View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14795_low_9 (Length: 216)

Name: NF14795_low_9
Description: NF14795
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14795_low_9
NF14795_low_9
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (66-216)||(32984077-32984227)
chr8 (66-216)||(9303574-9303724)
chr8 (66-216)||(10646155-10646305)
chr8 (66-216)||(24079901-24080051)
chr8 (66-216)||(13356120-13356270)
chr8 (65-216)||(40435152-40435303)
chr8 (61-216)||(43328739-43328894)
chr8 (66-216)||(33730641-33730791)
chr8 (66-216)||(33981663-33981813)
chr8 (67-216)||(37301326-37301475)
chr8 (65-216)||(9734287-9734436)
chr8 (65-216)||(31830954-31831105)
chr8 (66-216)||(5946079-5946229)
chr8 (66-216)||(37956453-37956603)
chr8 (66-216)||(41862252-41862402)
chr8 (66-216)||(6366018-6366168)
chr8 (66-216)||(17718722-17718872)
chr8 (66-216)||(25185931-25186081)
chr8 (66-216)||(41653927-41654077)
chr8 (59-216)||(35628809-35628966)
chr8 (68-216)||(32114281-32114429)
chr8 (66-216)||(2714581-2714730)
chr8 (66-216)||(9013716-9013865)
chr8 (66-216)||(37419972-37420122)
chr8 (66-216)||(41231978-41232128)
chr8 (66-216)||(45236565-45236715)
chr8 (66-216)||(2275945-2276094)
chr8 (66-192)||(12032986-12033112)
chr8 (66-216)||(13760646-13760798)
chr8 (89-215)||(29048426-29048552)
chr8 (69-215)||(44088446-44088592)
chr8 (66-216)||(45258542-45258691)
chr8 (67-216)||(41639946-41640095)
chr8 (66-215)||(45066592-45066741)
chr8 (66-199)||(3904126-3904258)
chr8 (67-216)||(22878423-22878572)
chr8 (66-182)||(41981534-41981650)
chr8 (66-194)||(25248087-25248215)
chr8 (66-179)||(31336163-31336276)
chr8 (66-216)||(4447295-4447434)
chr8 (78-216)||(42701301-42701440)
chr8 (66-216)||(3211237-3211376)
chr8 (66-216)||(10378341-10378480)
chr8 (146-216)||(41981465-41981535)
chr8 (66-216)||(117329-117468)
chr8 (66-216)||(31940347-31940485)
chr8 (66-216)||(40458772-40458911)
chr8 (66-216)||(41843285-41843424)
chr8 (141-216)||(39915887-39915962)
chr8 (72-216)||(32373733-32373865)
chr8 (66-216)||(9509400-9509539)
chr8 (66-204)||(9713730-9713857)
chr8 (71-216)||(4975412-4975546)
chr8 (66-216)||(2379172-2379311)
chr8 (66-216)||(33896843-33896982)
chr8 (72-216)||(40649837-40649970)
chr8 (66-216)||(3490399-3490538)
chr8 (156-216)||(27243218-27243278)
chr8 (156-216)||(27254793-27254853)
chr8 (66-216)||(26196317-26196455)
chr8 (156-215)||(38631685-38631744)
chr8 (66-143)||(39901662-39901739)
chr8 (66-216)||(33622467-33622604)
chr8 (139-216)||(31148953-31149029)
chr8 (157-216)||(164754-164812)
chr8 (66-141)||(41425429-41425503)
chr8 (83-135)||(38631754-38631806)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (66-216)||(23393051-23393201)
chr7 (66-216)||(25893917-25894067)
chr7 (67-216)||(33423276-33423425)
chr7 (66-216)||(36389389-36389539)
chr7 (66-216)||(45690097-45690247)
chr7 (66-216)||(17855461-17855611)
chr7 (66-216)||(33411293-33411443)
chr7 (66-216)||(33839715-33839865)
chr7 (66-216)||(35328069-35328219)
chr7 (66-216)||(35355921-35356071)
chr7 (66-216)||(47066977-47067127)
chr7 (66-215)||(33695821-33695970)
chr7 (66-215)||(40670597-40670746)
chr7 (66-216)||(46913142-46913294)
chr7 (66-216)||(22979647-22979797)
chr7 (66-216)||(49171362-49171512)
chr7 (66-215)||(27018150-27018299)
chr7 (66-216)||(2341661-2341812)
chr7 (66-216)||(5183825-5183975)
chr7 (66-216)||(20165814-20165964)
chr7 (66-216)||(47740331-47740481)
chr7 (66-216)||(10028521-10028673)
chr7 (66-216)||(26579717-26579867)
chr7 (66-204)||(35767519-35767657)
chr7 (66-216)||(37846016-37846166)
chr7 (66-215)||(31586882-31587031)
chr7 (64-216)||(29446871-29447022)
chr7 (66-216)||(45482691-45482841)
chr7 (66-216)||(48609677-48609827)
chr7 (75-216)||(15877583-15877724)
chr7 (66-216)||(5712201-5712351)
chr7 (66-216)||(33332822-33332971)
chr7 (66-215)||(35757020-35757169)
chr7 (66-216)||(43499518-43499668)
chr7 (66-216)||(31625737-31625886)
chr7 (67-215)||(33870279-33870424)
chr7 (66-215)||(19563481-19563630)
chr7 (66-203)||(28233936-28234073)
chr7 (78-215)||(41990870-41991007)
chr7 (66-213)||(31429475-31429622)
chr7 (66-197)||(30076527-30076658)
chr7 (66-216)||(45063357-45063505)
chr7 (66-216)||(10618331-10618474)
chr7 (100-216)||(33720070-33720186)
chr7 (66-185)||(44405412-44405531)
chr7 (66-216)||(35752034-35752173)
chr7 (66-182)||(41904272-41904388)
chr7 (66-216)||(24923024-24923163)
chr7 (66-216)||(43489251-43489390)
chr7 (90-215)||(44564372-44564497)
chr7 (66-216)||(46898016-46898155)
chr7 (67-216)||(33393361-33393499)
chr7 (66-216)||(2332052-2332191)
chr7 (66-216)||(36816845-36816984)
chr7 (66-216)||(37127970-37128109)
chr7 (66-216)||(46817421-46817560)
chr7 (66-216)||(7876328-7876467)
chr7 (66-216)||(44003370-44003509)
chr7 (66-216)||(48085891-48086030)
chr7 (75-216)||(26941541-26941671)
chr7 (66-216)||(7257414-7257553)
chr7 (66-216)||(21718150-21718288)
chr7 (66-216)||(24228574-24228713)
chr7 (66-215)||(47460772-47460910)
chr7 (68-216)||(39453484-39453614)
chr7 (66-216)||(26371082-26371221)
chr7 (67-216)||(45502817-45502955)
chr7 (68-216)||(15643948-15644085)
chr7 (65-216)||(29610668-29610808)
chr7 (66-209)||(37443602-37443734)
chr7 (66-216)||(498188-498327)
chr7 (74-216)||(25037516-25037647)
chr7 (66-216)||(45237533-45237672)
chr7 (157-216)||(29098784-29098843)
chr7 (100-216)||(32556640-32556745)
chr7 (148-216)||(16482854-16482922)
chr7 (66-216)||(44659876-44660015)
chr7 (67-216)||(46103154-46103291)
chr7 (66-216)||(47906758-47906898)
chr7 (148-216)||(29863048-29863116)
chr7 (68-214)||(35484672-35484807)
chr7 (156-216)||(39323649-39323709)
chr7 (156-216)||(39866698-39866758)
chr7 (70-215)||(41855093-41855228)
chr7 (156-215)||(33455130-33455189)
chr7 (137-215)||(38448508-38448586)
chr7 (66-134)||(39323712-39323779)
chr7 (151-201)||(26456157-26456207)
chr7 (181-216)||(35557763-35557798)
chr7 (70-135)||(29098850-29098915)
chr7 (66-131)||(42272180-42272244)
chr7 (148-216)||(7720574-7720642)
chr7 (80-124)||(39866762-39866806)
chr7 (184-216)||(30077043-30077075)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (66-216)||(5882538-5882688)
chr6 (66-216)||(26377204-26377354)
chr6 (65-216)||(14891378-14891529)
chr6 (66-215)||(24168124-24168273)
chr6 (66-216)||(11988974-11989124)
chr6 (66-216)||(22551061-22551211)
chr6 (66-216)||(34527862-34528012)
chr6 (68-216)||(2892220-2892368)
chr6 (66-216)||(959904-960054)
chr6 (66-216)||(7393586-7393736)
chr6 (66-216)||(8615272-8615422)
chr6 (66-216)||(18101495-18101645)
chr6 (66-216)||(28947119-28947269)
chr6 (66-215)||(2593852-2594001)
chr6 (63-216)||(7345109-7345262)
chr6 (66-203)||(22341788-22341925)
chr6 (66-216)||(599924-600074)
chr6 (66-216)||(19415533-19415683)
chr6 (66-216)||(10507908-10508058)
chr6 (66-216)||(1970743-1970893)
chr6 (66-216)||(33452572-33452722)
chr6 (66-215)||(5294801-5294950)
chr6 (66-215)||(5299353-5299502)
chr6 (75-216)||(16703398-16703539)
chr6 (66-216)||(24224070-24224220)
chr6 (67-216)||(19281056-19281205)
chr6 (66-216)||(23261929-23262079)
chr6 (66-216)||(30743448-30743598)
chr6 (119-216)||(30467656-30467753)
chr6 (66-216)||(15965465-15965604)
chr6 (66-216)||(28948845-28948984)
chr6 (66-216)||(7167614-7167753)
chr6 (65-216)||(4487559-4487699)
chr6 (73-216)||(13329413-13329545)
chr6 (66-215)||(1398586-1398724)
chr6 (66-215)||(3786782-3786920)
chr6 (166-215)||(929692-929741)
chr6 (66-216)||(3291040-3291179)
chr6 (66-141)||(18661830-18661905)
chr6 (152-215)||(1939579-1939642)
chr6 (66-141)||(24913096-24913171)
chr6 (66-125)||(34262342-34262401)
chr6 (150-216)||(375797-375863)
chr6 (68-125)||(375729-375786)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (66-216)||(24253414-24253564)
chr5 (66-216)||(31938929-31939079)
chr5 (66-216)||(35626070-35626220)
chr5 (66-216)||(43326379-43326529)
chr5 (67-216)||(15398483-15398632)
chr5 (68-216)||(6901831-6901979)
chr5 (66-216)||(27938929-27939080)
chr5 (66-216)||(7722081-7722231)
chr5 (66-216)||(39932611-39932761)
chr5 (66-216)||(40886028-40886177)
chr5 (66-215)||(2484292-2484441)
chr5 (66-215)||(12648830-12648979)
chr5 (65-216)||(15683823-15683974)
chr5 (66-216)||(739704-739854)
chr5 (66-216)||(3466681-3466831)
chr5 (66-216)||(5185004-5185154)
chr5 (66-216)||(18479668-18479818)
chr5 (66-216)||(43262183-43262333)
chr5 (66-215)||(27501055-27501204)
chr5 (66-211)||(29789295-29789440)
chr5 (67-216)||(27278474-27278627)
chr5 (66-206)||(34451292-34451432)
chr5 (66-216)||(25831553-25831702)
chr5 (66-216)||(28424795-28424943)
chr5 (66-216)||(5137747-5137897)
chr5 (66-216)||(13504742-13504892)
chr5 (66-216)||(40278858-40279008)
chr5 (66-216)||(38756487-38756638)
chr5 (66-215)||(890939-891087)
chr5 (68-216)||(40110266-40110413)
chr5 (66-216)||(33617617-33617756)
chr5 (66-216)||(763755-763905)
chr5 (66-216)||(19295762-19295901)
chr5 (65-216)||(9374501-9374641)
chr5 (85-216)||(4149726-4149847)
chr5 (66-216)||(23195248-23195387)
chr5 (66-216)||(27503411-27503550)
chr5 (66-216)||(38015514-38015653)
chr5 (66-215)||(31293989-31294138)
chr5 (66-216)||(3656568-3656707)
chr5 (66-216)||(5497305-5497444)
chr5 (104-216)||(40632531-40632634)
chr5 (67-216)||(9424593-9424731)
chr5 (75-216)||(42658671-42658801)
chr5 (66-216)||(6973095-6973234)
chr5 (66-216)||(13957702-13957841)
chr5 (68-215)||(36948492-36948626)
chr5 (66-216)||(14972010-14972149)
chr5 (66-212)||(27390633-27390768)
chr5 (66-214)||(38492647-38492783)
chr5 (66-216)||(2585494-2585633)
chr5 (66-216)||(36365445-36365584)
chr5 (66-215)||(18327173-18327311)
chr5 (137-215)||(12558090-12558167)
chr5 (67-215)||(33623940-33624077)
chr5 (97-216)||(6206916-6207024)
chr5 (140-216)||(5120057-5120132)
chr5 (66-216)||(24167784-24167923)
chr5 (66-216)||(38637910-38638049)
chr5 (141-216)||(36472348-36472423)
chr5 (66-216)||(1402505-1402644)
chr5 (160-216)||(42247865-42247921)
chr5 (66-216)||(612757-612894)
chr5 (66-216)||(40686931-40687069)
chr5 (157-216)||(3940411-3940470)
chr5 (163-216)||(9171111-9171164)
chr5 (149-215)||(20207088-20207154)
chr5 (181-216)||(9527124-9527159)
chr5 (166-216)||(15300962-15301012)
chr5 (66-124)||(42247791-42247849)
chr5 (64-129)||(3940334-3940399)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (66-216)||(23437624-23437774)
chr4 (66-216)||(26091258-26091408)
chr4 (66-216)||(34276579-34276729)
chr4 (66-216)||(9798497-9798647)
chr4 (66-216)||(21366609-21366759)
chr4 (66-216)||(44984793-44984943)
chr4 (66-216)||(237509-237659)
chr4 (66-216)||(39077577-39077727)
chr4 (66-216)||(42085239-42085389)
chr4 (66-216)||(53461816-53461966)
chr4 (66-216)||(54574940-54575090)
chr4 (67-216)||(6019960-6020109)
chr4 (67-216)||(32366661-32366810)
chr4 (68-216)||(397434-397582)
chr4 (65-216)||(47344688-47344839)
chr4 (66-216)||(2826682-2826831)
chr4 (66-216)||(31532135-31532285)
chr4 (66-216)||(53854430-53854579)
chr4 (66-216)||(18462013-18462163)
chr4 (66-216)||(19387688-19387838)
chr4 (66-216)||(43471695-43471845)
chr4 (66-216)||(51363039-51363188)
chr4 (66-215)||(31914231-31914379)
chr4 (66-215)||(41560361-41560510)
chr4 (66-215)||(42765842-42765990)
chr4 (68-216)||(41702461-41702609)
chr4 (69-216)||(6285339-6285486)
chr4 (61-216)||(55056254-55056409)
chr4 (66-216)||(146429-146579)
chr4 (66-216)||(3692210-3692360)
chr4 (66-216)||(27373108-27373257)
chr4 (66-216)||(29478392-29478542)
chr4 (66-216)||(31972336-31972486)
chr4 (66-216)||(45797511-45797661)
chr4 (66-208)||(48657858-48658000)
chr4 (66-216)||(55776077-55776226)
chr4 (66-216)||(55840255-55840404)
chr4 (66-216)||(41949414-41949566)
chr4 (66-216)||(49881059-49881213)
chr4 (66-216)||(407786-407934)
chr4 (66-216)||(2243490-2243640)
chr4 (66-216)||(3170658-3170808)
chr4 (66-216)||(22618514-22618662)
chr4 (66-216)||(23609119-23609269)
chr4 (66-216)||(42033207-42033357)
chr4 (66-216)||(54607994-54608144)
chr4 (66-216)||(38591700-38591846)
chr4 (66-215)||(54086442-54086590)
chr4 (66-215)||(55519860-55520009)
chr4 (66-216)||(14017376-14017524)
chr4 (66-216)||(29777257-29777407)
chr4 (66-216)||(42222323-42222473)
chr4 (70-216)||(50534663-50534809)
chr4 (70-216)||(50536628-50536774)
chr4 (66-216)||(56022998-56023148)
chr4 (66-215)||(47662102-47662251)
chr4 (66-215)||(50234033-50234182)
chr4 (68-216)||(50457812-50457960)
chr4 (64-216)||(54425014-54425165)
chr4 (66-216)||(31070074-31070223)
chr4 (70-216)||(35446538-35446683)
chr4 (66-208)||(52728307-52728448)
chr4 (66-192)||(36532830-36532956)
chr4 (66-216)||(48313589-48313737)
chr4 (67-216)||(53834055-53834204)
chr4 (84-216)||(22468788-22468920)
chr4 (66-216)||(1932795-1932945)
chr4 (75-216)||(33897504-33897645)
chr4 (66-216)||(41632007-41632156)
chr4 (83-216)||(39587796-39587929)
chr4 (66-215)||(48654847-48655002)
chr4 (66-216)||(48259512-48259660)
chr4 (66-216)||(54805614-54805768)
chr4 (66-216)||(9997931-9998070)
chr4 (66-193)||(42509351-42509478)
chr4 (63-216)||(45633776-45633918)
chr4 (66-163)||(35595772-35595869)
chr4 (68-216)||(51951714-51951861)
chr4 (66-216)||(43890960-43891099)
chr4 (66-216)||(54715067-54715206)
chr4 (65-216)||(5117437-5117577)
chr4 (66-216)||(15060289-15060428)
chr4 (66-216)||(22620625-22620764)
chr4 (66-216)||(37239090-37239229)
chr4 (66-216)||(38547601-38547740)
chr4 (66-216)||(52461395-52461534)
chr4 (110-200)||(52396774-52396865)
chr4 (67-168)||(35344868-35344968)
chr4 (66-216)||(4486581-4486720)
chr4 (66-216)||(20351842-20351981)
chr4 (66-216)||(31881314-31881453)
chr4 (67-135)||(33048994-33049062)
chr4 (66-216)||(34552351-34552490)
chr4 (66-216)||(34835209-34835348)
chr4 (66-216)||(47811938-47812077)
chr4 (66-216)||(54216736-54216875)
chr4 (65-216)||(52688381-52688521)
chr4 (68-215)||(54216346-54216482)
chr4 (70-216)||(27398607-27398742)
chr4 (66-216)||(46708741-46708880)
chr4 (70-216)||(46720057-46720195)
chr4 (66-216)||(49014130-49014269)
chr4 (66-215)||(27872612-27872750)
chr4 (148-216)||(14335172-14335240)
chr4 (66-215)||(33289736-33289873)
chr4 (66-216)||(27873550-27873687)
chr4 (66-143)||(48259704-48259780)
chr4 (66-216)||(573835-573974)
chr4 (66-216)||(6371249-6371388)
chr4 (148-216)||(27580151-27580219)
chr4 (84-215)||(33557960-33558080)
chr4 (148-216)||(1662330-1662398)
chr4 (156-216)||(3293102-3293162)
chr4 (149-216)||(43231534-43231601)
chr4 (66-211)||(51981479-51981613)
chr4 (156-216)||(11972208-11972268)
chr4 (164-216)||(42557614-42557666)
chr4 (66-171)||(42558270-42558367)
chr4 (66-134)||(3291805-3291873)
chr4 (66-118)||(1662261-1662313)
chr4 (149-216)||(49057940-49058007)
chr4 (66-118)||(14335101-14335153)
chr4 (148-216)||(18206589-18206661)
chr4 (158-198)||(47105108-47105148)
[»] chr1 (108 HSPs)
chr1 (66-216)||(3611168-3611318)
chr1 (66-216)||(31308033-31308183)
chr1 (66-216)||(45538185-45538335)
chr1 (66-216)||(21139412-21139562)
chr1 (66-216)||(44662002-44662152)
chr1 (66-215)||(25678259-25678408)
chr1 (72-216)||(4068689-4068833)
chr1 (68-216)||(43251743-43251891)
chr1 (66-216)||(17994951-17995101)
chr1 (66-216)||(26085398-26085548)
chr1 (66-216)||(26277209-26277359)
chr1 (70-215)||(26794337-26794482)
chr1 (66-216)||(5981202-5981352)
chr1 (66-216)||(25058720-25058870)
chr1 (66-216)||(33112818-33112967)
chr1 (66-216)||(38790197-38790347)
chr1 (66-216)||(6327548-6327697)
chr1 (66-216)||(23932509-23932659)
chr1 (66-216)||(23984787-23984937)
chr1 (66-216)||(24245025-24245175)
chr1 (66-216)||(31040741-31040891)
chr1 (66-216)||(37620192-37620342)
chr1 (66-216)||(39646600-39646750)
chr1 (66-215)||(47671619-47671768)
chr1 (66-206)||(36566372-36566512)
chr1 (66-216)||(35692663-35692814)
chr1 (66-216)||(24885533-24885683)
chr1 (66-216)||(33884120-33884270)
chr1 (66-216)||(33959982-33960132)
chr1 (66-216)||(41999847-41999997)
chr1 (66-216)||(50774249-50774399)
chr1 (66-215)||(35273629-35273778)
chr1 (66-215)||(42313361-42313510)
chr1 (66-216)||(46616581-46616731)
chr1 (66-216)||(47317347-47317497)
chr1 (66-216)||(47383732-47383882)
chr1 (67-215)||(3285435-3285582)
chr1 (66-213)||(2450529-2450676)
chr1 (69-216)||(28888613-28888760)
chr1 (66-216)||(5980100-5980250)
chr1 (66-216)||(26524889-26525039)
chr1 (66-216)||(38331859-38332009)
chr1 (66-216)||(46967041-46967191)
chr1 (66-216)||(47187137-47187287)
chr1 (66-216)||(49253975-49254125)
chr1 (66-216)||(49398988-49399138)
chr1 (66-216)||(51057103-51057253)
chr1 (95-215)||(31844409-31844529)
chr1 (79-215)||(42863898-42864034)
chr1 (70-216)||(23220939-23221079)
chr1 (66-216)||(46784455-46784605)
chr1 (66-216)||(36003162-36003315)
chr1 (66-207)||(51045596-51045737)
chr1 (110-216)||(25518846-25518952)
chr1 (66-194)||(4808699-4808827)
chr1 (66-216)||(48373536-48373677)
chr1 (69-211)||(45475848-45475987)
chr1 (66-216)||(33073243-33073382)
chr1 (63-216)||(2657335-2657477)
chr1 (66-216)||(27983603-27983737)
chr1 (66-197)||(4156438-4156576)
chr1 (66-216)||(10928099-10928238)
chr1 (66-216)||(41467632-41467771)
chr1 (83-216)||(51403034-51403157)
chr1 (66-198)||(47772172-47772304)
chr1 (67-216)||(6626025-6626163)
chr1 (66-159)||(13312531-13312624)
chr1 (66-216)||(2954887-2955026)
chr1 (72-216)||(26472185-26472318)
chr1 (66-216)||(26685888-26686027)
chr1 (66-216)||(29770702-29770841)
chr1 (66-216)||(30289910-30290049)
chr1 (66-216)||(38716247-38716386)
chr1 (96-215)||(2556885-2556995)
chr1 (129-216)||(31979998-31980085)
chr1 (66-216)||(1388505-1388644)
chr1 (66-216)||(4243490-4243629)
chr1 (66-216)||(4953084-4953223)
chr1 (66-216)||(41895164-41895303)
chr1 (66-216)||(42234872-42235010)
chr1 (66-216)||(51155590-51155728)
chr1 (66-215)||(33187373-33187505)
chr1 (152-216)||(13313249-13313313)
chr1 (66-216)||(48683330-48683469)
chr1 (66-215)||(5961267-5961405)
chr1 (72-216)||(34752320-34752453)
chr1 (66-216)||(10920232-10920371)
chr1 (148-216)||(27924729-27924797)
chr1 (156-216)||(32448680-32448740)
chr1 (66-216)||(39475783-39475921)
chr1 (148-216)||(52367915-52367983)
chr1 (66-129)||(7561528-7561591)
chr1 (156-215)||(44544125-44544184)
chr1 (95-216)||(46428282-46428392)
chr1 (66-216)||(52323970-52324110)
chr1 (157-215)||(24649802-24649860)
chr1 (101-216)||(13281597-13281701)
chr1 (156-216)||(44293534-44293594)
chr1 (97-205)||(24215806-24215903)
chr1 (65-185)||(31286503-31286612)
chr1 (167-216)||(7561632-7561681)
chr1 (101-216)||(35991634-35991738)
chr1 (149-201)||(39637943-39637996)
chr1 (69-122)||(32448754-32448807)
chr1 (66-213)||(38718167-38718309)
chr1 (66-103)||(31844818-31844855)
chr1 (96-127)||(39359502-39359533)
chr1 (66-135)||(44293455-44293524)
[»] chr3 (109 HSPs)
chr3 (66-216)||(47809596-47809747)
chr3 (66-216)||(47257825-47257975)
chr3 (66-215)||(38416724-38416873)
chr3 (67-215)||(51170034-51170182)
chr3 (66-216)||(7855114-7855264)
chr3 (66-216)||(22399129-22399278)
chr3 (66-216)||(28048392-28048542)
chr3 (66-216)||(40130959-40131109)
chr3 (66-216)||(49330069-49330219)
chr3 (66-215)||(40643833-40643982)
chr3 (64-216)||(37324573-37324725)
chr3 (68-215)||(48609756-48609903)
chr3 (66-216)||(24100315-24100464)
chr3 (66-216)||(32234398-32234547)
chr3 (66-216)||(40419867-40420017)
chr3 (66-216)||(41464384-41464534)
chr3 (66-216)||(42291874-42292024)
chr3 (66-216)||(43612047-43612197)
chr3 (66-216)||(48739233-48739383)
chr3 (66-215)||(35748311-35748460)
chr3 (66-215)||(46126020-46126168)
chr3 (63-216)||(51102375-51102528)
chr3 (66-216)||(29625827-29625977)
chr3 (66-216)||(37313431-37313581)
chr3 (66-212)||(39634572-39634717)
chr3 (66-216)||(40804510-40804660)
chr3 (66-216)||(44222861-44223011)
chr3 (66-216)||(52628986-52629135)
chr3 (67-216)||(55453245-55453394)
chr3 (66-216)||(2666032-2666182)
chr3 (66-216)||(20754393-20754543)
chr3 (66-216)||(27066978-27067128)
chr3 (66-216)||(7755307-7755456)
chr3 (66-216)||(46134388-46134538)
chr3 (68-216)||(43183944-43184092)
chr3 (70-216)||(35594153-35594299)
chr3 (66-216)||(41293319-41293468)
chr3 (67-216)||(43021746-43021896)
chr3 (66-216)||(44806716-44806866)
chr3 (66-216)||(51452751-51452900)
chr3 (66-215)||(41732561-41732710)
chr3 (66-215)||(53943588-53943736)
chr3 (81-216)||(52215108-52215243)
chr3 (66-216)||(18946935-18947085)
chr3 (66-216)||(39053426-39053576)
chr3 (66-216)||(43125863-43126012)
chr3 (66-216)||(52638874-52639024)
chr3 (66-215)||(36368972-36369120)
chr3 (68-216)||(53832486-53832634)
chr3 (68-215)||(47894822-47894969)
chr3 (66-216)||(51146215-51146365)
chr3 (95-216)||(24376605-24376726)
chr3 (83-216)||(46949406-46949538)
chr3 (66-216)||(41216487-41216637)
chr3 (66-216)||(5560025-5560182)
chr3 (66-188)||(52864550-52864671)
chr3 (99-215)||(53637874-53637990)
chr3 (66-181)||(33550467-33550582)
chr3 (68-216)||(54159000-54159138)
chr3 (102-215)||(37758962-37759075)
chr3 (69-216)||(49130610-49130746)
chr3 (66-216)||(42589862-42590001)
chr3 (65-216)||(38156631-38156771)
chr3 (66-216)||(25641678-25641817)
chr3 (66-216)||(34279721-34279860)
chr3 (66-216)||(37028755-37028894)
chr3 (68-216)||(48546842-48546979)
chr3 (66-216)||(51416001-51416140)
chr3 (66-216)||(54401219-54401358)
chr3 (66-216)||(54707220-54707359)
chr3 (66-216)||(55000178-55000317)
chr3 (66-216)||(55380017-55380156)
chr3 (66-216)||(24688146-24688285)
chr3 (66-216)||(25353586-25353725)
chr3 (66-216)||(47510940-47511079)
chr3 (66-216)||(53115479-53115618)
chr3 (66-216)||(39141125-39141265)
chr3 (117-199)||(47182049-47182131)
chr3 (66-216)||(31286793-31286932)
chr3 (66-216)||(41635800-41635939)
chr3 (68-216)||(45058915-45059052)
chr3 (66-216)||(30251501-30251640)
chr3 (67-216)||(51143849-51143987)
chr3 (71-215)||(40022107-40022240)
chr3 (97-216)||(17665555-17665663)
chr3 (66-216)||(40165683-40165822)
chr3 (66-213)||(52756067-52756207)
chr3 (149-216)||(41882063-41882130)
chr3 (67-216)||(42998790-42998928)
chr3 (137-214)||(2227995-2228072)
chr3 (66-192)||(48534007-48534122)
chr3 (66-216)||(50731914-50732053)
chr3 (66-216)||(50780803-50780942)
chr3 (66-216)||(51224038-51224176)
chr3 (149-216)||(21597220-21597287)
chr3 (149-216)||(28576184-28576251)
chr3 (66-153)||(30429227-30429314)
chr3 (66-215)||(43176738-43176876)
chr3 (149-216)||(48726070-48726137)
chr3 (162-216)||(44946014-44946068)
chr3 (137-216)||(41609099-41609178)
chr3 (66-141)||(44945935-44946010)
chr3 (137-216)||(47402810-47402888)
chr3 (66-108)||(41882011-41882053)
chr3 (72-125)||(52434291-52434344)
chr3 (67-107)||(37760346-37760386)
chr3 (66-118)||(40688431-40688483)
chr3 (172-216)||(48752117-48752161)
chr3 (172-212)||(52434176-52434216)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (66-216)||(11133-11283)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (66-216)||(746497-746647)
chr2 (66-216)||(17600867-17601017)
chr2 (66-216)||(23901810-23901960)
chr2 (66-215)||(45371022-45371171)
chr2 (66-216)||(4034623-4034773)
chr2 (66-216)||(6594458-6594608)
chr2 (66-216)||(11185003-11185153)
chr2 (66-216)||(13815218-13815368)
chr2 (66-216)||(14660477-14660627)
chr2 (66-216)||(34518398-34518548)
chr2 (66-216)||(38997132-38997282)
chr2 (66-216)||(40635249-40635399)
chr2 (66-215)||(1091951-1092100)
chr2 (72-216)||(6430504-6430648)
chr2 (65-216)||(10244581-10244732)
chr2 (66-216)||(2324889-2325039)
chr2 (66-216)||(5726160-5726310)
chr2 (66-216)||(26710376-26710526)
chr2 (66-216)||(27651034-27651184)
chr2 (69-216)||(10424626-10424773)
chr2 (66-216)||(11159652-11159802)
chr2 (66-216)||(27400434-27400584)
chr2 (66-216)||(7892688-7892838)
chr2 (66-214)||(37255337-37255485)
chr2 (66-216)||(4609657-4609807)
chr2 (66-211)||(9444726-9444874)
chr2 (66-216)||(14697537-14697687)
chr2 (66-216)||(27024446-27024596)
chr2 (66-216)||(32327392-32327542)
chr2 (66-216)||(33427647-33427797)
chr2 (66-215)||(2914138-2914287)
chr2 (66-215)||(32856436-32856585)
chr2 (69-196)||(25294886-25295013)
chr2 (66-216)||(32948477-32948626)
chr2 (66-216)||(37620867-37621020)
chr2 (66-216)||(40037174-40037323)
chr2 (66-216)||(40735495-40735645)
chr2 (95-216)||(32608411-32608532)
chr2 (95-216)||(12842134-12842255)
chr2 (95-215)||(8432945-8433065)
chr2 (72-216)||(15925111-15925255)
chr2 (66-199)||(1229675-1229809)
chr2 (100-216)||(41172489-41172605)
chr2 (66-173)||(447633-447740)
chr2 (67-216)||(39103078-39103216)
chr2 (123-216)||(42899946-42900039)
chr2 (66-216)||(21734900-21735039)
chr2 (66-216)||(28641292-28641431)
chr2 (66-216)||(35158050-35158189)
chr2 (66-216)||(29687072-29687211)
chr2 (68-216)||(145313-145450)
chr2 (66-216)||(13543624-13543763)
chr2 (66-216)||(19428426-19428565)
chr2 (66-216)||(3711664-3711803)
chr2 (66-216)||(4258521-4258659)
chr2 (104-176)||(28014856-28014928)
chr2 (66-216)||(44481859-44481998)
chr2 (66-173)||(12827137-12827243)
chr2 (66-215)||(43898971-43899108)
chr2 (66-216)||(12333497-12333634)
chr2 (66-216)||(27331329-27331472)
chr2 (66-216)||(27764863-27765001)
chr2 (66-216)||(34249296-34249435)
chr2 (66-216)||(39301197-39301336)
chr2 (71-216)||(35126811-35126945)
chr2 (71-215)||(28566703-28566836)
chr2 (66-209)||(43356134-43356266)
chr2 (66-216)||(12730092-12730231)
chr2 (66-216)||(2688729-2688868)
chr2 (156-216)||(3266327-3266387)
chr2 (168-216)||(12814645-12814693)
chr2 (156-212)||(40544155-40544211)
chr2 (151-215)||(30545853-30545917)
chr2 (148-216)||(38985349-38985416)
chr2 (157-216)||(2000417-2000476)
chr2 (68-124)||(3266399-3266455)
chr2 (156-216)||(8056657-8056717)
chr2 (66-121)||(42900781-42900835)
chr2 (66-124)||(40544085-40544143)
chr2 (66-143)||(10176637-10176714)
chr2 (83-135)||(8056727-8056779)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (66-215)||(13762-13911)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (66-216)||(1901-2051)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (66-216)||(39556-39706)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (66-216)||(75244-75394)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (66-216)||(176686-176836)
scaffold0007 (66-216)||(278038-278190)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (66-216)||(2432-2582)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (66-216)||(18854-19004)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (95-216)||(32593-32714)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (66-206)||(4596-4736)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (66-194)||(3133-3261)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (66-216)||(14776-14915)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (66-216)||(20477-20616)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (66-216)||(7122-7262)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (66-216)||(4554-4694)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (66-216)||(3424-3564)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (66-216)||(134-272)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (100-216)||(17938-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (148-216)||(19249-19321)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 32984077 - 32984227
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32984077 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 32984176  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984177 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 32984227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 9303574 - 9303724
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9303574 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 9303673  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9303674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 9303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10646305 - 10646155
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10646305 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagaacatttttaagtggtatccatgaactat 10646206  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646205 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 10646155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 24079901 - 24080051
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24079901 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24080000  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24080001 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 24080051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 13356120 - 13356270
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13356120 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 13356219  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13356220 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 13356270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 40435152 - 40435303
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40435152 cggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 40435251  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40435252 tcttgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaagttac 40435303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43328894 - 43328739
Alignment:
Q  61 gaatcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatga 160  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43328894 gaataggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 43328795  T
Q  161 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328794 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 43328739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33730641 - 33730791
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33730641 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33730740  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33730741 cttgaccccaccaacaaattgctcatattaattggttggtgggtaaattac 33730791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33981663 - 33981813
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33981663 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33981762  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33981763 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 33981813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 37301326 - 37301475
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  37301326 gtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatt 37301425  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37301426 ttggccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 37301475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9734436 - 9734287
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9734436 cggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaacta 9734339  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734338 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 9734287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 31830954 - 31831105
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31830954 cggtaacaactagggtacccatggaagaatggtaggtaatttacccaaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 31831053  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831054 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 31831105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5946229 - 5946079
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5946229 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5946130  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946129 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 5946079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37956603 - 37956453
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37956603 ggtgacaactagggtatccatgaaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37956504  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37956503 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 37956453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41862402 - 41862252
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41862402 ggtgacaattaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 41862303  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41862302 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 41862252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6366168 - 6366018
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6366168 ggtgacaactagggtatccatgaaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6366069  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366068 attgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 6366018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 17718722 - 17718872
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17718722 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 17718821  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718822 cttgaccccatcaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 17718872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25186081 - 25185931
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  25186081 ggtgacgattagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 25185982  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25185981 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 25185931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41654077 - 41653927
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  41654077 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 41653978  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41653977 tttgaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 41653927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35628966 - 35628809
Alignment:
Q  59 atgaatcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccat 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  35628966 atgaatgggtgacaactagggtactcatagaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtattctt 35628867  T
Q  159 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35628866 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 35628809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32114429 - 32114281
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  32114429 tgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 32114330  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32114329 tgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 32114281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2714730 - 2714581
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2714730 ggtgacaactaaagtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2714632  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714631 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 2714581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9013865 - 9013716
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9013865 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct-aaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 9013767  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9013766 cttgactccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 9013716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37420122 - 37419972
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37420122 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccttaatcaatacacattagtcacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 37420023  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37420022 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 37419972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41232128 - 41231978
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41232128 ggtgacaactagggtatccatggaggaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattggtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41232029  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232028 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 41231978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 45236565 - 45236715
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45236565 ggtgacaactaggatacccataaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45236664  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45236665 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattac 45236715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2276094 - 2275945
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2276094 ggtgacaactagtctacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 2275996  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2275995 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 2275945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12033112 - 12032986
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12033112 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 12033013  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcatt 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12033012 cttgaccgcaccaacaaattgctcatt 12032986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 13760646 - 13760798
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtac--ccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  13760646 ggtgacaactagggtacacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaaatggtatccatgaact 13760745  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13760746 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattac 13760798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Original strand, 29048426 - 29048552
Alignment:
Q  89 aagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgct 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29048426 aagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 29048525  T
Q  189 cattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29048526 cattttcattggttagtgggtaaatta 29048552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Original strand, 44088446 - 44088592
Alignment:
Q  69 gacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatctt 168  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44088446 gacaattagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 44088545  T
Q  169 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44088546 gatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgagtaaatta 44088592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45258691 - 45258542
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45258691 ggtgataactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagttacataaacacatttttaaatggtatccatgaactat 45258593  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45258592 cttgacccctccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattac 45258542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41640095 - 41639946
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  41640095 gtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataaacatatttttaagcggtatctatgaactatc 41639996  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639995 ttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 41639946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 45066592 - 45066741
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||    || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45066592 ggtgagaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttattataatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45066691  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45066692 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 45066741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3904258 - 3904126
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3904258 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacaatagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactat 3904160  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3904159 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 3904126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22878572 - 22878423
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22878572 gtgacaactagggtacccatagaagaattgtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 22878473  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22878472 ttgaccccaacaaaaaattgatcattttcattggaaggtggataaattac 22878423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41981650 - 41981534
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41981650 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41981551  T
Q  166 cttgaccccaccaacaa 182  Q
    |||||||||||||||||    
T  41981550 cttgaccccaccaacaa 41981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25248215 - 25248087
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25248215 ggtgacaattagggtatccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagcaacataagcacattttaaagtggtatccatgaactat 25248116  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248115 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt 25248087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31336276 - 31336163
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31336276 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgccccaaccaatacacattagccatataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 31336177  T
Q  166 cttgaccccaccaa 179  Q
    ||||||||||||||    
T  31336176 cttgaccccaccaa 31336163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 4447295 - 4447434
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  4447295 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 4447383  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4447384 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 4447434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Original strand, 42701301 - 42701440
Alignment:
Q  78 ggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttg---aagtggtatccatgaactatcttgacccc 174  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42701301 ggtacccatggaaggatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcaca--agcacattttttttaagtggtattcatgaactatcttgacccc 42701398  T
Q  175 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42701399 actaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 42701440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3211376 - 3211237
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  3211376 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaacgaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 3211288  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3211287 cttaaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 3211237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10378480 - 10378341
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  10378480 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 10378392  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10378391 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 10378341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41981535 - 41981465
Alignment:
Q  146 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981535 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 41981465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 117329 - 117468
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  117329 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 117417  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117418 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 117468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31940485 - 31940347
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  31940485 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31940398  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31940397 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 31940347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 40458772 - 40458911
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||           ||||||||||    
T  40458772 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacaaaaacacatatt-----------catgaactat 40458860  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40458861 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 40458911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41843424 - 41843285
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  41843424 ggtgataactaagctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 41843336  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41843335 ctggaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 41843285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 39915887 - 39915962
Alignment:
Q  141 ttttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39915887 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 39915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Original strand, 32373733 - 32373865
Alignment:
Q  72 aactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgac 171  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||           ||||||||||||||||    
T  32373733 aactaggttatccatggaagaatggtgg-taatttaccccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 32373820  T
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32373821 cccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 32373865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 9509400 - 9509539
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  9509400 ggtgaaaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaataaaaatttgccacataaacacatatt-----------catgaactat 9509488  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9509489 cttaaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 9509539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9713857 - 9713730
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  9713857 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 9713769  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgg 204  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9713768 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttgg 9713730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 4975412 - 4975546
Alignment:
Q  71 caactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttga 170  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||           |||||||||||||||    
T  4975412 caactaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccatataagcacatatt-----------catgaactatcttga 4975500  T
Q  171 ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4975501 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 4975546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2379311 - 2379172
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  2379311 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcaca-----------tattcatgaactat 2379223  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2379222 tttgatcccacaaataaattgttcattttcattagttggtgggtaaattac 2379172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33896843 - 33896982
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| |||||           ||  |||| | |||||||| || ||||||    
T  33896843 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatctataaactat 33896931  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33896932 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 33896982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Original strand, 40649837 - 40649970
Alignment:
Q  72 aactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgac 171  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||||| ||| ||||     
T  40649837 aactaggctacccatgaaagaatgatgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaattattttgat 40649925  T
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40649926 cccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 40649970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 3490399 - 3490538
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| |||||           ||| |||| | |||||| |||| || |||    
T  3490399 ggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtagtttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtaaccataaattat 3490487  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3490488 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattac 3490538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 27243218 - 27243278
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27243218 catgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 27243278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 27254793 - 27254853
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27254793 catgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 27254853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 26196317 - 26196455
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  26196317 ggtgacaactaggatattcatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 26196405  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  26196406 tttgaccccaccaataaattg-ttattatgattggttggtgggtaaattac 26196455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38631744 - 38631685
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38631744 catgaactatcttgaccacaccaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaatta 38631685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39901739 - 39901662
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattt 143  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  39901739 ggtgacaactaaggtatccattgaagaatggtggataatttacctcaaccaataaacattagccacggaaacacattt 39901662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33622467 - 33622604
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  33622467 ggtgacaactaggctacc-atgaaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagtcacataaccaca-----------tattcatgaactat 33622554  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33622555 tttga-cccataaatatattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 33622604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 31148953 - 31149029
Alignment:
Q  139 cattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  31148953 catttttaagtggtatc-atgaactatcttaaccccatcaataaatagctcattttcattggttagtgaataaattac 31149029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 164812 - 164754
Alignment:
Q  157 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  164812 atgaactatttagactccacca-caaattgctcatttttattggttggtggataaattac 164754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 41425429 - 41425503
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacat 141  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41425429 ggtggcaactaggctacccataaaagaattatggataatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 41425503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38631806 - 38631754
Alignment:
Q  83 ccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa 135  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38631806 ccattgaagaatggtggataatttatcccaaccaatacatattaaccacataa 38631754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 23393051 - 23393201
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23393051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23393150  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393151 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 25893917 - 25894067
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25893917 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25894016  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894017 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 25894067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 33423276 - 33423425
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33423276 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 33423375  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423376 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 33423425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36389539 - 36389389
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36389539 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 36389440  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389439 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 36389389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 45690097 - 45690247
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45690097 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45690196  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690197 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 45690247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17855611 - 17855461
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17855611 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 17855512  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17855511 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 17855461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33411443 - 33411293
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33411443 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33411344  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411343 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 33411293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33839715 - 33839865
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33839715 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33839814  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839815 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 33839865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 35328069 - 35328219
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35328069 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35328168  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35328169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttac 35328219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35356071 - 35355921
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35356071 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 35355972  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35355971 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 35355921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 47066977 - 47067127
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47066977 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47067076  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47067077 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 47067127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 33695821 - 33695970
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33695821 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33695920  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaatta 33695970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40670746 - 40670597
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40670746 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 40670647  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40670646 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggttggtaaatta 40670597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46913294 - 46913142
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa--acacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46913294 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacacatttttaagtggtatccatgaact 46913195  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46913194 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattac 46913142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 22979647 - 22979797
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22979647 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 22979746  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22979747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 22979797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 49171362 - 49171512
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49171362 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 49171461  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49171462 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 49171512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27018299 - 27018150
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27018299 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27018200  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018199 cttgaccacaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 27018150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 2341661 - 2341812
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtaccc-atggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2341661 ggtgacaactagggtaccccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaacta 2341760  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2341761 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 2341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 5183825 - 5183975
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5183825 ggtgataactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactat 5183924  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5183925 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 5183975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 20165814 - 20165964
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20165814 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaacctatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 20165913  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165914 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 20165964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 47740331 - 47740481
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  47740331 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 47740430  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47740431 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 47740481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10028673 - 10028521
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggta--cccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10028673 ggtgacaactagggtatacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaact 10028574  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10028573 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 10028521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 26579717 - 26579867
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26579717 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaactat 26579816  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26579817 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgatttgtgggtaaattac 26579867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35767657 - 35767519
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35767657 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 35767558  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35767557 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgg 35767519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 37846016 - 37846166
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||    
T  37846016 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaattat 37846115  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846116 cttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 37846166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31587031 - 31586882
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31587031 ggtgagaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31586932  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31586931 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaatta 31586882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29447022 - 29446871
Alignment:
Q  64 tcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  29447022 tcggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-actccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 29446924  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29446923 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 29446871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45482841 - 45482691
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45482841 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatcagtcacataagcatatttttaagtgatatccatgaactat 45482742  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45482741 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 45482691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 48609677 - 48609827
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  48609677 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaattat 48609776  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48609777 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattac 48609827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15877724 - 15877583
Alignment:
Q  75 tagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgacccc 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877724 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 15877625  T
Q  175 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15877624 accaacaaattgctcattttcatttgttagtgggtaaattac 15877583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5712351 - 5712201
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5712351 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 5712252  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5712251 cttgaccccactaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattac 5712201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33332971 - 33332822
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  33332971 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagcatatttttaagtggtatc-atgaactat 33332873  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332872 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 33332822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 35757020 - 35757169
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35757020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc-atgaacta 35757118  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35757119 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttggtggataaatta 35757169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43499668 - 43499518
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43499668 ggtgagaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatatacattggccacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 43499569  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43499568 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 43499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31625886 - 31625737
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31625886 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgg-taatttactccaaccaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31625788  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31625787 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattac 31625737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33870424 - 33870279
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||    
T  33870424 gtgacaactagagtacccat---agaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtattcatgaactatc 33870328  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33870327 ttgaccccaccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaatta 33870279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19563630 - 19563481
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  19563630 ggtgacaattagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccttaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 19563531  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19563530 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaatta 19563481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 203
Target Start/End: Original strand, 28233936 - 28234073
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28233936 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28234035  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28234036 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttg 28234073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 215
Target Start/End: Original strand, 41990870 - 41991007
Alignment:
Q  78 ggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccacc 177  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41990870 ggtacccatggaagaatggtgagtaatttatccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgaccccacc 41990969  T
Q  178 aacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41990970 aacaaattgctcattttcattggttggtgtgtaaatta 41991007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 31429475 - 31429622
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31429475 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgagtaatttacttcaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgtactat 31429574  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaat 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31429575 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaat 31429622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 30076527 - 30076658
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30076527 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttacgccaactaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 30076626  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcat 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30076627 cttgaccccaccaacaaattgatcattttcat 30076658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 45063357 - 45063505
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45063357 ggtgacaactagagtaccaatgaaagaatggtggataatttacctcaac--atacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45063454  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063455 cttgactccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 45063505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10618474 - 10618331
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10618474 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtattcatgaactat 10618375  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10618374 -------ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 10618331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Original strand, 33720070 - 33720186
Alignment:
Q  100 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33720070 gtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccatcaacaaattgctcatttttattg 33720169  T
Q  200 gttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  33720170 gttggtgggtaaattac 33720186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44405531 - 44405412
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44405531 ggtgacaactagaatacccatggaagaatggtaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 44405432  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaatt 185  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  44405431 cttgaccctaccaataaatt 44405412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 35752034 - 35752173
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  35752034 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 35752122  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35752123 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 35752173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41904388 - 41904272
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41904388 ggtgacaactaggatacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41904289  T
Q  166 cttgaccccaccaacaa 182  Q
    ||||||| |||||||||    
T  41904288 cttgacctcaccaacaa 41904272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 24923024 - 24923163
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||||| |||    
T  24923024 ggtgacaactaggctacccatgaaagaaggatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaattat 24923112  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24923113 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 24923163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43489390 - 43489251
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  43489390 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43489302  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43489301 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 43489251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44564497 - 44564372
Alignment:
Q  90 agaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctc 189  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||     
T  44564497 agaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatctatgaactatcttgacaccactaataaattgctt 44564398  T
Q  190 attttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  44564397 atttttattgattggtgggtaaatta 44564372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 46898016 - 46898155
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  46898016 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 46898104  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  46898105 tttgaccccatcaataaattgctcatatttattggttggtggataaattac 46898155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33393499 - 33393361
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||           |||| | ||||||||||| |||||||    
T  33393499 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacattaacc-----------tttttaggtggtatccataaactatc 33393411  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33393410 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 33393361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2332191 - 2332052
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  2332191 ggtgacaacttgggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaatacacagtaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 2332103  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2332102 cttgatcccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 2332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 36816845 - 36816984
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  36816845 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 36816933  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 36816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37128109 - 37127970
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |           ||||||||    
T  37128109 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatattta-----------tgaactat 37128021  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37128020 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 37127970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 46817421 - 46817560
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  46817421 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 46817509  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46817510 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattac 46817560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 7876328 - 7876467
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||           ||| ||||||||||    
T  7876328 ggtgacaactaggctaccaatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtaca-----------tattcatgaactat 7876416  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7876417 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 7876467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 44003370 - 44003509
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  44003370 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 44003458  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  44003459 cttgactccaccaataaattgctcattatgattagttggtgggtaaattac 44003509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48086030 - 48085891
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  48086030 ggtgataattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 48085942  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48085941 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 48085891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Original strand, 26941541 - 26941671
Alignment:
Q  75 tagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgacccc 174  Q
    |||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||||||||||||||||    
T  26941541 taggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgacccc 26941629  T
Q  175 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941630 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 26941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7257553 - 7257414
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||           ||| |||| | ||||||| ||| ||||||    
T  7257553 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataatcatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 7257465  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7257464 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 7257414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21718288 - 21718150
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  21718288 ggtgacaactaggctacccatgaaa-aataatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 21718201  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21718200 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 21718150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24228713 - 24228574
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||           ||||||||||    
T  24228713 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactat 24228625  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24228624 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattac 24228574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 47460772 - 47460910
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  47460772 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 47460860  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47460861 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaatta 47460910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 39453484 - 39453614
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||                  ||||||||    
T  39453484 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccattacacattagtcacataaacacat------------------aactatct 39453565  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39453566 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 39453614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26371221 - 26371082
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  26371221 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcaca-----------tattcatgaactat 26371133  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26371132 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatggataaattac 26371082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 45502817 - 45502955
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||| || |||           ||||    
T  45502817 gtgacaactaaggtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagctacataagcatatttttaaatgg-----------tatc 45502905  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45502906 ttgacccaactaacaaattgctcattttcattgattggtaggtaaattac 45502955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 15643948 - 15644085
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| |||||| |    
T  15643948 tgacaactagtgtacccatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaatcaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactattt 15644036  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15644037 tgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 15644085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29610808 - 29610668
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||||||    
T  29610808 cggtggcaactatgctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 29610720  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29610719 tcttaaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 29610668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 209
Target Start/End: Original strand, 37443602 - 37443734
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | |||||||| || ||||||    
T  37443602 ggtgacaactagggtacccataaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatctataaactat 37443690  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37443691 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggt 37443734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 498188 - 498327
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  498188 ggtggcaactaggctagccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 498276  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  498277 cttgaccccacaaataaattactcattttcattagttggtgggtaaattac 498327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 216
Target Start/End: Original strand, 25037516 - 25037647
Alignment:
Q  74 ctagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccc 173  Q
    ||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||           ||||||||||||||||||    
T  25037516 ctaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaatcaatacacatcagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccc 25037604  T
Q  174 caccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25037605 caccaataaattgatcattttaattgattggtgggtaaattac 25037647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 45237533 - 45237672
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||           |||||| |||    
T  45237533 ggtgacaactaagctacccataaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaattat 45237621  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45237622 cttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 45237672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29098843 - 29098784
Alignment:
Q  157 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29098843 atgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 29098784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Original strand, 32556640 - 32556745
Alignment:
Q  100 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||           |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||    
T  32556640 gtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgtccccacaaataaattgttcattttcattg 32556728  T
Q  200 gttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  32556729 gttggtgggtaaattac 32556745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Original strand, 16482854 - 16482922
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16482854 gtggtatccataaaccatcttgaccccaccaataaattgctcattatcattgattggtgggtaaattac 16482922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44660015 - 44659876
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || ||           ||||||||||    
T  44660015 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatggataatttactccaaccgatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactat 44659927  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44659926 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 44659876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46103291 - 46103154
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||     
T  46103291 gtgacaactagactacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaactaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatt 46103203  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46103202 ttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggt-ggtaaattac 46103154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 47906758 - 47906898
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaattt-accccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||| |||||||| || ||||| || || | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||||||    
T  47906758 ggtggcaactaggctatccatgaaaaaatgatgggtaattttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 47906846  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47906847 tcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattac 47906898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29863116 - 29863048
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29863116 gtggtatccatgaactattttgattccaccaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattac 29863048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35484807 - 35484672
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| | || |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||||    
T  35484807 tgacaattaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaataatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatct 35484719  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatt 214  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35484718 tgaccccataaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 35484672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39323709 - 39323649
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39323709 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattac 39323649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39866758 - 39866698
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39866758 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgagtaaattac 39866698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41855228 - 41855093
Alignment:
Q  70 acaactagg-gtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatctt 168  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || || || |           |||||||||||    
T  41855228 acaactaggagtatccatggaagaatgatgggtaatttatccaaactaatacacattagccacataagcatatattta-----------tgaactatctt 41855140  T
Q  169 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41855139 gactccaccaataaattgctcacattcattggttggtgggtaaatta 41855093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33455189 - 33455130
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33455189 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcatttttattggttggtgggtaaatta 33455130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 215
Target Start/End: Original strand, 38448508 - 38448586
Alignment:
Q  137 cacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  38448508 cacatttttaggtgatattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaatta 38448586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39323779 - 39323712
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39323779 ggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacata 39323712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26456207 - 26456157
Alignment:
Q  151 gtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggt 201  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26456207 gtattcatgaactatcttgatcccaccaataaattgctcattttcattggt 26456157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35557798 - 35557763
Alignment:
Q  181 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557798 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 35557763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29098915 - 29098850
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa 135  Q
    ||||||||| || ||||| || || | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29098915 acaactaggctatccatgaaaaaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataa 29098850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42272244 - 42272180
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccac 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42272244 ggtgacaactagggtatc-atggaagaattatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccac 42272180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Original strand, 7720574 - 7720642
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | | |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  7720574 gtggtatccatgaactatcttaacccaatctataaattgcttatttttattggttagtggataaattac 7720642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 39866806 - 39866762
Alignment:
Q  80 tacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacat 124  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39866806 tacccatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacat 39866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 216
Target Start/End: Original strand, 30077043 - 30077075
Alignment:
Q  184 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30077043 ttgcccattttcattggttggtgggtaaattac 30077075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5882688 - 5882538
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5882688 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5882589  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882588 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 5882538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 26377204 - 26377354
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26377204 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26377303  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377304 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 26377354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 14891378 - 14891529
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14891378 cggtaacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 14891477  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891478 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 14891529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24168273 - 24168124
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24168273 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24168174  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24168173 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaatta 24168124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 11988974 - 11989124
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11988974 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 11989073  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11989074 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattac 11989124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 22551061 - 22551211
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22551061 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaggtggtatccatgaactat 22551160  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551161 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 22551211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 34527862 - 34528012
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  34527862 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 34527961  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34527962 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 34528012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2892368 - 2892220
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2892368 tgacaactagggtacccatagaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 2892269  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892268 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 2892220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 959904 - 960054
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  959904 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatctatgaattat 960003  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  960004 cttgaccccaccaacaaattgctcatttccattggttggtgggtaaattac 960054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 7393586 - 7393736
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7393586 ggtgacaattatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 7393685  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7393686 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 7393736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8615422 - 8615272
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8615422 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 8615323  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8615322 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 8615272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 18101495 - 18101645
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18101495 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18101594  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101595 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 18101645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28947269 - 28947119
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  28947269 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaattat 28947170  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947169 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 28947119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 2593852 - 2594001
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2593852 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtggataatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2593951  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2593952 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 2594001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 7345109 - 7345262
Alignment:
Q  63 atcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaac 162  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7345109 atcgatgacaactaaggtagacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 7345208  T
Q  163 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345209 tattttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 7345262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 203
Target Start/End: Original strand, 22341788 - 22341925
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22341788 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 22341887  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341888 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttg 22341925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 600074 - 599924
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  600074 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatttatcccaaccaatacaaattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 599975  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  599974 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 599924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 19415533 - 19415683
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19415533 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgagctat 19415632  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19415633 cttgaccccaccaacaaattggtcattttcattagttggtgggtaaattac 19415683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 10507908 - 10508058
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10507908 ggtgacaactagggtagccatcgaagaatggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10508007  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10508008 cttgaccccaccaacaaattgctcattatcattggttggtggataaattac 10508058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1970893 - 1970743
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1970893 ggtgacaactaaagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 1970794  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1970793 cttgaccccaccaacaaattgtttattttcattggttggtgggtaaattac 1970743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33452572 - 33452722
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33452572 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 33452671  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33452672 cttgaccccaacaacaaattattcattttcattggttggtggataaattac 33452722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 5294801 - 5294950
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5294801 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5294900  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294901 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 5294950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 5299353 - 5299502
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5299353 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5299452  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299453 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 5299502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16703539 - 16703398
Alignment:
Q  75 tagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgacccc 174  Q
    |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16703539 taggatacccatggaagaatgatgcgtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgacccc 16703440  T
Q  175 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703439 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 16703398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 24224070 - 24224220
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24224070 ggtgacaactaggatactcatgaaagaatagtaggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24224169  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24224170 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 24224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 19281056 - 19281205
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  19281056 gtgacaactaggctacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactatc 19281155  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19281156 ttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggcaaattac 19281205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 23261929 - 23262079
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23261929 ggtgacaactagggtacctatgaaagaacggtggataatttaccccaaccaatacatattaacctcataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 23262028  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23262029 cttaaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23262079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 30743448 - 30743598
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30743448 ggtgataattagggtatccatgaaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 30743547  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30743548 cttgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 30743598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 30467656 - 30467753
Alignment:
Q  119 acacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30467656 acacattagccacataagcacatgtttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgtttggtgggtaaattac 30467753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15965604 - 15965465
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||| |||    
T  15965604 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacaca-----------tattcatgaagtat 15965516  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15965515 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 15965465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 28948845 - 28948984
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |           ||| |||||| |||    
T  28948845 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcata-----------tattcatgaattat 28948933  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28948934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 28948984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7167753 - 7167614
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  7167753 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 7167665  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7167664 cttgaccccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 7167614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4487699 - 4487559
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||           |||||||||    
T  4487699 cggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatgagtacatatt-----------catgaacta 4487611  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4487610 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattac 4487559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13329545 - 13329413
Alignment:
Q  73 actagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgacc 172  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||  |||||||||||| |||    
T  13329545 actaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tatttatgaactatcttaacc 13329457  T
Q  173 ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13329456 ccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 13329413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1398724 - 1398586
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||           ||| ||||||    
T  1398724 ggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catcaactat 1398636  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1398635 cttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 1398586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3786920 - 3786782
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  3786920 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 3786832  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
     |||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3786831 attgaccccacaaataaattcttcattttcattgattggtaggtaaatta 3786782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 929741 - 929692
Alignment:
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  929741 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaatta 929692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3291179 - 3291040
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |           ||||||||    
T  3291179 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacatattagccacataagcacatattta-----------tgaactat 3291091  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3291090 cttaaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattac 3291040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18661905 - 18661830
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacat 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18661905 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacat 18661830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 215
Target Start/End: Original strand, 1939579 - 1939642
Alignment:
Q  152 tatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  1939579 tatccatgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggtttataggtaaatta 1939642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 24913096 - 24913171
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacat 141  Q
    ||||||||||| | ||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24913096 ggtgacaactaagctactcatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacat 24913171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34262401 - 34262342
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacatt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  34262401 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcacaaccaataaacatt 34262342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 216
Target Start/End: Original strand, 375797 - 375863
Alignment:
Q  150 ggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  375797 ggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattagttggtaggtaaattac 375863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 125
Target Start/End: Original strand, 375729 - 375786
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacatt 125  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  375729 tgacaattaaggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt 375786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24253564 - 24253414
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24253564 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24253465  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253464 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 24253414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31939079 - 31938929
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31939079 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 31938980  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938979 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 31938929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35626220 - 35626070
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35626220 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35626121  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626120 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 35626070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 43326379 - 43326529
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43326379 ggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataggcacatttttaagtggtatccatgaactat 43326478  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326479 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 43326529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 15398483 - 15398632
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15398483 gtgacaactagagtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 15398582  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398583 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 15398632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6901979 - 6901831
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6901979 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatct 6901880  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901879 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 6901831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27939080 - 27938929
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggta-cccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27939080 ggtgacaactagggtaacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 27938981  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27938980 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 27938929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7722231 - 7722081
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7722231 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 7722132  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7722131 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattac 7722081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39932761 - 39932611
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39932761 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggttggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39932662  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932661 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 39932611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 40886028 - 40886177
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40886028 ggtgaaaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 40886126  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40886127 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 40886177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 2484292 - 2484441
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2484292 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtagtatccatgaactat 2484391  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2484392 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 2484441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12648979 - 12648830
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12648979 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 12648880  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648879 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 12648830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15683974 - 15683823
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15683974 cggtgacaactagggtacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 15683875  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683874 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 15683823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 739704 - 739854
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  739704 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 739803  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  739804 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 739854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 3466681 - 3466831
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3466681 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 3466780  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3466781 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattac 3466831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5185154 - 5185004
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5185154 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 5185055  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5185054 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 5185004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 18479668 - 18479818
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18479668 ggtgactactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18479767  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18479768 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 18479818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 43262183 - 43262333
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43262183 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43262282  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  43262283 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtaggttaattac 43262333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 27501055 - 27501204
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27501055 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaacaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27501154  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27501155 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaatta 27501204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 211
Target Start/End: Original strand, 29789295 - 29789440
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29789295 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 29789394  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789395 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 29789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 27278474 - 27278627
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaa----c 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    |    
T  27278474 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaattatc 27278573  T
Q  163 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27278574 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 27278627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34451432 - 34451292
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34451432 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34451333  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtg 206  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34451332 attgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtg 34451292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25831702 - 25831553
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  25831702 ggtgacaaataaggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaattggtatccatgaactat 25831603  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25831602 -ttgaccccaccaacaaattgcttattttcattggttggtgggtaaattac 25831553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 28424795 - 28424943
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28424795 ggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 28424894  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28424895 cttgaccccaccaacaaattg--cattttcattggttgatggataaattac 28424943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5137897 - 5137747
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5137897 ggtgacaactagggtattaatggaagaatggtggataatttactcaaatcaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 5137798  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5137797 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 5137747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 13504742 - 13504892
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13504742 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttatcccaactaatacatattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13504841  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13504842 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 13504892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 40278858 - 40279008
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  40278858 ggtgacaactagggtattcatggaagaatgatgggtaatttatctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 40278957  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40278958 gttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 40279008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 38756487 - 38756638
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatgg-aagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38756487 ggtgacaactagggtacctatgggaagaattgtgggtaatttatctcaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 38756586  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38756587 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcatttattggtgggtaaattac 38756638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 891087 - 890939
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  891087 ggtgacaattaggatacccatggaagaatggtaggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 890989  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  890988 cttgactcgaccaacaaattgctcattttcattagttggtggataaatta 890939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40110413 - 40110266
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40110413 tgacaattaggatactcatggaagaatggtagataatttaccctaactaatatacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 40110314  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40110313 tga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 40110266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33617756 - 33617617
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  33617756 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 33617668  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33617667 cttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 33617617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 763905 - 763755
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  763905 ggtgacaactagagtatccatcaaagaatgatgggtaatttaccccaactaatacatattagccacataagtacatttttaagtgatatccatgaactat 763806  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  763805 cttaactccaccaacaaattactcatttttattggttggtgagtaaattac 763755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19295901 - 19295762
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  19295901 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tatacatgaactat 19295813  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19295812 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 19295762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 9374501 - 9374641
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||| |||||||||    
T  9374501 cggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacctaaacaca-----------tattcatgaacta 9374589  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9374590 tcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 9374641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4149847 - 4149726
Alignment:
Q  85 atggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaat 184  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||          | |||||||||||||||    
T  4149847 atggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca----------taaccccaccaacaaat 4149758  T
Q  185 tgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4149757 tgctcatttttattggttggtgggtaaattac 4149726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 23195248 - 23195387
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  23195248 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 23195336  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23195337 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23195387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27503550 - 27503411
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  27503550 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 27503462  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27503461 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 27503411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 38015514 - 38015653
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  38015514 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 38015602  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38015603 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattac 38015653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 31293989 - 31294138
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |  ||| ||| || ||||| ||||||||| |||| ||||     
T  31293989 ggtgacaactagggtacccatgtaagaatggtgggtaatttactccaaccaataaccatcaatcacgtaagcatatttttaagtggtattcatggactac 31294088  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31294089 ccggaccctaccaataatttgctcattttcattggttggtgggtaaatta 31294138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 3656568 - 3656707
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  3656568 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 3656656  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3656657 cttgaccccaaaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 3656707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5497444 - 5497305
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  5497444 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 5497356  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5497355 tttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 5497305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40632634 - 40632531
Alignment:
Q  104 tttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632634 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacc---------ggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttg 40632544  T
Q  204 gtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||    
T  40632543 gtgggtaaattac 40632531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 9424593 - 9424731
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |           ||| |||||||||||    
T  9424593 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcata-----------tattcatgaactatc 9424681  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9424682 ttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattac 9424731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Original strand, 42658671 - 42658801
Alignment:
Q  75 tagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgacccc 174  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||           |||||||||||||||||||    
T  42658671 taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgacccc 42658759  T
Q  175 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42658760 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 42658801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6973234 - 6973095
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  6973234 ggtgtcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 6973146  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6973145 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 6973095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13957841 - 13957702
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||           ||||||||||    
T  13957841 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcgcatatt-----------catgaactat 13957753  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13957752 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 13957702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 36948492 - 36948626
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||           |||||||||||||||    
T  36948492 tgacagctagggtactcatgcaagaatggtgggtaatttacccta-ccaatacacattagccacataagcacat-----------atccatgaactatct 36948579  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36948580 t-accctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 36948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14972149 - 14972010
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||| ||||||    
T  14972149 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaatcaatacacattagtcacataagcacatatt-----------cataaactat 14972061  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972060 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 14972010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27390768 - 27390633
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  27390768 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 27390680  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27390679 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaa 27390633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38492783 - 38492647
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  38492783 ggtggcaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 38492696  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatt 214  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38492695 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 38492647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2585633 - 2585494
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||  |||| |  |||||||||| ||||||    
T  2585633 ggtgacaattagggtatccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------caactttttagatggtatccataaactat 2585545  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2585544 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 2585494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 36365445 - 36365584
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||  || ||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  36365445 ggtggcaactagactatccatgaaagaatgatggctaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 36365533  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36365534 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 36365584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 18327173 - 18327311
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  18327173 ggtgataactaaggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 18327261  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  18327262 cttgactccaccaataaattgcgcattataattggttggtgggtaaatta 18327311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 215
Target Start/End: Original strand, 12558090 - 12558167
Alignment:
Q  137 cacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12558090 cacatttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccacatcaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 12558167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Original strand, 33623940 - 33624077
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||           || ||||||| |||     
T  33623940 gtgacaattagggtatccattgaaaaatggtggataatttaccccaaccgatacacattagccacataagcaca-----------tacccatgaattatt 33624028  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33624029 ttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 33624077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6207024 - 6206916
Alignment:
Q  97 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |    
T  6207024 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactattttgaccccccaaataaattgctcattttaa 6206936  T
Q  197 ttggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6206935 ttggttggtgggtaaattac 6206916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5120132 - 5120057
Alignment:
Q  140 attttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5120132 atttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattac 5120057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 24167784 - 24167923
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  24167784 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgttgagtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 24167872  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  24167873 cttgaccccaccaataaattgtttattatgattggttggtggataaattac 24167923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 38637910 - 38638049
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||           ||| |||| |  |||||||||| ||||||    
T  38637910 ggtgacaactagggtacccatggaaaaattgtgggtaatttaccccaactaataaacatt-----------cacctttttagttggtatccataaactat 38637998  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  38637999 cttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattac 38638049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 36472348 - 36472423
Alignment:
Q  141 ttttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  36472348 ttttaaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtggataaattac 36472423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 1402505 - 1402644
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||           ||| ||||   ||||||||||| ||||||    
T  1402505 ggtgataactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaactaataaacatt-----------cacctttttgggtggtatccataaactat 1402593  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  1402594 cttgatcccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattac 1402644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Original strand, 42247865 - 42247921
Alignment:
Q  160 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247865 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 42247921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 612757 - 612894
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttac-cccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||             |||| || |||||    
T  612757 ggtgacaactaggatacccatggaagaatactgagtaatttactcccaaccaatacacattagccacataagca-------------tatcaataaacta 612843  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  612844 tcttgaccccaccaataaattgttcattttca-tggttggtggttaaattac 612894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40687069 - 40686931
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| ||||  | |||||| ||| ||||||    
T  40687069 ggtgacaattagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cactttttaga-tggtattcataaactat 40686982  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  40686981 cttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattac 40686931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 3940411 - 3940470
Alignment:
Q  157 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3940411 atgaattatcttgaccgcaccaataaattgctcattttcatttgttggtgggtaaattac 3940470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Original strand, 9171111 - 9171164
Alignment:
Q  163 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9171111 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcatttgttggtggataaattac 9171164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 215
Target Start/End: Original strand, 20207088 - 20207154
Alignment:
Q  149 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20207088 tggtatccatgaactatcttaatcacatcaataaattgttcattttcattggttgatggataaatta 20207154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 216
Target Start/End: Original strand, 9527124 - 9527159
Alignment:
Q  181 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9527124 aaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 9527159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Original strand, 15300962 - 15301012
Alignment:
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15300962 cttgactccaccgataaattgctcattttcattggttgatgtgtaaattac 15301012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Original strand, 42247791 - 42247849
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacat 124  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42247791 ggtgtcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacat 42247849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 129
Target Start/End: Original strand, 3940334 - 3940399
Alignment:
Q  64 tcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc 129  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3940334 tcggtgacaactaaggtatctatggaagaatgatgagtaatttattcgaaccaatacacattagcc 3940399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23437774 - 23437624
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23437774 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23437675  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23437624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 26091258 - 26091408
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26091258 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 26091357  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091358 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 26091408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34276729 - 34276579
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34276729 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34276630  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276629 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 34276579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9798647 - 9798497
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9798647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 9798548  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 9798497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 21366609 - 21366759
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21366609 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21366708  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366709 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 21366759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44984943 - 44984793
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44984943 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44984844  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984843 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 44984793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 237659 - 237509
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  237659 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactat 237560  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  237559 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 237509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39077727 - 39077577
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39077727 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 39077628  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39077627 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattac 39077577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42085389 - 42085239
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42085389 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 42085290  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085289 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 42085239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 53461816 - 53461966
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53461816 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53461915  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53461916 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttac 53461966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 54574940 - 54575090
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54574940 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 54575039  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54575040 cttgaccccaccaccaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 54575090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6020109 - 6019960
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6020109 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatt 6020010  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020009 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 6019960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 32366661 - 32366810
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32366661 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 32366760  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32366761 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattac 32366810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 397582 - 397434
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  397582 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatct 397483  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  397482 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattac 397434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47344839 - 47344688
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  47344839 cggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatccatgaacta 47344740  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344739 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 47344688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 2826682 - 2826831
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2826682 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 2826780  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2826781 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 2826831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 31532135 - 31532285
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31532135 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31532234  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31532235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattac 31532285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 53854430 - 53854579
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53854430 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53854528  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854529 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 53854579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 18462013 - 18462163
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18462013 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtgatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 18462112  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462113 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 18462163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 19387688 - 19387838
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19387688 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 19387787  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19387788 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattac 19387838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 43471695 - 43471845
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43471695 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataatcacatttttaagtggtatccatgaactat 43471794  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43471795 cttgaccacaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 43471845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51363188 - 51363039
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51363188 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 51363090  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363089 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 51363039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31914379 - 31914231
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31914379 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc-cataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31914281  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31914280 cttgaccccaccaacaaattgctcagtttcattggttggtgggtaaatta 31914231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41560510 - 41560361
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41560510 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41560411  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41560410 cttgatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaatta 41560361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 42765842 - 42765990
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42765842 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacattagcacatttttaagtggtat-catgaactat 42765940  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42765941 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 42765990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 41702461 - 41702609
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41702461 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 41702560  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41702561 taaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaagttac 41702609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6285486 - 6285339
Alignment:
Q  69 gacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatctt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6285486 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatttt 6285387  T
Q  169 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6285386 gaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 6285339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Original strand, 55056254 - 55056409
Alignment:
Q  61 gaatcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatga 160  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  55056254 gaataggtgacaacaagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatga 55056353  T
Q  161 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55056354 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 55056409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 146429 - 146579
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  146429 ggtgacaactagagtacgcatagaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 146528  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  146529 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 146579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 3692210 - 3692360
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3692210 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcaataaactat 3692309  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692310 cttaatcccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattac 3692360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27373257 - 27373108
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27373257 ggtgacaattagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 27373159  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373158 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 27373108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29478542 - 29478392
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29478542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 29478443  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29478442 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttagtgggtaaattac 29478392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 31972336 - 31972486
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31972336 ggtgacaattagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 31972435  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31972436 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 31972486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45797661 - 45797511
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45797661 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 45797562  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45797561 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 45797511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48658000 - 48657858
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48658000 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 48657901  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48657900 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtggg 48657858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55776226 - 55776077
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55776226 ggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55776127  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55776126 cttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 55776077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55840404 - 55840255
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55840404 ggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55840305  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55840304 cttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 55840255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41949566 - 41949414
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaa--cacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41949566 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatataagcacatttttaagtggtatccatgaact 41949467  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41949466 atcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 41949414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 49881059 - 49881213
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaattta----ccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaa 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49881059 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccgcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaa 49881158  T
Q  162 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49881159 ctatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 49881213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 407934 - 407786
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  407934 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 407837  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  407836 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 407786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2243640 - 2243490
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2243640 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttactccaactaatacacataagccacataaatacatttttaagtggtatccatgaactat 2243541  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2243540 cttgacccgaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 2243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3170808 - 3170658
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  3170808 ggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 3170709  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3170708 cttgaccccaccaacaaattgttcatttttattggttggtgggtaaattac 3170658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 22618514 - 22618662
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22618514 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 22618612  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618613 cttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 22618662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23609269 - 23609119
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23609269 ggtgacaaatagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtgaactat 23609170  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23609169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttgattggtgggtaaattac 23609119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42033357 - 42033207
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42033357 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaatatacattagctacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42033258  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42033257 cttgactccaccaacaaattgctcattttaattagttggtgggtaaattac 42033207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54608144 - 54607994
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  54608144 ggtgactactagggtatccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatacatgaactat 54608045  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54608044 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 54607994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38591846 - 38591700
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||||||||||    
T  38591846 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatt----aatggtatccatgaactat 38591751  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38591750 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattac 38591700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54086590 - 54086442
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  54086590 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgcacattagccacataagcacatttttaagcggtatccatgaactat 54086491  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54086490 cttga-cccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaatta 54086442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 55520009 - 55519860
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55520009 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55519910  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  55519909 cttgatcccaccaaaaaattgctcattttcattagttggtggataaatta 55519860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 14017376 - 14017524
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  14017376 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggcaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacactt--aagtggtatccatgaactat 14017473  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14017474 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttagtgggtaaattac 14017524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 29777257 - 29777407
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  29777257 ggtgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtaaactat 29777356  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777357 ctcgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 29777407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42222473 - 42222323
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42222473 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgtgtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcaatgaactat 42222374  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42222373 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 42222323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50534809 - 50534663
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttg 169  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50534809 acaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 50534710  T
Q  170 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  50534709 accccaccaataaattgctcatttttattgattggtgggtaagttac 50534663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 50536628 - 50536774
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttg 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  50536628 acaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagtcacataaacatatttttaagtggtatccattaactatcttg 50536727  T
Q  170 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50536728 accccaccaacaaatttctcattttcatcggttggtgggtaaattac 50536774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 56022998 - 56023148
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56022998 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 56023097  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56023098 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattac 56023148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 47662102 - 47662251
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47662102 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccattaactat 47662201  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
     ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47662202 attgacaccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaatta 47662251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50234182 - 50234033
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  50234182 ggtgacaactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccattaactat 50234083  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50234082 cttgatcccaccaacaaatttctcattttcattggttggtggataaatta 50234033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 50457812 - 50457960
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50457812 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttacctcaaccaatacacattagcaacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 50457911  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50457912 tgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattac 50457960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54425165 - 54425014
Alignment:
Q  64 tcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  54425165 tcggtgacaactagtgtacc-atggaagaatcgtgggtaatttaccccaaccaatagacattagtcacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 54425067  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54425066 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattac 54425014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 31070074 - 31070223
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31070074 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacatgagcacatttttaagtggtat-catgaactat 31070172  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31070173 cttgactccaccagcaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 31070223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35446683 - 35446538
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35446683 acaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccaaataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35446584  T
Q  170 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35446583 accccatcaacaaattgctcattttcattggtcggt-ggtaaattac 35446538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Original strand, 52728307 - 52728448
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  52728307 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacgcattagtcacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 52728405  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52728406 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 52728448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 36532830 - 36532956
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36532830 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36532929  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcatt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36532930 cttgaccccaccaacaaattgctcatt 36532956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48313737 - 48313589
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48313737 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaaccaatatatattagctacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 48313639  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313638 cttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 48313589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 53834055 - 53834204
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53834055 gtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacttcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 53834154  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53834155 ttgaccgcaccaacaaattgctcattttcattgattgttgggtaaattac 53834204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Original strand, 22468788 - 22468920
Alignment:
Q  84 catggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaa 183  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22468788 catggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatctatgaactatcttgatcccaccaacaaa 22468887  T
Q  184 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22468888 ttgctcattttcattggttggtggataaattac 22468920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1932945 - 1932795
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||| || || | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1932945 ggtgataactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 1932846  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932845 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattac 1932795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Original strand, 33897504 - 33897645
Alignment:
Q  75 tagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgacccc 174  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33897504 tagggtacctatagaagaatggtgggtaatttattccaattaatacacattagccatataatcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 33897603  T
Q  175 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33897604 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 33897645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 41632007 - 41632156
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  41632007 ggtgacaactaggatacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagtacatttttaagcgatatccatgaactat 41632106  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41632107 cttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 41632156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 39587796 - 39587929
Alignment:
Q  83 ccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587796 ccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagttatataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 39587895  T
Q  183 attgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39587896 attgctcatattcattggttggtaggtaaattac 39587929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48655002 - 48654847
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacat------tagccacataaacacattttgaagtggtatccatg 159  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||     
T  48655002 ggtgacaattagggtagccatggaagaatggtaggtaatttaccccaaccaatacacatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatc 48654903  T
Q  160 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48654902 aactatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 48654847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 48259512 - 48259660
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48259512 ggtgataagtagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacatattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaactat 48259609  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48259610 cttgactccaccaactaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 48259660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 54805614 - 54805768
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa----acacattttgaagtggtatccatgaa 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  54805614 ggtgacatctagggtacccatggaacaatgatgagtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaataaacacatttttaagtggtatctatgaa 54805713  T
Q  162 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54805714 ctatcttaatcccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattac 54805768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 9997931 - 9998070
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  9997931 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 9998019  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9998020 cttgatcccaccaataaattactcatattcattggttggtgggtaaattac 9998070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42509478 - 42509351
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42509478 ggtgataactagggtactcatggaagaatggtggataatttatcctaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42509379  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattt 193  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42509378 tttgaccccaccaataaattggtcattt 42509351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 45633776 - 45633918
Alignment:
Q  63 atcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaac 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||||||    
T  45633776 atcggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 45633864  T
Q  163 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45633865 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 45633918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35595869 - 35595772
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35595869 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35595772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51951861 - 51951714
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  51951861 tgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacac-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaactgatatccatgaactatct 51951763  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51951762 tgactccattaacaaattgttcattttcattgattggtggataaattac 51951714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43891099 - 43890960
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  43891099 ggtgacaactatggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 43891011  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43891010 attgactccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 43890960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54715206 - 54715067
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  54715206 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaactaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 54715118  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54715117 gttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 54715067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 5117437 - 5117577
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||||||  || ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||||||    
T  5117437 cggtgacaactagactatccattaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 5117525  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5117526 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 5117577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 15060289 - 15060428
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  15060289 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 15060377  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15060378 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 15060428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22620764 - 22620625
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  22620764 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 22620676  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22620675 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 22620625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 37239090 - 37239229
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  37239090 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 37239178  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37239179 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 37239229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 38547601 - 38547740
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  38547601 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 38547689  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38547690 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 38547740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52461534 - 52461395
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  52461534 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 52461446  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52461445 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 52461395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52396865 - 52396774
Alignment:
Q  110 ccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc-ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396865 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatctttaaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 52396774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35344968 - 35344868
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35344968 gtgacaactaggatacctatggaagaatggtggataatttacca-aaccaatacacattagccacataagcacattttcaagtggtatccatgaactatc 35344870  T
Q  167 tt 168  Q
    ||    
T  35344869 tt 35344868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 4486581 - 4486720
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||| |||    
T  4486581 ggtgacaactagactatctatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaattat 4486669  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4486670 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 4486720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 20351842 - 20351981
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  20351842 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 20351930  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351931 cttgatcccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 20351981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 31881314 - 31881453
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  31881314 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31881402  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31881403 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 31881453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33049062 - 33048994
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33049062 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa 33048994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34552490 - 34552351
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  34552490 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccgcataagcaca-----------tattcatgaactat 34552402  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34552401 cttgacaccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 34552351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34835348 - 34835209
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| |  |||||| ||| ||||||    
T  34835348 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttagatggtattcataaactat 34835260  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34835259 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 34835209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47812077 - 47811938
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  47812077 ggtgacaattagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 47811989  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47811988 cttgactcaatcaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaattac 47811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 54216736 - 54216875
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  54216736 ggtgataactagggtatccatggaagaatggagggtaatttatcccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactat 54216824  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54216825 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattac 54216875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52688521 - 52688381
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |           ||| |||||||||    
T  52688521 cggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcata-----------tattcatgaacta 52688433  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    | |||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52688432 ttttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 52688381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54216482 - 54216346
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||           ||||||||||||    
T  54216482 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatcgataatttaccccaaccaatacacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 54216394  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54216393 tgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 54216346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 27398607 - 27398742
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttg 169  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||            ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27398607 acaactagggtaccaatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattt-----------acatttttaagtggtatccataaactatcttg 27398695  T
Q  170 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  27398696 accccaccaataaattgcgcattatgattggttggtgggtaaattac 27398742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 46708741 - 46708880
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| || | ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  46708741 ggtgacaactaggctatcaatgaaagaatgatgggtgatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 46708829  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46708830 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 46708880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46720195 - 46720057
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||       |||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  46720195 acaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacat-------atat-cacctttttaggtggtatccataaactatcttg 46720104  T
Q  170 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46720103 accccatcaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 46720057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49014269 - 49014130
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||           ||||||||||    
T  49014269 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagtacatatt-----------catgaactat 49014181  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49014180 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattac 49014130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27872750 - 27872612
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  27872750 ggtgacaactacggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 27872662  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27872661 cttgatcccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaatta 27872612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Original strand, 14335172 - 14335240
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335172 gtggtatctatgaactatcttgaccctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 14335240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33289873 - 33289736
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||| ||||||||||    
T  33289873 ggtgacaa-taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaactat 33289786  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33289785 cttgatcctacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaatta 33289736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 27873550 - 27873687
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  27873550 ggtgacaactaggctacccaa--aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 27873636  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27873637 cttaaccccacaaataaattactcattttcattgattggtggataaattac 27873687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 143
Target Start/End: Original strand, 48259704 - 48259780
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattt 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48259704 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacatattagccacataagcacattt 48259780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 573974 - 573835
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  573974 ggtgacaactagtgtactcatggaaaaatagtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaactat 573886  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  573885 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtaggtaaattac 573835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 6371249 - 6371388
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | |||||| || | || |||    
T  6371249 ggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtaaccctaaattat 6371337  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6371338 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattac 6371388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27580219 - 27580151
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27580219 gtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 27580151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 215
Target Start/End: Original strand, 33557960 - 33558080
Alignment:
Q  84 catggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaa 183  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||           |||||||||||||||||| || || |||    
T  33557960 catgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaatacatatt-----------catgaactatcttgaccctacaaataaa 33558048  T
Q  184 ttgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33558049 ttcctcattttcattggttggtggataaatta 33558080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Original strand, 1662330 - 1662398
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  1662330 gtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtaggtaaattac 1662398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 3293102 - 3293162
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3293102 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 3293162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43231601 - 43231534
Alignment:
Q  149 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  43231601 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttgatggataaattac 43231534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 211
Target Start/End: Original strand, 51981479 - 51981613
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| ||||||  |||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  51981479 ggtgataactagtctaccaatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 51981567  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 211  Q
    ||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51981568 cttaatcccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaa 51981613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 11972208 - 11972268
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11972208 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgagtaaattac 11972268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42557666 - 42557614
Alignment:
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42557666 atcttgaccccaccaacaaattactcatttttattggttggtgggtaaattac 42557614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 42558367 - 42558270
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||        ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42558367 ggtgacaactaagatacccatggaagaatggtggataatttaccctaatcaatacacattagcc--------acatttttaagtggtatctatgaactat 42558276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Original strand, 3291805 - 3291873
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 134  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3291805 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 3291873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Original strand, 1662261 - 1662313
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaat 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  1662261 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaat 1662313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 49057940 - 49058007
Alignment:
Q  149 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49057940 tggtatctatgaactattttaacctcatcaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattac 49058007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Original strand, 14335101 - 14335153
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaat 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14335101 ggtgacaactagagtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaaacaat 14335153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Original strand, 18206589 - 18206661
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactat----cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   ||||||||||    
T  18206589 gtggtatccatgaactatatatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattac 18206661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Original strand, 47105108 - 47105148
Alignment:
Q  158 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcatt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  47105108 tgaactatcttgaccccatcaataaattgttcattttcatt 47105148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 108)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3611318 - 3611168
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3611318 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 3611219  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611218 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 3611168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31308183 - 31308033
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31308183 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31308084  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308083 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 31308033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45538335 - 45538185
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45538335 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45538236  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 45538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 21139412 - 21139562
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21139412 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21139511  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139512 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 21139562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44662152 - 44662002
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44662152 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 44662053  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662052 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 44662002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 25678259 - 25678408
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25678259 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25678358  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678359 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 25678408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Original strand, 4068689 - 4068833
Alignment:
Q  72 aactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgac 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4068689 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 4068788  T
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068789 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 4068833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43251891 - 43251743
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43251891 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43251792  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251791 tgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 43251743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 17994951 - 17995101
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17994951 ggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 17995050  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17995051 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 17995101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 26085398 - 26085548
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26085398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 26085497  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085498 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 26085548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26277359 - 26277209
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26277359 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacaaatttttaagtggtatccatgaactat 26277260  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277259 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 26277209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26794482 - 26794337
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26794482 acaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttg 26794383  T
Q  170 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794382 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 26794337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5981352 - 5981202
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5981352 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5981253  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5981252 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 5981202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25058870 - 25058720
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25058870 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25058771  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058770 tttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 25058720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33112818 - 33112967
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33112818 ggtgacaactagggtacc-atgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33112916  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33112917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttac 33112967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 38790197 - 38790347
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38790197 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccataaactat 38790296  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38790297 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 38790347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 6327548 - 6327697
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6327548 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtca-ataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6327646  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327647 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 6327697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 23932509 - 23932659
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23932509 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctgatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtgtccatgaactat 23932608  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932609 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23932659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23984937 - 23984787
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23984937 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23984838  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23984837 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttgatgggtaaattac 23984787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 24245025 - 24245175
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24245025 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24245124  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245125 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 24245175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31040891 - 31040741
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31040891 ggtgacaactagggtacccatggaataatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 31040792  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31040791 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattac 31040741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 37620192 - 37620342
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37620192 ggtgacaactagggtacacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaggacatttttaagtggtatccatgaactat 37620291  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37620292 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattac 37620342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39646750 - 39646600
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39646750 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagttacataagcacatttttaagtggtatccatgacctat 39646651  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39646650 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 39646600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47671768 - 47671619
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47671768 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47671669  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47671668 cttgacccctccaacaaatagctcattttcattggttggtcggtaaatta 47671619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36566512 - 36566372
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36566512 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36566413  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36566412 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtg 36566372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 35692663 - 35692814
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35692663 ggtgacaactagagtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagcggtatccatgaactat 35692762  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg-taaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35692763 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggataaattac 35692814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24885683 - 24885533
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24885683 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattatccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 24885584  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885583 cttgaccccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattac 24885533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33884270 - 33884120
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  33884270 ggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactat 33884171  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884170 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 33884120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33959982 - 33960132
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  33959982 ggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactat 33960081  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33960082 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 33960132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41999997 - 41999847
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41999997 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 41999898  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41999897 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattac 41999847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50774399 - 50774249
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50774399 ggtgacaactagggtacccatggaagaaaggtgggtaatttatcccaaccaatacacattggtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 50774300  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50774299 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggttaattac 50774249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35273778 - 35273629
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35273778 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtgtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35273679  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35273678 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaatta 35273629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 42313361 - 42313510
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  42313361 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtattaatgaactat 42313460  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42313461 cttgactccaccaataaatttctcattttcattggttggtgggtaaatta 42313510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46616731 - 46616581
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  46616731 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 46616632  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46616631 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattac 46616581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47317497 - 47317347
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47317497 ggtgacaactagggtacccatagaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 47317398  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47317397 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgaataaattac 47317347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 47383732 - 47383882
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47383732 ggtgacaactagggtaccaatgaaagaatggtgggtaatttatcccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47383831  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47383832 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 47383882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3285582 - 3285435
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3285582 gtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatc 3285484  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3285483 ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaatta 3285435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2450676 - 2450529
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2450676 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgataggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 2450577  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaat 213  Q
    |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2450576 cttgattccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaat 2450529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28888760 - 28888613
Alignment:
Q  69 gacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatctt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28888760 gacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatctcaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 28888661  T
Q  169 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888660 gatcccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattac 28888613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5980250 - 5980100
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5980250 ggtgacagctagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagctaatttttaagtggtatccattaactat 5980151  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5980150 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 5980100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 26524889 - 26525039
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||    
T  26524889 ggtgacaactagggtatccatggaagaatagtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatctataaactat 26524988  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26524989 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 26525039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 38331859 - 38332009
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  38331859 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactat 38331958  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38331959 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtgggtaaattac 38332009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 46967041 - 46967191
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46967041 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaacaaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46967140  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46967141 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 46967191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47187287 - 47187137
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47187287 ggtgacaactacggtacccatgaaagaatggtggataatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 47187188  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47187187 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattac 47187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 49253975 - 49254125
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  49253975 ggtgataattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagcacatttttaagtggtatccataaactat 49254074  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49254075 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 49254125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 49398988 - 49399138
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  49398988 ggtgacaactaggatacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaactat 49399087  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49399088 cttaactccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattac 49399138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51057253 - 51057103
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51057253 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacctcaactaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgatctat 51057154  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51057153 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattac 51057103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31844529 - 31844409
Alignment:
Q  95 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31844529 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacctcaccaacaaattgctcatttt 31844430  T
Q  195 cattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31844429 cattggttggtgggtaaatta 31844409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42864034 - 42863898
Alignment:
Q  79 gtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccacca 178  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42864034 gtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactatcttgaccccacca 42863935  T
Q  179 acaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42863934 acaaatagctcattttcattggttggtgggtaaatta 42863898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 23220939 - 23221079
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23220939 acaactagggtacccatggaagaatggtggata------cccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 23221032  T
Q  170 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221033 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23221079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46784605 - 46784455
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46784605 ggtgacaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46784506  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46784505 ctttacttctccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 46784455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36003315 - 36003162
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaag---ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaac 162  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36003315 ggtgacaactagggtacctatgaaagaagaatggtgggtaatttatccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 36003216  T
Q  163 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36003215 tatcttgaccccaccagtaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 36003162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 207
Target Start/End: Original strand, 51045596 - 51045737
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  51045596 ggtgacaactaggatacccgtagaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcataaactat 51045695  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51045696 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgg 51045737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25518952 - 25518846
Alignment:
Q  110 ccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518952 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 25518853  T
Q  210 aaattac 216  Q
    |||||||    
T  25518852 aaattac 25518846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4808827 - 4808699
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4808827 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4808728  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  4808727 cttgaccctatcaataaattgttcatttt 4808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48373677 - 48373536
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48373677 ggtgacaactaaggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacataagc---------acatttttaagtggtatccatgaactat 48373587  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373586 cttgaccccaccaataaactgctcattttcattggttggtgggtaaattac 48373536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Original strand, 45475848 - 45475987
Alignment:
Q  69 gacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatctt 168  Q
    |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  45475848 gacaactagggtacca--gaaagaatggtgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatcaactatctt 45475944  T
Q  169 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45475945 gaccccaccaataaattgctcattttcattgattggtgggtaa 45475987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33073382 - 33073243
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  33073382 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 33073294  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33073293 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 33073243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2657477 - 2657335
Alignment:
Q  63 atcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaac 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||||||    
T  2657477 atcggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 2657389  T
Q  163 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657388 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 2657335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 27983603 - 27983737
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||               
T  27983603 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtat----------- 27983691  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27983692 -----ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 27983737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4156576 - 4156438
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta- 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||     
T  4156576 ggtgacaactagagtacccatggaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtggtatccataaactat 4156477  T
Q  165 ------tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcat 197  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4156476 attgagtcttgaccccaccaacaaattggtcattttcat 4156438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10928238 - 10928099
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  10928238 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 10928150  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10928149 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattac 10928099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 41467632 - 41467771
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  41467632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 41467720  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41467721 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 41467771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 51403034 - 51403157
Alignment:
Q  83 ccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 182  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| || |||         ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51403034 ccatggaagaatggtgagtaatttatcccaaccaatacatataagc---------acatttt-aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 51403123  T
Q  183 attgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51403124 attgctcattttcattggttggtgggtaaattac 51403157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 198
Target Start/End: Original strand, 47772172 - 47772304
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || ||||||    
T  47772172 ggtgacaattaaggtacccatggaagaatggtgtgtaatttactccaaccaatatacattagtcacataaacacatttttaaatggtatatataaactat 47772271  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcatt 198  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47772272 tttgaccctaccaacaaattgcttattttcatt 47772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 6626025 - 6626163
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||||||||||    
T  6626025 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatc 6626113  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6626114 ttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 6626163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 159
Target Start/End: Original strand, 13312531 - 13312624
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatg 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13312531 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatttaagtggtatccatg 13312624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2955026 - 2954887
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |           ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  2955026 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacaat-----------cacctttttaagtggtatccattaactat 2954938  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  2954937 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattac 2954887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Original strand, 26472185 - 26472318
Alignment:
Q  72 aactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgac 171  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||||||||    
T  26472185 aactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaagacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 26472273  T
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26472274 cccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 26472318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26686027 - 26685888
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  26686027 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaactat 26685939  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26685938 cttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 26685888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29770841 - 29770702
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  29770841 ggtggcaactaggctacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 29770753  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29770752 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattac 29770702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 30289910 - 30290049
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  30289910 ggtgacaactaaggtactcatggaagaatggtggataatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcaca-----------tattcatgaactat 30289998  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30289999 cttgactccaccaataaattgctcatattcactggttggtgggtaaattac 30290049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 38716247 - 38716386
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| || |||    
T  38716247 ggtgacaacaagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaattat 38716335  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38716336 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 38716386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 215
Target Start/End: Original strand, 2556885 - 2556995
Alignment:
Q  96 gtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2556885 gtgggtaatttaccccaaccaatacaca---------taaacacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaacagattgctcattttc 2556975  T
Q  196 attggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||| ||| |||| |||||||    
T  2556976 attagttagtggataaatta 2556995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 216
Target Start/End: Original strand, 31979998 - 31980085
Alignment:
Q  129 cacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979998 cacataaggacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaacaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 31980085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1388644 - 1388505
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  1388644 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 1388556  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  1388555 cttgaccctaccaataaattgctcatcatgattggttggtgggtaaattac 1388505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 4243490 - 4243629
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||| ||||||    
T  4243490 ggtgacaactagactacccatgaaagaattatgggtaatttaccccatccaatacacattagccacataagcacatatt-----------cataaactat 4243578  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4243579 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattac 4243629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4953223 - 4953084
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  4953223 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 4953135  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4953134 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 4953084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 41895164 - 41895303
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  41895164 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 41895252  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  41895253 cttgacctcacaaataaattgctaattgttattggttggtgggtaaattac 41895303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42235010 - 42234872
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  42235010 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 42234923  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42234922 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 42234872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 51155590 - 51155728
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  51155590 ggtgacagctaaggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagtcacataaacacatatt-----------catgaactat 51155677  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51155678 cttgactccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattac 51155728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33187505 - 33187373
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 ||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  33187505 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaat-----------------acatatttttaagtggtatctataaactat 33187423  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33187422 cttgatccaaccaataaattgctcattttcattggttggtgtgtaaatta 33187373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 13313249 - 13313313
Alignment:
Q  152 tatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13313249 tatccatgaactatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 13313313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 48683330 - 48683469
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  48683330 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 48683418  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48683419 cttgactccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattac 48683469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 5961267 - 5961405
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  5961267 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 5961355  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5961356 cttgatcccaccaataaattgctcattatgatttgttggtgggtaaatta 5961405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Original strand, 34752320 - 34752453
Alignment:
Q  72 aactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgac 171  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||||| |     
T  34752320 aactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatcttaag 34752408  T
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34752409 cccacaaataaattgctcattttatttggttggtgggtaaattac 34752453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10920371 - 10920232
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  10920371 ggtgacaactaaggtatccatggaaaaatggtcggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 10920283  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  10920282 cttgaccccaccaataaattgtgcattatgattggttggtgggtaaattac 10920232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Original strand, 27924729 - 27924797
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27924729 gtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 27924797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32448740 - 32448680
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32448740 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 32448680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 39475783 - 39475921
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||| ||||||||||| || ||           |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  39475783 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggttatttatcccaaccaataaacgtt-----------cacatttttaggtggtatccataaactat 39475871  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39475872 cttgaccc-accaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 39475921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52367983 - 52367915
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52367983 gtggtatccataaactatcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 52367915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Original strand, 7561528 - 7561591
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7561528 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagcc 7561591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Original strand, 44544125 - 44544184
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44544125 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatta 44544184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Original strand, 46428282 - 46428392
Alignment:
Q  95 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||           |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  46428282 ggtggataatttactctaaccaatacacattagccatataaacacatatt-----------catgaactatcttgaccccatcaataaattgctcatatt 46428370  T
Q  195 cattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  46428371 cattggttgctgggtaaattac 46428392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52324110 - 52323970
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||  |||||           ||| |||| | ||||||| ||| || |||    
T  52324110 ggtgacaactagggtacccatggaagattggtgggtaatttactccaatcaatgaacattt----------cacctttttaggtggtattcataaattat 52324021  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52324020 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattac 52323970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Original strand, 24649802 - 24649860
Alignment:
Q  157 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649802 atgaactatcttgaccccaccaataaataactcattttcattggttggtgggtaaatta 24649860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 13281597 - 13281701
Alignment:
Q  101 taatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  13281597 taatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactattttgaccccacaaataaattgttcattgtcattgg 13281685  T
Q  201 ttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  13281686 ttggtgggtaaattac 13281701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 44293534 - 44293594
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44293534 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttgatgggtaaattac 44293594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24215903 - 24215806
Alignment:
Q  97 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |           ||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||    
T  24215903 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacata-----------tattcatgaactatcttgatcctacaaataaattgctcattttca 24215815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Original strand, 31286503 - 31286612
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  31286503 cggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaacta 31286591  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaatt 185  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  31286592 tcttgaccccaccaataaatt 31286612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Original strand, 7561632 - 7561681
Alignment:
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7561632 ttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 7561681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 35991634 - 35991738
Alignment:
Q  101 taatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||           ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |    
T  35991634 taatttaccccaaccaatacatattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcaattg 35991722  T
Q  201 ttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35991723 ttggtggataaattac 35991738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39637996 - 39637943
Alignment:
Q  149 tggtatccat-gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39637996 tggtatccattgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggt 39637943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32448807 - 32448754
Alignment:
Q  69 gacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacac 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32448807 gacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacac 32448754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 38718167 - 38718309
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttac-cccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |     |||  ||||||||    
T  38718167 ggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttactcccaaccgatatacattagccacataagcacatattca-----tatttatgaacta 38718260  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaat 213  Q
    ||||||  |||| || |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  38718261 tcttgatgccacaaataaattgttcatttttattggtcggtggataaat 38718309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 31844855 - 31844818
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31844855 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaa 31844818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 39359533 - 39359502
Alignment:
Q  96 gtgggtaatttaccccaaccaatacacattag 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39359533 gtgggtaatttaccccaaccaatacacattag 39359502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 135
Target Start/End: Original strand, 44293455 - 44293524
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa 135  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  44293455 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaactaatatatattagccacataa 44293524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 109)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 47809596 - 47809747
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47809596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 47809695  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47809696 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 47809747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47257975 - 47257825
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47257975 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 47257876  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257875 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 47257825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 38416724 - 38416873
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38416724 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaactat 38416823  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416824 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 38416873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Original strand, 51170034 - 51170182
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51170034 gtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 51170133  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51170134 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 51170182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 7855114 - 7855264
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7855114 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccttgaactat 7855213  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855214 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 7855264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22399278 - 22399129
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22399278 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttt-aagtggtttccatgaactat 22399180  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22399179 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 22399129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 28048392 - 28048542
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28048392 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28048491  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048492 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 28048542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 40130959 - 40131109
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40130959 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40131058  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131059 cttgaccccacagacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 40131109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49330219 - 49330069
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49330219 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 49330120  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49330119 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 49330069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40643982 - 40643833
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||||||    
T  40643982 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatgatatccataaactat 40643883  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40643882 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 40643833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37324725 - 37324573
Alignment:
Q  64 tcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  37324725 tcggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaatatatttttaagtggtatacatgaact 37324626  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37324625 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 37324573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48609903 - 48609756
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48609903 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 48609804  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48609803 taaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaatta 48609756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24100464 - 24100315
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24100464 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtat-catgaactat 24100366  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100365 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 24100315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 32234398 - 32234547
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32234398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 32234496  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234497 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 32234547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40420017 - 40419867
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40420017 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40419918  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40419917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 40419867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41464534 - 41464384
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41464534 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgctgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41464435  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464434 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 41464384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42292024 - 42291874
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42292024 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatctatgaactat 42291925  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42291924 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 42291874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 43612047 - 43612197
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43612047 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43612146  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43612147 cttgaccacgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 43612197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 48739233 - 48739383
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  48739233 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 48739332  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48739333 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattac 48739383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 35748311 - 35748460
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35748311 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 35748410  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35748411 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 35748460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46126168 - 46126020
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  46126168 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatccatgaactat 46126070  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46126069 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaatta 46126020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 51102375 - 51102528
Alignment:
Q  63 atcggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaac 162  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  51102375 atcggtgacaactagggtaccaacggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtgatatccatgaac 51102474  T
Q  163 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51102475 tatcttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattac 51102528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 29625827 - 29625977
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29625827 ggtgataattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29625926  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29625927 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 29625977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37313581 - 37313431
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  37313581 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 37313482  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37313481 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattac 37313431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 212
Target Start/End: Original strand, 39634572 - 39634717
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39634572 ggtgacaactagggtacccatggaagaattgtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39634671  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaa 212  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39634672 -ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaa 39634717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 40804510 - 40804660
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40804510 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 40804609  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40804610 cttgatcctaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 40804660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44223011 - 44222861
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  44223011 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacaat 44222912  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44222911 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattac 44222861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52629135 - 52628986
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52629135 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 52629037  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52629036 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 52628986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 55453245 - 55453394
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55453245 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 55453344  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  55453345 ttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttgatgagtaaattac 55453394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2666182 - 2666032
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2666182 ggtgacaactagagtacccatgaaagaatagtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacagttttaagtggtatccatgaactat 2666083  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2666082 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 2666032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 20754393 - 20754543
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20754393 ggtgacaactagggtactcatggaataatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtgatatccatgaactat 20754492  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20754493 cttgactctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 20754543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 27066978 - 27067128
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  27066978 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 27067077  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27067078 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattac 27067128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 7755307 - 7755456
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  7755307 ggtgacaagtagggtacccatggaagaatgatgggttatttaccccaagcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccataatctat 7755405  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7755406 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 7755456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46134538 - 46134388
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46134538 ggtgacaattagggtatccatgaaagaatggtgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46134439  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46134438 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattac 46134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43184092 - 43183944
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43184092 tgacaactagggtacctatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43183993  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43183992 tgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 43183944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35594299 - 35594153
Alignment:
Q  70 acaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35594299 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35594200  T
Q  170 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35594199 accccatcaacaaattgctcatttttattgattggtgggtaaattac 35594153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 41293319 - 41293468
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  41293319 ggtgacaattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaattat 41293417  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41293418 cttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 41293468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43021896 - 43021746
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43021896 gtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagctacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatc 43021797  T
Q  167 ttga-ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021796 ttgacccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 43021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44806866 - 44806716
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44806866 ggtgacaactagggtacccatgaaagaattgtggataatttacttcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44806767  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806766 cttgattccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 44806716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 51452751 - 51452900
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51452751 ggtgacaattagggtacc-atggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 51452849  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452850 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 51452900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41732710 - 41732561
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41732710 ggtgacaactggggtatccatggaaggatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41732611  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  41732610 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattgattgatggataaatta 41732561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 53943588 - 53943736
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53943588 ggtgacaactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 53943686  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53943687 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaatta 53943736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52215243 - 52215108
Alignment:
Q  81 acccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac 180  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52215243 acccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccaccaac 52215144  T
Q  181 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52215143 aaattgctcatgttcattagttggtgggtaaattac 52215108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18947085 - 18946935
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  18947085 ggtgacaagtagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgtctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaactggtatccatgaactat 18946986  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18946985 cttgaccccacaaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattac 18946935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39053576 - 39053426
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39053576 ggtgacaactagagtatccataaaaaaatgatgggtaatttaccccaacgaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39053477  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053476 cttgaccccatcaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattac 39053426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43126012 - 43125863
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43126012 ggtgacaactagg-tacctataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43125914  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43125913 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattgattagtgggtaaattac 43125863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52639024 - 52638874
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  52639024 ggtgacaactagggtacccatagaataatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaagtggtatccatgaattat 52638925  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  52638924 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttcgttggtaaattac 52638874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36369120 - 36368972
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36369120 ggtgataactagagcacccatggaagatgg-tgggtaatttaccctaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36369022  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36369021 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattagttggtgggtaaatta 36368972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 53832486 - 53832634
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||| || |||||||||| ||||||||    
T  53832486 tgacaactagggaacacatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcccctttttaattggtatccataaactatct 53832585  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53832586 tgacaccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 53832634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 47894822 - 47894969
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47894822 tgacaactagggtacccatggaagaatggtggatgatttacctcaactaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 47894921  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  47894922 tgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtaggtaaatta 47894969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 51146215 - 51146365
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  51146215 ggtggcaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcaaatttttaagtggtatccatgaactat 51146314  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  51146315 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgatgtgtaaattac 51146365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24376726 - 24376605
Alignment:
Q  95 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24376726 ggtgggtaatttaccccaacaaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcatttt 24376627  T
Q  195 cattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  24376626 cattggttggtgcgtaaattac 24376605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46949538 - 46949406
Alignment:
Q  83 ccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  46949538 ccatggaagaatggtgggtaatttatcc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccgccaacaa 46949440  T
Q  183 attgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46949439 attgttcattttcattggtcggtgggtaaattac 46949406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41216637 - 41216487
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41216637 ggtgacaactagagtacctatggaagaatagtgggtaatttatcccaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41216538  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41216537 attaaccccaccaacaaattgcttattttcattggttgatggataaattac 41216487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 5560025 - 5560182
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacatta--gccacataaacacattttgaagtggtatccatgaact 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5560025 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatagacattatagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 5560124  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctc-----attttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  5560125 atcttgaccccacaaacaaattgctcatttaattttcattggttggtgggtaaattac 5560182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52864671 - 52864550
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52864671 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactc-aaccaatatacattagctacataaacacatttttaaatggtatccatgaactat 52864573  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52864572 cttgaccccaccaacaaattgct 52864550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53637990 - 53637874
Alignment:
Q  99 ggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcatt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53637990 ggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcctgaccccactaacaaattgctcattttcatt 53637891  T
Q  199 ggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  53637890 ggttggtgggtaaatta 53637874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Original strand, 33550467 - 33550582
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  33550467 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 33550566  T
Q  166 cttgaccccaccaaca 181  Q
    ||| ||||||||||||    
T  33550567 cttaaccccaccaaca 33550582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 54159000 - 54159138
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||         ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54159000 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatt-accccaaccaatacacataagc---------acatttttaagtggtatctatgaactatct 54159089  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54159090 tgactccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 54159138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37759075 - 37758962
Alignment:
Q  102 aatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  37759075 aatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatgaactatcttgacttcatcaacaaattgctcattttcattggt 37758976  T
Q  202 tggtgggtaaatta 215  Q
    || ||| |||||||    
T  37758975 tgatggataaatta 37758962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49130746 - 49130610
Alignment:
Q  69 gacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatctt 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||||||||||||    
T  49130746 gacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatctt 49130658  T
Q  169 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49130657 gacctcatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 49130610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42590001 - 42589862
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  42590001 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 42589913  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42589912 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 42589862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 38156631 - 38156771
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||||||||    
T  38156631 cggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaacta 38156719  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38156720 tcttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattac 38156771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25641817 - 25641678
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |           ||||||||    
T  25641817 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattta-----------tgaactat 25641729  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25641728 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 25641678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 34279721 - 34279860
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  34279721 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 34279809  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279810 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 34279860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37028894 - 37028755
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||    
T  37028894 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacaca-----------tattcatgaactat 37028806  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37028805 cttgactccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 37028755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 48546842 - 48546979
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||         ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  48546842 tgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttaccccaatcaatacacataagc---------acatttttaagtggtatccatgaactat-t 48546931  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48546932 tgaccc-accaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 48546979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51416140 - 51416001
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  51416140 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tatacatgaactat 51416052  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51416051 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 51416001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54401358 - 54401219
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  54401358 ggtggcaattaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 54401270  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54401269 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 54401219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 54707220 - 54707359
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  54707220 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 54707308  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54707309 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 54707359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 55000178 - 55000317
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  55000178 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 55000266  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55000267 cttgaccctacaaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattac 55000317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55380156 - 55380017
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  55380156 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 55380068  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  55380067 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 55380017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24688285 - 24688146
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  24688285 ggtgacaactaggttacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccagtagacattagccacataaacacatatt-----------catgaactat 24688197  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688196 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 24688146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25353725 - 25353586
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  25353725 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 25353637  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  25353636 cttgaccccaccaataaattgcttattatgattggttggtgggtaaattac 25353586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 47510940 - 47511079
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  47510940 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 47511028  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47511029 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 47511079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53115618 - 53115479
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  53115618 ggtgacaactagggtacctatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaagtggtatccataaactat 53115530  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53115529 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 53115479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 39141125 - 39141265
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |         || ||||||||||    
T  39141125 ggtgataactaggttacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatat---------attcatgaactat 39141214  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39141215 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 39141265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 47182131 - 47182049
Alignment:
Q  117 atacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 199  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47182131 atacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 47182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 31286793 - 31286932
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  31286793 ggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31286881  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31286882 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattac 31286932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 41635800 - 41635939
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  41635800 ggtgacaactagattacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 41635888  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41635889 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 41635939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45059052 - 45058915
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| ||           ||||||||||||    
T  45059052 tgacaactaggctgcccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatatacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 45058964  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45058963 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 45058915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 30251501 - 30251640
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  30251501 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttagcccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 30251589  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  30251590 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgagtaaattac 30251640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51143987 - 51143849
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||     
T  51143987 gtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactata 51143899  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  51143898 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 51143849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40022240 - 40022107
Alignment:
Q  71 caactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttga 170  Q
    |||||| | |||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||||||||||||    
T  40022240 caactacgctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 40022152  T
Q  171 ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40022151 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaatta 40022107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 216
Target Start/End: Original strand, 17665555 - 17665663
Alignment:
Q  97 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||           ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17665555 tgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttca 17665643  T
Q  197 ttggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17665644 ttggttggtgggtaaattac 17665663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40165822 - 40165683
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  40165822 ggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 40165734  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  40165733 cttgactccaccaataaattactcattatgattgcttggtgggtaaattac 40165683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 52756067 - 52756207
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacatta----gccacataaacacattttgaagtggtatccatgaa 161  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||| ||||| ||           ||||||    
T  52756067 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccaaaccaatacacattaattagccacataagcacatatt-----------catgaa 52756155  T
Q  162 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaat 213  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  52756156 ctatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttagtgggtaaat 52756207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 41882063 - 41882130
Alignment:
Q  149 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41882063 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 41882130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 42998790 - 42998928
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||           ||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  42998790 gtgacaactaaggtactcatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataagcatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatc 42998878  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42998879 ttgaccccaccaataaattgatcattatgattggttggtgggtaaattac 42998928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 2227995 - 2228072
Alignment:
Q  137 cacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatt 214  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  2227995 cacattttgaagtgatatctatgaactatcttgacctcaccaataaattgcttattttcattggttgatcggtaaatt 2228072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 48534007 - 48534122
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  48534007 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccgatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 48534095  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcatt 192  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  48534096 cttgaccccacaaataaattgctcatt 48534122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 50731914 - 50732053
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   |||||           |||  ||| |  |||||||||| |||||     
T  50731914 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50732002  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  50732003 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattac 50732053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50780942 - 50780803
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   |||||           |||  ||| |  |||||||||| |||||     
T  50780942 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50780854  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  50780853 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattac 50780803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 51224038 - 51224176
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  51224038 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatatattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 51224126  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51224127 cttgaccccacaaataaattgctcatttttatt-gttggtgggtaaattac 51224176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 21597220 - 21597287
Alignment:
Q  149 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21597220 tggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattac 21597287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 28576184 - 28576251
Alignment:
Q  149 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28576184 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattttcatcggttgatgggtaaattac 28576251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 30429227 - 30429314
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggta 153  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30429227 ggtgacaactagggtacctacggaagaatggtggataatttatcccaattaatacatattagtcacataaacacatttttaagtggta 30429314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 43176738 - 43176876
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||||            ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  43176738 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaataaacat-----------ccacctttttaggtggtatccataaactat 43176826  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  43176827 cttgacatcaccaataaattgttcattatgattggttggtggataaatta 43176876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 48726070 - 48726137
Alignment:
Q  149 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  48726070 tggtatccatgaactgtcttgactctaccaataaattgcttattttcattgattggtgggtaaattac 48726137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Original strand, 44946014 - 44946068
Alignment:
Q  162 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44946014 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 44946068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41609178 - 41609099
Alignment:
Q  137 cacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||| || || |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41609178 cacatttttaggtagtatccatgaactattttaactccactaataaattgctcattttcattagttggtaggtaaattac 41609099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 44945935 - 44946010
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacat 141  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44945935 ggtgacaactaggctacgcatgaaagaatgatgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacat 44946010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 216
Target Start/End: Original strand, 47402810 - 47402888
Alignment:
Q  137 cacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  47402810 cacatttttaaatggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattgttcattttcattgattgatggataaattac 47402888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 108
Target Start/End: Original strand, 41882011 - 41882053
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttac 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  41882011 ggtgacaactagggtacccgtggaagaatggtggataatttac 41882053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 52434344 - 52434291
Alignment:
Q  72 aactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacatt 125  Q
    |||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  52434344 aactagggtacctatagaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt 52434291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 37760386 - 37760346
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaattta 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37760386 gtgataactagggtacctatggaagaatggtgggtaattta 37760346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40688483 - 40688431
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaat 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  40688483 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaat 40688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48752161 - 48752117
Alignment:
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  48752161 cccaccaataaattgcacattatgattggttggtgggtaaattac 48752117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52434216 - 52434176
Alignment:
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaa 212  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  52434216 cccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaa 52434176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 11133 - 11283
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11133 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11232  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11233 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 11283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 746647 - 746497
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  746647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 746548  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 746497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17601017 - 17600867
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17601017 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 17600918  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17600917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 17600867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23901960 - 23901810
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23901960 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23901861  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901860 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23901810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45371171 - 45371022
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45371171 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45371072  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371071 cttgaccccgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 45371022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4034773 - 4034623
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4034773 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4034674  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034673 cttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 4034623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 6594458 - 6594608
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6594458 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6594557  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594558 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 6594608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11185153 - 11185003
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11185153 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11185054  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185053 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 11185003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 13815218 - 13815368
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13815218 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13815317  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815318 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 13815368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14660627 - 14660477
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14660627 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14660528  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 14660477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34518548 - 34518398
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34518548 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34518449  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518448 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 34518398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38997282 - 38997132
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38997282 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 38997183  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997182 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 38997132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40635399 - 40635249
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40635399 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40635300  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40635299 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttac 40635249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 1091951 - 1092100
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1091951 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 1092050  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1092051 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaatta 1092100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6430648 - 6430504
Alignment:
Q  72 aactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgac 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6430648 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 6430549  T
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430548 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 6430504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 10244581 - 10244732
Alignment:
Q  65 cggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10244581 cggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 10244680  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244681 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 10244732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 2324889 - 2325039
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2324889 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2324988  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2324989 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 2325039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5726310 - 5726160
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5726310 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtaaccatgaactat 5726211  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5726210 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 5726160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26710526 - 26710376
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26710526 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26710427  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710426 cttgaccccaccaacaaaatgctcattttcattggttggtgggtaaattac 26710376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 27651034 - 27651184
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27651034 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27651133  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27651134 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgggcggtgggtaaattac 27651184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10424773 - 10424626
Alignment:
Q  69 gacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatctt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10424773 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 10424674  T
Q  169 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424673 gaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 10424626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11159802 - 11159652
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11159802 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccatccaatacacaatagccacataaacacatttttaagtggcatccatgaactat 11159703  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11159702 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattac 11159652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27400584 - 27400434
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27400584 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 27400485  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27400484 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 27400434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 7892688 - 7892838
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7892688 ggtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 7892787  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7892788 attgaccccgccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattac 7892838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Original strand, 37255337 - 37255485
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37255337 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37255436  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37255437 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 37255485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4609807 - 4609657
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4609807 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttggataatttaccccaaccaatacacattaggcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4609708  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4609707 cttgaccccaccaacaaattacttattttcattagttggtgggtaaattac 4609657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9444874 - 9444726
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaag---ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaac 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9444874 ggtgacaactagggtatccatggaagaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 9444775  T
Q  163 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9444774 tatcttgaccccaccagcaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 9444726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 14697537 - 14697687
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14697537 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14697636  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14697637 cttgatcacaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattac 14697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27024596 - 27024446
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27024596 ggtgacaactagggtacccatggaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataatcatatttttaagtggtatccatgaactat 27024497  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27024496 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggtttgtgggtaaattac 27024446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32327542 - 32327392
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32327542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 32327443  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32327442 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggctggtgggtaaattac 32327392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 33427647 - 33427797
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33427647 ggtgataactagggtacccatgaaagaatggtgtgtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 33427746  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33427747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatggataaattac 33427797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 2914138 - 2914287
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2914138 ggtgacaactaggatatccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccgatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2914237  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914238 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 2914287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 32856436 - 32856585
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32856436 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatgaactat 32856535  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32856536 cttgatcccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 32856585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25295013 - 25294886
Alignment:
Q  69 gacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatctt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25295013 gacaactagggtactcatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 25294914  T
Q  169 gaccccaccaacaaattgctcattttca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25294913 gaccccaccaacaaattgctcattttca 25294886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32948626 - 32948477
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32948626 ggtgacaactagagtacccatagaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact-t 32948528  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32948527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 32948477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 37620867 - 37621020
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37620867 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatccaaaccaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37620966  T
Q  166 cttg---accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620967 cttgagtaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 37621020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40037323 - 40037174
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40037323 ggtgacaactagggtacccatgaaa-aatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 40037225  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40037224 cttgaccccaccaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattac 40037174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40735645 - 40735495
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40735645 ggtgacaattagggtactcatggaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagtacatttttaagtggtatccataaactat 40735546  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40735545 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattac 40735495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32608532 - 32608411
Alignment:
Q  95 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32608532 ggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactatcttgacaccaccaacaaattgctcatttt 32608433  T
Q  195 cattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  32608432 cattggttggtggataaattac 32608411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12842255 - 12842134
Alignment:
Q  95 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12842255 ggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaattggtatccaagaactatcttgactccaccaacaaattactcatttt 12842156  T
Q  195 cattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  12842155 cattggttggtggataaattac 12842134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 8432945 - 8433065
Alignment:
Q  95 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8432945 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtatattttaaagtggtatccatgaactatcttgaccacaccaacaaattgctcatttt 8433044  T
Q  195 cattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  8433045 cattggttggcaggtaaatta 8433065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15925255 - 15925111
Alignment:
Q  72 aactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgac 171  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15925255 aactagggtatctatgaaagaatgatggataatttacctcaaccaatacacattagctacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 15925156  T
Q  172 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15925155 cccaccaataaattactcattttcattggttgatgggtaaattac 15925111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1229809 - 1229675
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggta-cccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaacta 164  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1229809 ggtgacaacttgggtaacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatatattagccagataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 1229710  T
Q  165 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 199  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1229709 tcttgaccccatcaacaaattgttcattttcattg 1229675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41172605 - 41172489
Alignment:
Q  100 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  41172605 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtacctttgaactatcttgacctcaccaataaattactcattttcattg 41172506  T
Q  200 gttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  41172505 gttggtgggtaaattac 41172489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 173
Target Start/End: Original strand, 447633 - 447740
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  447633 ggtgacaactagggtacccatggatgaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 447732  T
Q  166 cttgaccc 173  Q
    ||||||||    
T  447733 cttgaccc 447740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39103216 - 39103078
Alignment:
Q  67 gtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||     
T  39103216 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatt 39103128  T
Q  167 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39103127 ttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 39103078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42900039 - 42899946
Alignment:
Q  123 attagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42900039 attagccacataagcgcatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 42899946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 21734900 - 21735039
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  21734900 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 21734988  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21734989 cttgacccccccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 21735039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 28641292 - 28641431
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           ||| ||||||||||    
T  28641292 ggtgacaactaggctacccatgaaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacata-----------tattcatgaactat 28641380  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28641381 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 28641431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 35158050 - 35158189
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  35158050 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 35158138  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35158139 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 35158189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29687211 - 29687072
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  29687211 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29687123  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29687122 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 29687072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145313
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatct 167  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||           |||| ||||||||||||    
T  145450 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaactatct 145362  T
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  145361 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 145313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 13543624 - 13543763
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  13543624 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 13543712  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13543713 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtaggtaaattac 13543763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 19428426 - 19428565
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  19428426 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 19428514  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19428515 cttgaccccacaagtaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattac 19428565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3711803 - 3711664
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  3711803 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcaca-----------tattcatgaactat 3711715  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3711714 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtaggtaaattac 3711664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4258659 - 4258521
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  4258659 ggtgacaactaggctacccatgaacgaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 4258571  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4258570 cttga-cccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 4258521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Original strand, 28014856 - 28014928
Alignment:
Q  104 tttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccac 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014856 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccac 28014928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44481998 - 44481859
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||           ||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  44481998 ggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacttt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 44481910  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44481909 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 44481859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12827243 - 12827137
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| | |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12827243 ggtgacaactagagcacctgtggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactat 12827145  T
Q  166 cttgaccc 173  Q
    ||| ||||    
T  12827144 cttaaccc 12827137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 43898971 - 43899108
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  43898971 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43899058  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43899059 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 43899108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 12333497 - 12333634
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||           || ||||||||||    
T  12333497 ggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 12333583  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12333584 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattac 12333634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27331472 - 27331329
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |        ||| ||||||||||    
T  27331472 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacatattagccacataagcacatata-------tattcatgaactat 27331380  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27331379 cttgaccctacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattac 27331329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 27764863 - 27765001
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  27764863 ggtggcaactaggctacccatgaaagatga-tggttaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27764950  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27764951 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 27765001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34249435 - 34249296
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||| ||||||    
T  34249435 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagtcacataagcacatatt-----------cataaactat 34249347  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34249346 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattac 34249296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 39301197 - 39301336
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||           ||||||||||    
T  39301197 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagtcatataagcacatatt-----------catgaactat 39301285  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39301286 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 39301336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35126945 - 35126811
Alignment:
Q  71 caactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttga 170  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  35126945 caactagggtatctatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatcttga 35126857  T
Q  171 ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35126856 ccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 35126811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 28566703 - 28566836
Alignment:
Q  71 caactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttga 170  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||           |||||||||||||||    
T  28566703 caactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 28566791  T
Q  171 ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28566792 ccccagaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaatta 28566836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43356266 - 43356134
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||   |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  43356266 ggtgacaactaggctaaccatgaaagaatcatgggtaatttactcaaaccaatacaaattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43356178  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 209  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43356177 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggt 43356134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12730231 - 12730092
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |           ||||||||    
T  12730231 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagtcacataagcacatattta-----------tgaactat 12730143  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12730142 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 12730092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 2688729 - 2688868
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  2688729 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 2688817  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||    
T  2688818 cttgaccctacaaataaattgctaattttcattaatcggtggataaattac 2688868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3266387 - 3266327
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266387 catgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 3266327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12814693 - 12814645
Alignment:
Q  168 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814693 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 12814645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Original strand, 40544155 - 40544211
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40544155 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaa 40544211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30545917 - 30545853
Alignment:
Q  151 gtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  30545917 gtatccacgaactatcttgaccccaccaataagttgctcatttttattgtttggtaggtaaatta 30545853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Original strand, 38985349 - 38985416
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38985349 gtggtatccatgaactatcttgacat-atcaataaattgctcattttcattggttggtgagtaaattac 38985416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 2000417 - 2000476
Alignment:
Q  157 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2000417 atgaactattttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattac 2000476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3266455 - 3266399
Alignment:
Q  68 tgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacat 124  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3266455 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacat 3266399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8056717 - 8056657
Alignment:
Q  156 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8056717 catgaactatcttcactccacaaataaatagttcattttcattggttggtgggtaaattac 8056657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42900835 - 42900781
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaataca 121  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  42900835 ggtgacaactagg-tacacatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaataca 42900781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Original strand, 40544085 - 40544143
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacat 124  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  40544085 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgtgtaatttacctcaaccaatacacat 40544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10176714 - 10176637
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattt 143  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||   ||| ||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10176714 ggtgataactagggtgtccatggaagaataatggttaatttacttcaaccaataaacattagttacataaacacattt 10176637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8056779 - 8056727
Alignment:
Q  83 ccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa 135  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8056779 ccatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagctacataa 8056727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Original strand, 13762 - 13911
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13762 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13861  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13862 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 13911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2051 - 1901
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 1952  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 1901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 39556 - 39706
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39556 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39655  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39656 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 39706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 75244 - 75394
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  75244 ggtgacaactaggttaccaatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatgcatgaactat 75343  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75344 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 75394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 176836 - 176686
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  176836 ggtgacaactaggatacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatccatgaactat 176737  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  176736 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtcggtaaattac 176686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 278190 - 278038
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagt--ggtatccatgaact 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  278190 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggggtatccatgaact 278091  T
Q  164 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  278090 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaatttac 278038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 2432 - 2582
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2432 ggtgataactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2531  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2532 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataatttac 2582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 18854 - 19004
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18854 ggtgacaactagggtacccatggaagaattgtggataatttattccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 18953  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18954 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattac 19004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32714 - 32593
Alignment:
Q  95 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32714 ggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataaacacatttttaaatggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcatttt 32615  T
Q  195 cattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  32614 cattggttggtgggttaattac 32593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 206
Target Start/End: Original strand, 4596 - 4736
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 4695  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  4696 ctttaccccaccaacaaattgttcatttttattagttggtg 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3261 - 3133
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3261 ggtgacaactaaggtatccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 3162  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3161 cttgatcccaccaacaaattgctcatttt 3133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14915 - 14776
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||| ||| ||||||    
T  14915 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtaggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 14827  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14826 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 14776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 20477 - 20616
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||| | ||||||||||| || |||    
T  20477 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaattat 20565  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20566 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttgatgggtaaattac 20616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 7122
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||           ||| ||||||||||    
T  7262 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcaca-----------tattcatgaactat 7174  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctca-ttttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7173 cttgaccccacaaataaattgctcatttttcattgattggtgggtaaattac 7122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4694
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  |||||           ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  4554 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacatt-----------cacctttttaaatggtatccatgaactat 4642  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctca-ttttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4643 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattac 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3564 - 3424
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  |||||           ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  3564 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacatt-----------cacctttttaaatggtatccatgaactat 3476  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctca-ttttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3475 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattac 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 134
Alignment:
Q  66 ggtgacaactagggtacccatggaagaagggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||  |||||           ||| |||| | ||||||| ||| ||||||    
T  272 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtggg-aatttacctcaaccaattaacatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 185  T
Q  166 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  184 cttgactccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattac 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18043 - 17938
Alignment:
Q  100 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacattttgaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||| ||| || ||| ||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  18043 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcataaaatattttgactccatcaataaattgatcatattcattg 17955  T
Q  200 gttggtgggtaaattac 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  17954 gttggtgggtaaattac 17938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19321 - 19249
Alignment:
Q  148 gtggtatccatgaactat----cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 216  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   ||||||||||    
T  19321 gtggtatccatgaactatatatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattac 19249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University