View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1482_low_31 (Length: 231)

Name: NF1482_low_31
Description: NF1482
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1482_low_31
NF1482_low_31
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (1-223)||(51765293-51765518)
chr1 (4-216)||(20762577-20762790)
chr1 (4-218)||(3156769-3156983)
chr1 (4-218)||(3189234-3189448)
chr1 (4-218)||(3198051-3198265)
chr1 (4-218)||(3206890-3207104)
chr1 (4-218)||(44455063-44455278)
chr1 (4-218)||(28220276-28220491)
chr1 (4-218)||(28223471-28223686)
chr1 (4-218)||(31659141-31659356)
chr1 (4-218)||(196958-197173)
chr1 (4-217)||(1833426-1833640)
chr1 (4-217)||(8550837-8551051)
chr1 (1-125)||(13316399-13316521)
chr1 (10-218)||(50169266-50169475)
chr1 (4-218)||(49918252-49918468)
chr1 (4-218)||(834217-834432)
chr1 (4-211)||(37503607-37503812)
chr1 (4-218)||(3847171-3847386)
chr1 (4-218)||(4552687-4552902)
chr1 (1-210)||(23555312-23555522)
chr1 (4-185)||(50167225-50167408)
chr1 (3-223)||(9987107-9987320)
chr1 (4-218)||(37559918-37560134)
chr1 (5-218)||(10925126-10925343)
chr1 (4-217)||(45644404-45644619)
chr1 (3-223)||(40282282-40282496)
chr1 (3-221)||(20622286-20622499)
chr1 (14-218)||(15820210-15820415)
chr1 (10-203)||(30476502-30476698)
chr1 (4-209)||(13659386-13659592)
chr1 (4-185)||(28265604-28265787)
chr1 (3-223)||(21053863-21054077)
chr1 (10-218)||(13138032-13138239)
chr1 (4-218)||(928026-928243)
chr1 (4-167)||(37168252-37168416)
chr1 (4-203)||(46064836-46065036)
chr1 (4-167)||(13547139-13547302)
chr1 (4-167)||(13549050-13549213)
chr1 (10-216)||(9036329-9036528)
chr1 (4-173)||(19754442-19754613)
chr1 (4-167)||(11348653-11348816)
chr1 (4-173)||(41360863-41361032)
chr1 (10-167)||(42298031-42298188)
chr1 (4-124)||(47255390-47255508)
chr1 (4-167)||(37033122-37033286)
chr1 (4-167)||(29136202-29136365)
chr1 (4-167)||(193566-193729)
chr1 (4-124)||(7482280-7482399)
chr1 (4-166)||(31925757-31925919)
chr1 (4-164)||(19752643-19752804)
chr1 (4-167)||(47115126-47115290)
chr1 (3-214)||(44203547-44203751)
chr1 (4-173)||(40122246-40122418)
chr1 (148-216)||(13316513-13316581)
chr1 (10-104)||(34603595-34603689)
chr1 (4-108)||(22079331-22079435)
chr1 (4-153)||(16455591-16455739)
chr1 (4-67)||(6808507-6808571)
chr1 (50-167)||(37879007-37879124)
chr1 (4-63)||(32471519-32471579)
chr1 (4-77)||(13938181-13938256)
chr1 (14-67)||(25652141-25652195)
chr1 (4-108)||(3460710-3460815)
chr1 (4-77)||(9109469-9109543)
chr1 (15-62)||(4535541-4535589)
chr1 (10-46)||(37876822-37876858)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (1-223)||(4484377-4484601)
chr2 (1-223)||(30833243-30833467)
chr2 (1-216)||(45099660-45099875)
chr2 (1-216)||(4503180-4503395)
chr2 (4-223)||(32289470-32289682)
chr2 (1-216)||(36205712-36205926)
chr2 (4-216)||(5723306-5723517)
chr2 (4-218)||(2334468-2334682)
chr2 (4-218)||(36988126-36988340)
chr2 (4-218)||(29867772-29867987)
chr2 (4-218)||(38312143-38312358)
chr2 (4-218)||(42362255-42362470)
chr2 (4-218)||(6595056-6595271)
chr2 (4-218)||(17057419-17057634)
chr2 (4-218)||(17085402-17085617)
chr2 (4-218)||(723794-724009)
chr2 (4-218)||(11690404-11690619)
chr2 (4-185)||(36773497-36773680)
chr2 (3-223)||(6266596-6266810)
chr2 (4-211)||(33162500-33162708)
chr2 (4-218)||(11151641-11151856)
chr2 (4-218)||(36318059-36318274)
chr2 (4-218)||(34139820-34140036)
chr2 (10-173)||(11067253-11067417)
chr2 (4-218)||(14633875-14634091)
chr2 (87-218)||(39284788-39284921)
chr2 (4-167)||(35446934-35447097)
chr2 (4-167)||(45726884-45727047)
chr2 (5-167)||(1631783-1631945)
chr2 (4-190)||(7815323-7815512)
chr2 (10-190)||(13121698-13121879)
chr2 (4-185)||(26353125-26353302)
chr2 (4-218)||(14202462-14202672)
chr2 (20-199)||(24885583-24885763)
chr2 (3-214)||(12647435-12647639)
chr2 (10-83)||(17490204-17490277)
chr2 (4-150)||(24398027-24398176)
chr2 (10-190)||(11049479-11049666)
chr2 (10-67)||(7451173-7451230)
chr2 (4-111)||(33648182-33648290)
chr2 (3-126)||(13656081-13656202)
chr2 (4-67)||(42019920-42019986)
chr2 (14-67)||(34811281-34811335)
chr2 (14-67)||(42261545-42261599)
chr2 (18-78)||(7597074-7597135)
chr2 (4-67)||(3897045-3897109)
chr2 (152-218)||(41586349-41586417)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (1-223)||(11208-11432)
scaffold0491 (1-223)||(8782-9006)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (1-223)||(5258191-5258414)
chr3 (1-216)||(5260370-5260586)
chr3 (1-223)||(23200185-23200407)
chr3 (1-223)||(23197986-23198208)
chr3 (1-216)||(9636173-9636390)
chr3 (4-216)||(45095070-45095281)
chr3 (10-216)||(37408364-37408570)
chr3 (4-218)||(7762169-7762383)
chr3 (4-217)||(19683939-19684153)
chr3 (4-218)||(7764371-7764582)
chr3 (4-218)||(5236506-5236721)
chr3 (3-216)||(801003-801211)
chr3 (4-217)||(40734402-40734616)
chr3 (4-218)||(51398717-51398932)
chr3 (4-218)||(22835052-22835267)
chr3 (4-218)||(39153411-39153626)
chr3 (4-217)||(760751-760965)
chr3 (4-190)||(29196436-29196626)
chr3 (4-218)||(40735286-40735501)
chr3 (4-211)||(29682269-29682477)
chr3 (4-211)||(29810778-29810986)
chr3 (4-217)||(9581187-9581400)
chr3 (4-218)||(32891006-32891222)
chr3 (4-218)||(53921553-53921768)
chr3 (4-196)||(44331470-44331663)
chr3 (4-218)||(29812966-29813181)
chr3 (33-167)||(5433955-5434091)
chr3 (3-223)||(6716405-6716618)
chr3 (4-167)||(4569906-4570070)
chr3 (4-209)||(16498942-16499147)
chr3 (4-185)||(44700528-44700712)
chr3 (3-223)||(54635030-54635243)
chr3 (4-185)||(31314380-31314563)
chr3 (4-124)||(34491212-34491330)
chr3 (10-218)||(32744492-32744691)
chr3 (1-126)||(7780051-7780173)
chr3 (5-167)||(43401852-43402015)
chr3 (4-218)||(9666516-9666733)
chr3 (4-167)||(49199519-49199683)
chr3 (4-167)||(30236080-30236243)
chr3 (3-223)||(45282888-45283105)
chr3 (4-167)||(54593659-54593822)
chr3 (10-185)||(23391965-23392142)
chr3 (4-167)||(46860427-46860592)
chr3 (4-167)||(6095649-6095812)
chr3 (5-167)||(41819574-41819737)
chr3 (4-167)||(43403794-43403958)
chr3 (4-103)||(46173377-46173475)
chr3 (3-214)||(25637342-25637546)
chr3 (3-214)||(3617363-3617569)
chr3 (88-223)||(6718589-6718718)
chr3 (4-167)||(36018806-36018970)
chr3 (4-185)||(23410379-23410562)
chr3 (3-214)||(4600793-4600998)
chr3 (21-167)||(31340268-31340414)
chr3 (4-63)||(40913352-40913411)
chr3 (10-77)||(4055819-4055888)
chr3 (4-121)||(47304254-47304369)
chr3 (20-153)||(5373200-5373336)
chr3 (86-218)||(26386612-26386746)
chr3 (3-214)||(4598572-4598777)
chr3 (3-214)||(10211309-10211514)
chr3 (11-162)||(35138762-35138915)
chr3 (88-214)||(10209089-10209207)
chr3 (4-74)||(1313854-1313925)
chr3 (4-77)||(4075520-4075595)
chr3 (182-223)||(7782370-7782411)
chr3 (4-61)||(55302022-55302079)
chr3 (87-182)||(2075189-2075287)
chr3 (17-63)||(20937715-20937762)
chr3 (152-189)||(3328174-3328212)
chr3 (4-81)||(51352161-51352237)
chr3 (5-108)||(54739004-54739107)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (1-216)||(31218162-31218378)
chr8 (1-216)||(17982558-17982774)
chr8 (1-216)||(19945406-19945623)
chr8 (4-216)||(34254381-34254591)
chr8 (1-216)||(44303759-44303976)
chr8 (4-216)||(34256557-34256767)
chr8 (1-216)||(1746266-1746481)
chr8 (4-218)||(42498097-42498312)
chr8 (4-218)||(43036326-43036541)
chr8 (1-223)||(2627640-2627857)
chr8 (4-218)||(15212689-15212904)
chr8 (4-211)||(12702684-12702896)
chr8 (4-218)||(4731561-4731776)
chr8 (4-218)||(33352053-33352268)
chr8 (10-211)||(27811188-27811390)
chr8 (4-218)||(30143245-30143458)
chr8 (4-217)||(5689175-5689389)
chr8 (5-218)||(1292514-1292728)
chr8 (10-218)||(3303726-3303935)
chr8 (4-217)||(6598876-6599090)
chr8 (4-217)||(6674329-6674543)
chr8 (4-173)||(9765697-9765863)
chr8 (1-218)||(1345418-1345636)
chr8 (16-218)||(4162403-4162603)
chr8 (4-211)||(18141730-18141938)
chr8 (10-167)||(44353747-44353905)
chr8 (3-223)||(3439409-3439622)
chr8 (4-167)||(4283479-4283642)
chr8 (3-223)||(25689860-25690073)
chr8 (4-167)||(18655355-18655518)
chr8 (4-185)||(40321015-40321198)
chr8 (5-167)||(42435042-42435204)
chr8 (45-202)||(10929719-10929876)
chr8 (4-173)||(19491749-19491918)
chr8 (4-167)||(40221700-40221863)
chr8 (32-218)||(41364925-41365112)
chr8 (4-166)||(30291561-30291725)
chr8 (4-121)||(40328782-40328898)
chr8 (4-218)||(41366664-41366879)
chr8 (14-166)||(8965751-8965904)
chr8 (5-167)||(11383941-11384102)
chr8 (14-203)||(18106139-18106328)
chr8 (4-153)||(3772161-3772310)
chr8 (4-122)||(10930249-10930365)
chr8 (144-218)||(4733712-4733787)
chr8 (112-211)||(4743359-4743461)
chr8 (4-67)||(8153813-8153876)
chr8 (4-67)||(10015136-10015198)
chr8 (3-214)||(15290438-15290643)
chr8 (3-214)||(15470807-15471012)
chr8 (3-214)||(42575373-42575578)
chr8 (152-218)||(10015051-10015117)
chr8 (4-62)||(3073923-3073981)
chr8 (4-67)||(32902223-32902287)
chr8 (10-67)||(11712056-11712114)
chr8 (4-44)||(4733784-4733824)
chr8 (4-67)||(7597669-7597733)
chr8 (4-64)||(30909426-30909485)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (1-216)||(822-1036)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (1-216)||(30834583-30834799)
chr6 (1-223)||(2171579-2171801)
chr6 (1-216)||(16452376-16452592)
chr6 (4-216)||(5406250-5406461)
chr6 (4-216)||(5410575-5410786)
chr6 (4-216)||(5413444-5413655)
chr6 (4-218)||(33160402-33160618)
chr6 (4-216)||(31404725-31404937)
chr6 (1-223)||(412007-412223)
chr6 (4-218)||(9183081-9183296)
chr6 (4-217)||(28137458-28137672)
chr6 (1-223)||(3072806-3073023)
chr6 (1-223)||(6097498-6097704)
chr6 (4-218)||(26954336-26954550)
chr6 (4-190)||(3038953-3039141)
chr6 (4-167)||(21593619-21593782)
chr6 (3-223)||(27647768-27647979)
chr6 (4-203)||(33211235-33211435)
chr6 (3-216)||(16554781-16554988)
chr6 (3-216)||(16631337-16631544)
chr6 (4-124)||(21588931-21589049)
chr6 (10-124)||(17762990-17763102)
chr6 (3-216)||(16578567-16578774)
chr6 (3-216)||(16616606-16616813)
chr6 (3-216)||(16653024-16653231)
chr6 (4-121)||(17758026-17758141)
chr6 (4-124)||(2972989-2973107)
chr6 (4-167)||(5043582-5043745)
chr6 (4-124)||(3808758-3808877)
chr6 (4-167)||(26830173-26830337)
chr6 (3-214)||(6027162-6027366)
chr6 (3-214)||(25421219-25421425)
chr6 (132-217)||(16567110-16567196)
chr6 (4-124)||(22424876-22424995)
chr6 (5-104)||(603139-603237)
chr6 (132-211)||(16568953-16569033)
chr6 (4-185)||(4045357-4045542)
chr6 (88-214)||(33342241-33342359)
chr6 (5-79)||(25073611-25073686)
chr6 (4-48)||(5409119-5409163)
chr6 (4-67)||(26800642-26800705)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (1-216)||(35853820-35854035)
chr7 (1-223)||(39731274-39731490)
chr7 (1-223)||(25767007-25767224)
chr7 (2-223)||(48408700-48408924)
chr7 (10-216)||(4178680-4178885)
chr7 (4-216)||(29990960-29991171)
chr7 (4-218)||(14069883-14070098)
chr7 (4-218)||(14379911-14380126)
chr7 (4-218)||(19502081-19502296)
chr7 (4-210)||(23554951-23555158)
chr7 (4-218)||(48491482-48491697)
chr7 (4-218)||(4586064-4586279)
chr7 (4-201)||(47673993-47674191)
chr7 (1-223)||(43504201-43504418)
chr7 (12-217)||(47676194-47676400)
chr7 (10-218)||(18126547-18126756)
chr7 (10-218)||(38671278-38671487)
chr7 (4-218)||(26417219-26417434)
chr7 (4-218)||(31733019-31733234)
chr7 (4-218)||(43864147-43864362)
chr7 (4-185)||(8153277-8153460)
chr7 (4-219)||(1113559-1113775)
chr7 (4-218)||(30024782-30024997)
chr7 (4-218)||(48489334-48489549)
chr7 (4-185)||(41317484-41317667)
chr7 (10-185)||(27347752-27347929)
chr7 (4-218)||(31105443-31105658)
chr7 (5-167)||(2361023-2361185)
chr7 (3-223)||(24789746-24789960)
chr7 (4-218)||(496033-496248)
chr7 (12-217)||(31518699-31518905)
chr7 (3-223)||(20343802-20344016)
chr7 (5-124)||(29608737-29608854)
chr7 (4-190)||(36146458-36146647)
chr7 (43-217)||(24525985-24526161)
chr7 (4-167)||(34310766-34310929)
chr7 (4-167)||(48599384-48599547)
chr7 (110-216)||(24514915-24515023)
chr7 (4-217)||(25615767-25615971)
chr7 (4-201)||(41649061-41649258)
chr7 (4-218)||(4253578-4253795)
chr7 (4-124)||(22269973-22270091)
chr7 (4-167)||(8359366-8359530)
chr7 (4-167)||(4508756-4508919)
chr7 (4-167)||(6431926-6432089)
chr7 (36-190)||(12097941-12098097)
chr7 (5-97)||(2759248-2759339)
chr7 (4-124)||(3258995-3259113)
chr7 (41-200)||(4538627-4538787)
chr7 (4-83)||(23565111-23565190)
chr7 (3-214)||(6592389-6592593)
chr7 (3-214)||(6594607-6594811)
chr7 (3-214)||(18388809-18389013)
chr7 (3-214)||(18392245-18392449)
chr7 (4-83)||(32358104-32358183)
chr7 (51-214)||(1562103-1562257)
chr7 (4-104)||(2390301-2390400)
chr7 (10-167)||(4510604-4510761)
chr7 (10-167)||(4512446-4512603)
chr7 (4-119)||(22328440-22328556)
chr7 (17-218)||(23343877-23344080)
chr7 (50-214)||(32060422-32060579)
chr7 (4-218)||(36574565-36574781)
chr7 (4-67)||(6360002-6360065)
chr7 (92-218)||(2761439-2761567)
chr7 (4-59)||(31518965-31519020)
chr7 (4-46)||(24525552-24525594)
chr7 (14-63)||(3904676-3904726)
chr7 (33-63)||(27073875-27073905)
chr7 (33-63)||(27204408-27204438)
chr7 (4-63)||(5116663-5116723)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (4-211)||(25412672-25412878)
chr5 (1-216)||(13342966-13343181)
chr5 (1-223)||(26177788-26178003)
chr5 (1-223)||(16409380-16409596)
chr5 (1-216)||(36074090-36074307)
chr5 (1-216)||(30182494-30182709)
chr5 (1-223)||(18441695-18441911)
chr5 (1-223)||(9789271-9789487)
chr5 (4-218)||(13239655-13239869)
chr5 (4-218)||(39468599-39468814)
chr5 (4-218)||(13488106-13488321)
chr5 (4-218)||(32636727-32636942)
chr5 (4-211)||(30682972-30683178)
chr5 (1-223)||(26170679-26170883)
chr5 (4-217)||(42428480-42428694)
chr5 (10-218)||(533672-533881)
chr5 (4-184)||(37439070-37439259)
chr5 (4-218)||(28750705-28750920)
chr5 (4-218)||(42426285-42426500)
chr5 (10-211)||(33831590-33831792)
chr5 (3-223)||(29751209-29751423)
chr5 (4-218)||(537928-538143)
chr5 (4-218)||(16451984-16452198)
chr5 (4-203)||(8565996-8566196)
chr5 (3-223)||(29720269-29720483)
chr5 (3-223)||(29722429-29722643)
chr5 (4-218)||(31182876-31183089)
chr5 (4-167)||(213420-213583)
chr5 (4-167)||(40147216-40147379)
chr5 (8-218)||(42309989-42310200)
chr5 (4-166)||(13695740-13695904)
chr5 (10-223)||(22536346-22536550)
chr5 (4-218)||(3075708-3075923)
chr5 (4-167)||(28278271-28278434)
chr5 (25-218)||(5887487-5887681)
chr5 (3-216)||(10593170-10593377)
chr5 (4-167)||(5058002-5058163)
chr5 (4-120)||(38747009-38747123)
chr5 (91-210)||(19806295-19806415)
chr5 (3-214)||(25078034-25078240)
chr5 (3-214)||(25136003-25136209)
chr5 (1-214)||(40380006-40380212)
chr5 (1-214)||(40382217-40382423)
chr5 (110-218)||(42926796-42926907)
chr5 (4-82)||(9049392-9049470)
chr5 (4-124)||(27637663-27637781)
chr5 (3-214)||(16546545-16546750)
chr5 (88-214)||(16544323-16544441)
chr5 (4-166)||(16640990-16641153)
chr5 (10-167)||(27015487-27015635)
chr5 (21-67)||(42926922-42926968)
chr5 (11-111)||(316774-316874)
chr5 (10-74)||(33906086-33906151)
chr5 (4-67)||(3325968-3326032)
chr5 (5-67)||(10054867-10054929)
chr5 (4-108)||(22097879-22097981)
chr5 (14-63)||(35616228-35616278)
chr5 (10-52)||(42926961-42927003)
chr5 (7-67)||(8445770-8445831)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-216)||(434438-434654)
scaffold0002 (14-67)||(490380-490434)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (1-216)||(13992340-13992549)
chr4 (4-218)||(56178687-56178901)
chr4 (4-216)||(29999856-30000068)
chr4 (4-218)||(48142945-48143161)
chr4 (4-218)||(12739600-12739815)
chr4 (4-218)||(12747806-12748021)
chr4 (4-211)||(37740536-37740743)
chr4 (4-218)||(52095412-52095627)
chr4 (4-218)||(54199956-54200171)
chr4 (4-218)||(9927508-9927722)
chr4 (4-216)||(5370133-5370349)
chr4 (4-218)||(12745486-12745701)
chr4 (1-223)||(31495363-31495580)
chr4 (12-218)||(52082715-52082922)
chr4 (4-219)||(5429581-5429797)
chr4 (4-211)||(34570464-34570672)
chr4 (4-218)||(26175686-26175901)
chr4 (4-208)||(36994437-36994642)
chr4 (4-218)||(5871723-5871938)
chr4 (4-217)||(47038461-47038673)
chr4 (4-218)||(24969014-24969230)
chr4 (4-175)||(48893688-48893864)
chr4 (4-211)||(31474060-31474269)
chr4 (4-218)||(6542229-6542447)
chr4 (4-185)||(4587893-4588077)
chr4 (4-185)||(45687232-45687416)
chr4 (4-124)||(26364236-26364354)
chr4 (4-103)||(12743975-12744073)
chr4 (4-103)||(12744097-12744195)
chr4 (4-103)||(12745364-12745462)
chr4 (4-190)||(36463439-36463627)
chr4 (4-211)||(52467404-52467613)
chr4 (10-167)||(54882975-54883132)
chr4 (4-167)||(40632400-40632563)
chr4 (4-217)||(29254398-29254612)
chr4 (4-104)||(6655975-6656074)
chr4 (4-124)||(12073392-12073510)
chr4 (4-167)||(2209668-2209832)
chr4 (4-167)||(8665362-8665526)
chr4 (4-190)||(37229771-37229961)
chr4 (4-185)||(51336999-51337182)
chr4 (3-214)||(8395519-8395722)
chr4 (86-218)||(13009562-13009696)
chr4 (4-167)||(46703454-46703619)
chr4 (4-102)||(50673897-50673993)
chr4 (5-122)||(46147442-46147557)
chr4 (3-214)||(8393310-8393513)
chr4 (4-124)||(27417015-27417133)
chr4 (4-104)||(35662460-35662559)
chr4 (4-124)||(41639426-41639544)
chr4 (10-218)||(5207898-5208108)
chr4 (4-122)||(21688250-21688367)
chr4 (4-124)||(41964415-41964534)
chr4 (4-161)||(3913408-3913566)
chr4 (4-167)||(12119492-12119658)
chr4 (4-121)||(379383-379498)
chr4 (3-214)||(7122596-7122802)
chr4 (3-214)||(7124815-7125021)
chr4 (5-120)||(50262752-50262865)
chr4 (4-124)||(8648139-8648257)
chr4 (4-83)||(26699492-26699572)
chr4 (33-167)||(55085444-55085578)
chr4 (17-104)||(5349929-5350016)
chr4 (3-214)||(5138204-5138409)
chr4 (5-67)||(22882801-22882864)
chr4 (5-67)||(22934465-22934528)
chr4 (34-124)||(41639263-41639351)
chr4 (153-210)||(3910018-3910075)
chr4 (4-67)||(33089933-33089997)
chr4 (4-76)||(40975059-40975131)
chr4 (17-218)||(48142440-48142644)
chr4 (33-64)||(32091536-32091567)
chr4 (4-46)||(13009494-13009536)
chr4 (14-67)||(34112872-34112926)
chr4 (33-63)||(34788854-34788884)
chr4 (172-218)||(52093884-52093929)
chr4 (10-111)||(53345228-53345330)
chr4 (16-64)||(44570427-44570476)
chr4 (4-67)||(6677524-6677588)
chr4 (4-67)||(33989899-33989963)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-185)||(114538-114720)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (1-173)||(11506-11678)
scaffold0286 (179-223)||(22242-22286)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (4-209)||(149147-149353)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (4-218)||(20465-20680)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (10-167)||(7282-7439)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (3-214)||(2653-2857)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (4-124)||(18054-18171)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-214)||(3773-3979)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (51-216)||(6186-6342)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (14-167)||(80343-80496)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (4-67)||(27492-27556)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (10-65)||(10546-10601)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (4-63)||(25112-25172)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51765518 - 51765293
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagag-ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51765518 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaattt 51765419  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51765418 ctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaa 51765319  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  51765318 gaccctaaaccctagagttactccct 51765293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20762790 - 20762577
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20762790 ctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 20762692  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20762691 cttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 20762593  T
Q  201 cctaaaccctagagtt 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  20762592 cctaaaccctaaagtt 20762577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3156983 - 3156769
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3156983 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 3156885  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3156884 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccagggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 3156787  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  3156786 cctcaaccctaaagttac 3156769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3189448 - 3189234
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3189448 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttatacc 3189350  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3189349 ctttt-tccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaagac 3189252  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  3189251 cctcaaccctaaagttac 3189234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3198265 - 3198051
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3198265 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttatacc 3198167  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3198166 ctttt-tccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaagac 3198069  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  3198068 cctcaaccctaaagttac 3198051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3207104 - 3206890
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3207104 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttatacc 3207006  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3207005 ctttt-tccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaagac 3206908  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  3206907 cctcaaccctaaagttac 3206890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44455278 - 44455063
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44455278 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 44455180  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  44455179 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga-aaactctaatcaaaga 44455082  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  44455081 ccctcaaccctaaagttac 44455063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 28220276 - 28220491
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28220276 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 28220374  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28220375 cattt-tccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttcaatgcttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 28220472  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  28220473 ccctcaaccctaaagttac 28220491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 28223471 - 28223686
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  28223471 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagat-caaccataatttctacc 28223569  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28223570 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtcttcaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 28223667  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  28223668 ccctcaaccctaaagttac 28223686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31659356 - 31659141
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  31659356 ctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacagccctaatttctacc 31659258  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31659257 cattt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 31659160  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  31659159 ccctcaaccctaaagttac 31659141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 196958 - 197173
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  196958 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 197056  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
      ||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  197057 aattt-tctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 197154  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  197155 ccctcaaccctaaagttac 197173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1833640 - 1833426
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1833640 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagattcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 1833542  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1833541 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaa-ctctaatcaaaga 1833444  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| |||| || |||||    
T  1833443 ccctcaaccttaaagtta 1833426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 8550837 - 8551051
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  8550837 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 8550935  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  8550936 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcttaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 8551033  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  8551034 cccttaaccctaaagtta 8551051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 13316399 - 13316521
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13316399 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 13316497  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaag 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  13316498 accctttt-tcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 50169266 - 50169475
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  50169266 aatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt- 50169363  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||| ||| ||||| |    
T  50169364 ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtatttacaatgtttcccaacccaagataa-ccctaataaaaaaccctca 50169462  T
Q  206 accctagagttac 218  Q
    |||||| ||||||    
T  50169463 accctaaagttac 50169475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49918468 - 49918252
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  49918468 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 49918370  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtg-tttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  49918369 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttataatgtttcccaatccaagagaa-ctctaatcaaag 49918272  T
Q  199 accctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| | ||||||| ||||||    
T  49918271 accttcaaccctaaagttac 49918252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 834217 - 834432
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  834217 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctatc 834315  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  834316 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaaga 834413  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  834414 ccctcaaccctaaagttac 834432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 37503607 - 37503812
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  37503607 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa---ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttttacc 37503702  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaat-gtttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37503703 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatattttccaacccaatagaa-ctctaatcaaaga 37503800  T
Q  200 ccctaaacccta 211  Q
    |||| |||||||    
T  37503801 ccctcaacccta 37503812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 3847171 - 3847386
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| || |||||||  ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3847171 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 3847269  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3847270 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 3847367  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    ||||  |||||| ||||||    
T  3847368 ccctcgaccctaaagttac 3847386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 4552687 - 4552902
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4552687 ctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagg-acaaacctaatttctacc 4552785  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4552786 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccctcacccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctc-aattaaaga 4552883  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  4552884 ccctcaaccctaaagttac 4552902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23555312 - 23555522
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23555312 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 23555410  T
Q  101 acccttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaa 196  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23555411 acccattt-ttccaatctcaccaaagaataagacactcaataattttcattcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaa 23555508  T
Q  197 agaccctaaaccct 210  Q
    ||| ||| ||||||    
T  23555509 agatcctcaaccct 23555522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 50167225 - 50167408
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||     
T  50167225 ctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaa-taacaaccctaatttctact 50167323  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
      ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50167324 aattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 50167408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9987320 - 9987107
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9987320 actctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaaag-gttgcaagaaattagattagacaagttcacaatga-acaaccctaatttcta 9987223  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  9987222 cccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 9987130  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  9987129 cctaaaccctagagttgctccct 9987107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 37559918 - 37560134
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttt-gacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  37559918 ctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaa-gaacaactctaatttctac 37560016  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    || ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37560017 ccattt-tcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaatgtgtttacaatgttttcaaacccaagagaa-ctctaatcaaag 37560114  T
Q  199 accctaaaccctagagttac 218  Q
    ||||| |||| || ||||||    
T  37560115 accctcaaccttaaagttac 37560134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10925343 - 10925126
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttc---caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  10925343 tctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccataatttcta 10925245  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
     || ||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  10925244 tccattt-tttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctataatcaaa 10925147  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||    
T  10925146 gaccctcaaccctaaagttac 10925126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 45644404 - 45644619
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    || | ||||||||| |    
T  45644404 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatc 45644503  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  45644504 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcacccaagatgtttacaatgttttccaacctaagagaa-ccctaatcaaaga 45644601  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  45644602 ccctcaaccctaaagtta 45644619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40282496 - 40282282
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  40282496 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttcta 40282398  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  40282397 cccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 40282305  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  40282304 cctaaaccctagagttgctccct 40282282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 20622286 - 20622499
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaaga---gatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  20622286 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagatttgacaagttcac-aatgaacaaccctaatttc 20622383  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||     || |||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  20622384 tacccttt--tcccaatctcaccaaga-----cagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 20622476  T
Q  199 accctaaaccctagagttactcc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  20622477 accctaaaccctagagttgctcc 20622499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15820415 - 15820210
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctccc 113  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||| | | | ||    
T  15820415 cactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttttacccatct-ttcc 15820318  T
Q  114 aatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccc 209  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15820317 aatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaa-ctctaatcaaagaccctcaaccc 15820219  T
Q  210 tagagttac 218  Q
    || ||||||    
T  15820218 taaagttac 15820210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 30476502 - 30476698
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| |||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||     
T  30476502 aatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaa-gaacaaccctaatttcta-cctattt 30476599  T
Q  110 tcccaatctcaccaa----gaacaagcactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccct 203  Q
    |||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30476600 tcccaatctcaccaatattgaacaagaactcaatgattttcacccacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaataccct 30476698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 13659386 - 13659592
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||  ||||| | |||||   |||||||||||||||| |    
T  13659386 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaa-aaacaaccctaatttctatc 13659484  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacact-caccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13659485 cgttt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaa-ctctaatcaaaga 13659582  T
Q  200 ccctaaaccc 209  Q
    |||| |||||    
T  13659583 ccctcaaccc 13659592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 28265604 - 28265787
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| || | |||||||||||||||| |    
T  28265604 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-aatgaacaaccctaatttcta-c 28265701  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    || || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28265702 ctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagagaa 28265787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21054077 - 21053863
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  21054077 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 21053979  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    | ||||||  |||||||||||||||     |||||||||||||   |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  21053978 cacttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttttctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 21053886  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  21053885 cctaaaccctagagttgctccct 21053863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 13138032 - 13138239
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  || ||| ||||||||| || |||     
T  13138032 aatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaga-acgacc-taatttctatccatttt 13138129  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  13138130 tc--aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaccccaagagaa-ccctaatcaaagaccctca 13138226  T
Q  206 accctagagttac 218  Q
    |||||| ||||||    
T  13138227 accctaaagttac 13138239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 928026 - 928243
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    |||||||||||||| |    
T  928026 ctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatc 928125  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
     |||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  928126 atttt-ttccaatatcaccaaagaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaatc-ctaatcaaag 928223  T
Q  199 accctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| | |||| || ||||||    
T  928224 accttcaaccataaagttac 928243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37168416 - 37168252
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  37168416 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctac 37168318  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaat 167  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  37168317 ccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttacaat 37168252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 46065036 - 46064836
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  || || ||||||| | |||| |||||||| || |    
T  46065036 ctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaa-gaacaaacctaatttttatc 46064938  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  46064937 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaccccaagagaa-ccataatcaaaga 46064840  T
Q  200 ccct 203  Q
    ||||    
T  46064839 ccct 46064836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 13547139 - 13547302
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13547139 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaaatagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 13547237  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13547238 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 13549050 - 13549213
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13549050 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacatgaaattaggtttaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 13549148  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13549149 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 13549213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9036528 - 9036329
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccctttt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||     
T  9036528 aatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt- 9036432  T
Q  109 ctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaac 207  Q
     |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9036431 -tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 9036338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19754613 - 19754442
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19754613 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 19754515  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttac-aatgtttcc 173  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  19754514 catttttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttacgaatgtttcc 19754442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11348816 - 11348653
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11348816 ctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 11348718  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
      ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11348717 aattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 11348653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41361032 - 41360863
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  41361032 ctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 41360934  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 173  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  41360933 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcacccaagatgtttacgatgtttcc 41360863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 42298031 - 42298188
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||  |||     
T  42298031 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-aaacaaccctaatttctaccaattt- 42298128  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  42298129 tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttttactctcccaaggtgtttacaat 42298188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 47255390 - 47255508
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47255390 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 47255488  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| | |||||||||||||    
T  47255489 cattt-ttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 37033122 - 37033286
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  37033122 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctac 37033220  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  37033221 ccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 37033286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29136365 - 29136202
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29136365 ctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttccaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 29136267  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29136266 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 29136202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 193729 - 193566
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | | ||| | ||||||||||||||||||    
T  193729 ctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctaataaa-gaacaaccctaatttctacc 193631  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  193630 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcaccctcccaaggtgtttacaat 193566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 7482280 - 7482399
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  7482280 ctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctac 7482378  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    || |||  ||||||||||||||    
T  7482379 ccattt-acccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Original strand, 31925757 - 31925919
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||| ||||||||||||||    
T  31925757 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-aatgaacatccctaatttctacc 31925855  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaa 166  Q
    | ||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  31925856 cattt-ttccactctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaa 31925919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19752804 - 19752643
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  19752804 ctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaa-gaacaaccctaatttctacc 19752706  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttac 164  Q
    | |||  | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19752705 cattttactcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttac 19752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47115290 - 47115126
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  47115290 ctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctac 47115192  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  47115191 caattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagatgtttacaat 47115126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44203751 - 44203547
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  44203751 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 44203654  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  44203653 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 44203563  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  44203562 accctaaaccctagag 44203547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 40122246 - 40122418
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactat--caatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||  |||||||| |    
T  40122246 ctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaatctaatttcga 40122344  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 173  Q
    ||| ||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40122345 cccattt-ttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttttactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 40122418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Original strand, 13316513 - 13316581
Alignment:
Q  148 ctcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13316513 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctaaaccctaaagtt 13316581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34603689 - 34603595
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34603689 aatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctaccc 34603595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22079435 - 22079331
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| | ||||||||||    
T  22079435 ctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaa-gaacaaacataatttctac 22079337  T
Q  103 cctttt 108  Q
    | ||||    
T  22079336 catttt 22079331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16455739 - 16455591
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  | | ||  |||||||||  |    
T  16455739 ctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacta--gaaaaaatctaatttctcac 16455642  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc 153  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16455641 cattt-taccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6808571 - 6808507
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6808571 ctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 167
Target Start/End: Original strand, 37879007 - 37879124
Alignment:
Q  50 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttaca 147  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  37879007 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttcta-cctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttca 37879103  T
Q  148 ctc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  37879104 ctctcccaaggtgtttacaat 37879124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471519
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaatta 32471519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13938256 - 13938181
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgag-ttcttccaaagagatacaaaaga-gttacaagaaattagctttgacaagttc 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  13938256 ctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaagttc 13938181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652141
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagctt 25652141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3460815 - 3460710
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    ||| |||||||||||    
T  3460815 ctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctac 3460716  T
Q  103 cctttt 108  Q
    ||||||    
T  3460715 cctttt 3460710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 9109469 - 9109543
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttc 77  Q
    ||||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||    
T  9109469 ctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagttc 9109543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Original strand, 4535541 - 4535589
Alignment:
Q  15 actatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaatt 62  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4535541 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaatt 4535589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 46
Target Start/End: Original strand, 37876822 - 37876858
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaa 46  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37876822 aatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaa 37876858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4484377 - 4484601
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4484377 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaga-acaaccctaatttc 4484475  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4484476 tacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaa 4484575  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4484576 gaccctaaaccctagagttactccct 4484601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30833467 - 30833243
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30833467 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaaga-acaaccctaatttc 30833369  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30833368 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaa 30833269  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  30833268 aaccctaaaccctagagttactccct 30833243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45099875 - 45099660
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45099875 gaactctccaatccactatcaatgagttcttc-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 45099778  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45099777 acccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 45099679  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  45099678 gaccctaaaccctaaagtt 45099660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 4503180 - 4503395
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4503180 gaactctccaatccactatcaatgagttcttc-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 4503277  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4503278 accattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 4503376  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  4503377 gaacctaaaccctaaagtt 4503395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32289682 - 32289470
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32289682 ctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaaga-acaaccctaatttctac 32289584  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaa-cccaagagaagctctaatcaaagacc 201  Q
    |||||||   ||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  32289583 ccttttc---caatctcaccaaga-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaagact 32289492  T
Q  202 ctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32289491 ctaaaccctagagttactccct 32289470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 36205712 - 36205926
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36205712 gaactctccaatccgctgtcaatgagttcttc-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 36205809  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  36205810 accatttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 36205907  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  36205908 gaccctaaaccctaaagtt 36205926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 5723306 - 5723517
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  5723306 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaagcctaatttctacc 5723404  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5723405 cttttct--caatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 5723501  T
Q  201 cctaaaccctagagtt 216  Q
    || |||||||| ||||    
T  5723502 cccaaaccctaaagtt 5723517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 2334468 - 2334682
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  2334468 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaacccttatttctacc 2334566  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2334567 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaatac 2334664  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  2334665 cctcaaccctaaagttac 2334682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 36988126 - 36988340
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  36988126 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacata-gaacaaccctaatttctacc 36988224  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36988225 ctttt-ttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 36988322  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  36988323 cctcaaccctaaagttac 36988340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29867987 - 29867772
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29867987 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 29867889  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29867888 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 29867791  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||| | ||||||    
T  29867790 ccctcaacccaatagttac 29867772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38312358 - 38312143
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38312358 ctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 38312260  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38312259 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacacaaggtgtatacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 38312162  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
     ||| ||||||| ||||||    
T  38312161 acctcaaccctaaagttac 38312143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42362470 - 42362255
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  42362470 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 42362372  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42362371 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 42362274  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  42362273 ccctcaaccctaaagttac 42362255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 6595056 - 6595271
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6595056 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 6595154  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
     |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6595155 attttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactctccaaagtgtttacaatttttcccagcccaagagaa-ctctaatcaaagac 6595253  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  6595254 cctcaaccctaaagttac 6595271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 17057419 - 17057634
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |  |||| | ||||||||||||||||||    
T  17057419 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaa-gaacaaccctaatttctacc 17057517  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17057518 cattt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 17057615  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    || | ||||||| ||||||    
T  17057616 ccttcaaccctaaagttac 17057634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 17085402 - 17085617
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |  |||| | ||||||||||||||||||    
T  17085402 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaa-gaacaaccctaatttctacc 17085500  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17085501 cattt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 17085598  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    || | ||||||| ||||||    
T  17085599 ccttcaaccctaaagttac 17085617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 723794 - 724009
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  723794 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 723892  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    |  || | |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  723893 cagtt-ttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaa-ctctaatcaaaga 723990  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  723991 ccctcaaccctaaagttac 724009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11690619 - 11690404
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  11690619 ctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 11690521  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  11690520 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctataatcaaaga 11690423  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  11690422 ccctcaaccctaaagttac 11690404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36773680 - 36773497
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||    
T  36773680 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttattcc 36773582  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36773581 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 36773497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6266810 - 6266596
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  6266810 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 6266712  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  6266711 cccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 6266619  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  6266618 cctaaaccctagagttgctccct 6266596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 33162500 - 33162708
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33162500 ctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 33162598  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  33162599 cattt-tcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaa-ccctaatcaaaga 33162696  T
Q  200 ccctaaacccta 211  Q
    |||| |||||||    
T  33162697 ccctcaacccta 33162708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 11151641 - 11151856
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  11151641 ctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaatctaatttctacc 11151739  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11151740 cattt-tcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 11151837  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  11151838 ccctcaaccctaaagttac 11151856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 36318059 - 36318274
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36318059 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 36318157  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  36318158 cattt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagataa-ctctaatcaaaga 36318255  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |  | ||||||| ||||||    
T  36318256 cattcaaccctaaagttac 36318274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 34139820 - 34140036
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  34139820 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctac 34139918  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    || ||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34139919 ccattt-tctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaag 34140016  T
Q  199 accctaaaccctagagttac 218  Q
    ||  | ||||||| ||||||    
T  34140017 actttcaaccctaaagttac 34140036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11067417 - 11067253
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||     
T  11067417 aatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaa-gtacaacactaatttctacccattt- 11067320  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 173  Q
    | ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11067319 ttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 11067253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 14633875 - 14634091
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  14633875 ctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaatcctaatttctac 14633973  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    || ||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||     
T  14633974 ccattt-taccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaa-ctctaatcaaaa 14634071  T
Q  199 accctaaaccctagagttac 218  Q
    ||||| ||| ||| ||||||    
T  14634072 accctcaactctaaagttac 14634091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39284921 - 39284788
Alignment:
Q  87 caaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagc-actcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttcc-aacccaaga 182  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39284921 caaccctaatttctacccatttttcc-aatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 39284823  T
Q  183 gaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39284822 gaa-ctctaatcaaagaccctcaaccctaaagttac 39284788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 35446934 - 35447097
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35446934 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagattcaacaagatcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 35447032  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  35447033 aattt-taccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 35447097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45727047 - 45726884
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  45727047 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaactctaatttctacc 45726949  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  45726948 cattt-tcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 45726884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 1631783 - 1631945
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1631783 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaatcctaatttctaccc 1631881  T
Q  105 ttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaat 167  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  1631882 attt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttacaat 1631945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815512
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   ||||    |||||||||||| |||    
T  7815323 ctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaacc 7815422  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttac-aatgtttc-caacccaagagaagctct 190  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  7815423 tttttct--caatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgtttctcaacccaatagaacctct 7815512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13121879 - 13121698
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||    |||||||||||||||| |||      
T  13121879 aatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaa--ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattt-- 13121784  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctct 190  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13121783 tcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaagctct 13121698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26353302 - 26353125
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||    |||| ||||||||||     
T  26353302 ctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctaca 26353203  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaag-gtgtttacaatgtttccaacccaagagaa 185  Q
    ||||| |  |||||||||||  || || |||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26353202 ctttttt--caatctcacca--aagaa-cactcaataattttcactcaccgagagtgtttacaatgttcccaactcaagagaa 26353125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 14202462 - 14202672
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||      ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||    
T  14202462 ctctccaatctactatcaatgagttcttacaaag-gat------gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaaga-acaaacataatttctacc 14202553  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag---cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    | ||| |||||||||||  || ||| |||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14202554 cattt-tcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 14202651  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||||| |||| || ||||||    
T  14202652 gaccctcaaccataaagttac 14202672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885583
Alignment:
Q  20 caatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctc 119  Q
    |||||||||||| || || | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||| | ||| ||||||| |     
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctactcattt-tcccaatttt 24885666  T
Q  120 accaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    || || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24885665 acaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccatgagaa-ctctaatcaaaga 24885583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 12647435 - 12647639
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  12647435 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 12647532  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  12647533 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 12647623  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  12647624 accctaaaccctagag 12647639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 17490204 - 17490277
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaag 83  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  17490204 aatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag 17490277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24398176 - 24398027
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    |||| ||| ||||||    
T  24398176 ctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctac 24398077  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc 150  Q
    |||||  || |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  24398076 cctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactc 24398027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11049666 - 11049479
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatac-aaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa--ggtac-aaccctaatttctaccct 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||||   | || ||||||||||| |||| |    
T  11049666 aatctactatcaatgagttcttacaaagagatactaaaagggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttataccat 11049567  T
Q  106 tttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctct 190  Q
    ||  ||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11049566 tt--tcctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacacaagagaagctct 11049479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7451230 - 7451173
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7451230 aatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 33648290 - 33648182
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||    ||||||||||| |||    
T  33648290 ctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttac 33648191  T
Q  103 ccttttctc 111  Q
    | |||||||    
T  33648190 cattttctc 33648182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 13656081 - 13656202
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |    |||||||||||||    
T  13656081 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttct 13656178  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaaga 126  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||    
T  13656179 acccctt--tcccaatctcaccaaga 13656202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 42019920 - 42019986
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc---caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42019920 ctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 42019986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811335
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagctt 34811335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 42261545 - 42261599
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42261545 cactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagctt 42261599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 7597074 - 7597135
Alignment:
Q  18 atcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttca 78  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  7597074 atcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaagttca 7597135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3897109 - 3897045
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3897109 ctctctaatccactttcaatgagttctttacaaaattatacaaaagagttacaaaaaattagctt 3897045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41586417 - 41586349
Alignment:
Q  152 ccaaggtgtttacaa-tgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||    
T  41586417 ccaaggtgtttacaactgttttccaacccaagagaagctctcaccaaagacactcaaccctaaagttac 41586349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11208 - 11432
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11208 gaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaaga-acaaccctaatttc 11306  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11307 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaa 11406  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  11407 gaccataaaccctagagttactccct 11432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8782 - 9006
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8782 gaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaaga-acaaccctaatttc 8880  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8881 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatggtttacactcaccaaggtctttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaa 8980  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8981 gaccctaaagcctagagttactccct 9006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5258191 - 5258414
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5258191 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 5258289  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5258290 acccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 5258388  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||    
T  5258389 gaccctaaaccctaaagtttctccct 5258414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 5260370 - 5260586
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5260370 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 5260468  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5260469 acccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 5260567  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  5260568 gaccctaaaccctaaagtt 5260586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23200185 - 23200407
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  23200185 gaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaactctaatttct 23200283  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23200284 accatttt-tcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag 23200382  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  23200383 accctaaaccctagagttgctccct 23200407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23197986 - 23198208
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  23197986 gaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-aaacaactctaatttct 23198084  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23198085 accatttt-tcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag 23198183  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  23198184 accctaaaccctagagttgctccct 23198208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9636173 - 9636390
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9636173 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 9636271  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  9636272 acccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaa 9636371  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  9636372 gaccctaaaccctaaagtt 9636390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45095281 - 45095070
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45095281 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 45095183  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
     |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45095182 attt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 45095086  T
Q  201 cctaaaccctagagtt 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  45095085 cctaaaccctaaagtt 45095070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37408570 - 37408364
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  37408570 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctaccctttt- 37408473  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaa 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37408472 tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcactaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccataaa 37408374  T
Q  207 ccctagagtt 216  Q
    ||||| ||||    
T  37408373 ccctaaagtt 37408364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7762383 - 7762169
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7762383 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 7762285  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7762284 ctttt-tctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttcacaatatttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 7762187  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  7762186 cctcaaccctaaagttac 7762169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 19683939 - 19684153
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19683939 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 19684037  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19684038 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 19684135  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  19684136 cccttaaccctaaagtta 19684153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7764582 - 7764371
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7764582 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 7764484  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    |||||| |    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  7764483 cttttccc----tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagagaa-atctaatcaaagac 7764389  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||| ||| ||||||    
T  7764388 cctcaactctaaagttac 7764371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 5236506 - 5236721
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5236506 ctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 5236604  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5236605 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 5236702  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  5236703 ccctcaaccctaaagttac 5236721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 801211 - 801003
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  801211 actctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatga-acaaccctaatttct 801113  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  801112 acccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 801020  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  801019 ctctaaaccctagagtt 801003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40734616 - 40734402
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40734616 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 40734518  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40734517 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 40734420  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  40734419 ccctcaaccctaaagtta 40734402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51398932 - 51398717
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  51398932 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaa-gaacaaccctaatttctacc 51398834  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  51398833 cattt-ttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaatatttcccaacccaaga-aaactctaatcaaaga 51398736  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    | || ||||||| ||||||    
T  51398735 ctctcaaccctaaagttac 51398717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 22835052 - 22835267
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  22835052 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 22835150  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22835151 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgattacaatgtttcccaacacaagagaa-ctctaatcaaaga 22835248  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  22835249 ccctcaaccctaaagttac 22835267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 39153411 - 39153626
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| || | |||| |||||||||||||    
T  39153411 ctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcac-aatgaacaaacctaatttctacc 39153509  T
Q  104 cttttctcccaatctcac-caagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39153510 cattt-tcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 39153607  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  39153608 ccctcaaccctaaagttac 39153626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 760965 - 760751
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||  |||||||||||||    
T  760965 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacagacctaatttctacc 760867  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  760866 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 760769  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  760768 cccttaaccctaaagtta 760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 29196436 - 29196626
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||    
T  29196436 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacc 29196535  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctct 190  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29196536 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaacctct 29196626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40735501 - 40735286
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40735501 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 40735403  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacac-tcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  40735402 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagagaa-ctttaatcaaaga 40735305  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  40735304 ccctcaaccctaaagttac 40735286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29682477 - 29682269
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| | |||||||||||    
T  29682477 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacataatttctacc 29682379  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29682378 cattt-tcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 29682281  T
Q  200 ccctaaacccta 211  Q
    |||| |||||||    
T  29682280 cccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29810986 - 29810778
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |    
T  29810986 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaactctaatttcta-c 29810889  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
     | || ||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29810888 atattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaa-ctctaatcaaaga 29810790  T
Q  200 ccctaaacccta 211  Q
    |||| |||||||    
T  29810789 ccctcaacccta 29810778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9581400 - 9581187
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  9581400 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 9581302  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||  ||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9581301 catt--tccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 9581205  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  9581204 cccttaaccctaaagtta 9581187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32891222 - 32891006
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    || | |||||||||||    
T  32891222 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacc 32891123  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||    
T  32891122 cattt-tctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaccccaagagaa-ccctaatcaaaga 32891025  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  32891024 ccctcaaccctaaagttac 32891006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 53921553 - 53921768
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||| |||||||||||||    
T  53921553 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaattagctttaacaagctcacaaa-caacaaacctaatttctacc 53921651  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  53921652 cattt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtttttacaatgttttccaacccaaga-aaaccctaatcaaaga 53921749  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    | || ||||||| ||||||    
T  53921750 ctctcaaccctaaagttac 53921768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44331663 - 44331470
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  44331663 ctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatggcttacaagaaattagcttcaacaagctcac-aatgaacaaccctaatttctacc 44331565  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaa 196  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44331564 cattt-tcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaa 44331470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29813181 - 29812966
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  29813181 ctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttcta-c 29813084  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    || || | |||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  29813083 ctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgcttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaaga 29812985  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  29812984 ccctcaaccctaaagttac 29812966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 5433955 - 5434091
Alignment:
Q  33 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag 131  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5433955 caaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaag 5434054  T
Q  132 -cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaat 167  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5434055 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaat 5434091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6716618 - 6716405
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  6716618 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 6716521  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  6716520 cccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 6716428  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6716427 cctaaaccctagagttactccct 6716405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4570070 - 4569906
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  4570070 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcac-aatgaacaaccctaatttctacc 4569972  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc-aagaac-aagcactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4569971 cattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 4569906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16499147 - 16498942
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||  ||||| | |||||   |||||||||||||||| |    
T  16499147 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaa--aacaaccctaatttctatc 16499050  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacact-caccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16499049 cgttt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaa-ctctaatcaaaga 16498952  T
Q  200 ccctaaaccc 209  Q
    |||| |||||    
T  16498951 ccctcaaccc 16498942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 44700528 - 44700712
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44700528 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 44700626  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44700627 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaa 44700712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54635243 - 54635030
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  54635243 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 54635146  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  54635145 cccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 54635053  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  54635052 cctaaaccctagagttgctccct 54635030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31314563 - 31314380
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  31314563 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcac-aatgaacaaccctaatttctacc 31314465  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    | ||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31314464 cattt-tctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 31314380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34491330 - 34491212
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34491330 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 34491232  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  34491231 cattt-tcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 32744492 - 32744691
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| |||     
T  32744492 aatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaaga-acaaac-taatttctacccatttt 32744589  T
Q  110 tcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaacc 208  Q
    | | |||||||| ||  ||      |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32744590 ttc-aatctcacaaaatac------tcaatgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctcaacc 32744681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 7780051 - 7780173
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  7780051 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag-gttacaagaaattagatttgacaagttcac-aatgaacaaccctaatttc 7780148  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaaga 126  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  7780149 tacccttt--tcccaatctcacgaaga 7780173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 43401852 - 43402015
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43401852 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 43401950  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  43401951 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 43402015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 9666516 - 9666733
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    ||  ||||||||||||    
T  9666516 ctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacc 9666615  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    | ||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||    
T  9666616 cattt-ttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaactgaagagaa-ccctaatcaaag 9666713  T
Q  199 accctaaaccctagagttac 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  9666714 accctcaaccctaaagttac 9666733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 49199519 - 49199683
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  49199519 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccttaatttctac 49199617  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  49199618 ccattt-tcccaatctcaccaacgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 49199683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30236243 - 30236080
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30236243 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 30236145  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacact-caccaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  30236144 cattt-tcccaatctcatcaatgaacaagacactc-atgattttcactatcccaaggtgtttacaat 30236080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45283105 - 45282888
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaaga----gatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatt 97  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||    
T  45283105 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatt 45283008  T
Q  98 tctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  45283007 tctacccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttgcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaa 45282915  T
Q  198 g-accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  45282914 gaaccctaaaccctagagttgctccct 45282888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 54593822 - 54593659
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |     
T  54593822 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctgca 54593724  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  54593723 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 54593659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 23391965 - 23392142
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||  ||||| ||||||| | |||| | |||||||||| | |||     
T  23391965 aatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacttaatttctactcattt- 23392062  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23392063 tcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 23392142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46860592 - 46860427
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  46860592 ctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 46860494  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatg-atttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  46860493 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctcccaaggtgtttacaat 46860427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 6095649 - 6095812
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||  | ||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  6095649 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaagaagtttacaaa-gaacaaccctaatttctact 6095747  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  6095748 cattt-tcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 6095812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 41819574 - 41819737
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  41819574 tctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttagacaagctcacaaa-aaacaaccctaatttctacc 41819671  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  41819672 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaat 41819737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 43403794 - 43403958
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaa-aagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  43403794 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaa-gaacaagcctaatttctac 43403892  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  43403893 ccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 43403958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 46173475 - 46173377
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46173475 ctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25637546 - 25637342
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  25637546 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 25637449  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  25637448 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 25637358  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  25637357 accctaaaccctagag 25637342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3617569 - 3617363
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  3617569 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 3617472  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  3617471 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 3617379  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  3617378 accctaaaccctagag 3617363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718589
Alignment:
Q  88 aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 6718626  T
Q  188 tctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6718625 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagttactccct 6718589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36018970 - 36018806
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  36018970 ctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttcaac 36018873  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  36018872 ccattt-tcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaat 36018806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 23410379 - 23410562
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||| | |||| | |||||||||||  ||||| ||||||| | | || | |||||||||||    
T  23410379 ctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttatacgaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaataaacataatttctacc 23410477  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaa 185  Q
    | ||| ||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23410478 cattt-tccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa 23410562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 4600793 - 4600998
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    |||||||||||    
T  4600793 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 4600890  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4600891 ctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaag 4600981  T
Q  199 -accctaaaccctagag 214  Q
     ||||||||||||||||    
T  4600982 aaccctaaaccctagag 4600998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340414
Alignment:
Q  21 aatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctca 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaacctcaatttctaccaattt-tcccaatctca 31340365  T
Q  121 ccaa-gaac-aagcactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    |||| |||| || ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  31340366 ccaatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 31340414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 40913411 - 40913352
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40913411 ctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Original strand, 4055819 - 4055888
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaaga-gttacaagaaattagctttgacaagttc 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4055819 aatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttc 4055888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47304369 - 47304254
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||| |||| |||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  47304369 ctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggttacaagatattaacttcaacaagctcacaaa-gaacaaccataatttctacc 47304271  T
Q  104 cttttctcccaatctcac 121  Q
    | ||| || |||||||||    
T  47304270 cattt-tctcaatctcac 47304254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5373336 - 5373200
Alignment:
Q  20 caatgagttc-ttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatct 118  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||    || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5373336 caatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttctacccttttttcccaatct 5373237  T
Q  119 caccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc 153  Q
    |  ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  5373236 cttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcacc 5373200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Original strand, 26386612 - 26386746
Alignment:
Q  86 acaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttcc-aacccaag 181  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| |||| |||    
T  26386612 acaaacctaatttctacccattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttaccctgtttcccaacctaag 26386710  T
Q  182 agaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  26386711 agaa-ctctaatcaaagactctcaaccctaaagttac 26386746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 4598572 - 4598777
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    |||||||||||    
T  4598572 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 4598669  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  || ||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4598670 ctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaag 4598760  T
Q  199 -accctaaaccctagag 214  Q
     ||||||||||||||||    
T  4598761 aaccctaaaccctagag 4598777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10211514 - 10211309
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    |||||||||||    
T  10211514 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 10211417  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  10211416 ctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaag 10211326  T
Q  199 -accctaaaccctagag 214  Q
     ||||||||||||||||    
T  10211325 aaccctaaaccctagag 10211309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 162
Target Start/End: Original strand, 35138762 - 35138915
Alignment:
Q  11 atccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||  |||| || | |||| | |||||||||||| ||||    
T  35138762 atccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaa-gaacaaacataatttctacccatttc 35138860  T
Q  110 tcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgttt 162  Q
    ||    |||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  35138861 tcaatctctttccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttt 35138915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10209207 - 10209089
Alignment:
Q  88 aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagc 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| |||||||||||   |    
T  10209207 aaccctaatttctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtac 10209117  T
Q  188 tctaatcaaag-accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10209116 tctaatcaaagaaccctaaaccctagag 10209089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 1313854 - 1313925
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttc-ttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaag 74  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  1313854 ctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaag 1313925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 4075520 - 4075595
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagag-ttacaagaaattagctttgacaagttc 77  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4075520 ctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttc 4075595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Original strand, 7782370 - 7782411
Alignment:
Q  182 agaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7782370 agaagctctaatcaaagactctaaaacctagagttactccct 7782411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 55302022 - 55302079
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaat 61  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  55302022 ctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 182
Target Start/End: Original strand, 2075189 - 2075287
Alignment:
Q  87 caaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgttta-caatgttt-ccaacccaaga 182  Q
    |||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  2075189 caactctaattactaccatttt-tcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcagcaaggtgtttataaatgtttcccaacccaaga 2075287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20937762 - 20937715
Alignment:
Q  17 tatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20937762 tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaatta 20937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3328212 - 3328174
Alignment:
Q  152 ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctc 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3328212 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaagctc 3328174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 51352161 - 51352237
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaa 81  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  51352161 ctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaatg-gttacaagaaattaactttaaaaagctcacaa 51352237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 54739004 - 54739107
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttc-ttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||  ||||| ||||||||    ||| ||||||||||||    
T  54739004 tctccaatccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttac-ataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 54739102  T
Q  104 ctttt 108  Q
     ||||    
T  54739103 atttt 54739107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31218378 - 31218162
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31218378 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 31218280  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31218279 accattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 31218181  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  31218180 gaccctaaaccctaaagtt 31218162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17982774 - 17982558
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17982774 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 17982676  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17982675 acccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 17982577  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  17982576 gaccctaaaccctaaagtt 17982558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 19945406 - 19945623
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaag-agttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  19945406 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccataatttc 19945504  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  19945505 tacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagagaa-ctctaatcaa 19945603  T
Q  197 agaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  19945604 agactctaaaccctaaagtt 19945623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 34254381 - 34254591
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34254381 ctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 34254479  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaagacc 201  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34254480 cttt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagagaa-ctctaatcaaagacc 34254576  T
Q  202 ctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||| ||||    
T  34254577 ctaaaccctaaagtt 34254591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44303976 - 44303759
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  44303976 gaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccttaatttct 44303878  T
Q  101 accc-ttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaa 196  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44303877 accctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaa 44303779  T
Q  197 agaccctaaaccctagagtt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  44303778 agaccctaaaccctaaagtt 44303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 34256557 - 34256767
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34256557 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 34256655  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaagacc 201  Q
     |||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34256656 attt--ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagataa-ctctaatcaaagacc 34256752  T
Q  202 ctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||| ||||    
T  34256753 ctaaaccctaaagtt 34256767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 1746266 - 1746481
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1746266 gaactctccaatccactatcaatgagttcttc-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 1746363  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||| |||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  1746364 acctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccaaagagaa-ctctaatcaag 1746462  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  1746463 gaccctaaaccctaaagtt 1746481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42498312 - 42498097
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42498312 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 42498214  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  42498213 tttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaacgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaagac 42498115  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  42498114 cctcaaccctaaagttac 42498097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43036541 - 43036326
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43036541 ctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 43036443  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  43036442 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 43036345  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  43036344 ccctcaaccctaaagttac 43036326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2627857 - 2627640
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttcca-aagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2627857 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatga-acaaccctaattt 2627759  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2627758 ctacccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaa 2627666  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2627665 gactctaaaccctagagttactccct 2627640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15212904 - 15212689
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15212904 ctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 15212806  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15212805 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 15212708  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  15212707 ccctcaaccctaaagttac 15212689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 12702684 - 12702896
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12702684 ctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 12702782  T
Q  104 c----ttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaa 196  Q
    |    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12702783 cttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaa 12702881  T
Q  197 agaccctaaacccta 211  Q
    ||||||| |||||||    
T  12702882 agaccctcaacccta 12702896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4731776 - 4731561
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4731776 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaa-gagcaaccctaatttctacc 4731678  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4731677 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 4731580  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  4731579 ccctcaaccctaaagttac 4731561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33352268 - 33352053
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  33352268 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttttacc 33352170  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33352169 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 33352072  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  33352071 ccctcaaccctaaagttac 33352053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27811390 - 27811188
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  27811390 aatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt- 27811293  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27811292 tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacctaagagaa-ctctaatcaaagaccctca 27811194  T
Q  206 acccta 211  Q
    ||||||    
T  27811193 acccta 27811188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30143458 - 30143245
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30143458 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 30143360  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaagcactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    | ||| |||||||||  |||| ||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30143359 cattt-tcccaatctggccaatgaacaag-acacaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 30143263  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  30143262 cctcaaccctaaagttac 30143245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5689389 - 5689175
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||    
T  5689389 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaa-gcaccaccttaatttctacc 5689291  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| | |||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  5689290 cattt-ttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccaaactcaagagaa-ccctaatcaaaga 5689193  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  5689192 ccctcaaccctaaagtta 5689175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 1292514 - 1292728
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  1292514 tctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacttaatttctaccc 1292612  T
Q  105 ttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
     ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1292613 attt-tctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgttcacagtgtttcccaacccaaaagaa-ctctaatcaaagac 1292710  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  1292711 cctcaaccctaaagttac 1292728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 3303726 - 3303935
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||| | |||||||||||| |||     
T  3303726 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaa-gaacaaacttaatttctacccattt- 3303823  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  3303824 tcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ccctaatcaaagaccctca 3303922  T
Q  206 accctagagttac 218  Q
    ||| || ||||||    
T  3303923 accgtaaagttac 3303935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6599090 - 6598876
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||| | |||| | |||||||||||    
T  6599090 ctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaa-gaacaaacttaatttctacc 6598992  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6598991 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 6598894  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  6598893 ccctcaaccctaaagtta 6598876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6674543 - 6674329
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||| | |||| | |||||||||||    
T  6674543 ctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaa-gaacaaacttaatttctacc 6674445  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6674444 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 6674347  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  6674346 ccctcaaccctaaagtta 6674329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765697
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 9765765  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 173  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9765764 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa----tttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 9765697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 1345418 - 1345636
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  1345418 gaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaa-gaacaaccctaatttct 1345516  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaa 196  Q
    || | ||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1345517 acacattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaactcaagagaa-ctctaatcaa 1345614  T
Q  197 agaccctaaaccctagagttac 218  Q
    | ||||| ||||||| ||||||    
T  1345615 aaaccctcaaccctaaagttac 1345636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4162603 - 4162403
Alignment:
Q  16 ctatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaa 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||       
T  4162603 ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttctcaaa-gaacaaacctaacttctacccattt-tcc--- 4162509  T
Q  116 tctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaacccta 211  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  4162508 tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgctcaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa-ccctaatcaaagaccctcaacccta 4162410  T
Q  212 gagttac 218  Q
     ||||||    
T  4162409 aagttac 4162403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18141938 - 18141730
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18141938 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaa-cctaatttctacc 18141841  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  18141840 cattt-tcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggtgtttacaaatgtttcccaacctaagagaa-ccctaatcaaag 18141743  T
Q  199 accctaaacccta 211  Q
    ||||| |||||||    
T  18141742 accctcaacccta 18141730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44353905 - 44353747
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  44353905 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt- 44353808  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaat 167  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  44353807 tcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaat 44353747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3439622 - 3439409
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || |    ||||||||||||||    
T  3439622 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gccaagttcataatgaacaaaccctaatttcta 3439525  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  3439524 cccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 3439432  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  3439431 cctaaaccctagagtttctccct 3439409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4283642 - 4283479
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  4283642 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-aaacaaccctaatttctacc 4283544  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4283543 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcctaaggtgtttacaat 4283479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25690073 - 25689860
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  25690073 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 25689976  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  25689975 cc--tttttcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 25689883  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  25689882 cctaaaccctagagcttctccct 25689860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18655518 - 18655355
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  18655518 ctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccttaatttctacc 18655420  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaac-aagcactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18655419 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 18655355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40321198 - 40321015
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||||| |||  ||||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  40321198 ctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcac-aatgaacaaccctaatttctacc 40321100  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    | ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40321099 cattt-tcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcactcaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaa 40321015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 42435042 - 42435204
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42435042 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctaccc 42435140  T
Q  105 ttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  42435141 attt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 42435204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10929876 - 10929719
Alignment:
Q  45 aaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10929876 aaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaga-acaaacataatttctacccattt-tccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgat 10929779  T
Q  143 ttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaagaccc 202  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10929778 tttcactaatccaaggtgtttacaatgttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccc 10929719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 19491749 - 19491918
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  19491749 ctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 19491847  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 173  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  19491848 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcacccaagatgtttacgatgtttcc 19491918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40221863 - 40221700
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40221863 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 40221765  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  40221764 cattt-taccaatctcaccaaagaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 40221700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 41364925 - 41365112
Alignment:
Q  32 ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctca-ccaagaacaa 130  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  ||||||| | |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |  ||||||    
T  41364925 ccaaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaa-gaacaaacctaatttctaccaattt-tcccaatctcagtcttgaacaa 41365022  T
Q  131 g-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41365023 gacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaa-ctctaatcaaagaccctcaaccctaaagttac 41365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30291725 - 30291561
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    || |||||||||||||    
T  30291725 ctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacc 30291626  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaa 166  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  30291625 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaa 30291561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 40328898 - 40328782
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  40328898 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctac 40328800  T
Q  103 ccttttctcccaatctcac 121  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  40328799 ccattt-tcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 41366664 - 41366879
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||  ||||| | ||||| | |||| | |||||||||||    
T  41366664 ctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaa-gaacaaacataatttctacc 41366762  T
Q  104 cttttctcccaatctca-ccaagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || ||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41366763 cattt-tctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatctaagagaa-ctctaatcaaaga 41366860  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
     ||| ||||||| ||||||    
T  41366861 tcctcaaccctaaagttac 41366879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 8965751 - 8965904
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctccc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||  ||||  ||| ||||    ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  8965751 cactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggttataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacc--tttttccc 8965848  T
Q  114 aatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaa 166  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8965849 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 8965904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11384102 - 11383941
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11384102 tctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa-gaacaaccctaatttctaccc 11384004  T
Q  105 ttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
     ||| | |||||||||  | ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11384003 attt-ttccaatctcataatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 11383941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 18106139 - 18106328
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctccc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||| | |||||  || |||||| || ||| | ||    
T  18106139 cactatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaa-gaacaactatagtttctatccattt-ttcc 18106235  T
Q  114 aatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccct 203  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  18106236 aatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-atctaattaaagaccct 18106328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3772310 - 3772161
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | |||| ||||||||||| |    
T  3772310 ctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaattagcttaaataagctcacaaa-gaacaaacctaatttctatc 3772212  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc 153  Q
      ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  3772211 aattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactcacc 3772161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 10930249 - 10930365
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  || || ||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  10930249 ctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaa-gagcaaccctaatttctatc 10930347  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc 122  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  10930348 cattt-tcccaatctcacc 10930365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4733787 - 4733712
Alignment:
Q  144 tacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4733787 tacactcatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctcaaccctaaagttac 4733712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 211
Target Start/End: Original strand, 4743359 - 4743461
Alignment:
Q  112 ccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaac 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  4743359 ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagattc-ctaatcaaagaccctcaac 4743457  T
Q  208 ccta 211  Q
    ||||    
T  4743458 ccta 4743461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8153876 - 8153813
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8153876 ctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatatacaaaagagttacacgaatttagctt 8153813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10015198 - 10015136
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10015198 ctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15290643 - 15290438
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    |||||||||||    
T  15290643 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 15290546  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  15290545 ctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaag 15290455  T
Q  199 -accctaaaccctagag 214  Q
     ||||||||||||||||    
T  15290454 aaccctaaaccctagag 15290438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15471012 - 15470807
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    |||||||||||    
T  15471012 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 15470915  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  15470914 ctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaag 15470824  T
Q  199 -accctaaaccctagag 214  Q
     ||||||||||||||||    
T  15470823 aaccctaaaccctagag 15470807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 42575373 - 42575578
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaa-ccctaatt 97  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |  |||| ||||||||    
T  42575373 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatga-acaatccctaatt 42575469  T
Q  98 tctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  42575470 tctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaa 42575560  T
Q  198 g-accctaaaccctagag 214  Q
    | ||||||||||||||||    
T  42575561 gaaccctaaaccctagag 42575578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10015117 - 10015051
Alignment:
Q  152 ccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  10015117 ccaacgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctcaaccataaagttac 10015051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 3073923 - 3073981
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaatt 62  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3073923 ctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 32902223 - 32902287
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttcc-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32902223 ctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagctt 32902287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 11712056 - 11712114
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  11712056 aatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagctt 11712114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 4733824 - 4733784
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagataca 44  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4733824 ctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7597733 - 7597669
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7597733 ctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagctt 7597669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 30909485 - 30909426
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 64  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30909485 ctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaa-gagttacaagaaattag 30909426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 822
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1036 gaactctccaatccactatcaatgagttgttc-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 939  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  938 acccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaag 840  T
Q  199 accctaaaccctagagtt 216  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  839 accctaaaccctaaagtt 822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 30834583 - 30834799
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30834583 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 30834681  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30834682 acccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaa-ctctaatcaaa 30834780  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  30834781 gaccataaaccctaaagtt 30834799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2171579 - 2171801
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2171579 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaagg-gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaga-acaaccctaatttct 2171676  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2171677 accatttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaa 2171775  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2171776 gaccctaaaccctagagttgctccct 2171801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16452376 - 16452592
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16452376 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 16452474  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16452475 acccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaa-ctctaatcaaa 16452573  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  16452574 gaccctaaactctaaagtt 16452592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 5406250 - 5406461
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5406250 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 5406348  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
     |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5406349 attt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaa-ctctaatcaaagac 5406445  T
Q  201 cctaaaccctagagtt 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  5406446 cctaaaccctaaagtt 5406461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 5410575 - 5410786
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5410575 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 5410673  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
     |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5410674 attt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaa-ctctaatcaaagac 5410770  T
Q  201 cctaaaccctagagtt 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  5410771 cctaaaccctaaagtt 5410786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 5413444 - 5413655
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  5413444 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaa-gaacaaccctaatttctacc 5413542  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
      ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5413543 --tttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccgagagaa-ctctaatcaaagac 5413639  T
Q  201 cctaaaccctagagtt 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  5413640 cctaaaccctaaagtt 5413655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 33160402 - 33160618
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  33160402 ctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaactctaatttctacc 33160500  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatga-tttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
     |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33160501 tttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 33160599  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    | || ||||||| ||||||    
T  33160600 ctctcaaccctaaagttac 33160618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 31404725 - 31404937
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31404725 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 31404823  T
Q  104 cttttctcccaatctcac-caagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatc-aaaga 199  Q
     |||  ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31404824 attt--tcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa-ctctaatcaaaaga 31404920  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||| ||||    
T  31404921 ccctaaaccctaaagtt 31404937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 412223 - 412007
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  412223 gaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgataagttcacaatga-acaaccctaattt 412125  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  412124 ctacctttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag 412032  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  412031 actctaaaccctagagttactccct 412007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 9183081 - 9183296
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9183081 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 9183179  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9183180 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaggagaa-ctctaatcaaaga 9183277  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  9183278 ccctcaaccctaaagttac 9183296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 28137458 - 28137672
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28137458 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 28137556  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28137557 cattt-tcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 28137654  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  28137655 ccctcaaccctaaagtta 28137672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3072806 - 3073023
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  3072806 gaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatga-acaaccctaattt 3072904  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3072905 ctaccattttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaa 3072997  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3072998 gactctaaaccctagagtttctccct 3073023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6097498 - 6097704
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  6097498 gaactctccaatccactatcaatgagttctt----------acaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaaga-acaatcctaatttct 6097586  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||| ||||   ||||||||||||| |     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||     
T  6097587 accattttt--ccaatctcaccaaaa-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatactctaatcaaaga 6097679  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  6097680 accctaaaccctagagttgctccct 6097704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 26954336 - 26954550
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  26954336 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttatacc 26954434  T
Q  104 cttttctcccaatctcac-caagaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
      ||  ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||    
T  26954435 aatt--tcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactccccaaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagataa-ctctaatcaaaga 26954531  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    | || ||||||| ||||||    
T  26954532 ctctcaaccctaaagttac 26954550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 3038953 - 3039141
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  3038953 ctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagctcac-aatgaacaaccctaatttctacc 3039051  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctct 190  Q
      ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3039052 aattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctct 3039141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21593782 - 21593619
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21593782 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 21593684  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  21593683 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 21593619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27647979 - 27647768
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  27647979 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 27647882  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  || ||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  27647881 cccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacatggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 27647791  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  27647790 cctaaaccctagagtttctccct 27647768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 33211235 - 33211435
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||   |||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  33211235 ctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgagctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaa-gaacaaccataatttctacc 33211333  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaac-aagcactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
      ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33211334 aattt-tcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagtgacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 33211431  T
Q  200 ccct 203  Q
    ||||    
T  33211432 ccct 33211435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16554988 - 16554781
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||    
T  16554988 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 16554891  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    |||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  16554890 acccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaa 16554798  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  16554797 ccctaaaccctagagtt 16554781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16631544 - 16631337
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||    
T  16631544 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 16631447  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    |||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  16631446 acccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaa 16631354  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  16631353 ccctaaaccctagagtt 16631337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21589049 - 21588931
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21589049 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 21588951  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  21588950 cattt-tcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17763102 - 17762990
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  17763102 aatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt- 17763005  T
Q  110 tcccaatctcaccaa 124  Q
    || ||||||||||||    
T  17763004 tctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 16578567 - 16578774
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||    
T  16578567 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttct 16578664  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    |||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   ||| |||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  16578665 acccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaa 16578757  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  16578758 ccctaaaccctagagtt 16578774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16616813 - 16616606
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||    
T  16616813 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttct 16616716  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    |||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   ||| |||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  16616715 acccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaa 16616623  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  16616622 ccctaaaccctagagtt 16616606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16653231 - 16653024
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||||||||| |    
T  16653231 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaattttt 16653134  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    |||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  16653133 acccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaa 16653041  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  16653040 ccctaaaccctagagtt 16653024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17758141 - 17758026
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17758141 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 17758043  T
Q  104 cttttctcccaatctcac 121  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  17758042 cattt-tcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 2972989 - 2973107
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  2972989 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 2973087  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  2973088 cattt-tcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5043745 - 5043582
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||     
T  5043745 ctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctact 5043647  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5043646 cattt-tctcaatctcacgaatgaacaagacactc-atgattttcactctcacaaggtgtttacaat 5043582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 3808758 - 3808877
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||     
T  3808758 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttcta- 3808855  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  3808856 cctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 26830173 - 26830337
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  26830173 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaactctaatttctacc 26830271  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc--aagaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| | |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  26830272 cattt-ttccaatctcacccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 26830337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6027366 - 6027162
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  6027366 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 6027269  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  6027268 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 6027178  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  6027177 accctaaaccctagag 6027162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25421425 - 25421219
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  25421425 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 25421328  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  25421327 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 25421235  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  25421234 accctaaaccctagag 25421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16567196 - 16567110
Alignment:
Q  132 cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagtta 217  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16567196 cactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaa-ctctaatcaaagacccttaaccctaaagtta 16567110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 22424876 - 22424995
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa--gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  22424876 ctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttcta 22424973  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    ||| ||| | |||||||||||||    
T  22424974 cccattt-ttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 603139 - 603237
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  603139 tctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaacacaaatttctaccc 603237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16569033 - 16568953
Alignment:
Q  132 cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaacccta 211  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16569033 cactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaa-ctctaatcaaagacccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045357
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||   |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    |||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctac 4045443  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    | |||  |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  4045442 cattt--tcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttcccaactcaagagaa 4045357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Original strand, 33342241 - 33342359
Alignment:
Q  88 aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagc 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |    
T  33342241 aaccctaatttctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 33342331  T
Q  188 tctaatcaaag-accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33342332 tctaatcaaagaaccctaaaccctagag 33342359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 25073686 - 25073611
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttc-ttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcac 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  25073686 tctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcac 25073611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 5409119 - 5409163
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaag 48  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5409119 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaag 5409163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26800705 - 26800642
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26800705 ctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagttacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35854035 - 35853820
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35854035 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 35853937  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  35853936 accctttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctcaaatcaaa 35853839  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  35853838 gaccctaaaccctaaagtt 35853820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39731490 - 39731274
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39731490 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaaga-acaaccctaatttc 39731392  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||||||   |||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39731391 tacccttttt--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag 39731299  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39731298 accctaaaccctagagttactccct 39731274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 25767007 - 25767224
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25767007 gaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttc 25767105  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    ||||||||| | |||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||    
T  25767106 taccctttt-ttccaatctca--atgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttc---ccaaagagaaactctaatcaaag 25767199  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  25767200 accctaaaccctagagttgctccct 25767224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48408924 - 48408700
Alignment:
Q  2 aactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagag-ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||    
T  48408924 aactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaaga-acaacattaatttc 48408826  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48408825 taccctttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaa 48408727  T
Q  197 agaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48408726 agaccctaaaccctagagttgctccct 48408700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4178885 - 4178680
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||     
T  4178885 aatccactatcaatgagttcttc-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaa-gaacaaccctaatttcta-ccttttt 4178789  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaa 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4178788 tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctaaa 4178690  T
Q  207 ccctagagtt 216  Q
    ||||| ||||    
T  4178689 ccctaaagtt 4178680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29991171 - 29990960
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |    
T  29991171 ctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-taacaaccctaatttctatc 29991073  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29991072 cttt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 29990976  T
Q  201 cctaaaccctagagtt 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  29990975 cctaaaccctaaagtt 29990960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 14069883 - 14070098
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14069883 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 14069981  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtt-tccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14069982 ctttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 14070079  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| | ||||| ||||||    
T  14070080 ccctcagccctaaagttac 14070098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 14379911 - 14380126
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14379911 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 14380009  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtt-tccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14380010 ctttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 14380107  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| | ||||| ||||||    
T  14380108 ccctcagccctaaagttac 14380126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19502296 - 19502081
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||| |    
T  19502296 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaa-aaacaaccttaatttctaac 19502198  T
Q  104 cttttctcccaatctcacca-agaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19502197 cttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 19502099  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  19502098 cctcaaccctaaagttac 19502081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23555158 - 23554951
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23555158 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 23555060  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23555059 attttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaa-ctctaatcaaagac 23554961  T
Q  201 cctaaaccct 210  Q
    | | ||||||    
T  23554960 cttcaaccct 23554951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48491697 - 48491482
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48491697 ctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 48491599  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48491598 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 48491501  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  48491500 ccctcaaccctaaagttac 48491482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4586279 - 4586064
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4586279 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 4586181  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4586180 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 4586083  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
     ||| ||||||| ||||||    
T  4586082 gcctcaaccctaaagttac 4586064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 47673993 - 47674191
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47673993 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 47674091  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47674092 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43504201 - 43504418
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  43504201 gaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatga-acaaccctaattt 43504299  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||     ||||| ||||||| | |||  |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43504300 ctacccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaa 43504392  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43504393 gactctaaaccctagagtttctccct 43504418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 47676194 - 47676400
Alignment:
Q  12 tccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctc 111  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  47676194 tccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt-tc 47676291  T
Q  112 ccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaac 207  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  47676292 tcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctcaac 47676390  T
Q  208 cctagagtta 217  Q
    |||| |||||    
T  47676391 cctaaagtta 47676400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18126756 - 18126547
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||     
T  18126756 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacacattt- 18126659  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaac-aagcactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  18126658 ttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaatgtttcccaacccatgagaa-ctctaatcaaagaccctca 18126560  T
Q  206 accctagagttac 218  Q
    |||||| ||||||    
T  18126559 accctaaagttac 18126547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 38671278 - 38671487
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  38671278 aatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt- 38671375  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  38671376 tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctca 38671474  T
Q  206 accctagagttac 218  Q
    |||||| ||||||    
T  38671475 accctaaagttac 38671487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26417434 - 26417219
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26417434 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 26417336  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26417335 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacccgctcaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaa-ctctaatcaaaga 26417238  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  26417237 ccctcaaccctaaagttac 26417219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 31733019 - 31733234
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31733019 ctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 31733117  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31733118 cattt-tctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 31733215  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||    
T  31733216 ccctcaactctaaagttac 31733234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43864362 - 43864147
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43864362 ctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 43864264  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    |  || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  43864263 cactt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaaga 43864166  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  43864165 ccctcaaccctaaagttac 43864147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8153460 - 8153277
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||     
T  8153460 ctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaa-gaacaaccctaatttctact 8153362  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8153361 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 8153277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1113775 - 1113559
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  1113775 ctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctatc 1113677  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1113676 cattt-tctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 1113579  T
Q  200 ccctaaaccctagagttact 219  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  1113578 ccctcaaccctaaagttact 1113559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 30024782 - 30024997
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  30024782 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-aatgaacaaccctaatttctacc 30024880  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30024881 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaacgtttttcaacctaagagaa-ctctaatcaaaga 30024978  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  30024979 ccctcaaccctaaagttac 30024997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48489549 - 48489334
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  48489549 ctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaa-gaacaaccctaatttctacc 48489451  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48489450 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 48489353  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    || | ||||||| ||||||    
T  48489352 ccatcaaccctaaagttac 48489334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 41317484 - 41317667
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41317484 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 41317582  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
      ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41317583 aattt-tcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 41317667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27347929 - 27347752
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||     
T  27347929 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaatcctaatttctacccattt- 27347832  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27347831 tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacctaagagaa 27347752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 31105443 - 31105658
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | | ||  ||||||||||||    
T  31105443 ctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaaaaaatctaatttctacc 31105541  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||    
T  31105542 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttctcaccccaagataa-ctataatcaaaga 31105639  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  31105640 ccctcaaccctaaagttac 31105658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 2361023 - 2361185
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2361023 tctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctaccc 2361121  T
Q  105 ttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  2361122 attt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 2361185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24789960 - 24789746
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||    
T  24789960 actctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaat-gttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaattttta 24789862  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  24789861 cccttttc--ccaatcttaccaaga-----cactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 24789769  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  24789768 cctaaaccctagagttgctccct 24789746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 496033 - 496248
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| | || |||||||||||||||    
T  496033 ctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaactaccctaatttctacc 496131  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaac-aagcactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||  ||| || |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  496132 cattt-tcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcacccaaggtttttacaatgtttcccaatccaagagaa-ctctaatcaaaga 496229  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| |||| || ||||||    
T  496230 ccctcaaccttaaagttac 496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518699
Alignment:
Q  12 tccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctc 111  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||| || ||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaa-gaacaaacctaatttcta-cctattttc 31518808  T
Q  112 ccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaac 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||    
T  31518807 ccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttacgatgttttccaacccaaaagaa-ccataatcaaagacccttaac 31518709  T
Q  208 cctagagtta 217  Q
    |||| |||||    
T  31518708 cctaaagtta 31518699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20344016 - 20343802
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||    
T  20344016 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 20343919  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    |||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  20343918 acccttt--tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaa 20343826  T
Q  200 ccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  20343825 ccctaaaccctagagttgctccct 20343802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29608854 - 29608737
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29608854 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctaccc 29608756  T
Q  105 ttttctcccaatctcaccaa 124  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  29608755 attt-tcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 36146458 - 36146647
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||     ||| ||||||||||||    
T  36146458 ctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacc 36146556  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctct 190  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36146557 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaacctct 36146647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 24525985 - 24526161
Alignment:
Q  43 caaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatg 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24525985 caaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattt-tcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatg 24526083  T
Q  141 atttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24526084 attttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagagaa-ccataatcaaagaccctcaaccctaaagtta 24526161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 34310766 - 34310929
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34310766 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 34310864  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  34310865 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 34310929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 48599384 - 48599547
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48599384 ctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 48599482  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacact-caccaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  48599483 cattt-tcccaatatcaccaatgaacaagacaatc-atgattttcactcctccaaggtgtttacaat 48599547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Original strand, 24514915 - 24515023
Alignment:
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaa 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24514915 tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctaaa 24515013  T
Q  207 ccctagagtt 216  Q
    ||||| ||||    
T  24515014 ccctaaagtt 24515023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25615971 - 25615767
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||  |||| | | |||| |||||||||||||    
T  25615971 ctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacata-gaacaaacctaatttctacc 25615873  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaagacc 201  Q
    | ||| |||||||||   |||||     ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25615872 cattt-tcccaatct---caaga-----cactcaatgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa-ctctaatcaaagacc 25615783  T
Q  202 ctaaaccctagagtta 217  Q
    || |||| || |||||    
T  25615782 cttaaccttaaagtta 25615767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 41649061 - 41649258
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  41649061 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc-taaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 41649158  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
      ||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41649159 aattt-ttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaataaaaga 41649256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 4253578 - 4253795
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  4253578 ctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctac 4253677  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttac-aatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    | |||  | ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || | ||||    
T  4253678 cattt--taccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaa-ccctcaccaaa 4253774  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttac 218  Q
     ||||| ||||||| ||||||    
T  4253775 taccctcaaccctaaagttac 4253795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22270091 - 22269973
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22270091 ctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 22269993  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  22269992 cattt-tcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 8359366 - 8359530
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | | |||||||||||||||    
T  8359366 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaa-gaaaaaccctaatttctac 8359464  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaat 167  Q
    || ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8359465 ccattt-tcccaatctccccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttacaat 8359530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 4508756 - 4508919
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | |||||||||||||||||     
T  4508756 ctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataagctcacaaa-gaacaaccctaatttctact 4508854  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  4508855 cattt-tcccaatctcaccaatcaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 4508919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6432089 - 6431926
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  6432089 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaatcctaatttctacc 6431991  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  6431990 cattt-tcccaatctaaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaatgtgtttacaat 6431926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 190
Target Start/End: Original strand, 12097941 - 12098097
Alignment:
Q  36 agagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-ca 133  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  12097941 agagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcac-aatgaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctaaccaatgaacaagaca 12098038  T
Q  134 ctcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctct 190  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12098039 ctcaatgattttcactcacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctct 12098097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 2759248 - 2759339
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatt 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2759248 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3259113 - 3258995
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3259113 ctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctagtttctacc 3259015  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  3259014 cattt-tcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Original strand, 4538627 - 4538787
Alignment:
Q  41 tacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaa 138  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  | || |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4538627 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaa-gaacaaccctaatttctacccattt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaa 4538724  T
Q  139 tgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4538725 tgattttcactcacccaaggtgtttacaatttttcccaacccaagagaa-ttctaatcaaagac 4538787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 23565111 - 23565190
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaag 83  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  23565111 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaag 23565190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 6592389 - 6592593
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  6592389 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 6592486  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  6592487 tacccatttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 6592577  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  6592578 accctaaaccctagag 6592593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 6594607 - 6594811
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  6594607 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 6594704  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  6594705 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 6594795  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  6594796 accctaaaccctagag 6594811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 18388809 - 18389013
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  18388809 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 18388906  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  18388907 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 18388997  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  18388998 accctaaaccctagag 18389013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 18392245 - 18392449
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  18392245 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 18392342  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  18392343 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 18392433  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  18392434 accctaaaccctagag 18392449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 32358104 - 32358183
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaag 83  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  32358104 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag 32358183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562257
Alignment:
Q  51 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactc 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||    
T  1562103 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctc 1562192  T
Q  151 accaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 214  Q
      |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1562193 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 1562257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2390400 - 2390301
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2390400 ctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 2390302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 4510604 - 4510761
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||| | |||||| |||||||||||| |||     
T  4510604 aatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaa-gaacaaccttaatttctacccattt- 4510701  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaa-gcactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  4510702 tccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 4510761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 4512446 - 4512603
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||| | |||||| |||||||||||| |||     
T  4512446 aatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaa-gaacaaccttaatttctacccattt- 4512543  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaa-gcactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  4512544 tccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 4512603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 22328440 - 22328556
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttc-ttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    ||| ||||||||||     
T  22328440 ctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaa 22328539  T
Q  103 ccttttctcccaatctc 119  Q
    |||||  ||||||||||    
T  22328540 cctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23344080 - 23343877
Alignment:
Q  17 tatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaat 116  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||  ||| |||    
T  23344080 tatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttt--tccaaat 23343983  T
Q  117 ctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtg-tttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaacccta 211  Q
    |||||||| |||| || || |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||  ||||||    
T  23343982 ctcaccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaaggtgttttgaaatgtttccaaacctaagagaa-ccctaatcaaagactctcgacccta 23343884  T
Q  212 gagttac 218  Q
     ||||||    
T  23343883 aagttac 23343877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 32060422 - 32060579
Alignment:
Q  50 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||    
T  32060422 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctct 32060513  T
Q  150 caccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 214  Q
       |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32060514 ttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 32060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 36574565 - 36574781
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||    || | ||||||||||    
T  36574565 ctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttctac 36574664  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttac-aatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |  |||| ||||||||| ||||  |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||    
T  36574665 c--tttc-cccaatctctccaataaacaagacactcgataattttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaa-ccctcatcaaa 36574760  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| | ||||||| ||||||    
T  36574761 gaccgtcaaccctaaagttac 36574781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 6360002 - 6360065
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6360002 ctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761567
Alignment:
Q  92 ctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagc 187  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2761439 ctaatttctaccaattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-c 2761536  T
Q  188 tctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||||||||| | | | ||||||| ||||||    
T  2761537 tctaatcaaatatcatcaaccctaaagttac 2761567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 31519020 - 31518965
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaa 59  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31519020 ctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 31518965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 24525552 - 24525594
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaa 46  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24525552 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 24525594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 3904676 - 3904726
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3904676 cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaaatta 3904726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27073905 - 27073875
Alignment:
Q  33 caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27073905 caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 27073875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 63
Target Start/End: Original strand, 27204408 - 27204438
Alignment:
Q  33 caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204408 caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 27204438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5116723 - 5116663
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttc-ttccaaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  5116723 ctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaatta 5116663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25412878 - 25412672
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25412878 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 25412780  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25412779 cttt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 25412683  T
Q  201 cctaaacccta 211  Q
    |||||||||||    
T  25412682 cctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13343181 - 13342966
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13343181 gaactctccaatccactatcaatgagttcttc-aaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 13343084  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  13343083 acccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaga 13342985  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  13342984 gaccctaaaccctaaagtt 13342966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26178003 - 26177788
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26178003 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaaga-acaaccctaatttc 26177905  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26177904 tacccttttc---caatctcaccaaga-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag 26177813  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  26177812 actctaaaccctagagttactccct 26177788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16409596 - 16409380
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16409596 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaaga-acaaccctaatttc 16409498  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||||||   |||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16409497 tacccttttt--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag 16409405  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  16409404 actctaaaccctagagttactccct 16409380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 36074090 - 36074307
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  36074090 gaactctccaatccactatcaatgagttcttc-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaa-gaacaaccctaatttct 36074187  T
Q  101 accc--ttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatca 195  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36074188 acccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatca 36074286  T
Q  196 aagaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  36074287 aagaccctaaaccctaaagtt 36074307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30182709 - 30182494
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30182709 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 30182611  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30182610 accatttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 30182513  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  30182512 gaccctaatccctaaagtt 30182494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18441695 - 18441911
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18441695 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaa-ggaacaaccctaatttc 18441793  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||||||   |||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18441794 tacccttttt--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag 18441886  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  18441887 actctaaaccctagagttactccct 18441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9789271 - 9789487
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  9789271 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaa-ggaacaaccttaatttc 9789369  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||||||   |||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9789370 tacccttttt--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag 9789462  T
Q  199 accctaaaccctagagttactccct 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  9789463 actctaaaccctagagttactccct 9789487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13239869 - 13239655
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  13239869 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaaaaaccctaatttctacc 13239771  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239770 atttt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 13239673  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| |||| || ||||||    
T  13239672 cctcaaccataaagttac 13239655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 39468599 - 39468814
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39468599 ctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 39468697  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39468698 cattt-tcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatgaaaga 39468795  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  39468796 ccctcaaccctaaagttac 39468814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13488321 - 13488106
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13488321 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 13488223  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13488222 cattt-tcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 13488125  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  13488124 ccctcaaccctaaagttac 13488106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32636942 - 32636727
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  32636942 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccataatttctacc 32636844  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  32636843 cattt-tcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcactacccaagagaa-ctctaatcaaaga 32636746  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  32636745 cccttaaccctaaagttac 32636727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 30682972 - 30683178
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagt--tcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  30682972 ctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag----aaccctaatttcta 30683067  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30683068 ccctttt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcgcaacccaagagaa-ctctaatcaaag 30683165  T
Q  199 accctaaacccta 211  Q
    ||||| |||||||    
T  30683166 accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26170883 - 26170679
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  26170883 gaactctccaatccactatcaatgagttctt----------acaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaaga-acaatcctaatttct 26170795  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    |||||||||   ||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26170794 acccttttc---caatctcaccaaga-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaaga 26170703  T
Q  200 ccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  26170702 ctctaaaccctagagttactccct 26170679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 42428480 - 42428694
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  42428480 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaaaaaccataatttctacc 42428578  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42428579 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 42428676  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    || | ||||||| |||||    
T  42428677 ccttcaaccctaaagtta 42428694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 533881 - 533672
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||     
T  533881 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaccaaccctaatttctacccattt- 533784  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  533783 tcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccccca 533685  T
Q  206 accctagagttac 218  Q
    |||||| ||||||    
T  533684 accctaaagttac 533672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37439259 - 37439070
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37439259 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 37439161  T
Q  104 -----cttttc--tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagaga 184  Q
          |||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37439160 ttttatttttccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcaccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 37439070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 28750705 - 28750920
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28750705 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaa-gaacaaccctaatttctacc 28750803  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28750804 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttcaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 28750901  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  28750902 ccctcaaccctaaagttac 28750920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 42426285 - 42426500
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42426285 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 42426383  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  42426384 cattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatctaagagaa-ctctaatcaaaga 42426481  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  42426482 ccctcaaccctaaagttac 42426500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33831792 - 33831590
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||     
T  33831792 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacccattt- 33831695  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33831694 ttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctta 33831596  T
Q  206 acccta 211  Q
    ||||||    
T  33831595 acccta 33831590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 29751209 - 29751423
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  29751209 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 29751307  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  29751308 cccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 29751400  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  29751401 cctaaaccctagagttgctccct 29751423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 538143 - 537928
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  538143 ctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gagcaaccttaatttctacc 538045  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  538044 cattt-tcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacgatgtttcccaagccaagagaa-ctctaatcaaaga 537947  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  537946 ccctcaaccctaaagttac 537928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16452198 - 16451984
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||    
T  16452198 ctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaa-gaacaaacttaatttctacc 16452100  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    | ||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  16452099 cattt-ttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcacttaccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaa-ctctaatcaaagat 16452002  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  16452001 cctcaaccctaaagttac 16451984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 8565996 - 8566196
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  8565996 ctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaagttctacc 8566094  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8566095 cattt-tctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 8566192  T
Q  200 ccct 203  Q
    ||||    
T  8566193 ccct 8566196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29720483 - 29720269
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  29720483 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttcta 29720385  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  29720384 cccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 29720292  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  29720291 cctaaaccctagagttgctccct 29720269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29722643 - 29722429
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  29722643 actctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttcta 29722545  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-ac 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  29722544 cccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaac 29722452  T
Q  201 cctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  29722451 cctaaaccctagagttgctccct 29722429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31183089 - 31182876
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||  ||||  ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  31183089 ctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaatg-gttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaa-gaacaatcctaatttctacc 31182992  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||  | |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31182991 catt--ttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 31182895  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  31182894 ccctcaaccctaaagttac 31182876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 213583 - 213420
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  213583 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 213485  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  213484 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 213420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40147379 - 40147216
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  40147379 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaa-gaacaaccctaatttctacc 40147281  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  40147280 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttccactctcccaaggtgtttacaat 40147216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Original strand, 42309989 - 42310200
Alignment:
Q  8 ctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||| | | ||||||||||  |    
T  42309989 ctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagat-caaacttgatttctacccaat 42310087  T
Q  108 tctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaagaccct 203  Q
    | || |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |    
T  42310088 t-tctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtttacaatgttttccaaccaaagagaa-ccctaatcaaagaccat 42310185  T
Q  204 aaaccctagagttac 218  Q
    |||||||| ||||||    
T  42310186 aaaccctaaagttac 42310200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Original strand, 13695740 - 13695904
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||| |||    
T  13695740 ctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtac 13695839  T
Q  103 ccttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaa 166  Q
    |||||  |||||||||| || ||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13695840 ccttt--tcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatgattttcactcacacaaggtgtttacaa 13695904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 22536346 - 22536550
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccctttt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||     
T  22536346 aatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt- 22536442  T
Q  109 ctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaac 207  Q
     |||||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  || ||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  22536443 -tcccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctgcagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 22536534  T
Q  208 cctagagttactccct 223  Q
    ||||||| | ||||||    
T  22536535 cctagagcttctccct 22536550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 3075708 - 3075923
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||   |||| ||||||| | |||| ||||||||||| |    
T  3075708 ctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaa-gaacaaacctaatttcta-c 3075805  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    || || || ||||||||| || |||| || ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  3075806 ctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactcatcaaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaaga 3075904  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  3075905 ccctcaaccctaaagttac 3075923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28278434 - 28278271
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  28278434 ctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccataatttctacc 28278336  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  28278335 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaatgtgtttacaat 28278271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Original strand, 5887487 - 5887681
Alignment:
Q  25 agttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||  |||||||||| || ||| || ||||||||| ||    
T  5887487 agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaatctaatttctatccattt-tctcaatctcacaaa 5887584  T
Q  125 -gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
     ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5887585 tgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaataccctcaaccctaaagttac 5887681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10593377 - 10593170
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |    |||||||||||||    
T  10593377 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttct 10593280  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||  |||||||||||| |    
T  10593279 accc--ttctcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaa 10593187  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  10593186 ccctaaaccctagagtt 10593170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5058163 - 5058002
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||  ||||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  5058163 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggatacaagaaaatagcttcaacaagctcaca---gaacaaccctaatttctacc 5058067  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  5058066 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactcttccaaggtgtttacaat 5058002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38747123 - 38747009
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38747123 ctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 38747025  T
Q  104 cttttctcccaatctca 120  Q
    | ||| |||||||||||    
T  38747024 cattt-tcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19806415 - 19806295
Alignment:
Q  91 cctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaag 186  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19806415 cctaatttctacccatttttcc-aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt-cactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa- 19806319  T
Q  187 ctctaatcaaagaccctaaaccct 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  19806318 ctctaatcaaagaccctcaaccct 19806295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25078240 - 25078034
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  25078240 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 25078143  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  25078142 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 25078050  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  25078049 accctaaaccctagag 25078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25136209 - 25136003
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  25136209 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 25136112  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  25136111 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 25136019  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  25136018 accctaaaccctagag 25136003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40380212 - 40380006
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatt 97  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |    ||||||||||    
T  40380212 gaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatt 40380115  T
Q  98 tctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  40380114 tctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaa 40380024  T
Q  198 g-accctaaaccctagag 214  Q
    | ||||||||||||||||    
T  40380023 gaaccctaaaccctagag 40380006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40382423 - 40382217
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatt 97  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    |||||||| |    
T  40382423 gaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaact 40382326  T
Q  98 tctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  40382325 tctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaa 40382235  T
Q  198 g-accctaaaccctagag 214  Q
    | ||||||||||||||||    
T  40382234 gaaccctaaaccctagag 40382217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42926907 - 42926796
Alignment:
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaa 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  42926907 tcccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaa-ctctaatcaaagaccatca 42926809  T
Q  206 accctagagttac 218  Q
    | |||| ||||||    
T  42926808 atcctaaagttac 42926796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 9049392 - 9049470
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa 82  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  9049392 ctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa 9049470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 27637663 - 27637781
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27637663 ctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcataaa-gaacaaccctaatttctac 27637760  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  27637761 ccattt-tctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16546750 - 16546545
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    |||||||||||    
T  16546750 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 16546653  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||| ||||  | |||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  16546652 ctacccctttc--ctaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaag 16546562  T
Q  199 -accctaaaccctagag 214  Q
     ||||||||||||||||    
T  16546561 aaccctaaaccctagag 16546545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16544441 - 16544323
Alignment:
Q  88 aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagc 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |    
T  16544441 aaccctaatttctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 16544351  T
Q  188 tctaatcaaag-accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16544350 tctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16544323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Original strand, 16640990 - 16641153
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||| ||||||||    ||| ||||||||||||    
T  16640990 ctctccaatccactatcaa---gttcttacaaagagatacaaaagagttatcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 16641086  T
Q  104 -cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcac-caaggtgtttacaa 166  Q
      |||| || ||||||| |||| ||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  16641087 atttttttctcaatctcgccaatgaacaagacacttaatgaatttcactcactcaaggtgtttacaa 16641153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27015635 - 27015487
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||        ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||     
T  27015635 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt--------attagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttcta-cctattt 27015546  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaagcactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  27015545 tcccaatctcaccaatgaccaaacactc-atgattttcactctcccaagatgtttacaat 27015487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926922
Alignment:
Q  21 aatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 42926922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 316874 - 316774
Alignment:
Q  11 atccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| || | || | |||| ||||||||||||| |||||    
T  316874 atccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaagctctccaa-gaacaaacctaatttctacctttttc 316776  T
Q  110 tc 111  Q
    ||    
T  316775 tc 316774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Original strand, 33906086 - 33906151
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaag 74  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  33906086 aatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaagttagcttcgacaag 33906151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3326032 - 3325968
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3326032 ctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagctt 3325968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054929
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttc-ttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10054867 tctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaaag-gttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22097981 - 22097879
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||  |||| ||| | |||  |||||||||||||||||    
T  22097981 ctctctaatccactatcaatgagttttttacaaatagatacaa--gggttataagaaattaacttcaacaaattctccaaga-acaaccctaatttctac 22097885  T
Q  103 cctttt 108  Q
    ||||||    
T  22097884 cctttt 22097879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616228
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaatta 35616228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 42927003 - 42926961
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagtt 52  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42927003 aatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 42926961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8445831 - 8445770
Alignment:
Q  7 tctaatccactatcaatgagttcttcc-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8445831 tctaatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagctt 8445770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 434654 - 434438
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  434654 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 434556  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  434555 accctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagagaa-ctctaatcaaa 434457  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  434456 gaccctaaaccctaaagtt 434438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 490380 - 490434
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  490380 cactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagctt 490434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13992340 - 13992549
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13992340 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 13992437  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  13992438 acccttttttcccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaaga 13992532  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||| ||||    
T  13992533 ccctaaaccctaaagtt 13992549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 56178687 - 56178901
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  56178687 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 56178785  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178786 ctttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 56178883  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    | | ||||||| ||||||    
T  56178884 cttcaaccctaaagttac 56178901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 29999856 - 30000068
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaaga-gatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29999856 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacatgttcacaaa-gaacaaccctaatttctac 29999954  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29999955 ccttt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 30000051  T
Q  200 ccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||| ||||    
T  30000052 ccctaaaccctaaagtt 30000068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48143161 - 48142945
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48143161 ctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 48143063  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48143062 tttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 48142964  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  48142963 ccctcaaccctaaagttac 48142945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 12739600 - 12739815
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  12739600 ctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctatc 12739698  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12739699 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 12739796  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  12739797 ccctcaaccctaaagttac 12739815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 12747806 - 12748021
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  12747806 ctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctatc 12747904  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12747905 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 12748002  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  12748003 ccctcaaccctaaagttac 12748021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37740743 - 37740536
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  37740743 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttatacc 37740645  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37740644 ctttt-tccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagac 37740547  T
Q  201 cctaaacccta 211  Q
    ||| |||||||    
T  37740546 cctcaacccta 37740536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 52095412 - 52095627
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  52095412 ctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 52095510  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  52095511 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagt 52095608  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  52095609 ccctcaaccctaaagttac 52095627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 54199956 - 54200171
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54199956 ctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 54200054  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  54200055 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 54200152  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  54200153 ccctcaaccctaaagttac 54200171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 9927508 - 9927722
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9927508 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 9927606  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagac 200  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  9927607 cattt-tcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctttaatcaaagac 9927704  T
Q  201 cctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  9927705 cctcaaccctaaagttac 9927722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 5370133 - 5370349
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagc-tttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5370133 ctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctac 5370231  T
Q  103 --ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
      | |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  5370232 ctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaagtgtttacaatgtttcccagcccaagagaa-ctataatcaaa 5370330  T
Q  198 gaccctaaaccctagagtt 216  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  5370331 gaccctaaaccctaaagtt 5370349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 12745486 - 12745701
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12745486 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 12745584  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12745585 cattt-tcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacattgtttcccaaaccaagagaa-ctctaatcaaaga 12745682  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||    
T  12745683 ccctcaactctaaagttac 12745701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31495363 - 31495580
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaa-gagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  31495363 gaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatga-acaatcctaattt 31495461  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc-aacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31495462 ctacccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaa 31495554  T
Q  198 gaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  31495555 gactataaaccctagagttactccct 31495580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 52082715 - 52082922
Alignment:
Q  12 tccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctc 111  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  52082715 tccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaa-gaacaaccctagtttctacccattt-tc 52082812  T
Q  112 ccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaac 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  52082813 ccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctcaac 52082911  T
Q  208 cctagagttac 218  Q
    |||| ||||||    
T  52082912 cctaaagttac 52082922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5429797 - 5429581
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| || | | |||||||||||||||     
T  5429797 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaa-gaataaccctaatttctact 5429699  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5429698 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 5429601  T
Q  200 ccctaaaccctagagttact 219  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  5429600 ccctcaaccctaaagttact 5429581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 34570464 - 34570672
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  34570464 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttcta-c 34570561  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34570562 ctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagatgttttcaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 34570660  T
Q  200 ccctaaacccta 211  Q
    |||| |||||||    
T  34570661 ccctcaacccta 34570672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 26175686 - 26175901
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  26175686 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctccc 26175784  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  26175785 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaacagaa-ctttaatcaaaga 26175882  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||    
T  26175883 ccctcaactctaaagttac 26175901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36994642 - 36994437
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  36994642 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccttaatttctacc 36994544  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  36994543 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttgccaaatcaagagaa-ctctaatcaaaga 36994446  T
Q  200 ccctaaacc 208  Q
    |||| ||||    
T  36994445 ccctcaacc 36994437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5871938 - 5871723
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  5871938 ctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 5871840  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5871839 cattt-ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 5871742  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||  ||||||| ||||||    
T  5871741 cccataaccctaaagttac 5871723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 47038461 - 47038673
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47038461 ctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaatga-ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 47038558  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47038559 catt--ttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 47038655  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  47038656 ccctcaaccctaaagtta 47038673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969014
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaatctaatttctacc 24969132  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24969131 cattt-ttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaag 24969034  T
Q  199 accctaaaccctagagttac 218  Q
    ||| | |||| || ||||||    
T  24969033 accgtcaaccttaaagttac 24969014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 48893688 - 48893864
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaag---gtacaaccctaatttct 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    | |||||||||||||||    
T  48893688 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttct 48893787  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttccaa 175  Q
    |||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48893788 acccattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccaa 48893864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31474269 - 31474060
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaac-cctaatttctac 102  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||  ||||  ||||||||||||    
T  31474269 ctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaaga-acaagacctaatttctac 31474171  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttccaac-ccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    || ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  31474170 ccattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttcccactccaagagaacct-taatcaaag 31474073  T
Q  199 accctaaacccta 211  Q
    ||||| |||||||    
T  31474072 accctcaacccta 31474060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 6542229 - 6542447
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||    || |||||||||||||    
T  6542229 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctacc 6542328  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
     |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    ||||||    
T  6542329 attttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcattacaaaga 6542428  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    | || ||||||| ||||||    
T  6542429 cactcaaccctaaagttac 6542447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4588077 - 4587893
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||    || | ||||||||| |    
T  4588077 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttcta-c 4587979  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4587978 cttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccatgagaa 4587893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 45687232 - 45687416
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    || |||||||||| ||    
T  45687232 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcc 45687331  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||  | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45687332 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 45687416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26364354 - 26364236
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26364354 ctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 26364256  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  26364255 cattt-tcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 12743975 - 12744073
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12743975 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 12744097 - 12744195
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12744097 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 12745364 - 12745462
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12745364 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 36463439 - 36463627
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||| |||||||||||| |    
T  36463439 ctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-aatgaacagccctaatttctatc 36463537  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctct 190  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  36463538 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaacctct 36463627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 52467404 - 52467613
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| || ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  52467404 ctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 52467502  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    | ||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  52467503 cattt-tcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaa-ccctaatcaaag 52467600  T
Q  199 accctaaacccta 211  Q
    ||||| |||||||    
T  52467601 accctcaacccta 52467613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 54883132 - 54882975
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||     
T  54883132 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-aaacaaccctaatttctacccattt- 54883035  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  54883034 tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 54882975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40632563 - 40632400
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  40632563 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaactctaatttctacc 40632465  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  40632464 cattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 40632400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29254612 - 29254398
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||  ||||| ||| |||   ||||| ||||||||||||    
T  29254612 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggttgcaagaaattaacttcaacaagctcataaa-aaacaactctaatttctacc 29254514  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    |  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29254513 caatt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctactcaaaga 29254416  T
Q  200 ccctaaaccctagagtta 217  Q
    || | ||||||| |||||    
T  29254415 ccttcaaccctaaagtta 29254398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6656074 - 6655975
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  6656074 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-gaacaaccttaatttctacc 6655976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12073510 - 12073392
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  12073510 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 12073412  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  12073411 cattt-tcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2209832 - 2209668
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | | |||||||||||||||    
T  2209832 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaaaaaccctaatttctac 2209734  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    || ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  2209733 ccattt-tcccaatctcaacaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 2209668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8665526 - 8665362
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  8665526 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctctcaaa-gaacaaccctaatttctacc 8665428  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8665427 cattt-tcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacaat 8665362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 37229771 - 37229961
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagata-caaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtaca-accctaatttcta 101  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  37229771 ctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaatttgctttaacaagctcacaaa-gaacacaccctaatttcta 37229869  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatg-tttccaacccaagagaagctct 190  Q
    || |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37229870 ccattt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaacctct 37229961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 51337182 - 51336999
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaa--ccctaatttcta 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||| |||  | ||| ||||||||  ||||  || |||||||||    
T  51337182 ctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagggttataataaattatctt--aaaagctcacaaaga-acaaatccgtaatttcta 51337086  T
Q  102 cccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatg-tttccaacccaagagaa 185  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51337085 ccctttt-tctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa 51336999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8395722 - 8395519
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | |    |||||||||||||    
T  8395722 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttct 8395625  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  8395624 acccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaa 8395534  T
Q  200 ccctaaaccctagag 214  Q
    |||||||||||||||    
T  8395533 ccctaaaccctagag 8395519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Original strand, 13009562 - 13009696
Alignment:
Q  86 acaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttcc-aacccaag 181  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13009562 acaaacctaatttctacccattt-tcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 13009660  T
Q  182 agaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13009661 agaa-ctctaatcaaagacccttaaccctaaagttac 13009696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46703619 - 46703454
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  46703619 ctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctac 46703521  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  46703520 tcattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaat 46703454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 50673897 - 50673993
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  50673897 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag--acaatcctaatttctac 50673993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Original strand, 46147442 - 46147557
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| || | |||||||||||||||||||    
T  46147442 tctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcac-aatgaacaaccctaatttctaccc 46147540  T
Q  105 ttttctcccaatctcacc 122  Q
     ||| | |||||||||||    
T  46147541 attt-ttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8393513 - 8393310
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttcttccaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | |    |||||||||||||    
T  8393513 actctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttct 8393416  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-a 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  8393415 acccttttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaa 8393325  T
Q  200 ccctaaaccctagag 214  Q
    || ||||||||||||    
T  8393324 ccataaaccctagag 8393310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 27417015 - 27417133
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||     
T  27417015 ctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctaca 27417113  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| | |||||||||||||    
T  27417114 cattt-taccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35662559 - 35662460
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  35662559 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcataaa-gaacaaccctaatttctacc 35662461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41639544 - 41639426
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41639544 ctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 41639446  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| ||||||||| |||||    
T  41639445 cattt-tcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 5207898 - 5208108
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||      
T  5207898 aatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaagggttgcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctacccttt-- 5207995  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttac-aatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagacccta 204  Q
    | |||||| | |||| ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | || | |||||||||      
T  5207996 ttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaatccaagagaa-ccctcaccaaagacccgc 5208094  T
Q  205 aaccctagagttac 218  Q
    ||||||| ||||||    
T  5208095 aaccctatagttac 5208108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21688367 - 21688250
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21688367 ctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacc 21688269  T
Q  104 cttttctcccaatctcacc 122  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  21688268 catttttctcaatctcacc 21688250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41964534 - 41964415
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  41964534 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttacaataaattagcttaaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctac 41964436  T
Q  103 ccttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    || ||| ||||||| |||||||    
T  41964435 ccattt-tcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3913566 - 3913408
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| | ||| | |||||||||||     
T  3913566 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaa-gaacagctctaatttctact 3913468  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtt 161  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3913467 cattt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12119658 - 12119492
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctac 102  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    |||| ||||||||||    
T  12119658 ctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctac 12119559  T
Q  103 ccttttctcccaatctcacc-aagaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
     ||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  12119558 tctttt-ttccaatctcacctatgaacaagacactcattgattttcactctcccaaggtatttacaat 12119492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 379498 - 379383
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  379498 ctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttctacc 379400  T
Q  104 cttttctcccaatctcac 121  Q
    | ||| || |||||||||    
T  379399 cattt-tctcaatctcac 379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7122802 - 7122596
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  7122802 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 7122705  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  7122704 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 7122612  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  7122611 accctaaaccctagag 7122596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7125021 - 7124815
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  7125021 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 7124924  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  7124923 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 7124831  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  7124830 accctaaaccctagag 7124815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 50262752 - 50262865
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| ||||||| | ||    
T  50262752 tctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccgtaatttcgatcc 50262850  T
Q  105 ttttctcccaatctca 120  Q
     ||| |||||||||||    
T  50262851 attt-tcccaatctca 50262865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8648257 - 8648139
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||  |||| || | |||||||||||||||| |    
T  8648257 ctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaaactcac-aatgaacaaccctaatttctatc 8648159  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    | ||| ||||| |||||||||    
T  8648158 cattt-tcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 26699492 - 26699572
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaag 83  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  26699492 ctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag 26699572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 55085444 - 55085578
Alignment:
Q  33 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag 131  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  | | | ||||||||||||| |||||||    
T  55085444 caaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccttaatttctacc--tattttccaatctcaccaatgaacaag 55085540  T
Q  132 -cactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaat 167  Q
     || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  55085541 acagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 55085578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5350016 - 5349929
Alignment:
Q  17 tatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccc 104  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  5350016 tatcaacgagttctttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaa-gaacaaacctaatttctaccc 5349929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5138409 - 5138204
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaaccctaattt 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    |||||||||||    
T  5138409 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 5138312  T
Q  99 ctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag 198  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||| ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5138311 ctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtatttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaag 5138221  T
Q  199 -accctaaaccctagag 214  Q
     ||||||||||||||||    
T  5138220 aaccctaaaccctagag 5138204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Original strand, 22882801 - 22882864
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22882801 tctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 22882864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Original strand, 22934465 - 22934528
Alignment:
Q  5 tctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22934465 tctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 22934528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639263
Alignment:
Q  34 aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatcttaccaa 41639263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3910075 - 3910018
Alignment:
Q  153 caaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccct 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3910075 caaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaa-ctctaatcaaaggccctaaaccct 3910018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33089997 - 33089933
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttc-ttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  33089997 ctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagctt 33089933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Original strand, 40975059 - 40975131
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagtt 76  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||    
T  40975059 ctctctaatctactatcaaagagtcattacaaagagatacaatagagttaccagaaattaacttcaacaagtt 40975131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 48142440 - 48142644
Alignment:
Q  17 tatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaa 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    |||||||||||||| | | |  ||||||    
T  48142440 tatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgt--tcccaa 48142537  T
Q  116 tctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactca-ccaaggtgttt-acaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccct 210  Q
    ||||| ||| |  |||| ||||||||||||| |||||| || | |||||| | ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||    
T  48142538 tctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactcaagagaa-ccctaatcaaagaccatcaaccct 48142636  T
Q  211 agagttac 218  Q
    | ||||||    
T  48142637 aaagttac 48142644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 32091567 - 32091536
Alignment:
Q  33 caaagagatacaaaagagttacaagaaattag 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32091567 caaagagatacaaaagagttacaagaaattag 32091536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 13009494 - 13009536
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaa 46  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13009494 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa 13009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 34112926 - 34112872
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  34112926 cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaattagctt 34112872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 63
Target Start/End: Original strand, 34788854 - 34788884
Alignment:
Q  33 caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34788854 caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 34788884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 52093884 - 52093929
Alignment:
Q  172 ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52093884 ccaacccaagagaa-ctctaatcaaagaccctcaaccctaaagttac 52093929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 53345330 - 53345228
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctaccctttt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||   ||||| ||||||||| | ||||    
T  53345330 aatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaatttctatcatttt 53345231  T
Q  109 ctc 111  Q
    |||    
T  53345230 ctc 53345228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 64
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570476
Alignment:
Q  16 ctatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattag 64  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattag 44570476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6677588 - 6677524
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||||| |||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6677588 ctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagctt 6677524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33989963 - 33989899
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33989963 ctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 114720 - 114538
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  114720 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccttaatttctacc 114622  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  114621 ctttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 114538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11678 - 11506
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11678 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttct 11580  T
Q  101 acccttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 173  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11579 accatttt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcc 11506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22286 - 22242
Alignment:
Q  179 aagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttactccct 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22286 aagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgctccct 22242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 149147 - 149353
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||  ||||| | |||||   |||||||||||||||| |    
T  149147 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaa-aaacaaccctaatttctatc 149245  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacact-caccaaggtgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  149246 cgttt-tcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaa-ctctaatcaaaga 149343  T
Q  200 ccctaaaccc 209  Q
    |||| |||||    
T  149344 ccctcaaccc 149353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 20465 - 20680
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||| |     
T  20465 ctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa-aaacaaacctaatttctgct 20563  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaa-gcactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaatgt-ttccaacccaagagaagctctaatcaaaga 199  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  20564 cattt-tcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtctcccaacccaagataa-ctctaatcaaaga 20661  T
Q  200 ccctaaaccctagagttac 218  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  20662 ccctcaaccctaaagttac 20680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7439 - 7282
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| |||     
T  7439 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccttaatttctacccattt- 7342  T
Q  110 tcccaatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7341 ttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 7282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 2653 - 2857
Alignment:
Q  3 actctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||    
T  2653 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttc 2750  T
Q  100 tacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag- 198  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  2751 tacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 2841  T
Q  199 accctaaaccctagag 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  2842 accctaaaccctagag 2857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 18054 - 18171
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  18054 ctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcac-aatgaacaaccctaatttctacc 18151  T
Q  104 cttttctcccaatctcaccaa 124  Q
      ||| ||||| |||||||||    
T  18152 aattt-tcccactctcaccaa 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 3773 - 3979
Alignment:
Q  1 gaactctctaatccactatcaa-tgagttctt--ccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatt 97  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| | |    ||||||||||    
T  3773 gaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatt 3870  T
Q  98 tctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaa 197  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  3871 tctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaa 3961  T
Q  198 g-accctaaaccctagag 214  Q
    | ||||||||||||||||    
T  3962 gaaccctaaaccctagag 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6342 - 6186
Alignment:
Q  51 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagcactcaatgatttacactc 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||     ||||||||||||  | |||    
T  6342 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttc--ccaatctcaccaaga-----cactcaatgatt--ctctc 6253  T
Q  151 accaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagtt 216  Q
      |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6252 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 6186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 80343 - 80496
Alignment:
Q  14 cactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctccc 113  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  80343 cactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt-tccc 80440  T
Q  114 aatctcaccaa-gaacaag-cactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 167  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  80441 aatctcagcaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttcacaat 80496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 27492 - 27556
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 67  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27492 ctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 27556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 10601 - 10546
Alignment:
Q  10 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagagttacaagaaattagc 65  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10601 aatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaataaattagc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25172 - 25112
Alignment:
Q  4 ctctctaatccactatcaatgagttcttc-caaagagatacaaaagagttacaagaaatta 63  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25172 ctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaatta 25112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University