View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14798_low_12 (Length: 449)

Name: NF14798_low_12
Description: NF14798
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14798_low_12
NF14798_low_12
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (54-432)||(20909917-20910295)
chr1 (159-425)||(20109286-20109552)
chr1 (207-431)||(21134528-21134753)
chr1 (80-432)||(20953698-20954048)
chr1 (205-432)||(36134662-36134891)
chr1 (245-432)||(20255541-20255728)
chr1 (78-430)||(19717999-19718348)
chr1 (245-432)||(20883275-20883462)
chr1 (268-432)||(51655882-51656046)
chr1 (270-432)||(153728-153890)
chr1 (268-432)||(3172212-3172376)
chr1 (268-432)||(7507926-7508090)
chr1 (268-432)||(35648109-35648273)
chr1 (268-432)||(38095666-38095830)
chr1 (270-431)||(21878359-21878519)
chr1 (245-431)||(22643399-22643584)
chr1 (268-432)||(5833842-5834006)
chr1 (268-432)||(36246430-36246594)
chr1 (268-432)||(47617957-47618122)
chr1 (268-432)||(12623235-12623399)
chr1 (316-433)||(18516674-18516788)
chr1 (276-431)||(22464227-22464383)
chr1 (245-432)||(19169749-19169936)
chr1 (270-432)||(4167848-4168010)
chr1 (270-432)||(12731136-12731298)
chr1 (270-432)||(12741729-12741891)
chr1 (270-432)||(19179549-19179711)
chr1 (347-432)||(35400661-35400747)
chr1 (245-396)||(23067484-23067635)
chr1 (342-432)||(7679838-7679929)
chr1 (268-432)||(21864250-21864414)
chr1 (342-425)||(26561074-26561158)
chr1 (275-432)||(7744507-7744659)
chr1 (244-304)||(7744431-7744491)
chr1 (392-432)||(23065435-23065475)
chr1 (16-52)||(20910827-20910863)
chr1 (155-217)||(18516554-18516616)
chr1 (261-371)||(26898554-26898662)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (80-432)||(14008072-14008423)
chr3 (200-432)||(12397602-12397833)
chr3 (190-432)||(14131362-14131603)
chr3 (205-432)||(30053697-30053926)
chr3 (205-432)||(49665835-49666064)
chr3 (243-432)||(22141232-22141423)
chr3 (78-429)||(12962420-12962769)
chr3 (245-432)||(14581876-14582063)
chr3 (268-432)||(15833881-15834047)
chr3 (270-431)||(16658151-16658313)
chr3 (205-432)||(18142295-18142524)
chr3 (245-432)||(15662076-15662263)
chr3 (245-432)||(16670515-16670702)
chr3 (161-432)||(16793727-16793994)
chr3 (243-432)||(13654393-13654578)
chr3 (243-432)||(52920893-52921083)
chr3 (268-432)||(16476939-16477103)
chr3 (245-432)||(1054386-1054573)
chr3 (268-432)||(5627410-5627574)
chr3 (268-432)||(5875688-5875852)
chr3 (268-432)||(24660579-24660743)
chr3 (268-432)||(39372733-39372897)
chr3 (245-432)||(17962087-17962275)
chr3 (270-432)||(16390993-16391155)
chr3 (268-432)||(5511356-5511520)
chr3 (268-432)||(5547016-5547180)
chr3 (268-432)||(8775354-8775518)
chr3 (268-432)||(12296211-12296375)
chr3 (268-432)||(18484723-18484887)
chr3 (268-432)||(20721774-20721938)
chr3 (268-432)||(41684339-41684503)
chr3 (245-432)||(9005860-9006047)
chr3 (268-429)||(4744402-4744563)
chr3 (268-432)||(13122323-13122487)
chr3 (320-432)||(21317785-21317894)
chr3 (245-432)||(29905539-29905727)
chr3 (245-432)||(29946704-29946892)
chr3 (340-432)||(29951019-29951112)
chr3 (245-432)||(29995858-29996046)
chr3 (340-432)||(30000173-30000266)
chr3 (301-432)||(31113384-31113515)
chr3 (342-432)||(9993376-9993467)
chr3 (270-432)||(10654694-10654856)
chr3 (270-432)||(13382676-13382838)
chr3 (270-432)||(13393270-13393432)
chr3 (243-421)||(19884014-19884192)
chr3 (342-431)||(12248931-12249021)
chr3 (341-432)||(14321147-14321240)
chr3 (245-418)||(16812258-16812434)
chr3 (316-432)||(11514277-11514390)
chr3 (268-432)||(14466252-14466416)
chr3 (342-432)||(15226447-15226539)
chr3 (268-432)||(20683191-20683355)
chr3 (268-432)||(37867108-37867272)
chr3 (245-432)||(18006991-18007179)
chr3 (342-432)||(9390687-9390778)
chr3 (270-432)||(19779047-19779209)
chr3 (270-432)||(23757959-23758121)
chr3 (347-432)||(6220188-6220274)
chr3 (342-431)||(6500485-6500575)
chr3 (342-431)||(17909469-17909559)
chr3 (342-431)||(18851167-18851257)
chr3 (347-432)||(38195404-38195490)
chr3 (341-432)||(4404948-4405040)
chr3 (347-432)||(1793955-1794041)
chr3 (347-432)||(11216194-11216280)
chr3 (347-432)||(28324319-28324405)
chr3 (342-432)||(7804014-7804105)
chr3 (352-431)||(19643124-19643201)
chr3 (382-432)||(20627106-20627156)
chr3 (390-431)||(17034073-17034114)
chr3 (391-430)||(9295050-9295089)
chr3 (243-332)||(15834111-15834201)
chr3 (268-332)||(15834025-15834090)
chr3 (268-332)||(15834068-15834133)
chr3 (390-431)||(28352726-28352767)
chr3 (390-422)||(48987267-48987299)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (205-432)||(19620494-19620721)
chr4 (200-432)||(13004286-13004519)
chr4 (245-432)||(14777834-14778021)
chr4 (245-432)||(16818732-16818920)
chr4 (275-432)||(11536559-11536716)
chr4 (243-432)||(13575590-13575779)
chr4 (245-432)||(10291217-10291405)
chr4 (245-432)||(11515748-11515935)
chr4 (270-432)||(15206799-15206961)
chr4 (268-432)||(10750564-10750728)
chr4 (268-432)||(10964333-10964497)
chr4 (268-432)||(27657316-27657480)
chr4 (245-432)||(15474587-15474776)
chr4 (200-432)||(15139711-15139943)
chr4 (268-432)||(36019016-36019180)
chr4 (270-431)||(18762501-18762662)
chr4 (243-432)||(18776453-18776638)
chr4 (270-432)||(30936490-30936652)
chr4 (268-432)||(16256549-16256713)
chr4 (341-432)||(16305802-16305894)
chr4 (270-432)||(451256-451418)
chr4 (270-432)||(17918732-17918894)
chr4 (270-432)||(21997093-21997255)
chr4 (270-432)||(40470006-40470168)
chr4 (342-432)||(55755300-55755391)
chr4 (347-432)||(24027579-24027665)
chr4 (363-432)||(5874081-5874151)
chr4 (320-433)||(13306558-13306668)
chr4 (347-432)||(19954456-19954542)
chr4 (347-432)||(24640963-24641049)
chr4 (381-432)||(14356740-14356791)
chr4 (381-432)||(19888714-19888765)
chr4 (150-224)||(14356608-14356682)
chr4 (316-372)||(19887886-19887941)
chr4 (389-433)||(24620019-24620063)
chr4 (318-431)||(19053676-19053785)
chr4 (307-373)||(10327933-10327998)
chr4 (391-430)||(50066858-50066897)
chr4 (78-116)||(14356543-14356581)
chr4 (390-431)||(26821119-26821160)
chr4 (390-431)||(54690919-54690960)
chr4 (80-116)||(19887659-19887695)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (200-432)||(24745-24978)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (243-432)||(25593015-25593204)
chr6 (78-430)||(20112018-20112367)
chr6 (245-432)||(19288745-19288932)
chr6 (245-432)||(11236142-11236330)
chr6 (245-432)||(18543571-18543758)
chr6 (245-432)||(17043302-17043489)
chr6 (205-425)||(21625595-21625817)
chr6 (245-432)||(19461377-19461564)
chr6 (80-432)||(16877704-16878054)
chr6 (245-432)||(25686094-25686284)
chr6 (205-432)||(13602643-13602871)
chr6 (270-432)||(18925153-18925314)
chr6 (268-432)||(17981941-17982105)
chr6 (268-432)||(17984130-17984294)
chr6 (244-432)||(22802608-22802797)
chr6 (268-432)||(26026070-26026234)
chr6 (268-432)||(27342305-27342469)
chr6 (268-432)||(27403045-27403209)
chr6 (270-432)||(27385044-27385205)
chr6 (270-432)||(27475457-27475618)
chr6 (270-431)||(4631498-4631658)
chr6 (245-430)||(13913659-13913844)
chr6 (275-432)||(19483269-19483427)
chr6 (268-432)||(12726869-12727033)
chr6 (268-432)||(16931044-16931208)
chr6 (268-432)||(32311106-32311270)
chr6 (302-432)||(14069587-14069719)
chr6 (243-432)||(31126861-31127045)
chr6 (268-432)||(3661993-3662157)
chr6 (243-432)||(17048239-17048432)
chr6 (270-432)||(25788328-25788490)
chr6 (275-432)||(27373407-27373564)
chr6 (275-432)||(27463757-27463914)
chr6 (268-432)||(26865399-26865563)
chr6 (268-432)||(34817213-34817377)
chr6 (245-432)||(20462373-20462556)
chr6 (270-432)||(9122555-9122717)
chr6 (342-432)||(12855632-12855723)
chr6 (347-432)||(32972047-32972133)
chr6 (342-432)||(20062133-20062224)
chr6 (245-432)||(25734913-25735107)
chr6 (301-433)||(16742686-16742815)
chr6 (316-432)||(18378743-18378860)
chr6 (342-422)||(25794481-25794562)
chr6 (350-432)||(29918492-29918574)
chr6 (322-373)||(13553158-13553208)
chr6 (319-370)||(13487182-13487232)
chr6 (390-431)||(18419694-18419735)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (205-432)||(88877-89105)
chr5 (205-432)||(21099132-21099360)
chr5 (245-432)||(13523684-13523871)
chr5 (243-432)||(5430346-5430536)
chr5 (245-432)||(23478859-23479048)
chr5 (275-432)||(30743497-30743654)
chr5 (268-432)||(17617208-17617373)
chr5 (268-432)||(17729065-17729230)
chr5 (268-432)||(31358682-31358847)
chr5 (243-432)||(21660711-21660902)
chr5 (268-432)||(23706918-23707082)
chr5 (268-432)||(6985827-6985991)
chr5 (268-432)||(14040126-14040290)
chr5 (268-432)||(14558584-14558748)
chr5 (268-432)||(27042796-27042960)
chr5 (268-432)||(39491498-39491662)
chr5 (268-432)||(9346073-9346237)
chr5 (268-432)||(14447601-14447765)
chr5 (268-432)||(22685532-22685696)
chr5 (268-432)||(23306375-23306539)
chr5 (268-432)||(23372041-23372205)
chr5 (268-432)||(24588672-24588836)
chr5 (268-432)||(24817452-24817616)
chr5 (268-432)||(27470090-27470254)
chr5 (268-432)||(30228063-30228227)
chr5 (268-432)||(35225602-35225766)
chr5 (268-432)||(42052890-42053054)
chr5 (277-432)||(1109728-1109883)
chr5 (268-432)||(36583107-36583271)
chr5 (268-431)||(36697760-36697923)
chr5 (270-432)||(23405962-23406124)
chr5 (268-432)||(21414799-21414963)
chr5 (268-432)||(22156634-22156798)
chr5 (268-432)||(31843489-31843653)
chr5 (341-432)||(17447295-17447387)
chr5 (270-432)||(15993895-15994057)
chr5 (342-432)||(20561910-20562001)
chr5 (270-432)||(20797211-20797373)
chr5 (342-432)||(24926722-24926813)
chr5 (270-432)||(31448052-31448214)
chr5 (270-432)||(34062136-34062298)
chr5 (270-432)||(39361846-39362008)
chr5 (352-432)||(19477582-19477663)
chr5 (270-432)||(40400551-40400713)
chr5 (347-432)||(5291142-5291228)
chr5 (365-432)||(27603984-27604052)
chr5 (342-432)||(21519647-21519738)
chr5 (316-431)||(25935801-25935912)
chr5 (268-332)||(14558726-14558790)
chr5 (80-137)||(20797037-20797095)
chr5 (390-431)||(24421430-24421471)
chr5 (390-431)||(30445834-30445875)
chr5 (390-431)||(30455206-30455247)
chr5 (390-422)||(5609278-5609310)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (205-432)||(15335484-15335712)
chr8 (205-432)||(15424549-15424777)
chr8 (205-432)||(15515853-15516081)
chr8 (205-431)||(20381824-20382051)
chr8 (243-431)||(21288883-21289073)
chr8 (245-431)||(17518527-17518714)
chr8 (80-432)||(18773112-18773454)
chr8 (245-432)||(20259022-20259209)
chr8 (245-432)||(21045652-21045839)
chr8 (245-432)||(23784021-23784208)
chr8 (268-432)||(23352595-23352759)
chr8 (268-432)||(44481775-44481940)
chr8 (245-432)||(23371253-23371440)
chr8 (270-432)||(3597836-3597999)
chr8 (278-432)||(22663635-22663790)
chr8 (245-431)||(23184724-23184911)
chr8 (78-332)||(23352363-23352617)
chr8 (270-432)||(19927526-19927689)
chr8 (268-432)||(3358646-3358810)
chr8 (268-432)||(9341817-9341981)
chr8 (245-432)||(3833431-3833618)
chr8 (270-432)||(30324740-30324902)
chr8 (268-432)||(29077402-29077566)
chr8 (268-432)||(29087653-29087817)
chr8 (268-432)||(36078608-36078772)
chr8 (268-432)||(36293574-36293738)
chr8 (316-432)||(18684963-18685082)
chr8 (316-432)||(18730528-18730647)
chr8 (268-429)||(32087714-32087875)
chr8 (268-432)||(209598-209762)
chr8 (268-432)||(723221-723385)
chr8 (268-432)||(242495-242659)
chr8 (268-432)||(795865-796029)
chr8 (342-432)||(13688049-13688140)
chr8 (270-432)||(15780156-15780318)
chr8 (270-432)||(15790745-15790907)
chr8 (270-432)||(19129402-19129564)
chr8 (342-432)||(19225623-19225714)
chr8 (342-432)||(19419040-19419131)
chr8 (245-432)||(23468865-23469051)
chr8 (363-432)||(6151743-6151813)
chr8 (316-433)||(23192162-23192276)
chr8 (347-432)||(26111905-26111991)
chr8 (316-428)||(24646822-24646935)
chr8 (342-432)||(22745951-22746042)
chr8 (347-432)||(18154423-18154509)
chr8 (245-331)||(22163893-22163979)
chr8 (316-431)||(24502247-24502358)
chr8 (382-428)||(18566284-18566330)
chr8 (382-431)||(18527707-18527756)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (243-431)||(20569948-20570136)
chr2 (205-432)||(24377552-24377779)
chr2 (245-432)||(19312374-19312562)
chr2 (275-432)||(28711172-28711330)
chr2 (243-432)||(22454417-22454607)
chr2 (245-432)||(22764326-22764513)
chr2 (205-432)||(24850055-24850283)
chr2 (245-431)||(24813989-24814175)
chr2 (245-432)||(22751594-22751782)
chr2 (268-432)||(11404899-11405063)
chr2 (268-432)||(10267629-10267793)
chr2 (268-432)||(10278206-10278370)
chr2 (205-432)||(22318095-22318324)
chr2 (268-432)||(43346042-43346206)
chr2 (270-432)||(24424950-24425112)
chr2 (341-432)||(26867740-26867832)
chr2 (270-432)||(34803791-34803953)
chr2 (270-432)||(40222968-40223130)
chr2 (268-432)||(4210526-4210690)
chr2 (268-432)||(22959761-22959925)
chr2 (341-432)||(20417130-20417222)
chr2 (342-432)||(9772808-9772899)
chr2 (342-432)||(28731390-28731481)
chr2 (270-432)||(29244857-29245019)
chr2 (270-432)||(43083283-43083445)
chr2 (347-432)||(9907669-9907755)
chr2 (347-432)||(24337911-24337997)
chr2 (347-432)||(27222035-27222121)
chr2 (342-432)||(28379322-28379413)
chr2 (270-432)||(21171863-21172026)
chr2 (316-427)||(29410139-29410246)
chr2 (347-414)||(27639812-27639877)
chr2 (268-432)||(35253653-35253811)
chr2 (268-432)||(35264262-35264420)
chr2 (320-430)||(28769974-28770081)
chr2 (245-431)||(18848820-18849001)
chr2 (390-422)||(1799550-1799582)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (243-432)||(21132-21323)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (245-432)||(1378-1565)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (205-432)||(4406-4634)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (316-432)||(60020-60136)
scaffold0011 (205-432)||(134783-135012)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (243-431)||(7408-7597)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (308-433)||(14303936-14304060)
chr7 (268-432)||(13171915-13172078)
chr7 (205-431)||(13260068-13260296)
chr7 (78-432)||(22577342-22577693)
chr7 (243-431)||(4428534-4428724)
chr7 (78-286)||(14303749-14303956)
chr7 (245-432)||(15216979-15217166)
chr7 (243-432)||(12173807-12173997)
chr7 (243-432)||(14426998-14427188)
chr7 (268-432)||(13649184-13649349)
chr7 (243-432)||(9709323-9709512)
chr7 (270-432)||(48236447-48236610)
chr7 (243-432)||(2265014-2265204)
chr7 (243-432)||(16316059-16316249)
chr7 (275-432)||(16556321-16556479)
chr7 (275-432)||(16609183-16609341)
chr7 (60-432)||(332135-332503)
chr7 (268-432)||(11096700-11096864)
chr7 (268-432)||(26400194-26400358)
chr7 (270-431)||(13031597-13031759)
chr7 (243-432)||(18361131-18361316)
chr7 (268-432)||(1988221-1988385)
chr7 (268-432)||(8012199-8012363)
chr7 (268-432)||(9085928-9086092)
chr7 (268-432)||(24735417-24735581)
chr7 (268-432)||(42866508-42866672)
chr7 (245-432)||(18419795-18419982)
chr7 (270-432)||(2715709-2715871)
chr7 (270-432)||(15887771-15887933)
chr7 (268-432)||(167527-167691)
chr7 (268-432)||(40052149-40052313)
chr7 (270-429)||(9160394-9160553)
chr7 (268-432)||(8618031-8618195)
chr7 (243-379)||(21695891-21696027)
chr7 (270-432)||(467074-467236)
chr7 (270-432)||(5710933-5711095)
chr7 (279-433)||(11571826-11571975)
chr7 (270-432)||(22089768-22089930)
chr7 (347-432)||(5686147-5686233)
chr7 (347-432)||(21002577-21002663)
chr7 (347-432)||(26699223-26699309)
chr7 (352-432)||(9433909-9433990)
chr7 (268-431)||(4212657-4212820)
chr7 (347-432)||(11005847-11005933)
chr7 (268-432)||(17960215-17960379)
chr7 (316-431)||(26822757-26822869)
chr7 (319-432)||(4821960-4822074)
chr7 (347-432)||(6877426-6877512)
chr7 (307-432)||(13137471-13137597)
chr7 (316-431)||(9763131-9763244)
chr7 (316-431)||(9803623-9803735)
chr7 (316-431)||(19144032-19144143)
chr7 (316-431)||(20743431-20743542)
chr7 (316-431)||(1775136-1775247)
chr7 (270-329)||(13649330-13649389)
chr7 (78-112)||(4428371-4428405)
chr7 (389-431)||(17890988-17891030)
chr7 (390-431)||(7592143-7592184)
chr7 (390-431)||(15201869-15201910)
chr7 (268-332)||(22089910-22089974)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (245-432)||(12239-12426)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (245-432)||(10691-10878)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (245-432)||(17479-17666)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (245-432)||(211205-211392)
scaffold0014 (245-432)||(217074-217261)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (243-432)||(6565-6755)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (243-432)||(9675-9865)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (205-432)||(34202-34429)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (243-432)||(143579-143769)
scaffold0007 (270-432)||(58726-58888)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (205-432)||(41138-41366)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (245-432)||(4090-4277)
[»] scaffold0537 (2 HSPs)
scaffold0537 (245-432)||(4121-4308)
scaffold0537 (78-106)||(3956-3984)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (78-432)||(30143-30494)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (243-431)||(23150-23339)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (149-432)||(87384-87663)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (245-432)||(3617-3804)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (245-432)||(9315-9502)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (208-431)||(11013-11236)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (205-432)||(897-1124)
scaffold0040 (245-432)||(70273-70460)
scaffold0040 (155-429)||(3382-3651)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (245-432)||(61709-61896)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (270-432)||(148-311)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (243-432)||(19815-20006)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (245-431)||(5933-6119)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (243-432)||(14100-14290)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (275-432)||(7216-7373)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (243-431)||(7884-8074)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (205-432)||(8953-9182)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (245-432)||(2669-2856)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (245-432)||(9806-9993)
[»] scaffold0435 (1 HSPs)
scaffold0435 (205-399)||(4714-4908)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (243-432)||(8385-8575)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (245-432)||(128304-128492)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (245-432)||(2510-2697)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (289-432)||(36254-36398)
scaffold0120 (289-432)||(42607-42751)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (243-432)||(7798-7989)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (268-432)||(31775-31939)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (205-432)||(5003-5232)
scaffold0028 (390-431)||(95437-95478)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (245-432)||(9680-9867)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (245-432)||(6572-6759)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (245-432)||(58960-59147)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (245-432)||(15543-15730)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (245-432)||(176002-176189)
scaffold0017 (245-406)||(53262-53423)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (275-432)||(11887-12046)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (316-432)||(2228-2345)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (205-432)||(12930-13156)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (205-432)||(4170-4399)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (205-432)||(17162-17390)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (243-432)||(15012-15206)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (246-432)||(32907-33095)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (205-432)||(60279-60507)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (342-432)||(12792-12883)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (275-432)||(3954-4111)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (270-432)||(192584-192746)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (347-432)||(47099-47185)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (347-432)||(53055-53141)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (350-431)||(4880-4963)
scaffold0069 (270-332)||(4026-4088)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (270-432)||(23279-23441)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (342-432)||(3440-3531)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (315-432)||(10282-10400)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (342-431)||(37574-37664)
[»] scaffold1260 (1 HSPs)
scaffold1260 (78-137)||(2086-2148)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (316-371)||(9949-10003)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (382-430)||(16444-16494)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (245-327)||(30530-30612)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (390-431)||(2678-2719)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (390-431)||(27125-27166)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20910295 - 20909917
Alignment:
Q  54 tctttatttgtctttatagttttatatactttttgttgatgacaaaatggggaatagatatagatttaaaggccctgagccccactcattttaattttaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20910295 tctttatttgtatttatagttttatatactttttgttgatgacaaaatggggagtagatacagtattaaaggccctgaaccccactcattttaattttaa 20910196  T
Q  154 gttaaaattaaattagtaaaacctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaatt 253  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  20910195 gttaaaattaaattaggagaacctgcttctcatatgttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacacgtttaaagttgaatttaatt 20910096  T
Q  254 aacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgtt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20910095 aacttgtatatgatttagggagagcttacaaaccgcaccttaaaggactattggacttagggggagcttacaaacctcagaccctaaaagtttacttgtt 20909996  T
Q  354 aattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909995 aattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 20909917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 159 - 425
Target Start/End: Original strand, 20109286 - 20109552
Alignment:
Q  159 aattaaattagtaaaacctgcttctcatattttagtcttta-atttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaact 257  Q
    |||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||||| || || |  ||||||  | |||||||||||||    
T  20109286 aattgaattaggagaacctccttctcatctcttagtcttttgatatcatgtgagattattctgagtgttactatgtttttaaaa-taaatttaattaact 20109384  T
Q  258 tgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaatt 357  Q
    || |||  | |||||| |||||||||||   ||||||||||   | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  20109385 tgaatagaacttagggggagcttacaaatctcaccttaaagatattttggacttagggggagcttacaaacctcagaccctaatagtcaacttgttaatt 20109484  T
Q  358 aaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaa 425  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20109485 aggttaacaacaattgaacattttaatacaagtgtatgtcatcatcaaaaatggggagattgttggaa 20109552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 207 - 431
Target Start/End: Original strand, 21134528 - 21134753
Alignment:
Q  207 gtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattg 306  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  21134528 gtgagattattctgagtgttatttcgaatttaatgatgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattg 21134627  T
Q  307 gacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaa 405  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||    
T  21134628 gactcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaaagtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaa 21134727  T
Q  406 agagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21134728 aaagggggagattgttggaacaaaat 21134753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 432
Target Start/End: Original strand, 20953698 - 20954048
Alignment:
Q  80 tactttttgttgatgacaaaatggggaatagat--atag-atttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaacc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || | |||||||||| | |||| | |||| |  | || |||||||| ||  |||    
T  20953698 tactttttgttgatgacaaaagggggagtagatgtatagtatttatagactctgagccccattaatttaatttttga--tcaagttaaattaataggacc 20953795  T
Q  177 tgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggaga 276  Q
    | ||||| || | ||||||| |||    |||||||||||||||||||| ||||  |  |||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||    
T  20953796 ttcttcttatctcttagtctataa----atgtgagattattctgagtgatattttgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcaggggga 20953891  T
Q  277 gcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaac 376  Q
    || || ||||  |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20953892 gcctaaaaacctcaccttaaagtactattggacttagggagagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcac 20953991  T
Q  377 attgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20953992 attttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20954048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36134891 - 36134662
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  36134891 atgtgagaatattcagagtgttattgcgcttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtacta 36134792  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  36134791 ttggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatactcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcat 36134692  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36134691 caaaaagggggagattgttggaacaaaatg 36134662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20255728 - 20255541
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||   |||    
T  20255728 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggacttagggggagcttacaaacctcatac-ctggtagt 20255630  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20255629 caacttgttaattggatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20255541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19718348 - 19717999
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagatataga---tttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |||| |||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || |||||||| ||  |    
T  19718348 tatactttttgttgatgacaaaatggggagtagatgtacagtatttataggctctaagccccattaattt-aattttaa--tcaagttaaattaatagga 19718252  T
Q  175 cctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttaggga 274  Q
    ||| ||| | || | ||||||| | |||    || ||||||||||||||| || | ||  |||||   |||||||||||||| || |||  ||| |||      
T  19718251 ccttctttttatctcttagtctattatt----gtcagattattctgagtgttaattcgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaattcaggat 19718156  T
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||||||      
T  19718155 gagcttacaaacctcaccttaaagtactattagactcagagggagcttacaaacctcatacccttaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattac 19718056  T
Q  375 acattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaa 430  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  19718055 atattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggagagattgttggaagaaaa 19717999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 20883275 - 20883462
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || ||   |||    
T  20883275 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagctttcaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-cttgtagt 20883373  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  20883374 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgctggaataaaatg 20883462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 51655882 - 51656046
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  51655882 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagacttagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 51655980  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51655981 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 51656046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 153728 - 153890
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||   | | | ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  153728 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatccc-agaagtcaacttattaattagattaacaaca 153826  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  153827 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 153890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3172376 - 3172212
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||| |||| ||||||| || ||| |    
T  3172376 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agaagtcaacttattaattagatcaacga 3172278  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3172277 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 3172212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7508090 - 7507926
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  7508090 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 7507992  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7507991 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 7507926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 35648109 - 35648273
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  35648109 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 35648207  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35648208 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 35648273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38095830 - 38095666
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  38095830 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 38095732  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38095731 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 38095666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21878519 - 21878359
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||    || | ||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  21878519 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcta--tccagaagtcaacttattaattagatcaacaaca 21878422  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21878421 attgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 21878359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22643584 - 22643399
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || ||   |||    
T  22643584 aatttaattaacttgtatagaacttagtgggagcttacaaacctcaccttaaaagtctatttgactcagggggagcttacaaacctcatac-ctggtagt 22643486  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22643485 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcat-aaaaaaggggagattgttggaacaaaat 22643399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5834006 - 5833842
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  5834006 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 5833908  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5833907 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5833842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 36246430 - 36246594
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  36246430 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 36246528  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36246529 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 36246594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 47617957 - 47618122
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  47617957 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 47618055  T
Q  368 caattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47618056 caattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 47618122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 12623235 - 12623399
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | |||   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  12623235 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatc-ctagtggtcaacttattaattagatcaacaa 12623333  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12623334 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 12623399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 433
Target Start/End: Original strand, 18516674 - 18516788
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||||| |||| ||||||||    
T  18516674 ggagcttacaaacctcagaccctaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaattga-catt-taataccaatctttgtcatcaccaaaaagggggag 18516770  T
Q  416 attgttggaacaaaatga 433  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18516771 attgttggaacaaaatga 18516788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 431
Target Start/End: Original strand, 22464227 - 22464383
Alignment:
Q  276 agcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagac-tctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| | ||| || |||| |||| |||||||| ||||||    
T  22464227 agcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatacctctata-gtcaacgtgttcattagattaacaaaaattga 22464325  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22464326 gcattttaaatactaatgtttgtcagcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 22464383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 19169749 - 19169936
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||| ||  ||||||||||    |||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| | | |||    
T  19169749 aatttaattaactcgtatagaacttaagggaagcttacaaatcttaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatact-tgagagt 19169847  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19169848 caacttgttaattagatcaacaacaattgaaaattttaaatactattgtttgtcatcattaaaaaggggaagattgttggaacaaaatg 19169936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4168010 - 4167848
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   ||| |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  4168010 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatctc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 4167912  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4167911 attgaactttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 4167848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12731298 - 12731136
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  12731298 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 12731200  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12731199 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 12731136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12741891 - 12741729
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  12741891 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 12741793  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12741792 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 12741729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19179711 - 19179549
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  19179711 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagcgggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 19179613  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19179612 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19179549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 35400661 - 35400747
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35400661 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 35400747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23067635 - 23067484
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||   |||    
T  23067635 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagtttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctggtagt 23067537  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgt 396  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  23067536 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgt 23067484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7679929 - 7679838
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7679929 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 7679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21864414 - 21864250
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  21864414 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 21864316  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21864315 caatttaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaatg 21864250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26561158 - 26561074
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaa 425  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26561158 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaa 26561074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 7744507 - 7744659
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaa-aagtctacttgttaattaaattaacaacaattg 373  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||   |||    
T  7744507 gagcttacaaacctcacccaaaaggactattagactcaaggggagcttacaaacctcac---ctaagaagtc-acttgttaattagattaacaa---ttg 7744599  T
Q  374 aacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7744600 aatattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 7744659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Original strand, 7744431 - 7744491
Alignment:
Q  244 gaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  7744431 gaatttaattaacttgtatagaatttaaggagagcttacaaacctcaccttaaaagactat 7744491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23065475 - 23065435
Alignment:
Q  392 tttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23065475 tttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23065435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 20910863 - 20910827
Alignment:
Q  16 agagaacaagataagcaaaagttctacatctcagact 52  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20910863 agagaacaagataagcacaagttctacatctcagact 20910827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 18516554 - 18516616
Alignment:
Q  155 ttaaaattaaattagtaaaacctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattatt 217  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18516554 ttaaaattaatttaggagaacctggttctcatctcttagtctttgatttgatgtgagattatt 18516616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26898662 - 26898554
Alignment:
Q  261 atatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaa 360  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||  |||||||  |||||||  |||| || |||||||||||||||||| ||| | || ||| ||| |||||||| |    
T  26898662 atatgacttagggggagcttgcaaacctcaccttat-ggactatcagactcaggaggagcttacaaacctcatactatgaa-gtcaactggttaattaga 26898565  T
Q  361 ttaacaacaat 371  Q
    |||||||||||    
T  26898564 ttaacaacaat 26898554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14008423 - 14008072
Alignment:
Q  80 tactttttgttgatgacaaaatggggaatagatatag-atttaa--aggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaacc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||   |||| || || |||||| |||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||||    
T  14008423 tactttttgttgatgacaaaagggggagtacatatattatttatttaggctctaagtcccactaattt-aattctaaattaaa-ttgaattaggagaacc 14008326  T
Q  177 tgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggaga 276  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||    
T  14008325 tgcttctcatctcttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgtggttacgtttttaaaa-tgaatttaattaacttgaatagaactcaggggga 14008227  T
Q  277 gcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaac 376  Q
    ||||||||||  ||||||||  | | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14008226 gcttacaaacctcaccttaagag-caattggacttagggggagcttacaaacctcagaccctaaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgaac 14008128  T
Q  377 attgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14008127 atttcaatacaagtgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttggaacaaaatg 14008072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12397833 - 12397602
Alignment:
Q  200 atttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg 299  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  12397833 atttaatgtgagattattatgagtgttattatgtttttaaaa-tgaatttaattaacttgtatagaacctagggggagcttacaaacctcaccttaaagg 12397735  T
Q  300 actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcat 399  Q
    |||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||| |||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  12397734 actattagactcagtgggagcttataaacctcagaccctattggtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacaatttaataatagtgtttgtcat 12397635  T
Q  400 catcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12397634 cataaaaaaggggaagattgttggaacaaaatg 12397602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 432
Target Start/End: Original strand, 14131362 - 14131603
Alignment:
Q  190 ttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgc 289  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  |    
T  14131362 ttagtctttcatttcatgtgatattattctgagtgttactatgtttttaaat-tgaatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctc 14131460  T
Q  290 accttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactag 389  Q
    |||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||| |     
T  14131461 accttaaagagctattgcacttagggggaccttacaaacctcagaccctaaaagtcaacttgttaattagattaccaacaattgaactttttaatacaaa 14131560  T
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||||   | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14131561 tgtttgtcatcatattaaaggaggagattgttagaacaaaatg 14131603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 30053697 - 30053926
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-acta 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||| | | || | ||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  30053697 atgtgagattattctgagtgttatttcgaatttaatgatgaatttaattaacatggatataactcagtgggagcttacaaacctcaccttaaaagtacta 30053796  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  30053797 ttggactaagggggagcttacaaacctcataccctaatggtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcat 30053896  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30053897 caaaaagggggagattgttggaacaaaatg 30053926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 49665835 - 49666064
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-acta 303  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||   ||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  49665835 atgtgagatcattctgagtgttatttcgttcttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtacta 49665934  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  49665935 ttggactcagggggagcttacaaacctcataccctaataatcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcat 49666034  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49666035 caaaaagggggagattgttggaacaaaatg 49666064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22141423 - 22141232
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||| || |||| |    
T  22141423 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcaaggggagcttacaaacctcataccctaata 22141324  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22141323 gtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaaatactattgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 22141232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Original strand, 12962420 - 12962769
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagat--atag-atttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaa 174  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||| | |||| |||| |||  | ||||||||||| ||  |    
T  12962420 tatactttttgttgatgataaaagggggagtagatgtatagtatttataggctctgagccccattaattt-aattataa--tcaaattaaattaatatga 12962516  T
Q  175 cctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttaggg 273  Q
    |||  |||| || | ||||||||| |    |||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||   ||||||||||||||||| |||  | ||||||    
T  12962517 cctttttcttatctcttagtctttta----atgtgagaatattctgagtgttatttcatttttaaatgatgaatttaattaacttgaatagaacttaggg 12962612  T
Q  274 agagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattg 373  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |   |||||||| |||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  12962613 aaagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcaaggggagcttataaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaatta 12962712  T
Q  374 aacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaa 429  Q
     ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12962713 cacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgtttgaacaaa 12962769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14582063 - 14581876
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || | ||||||    
T  14582063 aatttaattaacaagtatagaatttagggggagctttcaaacctcaccttaaagg-ctattagactcagggggagcttacaaacctcataccc-aaaagt 14581966  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | || |||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14581965 caacgtgttaattaggttaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 14581876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15834047 - 15833881
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaaca 366  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||| || | || |||| || ||||||||| |||||||    
T  15834047 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattagatttagggggagcttacaaacctcatacccaaatagtcaacgtgttaattagattaaca 15833948  T
Q  367 acaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15833947 acaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15833881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 270 - 431
Target Start/End: Original strand, 16658151 - 16658313
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | | || |||||||||||| ||||||||||    
T  16658151 agggggagctttcaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatattcaacttgttaattagattaacaaca 16658250  T
Q  370 attgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16658251 attgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 16658313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 18142295 - 18142524
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    |||||||||||||||||| | | || ||| ||||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  18142295 atgtgagattattctgagagttctttcgcttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtacta 18142394  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||  || || | ||||||| |||||||||||||    
T  18142395 ttggacttagggggagcattcaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattacactttttaaatactaatgtttgtcatcat 18142494  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18142495 caaaaagggagagattgttggaacaaaatg 18142524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 15662076 - 15662263
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| | ||||   ||    
T  15662076 aatttaattaacgagtatagaacttaggaggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcata-tctagtggt 15662174  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15662175 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15662263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 16670515 - 16670702
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||| |||| | ||||  |||    
T  16670515 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaatctcata-tctagtagt 16670613  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16670614 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttttcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 16670702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 432
Target Start/End: Original strand, 16793727 - 16793994
Alignment:
Q  161 ttaaattagtaaaacctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtg-ctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttg 259  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||    |||||||  ||||||||||||||||     
T  16793727 ttaaattaggagaatctgcttctcatctcttagtctttgatttcatgtgagatttttctgagtgacgtttttaagtttaaaa-tgaatttaattaactta 16793825  T
Q  260 tatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaa 359  Q
     |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||| | |||||  |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  16793826 gatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa-gaactatcagactcagg-ggagcttacaaaccacagaccctaaa-gtcaacttgttaattag 16793922  T
Q  360 attaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  16793923 attaacaacaattgagcatt-taatactagtgtttgtcatcataaaaatgggagagattgttggaacaaaatg 16793994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13654578 - 13654393
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||| ||||||||| |  ||||| | |||||| |||| |   |||||||||||||||||||| |||||     
T  13654578 tgaatttaattaacttggatataacttaaggggagtttacaaacttcgtcttaa-gaactattagactcaaggggagcttacaaacctcagaccctaaa- 13654481  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  13654480 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgaccatt--aatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggagagattgctggaacaaaatg 13654393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 52921083 - 52920893
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||| || || | |    
T  52921083 tgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttgaagtactattgcactcagggagagcttacaaacctcaaacccttata 52920984  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52920983 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 52920893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16477103 - 16476939
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  16477103 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 16477005  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16477004 caattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 16476939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1054573 - 1054386
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  1054573 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 1054475  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  1054474 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggaggagattgttgaaacaaaatg 1054386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 5627410 - 5627574
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  5627410 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 5627508  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5627509 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5627574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 5875688 - 5875852
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  5875688 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 5875786  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5875787 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5875852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24660743 - 24660579
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  24660743 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 24660645  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24660644 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 24660579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39372897 - 39372733
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  39372897 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 39372799  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39372798 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 39372733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17962275 - 17962087
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||| |||||| |||||  ||||||||| | ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || | || |||    
T  17962275 aatttaattaacaagtatagaatttagggggagctttcaaacctcaccttaaaag-ctattagactgagggggagcttacaaacctcataccc-aacagt 17962178  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacatt---gtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||| |   | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17962177 caacgtgttaattagattaacaacaattgaacaattctgaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17962087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 16390993 - 16391155
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  16390993 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagattaacaaca 16391091  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16391092 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 16391155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5511520 - 5511356
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  5511520 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 5511422  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5511421 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5511356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 5547016 - 5547180
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  5547016 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 5547114  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5547115 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5547180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8775518 - 8775354
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  8775518 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 8775420  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8775419 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 8775354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 12296211 - 12296375
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  12296211 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 12296309  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12296310 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 12296375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18484887 - 18484723
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  18484887 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 18484789  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18484788 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 18484723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20721938 - 20721774
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  20721938 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 20721840  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20721839 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20721774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41684503 - 41684339
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  41684503 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 41684405  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41684404 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 41684339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 9005860 - 9006047
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||| | |||| ||  ||||||||||||||||  || |||  |||    
T  9005860 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctactagactcagggggagcttacaaacctcttac-ctaggagt 9005958  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9005959 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaccaaaatg 9006047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4744563 - 4744402
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  4744563 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 4744465  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaa 429  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4744464 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaa 4744402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13122487 - 13122323
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  13122487 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 13122389  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13122388 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 13122323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21317894 - 21317785
Alignment:
Q  320 cttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattg 419  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  21317894 cttacaaacctcataccctaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaattgaccatt--aatactagtgtttgtcatcatcaaaaagcggaagattg 21317798  T
Q  420 ttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||||    
T  21317797 ttggaacaaaatg 21317785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 29905539 - 29905727
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagga-ctattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaag 343  Q
    ||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||| ||  ||||||||| || ||||| |||| ||  | ||||||||||||||| || |||  ||    
T  29905539 aatttaattaacgagtatagaactcagggggagcttacacacctcaccttaaaagatctattagactcaggggcagcttacaaacctcatac-ctagtag 29905637  T
Q  344 tctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29905638 tcaacttgttaattagatcaacaataattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29905727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 29946704 - 29946892
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagga-ctattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaag 343  Q
    ||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||| ||  ||||||||| || ||||| |||| ||  | ||||||||||||||| || |||  ||    
T  29946704 aatttaattaacgagtatagaactcagggggagcttacacacctcaccttaaaagatctattagactcaggggcagcttacaaacctcatac-ctagtag 29946802  T
Q  344 tctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29946803 tcaacttgttaattagatcaacaataattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29946892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 340 - 432
Target Start/End: Original strand, 29951019 - 29951112
Alignment:
Q  340 aaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29951019 aaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29951112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 29995858 - 29996046
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagga-ctattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaag 343  Q
    ||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||| ||  ||||||||| || ||||| |||| ||  | ||||||||||||||| || |||  ||    
T  29995858 aatttaattaacgagtatagaactcagggggagcttacacacctcaccttaaaagatctattagactcaggggcagcttacaaacctcatac-ctagtag 29995956  T
Q  344 tctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29995957 tcaacttgttaattagatcaacaataattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29996046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 340 - 432
Target Start/End: Original strand, 30000173 - 30000266
Alignment:
Q  340 aaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30000173 aaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 30000266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 432
Target Start/End: Original strand, 31113384 - 31113515
Alignment:
Q  301 ctattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcat 399  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  31113384 ctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctggcagtcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcgt 31113482  T
Q  400 catcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31113483 catcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 31113515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 9993376 - 9993467
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9993376 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9993467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 10654694 - 10654856
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  10654694 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 10654792  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10654793 attgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 10654856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 13382676 - 13382838
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  13382676 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 13382774  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13382775 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 13382838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 13393270 - 13393432
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  13393270 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 13393368  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13393369 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 13393432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 421
Target Start/End: Original strand, 19884014 - 19884192
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || ||| ||| |||||||   | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || || | |    
T  19884014 tgaatttaattaacttggata-gaattggggggagtttacaaaactcgccttaaagtactattggatttagagggagcttacaaaccttatacccttata 19884112  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgtt 421  Q
     || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19884113 atcaaattgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgtt 19884192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Original strand, 12248931 - 12249021
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12248931 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 12249021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Original strand, 14321147 - 14321240
Alignment:
Q  341 aagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14321147 aagtcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 14321240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16812434 - 16812258
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  16812434 aatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa-gtactattggactcaggtggagcttacaaacctcataccctata-gt 16812337  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-----aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagatt 418  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16812336 caacttgttaattagattaacaacaattgtacattttttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagatt 16812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11514390 - 11514277
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||   || |||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11514390 ggagcttacgaacctcagaccctaagt-tcaacttgttaattagattaacaacaattgactatt--aatactagtgtttgtcatcatcaaaaagagggag 11514294  T
Q  416 attgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||||||||    
T  11514293 attgttggaacaaaatg 11514277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14466416 - 14466252
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  14466416 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 14466318  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14466317 caattaaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 14466252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 15226447 - 15226539
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15226447 agtcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15226539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 20683191 - 20683355
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  20683191 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 20683289  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20683290 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20683355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37867272 - 37867108
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  37867272 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 37867174  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37867173 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 37867108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18007179 - 18006991
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||| |||||| |||||  ||||||||| | | ||| |||| ||  ||||||||| ||||||| || | || |||    
T  18007179 aatttaattaacaagtatagaatttagggggagctttcaaacctcaccttaaaagcc-attagactcagggggagcttacgaacctcataccc-aacagt 18007082  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacatt---gtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | || |||| |||| |||||||||||||||||| |   | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18007081 caacgtgttcattagattaacaacaattgaacaattctgaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 18006991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 9390687 - 9390778
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9390687 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9390778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19779209 - 19779047
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  19779209 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 19779111  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19779110 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19779047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23758121 - 23757959
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  23758121 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 23758023  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23758022 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23757959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 6220188 - 6220274
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6220188 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 6220274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Original strand, 6500485 - 6500575
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6500485 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacagtttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 6500575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Original strand, 17909469 - 17909559
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17909469 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 17909559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Original strand, 18851167 - 18851257
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18851167 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 18851257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38195490 - 38195404
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38195490 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 38195404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4405040 - 4404948
Alignment:
Q  341 aagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4405040 aagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgatggaacaaaatg 4404948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 1793955 - 1794041
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1793955 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggatattgttggaacaaaatg 1794041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 11216194 - 11216280
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11216194 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttggaacaaaatg 11216280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 28324319 - 28324405
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28324319 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactgttgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 28324405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 7804014 - 7804105
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  7804014 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagaatgttagaacaaaatg 7804105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 431
Target Start/End: Original strand, 19643124 - 19643201
Alignment:
Q  352 ttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  19643124 ttaattagattaacaacaattgactatt--aatacttgtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattaatggaacaaaat 19643201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 432
Target Start/End: Original strand, 20627106 - 20627156
Alignment:
Q  382 aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20627106 aatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgtaggaacaaaatg 20627156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Original strand, 17034073 - 17034114
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17034073 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagatggttggaacaaaat 17034114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 9295089 - 9295050
Alignment:
Q  391 gtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaa 430  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9295089 gtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaa 9295050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15834201 - 15834111
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaa-aggactattggacttagaaggagcttacaaacctca 332  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15834201 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggcgagcttacaaacctca 15834111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15834090 - 15834025
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-actattggacttagaaggagcttacaaacctca 332  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15834090 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtattattggacttagggggagcttacaaacctca 15834025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15834133 - 15834068
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-actattggacttagaaggagcttacaaacctca 332  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15834133 ttagggcgagcttacaaacctcaccttaaaagtattattggacttagggggagcttacaaacctca 15834068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28352767 - 28352726
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  28352767 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 28352726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 422
Target Start/End: Original strand, 48987267 - 48987299
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttg 422  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48987267 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 48987299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 19620494 - 19620721
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||   ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19620494 atgtgagattattctgagtgttatttcgcttttaatgatgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacttcaccttaaagtactat 19620593  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  19620594 tggacttag-gggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattaaattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatc 19620692  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19620693 aaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19620721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 432
Target Start/End: Original strand, 13004286 - 13004519
Alignment:
Q  200 atttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||   |||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||     
T  13004286 atttaatgtgagattattctgagtgttattatgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaattcagggagagcttacaaacctcaccttaaagt 13004385  T
Q  300 actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtca 398  Q
    | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||    
T  13004386 aatattggactcagggggagcttacaaacctcatacttttaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatattaatgtttgtca 13004485  T
Q  399 tcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  13004486 tcatcaaaaatgaggagattgttggaacaaaatg 13004519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 14777834 - 14778021
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| || ||  ||||    
T  14777834 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctataggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctggaagt 14777932  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14777933 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgttagtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 14778021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 16818732 - 16818920
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||    
T  16818732 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 16818831  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16818832 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatg 16818920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11536716 - 11536559
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  11536716 gagcttacaaacctcaccttaaagatctattagacttagggggagcttacaaacctcaaac-ctagtagtcaacttgttaattagatcaacaacaattga 11536618  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11536617 acattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgtaacaaaatg 11536559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 13575590 - 13575779
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |    
T  13575590 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttagaaacctcacgttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatac-cttata 13575688  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13575689 gtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttggaacaaaatg 13575779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10291405 - 10291217
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagga-ctattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaag 343  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  ||    
T  10291405 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcaaac-ctagtag 10291307  T
Q  344 tctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10291306 tcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaatg 10291217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11515935 - 11515748
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||  | |||   |||    
T  11515935 aatttaattaacgagtatagaacttagggcgagctgacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctctta-tcttgtagt 11515837  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaat-actagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11515836 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaattactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 11515748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 15206799 - 15206961
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | ||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  15206799 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatc-ctagaagtcaacttgttaattagatcaacaaca 15206897  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15206898 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15206961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 10750564 - 10750728
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  10750564 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 10750662  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10750663 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 10750728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 10964333 - 10964497
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  10964333 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 10964431  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10964432 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 10964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27657480 - 27657316
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||| |||| ||||||| || ||| |    
T  27657480 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agaagtcaacttattaattagatcaacga 27657382  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27657381 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27657316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 15474587 - 15474776
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaa-aggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa-a 342  Q
    |||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  || ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||  || | ||| |    
T  15474587 aatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcatcttaagagtactattggacttatg-ggagcttacaaacctcttacccaaaata 15474685  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15474686 gtcaacttgttcattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15474776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15139943 - 15139711
Alignment:
Q  200 atttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg 299  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||   |||||||||||||  || |||  | | |||| ||||||||||||  | ||||||||     
T  15139943 atttaatgtcagattattctgagtgttatttcgtttttaatgatgaatttaattaatatggatagaactcagggggagcttacaaacctccccttaaagt 15139844  T
Q  300 actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtca 398  Q
    |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |  | |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  15139843 actattagactcagggggagcttacaaacctcaaacccatatagtcaatttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtca 15139744  T
Q  399 tcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  15139743 tcatcaaaaagggtgagatt-tttgaacaaaatg 15139711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36019180 - 36019016
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  36019180 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 36019082  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36019081 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 36019016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 270 - 431
Target Start/End: Original strand, 18762501 - 18762662
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  18762501 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 18762599  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18762600 attgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 18762662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18776638 - 18776453
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||| | |||||   ||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||    
T  18776638 tgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa-gaactatcaaactcagg-ggagctgacaaacctcataccctaaaa 18776541  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18776540 -tcaacttgttaattagattaacaacaattgaacatt-taatataagtgtttgtgatcatcaaaaagggggagattgttggaacacaatg 18776453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 30936490 - 30936652
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||  | || |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  30936490 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctct-attccagtggtcaacttattaattagatcaacaaca 30936588  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30936589 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 30936652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16256713 - 16256549
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||  | || |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  16256713 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctct-attccagtggtcaacttattaattagatcaacaa 16256615  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16256614 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 16256549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16305894 - 16305802
Alignment:
Q  341 aagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16305894 aagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 16305802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 451418 - 451256
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  451418 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 451320  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  451319 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 451256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17918894 - 17918732
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  17918894 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 17918796  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17918795 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17918732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21997255 - 21997093
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  21997255 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 21997157  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21997156 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 21997093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 40470006 - 40470168
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  40470006 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 40470104  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40470105 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 40470168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 55755300 - 55755391
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55755300 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 55755391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 24027579 - 24027665
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24027579 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 24027665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5874151 - 5874081
Alignment:
Q  363 aacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5874151 aacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5874081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 433
Target Start/End: Original strand, 13306558 - 13306668
Alignment:
Q  320 cttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattg 419  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||| | | ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  13306558 cttacaaacctcagaccctaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaattgacaatt--aatacaaatatttgtcatcaaaaaaaagggggagattg 13306654  T
Q  420 ttggaacaaaatga 433  Q
    ||||||||||||||    
T  13306655 ttggaacaaaatga 13306668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 19954456 - 19954542
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19954456 acttattaattagatcaaccacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19954542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24641049 - 24640963
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24641049 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatg 24640963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 432
Target Start/End: Original strand, 14356740 - 14356791
Alignment:
Q  381 taatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14356740 taatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 14356791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 432
Target Start/End: Original strand, 19888714 - 19888765
Alignment:
Q  381 taatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19888714 taatactggtgtttgtcatcatcaaaacgggggagattgttggaacaaaatg 19888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Original strand, 14356608 - 14356682
Alignment:
Q  150 ttaagttaaaattaaattagtaaaacctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtg 224  Q
    |||| |||||||||| |||| | |||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14356608 ttaacttaaaattaatttaggagaacctgtttctcatctcctagtctttgatttcatgtgagattattctgagtg 14356682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 372
Target Start/End: Original strand, 19887886 - 19887941
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaatt 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19887886 ggagcttacaaacctcagaccctaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaatt 19887941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24620063 - 24620019
Alignment:
Q  389 gtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatga 433  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24620063 gtgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgttggaacaaaatga 24620019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19053785 - 19053676
Alignment:
Q  318 agcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagat 417  Q
    |||||||| |||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||     |  |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19053785 agcttacacaccttagactctgaa-gtcaactcgttaattaaattaacaacaattgtc---ttaaatacttgtgtttttcatcatcaaaaaggggaagat 19053690  T
Q  418 tgttggaacaaaat 431  Q
    | ||||||||||||    
T  19053689 tcttggaacaaaat 19053676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 373
Target Start/End: Original strand, 10327933 - 10327998
Alignment:
Q  307 gacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattg 373  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10327933 gacttagggggagcttacgaacctcagaccctaaa-gtcaacttgttaattaatttaacaacaattg 10327998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 50066897 - 50066858
Alignment:
Q  391 gtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaa 430  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  50066897 gtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaa 50066858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Original strand, 14356543 - 14356581
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagatatag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14356543 tatactttttgttgatgacaaaatggggagtagacatag 14356581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Original strand, 26821119 - 26821160
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  26821119 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 26821160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 54690960 - 54690919
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  54690960 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 54690919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 116
Target Start/End: Original strand, 19887659 - 19887695
Alignment:
Q  80 tactttttgttgatgacaaaatggggaatagatatag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19887659 tactttttgttgatgacaaaaaggggagtagatatag 19887695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 432
Target Start/End: Original strand, 24745 - 24978
Alignment:
Q  200 atttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||   |||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||     
T  24745 atttaatgtgagattattctgagtgttattatgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaattcagggagagcttacaaacctcaccttaaagt 24844  T
Q  300 actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtca 398  Q
    | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||    
T  24845 aatattggactcagggggagcttacaaacctcatacttttaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatattaatgtttgtca 24944  T
Q  399 tcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  24945 tcatcaaaaatgaggagattgttggaacaaaatg 24978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25593204 - 25593015
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| |    
T  25593204 tgaatttaattaacttgtatagaacttcgggggagcttacaaacctcatcttaaaggactattggacttagcgggagcttacaaacctcataccctaata 25593105  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25593104 gtcaacttgttaattagattaacaacaattaaacattttaatacaagtgtttgtcatcaataaaaacggggagattgttggaacaaaatg 25593015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 430
Target Start/End: Original strand, 20112018 - 20112367
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagat--atag-atttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||  | ||||||||||| ||  |    
T  20112018 tatactttttgttgatgacaaaagggggagtagatgtatagtatttataggctctgagccccattaattt-aattttaa--tcaaattaaattaatagga 20112114  T
Q  175 cctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttaggga 274  Q
    | | ||||| || | ||||||| | |    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   | |||||||||||| || |||  | | | ||     
T  20112115 cattcttcttatctcttagtctatta----atgtgagattattctgagtgttatttcgtttttaatgattaatttaattaacatggatagaactcaaggg 20112210  T
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  20112211 gagcttacaaacctcgccttaaagtactattggacttagggggagcttacaaaccttaaaccctaatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgc 20112310  T
Q  375 acattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaa 430  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20112311 acattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaagaaaa 20112367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 19288745 - 19288932
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  19288745 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagaagt 19288843  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaaca-ttgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19288844 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacactttaaatactattgtctgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19288932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11236330 - 11236142
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||    
T  11236330 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 11236231  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11236230 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 11236142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18543758 - 18543571
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||  |  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  18543758 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcggggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 18543660  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18543659 caacttcttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 18543571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17043489 - 17043302
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || | ||||||    
T  17043489 aatttaattaactagtatagaatttagggggagctttcaaacctcaccttaaagg-ctattagactcagggggagcttacaaacctcataccc-aaaagt 17043392  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | || |||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17043391 caacgtgttaattaggttaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17043302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 205 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21625817 - 21625595
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| |||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  21625817 atgtgagattattctgagagttattgcgcttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacgaacctcaccttaaagtacta 21625718  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||||||    
T  21625717 ttggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcactttttaaatactaatgtttgtcatcat 21625618  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaa 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21625617 caaaaagggggagattgttggaa 21625595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 19461377 - 19461564
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||| | || ||   |||    
T  19461377 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcactttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaaccttatac-ctggcagt 19461475  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19461476 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19461564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16878054 - 16877704
Alignment:
Q  80 tactttttgttgatgacaaaatggggaatagat--atag-atttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaacc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||| ||||| |||| ||||||| || | |||| |||| |||  | || |||||||| || ||||    
T  16878054 tactttttgttgatgacaaaagggggagcagatgtatagtatttataggctctgagcctcattaattt-aattctaa--tcaagttaaattaatagaacc 16877958  T
Q  177 tgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggaga 276  Q
    | ||||| || | ||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   ||| |||||||||| || |||| | | | || ||    
T  16877957 ttcttctaatctcttagtctttta----atgtgagattattctgagtgttatttcgtttttaataatgattttaattaacatggatataactcatgggga 16877862  T
Q  277 gcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaac 376  Q
    ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||     
T  16877861 gcttacaaacctcaccataatgtactattggactcagggggagcttacaaacctcataccctaacagtcaacgtcttaattagattaacaacaattgaaa 16877762  T
Q  377 attgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     || |  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16877761 ttttttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 16877704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 25686094 - 25686284
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  25686094 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactaagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 25686192  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt----aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25686193 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacatttttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 25686284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13602871 - 13602643
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  13602871 atgtgagattattcttagtgttatttcgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactat 13602772  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    | |||| |   ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||     
T  13602771 tagactcatggggagcttacaaacctcatacccttacagtcaacttgttaattagattaacaataattgcacattttaaataccaatgtttgtcatcata 13602672  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13602671 aaaaaggaggagattgttggaacaaaatg 13602643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 18925153 - 18925314
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | | ||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  18925153 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agaagtcaacttattaattagatcaacaaca 18925251  T
Q  370 attgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18925252 attgaacattttaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 18925314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 17981941 - 17982105
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  17981941 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 17982039  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17982040 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17982105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 17984130 - 17984294
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  17984130 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 17984228  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17984229 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17984294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22802797 - 22802608
Alignment:
Q  244 gaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaag 343  Q
    ||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |   | | ||    
T  22802797 gaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatatctttatag 22802698  T
Q  344 tctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  22802697 tcaacgtgttaattagattaacaacaattaaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagagggagaatgttggaacaaaatg 22802608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26026234 - 26026070
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  26026234 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 26026136  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26026135 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 26026070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27342469 - 27342305
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  27342469 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 27342371  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27342370 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27342305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27403209 - 27403045
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  27403209 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 27403111  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27403110 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27403045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27385205 - 27385044
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||    || | ||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  27385205 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcta--tccagaagtcaacttattaattagatcaacaaca 27385108  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27385107 attgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27385044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27475618 - 27475457
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||    || | ||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  27475618 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcta--tccagaagtcaacttattaattagatcaacaaca 27475521  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27475520 attgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27475457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4631658 - 4631498
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||    || | ||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  4631658 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcta--tccagaagtcaacttattaattagatcaacaaca 4631561  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4631560 attgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 4631498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13913844 - 13913659
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||  | |   | ||    
T  13913844 aatttaattaacgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagacttagggggagcttacaaacctcaatccccgta-gt 13913746  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaa 430  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13913745 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaa 13913659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19483427 - 19483269
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||||| |||| |   ||||||||||||||||  || | || |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  19483427 gagcttacaaaactcaccttaaagtactatttgactcaaggggagcttacaaacctcctacccaaagagtcaacgtgttaattagattaacaacaattga 19483328  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19483327 acattttaaatactattgtttgtcatcatgaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19483269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 12726869 - 12727033
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  12726869 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 12726967  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12726968 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 12727033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16931208 - 16931044
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  16931208 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 16931110  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16931109 caattgaatattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 16931044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 32311106 - 32311270
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  32311106 ttagggggagcttacaaacctcacctcaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 32311204  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32311205 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 32311270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 302 - 432
Target Start/End: Original strand, 14069587 - 14069719
Alignment:
Q  302 tattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt---aatactagtgtttgtca 398  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||    
T  14069587 tattggacttagggggagcttacaaacctcaaaccc-agtagtcaacttgttaattaaatcaacaacaattgaacattttttaaatactattgtttgtca 14069685  T
Q  399 tcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  14069686 tcatcaaaaagggggagattgttggaaaaaaatg 14069719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 31126861 - 31127045
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||| | |||||  |||| ||  ||||||||||||||||| || || |||    
T  31126861 tgaatttaattaacttggataaaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa-gaactatcagactcagg-ggagcttacaaacctcatac-cttaaa 31126957  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31126958 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgactatt--aaaagtagtgtttgtcatcatcaaaaagggggtgattgttggaacaaaatg 31127045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3662157 - 3661993
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  3662157 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 3662059  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3662058 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgcaacaaaatg 3661993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17048432 - 17048239
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaa-aggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa 341  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| |||||| |||||  |||||| | || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || | |||    
T  17048432 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttccaaacctcacctttagagtactattagactcagggggagcttacaaacctcacaccc-aaa 17048334  T
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt----aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17048333 agtcaatgtgttaattaggttaacaacaattgaacattgttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17048239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25788490 - 25788328
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  25788490 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 25788392  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25788391 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 25788328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27373564 - 27373407
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||||  | | |   ||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  27373564 gagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcaatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaacaattga 27373466  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27373465 acattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27373407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27463914 - 27463757
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||||  | | |   ||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  27463914 gagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcaatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaacaattga 27463816  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27463815 acattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27463757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26865563 - 26865399
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  26865563 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 26865465  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26865464 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 26865399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 34817213 - 34817377
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  34817213 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 34817311  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34817312 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 34817377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20462556 - 20462373
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||||||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  20462556 aatttaattaacttgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagag-ctattagacttaatgggagcttaaaaacctcagaccctaaa-gt 20462459  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||| | || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  20462458 caacttgttaattagattaacaacaattgactat--taacattaatgtttgtcatcatcaaaaaaggagagattgttggaacaaaatg 20462373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 9122555 - 9122717
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  9122555 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 9122653  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9122654 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9122717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12855723 - 12855632
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12855723 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 12855632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 32972047 - 32972133
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32972047 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 32972133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 20062133 - 20062224
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20062133 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20062224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 25734913 - 25735107
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||   |||||||||||||||| || ||   |||    
T  25734913 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggtgagcttacaaacctcatac-cttgtagt 25735011  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--------aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |        ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  25735012 caacttgttaattagatcaacaagaattgaacatttttttttaaaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggaaattgttggaataaaatg 25735107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16742815 - 16742686
Alignment:
Q  301 ctattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatc 400  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||    
T  16742815 ctattagacttagggggagcttacaaacttcagactgtaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaattgactat--taacacttatgtttgtcatc 16742719  T
Q  401 atcaaagagggggagattgttggaacaaaatga 433  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||    
T  16742718 atcaaaaagggggagactattggaggaaaatga 16742686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18378860 - 18378743
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagaggggga 414  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||| | ||| | |||||    
T  18378860 ggagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgtttattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttatcatctttaaaaaagggga 18378761  T
Q  415 gattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  18378760 gattgttggaaaaaaatg 18378743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25794562 - 25794481
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttg 422  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25794562 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 25794481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29918574 - 29918492
Alignment:
Q  350 tgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29918574 tgttaattagattaacaacaattgcacattttgaatactaatgtt-gttatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29918492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 373
Target Start/End: Original strand, 13553158 - 13553208
Alignment:
Q  322 tacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattg 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13553158 tacaaacctcagactctaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaattg 13553208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 370
Target Start/End: Original strand, 13487182 - 13487232
Alignment:
Q  319 gcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaa 370  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13487182 gcttacaaacctcaaactcttaa-gtctacttgttaattaaatcaacaacaa 13487232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Original strand, 18419694 - 18419735
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  18419694 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 18419735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 88877 - 89105
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   | ||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  88877 atgtgagattattctgagtgttatttcgtttttaatgattaatttaattaacttggatagaactaagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactat 88976  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  88977 tggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaaattgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactagtgtttgtcatcatc 89076  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  89077 aaaaagggggagattgttggaacaaaatg 89105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 21099132 - 21099360
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||   || ||   ||||| |||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  21099132 atgtgagattattctaagtgatattacattttaaatgatgaatctaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactat 21099231  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    || ||| ||  ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  21099232 tgaactcagggggagcttacaaacctcatacccttaaagtcaatttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaataccagtgtttgtcatcatc 21099331  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21099332 aaaaagggggagattgttggaacaaaatg 21099360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13523871 - 13523684
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  13523871 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 13523773  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaaca-ttgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13523772 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacagtttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 13523684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5430536 - 5430346
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |    
T  5430536 tgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatacccttata 5430437  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5430436 gtcaacgtgttagttagattaacaacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5430346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23479048 - 23478859
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||    
T  23479048 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacatcaccttaatagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctgatagt 23478950  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt---aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23478949 caacttgttaattagatcaacaagaattgaacattttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23478859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30743654 - 30743497
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  30743654 gagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagg-ggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattga 30743556  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30743555 acattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgtaacaaaatg 30743497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 17617208 - 17617373
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||| |||| ||||||| || |||||    
T  17617208 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagtcaacttattaattagatcaacaa 17617307  T
Q  368 caattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17617308 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17617373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 17729065 - 17729230
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||| |||| ||||||| || |||||    
T  17729065 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagtcaacttattaattagatcaacaa 17729164  T
Q  368 caattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17729165 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17729230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 31358682 - 31358847
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||| |||| ||||||| || |||||    
T  31358682 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagtcaacttattaattagatcaacaa 31358781  T
Q  368 caattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31358782 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 31358847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21660902 - 21660711
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaa-aggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa 341  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||    
T  21660902 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggggagcttacaaacctcttac-ctaaa 21660804  T
Q  342 -agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     | || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21660803 tattcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 21660711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 23706918 - 23707082
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | || |||| |||| ||||||| || |||||    
T  23706918 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-aatagtcaacttattaattagatcaacaa 23707016  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23707017 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23707082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 6985827 - 6985991
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  6985827 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 6985925  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6985926 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 6985991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 14040126 - 14040290
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  14040126 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 14040224  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14040225 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 14040290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14558748 - 14558584
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  14558748 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 14558650  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14558649 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 14558584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27042960 - 27042796
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  27042960 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 27042862  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27042861 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27042796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39491662 - 39491498
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  39491662 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 39491564  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39491563 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 39491498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 9346073 - 9346237
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  9346073 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 9346171  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9346172 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9346237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14447765 - 14447601
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  14447765 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 14447667  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14447666 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 14447601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 22685532 - 22685696
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||| ||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  22685532 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttaaaaacctctgtccc-agcagtcaacttattaattagatcaacaa 22685630  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22685631 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 22685696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 23306375 - 23306539
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  23306375 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 23306473  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23306474 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23306539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 23372041 - 23372205
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  23372041 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 23372139  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23372140 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23372205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24588836 - 24588672
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  24588836 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 24588738  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24588737 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 24588672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24817616 - 24817452
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  24817616 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 24817518  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24817517 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 24817452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 27470090 - 27470254
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  27470090 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 27470188  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27470189 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27470254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30228227 - 30228063
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  30228227 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 30228129  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30228128 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 30228063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 35225602 - 35225766
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  35225602 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 35225700  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35225701 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 35225766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 42052890 - 42053054
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  42052890 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 42052988  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42052989 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 42053054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1109883 - 1109728
Alignment:
Q  277 gcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaac 376  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||   | | | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1109883 gcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatccc-agaagtcaacttattaattagattaacaacaattgaac 1109785  T
Q  377 attgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1109784 attttaaatactattgtttgtcatcatcagaaagggggagattgttggaacaaaatg 1109728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36583271 - 36583107
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || ||||     
T  36583271 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgcccc-agtagtcaacttattaattagatcaacat 36583173  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36583172 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 36583107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Original strand, 36697760 - 36697923
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  36697760 ttagggggagcttacaaacctcacctcaaagaactattagactcggggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 36697858  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36697859 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 36697923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 23405962 - 23406124
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  23405962 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 23406060  T
Q  370 attgaacattgta-atactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23406061 attgaacattttatatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23406124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21414963 - 21414799
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | |||   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  21414963 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctttc-ctagttgtcaactttttaattagatcaacaa 21414865  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21414864 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 21414799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 22156634 - 22156798
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||| | |  | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  22156634 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacct-atatcccagtggtcaacttattaattagatcaacaa 22156732  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22156733 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 22156798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 31843489 - 31843653
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  31843489 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 31843587  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31843588 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 31843653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17447387 - 17447295
Alignment:
Q  341 aagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17447387 aagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17447295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15994057 - 15993895
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  15994057 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 15993959  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15993958 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15993895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 20561910 - 20562001
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20561910 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20562001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 20797211 - 20797373
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| |   ||||||||||||||||   | | | ||||| |||| ||||||| || ||||| |    
T  20797211 agggggagcttacaaacatcaccttaaagatctattagactcaaggggagcttacaaacctctatccc-agaagtcaacttattaattagatcaacaaaa 20797309  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20797310 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20797373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24926813 - 24926722
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24926813 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 24926722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 31448052 - 31448214
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  31448052 agggagagcttacaaacctcactttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 31448150  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31448151 attgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 31448214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 34062136 - 34062298
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||  ||||||| || |||||||    
T  34062136 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaactgattaattagatcaacaaca 34062234  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34062235 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 34062298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 39361846 - 39362008
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  39361846 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 39361944  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39361945 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 39362008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Original strand, 19477582 - 19477663
Alignment:
Q  352 ttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19477582 ttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19477663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 40400551 - 40400713
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  40400551 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 40400649  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40400650 attgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 40400713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5291228 - 5291142
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5291228 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 5291142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27604052 - 27603984
Alignment:
Q  365 caacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27604052 caacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27603984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 21519647 - 21519738
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21519647 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttttcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 21519738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 25935801 - 25935912
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    ||||||||||||||||| |  || || ||| |||||||||||| |||||||||| |||    ||  ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  25935801 ggagcttacaaacctcaaatcctgaa-gtcaacttgttaattagattaacaacatttgt---tttaaatacttatgtttgtcatcatcaaaaaaggggag 25935896  T
Q  416 attgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  25935897 attgttggaacaaaat 25935912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14558790 - 14558726
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctca 332  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14558790 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagacttagggggagcttacaaacctca 14558726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Original strand, 20797037 - 20797095
Alignment:
Q  80 tactttttgttgatgacaaaatggggaatagatatag-atttaaaggccctgagcccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  20797037 tactttttgttgatgacaaaagggggagtagatgtagtattttaaggctctgagcccca 20797095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Original strand, 24421430 - 24421471
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  24421430 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 24421471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30445875 - 30445834
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  30445875 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 30445834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30455247 - 30455206
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  30455247 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 30455206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 422
Target Start/End: Original strand, 5609278 - 5609310
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttg 422  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5609278 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 5609310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 15335484 - 15335712
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| || |||  | | | || ||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  15335484 atgtgagattattctgagtgttattacgcttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagtattat 15335583  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||    
T  15335584 tggactcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactatggtttttcatcatc 15335683  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15335684 aaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15335712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 15424549 - 15424777
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| || |||  | | | || ||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  15424549 atgtgagattattctgagtgttattacgcttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagtattat 15424648  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||    
T  15424649 tggactcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactatggtttttcatcatc 15424748  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15424749 aaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15424777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 15515853 - 15516081
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| || |||  | | | || ||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  15515853 atgtgagattattctgagtgttattacgcttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagtattat 15515952  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||    
T  15515953 tggactcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactatggtttttcatcatc 15516052  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15516053 aaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15516081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 431
Target Start/End: Original strand, 20381824 - 20382051
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   |||||| |||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  20381824 atgtgagattattctgagtgttatttcggttttaatgatgaattgaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcagcttaaagtactat 20381923  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||| || || | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  20381924 tggactcagggggagcttacaaacctcatacccttataatcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatc 20382023  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20382024 aaaaagggggagattattggaacaaaat 20382051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21289073 - 21288883
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaa-aggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa 341  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||      
T  21289073 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggggagcttacaaacctcataccctatt 21288974  T
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21288973 agtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 21288883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 431
Target Start/End: Original strand, 17518527 - 17518714
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||   |||    
T  17518527 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctggcagt 17518625  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17518626 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 17518714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18773454 - 18773112
Alignment:
Q  80 tactttttgttgatgacaaaatggggaatagatatag-atttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaacctg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||    ||||||||| | |||| |||| |||    |||||||||||  | |||||     
T  18773454 tactttttgttgatgacaaaatggggagtagatgtagtatttatagtatttgagccccattaattt-aattctaaac--aaattaaattaagagaacctt 18773358  T
Q  179 cttctcatattttagtct-ttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagag 277  Q
    |||||||| | |||| || || |||| |||| |||||||||| |||| ||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  18773357 cttctcatctcttagcctatttatttaatgtaagattattctaagtg-tattatgctttttaagatgaatttaattaacttgtatagaatttagggggag 18773259  T
Q  278 cttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaaca 377  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||    |           |||||||||||||||    
T  18773258 cttacaaacctcaccttaaaggactattggactcagggggaacttacaaacctcagacgctaaaagactcaggg---------ggaacaacaattgaaca 18773168  T
Q  378 ttgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18773167 ttttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 18773112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 20259022 - 20259209
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  20259022 aatttaattaacgagtataggacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggcctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 20259120  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20259121 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacataatg 20259209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 21045652 - 21045839
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  21045652 aatttaattaacgagtataggacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggcctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 21045750  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21045751 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacataatg 21045839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23784208 - 23784021
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  23784208 aatttaattaacttgtatagaacttagtggtagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctaggagt 23784110  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23784109 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23784021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 23352595 - 23352759
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23352595 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaaaagctattggacttagg-ggagcttacaaacctcagaccctaaaagtcaacttgttaattagattaacaa 23352693  T
Q  368 caattga-acattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||  | || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23352694 caatggagcctttttaatacaagtgtttgtcatcatcaaaaaggaggagattgttggaacaaaatg 23352759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44481940 - 44481775
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||| |||| ||||||| || |||||    
T  44481940 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagtcaacttattaattagatcaacaa 44481841  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44481840 caattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 44481775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23371440 - 23371253
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||| |||| || |||  |||    
T  23371440 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggcctattagactcagggggagcttacaaaactcatac-ctagtagt 23371342  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23371341 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 3597836 - 3597999
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  3597836 agggggagcttacaaacctcaccttaaagtattattggactcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacgtgttaattagattaacacca 3597935  T
Q  370 attgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3597936 attgaacattttaaatattaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 3597999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22663790 - 22663635
Alignment:
Q  278 cttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaaca 377  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22663790 cttacaaacctcaccttaaagaactattggactcaaggggagcttacaaacctcatacccttaaagtcaacgtgttaattaaattaacaacaattgaaca 22663691  T
Q  378 ttgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22663690 ttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaggggggagattgtgggaacaaaatg 22663635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 245 - 431
Target Start/End: Original strand, 23184724 - 23184911
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||| || |||  ||| |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |   | | |||    
T  23184724 aatttaattaacatggatagaattcagggggagtttacaaacctcaccttaaagtactattgaacttagggggagcttacaaacctcatatctttatagt 23184823  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23184824 caacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 23184911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Original strand, 23352363 - 23352617
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagatatag-attta--aaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||| | ||||||| |||  ||||||| |||||| | ||    
T  23352363 tatactttttgttgatgacaaaagggggaatagatatagtatttatttaggctctgagccccact-aatttaattctaa-ataaaattgaattaggagaa 23352460  T
Q  175 cctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttaggga 274  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||  || || | |||| |||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||  | ||||||     
T  23352461 cctgtttctcatctcttagtctttaacttcatgtgaatttttttttagtgttattacgtttttaaagatgaatttaatt-acttgtatagaacttagggg 23352559  T
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctca 332  Q
    ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23352560 gagcttacaaacatcaccttaaaaagctattggacttagggggagcttacaaacctca 23352617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19927689 - 19927526
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || || | |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  19927689 agggggagcttacaaaccttaccttaaagtactattggattcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaaca 19927590  T
Q  370 attgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19927589 attgaacattttaaatactattgtttctcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19927526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 3358646 - 3358810
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  3358646 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 3358744  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3358745 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 3358810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9341981 - 9341817
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  9341981 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 9341883  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9341882 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9341817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3833618 - 3833431
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||| || |||  |||    
T  3833618 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacatcatac-ctagtagt 3833520  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3833519 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaaccaaatg 3833431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 30324740 - 30324902
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||   | | | ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  30324740 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatccc-agaagtcaacttattaattagattaacaaca 30324838  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30324839 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaacgggggagattgttggaacaaaatg 30324902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29077566 - 29077402
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  29077566 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 29077468  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29077467 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29077402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29087817 - 29087653
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  29087817 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 29087719  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29087718 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29087653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36078772 - 36078608
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  36078772 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 36078674  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36078673 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 36078608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36293738 - 36293574
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  36293738 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 36293640  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36293639 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 36293574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 432
Target Start/End: Original strand, 18684963 - 18685082
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatact-agtgtttgtcatcatcaaagagggg 412  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  18684963 ggagcttacaaacctcatacccttaaagttaacttgttaattaaattaacaacaattgaacatttttaaatactaagtgtttgtcaccatcaaaaatggg 18685062  T
Q  413 gagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18685063 gagattgttggaacaaaatg 18685082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 432
Target Start/End: Original strand, 18730528 - 18730647
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatact-agtgtttgtcatcatcaaagagggg 412  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  18730528 ggagcttacaaacctcatacccttaaagttaacttgttaattaaattaacaacaattgaacatttttaaatactaagtgtttgtcaccatcaaaaatggg 18730627  T
Q  413 gagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18730628 gagattgttggaacaaaatg 18730647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 429
Target Start/End: Original strand, 32087714 - 32087875
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  32087714 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 32087812  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaa 429  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32087813 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaa 32087875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 209598 - 209762
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  209598 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 209696  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  209697 taattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 209762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 723221 - 723385
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  723221 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 723319  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  723320 taattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 723385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 242659 - 242495
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  242659 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattaaactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 242561  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  242560 caattaaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 242495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 796029 - 795865
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  796029 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattaaactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 795931  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  795930 caattaaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 795865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 13688049 - 13688140
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13688049 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 13688140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 15780156 - 15780318
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  15780156 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 15780254  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15780255 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15780318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 15790745 - 15790907
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  15790745 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 15790843  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15790844 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15790907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19129564 - 19129402
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  19129564 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 19129466  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19129465 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19129402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19225714 - 19225623
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19225714 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19225623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19419131 - 19419040
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19419131 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 19419040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 23468865 - 23469051
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||| | |||||  | | |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||    
T  23468865 aatttaattaattagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagt 23468963  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||  ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23468964 caactctttaattagatcaacaacaattgaacatttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaatggggagattgttggaacaaaatg 23469051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6151813 - 6151743
Alignment:
Q  363 aacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6151813 aacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 6151743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 433
Target Start/End: Original strand, 23192162 - 23192276
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||    
T  23192162 ggagcttacaaacctcaaatcctaaa-gtcaactagttaattagattaacaacatttgaccatt--aatactggtgtttgtcatcatcaaaaagtcggag 23192258  T
Q  416 attgttggaacaaaatga 433  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23192259 attgttggaacaaaatga 23192276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26111991 - 26111905
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26111991 acttattaattagatcaacaacaattgaacgttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 26111905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24646935 - 24646822
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagaggggga 414  Q
    ||||||||||||| ||| || || | |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||    
T  24646935 ggagcttacaaacttcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaaaaacaattgcacattttaaatactaatgtttttcatcataaaaaatgggga 24646836  T
Q  415 gattgttggaacaa 428  Q
    ||||||||||||||    
T  24646835 gattgttggaacaa 24646822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22746042 - 22745951
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22746042 agtcaacttgttaattagattagcaacaattgcactttttaaatactaatgtttgtcatcataaaaaagtgggagattgttggaacaaaatg 22745951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18154509 - 18154423
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18154509 acttattaattagatcaacaacaattgagcattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggacattgttgaaacaaaatg 18154423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Original strand, 22163893 - 22163979
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctc 331  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22163893 aattcaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattggactcagggggagcttacaaacctc 22163979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 24502247 - 24502358
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24502247 ggagctgacaaacctcaaactctgaa-gtcaacttgttaattaaatcaacaataattgt---tttaaatacttatgtttgtcatcatcaaaaaggaggag 24502342  T
Q  416 attgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  24502343 attgttggaacaaaat 24502358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18566330 - 18566284
Alignment:
Q  382 aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaa 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  18566330 aatacttgtgtttgtcatcatcaaaaagggagagattgttagaacaa 18566284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 431
Target Start/End: Original strand, 18527707 - 18527756
Alignment:
Q  382 aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||    
T  18527707 aatacttgtgtttgtcatcatcgaaaatggtgagattgttggaacaaaat 18527756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20570136 - 20569948
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||  |  || | |||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||| |    
T  20570136 tgaatttaattaacttgtatagaacgtatgaagagcttacaaacctcaccttaaagagctataggacttagggggagcttacaaacctcataccctaata 20570037  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  20570036 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattttaatacaagtgtttgtcatcatcaaaaagggggaaattgttgtaacaaaat 20569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24377779 - 24377552
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24377779 atgtgagattattctgagtgatatttcgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactaagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactat 24377680  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| | || || ||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  24377679 tggactttgggggagcttacaaaccttatacccttaaa-tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatc 24377581  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  24377580 ataaagggggagattgttggaacaaaatg 24377552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 19312374 - 19312562
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| | | | | ||||    
T  19312374 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 19312473  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19312474 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatg 19312562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 28711172 - 28711330
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  28711172 gagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattga 28711271  T
Q  375 acattgta-atactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28711272 aaattttatatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 28711330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 22454417 - 22454607
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||||||||  || || |||    
T  22454417 tgaatttaattaacatgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattagactcagggggagattacaaacctcgtacccttaaa 22454516  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22454517 gtcaatttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaacagggagattgttggaacaaaatg 22454607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22764513 - 22764326
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  22764513 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 22764415  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22764414 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 22764326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 24850055 - 24850283
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||  |||||||||||||| |  |||  | | | || ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24850055 atgtgagattattctgagtgttatttcgtttttaaagatgaatttaattaacatagatagaactcatggggagcttacaaacctcaccttaaagtactat 24850154  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |  ||| ||  || |||||||||||||| || || ||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  24850155 taaactcagggggtgcttacaaacctcatacccttaaattcaacttgttaattagattaacaaaaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatc 24850254  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24850255 aaaaagggggagattgttagaacaaaatg 24850283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 431
Target Start/End: Original strand, 24813989 - 24814175
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||    
T  24813989 aatttaattaacttgtatagaacttagagggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctgatagt 24814087  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    | | |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24814088 caatttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaaatggggagattgttggaacaaaat 24814175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 22751594 - 22751782
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagga-ctattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaag 343  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || ||   ||    
T  22751594 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-cttgtag 22751692  T
Q  344 tctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22751693 tcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 22751782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 11404899 - 11405063
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  11404899 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 11404997  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11404998 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 11405063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10267793 - 10267629
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  10267793 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 10267695  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10267694 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 10267629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10278370 - 10278206
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  10278370 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 10278272  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10278271 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 10278206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22318324 - 22318095
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    |||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  22318324 atgtgaaattattctgagagttatttcgcttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccataaagtacta 22318225  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||| ||| ||  | ||||||||||| ||| || ||   |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| || |||||||||||||    
T  22318224 ttgaactcaggggaagcttacaaacttcatacccttttagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattattgtttgtcatcat 22318125  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22318124 caaaaaggggaagattgttggaacaaaatg 22318095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43346206 - 43346042
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  43346206 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 43346108  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43346107 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 43346042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 24424950 - 24425112
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  24424950 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattaaatcaacaaca 24425048  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24425049 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 24425112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26867832 - 26867740
Alignment:
Q  341 aagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26867832 aagtcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 26867740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 34803791 - 34803953
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  34803791 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 34803889  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34803890 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 34803953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40223130 - 40222968
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  40223130 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 40223032  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40223031 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 40222968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4210690 - 4210526
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  4210690 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 4210592  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4210591 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 4210526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 22959761 - 22959925
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  22959761 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 22959859  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22959860 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 22959925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Original strand, 20417130 - 20417222
Alignment:
Q  341 aagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20417130 aagtcaacttgttaattagatcaacaacaatttaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20417222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 9772808 - 9772899
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9772808 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9772899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 28731390 - 28731481
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28731390 agtcaacttattaattaaatcaacaacaattgaacagtttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 28731481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29245019 - 29244857
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  29245019 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 29244921  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29244920 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29244857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43083445 - 43083283
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  43083445 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 43083347  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43083346 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 43083283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 9907669 - 9907755
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9907669 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9907755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 24337911 - 24337997
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24337911 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 24337997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27222121 - 27222035
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27222121 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27222035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 28379322 - 28379413
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28379322 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtgatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 28379413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 21171863 - 21172026
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||| ||    
T  21171863 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagacttagggggagctttcaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacagca 21171961  T
Q  370 attgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21171962 attgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatg 21172026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 29410246 - 29410139
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29410246 ggagcttacaaacctcatacccttaa-gtctacatgttaattagattaacaacaattgt---ttcaaatacctgtgtttgtcatcatcaaaaagggggag 29410151  T
Q  416 attgttggaaca 427  Q
    ||||||||||||    
T  29410150 attgttggaaca 29410139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 414
Target Start/End: Original strand, 27639812 - 27639877
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagaggggga 414  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27639812 acttgttaattaaattaataacaattgaatatt--aatacttgtgtttgtcatcatcaaaaaggggga 27639877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35253811 - 35253653
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  35253811 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtc-ccagtagtcaacttattaattagatcaacaa 35253713  T
Q  368 caattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| | |||||||   || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35253712 caattgaacattttaaatacta---ttag--atcatcaaa-agggggagattgttggaacaaaatg 35253653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35264420 - 35264262
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  35264420 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtc-ccagtagtcaacttattaattagatcaacaa 35264322  T
Q  368 caattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| | |||||||   || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35264321 caattgaacattttaaatacta---ttag--atcatcaaa-agggggagattgttggaacaaaatg 35264262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28770081 - 28769974
Alignment:
Q  320 cttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattg 419  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||   |||  ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28770081 cttacaaacctcagatcctaaa-gtcagctcgttaattaaattaacaacaattgtctatt--aatgcttgtgtttgtcatcataaaaaagggggagattg 28769985  T
Q  420 ttggaacaaaa 430  Q
    | |||||||||    
T  28769984 tcggaacaaaa 28769974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18849001 - 18848820
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||  | |||||  |||||||  |||||||  | |||||||||| ||| |||  |  ||||    
T  18849001 aatttaattaacctggataaaatttaggaagagcttacaaacctcgccttat-ggactatcagacttaggggaagcttacaaatctctgaca-tggaagt 18848904  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    | | ||||||||||||| || ||||||||    ||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18848903 caatttgttaattaaatcaataacaattgt---ttcaaatacttgtgtttgtcatcataaaaaagggggagaatgttggaacaaaat 18848820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 422
Target Start/End: Original strand, 1799550 - 1799582
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttg 422  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1799550 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 1799582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21323 - 21132
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa 341  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||     
T  21323 tgaatttaattaacatggatatgacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattggacttagggggagcttacaaacctcatacccaaat 21224  T
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21223 agtcaacatgttaattaaattaacaacaattgaacgttttaaatactattgtttatcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 21132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1565 - 1378
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  1565 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagcagt 1467  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1466 caacttgttcattaaatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatg 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 4406 - 4634
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  4406 atgtgagattattctgagtgttatttcgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactat 4505  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  4506 tggactcaggggcagcttacaaacctcatacccttacagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatc 4605  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4606 aaaaagggggagattgttgaaacaaaatg 4634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 316 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 60136 - 60020
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  60136 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattttaatactagtgtttctcatcatcaaaaagggggag 60037  T
Q  416 attgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||||    
T  60036 attgttggaacataatg 60020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 134783 - 135012
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-acta 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||   ||||   | |||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||   ||||    
T  134783 atgtgagattattctgagtgttatttcgttcttaatgataaatttaattaacatggataaaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaattacta 134882  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  134883 ttggactcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcat 134982  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  134983 caaaaagggggagattgttggaagaaaatg 135012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 243 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7597 - 7408
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || |||    
T  7597 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattggactcagggggagcttacaaacctcatacccttaaa 7498  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7497 gtcaacgtgttaattagattaacaacagttgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 308 - 433
Target Start/End: Original strand, 14303936 - 14304060
Alignment:
Q  308 acttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaag 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  14303936 acttagagggagcttacaaacctcagaccctaaaagtcaacttgttaattaaattaacaacaattgaacattttaatactggtgtttgtcatcatcaaa- 14304034  T
Q  408 agggggagattgttggaacaaaatga 433  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||    
T  14304035 atgggaagattgttggaacaaaatga 14304060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 13171915 - 13172078
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13171915 ttagggggagcttacaaacctcaccttaagag-ctattggacttagggggagcttacaaacctcataccctaaaagtcaacttgttaattagattaacaa 13172013  T
Q  368 caattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13172014 caattgaactttttaatacaagtgtttgtgatcatcaaaaagggggaaattgttggaacaaaatg 13172078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 431
Target Start/End: Original strand, 13260068 - 13260296
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||   ||||||||||||||||| |||  | | | || ||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  13260068 atgtgacattattctgagtgttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacttggatagaactcaaggggagcttaaaaacctcaccttaaagtacta 13260167  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  13260168 ttcgacttagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcat 13260267  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13260268 caaaaagggggagattgttggaacaaaat 13260296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 432
Target Start/End: Original strand, 22577342 - 22577693
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagat--atag-atttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||| | |||| |||| |||    || |||||||| || ||    
T  22577342 tatactttttgttgatgacaaaagggggagtagatgtatagtatttataggctctgagccccattaattt-aattctaaac--aagttaaattaatagaa 22577438  T
Q  175 cctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttaggga 274  Q
    ||| ||||| || | ||||||| | |    ||||||||||||| |||||| |||| ||  || ||   | ||||||||||||||| |||  | | ||||     
T  22577439 ccttcttcttatctcttagtctatta----atgtgagattattttgagtgatatttcgttttaaatgattaatttaattaacttggatagaactcagggg 22577534  T
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || | | || |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22577535 gagcttacaaacctcaccttaaagtactataggacttagggggagcttacaaacctcaaacccttatactcaacttgttaattagattaacaacaattgc 22577634  T
Q  375 acattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22577635 acattttaaatactaatgtttgtcatcattaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 22577693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 431
Target Start/End: Original strand, 4428534 - 4428724
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa 341  Q
    |||||||||||||| || |||| | | |||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||     
T  4428534 tgaatttaattaacatggatataactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattggactaagggggagcttacaaacctcataccctaat 4428633  T
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
     ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4428634 tgtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 4428724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 286
Target Start/End: Original strand, 14303749 - 14303956
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagatatagatttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaacct 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||    
T  14303749 tatactttttgttgatgacaaaagggggcgtagatatagtattaaaggccttaagccccactaattttaattttaatttaaaattgaattaagagaacct 14303848  T
Q  178 gcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagag 277  Q
    | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| | |||    
T  14303849 gattcttatctcttagtctttaatttcatgtgagattattttgattgtttttacaattttaaa-ctgaatttaattaacttgtatagaacttagagggag 14303947  T
Q  278 cttacaaac 286  Q
    |||||||||    
T  14303948 cttacaaac 14303956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15217166 - 15216979
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  15217166 aatttaattaacgagtatagaatttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 15217068  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15217067 catcttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15216979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 12173807 - 12173997
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||| |||||||| || || | |    
T  12173807 tgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggacacagggggagcttagaaacctcatacccttata 12173906  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12173907 gtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 12173997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14427188 - 14426998
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |    
T  14427188 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtattattggactcagggggagcttacaaacctcatacccttata 14427089  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14427088 gtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcattaaaaagggggagattgttggaacgaaatg 14426998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13649349 - 13649184
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| || || | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13649349 ttagggggagcttacaaaccacaccttagagtactattggacttagggggaacttacaaacttcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaacaa 13649250  T
Q  368 caattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13649249 taattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 13649184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 9709323 - 9709512
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |    
T  9709323 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttagaaacctcacgttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatac-cttata 9709421  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9709422 gtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttggaacaaaatg 9709512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 48236447 - 48236610
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48236447 agggggagcttacaaacctcaccttaaaatactattggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaaca 48236546  T
Q  370 attgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  48236547 attgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgatgaaacaaaatg 48236610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 2265014 - 2265204
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |    
T  2265014 tgaatttaattaacatgaatagaactcaggggaagcttacaaacttcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcataccctcaca 2265113  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | | || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  2265114 gacaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgattgtcatcataaaaaatgaggagattgttggaacaaaatg 2265204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 16316059 - 16316249
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |  || | |    
T  16316059 tgaatttaattaacttgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttagagtactattgtacttagggggagcttacaaacctcaaatccttata 16316158  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16316159 gccaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaataataatgtttgtcaccatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaatg 16316249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 16556321 - 16556479
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||| || || | |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  16556321 gagcttacaaaccacaccttaaagtactattggactcatggagagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattga 16556420  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16556421 atattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 16556479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16609341 - 16609183
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||| || || | |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  16609341 gagcttacaaaccacaccttaaagtactattggactcatggagagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattga 16609242  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16609241 atattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 16609183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 332503 - 332135
Alignment:
Q  60 tttgtctttatagttttatatactttttgttgatgacaaaatggggaatagat--atag-attta-aaggccctgagccccactcattttaattttaagt 155  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||      
T  332503 tttgtcttta-agtttt-tatactttttgttgatgacaaaagggggagtagatgtatagtatttataaggctctgagccccattaattt-aattttaa-- 332409  T
Q  156 taaaattaaattagtaaaacctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtt-taaacctgaatttaatta 254  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||| || | ||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||| ||  || |||   ||||||||||||    
T  332408 tcaagttaaattaataggaccttcttct-atctcttagtctttta----atgtgagattattctgagtgttattgcgttttataattatgaatttaatta 332314  T
Q  255 acttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgtta 354  Q
    || || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | | || ||||||||    
T  332313 acatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaatactattggactcagggggagcttacaaacctcataccct-acattcaacttgtta 332215  T
Q  355 attaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |  |||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  332214 attagattaacaacaattgcaaatttttaaatattatcgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 332135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11096864 - 11096700
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  11096864 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 11096766  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11096765 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 11096700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 26400194 - 26400358
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  26400194 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 26400292  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26400293 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 26400358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 431
Target Start/End: Original strand, 13031597 - 13031759
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| |||||||| || || | |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13031597 agggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattagactttgggggagcttaaaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 13031696  T
Q  370 attgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  13031697 attgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcgaaaagggggtgattattggaacaaaat 13031759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 18361131 - 18361316
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | |||| || |||||||||  |||||||| | |||||   ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||     
T  18361131 tgaatttaattaacttggatagaactcagggggaacttacaaacctcaccttaa-gaactatcaaactcagggggagcttacaaacctcagaccctaaa- 18361228  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18361229 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgactatt--aatactagtgtttgtcatcataaaaaaggaggagattgttggaacaaaatg 18361316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1988385 - 1988221
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  1988385 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 1988287  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1988286 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 1988221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 8012199 - 8012363
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  8012199 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 8012297  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8012298 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 8012363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9086092 - 9085928
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  9086092 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 9085994  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9085993 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9085928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24735581 - 24735417
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  24735581 ttagggggagcttacaaacctcaccataaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 24735483  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24735482 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 24735417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42866672 - 42866508
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  42866672 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 42866574  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42866573 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 42866508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18419982 - 18419795
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||   |||||||  | ||||| |||| ||  ||||||||||||||||  || |||  |||    
T  18419982 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaaccttaccttaatagtctattagactcagggggagcttacaaacctcttac-ctagtagt 18419884  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18419883 caacttgttaatttgatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 18419795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 2715709 - 2715871
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  2715709 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgcccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 2715807  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2715808 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 2715871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 15887771 - 15887933
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  15887771 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 15887869  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15887870 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15887933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 167691 - 167527
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  167691 ttagggagagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 167593  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  167592 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 167527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 40052149 - 40052313
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  40052149 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 40052247  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40052248 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggagagattgttggaacaaaatg 40052313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 270 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9160553 - 9160394
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||   | | || |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  9160553 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacatctatccc-aatagtcaacttattaattaaatcaacaaca 9160455  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaa 429  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9160454 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaa 9160394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8618195 - 8618031
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  8618195 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 8618097  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8618096 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 8618031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21696027 - 21695891
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||| || || | |    
T  21696027 tgaatttaattaacttggataaaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattcgacttagggggagattacaaacctcaaacccttaca 21695928  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacatt 379  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21695927 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacatt 21695891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 467074 - 467236
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  467074 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 467172  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  467173 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 467236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5711095 - 5710933
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  5711095 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 5710997  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5710996 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5710933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 433
Target Start/End: Original strand, 11571826 - 11571975
Alignment:
Q  279 ttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacat 378  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  11571826 ttacaaacctcaccttaa-ggaatattagacttagggggagcttacaaatctcagaccataaa-gtcaacttcttaattaaattaacaacaattgactat 11571923  T
Q  379 tgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatga 433  Q
      |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  11571924 --taatactaatgtttgtcatcatcaaa-aaggggagattgtcggaacaaaatga 11571975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22089930 - 22089768
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  22089930 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaaca 22089832  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22089831 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 22089768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5686233 - 5686147
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5686233 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 5686147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 21002577 - 21002663
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21002577 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 21002663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 26699223 - 26699309
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26699223 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 26699309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9433990 - 9433909
Alignment:
Q  352 ttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9433990 ttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9433909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4212820 - 4212657
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  4212820 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 4212722  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4212721 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcattaaaaagggggagattgttggaacaaaat 4212657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11005933 - 11005847
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11005933 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactgttgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 11005847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 17960215 - 17960379
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |   ||| |||| ||||||| || |||||    
T  17960215 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtggtcaacttattaattagatcaacaa 17960313  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17960314 caattgaacattttaaatgctattgtttgtcatcgtcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17960379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26822869 - 26822757
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||    
T  26822869 ggagcttacaaacctcagactctgaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaattg--tttttaaatacttgtgtttgtcatcatcaaaaagggaaag 26822773  T
Q  416 attgttggaacaaaat 431  Q
    |||||| |||||||||    
T  26822772 attgttcgaacaaaat 26822757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4822074 - 4821960
Alignment:
Q  319 gcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagat 417  Q
    |||||||||||||| || || | |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  4822074 gcttacaaacctcatacccttatagtcaacgttttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcataaaaaaggggaatat 4821975  T
Q  418 tgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||||||    
T  4821974 tgttagaacaaaatg 4821960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 6877426 - 6877512
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6877426 acttattaattagatcaacatcaattgaacattttaaatactattgtttatcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 6877512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 307 - 432
Target Start/End: Original strand, 13137471 - 13137597
Alignment:
Q  307 gacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaa 405  Q
    |||||||  |||||| | ||||| || || || |||||| |||||||||||  ||||| |||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13137471 gacttagggggagctgataaaccgcatacccttaaagtcaacttgttaattggattaataacaattacacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaa 13137570  T
Q  406 agagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  13137571 aaagggtgagattgttggaacaaaatg 13137597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9763244 - 9763131
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcat-caaagaggggga 414  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||    
T  9763244 ggagctttcaaacctcagaccctaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaattgactat--taatacttgtgtttgtcatcataaaaaaatgggga 9763148  T
Q  415 gattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||| |||||    
T  9763147 gattgttggaagaaaat 9763131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9803735 - 9803623
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||| ||| | | |||     
T  9803735 ggagctttcaaacctcataccctaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaattgactatt--aatacttgtgtttgtcatcataaaaaatgaggac 9803639  T
Q  416 attgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  9803638 attgttggaacaaaat 9803623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19144143 - 19144032
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    ||  ||||||  |||| |||||||||||| | ||||||    
T  19144143 ggagcttacaaatctcatactctgaa-gtcaacttgttaattagattgacaacaattgt---ttcaaatacttatgttggtcatcatcaaaaaaggggag 19144048  T
Q  416 attgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  19144047 attgttggaacaaaat 19144032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20743542 - 20743431
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    ||  ||||||  |||| |||||||||||| | ||||||    
T  20743542 ggagcttacaaatctcatactctgaa-gtcaacttgttaattagattgacaacaattgt---ttcaaatacttatgttggtcatcatcaaaaaaggggag 20743447  T
Q  416 attgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  20743446 attgttggaacaaaat 20743431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 1775136 - 1775247
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggag 415  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |  ||| |||| | |||||||||||||| ||| |  ||||     
T  1775136 ggagcttacaaacctcagaccctgaa-gtctacctgttaattagattaacaacaat---attttgaaatatttgtgtttgtcatcattaaaaattgggac 1775231  T
Q  416 attgttggaacaaaat 431  Q
    |||||| |||||||||    
T  1775232 attgtttgaacaaaat 1775247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13649389 - 13649330
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacc 329  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13649389 agggggagcttacaaacctcaccttagagtactattggacttagggggagcttacaaacc 13649330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 112
Target Start/End: Original strand, 4428371 - 4428405
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4428371 tatactttttgttgatgacaaaatggggagtagat 4428405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 17890988 - 17891030
Alignment:
Q  389 gtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17890988 gtgtttgtgatcatcaaaaagagggagattgttggaacaaaat 17891030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Original strand, 7592143 - 7592184
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  7592143 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 7592184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Original strand, 15201869 - 15201910
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15201869 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 15201910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22089974 - 22089910
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctca 332  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  22089974 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctca 22089910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12426 - 12239
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||    
T  12426 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctgatagt 12328  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12327 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattattggaacaaaatg 12239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 10691 - 10878
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||    
T  10691 aatttaattaacttgtttagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctgacagt 10789  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10790 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 10878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17666 - 17479
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||   |||    
T  17666 aatttaattaacttgtatagaaattagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctgttagt 17568  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17567 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 17479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 211392 - 211205
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  211392 aatttaattaacaagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagacttagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 211294  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  211293 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 211205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 217261 - 217074
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  217261 aatttaattaacaagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagacttagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 217163  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  217162 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 217074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 6565 - 6755
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||| || || |||    
T  6565 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattggactcaaggggagcttacaaacctcatacccttaaa 6664  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6665 gtcaatgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 6755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9865 - 9675
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||   |||||||||||||||| || || |||    
T  9865 tgaatttaattaacatggatagaattcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattagactcagggagagcttacaaacctcatacccttaaa 9766  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9765 gtcaacgtgttaattatattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcctcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 34202 - 34429
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-acta 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |   |||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||    
T  34202 atgtgagattattctgagtgttatttca--tttaatgatgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacttcaccctaaaagtacta 34299  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  34300 ttggactcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcat 34399  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34400 caaaaaggaggagattgttggaacaaaatg 34429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 143769 - 143579
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||| || || | |    
T  143769 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcatcttaaagtactattggactcaggggaagcttacaaacctcatacccttata 143670  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  143669 gtcaacttgttaattaaattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 143579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 58726 - 58888
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||   |||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||| || |||||||    
T  58726 agggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctgttagacttagggagagcttacaaacctcatac-ctagtagtcaacttgttaattagatcaacaaca 58824  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  58825 attgaacgttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatg 58888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41366 - 41138
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgattta-gggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  || ||   ||||||||||||||||| |||  | | | ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  41366 atgtgagattattttgagtgttattacgttttaaatgatgaatttaattaacttgaatagaactcaagggggagcttacaaactttaccttaaagtacta 41267  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcat 402  Q
    || |||| | | |||||||||||| |||| ||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  41266 ttcgactca-agggagcttacaaaactcatactcttatagtcaatttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgttatcat 41168  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41167 caaaaagggggagattgttggaacaaaatg 41138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 4090 - 4277
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| | ||||  |||    
T  4090 aatttaattaacttgtatagaacttagaggaagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcata-tctagtagt 4188  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4189 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 4277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0537 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0537
Description:

Target: scaffold0537; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 4121 - 4308
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  4121 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagctctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 4219  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4220 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactatagtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0537; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 106
Target Start/End: Original strand, 3956 - 3984
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatgggga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3956 tatactttttgttgatgacaaaatgggga 3984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 432
Target Start/End: Original strand, 30143 - 30494
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaatagat--atag-atttaaaggccctgagccccactcattttaattttaagttaaaattaaattagtaaaa 174  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||  | || |||||||| ||  |    
T  30143 tatattttttgttgatgacaaaagggggagtagatgtatagtatttataggctctgagccccattaattt-aattttaa--tcaagttaaattaatagga 30239  T
Q  175 cctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttaggg 273  Q
    ||| ||||| || | ||||||| | |    |||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||||   |||||||||||||| || |||  | | ||||    
T  30240 ccttcttcttatctcttagtctatta----atgtaagattattttgagtgttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcaggg 30335  T
Q  274 agagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattg 373  Q
      | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30336 gaaacttacaaacctcaccttaaagtactattggacttagg-ggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattg 30434  T
Q  374 aacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30435 cacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 30494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23339 - 23150
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||   ||||||||  |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || || | |    
T  23339 tgaatttaattaacatggatagaatttagggggagcttacaaaccttaccttaaaatactattagactcagggggagcttacaaacctcatacccttata 23240  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgta-atactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23239 gtcaacatgttaattagattaacaacaattgcacattttatatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 23150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 87663 - 87384
Alignment:
Q  149 tttaagttaaaattaaattagtaaaacctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtg-ctattacgcgtttaaacctgaat 247  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||     ||| ||  |||||    
T  87663 tttaacttaaaattaaattaggagaacctgcttctcatctgttagtctttaatttcatgtgagattattctgagtgacgtttttaaattttaaaatgaat 87564  T
Q  248 ttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtcta 347  Q
    |||||||||||| |||  | | | ||  |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || || |||||| |    
T  87563 ttaattaacttgaatagaactcaagggtagcttacaaacctcaccttaagaga-tattggacttagggggagcttacaaacatcacaccct-aaagtcaa 87466  T
Q  348 cttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  87465 cttgttgattagattaacaacaattgaccattg--atactggtgtttgtcatcatcaaa-aaggggagttttttggaacaaaatg 87384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 3617 - 3804
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |  |||  |||    
T  3617 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcataa-ctagtagt 3715  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3716 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 3804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 9315 - 9502
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||  || |||  |||    
T  9315 aatttaattaacttgtatagaacttagtgggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactaagggggagcttacaaacctcttac-ctagcagt 9413  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9414 caatttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 208 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11236 - 11013
Alignment:
Q  208 tgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattgg 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  |||||   |||||||||||||| || |||  | | | || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  11236 tgagattattctgagtg-tattatgtttttaatgatgaatttaattaacatggataaaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgg 11138  T
Q  308 acttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaa 406  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||| || || |  ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11137 actcagggggagcttacaaacctcatacccttatggtcaacatgttaattagattaacaataattgaacattttaaatattagtgtttgtcatcatcaaa 11038  T
Q  407 gagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  11037 aagggggagattgttggaacaaaat 11013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 897 - 1124
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||| ||||||||  |||||||||| | |||    
T  897 atgtgagattattctgagtgttattacgtttttattgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagtttacaaacctcaccttaaagta-tat 995  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| |   || |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  996 tggactcaaggggggcttacaaacctcatacccttaaagtcaacttgttaattaaattaacaacaagtgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatc 1095  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     || | |||||||||||||||||||||||    
T  1096 taaaacggggagattgttggaacaaaatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 70460 - 70273
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  70460 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagaatcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 70362  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  70361 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaatgggagattgttggaacaaaatg 70273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 429
Target Start/End: Original strand, 3382 - 3651
Alignment:
Q  155 ttaaaattaaattagtaaaacctgcttctcatattttagtctttaatttcatgtgagattattct-gagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaatt 253  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||   ||    | |||||  |||||||||||    
T  3382 ttaaaattaatttaggagaacctgcttctcatctcttagtctctaatttcatgtgaaattatttttgagtgacgtttttggattaaaa-tgaatttaatt 3480  T
Q  254 aacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgtt 353  Q
    |||||| |||  | | | || ||||||||||||  |||||||| | |||||   ||| ||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  3481 aacttggataaaactcatgg-gagcttacaaacctcaccttaa-gaactatcaaactcagggggagcatacaaacctcataccctaaa-gtcaacttgtt 3577  T
Q  354 aattaaattaacaacaattgaacattgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaa 429  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3578 aattagattaacaacaattgaccatt--aatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattattggaacaaa 3651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 61896 - 61709
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| ||  ||||||||||||||||| || ||  ||||    
T  61896 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctataagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctggaagt 61798  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  61797 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgttagtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 61709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Original strand, 148 - 311
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  148 agggggagcttacaaacctcaccttaaaataatattggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaaca 247  T
Q  370 attgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  248 attgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 19815 - 20006
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaa-aggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa 341  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||   ||     
T  19815 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggggagcttacaaacctcttaccaaaat 19914  T
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19915 agtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 20006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 245 - 431
Target Start/End: Original strand, 5933 - 6119
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  5933 aatttaattaacttgtatagaacttagagggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatac-ctgaaagt 6031  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    | | |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6032 caaattgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaaatggggagattgttggaacaaaat 6119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14290 - 14100
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||| || || | |    
T  14290 tgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattagacttagggagagcttacaaacctcatacccttata 14191  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaaca-ttgtaatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14190 gtcaacttgttaattagattaacaataattgcacatttaaaatactaatgtttgtcatcatcaacaagggggagattgttggaacaaaatg 14100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7373 - 7216
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  7373 gagcttacaaacctcaccttaaagatctattagacttagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagtcaacttgttaattagatcaacaacaattga 7275  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7274 acattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 7216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8074 - 7884
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa 341  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||     
T  8074 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattggacttagggggagcttacaaacctcatacccaaat 7975  T
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  7974 agtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttagaacaaaat 7884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 8953 - 9182
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||   |||||   |||||||||||||| ||||||  | | ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||    
T  8953 atgtgagattattctgagtgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaacatgtatagaactcaggggaagattacaaacctcaccttaaagtacta 9052  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||  || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  9053 ttggactcagggggagcttacaaacctcgtacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatggttgtcatcat 9152  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9153 caaaaatggggagattgttggaacaaaatg 9182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2856 - 2669
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  2856 aatttaattaacgagtatagaatttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatac-ctagtagt 2758  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
       ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2757 tatcttgttaattagatcaacatcaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 2669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9993 - 9806
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| | || ||   |||    
T  9993 aatttaattaacttgtatagaacttaggaggagcttacaaaactcaccttaaaggtctattggactcagggggagcttacaaaccttatac-cttgtagt 9895  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9894 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcagaaagggggagattgttggaacaaaatg 9806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0435
Description:

Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 399
Target Start/End: Original strand, 4714 - 4908
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  4714 atgtgagattattctgagtggtatttcgtttttaaagatgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcacct-aaagtactat 4812  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcat 399  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  4813 tggacttagggggagcttacaaacctcataccctttaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcat 4908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8575 - 8385
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |   ||||||||||||||||| || || | |    
T  8575 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgaactcaatgggagcttacaaacctcatacccttata 8476  T
Q  343 gtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8475 gtcaacttgttaattagattaacaataattgcacattttaaatactaatgtttgtcattatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 8385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 128492 - 128304
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagga-ctattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaag 343  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || ||   ||    
T  128492 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcacac-cttgtag 128394  T
Q  344 tctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  128393 tcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 128304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2697 - 2510
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || ||   |||    
T  2697 aatttaattaacctgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagacttagggggagctttcaaacctcttac-ctggcagt 2599  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2598 caacttgttaattggatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaatgggggagattgttggaacaaaatg 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 289 - 432
Target Start/End: Original strand, 36254 - 36398
Alignment:
Q  289 caccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tact 387  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  36254 caccttaaaatactattagactcagggggagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgataattagattaacaacaattgcacattttaaatact 36353  T
Q  388 agtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36354 aatgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 36398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 289 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42751 - 42607
Alignment:
Q  289 caccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tact 387  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  42751 caccttaaaatactattagactcagggggagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgataattagattaacaacaattgcacattttaaatact 42652  T
Q  388 agtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42651 aatgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 42607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7989 - 7798
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaa-aggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaa 341  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| |||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |   ||     
T  7989 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcctacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggggagcttacaaacctctttccaaaat 7890  T
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7889 agtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 7798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31939 - 31775
Alignment:
Q  268 ttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | | | |  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  31939 ttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaa 31841  T
Q  368 caattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31840 caattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 31775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 5003 - 5232
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  || |||   |||||||||||||| || |||  | | |||| |||||||||||   ||||| |||  ||||    
T  5003 atgtgagattattctgagtgttatttcgttttaaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaagctcacctcaaactacta 5102  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||    
T  5103 ttggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgaacattttaaacactattgtttgtcatcat 5202  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||    
T  5203 cgaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 5232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 95478 - 95437
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  95478 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 95437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 9680 - 9867
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| | ||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||   |||    
T  9680 aatttaattaacgagtatagaacttagggggggcttacaaacctcgccttaaaggtctattagacttagggggagcttacaaacctcttac-ctggtagt 9778  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9779 caacttgttaattagatcaaaaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Original strand, 6572 - 6759
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | | ||||    
T  6572 aatttaattaacgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agaagt 6670  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6671 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 6759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 59147 - 58960
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||| |||||||| || |||  |||    
T  59147 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttaaaaacctcatac-ctagtagt 59049  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||  |  |||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  59048 caacttgttaatttgaccaacaacaattgaattttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 58960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15730 - 15543
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||| || |||  |||    
T  15730 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattaaactcagggagagcttacaaacctcatac-ctagtagt 15632  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15631 cagcttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatg 15543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 176189 - 176002
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||  |  ||||||||||||||||| || |||  |||    
T  176189 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactccgggggagcttacaaacctcaaac-ctagtagt 176091  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  176090 caacttgttaattagatcaacaacaattgaatattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttggaacaaaatg 176002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 406
Target Start/End: Original strand, 53262 - 53423
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagt 344  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||| ||| ||||||||  |||||||||   |||||||||| ||  |||||||||||||| || || ||   |||    
T  53262 aatttaattaatttgtatagaacttagggggagtttacaaacctcaccttaaaaatctattggactcagggggagcttacaaaccacaaac-ctggcagt 53360  T
Q  345 ctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaa 406  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  53361 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaa 53423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12046 - 11887
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaagg-actattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattg 373  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||| || | || ||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  12046 gagcttacaaacctcaccttaaaagtactactggacttagggggagcttacaaacctcatacccaaatagtcagcgtgttaattagattaacaacaattg 11947  T
Q  374 aacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11946 aactttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgttggaacaaaatg 11887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 316 - 432
Target Start/End: Original strand, 2228 - 2345
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagaggggga 414  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  2228 ggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaagtactattgtttgtcatcaccaaaaaggggga 2327  T
Q  415 gattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2328 gattattggaacaaaatg 2345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 12930 - 13156
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||| | ||||||  |||||||||| |||||    
T  12930 atgtgagattattcatagtgttatttcgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagataacaaacctcaccttaaagtactat 13029  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  13030 tggactcaaggggagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaatta--ttaaaaacaactgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatc 13127  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13128 aaaaagggggagattgttggaacaaaatg 13156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 4170 - 4399
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacc-tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggacta 303  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||   ||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||  ||||||||| |  |     
T  4170 atgtgagattattttgagtgttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacttggatagaactcagggtgagcttacaaacctcaccttaaaagtatt 4269  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcat 402  Q
    |||||||| |  ||||||||||||  ||| || || |  ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  4270 ttggacttcgggggagcttacaaaagtcaaacccttatggtcaacttgttaattagattaacaacaattgcatattttaaatactaatgtttgtcatcat 4369  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4370 aaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 4399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 17162 - 17390
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaagg-acta 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||  | | || | ||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  17162 atgtgagattattctgagtgttatttcgaatttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagagggagcttacaaacctcaccttaaaagtacta 17261  T
Q  304 ttggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcat 402  Q
    ||||||| |   ||||||||||||| ||| || |||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  17262 ttggactcaaggggagcttacaaac-tcataccctaatagtcaacatgttaattagattaacaataattgaacattttaaatgctattgtttgtcatcat 17360  T
Q  403 caaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  17361 caaaaaaggggagattgttgaaacaaaatg 17390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 432
Target Start/End: Original strand, 15012 - 15206
Alignment:
Q  243 tgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagctta----caaacctcagactct 338  Q
    |||||||||||||| || |||  | | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||    ||||||||  || |     
T  15012 tgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattagactcagggggagcttaattacaaacctcttaccca 15111  T
Q  339 aaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    || |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15112 aatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaactttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32907
Alignment:
Q  246 atttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtc 345  Q
    |||||||||||||| |||  | |  ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  | | ||    
T  33095 atttaattaacttggatagaactccgggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggacttagggggagcttacaaacctcaaacccgtacaatc 32996  T
Q  346 tacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  32995 aacttgttaattagattaacagcaattgcacattttaaaatactaatgtttgtcatcataaaaaagggagagattgttagaacaaaatg 32907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 60279 - 60507
Alignment:
Q  205 atgtgagattattctgagtgctattacgcgtttaaacctgaatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactat 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||  | | |||| ||| | ||||||  ||| |||||| |||||    
T  60279 atgtgagattattctgagtgttatttcgtttttaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagataacaaacctcactttaaagtactat 60378  T
Q  305 tggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatc 403  Q
    |||||| ||  |||| |||||||||||| || || | |||| |||||||||||| | ||| ||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  60379 tggactcagggggagtttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagaataaaaacaactgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatc 60478  T
Q  404 aaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||    
T  60479 aaaattggggagattgttggaacaaaatg 60507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 12792 - 12883
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12792 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 12883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 3954 - 4111
Alignment:
Q  275 gagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattga 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  3954 gagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-aaaagtcaacttattaattagatcaacaacaattga 4052  T
Q  375 acattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4053 acattttaaatactagtgtttgtcatcattaaaaagggggagattgttagaacaaaatg 4111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 192746 - 192584
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  192746 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtagtcaacttattaattagatcaacaaca 192648  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  192647 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 192584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 47099 - 47185
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47099 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 47185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 53055 - 53141
Alignment:
Q  347 acttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53055 acttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 53141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 431
Target Start/End: Original strand, 4880 - 4963
Alignment:
Q  350 tgttaattaaattaacaacaattgaacattgt--aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4880 tgttaattagattaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggagagattgttggaacaaaat 4963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 332
Target Start/End: Original strand, 4026 - 4088
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctca 332  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4026 agggggagcttacaaacctcaccataaagtactattggacttagagggagcttacaaacctca 4088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23441 - 23279
Alignment:
Q  270 agggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaaca 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||   | | |  | || |||| |||||||  | |||||||    
T  23441 agggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatccc-agtattcaacttattaattaggtcaacaaca 23343  T
Q  370 attgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23342 attgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 23279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3531 - 3440
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||| |||| ||||||| || | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3531 agtcaacttattaattagatcagcaacaattgaactttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 3440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10400 - 10282
Alignment:
Q  315 aggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagaggggg 413  Q
    |||||||| ||||||||| || || | | || ||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |    
T  10400 aggagcttgcaaacctcaaacccttataatcaacttgttaactagattcacaacaattgaaaattttaaatactgctgtttgtcatcatcaaaaagggtg 10301  T
Q  414 agattgttggaacaaaatg 432  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10300 agattgttggaacaaaatg 10282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Original strand, 37574 - 37664
Alignment:
Q  342 agtctacttgttaattaaattaacaacaattgaacattgtaa-tactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37574 agtcaacttgttaattagatcaacaaaaattgaacattttaaatactattgcttgtcatcatcaaaaagggagagattgttggaacaaaat 37664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1260 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1260
Description:

Target: scaffold1260; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 2086 - 2148
Alignment:
Q  78 tatactttttgttgatgacaaaatggggaataga--tatag-atttaaaggccctgagcccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2086 tatactttttgttgatgacaaaagggggagtagatgtatagtatttaaaggctctgagcccca 2148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 371
Target Start/End: Original strand, 9949 - 10003
Alignment:
Q  316 ggagcttacaaacctcagactctaaaagtctacttgttaattaaattaacaacaat 371  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9949 ggagcttacaaacctcataccctaaa-gtcaacttgttaattagattaacaacaat 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 430
Target Start/End: Original strand, 16444 - 16494
Alignment:
Q  382 aatactagtgtttgtcatcatcaaagaggggga--gattgttggaacaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16444 aatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggaaggattgttggaacaaaa 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30612 - 30530
Alignment:
Q  245 aatttaattaacttgtatatgatttagggagagcttacaaactgcaccttaaaggactattggacttagaaggagcttacaaa 327  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  30612 aatttaattaacgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaa 30530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Original strand, 2678 - 2719
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  2678 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27166 - 27125
Alignment:
Q  390 tgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaat 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27166 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 27125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University