View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1482R-Insertion-10 (Length: 525)

Name: NF1482R-Insertion-10
Description: NF1482R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1482R-Insertion-10
NF1482R-Insertion-10
[»] chr8 (97 HSPs)
chr8 (9-385)||(17982446-17982822)
chr8 (9-385)||(31218050-31218426)
chr8 (9-385)||(1746218-1746593)
chr8 (22-385)||(19945358-19945722)
chr8 (9-385)||(44303647-44304024)
chr8 (9-385)||(34254330-34254703)
chr8 (9-385)||(34256506-34256879)
chr8 (22-385)||(42498000-42498363)
chr8 (18-385)||(15212587-15212954)
chr8 (9-385)||(12702634-12703014)
chr8 (18-385)||(43036224-43036591)
chr8 (18-385)||(33351951-33352318)
chr8 (19-385)||(27811080-27811446)
chr8 (18-385)||(30143143-30143508)
chr8 (18-373)||(4731459-4731814)
chr8 (81-385)||(5689136-5689439)
chr8 (73-382)||(2627599-2627902)
chr8 (66-385)||(3303670-3303988)
chr8 (80-385)||(6598836-6599140)
chr8 (80-385)||(6674289-6674593)
chr8 (100-364)||(1345391-1345655)
chr8 (79-376)||(1292473-1292768)
chr8 (81-364)||(18141685-18141968)
chr8 (9-172)||(19948533-19948696)
chr8 (170-384)||(42434992-42435204)
chr8 (160-384)||(4283468-4283691)
chr8 (150-385)||(40321014-40321248)
chr8 (106-373)||(4162390-4162652)
chr8 (170-384)||(18655355-18655567)
chr8 (91-334)||(9765622-9765863)
chr8 (99-376)||(18106090-18106363)
chr8 (92-385)||(25689838-25690123)
chr8 (80-306)||(41364925-41365151)
chr8 (160-376)||(40221689-40221904)
chr8 (121-376)||(41366624-41366877)
chr8 (158-360)||(19491723-19491924)
chr8 (90-385)||(3439385-3439672)
chr8 (162-376)||(8965700-8965914)
chr8 (160-346)||(44353736-44353923)
chr8 (160-384)||(40328723-40328943)
chr8 (125-385)||(4743214-4743462)
chr8 (81-293)||(10929666-10929876)
chr8 (160-385)||(10930199-10930423)
chr8 (156-377)||(30291545-30291768)
chr8 (170-384)||(11383941-11384152)
chr8 (22-185)||(4733610-4733778)
chr8 (84-373)||(8153629-8153914)
chr8 (184-364)||(3772161-3772340)
chr8 (19-184)||(23799274-23799441)
chr8 (462-525)||(19945218-19945281)
chr8 (215-381)||(42575327-42575494)
chr8 (215-376)||(15290522-15290684)
chr8 (215-376)||(15470891-15471053)
chr8 (98-185)||(10015030-10015117)
chr8 (462-525)||(31218503-31218566)
chr8 (18-185)||(7412571-7412740)
chr8 (18-185)||(5702177-5702346)
chr8 (462-525)||(1746078-1746141)
chr8 (19-185)||(4696306-4696474)
chr8 (462-523)||(17982899-17982960)
chr8 (27-185)||(4456259-4456419)
chr8 (458-525)||(27811520-27811587)
chr8 (81-360)||(11712024-11712306)
chr8 (89-375)||(29796329-29796618)
chr8 (276-364)||(3073894-3073981)
chr8 (272-376)||(10015137-10015238)
chr8 (462-525)||(30143586-30143649)
chr8 (462-525)||(34254190-34254253)
chr8 (294-376)||(4733784-4733865)
chr8 (89-213)||(38863743-38863868)
chr8 (272-360)||(7597670-7597759)
chr8 (462-525)||(4731904-4731967)
chr8 (72-186)||(5990315-5990428)
chr8 (462-525)||(15213032-15213095)
chr8 (462-525)||(34256366-34256429)
chr8 (50-185)||(3051351-3051488)
chr8 (272-360)||(32902197-32902286)
chr8 (205-346)||(1822282-1822423)
chr8 (205-346)||(1856727-1856868)
chr8 (466-525)||(4733956-4734015)
chr8 (462-525)||(33352396-33352459)
chr8 (89-304)||(41266840-41267057)
chr8 (462-525)||(42498441-42498504)
chr8 (462-525)||(44304101-44304164)
chr8 (71-132)||(1872175-1872236)
chr8 (18-185)||(19175448-19175620)
chr8 (462-525)||(2627984-2628048)
chr8 (150-305)||(3231875-3232031)
chr8 (462-525)||(41366477-41366539)
chr8 (238-325)||(10240175-10240264)
chr8 (81-158)||(30291457-30291534)
chr8 (72-185)||(3318747-3318862)
chr8 (150-185)||(7493004-7493039)
chr8 (462-525)||(18105935-18105997)
chr8 (89-148)||(40320940-40320999)
chr8 (78-132)||(32902439-32902493)
chr8 (175-215)||(7444986-7445026)
[»] chr2 (95 HSPs)
chr2 (9-385)||(45099548-45099923)
chr2 (9-385)||(4503132-4503507)
chr2 (9-385)||(36205664-36206040)
chr2 (18-385)||(36988075-36988441)
chr2 (9-385)||(5723255-5723629)
chr2 (9-385)||(2334417-2334792)
chr2 (18-385)||(6595005-6595372)
chr2 (73-385)||(4484329-4484642)
chr2 (22-385)||(38312045-38312408)
chr2 (9-376)||(29867661-29868028)
chr2 (73-385)||(30833202-30833515)
chr2 (18-385)||(36318009-36318376)
chr2 (22-385)||(17057369-17057732)
chr2 (22-385)||(17085352-17085715)
chr2 (55-385)||(32289411-32289733)
chr2 (80-364)||(42362216-42362500)
chr2 (98-385)||(723744-724030)
chr2 (89-375)||(33162460-33162745)
chr2 (18-260)||(39284686-39284929)
chr2 (80-385)||(11151591-11151895)
chr2 (89-385)||(34139770-34140066)
chr2 (80-376)||(11690365-11690660)
chr2 (98-385)||(14633825-14634112)
chr2 (81-385)||(36773414-36773730)
chr2 (73-385)||(6266555-6266860)
chr2 (160-384)||(35446885-35447108)
chr2 (160-382)||(1631735-1631956)
chr2 (159-375)||(11067248-11067463)
chr2 (158-384)||(45726871-45727096)
chr2 (80-346)||(14202450-14202711)
chr2 (160-385)||(24397997-24398227)
chr2 (151-350)||(13121703-13121901)
chr2 (150-376)||(17490157-17490376)
chr2 (138-318)||(24885583-24885763)
chr2 (160-376)||(42288120-42288334)
chr2 (150-346)||(7815311-7815508)
chr2 (92-385)||(12647385-12647669)
chr2 (151-361)||(11049484-11049699)
chr2 (215-381)||(13656035-13656200)
chr2 (187-376)||(33648142-33648332)
chr2 (150-374)||(26353124-26353341)
chr2 (175-385)||(17450550-17450745)
chr2 (90-324)||(12123644-12123879)
chr2 (18-144)||(2837084-2837211)
chr2 (462-525)||(4502992-4503055)
chr2 (18-185)||(34389082-34389251)
chr2 (462-525)||(4484187-4484250)
chr2 (19-185)||(33528322-33528490)
chr2 (462-525)||(36205524-36205587)
chr2 (17-185)||(36757458-36757628)
chr2 (272-364)||(7451174-7451266)
chr2 (18-185)||(23078168-23078337)
chr2 (462-525)||(17057228-17057291)
chr2 (462-525)||(17085211-17085274)
chr2 (19-185)||(21630176-21630344)
chr2 (462-525)||(45100000-45100063)
chr2 (91-232)||(5700273-5700417)
chr2 (18-185)||(10706949-10707118)
chr2 (462-525)||(6594863-6594926)
chr2 (275-373)||(28671989-28672088)
chr2 (462-525)||(32289814-32289877)
chr2 (462-525)||(38312486-38312549)
chr2 (42-185)||(28258899-28259043)
chr2 (19-185)||(14698707-14698875)
chr2 (19-185)||(33118366-33118534)
chr2 (310-385)||(39284930-39285004)
chr2 (43-185)||(17865436-17865578)
chr2 (61-185)||(40015156-40015280)
chr2 (462-525)||(5723115-5723178)
chr2 (462-525)||(30833594-30833657)
chr2 (462-525)||(36987934-36987997)
chr2 (272-358)||(42019896-42019985)
chr2 (15-185)||(8389843-8390015)
chr2 (19-185)||(20522453-20522621)
chr2 (228-324)||(34811281-34811378)
chr2 (15-185)||(13569560-13569733)
chr2 (187-360)||(30218068-30218241)
chr2 (84-185)||(12632912-12633017)
chr2 (92-185)||(41586322-41586417)
chr2 (231-324)||(42261545-42261639)
chr2 (184-360)||(7597036-7597211)
chr2 (152-185)||(40739065-40739098)
chr2 (273-385)||(24197955-24198065)
chr2 (228-304)||(41446151-41446227)
chr2 (150-185)||(10445298-10445333)
chr2 (81-148)||(11049402-11049468)
chr2 (462-525)||(11067547-11067609)
chr2 (462-525)||(14202283-14202345)
chr2 (462-525)||(14633687-14633749)
chr2 (230-324)||(41454248-41454343)
chr2 (229-334)||(3897003-3897109)
chr2 (315-361)||(42412117-42412162)
chr2 (82-185)||(3278231-3278336)
chr2 (152-185)||(39483164-39483197)
chr2 (78-158)||(11067154-11067234)
[»] chr5 (91 HSPs)
chr5 (9-385)||(13342854-13343229)
chr5 (13-385)||(30182386-30182757)
chr5 (9-385)||(25412555-25412929)
chr5 (9-385)||(36074042-36074419)
chr5 (18-385)||(13239554-13239920)
chr5 (18-376)||(30682931-30683286)
chr5 (18-385)||(32636625-32636992)
chr5 (18-376)||(13488004-13488362)
chr5 (17-385)||(37438949-37439310)
chr5 (18-385)||(42428430-42428797)
chr5 (18-385)||(533570-533937)
chr5 (18-364)||(42426255-42426602)
chr5 (18-373)||(28750667-28751023)
chr5 (69-346)||(39468587-39468864)
chr5 (55-385)||(16409321-16409644)
chr5 (71-385)||(26177746-26178051)
chr5 (73-385)||(9789223-9789528)
chr5 (73-385)||(18441647-18441952)
chr5 (72-376)||(16451937-16452239)
chr5 (92-376)||(537901-538184)
chr5 (55-385)||(26170620-26170931)
chr5 (98-385)||(33831562-33831848)
chr5 (160-384)||(213409-213633)
chr5 (80-376)||(31182837-31183130)
chr5 (80-375)||(8565956-8566251)
chr5 (73-385)||(29751159-29751464)
chr5 (73-385)||(29720228-29720533)
chr5 (89-364)||(3075678-3075953)
chr5 (73-385)||(29722388-29722693)
chr5 (160-385)||(28278260-28278484)
chr5 (92-366)||(42309953-42310227)
chr5 (160-384)||(40147205-40147428)
chr5 (80-313)||(5887487-5887720)
chr5 (170-384)||(5058002-5058212)
chr5 (90-385)||(22536289-22536574)
chr5 (61-230)||(42926738-42926908)
chr5 (18-385)||(19806207-19806531)
chr5 (171-361)||(13695713-13695904)
chr5 (160-364)||(38746949-38747153)
chr5 (88-385)||(10593138-10593427)
chr5 (160-382)||(27637615-27637838)
chr5 (171-363)||(16640961-16641153)
chr5 (92-385)||(25078004-25078290)
chr5 (92-385)||(25135973-25136259)
chr5 (150-373)||(9049354-9049576)
chr5 (160-384)||(27015476-27015690)
chr5 (215-385)||(40380090-40380260)
chr5 (215-385)||(40382301-40382471)
chr5 (92-381)||(16546515-16546796)
chr5 (81-345)||(3325778-3326043)
chr5 (92-381)||(16544293-16544574)
chr5 (462-525)||(13343306-13343369)
chr5 (462-525)||(36073902-36073965)
chr5 (231-375)||(316777-316922)
chr5 (18-185)||(14520461-14520630)
chr5 (462-525)||(30182834-30182897)
chr5 (18-185)||(11916669-11916838)
chr5 (42-194)||(11181555-11181707)
chr5 (462-525)||(16409725-16409788)
chr5 (462-525)||(30682782-30682845)
chr5 (462-525)||(39468408-39468471)
chr5 (18-185)||(12083874-12084043)
chr5 (272-385)||(33906029-33906143)
chr5 (462-525)||(18441501-18441563)
chr5 (462-525)||(26178132-26178195)
chr5 (230-334)||(22097878-22097981)
chr5 (18-149)||(16649857-16649990)
chr5 (175-324)||(35616129-35616278)
chr5 (55-185)||(15464765-15464896)
chr5 (19-93)||(535685-535760)
chr5 (272-346)||(8445771-8445846)
chr5 (462-525)||(9789081-9789143)
chr5 (50-185)||(17003689-17003825)
chr5 (150-185)||(24553358-24553393)
chr5 (150-185)||(28832488-28832523)
chr5 (72-185)||(36932102-36932214)
chr5 (319-360)||(4160702-4160743)
chr5 (152-185)||(9353165-9353198)
chr5 (272-317)||(42926923-42926968)
chr5 (462-498)||(25413006-25413042)
chr5 (292-376)||(42926967-42927050)
chr5 (175-333)||(6016968-6017125)
chr5 (272-346)||(10054854-10054928)
chr5 (462-525)||(26171012-26171075)
chr5 (150-185)||(31300426-31300461)
chr5 (462-525)||(33831925-33831987)
chr5 (462-525)||(42426095-42426157)
chr5 (462-525)||(42428290-42428352)
chr5 (152-185)||(19588976-19589009)
chr5 (230-360)||(10700674-10700802)
chr5 (242-321)||(30802854-30802934)
[»] chr3 (136 HSPs)
chr3 (9-385)||(5258143-5258519)
chr3 (9-385)||(5260322-5260698)
chr3 (9-385)||(45094957-45095332)
chr3 (9-385)||(9636125-9636503)
chr3 (9-385)||(7762057-7762434)
chr3 (42-385)||(37408284-37408627)
chr3 (71-385)||(23200137-23200449)
chr3 (55-385)||(23197938-23198267)
chr3 (9-385)||(7764245-7764633)
chr3 (19-385)||(40734300-40734666)
chr3 (80-385)||(19683888-19684193)
chr3 (18-364)||(29810669-29811016)
chr3 (15-385)||(29812861-29813231)
chr3 (18-375)||(51398615-51398972)
chr3 (50-385)||(5236457-5236791)
chr3 (80-385)||(9581147-9581451)
chr3 (87-376)||(40735254-40735542)
chr3 (20-385)||(44331360-44331713)
chr3 (80-364)||(760711-760995)
chr3 (80-376)||(22835011-22835306)
chr3 (80-376)||(53921512-53921807)
chr3 (91-385)||(800973-801261)
chr3 (89-385)||(39153361-39153656)
chr3 (98-385)||(29682241-29682527)
chr3 (80-385)||(29196386-29196705)
chr3 (99-385)||(16498913-16499197)
chr3 (81-375)||(44700489-44700795)
chr3 (150-385)||(31314379-31314613)
chr3 (80-385)||(32744436-32744730)
chr3 (81-376)||(32890968-32891263)
chr3 (160-384)||(6095600-6095823)
chr3 (170-376)||(4569906-4570112)
chr3 (81-385)||(9666466-9666771)
chr3 (160-384)||(54593648-54593871)
chr3 (160-385)||(34491157-34491380)
chr3 (160-385)||(43401800-43402026)
chr3 (88-385)||(54635004-54635293)
chr3 (88-385)||(6716379-6716668)
chr3 (160-385)||(49199468-49199694)
chr3 (72-385)||(23391909-23392221)
chr3 (160-375)||(30236069-30236283)
chr3 (160-305)||(5433955-5434102)
chr3 (90-385)||(45282864-45283155)
chr3 (170-384)||(41819523-41819737)
chr3 (160-385)||(43403743-43403969)
chr3 (175-385)||(7780003-7780204)
chr3 (18-364)||(23410349-23410697)
chr3 (170-373)||(46860427-46860631)
chr3 (161-375)||(46173311-46173515)
chr3 (80-268)||(26386597-26386785)
chr3 (92-385)||(3617333-3617619)
chr3 (187-385)||(47304224-47304419)
chr3 (88-381)||(25637308-25637592)
chr3 (89-318)||(5373096-5373336)
chr3 (160-351)||(36018795-36018987)
chr3 (160-317)||(31340268-31340425)
chr3 (84-262)||(2075178-2075369)
chr3 (92-381)||(4600747-4601028)
chr3 (462-525)||(5258003-5258066)
chr3 (19-185)||(40592469-40592637)
chr3 (275-385)||(40913352-40913461)
chr3 (215-381)||(4598526-4598693)
chr3 (215-381)||(10056217-10056384)
chr3 (215-381)||(10058439-10058606)
chr3 (215-381)||(10060661-10060828)
chr3 (215-381)||(10062883-10063050)
chr3 (215-381)||(10065105-10065272)
chr3 (215-381)||(10211393-10211560)
chr3 (458-525)||(5260182-5260249)
chr3 (277-384)||(55301972-55302079)
chr3 (22-185)||(16264580-16264745)
chr3 (15-105)||(30709480-30709572)
chr3 (195-345)||(51352150-51352298)
chr3 (19-185)||(1735991-1736159)
chr3 (16-185)||(39032239-39032409)
chr3 (19-185)||(47923591-47923759)
chr3 (16-185)||(36029324-36029495)
chr3 (215-381)||(10209173-10209340)
chr3 (19-185)||(48438447-48438614)
chr3 (18-185)||(8370175-8370344)
chr3 (462-525)||(7764711-7764774)
chr3 (462-525)||(9634680-9634743)
chr3 (462-525)||(9635983-9636046)
chr3 (462-525)||(19683747-19683810)
chr3 (19-185)||(24694853-24695021)
chr3 (458-525)||(7762508-7762575)
chr3 (462-525)||(9581529-9581592)
chr3 (462-525)||(23199996-23200058)
chr3 (42-185)||(27974663-27974807)
chr3 (462-525)||(40735628-40735691)
chr3 (236-328)||(4055819-4055912)
chr3 (88-210)||(6718563-6718686)
chr3 (18-185)||(27026937-27027106)
chr3 (175-327)||(35138762-35138915)
chr3 (20-105)||(27038362-27038449)
chr3 (462-525)||(29811114-29811177)
chr3 (462-525)||(29813307-29813370)
chr3 (462-525)||(45095409-45095472)
chr3 (18-105)||(35925791-35925880)
chr3 (44-184)||(21711454-21711594)
chr3 (22-185)||(27986147-27986311)
chr3 (19-185)||(8126861-8127029)
chr3 (317-376)||(27305719-27305777)
chr3 (462-525)||(37408705-37408768)
chr3 (462-525)||(40734743-40734806)
chr3 (462-520)||(7779865-7779923)
chr3 (272-360)||(33191888-33191974)
chr3 (250-334)||(1313854-1313939)
chr3 (73-150)||(7782375-7782452)
chr3 (80-185)||(27453191-27453294)
chr3 (462-525)||(801335-801399)
chr3 (462-525)||(761091-761153)
chr3 (150-185)||(3323511-3323546)
chr3 (462-525)||(5236316-5236379)
chr3 (50-185)||(6794434-6794570)
chr3 (275-321)||(20937715-20937762)
chr3 (462-525)||(51399060-51399123)
chr3 (228-333)||(54739004-54739110)
chr3 (310-364)||(2075095-2075149)
chr3 (251-343)||(4075511-4075605)
chr3 (19-96)||(44331735-44331813)
chr3 (152-185)||(26299219-26299252)
chr3 (152-185)||(26928421-26928454)
chr3 (231-307)||(28253344-28253421)
chr3 (345-381)||(10067435-10067471)
chr3 (156-192)||(30709615-30709651)
chr3 (49-185)||(37725906-37726043)
chr3 (238-324)||(25491027-25491114)
chr3 (42-185)||(33386386-33386530)
chr3 (151-185)||(3328178-3328212)
chr3 (150-184)||(4386797-4386831)
chr3 (463-525)||(29682604-29682665)
chr3 (152-185)||(27038282-27038315)
chr3 (152-185)||(32143554-32143587)
chr3 (156-185)||(35925709-35925738)
chr3 (170-215)||(40612562-40612607)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (9-382)||(30834538-30834912)
chr6 (9-385)||(16452328-16452704)
chr6 (9-385)||(5406199-5406573)
chr6 (9-385)||(5410524-5410898)
chr6 (9-385)||(31404674-31405049)
chr6 (9-385)||(5413394-5413767)
chr6 (73-385)||(2171531-2171842)
chr6 (18-385)||(33160351-33160720)
chr6 (22-385)||(9183031-9183393)
chr6 (18-385)||(33211185-33211552)
chr6 (80-384)||(28137409-28137712)
chr6 (92-385)||(3072758-3073045)
chr6 (90-385)||(6097450-6097728)
chr6 (80-375)||(26954296-26954589)
chr6 (88-385)||(411981-412271)
chr6 (160-384)||(21593608-21593831)
chr6 (150-361)||(3038926-3039137)
chr6 (160-385)||(3808707-3808933)
chr6 (200-384)||(21588916-21589098)
chr6 (160-384)||(17762933-17763158)
chr6 (160-364)||(2972959-2973163)
chr6 (170-384)||(26830124-26830337)
chr6 (187-384)||(17757995-17758191)
chr6 (160-384)||(5043571-5043795)
chr6 (88-385)||(27647742-27648029)
chr6 (160-384)||(22424826-22425052)
chr6 (88-385)||(16554749-16555038)
chr6 (88-385)||(16631305-16631594)
chr6 (89-385)||(16568916-16569190)
chr6 (119-385)||(16653022-16653281)
chr6 (88-385)||(16578517-16578806)
chr6 (88-385)||(16616574-16616863)
chr6 (150-358)||(4045356-4045566)
chr6 (160-385)||(603088-603304)
chr6 (92-385)||(25421189-25421475)
chr6 (92-385)||(6027132-6027416)
chr6 (286-385)||(5409069-5409167)
chr6 (9-128)||(5411489-5411608)
chr6 (80-210)||(16567070-16567201)
chr6 (16-128)||(5407164-5407276)
chr6 (184-345)||(25073538-25073698)
chr6 (215-381)||(13153913-13154080)
chr6 (92-381)||(33342108-33342389)
chr6 (215-381)||(34164856-34165023)
chr6 (215-385)||(34167078-34167249)
chr6 (462-522)||(30834396-30834456)
chr6 (18-185)||(22963930-22964098)
chr6 (18-185)||(23824295-23824463)
chr6 (272-376)||(26800643-26800747)
chr6 (462-525)||(16452187-16452250)
chr6 (462-525)||(2171386-2171449)
chr6 (19-105)||(18234394-18234482)
chr6 (462-525)||(9182890-9182953)
chr6 (17-105)||(31086170-31086260)
chr6 (18-185)||(5757175-5757344)
chr6 (9-65)||(16452759-16452815)
chr6 (462-525)||(5408929-5408992)
chr6 (462-525)||(5413254-5413317)
chr6 (17-185)||(5017192-5017362)
chr6 (42-105)||(23896663-23896727)
chr6 (462-522)||(31404537-31404597)
chr6 (462-525)||(3072616-3072679)
chr6 (462-525)||(6097306-6097369)
chr6 (22-185)||(24435673-24435837)
chr6 (19-105)||(10076889-10076977)
chr6 (462-525)||(16569266-16569328)
chr6 (22-185)||(5571945-5572109)
chr6 (152-185)||(22709241-22709274)
chr6 (80-148)||(3039152-3039219)
chr6 (80-132)||(30684158-30684210)
chr6 (50-185)||(31936806-31936942)
chr6 (322-375)||(19643877-19643929)
chr6 (152-185)||(21356268-21356301)
chr6 (91-185)||(14521905-14522002)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (9-385)||(434326-434702)
scaffold0002 (462-525)||(434780-434843)
scaffold0002 (231-324)||(490380-490474)
[»] chr7 (119 HSPs)
chr7 (17-385)||(35853716-35854083)
chr7 (8-385)||(4178567-4178942)
chr7 (18-385)||(23554842-23555209)
chr7 (9-385)||(29990848-29991222)
chr7 (18-385)||(14069833-14070200)
chr7 (18-385)||(14379861-14380228)
chr7 (51-385)||(19502013-19502347)
chr7 (55-385)||(25766959-25767283)
chr7 (18-366)||(18126445-18126794)
chr7 (18-376)||(30024741-30025099)
chr7 (88-385)||(48408674-48408973)
chr7 (55-385)||(39731215-39731538)
chr7 (18-376)||(47676145-47676503)
chr7 (18-385)||(31732969-31733329)
chr7 (18-377)||(47673952-47674310)
chr7 (18-385)||(1113457-1113825)
chr7 (18-376)||(4585962-4586320)
chr7 (9-233)||(24514911-24515135)
chr7 (50-364)||(48491412-48491727)
chr7 (52-385)||(43864080-43864412)
chr7 (50-385)||(48489264-48489599)
chr7 (22-346)||(26417118-26417446)
chr7 (81-385)||(41317434-41317750)
chr7 (80-385)||(41649011-41649313)
chr7 (80-385)||(38671222-38671526)
chr7 (144-385)||(27347745-27347985)
chr7 (84-375)||(4253538-4253830)
chr7 (18-247)||(2761439-2761669)
chr7 (88-385)||(43504153-43504444)
chr7 (150-385)||(8153276-8153510)
chr7 (81-376)||(31105402-31105696)
chr7 (98-364)||(496003-496269)
chr7 (170-385)||(34310715-34310929)
chr7 (80-385)||(25615727-25616022)
chr7 (174-384)||(22269931-22270140)
chr7 (81-364)||(23565081-23565363)
chr7 (81-375)||(36146418-36146725)
chr7 (80-326)||(31518659-31518905)
chr7 (160-384)||(48599335-48599558)
chr7 (154-384)||(8359316-8359547)
chr7 (73-385)||(24789706-24790010)
chr7 (160-364)||(2360992-2361196)
chr7 (160-376)||(6431915-6432130)
chr7 (80-288)||(24525992-24526201)
chr7 (160-384)||(4508707-4508930)
chr7 (160-382)||(29608680-29608902)
chr7 (96-297)||(4538627-4538828)
chr7 (88-385)||(20343776-20344065)
chr7 (160-384)||(3258938-3259162)
chr7 (81-375)||(12097877-12098175)
chr7 (160-375)||(2390226-2390440)
chr7 (82-374)||(23343840-23344130)
chr7 (89-376)||(36574525-36574811)
chr7 (160-384)||(4510549-4510772)
chr7 (160-384)||(4512391-4512614)
chr7 (248-384)||(32358055-32358190)
chr7 (92-385)||(18388759-18389043)
chr7 (92-385)||(18392195-18392479)
chr7 (160-376)||(22328398-22328622)
chr7 (92-385)||(6592339-6592623)
chr7 (92-385)||(6594557-6594841)
chr7 (242-375)||(2759207-2759339)
chr7 (126-385)||(32060321-32060576)
chr7 (462-525)||(4179019-4179082)
chr7 (462-525)||(48409053-48409116)
chr7 (61-183)||(6570439-6570561)
chr7 (223-376)||(31518911-31519062)
chr7 (272-385)||(6359952-6360064)
chr7 (18-105)||(49092000-49092089)
chr7 (18-185)||(21989139-21989308)
chr7 (18-185)||(46516005-46516171)
chr7 (302-376)||(1560674-1560749)
chr7 (462-525)||(25766816-25766879)
chr7 (151-376)||(3904625-3904851)
chr7 (462-525)||(39731617-39731680)
chr7 (151-268)||(5514125-5514243)
chr7 (292-364)||(24525522-24525594)
chr7 (462-525)||(23555287-23555350)
chr7 (462-525)||(25616101-25616164)
chr7 (462-525)||(35854162-35854225)
chr7 (51-185)||(2479567-2479702)
chr7 (150-251)||(30843366-30843467)
chr7 (50-185)||(20284320-20284456)
chr7 (462-525)||(27348063-27348126)
chr7 (462-525)||(43864490-43864553)
chr7 (462-525)||(48491822-48491885)
chr7 (182-305)||(1360230-1360353)
chr7 (18-185)||(44847822-44847991)
chr7 (462-525)||(18126892-18126955)
chr7 (462-525)||(26417562-26417625)
chr7 (462-525)||(29991299-29991362)
chr7 (310-385)||(30814530-30814604)
chr7 (462-525)||(48489677-48489740)
chr7 (88-287)||(1562103-1562291)
chr7 (42-92)||(2759071-2759121)
chr7 (291-376)||(18396392-18396478)
chr7 (18-105)||(79699-79788)
chr7 (23-185)||(33332152-33332316)
chr7 (50-170)||(3047500-3047622)
chr7 (275-346)||(5116663-5116735)
chr7 (18-65)||(21983595-21983643)
chr7 (462-525)||(4586407-4586470)
chr7 (150-185)||(9185005-9185040)
chr7 (150-185)||(9189838-9189873)
chr7 (150-185)||(23402844-23402879)
chr7 (462-525)||(41648873-41648935)
chr7 (151-185)||(9235414-9235448)
chr7 (150-360)||(26639254-26639469)
chr7 (280-376)||(5513676-5513771)
chr7 (61-185)||(2580621-2580744)
chr7 (19-105)||(2647395-2647483)
chr7 (477-525)||(31732828-31732876)
chr7 (462-525)||(495847-495909)
chr7 (462-525)||(41317298-41317360)
chr7 (231-302)||(43363556-43363627)
chr7 (462-525)||(47675996-47676058)
chr7 (152-185)||(4796501-4796534)
chr7 (340-385)||(24748840-24748884)
chr7 (155-183)||(35961050-35961078)
[»] chr1 (111 HSPs)
chr1 (9-375)||(20762465-20762831)
chr1 (14-385)||(3206785-3207155)
chr1 (22-385)||(3189137-3189499)
chr1 (22-385)||(3197954-3198316)
chr1 (18-385)||(28220226-28220593)
chr1 (18-385)||(3156667-3157033)
chr1 (18-385)||(28223421-28223788)
chr1 (18-385)||(31659039-31659406)
chr1 (18-375)||(49918150-49918508)
chr1 (18-364)||(37503577-37503921)
chr1 (18-385)||(10925024-10925394)
chr1 (18-361)||(1833323-1833667)
chr1 (50-376)||(44454993-44455319)
chr1 (55-385)||(51765234-51765566)
chr1 (80-385)||(8550786-8551091)
chr1 (18-385)||(30476446-30476815)
chr1 (40-375)||(37559877-37560213)
chr1 (81-376)||(50169219-50169513)
chr1 (98-385)||(834167-834453)
chr1 (66-384)||(23555267-23555583)
chr1 (80-375)||(3847131-3847425)
chr1 (81-375)||(50167185-50167491)
chr1 (80-376)||(196916-197212)
chr1 (84-364)||(15820175-15820455)
chr1 (81-385)||(28265554-28265869)
chr1 (80-385)||(4552637-4552941)
chr1 (72-385)||(13137976-13138286)
chr1 (12-189)||(13316513-13316690)
chr1 (215-385)||(13316351-13316520)
chr1 (71-385)||(46064773-46065086)
chr1 (81-385)||(45644354-45644658)
chr1 (99-385)||(13659336-13659621)
chr1 (160-384)||(11348642-11348865)
chr1 (160-384)||(37168241-37168465)
chr1 (73-385)||(9987066-9987370)
chr1 (161-384)||(13547090-13547312)
chr1 (161-384)||(13549001-13549223)
chr1 (88-385)||(40282256-40282546)
chr1 (92-385)||(20622236-20622523)
chr1 (170-384)||(29136202-29136415)
chr1 (80-375)||(40122206-40122502)
chr1 (98-364)||(927996-928264)
chr1 (187-384)||(47255340-47255535)
chr1 (170-385)||(42297974-42298188)
chr1 (160-373)||(19754438-19754651)
chr1 (160-384)||(47115115-47115340)
chr1 (160-385)||(37033071-37033297)
chr1 (171-384)||(31925708-31925919)
chr1 (88-381)||(21053837-21054123)
chr1 (160-375)||(34603519-34603735)
chr1 (89-385)||(9036298-9036585)
chr1 (158-360)||(41360857-41361058)
chr1 (160-384)||(193555-193778)
chr1 (170-384)||(7482231-7482445)
chr1 (173-375)||(19752643-19752844)
chr1 (92-385)||(44203517-44203801)
chr1 (184-345)||(16455591-16455750)
chr1 (230-360)||(22079330-22079461)
chr1 (160-289)||(37879006-37879135)
chr1 (153-375)||(37282701-37282923)
chr1 (16-185)||(3281938-3282109)
chr1 (94-375)||(44650172-44650454)
chr1 (462-525)||(13316211-13316274)
chr1 (18-185)||(21536267-21536436)
chr1 (293-384)||(28242382-28242472)
chr1 (230-360)||(2926522-2926653)
chr1 (462-525)||(3157111-3157174)
chr1 (19-185)||(13598631-13598799)
chr1 (462-525)||(20762914-20762977)
chr1 (19-185)||(29652044-29652212)
chr1 (285-384)||(37876767-37876865)
chr1 (463-525)||(37559724-37559786)
chr1 (171-303)||(8871129-8871259)
chr1 (462-525)||(8550643-8550706)
chr1 (462-525)||(49918596-49918659)
chr1 (219-384)||(36683694-36683847)
chr1 (187-358)||(6808418-6808595)
chr1 (18-185)||(13604319-13604488)
chr1 (462-525)||(10925468-10925531)
chr1 (15-185)||(37069998-37070170)
chr1 (462-525)||(44455406-44455469)
chr1 (50-185)||(47102569-47102705)
chr1 (462-525)||(51765645-51765708)
chr1 (81-158)||(777095-777172)
chr1 (230-361)||(3460709-3460841)
chr1 (50-185)||(47098555-47098691)
chr1 (193-344)||(9109459-9109610)
chr1 (236-334)||(13938157-13938256)
chr1 (61-185)||(22819662-22819785)
chr1 (462-525)||(31659484-31659547)
chr1 (150-197)||(777177-777225)
chr1 (66-106)||(9022653-9022693)
chr1 (184-321)||(12318585-12318721)
chr1 (236-334)||(32471481-32471579)
chr1 (50-185)||(32889669-32889805)
chr1 (186-233)||(44646934-44646981)
chr1 (275-384)||(2262974-2263084)
chr1 (18-184)||(26644594-26644763)
chr1 (272-356)||(5459962-5460046)
chr1 (152-185)||(16124347-16124380)
chr1 (316-384)||(8871063-8871130)
chr1 (462-514)||(37503427-37503479)
chr1 (462-525)||(834029-834091)
chr1 (278-324)||(16914234-16914281)
chr1 (462-525)||(28223281-28223343)
chr1 (458-525)||(40122060-40122126)
chr1 (150-183)||(9022737-9022770)
chr1 (272-324)||(25652142-25652195)
chr1 (276-323)||(4535541-4535589)
chr1 (160-212)||(6484023-6484075)
chr1 (84-172)||(43342468-43342556)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (14-385)||(56178636-56179006)
chr4 (9-385)||(5370082-5370462)
chr4 (9-384)||(29999806-30000180)
chr4 (9-385)||(48142834-48143212)
chr4 (15-385)||(52095362-52095729)
chr4 (18-385)||(37740427-37740793)
chr4 (18-385)||(12739550-12739917)
chr4 (18-385)||(26175636-26176003)
chr4 (42-385)||(9927458-9927799)
chr4 (18-385)||(5429481-5429847)
chr4 (55-385)||(13992292-13992616)
chr4 (9-385)||(52082663-52083032)
chr4 (18-385)||(34570414-34570781)
chr4 (18-346)||(12747794-12748123)
chr4 (18-364)||(54199926-54200273)
chr4 (22-344)||(12745476-12745799)
chr4 (15-385)||(29254292-29254662)
chr4 (59-385)||(36994368-36994692)
chr4 (80-385)||(5871684-5871988)
chr4 (73-385)||(31495315-31495621)
chr4 (98-385)||(47038411-47038695)
chr4 (91-376)||(6542188-6542475)
chr4 (82-385)||(52467354-52467657)
chr4 (80-334)||(24968975-24969230)
chr4 (150-385)||(36463389-36463623)
chr4 (81-375)||(37229731-37230039)
chr4 (80-385)||(13009444-13009735)
chr4 (160-384)||(41639370-41639593)
chr4 (170-385)||(2209668-2209883)
chr4 (150-364)||(4587892-4588107)
chr4 (158-385)||(48893638-48893868)
chr4 (160-385)||(54882964-54883188)
chr4 (160-364)||(8665351-8665556)
chr4 (125-376)||(31474059-31474310)
chr4 (160-384)||(46703443-46703669)
chr4 (160-384)||(6655900-6656123)
chr4 (84-385)||(45687182-45687496)
chr4 (87-361)||(5207865-5208140)
chr4 (187-385)||(27416965-27417160)
chr4 (170-376)||(40632400-40632604)
chr4 (91-376)||(51336938-51337223)
chr4 (160-381)||(41964358-41964580)
chr4 (160-384)||(35662384-35662608)
chr4 (9-166)||(52093882-52094039)
chr4 (202-366)||(26364223-26364386)
chr4 (172-384)||(8648095-8648306)
chr4 (160-384)||(12073336-12073560)
chr4 (236-385)||(12743925-12744073)
chr4 (236-385)||(12745314-12745462)
chr4 (170-384)||(50673848-50674059)
chr4 (160-376)||(379322-379540)
chr4 (160-385)||(12119481-12119708)
chr4 (160-385)||(21688192-21688417)
chr4 (160-385)||(50262700-50262922)
chr4 (92-385)||(8395489-8395772)
chr4 (176-346)||(3913408-3913578)
chr4 (236-344)||(12744087-12744195)
chr4 (215-385)||(8393394-8393563)
chr4 (199-385)||(46147391-46147575)
chr4 (160-376)||(26699450-26699670)
chr4 (121-321)||(48142440-48142642)
chr4 (170-305)||(55085444-55085578)
chr4 (92-381)||(5135948-5136230)
chr4 (154-376)||(29056295-29056518)
chr4 (92-381)||(5138174-5138455)
chr4 (19-185)||(36314928-36315096)
chr4 (19-185)||(36329137-36329305)
chr4 (18-185)||(8689193-8689362)
chr4 (19-185)||(5268898-5269066)
chr4 (92-385)||(7124785-7125071)
chr4 (170-304)||(41639218-41639351)
chr4 (92-385)||(7122566-7122852)
chr4 (462-525)||(13992150-13992213)
chr4 (175-358)||(33089837-33090021)
chr4 (185-328)||(53345187-53345330)
chr4 (18-185)||(3777780-3777949)
chr4 (92-184)||(3909983-3910075)
chr4 (53-185)||(10047612-10047745)
chr4 (18-185)||(16622990-16623159)
chr4 (18-185)||(16628569-16628738)
chr4 (188-376)||(22882760-22882946)
chr4 (188-376)||(22934424-22934610)
chr4 (272-360)||(33989900-33989989)
chr4 (22-185)||(5396372-5396537)
chr4 (19-184)||(25861731-25861898)
chr4 (465-525)||(52082522-52082582)
chr4 (19-105)||(54867490-54867578)
chr4 (462-525)||(5369941-5370004)
chr4 (462-525)||(48143294-48143357)
chr4 (150-343)||(6677402-6677597)
chr4 (462-525)||(5429925-5429988)
chr4 (462-525)||(56178495-56178558)
chr4 (236-321)||(5349930-5350016)
chr4 (18-185)||(6743112-6743281)
chr4 (81-158)||(46147581-46147658)
chr4 (78-185)||(5112468-5112576)
chr4 (43-185)||(5147909-5148052)
chr4 (18-105)||(35662010-35662098)
chr4 (462-525)||(9927318-9927381)
chr4 (462-525)||(34570273-34570336)
chr4 (462-525)||(37740871-37740934)
chr4 (462-525)||(48893502-48893564)
chr4 (462-525)||(52095221-52095284)
chr4 (462-525)||(54199767-54199830)
chr4 (82-185)||(23042988-23043093)
chr4 (220-324)||(34112821-34112926)
chr4 (42-105)||(5143571-5143635)
chr4 (152-194)||(31985466-31985508)
chr4 (231-305)||(34788854-34788928)
chr4 (175-217)||(35369607-35369649)
chr4 (187-322)||(44570427-44570567)
chr4 (84-172)||(21704040-21704128)
chr4 (49-185)||(39774033-39774171)
chr4 (462-525)||(47038275-47038337)
chr4 (150-214)||(5349840-5349905)
chr4 (231-324)||(16422666-16422760)
chr4 (462-500)||(31495190-31495227)
chr4 (81-147)||(36463639-36463705)
chr4 (229-289)||(42234318-42234377)
chr4 (72-105)||(18377664-18377697)
chr4 (277-360)||(21703860-21703943)
chr4 (275-358)||(37754986-37755070)
chr4 (89-194)||(37755112-37755220)
chr4 (50-105)||(42599305-42599361)
[»] scaffold1519 (2 HSPs)
scaffold1519 (82-385)||(783-1084)
scaffold1519 (462-524)||(1162-1224)
[»] scaffold0491 (4 HSPs)
scaffold0491 (55-385)||(11160-11491)
scaffold0491 (55-385)||(8734-9065)
scaffold0491 (462-525)||(8592-8655)
scaffold0491 (462-525)||(11018-11081)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (18-385)||(114388-114771)
scaffold0016 (462-525)||(114849-114912)
[»] scaffold0286 (3 HSPs)
scaffold0286 (160-385)||(11502-11726)
scaffold0286 (73-152)||(22201-22280)
scaffold0286 (467-525)||(11817-11875)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (18-385)||(20415-20782)
scaffold0066 (462-523)||(20276-20337)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (99-385)||(149097-149382)
scaffold0006 (19-184)||(2726-2892)
scaffold0006 (19-185)||(5916-6084)
scaffold0006 (18-185)||(132976-133145)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (170-384)||(7282-7494)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (170-384)||(18004-18216)
scaffold0176 (19-185)||(17482-17650)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (92-385)||(2603-2887)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (193-376)||(10468-10648)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (88-381)||(6154-6438)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (92-381)||(3729-4009)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (170-324)||(80343-80496)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (18-185)||(85914-86083)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (150-373)||(27453-27678)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (18-185)||(36529-36698)
scaffold0087 (49-185)||(43690-43827)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (150-205)||(19117-19173)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (231-334)||(25068-25172)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (78-185)||(8176-8283)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (152-185)||(45429-45462)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 97)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 17982446 - 17982822
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982446 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 17982545  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982546 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 17982645  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982646 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 17982745  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17982746 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 17982822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 31218050 - 31218426
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218050 gattgggaaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctttgtagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgggaa 31218149  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218150 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 31218249  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218250 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 31218349  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31218350 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 31218426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1746593 - 1746218
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1746593 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacaactatataagtgttctttgcagattttgaagaagagctggaagagagagaaacttgggaa 1746494  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746493 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtccttgattagagttctctttggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 1746394  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1746393 tgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gaa 1746295  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1746294 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 1746218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19945722 - 19945358
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagca 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19945722 cgtggcacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagacaaacttgggaaatcaaaggaagca 19945623  T
Q  122 actttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtga 221  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945622 actttagggtttagagtctttgattagagttctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtga 19945523  T
Q  222 gattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacc-cttttgtatctctttggaagaactcattgat 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945522 gattgggaaaaaagggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaactcattgat 19945423  T
Q  321 agtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19945422 agtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa 19945358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 44303647 - 44304024
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44303647 gattggggaaaatcgtgacacgatttcgacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgagaa 44303746  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44303747 atcaaaggaaacaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 44303846  T
Q  209 tgttcattggtgagattggg-aaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgga 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  44303847 tgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctcttttta 44303946  T
Q  308 agaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  44303947 agaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaa 44304024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34254703 - 34254330
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254703 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 34254604  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254603 atcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggtt-ggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 34254505  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34254504 tgttcattggtgagattggg--aaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 34254407  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34254406 gaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 34254330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34256879 - 34256506
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34256879 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagaaagataaacttgggaa 34256780  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34256779 atcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttatcttgggttgg-aaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtct 34256681  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34256680 tgttcattggtgagattgg--aaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 34256583  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34256582 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 34256506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Original strand, 42498000 - 42498363
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagca 121  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  42498000 cgtgacatgatttcgacgctgaagactgctatataactgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggta 42498099  T
Q  122 actttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtga 221  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42498100 actttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacgttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtga 42498199  T
Q  222 gattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgata 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42498200 gattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaactcattgata 42498299  T
Q  322 gtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42498300 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 42498363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 15212587 - 15212954
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15212587 aaaatgtgacacgattgtgacagctgaagactgctatataagtgttctttacagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaatg 15212686  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15212687 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcat 15212786  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15212787 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 15212885  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  15212886 ttgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12703014 - 12702634
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703014 gatttgggaaaaacgtgacacgattttgacagttgaagattgttatgtaagtgttctttgcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggga 12702915  T
Q  108 aatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 207  Q
    ||||||| || | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12702914 aatcaaaggaggtaaatttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattaagtgtc 12702815  T
Q  208 ttgttcattggtgagattgggaaaaaat----ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12702814 ttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctctt 12702715  T
Q  304 tggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12702714 tgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 43036224 - 43036591
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43036224 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttctttgcagattttgaatgagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 43036323  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036324 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 43036423  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  43036424 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactca 43036522  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  43036523 ttgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 33351951 - 33352318
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||      
T  33351951 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagttttctttgcaaattttgaaggtgaggtggaagagagagaaacttgggaaatcaaaga 33352050  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33352051 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcat 33352150  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33352151 tggtgagattggg-aaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 33352249  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  33352250 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 385
Target Start/End: Original strand, 27811080 - 27811446
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27811080 aaacgtgtcacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcatattttgaaggaaagctggaagagagagaaaattgggaaatcaaagga 27811179  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
     | || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27811180 ggtaaatttagggttgagggtctttgattagagttctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 27811279  T
Q  217 ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcat 316  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  27811280 ggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacccat 27811378  T
Q  317 tgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  27811379 tgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 30143143 - 30143508
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30143143 aaaacgtgacacgattttgacaactgaagactgctatataagtgttctttgtagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 30143242  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30143243 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatt--gtgtcttgttcat 30143340  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    |||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30143341 tggccagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 30143439  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  30143440 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaag-ttgaactgaactgagtcaacaa 30143508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Original strand, 4731459 - 4731814
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  4731459 aaaacgtgacacgattttgatagctgaagactactatataagtgttctttgtagattttgaaggagcggttgaagagagagaaacttgaaaaatcaaagg 4731558  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731559 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 4731658  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4731659 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 4731757  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  4731758 ttgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaa 4731814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 81 - 385
Target Start/End: Original strand, 5689136 - 5689439
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 180  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5689136 agagcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgagtttggaaacattgtaaacac 5689235  T
Q  181 cttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatt 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  5689236 cttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattaatgagattgg-aaaaatgggtagaaattaaggtggtgctttgtgagcttgtcaaagctaatt 5689334  T
Q  280 tcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagt 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||    
T  5689335 tcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggt 5689433  T
Q  380 gaacaa 385  Q
     |||||    
T  5689434 caacaa 5689439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 382
Target Start/End: Original strand, 2627599 - 2627902
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2627599 tttgaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacat 2627698  T
Q  172 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
     | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2627699 gggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaa 2627789  T
Q  272 agctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctt-tggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 369  Q
    | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2627790 atctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 2627889  T
Q  370 cgaactgagtgaa 382  Q
    ||||||| |||||    
T  2627890 cgaactgggtgaa 2627902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3303988 - 3303670
Alignment:
Q  66 ttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttggg 165  Q
    ||||| |||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3303988 ttcattttttgagggggaggttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttacggttgagggtctttgattagggttctcttgggttggg 3303889  T
Q  166 aaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaac 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  3303888 aaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtatcttgtttattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaagtttgttctttgtgagc 3303790  T
Q  265 ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||   | ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  3303789 ttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-t 3303691  T
Q  365 tggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  3303690 tggaccgaactgggtaaacaa 3303670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 6598836 - 6599140
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598836 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 6598935  T
Q  180 ccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||| || |||||   |||||||    
T  6598936 ccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattggg-aaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgtttaagctaat 6599034  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |    
T  6599035 ttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggg 6599133  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    | |||||    
T  6599134 tcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 6674289 - 6674593
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6674289 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 6674388  T
Q  180 ccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||| || |||||   |||||||    
T  6674389 ccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattggg-aaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgtttaagctaat 6674487  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |    
T  6674488 ttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggg 6674586  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    | |||||    
T  6674587 tcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1345655 - 1345391
Alignment:
Q  100 acttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatca 198  Q
    |||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1345655 acttggaaaatcaaaggatgtaactttagggttgagggtttttgattagagttctcttgagttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatca 1345556  T
Q  199 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtat 298  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || |   ||||||||||||||||||| | |||||    
T  1345555 ttgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgtg-tagaaattagggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtat 1345457  T
Q  299 ctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1345456 ctctttgaaagaactcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 1345391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1292768 - 1292473
Alignment:
Q  79 ggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaac 178  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  1292768 ggagagcttcaagagaggaaaacttggaaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacactgtgaac 1292669  T
Q  179 accttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaa 277  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||||   ||||||    
T  1292668 accttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttctttggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaa 1292570  T
Q  278 tttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1292569 tttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 1292473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 364
Target Start/End: Original strand, 18141685 - 18141968
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaaca 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| || || | || ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18141685 agagcttcaagagagagaaactaggaaaatcgaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttaggttgggaaacatttgtaaaca 18141784  T
Q  180 ccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  18141785 ccttgggcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaaaatg-ggtagaaattagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaat 18141882  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18141883 ttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagtt 18141968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19948696 - 19948533
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19948696 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacaactatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 19948597  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19948596 atcaaaggaagcaactttagggtttagagtctttgattagagttcttttgagttgggaaacatt 19948533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42435204 - 42434992
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42435204 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 42435107  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42435106 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 42435008  T
Q  369 ccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||||| |||||||    
T  42435007 ccgaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 4283468 - 4283691
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  4283468 gttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttttt 4283565  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  4283566 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagg 4283665  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4283666 tcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 150 - 385
Target Start/End: Original strand, 40321014 - 40321248
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  40321014 gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgagtgactgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagg 40321112  T
Q  249 gttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctc 348  Q
    ||||||| |||||| |||||   || |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  40321113 gttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctctttgtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccc 40321212  T
Q  349 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  40321213 cagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 4162390 - 4162652
Alignment:
Q  106 gaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagt 204  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4162390 gaaattaaaagaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagt 4162489  T
Q  205 gtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 304  Q
    |||||||||||| ||||||    | ||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4162490 gtcttgttcattagtgaga----ggaaaatgggtagaagttaggtttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 4162585  T
Q  305 ggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4162586 gtaagaactcattgatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagtaggtcaag-ttggaccgaa 4162652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Original strand, 18655355 - 18655567
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18655355 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgt 18655452  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18655453 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttgga 18655551  T
Q  369 ccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||||| |||||||    
T  18655552 ccgaactgggtgaaca 18655567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 334
Target Start/End: Original strand, 9765622 - 9765863
Alignment:
Q  91 gagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg--ggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tg 187  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || | ||||| |||||| || |||||| | |   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9765622 gagagagaaacttgggaatacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttgagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtg 9765721  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  9765722 agtgaaa----ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaa 9765816  T
Q  288 cccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagag 334  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9765817 cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18106363 - 18106090
Alignment:
Q  99 aacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatc 197  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18106363 aacttgggaaatcaaaggagagaactttaggatagagggtctttaattagatttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatt 18106264  T
Q  198 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgt 296  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||  ||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| | |||||    
T  18106263 gttgagtgtcttgttcatcggtgagattgg--aaaaatggatagaaactatagttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgt 18106166  T
Q  297 atctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18106165 atct-tttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaag-ttggaccgaactg 18106090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 25689838 - 25690123
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  25689838 agagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 25689936  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25689937 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 25690026  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25690027 c-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 25690123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41365151 - 41364925
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41365151 gagaacttcaagagaggaaaacttgtgaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaaca 41365052  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||   |||||||    
T  41365051 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattggg-aaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagtttgtttaagctaat 41364953  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttgg 306  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  41364952 ttcttgtaacacatttgtatccctttgg 41364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Original strand, 40221689 - 40221904
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  40221689 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttctttggtgagattggtaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 40221786  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  40221787 tgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 40221886  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  40221887 tcaag-ttggaccgaactg 40221904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41366877 - 41366624
Alignment:
Q  121 aactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 219  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  41366877 aactttagggttgaggatctttgattagagttctcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagact 41366778  T
Q  220 gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattga 319  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||| | ||||||||||| | |||||   |||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  41366777 gagattgagaaaatg-ggtagaaattatgtttgttctttgtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcattta 41366679  T
Q  320 tagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41366678 tagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttggaccgaactg 41366624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 158 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19491924 - 19491723
Alignment:
Q  158 gggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttct 256  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  19491924 gggttgggaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttct 19491827  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||||| |||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  19491826 ttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtag 19491727  T
Q  357 gtca 360  Q
    ||||    
T  19491726 gtca 19491723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 3439385 - 3439672
Alignment:
Q  90 agagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg 187  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||       
T  3439385 agagagagagacttgagaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa 3439483  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    || ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  3439484 agagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggca-agctaatttcttgta 3439573  T
Q  287 acccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3439574 acc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaa 3439672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 162 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8965914 - 8965700
Alignment:
Q  162 tgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttcttt 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  8965914 tgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcttt 8965817  T
Q  259 gtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 358  Q
     |||  ||||   || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| ||| | |||||    
T  8965816 atgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctctttgtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggt 8965717  T
Q  359 caagtttggaccgaactg 376  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8965716 caag-ttggaccgaactg 8965700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 346
Target Start/End: Original strand, 44353736 - 44353923
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  44353736 gttgggaaacaattgtaaacacattgggtgagtaaaaatcattgagtatcttgttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 44353834  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    
T  44353835 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 40328723 - 40328943
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  40328723 gttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctt 40328820  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40328821 tgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 40328920  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
         |||||||| ||||||||||||||    
T  40328921 -----gtttggacggaactgagtgaaca 40328943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 125 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4743462 - 4743214
Alignment:
Q  125 ttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 223  Q
    |||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743462 ttagggttgagggtctttgattaggaatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 4743363  T
Q  224 ttgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagt 323  Q
    || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||   ||||||  ||||||||||| |||||          |||||||||||||||||    
T  4743362 tt-ggaaaaatgggtag-aattaggtttgttctttgtgtgtttgttgaagctaaaatcttgtaacccatttgt----------aagaactcattgatagt 4743275  T
Q  324 ggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  4743274 ggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 293
Target Start/End: Original strand, 10929666 - 10929876
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 180  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10929666 agagcttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttg-gggtctttgattagagttctcttgggttgggaa-cattgtaaacac 10929763  T
Q  181 cttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatt 279  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  10929764 cttggattagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagatatgg-aaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatt 10929862  T
Q  280 tcttgtaacccttt 293  Q
    ||||||||| ||||    
T  10929863 tcttgtaactcttt 10929876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10930423 - 10930199
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||    
T  10930423 gttgggaaacaattgtaaacattttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatcggtgagattgggaaaa--tggatagaaattagggttgctct 10930327  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||||| || ||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  10930326 ttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctctttgtaagaacacattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattag 10930227  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  10930226 gtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 10930199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 156 - 377
Target Start/End: Original strand, 30291545 - 30291768
Alignment:
Q  156 ttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-g 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| || |    
T  30291545 ttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattaggttttg 30291643  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctct-cctccag 351  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  30291644 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccag 30291743  T
Q  352 agtaggtcaagtttggaccgaactga 377  Q
    | || | |||| ||||||||||||||    
T  30291744 attatgccaag-ttggaccgaactga 30291768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Original strand, 11383941 - 11384152
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  11383941 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatta-tgagattgg-aaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgt 11384037  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11384038 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaacccattgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttgga 11384136  T
Q  369 ccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||||| |||||||    
T  11384137 ccgaactgggtgaaca 11384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Original strand, 4733610 - 4733778
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt--catattttgaaggagagcttgaagag--agagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4733610 cgtgtcacgattttgacagttgaagactactatataagtgttctttttgcagattttgaaggagaggttgaagagagagagaaacttgggaaatcaaaag 4733709  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4733710 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4733778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 373
Target Start/End: Original strand, 8153629 - 8153914
Alignment:
Q  84 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacacct 182  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||| || | || |||| |||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8153629 gctttaagagagagaaatttaggaaatcaaaggaggtaattttaaggttgagagtctttgattaatgttcttttgggttgggaaacatttgtatacacct 8153728  T
Q  183 tgg-tgagtgaaaatcattga--gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaac-ttgtcatagctaat 278  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||      ||| ||| | ||||   ||||||     
T  8153729 tggatgagtgaaaatcattgagtgtgtcatgttcattggtgagatt--gagaaaatggtagaaattaggg------tttctgagctttgttgaagctaaa 8153820  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  8153821 ttcgtgtaactcttttgtatatctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttggaccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Original strand, 3772161 - 3772340
Alignment:
Q  184 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttctt 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||    
T  3772161 ggtgagtgaaaatgattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat-tgatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttctt 3772259  T
Q  284 gtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||| | ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  3772260 gtaactcatttgtatatctttgtaagaatttattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaagtt 3772340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 23799274 - 23799441
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||| |    
T  23799274 aaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcatattttgaaggatagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaagg 23799372  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 184  Q
    | | |||||||||||| || ||||||    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23799373 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggggaacattgtaaacaccttg 23799441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19945281 - 19945218
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945281 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 19945218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 42575494 - 42575327
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  42575494 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 42575399  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42575398 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 42575327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 376
Target Start/End: Original strand, 15290522 - 15290684
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  15290522 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 15290617  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290618 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 15290684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 376
Target Start/End: Original strand, 15470891 - 15471053
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  15470891 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 15470986  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470987 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 15471053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 185
Target Start/End: Original strand, 10015030 - 10015117
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10015030 aaacttgggaaatcaaaggacgtaactttatggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacgttgg 10015117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 31218503 - 31218566
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31218503 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttgctactt 31218566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7412740 - 7412571
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||     
T  7412740 aaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaag 7412642  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || ||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412641 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 7412571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 5702177 - 5702346
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||     
T  5702177 aaaacgtgtcacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaactt-ggattacaaag 5702275  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5702276 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgg 5702346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1746141 - 1746078
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1746141 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgttattggttactactt 1746078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 4696306 - 4696474
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |    
T  4696306 aaacgtgacacgattttgacagctgaagaccgttatataagggttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaagg 4696404  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |   |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4696405 agataactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4696474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 462 - 523
Target Start/End: Original strand, 17982899 - 17982960
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17982899 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgttattggttactac 17982960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4456419 - 4456259
Alignment:
Q  27 cacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaact 124  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || | ||||    
T  4456419 cacgattttgacagctgaagacggctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaaggaggtaact 4456321  T
Q  125 ttagggtttaggg--tctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||| || |  ||| || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456320 ttagggttgagtgtctctgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4456259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 458 - 525
Target Start/End: Original strand, 27811520 - 27811587
Alignment:
Q  458 ctaaattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  27811520 ctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 27811587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11712306 - 11712024
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacatt-gtaaac 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| || | |||||||||||| || ||||||  | |||| || |||||||||  ||| |||| ||||||    
T  11712306 agagcttcaagagagagaaacttagggtatcaaatgaggtaactttagggttgagtgtctttggtgagaggttttcttgggttccgaagcatttgtaaac 11712207  T
Q  179 accttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagct 275  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||||| ||||| |   || |||||||| || |||| ||| || |||||   ||||    
T  11712206 atcttggatgagtgaaa-tcattgagtcttttgttctttggaagagattgagaaaataa--tataaattaggttttgttccttgagagcttgttgaagct 11712110  T
Q  276 aatttcttgtaacccttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  || |||||||||    
T  11712109 aatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccctcaaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29796618 - 29796329
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacacctt-ggt 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||    || ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||     
T  29796618 aagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggatctttggcgagggttctcttgggttgggaaacatttgtaaatatcttgggc 29796519  T
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaaaatggtagaaat-tagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| |  |  ||||||||||||| |  ||||||||  ||| |||||||| | ||||||||   |||| ||||||||    
T  29796518 gagtg-aattcattgagtctcttgttcttgagaagagattgggaaaaga--gtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttg 29796422  T
Q  285 taacccttttgtatctctttg--gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||  ||||||| || ||||   || |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||   ||||||||||||    
T  29796421 taacatttttgtacctatttgtaaaaaaactcatttataatggattggagagatcaatctctcccccaatgtaggtcattgttggaccgaact 29796329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073894
Alignment:
Q  276 aatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 3073894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 376
Target Start/End: Original strand, 10015137 - 10015238
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 371  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10015137 agctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttggaccg 10015233  T
Q  372 aactg 376  Q
    |||||    
T  10015234 aactg 10015238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 30143586 - 30143649
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  30143586 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 30143649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34254253 - 34254190
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  34254253 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttactactt 34254190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 376
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733865
Alignment:
Q  294 tgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 4733865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 213
Target Start/End: Original strand, 38863743 - 38863868
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag-agttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt 186  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||   ||||||| |||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  38863743 aagagagagaaactttgaaaatcaaatgagctaactttaaggttgagtgtctttagtgaggagttctcttgggttgggaaacatttgtaaacatcttgga 38863842  T
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 213  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38863843 gagt-aaaatcattgagtctcttgttc 38863868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 7597670 - 7597759
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7597670 agctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtca 7597759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 4731904 - 4731967
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  4731904 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatatcggttactactt 4731967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 5990315 - 5990428
Alignment:
Q  72 ttttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagc-aactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca 170  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |  |||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  5990315 tttttaaggagagctagaagagagagaaacttgg-aaatacaaagacggtaactttagggttgagtgtctttagtgag-gttctcttgggttgggaaaca 5990412  T
Q  171 ttgtaaacaccttggt 186  Q
    |||||| || ||||||    
T  5990413 ttgtaatcatcttggt 5990428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 15213032 - 15213095
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  15213032 attagatcaaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttactactt 15213095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34256429 - 34256366
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||    
T  34256429 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttaatattggttactactt 34256366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3051488 - 3051351
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt-aatta 147  Q
    ||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||   |||||||||||| || ||||||  | |     
T  3051488 ctatataagtgtttctatgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggactataaaggagagaactttagggttgagtgtctttgtagtg 3051389  T
Q  148 gagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3051388 gggttctcttgagttgggaaacattgtaaacatcttgg 3051351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32902286 - 32902197
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  32902286 agctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaatttgagagatcaatctctccccctgagtaggtca 32902197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 346
Target Start/End: Original strand, 1822282 - 1822423
Alignment:
Q  205 gtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 303  Q
    |||||||||||| | |||||||   ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1822282 gtcttgttcatttgagagattgc--aaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatt 1822379  T
Q  304 tg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    ||  || |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1822380 tgtaaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcc 1822423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 346
Target Start/End: Original strand, 1856727 - 1856868
Alignment:
Q  205 gtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 303  Q
    |||||||||||| | |||||||   ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1856727 gtcttgttcatttgagagattgc--aaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatt 1856824  T
Q  304 tg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    ||  || |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1856825 tgtaaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcc 1856868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 525
Target Start/End: Original strand, 4733956 - 4734015
Alignment:
Q  466 gatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  4733956 gatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcattttgatattggttactactt 4734015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 33352396 - 33352459
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  33352396 attagatttaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttattactt 33352459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 304
Target Start/End: Original strand, 41266840 - 41267057
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacacctt-gg 185  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| || | |||||||||||| |  ||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||    
T  41266840 aagagagagaaacctaggatatcaaatgaggtaactttagggttgaatgtctttggtgagaggttctcttgggttgggagacagttgtaaatactttggg 41266939  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg-gttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |  ||| |  || ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||     |||||||||||    
T  41266940 tgagtg-aaatcattgagtctcttgttc-ttaggaagagtttgagaaaatggtagaaattaggttttgttcttagagaacttgttgagactaatttcttg 41267037  T
Q  285 taacccttttgtatctcttt 304  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  41267038 taactcttttgtatttcttt 41267057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 42498441 - 42498504
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  42498441 attagatctaggtgttgttattgttaattattgcttgtgttcactttgatattggttgctactt 42498504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 44304101 - 44304164
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||    
T  44304101 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgctcactttaatattggttactactt 44304164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1872236 - 1872175
Alignment:
Q  71 attttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtt 132  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  1872236 attttgagggagagcttcaagagagagaaacttgagaaatcaaagaaagtaactttagggtt 1872175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 19175448 - 19175620
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggaga---gcttgaagagagagaaacttgggaaatca 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||   ||    
T  19175448 aaaacgtgatacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttcttgtacagtttttgaaggagatcagcttgaagtgagagaaactt-ggattaca 19175546  T
Q  113 aaagaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || || | |||||||||||| || |||||  || | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19175547 aaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 19175620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 2627984 - 2628048
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttga-ttattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  2627984 attagatctaggtgttgttattgttgattttttgcttgcacccactttgttagtggttactactt 2628048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3232031 - 3231875
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaatta 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||| | ||  ||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3232031 gttctcttgagttgggaaacattagtaaacaccttgggtgggtgaat-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgagaaaaat--gtagaaatta 3231935  T
Q  247 gggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg 305  Q
    || || |||||| |||| |||||   ||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  3231934 ggctttgttcttcgtgagcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttg 3231875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 41366539 - 41366477
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  41366539 attagatctaggtgttgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttgatattggttactactt 41366477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 325
Target Start/End: Original strand, 10240175 - 10240264
Alignment:
Q  238 tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtgg 325  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||   | |||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10240175 tagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcattgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 30291457 - 30291534
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg 158  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || | |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  30291457 agagcttcaagaaagagaaactaggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattagggttctcttg 30291534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3318862 - 3318747
Alignment:
Q  72 ttttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaaca 170  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||  |  || ||||||||||||| |||||||    
T  3318862 ttttgaggcagagcttcaaaagagagaaagttgagaattcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttggtgggaggttctcttgggttaggaaaca 3318763  T
Q  171 -ttgtaaacaccttgg 185  Q
     ||| |||||||||||    
T  3318762 tttgaaaacaccttgg 3318747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 7493004 - 7493039
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7493004 gttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 7493039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18105997 - 18105935
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||||||    
T  18105997 attagatctaggtgatgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttaatattggttactactt 18105935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 148
Target Start/End: Original strand, 40320940 - 40320999
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  40320940 aagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttcgggttgagggtctttgattag 40320999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32902493 - 32902439
Alignment:
Q  78 aggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtt 132  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  32902493 aggagggcttcaagagagagaaacttgggaaatcagatgaggtaactttagggtt 32902439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7445026 - 7444986
Alignment:
Q  175 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7445026 aaacacgttggtgagtgaaaatctttgagtctcttgttcat 7444986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 95)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 45099548 - 45099923
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45099548 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctttgtagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaa 45099647  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099648 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 45099747  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  45099748 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gaa 45099846  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45099847 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 45099923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4503507 - 4503132
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4503507 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgtagaagacaactatataagtgttctttgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgggaa 4503408  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503407 atcaaaggaagcaactttagggtttaggttctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 4503308  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  4503307 tgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gaa 4503209  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4503208 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 4503132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36206040 - 36205664
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatata--agtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36206040 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttggg 36205941  T
Q  107 aaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgt 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205940 aaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgt 36205841  T
Q  207 cttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  36205840 cttgttcattggtgagattggga-aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-g 36205743  T
Q  307 aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36205742 aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 36205664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36988441 - 36988075
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36988441 aaaatgtgacacgattttgacgctgaagactgctatataagtgttctttgcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagga 36988342  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 217  Q
     | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988341 ggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 36988242  T
Q  218 gtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcatt 317  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36988241 gtgggatt-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatt 36988143  T
Q  318 gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36988142 gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 36988075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5723629 - 5723255
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723629 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataaatgttctttgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgggaa 5723530  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723529 atcaaaggaggcaactttagggtttggggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 5723430  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5723429 tgttcattggtgagatt--gagaaaagggtagaaattaggcttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaa 5723332  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5723331 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaa 5723255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2334792 - 2334417
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2334792 gatttgggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaa 2334693  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334692 atcaaaggaggtaactttagggttgagggtatttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 2334593  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  2334592 tgttcattggtgagattggg-aaaatgggtagaaataagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctctttgtaa 2334494  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2334493 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaa 2334417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6595372 - 6595005
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  6595372 aaaacgtgacacgattttgacgttgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttaggaaatcaaatga 6595273  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 217  Q
     | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6595272 ggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggctgggaaaaattgtaaacactttggagagtgagaatcattgggtgtcttgttcattg 6595173  T
Q  218 gtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcatt 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  6595172 gtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaagaactcgtt 6595073  T
Q  318 gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595072 gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 6595005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4484642 - 4484329
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4484642 tttgaaagagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacat 4484543  T
Q  172 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4484542 tgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaa 4484444  T
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctc-tttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4484443 agctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaca 4484344  T
Q  371 gaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| ||||||||    
T  4484343 gaactgggtgaacaa 4484329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Original strand, 38312045 - 38312408
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagc 120  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |     
T  38312045 cgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaatttgggaaatcaaaggaggt 38312144  T
Q  121 aactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 219  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38312145 aactttagggttgaggttctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 38312244  T
Q  220 gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattga 319  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38312245 gagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagatctcattga 38312343  T
Q  320 tagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  38312344 tagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 29867661 - 29868028
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgca-gaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggga 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||     
T  29867661 gatttgggaaaaacgtgacacgattttgacagatgaagactgctatataagtgttctttgcagtttttgaaagagagcttaaagagagagaaactttggg 29867760  T
Q  108 aatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgt 206  Q
    |||||||  | | |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29867761 aatcaaagaaggtaactattgggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgt 29867860  T
Q  207 cttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  29867861 cttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt 29867959  T
Q  307 aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  29867960 aagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactg 29868028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Original strand, 30833202 - 30833515
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30833202 tttgaaggtgagctggaagagaaagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtttttgattagagcttatcttgggttgggaaacat 30833301  T
Q  172 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30833302 tgtaaacactttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaa 30833400  T
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctc-tttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30833401 agttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggact 30833500  T
Q  371 gaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| ||||||||    
T  30833501 gaactgggtgaacaa 30833515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36318376 - 36318009
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  36318376 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagaggtaaaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 36318277  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36318276 aggtaactttagggttgaatgtctttgattagagttatcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 36318177  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36318176 tggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 36318078  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  36318077 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 36318009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17057732 - 17057369
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagc 120  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  || |     
T  17057732 cgtgacacatttttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagtttgaagagagagaaaatttggaaatcaacggaggt 17057633  T
Q  121 aactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 219  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17057632 aactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 17057533  T
Q  220 gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattga 319  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||   ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17057532 gagatt-ggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattga 17057434  T
Q  320 tagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  17057433 tagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17085715 - 17085352
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagc 120  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  || |     
T  17085715 cgtgacacatttttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagtttgaagagagagaaaatttggaaatcaacggaggt 17085616  T
Q  121 aactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 219  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17085615 aactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 17085516  T
Q  220 gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattga 319  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||   ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17085515 gagatt-ggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattga 17085417  T
Q  320 tagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  17085416 tagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Original strand, 32289411 - 32289733
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-tt 152  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  32289411 taagtgttcttgtgcagattttgaagg-gagatggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagctt 32289509  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  32289510 ctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgg---aaaagggtagaaattagggttg 32289599  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccag 351  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32289600 ttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtaaattagagagatcaatctctcctccag 32289699  T
Q  352 agtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32289700 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 32289733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 364
Target Start/End: Original strand, 42362216 - 42362500
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42362216 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 42362315  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  42362316 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 42362414  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362415 ttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 724030 - 723744
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaat 196  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  724030 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 723931  T
Q  197 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgt 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  723930 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgg-aaaactgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 723832  T
Q  297 atctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  723831 atccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 89 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33162745 - 33162460
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33162745 aagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtg 33162646  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  33162645 attgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgaaattaggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa 33162547  T
Q  288 cccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33162546 cccatttgtatctctctgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaact 33162460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 39284686 - 39284929
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39284686 aaaacgtgacatgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 39284785  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39284786 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcat 39284885  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgt 260  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  39284886 tggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattagggttgctctttgt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11151895 - 11151591
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11151895 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 11151796  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  11151795 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgaaattggg-aaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 11151697  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  11151696 ttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactggg 11151598  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    | |||||    
T  11151597 tcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34140066 - 34139770
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtg 187  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34140066 aagagaggaaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaagtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtg 34139967  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  34139966 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgag-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaa 34139868  T
Q  288 cccttttgtatctc-tttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||| | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  34139867 cccatatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 376
Target Start/End: Original strand, 11690365 - 11690660
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690365 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattatagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 11690464  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  11690465 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggg-aaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 11690563  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  11690564 ttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactg 11690660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14634112 - 14633825
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaat 196  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14634112 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggtttttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 14634013  T
Q  197 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgt 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  14634012 cattgagtgtcttgttcatttgtgagatt-ggtaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 14633914  T
Q  297 atctc-tttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14633913 atcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa 14633825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 385
Target Start/End: Original strand, 36773414 - 36773730
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg-------------ggttgggaa 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||             |||||||||    
T  36773414 agagcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaa 36773513  T
Q  168 acattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||| |||    
T  36773514 acattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggaataaattagggttgttctttgtgagctt 36773612  T
Q  267 gtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 366  Q
    ||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||    
T  36773613 gttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttg 36773711  T
Q  367 gaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||| || |||||    
T  36773712 gaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Original strand, 6266555 - 6266860
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaaca 170  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  6266555 tttgaaggagagtgggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaaca 6266653  T
Q  171 ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtc 269  Q
    | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6266654 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc 6266744  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266745 aaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 6266843  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||    
T  6266844 ccgaactgggtgaacaa 6266860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35447108 - 35446885
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35447108 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaat-tggtagaaattagggttgttctt 35447011  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35447010 tgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtagg 35446911  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35446910 tcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1631956 - 1631735
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1631956 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattaggattgttctt 1631859  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1631858 tgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtagg 1631759  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  1631758 tcaag-ttggaccgaactgagtgaa 1631735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 375
Target Start/End: Original strand, 11067248 - 11067463
Alignment:
Q  159 ggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||    
T  11067248 ggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgaaattgg-aaaaatgggtagaaattagtgttgtactt 11067346  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  11067347 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattagg 11067446  T
Q  358 tcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  11067447 tcaag-ttggaccgaact 11067463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 158 - 384
Target Start/End: Original strand, 45726871 - 45727096
Alignment:
Q  158 gggttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttc 255  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  45726871 gggttaggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttc 45726968  T
Q  256 tttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagta 355  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45726969 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 45727068  T
Q  356 ggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45727069 ggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14202711 - 14202450
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202711 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttatggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 14202612  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattga--gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagcta 276  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||   |||||    
T  14202611 ccttgggtgagtgaaaattattgagtgtgtctttttcatttctgagattggg-aaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtttaagcta 14202513  T
Q  277 atttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    |||||||||||| |      ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  14202512 atttcttgtaactc------atc-ctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcc 14202450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Original strand, 24397997 - 24398227
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt--gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaatt-agggttgttc 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || ||| ||||||    
T  24397997 gttgggaaacaattgtaaacacctttggaagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttc 24398096  T
Q  256 tttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagt 354  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  24398097 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagt 24398196  T
Q  355 aggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||   |||||||||||||  |||||||    
T  24398197 aggtcattgttggaccgaactggctgaacaa 24398227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 350
Target Start/End: Original strand, 13121703 - 13121901
Alignment:
Q  151 ttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  13121703 ttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactggg--aaaatggtagaaattagg 13121800  T
Q  249 g-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    | ||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  13121801 gtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc--tttgtatctctttgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcct 13121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17490376 - 17490157
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg 248  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||       
T  17490376 gttctcttgagttggaaaacattgcaaacacagtgggtgggtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgttgagattgg---aaaatggtagaaatt--- 17490283  T
Q  249 gttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctc 348  Q
     || |||||||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  17490282 -ttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttgtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccc 17490184  T
Q  349 cagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17490183 tagagtaggtcaa-tttggaccgaactg 17490157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 318
Target Start/End: Original strand, 24885583 - 24885763
Alignment:
Q  138 tctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg 236  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  ||    
T  24885583 tctttgattagagttctcatgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtaaaattgggaaaa--tg 24885680  T
Q  237 -gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattg 318  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||    
T  24885681 agtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctctgtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42288334 - 42288120
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  42288334 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtgcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaaggttgttctt 42288237  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  42288236 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttctttgtaagagctcattgataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattagg 42288138  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  42288137 tcaag-ttggaccgaactg 42288120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 150 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7815508 - 7815311
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  7815508 gttctattgggttgagaaacatttgtaaacaccttaggtgggtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaa--ggttgaaattag 7815411  T
Q  248 ggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    |||| |||||||   | |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||    
T  7815410 ggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctcc 7815311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12647669 - 12647385
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  12647669 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 12647572  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12647571 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 12647484  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12647483 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 12647385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 361
Target Start/End: Original strand, 11049484 - 11049699
Alignment:
Q  151 ttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg 248  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  11049484 ttctcttgtgttgggaaacatttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttttttggtgagattagg--aaaatggtataaattagg 11049581  T
Q  249 g-ttgttc---tttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctc 343  Q
    | ||||||   ||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||    
T  11049582 gtttgttctaatttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctc 11049681  T
Q  344 tcctccagagtaggtcaa 361  Q
    |||| || | ||||||||    
T  11049682 tccttcataataggtcaa 11049699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13656200 - 13656035
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 312  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||    
T  13656200 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaac 13656105  T
Q  313 tcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13656104 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 13656035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 376
Target Start/End: Original strand, 33648142 - 33648332
Alignment:
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||  |  ||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||| ||    
T  33648142 gagtgaaaataattgagtgtcttgtacatgagaggagatt--gagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctg 33648239  T
Q  285 taacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33648240 taacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactg 33648332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 374
Target Start/End: Original strand, 26353124 - 26353341
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacac-cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg 248  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||     || ||||||||||||  ||||||  |||||||||| |    
T  26353124 gttctcttgagttgggaa-cattgtaaacactctcggtgagtgaaaattattgagtgt-----tctttggtgagattg--aaaaaagtgtagaaattaag 26353215  T
Q  249 gtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    ||| |||||||||||  ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  26353216 gtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaagtactcattgatagtggattggagagatcactctctccc 26353315  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtttggaccgaac 374  Q
      ||||||||||||| |||||||||||    
T  26353316 ttagagtaggtcaag-ttggaccgaac 26353341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 385
Target Start/End: Original strand, 17450550 - 17450745
Alignment:
Q  175 aaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatag 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||   ||    
T  17450550 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-tgaaaaatgggtagagattaggcttgttctttgtgagcttgttgaag 17450648  T
Q  274 ctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    ||||||| ||||||||| |||||            |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17450649 ctaattt-ttgtaacccatttgt------------gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaa 17450733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12123879 - 12123644
Alignment:
Q  90 agagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg-tg 187  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||  | | ||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  12123879 agagggagaaacttgaaaaatcaaagtaggtaactttaaggttgatggtctttggttagagttctcttaggttgggaaacatttataaacaccttggatg 12123780  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||  ||||   |||| ||||||||||    
T  12123779 agtgaaaatcatcgagtgtcttgttcatttgagagattgg---aaaatgagtataaattagagttgttctttatgattttgttgaagcttatttcttgta 12123683  T
Q  287 acccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtg 324  Q
    || ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||    
T  12123682 actcttttgtatcattttgtaaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2837211 - 2837084
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2837211 aaaacgtaacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgtaaattttgaaggagagtttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 2837112  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaa 144  Q
    | | || |||| |||| ||| |||||||    
T  2837111 aggtaattttaaggttgaggatctttaa 2837084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4503055 - 4502992
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503055 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 4502992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34389251 - 34389082
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||   ||||     
T  34389251 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgatgtgagagaaactt-ggattacaaag 34389153  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | ||||||||||||  | |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34389152 gaggtaactttagggttgtgtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 34389082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4484250 - 4484187
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4484250 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttactactt 4484187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 33528322 - 33528490
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |    
T  33528322 aaacgtgacacgattttaacaactgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaagg 33528420  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33528421 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgg 33528490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 36205587 - 36205524
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36205587 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgttattggttactactt 36205524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 36757458 - 36757628
Alignment:
Q  17 aaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaat-caa 113  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||    
T  36757458 aaaatcgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaactt--gaattacaa 36757555  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | || | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757556 aggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 36757628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 364
Target Start/End: Original strand, 7451174 - 7451266
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7451174 agctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaagtt 7451266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 23078168 - 23078337
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||     
T  23078168 aaaacgtgacacaattttgacagttgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaag 23078266  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||| ||||| || |||||  | || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078267 gaggtaacttttgggttgagtgtctttgtgatgaga-atctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 23078337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17057291 - 17057228
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  17057291 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 17057228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17085274 - 17085211
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  17085274 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 17085211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21630344 - 21630176
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttc-atattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| |    
T  21630344 aaacgtgacacgattttgacagctaaagactgctatataagtgttcttgtgtagattttgaaggagagcttgaagggagagaaactt-ggattacaaagg 21630246  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||| ||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21630245 aggtaactttagtgttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 21630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 45100000 - 45100063
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  45100000 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 45100063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5700417 - 5700273
Alignment:
Q  91 gagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctc-ttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tg 187  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| || | |||||||||||| ||| || ||||| |  |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||    
T  5700417 gagagagaaattggggaaattaaaggaggtaactttagggttgaggatcattaatgatggttctcgttgggttgagaaacatttgtaaacactttgggtg 5700318  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 232  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5700317 aatgaaaaacattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaa 5700273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 10706949 - 10707118
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||   ||||     
T  10706949 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagctggaagagagagaaactt-agattacaaag 10707047  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | ||||||||||||||   ||||  || | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10707048 gaggtaactttagggtttattatctttgtagtgag-gatctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgg 10707118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 6594926 - 6594863
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  6594926 attagatctaggtgctgttattgttgattattacttgtgttcactttgatattggttactactt 6594863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  275 taatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 32289814 - 32289877
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  32289814 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttgttagtggttactactt 32289877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 38312486 - 38312549
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  38312486 attagatctaggtgctgttattgttgattgttgcttgtgttcactttgatattggttactactt 38312549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Original strand, 28258899 - 28259043
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttcttttc-atattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtct 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || | |||||||||||| || ||||    
T  28258899 gaagactgctatataagtgttcttgtgtagattttgaagaagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtct 28258997  T
Q  141 tta-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28258998 ttatagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 28259043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 14698707 - 14698875
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttc-atattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||   |||| |    
T  14698707 aaacgtgacacgattttgatagttgaagactgctatataagtgttcttgtgtagattttgaaggagagcttttagagagagaaactt-ggattacaaagg 14698805  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698806 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 14698875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33118534 - 33118366
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||   |||| |    
T  33118534 aaacatgacacgattttgacaactgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttttagagagagaaactt-ggattacaaagg 33118436  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33118435 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttggggaacattgtaaacaccttgg 33118366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 385
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285004
Alignment:
Q  310 aactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17865578 - 17865436
Alignment:
Q  43 aagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||   | |||| || | |||||||||||| || |||||    
T  17865578 aagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttgaagaagagcttgaagagacagaa-cttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctt 17865481  T
Q  142 ta-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865480 tgtagtgaagatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 17865436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40015280 - 40015156
Alignment:
Q  61 ttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttggg 160  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    |||| || | |||||||||||| || || ||  |||   |||||||||||    
T  40015280 ttctgttcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaatttaggtttacaaaggaggtaactttagggttgagtgttttgtattgaggttctcttggg 40015181  T
Q  161 ttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  40015180 ttgggaaacattgtaaacacattgg 40015156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5723178 - 5723115
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  5723178 attagatctaggtgttgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttactactt 5723115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 30833594 - 30833657
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||    
T  30833594 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcacataattaatggttactactt 30833657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 36987997 - 36987934
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||    
T  36987997 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgtttactttgaaattggttactactt 36987934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42019985 - 42019896
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg---gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 358  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  42019985 agctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctcttccccatagtaggt 42019896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Original strand, 8389843 - 8390015
Alignment:
Q  15 ggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatca 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||| | ||| ||||||||| | | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||   ||    
T  8389843 ggaaaaacatgacacgattttgatagctgaagactgttatttaagtgttcctgtgcagattttgaagtagagctggaagagagagaaactt-ggattaca 8389941  T
Q  113 aaagaagcaactttagggtttagggtcttt-aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || ||   |||||||||||| |||||||||  | |   | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8389942 aaggagataactttagggttgagggtctttgtagtgatgatctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttgg 8390015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20522621 - 20522453
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || || |||||| |||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||   |||| |    
T  20522621 aaacgtgacacgattttgacagctaaaaactgctataaaagtgttcttctgcagattttgaaggtgagcttggagagagagaaactt-agattacaaagg 20522523  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || ||||||     |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20522522 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagtatctcttgggttgggaagcattgtaaacaacttgg 20522453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34811378 - 34811281
Alignment:
Q  228 gaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtg 324  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| | || |||||   ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34811378 gaaaaaatggtagaaattaagattgctcttagagagcttgttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattgatagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13569733 - 13569560
Alignment:
Q  15 ggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttga-agagagagaaacttgggaaatc 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||   |    
T  13569733 ggaaaaatttgacacgattttgacagctgaagactactatataagtgttcttgtgcagattttaaaggagagcttgggagagagagaaactt-ggattac 13569635  T
Q  112 aaaagaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||| ||   |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13569634 aaatgagataactttagggttaagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattataaacaccttgg 13569560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30218241 - 30218068
Alignment:
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg-agattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgt 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||    ||||||| ||||| |||||||| | || ||| |   ||||||||||||||    
T  30218241 gagtggaaatcattgagtgtcttgttcatggaaggagattgagaaatg--ggtagaagttaggtttgttcttggagagcttattgaagctaatttcttgt 30218144  T
Q  286 aacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    |||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||| ||  | || |||||| |||| |||||||| ||||    
T  30218143 aaccattttgtatctctttgtaaataattcattgatagtgggttgaaaagatcaatcactcccccagagtaagtca 30218068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12633017 - 12632912
Alignment:
Q  84 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagt---tctcttgggttgggaaaca-ttgtaaaca 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||| || ||||||||| |||||   | | |||||||| |||||| |||||||||    
T  12633017 gcttcaagagagagaaacttgggaaaccaaaggagataactttagggttgagtgtctttaatgagagtttatttattgggttgagaaacatttgtaaaca 12632918  T
Q  180 ccttgg 185  Q
    ||||||    
T  12632917 ccttgg 12632912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 185
Target Start/End: Original strand, 41586322 - 41586417
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||| |||||| | || | |||||||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41586322 agagagaaacttggtaaatcagatgatgtaactttagggttgagtgtctttggtgagagcttctcttgggttggaaaacagttgtaaacaccttgg 41586417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42261639 - 42261545
Alignment:
Q  231 aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtg 324  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| | || |||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  42261639 aaaatcgtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtg 42261545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7597211 - 7597036
Alignment:
Q  184 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttc 281  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||| ||||  |   ||||||||||| || |||| || ||||||||||  | ||||||||    
T  7597211 ggtgagtgaaaatcactcagtgtcttgttcatgggaagagattgagaaatgaa--tagaaattaggttttgttccttatgaacttgtcgaaactaatttc 7597114  T
Q  282 ttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||   ||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  7597113 ttgtaagtcttttgtatctttttgtaaagaactcattgattgtagaacggagagatc--tctctccttcagagtaggtca 7597036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40739098 - 40739065
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40739098 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 40739065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 385
Target Start/End: Original strand, 24197955 - 24198065
Alignment:
Q  273 gctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccaga-gtaggtcaagtttggacc 370  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||  | ||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  24197955 gctaatttcttgtaaccc--ttgtatctctttgcaagaaactctttgataatggattggagagatc--tatcttctccagacgtaggtcacgtttgggcc 24198050  T
Q  371 gaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| || |||||    
T  24198051 gaactgggtaaacaa 24198065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Original strand, 41446151 - 41446227
Alignment:
Q  228 gaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 304  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| || |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  41446151 gaaaaaaaggtagaaattatgtttgttctttgagagcttgttgaagctaattttaagtaacccttttgtatctcttt 41446227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 10445298 - 10445333
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10445298 gttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 10445333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 11049402 - 11049468
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| | ||||||| |||||    
T  11049402 agagcttcaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaa-tttagggttgatggtctttgattag 11049468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 11067547 - 11067609
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  11067547 attagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttactactt 11067609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14202345 - 14202283
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  14202345 attagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgcgttcactttgatattgattactactt 14202283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14633749 - 14633687
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  14633749 attagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttactactt 14633687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 324
Target Start/End: Original strand, 41454248 - 41454343
Alignment:
Q  230 aaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtg 324  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| || |||||   ||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  41454248 aaaaatggtagaaattagatttgttttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgatagtg 41454343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 334
Target Start/End: Original strand, 3897003 - 3897109
Alignment:
Q  229 aaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggat 327  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||   ||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||||   |||| || ||||||||||| |||||||    
T  3897003 aaaaaatgatagaaattaagattgttcttgaagaactcgttgaagctaattttttgtaactcttttgtataattttgtaaagaactcattgaaagtggat 3897102  T
Q  328 tagagag 334  Q
    |||||||    
T  3897103 tagagag 3897109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 361
Target Start/End: Original strand, 42412117 - 42412162
Alignment:
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaa 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42412117 attgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3278336 - 3278231
Alignment:
Q  82 gagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaaca 179  Q
    |||||| ||| ||||||||  || ||||||||| || | |||||||||||| ||  || || || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3278336 gagcttcaagggagagaaatctgagaaatcaaatgaggtaactttagggttgagtatcgttgatgagagattctcttgggttggaaaacatttgtaaaca 3278237  T
Q  180 ccttgg 185  Q
    ||||||    
T  3278236 ccttgg 3278231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39483197 - 39483164
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39483197 tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgg 39483164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Original strand, 11067154 - 11067234
Alignment:
Q  78 aggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg 158  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||| |  |||||| ||||  |||||||||    
T  11067154 aggagggcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttatggttgattgtctttgattaaggttctcttg 11067234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 13342854 - 13343229
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13342854 gattggggaaaaacgtgacacgattttgaggcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 13342953  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13342954 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtctctgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 13343053  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  13343054 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctcttt-gaa 13343152  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13343153 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaa 13343229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 385
Target Start/End: Original strand, 30182386 - 30182757
Alignment:
Q  13 ggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182386 ggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctataaaagtgttctttgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgggaaatca 30182485  T
Q  113 aaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 212  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182486 aaggaagcaactttagggattagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 30182585  T
Q  213 cattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaac 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30182586 cattggtgagattggg-aaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttggaagaac 30182684  T
Q  313 tcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30182685 tcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaa 30182757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 25412555 - 25412929
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412555 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgacgcagaagacatctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 25412654  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412655 atcaaaggaggcaacattagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 25412754  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25412755 tgttcattggtgagattggg--aaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 25412852  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25412853 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa 25412929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36074419 - 36074042
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074419 gattgggaaaaaacgtgacatgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 36074320  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074319 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 36074220  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaa--aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  36074219 tgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-g 36074121  T
Q  307 aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36074120 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaa 36074042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 13239554 - 13239920
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  13239554 aaaacgtgacacaattttgacgctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaagtagagtttgaagagagagaaacttagaaaatcaaagga 13239653  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 217  Q
     | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239654 ggtaactttatggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 13239753  T
Q  218 gtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcatt 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13239754 gtgagatt-ggaaaaaatggtagaaattagggtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatt 13239852  T
Q  318 gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13239853 gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaa 13239920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30683286 - 30682931
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  30683286 aaaacgtgacacgattttgacgctgaaaactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcagagga 30683187  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 217  Q
     | || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30683186 ggtaattttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 30683087  T
Q  218 gtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaaga--actca 315  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  30683086 gtgagattggga-aaaagggtagaaattagg---gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaatactca 30682991  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30682990 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 30682931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 32636625 - 32636992
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32636625 aaaacgtgacatgattttgacagctgaaaactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttggagagagagaaacttgagaaatcaaagg 32636724  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32636725 aggtaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggtagtgaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcat 32636824  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  32636825 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactct 32636923  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  32636924 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 13488004 - 13488362
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13488004 aaaacgtgacacaattttgacagctgaagactgttatataagtgttttttgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 13488103  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13488104 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcat 13488203  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13488204 tggtaagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 13488302  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13488303 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactg 13488362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 385
Target Start/End: Original strand, 37438949 - 37439310
Alignment:
Q  17 aaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37438949 aaaaacgtgacacaattttgatgttgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggaaaatcaaatg 37439048  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
    | | |||||||||||| |||||||              |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37439049 aggtaactttagggttgagggtct--------------cttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatt 37439134  T
Q  217 ggtgagattgggaa---aaaat----ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaag 309  Q
    ||||||||||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37439135 ggtgagattgggaaggaaaaataaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaag 37439234  T
Q  310 aactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37439235 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 37439310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 42428797 - 42428430
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42428797 aaaacctgacacgattttgacaactgaagactgctatataaatgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 42428698  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    |   |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42428697 agataactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 42428598  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42428597 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattatggtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 42428499  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  42428498 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 533570 - 533937
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  533570 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttttttgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaatttgggaaatcaaagg 533669  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  533670 aggtaactttagggttgggggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcat 533769  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  533770 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttggtctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 533868  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  533869 ttgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42426602 - 42426255
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  42426602 aaaacgtgacacaattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaaaagagagaaacttgggaaatcaaagg 42426503  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42426502 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcat 42426403  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42426402 tggtgagattgag-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttgtaagaactca 42426304  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  42426303 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaagtt 42426255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28751023 - 28750667
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28751023 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagtctgctatataagtgttcttatgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaag 28750924  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 214  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750923 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 28750824  T
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 314  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  28750823 ttggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatctttttgtaagaactc 28750725  T
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28750724 attgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaa 28750667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 69 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 39468864 - 39468587
Alignment:
Q  69 atattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39468864 atattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttcattagagttctcttgggttgggaaa 39468765  T
Q  169 cattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39468764 cattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 39468666  T
Q  268 tcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39468665 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcc 39468587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Original strand, 16409321 - 16409644
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-tt 152  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  16409321 taagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagctt 16409419  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  16409420 ctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgg--aaaaagggtagaaattagggttg 16409510  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccag 351  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16409511 ttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccag 16409610  T
Q  352 agtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16409611 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16409644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 71 - 385
Target Start/End: Original strand, 26177746 - 26178051
Alignment:
Q  71 attttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaac 169  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26177746 attttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaac 26177844  T
Q  170 attgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 269  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26177845 atggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgg---aaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 26177934  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26177935 aaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 26178034  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||    
T  26178035 ccgaactgggtgaacaa 26178051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9789528 - 9789223
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9789528 tttgaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacat 9789429  T
Q  172 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  9789428 gggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgg--aaaaagggtagaaattaaggttgttccttgtgaacttgtcaa 9789338  T
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 370  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9789337 atctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 9789238  T
Q  371 gaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| ||||||||    
T  9789237 gaactgggtgaacaa 9789223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18441952 - 18441647
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18441952 tttgaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacat 18441853  T
Q  172 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18441852 gggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgg--aaaaagggtagaaattagggttgttccttgtgaacttgtcaa 18441762  T
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 370  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18441761 atctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggacc 18441662  T
Q  371 gaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| ||||||||    
T  18441661 gaactgggtgaacaa 18441647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 376
Target Start/End: Original strand, 16451937 - 16452239
Alignment:
Q  72 ttttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16451937 ttttgaggaagagcttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggatctttgattagagttctcttgggttcggaaacat 16452036  T
Q  172 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||       
T  16452037 tgtaaacaccttggtaagtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagatt-ggaaaaatgggtagaaattaagtttgttctttctgagcttgttga 16452135  T
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16452136 agctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccg 16452234  T
Q  372 aactg 376  Q
    |||||    
T  16452235 aactg 16452239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 92 - 376
Target Start/End: Original strand, 537901 - 538184
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagt 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  537901 agagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttggcttgggaaacatcgtaaacaccttgggtgagt 538000  T
Q  191 gaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  538001 gaaaatcattgcgtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaaggttgctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccc 538099  T
Q  291 ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  538100 atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactg 538184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Original strand, 26170620 - 26170931
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-tt 152  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| |||| || ||    
T  26170620 taagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattacagctt 26170718  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||    
T  26170719 ctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgg---aaaagggtagaaattaggattg 26170808  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccaga 352  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26170809 ttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgt----------aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 26170898  T
Q  353 gtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26170899 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 26170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Original strand, 33831562 - 33831848
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaat 196  Q
    ||||||||||||||||| ||   || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33831562 aaacttgggaaatcaaaggagttaattttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 33831661  T
Q  197 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgt 296  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  33831662 cattgagtgtcttattcatttgtgagattgg-aaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 33831760  T
Q  297 atctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||| || |||||    
T  33831761 atctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa 33831848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 213409 - 213633
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  213409 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 213506  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  213507 tgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtagg 213606  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  213607 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 376
Target Start/End: Original strand, 31182837 - 31183130
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31182837 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 31182936  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||   || ||||    
T  31182937 ccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgg--aaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagtttgtttaagttaat 31183034  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31183035 ttcttgtaa-ccatttgtatccctttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactg 31183130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8566251 - 8565956
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggttt-agggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaac 178  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8566251 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggcatgagggtctttgattagagttctcttgggttcggaaacattgtaaac 8566152  T
Q  179 accttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaa 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||||    
T  8566151 accttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatg-ggtagaacttaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaa 8566053  T
Q  278 tttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8566052 tttcttgtaacccatttgtatccctctgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaact 8565956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29751464 - 29751159
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaaca 170  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  29751464 tttgaaggagagttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaaca 29751366  T
Q  171 ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtc 269  Q
    | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29751365 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc 29751275  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751274 aaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 29751176  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||    
T  29751175 ccgaactgggtgaacaa 29751159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Original strand, 29720228 - 29720533
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaaca 170  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  29720228 tttgaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaaca 29720326  T
Q  171 ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtc 269  Q
    | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29720327 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtc 29720417  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
      | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29720418 taatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttgga 29720516  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||    
T  29720517 ccgaactgggtgaacaa 29720533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3075953 - 3075678
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacc-ttggtg 187  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3075953 aagagagtaaaactttggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctttgatg 3075854  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    | ||||||||||||||    
T  3075853 agtgaaaatcattgagtgtctcgttcatttgtgagattgagaaaata-ggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaa 3075755  T
Q  288 cccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  3075754 cccatttgtatctttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaagtt 3075678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Original strand, 29722388 - 29722693
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaaca 170  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  29722388 tttgaaggagagttggaaaagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaaca 29722486  T
Q  171 ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtc 269  Q
    | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29722487 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtc 29722577  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
      | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29722578 taatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttgga 29722676  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||    
T  29722677 ccgaactgggtgaacaa 29722693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Original strand, 28278260 - 28278484
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  28278260 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattatggttgttctt 28278357  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28278358 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 28278457  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28278458 tcaag-ttggaccgaactgggtgaacaa 28278484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 92 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42310227 - 42309953
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| | |||    
T  42310227 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtttatggtctttgattagggttctctttggttggaaaacattgtaaacattttgggtaagt 42310128  T
Q  191 gaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    ||||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||| |    
T  42310127 gaaaatcattgagtgtcttgctcattggtgagattgagaaattg-ggtagaaatcaagtttgatctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactc 42310029  T
Q  291 ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||    
T  42310028 ttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtagattaagtttg 42309953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 40147205 - 40147428
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  40147205 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtggaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 40147302  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
     |||| |||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40147303 cgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 40147402  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40147403 tcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5887720 - 5887487
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5887720 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtatttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 5887621  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaa 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||||||    
T  5887620 ccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagatt--gagaaaatggatagaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaa 5887523  T
Q  278 tttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaact 313  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  5887522 tttcttgcaacccatttgtatcactttgtaagaact 5887487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Original strand, 5058002 - 5058212
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  5058002 attgtaaacaccttggaagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttct--gtgagcttgt 5058097  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5058098 tgaagctattttcttgtatcccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttgga 5058196  T
Q  369 ccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||||| |||||||    
T  5058197 ccgaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22536574 - 22536289
Alignment:
Q  90 agagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | || | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||| ||  |    
T  22536574 agagagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccctgcag 22536476  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    || |||  |||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22536475 agagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttgta 22536388  T
Q  287 acccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22536387 acc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 22536289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 230
Target Start/End: Original strand, 42926738 - 42926908
Alignment:
Q  61 ttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttggg 160  Q
    |||| |||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||     
T  42926738 ttctgttcagattttggatgagagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttaggattgatggtctttgattagagttctcttgga 42926837  T
Q  161 ttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42926838 ttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagattgggaa 42926908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 19806207 - 19806531
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||                     
T  19806207 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaa----------------- 19806289  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
         |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19806290 -----acttgagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtgtcttgttcat 19806383  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||   |||||||||||| |||                   ||||||||     
T  19806384 tggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagg-ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttctaa-------------------aagaactcc 19806462  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13695904 - 13695713
Alignment:
Q  171 ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgt 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13695904 ttgtaaacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtatctttttctttggagagattgggaaaag--ggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgt 13695807  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaa 361  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||    
T  13695806 taaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Original strand, 38746949 - 38747153
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  38746949 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtatcttgttcattaatgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 38747046  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |||    
T  38747047 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaaaactcattgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcagg 38747146  T
Q  358 tcaagtt 364  Q
    |||||||    
T  38747147 tcaagtt 38747153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 10593138 - 10593427
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||     
T  10593138 gaagagagagagacttgggaaatcaaaggggg-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtaga-aaacatgggaaacaccttgt 10593235  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
      || || |||||||||||||||||       |||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  10593236 aaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggagaag--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttg 10593325  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10593326 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 10593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27637838 - 27637615
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  27637838 gttgggaaacaattgtgaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 27637740  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    | ||| |||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27637739 tatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtag 27637641  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||   ||||||||||||| |||||    
T  27637640 gtcattgttggaccgaactgggtgaa 27637615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16641153 - 16640961
Alignment:
Q  171 ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaa-tggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttg 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16641153 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaattcattaagtgtcttgttcattggcgagattgagaaaaaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttg 16641054  T
Q  268 tcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 363  Q
    |   |||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16641053 ttgaagctgatttctgataactcttttgtatctctttgtaagaact---tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 25078004 - 25078290
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  25078004 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 25078101  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25078102 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 25078191  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25078192 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 25078290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 25135973 - 25136259
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  25135973 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 25136070  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25136071 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 25136160  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25136161 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 25136259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9049576 - 9049354
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  9049576 gttctcttgatttgggaaacatttgtaaacactttgggtgagtaaaaatcactgagtgtcttgttgattagtgagtttgggaaaa--tgatagaaattag 9049479  T
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
     |||  | ||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  9049478 tgtttgtttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctccc 9049379  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  9049378 ccaaagtaggtgaag-ttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 27015476 - 27015690
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27015476 gttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gagtgt-ttggtcattggtgagattgggaaaata-ggtagaaattagggttgttctt 27015572  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    |||||||||||   |||||||        |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||    
T  27015573 tgtgaacttgttgaagctaat--------acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaatagg 27015664  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27015665 tcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 27015690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 40380090 - 40380260
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaa 311  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| |||| |  |||||    
T  40380090 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaa 40380185  T
Q  312 ctcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40380186 ctcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 40380260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 40382301 - 40382471
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaa 311  Q
    |||||||||||||||||    ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |  |||||    
T  40382301 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaa 40382396  T
Q  312 ctcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40382397 ctcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 40382471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Original strand, 16546515 - 16546796
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  16546515 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 16546612  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| |||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16546613 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattaggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaa 16546700  T
Q  288 cccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    || | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16546701 cc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 16546796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 345
Target Start/End: Original strand, 3325778 - 3326043
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaaca 179  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||  || ||||||  | || ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  3325778 agagctttaagagagagaaaattgggaaatcaaaaagagtaattttagggtcgagtgtctttggtgagtgttctcttgagttgagaaacatttgtaaaca 3325877  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaa 277  Q
    |||||| |||||||||  ||||| || |||||||| | ||  || ||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||   || |||||   ||||||    
T  3325878 ccttgggtgagtgaaac-cattgggtatcttgttcttaggaagaaattg--aaaaaaaggtagaaattagttttgttcttgaagagcttgttgaagctaa 3325974  T
Q  278 tttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctc 345  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  3325975 tttcttgtaaccattgtgtatctctttgtaaagaactcaatgatggtggattagagagatcaatatctc 3326043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Original strand, 16544293 - 16544574
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  16544293 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 16544390  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  16544391 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttctcataa 16544478  T
Q  288 cccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    || | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16544479 cc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 16544574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 13343306 - 13343369
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13343306 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 13343369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 36073965 - 36073902
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36073965 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttattactt 36073902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Original strand, 316777 - 316922
Alignment:
Q  231 aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggatta 329  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||      
T  316777 aaaaaggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggatcg 316876  T
Q  330 gagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||| | ||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||    
T  316877 gagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaact 316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14520630 - 14520461
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||     
T  14520630 aaaacgtgacacgattttgacagctggagactcctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-agattacaaag 14520532  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520531 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 14520461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 30182834 - 30182897
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182834 attagatctaggtgttgttattgttgattattgtttgcattcactttgttattggttactactt 30182897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 11916669 - 11916838
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||     
T  11916669 aaaacgtgacacgattttgacagttgaaaactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaag 11916767  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| ||  ||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11916768 gaggtaactttagggttgagtttctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 11916838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Original strand, 11181555 - 11181707
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||| || | ||||||| |||| || |||||    
T  11181555 gaagactgttatataagtgttctttgcagtttttgaagtagagcttgaagagagagaaacttggttta-caaaggaggtaactttatggttgagtgtctt 11181653  T
Q  142 --taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaa 194  Q
      || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11181654 tgtagtgag-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgaaa 11181707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 16409725 - 16409788
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  16409725 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttgttagtggttactactt 16409788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 30682845 - 30682782
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  30682845 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 30682782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39468471 - 39468408
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  39468471 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttactactt 39468408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 12083874 - 12084043
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||   ||||     
T  12083874 aaaacgtgacacaattttgacagttgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagctagaagtgagagaaactt-ggattacaaag 12083972  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtcttta-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || ||||||| | |   | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12083973 gaggtaactttagggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttggtaaacattttaaacaccttgg 12084043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33906143 - 33906029
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 370  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||||||| | | ||||||||||||  |||||||    
T  33906143 agctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttggacc 33906044  T
Q  371 gaactgagtgaacaa 385  Q
    || ||| || |||||    
T  33906043 gagctgggtaaacaa 33906029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18441563 - 18441501
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  18441563 attagatctaggtgctgtt-ttgttgattattgcttgcacacactttgttggtggttactactt 18441501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 26178132 - 26178195
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  26178132 attagatctaggtgttgttatcattgattattgcttgcacacactttgttagtggttactactt 26178195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 334
Target Start/End: Original strand, 22097878 - 22097981
Alignment:
Q  230 aaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggatt 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||   || ||||||||| ||||||  |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  22097878 aaaaagggtagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataaccc--ttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtggatt 22097975  T
Q  329 agagag 334  Q
    ||||||    
T  22097976 agagag 22097981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16649990 - 16649857
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| |||| || |||||||| || || || |||||||  |||||||||||||||||     
T  16649990 aaaatgtgacatgattttgacagctaaagactactatataagtgtttctttgcagattttgaatgataggttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaag 16649891  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctttaattaga 149  Q
    || | |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  16649890 gaggtaactttagggttgatggtctttgattaga 16649857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Original strand, 35616129 - 35616278
Alignment:
Q  175 aaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcata 272  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||  ||||||| ||||  |  |||||||||||| |||||||| | || || ||   |    
T  35616129 aaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcacgggaagagattgagaaatga--gtagaaattaggtttgttcttggagagctcgtttaa 35616225  T
Q  273 gctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtg 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  35616226 gttaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15464896 - 15464765
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaa-gcaactttagggtttagggtctt--taattagag 150  Q
    ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||| | |||||||||||| || |||||  || | || |    
T  15464896 taagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgaagagagagaaacttgg--attacaaagaaggaaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-g 15464800  T
Q  151 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15464799 atctcttgggttgggaaacatcgtaaacaccttgg 15464765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Original strand, 535685 - 535760
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagag 93  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  535685 aaacgtgtcacgattttgacagctgaagactgatatataattgttctttgcagattttgaaggagaggttgaagag 535760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Original strand, 8445771 - 8445846
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-ggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  8445771 agctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagattagaaagatgaatctctcc 8445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9789143 - 9789081
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  9789143 attagatctaggtgctgtt-ttgttgatttttgcttgcacacactttgttggtggttactactt 9789081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Original strand, 17003689 - 17003825
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt--taatt 146  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||   |||| ||   |||||||||||| |  |||||  || |     
T  17003689 ctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagagctttgagagagagaaactt-ggattacaaaggagataactttagggttgaatgtctttgtagtg 17003787  T
Q  147 agagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17003788 ag-gttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgg 17003825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 24553358 - 24553393
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24553358 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 24553393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28832523 - 28832488
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28832523 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 28832488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Original strand, 36932102 - 36932214
Alignment:
Q  72 ttttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaaca 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |   |||| || | |||||||||||| || |||||||    || | |||||||||||||||||||    
T  36932102 ttttggaggagagct-gaagagagagaaacttgg-attgcaaaggagggaactttagggttgagtgtctttatagtgatgatctcttgggttgggaaaca 36932199  T
Q  171 ttgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||||    
T  36932200 ttgtaaacaccttgg 36932214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 360
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160743
Alignment:
Q  319 atagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 4160743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Original strand, 9353165 - 9353198
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9353165 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9353198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 42926923 - 42926968
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcatt 317  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  42926923 agctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 498
Target Start/End: Original strand, 25413006 - 25413042
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25413006 attagatataggtgctgttattgttgattattgcttg 25413042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Original strand, 42926967 - 42927050
Alignment:
Q  292 tttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||  | ||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||    
T  42926967 tttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactg 42927050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 333
Target Start/End: Original strand, 6016968 - 6017125
Alignment:
Q  175 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatag 273  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||| |||||   ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||   ||    
T  6016968 aaacaccttgaagagtgaaaattcttgagtctcttgttcattagatgaaattgg---aaattggtagaaatta-ggttcttctttgagaacctgttgaag 6017063  T
Q  274 -ctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtggattagaga 333  Q
     |||||||||||||||| |||| ||| |||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  6017064 actaatttcttgtaacctttttttatttcttcgtaagaaactcattgatagtagatcagaga 6017125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10054928 - 10054854
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||    
T  10054928 agctaatttcttataacc-ttttgtatctctttgtaatgaactcattgatagtgtattggagatatcaatatctcc 10054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 26171012 - 26171075
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  26171012 attagatctaggtgttgttatcatcgattattgcttgcacacactttgttagtgcttactactt 26171075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 31300426 - 31300461
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31300426 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgg 31300461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 33831925 - 33831987
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  33831925 attagatttaggtgctgctattgttg-ttattgcttgtgttcactttgattttggttactactt 33831987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 42426157 - 42426095
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  42426157 attagatctaggtgttgttattattgatg-ttgcttgtgttcactttgatattggttactactt 42426095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 42428352 - 42428290
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  42428352 attagatctaggtgttgttattatt-attgttgcttgtgttcactttgatattggttactactt 42428290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19589009 - 19588976
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19589009 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 19588976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10700802 - 10700674
Alignment:
Q  230 aaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-ggaagaactcattgatagtggatt 328  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||   |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |    
T  10700802 aaaaaaggtagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaagctaa-ttcttataacatttttgtatctctttaaaaagaactcattgatagtgaagt 10700704  T
Q  329 agagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
     ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||    
T  10700703 ggagagatc--tctctcccccatagtaggtca 10700674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 321
Target Start/End: Original strand, 30802854 - 30802934
Alignment:
Q  242 aattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgata 321  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||   | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  30802854 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 30802934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 136)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5258519 - 5258143
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5258519 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatatacgtgttctttgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgagaa 5258420  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258419 atcaaagggagaaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 5258320  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258319 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 5258220  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5258219 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa 5258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5260698 - 5260322
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5260698 gattggggaaaaacatgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaa 5260599  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5260598 atcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 5260499  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5260498 tggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 5260399  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5260398 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa 5260322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 45094957 - 45095332
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttga-cgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45094957 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgaacgctgaagattgctatataagtgttctttgcagattttgaagatgagcttgaagagagagaaacttggga 45095056  T
Q  108 aatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095057 aatcaaaagaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 45095156  T
Q  208 ttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgga 307  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45095157 ttgttcattggtgagattggg--aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgta 45095254  T
Q  308 agaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45095255 agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 45095332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9636503 - 9636125
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaag-gagagcttgaagagagagaaacttggga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  9636503 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaaggcagctatataagtgttctttgcagattttgaagagtgagttggaagagagagaaacttggga 9636404  T
Q  108 aatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgt 206  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9636403 aatcaaaggaagaaactttagggtttagggtctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgt 9636304  T
Q  207 cttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg 306  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9636303 cttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttttgt 9636204  T
Q  307 aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9636203 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa 9636125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 7762057 - 7762434
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagaga--aacttggg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  7762057 gattggggaaaaacgtgacacgatttagacgctgaagactgctatataagtgttctttgcaaattttgaaggaaagcttgaagagagagagaaacttggg 7762156  T
Q  107 aaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgt 206  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762157 aaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgt 7762256  T
Q  207 cttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg 306  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7762257 cttattcattggtgagattgagaaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgt 7762355  T
Q  307 aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7762356 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 7762434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 37408284 - 37408627
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttcttttcat-attttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtct 140  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  37408284 gaagactggtatataagtgttcttgtgaagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggtct 37408383  T
Q  141 ttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtag 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37408384 ttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattggg-aaaaagggtag 37408482  T
Q  241 aaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  37408483 aaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaat 37408582  T
Q  341 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37408583 ctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaa 37408627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 71 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23200449 - 23200137
Alignment:
Q  71 attttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt-ctcttgggttgggaaac 169  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23200449 attttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaac 23200351  T
Q  170 attgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23200350 attgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaa-tggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtc 23200253  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 369  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200252 aaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 23200153  T
Q  370 cgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23200152 cgaactgggtgaacaa 23200137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23198267 - 23197938
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt- 152  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  23198267 taagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttggaaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagttt 23198169  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23198168 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaa-tggtagaaattagagttg 23198071  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccaga 352  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23198070 ttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccaga 23197971  T
Q  353 gtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23197970 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 23197938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 7764245 - 7764633
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagc----------------ttgaaga 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||                |||||||    
T  7764245 gattggggaaaaacgtgacacgatttagatgctgaagactgctatataagtgttctttgcaaattttgaaggagagcattgtaaacattagagttgaaga 7764344  T
Q  93 gagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtga 192  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7764345 gagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggtctttgattagatttctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggtgagtga 7764444  T
Q  193 aaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccctt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  7764445 aaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaag--ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactctt 7764540  T
Q  293 ttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  7764541 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaa 7764633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 385
Target Start/End: Original strand, 40734300 - 40734666
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  40734300 aaacgtgacacaattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagacagaaacttggaaaatcaaagga 40734399  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
       |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734400 gataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 40734499  T
Q  217 ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcat 316  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  40734500 ggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccctttgtaagaactcat 40734598  T
Q  317 tgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  40734599 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19684193 - 19683888
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19684193 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 19684094  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19684093 ccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaat 19683995  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19683994 ttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactggg 19683895  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    |||||||    
T  19683894 tgaacaa 19683888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Original strand, 29810669 - 29811016
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  29810669 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcatattttgaagaaaaggttgaagaaagaaaaacttgggaaatcaaagg 29810768  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29810769 aggtaattttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttattcat 29810868  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29810869 tggtgagattaggaaaatat-gtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 29810967  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29810968 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 385
Target Start/End: Original strand, 29812861 - 29813231
Alignment:
Q  15 ggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29812861 ggaaaaacgtgacacgattttgaccgctgaagactgctatataagtgttctttgtagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 29812960  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 212  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29812961 aggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaagcattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgaggggcttgtt 29813060  T
Q  213 cattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaac 312  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  29813061 aattggtgagatt-ggaaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaac 29813159  T
Q  313 tcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||| || |||||    
T  29813160 tcatttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaa 29813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Original strand, 51398615 - 51398972
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51398615 aaaatgtgacacgattttgacagctgaagattgctatataagtgttctttgtagattttgaaggagaggttgaagagatagaaacttgggaaatcaaagg 51398714  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51398715 aggtaactttagggttgagagtctttgattagagttttcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 51398814  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  51398815 tgatgagatt-ggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactca 51398913  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51398914 ttgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 51398972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5236791 - 5236457
Alignment:
Q  50 ctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag 148  Q
    |||| ||||||||||| | || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5236791 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaagtggggcttgaagagagagaaacttgggaaatcgaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 5236692  T
Q  149 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  5236691 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggg-aaaatgggtagaaattag 5236593  T
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||     
T  5236592 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattcgagagatcaatctttcc- 5236494  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  5236493 ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaa 5236457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 9581147 - 9581451
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581147 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 9581246  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  9581247 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgggattcggaaatg--ggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 9581344  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9581345 ttcttttaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 9581444  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    |||||||    
T  9581445 tgaacaa 9581451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 376
Target Start/End: Original strand, 40735254 - 40735542
Alignment:
Q  87 tgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  40735254 tgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttgga 40735353  T
Q  187 ga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgt 285  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||    
T  40735354 aaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgt 40735452  T
Q  286 aacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40735453 aaccagtttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 40735542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Original strand, 44331360 - 44331713
Alignment:
Q  20 aacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  44331360 aacgtgacatgattttgacagctgaagactgctatataaatgttctttgtagattt-gaaggagagcttga-gagagagaaacttgggaaatcaaaggag 44331457  T
Q  119 gcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 217  Q
    | |||||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44331458 gtaactttagggttga----------ttagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 44331547  T
Q  218 gtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcatt 317  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||    
T  44331548 gtgagattaggaaaatg-ggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctctttgtaagaacttatt 44331646  T
Q  318 gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  44331647 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 80 - 364
Target Start/End: Original strand, 760711 - 760995
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  760711 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattataaaca 760810  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||| |||||   |||||||    
T  760811 ccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtctgttctttgtgagcttgtttaagctaat 760909  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  760910 ttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 80 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22835306 - 22835011
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22835306 gagaacttcaagagaggaaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgtgttgggaaacattgtaatca 22835207  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  22835206 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 22835108  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  22835107 ttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactg 22835011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 80 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 53921807 - 53921512
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  53921807 gagagcttgaagagagaaaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagagtctttgattagggttttcttgggttggaaaacattgtaaaaa 53921708  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  53921707 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattaggtttgttgtttgtgagcttgttaaagctaat 53921609  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  53921608 ttcttgtaactcatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactg 53921512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 385
Target Start/End: Original strand, 800973 - 801261
Alignment:
Q  91 gagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
T  800973 gagagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagag 801072  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacc 289  Q
     ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  801073 agaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact 801163  T
Q  290 ctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  801164 ctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 801261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 89 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 39153656 - 39153361
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtg 187  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39153656 aagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtg 39153557  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  39153556 aatgaaaatcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattggg-aaaatgggtagaaattaggtttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaa 39153458  T
Q  288 cccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||    
T  39153457 ctcatttgtatccctttataagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Original strand, 29682241 - 29682527
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaat 196  Q
    ||||||||||||||||| ||   || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682241 aaacttgggaaatcaaaggagttaaatttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 29682340  T
Q  197 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgt 296  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||| |||||    
T  29682341 cattgagtgtcttgtttatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgt 29682439  T
Q  297 atctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  29682440 atccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 29682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29196705 - 29196386
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt-------------ctcttgggttggga 166  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||             ||||||||||||||    
T  29196705 gagagctacaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttttcttgagaggttctcttgggttggga 29196606  T
Q  167 aacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaa 263  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||     
T  29196605 aacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggtttgttctttgtgag 29196507  T
Q  264 cttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  29196506 cttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag- 29196408  T
Q  364 ttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  29196407 ttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 385
Target Start/End: Original strand, 16498913 - 16499197
Alignment:
Q  99 aacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg-agtgaaaatc 197  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16498913 aacttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 16499012  T
Q  198 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgta 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||| | |||||   |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  16499013 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacg-gatagaaattagggttgtt-tttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttata 16499110  T
Q  298 tctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  16499111 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44700795 - 44700489
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt-------------ctcttgggttgggaa 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||| ||||| |||             |||||||||||||||    
T  44700795 agagcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattagggttatcttgaggggttctcttgggttgggaa 44700696  T
Q  168 acatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaact 265  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44700695 acatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagtt 44700597  T
Q  266 tgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagttt 365  Q
    |||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||    
T  44700596 tgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaag-tt 44700499  T
Q  366 ggaccgaact 375  Q
    ||||||||||    
T  44700498 ggaccgaact 44700489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 385
Target Start/End: Original strand, 31314379 - 31314613
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  31314379 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattagg 31314477  T
Q  249 gttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctc 348  Q
    ||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  31314478 gttgttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatatctcccc 31314577  T
Q  349 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31314578 catattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa 31314613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32744730 - 32744436
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32744730 gagagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 32744631  T
Q  180 ccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaat-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |        || ||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  32744630 cattggtgagtgaaaatcattgagtat--------tttgtgagatt--gaaaaaatgggtagaaatta-gtttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 32744542  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  32744541 ttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactggg 32744443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 376
Target Start/End: Original strand, 32890968 - 32891263
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 180  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||| || ||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32890968 agagcttcaagagaggaaaatttggaaagtcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttggggtgggaaacattgtaaacac 32891067  T
Q  181 cttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||||||||| | || ||||||||||| |||||   |||||||    
T  32891068 cttgggtgagtaaaaatcattgagtgtcttgttcttcggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaat 32891166  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  32891167 ttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactg 32891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6095823 - 6095600
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  6095823 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttattcattggtgagattgggaaaa--tgagtagaaattagggttgttct 6095727  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||| ||||| |   || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6095726 ttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 6095627  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6095626 gtcaag-ttggaccgaactgtgtgaaca 6095600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 376
Target Start/End: Original strand, 4569906 - 4570112
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  4569906 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttctttggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttcattgtgagcttat 4570004  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4570005 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttgga 4570104  T
Q  369 ccgaactg 376  Q
    ||||||||    
T  4570105 ccgaactg 4570112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9666771 - 9666466
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaaca 179  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  9666771 agagcttcaagagagagacactagggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttcagttgggaaacatttgtaaaca 9666672  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag-ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaa 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   ||||||||||||| |||||   ||||||    
T  9666671 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaa 9666573  T
Q  278 tttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactga 377  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||     
T  9666572 tttcttgtaactcatttatacctctttgtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgg 9666474  T
Q  378 gtgaacaa 385  Q
    || |||||    
T  9666473 gtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 54593648 - 54593871
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  54593648 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgtgc-agaaattagggttgttctt 54593745  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  54593746 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatg 54593845  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  54593846 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 54593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Original strand, 34491157 - 34491380
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  34491157 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaattc--tgagtgtgttattcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 34491253  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34491254 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 34491353  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34491354 tcaag-ttggaccgaactgggtgaacaa 34491380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 43402026 - 43401800
Alignment:
Q  160 gttgggaaac-attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  43402026 gttgggaaacgattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 43401929  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  43401928 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtag 43401829  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  43401828 gtcatggttggaccgaactgggtgaacaa 43401800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 54635004 - 54635293
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  54635004 gaagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 54635102  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
      || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  54635103 aaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttg 54635192  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaac 383  Q
    ||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54635193 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaac 54635291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 6716379 - 6716668
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  6716379 gaagagagagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 6716477  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
      || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6716478 aaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttg 6716567  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaac 383  Q
    ||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6716568 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaac 6716666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 49199694 - 49199468
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  49199694 gttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcgttggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaaggttgttctt 49199597  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||    
T  49199596 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagactag 49199497  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  49199496 gtcatggttggaccgaactgggtgaacaa 49199468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23392221 - 23391909
Alignment:
Q  72 ttttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttgggttgggaaac 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||   || ||||||||| || ||||||  | | || ||||||||||||||||||||    
T  23392221 ttttgaaggagagct-gaagagagagaaacttgggactgcaaaggagagaaatttagggttgagtgtctttgtagtgag-gttctcttgggttgggaaac 23392124  T
Q  170 attgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 267  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  23392123 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtctttttcattggtgagtttgggaaaa--tgagtagaaattaagtttgttctttgtgagcttg 23392026  T
Q  268 tcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 367  Q
    |   || |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  23392025 tttaagataatttcttgtaacccatttgtatcactttgcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttgg 23391927  T
Q  368 accgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||| || |||||    
T  23391926 accgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 375
Target Start/End: Original strand, 30236069 - 30236283
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  30236069 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgatgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 30236166  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  30236167 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 30236266  T
Q  358 tcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  30236267 tcaag-ttggaccgaact 30236283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5434102 - 5433955
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5434102 gttgggaaacaattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctt 5434003  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5434002 tgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttg 5433955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 45282864 - 45283155
Alignment:
Q  90 agagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg 187  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||       
T  45282864 agagagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgcaa 45282962  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45282963 agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgta 45283052  T
Q  287 acccttttgtatctcttt----ggaagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||| ||||||||| ||||    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283053 acc-ttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 45283151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41819737 - 41819523
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41819737 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgt 41819639  T
Q  269 catagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 367  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  41819638 ctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgg 41819540  T
Q  368 accgaactgagtgaaca 384  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  41819539 accaaactgggtgaaca 41819523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 43403969 - 43403743
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  43403969 gttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggcttgttctt 43403872  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccctt-ttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   |||| |||||||||||| | | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43403871 tgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtag 43403772  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  43403771 gtcatggttggaccgaactgggtgaacaa 43403743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7780204 - 7780003
Alignment:
Q  175 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagc 274  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  7780204 aaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttc-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatc 7780114  T
Q  275 taatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7780113 taatttcttgtaacc-ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaa 7780015  T
Q  374 ctgagtgaacaa 385  Q
     || ||||||||    
T  7780014 gtgggtgaacaa 7780003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23410697 - 23410349
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgtt-cttttca-tattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaa 114  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  23410697 aaaacgtgacacaattt-gacagctgaagactgctatataagtgtttctttgcagttttttgaaggagagct-gaagagagagaaacttgggattgcaaa 23410600  T
Q  115 agaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgt 211  Q
     ||   |||||||||||| || ||||||  | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23410599 ggagagaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgt 23410501  T
Q  212 tcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaa 311  Q
    ||||| |||| ||| ||||||   ||||||||||| | || |||||||||| |||||   |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23410500 tcattagtgaaatttggaaaatg-ggtagaaattatgtttattctttgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcactttgtaagaa 23410402  T
Q  312 ctcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||| | |||| |||||| ||||| | ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  23410401 ctcttagataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaagtt 23410349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 373
Target Start/End: Original strand, 46860427 - 46860631
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaat-cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 267  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  46860427 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttg 46860525  T
Q  268 tcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 367  Q
    |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  46860526 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttgg 46860625  T
Q  368 accgaa 373  Q
    ||||||    
T  46860626 accgaa 46860631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 161 - 375
Target Start/End: Original strand, 46173311 - 46173515
Alignment:
Q  161 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46173311 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt----------aaaattggtagaaattagggttgttcttt 46173399  T
Q  259 gtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 358  Q
    |||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  46173400 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 46173499  T
Q  359 caagtttggaccgaact 375  Q
    |||| ||||||||||||    
T  46173500 caag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26386785 - 26386597
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |    
T  26386785 gagaacttaaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattagagttctcttaggttgggaaacagggtaaata 26386686  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26386685 ctttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggg-aaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 26386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 3617333 - 3617619
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  3617333 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 3617430  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3617431 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 3617520  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3617521 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3617619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 385
Target Start/End: Original strand, 47304224 - 47304419
Alignment:
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||   || |||| |||||||    
T  47304224 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatg-ggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgta 47304321  T
Q  287 acccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  47304322 acccatctgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaa 47304419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 381
Target Start/End: Original strand, 25637308 - 25637592
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  25637308 gaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 25637405  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
     ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  25637406 agagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttg 25637493  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||| | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25637494 taacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 25637592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 318
Target Start/End: Original strand, 5373096 - 5373336
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattg-taaacacctt---- 183  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||| |||| || ||||||  | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        
T  5373096 aagagagagaaacttgaaaaatcaaaggaggtaactttaaggttgagagtctttggtgaaggttctcttgggttgggaaacattggtaaacaccttattg 5373195  T
Q  184 ----ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg-gttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||   |||||||    
T  5373196 ggtgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattgaagagattgggaaaaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaat 5373295  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattg 318  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  5373296 ttattgtaacccttttatatctctttgtaaggaactcattg 5373336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 36018795 - 36018987
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  36018795 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattaacgagtgacttgttcattggtgaaattgggaaaatg-ggttgaaattagggttgttctt 36018893  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac-ccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccag 351  Q
    ||||| |||||   || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  36018894 tgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31340425 - 31340268
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  31340425 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattgaggttgttctt 31340328  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcatt 317  Q
    ||||| |||||   |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  31340327 tgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2075369 - 2075178
Alignment:
Q  84 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttct-------------cttgggttgggaaaca 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||| |||||||||||             ||||||||||||||||    
T  2075369 gcttcaagagagagaaacttgggaaatcaaatga-gtaactttagggttgagagtctttgattagagttcttttgagaagttatcttgggttgggaaaca 2075271  T
Q  171 ttg-taaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtga 262  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  2075270 tttataaacaccttgctgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgatattggga-aaaatggtagtaattagagttggttctttgtga 2075178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4601028 - 4600747
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |  | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  4601028 agagagagacttgggaaatcaaagggaa-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 4600931  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4600930 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaa 4600843  T
Q  288 cccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    || ||||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4600842 cc-ttttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 4600747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5258066 - 5258003
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258066 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 5258003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 40592469 - 40592637
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||| |    
T  40592469 aaacgtgacacgattttgacagctgaagaccgctatataagtgttcttgtgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaagg 40592567  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40592568 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 40592637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 385
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913461
Alignment:
Q  275 taatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 374  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaac 40913450  T
Q  375 tgagtgaacaa 385  Q
    || || |||||    
T  40913451 tgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4598693 - 4598526
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  4598693 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 4598598  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4598597 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 4598526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 10056217 - 10056384
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  10056217 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 10056312  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10056313 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10056384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 10058439 - 10058606
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  10058439 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 10058534  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10058535 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10058606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 10060661 - 10060828
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  10060661 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 10060756  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10060757 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10060828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 10062883 - 10063050
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  10062883 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 10062978  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10062979 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10063050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 10065105 - 10065272
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  10065105 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 10065200  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10065201 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10065272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 10211393 - 10211560
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  10211393 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 10211488  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10211489 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10211560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 458 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5260249 - 5260182
Alignment:
Q  458 ctaaattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5260249 ctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttactactt 5260182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301972
Alignment:
Q  277 atttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||     
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactt 55301980  T
Q  377 agtgaaca 384  Q
     |||||||    
T  55301979 ggtgaaca 55301972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16264745 - 16264580
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaag 119  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||| || |    
T  16264745 cgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagtttttgaaggagagcttgaagtaagagaaactt-ggattacaaaggagg 16264647  T
Q  120 caactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     |||||||||||| || |||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264646 taactttagggttgagtgtctttgtaatgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 16264580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 30709480 - 30709572
Alignment:
Q  15 ggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30709480 ggaaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagacagaaacttgg 30709572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 51352298 - 51352150
Alignment:
Q  195 atcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttt 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||| | | || ||||||||||||| || ||    
T  51352298 atcattgagtgtcttgtttattggtgagattagg--aaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaa-ccatt 51352202  T
Q  294 tgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctc 345  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  51352201 tgtatttctttgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 1735991 - 1736159
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||   |||| |    
T  1735991 aaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttatgcagattttgaaggagagtttggagagagagaaactt-ggattacaaagg 1736089  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736090 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctattgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 1736159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 39032239 - 39032409
Alignment:
Q  16 gaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  39032239 gaaaatcgtgacacgattttgacagctgaagattgctatataagtgttcttgtgcagtttttgaagtagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaa 39032337  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | || | |||||||||||| || ||||||     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39032338 aggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagatctcttgggttggtaaacattgtaaacaccttgg 39032409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 47923591 - 47923759
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |    
T  47923591 aaacgtgacacgattttgacaactgaagagtgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaagg 47923689  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | ||||||||| || || |||||  || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47923690 aggtaactttaggattgagtgtctttgtagtgaga-atctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 47923759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36029495 - 36029324
Alignment:
Q  16 gaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||    
T  36029495 gaaaaacgtgacacaattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtaagagaaactt-ggattacaa 36029397  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | || | || ||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36029396 aggaggtaaatttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 36029324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 10209173 - 10209340
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||   |||| |  ||||    
T  10209173 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtagtccttttgtaaaga 10209268  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10209269 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtga 10209340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48438614 - 48438447
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||| |    
T  48438614 aaacgtgacacgattttaacagccgaagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttgaaggagagcttgaatagagagaaactt-ggattacaaagg 48438516  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtcttt-aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || ||||||  | ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48438515 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtaaggatctctt-ggttgggaaacattgtaaacaccttgg 48438447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 8370175 - 8370344
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||     
T  8370175 aaaacgtgacacgattttgacaactgaagactgctatataagcgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaag 8370273  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8370274 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 8370344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 7764711 - 7764774
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  7764711 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 7764774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9634743 - 9634680
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  9634743 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 9634680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9636046 - 9635983
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  9636046 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 9635983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19683810 - 19683747
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  19683810 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 19683747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 24694853 - 24695021
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||   |||| |    
T  24694853 aaacgtaacacgattttgacaactgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaa-tttggattacaaagg 24694951  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24694952 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 24695021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 458 - 525
Target Start/End: Original strand, 7762508 - 7762575
Alignment:
Q  458 ctaaattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  7762508 ctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattacttgtgttcactttgatattggttactactt 7762575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 9581529 - 9581592
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  9581529 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttactactt 9581592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23200058 - 23199996
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23200058 attagatctaggtgtt-ttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttactactt 23199996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Original strand, 27974663 - 27974807
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtct 140  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || | |||||||||||| || ||||    
T  27974663 gaagactgttatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtct 27974761  T
Q  141 t--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |  || | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27974762 ttgtagtgag-gatctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttgg 27974807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 40735628 - 40735691
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  40735628 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttactactt 40735691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4055912 - 4055819
Alignment:
Q  236 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacc-cttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtggatt 328  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4055912 ggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggatt 4055819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Original strand, 6718563 - 6718686
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttaggg-tctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||     
T  6718563 gaagagagagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgt 6718661  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttg 210  Q
      || || |||||||||||||||||    
T  6718662 aaagagagaatcattgagtgtcttg 6718686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27027106 - 27026937
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||   ||||     
T  27027106 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtaatcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagaaaaactt-ggattacaaag 27027008  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27027007 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtactgag-gatctcttggatagggaaacattgtaaacaccttgg 27026937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 35138915 - 35138762
Alignment:
Q  175 aaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcata 272  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||    ||||||||||| | |||||||| ||||  ||||   |    
T  35138915 aaacaccttgggagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatggaaagagattgagaaatg--ggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaa 35138818  T
Q  273 gctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggat 327  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35138817 gttaatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtggat 35138762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27038449 - 27038362
Alignment:
Q  20 aacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttc-atattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27038449 aacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgtagattttgaagaagagcttgaagagagaaaaacttgg 27038362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 29811114 - 29811177
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  29811114 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttctctttgaaattggttactactt 29811177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 29813307 - 29813370
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  29813307 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattagttactactt 29813370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 45095409 - 45095472
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  45095409 attagatctatgtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttactactt 45095472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35925880 - 35925791
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  35925880 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagtttttgaaggtgagcttaaagtgagagaaacttgg 35925791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21711594 - 21711454
Alignment:
Q  44 agacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt 142  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||| || | |||||||||||| || ||||||    
T  21711594 agactgctatgtaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtcttt 21711497  T
Q  143 --aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 184  Q
      | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711496 gtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 21711454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Original strand, 27986147 - 27986311
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaag 119  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||   | |||| || |    
T  27986147 cgtgacacgattttgtccgcagaagacaggtatttaagtgttcttgtgcagatttggaag-agagttggaagagagagaaacttggatta-caaaggagg 27986244  T
Q  120 caactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     |||||||||||| || ||||||  | | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986245 gaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 27986311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8127029 - 8126861
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||   ||||      
T  8127029 aaacgtgacacgattttgacagttgaagactgctatataagtgtttatttgcagattttgaaggagagtttttagagagagaaactt-ggattacaaaga 8126931  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||| |||||||  ||| || |||||  || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8126930 aagtaactttacagttgagtgtctttgtagtgag-gttttcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 8126861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  317 tgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 37408705 - 37408768
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  |||||||||||||||    
T  37408705 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgctcactttaatattggttactactt 37408768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 40734743 - 40734806
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  40734743 attagatctaggtgctgttattttttattatttcttgtgttcactttgatattggttactactt 40734806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7779923 - 7779865
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttac 520  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  7779923 attagatctaggtgctgtttttgttgattattgcttgcacacactttgttggtggttac 7779865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 33191888 - 33191974
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  33191888 agctaagttcttgtaaccatttt--atgtctttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctct-ctccagaggaggtca 33191974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1313939 - 1313854
Alignment:
Q  250 ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagag 334  Q
    |||||||| | || ||||| | ||||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1313939 ttgttcttggagagcttgttaaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactcattgatattggattagagag 1313854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7782452 - 7782375
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag 150  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  7782452 tttgaaggacagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctaggttttagagtctttgattagag 7782375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27453294 - 27453191
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | |||| || | |||||||||||| || |||| || | || | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27453294 gagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtgtctgtagtgag-gatctcttgggttggcaaacattgtaaaca 27453197  T
Q  180 ccttgg 185  Q
    ||||||    
T  27453196 ccttgg 27453191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 801335 - 801399
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttatt-gttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  801335 attagatctaggtgctgttttttgttgattattgcttgcacacactttattagtggttactactt 801399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 761091 - 761153
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  761091 attagatctaggtgctgctattgttg-ttattgcttgagttcactttgattttggttactactt 761153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 3323511 - 3323546
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323511 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3323546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5236379 - 5236316
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  5236379 attagatctaggagctcttattgttgattattgcttgtgttcactttgatatcgattactactt 5236316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Original strand, 6794434 - 6794570
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aatt 146  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||   | |||| || | |||||||||||| || ||| ||  | |     
T  6794434 ctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagaggttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtcattgtagtg 6794532  T
Q  147 agagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6794533 ag-gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgg 6794570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 321
Target Start/End: Original strand, 20937715 - 20937762
Alignment:
Q  275 taatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgata 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20937715 taatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgata 20937762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 51399060 - 51399123
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||| || ||||||    
T  51399060 attagatctaggtgctgttattgttgattattgctagtgctcactttgatattgttttctactt 51399123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 54739110 - 54739004
Alignment:
Q  228 gaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtgg 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||   | ||||||| | ||||| ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  54739110 gaaaaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttat-gtaactcttttatatctctctgtaaagaactcattgatagtgg 54739012  T
Q  326 attagaga 333  Q
    ||| ||||    
T  54739011 attggaga 54739004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2075149 - 2075095
Alignment:
Q  310 aactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2075149 aactaattgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaagtt 2075095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4075605 - 4075511
Alignment:
Q  251 tgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacc-cttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtggattagagagttcaatctc 343  Q
    ||||||| | |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  4075605 tgttcttagagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatcactttgtaagaaactctttgatagtggattggagagatcactctc 4075511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44331813 - 44331735
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagaga 96  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44331813 aaacgtggcatgattttgacagctgaagactgctatatatgtgttatttgcagattttgaaggagagcttaaagagaga 44331735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26299252 - 26299219
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299252 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 26299219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Original strand, 26928421 - 26928454
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928421 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 26928454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28253421 - 28253344
Alignment:
Q  231 aaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgga 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||   || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  28253421 aaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacgattttgtatttctttgga 28253344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067471
Alignment:
Q  345 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10067471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 192
Target Start/End: Original strand, 30709615 - 30709651
Alignment:
Q  156 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtga 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30709615 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttggggagtga 30709651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37726043 - 37725906
Alignment:
Q  49 gctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt--taat 145  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||||||| |||   |||| || | |||||||||||| || |||||  || |    
T  37726043 gctatataagtgttcttgtgcagattttggaagtgagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaaggaggaaactttagggttgagtgtctttgtagt 37725945  T
Q  146 tagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     || | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37725944 gag-gatctcttgggtggggaaacattataaacaccttgg 37725906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25491114 - 25491027
Alignment:
Q  238 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtg 324  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||   |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  25491114 tagaaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtg 25491027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Original strand, 33386386 - 33386530
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtct 140  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||   | |||| ||   |||||||||||| || ||||    
T  33386386 gaagactggtatttaagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggagagaactttagggttgagtgtct 33386484  T
Q  141 tt--aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||  | | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33386485 ttgtagtgag-gatctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgg 33386530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 3328178 - 3328212
Alignment:
Q  151 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3328178 ttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 3328212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 184
Target Start/End: Original strand, 4386797 - 4386831
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4386797 gttctcttgggttgggaaacattgtaatcaccttg 4386831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 525
Target Start/End: Original strand, 29682604 - 29682665
Alignment:
Q  463 ttagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||    
T  29682604 ttagatctaggtgctgctattgttg-ttattgcttgtattcactttaattttgattactactt 29682665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27038315 - 27038282
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27038315 tctcttgggtagggaaacattgtaaacaccttgg 27038282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32143587 - 32143554
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32143587 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 32143554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35925738 - 35925709
Alignment:
Q  156 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35925738 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 35925709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Original strand, 40612562 - 40612607
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40612562 attgtaaacaacttggcaagtgaaaatcattgagtctcttgttcat 40612607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30834912 - 30834538
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaa-cgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggga 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30834912 gattggggaaaaaacgtgacacgattttgacacagaagacaactatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgaga 30834813  T
Q  108 aatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30834812 aatcaaaggaagcaactttagggtttatggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtc 30834713  T
Q  208 ttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834712 ttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgga 30834613  T
Q  308 agaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30834612 agaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 30834538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16452704 - 16452328
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16452704 gattggggaaaaacgtgacacgatttagacgatgaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaa 16452605  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452604 atcaaagtaagcaactttagagtttagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 16452505  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16452504 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttggaa 16452405  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16452404 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16452328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5406573 - 5406199
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5406573 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttatttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaa 5406474  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5406473 atcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 5406374  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5406373 tgttcattggtgagattggg--aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 5406276  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5406275 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa 5406199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5410898 - 5410524
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5410898 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttatttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaa 5410799  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5410798 atcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 5410699  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5410698 tgttcattggtgagattggg--aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 5410601  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5410600 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa 5410524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31405049 - 31404674
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31405049 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagacagctatataagtgttatttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 31404950  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttta-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 207  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404949 atcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 31404850  T
Q  208 ttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgga 307  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31404849 ttgttcatcagtgagattgggaaaa--tggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgta 31404752  T
Q  308 agaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31404751 agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaa 31404674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5413767 - 5413394
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5413767 gattggggaaaaacgttacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagatagagaaacttgggaa 5413668  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5413667 atcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtgtct 5413568  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5413567 tgttcattggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 5413470  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5413469 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg-gtgaacaa 5413394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2171842 - 2171531
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt-ctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2171842 tttgaaggtgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaacat 2171743  T
Q  172 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2171742 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaa 2171644  T
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171643 agctaatttcttgtaaccc-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 2171545  T
Q  372 aactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||    
T  2171544 aactgggtgaacaa 2171531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33160720 - 33160351
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaa-cttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  33160720 aaaacgtgacacaattttgacgctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgatggagagctggaagagagagaaaacttggggaatcaaagg 33160621  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaa-tcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33160620 aggtaactttagggttgagagtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaaatcattgagtgtcttattcat 33160521  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33160520 tggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactca 33160421  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33160420 ttgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaa 33160351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9183393 - 9183031
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagca 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  9183393 cgtgacacgattttgacgctgaagactactatataagttttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggta 9183294  T
Q  122 actttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9183293 actttagggttgagggtctttgattagagttctcctgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg 9183194  T
Q  221 agattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgat 320  Q
    |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9183193 agattgag-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgat 9183095  T
Q  321 agtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  9183094 agtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 9183031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33211552 - 33211185
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33211552 aaaacatgacacgattttgacagctcaatactgctatataagtgttctttgcagattgtgaaggagaagttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 33211453  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33211452 aggtaactttacagttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtcactgaaaatcattgagtgttttgttcat 33211353  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    || |||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||    
T  33211352 tggtgagattggg-aaaattggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaagaactca 33211254  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    || ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  33211253 tttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28137712 - 28137409
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||| |||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137712 gagaacttcaagagaggaaaacttggaaaatcaaaggagttaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 28137613  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  28137612 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 28137514  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  28137513 ttcttgtaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgtg 28137415  T
Q  379 tgaaca 384  Q
    ||||||    
T  28137414 tgaaca 28137409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3073045 - 3072758
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||     
T  3073045 agagagaaacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagaga 3072946  T
Q  191 gaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc 290  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  3072945 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--tggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactc 3072855  T
Q  291 tttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3072854 tttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3072758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6097728 - 6097450
Alignment:
Q  90 agagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6097728 agagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtg 6097629  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6097628 agtgaaaatcattgagtgt-------tttggtgagattgg--aaaaatggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa 6097538  T
Q  288 cccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | |||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6097537 ctcttttgt----------aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6097450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26954589 - 26954296
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26954589 gagagcttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattagagttatcttaggttgggaaacattgtaaaca 26954490  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  26954489 cctttggggagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatatgtgagattgggaaat--tggtataaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaat 26954392  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26954391 ttcttgtaactcatctgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaact 26954296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 411981 - 412271
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggt 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||      
T  411981 gaagagagagaaacttgagaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgaa 412079  T
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  412080 gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgta 412170  T
Q  287 accctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    || ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  412171 actctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 412270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 21593608 - 21593831
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21593608 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 21593705  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21593706 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 21593805  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21593806 tcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3039137 - 3038926
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3039137 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagg 3039039  T
Q  249 gttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctc 348  Q
    ||||||| |||||| ||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| | ||||||||| |    
T  3039038 gttgttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttaatagtggattggagagattaatctctcccc 3038939  T
Q  349 cagagtaggtcaa 361  Q
    |||| ||||||||    
T  3038938 cagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3808933 - 3808707
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3808933 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcaca-agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaata-ggtagaaattagggttgttctt 3808836  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3808835 tgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 3808736  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  3808735 gtcatgattggaccgaactaggtgaacaa 3808707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 384
Target Start/End: Original strand, 21588916 - 21589098
Alignment:
Q  200 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21588916 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc 21589014  T
Q  300 tctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21589015 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 17762933 - 17763158
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17762933 gttgggaaacaattgtaaacactttgagagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 17763031  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||     
T  17763032 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaga 17763131  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||    
T  17763132 tcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2973163 - 2972959
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  2973163 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcata-agtgtcgtgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctt 2973066  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2973065 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtagg 2972966  T
Q  358 tcaagtt 364  Q
    |||||||    
T  2972965 tcaagtt 2972959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26830337 - 26830124
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 267  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26830337 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 26830240  T
Q  268 tcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 367  Q
    |   |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26830239 ttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-g 26830141  T
Q  368 accgaactgagtgaaca 384  Q
    || |||||| |||||||    
T  26830140 actgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Original strand, 17757995 - 17758191
Alignment:
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  17757995 gagtgaaaattcatgagtgtcttcttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 17758093  T
Q  287 acccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  17758094 acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17758191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 5043571 - 5043795
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||    
T  5043571 gttgggaaacaattgtaaacaccttgtgagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattcgtgagattgagaaaa--tgagtagaaattaggtttgttct 5043667  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5043668 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtag 5043767  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||   ||||||||||||| |||||||    
T  5043768 gtcattgttggaccgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 27647742 - 27648029
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||| ||     
T  27647742 gaagagagagagacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccatgt 27647840  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
     ||| |||  |||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27647841 agagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttg 27647928  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaac 383  Q
    ||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27647929 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaac 27648027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22425052 - 22424826
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22425052 gttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagggttgttctt 22424954  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc--ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagta 355  Q
    ||||| |||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22424953 tgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagagta 22424855  T
Q  356 ggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||   |||||||| |||| |||||||    
T  22424854 ggtcattgttggaccgtactgggtgaaca 22424826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 16554749 - 16555038
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  16554749 gaagtgagagagacttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 16554846  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
      || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16554847 aaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttg 16554936  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16554937 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 16555035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 16631305 - 16631594
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  16631305 gaagtgagagagacttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 16631402  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
      || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16631403 aaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttg 16631492  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16631493 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 16631591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 385
Target Start/End: Original strand, 16568916 - 16569190
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtg 187  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  16568916 aagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaattaaatttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggta 16569015  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg-gttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    |||||||||||||||||||||          |||||||| | ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  16569016 agtgaaaatcattgagtgtct----------tgagattgag-aaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgta 16569104  T
Q  287 acccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||            ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  16569105 ac------------ctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 16569190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 385
Target Start/End: Original strand, 16653022 - 16653281
Alignment:
Q  119 gcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  16653022 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 16653114  T
Q  217 ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactc 314  Q
     |||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  16653115 -gtgagattgggaaaag--ggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 16653209  T
Q  315 att-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16653210 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16653281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16578806 - 16578517
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||     
T  16578806 gaagtgagagagacttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacgttgt 16578709  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
      || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16578708 aaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtca-agctaatttcttg 16578619  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16578618 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 16578520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 16616574 - 16616863
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||     
T  16616574 gaagtgagagagacttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacgttgt 16616671  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
      || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16616672 aaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtca-agctaatttcttg 16616761  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16616762 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 16616860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 358
Target Start/End: Original strand, 4045356 - 4045566
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  4045356 gttctcttgagttgggaaacatttgtaaacacctagggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttattggagagattggg--aaaatggtagaaattag 4045453  T
Q  248 gg-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctc 345  Q
    || ||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  4045454 ggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatcaatttcta 4045553  T
Q  346 ctccagagtaggt 358  Q
    | ||| |||||||    
T  4045554 ccccaaagtaggt 4045566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 603304 - 603088
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| | |||||||||    
T  603304 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggg---------tagaaatttgtgttgttctt 603215  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||||    
T  603214 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattagg 603115  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  603114 tcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 25421189 - 25421475
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  25421189 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 25421286  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25421287 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 25421376  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25421377 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 25421475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 6027132 - 6027416
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  6027132 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 6027229  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6027230 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 6027317  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6027318 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6027416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5409167 - 5409069
Alignment:
Q  286 aacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5409167 aacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg-gtgaacaa 5409069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5411608 - 5411489
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5411608 gattggggaaaaatgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaa 5411509  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttag 128  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  5411508 atcaaaggaggcaactttag 5411489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Original strand, 16567070 - 16567201
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16567070 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaaca 16567169  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16567170 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 16567201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5407276 - 5407164
Alignment:
Q  16 gaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5407276 gaaaaatgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaag 5407177  T
Q  116 gaagcaactttag 128  Q
    || ||||||||||    
T  5407176 gaggcaactttag 5407164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 25073538 - 25073698
Alignment:
Q  184 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg-agattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttct 282  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||| | ||||| ||| |    
T  25073538 ggtgagtgaaa-tcattgagtatcttgttcatgggaggagattg--aaaaaatggtagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaagctattttat 25073634  T
Q  283 tgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctc 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25073635 tgtaacccttttgtatctctatgtaaagaactcattgatagtggattagagaaatcaatctctc 25073698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 13153913 - 13154080
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  13153913 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 13154008  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13154009 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 13154080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33342389 - 33342108
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  33342389 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 33342292  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33342291 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaa 33342204  T
Q  288 cccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    || | |||||   |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33342203 cc-tcttgtactccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 33342108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 381
Target Start/End: Original strand, 34164856 - 34165023
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  34164856 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 34164951  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34164952 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 34165023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 34167078 - 34167249
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aaga 310  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||    
T  34167078 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga 34167173  T
Q  311 actcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34167174 acttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 34167249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 462 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 30834456 - 30834396
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttacta 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834456 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttacta 30834396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22964098 - 22963930
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||   ||||||    
T  22964098 aaaacgtgacacgattttgacggctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaactagagcttgaaaagagagaaactt-tgattacaaaag 22964000  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtcttt-aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |   |||||||||||| || ||||||  | |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22963999 agctaactttagggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 22963930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 23824295 - 23824463
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||   ||||||    
T  23824295 aaaacgtgacacgattttgacggctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaactagagcttgaaaagagagaaactt-tgattacaaaag 23824393  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtcttt-aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |   |||||||||||| || ||||||  | |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23824394 agctaactttagggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 23824463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 376
Target Start/End: Original strand, 26800643 - 26800747
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 370  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  26800643 agctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggacc 26800741  T
Q  371 gaactg 376  Q
    ||||||    
T  26800742 gaactg 26800747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16452250 - 16452187
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16452250 attagatctaggtgatgttattgttgattattgcttgtattcactttgttattggttactactt 16452187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2171449 - 2171386
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  2171449 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcacacactttgttagtggttactactt 2171386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18234482 - 18234394
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18234482 aaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagtttttgaaggagagcttgaagagaaagaaacttgg 18234394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9182953 - 9182890
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  9182953 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 9182890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 31086170 - 31086260
Alignment:
Q  17 aaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31086170 aaaaacgtgacacgattttgatagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggtgagctggaagagagagaaacttgg 31086260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 5757175 - 5757344
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||  | || |||||| |||| ||||||||| || | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||     
T  5757175 aaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctaaataagtgtttttgtgcagattttggaggagagctggaagagagagaaacttggatta-caaag 5757273  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || ||||||  | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757274 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtatttag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5757344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16452815 - 16452759
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16452815 gattggggaaaaacgtgacacgatttagacgatgaagacagctatataagtgttctt 16452759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5408992 - 5408929
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  5408992 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttactactt 5408929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5413317 - 5413254
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  5413317 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttactactt 5413254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 5017192 - 5017362
Alignment:
Q  17 aaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctt-ttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaa 114  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    |||| |||||||||| |||   ||||    
T  5017192 aaaaatgtgacacgattttgacagctgaagaccgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggaaaaagaaagagaaactt-ggattacaaa 5017290  T
Q  115 agaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     ||   |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017291 cgagataactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5017362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23896727 - 23896663
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23896727 gaagactgctatataagagttcttgtgcatattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgg 23896663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 31404597 - 31404537
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttacta 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||    
T  31404597 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattgattacta 31404537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 3072679 - 3072616
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  3072679 attagatctatgtgctatttttgttgattattgcttgcacacactttgttagtggttactactt 3072616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 6097369 - 6097306
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  6097369 attagatcaaggtgctgtttttgttgattatagcttgcacacactttgttagtggttactactt 6097306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Original strand, 24435673 - 24435837
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaag 119  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   | |||| ||      
T  24435673 cgtgacacgaatttgacagttgaagactgctatataagtgtttgtttgcaaattttgaagaatagcttgaagagagagaaactaggatta-caaaggaga 24435771  T
Q  120 caactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     |||||||||||| || ||||||   |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24435772 taactttagggttgagtgtctttgtgtgaggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgg 24435837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Original strand, 10076889 - 10076977
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10076889 aaacgtgacacgactttgacagctgaagattgctatatatatgttcttgtgcagattttgaaggagagctttaagagagagaaacttgg 10076977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 16569266 - 16569328
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  16569266 attagatctaggtgctgctattgttg-ttattgcttgagttcactttgattttggttactactt 16569328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Original strand, 5571945 - 5572109
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttcttttc-atattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaag 119  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||   | |||  || |    
T  5571945 cgtgacacgattttgacaactgaagactgctatataagtgttcttgtggagtttttgaaggagagcttta-gagagagaaacttggatta-caatggagg 5572042  T
Q  120 caactttagggtttagggtcttta-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     ||||||||||||  | ||||||  | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5572043 taactttagggttgggtgtctttgtagtggggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5572109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22709274 - 22709241
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709274 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 22709241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3039219 - 3039152
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag 148  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3039219 gagagcttcaagagagaaaaacttgggaa-tcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 3039152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30684210 - 30684158
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtt 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  30684210 gagagcttcaagagagagaaacttggtaaatcaaatcaagtaactttagggtt 30684158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31936942 - 31936806
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aatt 146  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |   |||| || | |||||||||||| || ||||||  | |     
T  31936942 ctatataagtgtttctttgcagattttgaagtagaggttttagagagagaaacttgg-attgcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 31936844  T
Q  147 agagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31936843 ag-gatctattgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 31936806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Original strand, 19643877 - 19643929
Alignment:
Q  322 gtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19643877 gtggattagagagttgc-tctctccttcagagtaggtcaaatttggaccgaact 19643929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21356301 - 21356268
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21356301 tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttgg 21356268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14522002 - 14521905
Alignment:
Q  91 gagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttg--ggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| | ||||  |||| || | ||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14522002 gagagagaaacctaggaatacaaatgaggtaactttagggtttaatgtctttgtagttag-gttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgg 14521905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 434326 - 434702
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  434326 gattggggaaaaacgtggcacgattttgacgcagaagaccgctataaaagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaa 434425  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434426 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 434525  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  434526 tgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 434625  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  434626 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 434702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 434780 - 434843
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||  || ||||||||||||    
T  434780 attagatctaggtgctgttattgttgattattgattgaaaacactttaataatggttactactt 434843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 490474 - 490380
Alignment:
Q  231 aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtg 324  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| | || |||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  490474 aaaatcgtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtg 490380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 119)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 385
Target Start/End: Original strand, 35853716 - 35854083
Alignment:
Q  17 aaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  35853716 aaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttaggaaatcaaagg 35853815  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853816 tagcaactttagggtttagggtctttgatttgagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 35853915  T
Q  217 ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcat 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35853916 ggtgagattggg-aaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcat 35854014  T
Q  317 tgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35854015 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 35854083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 385
Target Start/End: Original strand, 4178567 - 4178942
Alignment:
Q  8 agattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4178567 agattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctataaaagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgaga 4178666  T
Q  108 aatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4178667 aatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 4178766  T
Q  208 ttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4178767 ttgttcattggtgagattgggaaaaaa-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-ga 4178864  T
Q  308 agaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  4178865 agaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaa 4178942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 23554842 - 23555209
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23554842 aaaacgtgacacgattttgacgctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagga 23554941  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 217  Q
     | ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23554942 ggtaacttcagggttgaaggtctttgattagagttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 23555041  T
Q  218 gtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcatt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23555042 gtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctctttgtaagaactcatt 23555141  T
Q  318 gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23555142 gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 23555209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 29990848 - 29991222
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29990848 gattggggaaaaatgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagtttgaagagagagaaacttgggaa 29990947  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29990948 atcaaaggagacaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 29991047  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29991048 tgttcattggtgagattggg--aaaaggatagaaattagggttgttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttctaa 29991145  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29991146 taactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 29991222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14070200 - 14069833
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14070200 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttctttgccgattttaaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 14070101  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14070100 aggtaactttagggctgagggtctttgattagagttctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 14070001  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14070000 tggtgagattgggaaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 14069902  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  14069901 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14380228 - 14379861
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14380228 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttctttgccgattttaaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 14380129  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14380128 aggtaactttagggctgagggtctttgattagagttctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 14380029  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14380028 tggtgagattgggaaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 14379930  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  14379929 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 51 - 385
Target Start/End: Original strand, 19502013 - 19502347
Alignment:
Q  51 tatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag 150  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19502013 tatataaatgttctttgcagattttgaaggagagcttaaagagagacaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagag 19502112  T
Q  151 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  19502113 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggt 19502212  T
Q  251 tgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctcca 350  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19502213 tgttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 19502312  T
Q  351 gagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  19502313 gagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaa 19502347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25767283 - 25766959
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt- 152  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  25767283 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagct-gaagagagagaaacttgagaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagttt 25767185  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25767184 ctctt----tgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg---agattgg-aaaaaagggtagaaattagggttg 25767093  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccag 351  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25767092 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccag 25766993  T
Q  352 agtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25766992 agtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaa 25766959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 366
Target Start/End: Original strand, 18126445 - 18126794
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18126445 aaaacgtgacacgattttgacagctaaagactgatatataagtgttctttgcagattttgaagaagagcttgaatagagagaaacttgggaaatcaaagg 18126544  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18126545 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcatgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttcat 18126644  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 314  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18126645 tggtgagattgg--aaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactc 18126742  T
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 366  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18126743 attgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagtttg 18126794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30025099 - 30024741
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30025099 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactactatataagtgttctttgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 30025000  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30024999 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgaaaaacgttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 30024900  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  30024899 tggtgagattgag-aaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactct 30024801  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30024800 ttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 30024741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 48408674 - 48408973
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt-ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48408674 gaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggt 48408773  T
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48408774 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggg-aaaaagggtagaaattaatgttgttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgta 48408872  T
Q  287 a-cccttttgtatctc-tttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    | |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48408873 accccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaaca 48408972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Original strand, 39731215 - 39731538
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-tt 152  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  39731215 taagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtctttgattagagctt 39731313  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  39731314 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgg--aaaaagggtagaaattagggttg 39731404  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccag 351  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39731405 ttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccag 39731504  T
Q  352 agtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39731505 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 39731538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47676503 - 47676145
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47676503 aaaacgtgacacaattttgacagttgaagactgatatataagtgttctttgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 47676404  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    |   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47676403 agataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcat 47676304  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47676303 tggtgagattgag-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 47676205  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
     |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  47676204 atgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactg 47676145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31733329 - 31732969
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    ||||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31733329 aaaacgtgacacgattttga------agactgctatataagtgttctttgcagattttgaagaaaagctggaagagagagaaacttgagaaatcaaaaga 31733236  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
     | |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733235 ggtaactttagagttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 31733136  T
Q  217 ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcat 316  Q
    ||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31733135 ggtgagactgag-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcat 31733037  T
Q  317 tgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  31733036 tgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47674310 - 47673952
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47674310 aaaacatgacatgattttgacagctgaagactgctatataggtgttctttgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 47674211  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | ||||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47674210 aggtaacttcaaggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 47674111  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47674110 tggtgagattgag-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 47674012  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactga 377  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  47674011 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactga 47673952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 1113457 - 1113825
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||| || | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1113457 aaaacgtgacacgattttgacagctgaatactgttatataagtgtttctgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaag 1113556  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1113557 gaagtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 1113656  T
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaact 313  Q
    || ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1113657 tttgtgagatt--gagaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaact 1113754  T
Q  314 cattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  1113755 cattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttt-gaccgaattgagtcaacaa 1113825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 4585962 - 4586320
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4585962 aaaatgtgacacgattttgacagctaaagactgttatataagtgttctttgcagattttgaaggagagttagaagagagaaaaacttgggaaatcaaagg 4586061  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4586062 atgtaactttagggttgaggctctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcat 4586161  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  4586162 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgtaagaactca 4586260  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||  |||||||||||||    
T  4586261 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactg 4586320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24515135 - 24514911
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24515135 gattggggaaaaacgcgacacgatttagacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaggggagcttgaagagagagaaacttgggaa 24515036  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515035 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 24514936  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24514935 tgttcattggtgagattgggaaaaa 24514911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 50 - 364
Target Start/End: Original strand, 48491412 - 48491727
Alignment:
Q  50 ctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag 148  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48491412 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgataaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 48491511  T
Q  149 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  48491512 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattag 48491610  T
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  48491611 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 48491710  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||| |||||||||||    
T  48491711 ccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 385
Target Start/End: Original strand, 43864080 - 43864412
Alignment:
Q  52 atataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagt 151  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  43864080 atataagtgttctttgtagattttgaagaatagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagt 43864179  T
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  43864180 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaagtgggtagaaattagggt 43864278  T
Q  251 tgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctcca 350  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||    
T  43864279 tgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaatctctctccca 43864378  T
Q  351 gagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  43864379 gattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 50 - 385
Target Start/End: Original strand, 48489264 - 48489599
Alignment:
Q  50 ctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag 148  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||| |||||    
T  48489264 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagagattgaagatagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattag 48489363  T
Q  149 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  48489364 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtcttgttcattggtgagattggg-aaaatgggtagaaattag 48489462  T
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||     
T  48489463 ggttgttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgcaataactcattcatagtggattggagagatcaatctctccc 48489562  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48489563 ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaa 48489599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Original strand, 26417118 - 26417446
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgacgca-gaagacagctatataagtgtt-----cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||     |||| || ||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||     
T  26417118 cgtgacacgattttgacggttgaagactgctatataagtgttaatttctttgcagattttgaagaagagcttgaagagata--aacttgagaaatcaaag 26417215  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 214  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26417216 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgagcgggtgaaaatcattgagtgtcttgttca 26417315  T
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 314  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26417316 ttggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactc 26417414  T
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26417415 gttgatagtggattggagagatcaatctctcc 26417446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 81 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41317750 - 41317434
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg-------------ggttgggaa 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||             |||||||||    
T  41317750 agagcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaa 41317651  T
Q  168 acattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41317650 acattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggttgttctttgtgagctt 41317552  T
Q  267 gtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 366  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  41317551 gtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttg 41317453  T
Q  367 gaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||| || |||||    
T  41317452 gaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41649313 - 41649011
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41649313 gagaacttcaagagagcaaaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagg-tcttttattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 41649215  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  41649214 ccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgg-aaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt-tagctaat 41649117  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |    
T  41649116 ttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactggg 41649018  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    | |||||    
T  41649017 tcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 38671526 - 38671222
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38671526 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 38671427  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  38671426 ccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 38671328  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |    
T  38671327 ttattgtaacacatttgtatcactttgtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactggg 38671229  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    | |||||    
T  38671228 tcaacaa 38671222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 144 - 385
Target Start/End: Original strand, 27347745 - 27347985
Alignment:
Q  144 attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaa 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  27347745 attagagttctcttaggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaa 27347843  T
Q  243 attagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatct 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  27347844 attaggattgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaatct 27347943  T
Q  343 ctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  27347944 ctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 84 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4253830 - 4253538
Alignment:
Q  84 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacacct 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| |||  | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4253830 gctttaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtatttggtgagggttctcttgggttggaaaacatttgtaaacacct 4253731  T
Q  183 t-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaattt 280  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  4253730 taggtgagtgaaaatcattgagtttcttgttcattggtgaaattgg--taaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaattt 4253633  T
Q  281 cttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4253632 catgtaacccttttatatctctttggaaagaactcattgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaact 4253538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2761669 - 2761439
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2761669 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagataaacttgggaaatcaaagg 2761570  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2761569 aggtaactttagggttgatgatatttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcat 2761470  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2761469 tggtgagattggg-aaaattggtagaaattag 2761439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 43504444 - 43504153
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||      
T  43504444 gaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaa 43504345  T
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43504344 gagagaaaatcatcgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgta 43504254  T
Q  287 accctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    || ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43504253 actctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 43504154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 385
Target Start/End: Original strand, 8153276 - 8153510
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattag 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  8153276 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa--tgagtagaaattag 8153373  T
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  8153374 ggttgttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 8153473  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||    
T  8153474 ccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 81 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31105696 - 31105402
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 180  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  31105696 agagcttcaagagaggaaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattatagttatcttggggtgagaaacattgtaaacac 31105597  T
Q  181 cttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatt 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  || |||||||||| |||||   ||||||||    
T  31105596 cttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagattttttctttgtgagcttgttgaagctaatt 31105498  T
Q  280 tcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31105497 tcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactg 31105402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 496269 - 496003
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaat 196  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  496269 aaacttgggaaatcaaatgaggtaactttaaggttgagggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattgtaaaaaccttgggtgagtgaaaat 496170  T
Q  197 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgt 296  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||| |||||    
T  496169 catttagtgttttgttaatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggtagttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgt 496071  T
Q  297 atctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  496070 atctctttataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaagtt 496003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 170 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34310929 - 34310715
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34310929 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgt 34310832  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310831 tgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 34310732  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||    
T  34310731 ccgaactgggtgaacaa 34310715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 25615727 - 25616022
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  |||||| |||||||||| ||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615727 gagaacttcaagagaggaaaacttaggaaatcaaaggagttaactttaaggttaagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaaca 25615826  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||          ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||   |||||||    
T  25615827 ccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg----------agattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctatgtgcgcttgtttaagctaat 25615915  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25615916 ttcttgtaacccatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 25616015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 384
Target Start/End: Original strand, 22269931 - 22270140
Alignment:
Q  174 taaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcata 272  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |    
T  22269931 taaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaa 22270029  T
Q  273 gctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccga 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22270030 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactgattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccga 22270128  T
Q  373 actgagtgaaca 384  Q
    |||| |||||||    
T  22270129 actgggtgaaca 22270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23565363 - 23565081
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaaca 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| || | ||||||| |||||||    
T  23565363 agagcttcaagagagagaaacttgggatatcaaaggaggtaactttagg-ttaagggtctttgattag-gttctcttggtttagaaaacatttgtaaaca 23565266  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaat-ggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcatagcta 276  Q
    |||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||   | |||    
T  23565265 ccttgggtgagtgaacatga---agtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaacta 23565169  T
Q  277 atttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  23565168 atttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcctagagtaggtcaagtt 23565081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36146725 - 36146418
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaatta------------gag-ttctcttgggttgggaa 167  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||| ||||            ||| |||||||||||||||||    
T  36146725 agagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagtgttgagggtctttgattatggttttcttgagaggttctcttgggttgggaa 36146626  T
Q  168 acatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||| ||||||| |    
T  36146625 acatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagtttgttatttgtgagc 36146527  T
Q  265 ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |    
T  36146526 ttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-t 36146429  T
Q  365 tggaccgaact 375  Q
    |||||||||||    
T  36146428 tggaccgaact 36146418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 80 - 326
Target Start/End: Original strand, 31518659 - 31518905
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  31518659 gagagcttcaagagaggaaaactttggaaatcaaaggagataactttagggttaagggtctttgattatggttcttttgggttggaaaacatcgtaaaca 31518758  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||| |    
T  31518759 ccttgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaata-ggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttattgaagctagt 31518857  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtgga 326  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31518858 ttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48599558 - 48599335
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  48599558 gttgggaaacaattgtaaacaccttggaggagtgaaaatcat-gattgtcttgttcattggtgatattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 48599461  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  48599460 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttggaagagctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcaga 48599361  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48599360 tcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8359547 - 8359316
Alignment:
Q  154 tcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt 251  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  8359547 tcttgagttggaaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggggagattgggaaaatg-ggtagaaattagggtt 8359450  T
Q  252 gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctcca 350  Q
     |||||||||| |||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8359449 tttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 8359350  T
Q  351 gagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  8359349 gagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Original strand, 24789706 - 24790010
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaaca 170  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  24789706 tttgaaggagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaaca 24789803  T
Q  171 ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtc 269  Q
    | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       || ||||||||||||   |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24789804 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtaagattgggaaaag--ggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc 24789894  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789895 aaagctaatttcttgtaaca-ttttgtatcccttttgtaaaaactctttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 24789993  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||    
T  24789994 ccgaactgggtgaacaa 24790010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2361196 - 2360992
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  2361196 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 2361099  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  2361098 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattagg 2360999  T
Q  358 tcaagtt 364  Q
    |||||||    
T  2360998 tcaagtt 2360992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Original strand, 6431915 - 6432130
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  6431915 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatg-ggtagaaattaggattgttctt 6432012  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6432013 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtagg 6432112  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  6432113 tcaag-ttggaccgaactg 6432130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24526201 - 24525992
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24526201 gagagcttcaagagagaaaaactagggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattatggttctcttaggttgggaaacattgtaaaca 24526102  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg-gttgttctttgtgaacttgtcatagctaa 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24526101 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaaattggg-aaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaa 24526003  T
Q  278 tttcttgtaac 288  Q
    |||||||||||    
T  24526002 tttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4508930 - 4508707
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  4508930 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttgattggtgagattgggaaaa--tgagtagaaattagggttgttct 4508834  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||||| ||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  4508833 ttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtag 4508734  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  4508733 gttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 382
Target Start/End: Original strand, 29608680 - 29608902
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  29608680 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagcgaaacttcatgagtgtcttgttctttggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 29608778  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  29608779 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtagg 29608878  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  29608879 tcaag-ttggaccgaactgagtgaa 29608902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4538828 - 4538627
Alignment:
Q  96 agaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| || | || |||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4538828 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaattttaaggttgagagtctttgattagaattctcttgggttgggaaaaattgtaaacaccttgggtgagtgaaa 4538729  T
Q  195 atcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccctttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| || |   ||||||||||||||||||| |||    
T  4538728 atcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaattttttaagctaatttcttgtaacccattt 4538630  T
Q  295 gta 297  Q
    |||    
T  4538629 gta 4538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 20343776 - 20344065
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  20343776 gaagagagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 20343874  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
      || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20343875 aaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttg 20343964  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaa 382  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20343965 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 20344062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 3258938 - 3259162
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  3258938 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaactagggttgttctt 3259036  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3259037 tgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 3259136  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  3259137 tcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12098175 - 12097877
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt-------------ctcttgggttgggaa 167  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||             |||||||||||||||    
T  12098175 agagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttttcttgagaggttctcttgggttgggaa 12098076  T
Q  168 acattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 266  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12098075 acattgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggttagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagctt 12097977  T
Q  267 gtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 366  Q
    ||   || |||||||||||||||| |||||||||||       ||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  12097976 gttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct-------aactctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaag-ttg 12097886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 375
Target Start/End: Original strand, 2390226 - 2390440
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2390226 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagcgaaaatcata-agtgtcttgttcattggtgaaattcg-aaaaatgggtagaaattagggttgttctt 2390323  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2390324 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcatatatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 2390423  T
Q  358 tcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  2390424 tcaag-ttggaccgaact 2390440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 374
Target Start/End: Original strand, 23343840 - 23344130
Alignment:
Q  82 gagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacac 180  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||  || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||  ||||||    
T  23343840 gagcttcaagaaagagaatcttgggaaatcaaaggatgtaactttagggtcgagagtctttgattagggttctcttaggtttggaaacatttcaaaacac 23343939  T
Q  181 ctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaatt-agggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||   |||||||    
T  23343940 cttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctagttcattggtgagatttgg--aaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaat 23344037  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 374  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344038 ttcttgtaaccctttagtatatctttgtgagaactcattgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagtaggtcaag-ttggaccgaac 23344130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36574811 - 36574525
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacacctt-ggt 186  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  36574811 aagagagagaaaattgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgacggtctttgatgagggttctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttaggt 36574712  T
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaatt-agggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgt 285  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||| ||  |||||||||||||  ||||   ||||||||||||||    
T  36574711 gagtgaaaattatcgagtgtcttgtttattggagagattggggaaa---ggtagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgt 36574615  T
Q  286 aacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  36574614 aacccttttatatctctttgtaaagaactcattgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-tttggaccaaactg 36574525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4510772 - 4510549
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  4510772 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatg-ggtagaaattaaggttgttctt 4510675  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    |||||  || |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||  ||||||||    
T  4510674 tgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtagg 4510575  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  4510574 tcaag-ttggaccgtactgggtgaaca 4510549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4512614 - 4512391
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  4512614 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatg-ggtagaaattaaggttgttctt 4512517  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    |||||  || |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||  ||||||||    
T  4512516 tgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtagg 4512417  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  4512416 tcaag-ttggaccgtactgggtgaaca 4512391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 248 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32358190 - 32358055
Alignment:
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    |||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32358190 ggttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 32358091  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32358090 ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18389043 - 18388759
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  18389043 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 18388946  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18388945 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 18388858  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18388857 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 18388759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18392479 - 18392195
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  18392479 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 18392382  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18392381 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 18392294  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18392293 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 18392195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22328622 - 22328398
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt----cattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-g 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |    
T  22328622 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagggaatgaaaatcattgagtgtcttgtttgttcattagagagattgggaagaaaggttagaaattagagtttg 22328523  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccag 351  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  22328522 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatcaatctctcccctag 22328423  T
Q  352 agtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||   |||||||||||||    
T  22328422 agtaggtcattgttggaccgaactg 22328398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6592623 - 6592339
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  6592623 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 6592526  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6592525 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaatg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 6592438  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6592437 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6592339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6594841 - 6594557
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  6594841 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 6594744  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6594743 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 6594656  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6594655 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6594557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759207
Alignment:
Q  242 aattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 2759240  T
Q  342 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2759239 tcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 2759207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32060576 - 32060321
Alignment:
Q  126 tagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 223  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  32060576 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 32060485  T
Q  224 ttgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctc---tttggaa-gaactcatt- 317  Q
    ||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |   |||| || |||||||||     
T  32060484 ttgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccctttttgtaaagaactcattt 32060389  T
Q  318 gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32060388 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa 32060321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 4179019 - 4179082
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4179019 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttacattcactttgttattggttactactt 4179082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 48409053 - 48409116
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48409053 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttactactt 48409116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Original strand, 6570439 - 6570561
Alignment:
Q  61 ttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttggg 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| || | ||||||||| || || |||||| | ||| |||||||||||    
T  6570439 ttctttgcatattttgaaggagagcttaaagaggggaaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttaggattgagtgtctttgactagggttctcttggg 6570538  T
Q  161 ttgggaaacattgtaaacacctt 183  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  6570539 gtgggaaacattgtaaacacctt 6570561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 223 - 376
Target Start/End: Original strand, 31518911 - 31519062
Alignment:
Q  223 attgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatag 322  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |   |||| | |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31518911 attgggaaaata-ggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagct-agttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacag 31519008  T
Q  323 tggattagagagttcaatctctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31519009 tggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 31519062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6360064 - 6359952
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||    
T  6360064 agctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttggatcg 6359966  T
Q  372 aactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| || |||||    
T  6359965 aactgggtcaacaa 6359952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 49092089 - 49092000
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49092089 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 49092000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21989308 - 21989139
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||     
T  21989308 aaaatgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaag 21989210  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | ||||||||| || || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21989209 gaggtaactttaggtttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 21989139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 46516005 - 46516171
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||   |||| |    
T  46516005 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggggagctt--agagagagaaactt-ggattacaaagg 46516101  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46516102 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgg 46516171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1560749 - 1560674
Alignment:
Q  302 tttggaagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560749 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 1560674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25766879 - 25766816
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25766879 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcgctcactttgttattggttactactt 25766816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3904851 - 3904625
Alignment:
Q  151 ttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  3904851 ttctcttgagttaagaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgggaaaa--tggtagaaattag 3904755  T
Q  248 ggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctc 345  Q
    | || |||||||| || | | |   |  |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  3904754 gttttgttctttgagagcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtg-atcagagagatcaatctctc 3904656  T
Q  346 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |  ||||||||||||   |||||||||||||    
T  3904655 cctcagagtaggtcattgttggaccgaactg 3904625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 39731617 - 39731680
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39731617 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttgttattggttactactt 39731680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5514243 - 5514125
Alignment:
Q  151 ttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaatta-g 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||| |    
T  5514243 ttctcttgggttgggaaacacttgtaaacaccttcgatgagtgaaaatcattgagtttcttgttcatttgagagatt--gaaaaaagagtagaaattatg 5514146  T
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
      ||||||||||||| |||||    
T  5514145 ttttgttctttgtgagcttgt 5514125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24525594 - 24525522
Alignment:
Q  292 tttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24525594 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagtt 24525522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 23555287 - 23555350
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  23555287 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 23555350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 25616101 - 25616164
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  25616101 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 25616164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 35854162 - 35854225
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  35854162 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttactactt 35854225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2479702 - 2479567
Alignment:
Q  51 tatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattaga 149  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||   | |||| || | |||||||||||| || |||||||    ||    
T  2479702 tatataagtgttcttgtgcagattttggagaagagcttgaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtgtctttatagtga 2479604  T
Q  150 gt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479603 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 2479567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30843467 - 30843366
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||  |||| |||||||    
T  30843467 gttctcttgggttgagaaacatttgtaaacaccttagatgagttaaaatcattgagtatcttgttcattggagagattgagtaaaa--ggtataaattag 30843370  T
Q  248 ggtt 251  Q
    ||||    
T  30843369 ggtt 30843366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20284456 - 20284320
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aatt 146  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||   || ||| || | |||||||||||| || ||||||  | |     
T  20284456 ctatataagtgtttctttgcaaattttgaaggagagttttgagagagagaaacttggattat-aaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 20284358  T
Q  147 agagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284357 ag-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 20284320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 27348063 - 27348126
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27348063 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttgctactt 27348126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 43864490 - 43864553
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  43864490 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattgattaccactt 43864553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 48491822 - 48491885
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  48491822 attagatctaggcgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 48491885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1360353 - 1360230
Alignment:
Q  182 ttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaattt 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||| | ||||||||   ||| |||||    
T  1360353 ttggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcatggaatgagattgggaaaaa--ggtagaaattaggttttgtcttggagaacttgttgaagcgaattt 1360257  T
Q  281 cttgtaaccc--ttttgtatctctttg 305  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1360256 cttgtaacccttttttgtatctctttg 1360230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 44847822 - 44847991
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttc-atattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||   || |||     
T  44847822 aaaacgtggcacgattttatcagctgaagacggctatataagtgttcttgtgtagattttggtgaagagcttgaagagagagaaacttggattat-aaag 44847920  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || ||||||  | | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44847921 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 44847991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 18126892 - 18126955
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  18126892 attagatctaggtgttgttattcttgattattgcttgtgttcactttgatattgattactactt 18126955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 26417562 - 26417625
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  26417562 attatatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtggttactttgatattggttactactt 26417625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 29991299 - 29991362
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  29991299 attagatctaggtgttgttattgttgattattacttgtgctcactttgatattggttactactt 29991362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 385
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814604
Alignment:
Q  310 aactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 48489677 - 48489740
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  48489677 attagatctaggtgttgttattgttgattattgctcatgttcactttgatattggttactactt 48489740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1562291 - 1562103
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  1562291 gaagagagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 1562194  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
     ||| |||  |||||||||||||||       |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  1562193 agagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattggg--aaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttg 1562106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 2759121 - 2759071
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaaga 92  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2759121 gaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaaga 2759071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 18396392 - 18396478
Alignment:
Q  291 ttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  18396392 ttttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactg 18396478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 79788 - 79699
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    |||| ||||||||||| |||| |  ||||||  ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79788 aaaatgtgacacgattctgacagttgaagactactatatatgtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 79699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Original strand, 33332152 - 33332316
Alignment:
Q  23 gtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagc 120  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||   |||| || |     
T  33332152 gtgacacgattttgacagttgaagactgctatattagtgtttctttgcagattttgaaggagagctttgagagatagaaactt-ggattacaaaggaggt 33332250  T
Q  121 aactttagggtttagggtcttt-aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||| || || |||  | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33332251 aactttagggttgagtgtttttgtagtaaggttctcttgggttgagaaacattgtaaacatcttgg 33332316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3047622 - 3047500
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt--taatt 146  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| || | |||||||||||| || |||||  || |     
T  3047622 ctatataagtgtttcagttcagattttgaagaagagctttaagagagagaaacttgggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 3047523  T
Q  147 agagttctcttgggttgggaaaca 170  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  3047522 ag-gttctcttgggttgggaaaca 3047500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 346
Target Start/End: Original strand, 5116663 - 5116735
Alignment:
Q  275 taatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  5116663 taatttattgtaaaccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagagataaatctctcc 5116735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 21983643 - 21983595
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctt 65  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21983643 aaaacgtgacacgattttgaccgctgaagacagctatataagtgttctt 21983595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 4586407 - 4586470
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||    
T  4586407 attagatctaggtgttgttattgtttattattgcttgtgttcactttgaaattggttaccactt 4586470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 9185005 - 9185040
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185005 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9185040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 9189838 - 9189873
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9189838 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9189873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 23402844 - 23402879
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402844 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 23402879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 41648935 - 41648873
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  41648935 attagatctaggtgctgctattgttg-ttattgcttgtgttcactttgatattagttactactt 41648873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 9235414 - 9235448
Alignment:
Q  151 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9235414 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9235448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 360
Target Start/End: Original strand, 26639254 - 26639469
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaatta 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||  | ||  ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26639254 gttctcttgcgttgggaaacatttgtaaacactttaggtgagt-aaaatcattgagtctcttctttttgggaagagattgtgaaaa--tggtagaaatta 26639350  T
Q  247 gggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctct----ttggaag-aactcattgatagtggattagagagttcaatc 341  Q
    ||  ||||||| | ||  ||||    | |||||||||||||||||||||||| | |    ||| ||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  26639351 ggtatgttcttggagagtttgttgatgttaatttcttgtaacccttttgtatatatatcattgtaaataactctttgataatggattagagagatcaatc 26639450  T
Q  342 tctcctccagagtaggtca 360  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  26639451 tctcctccatagtatgtca 26639469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5513771 - 5513676
Alignment:
Q  280 tcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | || ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5513771 tcttataacccttttatatctctttgtaaagaactcattgacactgaattggagaat-caatctcacctccagagtaggtcaa-tttggactgaactg 5513676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2580744 - 2580621
Alignment:
Q  61 ttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttggg 160  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |   |||| || | |||||||||||| || ||||||   |   |||||||||||    
T  2580744 ttctttgcagattttgaagtagaggttttagagagagaaacttgg-attgcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtgtgaggttctcttggg 2580646  T
Q  161 ttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  2580645 ttggaaaacattgtaaacaccttgg 2580621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Original strand, 2647395 - 2647483
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  2647395 aaacgtgatacgattttgagagctgaagactgctataaaagtgttcttgtgcagattttgaaggagagattttagagagagaaacttgg 2647483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31732876 - 31732828
Alignment:
Q  477 tgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  31732876 tgttattgttgattattgcttgtgttcactttgaaattggttactactt 31732828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 495909 - 495847
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||||||||||||    
T  495909 attagatctaggtgttgttattgttg-ttattgtttgtgtttactttgatattggttactactt 495847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 41317360 - 41317298
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  41317360 attagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttactactt 41317298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43363627 - 43363556
Alignment:
Q  231 aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctct 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||   | ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43363627 aaaatggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctct 43363556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 47676058 - 47675996
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  47676058 attagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttactactt 47675996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Original strand, 4796501 - 4796534
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796501 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 4796534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 385
Target Start/End: Original strand, 24748840 - 24748884
Alignment:
Q  340 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24748840 tctctcctccagattaggtcaa-tttggaccgaactgagtcaacaa 24748884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35961078 - 35961050
Alignment:
Q  155 cttgggttgggaaacattgtaaacacctt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961078 cttgggttgggaaacattgtaaacacctt 35961050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 111)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 20762465 - 20762831
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20762465 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaa 20762564  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20762565 atcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatct 20762664  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20762665 tgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaa 20762764  T
Q  309 gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20762765 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaact 20762831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 385
Target Start/End: Original strand, 3206785 - 3207155
Alignment:
Q  14 gggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3206785 gggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttctttgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaa 3206884  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 213  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3206885 aggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttc 3206984  T
Q  214 attggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaact 313  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  3206985 attggtgagatttgg-aaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaact 3207083  T
Q  314 cattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3207084 cattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3207155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Original strand, 3189137 - 3189499
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagca 121  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  3189137 cgtgacacaatttggacgctgaagattgctatataagtgttctttgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggta 3189236  T
Q  122 actttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtga 221  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3189237 actttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtga 3189336  T
Q  222 gattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgata 321  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3189337 gatttgg-aaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgata 3189435  T
Q  322 gtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3189436 gtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3189499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Original strand, 3197954 - 3198316
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagca 121  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  3197954 cgtgacacaatttggacgctgaagattgctatataagtgttctttgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggta 3198053  T
Q  122 actttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtga 221  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3198054 actttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtga 3198153  T
Q  222 gattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgata 321  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3198154 gatttgg-aaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgata 3198252  T
Q  322 gtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3198253 gtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3198316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28220593 - 28220226
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28220593 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 28220494  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28220493 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaagcattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcat 28220394  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28220393 tggtgagattcgg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 28220295  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  28220294 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 3156667 - 3157033
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3156667 aaaacgtaacacaattttgacagctgaagactgttatataagtgttctttgcagattttgaaggagagctggaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 3156766  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156767 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 3156866  T
Q  217 ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcat 316  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3156867 ggtgagattgag-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcat 3156965  T
Q  317 tgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  3156966 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28223788 - 28223421
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28223788 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 28223689  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28223688 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgaagacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 28223589  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28223588 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattatggttgatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 28223490  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  28223489 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 31659039 - 31659406
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31659039 aaaatgtgacacgattttgacagttgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgagagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 31659138  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31659139 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 31659238  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  31659239 tggtgagatt-ggaaaaatgggtagaaattagggctgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactta 31659337  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  31659338 ttgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Original strand, 49918150 - 49918508
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49918150 aaaatgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 49918249  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaa-caccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 214  Q
    | | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49918250 aggtaactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattataaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 49918349  T
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 314  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactc 49918448  T
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  49918449 attgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaact 49918508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37503921 - 37503577
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37503921 aaaacgtgacacgatttttacagctgaagactgatatataagtgttctttgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 37503822  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37503821 aggtgactttagggttgagggtctttgattagagttctattgggttggaaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 37503722  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  37503721 tggtgagattggg-aaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctctttgtaagaactca 37503626  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  37503625 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagtt 37503577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 10925024 - 10925394
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10925024 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggaaaatcaaagg 10925123  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925124 aggtaactttagggttgagggtctttgattatagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 10925223  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg---gaagaa 311  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||    
T  10925224 tggtgagatt--gaaaaaatggatagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaagaa 10925321  T
Q  312 ctcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
     |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||    
T  10925322 ttcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagattaggtaaag-ttggatcgaactgggtcaacaa 10925394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Original strand, 1833323 - 1833667
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1833323 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactcctatataagtattctttgcagattttgaatgagagattgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 1833422  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    |   ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833423 agataactttaaggttgagggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 1833522  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  | |   |||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  1833523 tggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactca 1833621  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaa 361  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1833622 ttgatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Original strand, 44454993 - 44455319
Alignment:
Q  50 ctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag 148  Q
    |||| ||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44454993 ctatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagagagaaacttggtaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattag 44455092  T
Q  149 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  44455093 agttttcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattag 44455191  T
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  44455192 ggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 44455291  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44455292 ccagattaggtcaagttt-gaccgaactg 44455319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Original strand, 51765234 - 51765566
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-tt 152  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51765234 taagtgttcttgtgcagattttgaagg-gagttggaagagtgagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtctttgattagagctt 51765332  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51765333 ctcttgggttgg-aaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttg 51765430  T
Q  253 ttc-tttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctcc 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51765431 tacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 51765530  T
Q  350 agagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  51765531 agagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaa 51765566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8551091 - 8550786
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8551091 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttaagaaacattgtaaaca 8550992  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  8550991 cattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 8550893  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8550892 ttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 8550793  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    |||||||    
T  8550792 tgaacaa 8550786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 30476815 - 30476446
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30476815 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaatg 30476716  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-- 213  Q
    | | ||  |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||      
T  30476715 atgtaatgttagggctgagggtatttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgggtgaaaatcattgagt-tcttgttcaa 30476617  T
Q  214 -attggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaac 312  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30476616 tattggtgagattgggaaaata-ggtagaaattagggttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaac 30476518  T
Q  313 tcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||| |||||| || || ||||||||| | ||| |  |||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  30476517 tcattgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 30476446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37560213 - 37559877
Alignment:
Q  40 cagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtc 139  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| |||| ||||||    
T  37560213 cagaagactcctgtataagtgttctttgcagattttgaagtaaagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttaaggttgagggtc 37560114  T
Q  140 tttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggt 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||    
T  37560113 tttgattagagttctcttgggtttgaaaacattgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattagg-aaaatgggt 37560015  T
Q  239 agaaattagggttgttctttgtgaacttg-tcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttc 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  37560014 agaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtgaattggagagatc 37559915  T
Q  338 aatctctcctcc-agagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37559914 aatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaact 37559877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 81 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50169513 - 50169219
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 180  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  50169513 agagcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggttttttattagggttatcttgggttgggaaacattgtaaatac 50169414  T
Q  181 cttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatt 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50169413 cttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatt 50169315  T
Q  280 tcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50169314 tcttgtaactcatttgtatctctttgtaagtactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactg 50169219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 834453 - 834167
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaat 196  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  834453 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgcgtgaaaat 834354  T
Q  197 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttg 295  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  834353 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaa--tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttg 834256  T
Q  296 tatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  834255 tatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 66 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23555583 - 23555267
Alignment:
Q  66 ttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttggg 165  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23555583 ttcattttttgagagagagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcagggttgaggatctttgattaaagttctcttgggttggg 23555484  T
Q  166 aaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaac 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555483 aaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaattattgagtgtcttattctttggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 23555385  T
Q  265 ttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||   | |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  23555384 ttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaag-t 23555287  T
Q  365 tggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  23555286 tggatcgaactgagtaaaca 23555267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 80 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3847425 - 3847131
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3847425 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtcgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 3847326  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||     
T  3847325 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtttaagctaaa 3847227  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3847226 tttttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 3847131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 81 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50167491 - 50167185
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg-------------ggttgggaa 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||             |||||||||    
T  50167491 agagcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaa 50167392  T
Q  168 acattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  50167391 acattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tagtagaaattagggttgttatttgtgagctt 50167293  T
Q  267 gtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 366  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  50167292 gtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttg 50167194  T
Q  367 gaccgaact 375  Q
    |||||||||    
T  50167193 gaccgaact 50167185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 197212 - 196916
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197212 gagaacttcaagagaggaaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 197113  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||    
T  197112 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgag-aaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagttaat 197014  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  197013 ttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 196916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 84 - 364
Target Start/End: Original strand, 15820175 - 15820455
Alignment:
Q  84 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt 183  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15820175 gcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaagaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgagttgggaaacattgtaaacacctt 15820274  T
Q  184 -ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttct 282  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  15820275 gggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgatatt-ggaaagatgggtaaaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttct 15820373  T
Q  283 tgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15820374 tgtaacacatttgtatctctttttaagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 81 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28265869 - 28265554
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattaga------------gttctcttgggttgggaaa 168  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||             |||||||| ||||||||||    
T  28265869 agagcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaggttctcttgaggggttctcttaggttgggaaa 28265770  T
Q  169 cattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28265769 cattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattgggaaaata-ggtagaaattagggttgttcattgtgagcttg 28265671  T
Q  268 tcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 367  Q
    |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  28265670 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgg 28265572  T
Q  368 accgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||| || |||||    
T  28265571 accgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4552941 - 4552637
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4552941 gagagcttcaagagaggagaacttgggaaattaaaggaggtaactttagggttgagggtctttaattgaggttctcttgggttgagaaacattgtaaaca 4552842  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||||    
T  4552841 ccttgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattaggtttgtcctttgtgagcttgttgaagctaat 4552743  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  4552742 ttcttgtaacccctttgtatccctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 4552644  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    | |||||    
T  4552643 tcaacaa 4552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13138286 - 13137976
Alignment:
Q  72 ttttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13138286 ttttgaggaagagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttggggtgggaaacat 13138187  T
Q  172 tgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||     
T  13138186 tgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg---aaaaatggatagaaatta-ggtcgttctttgtgagcttgtt 13138091  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 369  Q
      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||| | |||||||||| |  ||||||    
T  13138090 gaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattggac 13137992  T
Q  370 cgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||| || |||||    
T  13137991 cgaactgggtcaacaa 13137976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13316690 - 13316513
Alignment:
Q  12 tggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316690 tggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttctttgcagattttgaagatgagcttgaagagagagaaacttgggaaatc 13316591  T
Q  112 aaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316590 aaaggtagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 13316513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13316520 - 13316351
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316520 ttggtgagattgggaaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 13316422  T
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13316421 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 13316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 385
Target Start/End: Original strand, 46064773 - 46065086
Alignment:
Q  71 attttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaaca 170  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||  ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  46064773 atttttaaggagagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaagaaggtaactttattgttgagggtctttgattatggttctcttggggtggaaaaca 46064872  T
Q  171 ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||| || ||    
T  46064873 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaa--tggataaaaattaggtttgttctttgtgagctcgt 46064970  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46064971 tgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttgga 46065069  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
     ||||||| || |||||    
T  46065070 tcgaactgggtaaacaa 46065086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45644658 - 45644354
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 180  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  45644658 agagcttcaagagagaaaaactagggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttgattagggttctcttaggttggaaaacattgtaaacat 45644559  T
Q  181 cttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaa 277  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45644558 cttgggtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaa--tggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaa 45644461  T
Q  278 tttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactga 377  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  45644460 tttcttgcaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 45644362  T
Q  378 gtgaacaa 385  Q
    || |||||    
T  45644361 gtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13659621 - 13659336
Alignment:
Q  99 aacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg-agtgaaaatc 197  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13659621 aacttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 13659522  T
Q  198 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgta 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||| | |||||   |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  13659521 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacg-gatagaaattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttata 13659423  T
Q  298 tctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  13659422 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 11348642 - 11348865
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11348642 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggttgttctt 11348739  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11348740 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttctaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 11348839  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11348840 tcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 11348865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 37168241 - 37168465
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  37168241 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 37168338  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37168339 tgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 37168438  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37168439 gtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Original strand, 9987066 - 9987370
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaaca 170  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  9987066 tttgaaggtgagttggaagagagatagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaaca 9987164  T
Q  171 ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtca 270  Q
    | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9987165 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtct 9987255  T
Q  271 tagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 369  Q
     | ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987256 aatctaatttcttgcaacc-ttttgtatcccttttgcaagaactcattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 9987354  T
Q  370 cgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9987355 cgaactgggtgaacaa 9987370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13547312 - 13547090
Alignment:
Q  161 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  13547312 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttcttt 13547215  T
Q  259 gtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 358  Q
    |||| |||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13547214 gtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 13547115  T
Q  359 caagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  13547114 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13549223 - 13549001
Alignment:
Q  161 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  13549223 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttcttt 13549126  T
Q  259 gtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 358  Q
    |||| ||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13549125 gtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 13549026  T
Q  359 caagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  13549025 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 40282256 - 40282546
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  40282256 gaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 40282354  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
     ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||    
T  40282355 agagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttg 40282445  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaac 383  Q
    ||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40282446 taacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaac 40282544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20622523 - 20622236
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  20622523 agagagagacttgggaaatcaaatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 20622425  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacc 289  Q
     |||||||||||| |||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20622424 ggaaaatcattgactgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc 20622334  T
Q  290 cttttgtatctcttt---ggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
     ||||||||| ||||   | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20622333 -ttttgtatcccttttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 20622236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Original strand, 29136202 - 29136415
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29136202 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 29136299  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29136300 tgaagctaatttcttggaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 29136399  T
Q  369 ccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||||  |||||||    
T  29136400 ccgaactaggtgaaca 29136415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40122502 - 40122206
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  40122502 gagaggttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttatggttgaggatcattaattagagttatcttggattgggaaacattgtaaaca 40122403  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||   |||||||    
T  40122402 ccttgggtgagtaaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagatt-ggaaaaatgggtcgaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaat 40122304  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattg--atagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  40122303 ttcttataactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaact 40122206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 928264 - 927996
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaa 195  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  928264 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttatggttgaaggtctttgattaggattctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaa 928165  T
Q  196 tcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccctttt 294  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  928164 tcaatgagtgtcttgttctttggtgatattgg-aaaaaatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt 928066  T
Q  295 gtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| | |||  ||||||||||||    
T  928065 ggatctctttgtaaaaactcattaatagtggattagagagaccaacctcttccccaaggtaggtcaagtt 927996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47255535 - 47255340
Alignment:
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  47255535 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 47255438  T
Q  287 acccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  47255437 acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 42298188 - 42297974
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42298188 attgtaaacaccttgggagagtaaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgt 42298091  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  42298090 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttgga 42297991  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| ||||||||    
T  42297990 ccgaactgggtgaacaa 42297974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 373
Target Start/End: Original strand, 19754438 - 19754651
Alignment:
Q  160 gttgggaaacatt-gtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19754438 gttgggaaacattcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 19754536  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||    
T  19754537 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattagg 19754636  T
Q  358 tcaagtttggaccgaa 373  Q
    ||||| ||||||||||    
T  19754637 tcaag-ttggaccgaa 19754651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 47115115 - 47115340
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47115115 gttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggttgttctt 47115212  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47115213 tgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtag 47115312  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||   ||||||||||||| |||||||    
T  47115313 gtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37033297 - 37033071
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  37033297 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 37033200  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  37033199 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtag 37033100  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  37033099 gtcatggttggaccgaactgggtgaacaa 37033071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31925919 - 31925708
Alignment:
Q  171 ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 269  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||     
T  31925919 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagagtgg-aaaaatgggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgtt 31925822  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 369  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31925821 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggac 31925723  T
Q  370 cgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||  |||||||    
T  31925722 cgaactaggtgaaca 31925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 381
Target Start/End: Original strand, 21053837 - 21054123
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  21053837 gaagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 21053935  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
     |||  |||||||||||||||||||       |||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  21053936 agagaaaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagt--gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttg 21054026  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
     |||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21054027 caacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 21054123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 375
Target Start/End: Original strand, 34603519 - 34603735
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34603519 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattg--aaaaaatgggtagaaattagggttgttct 34603616  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagta 355  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  34603617 ttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctctttgtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagta 34603716  T
Q  356 ggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  34603717 ggtcaag-ttggaccgaact 34603735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 385
Target Start/End: Original strand, 9036298 - 9036585
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggt 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||      
T  9036298 aagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta 9036395  T
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgt 285  Q
     || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9036396 aagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttgt 9036485  T
Q  286 aacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9036486 aacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 9036584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 158 - 360
Target Start/End: Original strand, 41360857 - 41361058
Alignment:
Q  158 gggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttct 256  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  41360857 gggttgggaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttct 41360954  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||||| |||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  41360955 ttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtag 41361054  T
Q  357 gtca 360  Q
    ||||    
T  41361055 gtca 41361058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 193555 - 193778
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  193555 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagggtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 193652  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    | | | |||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  193653 tattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatg 193752  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  193753 tcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7482445 - 7482231
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7482445 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtattgttcattggtgagattgggtaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 7482347  T
Q  269 catagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 367  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7482346 ttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttgg 7482248  T
Q  368 accgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||  |||||||    
T  7482247 accgaactaggtgaaca 7482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 375
Target Start/End: Original strand, 19752643 - 19752844
Alignment:
Q  173 gtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       
T  19752643 gtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcgagcttgttga 19752741  T
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 371  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||    
T  19752742 agctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccg 19752840  T
Q  372 aact 375  Q
    ||||    
T  19752841 aact 19752844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 44203517 - 44203801
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  44203517 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 44203614  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44203615 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 44203702  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44203703 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 44203801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 16455591 - 16455750
Alignment:
Q  184 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggt-agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||  || ||||  |||| |||||   |||||||||||    
T  16455591 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaa--tggtgagaaattagattttttcta-gtgagcttgttgaagctaatttct 16455687  T
Q  283 tgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16455688 tgtaacccatttgtatctctgtgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Original strand, 22079330 - 22079461
Alignment:
Q  230 aaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggatt 328  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  22079330 aaaaatggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattgatattggatt 22079429  T
Q  329 agagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
     ||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  22079430 ggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37879135 - 37879006
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37879135 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaata-ggtagaaattagggttgttctt 37879038  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacc 289  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  37879037 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 37879006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37282923 - 37282701
Alignment:
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgt-aaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg- 249  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||     
T  37282923 ctcttgggttggaaaacttttttaaacaccttgtatgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggagagattg---aaaaatggtataaattagggt 37282827  T
Q  250 ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctc 348  Q
    |||||| |||||| |||||   ||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||     
T  37282826 ttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagataaatctctcctt 37282727  T
Q  349 cagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
      ||||||||||| ||||||| |||||    
T  37282726 tggagtaggtcaa-tttggactgaact 37282701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3282109 - 3281938
Alignment:
Q  16 gaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||    
T  3282109 gaaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttatgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaa 3282011  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | || | ||||||| |||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3282010 atgaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3281938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44650454 - 44650172
Alignment:
Q  94 agagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtg 191  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||   || ||||||| | || ||||||  | || ||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44650454 agagagacttgggaaatcaaaggagaaaattttagggatgagagtctttggtgagggttctcttaagttggaaaacatttgtaaacactttgggtgagtg 44650355  T
Q  192 aaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaatta-gggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||| |||||| || |||||||||||||  |||| |  |||||||| ||||||  |    
T  44650354 aaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaa--tgtaaaaattatggtttgttctttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaaatc 44650257  T
Q  291 ttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 375  Q
    |||| ||||||||||  || || ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||    
T  44650256 ttttatatctctttgtaaataattcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagtaggtcaa-tttggaccgaact 44650172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13316274 - 13316211
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13316274 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattgattactactt 13316211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 21536267 - 21536436
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||     
T  21536267 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaag 21536365  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21536366 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttgg 21536436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 384
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242472
Alignment:
Q  293 ttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Original strand, 2926522 - 2926653
Alignment:
Q  230 aaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggatt 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||| | || |||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  2926522 aaaaatggtagaaattaggtttgtgcttgaagaacttgttaaagttaatttattgtaacctttttgcatctctttgaaacgaattcattggtagtggatt 2926621  T
Q  329 agagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
     ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  2926622 ggagagatcaatctcttctgcagagtaggtca 2926653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 3157111 - 3157174
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  3157111 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 3157174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13598799 - 13598631
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||| |    
T  13598799 aaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaaatt-ggattacaaagg 13598701  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | ||||||| |||| || |||||  || | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13598700 aggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttgg 13598631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 20762914 - 20762977
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  20762914 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgaattcactttgatattggttaatactt 20762977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29652212 - 29652044
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||| |    
T  29652212 aaacgtgacatgattttgacagctgaagactgctatataagtgtttttgtgcagattttgaaggagagcttgaaaagagagaaactt-ggattacaaagg 29652114  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29652113 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 29652044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37876865 - 37876767
Alignment:
Q  285 taacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  37876865 taacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 463 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37559786 - 37559724
Alignment:
Q  463 ttagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  37559786 ttagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 37559724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8871259 - 8871129
Alignment:
Q  171 ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  8871259 ttgtaaacaccttggatgagcgaaaatcat--agtgtcttgttcttttgtgagatttggaaaa--tggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgt 8871164  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8871163 tgaagctaatttcttgtaaccattttgtaactctt 8871129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8550706 - 8550643
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  8550706 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 8550643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 49918596 - 49918659
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  49918596 attagatataggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 49918659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 384
Target Start/End: Original strand, 36683694 - 36683847
Alignment:
Q  219 tgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattg 318  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||||   ||||||||||||||||| | ||||||          |||||||||||    
T  36683694 tgagattgggaaaata-ggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta----------agaactcattg 36683782  T
Q  319 atagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  36683783 atagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactgagtaaaca 36683847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 358
Target Start/End: Original strand, 6808418 - 6808595
Alignment:
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt------gttctttgtgaacttgtcatagctaatt 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| || |||  |||||||||||||| ||      |||||| | || |||||   |||||| |    
T  6808418 gagtgaaaattattgagtgtcttgttcatgagtagagattagggaaa--tggtagaaattaggattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaact 6808515  T
Q  280 tcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 358  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  6808516 tcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 13604319 - 13604488
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||     
T  13604319 aaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttggaggagagcttaaagagagagaaactt-ggattacaaag 13604417  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| ||  ||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13604418 gagggaactttagggttgagtatctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 13604488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 10925468 - 10925531
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  10925468 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattgattactactt 10925531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37070170 - 37069998
Alignment:
Q  15 ggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatca 112  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||   ||    
T  37070170 ggaaaatcgtgacataattttgacagctaaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagtagagctggaagagagagaaactt-ggattaca 37070072  T
Q  113 aaagaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || || | ||||||| |||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37070071 aaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 37069998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 44455406 - 44455469
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  44455406 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttaccactt 44455469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Original strand, 47102569 - 47102705
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aatt 146  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||   | |||| || | |||||||||||| || ||||||  | |     
T  47102569 ctatataagtgtttctttgcagattttgaatgagagcttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 47102667  T
Q  147 agagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47102668 ag-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 47102705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 51765645 - 51765708
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||    
T  51765645 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcacttaattagtggttactactt 51765708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 777095 - 777172
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg 158  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  777095 agagcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattagggttctcttg 777172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 361
Target Start/End: Original strand, 3460709 - 3460841
Alignment:
Q  230 aaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggat 327  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||| |||    
T  3460709 aaaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcgat 3460808  T
Q  328 tagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaa 361  Q
    | ||||| ||||| ||| | | ||||||||||||    
T  3460809 tggagagatcaatatcttc-ctagagtaggtcaa 3460841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Original strand, 47098555 - 47098691
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattag 148  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||   | |||| || | |||||||||||| || ||||||     |    
T  47098555 ctatataagtgtttctttgcagattttgaatgagagcttttagagagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagcg 47098653  T
Q  149 ag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47098654 aggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 47098691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9109610 - 9109459
Alignment:
Q  193 aaatcattgagtgtcttgttcattggt--gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||  ||| |||||||| | || | ||| | ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  9109610 aaatccttgagtgtcttgttcat-ggtaggagattgagaaaa--tggaagaaattaagtttttacttggagaacttgttgaagttaatttcttgtaaccc 9109514  T
Q  291 ttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctct 344  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  9109513 ttttgtatctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctct 9109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 334
Target Start/End: Original strand, 13938157 - 13938256
Alignment:
Q  236 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttggaagaa-ctcattgatagtggattagaga 333  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||| | |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13938157 ggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattggaga 13938255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22819785 - 22819662
Alignment:
Q  61 ttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttg 158  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    |||| || | ||||||||| ||||| ||||||  | | || |||||||||    
T  22819785 ttctgttcaaattttgaaggagagtttgaagagaga--aacttgggtttacaaaggaggtaactttaggatttagtgtctttgtagtgag-gttctcttg 22819689  T
Q  159 ggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22819688 ggttgggaaacattgtaaacaccttgg 22819662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 31659484 - 31659547
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  31659484 attagatcaaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcattttgatattggttactactt 31659547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 197
Target Start/End: Original strand, 777177 - 777225
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  777177 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatc 777225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 106
Target Start/End: Original strand, 9022653 - 9022693
Alignment:
Q  66 ttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9022653 ttcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggg 9022693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12318721 - 12318585
Alignment:
Q  184 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttct 282  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||    ||||||||||||| |||||| | | || |||||   |||||||||||    
T  12318721 ggtgagtgaaa-tcattgagtttcttgttcatgggtagagatttggaaatg--ggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttct 12318625  T
Q  283 tgtaacccttttgtatctctt-tggaagaactcattgata 321  Q
    ||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  12318624 tgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcattgata 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 334
Target Start/End: Original strand, 32471481 - 32471579
Alignment:
Q  236 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtggattagagag 334  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||  | | || |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32471481 ggtataaattaggtttgttctttgagaactgttga-agttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattcgagag 32471579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32889805 - 32889669
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aatt 146  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |   |||| || | |||||||||||| || ||||||  | |     
T  32889805 ctatataagtgtttctttgcatattttgaagtagagattttagagagagaaacttgg-attgcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 32889707  T
Q  147 agagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32889706 ag-gtttttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 32889669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44646981 - 44646934
Alignment:
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  44646981 tgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaa 44646934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2263084 - 2262974
Alignment:
Q  275 taatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||   || ||||||||   |||| |||||    
T  2263084 taatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatcaatctttcccttagggtaggtcattgttggtccgaa 2262985  T
Q  374 ctgagtgaaca 384  Q
    |||||| ||||    
T  2262984 ctgagtaaaca 2262974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 26644594 - 26644763
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaa-ggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaa 114  Q
    |||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   | ||||    
T  26644594 aaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttatgcagattttgaaaggagagcctgaagagagagaaacttggatta-caaa 26644692  T
Q  115 agaagcaactttagggtttagggtcttta-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 184  Q
     ||   || ||||||||| || ||||||  | |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26644693 ggagataattttagggttgagtgtctttgtagtgaagatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 26644763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 356
Target Start/End: Original strand, 5459962 - 5460046
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||    
T  5459962 agctaatttcttgtaaca-ttttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Original strand, 16124347 - 16124380
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124347 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 16124380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8871130 - 8871063
Alignment:
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  8871130 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaag-ttggaccgaattgagtaaaca 8871063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 37503479 - 37503427
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttatt 514  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  37503479 attagatctaggtgttgatattgttgattattgcttgtgttcactttgatatt 37503427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 834091 - 834029
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  834091 attagatcttggtgttgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttgatattggttactactt 834029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16914281 - 16914234
Alignment:
Q  278 tttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtg 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16914281 tttcttctaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28223343 - 28223281
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  28223343 attagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttactactt 28223281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 40122126 - 40122060
Alignment:
Q  458 ctaaattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  40122126 ctaaattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcacttagatattggttactactt 40122060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 183
Target Start/End: Original strand, 9022737 - 9022770
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt 183  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9022737 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctt 9022770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 324
Target Start/End: Original strand, 25652142 - 25652195
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtg 324  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  25652142 agctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4535589 - 4535541
Alignment:
Q  276 aatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagt 323  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4535589 aatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagt 4535541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Original strand, 6484023 - 6484075
Alignment:
Q  160 gttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6484023 gttgggaaacattctaaacattttgatgagtaaaaatcattgagtatcttgtt 6484075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 43342556 - 43342468
Alignment:
Q  84 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt 172  Q
    |||| |||||||||||| || |||||  ||| || | |||||| ||| | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43342556 gcttcaagagagagaaagttaggaaactaaaggatgtaacttttgggatgagggtctttggtgagagttctcttcggttgggaaacatt 43342468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 56179006 - 56178636
Alignment:
Q  14 gggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 113  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56179006 gggaaaaatgtgacacgatttcgacgctgaagactgttatataagtgttctttgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 56178907  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 213  Q
    | || | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178906 aggaggtaactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 56178807  T
Q  214 attggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaact 313  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56178806 attggtgagattggga-aaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaact 56178708  T
Q  314 cattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56178707 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 56178636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5370462 - 5370082
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaa-cgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggga 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5370462 gattggggaaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagacaactatataagtgttctttgcagattttgaaggagaacttgaagagagagaaacttgaga 5370363  T
Q  108 aatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 207  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5370362 aatcaaaggagacaactttagggtttagggtctttgattatagttctcttgggctgggaaacattgtaaacactttggtgagtgaaaatcattgagtgtc 5370263  T
Q  208 ttgttcattggtgagattgggaaaaaa--tggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc-atagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 304  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5370262 ttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 5370163  T
Q  305 ggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5370162 gtaagaactcattgatagtggactagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 5370082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30000180 - 29999806
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30000180 gattggggaaaaatgtgacacgatttcgacgctgaagattgctatataagtgttttttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 30000081  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 208  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30000080 atcaaaggagacaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtct 29999981  T
Q  209 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatc-tctttgga 307  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |    
T  29999980 tgttcattggtgagattggg--aaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgta 29999883  T
Q  308 agaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29999882 agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29999806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 48142834 - 48143212
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaag-gagagcttgaagagagagaaacttggga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48142834 gatttgggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagtctgctatataagtgttctttgcagtttttgaagagagagctagaagagagagaaacttggga 48142933  T
Q  108 aatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgt 206  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48142934 aatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgt 48143033  T
Q  207 cttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  48143034 cttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcat 48143133  T
Q  307 aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48143134 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaa 48143212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 52095729 - 52095362
Alignment:
Q  15 ggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaa 114  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095729 ggaaaaacgtgac--gatttcgacgctgaagactgctatataagtgttctttgtagattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaa 52095632  T
Q  115 agaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 213  Q
     || | |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095631 ggaggtaactttagggttgagggactttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 52095532  T
Q  214 attggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaact 313  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  52095531 attggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaat 52095433  T
Q  314 cattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  52095432 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaa 52095362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 37740427 - 37740793
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37740427 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 37740526  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
    | | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37740527 aggtaagtttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcatt 37740626  T
Q  217 ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcat 316  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37740627 ggtgagatttgg-aaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcat 37740725  T
Q  317 tgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  37740726 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgtgtcaacaa 37740793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12739917 - 12739550
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12739917 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttacagattttgaagtggaggttgaagagagagaaacttgagaaatcaaagg 12739818  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12739817 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcat 12739718  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 314  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  12739717 tggtgagattggg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactc 12739620  T
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12739619 attgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26176003 - 26175636
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26176003 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 26175904  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26175903 aggtaactttagagttgagggtctttgattaaagttctgttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 26175804  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26175803 tggtgagattggg-aaaatggggagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 26175705  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  26175704 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9927799 - 9927458
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt 141  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||    
T  9927799 gaagactgctaaataagtgttctctgcagattttgaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctt 9927700  T
Q  142 taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtaga 241  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  9927699 tgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattggg-aaaatgggtaga 9927601  T
Q  242 aattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9927600 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatc 9927501  T
Q  342 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9927500 tctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa 9927458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 5429481 - 5429847
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaaga 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5429481 aaaacatgacacgattttgacgctgaaaactgctatataagtgttctttgcagaccttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagga 5429580  T
Q  118 agcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 216  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429581 agtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 5429680  T
Q  217 ggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  5429681 ggtgagattggg--aaaatgagtagaaattagggttattcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactca 5429778  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  5429779 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13992616 - 13992292
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagt-t 152  Q
    ||||||||||| | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13992616 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggtctttgattagagtct 13992517  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13992516 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttg 13992424  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccaga 352  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13992423 ttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctc-ttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 13992325  T
Q  353 gtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13992324 gtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaa 13992292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 52083032 - 52082663
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52083032 gatttgggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagactcctatataagtgttctttgcaaattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaa 52082933  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtc 207  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52082932 atcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtc 52082833  T
Q  208 ttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgga 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  52082832 ttgttcattggtgagattggg-aaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgta 52082734  T
Q  308 agaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| || |||||||||       ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  52082733 agaaatctttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaa 52082663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34570781 - 34570414
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  34570781 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactactatatatgtgttctttgcagattttgaaggagagctggaacagagagaaacttgggaaatcaaagg 34570682  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34570681 aggtagctttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 34570582  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  34570581 tggtgagattgggaaaata-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctctttgtaagaactca 34570483  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||    
T  34570482 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaa 34570414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12748123 - 12747794
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12748123 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttacagattttgaagtggaggttgaagagagagaaacttgagaaatcaaagg 12748024  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12748023 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcat 12747924  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 314  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  12747923 tggtgagattggg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactc 12747826  T
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12747825 attgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54200273 - 54199926
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  54200273 aaaatgtgacacgattttgatagctgaagactgctatataagtgttctttgtagtttttgaagaagagctgaaagagagagaaacttaggaaatcaaagg 54200174  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54200173 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 54200074  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 315  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54200073 tggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 54199975  T
Q  316 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54199974 ttgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagtt 54199926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12745799 - 12745476
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagc 120  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || |     
T  12745799 cgtgtcacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaagttgaggttgaagagagagaaacttgggaaaaaaaaggaggt 12745700  T
Q  121 aactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 219  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12745699 aactttagagttgagggtctttgattagagttctcttggtttgggaaacaatgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggc 12745600  T
Q  220 gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattga 319  Q
    |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12745599 gagattaggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattga 12745501  T
Q  320 tagtggattagagagttcaatctct 344  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    
T  12745500 tagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 385
Target Start/End: Original strand, 29254292 - 29254662
Alignment:
Q  15 ggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29254292 ggaaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgaaggtgaggttgtagagagagaaacttgggaaatcaa 29254391  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 212  Q
    | ||   |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29254392 aggagataactttagggttgaaggtctttgagtagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgtt 29254491  T
Q  213 cattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaac 312  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||   || |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29254492 cattggtgagattgggaaattg-ggtagaaattagagttgttttttatgagcttgttgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctctttgtaagaac 29254590  T
Q  313 tcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  29254591 tcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 29254662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 59 - 385
Target Start/End: Original strand, 36994368 - 36994692
Alignment:
Q  59 tgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg 158  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||    
T  36994368 tgttctttgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaacttttgg-ttgagggtctttgattagagttctcttg 36994466  T
Q  159 ggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
      |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  36994467 atttggcaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaaggttgttctt 36994565  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||     
T  36994566 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaga 36994665  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  36994666 tcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 36994692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Original strand, 5871684 - 5871988
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5871684 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttatgggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 5871783  T
Q  180 ccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||| |||    
T  5871784 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagcaaat 5871882  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  5871883 ttcttgtaacccatttttatcactttgcaagaactctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactggg 5871981  T
Q  379 tgaacaa 385  Q
    | |||||    
T  5871982 tcaacaa 5871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31495621 - 31495315
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacat 171  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31495621 tttgaaggagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacat 31495522  T
Q  172 tgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcat 271  Q
     | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  31495521 gggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattaggattgttcattgtgaacttgtcaa 31495431  T
Q  272 agctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 369  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495430 atctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 31495331  T
Q  370 cgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31495330 cgaactgggtgaacaa 31495315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47038695 - 47038411
Alignment:
Q  98 aaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaat 196  Q
    ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47038695 aaactggggaaatcaaaggagttaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattataaacaccttgggtgagtgaaaat 47038596  T
Q  197 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  | |||||    
T  47038595 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-tcatttgt 47038499  T
Q  297 atctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  47038498 atctgtttgtaaggactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6542475 - 6542188
Alignment:
Q  91 gagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tg 187  Q
    ||||||||||| | ||||  |||| || | |||||||||||| || ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6542475 gagagagaaacctaggaatacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtaatgag-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtg 6542377  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||   | ||||||||||||     
T  6542376 agtgaaaattattgagtgtcttgttcattggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtt 6542277  T
Q  287 acccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6542276 agccttttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactg 6542188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 52467657 - 52467354
Alignment:
Q  82 gagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacac 180  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || | || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52467657 gagcttcaagagagagaaactagggtaatcaaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttgggttgggaaacatttgtaaacac 52467558  T
Q  181 cttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatt 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||     
T  52467557 cttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaata 52467459  T
Q  280 tcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagt 379  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  52467458 tcttgtaacccatttgtatcactttgtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 52467360  T
Q  380 gaacaa 385  Q
     |||||    
T  52467359 caacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 334
Target Start/End: Original strand, 24968975 - 24969230
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaac 178  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24968975 gagaacttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttaaggttgacggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacatttgtaaac 24969074  T
Q  179 accttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaa 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||||||    
T  24969075 accttgggtgagtgaaaatcattgagagtcttgttctttggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgttgaagctaa 24969173  T
Q  278 tttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagag 334  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24969174 tttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactaattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 150 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36463623 - 36463389
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattag 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  36463623 gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaattcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa--tggatagaaattag 36463526  T
Q  248 ggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
    || ||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  36463525 ggctgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgacagtggattggagagatcaatctctccc 36463426  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  36463425 ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37230039 - 37229731
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt-------------ctcttgggttgggaa 167  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||             |||||||||||| ||    
T  37230039 agagcttcaagagagacaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggtttagggtctttgattagggttatcttgagaggttctcttgggttggaaa 37229940  T
Q  168 acatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggt-tgttctttgtgaac 264  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37229939 acatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattggg--aaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagc 37229842  T
Q  265 ttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 363  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||     
T  37229841 ttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag- 37229743  T
Q  364 ttggaccgaact 375  Q
    ||||||||||||    
T  37229742 ttggaccgaact 37229731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13009735 - 13009444
Alignment:
Q  80 gagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 179  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13009735 gagaacttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 13009636  T
Q  180 cctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaat 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |             |    
T  13009635 ccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgtg-aaaatgggtagaaattaggtttgttcttcgtgagc-------------t 13009550  T
Q  279 ttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgag 378  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |    
T  13009549 ttcttgtaaaacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaag-ttagaccgaactgtg 13009451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 41639370 - 41639593
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41639370 gttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 41639467  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41639468 tgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 41639567  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41639568 tcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 41639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 385
Target Start/End: Original strand, 2209668 - 2209883
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2209668 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgttgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgt 2209765  T
Q  269 catagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 367  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2209766 tgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttgg 2209865  T
Q  368 accgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2209866 accgaactgggtgaacaa 2209883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 150 - 364
Target Start/End: Original strand, 4587892 - 4588107
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagg 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  4587892 gttctcatgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcatgttcattggtgaaattgggaaaaaa-ggtagaaattaag 4587990  T
Q  249 gtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcct 347  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||     
T  4587991 atttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctccc 4588090  T
Q  348 ccagagtaggtcaagtt 364  Q
    ||| | ||||| |||||    
T  4588091 ccataataggtgaagtt 4588107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 158 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 48893868 - 48893638
Alignment:
Q  158 gggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttc- 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||     
T  48893868 gggtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatg-ggtagaaattagggttgttca 48893770  T
Q  256 ---tttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccaga 352  Q
       ||||||| |||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  48893769 ttgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 48893670  T
Q  353 gtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
     ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48893669 ttaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Original strand, 54882964 - 54883188
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  54882964 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttttt 54883061  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |    
T  54883062 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaag 54883161  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  54883162 tcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 54883188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Original strand, 8665351 - 8665556
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8665351 gttgggaaacaattgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 8665449  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    || || |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8665450 tgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 8665549  T
Q  358 tcaagtt 364  Q
    |||||||    
T  8665550 tcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 125 - 376
Target Start/End: Original strand, 31474059 - 31474310
Alignment:
Q  125 ttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 223  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474059 ttagggttgagggtctttgattaaggttctcttggagtgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 31474158  T
Q  224 ttgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatag 322  Q
    ||| |||||   |||||||||||||  ||||||||| |||  ||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31474159 ttgagaaaatg-ggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatag 31474257  T
Q  323 tggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    | |||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31474258 ttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccgaactg 31474310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 46703443 - 46703669
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  46703443 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa--tgagtagaaattagggttgttct 46703540  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagta 355  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  46703541 ttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 46703640  T
Q  356 ggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||   |||||||||| || |||||||    
T  46703641 ggtcattgttggaccgaattgggtgaaca 46703669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 6655900 - 6656123
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6655900 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcacttgtgagattg--aaaaaatgggtagaaattaaggttgttct 6655996  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6655997 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtag 6656096  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||    
T  6656097 gtcaag-ttggaccgaattgggtgaaca 6656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45687496 - 45687182
Alignment:
Q  84 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg-------------ggttgggaaaca 170  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||             ||||||||||||    
T  45687496 gcttcaagagagagaaactagggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaaaca 45687397  T
Q  171 ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  45687396 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaattttttgattgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgt 45687298  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
    || |||||||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||| |||||    
T  45687297 caaagctaatttcttataactcatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttgga 45687199  T
Q  369 ccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| || |||||    
T  45687198 ccgaactgggtcaacaa 45687182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5208140 - 5207865
Alignment:
Q  87 tgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| || | |||| |||||||  ||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5208140 tgaagagagagaaatttggaaaatcaaaggaggtaactatagggttgcgggtctttggtgagggttctcttggattgggaaacatttgtaaacaccttgg 5208041  T
Q  186 -tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttctt 283  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  5208040 gtgagtgaaaatcatttagtgacttgttcattggagtgattgg--aaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttatt 5207943  T
Q  284 gtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaa 361  Q
    | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  5207942 gcaacccttgtatatctatttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa 5207865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27417160 - 27416965
Alignment:
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgta 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  27417160 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatgtg-tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 27417063  T
Q  287 acccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27417062 acccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa 27416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 376
Target Start/End: Original strand, 40632400 - 40632604
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40632400 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 40632497  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  40632498 tgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttgga 40632596  T
Q  369 ccgaactg 376  Q
    ||||||||    
T  40632597 ccgaactg 40632604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 376
Target Start/End: Original strand, 51336938 - 51337223
Alignment:
Q  91 gagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tg 187  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||| |  ||||||  | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  51336938 gagagagaaacttaggaatacaaaggaagtaactttagggttgaatgtctttgtagtgag-gttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtg 51337036  T
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg--ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgt 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | | |  |||||| || |    
T  51337037 agtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaag-ggtagaaattacggatttgttctttgtgagcttttaaga--taatttattat 51337133  T
Q  286 aacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||    
T  51337134 aacccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaag-ttggaccgaactg 51337223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 381
Target Start/End: Original strand, 41964358 - 41964580
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41964358 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgaaattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 41964456  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    ||||| |||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41964457 tgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 41964556  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  41964557 gtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 35662384 - 35662608
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaa-tcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttc 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35662384 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagtgtgaaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattg--aaaaaatgggtagaaattagggttgttc 35662480  T
Q  256 tttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagta 355  Q
    ||| |||  ||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  35662481 tttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagta 35662580  T
Q  356 ggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35662581 ggtcaag-ttggaccgaactgaatgaaca 35662608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 52094039 - 52093882
Alignment:
Q  9 gattggggaaaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52094039 gatttgggaaaaacgtgacacgatttcgacgctgaagactcctatataagtgttctttgcaaattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaa 52093940  T
Q  109 atcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttggga 166  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52093939 atcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttggga 52093882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 202 - 366
Target Start/End: Original strand, 26364223 - 26364386
Alignment:
Q  202 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26364223 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc 26364321  T
Q  302 tttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 366  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26364322 tttgtaagaactcattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttg 26364386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 384
Target Start/End: Original strand, 8648095 - 8648306
Alignment:
Q  172 tgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 269  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  8648095 tgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaa--tggatagaaattagggttgttcattgtgagtttgtt 8648192  T
Q  270 atagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 369  Q
      |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8648193 gaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 8648291  T
Q  370 cgaactgagtgaaca 384  Q
    | ||||| |||||||    
T  8648292 caaactgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 12073336 - 12073560
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  12073336 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagtgtgaaaatcat-gagtgtcttgcttattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattaggtttgttctt 12073433  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12073434 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtagg 12073533  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||   ||||||||||||  |||||||    
T  12073534 tcattgttggaccgaactaggtgaaca 12073560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743925
Alignment:
Q  236 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  12744073 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12743974  T
Q  336 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12743973 tcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745314
Alignment:
Q  236 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  12745462 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12745363  T
Q  336 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12745362 tcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 50674059 - 50673848
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 267  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  50674059 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcgtgttcatttgtgagattgagaaaa--tgagtagaaattaggattgt-ctttgtgagcttg 50673964  T
Q  268 tcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 367  Q
    |   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50673963 ttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgg 50673865  T
Q  368 accgaactgagtgaaca 384  Q
    ||||||||  |||||||    
T  50673864 accgaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Original strand, 379322 - 379540
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaat-cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||    
T  379322 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaattagtatcttgttcatttgtgagattgagaaaatg-ggtagaaattaggtttgttct 379420  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  379421 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgctttgtaagaactaattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 379520  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  379521 gtcattgttggaccgaactg 379540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Original strand, 12119481 - 12119708
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttct 256  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  12119481 gttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcataggtgagattgg-aaaaaagagtagaaattatggtttgttct 12119579  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagta 355  Q
    |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  12119580 ttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc-caagagta 12119678  T
Q  356 ggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||   ||||||||||||  ||||||||    
T  12119679 ggtcattgttggaccgaactaggtgaacaa 12119708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Original strand, 21688192 - 21688417
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 257  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21688192 gttgggaaacaattctaaacaccttgggggagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatcggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 21688290  T
Q  258 tgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 357  Q
    ||||| |||||   | ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||| |||| | ||| ||||    
T  21688291 tgtgagcttgttgaaactaattttttgtaactcatttgtatctcttcggaagaactcattgataatgaattggagagatcaatccctcccctagattagg 21688390  T
Q  358 tcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  21688391 tcaag-ttagaccgaattgagtcaacaa 21688417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 50262922 - 50262700
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttct 256  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||    
T  50262922 gttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgtttattg---agattgggaaaa--tggatcgaaattacggttgttct 50262829  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 356  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  50262828 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtag 50262729  T
Q  357 gtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  50262728 gtcattgttggaccgaactgggtgaacaa 50262700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 8395489 - 8395772
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  8395489 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 8395586  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8395587 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtca-agctaatttcttgtaac 8395674  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8395675 c-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 8395772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 346
Target Start/End: Original strand, 3913408 - 3913578
Alignment:
Q  176 aacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatag 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||  ||||   ||    
T  3913408 aacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaa--tgagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaag 3913505  T
Q  274 ctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcc 346  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3913506 ctaatttcttttaacccatttgtatatctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 3913578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  236 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  12744195 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12744096  T
Q  336 tcaatctct 344  Q
    |||||||||    
T  12744095 tcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Original strand, 8393394 - 8393563
Alignment:
Q  215 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 312  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  8393394 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtca-agctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 8393489  T
Q  313 tcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8393490 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 8393563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 46147575 - 46147391
Alignment:
Q  199 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtat 298  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  46147575 ttgattgtcttgttcatcggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 46147477  T
Q  299 ctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  46147476 ctctttgtaagaactctttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26699670 - 26699450
Alignment:
Q  160 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttct 256  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||  ||| ||| |||| | ||||||||| |||||    
T  26699670 gttgggaaacaattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgtttattagagagattcagaagaaagggtatagattagggtttgttct 26699571  T
Q  257 ttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagta 355  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||   ||||||||    
T  26699570 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctatcccagagta 26699471  T
Q  356 ggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||   |||||||||||||    
T  26699470 ggtcattgttggaccgaactg 26699450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48142642 - 48142440
Alignment:
Q  121 aactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgt-aaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 218  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  48142642 aactttagggttgatggtctttgattagggttctcttgagttgggaaacatttttaaacacttcgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgcccattga 48142543  T
Q  219 tgagattgggaaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcat 316  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  48142542 tgagattggg--aacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaactcat 48142445  T
Q  317 tgata 321  Q
    |||||    
T  48142444 tgata 48142440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55085578 - 55085444
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  55085578 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattggaaaata--ggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgt 55085481  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg 305  Q
       |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  55085480 tgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctctttg 55085444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Original strand, 5135948 - 5136230
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||  |||    
T  5135948 agagagaaacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgtagag 5136046  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5136047 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaa 5136134  T
Q  288 cccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    || | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5136135 cc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 5136230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 29056295 - 29056518
Alignment:
Q  154 tcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattag-ggt 250  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||| | |    
T  29056295 tcttgtgttgggaaacatttggaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgttttgttcattagagagattggg--aaaatggtaggaattagagtt 29056392  T
Q  251 tgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaa-ctcattgatagtggattagagagttcaatctctcctcc 349  Q
    |||||||||||  ||||| | | ||||||||||| || |||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||  | |||||||  ||    
T  29056393 tgttctttgtgtgcttgttagaactaatttcttgcaatccttttatatctctttgtaacaacctcattgataatggattagagagacctatctctcaccc 29056492  T
Q  350 agagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    || ||||||| | ||| ||||||||||    
T  29056493 agtgtaggtcca-ttttgaccgaactg 29056518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Original strand, 5138174 - 5138455
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||  |||    
T  5138174 agagagaaacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaataccttgtagag 5138271  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcatagctaatttcttgtaa 287  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5138272 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtca-agctaatttcttgtaa 5138359  T
Q  288 cccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    || | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5138360 cc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 5138455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 36314928 - 36315096
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||| |    
T  36314928 aaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagataaacttggatta-caaagg 36315026  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36315027 aggtaactttagggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgg 36315096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 36329137 - 36329305
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||| |    
T  36329137 aaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagataaacttggatta-caaagg 36329235  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36329236 aggtaactttagggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgg 36329305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 8689193 - 8689362
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||     
T  8689193 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaag 8689291  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | ||||||||||||||| |||||  || | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8689292 gaggtaactttagggtttagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattttaaacaccttgg 8689362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 5268898 - 5269066
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |    
T  5268898 aaacgtgacacgattttaacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaagg 5268996  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5268997 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5269066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 7124785 - 7125071
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  7124785 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 7124882  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7124883 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaac 7124972  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  7124973 c-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaa 7125071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 304
Target Start/End: Original strand, 41639218 - 41639351
Alignment:
Q  170 attgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41639218 attgtaaacaccttaggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtaaactttt 41639315  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 304  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41639316 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Original strand, 7122566 - 7122852
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  7122566 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 7122663  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7122664 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaac 7122753  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  7122754 c-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaa 7122852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13992213 - 13992150
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13992213 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttactactt 13992150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 358
Target Start/End: Original strand, 33089837 - 33090021
Alignment:
Q  175 aaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcata 272  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |  |   ||||||||| | |||||||| | || |||||   |    
T  33089837 aaacaccttggaagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatgggaagagattgagagatgaa--tagaaattatgtttgttcttggagagcttgttgaa 33089934  T
Q  273 gctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 358  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33089935 gctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 328
Target Start/End: Original strand, 53345187 - 53345330
Alignment:
Q  185 gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg-ttctttgtgaacttgtcatagctaatttctt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||    
T  53345187 gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatcggagagatt--gagaaaatgatagaaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttctt 53345284  T
Q  284 gtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggatt 328  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  53345285 gtaacccttttatatctttttgtaaagaactcattaatattggatt 53345330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3777949 - 3777780
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||     
T  3777949 aaaacttgacatgattttgacagctgaagactgctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaag 3777851  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3777850 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3777780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Original strand, 3909983 - 3910075
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 184  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3909983 agagaaaaactagggaaatcaaaggaggtaacttaagggtttagggcctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttg 3910075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10047745 - 10047612
Alignment:
Q  53 tataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt--taattaga 149  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || | |||||||||||| || |||||  |||| ||     
T  10047745 tataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtaatgag- 10047648  T
Q  150 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10047647 gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 10047612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 16622990 - 16623159
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||     
T  16622990 aaaacgtgacacgattttgacaggtgaaggctgctatataagtgtttttgtgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaactt-ggattacaaag 16623088  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623089 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 16623159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 16628569 - 16628738
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgca-gaagacagctatataagtgttctt-ttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||||     
T  16628569 aaaacgtgacacgattttgacagatgaaggctgctatataagtgtttttgttcagattttgaaggagagctagaagagagagaaaatt-ggattgcaaag 16628667  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628668 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 16628738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22882946 - 22882760
Alignment:
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgt 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||   |||||||| || |||||||| |||||||| | ||  ||||   ||||||||||||||    
T  22882946 agtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagattg---aaaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgt 22882850  T
Q  286 aacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||| || ||||||||||   |||||||||||||    
T  22882849 aacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaa--tctcccccggagtaggtcattgttggaccgaactg 22882760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22934610 - 22934424
Alignment:
Q  188 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgt 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||   |||||||| || |||||||| |||||||| | ||  ||||   ||||||||||||||    
T  22934610 agtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagattg---aaaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgt 22934514  T
Q  286 aacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||| || ||||||||||   |||||||||||||    
T  22934513 aacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaa--tctcccccggagtaggtcattgttggaccgaactg 22934424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 33989900 - 33989989
Alignment:
Q  272 agctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33989900 agctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Original strand, 5396372 - 5396537
Alignment:
Q  22 cgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaag 119  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||| || |    
T  5396372 cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgagcagattttgaaggagagctggaagagagagaaactt-ggattacaaaggagg 5396470  T
Q  120 caactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
      ||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396471 ttactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5396537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 25861731 - 25861898
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |  ||||    
T  25861731 aaacgtgacacgattttgacagttgaagacttctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagagcttttagagagagaaacttgg--attacaaag 25861828  T
Q  117 aa-gcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 184  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25861829 aaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 25861898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 465 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 52082582 - 52082522
Alignment:
Q  465 agatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  52082582 agatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 52082522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 54867578 - 54867490
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54867578 aaacgtgacacgattttgacagctgaagactactatataagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgaagagagagaaacttgg 54867490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5370004 - 5369941
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  5370004 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattgattactactt 5369941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 48143294 - 48143357
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  48143294 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 48143357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 343
Target Start/End: Original strand, 6677402 - 6677597
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaatta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| | ||  || |||||   ||||||||||||||||    
T  6677402 gttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacattggatgagtgaaa-taattgagtctcttgttcttgggaagaaattgg---aaaatggtagaaatta 6677497  T
Q  247 gggttgtt--ctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctc 343  Q
    || || ||  ||| | || |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  6677498 ggttttttttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctttgtaaagaagtctttgataatggatttgagagatcaatctc 6677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 5429925 - 5429988
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  5429925 attagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattgattactactt 5429988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 56178558 - 56178495
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  56178558 attagatctaggtgttgttattgtttattattgcttgtgttcactttgatattggttactactt 56178495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 5349930 - 5350016
Alignment:
Q  236 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgata 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | | ||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  5349930 ggtagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaaagaactcgttgata 5350016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 6743112 - 6743281
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    ||||| |||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||     
T  6743112 aaaacttgacacaattttgacagttgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaag 6743210  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | ||||| ||| || || ||||||     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6743211 gaggtaacttgaggtttgagtgtctttgtagcgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 6743281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 46147658 - 46147581
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg 158  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  46147658 agagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttttcttg 46147581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5112576 - 5112468
Alignment:
Q  78 aggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| || | || |||||| || || ||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5112576 aggagagcttgaagagagagaaacttgagattacaaaggaggtaattttaggtttgagtgtctttgttgtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaa 5112477  T
Q  177 acaccttgg 185  Q
    |||||||||    
T  5112476 acaccttgg 5112468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5148052 - 5147909
Alignment:
Q  43 aagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||   || | || | ||||||||||||||| |||||    
T  5148052 aagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaaatgagagaaactt-ggattacacaggaggtaactttagggtttagtgtctt 5147954  T
Q  142 t-aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |  | ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5147953 tgtagtaaggatctcttgagttgggaaacattgtaaacacattgg 5147909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Original strand, 35662010 - 35662098
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    ||||||||| || ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35662010 aaaacgtgatacaattttgacaactgaagactgctatataagtgttctttgcagattttgatggagaggttgaagagagaaaaacttgg 35662098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9927381 - 9927318
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||    
T  9927381 attaaatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgtttactttgatattggtaactactt 9927318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34570336 - 34570273
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  34570336 attagatctaggtgttgttattgttgattattgtttgtgttcattttgatattggttactactt 34570273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 37740871 - 37740934
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||| |||||||||    
T  37740871 attagatctaggtgctgttattgttgattattgattctgttcactttgatattgattactactt 37740934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 48893564 - 48893502
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  48893564 attagatctaggtgctgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttgatattggttactactt 48893502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 52095284 - 52095221
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  52095284 attagatctaggtgttgttattgttgattattacttgtgttcactttgatattgattactactt 52095221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 54199830 - 54199767
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  54199830 attagatctaggtgatgttattgctgattattgcttgtgttcactttgatactggttactactt 54199767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23043093 - 23042988
Alignment:
Q  82 gagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaaca 179  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| | |||||||  | ||| |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  23043093 gagcttcaacagagagaaacttgagaaatcaaaagatttaactttagggttgaaggtctttggtaagaggttctcttagattgggaaacatttgtaaaca 23042994  T
Q  180 ccttgg 185  Q
    ||||||    
T  23042993 ccttgg 23042988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 324
Target Start/End: Original strand, 34112821 - 34112926
Alignment:
Q  220 gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattg 318  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||  | || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  34112821 gagattggaaaaaaaaagtagaaattatgtttgttctaggagagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattg 34112920  T
Q  319 atagtg 324  Q
    ||||||    
T  34112921 atagtg 34112926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 5143635 - 5143571
Alignment:
Q  42 gaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5143635 gaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtaagagaaacttgg 5143571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 194
Target Start/End: Original strand, 31985466 - 31985508
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31985466 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgaaa 31985508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34788928 - 34788854
Alignment:
Q  231 aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg 305  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | || |||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34788928 aaaatggtagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttg 34788854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35369649 - 35369607
Alignment:
Q  175 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 217  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35369649 aaacaccttgtagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 35369607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44570567 - 44570427
Alignment:
Q  187 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat-----tggt--gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||   |||||||   ||||||||||||||||| | ||||| || | || |||||   | ||||||    
T  44570567 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatgttcatgggaagagattg---aaaaatggtagaaattatgtttgttgttggagagcttgttgaaactaatt 44570471  T
Q  280 tcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatag 322  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44570470 tcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21704128 - 21704040
Alignment:
Q  84 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacatt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| |||| |  ||||||  | || |||||||||||||| ||||||||    
T  21704128 gcttcaagagagagaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttaaggttgaaagtctttggtgagggttctcttgggttgagaaacatt 21704040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Original strand, 39774033 - 39774171
Alignment:
Q  49 gctatataagtgttctt-ttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aat 145  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||||||| ||  | |||  ||     
T  39774033 gctatataagtgtttatgttcagattttgaagtagagtttaaagagagagaaacttgggtttacaaaggaggtaactttagggttgagattatttgtaac 39774132  T
Q  146 tagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39774133 gag-gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgg 39774171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 47038337 - 47038275
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||||||||||||    
T  47038337 attagatctaggtgttgttattgttg-ttattgtttgtgtttactttgatattggttactactt 47038275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 214
Target Start/End: Original strand, 5349840 - 5349905
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 214  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5349840 gttcttttgggttgg-aaacatttgtaaacaccttggatgattgaaaatctttgagtgtcttgttca 5349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16422760 - 16422666
Alignment:
Q  231 aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtg 324  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||    
T  16422760 aaaatggtagaaattatgtttgttttttgagagctttttgaagctaatttctagaaacccttttgtatatctttgtaatgaactcatggatagtg 16422666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31495227 - 31495190
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 500  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31495227 attagatctaggtgctgtt-ttgttgattattgcttgca 31495190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36463705 - 36463639
Alignment:
Q  81 agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaatta 147  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  36463705 agagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcataggaggtaactttaggattgagggtctttgatta 36463639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Original strand, 42234318 - 42234377
Alignment:
Q  229 aaaaaatg-gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacc 289  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  42234318 aaaaaatgagtagaaattagagttgttctttgtgaacttg--agatctaatttcttgtaacc 42234377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18377697 - 18377664
Alignment:
Q  72 ttttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18377697 ttttgaaggagagcttgaagagaaagaaacttgg 18377664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21703943 - 21703860
Alignment:
Q  277 atttcttgtaacccttttgtatctctttggaa-gaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtca 360  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  21703943 atttcttgtaccctttttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggagatatcaatctatcc-ccatagtaggtca 21703860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37755070 - 37754986
Alignment:
Q  275 taatttcttgtaacccttttgtatctcttt-ggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 358  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||   || |||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  37755070 taatttcttgtaacctttttttatctctttctaaaaaactcattgataatggtttgaagagatcaatctctcccccatagtaggt 37754986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37755220 - 37755112
Alignment:
Q  89 aagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattaga-gttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacacctt-gg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| || || ||||||  | ||| |||||||||| ||  |||| | ||||||||||||| ||    
T  37755220 aagagagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttaggattgagagtctttggtgagaggttctcttggattatgaaatatttgtaaacaccttagg 37755121  T
Q  186 tgagtgaaa 194  Q
    |||||||||    
T  37755120 tgagtgaaa 37755112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 105
Target Start/End: Original strand, 42599305 - 42599361
Alignment:
Q  50 ctatataagtgtt-cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 105  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  42599305 ctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagagcttttagtgagagaaacttgg 42599361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 82 - 385
Target Start/End: Original strand, 783 - 1084
Alignment:
Q  82 gagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacc 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  783 gagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggcagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacc 882  T
Q  182 ttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  883 ttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttc 981  T
Q  282 ttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  982 ttgtaacccttttgtatctcttt-gaacaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 1080  T
Q  382 acaa 385  Q
    ||||    
T  1081 acaa 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 462 - 524
Target Start/End: Original strand, 1162 - 1224
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactact 524  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1162 attagatctaggtggtgttattgttgattattgcttgcattcacattgtcattggttactact 1224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11491 - 11160
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-tt 152  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  11491 taagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatggtctttgattagagctt 11393  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11392 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttg 11294  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctc-tttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccag 351  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11293 ttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccag 11194  T
Q  352 agtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11193 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 11160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9065 - 8734
Alignment:
Q  55 taagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagag-tt 152  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  9065 taagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctaggctttagggtctttgattagagctt 8967  T
Q  153 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8966 ctcttgggttgggaaacattgtaaagaccttggtgagtgtaaaccattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttg 8868  T
Q  253 ttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccag 351  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8867 ttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccag 8768  T
Q  352 agtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8767 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 8734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8655 - 8592
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  8655 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccacttagtcattggttactactt 8592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11081 - 11018
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  11081 attagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccacttagtcattggttactactt 11018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Original strand, 114388 - 114771
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacgcagaagacagctatataagtgtt----cttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 113  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| | ||||||||||||||    |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  114388 aaaacgtgacacgatttcgatgctgaaggctgctatataagtgttagatctttgcagattttgaatgtgagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaa 114487  T
Q  114 aagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttg-------------ggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcatt 200  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114488 aggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgaggggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcatt 114587  T
Q  201 gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  114588 gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaag-ggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatct 114686  T
Q  301 ctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  114687 ctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaa 114771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 114849 - 114912
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  114849 attagatataggtgttgttattgttgattattgattgtgttcactttgatattggttattactt 114912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Original strand, 11502 - 11726
Alignment:
Q  160 gttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11502 gttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-atggtagaaattagggttgttctttg 11600  T
Q  260 tgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtc 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11601 tgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtc 11700  T
Q  360 aagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11701 aagtttggaccgaactgggtgaacaa 11726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 152
Target Start/End: Original strand, 22201 - 22280
Alignment:
Q  73 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagtt 152  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22201 tttgaaggtgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagtt 22280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 467 - 525
Target Start/End: Original strand, 11817 - 11875
Alignment:
Q  467 atctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactactt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  11817 atctaggtgctgttattgttgattattgcttgcacacactttgttagtggttactactt 11875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20782 - 20415
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||| || | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20782 aaaacgtaacacgattttgatagctgaaaactgttatataagtgttctttgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaactttggaaatcaaagg 20683  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 215  Q
    | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||    
T  20682 aggtaactttagggttgagggtctttgattagagttatcttgggttgggagacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtttattattcat 20583  T
Q  216 tggtgagattgggaaaaaatg-gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactc 314  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20582 tggtgagattgggaaaa--tgagcagaaattaggtttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactc 20485  T
Q  315 attgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
     |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  20484 tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20337 - 20276
Alignment:
Q  462 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttactac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  20337 attagatctaggtgctgttattgttaattattgcttgtgttcactttgacattggttactac 20276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 149382 - 149097
Alignment:
Q  99 aacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctttaattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg-agtgaaaatc 197  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  149382 aacttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 149283  T
Q  198 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgta 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||| | |||||   |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  149282 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacg-gatagaaattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttata 149184  T
Q  298 tctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  149183 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2892 - 2726
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   |||||     
T  2892 aaacgtgacacgattttaacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaa--ttggattacaaaaa 2795  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 184  Q
    | | |||||||||||| ||  ||||  || | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2794 aggtaactttagggttaagtttctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 2726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6084 - 5916
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||| |    
T  6084 aaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaaatt-ggattacaaagg 5986  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | ||||||| |||| || |||||  || | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5985 aggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttgg 5916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 132976 - 133145
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||     
T  132976 aaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttggaggagagcttaaagagagagaaactt-ggattacaaag 133074  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| ||  ||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133075 gagggaactttagggttgagtttctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 133145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Original strand, 7282 - 7494
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7282 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgt 7379  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  7380 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttgga 7478  T
Q  369 ccgaactgagtgaaca 384  Q
    |||||||| |||||||    
T  7479 ccgaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18216 - 18004
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18216 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagagtgggaaaat-tggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgt 18119  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 368  Q
       ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18118 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttgga 18020  T
Q  369 ccgaactgagtgaaca 384  Q
     ||||||| |||||||    
T  18019 tcgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17650 - 17482
Alignment:
Q  19 aaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttcttttcatattttgaaggagagcttg-aagagagagaaacttgggaaatcaaaag 116  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| |||   || | |    
T  17650 aaacgtgtcacgattttgacagctgaaaactgctatataagtgttctttgtagattttgaagtatagcttgaaagagagagaacctt-ggattacatagg 17552  T
Q  117 aagcaactttagggtttagggtcttt-aattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    | | ||||||| |||| || ||||||  | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17551 aggtaactttacggttgagtgtctttgtagtggagatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 17482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2887 - 2603
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  2887 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 2790  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2789 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 2702  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 385  Q
    | | ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2701 c-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 2603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 10468 - 10648
Alignment:
Q  193 aaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaact--tgtcatagctaatttcttgtaacc 289  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    |||||||| ||||||||    
T  10468 aaatctttgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaaaa-gatataaattagggtttgttctttgtgagctcttgt----gctaatttattgtaacc 10562  T
Q  290 cttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 376  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10563 attttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 10648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 381
Target Start/End: Original strand, 6154 - 6438
Alignment:
Q  88 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     
T  6154 gaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt 6251  T
Q  186 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttg 284  Q
     ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6252 agagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttg 6339  T
Q  285 taacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    ||| || || ||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6340 taagccctt-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtga 6438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4009 - 3729
Alignment:
Q  92 agagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggt-ctttaattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  4009 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 3912  T
Q  190 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaac 288  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3911 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtca-agctaatttcttgtaac 3824  T
Q  289 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtga 381  Q
    | | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3823 c-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 3729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 80496 - 80343
Alignment:
Q  170 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 268  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  80496 attgtgaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgctgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 80399  T
Q  269 catagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtg 324  Q
       ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  80398 tgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctttttgtaagaactcatagatagtg 80343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 86083 - 85914
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgacg-cagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   ||||     
T  86083 aaaacgtgacacgattttgacaactgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggatagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaag 85985  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85984 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgg 85914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27678 - 27453
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaaaatggtagaaatta 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||   ||  ||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  27678 gttctcttgagttgggaaacatttgtaaacaccttggatgagtgaaa-tctttgagtctcttgttctagggaagagattgtgaaaaga--gtagaaatta 27582  T
Q  247 ggg-ttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaag-aactcattgatagtggattagagagttcaatctct 344  Q
     |  ||||||||   || |||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27581 tgtattgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctct 27482  T
Q  345 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 373  Q
    || ||| |||||||||   ||||||||||    
T  27481 cccccatagtaggtcattgttggaccgaa 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 36529 - 36698
Alignment:
Q  18 aaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||  | || |||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||     
T  36529 aaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctataaaagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt-ggattacaaag 36627  T
Q  116 gaagcaactttagggtttagggtctt--taattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    || | |||||||||||| || |||||  || | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36628 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 36698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Original strand, 43690 - 43827
Alignment:
Q  49 gctatataagtgttctttt-catattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtctt--taat 145  Q
    |||||||||||||| || | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||   |||| || | |||||||||||| || |||||  || |    
T  43690 gctatataagtgtttttgtgcagattttggaggagagctggaagagagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagt 43788  T
Q  146 tagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
     || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43789 gag-gatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 43827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19173 - 19117
Alignment:
Q  150 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19173 gttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacttgggtgagtgaaaatcattgagtg 19117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Original strand, 25068 - 25172
Alignment:
Q  231 aaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcatagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-gaagaactcattgatagtggatta 329  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||  ||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||    
T  25068 aaaatggtagaaactagttttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagta 25167  T
Q  330 gagag 334  Q
    |||||    
T  25168 gagag 25172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 185
Target Start/End: Original strand, 8176 - 8283
Alignment:
Q  78 aggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaagcaactttagggtttagggtcttt--aattagagttctcttgggttgggaaacattgta 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   | |||| || | |||||||||||| || ||||||  | | || | ||||||||||||||||||||||||    
T  8176 aggagagctggaagagagagaaacttggatta-caaaggagggaactttagggttgagtgtctttgtagtgag-gatctcttgggttgggaaacattgta 8273  T
Q  176 aacaccttgg 185  Q
    ||||||||||    
T  8274 aacaccttgg 8283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45462 - 45429
Alignment:
Q  152 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45462 tctcttgggttgtgaaacattgtaaacaccttgg 45429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University