View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14793_high_2 (Length: 525)

Name: NF14793_high_2
Description: NF14793
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14793_high_2
NF14793_high_2
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (13-322)||(36494808-36495118)
chr8 (172-325)||(2041798-2041952)
chr8 (172-324)||(24112477-24112630)
chr8 (171-324)||(22259926-22260080)
chr8 (172-324)||(26782015-26782168)
chr8 (172-324)||(10830656-10830809)
chr8 (172-324)||(35117502-35117655)
chr8 (172-324)||(44804183-44804336)
chr8 (172-324)||(18595291-18595444)
chr8 (172-324)||(29939116-29939269)
chr8 (172-324)||(14423480-14423633)
chr8 (172-324)||(40116677-40116830)
chr8 (177-316)||(39207221-39207361)
chr8 (175-317)||(34998178-34998321)
chr8 (172-317)||(6143773-6143919)
chr8 (172-317)||(8022274-8022420)
chr8 (172-316)||(15730355-15730500)
chr8 (172-316)||(34678956-34679101)
chr8 (176-324)||(34841838-34841987)
chr8 (172-324)||(41576149-41576302)
chr8 (178-317)||(13110965-13111105)
chr8 (192-324)||(28639923-28640055)
chr8 (175-324)||(5321090-5321240)
chr8 (192-325)||(145033-145166)
chr8 (172-324)||(39222046-39222199)
chr8 (197-317)||(33279289-33279409)
chr8 (175-324)||(38166235-38166385)
chr8 (172-324)||(33286439-33286592)
chr8 (175-317)||(5015151-5015294)
chr8 (176-317)||(4036411-4036553)
chr8 (217-324)||(10836025-10836132)
chr8 (178-316)||(9807862-9808000)
chr8 (192-322)||(2320518-2320648)
chr8 (172-277)||(4716572-4716678)
chr8 (175-282)||(39219394-39219502)
chr8 (218-324)||(42572178-42572284)
chr8 (217-324)||(883352-883459)
chr8 (176-261)||(6082907-6082993)
chr8 (331-379)||(36491597-36491645)
chr8 (324-379)||(18594973-18595028)
chr8 (172-278)||(18684830-18684936)
chr8 (172-278)||(18730395-18730501)
chr8 (272-317)||(12848365-12848410)
chr8 (234-311)||(30128710-30128785)
chr8 (324-358)||(34998546-34998580)
chr8 (338-379)||(29938793-29938834)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (172-324)||(38867364-38867517)
chr7 (171-324)||(17754342-17754496)
chr7 (172-324)||(9453332-9453485)
chr7 (172-317)||(12097085-12097231)
chr7 (171-324)||(33358406-33358560)
chr7 (172-324)||(5281447-5281600)
chr7 (172-317)||(25749044-25749190)
chr7 (172-324)||(42205103-42205256)
chr7 (175-324)||(6395832-6395982)
chr7 (176-324)||(32042097-32042246)
chr7 (169-324)||(12100477-12100633)
chr7 (171-324)||(4476315-4476469)
chr7 (172-317)||(36890263-36890409)
chr7 (172-324)||(3512131-3512284)
chr7 (176-324)||(33845868-33846017)
chr7 (176-320)||(43067464-43067609)
chr7 (172-317)||(7164746-7164892)
chr7 (177-324)||(22648923-22649068)
chr7 (169-324)||(30180062-30180218)
chr7 (177-324)||(1803663-1803811)
chr7 (173-316)||(42674179-42674323)
chr7 (192-324)||(46133781-46133913)
chr7 (172-324)||(43407693-43407846)
chr7 (171-317)||(24791816-24791961)
chr7 (172-278)||(934106-934213)
chr7 (217-316)||(15656640-15656739)
chr7 (217-324)||(16893857-16893964)
chr7 (176-317)||(48866185-48866327)
chr7 (217-316)||(42964134-42964233)
chr7 (217-324)||(43157299-43157406)
chr7 (172-324)||(37004114-37004268)
chr7 (219-324)||(8631495-8631600)
chr7 (172-323)||(15648618-15648770)
chr7 (172-324)||(18120693-18120829)
chr7 (179-323)||(36847607-36847752)
chr7 (217-317)||(43021090-43021190)
chr7 (324-379)||(37705341-37705396)
chr7 (324-379)||(12100870-12100925)
chr7 (324-379)||(33358790-33358845)
chr7 (324-379)||(42673891-42673946)
chr7 (324-379)||(33846237-33846292)
chr7 (172-215)||(43157393-43157437)
chr7 (218-324)||(20165379-20165485)
chr7 (172-221)||(43021059-43021109)
chr7 (324-361)||(18121051-18121088)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (172-324)||(15669925-15670078)
chr4 (171-324)||(19912926-19913080)
chr4 (172-324)||(50354359-50354512)
chr4 (171-317)||(6687850-6687997)
chr4 (172-317)||(35490260-35490406)
chr4 (172-324)||(44784212-44784365)
chr4 (172-324)||(50053593-50053746)
chr4 (172-324)||(53408835-53408988)
chr4 (175-324)||(33704580-33704730)
chr4 (171-324)||(38070568-38070722)
chr4 (172-316)||(2480813-2480958)
chr4 (172-324)||(15240321-15240474)
chr4 (168-324)||(38055974-38056131)
chr4 (172-324)||(45423893-45424046)
chr4 (172-324)||(52140015-52140168)
chr4 (169-324)||(23702063-23702219)
chr4 (169-324)||(54190272-54190428)
chr4 (175-324)||(27583128-27583278)
chr4 (172-324)||(10687635-10687788)
chr4 (172-324)||(10901275-10901428)
chr4 (173-317)||(43289448-43289593)
chr4 (168-324)||(47632849-47633006)
chr4 (173-324)||(41852213-41852365)
chr4 (172-317)||(1756249-1756395)
chr4 (172-324)||(28031934-28032087)
chr4 (172-324)||(53716706-53716859)
chr4 (171-324)||(44377294-44377448)
chr4 (175-317)||(26088184-26088327)
chr4 (176-324)||(16701526-16701675)
chr4 (192-324)||(53876309-53876441)
chr4 (172-322)||(30172259-30172410)
chr4 (178-324)||(40428118-40428265)
chr4 (179-324)||(6610744-6610890)
chr4 (175-324)||(9595300-9595450)
chr4 (174-324)||(23775764-23775913)
chr4 (175-324)||(28361134-28361284)
chr4 (176-317)||(50055707-50055849)
chr4 (177-324)||(16704767-16704915)
chr4 (178-317)||(53353618-53353758)
chr4 (175-324)||(30423030-30423180)
chr4 (176-324)||(8590096-8590245)
chr4 (177-316)||(23261220-23261360)
chr4 (172-317)||(34617913-34618058)
chr4 (175-324)||(48910498-48910648)
chr4 (176-324)||(31970424-31970573)
chr4 (193-324)||(48748645-48748775)
chr4 (192-324)||(44378592-44378724)
chr4 (217-325)||(54413311-54413419)
chr4 (177-324)||(20877696-20877832)
chr4 (210-324)||(1617709-1617823)
chr4 (200-325)||(33704933-33705057)
chr4 (173-316)||(44547160-44547303)
chr4 (218-317)||(19164045-19164144)
chr4 (234-324)||(27535462-27535552)
chr4 (176-317)||(40679525-40679667)
chr4 (213-317)||(37968255-37968359)
chr4 (225-317)||(27488186-27488276)
chr4 (219-317)||(51780305-51780403)
chr4 (172-324)||(14988525-14988658)
chr4 (247-324)||(8931555-8931632)
chr4 (324-379)||(33704282-33704337)
chr4 (176-237)||(27531963-27532025)
chr4 (324-378)||(44378912-44378966)
chr4 (178-323)||(46035728-46035874)
chr4 (324-379)||(14988235-14988290)
chr4 (324-379)||(23261584-23261639)
chr4 (324-379)||(23268744-23268799)
chr4 (324-379)||(54189985-54190040)
chr4 (324-379)||(31970145-31970200)
chr4 (324-379)||(45424249-45424304)
chr4 (234-323)||(46256637-46256727)
chr4 (329-379)||(54413066-54413116)
chr4 (324-379)||(19164667-19164722)
chr4 (338-379)||(16701236-16701277)
chr4 (338-379)||(19913327-19913368)
chr4 (338-379)||(55344394-55344435)
chr4 (338-378)||(15240722-15240762)
chr4 (338-378)||(15669639-15669679)
chr4 (338-378)||(27535810-27535850)
chr4 (324-356)||(44377028-44377060)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (172-324)||(34700970-34701123)
chr3 (172-324)||(38934685-38934838)
chr3 (175-324)||(44689569-44689719)
chr3 (172-324)||(8043421-8043574)
chr3 (172-324)||(15521387-15521540)
chr3 (172-324)||(16355265-16355418)
chr3 (171-324)||(29784202-29784356)
chr3 (172-324)||(22175345-22175498)
chr3 (172-324)||(50529673-50529826)
chr3 (177-324)||(32360071-32360219)
chr3 (172-324)||(20699875-20700028)
chr3 (172-324)||(25493724-25493877)
chr3 (172-324)||(26000088-26000241)
chr3 (172-324)||(37697429-37697582)
chr3 (172-324)||(42307230-42307383)
chr3 (178-317)||(53028868-53029008)
chr3 (172-317)||(38856651-38856797)
chr3 (172-324)||(15517922-15518075)
chr3 (172-324)||(32244929-32245082)
chr3 (173-316)||(44608809-44608953)
chr3 (178-317)||(46451650-46451790)
chr3 (172-324)||(29785703-29785856)
chr3 (172-320)||(48924518-48924667)
chr3 (176-317)||(35227098-35227240)
chr3 (175-324)||(54869373-54869523)
chr3 (172-324)||(42103546-42103696)
chr3 (202-317)||(50528135-50528250)
chr3 (177-322)||(26123412-26123558)
chr3 (172-324)||(13697456-13697609)
chr3 (172-324)||(21581788-21581941)
chr3 (177-324)||(49129820-49129968)
chr3 (217-324)||(20841705-20841812)
chr3 (227-324)||(54533375-54533472)
chr3 (217-324)||(24835383-24835490)
chr3 (171-324)||(29446268-29446410)
chr3 (172-324)||(12116970-12117106)
chr3 (217-318)||(52922216-52922317)
chr3 (324-379)||(20842042-20842097)
chr3 (324-379)||(12117352-12117407)
chr3 (324-379)||(21581475-21581530)
chr3 (324-379)||(25999825-25999880)
chr3 (324-379)||(42307603-42307658)
chr3 (258-323)||(36787513-36787578)
chr3 (324-379)||(37697845-37697900)
chr3 (324-360)||(2895657-2895693)
chr3 (324-361)||(22174617-22174654)
chr3 (175-323)||(29624624-29624772)
chr3 (324-361)||(50529385-50529422)
chr3 (324-359)||(35643646-35643681)
chr3 (338-379)||(15519849-15519890)
chr3 (175-223)||(24835355-24835404)
chr3 (173-237)||(36787444-36787509)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (172-324)||(3872476-3872629)
chr2 (175-324)||(5734140-5734290)
chr2 (172-324)||(851651-851804)
chr2 (172-324)||(33905284-33905437)
chr2 (171-324)||(18806112-18806266)
chr2 (172-317)||(1481269-1481415)
chr2 (175-324)||(31516566-31516716)
chr2 (172-317)||(30265978-30266124)
chr2 (192-317)||(16588296-16588421)
chr2 (172-324)||(26322516-26322669)
chr2 (169-324)||(19383343-19383499)
chr2 (172-324)||(6174322-6174475)
chr2 (177-324)||(16065740-16065888)
chr2 (177-316)||(28323012-28323152)
chr2 (175-325)||(42938537-42938687)
chr2 (172-324)||(1110038-1110191)
chr2 (175-324)||(1679298-1679448)
chr2 (176-324)||(44946960-44947109)
chr2 (217-324)||(30419450-30419557)
chr2 (217-324)||(4231685-4231792)
chr2 (219-324)||(2178161-2178266)
chr2 (217-324)||(39636110-39636217)
chr2 (210-317)||(4016791-4016898)
chr2 (178-322)||(42445088-42445233)
chr2 (217-323)||(3587043-3587149)
chr2 (172-323)||(12516397-12516549)
chr2 (324-379)||(2178474-2178529)
chr2 (172-317)||(39463770-39463916)
chr2 (218-322)||(11707762-11707866)
chr2 (217-316)||(22100245-22100344)
chr2 (324-376)||(4016486-4016538)
chr2 (324-379)||(30270393-30270448)
chr2 (324-365)||(39635879-39635920)
chr2 (176-221)||(19900662-19900708)
chr2 (217-261)||(19900689-19900733)
chr2 (324-363)||(1481727-1481766)
chr2 (229-323)||(45111589-45111682)
chr2 (338-379)||(5733854-5733895)
chr2 (324-361)||(31516913-31516950)
chr2 (171-222)||(12517392-12517444)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (172-324)||(18614282-18614435)
chr6 (172-317)||(20727353-20727499)
chr6 (172-324)||(10550939-10551092)
chr6 (172-324)||(16306470-16306623)
chr6 (172-324)||(3346837-3346990)
chr6 (172-324)||(53645-53798)
chr6 (172-324)||(30692582-30692735)
chr6 (177-324)||(3955122-3955270)
chr6 (172-317)||(26703656-26703802)
chr6 (172-324)||(9460350-9460503)
chr6 (174-324)||(2838299-2838450)
chr6 (175-317)||(23073666-23073809)
chr6 (202-324)||(21894092-21894214)
chr6 (169-324)||(33465106-33465255)
chr6 (192-324)||(17260391-17260527)
chr6 (217-324)||(6085970-6086077)
chr6 (175-317)||(26946374-26946516)
chr6 (213-324)||(30692736-30692847)
chr6 (217-324)||(35198870-35198977)
chr6 (171-250)||(34887100-34887180)
chr6 (324-379)||(6086310-6086365)
chr6 (324-379)||(26704046-26704101)
chr6 (240-319)||(29734178-29734257)
chr6 (172-322)||(12835754-12835903)
chr6 (324-379)||(2837989-2838044)
chr6 (324-379)||(30692293-30692348)
chr6 (325-378)||(53345-53398)
chr6 (324-379)||(3955481-3955536)
chr6 (324-379)||(10550658-10550715)
chr6 (276-317)||(34887050-34887091)
chr6 (172-218)||(30691805-30691852)
chr6 (324-365)||(23075785-23075826)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (172-324)||(1168710-1168863)
chr1 (172-324)||(17592427-17592580)
chr1 (172-324)||(17586687-17586840)
chr1 (172-324)||(42369641-42369794)
chr1 (172-324)||(38829865-38830018)
chr1 (177-324)||(26663903-26664051)
chr1 (172-322)||(40093243-40093394)
chr1 (172-317)||(1940246-1940391)
chr1 (171-324)||(8078948-8079102)
chr1 (175-324)||(29079242-29079392)
chr1 (171-324)||(52697398-52697552)
chr1 (174-325)||(969851-970003)
chr1 (172-317)||(33511023-33511169)
chr1 (179-324)||(43906293-43906439)
chr1 (172-324)||(1171258-1171411)
chr1 (172-324)||(23323374-23323527)
chr1 (172-324)||(25897980-25898133)
chr1 (172-324)||(39259698-39259851)
chr1 (172-324)||(51358672-51358825)
chr1 (173-324)||(26579508-26579660)
chr1 (172-324)||(6766177-6766330)
chr1 (176-324)||(41927793-41927942)
chr1 (172-324)||(52752514-52752667)
chr1 (192-324)||(2348473-2348605)
chr1 (177-324)||(8121606-8121754)
chr1 (172-316)||(15718432-15718577)
chr1 (176-317)||(40150104-40150247)
chr1 (192-317)||(15553672-15553797)
chr1 (172-324)||(20097428-20097581)
chr1 (200-324)||(5216119-5216243)
chr1 (172-317)||(23318849-23318995)
chr1 (172-324)||(7146401-7146556)
chr1 (217-325)||(13995978-13996086)
chr1 (217-325)||(14004092-14004200)
chr1 (217-324)||(16052905-16053012)
chr1 (219-323)||(15203696-15203800)
chr1 (204-324)||(29699578-29699698)
chr1 (172-279)||(38172551-38172659)
chr1 (217-318)||(46410022-46410123)
chr1 (219-324)||(29288861-29288966)
chr1 (175-270)||(46761765-46761861)
chr1 (217-324)||(32672410-32672517)
chr1 (217-324)||(52088369-52088477)
chr1 (200-323)||(5678495-5678617)
chr1 (241-322)||(12683375-12683456)
chr1 (242-324)||(2474329-2474410)
chr1 (250-324)||(23499165-23499239)
chr1 (172-246)||(2478437-2478512)
chr1 (234-323)||(5216249-5216338)
chr1 (176-316)||(22887391-22887537)
chr1 (324-379)||(46761408-46761463)
chr1 (324-379)||(25897710-25897765)
chr1 (324-379)||(29078957-29079012)
chr1 (324-379)||(29288564-29288619)
chr1 (324-379)||(39260060-39260115)
chr1 (324-379)||(52752878-52752933)
chr1 (265-325)||(49146766-49146826)
chr1 (324-365)||(38172265-38172306)
chr1 (172-215)||(46410110-46410154)
chr1 (324-379)||(970247-970302)
chr1 (324-379)||(23498907-23498962)
chr1 (174-215)||(32672504-32672546)
chr1 (172-224)||(12683453-12683506)
chr1 (203-246)||(29699747-29699790)
chr1 (330-377)||(8121311-8121360)
chr1 (229-323)||(36523905-36523999)
chr1 (177-225)||(23499252-23499301)
chr1 (338-379)||(41928214-41928255)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (172-324)||(69-222)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (172-324)||(9007292-9007445)
chr5 (172-324)||(19360715-19360868)
chr5 (171-324)||(27678492-27678646)
chr5 (175-320)||(33991958-33992104)
chr5 (173-317)||(8373600-8373745)
chr5 (172-324)||(26602286-26602439)
chr5 (175-324)||(24104961-24105111)
chr5 (175-324)||(33490503-33490653)
chr5 (174-324)||(35782002-35782151)
chr5 (172-324)||(1165052-1165205)
chr5 (171-324)||(35419631-35419785)
chr5 (172-317)||(27421424-27421570)
chr5 (178-317)||(1579599-1579739)
chr5 (178-317)||(1605076-1605216)
chr5 (172-324)||(27025744-27025897)
chr5 (176-324)||(4121675-4121826)
chr5 (200-324)||(31413345-31413469)
chr5 (177-324)||(31883937-31884085)
chr5 (177-324)||(34708283-34708431)
chr5 (217-324)||(16070184-16070291)
chr5 (172-317)||(35419918-35420055)
chr5 (174-295)||(23765297-23765419)
chr5 (174-295)||(23815145-23815267)
chr5 (217-317)||(41818028-41818128)
chr5 (172-320)||(19515495-19515649)
chr5 (175-317)||(16736638-16736764)
chr5 (324-379)||(27678881-27678936)
chr5 (324-379)||(33490908-33490963)
chr5 (263-324)||(20988364-20988425)
chr5 (324-379)||(24105389-24105444)
chr5 (324-379)||(26602650-26602705)
chr5 (324-379)||(35782358-35782413)
chr5 (172-230)||(38597158-38597217)
chr5 (324-379)||(8374045-8374100)
chr5 (247-312)||(3180516-3180581)
chr5 (275-324)||(38597217-38597267)
chr5 (338-379)||(16069807-16069848)
chr5 (338-379)||(19358984-19359025)
[»] scaffold1827 (1 HSPs)
scaffold1827 (178-324)||(34-181)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (173-317)||(18256-18401)
[»] scaffold0444 (3 HSPs)
scaffold0444 (171-317)||(1710-1857)
scaffold0444 (192-324)||(433-565)
scaffold0444 (324-378)||(191-245)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (176-324)||(10912-11063)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (179-324)||(144652-144798)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36495118 - 36494808
Alignment:
Q  13 agagatgaagtaaccgataaggtaaaaggaagatgaagaaaaatgggattacgaaccaaccttcttctgctaaagatagcagcattcccattgtgtgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36495118 agagatgaagtaaccgataaggtaaaaggaagatgaagaaaaatgggattacgaaccaaccttcttctgctaaagatagcagcattcccattgtgtgtga 36495019  T
Q  113 gaggttttgggaatgcaattgagaaaggattttggagcgaaataggtttaggaggctttggccccgtttggataaaca-attatatagatgcttatagca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  36495018 gaggttttgggaatgcaattgagaaacgattttggagcgaaataggtttaggaggttttgggcccgtttggataaacagcttatatagatgcgtatagca 36494919  T
Q  212 ttagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaag 311  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36494918 ttagctcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaag 36494819  T
Q  312 tgtttgaatgt 322  Q
    |||||| ||||    
T  36494818 tgtttggatgt 36494808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 172 - 325
Target Start/End: Original strand, 2041798 - 2041952
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2041798 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 2041897  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtgat 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2041898 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgat 2041952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 24112477 - 24112630
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24112477 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactatttat 24112576  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24112577 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 24112630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 22259926 - 22260080
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22259926 tggctccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctattta 22260025  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22260026 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 22260080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 26782015 - 26782168
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26782015 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacttcgtaagctcttatacttgataagctatttat 26782114  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26782115 gtttggatatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtga 26782168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 10830656 - 10830809
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10830656 ggccccgtttggataaacagtttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttaataagctatttat 10830755  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10830756 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 10830809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 35117502 - 35117655
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35117502 ggcctcgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 35117601  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  35117602 gtttggatatgtacactaaaaagtacttgcataaattgaagtgtttggatgtga 35117655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 44804183 - 44804336
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44804183 ggccccgtttagataaacagcttatatagatgcttatagcatcagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 44804282  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44804283 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 44804336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18595444 - 18595291
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18595444 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttatgacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 18595345  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18595344 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 18595291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29939269 - 29939116
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29939269 ggccctgttttgataaacaacttatatagatgcttataacattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 29939170  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29939169 gttttgatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 29939116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14423633 - 14423480
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  14423633 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattaaggcttataacattagagcttacattataagctcgtatacttgataaactatttat 14423534  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14423533 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 14423480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 40116677 - 40116830
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40116677 ggcctcgtttggattaacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataatattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 40116776  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40116777 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 40116830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39207361 - 39207221
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39207361 cgtttggataaacaatttatatagatgcttatagcataagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttg 39207262  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39207261 gatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaaatgttt 39207221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 34998178 - 34998321
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34998178 cccgtttggataaacaacttatatagatgcttatatcattagaccttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 34998277  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34998278 tgtatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 34998321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 6143773 - 6143919
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6143773 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacgtcataagctcttatacttaataagctatttat 6143872  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6143873 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 6143919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8022420 - 8022274
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8022420 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatgacattagggtttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 8022321  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8022320 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 8022274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15730500 - 15730355
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  15730500 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataacagtagagcttacatcataaactcttctacttgataagttatttat 15730401  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15730400 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 15730355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Original strand, 34678956 - 34679101
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34678956 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttat 34679055  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  34679056 gtttggatatgtacactaaaaagtactttcataaattgaattgttt 34679101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Original strand, 34841838 - 34841987
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  34841838 ccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcactagggtttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttt 34841937  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34841938 ggatatttacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 34841987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41576302 - 41576149
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41576302 ggccccgtttgcataaacagtttatatagatgcttatagcattaggacttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctattaat 41576203  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  41576202 gtttggatatgtacactaaaaagtacttagatgaattgaagtgtttggatgtga 41576149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13111105 - 13110965
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13111105 gtttggataaacaacttatatagatgcttatgacattagggcttataacattagagcttacgtcataagctcttatacttaataagctatttatgtttgg 13111006  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13111005 atatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 13110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28640055 - 28639923
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28640055 ttatatagatgcttataatattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaa 28639956  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28639955 agtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 28639923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5321240 - 5321090
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5321240 cccgtttggataaacaacttatataaatgcttataatattagggcttatagaattagagcttacatcataagttcttatacttgataaactatttatgtt 5321141  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5321140 tggatatgtacactaaaaagtacttacatagattgaagtgtttgaatgtga 5321090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 145166 - 145033
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  145166 ttatatagatggttatagcattatgacttataacattagagtttacatcataagttcttatacttaataagctatttatgtttgaatatgtacacaaaaa 145067  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttgaatgtgat 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145066 agtacttacataaattgaagtgtttgaatgtgat 145033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39222199 - 39222046
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  39222199 ggccctgtttggataaacagcttgtatagatgcttatagcattatggcttataacattagagcttacatcataagctcttatactcgataagctctttat 39222100  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39222099 gtttggatatgtacacttaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 39222046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33279409 - 33279289
Alignment:
Q  197 tagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtac 296  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33279409 tagatgcttatgacattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtac 33279310  T
Q  297 ttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  33279309 ttacataaattgaagtgtttg 33279289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 38166235 - 38166385
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  38166235 cccgtttggataaacagcttatatagatgtttatagcattaggacttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtt 38166334  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38166335 tggctatgtatacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 38166385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 33286439 - 33286592
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  33286439 ggccccgttttgataaacaacttatatagatgtttatagcattagggcttataatattagagcttacatcataaacttttatacttgataagctatttat 33286538  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  33286539 gtttggatatgtatacaaaaaagtacatacataaattgaagtgtttggatgtga 33286592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5015294 - 5015151
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  5015294 cccgtttggataaacaatttatatagatgcttatagcattatggcttataatattaaagcttatatcataagtacttatactcgataaactctttatgtt 5015195  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5015194 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 5015151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4036553 - 4036411
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||  ||||||| |||    
T  4036553 ccgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagtgcttataacattagagcttacaacataagcttttatactttataacttatttatgttt 4036454  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4036453 ggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 4036411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Original strand, 10836025 - 10836132
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10836025 gcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttaataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 10836124  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  10836125 ggatgtga 10836132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9808000 - 9807862
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  9808000 gtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacgttataagctcttatacttaataagttatttatgtttgg 9807901  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9807900 atat-tacactaaaaaatacttacataaattgaagtgttt 9807862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 322
Target Start/End: Original strand, 2320518 - 2320648
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2320518 ttatattgatgcttataacattagagcttatagcactagagcttacatcataagctcttatactcaataagctctttatgtttggatatgtacactaaaa 2320617  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttgaatgt 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2320618 agtacttacataaattgaagtgtttggatgt 2320648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4716678 - 4716572
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4716678 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcatgagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 4716579  T
Q  271 ctttgga 277  Q
     ||||||    
T  4716578 gtttgga 4716572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39219502 - 39219394
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  39219502 cccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttatagcattagagcttatatcataagctcttatactttataagctatttatgtt 39219403  T
Q  274 tggatatgt 282  Q
    |||||||||    
T  39219402 tggatatgt 39219394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42572284 - 42572178
Alignment:
Q  218 cttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  42572284 cttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatatttgaatatttacactaaaaagtacttacataaattaaagtatttg 42572185  T
Q  318 aatgtga 324  Q
    |||||||    
T  42572184 aatgtga 42572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 883459 - 883352
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  883459 gcttatagcattagagcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttagatatattcactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 883360  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  883359 ggatgtga 883352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 261
Target Start/End: Original strand, 6082907 - 6082993
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataa 261  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6082907 ccgtttggataaatagcttatataaatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataa 6082993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36491645 - 36491597
Alignment:
Q  331 gtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36491645 gtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 36491597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18595028 - 18594973
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  18595028 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagcgtgcagtttgttac 18594973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18684936 - 18684830
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  18684936 ggccccgtttggataaatagcttatagagatgcttatagcattaaaacttatag-actagagcttacatcataagctcttatactcaataagctctttat 18684838  T
Q  271 ctttggat 278  Q
     |||||||    
T  18684837 gtttggat 18684830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18730501 - 18730395
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  18730501 ggccccgtttggataaatagcttatagagatgcttatagcattaaaacttatag-actagagcttacatcataagctcttatactcaataagctctttat 18730403  T
Q  271 ctttggat 278  Q
     |||||||    
T  18730402 gtttggat 18730395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 12848365 - 12848410
Alignment:
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12848365 tttggatatgtacactaaaaagtacatacgtaaattgaagtgtttg 12848410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30128785 - 30128710
Alignment:
Q  234 ttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaag 311  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30128785 ttacatcataagctcttataca--ataagttttttatgtttggatatatatactaaaatgtacttgtataaattgaag 30128710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 358
Target Start/End: Original strand, 34998546 - 34998580
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatataga 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34998546 attagaggtgtaaataaacttaccatatatataga 34998580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29938834 - 29938793
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29938834 taaacttaccatatatatagatattagtgtacagtttgttac 29938793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38867517 - 38867364
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38867517 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 38867418  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38867417 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 38867364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17754496 - 17754342
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17754496 tggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctattta 17754397  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17754396 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 17754342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9453485 - 9453332
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9453485 ggccccgtttgaataaacaacttatatagatacttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 9453386  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9453385 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 9453332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 12097085 - 12097231
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12097085 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 12097184  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12097185 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 12097231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 33358406 - 33358560
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33358406 tggccccgtttggataaacatcttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctattta 33358505  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33358506 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 33358560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5281600 - 5281447
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5281600 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttatagcattagaacttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 5281501  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5281500 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 5281447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25749190 - 25749044
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25749190 ggccccggttggataaacaacttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagggcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 25749091  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25749090 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 25749044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42205256 - 42205103
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  42205256 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattggggcttataacattagagcttacatcataagctcttatttttgataagctatttat 42205157  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  42205156 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttggatgtga 42205103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6395982 - 6395832
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6395982 cccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttatatcattagagattacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 6395883  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6395882 tggatatatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 6395832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32042246 - 32042097
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32042246 ccgtttggataaacaacttatatagatgcttatatcattagagcttataacattagagcttacatcttaagcccttatacttgataagctatttatgttt 32042147  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32042146 ggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 32042097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 169 - 324
Target Start/End: Original strand, 12100477 - 12100633
Alignment:
Q  169 tttggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatt 267  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12100477 tttggctccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagaattagtacttataacattagagcttatatcataagttcttatacttgataagctatt 12100576  T
Q  268 tatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12100577 tatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 12100633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 4476315 - 4476469
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  4476315 tggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttatatcattagagcttacatcataagctcttatacttaataagctgttta 4476414  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4476415 tgtttagatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 4476469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 36890263 - 36890409
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  36890263 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttataccattagggcttacagcattagagcttacatcataagctcttatatttgataagatatttat 36890362  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36890363 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 36890409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3512284 - 3512131
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  3512284 ggcctcgtttggataaacaacttatatagacgcttatagcattagggcttataatattagagcttacatcataagctcttatatttgataaactatttat 3512185  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3512184 gtttggatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 3512131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Original strand, 33845868 - 33846017
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33845868 ccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttatgacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagcaatttatgttt 33845967  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33845968 ggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 33846017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 320
Target Start/End: Original strand, 43067464 - 43067609
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  43067464 ccgttcggataaacagtttatatagatgcttatggtattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttt 43067563  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaat 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43067564 ggatacgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaat 43067609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7164892 - 7164746
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7164892 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacaatagagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttat 7164793  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7164792 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaaatgtttg 7164746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Original strand, 22648923 - 22649068
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||    
T  22648923 cgtttggataaacaacttatatagatgcttatagtattagggcttataatattagagcttacatcataagctct---acttgataagctatttatgtttg 22649019  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22649020 gatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 22649068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 324
Target Start/End: Original strand, 30180062 - 30180218
Alignment:
Q  169 tttggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30180062 tttggccccgtttggataaacaacttatatacatgcttgttgcattagagtttataccattagagcttatatcataagctcttatacttgataagttatt 30180161  T
Q  268 tatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30180162 tatgtttggatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtga 30180218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1803811 - 1803663
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1803811 cgtttggataaacagcttatacaaatgcttatagcataagggcttataacattagagcttacattataagctcttatacttgataagctatttaggtttg 1803712  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1803711 gatatgtacactaaaaagtagttacataaattgaagtgtttggatgtga 1803663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 173 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42674323 - 42674179
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||     
T  42674323 gccccgtttggataaacagtttatataaatgcttatagtattagggcttataacattagagcttacatcataaactcttatatttgataagttatttatg 42674224  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42674223 tttggatatgtacactaaaaagtactaacataaattgaagtgttt 42674179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Original strand, 46133781 - 46133913
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46133781 ttatataaatgcttatatcattagggcctatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaa 46133880  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  46133881 agtacttacataaattaaagtgtttggatgtga 46133913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43407846 - 43407693
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||     
T  43407846 ggccccgtttggataaacagcttatattgatgcttatagcattagagcttatagcactagagcttacatcataagctcttatactcaataagctatttac 43407747  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  43407746 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataacttgaagtgtttggatgtga 43407693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Original strand, 24791816 - 24791961
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24791816 tggccctgtttggataaacagcttatatagatgtttatggtattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctattta 24791915  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24791916 tgtttggatatgtacact--aaagtacttacataaattgaagtgtttg 24791961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 172 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 934213 - 934106
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  934213 ggccccgtttggataaacagtttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 934114  T
Q  271 ctttggat 278  Q
     |||||||    
T  934113 gtttggat 934106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15656739 - 15656640
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15656739 gcttataacattagagtttacatcataagttcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 15656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Original strand, 16893857 - 16893964
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16893857 gcttataacattagagcttacatcataaactcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 16893956  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  16893957 ggatgtga 16893964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48866327 - 48866185
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  48866327 ccgtttggataaacagcttatataggtgtttatggcattagggtttataatattagagcttacatcataagctcttatatttgataagttatttatgttt 48866228  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48866227 ggatatgtacactaaaaagtacttacataaagtgaagtgtttg 48866185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Original strand, 42964134 - 42964233
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42964134 gcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 42964233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43157406 - 43157299
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43157406 gcttatagcattagagtttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttcgatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgttt 43157307  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  43157306 ggatgtga 43157299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 37004114 - 37004268
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||||||     
T  37004114 ggccccatttggataaacagtttatattgatgcttatagcattagagcttatagcactagagctcacatcataagctcttatactcaataaactatttaa 37004213  T
Q  271 c-tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  37004214 cgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataacttgaagtgtttggatgtga 37004268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8631600 - 8631495
Alignment:
Q  219 ttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttga 318  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8631600 ttatagcattagagcttacaacataagttcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactgaaaagtacttaaataaattgaagtgtttgg 8631501  T
Q  319 atgtga 324  Q
    ||||||    
T  8631500 atgtga 8631495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 323
Target Start/End: Original strand, 15648618 - 15648770
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || || || |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||     
T  15648618 ggccccatttggataaacagcttatattgatgcttatagcagtagagcttatagcactacagcttacatcataagctcttatactcaataagatatttac 15648717  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15648718 gttttgatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtg 15648770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 18120693 - 18120829
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||                 |||||||||||||    
T  18120693 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttatcacattagagcttacatc-----------------ataagctatttat 18120775  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18120776 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 18120829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 323
Target Start/End: Original strand, 36847607 - 36847752
Alignment:
Q  179 tttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgga 277  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| || ||||| |||||||||||| |||| || |  ||||||| ||||| |||| |    
T  36847607 tttggataaacaacttatattgatgcttataacattagagtttatagcactagagcttacatcataagctcttgtattcaataagctctttatgtttgaa 36847706  T
Q  278 tatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  36847707 tatgtacactaaaaagtacttacgtaaattgaagtgtttggatgtg 36847752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 317
Target Start/End: Original strand, 43021090 - 43021190
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43021090 gcttatagcattagggcttacatcataagctcttatacttgataagttatatatgtttggatatgtacactaaaaagtacttccataaattgaagtgttt 43021189  T
Q  317 g 317  Q
    |    
T  43021190 g 43021190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37705396 - 37705341
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37705396 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 37705341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 12100870 - 12100925
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12100870 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtttgcagtttgttac 12100925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 33358790 - 33358845
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33358790 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 33358845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42673946 - 42673891
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  42673946 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtgtacagtttattac 42673891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 33846237 - 33846292
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  33846237 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagcgtgcagtttgttac 33846292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43157437 - 43157393
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattag 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43157437 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattag 43157393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20165485 - 20165379
Alignment:
Q  218 cttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||| || |||   |||||||||||| || ||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  20165485 cttatagcataagagcttacatcataagttcttatatttaataaactttttccatttggatatgtatacgaaaaaataattacataaactgaagtgtttg 20165386  T
Q  318 aatgtga 324  Q
    || ||||    
T  20165385 aacgtga 20165379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 43021059 - 43021109
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggctta 221  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43021059 ggccctgtttggataaacaacttatataaatgcttatagcattagggctta 43021109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 361
Target Start/End: Original strand, 18121051 - 18121088
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatat 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18121051 attagagatgtaaataaacttatcatatatatatatat 18121088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15670078 - 15669925
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15670078 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 15669979  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15669978 gtttggatatgtacactaataagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 15669925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 19912926 - 19913080
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19912926 tggcctcgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagctcttatacttgataagctattta 19913025  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19913026 tgtttggatatgtacactaataagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 19913080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50354512 - 50354359
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  50354512 ggcctcgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttat 50354413  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50354412 gtttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttggatgtga 50354359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Original strand, 6687850 - 6687997
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6687850 tggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctattta 6687949  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6687950 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 6687997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 35490260 - 35490406
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35490260 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 35490359  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35490360 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 35490406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 44784212 - 44784365
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44784212 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattaagacttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 44784311  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44784312 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 44784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 50053593 - 50053746
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50053593 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 50053692  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  50053693 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 50053746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 53408988 - 53408835
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53408988 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 53408889  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53408888 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 53408835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33704730 - 33704580
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33704730 cccgtttggataaacagcttatatagatgcttatatcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 33704631  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33704630 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 33704580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 38070568 - 38070722
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  38070568 tggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataaactcttatacttgataaactattta 38070667  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38070668 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 38070722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Original strand, 2480813 - 2480958
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2480813 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 2480912  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2480913 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 2480958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 15240321 - 15240474
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15240321 ggccccgttcggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggtttataacattagagcttacatcataagttcttaaacttgataagctatttat 15240420  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15240421 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 15240474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 168 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38056131 - 38055974
Alignment:
Q  168 ctttggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38056131 ctttggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttaaagcattagggcttataacattagaacttacatcataagctcttatacttgataagctat 38056032  T
Q  267 ttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38056031 ttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 38055974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 45423893 - 45424046
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45423893 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataaactcttatacttgataagctatttat 45423992  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  45423993 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtatggatgtga 45424046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52140168 - 52140015
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52140168 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattaggtcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 52140069  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52140068 gtttggatatgtacactagaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtga 52140015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 169 - 324
Target Start/End: Original strand, 23702063 - 23702219
Alignment:
Q  169 tttggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23702063 tttggtcccgtttggataaacagtttatatagatgcttatagcattatggcttataatattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatt 23702162  T
Q  268 tatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23702163 tatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttgaatgtga 23702219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 169 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 54190428 - 54190272
Alignment:
Q  169 tttggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54190428 tttggccccgtttggataaacatcttatatagatgtttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatt 54190329  T
Q  268 tatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54190328 tatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 54190272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 27583128 - 27583278
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  27583128 cccgtttggataaaaagcttatataaatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 27583227  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27583228 ttgatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 27583278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 10687635 - 10687788
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10687635 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataccattagagcttaaatcataagctcttatacttgataagctatttat 10687734  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10687735 gtttgtatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtga 10687788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 10901275 - 10901428
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10901275 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataccattagagcttaaatcataagctcttatacttgataagctatttat 10901374  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10901375 gtttgtatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtga 10901428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 317
Target Start/End: Original strand, 43289448 - 43289593
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  43289448 gccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcatcagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatg 43289547  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43289548 tttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 43289593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 168 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47633006 - 47632849
Alignment:
Q  168 ctttggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctat 266  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47633006 ctttggtctcgtttggataaacagcttatataaatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctat 47632907  T
Q  267 ttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47632906 ttatatttggatttgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttgaatgtga 47632849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Original strand, 41852213 - 41852365
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41852213 gccccgtttggataaaaagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacgtcataagctcttatacttgataagctatttatg 41852312  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41852313 tttggatatgtacacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 41852365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 1756249 - 1756395
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1756249 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacaatagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 1756348  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1756349 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 1756395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 28031934 - 28032087
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28031934 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcatccgagcttataacataagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 28032033  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28032034 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 28032087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 53716706 - 53716859
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53716706 ggcctcgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttatcacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttat 53716805  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53716806 gtttggatatatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 53716859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44377448 - 44377294
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa--ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattt 268  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44377448 tggccccatttggataaacaacatta-atagatgcttgtagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctattt 44377350  T
Q  269 atctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44377349 atgtttggatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttggatgtga 44377294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 26088184 - 26088327
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  26088184 cccgtttggataaacaacttatattgatgcttatagcattagaacttataacattaaagtttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 26088283  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26088284 tggatatgtacactaaaaagtacttccataaattgaagtgtttg 26088327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16701675 - 16701526
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||    
T  16701675 ccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagcttttatacttgataagttatttatgttt 16701576  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16701575 agatatgtacatcaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 16701526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 53876441 - 53876309
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53876441 ttatatagatgcttatagcattagagcttataatattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaa 53876342  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53876341 agtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 53876309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30172410 - 30172259
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30172410 ggccccatttggataaacaacttatatagatgcttatagtattagggcttataacattagagcttaaatcataagctcttatacttgataagttatttat 30172311  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgt 322  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30172310 gttttgatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgt 30172259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 324
Target Start/End: Original strand, 40428118 - 40428265
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  40428118 gtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacagtagagcttacatcataagctcttatacttgataatttatttatgtttgg 40428217  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40428218 atatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 40428265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Original strand, 6610744 - 6610890
Alignment:
Q  179 tttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgga 277  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6610744 tttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttatatcataagcttttatacttgataagctatttatgtttgga 6610843  T
Q  278 tatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6610844 tatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtga 6610890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 9595300 - 9595450
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9595300 cccgtttggataaatagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacaatagagcttacattataagttcttatacttgataagttatttatgtt 9595399  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9595400 tgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 9595450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 324
Target Start/End: Original strand, 23775764 - 23775913
Alignment:
Q  174 ccccgtttggataaacaattatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23775764 ccccgtttggataacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtt 23775863  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  23775864 tggatatgt-cactaaaaagtacttacattaattgaagtgtttggatgtga 23775913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28361284 - 28361134
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28361284 cccgtttggataaacagcttatatagatgcttataggattagagcttataatattagagcttacatcataagttcttatatttgataagctatttatatt 28361185  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28361184 tggatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttggatgtga 28361134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50055849 - 50055707
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  50055849 ccgtttggataaatagtttatatagatgcttatgacattagggcttataatattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgttt 50055750  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055749 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 50055707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16704915 - 16704767
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16704915 cgtttggataaacagtttatatagatgcttatagtattagagcttataccattagagcttacatcataagctcttatacttgataagtcatttatgtttg 16704816  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16704815 gatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtga 16704767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53353758 - 53353618
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  53353758 gtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacgtcataagctcttatacttaataacatatttatgtttgg 53353659  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353658 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 53353618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 30423030 - 30423180
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  30423030 cccgtttgaataaccaacttatataaatgcttatagcattagggcttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtt 30423129  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30423130 tggatatgtatactaaaaagtgcttacataaattgaagtgtttggatgtga 30423180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Original strand, 8590096 - 8590245
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  8590096 ccgtttggataaacagtttatatagatgcttatatcattagagcttataatgttagagcttacattataagctcttatacttgataagctatttatgttt 8590195  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  8590196 ggatatgtacactaaaaagtacttacataagttgaagtgtttggatgtga 8590245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 23261220 - 23261360
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23261220 cgtttggataaacagcttatatagatgcttataatattagggtttataacattagagcttacatcataagtttttatatttgataagttatttatgtttg 23261319  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261320 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 23261360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34618058 - 34617913
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  34618058 ggccccgtttggataaacaacttatataaatgct-atagcattatggcttataatattagagcttacatcataagctcttatacttgataaattatttat 34617960  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34617959 gtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 34617913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48910648 - 48910498
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48910648 cccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattatggtttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtt 48910549  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48910548 tgagtatgtatgcaaaaaagtacttatataaattgaagtgtttggatgtga 48910498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31970573 - 31970424
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31970573 ccgtttggataaacagtttatattgatgcttataacactagtgcttataacattagagcttatatcataatctcttatacttgataagttatttatgttt 31970474  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31970473 ggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 31970424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48748775 - 48748645
Alignment:
Q  193 tatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaa 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48748775 tatataga-gcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataaactcttatatttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaa 48748677  T
Q  293 gtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48748676 atacttacataaattgaagtgtttggatgtga 48748645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Original strand, 44378592 - 44378724
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44378592 ttatatagatgcttatgacattaagacttataatattagagattacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttgaatatgtacactaaaa 44378691  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44378692 agtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 44378724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 54413419 - 54413311
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54413419 gcttatgacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 54413320  T
Q  317 gaatgtgat 325  Q
    | |||||||    
T  54413319 ggatgtgat 54413311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20877832 - 20877696
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||            ||||||||||| ||||    
T  20877832 cgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagagcttacatcataagat------------aagctatttatgtttg 20877745  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20877744 gatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 20877696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1617823 - 1617709
Alignment:
Q  210 cattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattga 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1617823 cattaaggcttataacattagagcttacataataaactcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaaagtacttacataaattga 1617724  T
Q  310 agtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| ||||||    
T  1617723 agtgtttggatgtga 1617709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33705057 - 33704933
Alignment:
Q  200 atgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtactta 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33705057 atgcttatagctttagggtttataacattagagcttacatcataaattcttatatttgataagctatttatgtttggatatgta-tctaaaaagtactta 33704959  T
Q  300 tataaattgaagtgtttgaatgtgat 325  Q
     ||||||||||||||| | |||||||    
T  33704958 cataaattgaagtgttcggatgtgat 33704933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 316
Target Start/End: Original strand, 44547160 - 44547303
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||     
T  44547160 gccctgtttggataaacaacttatattgatgcttat-gcattagaacttatagcagtagagcttacatcataagctcttatgctcaataagctctttatg 44547258  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44547259 tttggatatgtacactaaaaagtacttatgtaaattgaagtgttt 44547303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 317
Target Start/End: Original strand, 19164045 - 19164144
Alignment:
Q  218 cttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19164045 cttataacattagagcttacatcataaactcttatatttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 19164144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 324
Target Start/End: Original strand, 27535462 - 27535552
Alignment:
Q  234 ttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27535462 ttacatcataagttcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 27535552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Original strand, 40679525 - 40679667
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||    
T  40679525 ccgtttggataaccagtttatataaatgcttataatattagagcttataacattagagcttatatcataagcttttatacttaataagttatttatgttt 40679624  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  40679625 ggatatgtacactaaaaagtatttacataaattaaagtgtttg 40679667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Original strand, 37968255 - 37968359
Alignment:
Q  213 tagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagt 312  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  37968255 tagggcttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataaacaatttatgtttggatatgtacactaaaaagtactttcataaattgaaat 37968354  T
Q  313 gtttg 317  Q
    |||||    
T  37968355 gtttg 37968359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 317
Target Start/End: Original strand, 27488186 - 27488276
Alignment:
Q  225 cattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27488186 cattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacact--aaagtacttaaataaattgaagtgtttg 27488276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Original strand, 51780305 - 51780403
Alignment:
Q  219 ttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51780305 ttatagcattagagcttatatcataagctcttatatttgataagctctttatgtttggatatgtgtattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 51780403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14988658 - 14988525
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||               ||||||     ||||||||||||    
T  14988658 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagag---------------cttata-----taagctatttat 14988579  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14988578 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaatcgaagtgtttggatgtga 14988525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 324
Target Start/End: Original strand, 8931555 - 8931632
Alignment:
Q  247 tcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  8931555 tcttctacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaggtacttacctaaattgaagtgtttggatgtga 8931632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33704337 - 33704282
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33704337 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 33704282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Original strand, 27531963 - 27532025
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttac 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27531963 ccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttac 27532025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 44378912 - 44378966
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgtta 378  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44378912 attagaggtgtaaataaacttaccatatatatagatattagtatacagtttgtta 44378966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 46035874 - 46035728
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| | ||||   |  |||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||   ||| |    
T  46035874 gtttggataaacaacttacacacatgcttatagcattagagtttattgaacaagaacttacatcataagctcttatactcaataagcttttttcgtttag 46035775  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46035774 ataagtacattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaatgtg 46035728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14988290 - 14988235
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14988290 attagaggtgtaaataaacatatcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 14988235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 23261584 - 23261639
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  23261584 attagaggtgtaaataaacttatcatatatataaatattagtgtacagtttgttac 23261639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 23268744 - 23268799
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  23268744 attagaggtgtaaataaacttatcatatatataaatattagtgtacagtttgttac 23268799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54190040 - 54189985
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54190040 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 54189985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31970200 - 31970145
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31970200 attagagatgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 31970145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 45424249 - 45424304
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45424249 attagaggtgtaaataaatttatcatatatatagaaattagtgtacagtttgttac 45424304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Original strand, 46256637 - 46256727
Alignment:
Q  234 ttacatcataagatcttatacttgataagctatttatct-ttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||   | ||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46256637 ttacatcataagctcttatactcaataagcttttttcgtgttggataagtacattaaaaagtacttacacaaattgaagtgtttgaatgtg 46256727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54413116 - 54413066
Alignment:
Q  329 aggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54413116 aggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 54413066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 19164667 - 19164722
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  19164667 attagaggtgtagataaacttaccatatatatagatattagtgtacaatttgttac 19164722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16701277 - 16701236
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  16701277 taaacttatcatatatatagatattagtgtacaatttgttac 16701236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 19913327 - 19913368
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  19913327 taaacttatcatatatatagatattagtgtacaatttgttac 19913368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 55344394 - 55344435
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  55344394 taaacttgtcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 55344435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Original strand, 15240722 - 15240762
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgtta 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  15240722 taaacttatcatatatatagatattagtgtacaatttgtta 15240762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15669679 - 15669639
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgtta 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  15669679 taaacttatcatatatatagatattagtgtacaatttgtta 15669639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Original strand, 27535810 - 27535850
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgtta 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27535810 taaacttaccatatatatagatattagtgtacagtttgtta 27535850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44377060 - 44377028
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatata 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44377060 attagaggtgtaaataaacttaccatatatata 44377028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34701123 - 34700970
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34701123 ggcctcgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 34701024  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34701023 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaatgtga 34700970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38934838 - 38934685
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38934838 ggccctgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 38934739  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38934738 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 38934685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44689719 - 44689569
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  44689719 cccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagccttagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 44689620  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44689619 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 44689569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8043574 - 8043421
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8043574 ggccctgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 8043475  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8043474 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 8043421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15521540 - 15521387
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15521540 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 15521441  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15521440 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 15521387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16355418 - 16355265
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16355418 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattatagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 16355319  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  16355318 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttggatgtga 16355265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 29784202 - 29784356
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29784202 tggccccgtttggataaacagcttatatagatgtttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagttcttatacttgataagctattta 29784301  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29784302 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 29784356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22175498 - 22175345
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22175498 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataaactcttatacttgataagctatttat 22175399  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22175398 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 22175345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50529826 - 50529673
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50529826 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcacaagctcttatacttgataagctatttat 50529727  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  50529726 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 50529673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32360219 - 32360071
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32360219 cgtttggataaacagcttatatagatgtttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttg 32360120  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32360119 gatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 32360071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20700028 - 20699875
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20700028 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagctgacatcataagctcttatacttgataagctatttat 20699929  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20699928 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 20699875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 25493724 - 25493877
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25493724 ggcctcgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattatgacttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttat 25493823  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25493824 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 25493877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26000241 - 26000088
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26000241 ggccccgtttggataaacattttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatatttgataagctatttat 26000142  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26000141 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 26000088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 37697429 - 37697582
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37697429 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttatgacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 37697528  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37697529 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 37697582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 42307230 - 42307383
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42307230 ggccccgtttggataaacatcttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagttatttat 42307329  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42307330 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 42307383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53029008 - 53028868
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53029008 gtttggataaacaacttatatagatgtttatagcattagggcttataacattagagtttacgtcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgg 53028909  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53028908 atatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 53028868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38856797 - 38856651
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38856797 ggcccagtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacaatagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 38856698  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38856697 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 38856651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 15517922 - 15518075
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15517922 ggccccgtttggataaacagcttatataggtgcttataccattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttat 15518021  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  15518022 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttggatgtga 15518075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32245082 - 32244929
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32245082 ggccccgtttggataaacagcttatatagatacttatagcattagggtttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 32244983  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32244982 gttcggatatgtacattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 32244929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 316
Target Start/End: Original strand, 44608809 - 44608953
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  44608809 gccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagaacttataatattagagcttacatcataaactcttatacttgataagctatttatg 44608908  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44608909 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 44608953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Original strand, 46451650 - 46451790
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46451650 gtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacatcagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgg 46451749  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46451750 atatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 46451790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29785856 - 29785703
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29785856 ggccctgtttggataaacaacttatctagatgcttatagcattaaggcttataacattagatcttacatcataagctcttatacttgataaactatttat 29785757  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29785756 gcttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 29785703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 320
Target Start/End: Original strand, 48924518 - 48924667
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaaca-attatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48924518 ggcccagtttggataaacagattatatagatgcttatgacattagggcttataacattagagctcacatcataagctcttatacttgataaactatttat 48924617  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaat 320  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48924618 ggttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaat 48924667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35227240 - 35227098
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  35227240 ccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttt 35227141  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |  |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35227140 gactatgtatacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 35227098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 54869373 - 54869523
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||    
T  54869373 cccgtttggataaacagtttatataggtgcttataccattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagttatttacgtt 54869472  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  54869473 tggatatgtacactaaaaagtacttacataacttgaagtgtttggatgtga 54869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 42103546 - 42103696
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42103546 ggcctcgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattatggcttataaca---gagcttatatcataagctcttatatttgataagctatttat 42103642  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42103643 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 42103696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 50528135 - 50528250
Alignment:
Q  202 gcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttata 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50528135 gcttatagcattatggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttaagtttggatatgtacactaaaaagtacttaca 50528234  T
Q  302 taaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  50528235 taaattgaagtgtttg 50528250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26123558 - 26123412
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26123558 cgtttagataaacaacttatgtagatgcttataacattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttg 26123459  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgt 322  Q
     |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26123458 aatatatgcactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgt 26123412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13697609 - 13697456
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13697609 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttataacattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttat 13697510  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||| || || || || ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13697509 gtttagacatatatacaaaaaattacttacataaattgaagtgtttggatgtga 13697456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21581941 - 21581788
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21581941 ggccccgtttggataaacagcttatatagatacttatagcattagtgcttataatattagagcttatatcataaactcttatacttgataagttatttat 21581842  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21581841 gtttggatgtatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 21581788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 49129968 - 49129820
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||  ||||    
T  49129968 cgtttggataaacagcttatattgatgcttatagcattagagcttatagcactagagcttacatcataagctcttatattcaataagctatttacgtttg 49129869  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  49129868 gatatgtacactaaaaagtacttacataacttgaagtgtttggatgtga 49129820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Original strand, 20841705 - 20841812
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20841705 gcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 20841804  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  20841805 ggatgtga 20841812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 324
Target Start/End: Original strand, 54533375 - 54533472
Alignment:
Q  227 ttagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54533375 ttagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 54533472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Original strand, 24835383 - 24835490
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  24835383 gcttataacattagggcttatattataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaagataattacataaattgaagtgttt 24835482  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  24835483 ggatgtga 24835490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29446410 - 29446268
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |      ||| ||      || | ||||||||||||||||||||||    
T  29446410 tggcctcgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttatca------agtata------aatagcttatacttgataagctattta 29446323  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29446322 tgtttggatatatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 29446268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 12116970 - 12117106
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||                 |||||||||    
T  12116970 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataa-----------------gctatttat 12117052  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12117053 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 12117106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52922317 - 52922216
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52922317 gcttatagcattagagcttacattataagctcttatactcaataagctctttatgtttgaatatgtacgctaaaaagtacttacgtaaattgaagtgttt 52922218  T
Q  317 ga 318  Q
    ||    
T  52922217 ga 52922216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 20842042 - 20842097
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20842042 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 20842097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 12117352 - 12117407
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12117352 attagaggtgtaaataaacatatcatacatatagatattagtgtgcagtttgttac 12117407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21581530 - 21581475
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21581530 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 21581475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25999880 - 25999825
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25999880 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 25999825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 42307603 - 42307658
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42307603 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 42307658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 323
Target Start/End: Original strand, 36787513 - 36787578
Alignment:
Q  258 ataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  36787513 ataagctatttacgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacgtaaattgaagtgtttggatgtg 36787578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 37697845 - 37697900
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  37697845 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagcgtgcagtttgttac 37697900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2895693 - 2895657
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagata 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895693 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagata 2895657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 361
Target Start/End: Original strand, 22174617 - 22174654
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22174617 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatatatat 22174654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29624772 - 29624624
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    |||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||| ||||||   || |||| || ||| | ||| |||| ||||  ||||||| ||||  ||    
T  29624772 cccgtttggataaataacttatacatatgcttgtagcattagagcttatgt-ataagagcttgcattagaagctcttgtactcaataagctttttacatt 29624674  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  29624673 tggataagtacacttaaaagtacttacagaaattgaaatgtttggatgtg 29624624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50529422 - 50529385
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50529422 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatatatat 50529385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35643681 - 35643646
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagat 359  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35643681 attagaggtgtaaataaacttaccatatatatagat 35643646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 15519849 - 15519890
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  15519849 taaacttatcatatatatagatattaatgtacagtttgttac 15519890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 24835355 - 24835404
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttata 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24835355 cccgtttggataaacagcttatataaatgcttataacattagggcttata 24835404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 36787444 - 36787509
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttac 237  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  36787444 gccccgtttgaataaacagcttatattgatgcttatagcattagagcttatagcactagagcttac 36787509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 3872476 - 3872629
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3872476 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 3872575  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3872576 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 3872629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5734290 - 5734140
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  5734290 cccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 5734191  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5734190 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 5734140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 851804 - 851651
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  851804 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 851705  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  851704 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgatgtgtttggatgtga 851651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 33905284 - 33905437
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33905284 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 33905383  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33905384 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 33905437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 18806112 - 18806266
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18806112 tggccctgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattaaagcttacatcataagctcttatacttgataagctattta 18806211  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18806212 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 18806266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 1481269 - 1481415
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1481269 ggccccgtttggataaacaacttatatagattcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaggtatttat 1481368  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1481369 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 1481415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 31516566 - 31516716
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31516566 cccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattaggacttattacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 31516665  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31516666 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 31516716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 30265978 - 30266124
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30265978 ggccccgtttggacaaacaacttatatatttacttatagcattagagcttataacattagagtttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 30266077  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30266078 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 30266124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 317
Target Start/End: Original strand, 16588296 - 16588421
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16588296 ttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaa 16588395  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  16588396 agtacttacataaattgaagtgtttg 16588421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 26322516 - 26322669
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26322516 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttataggattagggcttataacattatagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttaa 26322615  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26322616 gtttggatatgtacactaaaaactacttacataaattgaagtgtttggatgtga 26322669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 169 - 324
Target Start/End: Original strand, 19383343 - 19383499
Alignment:
Q  169 tttggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatt 267  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19383343 tttggccctgtttggataaacaacttatatggatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcctatacttgataagctatt 19383442  T
Q  268 tatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  19383443 tatatttggatttgtacactaaaaagtacttacagaaattgaattgtttgaatgtga 19383499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 6174322 - 6174475
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6174322 ggccccgtttggataaatagtttatatagatgcttatagtattagggtttatagaattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 6174421  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6174422 gtttggatatgtacactaaaaagtaattacataaattgaagtgtttggatgtga 6174475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Original strand, 16065740 - 16065888
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16065740 cgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattacaacttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttg 16065839  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16065840 aatatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtga 16065888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 28323012 - 28323152
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28323012 cgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagggcttatatcataagctcttatacttaataagctatttatgtttg 28323111  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28323112 gatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 28323152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42938687 - 42938537
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  42938687 cccgtttggataaatagcttatatagatgcttatagcattagaacttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 42938588  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtgat 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  42938587 tggatatgtacact-aaaagtacttacatatattgaagtgtttggatgtgat 42938537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1110191 - 1110038
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1110191 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttataacatcagggcttataacattagagcttacattataagctcttgtacttgataagctatttat 1110092  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  1110091 gtttggatatgtatactaaagagtacttacataaattgaagcgtttggatgtga 1110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1679448 - 1679298
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||    
T  1679448 cccgtttggataaacatcttatatagatgtttatagcattagggtttataacattagagcttacatcataagctctcatactttataagctatatatgtt 1679349  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  1679348 tggatatgtacattaaaaagtacctacataaattgaagtgtttggatgtga 1679298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Original strand, 44946960 - 44947109
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  44946960 ccgtttggataaacagtttatatagatgtttatagcattaaggcttataatattagagcttacatcataagctcttatatttgataagttatttatgttt 44947059  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  44947060 ggatatgtacacaaaaaagtacttccataaattgaagtgtttggatgtga 44947109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Original strand, 30419450 - 30419557
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30419450 gcttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgttt 30419549  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  30419550 ggatgtga 30419557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Original strand, 4231685 - 4231792
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4231685 gcttatatcattagagcttacatcataagcccttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 4231784  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  4231785 ggatgtga 4231792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Original strand, 2178161 - 2178266
Alignment:
Q  219 ttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttga 318  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2178161 ttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgcacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgg 2178260  T
Q  319 atgtga 324  Q
    ||||||    
T  2178261 atgtga 2178266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39636217 - 39636110
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39636217 gcttatagcattagagcttatatcataagttcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaaatgttt 39636118  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  39636117 ggatgtga 39636110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4016898 - 4016791
Alignment:
Q  210 cattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattga 309  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4016898 cattagagcttataacattagagcttacatcataagttcttgtacttgataagttatttatgtttgaatatgtacactaaaaaatacttacataaattga 4016799  T
Q  310 agtgtttg 317  Q
    ||||||||    
T  4016798 agtgtttg 4016791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Original strand, 42445088 - 42445233
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||| ||||  |||||    
T  42445088 gtttggataaacagcttatattgatgtttatagcattagagcttataacactagagtttacattataagctcttaaattcaataagctctttaagtttgg 42445187  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgt 322  Q
    || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  42445188 atgtgtacactaaaaaatacttacgtaaattgaagtgtttggatgt 42445233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3587149 - 3587043
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  3587149 gcttatagcactagagcttacatcataagctcttattctcaataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtatttatgtaaattaaaatgttt 3587050  T
Q  317 gaatgtg 323  Q
    |||||||    
T  3587049 gaatgtg 3587043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 323
Target Start/End: Original strand, 12516397 - 12516549
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||   ||| ||||  ||||||| |||      
T  12516397 ggccccttttggataaacagcttatacaaatgcttatagcattagagcttataacatgagagcttatatcataattgcttgtactcaataagcttttttc 12516496  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
     ||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  12516497 gtttggatgtttacactaataagtacctacataaattgaagtgtttggatgtg 12516549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 2178474 - 2178529
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2178474 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 2178529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39463916 - 39463770
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| | ||| |||| ||||  ||||| | ||||     
T  39463916 ggccccgtttggataaacaggttatacatatgcttgtagcattagagcttattgcataagagcttacattagaagctcttgtactcaataagatttttac 39463817  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39463816 gtttggataagtacacttaaaagtacttacacaaattgaagtgtttg 39463770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 322
Target Start/End: Original strand, 11707762 - 11707866
Alignment:
Q  218 cttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||    
T  11707762 cttatagcattagagcttacatcataagctctaatacttaataagctacttacgtttggacatgtacactaaaaagtatttgcatgaattaaagtgtttg 11707861  T
Q  318 aatgt 322  Q
     ||||    
T  11707862 gatgt 11707866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Original strand, 22100245 - 22100344
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22100245 gcttatagaattagagcttacattataagttcttatactcaataagttctttatgtttggatatgtacgctaaaaagtacttacgtaaaatgaagtgttt 22100344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4016538 - 4016486
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4016538 attagaggtgtaaataaacttaccatatatatagatattagtgtacagtttgt 4016486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 30270393 - 30270448
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30270393 attagaagtgtaaataaacttaccatatatatagatattagtgtacagtttgttac 30270448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39635920 - 39635879
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39635920 attagaggtgtaaataaacttaccatatatatagatattagt 39635879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 221
Target Start/End: Original strand, 19900662 - 19900708
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggctta 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19900662 ccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagagctta 19900708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 261
Target Start/End: Original strand, 19900689 - 19900733
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataa 261  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19900689 gcttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataa 19900733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 363
Target Start/End: Original strand, 1481727 - 1481766
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatatta 363  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1481727 attagaggtgtaaataaacttaccatatatatagttatta 1481766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Original strand, 45111589 - 45111682
Alignment:
Q  229 agagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||  |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  45111589 agagcttacatcataagctcttatactaaataaggtttttacgtttgaatatgtacac-aaaaaatacttaaataaattaaagtatttggatgtg 45111682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5733895 - 5733854
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  5733895 taaacttatcatatatatagatattagtgtacaatttgttac 5733854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 361
Target Start/End: Original strand, 31516913 - 31516950
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatat 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31516913 attagagatgtaaataaacttatcatatatatatatat 31516950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12517444 - 12517392
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaaca-attatatagatgcttatagcattagggcttat 222  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  12517444 tggccccgtttggataaacagcttatacaaatgcttatagcattagagcttat 12517392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18614435 - 18614282
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18614435 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 18614336  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18614335 atttggatatgtacactgaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 18614282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20727499 - 20727353
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20727499 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 20727400  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20727399 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 20727353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10551092 - 10550939
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10551092 ggcctcgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 10550993  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10550992 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 10550939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 16306470 - 16306623
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16306470 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatactagataagctatttat 16306569  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16306570 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 16306623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 3346837 - 3346990
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3346837 ggccacgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggtttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 3346936  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3346937 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 3346990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 53798 - 53645
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53798 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttatgacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 53699  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53698 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 53645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30692735 - 30692582
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30692735 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttaaaacattagtgcttataacatcagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 30692636  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30692635 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 30692582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Original strand, 3955122 - 3955270
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3955122 cgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataagctctcatacttgataagctatttatgtttg 3955221  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3955222 gatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 3955270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 26703656 - 26703802
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26703656 ggccccgtttggataaacagcttatataggtgcttatagcattagtgcttataacattagagcttatatgataagctcttatacttgataagctatttat 26703755  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26703756 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 26703802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9460503 - 9460350
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9460503 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgtttatagcatcagagcttataatattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 9460404  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9460403 gtttggatatttacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 9460350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2838450 - 2838299
Alignment:
Q  174 ccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatct 272  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2838450 ccccgtttggataaacagcttatatagatgtttatagcattagtgtttataacattagaacttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgt 2838351  T
Q  273 ttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2838350 ttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 2838299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 23073666 - 23073809
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23073666 cccgttaggataaacaacttatatagatgcttataacattagagtttataacattagagtttatatcataagctcttatacttgataaactatttatgtt 23073765  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23073766 tggatatatacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttg 23073809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21894214 - 21894092
Alignment:
Q  202 gcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttata 301  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21894214 gcttatagcattaggatttataacattagagcttacatcataagctcttatactttataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaaagtacttaca 21894115  T
Q  302 taaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  21894114 taaattgaagtgtttggatgtga 21894092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33465255 - 33465106
Alignment:
Q  169 tttggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatt 267  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33465255 tttggccccgtttgaataaacaacttatatagatgcttatagcattagaacttataacattagagcttacatcataaactcttatacttgataagctatt 33465156  T
Q  268 tatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||| |       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33465155 tatgt-------tgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtga 33465106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Original strand, 17260391 - 17260527
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17260391 ttataaagatgcttatagaattagagcttataccattagagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaa 17260490  T
Q  292 agtacttatataaatt----gaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| |||||||    |||||||||| ||||||    
T  17260491 agtacttaaataaattaattgaagtgtttggatgtga 17260527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Original strand, 6085970 - 6086077
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6085970 gcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttaataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 6086069  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  6086070 ggatgtga 6086077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 26946374 - 26946516
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || | ||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||    
T  26946374 cccgtttggataaacagcttatattgatacttatagcattagagcttatagcact-gagcttatatcataagctcttatactcaataagctatttacgtt 26946472  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26946473 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 26946516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 213 - 324
Target Start/End: Original strand, 30692736 - 30692847
Alignment:
Q  213 tagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagt 312  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30692736 taggacttataacattagagcttacatcataagcttttatacttgataagttatttacgtttggatatgtacacaaaaaagtacttacataaattgaagt 30692835  T
Q  313 gtttgaatgtga 324  Q
    ||||| ||||||    
T  30692836 gtttggatgtga 30692847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35198977 - 35198870
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35198977 gcttataatattatagcttacatcataagctctcatacttgataagctatttatatttggatatgtacattaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 35198878  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  35198877 ggatgtga 35198870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34887180 - 34887100
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatctt 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  34887180 tggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacaccataagctctt 34887100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 6086310 - 6086365
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6086310 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 6086365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 26704046 - 26704101
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26704046 attagaggtgtaaataaacatatcatatatatatatattagtgtgcagtttgttac 26704101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 319
Target Start/End: Original strand, 29734178 - 29734257
Alignment:
Q  240 cataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaa 319  Q
    |||||| |||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29734178 cataagctcttatactcaataaactttttatgtttgaatatgtacattaaaaagtacttatataaattgaaatgtttgaa 29734257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12835903 - 12835754
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaattatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||  || |||| ||| ||||||||  ||||||||  ||| | | ||||      
T  12835903 ggccccgtttggataaaca-ttatacagatgcttataacattagagtttatagtatcagagcttatatcataagtgcttatactcaatatgttttttacg 12835805  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgt 322  Q
    ||||||| | ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12835804 tttggatgtttatgttaataagtacttatataaattgaagtgtttggatgt 12835754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2838044 - 2837989
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  2838044 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagttttttac 2837989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30692348 - 30692293
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30692348 attagagatgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 30692293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 53398 - 53345
Alignment:
Q  325 ttagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgtta 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  53398 ttagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagcgtgcagtttgtta 53345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 3955481 - 3955536
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  3955481 attagagctgtaaataaacatatcatatatattgatattggtgtgcagtttgttac 3955536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10550715 - 10550658
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttat--catatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  10550715 attagaggtgtaaataaacttatcacatatatatagatattagtgtacaatttgttac 10550658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34887091 - 34887050
Alignment:
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34887091 gatacgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 34887050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 30691805 - 30691852
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggc 218  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30691805 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagggc 30691852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Original strand, 23075785 - 23075826
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23075785 attaaaggtgtaaataaacttaccatatatataaatattagt 23075826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 1168710 - 1168863
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1168710 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttataacattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 1168809  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1168810 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 1168863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17592580 - 17592427
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17592580 ggccctgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 17592481  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17592480 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 17592427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 17586687 - 17586840
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17586687 ggccccatttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 17586786  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17586787 gtttggatatgcacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 17586840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 42369641 - 42369794
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42369641 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 42369740  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  42369741 atttggatatgtacactgaaaagtacttgcataaattgaagtgtttggatgtga 42369794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38830018 - 38829865
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38830018 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagagcttataccattagagtttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 38829919  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38829918 gtttagatatgtacactgaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtga 38829865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26664051 - 26663903
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26664051 cgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattaggacttataacattagagcttacatcataaattcttatacttgataagctatttatgtttg 26663952  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26663951 gatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 26663903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 172 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40093394 - 40093243
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40093394 ggccccgtttggataaacaacttatatagatacttatagcattggagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 40093295  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgt 322  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40093294 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgt 40093243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 1940246 - 1940391
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1940246 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatgacattagggcttataacattagagtttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 1940345  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1940346 gtttggatatgtacact-aaaagtacttacataaattgaagtgtttg 1940391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 8078948 - 8079102
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8078948 tggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactattta 8079047  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  8079048 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataagttgaagtgtttggatgtga 8079102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29079392 - 29079242
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  29079392 cccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 29079293  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29079292 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 29079242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52697552 - 52697398
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52697552 tggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagttcttatacttgataagttattta 52697453  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52697452 tgtttggatatatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 52697398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 325
Target Start/End: Original strand, 969851 - 970003
Alignment:
Q  174 ccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatct 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  969851 ccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagtgtttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgt 969950  T
Q  273 ttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtgat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  969951 ttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgat 970003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33511169 - 33511023
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33511169 ggccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 33511070  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33511069 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttg 33511023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43906439 - 43906293
Alignment:
Q  179 tttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgga 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43906439 tttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattaaagattacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgga 43906340  T
Q  278 tatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43906339 tatgtacacaaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtga 43906293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1171411 - 1171258
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1171411 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattatagcttataacattaaagcttacatcatgagctcttatacttgataagctatttat 1171312  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  1171311 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataagttgaagtgtttggatgtga 1171258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23323527 - 23323374
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  23323527 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattaaagcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttaa 23323428  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23323427 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 23323374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25898133 - 25897980
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25898133 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgtttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 25898034  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25898033 gtttggatatgtagactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 25897980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 39259698 - 39259851
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39259698 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttataacattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagttatttat 39259797  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39259798 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 39259851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 51358672 - 51358825
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51358672 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagttcttatatttgataagctatttat 51358771  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  51358772 gtttggatatgcacactaaaaagtacttacataaattgaagtatttggatgtga 51358825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Original strand, 26579508 - 26579660
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  26579508 gccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggtttataatattagagcttacatcataagcttttatacttgataagctatttatg 26579607  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  26579608 tttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaaatgtttggatgtga 26579660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6766330 - 6766177
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6766330 ggccccgtttgaataaacaatttatatagatgcttatagcattagggcttataacattatagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttat 6766231  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||    
T  6766230 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacactaattgaagtatttggatgtga 6766177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Original strand, 41927793 - 41927942
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||    
T  41927793 ccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagtattatagcttataacattagagtttacatcataagtttttatacttgataagttatttatgttt 41927892  T
Q  275 ggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41927893 ggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 41927942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 52752514 - 52752667
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52752514 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttataatattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagttatttat 52752613  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52752614 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 52752667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2348605 - 2348473
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2348605 ttatgtagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatggttggatatgtacactaaaa 2348506  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2348505 agtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 2348473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8121754 - 8121606
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  8121754 cgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattaaggcttataacattagagcttacatcataagttcttatatttgataaactatttatgtttg 8121655  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8121654 gatatgtacactaaaaagtacctacataaattgaagtgtttggatgtga 8121606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15718577 - 15718432
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15718577 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttataacattatggcttataacattagagcttacatcataagttcttatacttgataagctatttat 15718478  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15718477 gtttggatatatacacaaaaaagtacttacataaattaaagtgttt 15718432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40150247 - 40150104
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatcttt 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  40150247 ccgtttggataaacaacttatataaatgcttataatattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttt 40150148  T
Q  275 ggatatgtacac-taaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40150147 ggatatgtacacaaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 40150104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 317
Target Start/End: Original strand, 15553672 - 15553797
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15553672 ttatatagatgcttatgatattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgaatatgtacactaaaa 15553771  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  15553772 agtacttacataaattgaagtgtttg 15553797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20097581 - 20097428
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20097581 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttataacattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatactttataagttatttat 20097482  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  20097481 gtttggatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtttttggatgtga 20097428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5216243 - 5216119
Alignment:
Q  200 atgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtactta 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5216243 atgcttatggcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaggtatttatgtttggatatgtacaccaaaaagtactta 5216144  T
Q  300 tataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||||||||||||| ||||||    
T  5216143 cataaattgaagtgtttggatgtga 5216119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 23318849 - 23318995
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||    
T  23318849 ggccccgttttgataaacaatttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagttcattat 23318948  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23318949 gtttggatatgtgtattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 23318995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7146556 - 7146401
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7146556 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagtattagggcttataacattggagctttcatcataagctcttatacttaataagctatttat 7146457  T
Q  271 ctttggatatg--tacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7146456 gtttggatatgtatacaaaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 7146401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 325
Target Start/End: Original strand, 13995978 - 13996086
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13995978 gcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 13996077  T
Q  317 gaatgtgat 325  Q
    | |||||||    
T  13996078 ggatgtgat 13996086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 325
Target Start/End: Original strand, 14004092 - 14004200
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14004092 gcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 14004191  T
Q  317 gaatgtgat 325  Q
    | |||||||    
T  14004192 ggatgtgat 14004200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16053012 - 16052905
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16053012 gcttataacattatagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 16052913  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  16052912 ggatgtga 16052905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15203800 - 15203696
Alignment:
Q  219 ttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttga 318  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15203800 ttatagcattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgg 15203701  T
Q  319 atgtg 323  Q
    |||||    
T  15203700 atgtg 15203696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29699698 - 29699578
Alignment:
Q  204 ttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatata 303  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29699698 ttatagcattagagcatatatcattagagcttacatcataagcttttatacttgataagctattcatgtttggatatgtacactaaaaagtacttaaata 29699599  T
Q  304 aattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  29699598 aattgaagtgtttggatgtga 29699578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 172 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38172659 - 38172551
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38172659 ggccccgtttggataaacatcttatatagatgcttatagcattagggtttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttat 38172560  T
Q  271 ctttggata 279  Q
     ||||||||    
T  38172559 gtttggata 38172551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 46410123 - 46410022
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  46410123 gcttatagcattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacatacataaattgaagtgttt 46410024  T
Q  317 ga 318  Q
    ||    
T  46410023 ga 46410022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29288966 - 29288861
Alignment:
Q  219 ttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttga 318  Q
    ||||| |||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29288966 ttatagcattagtgcttatattataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgg 29288867  T
Q  319 atgtga 324  Q
    ||||||    
T  29288866 atgtga 29288861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 46761861 - 46761765
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46761861 cccgtttggataaacagtttatatagatgtttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 46761765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32672517 - 32672410
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32672517 gcttatagcattagagcttataccataagctcttatacttgataagctatttatatttggatatgtacattgaaaagtacttaaataaattgaagtgttt 32672418  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  32672417 ggatgtga 32672410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52088477 - 52088369
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatactt-gataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  52088477 gcttataacattagagtttacatcataagttcttatactttgataaactttttatgtttagatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgta 52088378  T
Q  316 tgaatgtga 324  Q
    || ||||||    
T  52088377 tggatgtga 52088369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5678617 - 5678495
Alignment:
Q  200 atgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtactta 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||    
T  5678617 atgcttatagcattagagcttataa-actagaacttacatcataagctcttatactcaataagttctttatatttggatatgtatgctaaaaagtattta 5678519  T
Q  300 tataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  5678518 cataaattgaagtgtttgaatgtg 5678495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 241 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12683456 - 12683375
Alignment:
Q  241 ataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgt 322  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12683456 ataagctcttatatttgataagctatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgt 12683375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2474410 - 2474329
Alignment:
Q  242 taagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  2474410 taagttcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacaccaaaaagtacttacat-aattgaagtgtttggatgtga 2474329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23499239 - 23499165
Alignment:
Q  250 tatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  23499239 tatacttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttagataaattgaaatgtttggatgtga 23499165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2478512 - 2478437
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataaga 246  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2478512 ggccctgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattaaggcttatagcattagagcttacatcataaga 2478437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Original strand, 5216249 - 5216338
Alignment:
Q  234 ttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  5216249 ttacatcataagctcttatactcaataagctctttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacgtaaattgaagtatttggatgtg 5216338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 316
Target Start/End: Original strand, 22887391 - 22887537
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtt----tacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||| || |    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  22887391 ccgtttggataaataatttatatagatgtttatagtattatgacttataatattaaagctagagtacatcataagctcttgtatttgataagctatttat 22887490  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaa-ttgaagtgttt 316  Q
     |||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22887491 gtttgaatattttcactaaaaagtacttacataaatttgaagtgttt 22887537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46761463 - 46761408
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  46761463 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 46761408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25897765 - 25897710
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25897765 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 25897710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29079012 - 29078957
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29079012 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 29078957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29288619 - 29288564
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29288619 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 29288564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 39260060 - 39260115
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39260060 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtttgcagtttgttac 39260115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 52752878 - 52752933
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  52752878 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 52752933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 49146826 - 49146766
Alignment:
Q  265 atttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtgat 325  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  49146826 atttatgtttggatatgtacattaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgat 49146766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38172306 - 38172265
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagt 365  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38172306 attagaagtgtaaataaacttatcatatatatagatattagt 38172265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46410154 - 46410110
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattag 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46410154 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattag 46410110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 970247 - 970302
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  970247 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcaaattgttac 970302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23498962 - 23498907
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  23498962 attagaggtgtaaataaacttaccgtatatatagatattagtgtacactttgttac 23498907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32672546 - 32672504
Alignment:
Q  174 ccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattag 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32672546 ccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattag 32672504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12683506 - 12683453
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataa 224  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12683506 ggccccgtttggataaacagtttatataaatgcttataacattagggcttataa 12683453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29699790 - 29699747
Alignment:
Q  203 cttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataaga 246  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29699790 cttatagcattagagcttatatcattagagcttacatcataaga 29699747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8121360 - 8121311
Alignment:
Q  330 ggtgtaaataaacttatcatata--tatagatattagtatgcagtttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  8121360 ggtgtaaataaacttatcatatatatatagatattagtgtacagtttgtt 8121311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36523999 - 36523905
Alignment:
Q  229 agagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtg 323  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||  | ||||| | |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36523999 agagcttatatcataagtgcttatattcgataagctttttacttatggatgtttacacttataagtacttacataaattgaagtgtttggatgtg 36523905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23499301 - 23499252
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataac 225  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23499301 cgtttggataaacagtttatatagatgcttataacattagagcttataac 23499252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 41928214 - 41928255
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41928214 taaacttaccatatatatagatattagtgtacagtttgttac 41928255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 222 - 69
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  222 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagtattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 123  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  122 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 69  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 9007292 - 9007445
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9007292 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagtattagggcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttat 9007391  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9007392 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 9007445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19360868 - 19360715
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19360868 ggccccgtttggataaacaatttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataagctatttat 19360769  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19360768 gtttggatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 19360715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 27678492 - 27678646
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27678492 tggccccgtttggataaacaacttatatagatgtttatagcattagtgcttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctattta 27678591  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27678592 tgtttcgatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 27678646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33992104 - 33991958
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  33992104 cccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtt 33992005  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33992004 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaat 33991958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 317
Target Start/End: Original strand, 8373600 - 8373745
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  8373600 gccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatatcattagagcttataacattagagcttacatcataagctcttatactttataagctatttatg 8373699  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8373700 tttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 8373745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 26602286 - 26602439
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  26602286 ggccccgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacgtgataaattatttat 26602385  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26602386 gtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 26602439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 24104961 - 24105111
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24104961 cccgtttggataaacagtttatatagatgcttatagcattagtgcttatgacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 24105060  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24105061 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 24105111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 33490503 - 33490653
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33490503 cccgtttggataaacagcttatatagatgcttatagcattagtgtttataacattagagcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtt 33490602  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33490603 tggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 33490653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 174 - 324
Target Start/End: Original strand, 35782002 - 35782151
Alignment:
Q  174 ccccgtttggataaacaattatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  35782002 ccccgtttggataacaatttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtt 35782101  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  35782102 tggatatgtacactaaaaagtactt-cataaattgaagtgtttggatgtga 35782151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Original strand, 1165052 - 1165205
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  1165052 ggcctcgtttggataaacaacttatatagatgcttatagcattatggcttataacattagagcttacatcataagctcttatatttgataaattatttat 1165151  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1165152 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 1165205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 35419631 - 35419785
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaatt-atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattta 269  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  35419631 tggctccgtttggataaacagtttatatagatgcttataacattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttcataagttattta 35419730  T
Q  270 tctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  35419731 tgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaaatgtttggatgtga 35419785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27421570 - 27421424
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27421570 ggccccgtttagataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataatattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 27421471  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27421470 gtttagatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtttttg 27421424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1579739 - 1579599
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1579739 gtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattaggactaataaaattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgg 1579640  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1579639 atatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 1579599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Original strand, 1605076 - 1605216
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1605076 gtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattaggactaataaaattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgg 1605175  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1605176 atatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 1605216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27025897 - 27025744
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  27025897 ggccccgtttgaataaacagcttatatagatgtttatagcattagggcttataatattagagtttgcattataagtttttatatttgataagctatttat 27025798  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27025797 gtttgggtatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 27025744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4121826 - 4121675
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatct--tatacttgataagctatttatct 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |    
T  4121826 ccgtttggataaacaacttatatagatgattatagtattagggcttataatattagagcttatatcataagctctcttatacttgataagctatttatgt 4121727  T
Q  273 ttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  4121726 ttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttcggatgtga 4121675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31413469 - 31413345
Alignment:
Q  200 atgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtactta 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31413469 atgcttataacattagggcttatagcattagagtttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttaggatatgtacactaaaaagtactta 31413370  T
Q  300 tataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
     |||||||||| |||||| ||||||    
T  31413369 cataaattgaattgtttggatgtga 31413345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31884085 - 31883937
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31884085 cgtttggataaacagcttatataaatgcttatagcattagaacttataacattagagcttaaatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttg 31883986  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31883985 gatatgtacactaacaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 31883937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Original strand, 34708283 - 34708431
Alignment:
Q  177 cgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttg 275  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  34708283 cgtttggataaacagcttatatagatgcttatagtattagtgcttataacattagagcttatatcacaagctcttatacttaataaactatttatgtttg 34708382  T
Q  276 gatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34708383 gatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 34708431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16070291 - 16070184
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16070291 gcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttt 16070192  T
Q  317 gaatgtga 324  Q
    | ||||||    
T  16070191 ggatgtga 16070184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 35419918 - 35420055
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||         || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35419918 ggccccgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggctta---------agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttat 35420008  T
Q  271 ctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35420009 gtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 35420055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 295
Target Start/End: Original strand, 23765297 - 23765419
Alignment:
Q  174 ccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatct 272  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |    
T  23765297 ccccgttaggataaacaacttatatagatgtttatagcattaggacttataacattagaacttacatcataagctcttatatttgataagctattaatgt 23765396  T
Q  273 ttggatatgtacactaaaaagta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23765397 ttggatatgtacactaaaaagta 23765419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 295
Target Start/End: Original strand, 23815145 - 23815267
Alignment:
Q  174 ccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatct 272  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |    
T  23815145 ccccgttaggataaacaacttatatagatgtttatagcattaggacttataacattagaacttacatcataagctcttatatttgataagctattaatgt 23815244  T
Q  273 ttggatatgtacactaaaaagta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23815245 ttggatatgtacactaaaaagta 23815267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 317
Target Start/End: Original strand, 41818028 - 41818128
Alignment:
Q  217 gcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  41818028 gcttataacattagagcttacaacataagttcttatacttgataagctctttatgtttggatatgtacagtaaaaagtatttacttaaattgaagtgttt 41818127  T
Q  317 g 317  Q
    |    
T  41818128 g 41818128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 320
Target Start/End: Original strand, 19515495 - 19515649
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttat 270  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||   ||||  | |||||    
T  19515495 ggccccgtttggataaatagcttatacaggtgcttatagcattagagcttatagcactagagcttacatcataagttcttatacgcaataaattctttat 19515594  T
Q  271 ctttggatatg-----tacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaat 320  Q
     ||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19515595 gtttggatatgtactctacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttgaat 19515649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 16736638 - 16736764
Alignment:
Q  175 cccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctt 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||                 ||||||||||||| ||    
T  16736638 cccgtttggataaacagcttatataggtgcttatggcattagggcttataacattagagcttacatc-----------------ataagctatttatgtt 16736720  T
Q  274 tggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16736721 tggatatgtacattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 16736764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 27678881 - 27678936
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27678881 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 27678936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 33490908 - 33490963
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33490908 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagtgtgcagtttgttac 33490963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 324
Target Start/End: Original strand, 20988364 - 20988425
Alignment:
Q  263 ctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20988364 ctatttatgtttggatatgtacgctgaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtga 20988425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 24105389 - 24105444
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  24105389 attagaggtgtaaataaacatatcatatatattgatattagcgtgcagtttgttac 24105444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 26602650 - 26602705
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26602650 attagaggtgtaaataagcatatcatatatatagatattagtgtacagtttgttac 26602705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 35782358 - 35782413
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  35782358 attagaggtgtaaatatacttatcatatatatagatattagtgtacaatttgttac 35782413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Original strand, 38597158 - 38597217
Alignment:
Q  172 ggccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattag 230  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38597158 ggccccgtttggataaacagcttatttagatgtttatagcattagggcttataacattag 38597217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 8374045 - 8374100
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  8374045 attaaaggtgtaaataaacttaccatatatatagatattaatgtacagtttgttac 8374100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3180581 - 3180516
Alignment:
Q  247 tcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagt 312  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3180581 tcttatatttaataagctttttatgtttgattatgtacactaaaaaatactcatataaattgaagt 3180516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Original strand, 38597217 - 38597267
Alignment:
Q  275 ggatatgtacactaaaaa-gtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38597217 ggatatgtacactaaaaaagtatttacataaattgaagtgtttggatgtga 38597267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16069848 - 16069807
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  16069848 taaacttatcatatatatagatattaatgtacagtttgttac 16069807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19359025 - 19358984
Alignment:
Q  338 taaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgttac 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19359025 taaacttaccatatatatagatattagtgtacagtttgttac 19358984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1827 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1827
Description:

Target: scaffold1827; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 181 - 34
Alignment:
Q  178 gtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgg 276  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  181 gtttggataaacagcttatatagatgtttatagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgg 82  T
Q  277 atatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  81 atatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 317
Target Start/End: Original strand, 18256 - 18401
Alignment:
Q  173 gccccgtttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatc 271  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18256 gccctgtttggataaacagcttatatagatgcttatggcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatg 18355  T
Q  272 tttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18356 tttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttg 18401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Original strand, 1710 - 1857
Alignment:
Q  171 tggccccgtttggataaacaa--ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctattt 268  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1710 tggccccatttggataaacaacatta-atagatgcttgtagcattagggcttataacattagagcttacatcataagctcttatacttgataagctattt 1808  T
Q  269 atctttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttg 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1809 atgtttggatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttg 1857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 565 - 433
Alignment:
Q  192 ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  565 ttatatagatgcttatgacattaagacttataatattagagattacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttgaatatgtacactaaaa 466  T
Q  292 agtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  465 agtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 245 - 191
Alignment:
Q  324 attagaggtgtaaataaacttatcatatatatagatattagtatgcagtttgtta 378  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  245 attagaggtgtaaataaacttaccatatatatagatattagtatacagtttgtta 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11063 - 10912
Alignment:
Q  176 ccgtttggataaacaatt---atatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatct 272  Q
    |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  11063 ccgtttggataaacaacttatatatagatgcttatagcattagagcttataatattagagattacatcgtaaactcttatatttgataagctatttatgt 10964  T
Q  273 ttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10963 ttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtga 10912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Original strand, 144652 - 144798
Alignment:
Q  179 tttggataaacaa-ttatatagatgcttatagcattagggcttataacattagagtttacatcataagatcttatacttgataagctatttatctttgga 277  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  144652 tttggataaacagcttatatagatgtttataacattaaggcttataacattagagtttatatcataagcccttatatttgataagctatttatgtttgga 144751  T
Q  278 tatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttgaatgtga 324  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  144752 tatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtga 144798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University