaag 272  Q
    |||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  74913 atgatttgtaagactaccatttgatgtaatcaaatcctaatagtgaaacaataatgaag 74971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15146 - 15062
Alignment:
Q  328 gtacttcaattgttcatagtcttaaatgaacattgaagatgccctttttgactttaatcaaataaatgcttttattccttgattgatc 415  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||   ||||||  |||||| |||||||||||    
T  15146 gtacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaagat---ctttttgacattagtcttgtaaatgtctttatttcttgattgatc 15062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13694 - 13645
Alignment:
Q  214 atgatttgtaagacttgtaattaatgtaatcaaatcctaatagtgaaaca 263  Q
    ||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13694 atgatttgtaagacttccatttgatgtaatcaaatcgtaatagtgaaaca 13645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 265
Target Start/End: Original strand, 13146 - 13174
Alignment:
Q  237 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacatt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13146 atgtaatcaaatcctaatagtgaaacatt 13174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University