View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14814_low_2 (Length: 456)

Name: NF14814_low_2
Description: NF14814
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14814_low_2
NF14814_low_2
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (1-423)||(24049784-24050205)
chr7 (1-441)||(11559889-11560328)
chr7 (1-436)||(11628971-11629407)
chr7 (1-438)||(48797008-48797444)
chr7 (1-438)||(14975767-14976202)
chr7 (1-438)||(15405243-15405678)
chr7 (1-438)||(30226402-30226838)
chr7 (1-438)||(12560603-12561039)
chr7 (17-438)||(3285690-3286110)
chr7 (1-437)||(7620415-7620850)
chr7 (1-287)||(14985006-14985288)
chr7 (1-287)||(15414617-15414899)
chr7 (106-183)||(9567351-9567428)
chr7 (22-181)||(4547452-4547611)
chr7 (11-60)||(7508731-7508780)
chr7 (106-183)||(4794218-4794295)
chr7 (110-178)||(10661316-10661384)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (1-441)||(15687085-15687526)
chr4 (1-441)||(11905429-11905862)
chr4 (1-438)||(24143468-24143903)
chr4 (1-437)||(23541577-23542011)
chr4 (1-396)||(46738693-46739090)
chr4 (1-438)||(19894202-19894637)
chr4 (1-423)||(22555306-22555728)
chr4 (1-396)||(25354065-25354460)
chr4 (1-192)||(11324780-11324970)
chr4 (336-438)||(11324657-11324759)
chr4 (107-183)||(31971376-31971452)
chr4 (7-122)||(10197937-10198056)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-438)||(36630-37067)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (1-438)||(33465549-33465986)
chr8 (1-437)||(17280222-17280656)
chr8 (1-438)||(17880127-17880564)
chr8 (1-438)||(37154913-37155350)
chr8 (22-438)||(22876367-22876787)
chr8 (1-287)||(39081298-39081583)
chr8 (1-198)||(8727177-8727372)
chr8 (209-437)||(8730470-8730699)
chr8 (242-438)||(18676363-18676559)
chr8 (13-181)||(23250075-23250243)
chr8 (330-396)||(23250401-23250466)
chr8 (7-114)||(12240534-12240643)
chr8 (348-437)||(39081586-39081675)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (5-438)||(13314354-13314787)
chr2 (1-438)||(29566345-29566782)
chr2 (1-438)||(18766011-18766448)
chr2 (124-379)||(18606044-18606299)
chr2 (7-149)||(31587829-31587974)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (2-438)||(33062719-33063155)
chr1 (1-438)||(45598719-45599155)
chr1 (2-438)||(52436205-52436643)
chr1 (7-438)||(40312612-40313042)
chr1 (57-438)||(11085048-11085429)
chr1 (1-198)||(17012334-17012531)
chr1 (124-411)||(17038685-17038973)
chr1 (43-149)||(8282311-8282419)
chr1 (7-76)||(8902354-8902425)
chr1 (340-374)||(15914875-15914909)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (1-438)||(32452320-32452757)
chr6 (1-438)||(15002549-15002987)
chr6 (2-423)||(9384948-9385369)
chr6 (1-438)||(19216287-19216724)
chr6 (1-379)||(16137028-16137406)
chr6 (209-437)||(20003623-20003852)
chr6 (1-107)||(12444441-12444547)
chr6 (1-108)||(20003435-20003543)
chr6 (1-156)||(15003965-15004120)
chr6 (91-152)||(30425315-30425376)
chr6 (110-183)||(16308992-16309065)
chr6 (94-153)||(21322941-21323000)
chr6 (93-182)||(24542089-24542178)
chr6 (123-183)||(21727619-21727679)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (7-438)||(20286900-20287331)
chr5 (1-438)||(20497540-20497977)
chr5 (1-422)||(7897320-7897740)
chr5 (1-438)||(17920177-17920610)
chr5 (1-438)||(26182623-26183059)
chr5 (300-438)||(34404822-34404961)
chr5 (106-183)||(22130482-22130559)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (2-438)||(9037040-9037475)
chr3 (1-438)||(8749372-8749809)
chr3 (1-437)||(9030811-9031231)
chr3 (1-84)||(11564326-11564409)
chr3 (125-183)||(7495569-7495627)
chr3 (341-406)||(11560912-11560977)
chr3 (106-183)||(13914239-13914316)
chr3 (106-183)||(13918280-13918357)
chr3 (11-60)||(15674908-15674957)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (1-438)||(16360-16797)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-411)||(3454-3863)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (22-238)||(11546-11772)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (2-156)||(103440-103595)
scaffold0032 (367-441)||(103606-103679)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (108-178)||(52570-52640)
scaffold0064 (108-181)||(45562-45634)
[»] scaffold0645 (1 HSPs)
scaffold0645 (341-406)||(1718-1783)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (11-60)||(9849-9898)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (106-183)||(73867-73944)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (106-182)||(413-489)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 24049784 - 24050205
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24049784 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaagaacagactcaaaaccttaaatgatctatatttcaaatgacggct 24049883  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcaga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24049884 tgaataatgaattaggtcttgcagtcttgtttaaatactgaagcaatacggatcagaacaacttaatgggcttcggaacaaaacggtgatc-gtttcaga 24049982  T
Q  201 acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24049983 acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcctgatcagctccaaactttcctaagtagatagcactcccttagg 24050082  T
Q  301 aaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcag 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24050083 aaatcacaaacgatctgattctgtactaaaagcatgcagcttgaccaacaataattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcataaaaccag 24050182  T
Q  401 gcaaggcacaggtcaactgaacc 423  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  24050183 gcaaggtacaggtcaactgaacc 24050205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11560328 - 11559889
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  11560328 caactcaaacacagtcctaaacattcatcaagatgatacacgaaaggctaacaaattacagactgaaaaacctaaatgatctattcttcaaatgacggct 11560229  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcaga 200  Q
    |  || ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11560228 tagatgatgtattaggtcttgcagtcttgattaaatactgaagcaataggggtcagaacaaatttttgggcttcagaacaaa-cggtgatccgtttcaca 11560130  T
Q  201 acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcagg 300  Q
     | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||  ||||    
T  11560129 tcgatcataaccagataaggaaagtccaaatatgtaggcacattattaggaacatccttatcaccttcaaactttccgaagtcgatagcactccaacagg 11560030  T
Q  301 aaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcag 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  11560029 aaatcacaaacgatctgattttgtactaaaagcacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaataaacgcgtgcgaaaaacaag 11559930  T
Q  401 gcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttggaac 441  Q
    |||||  | ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  11559929 gcaagctataggtcaactaaaccatgccaggatattggaac 11559889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 11628971 - 11629407
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |    
T  11628971 caactcaaacacagtcctaaacatgcttcaagatgatacacgaaaggctcacaaataacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggc 11629070  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    |||||||||   ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||     
T  11629071 ttgaataattctttaggtcttccagttttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagta-aacttgttgggctttagaacaatccggtgatccatttcac 11629169  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaa-ctttcctaagtagatagcactccctc 297  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||   ||     
T  11629170 gaacaa-cagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcaactccaaaactttcctaagtagataacacaatctt 11629268  T
Q  298 aggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||     
T  11629269 aggaaatcacaaacgatctgatcctgtcctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaagcgtggattcctttaataaaaaagcgtgtgcgtaaaac 11629368  T
Q  398 caggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgtt 436  Q
     ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11629369 aaggcaaggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgtt 11629407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 48797444 - 48797008
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |    
T  48797444 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggc 48797346  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    ||||||  |    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||     
T  48797345 ttgaatgcttctctaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagta-aacttgttggacttcagaacaatccggtgatccatttcac 48797247  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    | ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   || |    
T  48797246 gtacaat-agaaccagaaaaagaaactcctaatatgtaggcacattattaggaaaatcctgatcacctccaaactttcctaagcagatagctcattctta 48797148  T
Q  299 ggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||      
T  48797147 ggaaatcacaaacgatttgatcctgtgctaaaaacatgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaaca 48797048  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48797047 aggcagggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 48797008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 14975767 - 14976202
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||   ||||||||||| |||||||||  |||| |||||| ||    
T  14975767 caactcaaactcagtcctaaacatgcattaagatgatacacgaaagactcacata-aacac--tcaaaaccctagatgatctattcttcagatgacggct 14975863  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttc-ag 199  Q
    ||||| ||    || ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||    
T  14975864 tgaatcattctctaggtcttccagtcttgtttaaatattgaagcaatacgggtcagtaaaacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttcaag 14975963  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    | ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||   || ||    
T  14975964 atcaa-cagaatcagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccacactttcctaagtagctaacacaatcttag 14976062  T
Q  300 gaaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    |||| |||||| |||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||      
T  14976063 gaaaacacaaaccgatctgatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaaca 14976162  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||| ||  || ||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  14976163 aggcagggtgcaagtcaactaaaccatgccaggatattgg 14976202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 15405243 - 15405678
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||   ||||||||||| |||||||||  |||| |||||| ||    
T  15405243 caactcaaactcagtcctaaacatgcattaagatgatacacgaaagactcacata-aacac--tcaaaaccctagatgatctattcttcagatgacggct 15405339  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttc-ag 199  Q
    ||||| ||    || ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||    
T  15405340 tgaatcattctctaggtcttccagtcttgtttaaatattgaagcaatacgggtcagtaaaacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttcaag 15405439  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    | ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||   || ||    
T  15405440 atcaa-cagaatcagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccacactttcctaagtagctaacacaatcttag 15405538  T
Q  300 gaaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    |||| |||||| |||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||      
T  15405539 gaaaacacaaaccgatctgatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaaca 15405638  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||| ||  || ||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  15405639 aggcagggtgcaagtcaactaaaccatgccaggatattgg 15405678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 30226402 - 30226838
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||||  |||||| ||||  |    
T  30226402 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaaggtgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaacccttgatgatctattcttcaaaatgacagc 30226500  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcag 199  Q
    |||||||||     |||| || | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||     
T  30226501 ttgaataattctccaagtgttacagtcttgtttaaatactgaggcaatacaggtcagtaga-cttgttgagcttcagaacaattcggtgatccatttcac 30226599  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||    
T  30226600 aaacaacagaaccagaaaaggaaactcctataaagtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatcttag 30226699  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
     |||||||||||||| ||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  | ||| |||||||||  |    
T  30226700 taaatcacaaacgatttgatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaatataatagcgcatgcgtaaaacaa 30226799  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||| ||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  30226800 ggcagggtgcaggtcaactgaatcatgccaggatgttgg 30226838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12561039 - 12560603
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaat--gacga 98  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| |||||||||  |||||||  ||||     
T  12561039 caactcaaacatagtcctaaacatgcataaagatgatacacgaaaggctcacata-aatagactcaaaatcctagatgatctattcttcaaatttgacgg 12560941  T
Q  99 cttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca 198  Q
    |||||||| |    || ||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  12560940 cttgaatacttctctaggtcttccaatcttgtttatatactgaagtaatacgggtcagta-aacttgttgggcttcagaacaatctggtgatccgtttca 12560842  T
Q  199 -gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctc 297  Q
     | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||   |  ||     
T  12560841 cgtacaa-cagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatccttatcacctcctaactttcctaagtagatagttat-tctt 12560744  T
Q  298 aggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  12560743 aggaaatcacaaacgatctgatcctgtgctaaaaacaagcagcttgactaacaagaataaaggtgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaac 12560644  T
Q  398 caggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
     ||||| ||   |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12560643 aaggcagggtggaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 12560603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3286110 - 3285690
Alignment:
Q  17 ctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttgaataatgaattaag 116  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  || |||| ||| ||| |||       || |    
T  3286110 ctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttgaaattacggcttcaattcctctctagg 3286012  T
Q  117 tcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-gaacaatcagaaccaga 215  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||    
T  3286011 tcttccagtcttgtttaaatactgaaacaatacaagtcagta-aacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttcacgatcaa-cagaatcaga 3285914  T
Q  216 taaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaatcacaaa-cgat 314  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||   || || |||||||||| ||||    
T  3285913 taaggaaactgctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacttccaaactttcctaagtagataacacaatcttagaaaatcacaaaccgat 3285814  T
Q  315 ctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggcacaggtc 414  Q
    ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  | | |||||||||||  ||||| ||  ||||||    
T  3285813 ctgatcatgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaatacgtggattccttaaataaaatagcacgtgcgtaaaacaaggcagggtgcaggtc 3285714  T
Q  415 aactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3285713 aactgaaccatgccaggatgttgg 3285690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 437
Target Start/End: Original strand, 7620415 - 7620850
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  7620415 caactcaaactcagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaagggtcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaatgacgact 7620513  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    |||||| |    || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |    
T  7620514 tgaatacttctctaggtcttccagtcttgtttaaatactaaagcaatacgagtcatta-atcttgttgggcttcagaacaatcctgtgatccatttcacg 7620612  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     |||| || || || | ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||   || ||    
T  7620613 tacaa-caaaatcataaaaggaaactcctaatatgtaggtacattattaggaacatcctgatcacctcctaactttcctaagtagataacacaatcttag 7620711  T
Q  300 gaaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||  ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||  | |||||||||||||      
T  7620712 gaaatcacaaaccgatccgatcctgtgctaaaaacacgcagtttgaccaacaagaataaaagcgttgataccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaaca 7620811  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttg 437  Q
    ||||| |   || |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  7620812 aggcaggatgcatgtcaaccgaaccttgccaggatgttg 7620850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 14985006 - 14985288
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||| || || |||  |||| |||||  ||    
T  14985006 caactcaaactcagtcctaaacatgcattaagatgatacacgaaaggctcacata-aacac--tcaaaaccctagataatatattcttcagatgacagct 14985102  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    ||||| ||    || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  14985103 tgaatcattctctaggtcttcca-tcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagtaaaacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttcacg 14985201  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagata 287  Q
    | ||| || || |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14985202 atcaa-cataatcagaaaagaaaacttctaatatgtaggcacattattaggaacatcctaatcacctccaagctttcctaagtagata 14985288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 15414617 - 15414899
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||| || || |||  |||| |||||  ||    
T  15414617 caactcaaactcagtcctaaacatgcattaagatgatacacgaaaggctcacata-aacac--tcaaaaccctagataatatattcttcagatgacagct 15414713  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    ||||| ||    || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  15414714 tgaatcattctctaggtcttcca-tcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagtaaaacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttcacg 15414812  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagata 287  Q
    | ||| || || |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15414813 atcaa-cataatcagaaaagaaaacttctaatatgtaggcacattattaggaacatcctaatcacctccaagctttcctaagtagata 15414899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 9567351 - 9567428
Alignment:
Q  106 aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  9567351 aatgaattaggtcttgtagtcttgtatatatactgaagcaatatgggtcagtagactttgttgggcttcagaacaaaa 9567428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4547611 - 4547452
Alignment:
Q  22 catgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaa-ataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttgaat-aatgaattaagtct 119  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  4547611 catgcatcaaggtgatacacgaaagactcacaatgaaacagactcaaaaccctaaa-gatctaaacttc-aatgacgatttgaatggttgaattaggtct 4547514  T
Q  120 tgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaa 181  Q
    ||  |||| ||||| ||| ||||||||||  ||  | |||  ||||||||||||||||||||    
T  4547513 tgtagtctcgtttatatattgaagcaatataggatataacttcttgttgggcttcagaacaa 4547452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 7508731 - 7508780
Alignment:
Q  11 acagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataaca 60  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7508731 acagtcccaagcttgcatcaagatgatacaagaaaggctcacaaataaca 7508780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4794295 - 4794218
Alignment:
Q  106 aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||| | || | |||||||| |||||||||||||    
T  4794295 aatgaattaggtcttgtagtcttgtatatatactaaagcaatatgggttataatatcttgttggacttcagaacaaaa 4794218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 178
Target Start/End: Original strand, 10661316 - 10661384
Alignment:
Q  110 aattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaa 178  Q
    ||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  10661316 aattaggtcttgaagttttgtttatatactgaagcaatacgggtcaaatagtcttgttgggcttcagaa 10661384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15687526 - 15687085
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  15687526 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaagatgatacacgaaagactcacaaataacagactcaaaaccctaaatgatctattcttcaaatgacggct 15687427  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcaga 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15687426 tgaatgatgaattaggtcttgcagtcttgtttagatactgaagcaatatgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatctgtttcaga 15687327  T
Q  201 acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcagg 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15687326 ataatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcggg 15687227  T
Q  301 aaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcag 400  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||    
T  15687226 aaatcataaacgatctgattctgtactaaaagcacgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtggattccttaaataaacaaacacgtgcgtaaaacaag 15687127  T
Q  401 gcaaggcacaggtca-actgaaccgtgccacgatgttggaac 441  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15687126 gcaaggtacagggcataccgaaccatgccaggatgttggaac 15687085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 11905429 - 11905862
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||| | |  ||||||||||| ||    
T  11905429 caactcaaacatagtcataaacatgcaacaagatgatacacgaaaggctcacaaata-caaactcaaaaacctaaaagatttgttcttcaaatgacggct 11905527  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcaga 200  Q
    | ||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  11905528 tcaataattcattaggtcttgcagtcttgattaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaa-cggtgatctgtttcaca 11905626  T
Q  201 acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcagg 300  Q
     |||||||||| |||||||     ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11905627 tcaatcagaactagataag-----tcctaatatgtagacacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcatg 11905721  T
Q  301 aaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcag 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  11905722 aaatcacaaacgatctgattctgtactaaaagcacgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtggattccttaaataaataaacgcgtgtgtaaaacaag 11905821  T
Q  401 gcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttggaac 441  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11905822 gcaaggtaccggtcaactgaaccatgccaggatgttggaac 11905862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 24143468 - 24143903
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||   |||||    
T  24143468 caactcaaacacagtcctaagcatgtatcaagatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatatattcttcaaacagcgact 24143566  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    ||||| ||    || ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  24143567 tgaatgattctctaggtcttccagtcttgtttaaatattgaagtaatacgggtcagta-aacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttcacg 24143665  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    || ||    
T  24143666 tacaa-cagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacataattcggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacataatcttag 24143764  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    |||||||||||| || ||||  | |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||  |    
T  24143765 gaaatcacaaacaatttgatcctatgctaaaaacatgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgaaaaacta 24143864  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24143865 ggcaaggtgtaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 24143903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 437
Target Start/End: Original strand, 23541577 - 23542011
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||    
T  23541577 caactcaaacacaatcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacaaa-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaatgacagct 23541675  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    ||||| ||    || |||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||  | | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  23541676 tgaatcattctctaggtcttctagtcttgtttaaatactgaagcaatacagatcatta-atcttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttcacg 23541774  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     |||| || ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||   || ||    
T  23541775 tacaa-cataaccagaaaaggaaactcctaataagtatgcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagcagataacacaatcttag 23541873  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||  |    
T  23541874 gaaatcacaaacgatctgatcttgtgctaaaaatacgcagcttgaccgacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaataacgcgtgcgaaaaacaa 23541973  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttg 437  Q
    ||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  23541974 ggcaaagtacaggtcaattgaaccatgccatgatgttg 23542011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 46739090 - 46738693
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  || | |||||| ||    
T  46739090 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattctttagatgacggct 46738992  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    |||||| |    || ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |    
T  46738991 tgaatacttctctaggtcttccagtcttgttgaaatactgaagcaatacgggtcagtaaaacttgttgggcttctgaacaatccggtgatccatttcacg 46738892  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    | ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||    
T  46738891 atcaa-cagaatcagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatcttag 46738793  T
Q  300 gaaatcac-aaacgatctgattatgtatt--aaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaa 396  Q
     ||||||| ||||||||||||  |||  |  |||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  46738792 aaaatcacaaaacgatctgatcctgtgctaaaaaaacacgcagtttgaccaacaagaataaagacgtgaattccttaaataaaaaagcgtgtgcgtaaaa 46738693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19894637 - 19894202
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  ||    
T  19894637 caactcaaacacattcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaa-ccctagatgatctattcttcaaatgacagct 19894540  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    ||||| ||    || ||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  19894539 tgaatgattctctatgtcttccaatcttgtttaaatactgaagcaataagggtcagta-aacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttcacg 19894441  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     |||| ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||    
T  19894440 tacaa-cagaatcagaaaagaaaacttctaatatgtagacacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatcttag 19894342  T
Q  300 gaaatcacaaac-gatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
     ||||||||||| ||| ||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||      
T  19894341 aaaatcacaaaccgatatgatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgtgtaaaaca 19894242  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  19894241 aggcagggtgcaggtcaactgaatcatgccaggatgttgg 19894202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 22555306 - 22555728
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||  |||||| ||||| |    
T  22555306 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacaaaaggctcacata-aacagactcaaaatcctagatgatctattcttcaaaatgacggc 22555404  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    ||||||||||   || || || | |||| |||||||||||||| |||||||||| |  | | ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||     
T  22555405 ttgaataatgctctaggttttccagtctcgtttaaatactgaaacaatacgggttatta-atcttgttgggcttcagaagaatccggtgatccatttcac 22555503  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    || ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |    
T  22555504 gatcaa-cagaatcagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattagaaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatctta 22555602  T
Q  299 ggaaatcaca-aacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaag 397  Q
    | |||||||| | |||||||||  |||  ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||     
T  22555603 gaaaatcacacaccgatctgatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccatcaagaataaaggcgtgaattccttaaataaaattgcgcatgcgtaaaac 22555702  T
Q  398 caggcaaggcacaggtcaactgaacc 423  Q
     ||||| ||  |||||||||||||||    
T  22555703 aaggcagggtgcaggtcaactgaacc 22555728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25354460 - 25354065
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||    
T  25354460 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgacacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagataatctattcttcaaatgacggct 25354362  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtt--tca 198  Q
    ||||||||    || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||||  |||  |||||||| ||  |||    
T  25354361 tgaataattctctaggccttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagatc-atttttcgggcttcagataaaactggtgatccattaatca 25354263  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaa--actttcctaagtagatagcactccct 296  Q
     | |||| || ||| |||||| ||| |||||| | ||||||| ||  || ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||| |||    
T  25354262 -atcaat-aggaccggataagaaaactcctaaaaagtaggcacatctttaggaacattatgatcaccttcaaagactttcctaagtcgttagcacttcct 25354165  T
Q  297 caggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaa 396  Q
    |||||||||||| | | ||||||  | |  ||||  || |||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25354164 caggaaatcacatatgttctgatcttctcataaagacacgcaggttgaccaacactaatgaaggcgtggattccttaaataaacgaacgcgtgcgtaaaa 25354065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11324970 - 11324780
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||      
T  11324970 caactcaaatgcagtcctaaacatgcatcaagatgatacactaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggt 11324872  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatcc 192  Q
    ||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11324871 ttgaataatgctctacgtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcatta-atcttgttgggcttcagaacaattcggtgatcc 11324780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11324759 - 11324657
Alignment:
Q  336 gcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgt 435  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||  |||||||||  | |||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11324759 gcagctttaccatcaagaataaaggcgtggattggttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaacaaggcagggtgcaggtcaactgaaccatgccaagatgt 11324660  T
Q  436 tgg 438  Q
    |||    
T  11324659 tgg 11324657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 183
Target Start/End: Original strand, 31971376 - 31971452
Alignment:
Q  107 atgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||| | || | | ||||||||||||||||||||    
T  31971376 atgaattaggtcttgtagtcttgtatatatactgaagcaatatgggttataatatcctgttgggcttcagaacaaaa 31971452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10198056 - 10197937
Alignment:
Q  7 aaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaa-ggctcacaaataac--agagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttga 103  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||  || | ||||||||||||    
T  10198056 aaactcagtccttatcatgtatcaaagtgatacaagaaaaggctcacaaataacaaagactcaaaaccctaaaaactctattcttgatatgacgacttga 10197957  T
Q  104 at-aatgaattaagtcttgc 122  Q
    || ||| |||||||| ||||    
T  10197956 atgaataaattaagttttgc 10197937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 36630 - 37067
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||  |||||| |||||      
T  36630 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatatacgaaaggctcacaaataacaaactcaaaaccctaaacaatctattcttcaaaatgacggt 36729  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcag 199  Q
    |||||||||   ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||     
T  36730 ttgaataattctttaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagtacactttgttgggcttcagaacaat-cggtgatccatttcat 36828  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||   || ||    
T  36829 aaacaacagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttactaagtagataacacattcttag 36928  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  || ||||||| ||||  |    
T  36929 gaaatcacaaacgatctgattttgtgctaaaagcacacagcttgaccaacaagaataaaggcatggattccttaaataaaataatgcgtgcgaaaaacaa 37028  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37029 ggcaaggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 37067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 33465986 - 33465549
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||  |||||| |||||      
T  33465986 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatatacgaaaggctcacaaataacaaactcaaaaccctaaacaatctattcttcaaaatgacggt 33465887  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcag 199  Q
    |||||||||   ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||     
T  33465886 ttgaataattctttaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagtacactttgttgggcttcagaacaat-cggtgatccatttcat 33465788  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||   || ||    
T  33465787 aaacaacagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttactaagtagataacacattcttag 33465688  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  || ||||||| ||||  |    
T  33465687 gaaatcacaaacgatctgattttgtgctaaaagcacacagcttgaccaacaagaataaaggcatggattccttaaataaaataatgcgtgcgaaaaacaa 33465588  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33465587 ggcaaggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 33465549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 437
Target Start/End: Original strand, 17280222 - 17280656
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  17280222 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacataga-cagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaatgacggct 17280320  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcaga 200  Q
    ||||| ||    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||     
T  17280321 tgaatcattctctaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgagtcagta-aacttgttgggctacagaacaatccagtgatccatttcagg 17280419  T
Q  201 -acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||    
T  17280420 tacaa-cagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtagacacataattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatcttag 17280518  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||  |    
T  17280519 gaaatcacaaacgatctgatcctgtgctaaaaacacgcagcttggccaacaagaataaaggggtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgaaaaacaa 17280618  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttg 437  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  17280619 ggcaaggtacaagtcaactgaaccatgccatgatgttg 17280656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17880564 - 17880127
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  17880564 caactcaaacacagtcctaaacatgcattaagatgatacacgaaaggctcacaaataacagactcaaaatcctacatgatctattcttcaaatgacggct 17880465  T
Q  101 tgaat-aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcag 199  Q
    ||||| |||    || ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||     
T  17880464 tgaattaattctctaggtcttccagtcttatttaaatactgaagcaatacgggtcagtaaaa-ttgttgggcttcggaacaattcggtgatccatttcac 17880366  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     | || |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||    
T  17880365 gaaaagcagaaccagtaaaggaaactcctaatatttaggcacattattaggaacatattgatcacctccaaactttcctaagtagatagctcattcttag 17880266  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||| || ||| |||||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||  | |||||||||||||  |    
T  17880265 gaaatcacaaacgatctgatcctgtgctaaaaacacgcaacttgaccaacaagaataaaaatgtggattccttagataaaatagcgcgtgcgtaaaacaa 17880166  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17880165 ggcaaggtgcaggtcaactgaaccatgccaagatgttgg 17880127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37155350 - 37154913
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| |||||| |||| |||||||||  |||||| ||||| |    
T  37155350 caactcaaacacaatcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctaacata-aatagactcaaaatcctagatgatctattcttcaaaatgacggc 37155252  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    ||||||| |   ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||     
T  37155251 ttgaatacttctttaggtcttccagtcttgtttaaatattgaagcaatacgggtcagtaaaacttgttgggcttcagaacaattcggtgatccatttcac 37155152  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    || ||| || || |||| ||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||   || |    
T  37155151 gatcaa-cataatcagaaaaggaaactcataatatgtaggcacgttattaggaacatcctgatcacctctaaattttcctaagtagataacacaatctta 37155053  T
Q  299 ggaaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaag 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||     
T  37155052 ggaaatcacaaaccgatctaatcctgtactaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaagacgtgaattccttaaaaaaat-agcgcgtgcgtaaaac 37154954  T
Q  398 caggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
     | ||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37154953 aacgcagggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 37154913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 438
Target Start/End: Original strand, 22876367 - 22876787
Alignment:
Q  22 catgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgacttgaataatgaattaagtctt 120  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||   ||||| ||||| ||||||| ||    || |||||    
T  22876367 catgcatcaagaggatacaagaaaggctcacaaataacatactcaaaaccctaaacaatctattcctcaaaatgacggcttgaatgattctctaggtctt 22876466  T
Q  121 gcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaa-cttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcagaaca-atcagaaccagataa 218  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||| || | | |||||||||| ||    
T  22876467 ccagtcttgtttaaataccgaagcaatacgg-tcagtacactcttgttgggcttcagaacaat-cagtgatctatttcataaaacaacagaaccagaaaa 22876564  T
Q  219 ggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaatcacaaacgatctga 318  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  22876565 ggaaactcctgatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagatagcacattcttaggaaatcacaaacgatctga 22876664  T
Q  319 ttatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaat----aaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggcacaggtc 414  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||    |||| |||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  22876665 ttctgtactaaaagcacgcagcttgacc-acaagaataaagacgtggattccttaaataaataaaaaaacacgtgcgaaaaacaaggcaaggtgcagatc 22876763  T
Q  415 aactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  22876764 aactgaaccatgccaggatgttgg 22876787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 39081298 - 39081583
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| |||||   |    
T  39081298 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacatgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagttgatctattcttcagatgacagat 39081396  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcaga 200  Q
    |||||| |    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |    
T  39081397 tgaatacttctctaagtctttcagtcttgtttaaatactgaagcaataggggttagtaaaacttgttgggcttcagaacaatccggcgatccatttcaca 39081496  T
Q  201 acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagata 287  Q
    |  | ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39081497 atcaacagaatcagaaaaggaaactcctgatatgtaggcacattactaggaacatcctgatcacctccaaacttttctaagtagata 39081583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 8727177 - 8727372
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  8727177 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacata-aacaaactcaaaaccctagatgatctattcttcaaatgacggct 8727275  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca 198  Q
    |||||| |    || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  8727276 tgaatacttctctaggtcttccaatcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagta-aacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccatttca 8727372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 437
Target Start/End: Original strand, 8730470 - 8730699
Alignment:
Q  209 aaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaatcaca 308  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    || |||||||||||    
T  8730470 aaccagaaaaggaaattcctaatatgtaggcacataattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacaaaatcttaggaaatcaca 8730569  T
Q  309 aa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggc 407  Q
    || | |||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||  | |||||||||||||  ||||| ||     
T  8730570 aaccaatctgatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaagacatggattgcttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaacaaggcagggt 8730669  T
Q  408 acaggtcaactgaaccgtgccacgatgttg 437  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8730670 gcaggtcaactgaaccatgccaggatgttg 8730699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Original strand, 18676363 - 18676559
Alignment:
Q  242 attatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaatcacaaac-gatctgattatgtattaaaagcatgcagc 340  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | |||   || |||||||||||||| ||| ||||  |||  ||||  || |||||    
T  18676363 attattaggaacattctgatcacctccaaacattcctaagtagacaacacaatcttaggaaatcacaaaccgatatgatcttgtgctaaatacacgcagc 18676462  T
Q  341 ttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | | |||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18676463 ttgaccaacaagaattaaggcatggattccttaaataaaatagcacgtgcgtaaaacaaggc-agggtcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 18676559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 23250075 - 23250243
Alignment:
Q  13 agtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagag--tcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttgaataatga 110  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||  ||||||  |||    
T  23250075 agtccttaacatgcatcaaggtgatacacgaaaggctcacaattaacagagactcaaaaccctaaa-gatctaaacttcaaa-gacggattgaattctga 23250172  T
Q  111 attaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaa 181  Q
     ||| ||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |||   |||||||||||||||||||    
T  23250173 tttaggtcttgtagtcttgtttacatattgaagaaatacgggttataacttgttgttgggcttcagaacaa 23250243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 396
Target Start/End: Original strand, 23250401 - 23250466
Alignment:
Q  330 aagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaa 396  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  23250401 aagcacgcagcttggccaacaagaaataaggcgtggattccttaaatagat-aatgcgtgcgtaaaa 23250466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Original strand, 12240534 - 12240643
Alignment:
Q  7 aaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagag--tcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttgaa 104  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||| |||  ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||   ||||| ||| | |||||||||| ||    
T  12240534 aaacacagtcctaaacttgcatcaaggtgacacaataaaggttcacaattaacagagactcaaaaccctaaaaactctatttttaatatgacgacttcaa 12240633  T
Q  105 taatgaatta 114  Q
    | ||||||||    
T  12240634 ttatgaatta 12240643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 437
Target Start/End: Original strand, 39081586 - 39081675
Alignment:
Q  348 acaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttg 437  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||  ||||| ||  |||||||||| |||| || || |||||||    
T  39081586 acaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcatgcgtaaaacaaggcagggtgcaggtcaactaaaccatgtcaggatgttg 39081675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13314787 - 13314354
Alignment:
Q  5 tcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgacttga 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||||    
T  13314787 tcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgataaacgaaaggctcacaaataacagactcaaaaccctaaacaatctattcttcaaaatgacggcttga 13314688  T
Q  104 ataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcagaaca 203  Q
    |||||   ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||      
T  13314687 ataattctttaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatatgggtcagtacactttgttgggcttcagaacaat-cggtgatccatttcataaac 13314589  T
Q  204 atcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaa 303  Q
    | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||    
T  13314588 aacagaaccagaaaaggaaactcttaatatgtaggcaaattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagatagcacattcttaggaaa 13314489  T
Q  304 tcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggca 403  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||| | ||||  |||||    
T  13314488 tcacaaacgatctgattctgtgctaaaagcacgcaacttgaccaacaagaataaaggcgtggattcctcaaataaaataacgcgtgtgaaaaacaaggca 13314389  T
Q  404 aggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  13314388 aggtgcaggtcaactgaaccattccaagatgttgg 13314354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 29566345 - 29566782
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |    
T  29566345 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacaaataacagactcaaaaccctaaacaatctattcttcaaaatgacggc 29566444  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcag 199  Q
     ||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||     
T  29566445 atgaataattctttaggtcttccagtcttgtttaaataatgaagcaatacgggccagtacactttgttgggcttcagaacaat-cagtgatccatttcat 29566543  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  29566544 aatcaacagaaccagaaaaggaaactcctaatatgcagacacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagatagcacattcttag 29566643  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
     ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||  |    
T  29566644 aaaatcacaaacgaactgattttgtgctaaaagcacgcaacttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaataacgcgtgcgaaaaacaa 29566743  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29566744 ggcaatgtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 29566782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 18766011 - 18766448
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |    
T  18766011 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacaaataacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggc 18766110  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    |||||||||    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||     
T  18766111 ttgaataattctctaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcactaaactttgttgggcttcagaacaat-cggtgatccatatcat 18766209  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |    
T  18766210 gaacaa-cagaaccagaaaaggaaactcttaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagatatcacaaactta 18766308  T
Q  299 ggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||| ||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||      
T  18766309 ggaaatcacaaacgatcagatcctgtgctaaaaacatgcaacttgaacaacacgaataaaagcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaaca 18766408  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  18766409 aggtaaggtgcaggtcaactgaaccatggcaggatgttgg 18766448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18606299 - 18606044
Alignment:
Q  124 gtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-gaacaatcagaaccagataaggaa 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| | |||| ||||| |||| ||||||    
T  18606299 gtcttgtttaaatattgaagcaatacgggtcatta-atcttgttgggcttcagaacaatccggtaatccatttcacgtacaa-cagaatcagaaaaggaa 18606202  T
Q  223 agtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaatcacaaac-gatctgatta 321  Q
    | |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||   || |||||||||||||| ||||||||      
T  18606201 actcctaatatgcaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtggaaaacacaatcttaggaaatcacaaactgatctgatcc 18606102  T
Q  322 tgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaa 379  Q
    |||  ||| | || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  18606101 tgtgctaagaacacgcagcttgaccaacaagaataaagacgtggattccttaagtaaa 18606044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Original strand, 31587829 - 31587974
Alignment:
Q  7 aaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaa-ggctcacaaataacagag--tcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttga 103  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    |||| ||| | |||||| ||| |    
T  31587829 aaactcagtccttatcatgtatcaaagtgatacaagaaaaggctcacaaataacaaagactcacaaccctaaaaaccctatttttgatatgacggcttca 31587928  T
Q  104 ataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatac 149  Q
    || ||||| || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  31587929 attatgaaataggtcttgcagtcttgtatatatactgaagcaatac 31587974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 438
Target Start/End: Original strand, 33062719 - 33063155
Alignment:
Q  2 aactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgact 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||    
T  33062719 aactcaaacacagtcctaaacatgcatcaaggtgatacacgaaaggctcacaaataacaaactcaaacccctagatgatctattcttcaaaatgacggct 33062818  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    ||||| ||    ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |    
T  33062819 tgaatgattctctagatcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagta-aacttgttgggcttcagaacaattcggtgatcaatctcacg 33062917  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| |||   || ||    
T  33062918 aacaa-cataaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattatttggaacattctggtcacctctaaactttcctaagtagataacacaatcttag 33063016  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||  |    
T  33063017 gaaatcacaaacgatatgatcctgtgctaaaatcacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggatttcttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaacaa 33063116  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33063117 ggcaaggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 33063155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45599155 - 45598719
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||    
T  45599155 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaatgacagct 45599057  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    |||||| |    || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  45599056 tgaatacttctctaggtcttccagtcttgtttaaatactaaagcaatacgtgtcatta-atcttgttgggcttcagaacaattcggtgatccatttcacg 45598958  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     |||| ||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||    
T  45598957 tacaa-cagaatcagaaaaggaagctcctaatatataggcacactattaggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatcttag 45598859  T
Q  300 gaaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||      
T  45598858 gaaatcacaaaccgatatgatcatgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaacagcgtgtgcgtaaaaca 45598759  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    || || ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45598758 agacagggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 45598719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 52436643 - 52436205
Alignment:
Q  2 aactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgact 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||  |||||| ||||| ||    
T  52436643 aactcaaacacagttctaaacatgcatcaagatgatacacgaaagactcacaaataacagactcaaaaccttaaacaatatattcttcaaaatgacggct 52436544  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcaga 200  Q
    ||||| ||    ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |    
T  52436543 tgaatgattctctagttcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagtaaactttgttgggcttcagaacaat-cggtgatctatttcaca 52436445  T
Q  201 acaat--cagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    | ||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||   || |    
T  52436444 aaaacaacagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcaccttcgaactttcctaagtagatagcacattctta 52436345  T
Q  299 ggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||  |  ||||||||||||      
T  52436344 ggaaatcacaaatgatctgataatgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaaaaataaagacgttgattccttaaataaaatagtgcgtgcgtaaaaca 52436245  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  52436244 aggcaaggtgcaggtcaactgaaccatgcaaggatgttgg 52436205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40313042 - 40312612
Alignment:
Q  7 aaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttgaata 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | || |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  40313042 aaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaatcatagatgatctattcttcaaatgacggcttgaata 40312944  T
Q  107 atgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-gaacaat 205  Q
     |    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||| | ||||     
T  40312943 cttctctaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcataa-atcttgttgggctttagaacaatcctgtgatccatttcacgtacaa- 40312846  T
Q  206 cagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaatc 305  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    | ||||||||    
T  40312845 cagaaccagaaaagaaaactcctaatatgtaggcacataattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaattttaggaaatc 40312746  T
Q  306 acaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaa 404  Q
    ||||| | |||||||  |||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||  ||||||    
T  40312745 acaaaccaatctgatcctgtgctaaaaacacacagcttgaccaacaagaataaagacgtggattccttaattaaaataacgtgtgtgtaaaacaaggcaa 40312646  T
Q  405 ggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40312645 ggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 40312612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11085429 - 11085048
Alignment:
Q  57 aacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcag 156  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| |    || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11085429 aacagactcaaaatcctagatgatctattcttcaaatgacggcttgaatatttctctaggtcttccagacttgtttaaatactgaagcaatacgggtcat 11085330  T
Q  157 aacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacat 255  Q
     | | ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| | |||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  11085329 ta-atcttgttgggcttcagaacaatctggtgatccatttcacgtacaa-cagaatcagaaaaggaaactcctaacatgtaggcacattattaggaacat 11085232  T
Q  256 catgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaatcacaaac-gatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaa 354  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   || |||||||||||||| ||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  11085231 cctgatcacctccaaactttcttaagtagataacacaatcttaggaaatcacaaaccgatctgatcttgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaa 11085132  T
Q  355 ttaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  11085131 ttaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaacaaggcagggtgcaggttaactgaaccatgccaggatgttgg 11085048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17012334 - 17012531
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttc-aaatgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||  ||| ||||||   |    
T  17012334 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaagactcacaaataacatactcaaaccactagatgatctattcttcaaaatgatagc 17012433  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca 198  Q
    ||||||       || ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  17012434 ttgaatccatctctaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaataaaggtcagta-aacttgttaggcttgagaacaatccggtgatccatttca 17012531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 411
Target Start/End: Original strand, 17038685 - 17038973
Alignment:
Q  124 gtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtt--tcagaacaatcagaaccagataagga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  || | |||||||||   ||| ||||||||| ||  ||||  |||| || ||||||||||||    
T  17038685 gtcttgtttaaatactgaagcaatacaggtcaaatcatttt-tcgggcttcaggtaaaatcggtgatccattactcagt-caat-aggaccagataagga 17038781  T
Q  222 aagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaa--ctttcctaagtagatagcactccctcaggaaatcacaaacgatctgat 319  Q
    || |||||| |  |||||| ||  || ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||| | | | ||||    
T  17038782 aactcctaaaaattaggcacatctttaggaacattatgatcaccttcaaagactttcctaattcgttggcacttcctcaggaaatcacatatgttatgat 17038881  T
Q  320 tatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggcacag 411  Q
      | |  ||||  || |||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  17038882 cttctcataaagacacgcaggttgaccaacactaatgaaggcgtggattccttaaataaacgaacgcgtgcgtaaaataaggcaaggtacag 17038973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 149
Target Start/End: Original strand, 8282311 - 8282419
Alignment:
Q  43 aaaggctcacaaataacagag--tcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactg 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||   |||||  || | | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  8282311 aaagactcacaaataacaaagactcaaaaccctaaaaactctattcttgatacgacggcttgaataatgaattaggtcttgcagtcttgtatacatactg 8282410  T
Q  141 aagcaatac 149  Q
    |||||||||    
T  8282411 aagcaatac 8282419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 8902354 - 8902425
Alignment:
Q  7 aaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacag--agtcaaaaccctaaa 76  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  8902354 aaacacaatcctaaacttgcatcaagatgatacaagaaaggctcacaattaacagatactcaaaaccctaaa 8902425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15914909 - 15914875
Alignment:
Q  340 cttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaa 374  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15914909 cttgaccaacaagaaataaggcgtgaattccttaa 15914875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 32452320 - 32452757
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||  |||||| ||||| |    
T  32452320 caactcaaacacaatcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacaaataacagactcaaaaccttaaacaatatattcttcaaaatgacggc 32452419  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcag 199  Q
    |||||||||    || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||   |||||||| |||||     
T  32452420 ttgaataattctctaggtctttcactcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagtacaatatgttgggcttcagaacaatt-ggtgatccatttcat 32452518  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||   || ||    
T  32452519 aaacaacagaaccagaaaaggaaactcttaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcaccttcaaactttcccaagtagatagcacattcttag 32452618  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||  |    
T  32452619 gaaatcacaaaagatctgattttgtgctaaaagcacacagcttgaccaataagaataaaggcgtggattccttaaataaaataacgcgtgggaaaaacaa 32452718  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||||   || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32452719 ggcaagatgcatgtcaactgaaccatgccaggatgttgg 32452757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15002987 - 15002549
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||  |||||| || || |    
T  15002987 caactcaagcacaatcctaaacatgcatcaagatgatacacaaaaggctcacaactaacagactcaaaatcctaaacaatctattattcaaaatgtcggc 15002888  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcag 199  Q
    | |||||||   ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||     
T  15002887 tggaataatcctttaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagtacattttgttgggcttcagaacaat-cggtgatccatttcac 15002789  T
Q  200 aaca-atcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    || | | || ||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||   || |    
T  15002788 aaaacaccataactagaaaaggaaactcttaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaacttttctaagtagataacacattctta 15002689  T
Q  299 ggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||||| ||||      
T  15002688 ggaaatcaaaaacgatctgattctgtgctaaaagcacgcaccttgaccaacaagagtaaaggcgtggattccttaaaaaagttaacgcgtgcgaaaaaca 15002589  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15002588 aggcaatgtgcaggtcaactgaaccatgccacgatgttgg 15002549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 423
Target Start/End: Original strand, 9384948 - 9385369
Alignment:
Q  2 aactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgact 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||   |||||| ||||| ||    
T  9384948 aactcaaacacagtcgtaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacaaataacagactcaaaaccctaaacaatctaatcttcaaaatgacggct 9385047  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcaga 200  Q
    | ||| ||    || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |    
T  9385048 taaatgatactctaggtcttccactcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagtaaactttgttgggctttagaacaaa-cggtgatccatttcaca 9385146  T
Q  201 acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcagg 300  Q
    |  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||    
T  9385147 aacaacagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtagggacattattaggaacatcctgatcacgtccaaactttcctaagtagatagcacattcttagg 9385246  T
Q  301 aaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcag 400  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||  || || || | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |  || |||| ||||  ||    
T  9385247 aaatcacaaccgatatgatcctgtgctataaacacgtagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaactagtgcatgcgaaaaacaag 9385346  T
Q  401 gcaaggcacaggtcaactgaacc 423  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  9385347 gcaaggtccaggtcaactgaacc 9385369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 19216287 - 19216724
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||    
T  19216287 caactcaaacacagtcttaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatttattcttcaaatgacggct 19216385  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttg-tttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    ||||||||    |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||   |||     
T  19216386 tgaataattctctaagtcttcctgacttgttttaaatactgaagcaatacgggtcagaa-gacttgttgggcttcagaacaatccgatgatccaaatcac 19216484  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||   || |    
T  19216485 gtacaa-cagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacactattaggaacatcctgatcacctccaaacttttctaagtagataacacaatctta 19216583  T
Q  299 ggaaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaag 397  Q
    | |||||||||| |||||| ||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||     
T  19216584 gaaaatcacaaaccgatctcatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtgggttccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaat 19216683  T
Q  398 caggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  19216684 aaggcagggtgcaggtcaacttaaccatgccaggatattgg 19216724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16137406 - 16137028
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |    
T  16137406 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggctcgcata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggc 16137308  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcag 199  Q
    ||||||  |    || ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||      
T  16137307 ttgaattcttctctaggtctcccagtcttgtataaatactgaagcaatacgggttagta-aacttgttgggcttcagaataatccggtgatctatttcgc 16137209  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
    ||  | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||   || ||    
T  16137208 aatcaacagaatcagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctaatcaccttcaaactttcctaagtagataacacaatcttag 16137109  T
Q  300 gaaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaa 379  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||  ||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16137108 gaaatcacaaaccgatctgatcttgtgctaaaaacacgcaacttgaccaacaagaataaaggcgtgcattccttaaataaa 16137028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 437
Target Start/End: Original strand, 20003623 - 20003852
Alignment:
Q  209 aaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaa-ctttcctaagtagatagcactccctcaggaaatcac 307  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||   || ||||||||||    
T  20003623 aaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggaacattattaggaacatcctgatcacctccaaaactttcctaagtagataacacaatcttaggaaatcac 20003722  T
Q  308 aaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggc 407  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| || ||| |||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||||     
T  20003723 aaacgatctgatcctgtcctaaaaacacgcaacttgaccaacaagaataaaagtgtggattccttaaataaaaaagcgcatgcgtaaaacaaggcaaggt 20003822  T
Q  408 acaggtcaactgaaccgtgccacgatgttg 437  Q
     || ||||||| |||| ||| | |||||||    
T  20003823 gcaagtcaactaaaccatgctaggatgttg 20003852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12444547 - 12444441
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttc-aaatgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  12444547 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacgac 12444449  T
Q  100 ttgaataa 107  Q
    ||||||||    
T  12444448 ttgaataa 12444441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 20003435 - 20003543
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttc-aaatgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |  ||| |||||||| |    
T  20003435 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagactcaaaacctcatatgatctcttcttcaaaatgacggc 20003534  T
Q  100 ttgaataat 108  Q
    |||||||||    
T  20003535 ttgaataat 20003543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15004120 - 15003965
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttc-aaatgacgac 99  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||  ||| ||||| |       
T  15004120 caactcaagcacagtcctaaacatgcatcaagatgatatacgaaaggctcacaaataacagactcaaaatcctaaacaatctattcttcaaaatgtcagt 15004021  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcag 156  Q
    |||||||||   ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15004020 ttgaataatcctttaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagc-atacgggtcag 15003965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 152
Target Start/End: Original strand, 30425315 - 30425376
Alignment:
Q  91 aatgacgacttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacggg 152  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  30425315 aatgacggcttgaatgatgaattaagtcttgcagtcttgtatatatactaaagcaatacggg 30425376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16309065 - 16308992
Alignment:
Q  110 aattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||||||||||||||||    
T  16309065 aattaggtcttgaagtcttgtttatatactgaagcaatacggggcagtagactttgatgggcttcagaacaaaa 16308992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21323000 - 21322941
Alignment:
Q  94 gacgacttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggt 153  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21323000 gacggcttgaattatcaattaggtcttgaagtcttgtataaatactgaagcaatacgggt 21322941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 182
Target Start/End: Original strand, 24542089 - 24542178
Alignment:
Q  93 tgacgacttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaa 182  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||   |||||||||||||||||    
T  24542089 tgacggcttgaataaataattaggtcttgaagtcttgaatatatactgaagcaatacgggtcaaataaacggtttgggcttcagaacaaa 24542178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 21727619 - 21727679
Alignment:
Q  123 ggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||| | || |  |||||||||||||||||||||    
T  21727619 ggtcttgtatatatactgaagcaatatgggttataatattttgttgggcttcagaacaaaa 21727679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 438
Target Start/End: Original strand, 20286900 - 20287331
Alignment:
Q  7 aaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgacttgaat 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  20286900 aaacacagtcctaaacatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataatagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggcttgaat 20286999  T
Q  106 aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttcagaacaat 205  Q
    |||    |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||  |     
T  20287000 aattctctaagtcttccagtcttgtttaaaaactgaagaaatacgggtcagtacactttgttgtgctccagaacaat-cggtgatccatttcacaaacaa 20287098  T
Q  206 cagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcaggaaatc 305  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||    
T  20287099 cagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctccaaactttcctaagtagataacacattcttaggaaatc 20287198  T
Q  306 acaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaag 405  Q
     ||||||||| | |  |||  ||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||  ||||| |    
T  20287199 ccaaacgatccggtcttgtgctaaaaacacgtagcttgaccaacaagaataaagacgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgaaaaacaaggcagg 20287298  T
Q  406 gcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |   |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20287299 gtggaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 20287331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20497977 - 20497540
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |    
T  20497977 caactcaaacacagtcctaaacatgcattaggatgatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggc 20497879  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    |||||| |||   || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||     
T  20497878 ttgaatgatgctctaggtcttcctgtcttgtttaaataccgaagcaatacgggtcatta-atcttgttgggcttcataacaatccggtgatccatttcac 20497780  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    |  ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |    
T  20497779 gttcaa-cagaatcagaaaaggaaactcctaatatgtatgcacattattaggaacatcttgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatctta 20497681  T
Q  299 ggaaatcacaaac-gatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaag 397  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||   ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||     
T  20497680 ggaaatcacaaaccggtctgaacatgagctaaaaacacgcagcttgaccatcaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgagtgcgtaaaac 20497581  T
Q  398 caggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
     ||||| ||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  20497580 aaggcagggtgcaggtcaactgaaccataccaagatgttgg 20497540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7897740 - 7897320
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttc-aaatgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |    
T  7897740 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaaaattatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggc 7897642  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    |||||||      || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||     
T  7897641 ttgaatacctctctaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagta-aacttgttgggcttcagaacaatccggtgatccaaatcac 7897543  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    | || | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||   || |    
T  7897542 gtacca-cagaaccaaaaaaggaaactcctaatatgtaggcacactattaggaacatcctgatcacctccaaacttttctaagtaaatcacacgatctta 7897444  T
Q  299 ggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||  | |  ||||  || |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||      
T  7897443 ggaaatcacaaacgatctgatcctatgctaaagacacgcagcttgaccaacaagaataaatacgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaact 7897344  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaac 422  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||    
T  7897343 aggtaaggtgcaggtcaactgaac 7897320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17920610 - 17920177
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||   |||||||||| ||    
T  17920610 caactcaaactcagtcctaaacatgcatcaagaggatacacgaaaggctcacata-aacagactcaaaaccctagatgatttattcctcaaatgacggct 17920512  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    |||||| |    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||   ||| |    
T  17920511 tgaatacttctctaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggttagaa-gacttgttgggcttcagaacaatccgatgatccaaatcacg 17920413  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||   || ||    
T  17920412 tacaa-cagaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacactattagaaacatcatgatcacctccaaactttcctaagaaaatcacacgatcttag 17920314  T
Q  300 gaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    |||||||||||| || |||| ||||  ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||    
T  17920313 gaaatcacaaactatttgatcatgtgctaaaa-cacgcagcttgaccaacaacaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgc-taaaaaca 17920216  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
     |  |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17920215 aggcaggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 17920177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 26183059 - 26182623
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||      
T  26183059 caactcaaacagagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaagtctcacata-aacatactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacggg 26182961  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    |||||||||    || ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||   |||||||| |||||     
T  26182960 ttgaataattctctaggtcatccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagta-aacttgttgc-cttcagaaaaatttggtgatccatttcac 26182863  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    | |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |    
T  26182862 gtacaa-cagaatcagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacgttattaggaacaacccgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatctta 26182764  T
Q  299 ggaaatcacaaac-gatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaag 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||     || |||||||||     
T  26182763 ggaaatcacaaactgatctgatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaagacgtggattccttaaataaaatggtgcatgcgtaaaac 26182664  T
Q  398 caggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
     ||||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26182663 aaggcagggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 26182623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34404961 - 34404822
Alignment:
Q  300 gaaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||      
T  34404961 gaaatcacaaatcgatctgatcctgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaaca 34404862  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||| | ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34404861 aggaagggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgttgg 34404822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22130559 - 22130482
Alignment:
Q  106 aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    |||||||||  |||||  ||||||| || |||||||||||||| | || | || | ||||||||||||||||||||||    
T  22130559 aatgaattagatcttgtagtcttgtatatatactgaagcaatatgagttataatatcttgttgggcttcagaacaaaa 22130482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 438
Target Start/End: Original strand, 9037040 - 9037475
Alignment:
Q  2 aactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||    
T  9037040 aactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggttcacata-aacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaatgacggctt 9037138  T
Q  102 gaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-ga 200  Q
    |||| ||    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||| ||    
T  9037139 gaatcattctctaggtcttccagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagta-aacttgttgggctttagaacaatccgatgatccatttcacga 9037237  T
Q  201 acaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcagg 300  Q
     ||| |||||    | ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||   || |||    
T  9037238 tcaa-cagaattgaaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacctcaaaactttcctaagtagataacacaatcttagg 9037336  T
Q  301 aaatcacaaa-cgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagca 399  Q
    |||||||||| |||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||  |    
T  9037337 aaatcacaaaccgatctgatcttgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagtgcgtgcgtaaaacaa 9037436  T
Q  400 ggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    |||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9037437 ggcaaggtgcacgtcaactgaaccatgccaggatgttgg 9037475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 8749372 - 8749809
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||| | ||    
T  8749372 caactcaaacacagtcctaaacatgcatcaagatgatacacgaaaggttcataaa-aacagactcaaaaccctagatgatatattcttcaaatgatggct 8749470  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca-g 199  Q
    ||||| ||    || ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  8749471 tgaatgattctctaggtcttccagtcttgtttaaatattgaaacaatacgggttagta-aacttgttgggcttcagaacaattcggtgatccatttcacg 8749569  T
Q  200 aacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctcag 299  Q
     |||   | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||   || ||    
T  8749570 tacatcaaaaaccagaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcctgatcacttccaaactttcctaagtagataacacaatcttag 8749669  T
Q  300 gaaatcacaaac-gatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |  || |||||||||      
T  8749670 gaaatcacaaacagatctgatcatgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaaggcgtggattccttaaataaaatagagcatgcgtaaaaca 8749769  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8749770 aggcaaggtgcaagtcaactgaaccatgccaggatgttgg 8749809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9031231 - 9030811
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaa-tgacgac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||  |||||| ||||| |    
T  9031231 caactcaaacacagtcctaaacatgcattaagatgatacacgaaaagctcacaca-aacagactcaaaatcctagatgatctattcttcaaaatgacggc 9031133  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    |||||| |                ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||     
T  9031132 ttgaatga----------------gtcttgtttaaatactgaagcaatacgagtcagta-aacttgttgtgcttcagaacaatccggtgatccatttcac 9031050  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    || ||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |    
T  9031049 gatcaa-cagaatcaaaaaaggaaactcctaatatgtaggcacattattaggaacatcgtgatcacctccaaactttcctaagtagataacacaatctta 9030951  T
Q  299 ggaaatcacaaac-gatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaag 397  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||| |||| |||  ||| |||| |||||||||  | ||||||| |||||     
T  9030950 ggaaatcacaaactgatctgatcatgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacatgaataaagatgtggattctttaaataaaatagcgcgtgcataaaac 9030851  T
Q  398 caggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttg 437  Q
     || ||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  9030850 gagacagtgtgcagatcaactgaaccatgccaggatgttg 9030811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 11564409 - 11564326
Alignment:
Q  1 caactcaaa-cacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctat 84  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11564409 caactcaaagcacaatcctaaacatgcatcaaagtgatacacgaaaggctcacata-aatagactcaaaaccctagatgatctat 11564326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7495627 - 7495569
Alignment:
Q  125 tcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||||||||||    
T  7495627 tcttgtatatatactgaagcaatatgggttataaaatcttgttgggcttcagaacaaaa 7495569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11560977 - 11560912
Alignment:
Q  341 ttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaagg 406  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  11560977 ttgaccaacactaatgaaggtgtggattccttaaataaacgaacgcgtgcgtaaaataaggcaagg 11560912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 13914239 - 13914316
Alignment:
Q  106 aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| || |||||| ||||||| |||| | || | ||| ||||||||||||||||||    
T  13914239 aatgaattaggtcttgtagtcttgtatatatactgtagcaatatgggttataaaatcttattgggcttcagaacaaaa 13914316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 13918280 - 13918357
Alignment:
Q  106 aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    ||||||| | ||||||  ||||||| || |||||||||||||| | || | || | ||||||||||||||||||||||    
T  13918280 aatgaatcaggtcttgtagtcttgtatatatactgaagcaatatgagttataaaatcttgttgggcttcagaacaaaa 13918357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15674957 - 15674908
Alignment:
Q  11 acagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataaca 60  Q
    |||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15674957 acagtcctaagcttgcctcaaggtgatacaagaaaggctcacaaataaca 15674908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16797 - 16360
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttc-aaatgacgac 99  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||  |    
T  16797 caactcaaacgcagtcctaaacaagcatcaagatgatacacgcaaggctcacaaataacagactcaaaaccctagatgatctattcttcaaaatgacagc 16698  T
Q  100 ttgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtttca- 198  Q
    |||||||||    || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |    |||||||  |||| ||| ||   |||||||  ||||     
T  16697 ttgaataattctctaggtcttctagtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtgagtaatctttgttggatttcataac-aattagtgatccaattcac 16599  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaaactttcctaagtagatagcactccctca 298  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||     || |    
T  16598 gaacaa-cagaaccagaaaaggaaactcctaacatgtaggcaaattattaggaacattctgatcaccaccaaacgttcctaagtagatagcttattctta 16500  T
Q  299 ggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||   ||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||      
T  16499 ggaaatcacaaacgatctgatcccgtgctaaaaacacgcagcttgaccaacaagaataaagacgtgcattccttaaataaaatagcgcgtgcgtaaaata 16400  T
Q  399 aggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttgg 438  Q
    ||||| ||  ||||| || |||||| ||| | ||||||||    
T  16399 aggcagggtgcaggttaattgaaccatgctaggatgttgg 16360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 3454 - 3863
Alignment:
Q  1 caactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgact 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||    
T  3454 caactcaaacacagtcttaaacatgcatcaagatgatacccgaaaggttcacaca-aaccgactcaaaaccctagatgatctattcttcaaatgacagct 3552  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaacggtgatccgtt--tca 198  Q
    ||||||||    || |||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || | |||||| ||   ||| ||||||||| ||  |||    
T  3553 tgaataattctctaggtcttctaatcttgtttaaatactgaagcaatacaggtcagatc-atttttcgggctttaggtaaaaccggtgatccattcctca 3651  T
Q  199 gaacaatcagaaccagataaggaaagtcctaatatgtaggcagattatttggaacatcatgatcacctccaa--actttcctaagtagatagcactccct 296  Q
    |  | || || ||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||  || ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||| |||    
T  3652 g-tcgat-aggaccggataaggaaactcctaa-aagtaggcacatctttaggaacattatgatcaccttcaaagactttcctaagtcgttagcacttcct 3748  T
Q  297 caggaaatcacaaacgatctgattatgtattaaaagcatgcagcttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaa 396  Q
     |||||||||||   | ||||||  | |  ||||  ||  ||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3749 taggaaatcacatttgttctgatcttctcataaagacacacaggttgaccaacactaatgaaggcgtggattccttaaataaacgtacgcgtgcgtaaaa 3848  T
Q  397 gcaggcaaggcacag 411  Q
      |||||||| ||||    
T  3849 taaggcaaggtacag 3863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 11546 - 11772
Alignment:
Q  22 catgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagag--tcaaaaccctaaatgatctatatttcaaatgacgacttgaataatgaattaagtct 119  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| | |||||  |||||   ||||    
T  11546 catgcatcaaggtgatacacgaaaggctcacaattaacatagactcaaaaccctaaa-gatctaaacttcaa-tgacggcctgaatcgtgaatatggtct 11643  T
Q  120 tgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaaca----------aaacggtgatccgtttcagaacaatcaga 209  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||| ||||          |||||||||||||||||| || ||||||     
T  11644 tgtagtcttgtttatatactgaagcaatacgggttataacttcttgttgggattcaaaacaatccacaaacaaacggtgatccgtttcacaagaatcagc 11743  T
Q  210 accagataaggaaagtcctaatatgtagg 238  Q
    | || ||| |||||||||||| |||||||    
T  11744 aacaaatatggaaagtcctaaaatgtagg 11772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 103440 - 103595
Alignment:
Q  2 aactcaaacacagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataacagagtcaaaaccctaaatgatctatatttc-aaatgacgact 100  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | ||    
T  103440 aactcaaacacagtcttaaatatgcatcaagatgttaaacgaacagctcacaaataacatactcaaaaccctaaataatctattcttcaaaatgatggct 103539  T
Q  101 tgaataatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcag 156  Q
    |||||| |   |||  ||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  103540 tgaatagttctttagatcttctaatcttgtttaaatactgaagcaatacggttcag 103595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 441
Target Start/End: Original strand, 103606 - 103679
Alignment:
Q  367 ttccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaaggcacaggtcaactgaaccgtgccacgatgttggaac 441  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  103606 ttccttaaataaaataacgcgtgcg-aaaacaaggcaaggtgcaggtcaactgaaccatgccaggatgtaggaac 103679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 52640 - 52570
Alignment:
Q  108 tgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaa 178  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  52640 tgaattaggtcttgtagtcttgtatttatactgaagcaatacgggttataacatcttgttgggcttcagaa 52570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45634 - 45562
Alignment:
Q  108 tgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaa 181  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||    
T  45634 tgaattaggtcttgtagtcttgtatttatactgaagcaatacgggttataacatcttg-tgggcttcagaacaa 45562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0645
Description:

Target: scaffold0645; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 406
Target Start/End: Original strand, 1718 - 1783
Alignment:
Q  341 ttgaccaacaagaattaaggcgtgaattccttaaataaataaacgcgtgcgtaaaagcaggcaagg 406  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  1718 ttgaccaacactaatgaaggtgtggattccttaaataaacgaacgcgtgcgtaaaataaggcaagg 1783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9898 - 9849
Alignment:
Q  11 acagtcctaagcatgcatcaaaatgatacacgaaaggctcacaaataaca 60  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9898 acagtcatatgcttgcatcaacatgatacaagaaaggctcacaaataaca 9849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 73944 - 73867
Alignment:
Q  106 aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaaa 183  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||| | || | |||||||||||| |||||||||    
T  73944 aatgaattaggtcttgtagtcttgtatatatactaaagcaatatgggttataatatcttgttgggcttgagaacaaaa 73867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Original strand, 413 - 489
Alignment:
Q  106 aatgaattaagtcttgcggtcttgtttaaatactgaagcaatacgggtcagaacaacttgttgggcttcagaacaaa 182  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||   |||||||||||||||||    
T  413 aatgaattaggtcttgaagtcttgaatatatactgaagcaatacgggtcaaataaacggtttgggcttcagaacaaa 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University