View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14820_high_3 (Length: 400)

Name: NF14820_high_3
Description: NF14820
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14820_high_3
NF14820_high_3
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (14-382)||(8534161-8534529)
chr6 (38-382)||(24186503-24186847)
chr6 (53-382)||(20788770-20789099)
chr6 (71-165)||(33525975-33526069)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (14-375)||(49244508-49244869)
chr1 (53-382)||(24343072-24343401)
chr1 (53-382)||(24355450-24355779)
chr1 (32-382)||(41698757-41699107)
chr1 (32-382)||(41704351-41704701)
chr1 (34-382)||(14122803-14123151)
chr1 (173-374)||(40249052-40249253)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (34-375)||(35049128-35049469)
chr7 (34-165)||(15635634-15635765)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (53-382)||(412099-412428)
chr3 (14-382)||(49960138-49960506)
chr3 (53-382)||(413595-413924)
chr3 (34-382)||(53324707-53325055)
chr3 (329-382)||(26301521-26301574)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (53-382)||(15049321-15049650)
chr2 (53-382)||(15230270-15230591)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (32-382)||(54077843-54078193)
chr4 (34-382)||(20007215-20007563)
chr4 (227-371)||(53227511-53227649)
chr4 (229-366)||(20660254-20660390)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (32-382)||(23557040-23557391)
chr5 (98-382)||(9284244-9284525)
chr5 (34-162)||(9285417-9285543)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8534529 - 8534161
Alignment:
Q  14 aagaatatggggtctcacataaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8534529 aagaatatggggtctcacataaaaaggaaattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacg 8534430  T
Q  114 ggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8534429 ggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaa 8534330  T
Q  214 ctattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8534329 ctattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaaga 8534230  T
Q  314 tgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8534229 tgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 8534161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 38 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24186847 - 24186503
Alignment:
Q  38 aggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtg 137  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  24186847 aggaggttagaacttaatgatcaagctgggattaatgtgagtagaaattttcgatccttggtcggtgaagcaaatgggtatgagaatctcacatttggag 24186748  T
Q  138 aaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagca 237  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || || ||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24186747 aaaaagactgtagaaaccacatagacaaagtaagacgattacgacttgggacaggagatgctgaagcaatacaaaaatactttgttaggatgcaaaagca 24186648  T
Q  238 aaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatacttt 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24186647 aaatagtcaattttattatgtaatggacgtcgatgatgaaagtcggttacgaaatgtgttttgggcagatgcaagatgtagggccgcatatgaatatttt 24186548  T
Q  338 ggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || |||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24186547 ggcgaagtcatatctttcgacaccacttacttaacaaataaatat 24186503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20789099 - 20788770
Alignment:
Q  53 aatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaa 152  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||  ||||  | |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  20789099 aatgaccaagctgggattaatgtaagtagaaatttccgatcctttgttgttgaagcagatgggtatgaaaatctcacatttggagaaaaagactgcaaaa 20789000  T
Q  153 actatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagtttta 252  Q
    |||| |||||||| || || || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  20788999 actacatagacaaagtaagacgactgtgacttgggacaggagatgctgaagcaatacaaaattattttgtgaggatacaaaagcaaaacagtcaatttta 20788900  T
Q  253 ttatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaact 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  || |||  |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20788899 ttatgtgatggatgtggatgatgaaattcggttacaaaatgtgttttgggcagatgcaagatgtagggttgcatatgaatattttggtgaagtcataact 20788800  T
Q  353 tttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20788799 ttcgacaccacttacttaacaaataaatat 20788770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33526069 - 33525975
Alignment:
Q  71 aatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaa 165  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| | ||||||| | ||||  |||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33526069 aatgtaagcagaaattttcgatctttagttgttgcaacaaataggtatgagaatcttacatttgaagaaaaagattgtagaaactatatagacaa 33525975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Original strand, 49244508 - 49244869
Alignment:
Q  14 aagaatatggggtctcacataaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  49244508 aagaatatggggtctcacataaaaaggtgattagagattaatgatcaagtaggtatcaatgttagtagaaattttatatctatggttgttgaagcaaatg 49244607  T
Q  114 ggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaa 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  49244608 ggtatgagaatctcacatttggtgaaaaggactgtaggaactatatagacaaggtcaggcgactaaggcttgggacaggaggcgctgaagcaatgcaaaa 49244707  T
Q  214 ctattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaaga 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49244708 ctatttcgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgttgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaaga 49244807  T
Q  314 tgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaa 375  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  49244808 tgtagggatgcatataaatacttcggtgaagtcgcaacttttgacaccacttatttagcaaa 49244869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Original strand, 24343072 - 24343401
Alignment:
Q  53 aatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaa 152  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24343072 aatgatcaagctgggattaatgtgagtagaaattttcgatccttggtcggtgaagcaaatgggtatgagaatctcacatttggagaaaaagactgtagaa 24343171  T
Q  153 actatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagtttta 252  Q
    || | |||||||| || || ||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24343172 accacatagacaaagtaagacgattacgacttgggacaggagatgctgaagcaatacaaaaatactttgttaggatgcaaaagcaaaatagtcaatttta 24343271  T
Q  253 ttatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaact 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  24343272 ttatgtaatggacgtcgatgatgaaagtcggttacgaaatgtgttttgggcagatgcaagatgtagggccgcatatgaatattttggcgaagtcatatct 24343371  T
Q  353 tttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24343372 ttcgacaccacttacttaacaaataaatat 24343401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Original strand, 24355450 - 24355779
Alignment:
Q  53 aatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaa 152  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24355450 aatgatcaagctgggattaatgtgagtagaaattttcgatccttggtcggtgaagcaaatgggtatgagaatctcacatttggagaaaaagactgcagaa 24355549  T
Q  153 actatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagtttta 252  Q
    || | |||||||| || || |   || | |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  24355550 accacatagacaaagtaagacaattacgacttgggacaggagatgctgaagcaatacagaaatactttgttaggatgcaaaaacaaaatagtcaatttta 24355649  T
Q  253 ttatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaact 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  24355650 ttatgtaatggacgtcgatgatgaaagtcggttacgaaatgtgttttgggcagatgcaagatgtagggccgcatatgaatattttggcgaagtcatatct 24355749  T
Q  353 tttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24355750 ttcgacaccacttacttaacaaataaatat 24355779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 382
Target Start/End: Original strand, 41698757 - 41699107
Alignment:
Q  32 ataaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacat 131  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  || || || || || ||||    
T  41698757 ataaaaaggagattggaggttaatgaccaagctgggattaatgtaagtagaaattttcggtctatggttgttgaagcaagtggatatgataaccttacat 41698856  T
Q  132 ttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgca 231  Q
    | || ||||||||   ||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  41698857 tcggggaaaaagatgctagaaactacatagacaaagtgaggcggcttcgacttgggacaggagatgctgaagccattcaaaattattttgttagaatgca 41698956  T
Q  232 aaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaa 331  Q
    ||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  41698957 aagaagaaatagtgaattttattatgtaatggatgtggatgacacaagtcgtttacgaaatgttttttgggcagatgcgagatgcagggctgcttatgag 41699056  T
Q  332 tactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41699057 tattttggtgaagtaataacctttgacaccacttacttaacaaataaatat 41699107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 382
Target Start/End: Original strand, 41704351 - 41704701
Alignment:
Q  32 ataaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacat 131  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  || || || || || ||||    
T  41704351 ataaaaaggagattggaggttaatgaccaagctgggattaatgtaagtagaaattttcggtctatggttgttgaagcaagtggatatgataaccttacat 41704450  T
Q  132 ttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgca 231  Q
    | || ||||||||   ||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  41704451 tcggggaaaaagatgctagaaactacatagacaaagtgaggcggcttcgacttgggacaggagatgctgaagccattcaaaattattttgttagaatgca 41704550  T
Q  232 aaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaa 331  Q
    ||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  41704551 aagaagaaatagtgaattttattatgtaatggatgtggatgacacaagtcgtttacgaaatgttttttgggcagatgcgagatgcagggctgcttatgag 41704650  T
Q  332 tactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41704651 tattttggtgaagtaataacctttgacaccacttacttaacaaataaatat 41704701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Original strand, 14122803 - 14123151
Alignment:
Q  34 aaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacattt 133  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||    
T  14122803 aaaaaggaggttagatattaatgatcaagctggtattaatgtaagcagaaatttccgatatatggttgttgatgcaaatggatatgataatcttactttt 14122902  T
Q  134 ggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaa 233  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||||| || || || ||  | ||||||| |||||| | |||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  14122903 ggagaaaaagattgtagaaattacatagacaaagtaagacgacttcgacttgggataggagatgttgaagctattcaaaactattttgtcataatgcaaa 14123002  T
Q  234 agcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaata 333  Q
     | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||| ||    
T  14123003 tgaaaaatagtcaattttattatgtgatggatgtggatgacaaaagtcgtttgcgaaatgtattctgggtagatgcgagaagtagggctacttatgagta 14123102  T
Q  334 ctttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
     ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14123103 ttttggtgaaatcataacttttgataccacttatttaacaaataaatat 14123151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Original strand, 40249052 - 40249253
Alignment:
Q  173 cggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatg 272  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| || | || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  40249052 cggctaagacttgggagaggagatgttgatgcaattcatagcttttttcatagaatgcaaaagcaaaatagtcaattttattgtgcaatggatatggatg 40249151  T
Q  273 atgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaac 372  Q
    || | ||   | ||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  40249152 ataaaaggaatatacaaaatttattttgggcagatgcgagatgtagggctgcatatgaatattttggtgaagtcataactttggataccacttatttaac 40249251  T
Q  373 aa 374  Q
    ||    
T  40249252 aa 40249253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 375
Target Start/End: Original strand, 35049128 - 35049469
Alignment:
Q  34 aaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacattt 133  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||    
T  35049128 aaaaaggaggttagatattaatgatcaagctggtattaatgtaagcagaaatttccgatctatggttgttgaagcaaatggatatgataatcttacattt 35049227  T
Q  134 ggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaa 233  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| |  || |||||  | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  35049228 ggagaaaaagattgtagaaattacattgacaaagcaagacggcttcgacttgggacaggagatgctgaagctattcaaaactattttgtcagaatgcaaa 35049327  T
Q  234 agcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaata 333  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  35049328 agaaaaatagtcaattttattatgtgatggatgtggatgacaaaagtcgtttgcgaaatgtattctgggtagatgcgagatgtagggctgcttatgagta 35049427  T
Q  334 ctttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaa 375  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  35049428 ttttggtgaagtcataacttttgataccacttatttaacaaa 35049469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15635765 - 15635634
Alignment:
Q  34 aaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacattt 133  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||||    
T  15635765 aaaaaggaggttagatattaatgatcaagctgatattaatgtaagcagaaatttccgatctatggttgttgaagcaaatgaatatgataatcttacattt 15635666  T
Q  134 ggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaa 165  Q
    |  ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  15635665 gaagaaaaagatcgtagaaattacatagacaa 15635634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 412428 - 412099
Alignment:
Q  53 aatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaa 152  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  412428 aatgatcaagctgggattaatgtgagtagaaattttcgatccttggtcggtgaagcaaatgggtatgagaatctcacatttggagaaaaagactgtagaa 412329  T
Q  153 actatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagtttta 252  Q
    || | |||||||| || || ||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  412328 accacatagacaaagtaagacgattacgacttgggacaggagatgctgaagcaatacaaaaatactttgttaggatgcaaaagcaaaatagtcaatttta 412229  T
Q  253 ttatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaact 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  412228 ttatgtaatggacgtcgatgatgaaagtcggttacgaaatgtgttttgggcagatgcaagatgtagggccgcatatgaatattttggcgaagtcatatct 412129  T
Q  353 tttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  412128 ttcgacaccacttacttaacaaataaatat 412099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 382
Target Start/End: Original strand, 49960138 - 49960506
Alignment:
Q  14 aagaatatggggtctcacataaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacg 113  Q
    |||||||||||| |||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| || || ||||| || |||||||||  |||| | || ||||||||||| |    
T  49960138 aagaatatgggggctcaaatgaagaggaggttagaactcaatgatgaagctgggattaatgtaagcagaaattttcaatctctagtcgttgaagcaaatg 49960237  T
Q  114 ggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaa 213  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||  | ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49960238 ggtataagaatctcacatttggagaaaaagactgcaggaactacatagacaaagtaagaagactacgacttgggacaagagatgctgaagcaatacaaaa 49960337  T
Q  214 ctattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaaga 313  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  49960338 atattttgttaggatgcaaaagcaaaacagtcaattttattatgtcatgaatgtggatgatgaaagtcgattacgaaatgtgttttgggcagatgcaaga 49960437  T
Q  314 tgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  49960438 tgtagggttgcatatgaatattttggtgaagtcataactttcgacaccacttatttaacaaataaatat 49960506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Original strand, 413595 - 413924
Alignment:
Q  53 aatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaa 152  Q
    ||||||||||| || || ||||  |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  413595 aatgatcaagctgggattaatgcgagtagaaattttcgatccttggtcggtgaagcaaatgggtatgagaatctcacatttggagaaaaagactgtagaa 413694  T
Q  153 actatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagtttta 252  Q
    || | |||||||| || || ||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  413695 accacatagacaaagtaagacgattacgacttgggacaggagatgctgaagcaatacaaaaatactttgttaggatgcaaaagcaaaatagtcaatttta 413794  T
Q  253 ttatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaact 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  413795 ttatgtaatggacgtcgatgatgaaagtcggttacgaaatgtgttttgggcagatgcaagatgtagggccgcatatgaatattttggcgaagtcatatct 413894  T
Q  353 tttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  413895 ttcgacaccacttacttaacaaataaatat 413924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53325055 - 53324707
Alignment:
Q  34 aaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacattt 133  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||| || || || || ||||| ||||||    
T  53325055 aaaaaggaggttagatattaatgatcaagctgatattaatgtaagcagaaatttctgatctatggttgtttaagccaatggatatgataatcttacattt 53324956  T
Q  134 ggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaa 233  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||  | ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||    
T  53324955 ggagaaaaagattgtagaaattacatagacaatgtaagacggcttcgacttgggataggagatgctgaagctattcaaaactattttgtcagaatgaaaa 53324856  T
Q  234 agcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaata 333  Q
    || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  | || |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||    
T  53324855 agaaaaatagtcaattttattatgtgatggatctggatgacaaaagtcgtttgcgaaatgtattctgggcagatgcgagaagtaggactgcttatgagta 53324756  T
Q  334 ctttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53324755 ttttggtgaagtcataacttttgataccacttatttaacaaataaatat 53324707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 382
Target Start/End: Original strand, 26301521 - 26301574
Alignment:
Q  329 gaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26301521 gaatactttggtgaagtcataacttttgacatcacttatttaacaaataaatat 26301574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15049650 - 15049321
Alignment:
Q  53 aatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaa 152  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||  ||||  | |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  15049650 aatgaccaagctgggattaatgtaagtagaaatttccgatcctttgttgttgaagcagatgggtatgaaaatctcacatttggagaaaaagactgcataa 15049551  T
Q  153 actatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagtttta 252  Q
    |||| |||||||| || || || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  15049550 actacatagacaaagtaagacgactttgacttgggacaggagatgctgaagcaatacaaaattattttgtgaggatgcaaaagcaaaacagtcaatttta 15049451  T
Q  253 ttatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaact 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || |||  |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15049450 ttatgtgatggatgtggatgatgaaagtcggttacaaaatgtgttttgggcagatgcaagatgtagggttgcatatgaatattttggtgaagtcataact 15049351  T
Q  353 tttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15049350 ttcgacaccacttacttaacaaataaatat 15049321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15230591 - 15230270
Alignment:
Q  53 aatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaa 152  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| | ||  |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15230591 aatgatcaagctgggattaatgtgagtagaaatttttggtccttggtcggtgaagcaaatgggtatgagaatctcacatttggagaaaaagactgcagaa 15230492  T
Q  153 actatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagtttta 252  Q
    |||| ||  |||| || || ||  || |       |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15230491 actacattcacaaagtaagacgattacg-------acaggagatgctgaagcaatacaaaaatactttgttaggatgcaaaagcaaaatagtcaatttta 15230399  T
Q  253 ttatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaact 352  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| || ||  || | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  15230398 ttatgtgatggacgtgaatgatgaaagtcgactacg-aatgtgttttcggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatatttcggcgaagtcataact 15230300  T
Q  353 tttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15230299 ttcgacaccacttacttaacaaataaatat 15230270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 54078193 - 54077843
Alignment:
Q  32 ataaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacat 131  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  || || || || || ||||    
T  54078193 ataaaaaggagattggaggttaatgaccaagctgggattaatgtaagtagaaattttcggtctatggttgttgaagcaagtggatatgataaccttacat 54078094  T
Q  132 ttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgca 231  Q
    | || ||||||||   ||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  54078093 tcggggaaaaagatgctagaaactacatagacaaagtgaggcggcttcgacttgggacaggagatgctgaagccattcaaaattattttgttagaatgca 54077994  T
Q  232 aaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaa 331  Q
    ||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  54077993 aagaagaaatagtgaattttattatgtaatggatgtggatgacacaagtcgtttacgaaatgttttttgggcagatgcgagatgcagggctgcttatgag 54077894  T
Q  332 tactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    || |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  54077893 tattttggtgaagtaataacctttgacaccacttacttaacaaataaatat 54077843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20007563 - 20007215
Alignment:
Q  34 aaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacattt 133  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  ||| |||||||||||||||||| || || || ||||| || |||    
T  20007563 aaaaaggaggttggatattaatgatcaagctggtattaatgtaagcagaaatttccgatatatggttgttgaagcaaatggatatgataatcttactttt 20007464  T
Q  134 ggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaa 233  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| || || || ||  | ||||||| |||||| | |||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  20007463 ggagaaaaagattgtagaaattacatggacaaagtaagacgacttcgacttgggataggagatgttgaagctattcaaaactattttgtcataatgcaaa 20007364  T
Q  234 agcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaata 333  Q
     | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||| ||    
T  20007363 tgaaaaatagtcaattttattatgtgatggatgtggatgacaaaagtcgtttgcgaaatgtattctgggtagatgcgagaagtagggctacttatgagta 20007264  T
Q  334 ctttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
     ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20007263 ttttggtgaaatcataacttttgataccacttatttaacaaataaatat 20007215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 53227649 - 53227511
Alignment:
Q  227 atgcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcat 326  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  53227649 atgcaaaggcaaaacggtcaattttattatgcaatagatgttgatgatgaaagccggttacgaaaagtgttttggacagatgcaagatgtagggttgcat 53227550  T
Q  327 atgaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaa 371  Q
    |||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53227549 atgaa------ggtgaagtcataacttttgacaccacttatttaa 53227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 366
Target Start/End: Original strand, 20660254 - 20660390
Alignment:
Q  229 gcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatat 328  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || |  ||| | ||||| || |||||| |||||||||| ||||   |||||    
T  20660254 gcaaaagcaaaacagtcaattttatgatgcaatggatgtggatgatgaaagtcaattacg-aatgtgttttgggcatatgcaagatgaagggtaacatat 20660352  T
Q  329 gaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccactta 366  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||    
T  20660353 gaatattttggcgacgtcataacttttggcgccactta 20660390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 382
Target Start/End: Original strand, 23557040 - 23557391
Alignment:
Q  32 ataaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacat 131  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  || || || || || ||||    
T  23557040 ataaaaaggagattggaggttaatgaccaagctgggattaatgtaagtagaaattttcggtctatggttgttgaagcaagtggatatgataaccttacat 23557139  T
Q  132 ttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacgctgaagc-aatacaaaactattttgttagaatgc 230  Q
    | ||  |||||||   ||||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23557140 tcgggaaaaaagatgctagaaactacatagacaaagtgaggcggcttcgactagggacaggagatgctgaagccaattcaaaattattttgttagaatcc 23557239  T
Q  231 aaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggatgtggatgatgatagccgtttaagaaatgtattctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatga 330  Q
    |||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23557240 aaagaagaaatagtgaattttattatgtaatggatgtggatgacacaagtcgtttacgaaatgttttttgggcagatgcgagatgaagggctgcttatga 23557339  T
Q  331 atactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
     || |||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23557340 gtattttggtgaagtaataaccattgacaccacttacttaacaaataaatat 23557391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9284525 - 9284244
Alignment:
Q  98 gttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacatttggtgaaaaagactgtagaaactatatagacaaggtcaggcggctaaggcttgggacaggagacg 197  Q
    ||||||||||| || || || || ||| | ||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||   ||||||  ||| |||| |    
T  9284525 gttgttgaagcgaatggatatgataattttacacttggaggaaaagattgtagaaactatatagacaaaataagacggcatcggcttg--acatgagatg 9284428  T
Q  198 ctgaagcaatacaaaactattttgttagaatgcaaaagcaaaatagtcagttttattatgtaatggat-gtggatgatgatagccgtttaagaaatgtat 296  Q
     |||||| || |||||||||||||| | |||| ||| |  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  | || | |||  |||||||||    
T  9284427 ttgaagctattcaaaactattttgtcaaaatgaaaaggagaaatagtcaattgtattatgtaatggattgtggatgacaaaagtcattt--gaaatgtat 9284330  T
Q  297 tctgggcagatgcaagatgtagggctgcatatgaatactttggtgaagtcgtaacttttgacaccacttatttaacaaacaaatat 382  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |  |  ||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  9284329 tttgggcagatgcgagatgtaggacaactcatgaatattttggtgaattcataacttttgacatcgcttgtttaacaaataaatat 9284244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 9285417 - 9285543
Alignment:
Q  34 aaaaaggagattagagattaatgatcaagcaggtatcaatgtcagtagaaattttagatctatggttgttgaagcaaacgggtacgagaatctcacattt 133  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||| || || || || |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||    
T  9285417 aaaaatgaggttagagcttaatgatcaagctggaattaa-gttagtagacatgttttatctatggttgttgaagcaaatgggtatgataatctta-attt 9285514  T
Q  134 ggtgaaaaagactgtagaaactatataga 162  Q
     | |||||||| || |||||||| |||||    
T  9285515 agagaaaaagattgcagaaactacataga 9285543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University