View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14830_low_5 (Length: 438)

Name: NF14830_low_5
Description: NF14830
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14830_low_5
NF14830_low_5
[»] chr3 (199 HSPs)
chr3 (64-356)||(49627766-49628064)
chr3 (65-356)||(40883538-40883835)
chr3 (64-351)||(55455030-55455329)
chr3 (64-356)||(33637563-33637861)
chr3 (64-356)||(30155952-30156250)
chr3 (64-356)||(48652111-48652409)
chr3 (65-356)||(1074557-1074863)
chr3 (64-356)||(14585622-14585929)
chr3 (64-356)||(41867995-41868292)
chr3 (64-349)||(31462417-31462708)
chr3 (64-356)||(11819243-11819551)
chr3 (65-356)||(32080426-32080723)
chr3 (64-356)||(40012934-40013241)
chr3 (75-356)||(53402781-53403077)
chr3 (64-356)||(13701664-13701970)
chr3 (64-356)||(48855037-48855344)
chr3 (64-356)||(53155092-53155399)
chr3 (64-356)||(54706394-54706684)
chr3 (64-354)||(55446219-55446515)
chr3 (64-356)||(22485125-22485433)
chr3 (81-355)||(35174869-35175157)
chr3 (64-356)||(105710-106004)
chr3 (62-356)||(36691459-36691768)
chr3 (62-356)||(34103418-34103716)
chr3 (64-356)||(31270486-31270776)
chr3 (62-356)||(3457099-3457391)
chr3 (64-356)||(19645352-19645657)
chr3 (81-356)||(54238698-54238987)
chr3 (207-356)||(36624515-36624664)
chr3 (64-356)||(39610370-39610673)
chr3 (64-346)||(45047684-45047964)
chr3 (64-356)||(3312604-3312890)
chr3 (64-356)||(48401273-48401559)
chr3 (64-279)||(4019829-4020044)
chr3 (75-314)||(4081910-4082164)
chr3 (64-348)||(24483358-24483640)
chr3 (64-279)||(22844283-22844498)
chr3 (75-320)||(4817553-4817810)
chr3 (123-356)||(48401022-48401238)
chr3 (75-279)||(1165075-1165279)
chr3 (75-279)||(39340430-39340630)
chr3 (65-279)||(3088333-3088547)
chr3 (65-279)||(20200727-20200941)
chr3 (85-279)||(40797264-40797458)
chr3 (65-279)||(43029914-43030128)
chr3 (65-279)||(20202909-20203123)
chr3 (65-279)||(21803762-21803976)
chr3 (81-279)||(28994994-28995192)
chr3 (65-279)||(50520014-50520228)
chr3 (77-279)||(37051825-37052031)
chr3 (65-279)||(10977474-10977688)
chr3 (74-279)||(33076516-33076721)
chr3 (85-279)||(913007-913199)
chr3 (64-279)||(2598309-2598523)
chr3 (64-352)||(2147921-2148206)
chr3 (77-279)||(1806140-1806342)
chr3 (207-356)||(19861099-19861248)
chr3 (64-292)||(38530165-38530392)
chr3 (75-279)||(32089610-32089813)
chr3 (74-279)||(22286430-22286634)
chr3 (65-279)||(11846779-11846993)
chr3 (85-279)||(21586130-21586324)
chr3 (62-279)||(29776356-29776573)
chr3 (62-291)||(34960589-34960806)
chr3 (85-257)||(42106391-42106563)
chr3 (74-356)||(53962278-53962559)
chr3 (77-279)||(32237677-32237879)
chr3 (65-351)||(3961445-3961726)
chr3 (74-279)||(43839195-43839400)
chr3 (62-279)||(45664452-45664669)
chr3 (63-278)||(21084400-21084620)
chr3 (228-356)||(27189245-27189373)
chr3 (65-277)||(27831332-27831543)
chr3 (64-279)||(4206221-4206446)
chr3 (206-356)||(47733702-47733846)
chr3 (75-279)||(33977604-33977808)
chr3 (62-186)||(2192417-2192547)
chr3 (64-184)||(55090361-55090487)
chr3 (64-349)||(31550100-31550377)
chr3 (126-279)||(40702666-40702819)
chr3 (75-279)||(43243039-43243243)
chr3 (74-169)||(46926745-46926840)
chr3 (77-279)||(50460421-50460630)
chr3 (81-279)||(29182295-29182493)
chr3 (74-259)||(20251908-20252092)
chr3 (116-279)||(54240317-54240480)
chr3 (64-278)||(34767218-34767425)
chr3 (65-279)||(47914262-47914476)
chr3 (64-194)||(50981128-50981264)
chr3 (64-194)||(51084262-51084398)
chr3 (79-264)||(51990558-51990752)
chr3 (63-183)||(30293126-30293246)
chr3 (64-228)||(36540365-36540529)
chr3 (121-348)||(25135051-25135272)
chr3 (64-210)||(36623925-36624076)
chr3 (182-356)||(39429304-39429470)
chr3 (200-279)||(53427029-53427108)
chr3 (85-194)||(40365540-40365650)
chr3 (64-169)||(19148331-19148443)
chr3 (64-242)||(44984527-44984711)
chr3 (74-222)||(25939174-25939322)
chr3 (126-277)||(47587103-47587254)
chr3 (66-279)||(11225577-11225798)
chr3 (119-279)||(25373817-25373965)
chr3 (215-355)||(48212501-48212635)
chr3 (81-266)||(51742056-51742233)
chr3 (75-177)||(14740373-14740475)
chr3 (74-240)||(28876743-28876909)
chr3 (64-256)||(40461660-40461855)
chr3 (126-278)||(29017027-29017179)
chr3 (75-266)||(31628630-31628820)
chr3 (81-214)||(40401206-40401345)
chr3 (75-271)||(25084263-25084465)
chr3 (64-222)||(25111831-25111987)
chr3 (127-279)||(26412521-26412672)
chr3 (63-191)||(35670732-35670860)
chr3 (68-161)||(38379420-38379519)
chr3 (246-337)||(20044713-20044798)
chr3 (73-161)||(43017087-43017172)
chr3 (64-220)||(46732414-46732576)
chr3 (65-240)||(41598139-41598320)
chr3 (73-191)||(45568249-45568364)
chr3 (132-244)||(33937147-33937259)
chr3 (150-341)||(5327242-5327427)
chr3 (125-228)||(31730909-31731011)
chr3 (63-169)||(33070488-33070595)
chr3 (64-122)||(48212742-48212800)
chr3 (62-189)||(51059991-51060124)
chr3 (74-348)||(566316-566587)
chr3 (77-175)||(7869128-7869232)
chr3 (237-349)||(31730811-31730917)
chr3 (74-259)||(35501447-35501622)
chr3 (73-113)||(23799752-23799792)
chr3 (308-348)||(37451906-37451946)
chr3 (62-242)||(42167721-42167905)
chr3 (81-121)||(51256792-51256832)
chr3 (74-222)||(550485-550637)
chr3 (74-121)||(7658406-7658453)
chr3 (305-356)||(32408728-32408779)
chr3 (124-279)||(33604981-33605136)
chr3 (64-143)||(33794124-33794203)
chr3 (64-122)||(2522741-2522799)
chr3 (81-119)||(31731408-31731446)
chr3 (294-348)||(42167920-42167974)
chr3 (81-135)||(48053071-48053125)
chr3 (197-279)||(53293303-53293385)
chr3 (291-348)||(6894651-6894708)
chr3 (73-106)||(46304325-46304358)
chr3 (74-106)||(20464770-20464802)
chr3 (66-122)||(32408549-32408605)
chr3 (64-189)||(54149162-54149284)
chr3 (74-191)||(628729-628842)
chr3 (73-104)||(7448718-7448749)
chr3 (73-104)||(7456860-7456891)
chr3 (156-279)||(7656280-7656403)
chr3 (122-189)||(30648549-30648616)
chr3 (73-161)||(40487524-40487609)
chr3 (127-222)||(43897286-43897381)
chr3 (122-189)||(44907229-44907296)
chr3 (121-220)||(47437897-47437996)
chr3 (208-279)||(51059871-51059942)
chr3 (73-191)||(24396303-24396415)
chr3 (230-264)||(25849913-25849947)
chr3 (65-115)||(27189117-27189167)
chr3 (98-136)||(33070029-33070067)
chr3 (73-106)||(9998718-9998751)
chr3 (73-106)||(10108487-10108520)
chr3 (73-106)||(10233321-10233354)
chr3 (75-115)||(14859736-14859777)
chr3 (79-120)||(19860956-19860997)
chr3 (121-186)||(22803210-22803275)
chr3 (85-134)||(30195408-30195457)
chr3 (311-356)||(32607503-32607548)
chr3 (73-106)||(35175654-35175687)
chr3 (73-106)||(35864765-35864798)
chr3 (73-106)||(36910570-36910603)
chr3 (73-106)||(37041019-37041052)
chr3 (124-177)||(39917230-39917283)
chr3 (73-106)||(41818477-41818510)
chr3 (81-122)||(47733452-47733493)
chr3 (73-106)||(52922921-52922954)
chr3 (74-106)||(8914974-8915006)
chr3 (312-356)||(12116132-12116176)
chr3 (312-356)||(14464544-14464588)
chr3 (74-106)||(21533614-21533646)
chr3 (99-183)||(22893417-22893501)
chr3 (74-106)||(27706020-27706052)
chr3 (74-106)||(32881164-32881196)
chr3 (312-356)||(35499194-35499238)
chr3 (122-186)||(36906302-36906366)
chr3 (126-194)||(40716562-40716630)
chr3 (73-105)||(43488395-43488427)
chr3 (76-177)||(44959780-44959878)
chr3 (228-264)||(46178672-46178708)
chr3 (73-105)||(47896403-47896435)
chr3 (74-106)||(48650539-48650571)
chr3 (62-98)||(51487357-51487393)
chr3 (74-122)||(54008749-54008797)
chr3 (65-101)||(54240482-54240518)
[»] chr4 (222 HSPs)
chr4 (62-356)||(7060483-7060783)
chr4 (74-356)||(38943821-38944109)
chr4 (64-356)||(36124011-36124309)
chr4 (2-349)||(28837232-28837587)
chr4 (64-356)||(7083475-7083777)
chr4 (64-355)||(42197714-42198020)
chr4 (91-356)||(22757254-22757524)
chr4 (64-356)||(477675-477973)
chr4 (62-356)||(626211-626511)
chr4 (62-356)||(51152284-51152583)
chr4 (66-356)||(31522106-31522411)
chr4 (64-356)||(43244035-43244342)
chr4 (64-356)||(393928-394235)
chr4 (64-356)||(26742126-26742424)
chr4 (64-356)||(6882116-6882411)
chr4 (85-356)||(26674532-26674809)
chr4 (64-356)||(6911840-6912147)
chr4 (64-356)||(13965720-13966010)
chr4 (64-356)||(45350724-45351031)
chr4 (64-356)||(45360203-45360510)
chr4 (64-356)||(20887411-20887717)
chr4 (64-356)||(25658327-25658628)
chr4 (77-356)||(20399569-20399864)
chr4 (64-354)||(11209967-11210272)
chr4 (64-356)||(30202198-30202505)
chr4 (77-356)||(32616526-32616820)
chr4 (64-356)||(8517113-8517417)
chr4 (64-354)||(8712692-8712975)
chr4 (65-356)||(39837755-39838060)
chr4 (64-356)||(19745549-19745857)
chr4 (64-356)||(19793949-19794257)
chr4 (74-356)||(24611462-24611760)
chr4 (64-348)||(44756693-44756995)
chr4 (74-356)||(24568379-24568674)
chr4 (64-350)||(5814512-5814798)
chr4 (64-355)||(50801378-50801669)
chr4 (79-356)||(7860878-7861167)
chr4 (75-337)||(6082111-6082366)
chr4 (75-352)||(27394994-27395272)
chr4 (63-356)||(39523569-39523875)
chr4 (64-356)||(56236485-56236783)
chr4 (75-356)||(53647792-53648063)
chr4 (74-279)||(43157008-43157213)
chr4 (64-350)||(24100306-24100600)
chr4 (64-279)||(14346662-14346877)
chr4 (64-279)||(29473996-29474211)
chr4 (64-348)||(55600200-55600490)
chr4 (80-279)||(23926272-23926471)
chr4 (64-279)||(38434830-38435044)
chr4 (75-279)||(29589040-29589244)
chr4 (64-279)||(46728588-46728803)
chr4 (65-279)||(4634514-4634728)
chr4 (65-279)||(9662084-9662298)
chr4 (77-279)||(50981395-50981597)
chr4 (62-356)||(12716784-12717078)
chr4 (204-356)||(24825809-24825964)
chr4 (64-349)||(27090890-27091175)
chr4 (77-279)||(33020608-33020810)
chr4 (65-279)||(41486806-41487019)
chr4 (207-356)||(13586052-13586201)
chr4 (75-279)||(23067527-23067731)
chr4 (74-279)||(15729659-15729864)
chr4 (64-279)||(46716562-46716777)
chr4 (65-279)||(53903812-53904024)
chr4 (64-278)||(29576789-29577003)
chr4 (64-232)||(7242454-7242622)
chr4 (87-279)||(30469814-30470006)
chr4 (65-279)||(14542181-14542395)
chr4 (65-279)||(54420409-54420623)
chr4 (64-285)||(46267897-46268132)
chr4 (75-279)||(16992103-16992306)
chr4 (64-279)||(42972269-42972485)
chr4 (64-279)||(4959242-4959457)
chr4 (64-277)||(51646327-51646538)
chr4 (64-279)||(2945368-2945584)
chr4 (75-279)||(37869097-37869300)
chr4 (77-279)||(5388746-5388946)
chr4 (64-208)||(18502496-18502646)
chr4 (64-279)||(44374943-44375158)
chr4 (64-272)||(29266558-29266762)
chr4 (234-356)||(29922995-29923117)
chr4 (75-279)||(20961679-20961883)
chr4 (232-356)||(43278094-43278218)
chr4 (222-353)||(2447963-2448094)
chr4 (64-194)||(30416295-30416426)
chr4 (73-344)||(31932434-31932705)
chr4 (117-279)||(34115377-34115539)
chr4 (75-356)||(3159154-3159418)
chr4 (75-220)||(23002612-23002756)
chr4 (75-279)||(46775537-46775740)
chr4 (64-263)||(6408692-6408891)
chr4 (65-279)||(9474207-9474422)
chr4 (116-279)||(35658251-35658414)
chr4 (116-279)||(52555460-52555623)
chr4 (64-186)||(7084279-7084409)
chr4 (64-337)||(41837510-41837781)
chr4 (77-220)||(3673778-3673921)
chr4 (249-356)||(43493141-43493248)
chr4 (74-244)||(4622382-4622551)
chr4 (113-279)||(26576220-26576386)
chr4 (111-279)||(11817287-11817454)
chr4 (75-356)||(56062149-56062430)
chr4 (62-278)||(31311700-31311916)
chr4 (74-279)||(38169836-38170043)
chr4 (85-232)||(40861216-40861363)
chr4 (125-279)||(1657295-1657449)
chr4 (88-272)||(15182712-15182901)
chr4 (75-356)||(24789349-24789632)
chr4 (75-356)||(24818627-24818910)
chr4 (64-191)||(34668506-34668632)
chr4 (104-219)||(47466208-47466323)
chr4 (153-356)||(22049168-22049365)
chr4 (117-279)||(32189210-32189372)
chr4 (62-272)||(33288809-33289018)
chr4 (65-350)||(22121612-22121898)
chr4 (79-193)||(6789559-6789674)
chr4 (64-147)||(38545821-38545904)
chr4 (64-235)||(56250439-56250617)
chr4 (64-279)||(28990529-28990748)
chr4 (64-157)||(12519972-12520065)
chr4 (63-261)||(23963923-23964117)
chr4 (82-222)||(10680692-10680832)
chr4 (82-222)||(10894332-10894472)
chr4 (197-356)||(40198353-40198506)
chr4 (116-337)||(22621610-22621825)
chr4 (64-222)||(37431459-37431623)
chr4 (268-356)||(29268650-29268738)
chr4 (82-161)||(10665522-10665601)
chr4 (82-161)||(10879667-10879746)
chr4 (81-228)||(47923543-47923690)
chr4 (174-350)||(18995455-18995621)
chr4 (75-229)||(19885645-19885799)
chr4 (75-278)||(44021260-44021463)
chr4 (64-259)||(9549690-9549878)
chr4 (206-279)||(29257456-29257529)
chr4 (64-222)||(56172116-56172280)
chr4 (82-222)||(17220073-17220213)
chr4 (85-221)||(22066745-22066881)
chr4 (85-136)||(3169751-3169802)
chr4 (77-144)||(50002874-50002941)
chr4 (81-242)||(26625356-26625516)
chr4 (82-159)||(10715981-10716058)
chr4 (82-159)||(10929751-10929828)
chr4 (64-161)||(24826002-24826106)
chr4 (67-220)||(39797263-39797418)
chr4 (171-279)||(47704121-47704229)
chr4 (85-136)||(1645293-1645344)
chr4 (64-264)||(31994274-31994485)
chr4 (82-159)||(10710461-10710538)
chr4 (82-159)||(10924231-10924308)
chr4 (127-279)||(31601087-31601239)
chr4 (78-186)||(43002213-43002321)
chr4 (124-222)||(26623933-26624031)
chr4 (225-279)||(38545914-38545968)
chr4 (63-144)||(40913429-40913513)
chr4 (116-222)||(46829695-46829801)
chr4 (73-191)||(56040450-56040565)
chr4 (216-279)||(12519887-12519950)
chr4 (64-142)||(40198211-40198290)
chr4 (75-134)||(43489304-43489363)
chr4 (199-279)||(45756855-45756937)
chr4 (224-338)||(13169276-13169384)
chr4 (64-106)||(48257427-48257469)
chr4 (123-189)||(51318177-51318243)
chr4 (178-279)||(1125172-1125273)
chr4 (241-278)||(7242614-7242651)
chr4 (64-121)||(13169114-13169171)
chr4 (75-189)||(32766706-32766817)
chr4 (73-176)||(36204184-36204283)
chr4 (116-176)||(54317767-54317827)
chr4 (312-356)||(1531957-1532001)
chr4 (73-191)||(43095818-43095938)
chr4 (231-279)||(46386609-46386657)
chr4 (75-184)||(51958670-51958783)
chr4 (75-122)||(3171289-3171336)
chr4 (63-122)||(12755173-12755232)
chr4 (231-262)||(38166186-38166217)
chr4 (73-115)||(43853716-43853759)
chr4 (297-348)||(56172012-56172063)
chr4 (68-122)||(56335838-56335890)
chr4 (64-106)||(18936065-18936107)
chr4 (64-106)||(24098865-24098906)
chr4 (75-105)||(36700496-36700526)
chr4 (73-191)||(2520969-2521084)
chr4 (311-356)||(2624545-2624590)
chr4 (73-106)||(4142568-4142601)
chr4 (73-102)||(7273609-7273638)
chr4 (62-118)||(7579445-7579504)
chr4 (77-106)||(10258709-10258738)
chr4 (73-102)||(10496612-10496641)
chr4 (73-106)||(19853316-19853349)
chr4 (73-106)||(21686046-21686079)
chr4 (73-106)||(26633475-26633508)
chr4 (311-356)||(29965684-29965729)
chr4 (81-122)||(31444758-31444799)
chr4 (197-278)||(37870085-37870166)
chr4 (73-106)||(42032322-42032355)
chr4 (62-107)||(42914791-42914836)
chr4 (197-258)||(45681764-45681825)
chr4 (85-130)||(46386470-46386515)
chr4 (198-275)||(50002978-50003055)
chr4 (312-356)||(4643907-4643951)
chr4 (312-356)||(9283960-9284004)
chr4 (74-106)||(12493604-12493636)
chr4 (74-106)||(13634387-13634419)
chr4 (312-356)||(25273932-25273976)
chr4 (122-190)||(26090760-26090828)
chr4 (74-106)||(27652226-27652258)
chr4 (74-106)||(32952546-32952578)
chr4 (232-264)||(35964914-35964946)
chr4 (74-106)||(36161994-36162026)
chr4 (74-106)||(36194991-36195023)
chr4 (89-129)||(40129898-40129938)
chr4 (312-356)||(43154010-43154054)
chr4 (73-161)||(43510416-43510501)
chr4 (75-122)||(45032729-45032777)
chr4 (74-106)||(46990919-46990951)
chr4 (312-356)||(47417711-47417755)
chr4 (312-356)||(49410272-49410316)
chr4 (312-356)||(50766508-50766552)
chr4 (122-186)||(53616480-53616544)
chr4 (312-356)||(53616646-53616690)
[»] chr1 (172 HSPs)
chr1 (64-356)||(18343773-18344064)
chr1 (64-356)||(15390906-15391213)
chr1 (64-356)||(42276515-42276822)
chr1 (64-356)||(28677793-28678091)
chr1 (62-356)||(13488188-13488497)
chr1 (64-356)||(44517307-44517615)
chr1 (64-356)||(33486690-33486991)
chr1 (65-356)||(45750638-45750944)
chr1 (78-356)||(14265444-14265736)
chr1 (64-348)||(12871789-12872073)
chr1 (64-356)||(29205445-29205735)
chr1 (81-356)||(27534857-27535147)
chr1 (64-356)||(32878868-32879160)
chr1 (64-356)||(32784239-32784546)
chr1 (85-356)||(45193303-45193589)
chr1 (62-356)||(3232948-3233240)
chr1 (64-349)||(4882031-4882313)
chr1 (116-348)||(4870754-4870986)
chr1 (64-356)||(37822017-37822306)
chr1 (76-356)||(7995245-7995521)
chr1 (116-356)||(29726309-29726558)
chr1 (64-356)||(9298085-9298377)
chr1 (64-356)||(51418144-51418451)
chr1 (116-356)||(47551255-47551489)
chr1 (64-356)||(10627160-10627472)
chr1 (75-356)||(33938709-33938974)
chr1 (62-278)||(12147714-12147930)
chr1 (64-356)||(42491053-42491336)
chr1 (63-279)||(26771337-26771553)
chr1 (64-279)||(11121207-11121422)
chr1 (64-279)||(13969308-13969523)
chr1 (64-279)||(34659309-34659524)
chr1 (64-279)||(44513670-44513885)
chr1 (64-279)||(46589379-46589594)
chr1 (65-279)||(15276115-15276329)
chr1 (75-279)||(33177277-33177481)
chr1 (64-279)||(8893524-8893738)
chr1 (64-320)||(13152636-13152894)
chr1 (64-279)||(44562417-44562632)
chr1 (81-278)||(13691448-13691645)
chr1 (75-279)||(2350853-2351056)
chr1 (64-356)||(10304738-10305030)
chr1 (81-279)||(40992529-40992727)
chr1 (64-356)||(423947-424252)
chr1 (63-279)||(33703177-33703393)
chr1 (64-347)||(15790930-15791227)
chr1 (65-279)||(38646815-38647029)
chr1 (62-355)||(25032755-25033048)
chr1 (77-220)||(34566971-34567114)
chr1 (65-279)||(23257319-23257533)
chr1 (64-279)||(26199811-26200026)
chr1 (65-279)||(22344581-22344795)
chr1 (62-279)||(49652066-49652283)
chr1 (75-279)||(36621583-36621786)
chr1 (64-279)||(12967401-12967615)
chr1 (65-279)||(6212583-6212797)
chr1 (74-279)||(630462-630667)
chr1 (64-245)||(22031770-22031951)
chr1 (74-279)||(27469386-27469591)
chr1 (75-259)||(38644476-38644660)
chr1 (75-279)||(52839761-52839965)
chr1 (64-356)||(50107583-50107876)
chr1 (125-348)||(40862555-40862772)
chr1 (146-356)||(28399086-28399290)
chr1 (63-279)||(10877577-10877794)
chr1 (74-279)||(45659245-45659450)
chr1 (74-279)||(28213279-28213489)
chr1 (81-273)||(29067285-29067476)
chr1 (75-279)||(14716955-14717153)
chr1 (65-279)||(15698429-15698643)
chr1 (129-279)||(21326704-21326854)
chr1 (74-183)||(5844458-5844567)
chr1 (64-216)||(17347886-17348042)
chr1 (67-275)||(25278508-25278715)
chr1 (77-218)||(37662648-37662785)
chr1 (64-278)||(47392368-47392580)
chr1 (65-356)||(32301498-32301788)
chr1 (127-277)||(33125543-33125693)
chr1 (260-356)||(17347757-17347853)
chr1 (75-186)||(900376-900486)
chr1 (62-222)||(10599167-10599333)
chr1 (74-350)||(26097697-26097960)
chr1 (64-194)||(30853615-30853744)
chr1 (64-279)||(11877116-11877341)
chr1 (117-214)||(20413094-20413191)
chr1 (126-348)||(24114420-24114632)
chr1 (75-279)||(1768158-1768356)
chr1 (121-347)||(45425207-45425427)
chr1 (124-257)||(38783320-38783453)
chr1 (62-278)||(2486144-2486369)
chr1 (62-278)||(8224406-8224616)
chr1 (80-222)||(23791282-23791424)
chr1 (83-230)||(33001797-33001944)
chr1 (64-184)||(33127976-33128098)
chr1 (278-351)||(13869802-13869875)
chr1 (74-350)||(13999132-13999399)
chr1 (64-120)||(16141022-16141078)
chr1 (309-356)||(20411732-20411779)
chr1 (198-279)||(5832465-5832546)
chr1 (197-261)||(6158838-6158902)
chr1 (282-349)||(8737517-8737584)
chr1 (64-184)||(10782751-10782877)
chr1 (64-356)||(25689507-25689802)
chr1 (231-356)||(29938398-29938516)
chr1 (170-279)||(8743909-8744018)
chr1 (291-356)||(29551645-29551710)
chr1 (75-191)||(10265022-10265138)
chr1 (89-161)||(21326854-21326926)
chr1 (77-191)||(31919162-31919278)
chr1 (151-222)||(8937900-8937971)
chr1 (66-113)||(28666476-28666523)
chr1 (237-347)||(3101836-3101940)
chr1 (116-222)||(15312339-15312445)
chr1 (64-122)||(30678648-30678706)
chr1 (200-278)||(37684894-37684972)
chr1 (200-278)||(37700545-37700623)
chr1 (296-350)||(39080816-39080870)
chr1 (180-274)||(46930331-46930425)
chr1 (64-235)||(48003487-48003663)
chr1 (198-279)||(4564747-4564828)
chr1 (117-220)||(6788153-6788249)
chr1 (81-214)||(29551436-29551576)
chr1 (279-348)||(29802794-29802863)
chr1 (75-169)||(29938556-29938656)
chr1 (79-144)||(32538888-32538953)
chr1 (74-164)||(44915839-44915926)
chr1 (73-191)||(27456657-27456777)
chr1 (279-339)||(29069725-29069785)
chr1 (91-279)||(35356250-35356437)
chr1 (207-349)||(2513418-2513554)
chr1 (75-122)||(10188555-10188602)
chr1 (260-303)||(20413054-20413097)
chr1 (62-120)||(12537930-12537988)
chr1 (64-117)||(13869970-13870021)
chr1 (78-244)||(17920654-17920820)
chr1 (123-189)||(18569142-18569208)
chr1 (153-279)||(34039332-34039458)
chr1 (197-279)||(34334897-34334979)
chr1 (108-270)||(41018544-41018705)
chr1 (171-236)||(171294-171359)
chr1 (73-110)||(8758062-8758099)
chr1 (73-106)||(26535591-26535624)
chr1 (75-107)||(5856160-5856192)
chr1 (312-356)||(40646711-40646755)
chr1 (73-191)||(47133076-47133190)
chr1 (73-161)||(7337467-7337552)
chr1 (306-349)||(8937797-8937840)
chr1 (122-189)||(9687035-9687102)
chr1 (121-176)||(39927384-39927439)
chr1 (125-168)||(40922912-40922955)
chr1 (279-349)||(18889271-18889341)
chr1 (124-186)||(38520367-38520429)
chr1 (139-217)||(43504111-43504189)
chr1 (73-106)||(11462286-11462319)
chr1 (73-106)||(21947422-21947455)
chr1 (310-343)||(31427065-31427098)
chr1 (73-106)||(35484195-35484228)
chr1 (73-106)||(36894212-36894245)
chr1 (230-263)||(39927491-39927524)
chr1 (64-121)||(46930482-46930538)
chr1 (74-138)||(171498-171562)
chr1 (132-232)||(8960782-8960882)
chr1 (312-356)||(19715891-19715935)
chr1 (121-189)||(31130422-31130490)
chr1 (241-277)||(35077748-35077784)
chr1 (228-264)||(39987499-39987535)
chr1 (73-105)||(40163234-40163266)
chr1 (74-106)||(41081492-41081524)
chr1 (74-106)||(48750451-48750483)
chr1 (73-105)||(49504399-49504431)
chr1 (312-356)||(50148411-50148455)
chr1 (122-186)||(50165929-50165993)
[»] chr7 (187 HSPs)
chr7 (64-356)||(21990822-21991129)
chr7 (64-356)||(45482224-45482519)
chr7 (74-356)||(17473425-17473713)
chr7 (74-356)||(17579501-17579789)
chr7 (64-356)||(32740912-32741210)
chr7 (66-356)||(42603435-42603730)
chr7 (62-356)||(11833178-11833487)
chr7 (74-356)||(17508868-17509165)
chr7 (74-356)||(17544049-17544346)
chr7 (73-356)||(36719223-36719513)
chr7 (64-348)||(9785485-9785784)
chr7 (64-356)||(45457210-45457517)
chr7 (64-329)||(44482532-44482807)
chr7 (64-356)||(3266546-3266841)
chr7 (64-356)||(48304046-48304354)
chr7 (64-356)||(36578995-36579302)
chr7 (64-356)||(1280791-1281098)
chr7 (64-356)||(41288116-41288423)
chr7 (65-356)||(10094601-10094906)
chr7 (64-356)||(36253090-36253397)
chr7 (62-356)||(24319875-24320184)
chr7 (76-349)||(26161118-26161409)
chr7 (64-356)||(6667555-6667862)
chr7 (64-356)||(39532629-39532936)
chr7 (73-356)||(42644832-42645113)
chr7 (64-356)||(46025709-46025990)
chr7 (64-356)||(40761748-40762055)
chr7 (64-356)||(4621034-4621328)
chr7 (64-277)||(37375710-37375928)
chr7 (81-356)||(5684524-5684805)
chr7 (81-356)||(5709574-5709855)
chr7 (64-356)||(2622752-2623059)
chr7 (73-354)||(22747172-22747468)
chr7 (75-355)||(24988165-24988440)
chr7 (64-347)||(9137125-9137407)
chr7 (64-356)||(28664610-28664902)
chr7 (64-356)||(21603620-21603925)
chr7 (65-356)||(10574541-10574831)
chr7 (67-314)||(32643170-32643432)
chr7 (64-350)||(27535594-27535894)
chr7 (77-279)||(29804360-29804562)
chr7 (62-279)||(28015588-28015805)
chr7 (62-350)||(21954485-21954773)
chr7 (74-279)||(772674-772879)
chr7 (77-279)||(21328979-21329181)
chr7 (64-279)||(26017326-26017541)
chr7 (65-279)||(49167156-49167370)
chr7 (207-356)||(9719785-9719934)
chr7 (65-279)||(47156616-47156830)
chr7 (74-279)||(8319546-8319751)
chr7 (87-279)||(43483819-43484011)
chr7 (64-279)||(21552123-21552338)
chr7 (124-354)||(29352388-29352611)
chr7 (85-279)||(2532172-2532366)
chr7 (74-279)||(38649036-38649242)
chr7 (62-279)||(30992490-30992706)
chr7 (74-279)||(33530153-33530358)
chr7 (75-279)||(19895363-19895567)
chr7 (65-279)||(7986123-7986337)
chr7 (74-279)||(35362786-35362990)
chr7 (65-279)||(40775498-40775709)
chr7 (77-279)||(45949372-45949562)
chr7 (205-352)||(15674421-15674568)
chr7 (64-216)||(37593392-37593550)
chr7 (85-279)||(41748216-41748410)
chr7 (75-257)||(46918652-46918834)
chr7 (64-349)||(39707452-39707735)
chr7 (74-279)||(5024730-5024939)
chr7 (75-279)||(42490934-42491137)
chr7 (77-257)||(47749987-47750167)
chr7 (66-342)||(38273076-38273354)
chr7 (63-279)||(22379376-22379592)
chr7 (75-279)||(43806829-43807033)
chr7 (64-278)||(34893341-34893553)
chr7 (65-279)||(134814-135028)
chr7 (65-279)||(40476938-40477152)
chr7 (62-279)||(37399829-37400046)
chr7 (75-279)||(11002074-11002278)
chr7 (91-279)||(34594217-34594405)
chr7 (65-279)||(8611292-8611507)
chr7 (65-220)||(18753985-18754140)
chr7 (96-279)||(36350399-36350581)
chr7 (64-356)||(37714639-37714931)
chr7 (64-279)||(39090319-39090534)
chr7 (74-356)||(5238113-5238391)
chr7 (64-278)||(14707815-14708026)
chr7 (77-278)||(14733748-14733947)
chr7 (229-348)||(15017209-15017329)
chr7 (63-279)||(23732061-23732276)
chr7 (65-256)||(24470658-24470850)
chr7 (65-256)||(24475606-24475798)
chr7 (64-356)||(25112672-25112954)
chr7 (124-348)||(25531620-25531839)
chr7 (74-232)||(35141341-35141499)
chr7 (64-356)||(9137568-9137859)
chr7 (204-356)||(38277004-38277150)
chr7 (249-348)||(43847238-43847337)
chr7 (74-279)||(37890168-37890372)
chr7 (62-178)||(15674015-15674137)
chr7 (64-163)||(43847335-43847440)
chr7 (73-220)||(25854889-25855035)
chr7 (75-279)||(40657841-40658044)
chr7 (64-279)||(16273613-16273827)
chr7 (64-232)||(35134870-35135037)
chr7 (62-337)||(10623977-10624251)
chr7 (64-194)||(23808659-23808793)
chr7 (62-159)||(15123669-15123766)
chr7 (65-279)||(31724851-31725071)
chr7 (65-161)||(8180165-8180267)
chr7 (64-257)||(44681713-44681908)
chr7 (231-338)||(14657693-14657794)
chr7 (126-274)||(26638349-26638497)
chr7 (80-278)||(25876557-25876764)
chr7 (64-215)||(46881502-46881659)
chr7 (64-222)||(31254785-31254949)
chr7 (153-356)||(27050229-27050424)
chr7 (64-176)||(32587196-32587311)
chr7 (116-279)||(6646321-6646484)
chr7 (64-156)||(14657575-14657673)
chr7 (64-182)||(7765531-7765656)
chr7 (81-194)||(28314298-28314411)
chr7 (64-255)||(22751657-22751847)
chr7 (63-146)||(32083598-32083681)
chr7 (64-115)||(32312916-32312967)
chr7 (64-111)||(48643480-48643527)
chr7 (153-351)||(27704834-27705026)
chr7 (64-240)||(17222384-17222563)
chr7 (73-122)||(20206195-20206244)
chr7 (64-120)||(38277208-38277264)
chr7 (125-279)||(5948644-5948801)
chr7 (282-349)||(6496059-6496126)
chr7 (309-356)||(37593279-37593326)
chr7 (73-191)||(28407722-28407837)
chr7 (64-122)||(34871148-34871206)
chr7 (64-191)||(37837253-37837377)
chr7 (238-279)||(9934074-9934115)
chr7 (73-191)||(9977014-9977129)
chr7 (206-279)||(43098808-43098881)
chr7 (171-267)||(32312810-32312906)
chr7 (66-161)||(33901983-33902085)
chr7 (73-120)||(6622795-6622842)
chr7 (232-279)||(17222306-17222353)
chr7 (170-220)||(5436136-5436186)
chr7 (78-140)||(10250185-10250246)
chr7 (64-122)||(15017107-15017165)
chr7 (64-122)||(24533553-24533611)
chr7 (197-279)||(26638497-26638579)
chr7 (64-122)||(33095790-33095848)
chr7 (75-260)||(35306163-35306358)
chr7 (85-167)||(35911813-35911895)
chr7 (310-356)||(37375946-37375992)
chr7 (282-356)||(43256437-43256511)
chr7 (75-185)||(14762357-14762473)
chr7 (73-177)||(14810816-14810920)
chr7 (73-177)||(15257811-15257915)
chr7 (73-106)||(17611648-17611681)
chr7 (74-191)||(34899412-34899526)
chr7 (64-121)||(39989843-39989900)
chr7 (62-102)||(15670462-15670502)
chr7 (123-215)||(17230413-17230505)
chr7 (74-106)||(35261554-35261586)
chr7 (280-356)||(46881339-46881415)
chr7 (200-235)||(15336051-15336086)
chr7 (87-142)||(35562736-35562791)
chr7 (296-346)||(22493204-22493254)
chr7 (64-106)||(35133212-35133254)
chr7 (64-121)||(35544815-35544870)
chr7 (73-191)||(8001350-8001465)
chr7 (73-106)||(12141111-12141144)
chr7 (279-356)||(17223293-17223370)
chr7 (73-106)||(25286992-25287025)
chr7 (73-106)||(28044560-28044593)
chr7 (121-186)||(31235613-31235678)
chr7 (73-106)||(31481891-31481924)
chr7 (132-225)||(39544776-39544869)
chr7 (73-191)||(40993329-40993444)
chr7 (73-106)||(46700288-46700321)
chr7 (73-106)||(48061676-48061709)
chr7 (312-356)||(2843237-2843281)
chr7 (75-115)||(10037931-10037971)
chr7 (312-356)||(14627875-14627919)
chr7 (92-144)||(27706290-27706342)
chr7 (280-356)||(31703368-31703444)
chr7 (294-350)||(32116481-32116537)
chr7 (294-342)||(32571747-32571795)
chr7 (89-121)||(43998651-43998683)
chr7 (125-189)||(46339234-46339298)
[»] chr8 (165 HSPs)
chr8 (64-348)||(10148113-10148403)
chr8 (81-356)||(10338510-10338791)
chr8 (64-356)||(2234132-2234439)
chr8 (64-350)||(14600360-14600661)
chr8 (64-356)||(31202618-31202915)
chr8 (73-356)||(11162043-11162344)
chr8 (64-356)||(24790832-24791137)
chr8 (62-356)||(4757325-4757617)
chr8 (74-356)||(7579527-7579824)
chr8 (64-356)||(37612813-37613103)
chr8 (75-356)||(31407424-31407717)
chr8 (75-351)||(2024897-2025188)
chr8 (64-356)||(30026544-30026851)
chr8 (64-319)||(23970850-23971115)
chr8 (75-355)||(32778645-32778925)
chr8 (65-353)||(1809901-1810188)
chr8 (64-356)||(39067352-39067658)
chr8 (62-356)||(41361892-41362202)
chr8 (64-356)||(19720169-19720480)
chr8 (62-356)||(13575869-13576163)
chr8 (64-356)||(43936842-43937146)
chr8 (65-356)||(28296778-28297076)
chr8 (88-356)||(3204472-3204754)
chr8 (64-356)||(9501746-9502035)
chr8 (116-356)||(12329787-12330036)
chr8 (64-279)||(16937007-16937222)
chr8 (62-356)||(22787652-22787952)
chr8 (64-356)||(24699992-24700301)
chr8 (87-356)||(31308308-31308592)
chr8 (116-356)||(37128215-37128456)
chr8 (81-349)||(24210408-24210690)
chr8 (64-279)||(41996774-41996989)
chr8 (64-279)||(12248379-12248594)
chr8 (85-279)||(32256410-32256604)
chr8 (65-279)||(44295547-44295761)
chr8 (64-349)||(13570429-13570701)
chr8 (77-279)||(14530597-14530799)
chr8 (64-285)||(5526033-5526269)
chr8 (64-279)||(3925359-3925573)
chr8 (64-279)||(8054476-8054690)
chr8 (65-275)||(9992902-9993111)
chr8 (85-279)||(10043003-10043195)
chr8 (163-349)||(38545930-38546115)
chr8 (64-356)||(2968692-2968982)
chr8 (64-279)||(5457302-5457517)
chr8 (64-279)||(12243884-12244099)
chr8 (77-220)||(18190532-18190675)
chr8 (64-279)||(15665770-15665987)
chr8 (77-279)||(27534093-27534295)
chr8 (81-279)||(32062025-32062223)
chr8 (81-275)||(37720075-37720268)
chr8 (78-279)||(1215023-1215224)
chr8 (64-279)||(23766971-23767185)
chr8 (74-279)||(16937950-16938160)
chr8 (64-279)||(31712742-31712959)
chr8 (75-259)||(32104516-32104700)
chr8 (116-332)||(40490253-40490467)
chr8 (64-279)||(2629142-2629359)
chr8 (63-275)||(13977643-13977857)
chr8 (80-279)||(32920875-32921074)
chr8 (65-279)||(16996558-16996772)
chr8 (65-279)||(32413021-32413235)
chr8 (80-277)||(7269150-7269346)
chr8 (64-277)||(7280797-7281009)
chr8 (64-279)||(12357026-12357239)
chr8 (77-279)||(11298443-11298643)
chr8 (74-279)||(36545460-36545664)
chr8 (81-279)||(18196831-18197029)
chr8 (65-279)||(5328183-5328392)
chr8 (81-279)||(16809094-16809291)
chr8 (63-266)||(9799678-9799881)
chr8 (224-350)||(10334342-10334462)
chr8 (64-232)||(5989891-5990059)
chr8 (65-192)||(26538702-26538829)
chr8 (65-279)||(37129343-37129558)
chr8 (77-255)||(9270276-9270453)
chr8 (79-279)||(31147512-31147711)
chr8 (74-230)||(17019380-17019536)
chr8 (74-230)||(17549817-17549973)
chr8 (124-342)||(6219840-6220051)
chr8 (64-194)||(18994198-18994327)
chr8 (75-242)||(4928196-4928369)
chr8 (65-356)||(4429221-4429514)
chr8 (64-216)||(15286694-15286853)
chr8 (64-216)||(15467063-15467222)
chr8 (64-144)||(37659226-37659306)
chr8 (75-337)||(10951970-10952231)
chr8 (75-337)||(10959975-10960236)
chr8 (87-194)||(15237231-15237338)
chr8 (117-279)||(7014188-7014350)
chr8 (62-122)||(38545476-38545536)
chr8 (157-279)||(5917510-5917632)
chr8 (133-272)||(31874319-31874457)
chr8 (63-144)||(45310897-45310978)
chr8 (309-356)||(1039816-1039863)
chr8 (68-356)||(7256476-7256763)
chr8 (64-356)||(20992967-20993259)
chr8 (74-186)||(26673454-26673572)
chr8 (198-336)||(33526566-33526698)
chr8 (250-356)||(10633050-10633150)
chr8 (86-232)||(283701-283841)
chr8 (86-232)||(632036-632176)
chr8 (86-232)||(817848-817988)
chr8 (63-159)||(27989040-27989137)
chr8 (63-159)||(28046342-28046439)
chr8 (237-285)||(15288677-15288725)
chr8 (237-285)||(15469046-15469094)
chr8 (62-222)||(21471849-21472015)
chr8 (163-257)||(3028269-3028363)
chr8 (64-122)||(7291556-7291614)
chr8 (64-122)||(9627838-9627896)
chr8 (64-114)||(10334893-10334943)
chr8 (64-204)||(12111002-12111148)
chr8 (75-191)||(21237960-21238072)
chr8 (108-194)||(36555746-36555832)
chr8 (65-114)||(31874460-31874509)
chr8 (74-186)||(11725870-11725976)
chr8 (65-113)||(11967996-11968044)
chr8 (78-191)||(7198003-7198112)
chr8 (107-194)||(14918380-14918467)
chr8 (105-245)||(20082332-20082474)
chr8 (81-247)||(36261219-36261384)
chr8 (75-121)||(589029-589075)
chr8 (75-121)||(624847-624893)
chr8 (74-143)||(3028366-3028433)
chr8 (65-144)||(6833712-6833783)
chr8 (305-346)||(14186909-14186950)
chr8 (73-106)||(19443855-19443888)
chr8 (279-356)||(19488989-19489066)
chr8 (74-119)||(35778777-35778822)
chr8 (80-191)||(41431281-41431391)
chr8 (179-255)||(7281838-7281914)
chr8 (74-122)||(9802065-9802113)
chr8 (74-191)||(30568124-30568238)
chr8 (64-107)||(6314917-6314960)
chr8 (206-277)||(12964092-12964163)
chr8 (73-161)||(16928559-16928644)
chr8 (75-106)||(27498170-27498201)
chr8 (241-279)||(283833-283871)
chr8 (241-279)||(632006-632044)
chr8 (241-279)||(817818-817856)
chr8 (75-121)||(4021160-4021206)
chr8 (291-345)||(4928141-4928195)
chr8 (305-343)||(30261900-30261938)
chr8 (316-346)||(32726606-32726636)
chr8 (229-263)||(43192282-43192316)
chr8 (64-121)||(7281962-7282019)
chr8 (73-191)||(7883043-7883158)
chr8 (73-106)||(9637211-9637244)
chr8 (73-102)||(15596955-15596984)
chr8 (73-106)||(17693415-17693448)
chr8 (73-106)||(23230897-23230930)
chr8 (291-348)||(35778982-35779039)
chr8 (73-106)||(40211102-40211135)
chr8 (73-106)||(40618875-40618908)
chr8 (73-106)||(41684627-41684660)
chr8 (312-356)||(2655914-2655958)
chr8 (312-356)||(9619353-9619397)
chr8 (74-102)||(14544681-14544709)
chr8 (74-106)||(14585942-14585974)
chr8 (74-106)||(18890491-18890523)
chr8 (312-356)||(23851490-23851534)
chr8 (64-120)||(26912038-26912094)
chr8 (73-105)||(33214473-33214505)
chr8 (232-264)||(37971385-37971417)
[»] chr6 (110 HSPs)
chr6 (64-356)||(12481033-12481331)
chr6 (64-356)||(14782809-14783103)
chr6 (64-356)||(31705325-31705632)
chr6 (64-356)||(23654410-23654716)
chr6 (64-354)||(1106517-1106826)
chr6 (64-356)||(35219567-35219874)
chr6 (64-356)||(23101062-23101369)
chr6 (64-351)||(12653972-12654259)
chr6 (64-315)||(30813267-30813524)
chr6 (64-356)||(8693325-8693615)
chr6 (64-356)||(4393930-4394237)
chr6 (64-356)||(15589779-15590069)
chr6 (64-356)||(21507508-21507798)
chr6 (64-356)||(23637776-23638081)
chr6 (64-356)||(2304492-2304799)
chr6 (66-356)||(4921564-4921842)
chr6 (75-356)||(6295914-6296210)
chr6 (75-356)||(6302724-6303020)
chr6 (64-340)||(29920571-29920862)
chr6 (75-278)||(10744814-10745017)
chr6 (64-279)||(20496424-20496639)
chr6 (171-356)||(31937187-31937381)
chr6 (77-279)||(34020834-34021036)
chr6 (76-356)||(13871292-13871581)
chr6 (64-349)||(2488304-2488589)
chr6 (74-279)||(12576159-12576364)
chr6 (64-255)||(19402506-19402712)
chr6 (64-230)||(4660723-4660895)
chr6 (75-279)||(13233787-13233991)
chr6 (75-279)||(23843103-23843307)
chr6 (164-356)||(6419618-6419819)
chr6 (64-275)||(5416893-5417103)
chr6 (64-279)||(19760019-19760234)
chr6 (75-258)||(31748209-31748392)
chr6 (75-279)||(8632875-8633079)
chr6 (64-232)||(8644506-8644674)
chr6 (74-279)||(11426172-11426381)
chr6 (65-279)||(20845239-20845458)
chr6 (65-279)||(548541-548749)
chr6 (64-279)||(4663488-4663703)
chr6 (77-271)||(16913564-16913761)
chr6 (62-279)||(892515-892732)
chr6 (77-335)||(8978423-8978680)
chr6 (64-243)||(6127799-6127984)
chr6 (81-279)||(33541216-33541414)
chr6 (75-279)||(15127808-15128012)
chr6 (110-279)||(32804526-32804694)
chr6 (198-340)||(1418906-1419042)
chr6 (64-278)||(31804452-31804660)
chr6 (117-278)||(12651922-12652083)
chr6 (64-166)||(31936287-31936395)
chr6 (288-356)||(19402703-19402771)
chr6 (64-144)||(5146307-5146393)
chr6 (157-279)||(7049476-7049598)
chr6 (64-193)||(33129855-33129981)
chr6 (64-257)||(904521-904714)
chr6 (64-279)||(33194825-33195042)
chr6 (62-356)||(29284913-29285191)
chr6 (75-217)||(15469926-15470069)
chr6 (64-348)||(5527302-5527578)
chr6 (89-347)||(16328769-16329020)
chr6 (77-162)||(22530546-22530631)
chr6 (74-337)||(14730801-14731062)
chr6 (92-272)||(31395488-31395674)
chr6 (216-350)||(12156302-12156430)
chr6 (80-194)||(23588002-23588116)
chr6 (64-120)||(4085087-4085143)
chr6 (64-128)||(5545062-5545126)
chr6 (64-120)||(6419533-6419589)
chr6 (196-355)||(1914993-1915146)
chr6 (232-349)||(8508295-8508406)
chr6 (75-279)||(27135342-27135547)
chr6 (125-260)||(20430769-20430904)
chr6 (75-186)||(31680759-31680877)
chr6 (75-271)||(32457884-32458076)
chr6 (124-222)||(16338044-16338142)
chr6 (74-279)||(28943501-28943705)
chr6 (64-125)||(1944445-1944506)
chr6 (64-332)||(9043784-9044055)
chr6 (75-185)||(15985643-15985758)
chr6 (129-258)||(20028441-20028569)
chr6 (282-338)||(3358949-3359005)
chr6 (207-279)||(8694088-8694160)
chr6 (73-191)||(31296991-31297105)
chr6 (123-222)||(3359047-3359146)
chr6 (305-356)||(15470147-15470198)
chr6 (126-220)||(7870444-7870538)
chr6 (73-191)||(33052972-33053087)
chr6 (311-356)||(15175970-15176015)
chr6 (280-347)||(16339734-16339801)
chr6 (73-161)||(32327024-32327109)
chr6 (75-130)||(33197610-33197665)
chr6 (116-191)||(35039010-35039085)
chr6 (197-348)||(3610155-3610298)
chr6 (305-347)||(16338213-16338255)
chr6 (124-186)||(18248802-18248864)
chr6 (73-106)||(3913378-3913411)
chr6 (73-106)||(11321348-11321381)
chr6 (73-106)||(12170721-12170754)
chr6 (294-347)||(16360936-16360989)
chr6 (73-106)||(21426490-21426523)
chr6 (124-191)||(528204-528269)
chr6 (74-106)||(606457-606489)
chr6 (122-166)||(8027948-8027992)
chr6 (70-106)||(22571653-22571689)
chr6 (70-106)||(29255247-29255283)
chr6 (75-114)||(29744479-29744519)
chr6 (77-186)||(30608323-30608429)
chr6 (74-106)||(31984395-31984427)
chr6 (74-102)||(34185499-34185527)
[»] chr2 (195 HSPs)
chr2 (67-356)||(4732230-4732526)
chr2 (65-351)||(44942451-44942752)
chr2 (64-349)||(4739496-4739796)
chr2 (66-356)||(10286670-10286968)
chr2 (64-356)||(35333665-35333972)
chr2 (64-356)||(9978332-9978630)
chr2 (64-356)||(25068012-25068308)
chr2 (64-356)||(33012208-33012515)
chr2 (64-356)||(20560787-20561093)
chr2 (64-356)||(29542952-29543260)
chr2 (64-356)||(38384120-38384418)
chr2 (62-356)||(12704847-12705155)
chr2 (65-356)||(5754448-5754748)
chr2 (64-356)||(9689639-9689946)
chr2 (64-356)||(15920035-15920320)
chr2 (64-356)||(36868168-36868475)
chr2 (64-356)||(13878663-13878970)
chr2 (64-356)||(14018788-14019095)
chr2 (65-356)||(31908472-31908777)
chr2 (64-356)||(28261559-28261849)
chr2 (64-356)||(12890771-12891079)
chr2 (64-356)||(43696028-43696335)
chr2 (64-351)||(18089066-18089353)
chr2 (64-334)||(34416417-34416702)
chr2 (64-356)||(11937520-11937819)
chr2 (64-353)||(28230751-28231055)
chr2 (64-356)||(4603970-4604268)
chr2 (67-356)||(11798195-11798484)
chr2 (64-356)||(32314602-32314892)
chr2 (65-356)||(38534960-38535266)
chr2 (64-356)||(34471126-34471423)
chr2 (64-356)||(17267780-17268087)
chr2 (64-356)||(43473799-43474089)
chr2 (64-279)||(26491532-26491747)
chr2 (64-356)||(27095866-27096156)
chr2 (64-356)||(4426313-4426619)
chr2 (68-356)||(32015413-32015716)
chr2 (64-350)||(13740308-13740615)
chr2 (92-356)||(22597295-22597575)
chr2 (65-356)||(41797754-41798060)
chr2 (79-279)||(35353871-35354071)
chr2 (64-300)||(11942584-11942835)
chr2 (64-272)||(16136322-16136545)
chr2 (67-279)||(37883884-37884096)
chr2 (64-279)||(25622712-25622927)
chr2 (77-279)||(3397660-3397862)
chr2 (62-278)||(34480197-34480413)
chr2 (74-279)||(12366099-12366304)
chr2 (207-356)||(34962888-34963037)
chr2 (77-277)||(5071051-5071251)
chr2 (81-279)||(43928985-43929183)
chr2 (81-279)||(2251033-2251230)
chr2 (65-279)||(25771676-25771890)
chr2 (64-279)||(3390654-3390869)
chr2 (89-356)||(11580824-11581091)
chr2 (65-279)||(27023808-27024022)
chr2 (75-279)||(28228453-28228657)
chr2 (64-279)||(18141149-18141364)
chr2 (80-279)||(31125063-31125262)
chr2 (146-356)||(7072716-7072909)
chr2 (67-356)||(17767227-17767521)
chr2 (65-279)||(44167381-44167594)
chr2 (74-259)||(5930674-5930859)
chr2 (74-275)||(13268807-13269008)
chr2 (75-279)||(3603216-3603420)
chr2 (64-279)||(15673632-15673851)
chr2 (64-279)||(19580670-19580885)
chr2 (64-279)||(4878402-4878619)
chr2 (89-279)||(10589326-10589516)
chr2 (65-279)||(41177089-41177303)
chr2 (65-279)||(43567104-43567317)
chr2 (67-316)||(20570173-20570422)
chr2 (64-272)||(16720516-16720724)
chr2 (65-279)||(3465160-3465374)
chr2 (65-279)||(36508160-36508377)
chr2 (64-232)||(11931150-11931318)
chr2 (74-279)||(27191011-27191220)
chr2 (74-279)||(27840825-27841034)
chr2 (104-279)||(7640064-7640239)
chr2 (65-267)||(8064457-8064658)
chr2 (168-348)||(6431181-6431355)
chr2 (64-279)||(20036613-20036827)
chr2 (65-279)||(6090121-6090334)
chr2 (74-279)||(9715222-9715427)
chr2 (74-279)||(25237009-25237214)
chr2 (64-279)||(40125618-40125831)
chr2 (65-279)||(38822303-38822515)
chr2 (64-356)||(40038977-40039269)
chr2 (64-259)||(44441630-44441825)
chr2 (64-337)||(7581761-7582029)
chr2 (81-191)||(44589206-44589322)
chr2 (103-279)||(29734421-29734601)
chr2 (64-349)||(13548573-13548855)
chr2 (140-279)||(25516723-25516862)
chr2 (62-186)||(34962647-34962777)
chr2 (64-142)||(11550334-11550412)
chr2 (64-194)||(19953854-19953984)
chr2 (64-222)||(27665838-27666003)
chr2 (75-208)||(106557-106697)
chr2 (88-345)||(20598360-20598617)
chr2 (62-223)||(30933535-30933695)
chr2 (64-220)||(4703436-4703598)
chr2 (77-235)||(9207037-9207195)
chr2 (138-279)||(31811808-31811949)
chr2 (68-338)||(17792652-17792920)
chr2 (64-275)||(16570587-16570800)
chr2 (240-348)||(20124620-20124722)
chr2 (64-120)||(3527397-3527453)
chr2 (68-220)||(14825851-14826003)
chr2 (201-348)||(45694258-45694399)
chr2 (66-278)||(12183006-12183214)
chr2 (279-356)||(27666370-27666447)
chr2 (85-213)||(11561362-11561496)
chr2 (62-161)||(39481189-39481288)
chr2 (153-279)||(2763285-2763411)
chr2 (171-337)||(8027779-8027939)
chr2 (66-176)||(17304188-17304304)
chr2 (75-346)||(19904678-19904945)
chr2 (74-279)||(5172026-5172236)
chr2 (64-120)||(7071429-7071485)
chr2 (75-222)||(15786248-15786393)
chr2 (296-348)||(20607215-20607267)
chr2 (102-275)||(31262662-31262832)
chr2 (74-278)||(17054728-17054936)
chr2 (153-280)||(17118571-17118698)
chr2 (124-279)||(22269212-22269366)
chr2 (75-121)||(27666577-27666623)
chr2 (66-220)||(45035274-45035428)
chr2 (210-279)||(11550409-11550478)
chr2 (121-278)||(17116133-17116289)
chr2 (211-279)||(29812430-29812498)
chr2 (66-275)||(31271611-31271826)
chr2 (78-251)||(33852158-33852335)
chr2 (77-192)||(39963530-39963648)
chr2 (297-356)||(823860-823919)
chr2 (200-279)||(7443370-7443449)
chr2 (81-144)||(13547173-13547236)
chr2 (153-280)||(17056226-17056353)
chr2 (153-280)||(17068673-17068800)
chr2 (294-349)||(26254835-26254890)
chr2 (172-225)||(2898741-2898794)
chr2 (197-274)||(11426879-11426956)
chr2 (304-349)||(15261322-15261367)
chr2 (64-217)||(22651643-22651795)
chr2 (73-191)||(31788636-31788751)
chr2 (64-177)||(11985029-11985139)
chr2 (74-263)||(17073162-17073355)
chr2 (74-191)||(8809459-8809575)
chr2 (64-115)||(16379762-16379813)
chr2 (65-120)||(25516914-25516969)
chr2 (75-194)||(35283030-35283149)
chr2 (200-278)||(2550410-2550488)
chr2 (274-356)||(6510642-6510724)
chr2 (64-122)||(13113420-13113478)
chr2 (294-356)||(15028208-15028270)
chr2 (149-227)||(19382200-19382278)
chr2 (77-191)||(35220508-35220619)
chr2 (116-194)||(45693822-45693900)
chr2 (81-190)||(31268790-31268899)
chr2 (73-191)||(36692054-36692169)
chr2 (73-106)||(37876411-37876444)
chr2 (280-348)||(8531447-8531515)
chr2 (309-349)||(8781719-8781759)
chr2 (75-115)||(15261120-15261160)
chr2 (74-122)||(15439881-15439929)
chr2 (74-106)||(30923263-30923295)
chr2 (305-356)||(2550330-2550381)
chr2 (75-122)||(14826319-14826366)
chr2 (140-222)||(15028071-15028151)
chr2 (153-272)||(17095243-17095362)
chr2 (63-122)||(17118278-17118337)
chr2 (73-161)||(31193141-31193226)
chr2 (208-279)||(42105578-42105648)
chr2 (73-191)||(4903950-4904065)
chr2 (74-115)||(12553975-12554017)
chr2 (89-152)||(20607133-20607202)
chr2 (73-164)||(25508873-25508961)
chr2 (73-191)||(33923885-33924000)
chr2 (73-106)||(5427674-5427707)
chr2 (73-159)||(12677256-12677339)
chr2 (94-151)||(24520561-24520618)
chr2 (279-356)||(36080683-36080760)
chr2 (230-263)||(37614062-37614095)
chr2 (73-106)||(37994545-37994578)
chr2 (73-106)||(38445428-38445461)
chr2 (73-102)||(41328005-41328034)
chr2 (74-106)||(10237011-10237043)
chr2 (280-356)||(12994098-12994173)
chr2 (73-105)||(24461702-24461734)
chr2 (312-356)||(27249147-27249191)
chr2 (74-106)||(32448423-32448455)
chr2 (122-186)||(34600401-34600465)
chr2 (312-356)||(36234049-36234093)
chr2 (122-182)||(36234189-36234249)
chr2 (122-186)||(41431215-41431279)
[»] chr5 (167 HSPs)
chr5 (64-348)||(7771475-7771774)
chr5 (64-356)||(6635408-6635715)
chr5 (64-356)||(17331488-17331795)
chr5 (73-356)||(29097949-29098238)
chr5 (64-356)||(32347377-32347675)
chr5 (62-356)||(6281204-6281513)
chr5 (64-356)||(17095895-17096202)
chr5 (116-356)||(23428412-23428652)
chr5 (64-349)||(23881770-23882070)
chr5 (64-356)||(20483346-20483653)
chr5 (64-356)||(33164123-33164429)
chr5 (74-356)||(177768-178064)
chr5 (65-356)||(27241224-27241521)
chr5 (64-356)||(17699713-17700020)
chr5 (64-356)||(17732041-17732347)
chr5 (64-356)||(26294728-26295018)
chr5 (64-348)||(39531062-39531363)
chr5 (64-356)||(6681531-6681837)
chr5 (77-356)||(2555017-2555311)
chr5 (64-356)||(11734499-11734780)
chr5 (64-356)||(34431220-34431531)
chr5 (64-356)||(39179499-39179789)
chr5 (64-356)||(18653942-18654249)
chr5 (73-356)||(25962079-25962362)
chr5 (74-348)||(28040797-28041086)
chr5 (77-279)||(40564838-40565040)
chr5 (62-356)||(42396162-42396473)
chr5 (64-279)||(41554718-41554933)
chr5 (116-356)||(42609304-42609553)
chr5 (65-355)||(3740518-3740798)
chr5 (62-279)||(18472392-18472609)
chr5 (64-279)||(14910344-14910559)
chr5 (77-279)||(29310035-29310237)
chr5 (65-279)||(31646060-31646274)
chr5 (74-279)||(33486247-33486452)
chr5 (117-354)||(980739-980988)
chr5 (64-279)||(5378533-5378748)
chr5 (64-280)||(42505067-42505287)
chr5 (63-356)||(12439348-12439624)
chr5 (65-279)||(28618833-28619047)
chr5 (64-273)||(26293853-26294077)
chr5 (118-356)||(3079047-3079295)
chr5 (63-279)||(34844147-34844363)
chr5 (64-279)||(40774992-40775207)
chr5 (64-279)||(6647577-6647796)
chr5 (65-279)||(6886847-6887061)
chr5 (74-279)||(20270945-20271151)
chr5 (81-279)||(28500920-28501118)
chr5 (64-279)||(37219234-37219448)
chr5 (81-279)||(8811837-8812035)
chr5 (75-259)||(2415651-2415837)
chr5 (77-279)||(6074417-6074619)
chr5 (65-279)||(35906500-35906714)
chr5 (79-279)||(20145902-20146102)
chr5 (65-279)||(4070782-4070995)
chr5 (79-279)||(8957437-8957637)
chr5 (64-343)||(7150984-7151263)
chr5 (73-279)||(17325341-17325545)
chr5 (64-278)||(29154452-29154666)
chr5 (75-259)||(32387715-32387899)
chr5 (64-279)||(19645705-19645924)
chr5 (64-272)||(34866669-34866878)
chr5 (238-356)||(11858070-11858186)
chr5 (63-277)||(25770839-25771057)
chr5 (64-271)||(15710780-15710990)
chr5 (77-279)||(12524345-12524547)
chr5 (244-356)||(43494020-43494132)
chr5 (65-275)||(10923803-10924013)
chr5 (64-184)||(17218050-17218169)
chr5 (66-279)||(39415923-39416141)
chr5 (81-277)||(39591281-39591477)
chr5 (64-189)||(42781337-42781468)
chr5 (124-337)||(35402214-35402428)
chr5 (75-217)||(3495139-3495281)
chr5 (62-184)||(37425448-37425570)
chr5 (64-279)||(6639225-6639448)
chr5 (212-356)||(17687365-17687503)
chr5 (74-279)||(9034623-9034825)
chr5 (64-218)||(28662362-28662516)
chr5 (64-207)||(32309814-32309963)
chr5 (62-191)||(39308419-39308546)
chr5 (215-356)||(39915653-39915788)
chr5 (74-279)||(41358260-41358470)
chr5 (170-351)||(42512764-42512939)
chr5 (232-348)||(12215301-12215410)
chr5 (123-356)||(17523256-17523483)
chr5 (75-278)||(34874093-34874285)
chr5 (125-348)||(14535066-14535283)
chr5 (64-263)||(13161608-13161812)
chr5 (64-356)||(26905303-26905598)
chr5 (128-242)||(33999870-33999984)
chr5 (66-257)||(39530817-39531013)
chr5 (204-356)||(32309324-32309470)
chr5 (63-122)||(29663028-29663087)
chr5 (64-130)||(4726671-4726737)
chr5 (76-279)||(11647431-11647639)
chr5 (78-194)||(24288641-24288756)
chr5 (78-194)||(24373466-24373581)
chr5 (105-194)||(32390373-32390462)
chr5 (288-348)||(12891844-12891904)
chr5 (208-279)||(4726740-4726811)
chr5 (74-161)||(13079450-13079537)
chr5 (218-356)||(35275815-35275947)
chr5 (118-279)||(37425250-37425409)
chr5 (64-130)||(28423704-28423770)
chr5 (132-278)||(39532077-39532223)
chr5 (64-121)||(9196685-9196742)
chr5 (203-276)||(13007925-13007998)
chr5 (73-191)||(14726265-14726380)
chr5 (64-170)||(17067441-17067553)
chr5 (202-279)||(28388914-28388991)
chr5 (116-176)||(907658-907718)
chr5 (124-356)||(26240413-26240639)
chr5 (64-111)||(586160-586207)
chr5 (77-159)||(32188404-32188487)
chr5 (124-219)||(43494180-43494275)
chr5 (197-279)||(1419260-1419342)
chr5 (305-355)||(18573480-18573530)
chr5 (76-191)||(38597966-38598078)
chr5 (73-184)||(8096303-8096410)
chr5 (203-276)||(13080388-13080461)
chr5 (153-262)||(20187388-20187496)
chr5 (295-356)||(25487768-25487829)
chr5 (73-186)||(6011942-6012052)
chr5 (74-186)||(13422107-13422215)
chr5 (117-220)||(35455381-35455484)
chr5 (75-191)||(10332354-10332466)
chr5 (294-356)||(39531636-39531698)
chr5 (280-349)||(374449-374518)
chr5 (73-106)||(13007480-13007513)
chr5 (64-161)||(13008014-13008111)
chr5 (73-191)||(14082200-14082315)
chr5 (75-185)||(17566135-17566251)
chr5 (64-113)||(19200250-19200299)
chr5 (73-113)||(4771100-4771140)
chr5 (63-123)||(16575166-16575226)
chr5 (132-184)||(34929708-34929760)
chr5 (294-350)||(39415553-39415609)
chr5 (62-105)||(13677511-13677554)
chr5 (295-346)||(20187505-20187556)
chr5 (73-193)||(26877913-26878029)
chr5 (75-147)||(39558168-39558246)
chr5 (73-168)||(1409692-1409784)
chr5 (65-176)||(6012716-6012833)
chr5 (160-258)||(9406366-9406463)
chr5 (86-144)||(13006443-13006501)
chr5 (196-274)||(17518116-17518194)
chr5 (312-354)||(19259808-19259850)
chr5 (73-184)||(38007533-38007641)
chr5 (77-120)||(39915849-39915894)
chr5 (73-106)||(8984793-8984826)
chr5 (73-106)||(9113529-9113562)
chr5 (64-161)||(13080477-13080574)
chr5 (64-121)||(20187288-20187345)
chr5 (73-106)||(24229588-24229621)
chr5 (81-122)||(31254942-31254983)
chr5 (73-191)||(34945562-34945677)
chr5 (74-122)||(374656-374704)
chr5 (312-356)||(2057834-2057878)
chr5 (62-106)||(11867905-11867949)
chr5 (207-255)||(12891895-12891943)
chr5 (121-189)||(20257525-20257593)
chr5 (312-356)||(27266855-27266899)
chr5 (81-121)||(32755497-32755536)
chr5 (312-356)||(34881757-34881801)
chr5 (294-350)||(34906319-34906375)
chr5 (64-104)||(42609583-42609623)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (64-356)||(35244-35542)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (64-356)||(12904-13206)
scaffold0121 (73-106)||(31078-31111)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (64-348)||(74332-74631)
[»] scaffold0294 (2 HSPs)
scaffold0294 (64-356)||(3721-4028)
scaffold0294 (89-166)||(5877-5960)
[»] scaffold0536 (1 HSPs)
scaffold0536 (64-356)||(3060-3362)
[»] scaffold1350 (1 HSPs)
scaffold1350 (108-356)||(1734-1992)
[»] scaffold0432 (2 HSPs)
scaffold0432 (64-279)||(2102-2326)
scaffold0432 (314-356)||(2339-2381)
[»] scaffold0999 (1 HSPs)
scaffold0999 (64-320)||(1900-2158)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (68-356)||(6787-7085)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (77-279)||(25193-25395)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (64-279)||(105271-105492)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (64-356)||(6297-6602)
[»] scaffold0316 (1 HSPs)
scaffold0316 (89-279)||(11896-12086)
[»] scaffold0722 (1 HSPs)
scaffold0722 (64-279)||(5194-5409)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (65-279)||(36755-36969)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (64-230)||(20888-21060)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (75-275)||(136754-136953)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (64-346)||(403902-404205)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (87-279)||(11245-11434)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (75-279)||(11455-11659)
[»] scaffold1379 (3 HSPs)
scaffold1379 (249-356)||(135-242)
scaffold1379 (233-346)||(927-1034)
scaffold1379 (64-228)||(732-905)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (64-230)||(9997-10163)
[»] scaffold0157 (3 HSPs)
scaffold0157 (64-157)||(846-939)
scaffold0157 (216-279)||(961-1024)
scaffold0157 (74-106)||(26841-26873)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (81-279)||(10180-10377)
[»] scaffold1294 (1 HSPs)
scaffold1294 (95-279)||(1006-1190)
[»] scaffold0045 (3 HSPs)
scaffold0045 (75-151)||(1600-1676)
scaffold0045 (163-279)||(9425-9541)
scaffold0045 (64-136)||(48019-48091)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (153-277)||(91161-91285)
scaffold0023 (75-136)||(91101-91162)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (65-279)||(244867-245074)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (65-194)||(93989-94111)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (197-279)||(21207-21289)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (75-333)||(15360-15618)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (62-348)||(22298-22579)
[»] scaffold0580 (4 HSPs)
scaffold0580 (75-217)||(470-613)
scaffold0580 (75-217)||(8209-8352)
scaffold0580 (311-355)||(698-742)
scaffold0580 (311-355)||(8437-8481)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (63-356)||(201730-202012)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (63-136)||(69162-69234)
scaffold0039 (73-106)||(53205-53238)
[»] scaffold0542 (2 HSPs)
scaffold0542 (198-356)||(3942-4094)
scaffold0542 (132-176)||(4142-4186)
[»] scaffold0603 (1 HSPs)
scaffold0603 (64-106)||(7979-8021)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (75-121)||(30284-30330)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (124-346)||(35841-36057)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (64-121)||(11222-11279)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (73-115)||(3838-3881)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (280-346)||(3626-3692)
[»] scaffold1827 (1 HSPs)
scaffold1827 (112-152)||(781-821)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (74-106)||(1472-1504)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (121-177)||(35251-35307)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 199)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 49627766 - 49628064
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |     
T  49627766 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatttgtgaacaatcc 49627865  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49627866 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactatattcatgtctctggaatactcatgtctccggatctgcaac 49627965  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49627966 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctaaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 49628064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Original strand, 40883538 - 40883835
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40883538 aaaataaacaatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 40883637  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40883638 acatcatccgtgttaatagcataaaacgacaaagtacccaagcctacaaatatgactatattcatgtatccgaaatactcatgtcttcggatctgcaacg 40883737  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40883738 tcgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaagaaacaccgcactaagacgggaaat 40883835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 64 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 55455329 - 55455030
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  55455329 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaagaaggatgaatctgtgaataaact 55455230  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55455229 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 55455130  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtc------attgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    ||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55455129 gttaacgacgccaaagtcattgtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 55455030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33637861 - 33637563
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33637861 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 33637762  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33637761 cacatcatccatgttaatagcataaaatggcaaggtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctacggatctgcaac 33637662  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33637661 gttgacgacgccaaagtcattttcattgatcggatctgcttttgttcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 33637563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 30155952 - 30156250
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  30155952 aaaaataaacgatactcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggaagaatatgtgaacaaact 30156051  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  30156052 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtatatatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgaaatacccatgtccccggatctgcaac 30156151  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30156152 cttgacgacgccaaaatcattgttattgatcggatctgaacttgctcaaagctaatttttcaaccagaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 30156250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 48652111 - 48652409
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaa------attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  48652111 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaactccaaattcgctaaaaacaaaaagcatgaatctgtgaacaaact 48652210  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48652211 cacatcatccatgttaatagcataaaacagcaaggtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccggatctgcaac 48652310  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48652311 gttgacgacgccaaagtcattttcattgatcggatctgctcttgttcaaagttaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 48652409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Original strand, 1074557 - 1074863
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1074557 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 1074656  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 249  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1074657 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtaaatatgtctacaaatatgactaacatgattatattcaagtctccggaatactcatgtctccgga 1074756  T
Q  250 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  1074757 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataatcactacactaagac 1074856  T
Q  350 gggaaat 356  Q
    |||||||    
T  1074857 gggaaat 1074863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14585929 - 14585622
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  14585929 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgagcaaact 14585830  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14585829 cacggcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactgtattcatgtctccggaatactcatgtctccag 14585730  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14585729 atctgcaatgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctgatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 14585630  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  14585629 cgggaaat 14585622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 41867995 - 41868292
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41867995 aaaaataaacgatatgcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaact 41868094  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41868095 cacaccatc-atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgtctacaaatatgactatattcaagtctcagaaatactcatgtctccggttctgcaac 41868193  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||    
T  41868194 gttgacgatgctaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaaaatacgccgcacaaagacggaaaat 41868292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Original strand, 31462417 - 31462708
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  31462417 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaact 31462516  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    || | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  31462517 caaaacatccatgttaatagaataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgattatattcatatctctggaataatcatgtctctggatctgcacc 31462616  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31462617 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacgccgcactaagac 31462708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11819551 - 11819243
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgcta--aaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11819551 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctataaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaa 11819452  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  11819451 ctcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaa-gtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtcttc 11819353  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11819352 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgttattgatcggatatgctcctgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 11819253  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    ||||||||||    
T  11819252 gacgggaaat 11819243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Original strand, 32080426 - 32080723
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  32080426 aaaataaacgatattctttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactc 32080525  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32080526 atatcatccatgttaatagcataaaaagacaaggtacctacgcctacaaatatgactatattcaagtctccgaaatcctcatgtctccggatctgcaacg 32080625  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  32080626 ttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatcattcaagctgaatcaaataaacatcgcactatgacgagaaat 32080723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 40012934 - 40013241
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  40012934 aaaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgatcaaact 40013033  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac---------tatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40013034 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaacgtacatatccctacaaatatgactaatttgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 40013133  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40013134 atctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgattgaatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 40013233  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  40013234 tgggaaat 40013241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 53403077 - 53402781
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||    
T  53403077 atattcatgcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactaacaacatcca 53402978  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaa---------tatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| ||         |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53402977 tgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttaccaacatgattaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctctggatctgcaacgt 53402878  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53402877 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacagcgcactaagacgggaaat 53402781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 13701664 - 13701970
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  13701664 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaact 13701763  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||      
T  13701764 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccaa 13701863  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13701864 atctgcaac-ttaacgacaccaaagtcattgtcattgatcagatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactagga 13701962  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  13701963 cgggaaat 13701970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48855344 - 48855037
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48855344 aaaaataaacgatattaattcattcaaattgatagagtacatcgaaacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaataaact 48855245  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48855244 cacaacatccatgttaataacataaaacggcaatgtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccgg 48855145  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  48855144 atctgcaacggtgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacatgaatcaaataaacaccacactaaga 48855045  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  48855044 cggaaaat 48855037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 53155092 - 53155399
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||    
T  53155092 aaaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatgaataatctgtgaacaaact 53155191  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53155192 cacaacatccatgttaatagcgtaaaaaggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtctccgg 53155291  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53155292 atctgcaaagttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaaga 53155391  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  53155392 cggaaaat 53155399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 54706394 - 54706684
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  54706394 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgttacaatacaaatccatattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaact 54706493  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||||    
T  54706494 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgcaac 54706585  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54706586 gttgacgacgccaaagccattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaggtaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 54706684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 55446515 - 55446219
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  55446515 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgacagagtatatcgatacaatgcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaagt 55446416  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55446415 cacatcatctatgttaatagcataaaacagcaaagtatctatgcatataaatatgactatattcaagtcttcagaatactcatgactccggatctgcaac 55446316  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55446315 gttgacgacgctaaagtcattgtcattgattggatctgcacttgctcaaagctaatccttcaatctgaatcaaataaaccccgcactaagacgggaa 55446219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22485433 - 22485125
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcatt-cattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||    
T  22485433 aaaaataaacgatattcatttcatttaaattgatacaatacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctatgaacaaac 22485334  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccg 247  Q
    ||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22485333 tcacaacatccatgttcatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatacttatgtcttcg 22485234  T
Q  248 gatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22485233 gatctgcaacgttgaggacgccaaagtcattgtcattgaccggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 22485134  T
Q  348 acgggaaat 356  Q
    |||| ||||    
T  22485133 acggaaaat 22485125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 81 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35175157 - 35174869
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||      || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35175157 attcattcaaattgatatagtac-tcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaggaatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 35175059  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacga 265  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  35175058 tagcataaaacgacaaagtacttatgcctacacatatgactagtatgactatattcatgtctccagaatactcatgtctccatatctgcaacgttgatga 35174959  T
Q  266 cgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35174958 cgccaaagtcattgtcattgatcaaatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 35174869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 105710 - 106004
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat-----tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || |||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  105710 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatcaaagtcactaagaacaaaaaggatgaatctccgaacaaactc 105809  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatat---tcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  105810 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactatataattgaagtttccggaatactcatgtctccgaatctgca 105909  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||||||| | |||      |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  105910 acgttgacgacacaaaa------gtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacgacactaagacgggaaa 106003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 36691459 - 36691768
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||      || |||||||| |||||||| |||||||||  ||     
T  36691459 ataaaaataaacgatattcattcattcaaatcgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacgaaaaggataaatttgtgagcaac 36691558  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||         |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36691559 ctcacaacatctatgttaataacataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctcc 36691658  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36691659 agatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcgaatatgcacttgcgcaaagttaatctttcaacctggatcaaataaacaccgtactaa 36691758  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||    
T  36691759 gacggaaaat 36691768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 34103418 - 34103716
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||      ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||    
T  34103418 ataaaagtaaacaatattcattcgttcaaattgatagagtatatcgatataatacaaatttatattcgctaaaaataaagaggatgaatt-gtgaacaaa 34103516  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
     ||||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34103517 ttcacaacatccatgttaatagcacaaaacggcaaagtatttatgactacaaatatgactatatccaagtctccggaatactcatttctccgtatctgca 34103616  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34103617 acgttgacgacgctgaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgc-tcaatctaatctttcgacctgaatcaaataaacaccgcactaaaacgggaaa 34103715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31270776 - 31270486
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31270776 aaaaatatacgatatttattcattcaaatggatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 31270677  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||||    
T  31270676 cacaacatccatgttaattgcatacaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgatta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgcaac 31270585  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31270584 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcgaataaacaccgcactaagacgggaaat 31270486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3457391 - 3457099
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  3457391 ataaaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcgaacaaa 3457292  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||  ||| ||     ||| || |||||| |||||||||    
T  3457291 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatataatta-at--atgact-----atattcttgtctctggatctgca 3457200  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3457199 atgttgacgacgccaaaatcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgtactaagacgggaaa 3457100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19645657 - 19645352
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  19645657 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaattcaaattcaaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgtgaacaaact 19645558  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact---------atattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| |||| || |||| || |||||||   ||| || | ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19645557 cacaacatc-atgttaaaagcataaaacataaaattatcgatgcctacaaatatgactcatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtcttcgg 19645459  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  19645458 atctgcaatattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaat-agctccgcactaaga 19645360  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  19645359 cgggaaat 19645352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 356
Target Start/End: Original strand, 54238698 - 54238987
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  54238698 attcattcaaattgataaagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacaaccatgttaa 54238797  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaac-tatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
     || || ||||| ||||||| | |||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||     
T  54238798 cagcatgaaacggcaaagtaccatatgtctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcgtgtctttgaatctgcaacgttgaca 54238897  T
Q  265 acgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54238898 acgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaatctaatctttcaacctgaatcaaat--acaccgcactaagacgggaaat 54238987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 207 - 356
Target Start/End: Original strand, 36624515 - 36624664
Alignment:
Q  207 aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36624515 aatatgactatattcatgtctccagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgatgccaaagccattgtcattgatcggatctgcacttgcttaa 36624614  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36624615 agctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 36624664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39610673 - 39610370
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39610673 aaaaataa-cgatattcattcattcaaattaatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 39610575  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||||||   ||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         |||| | ||||||| | |||||||||| |||     
T  39610574 cacatc---catgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctccgaagtactcatgtcaccga 39610478  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||    
T  39610477 atctacaacattgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaatctaaatcaaataaacaacgtactaaga 39610378  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    || |||||    
T  39610377 cgagaaat 39610370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45047964 - 45047684
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||    
T  45047964 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacgaaaatgatgaatcagtgaacaaact 45047865  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||| ||  ||| ||     ||| | |||||||||||||||||||    
T  45047864 cacatcatccatgttaataggataaaacggcaaagtacatatgcctacatatataacta-at--atgact-----atatttatgtctccggatctgcaac 45047773  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45047772 gttgacgacgccgaagtcattgtcattgatcgaatctgcacttgctaaaagctaatctttcaatctgaataaaataaacaccgcactaa 45047684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3312890 - 3312604
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata--caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  3312890 aaaaataaacgaaattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatatccaaattctctaaaaacaaaaaggttgaatctgtgaacaaagtcaca 3312791  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  3312790 acatccatgttaatagcataaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgactatattcaagtcaccggaata-ttatgtctctggatctacaacgttg 3312692  T
Q  262 acgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||| || ||       |||||| || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  3312691 acgatgcaaa-------gtcattaataggatctacacttgctcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcaagaagacgagaaat 3312604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48401559 - 48401273
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  48401559 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaact 48401460  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||                 ||||||||||||    
T  48401459 cacatcatccatgttaatagcatataacagcaaagtacatatgcctacaaatatgactatatttatgtctc-----------------cggatctgcaac 48401377  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatcttt-----caacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  48401376 gttgacgacgccaaagtcattatcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatcttttaacctaacctgaattaaataaacaccgcacaaagactgg 48401277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4020044 - 4019829
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||| |    
T  4020044 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatgcaaattcgcaaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactcacaac 4019945  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||| | | || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4019944 atccatgttaatagcataaaacgacaaagtacataagcctatacagattactatattcaagtctccagaatactcatgcctccggatctgcaacgttgac 4019845  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  4019844 gacgccaaagtcattg 4019829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4082164 - 4081910
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  4082164 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaccaaaaaggatgaatctgtaaacaaactcacaacatcca 4082065  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    | ||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||         |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  4082064 tgttaatagcataaaacggaaaagtacatatggctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaataatcatgtattcggatctgcaacgt 4081965  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  4081964 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatc 4081910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Original strand, 24483358 - 24483640
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||    
T  24483358 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatagaatacaaatccaaattcgctaaaaataaaaaggataaacctgtgaacaaact 24483457  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24483458 cacaacatccatgttaatatcataaaacggcaaagtccttatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccagatctgcaac 24483549  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||   ||||||||||    
T  24483550 gttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacctaaatcaagtaaatgtcgcactaaga 24483640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22844498 - 22844283
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  22844498 aaaaataaatgatattcattcattcgaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgcttaaaacaaaaaggacgaatatgtgaacaaactcacaac 22844399  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22844398 atccatgttaatagcataaaacgacaaagtactaaagcctacgcatatgactatatttaggtctccggaatacccatgtcttcggatctgcaatgttgac 22844299  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
     || ||||||||||||    
T  22844298 aactccaaagtcattg 22844283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 320
Target Start/End: Original strand, 4817553 - 4817810
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||      |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  4817553 atatttattcattcaaattgatagagtacattggtacaatataaattcaaattcgttaaaaacaaaaagcatgaatatgtgaacaaactcacaacatcca 4817652  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | |||||||||||||| |  ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4817653 tgttaatagtataaaatggaaaagtacttatgccaataaatatgactatattcatgtatccggaatactcatgtcttcggatctggaacgttgacgacgc 4817752  T
Q  269 c-----aaagtcattgtcattgatcgga-tatgcacttgcttaaaactaatctttcaa 320  Q
    |     |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  4817753 caaattaaagtcattgtcattgatcggattctgcacttactcaaagctaatctttcaa 4817810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48401238 - 48401022
Alignment:
Q  123 gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  48401238 gctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcatataacagcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattta 48401139  T
Q  223 tgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacc 322  Q
    ||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  48401138 tgtctccgga-----------------tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatcttttaacc 48401056  T
Q  323 tgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48401055 tgaatcaaataaacaccgcacaaagactggaaat 48401022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 1165075 - 1165279
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  1165075 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactcacatcatccatgttaa 1165174  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||    || ||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1165175 tagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaagt 1165274  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  1165275 cattg 1165279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39340630 - 39340430
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    ||||    
T  39340630 atattcattctttcaaattgatagggtatatcgatacaatgcaaattccctaaaaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatc----ttaa 39340535  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| ||||||||  ||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39340534 tagcataaaacggaaaagtataaaagcctacacatatgactatattcaagtctccggaatacacatgtctccggatctgcaacgttgacgacgacaaagt 39340435  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  39340434 cattg 39340430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 3088333 - 3088547
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  3088333 aaaataaaagatatttattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctcacaaca 3088432  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  3088433 tccatattaatagcataaaacaacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatg 3088532  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  3088533 acgccaaagtcattg 3088547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 20200727 - 20200941
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| | ||||||| ||    
T  20200727 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatacaaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgcgaacagactcacaaca 20200826  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  20200827 tccatgttaatagtataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccgaaataatcatgtctccggatttgcaacgtggaag 20200926  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| |||||||||    
T  20200927 acgccgaagtcattg 20200941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40797458 - 40797264
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  40797458 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatctatgttaatagcataaaa 40797359  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  40797358 cgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccttgtctccggatctacaatgttgatgactccaaagtcattg 40797264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43030128 - 43029914
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  43030128 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatca 43030029  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  43030028 tccatgttaatagcataaaatggcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 43029929  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    || ||||||||||||    
T  43029928 actccaaagtcattg 43029914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 20202909 - 20203123
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| | ||||||| ||    
T  20202909 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatacaaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgcgaacagactcacaaca 20203008  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| || |    
T  20203009 tccatgttaatagtataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccgaaataatcatgtctccgaatttgcaacgtggaag 20203108  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| |||||||||    
T  20203109 acgccgaagtcattg 20203123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21803976 - 21803762
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  21803976 aaaataaaagatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaaca 21803877  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| || ||||  |||||||    |||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  21803876 tccatgttaatagcatgaaacatcaaagtacaagtgcctacacatatgactgtatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatg 21803777  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||    
T  21803776 acgtcaaagtcattg 21803762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Original strand, 28994994 - 28995192
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  28994994 attcattcaaatcgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttaatagcat 28995093  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28995094 aaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 28995192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50520228 - 50520014
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||    
T  50520228 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacagactcacaaca 50520129  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| || |    
T  50520128 tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccagatctgcaacgtggatg 50520029  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||| ||||||    
T  50520028 acgccaaaatcattg 50520014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37052031 - 37051825
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta--- 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||       
T  37052031 attcattcattcaaattgacagagtacatcgatgcaatacaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaaaaaactcacaacatccatgttaata 37051932  T
Q  174 -atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
     |||| |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37051931 tatagcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatcttcggaatagctatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaa 37051832  T
Q  273 gtcattg 279  Q
    || ||||    
T  37051831 gttattg 37051825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10977688 - 10977474
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10977688 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatatcatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatca 10977589  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||||||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  10977588 tccatgttaatagcataaaacagcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccgaaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 10977489  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  10977488 acgccaaagtcattg 10977474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33076721 - 33076516
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||| |||    
T  33076721 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatggtgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactcacaatatccatgtta 33076622  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| |||||||| |||||||   ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  33076621 atagcataaaacggcaaagtacaaatgccaacacatatgactatattcaaatctccggaataaccatgcctccggatctgcaacgtggatgacgtcaaag 33076522  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  33076521 tcattg 33076516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Original strand, 913007 - 913199
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  913007 attcaaattgatag--tacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaa 913104  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    || |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  913105 cggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccgaaatacctttgtctccggatctgcaacgttgatgactccaaagtcattg 913199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2598523 - 2598309
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||      
T  2598523 aaaaataaatgatattcatgtattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatcc-ctaaaaacaaaaaggatgaatttgcaaacaaactcacaat 2598425  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    || ||| ||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  2598424 attcatgttaatagcataacacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatattctagtctccgaaatactcatgtcttcgaatttgcaacattgac 2598325  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  2598324 gacaccaaagtcattg 2598309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2148206 - 2147921
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||       ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2148206 aaaaataa-cgacattcgttcattcaaattgatagagtacgttgatacaatataaattcaaagtcactataaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaact 2148108  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||| ||||    
T  2148107 cacaacatccatattaatagcataaaacggcaaagtacaaatgtctacaaatatgactatattcaagtcttcggaatactcatctctcagg-tctacaac 2148009  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    ||||| ||| | |||      |||||||||| ||| | |||||||| |||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2148008 gttgatgacactaaa------gtcattgatcagatctacacttgctcaaagataatc-ttcaactcgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 2147921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 1806140 - 1806342
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  1806140 attcattcattcgaattgatggagtacatcgatttaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcattgaacaaactcacaacatccttgttaata 1806239  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||| ||| |||| ||  || ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1806240 gcataatacggcaaaatacataagcctataaatatgactatattaaaatctccggaatacccatgccttcggatttgcaacgttgatgacgccaaagtca 1806339  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  1806340 ttg 1806342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 207 - 356
Target Start/End: Original strand, 19861099 - 19861248
Alignment:
Q  207 aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19861099 aatatgactatattcaagtctctagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgatgtcaaagtcattgtcattgatcgaatatgcacttgctcaa 19861198  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |  |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  19861199 agttaatatttcaacctgaatcaagtaaacattgcactaagactggaaat 19861248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38530392 - 38530165
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattca-ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38530392 aaaaataaacgatattcaattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaacccaaattttttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaagaaac 38530293  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    ||| | ||||||| ||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||  |     ||| ||||||||||||||||||||    
T  38530292 tcaaagcatccatgttaataacataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta-at--atgatt-----atattcatgtctccggatctgcaa 38530201  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggat 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38530200 cgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggat 38530165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 32089610 - 32089813
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| || ||||  |||    
T  32089610 atattcattcactcaaattgatagagtacattaatacaatgcaaattcgttaaaaacaaaaacgatgaatctgtgcacaaactcacaacaaccatgataa 32089709  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |    
T  32089710 tagtataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatgtgactatattcaagtctccggaatacctatgtct-cggatattcaacgttgacgacgtcaaaat 32089808  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  32089809 cattg 32089813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 22286430 - 22286634
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||||||| |||    
T  22286430 gatattcattcattcaa-ttgagagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 22286528  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  22286529 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccagatctgcaacgtggatgacgtcaaag 22286628  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  22286629 tcattg 22286634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11846993 - 11846779
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |  || ||| ||    
T  11846993 aaaataaatgatattcattcattcaaattgacagagtacatcaataaaatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgagtatgtgaacaggctgacaaca 11846894  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||   ||||||||| ||||||||||||| |  | ||| |||||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  11846893 tccattttaatagtataaaacggaaaaatacaaatgcctacacatatgactatatttaaatatccagaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatg 11846794  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||| ||||||    
T  11846793 acgccaaaatcattg 11846779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21586324 - 21586130
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  21586324 attcaaatttataaagtaaatagatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatatgaacaaactcacaacatcgatgttaatagcataaaa 21586225  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |  |||||||   | | ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  21586224 cagcaaagtacaaaaggctacacatatcactatattcaactctccggaatacacatgtctccggatctccaacgtggacgacgtcaaagtcattg 21586130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 279
Target Start/End: Original strand, 29776356 - 29776573
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  29776356 ataaaaataaatgatattcatttattcaaattgatagagtacattgatacaatgcaaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgcgatcaaactcaca 29776455  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     || |||| |||||||  |||||||||||||||   | |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||| ||  |||| |    
T  29776456 acaaccatgttaatagcgtaaaacgacaaagtacaaaagcctgcacatatgactatattcaagtctctgaaatacccttgtctccggatttgtgacgtgg 29776555  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    || || ||||||| ||||    
T  29776556 acaacaccaaagttattg 29776573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 291
Target Start/End: Original strand, 34960589 - 34960806
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  34960589 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagac-acatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtaaacaaa 34960687  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| | ||||| ||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||                 | |||||||||||||||||    
T  34960688 ctcacagcttccatgttaataacataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgactgtat-----------------ttatgtctccggatctgca 34960770  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcgga 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34960771 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcgga 34960806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 42106563 - 42106391
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42106563 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgttaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaa 42106464  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||| | ||||   |  |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  42106463 cgagagagtactaaaacctacacatatgactgtatttaagtctccggaatacccttgtctccggatttgcaac 42106391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 53962559 - 53962278
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgcta-----aaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    |     | ||||||||  |||||| |   || ||| ||||| ||||||    
T  53962559 gatattcattcattcaaattgatagagtatattgatacattacaaatttaaaatcggcagaacaaaaattatgaatctacaaacaaattcacaacatcca 53962460  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||| || ||||| ||||||||| || |     
T  53962459 tgttaacagtataaaacaacagagtatctatgcctacaaatatgactatattcaagtctttgaaatattcatgtcccctgatctccaacgttgatgaagt 53962360  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||| ||| ||      || |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53962359 caaaatcaatg------attggatctgcacttgctcaaagctaatcttttaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 53962278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 32237677 - 32237879
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  32237677 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaacaacaaagaggatgaatctgcgaacaaacacacaacatccatgttaata 32237776  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||||  ||||| |   | ||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  32237777 gcataaaactgcaaagcacaaaagcctacacatatgactaaattcaaatctccgaaatatccatgtcttcggatctgcaacgtggacaacatcaaagtca 32237876  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  32237877 ttg 32237879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 351
Target Start/End: Original strand, 3961445 - 3961726
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  3961445 aaaataaacgatattcatttattcaaattgataaagtatatcgatacaatacaaattcaaagtcactataaacaaaaatgatgaatttgcaaacaaactc 3961544  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||| |||||||||  |||     |||    
T  3961545 acaacatccatattaataacataaaacgatggagtatatatgcctacaaatatgactatattcaagcttccataatattcatgtctctagat-----acg 3961639  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    |||| | ||||||||||||||  |||||    || | || ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3961640 ttgatggcgccaaagtcattg--attga----atctacatttgctcaaagttaatcttacaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 3961726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 43839195 - 43839400
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  43839195 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaatttgctaaaaataaaaagaatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgtta 43839294  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||  |||||||| |||||||   ||||||||| |||||| |||||| |  ||| |||||||  || |||| |||||||||||||| || ||||||| ||    
T  43839295 atatcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgattatatttaaatcttcggaataaccacgtcttcggatctgcaacgtggatgacgccagag 43839394  T
Q  274 tcattg 279  Q
    | ||||    
T  43839395 ttattg 43839400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45664669 - 45664452
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  ||||||    
T  45664669 ataaaaataaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtaaacaggctcaca 45664570  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     ||||||| ||||||| ||||||   ||| |||   |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  45664569 acatccatgttaatagcataaaattgcaaggtacaaatgcatacacatacgactatatttaaatctccgggataaccatatctccggatctgcaacgtgg 45664470  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||||||||||||||||    
T  45664469 atgacgccaaagtcattg 45664452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Original strand, 21084400 - 21084620
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac-----aatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| || ||    
T  21084400 taaaaataaacgatatccattcgttcgaattgatagagtacatcgatacaatacaatacaaattcgctaaaaacaaagatgatgaatctgcgaacaatct 21084499  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||  || |||| || ||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||| |||||||||     
T  21084500 catatcattcatgttaatagcataaaacgacaaaatacttaagcctgcatatatgactatattcaggtctttagaatacccatatctccagatctgcaat 21084599  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  21084600 gttgacgacaccaaattcatt 21084620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Original strand, 27189245 - 27189373
Alignment:
Q  228 ccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaat 327  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27189245 ccggaatacttatgtctctagatctgtaacgttgacgacgccaaagtcaatgtcattgatcagatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaat 27189344  T
Q  328 caaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27189345 aaaataaacaccgcaccaagacgggaaat 27189373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27831543 - 27831332
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||    
T  27831543 aaaataaatgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatttaa-ttcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaaca 27831445  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||| ||   | | ||||| || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||    
T  27831444 tccatgtcaatagcataaaacgacaaaatacaaaagactacacatgtgatcacattcaagtctccggaatacccgtgtctccggatctacagcgtggacg 27831345  T
Q  265 acgccaaagtcat 277  Q
    |||||||||||||    
T  27831344 acgccaaagtcat 27831332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 4206221 - 4206446
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||| |||||  |     ||| ||||| |||| |||||    
T  4206221 aaaaataaacaatgttcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatataaatccaaattcgttaaaataa-----gataaatttatgaacaaact 4206315  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||         |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  4206316 cacaacatccatattaatagtataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaatacttatgtctcccg 4206415  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4206416 atctacaacgttgacgacgccaaagtcattg 4206446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 356
Target Start/End: Original strand, 47733702 - 47733846
Alignment:
Q  206 aaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctta 305  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    ||||||| ||||| |    
T  47733702 aaatatgattatattcaagtctccggaatactattgtgtctggatctgcaactttgacgacgccaaagtcattg--attga----atatgcatttgctca 47733795  T
Q  306 aaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47733796 aaactaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaat 47733846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 33977604 - 33977808
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||| ||||    
T  33977604 atattcattcattcaaattgaaaaggtacatcgataaaatgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacagactcacaacatccatgttaa 33977703  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||  |||||||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||| |  | ||| |||||  ||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  33977704 taacataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatataactatatttaaatttccagaataaccatatttccggatctgcaacgtggatgacaccaaagt 33977803  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  33977804 cattg 33977808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2192547 - 2192417
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaa------attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  2192547 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaa 2192448  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
     ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  2192447 ttcacaacatccatgttaatagcataaaacg 2192417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 184
Target Start/End: Original strand, 55090361 - 55090487
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  55090361 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaact 55090460  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  55090461 cccatcatccatgttaatagcataaaa 55090487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31550377 - 31550100
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||  |||||||||      |||||||||||| ||||||||| || ||| |||||    
T  31550377 aaaaataaacgatattcattcatttaaattagtagagtacattgatacggtacaaattcaaggtcgctaaaaacaaataggatgaatctgcgaacaaact 31550278  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||||   ||| ||||||| |||||||||||   ||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||| |||||     
T  31550277 cacatc---catgttaatagcataaaacgacatcatacatatgcctgcaaatataactatattcaagtctctggattacacaagtctccggatgtgcaaa 31550181  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||    ||||||||||| |     | ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  31550180 gttgacgacgacaaagtcattg--attga----atatgcacttgtt-----caaatctttcaacctaaatcaaataaacaccacgctaagac 31550100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40702819 - 40702666
Alignment:
Q  126 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgt 225  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  40702819 aaaaataaaatggatgaatctgcgaacaaacttacatcatccatgttaagagcataaaatgacaaagtacatatccatacaaatataactatattcaagt 40702720  T
Q  226 ctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40702719 ctctgaaatactcatgtctcaggatctgcaacattgacgacgccaaagtcattg 40702666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43243243 - 43243039
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||    
T  43243243 atatgcattcattcaacttgataaagtacatcaatacaatgcaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaagaaactcacatcatcgatgttaa 43243144  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    | | ||||||||| ||| ||   |  |||||| |||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  43243143 ttgcataaaacgaaaaaatacaaaaacctacacatataactattttcaagtctccataatactcatgtcttcagatctacaacattgacgacgtcaaggt 43243044  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  43243043 cattg 43243039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 46926840 - 46926745
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  46926840 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccat 46926745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50460630 - 50460421
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaa-------acaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  50460630 attcatttatttaaattgacagagtacatcgatgcaattcaaatttgctaaaagttaagaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccat 50460531  T
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
     |||| |  ||||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |    
T  50460530 gttaacaacataaaacaacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctttggaatactcatgtcttcggatttgcaacgttgacaacgtc 50460431  T
Q  270 aaagtcattg 279  Q
    ||||| ||||    
T  50460430 aaagttattg 50460421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Original strand, 29182295 - 29182493
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||| |  |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  29182295 attcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaataaaaatgatgaatctatgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 29182394  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||||| ||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||  |||| |||||||||| ||||| || ||| || ||||| |||| |||||    
T  29182395 aaaatgacaaaatacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccaaaataatcatgtctccagatctacagcgtggatgacgctaaagccattg 29182493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20252092 - 20251908
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||    
T  20252092 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcaata--atgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatatgtgaacagactcacaacatccatgtt 20251995  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    |||||||||||||| |||||||    ||| |||| |||| |||||||| |  || ||  || |  ||||||||||||||||||||||    
T  20251994 aatagtataaaacggcaaagtacaattgcttacacatataactatatttaaatcaccaaaacaaccatgtctccggatctgcaacgt 20251908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 54240480 - 54240317
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  54240480 caaattcgctaaaaacaaataggatgaatctgtaaacaggctcacaacatctatgttaatagtataaaacgacaaaatacaaatgcctacacatatgact 54240381  T
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  54240380 atatttaaatcttcgtaataatcatgtctccggatctgcaacatggatgtcgccaaagtcattg 54240317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34767425 - 34767218
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaa-ttgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||         |||||| ||     
T  34767425 aaaaataaatgatattcattcattcaaaattgatagagtacatcaatacaacgtaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaac--------aaactcgcag 34767334  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    | | ||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  34767333 cgttcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacataagactatattcaagtctccggaatacccatgtctccggatatgcaatgtgga 34767234  T
Q  263 cgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||| ||||| |||||    
T  34767233 cgacaccaaaatcatt 34767218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 47914262 - 47914476
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||| ||    
T  47914262 aaaataaaagatattcattaattcaaatgaaaagagtacatcgatgtaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagcctgacaaca 47914361  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||| ||||| | |||||||| || |  |||||| || |  ||||| |  ||||||||||||| || |    
T  47914362 tccatgttaatagcataaaatgacaaagtacaaatgtctacacacatgactatgtttaaatctccgaaacaaccatgtttaaggatctgcaacgtggatg 47914461  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  47914462 acgccaaagtcattg 47914476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Original strand, 50981128 - 50981264
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||      |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  50981128 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatatagtacaaatttaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaataaact 50981227  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  50981228 cacaacttccatattaaaagcataaaacgacatagta 50981264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Original strand, 51084262 - 51084398
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||      |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  51084262 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatatagtacaaatttaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaataaact 51084361  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  51084362 cacaacttccatattaaaagcataaaacgacatagta 51084398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 51990558 - 51990752
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaac---aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |   |||  |   |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  51990558 tcattcattcaaattgatagagtacattaatacaattcaaatcc---aaattcgctaaaagggatgaatttgtgaacaaactcacaacatcaatgttaat 51990654  T
Q  176 agtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaat---------atgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    || ||||||||  |||||| ||||||||| ||||         ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51990655 agcataaaacggaaaagtacctatgcctataaatttaactaatatgactatatttatgtctccagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 51990752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30293246 - 30293126
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||    
T  30293246 taaaaataaacgatattcattcaatcaaattgatagaatatattgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcaaacaagctcacat 30293147  T
Q  163 catccatattaatagtataaa 183  Q
    ||| ||  ||||||| |||||    
T  30293146 cattcaagttaatagcataaa 30293126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 36540365 - 36540529
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |    
T  36540365 aaaaataaatgatatccattcattcaaattgatatagtacatcgatacactgaaaattcagtaaaaacaaaaaggttgaatctgtaaacaaactcacaac 36540464  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctc 228  Q
    ||| |||||||||  |||||||| |||||||   | ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  36540465 atctatattaataacataaaacggcaaagtactgaagcctacacaaatgactatattcaagtctc 36540529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 348
Target Start/End: Original strand, 25135051 - 25135272
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||| || ||| ||||||| |||||   ||||| || || ||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  25135051 tcgctaaaaacgaaaaggatgaatatgcgaataagcttacaacatccatcttaatgacataaatcggcagagtacttatgcctaaaaatatgattatatt 25135150  T
Q  221 catgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaa 320  Q
    || |||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||    | |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  25135151 caagtcttcagaatattcatgtcttcatatctgcaacgttgacgatgtcaaaatcattg--attgat----tttgcacttgctcaaatctaatatttcaa 25135244  T
Q  321 cctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||    
T  25135245 cttgaatcagataaacactgcactaaga 25135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Original strand, 36623925 - 36624076
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| |    
T  36623925 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcggtacaatataaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaa-ttgttaacaaaat 36624023  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata 210  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||    
T  36624024 cacaacatccatgttaatagcataaaacggtaaattacatatgcctacaaata 36624076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 356
Target Start/End: Original strand, 39429304 - 39429470
Alignment:
Q  182 aaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtc 281  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||      |||    
T  39429304 aaacgacaaaatatatatgcctacaaat--gactatattcaagtctctagaatactcatgtcttcggatctgaaacgttgacgatttcaaa------gtc 39429395  T
Q  282 attgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39429396 attgattggatttgcacttgctcagagctaatctttcaacctaaattaaataaacaccacactaagatgggaaat 39429470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53427108 - 53427029
Alignment:
Q  200 gcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53427108 gcctacacatatgactatattcaagtcttcggaatactcaagtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 53427029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40365650 - 40365540
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaa-caaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaa 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| || || ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  40365650 attcaaattgatatagtacatcgatacaatgcaaattcgttaaaaataaaaaaggatgcatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaa 40365551  T
Q  184 acgacaaagta 194  Q
    |||||||||||    
T  40365550 acgacaaagta 40365540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19148443 - 19148331
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatatt-cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaa------attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  19148443 aaaaataaacgatatttcattcattcaaattgatagtgtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaattaaaaggatgaatatgtgaacaaac 19148344  T
Q  157 tcacatcatccat 169  Q
    |||||||||||||    
T  19148343 tcacatcatccat 19148331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 242
Target Start/End: Original strand, 44984527 - 44984711
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||      || |||||||||||| |||| ||  || ||| |||||    
T  44984527 aaaaataaacgatatccattcatttaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcaaaatctctaaaaacaaaagggataaacatgcgaacaaact 44984626  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgt 242  Q
    || | |||||||||||||||||||||||   | ||||  |||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  44984627 cagagcatccatattaatagtataaaacagaagagtacatatatctacaaatatgactatattcaagtcttcaaaatactcatgt 44984711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 25939174 - 25939322
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||||| ||     
T  25939174 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatgcaaattcattaaaaataaaaaggatgaatctacgaacaaattcacaacatccatgttg 25939273  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||| |||| | |  ||||||   | ||||||| |||||||||||||||    
T  25939274 atagcataagatggtaaagtacaaaagcctacacatatgactatattca 25939322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 277
Target Start/End: Original strand, 47587103 - 47587254
Alignment:
Q  126 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgt 225  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| || | ||    
T  47587103 aaaaacaaaatggatgaatctgcgaacaaactcacatcattcatgttaatagcataaaacgacagagtataaaagcctacaaatatgactatttttaagt 47587202  T
Q  226 ctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
     |||  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  47587203 atccataatacttttgtctctggatctgcaacattgacgacatcaaagtcat 47587254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11225798 - 11225577
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||       | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  11225798 aaataaacgatattcattcattcaaattgatataatatatcgatacaatagaaatttaaagttgttaaaaacaaaaaggacgaatttgcgaacaaaatca 11225699  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagta-ac-tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    || |||  || ||| ||| |||| |||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||  ||  |  ||||||||||| | |||||||||||     
T  11225698 caacatttatgttagtagcataagacgacagagtacacatatgcctacaaacatgactatattcaaatcaacaaaatactcatgttttcggatctgcaat 11225599  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| || || ||||||||||    
T  11225598 gttgaagatgcaaaagtcattg 11225577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Original strand, 25373817 - 25373965
Alignment:
Q  119 attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactata 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||          |||||  | | |||||    
T  25373817 attcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaaaaaactcacaacattcatgttaatagcataaaacgacaaag----------tacaa--aagcctata 25373904  T
Q  219 ttcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  25373905 ttcaagtctctggaatactcatatctccggatctgcaacgtgaacgacgtcaaagtcattg 25373965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 48212635 - 48212501
Alignment:
Q  215 tatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatc 314  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||      |||||| |||| |||||||||| | | ||||||    
T  48212635 tatattcaagtctccagaatactcatgtcttcggatctgcaatattgacaacgccaaagtc------attgattggatctgcacttgctcagagctaatc 48212542  T
Q  315 tttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48212541 cttcaatctgaatctaataaacactgcactaagacgagaaa 48212501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51742233 - 51742056
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| || |||  |||||||| ||||||| |        |    
T  51742233 attcattcaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcgccaaaaaaaaaaagaatgaatatgcgaacgaactcacaacatccatgt--------t 51742142  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||||||||||||||  || |  |  |||| |||||||||||| |||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  51742141 aaaacgacaaagtacttaagtatgaaaatgtgactatattcaagtctctaaaatacacatgcctctggatctgcaacgttgacgac 51742056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 14740373 - 14740475
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  14740373 atatttattcattcaaattgaaagagtacatcgatgtaatgcaaattcgttaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacagcctcacagcatccatgttaa 14740472  T
Q  175 tag 177  Q
    |||    
T  14740473 tag 14740475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28876909 - 28876743
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||  || ||||||||| ||| | | |||    
T  28876909 gatatttattcattcaaattgatagagtatatcaatacaatacaaattcgctgaaaaaagaagtgatgaatttgcaaacaaactcacaacattcgtgtta 28876810  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcat 240  Q
    |||  |||||| |||||||||   | || |||  ||||||||||||| | || |||| |||||||||    
T  28876809 ataccataaaatgacaaagtacaaaagcatacgcatatgactatatttaagtatccgaaatactcat 28876743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 256
Target Start/End: Original strand, 40461660 - 40461855
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   ||||| || ||| ||| ||||| |    
T  40461660 aaaaataaatgatattaatttattcaaattgataaagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaatgaaaattttgaatctgcgaacaaagtcacaac 40461759  T
Q  164 atc---catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    |||   ||| |||| || ||| ||||||||||||   | | ||| | ||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||||||    
T  40461760 atccatcatgttaaaagcatagaacgacaaagtacaaaaggctatacatatgactatattcaagtctctgtgatacccatgtctccagatctgcaa 40461855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Original strand, 29017027 - 29017179
Alignment:
Q  126 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgt 225  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||| | |||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  29017027 aaaaaaaaaaaggaaaaatttatgaacaaattcaaagcatcgatattaattgcataaaacaacatagtaactatgcatataaatatgactatattcaagt 29017126  T
Q  226 ctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||  |||||  ||||||| |||||||||||| || | ||||  |||||||||    
T  29017127 ctctagaatatacatgtcttcggatctgcaactttaatgacgttaaagtcatt 29017179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 266
Target Start/End: Original strand, 31628630 - 31628820
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc-acatcatccatatta 173  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||  || |||    
T  31628630 atattcatttattcaaactgataatgtagatc-atacaatacaaattcgttaaatacaataaggataaatttgtgaacaaactcaacaccat-tatgtta 31628727  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    |||| |||| ||||||   ||  |  ||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  31628728 atagcataagacgacatgatacattagcctacaaatatgactatattcaagtatttgaaatactcatgtttctggatctacaacgttgacgac 31628820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Original strand, 40401206 - 40401345
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  || ||||    
T  40401206 attcattcaaattgatatagtacatcgatacaatgcaaatttaatgccgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtaaacaaactcacatcatatatgttaa 40401305  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac 214  Q
    | | || |||||||  |||| | ||  |||||||||||||    
T  40401306 tcgcatgaaacgacggagtacccatctctacaaatatgac 40401345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25084465 - 25084263
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||      | ||||||   ||| ||| ||||||  || ||||| ||| ||| ||    
T  25084465 atatacattcatttaaattgatagagtatattaatacaatacaaattcaaaattgttaaaaatgtaaatgataaatttgcaaacaaacttacaacatgca 25084366  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | ||||||  || ||||  |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  25084365 tgttaataacattaaacagcaaaatacatatgcctacaaatatgattatattcaagtctccagaatattcatgtctcatgatctgcaacgttgacgacac 25084266  T
Q  269 caa 271  Q
    |||    
T  25084265 caa 25084263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 25111831 - 25111987
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||        |||||| ||||||||||||| | |||           
T  25111831 aaaaataaatgatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatataaattcaaagttattaaaaagaaaaaggatgaatctatga------- 25111923  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  25111924 -acatcatccatattaataatataaaatgacaaaatacacatgcctacaaatatgattatattca 25111987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26412672 - 26412521
Alignment:
Q  127 aaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtc 226  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||| || |||||    |  |||||| ||||||||||||| | |||    
T  26412672 aaaacaaaaag-atgaatctataaataaactcacaacattcatgttaataacataaaaggagaaagttcaaaaacctacacatatgactatatttaagtc 26412574  T
Q  227 tccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |  | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26412573 tttgaaatattcatgtctccggatttgcaacgttgacgacgccaaactcattg 26412521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35670860 - 35670732
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||| || ||| ||| |||||     
T  35670860 taaaaataaatgatattcgttcattgaaattgataaagtacactcatacagtataaattcactaaaaacaaaagggattaatgtgcgaacaaattcacaa 35670761  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaa 191  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||    
T  35670760 gattcatgttaatagtataaaacgacaaa 35670732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 38379420 - 38379519
Alignment:
Q  68 ataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38379420 ataaacgatatttatttattcaaattgataaagtacattgatacaatacaaattcaaagttgttaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactcaca 38379519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 337
Target Start/End: Original strand, 20044713 - 20044798
Alignment:
Q  246 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20044713 cggatctgcaacgttgacgacgtcaaaatgattg--attga----atatgcacttgctcaaaactaatcttccaacctgaatcaaataaaca 20044798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 43017172 - 43017087
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43017172 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgtgaataaactcaca 43017087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Original strand, 46732414 - 46732576
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  ||||||||       ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||     
T  46732414 aaaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtgcaatgatgtaatacaaacccaagatcgctaacaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaacc 46732513  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    |||   ||| || ||||||  ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  46732514 cacgatatctattttaataacataaaacgacatagcatttatgcctacaaatatgactatatt 46732576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 240
Target Start/End: Original strand, 41598139 - 41598320
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||        ||||||||||| | || ||| ||  || ||||||    
T  41598139 aaaataaacgatattcatttatttaaattgatatagtacatcaatacgatacaaattcaaagttattaaaaacaaaaggaattaatatgcaaacaaactc 41598238  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcat 240  Q
     || ||||||| ||||||  |||||| | || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  41598239 gcaacatccattttaataacataaaatggcagagtacatatgcctacaaatatgattatattcaagtcttcgaaatactcat 41598320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 45568249 - 45568364
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||  |    
T  45568249 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacatcacccaagt 45568344  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  45568345 taatagcatacaacggcaaa 45568364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Original strand, 33937147 - 33937259
Alignment:
Q  132 aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgg 231  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||| || ||| |    
T  33937147 aaaaatgatgaatttatgaacaaatacacaaaatccatgttaatagtataaaatgacaaaatacatatgcatacaaatataattatattcaagtatccag 33937246  T
Q  232 aatactcatgtct 244  Q
    |||||||||||||    
T  33937247 aatactcatgtct 33937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 341
Target Start/End: Original strand, 5327242 - 5327427
Alignment:
Q  150 aataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 249  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |  ||| ||  |||| ||  |||||||| |||||| | | | ||| ||||||||||| || |||    
T  5327242 aataaactcacaatatccatgttaatagtataaaatgtaaaattatttatgtctttaaatatgattatatttaagccaccgaaatactcatgtttcggga 5327341  T
Q  250 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgc 341  Q
    | | |||||||||| ||||  |||| ||||  ||| | |    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5327342 tttacaacgttgactacgcagaagttattg--attaaac----atgcacttgatcaaaattaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgc 5327427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31731011 - 31730909
Alignment:
Q  125 taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatg 224  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| || ||||||  || |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  31731011 taaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatc-atgttaataacattaaacggtaaactacgcatgcctacaaatatgactatattcatg 31730913  T
Q  225 tctc 228  Q
    ||||    
T  31730912 tctc 31730909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33070595 - 33070488
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||||    
T  33070595 taaaaatgaacgatatttattcattcaaattgatggagtgtattgatacaatataaatttgctaaaaacaaaaataaatgaatatgcgaacaaactcaca 33070496  T
Q  162 tcatccat 169  Q
     |||||||    
T  33070495 acatccat 33070488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48212800 - 48212742
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48212800 aaaaataaacaatatttattcattccaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattc 48212742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51060124 - 51059991
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||      |  |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  51060124 ataaaaataaacgatgtttattcatttaaatcgatagagtaaatcgatagaatacagatttaaagtccttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaa 51060025  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    || ||| |||||| |||||||  | |||||||||    
T  51060024 cttacaacatccacattaataacacaaaacgaca 51059991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 566587 - 566316
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||      ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| | |||||    
T  566587 gatattcattaactcaaattgttaaagtatatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaatcaaaaag-attaatttgttaataaactcatagcatcc 566489  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    ||   | |||||||||| ||||| |||  |||| | ||| |||||||||| |||| |   ||  |||  |||||| |  |||||| ||| ||||||||||    
T  566488 atgcca-tagtataaaatgacaa-gtacatatgtcaacatatatgactatgttcaagctaccaaaattttcatgtttttggatctacaaagttgacgacg 566391  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    | ||||||||||  |||||    || |||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  566390 caaaagtcattg--attga----atctgcaattgataaaagctagtctttcaacctgaatcaaataaacaacgcattaaga 566316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 175
Target Start/End: Original strand, 7869128 - 7869232
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||      |||||||||||| ||| | | |||||||||| ||||||| | ||| ||||    
T  7869128 attcattcattcaaattgatagagtatatcgataaaatataaattgaaaatcgctaaaaacagaaaaggtaaatttgtgaacaaactcataacattcata 7869227  T
Q  171 ttaat 175  Q
    |||||    
T  7869228 ttaat 7869232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31730917 - 31730811
Alignment:
Q  237 tcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaac 336  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||      ||||||| |||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31730917 tcatgtctctagatctgcaacattgatgacgccaaagttattg------atcggatttgcacttgttcaaagttaatctttcaacttgaatcaaataaac 31730824  T
Q  337 accgcactaagac 349  Q
    |  ||||||||||    
T  31730823 attgcactaagac 31730811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 259
Target Start/End: Original strand, 35501447 - 35501622
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||| |||||||||        ||||| |||||| |  |||||| ||||||| |||    
T  35501447 gatattcattcattcaaattgataaaatacatcgat--aatgcaaatttgctaaaaac--------tgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 35501536  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    |||  |||||| |||||||||    ||| |||| ||||||||||||| |  || || ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  35501537 atatcataaaatgacaaagtataattgcttacacatatgactatatttaaatcaccagaacaaccatgtctccggatctgcaacgt 35501622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Original strand, 23799752 - 23799792
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23799752 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatagatacaa 23799792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37451946 - 37451906
Alignment:
Q  308 actaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451946 actaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 37451906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 242
Target Start/End: Original strand, 42167721 - 42167905
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||      | |||||||||||||| | ||||| ||  || |||    
T  42167721 ataaaaataaatgatattcattcattcaaattgacagagaatatcgatacaatataaatttaaaattgctaaaaacaaaaatggtgaatctgcaaacaaa 42167820  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgt 242  Q
    || ||| || |||| ||||||  ||||||||||| ||||  ||||| | |  |||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||    
T  42167821 cttacaacaaccatgttaataacataaaacgacagagtacatatgcattc--atatgactatatgcaagtcaccgaaatattcatgt 42167905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 51256832 - 51256792
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51256832 attcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatt 51256792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 550637 - 550485
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||      ||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| | |||||    
T  550637 gatattcattaactcaaattgttaaagtatatctatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaag-attaatatgttaataaactcatagcatcc 550539  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    || ||| | ||||||||||  | ||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  550538 atgttatt-gtataaaacggtagagtacatatgtctacatatatgactatattca 550485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7658453 - 7658406
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  7658453 gatattcattcattcaaattgatatagtacattgatacaatataaatt 7658406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 356
Target Start/End: Original strand, 32408728 - 32408779
Alignment:
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  32408728 aaaactaatctttcaacccgaatcaaataaacaccgtactgagacaggaaat 32408779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Original strand, 33604981 - 33605136
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||| |  ||||||||| |||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||||||||| ||||||||     
T  33604981 ctaaaaacaaaaatgatgaatttgcaaacaaacacttatcatccatgttaacaacataaaacgacacattacatacgcctacaaatatgaatatattcaa 33605080  T
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    | | |   || ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  33605081 gccactaaaaaactcaagttcccggatccgcaacgttgacgacacaaaagtcattg 33605136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33794203 - 33794124
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaa 143  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  33794203 aaaaataaatgatattcatttattcaaattgatagagcaaattgatacaatgcaagttctttaaaaacaaaaaggttgaa 33794124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 2522741 - 2522799
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2522741 aaaaataaacgatattcattcattcagaccgacagagtacattgatacaatacaaattc 2522799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31731446 - 31731408
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31731446 attcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaa 31731408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 348
Target Start/End: Original strand, 42167920 - 42167974
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42167920 tgcacttgattaaagcaaatctttcaatctgaatcaaataaacaccacactaaga 42167974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 135
Target Start/End: Original strand, 48053071 - 48053125
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  48053071 attcattcaaattgatagagtatatcgatgcaatgcaaattcgttaaaaataaaa 48053125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53293385 - 53293303
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  53293385 tatgccaacaaatatgactagattcaagtcatcagaatactcgtgtcttcgggtcagcaacgttgacgacgtcaaaatcattg 53293303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 348
Target Start/End: Original strand, 6894651 - 6894708
Alignment:
Q  291 atatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  6894651 atatgctcttgctcaaaactaatctttcaacttgaattaaataaatacggcactaaga 6894708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 46304325 - 46304358
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46304325 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 46304358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 20464770 - 20464802
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464770 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 20464802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 122
Target Start/End: Original strand, 32408549 - 32408605
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32408549 aaataaacgaaattcacttattcagatcgatagagtacatcgatacaatacaaattc 32408605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54149284 - 54149162
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||  || |||  |||||||||    
T  54149284 aaaattaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaactaactcacat 54149189  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    || |||  ||||||| ||| |||||||    
T  54149188 cacccaggttaatagcatacaacgaca 54149162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Original strand, 628729 - 628842
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||  |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||| || |||  |||    
T  628729 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc---aaaat-caagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagtta 628824  T
Q  174 atagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||| ||| |||| ||||    
T  628825 atagaatacaacggcaaa 628842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 104
Target Start/End: Original strand, 7448718 - 7448749
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7448718 cgatattcattcattcaaattgatagagtaca 7448749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 104
Target Start/End: Original strand, 7456860 - 7456891
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7456860 cgatattcattcattcaaattgatagagtaca 7456891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 279
Target Start/End: Original strand, 7656280 - 7656403
Alignment:
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||   |||| || | ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||| || ||||    
T  7656280 ctcacaacattcatgttaatggcataaaactacaaagtacaaatgcttagacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccgaatttgca 7656379  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| || ||||| ||||||||||    
T  7656380 acgtggatgacgctaaagtcattg 7656403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Original strand, 30648549 - 30648616
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  30648549 cgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgaca 30648616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40487609 - 40487524
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||   |||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  40487609 cgatattcattcattcaaatcgatagagtatatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacataaagagtgaatttgcgaacaaactcaca 40487524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 222
Target Start/End: Original strand, 43897286 - 43897381
Alignment:
Q  127 aaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||  |  ||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43897286 aaaacaaaaaagataaatttgtgaacaaactcaaaacatataggttaataacataaaacaacaaagtacatatacctactaatatgactatattca 43897381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Original strand, 44907229 - 44907296
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  44907229 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaaattaatagcatataacgaca 44907296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 220
Target Start/End: Original strand, 47437897 - 47437996
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||  |||| ||||||| ||||| |||||    
T  47437897 tcgctaaaaacaaaaggaatgaatatgcgaacaaactaatatcatacatgttaatagcataaaacaataaagtacatatgtctacaaacatgaccatatt 47437996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 51059942 - 51059871
Alignment:
Q  208 atatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  51059942 atatgactatattcaaatatccgaaatactcatatctccggatctataacgttgacaacgcaaaagttattg 51059871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 24396303 - 24396415
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||     | |||||||||  ||| |||||||||||| | |||| |||| ||| ||  ||    
T  24396303 cgatattcattaattcaaattgatagagtacatc-attcaata-----ttgctaaaaacttaaatgatgaatttgtgtacaaacacacaacattcaagtt 24396396  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  24396397 aatagcataaaacggcaaa 24396415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25849947 - 25849913
Alignment:
Q  230 ggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25849947 ggaatattcatgtctccggatctgcaacgttgacg 25849913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 115
Target Start/End: Original strand, 27189117 - 27189167
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 115  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27189117 aaaataaatgatattcatttattcaaattgatatagtacattgatacaata 27189167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33070067 - 33070029
Alignment:
Q  98 gagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33070067 gagtacattgatacaatataaattcgctaaaaacaaaaa 33070029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9998751 - 9998718
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9998751 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 9998718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10108520 - 10108487
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10108520 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 10108487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10233354 - 10233321
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10233354 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 10233321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 14859777 - 14859736
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14859777 atattcattcattcaaattgatagaatacatcagatacaata 14859736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 120
Target Start/End: Original strand, 19860956 - 19860997
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19860956 tcattcattcaagttgataaagtacatcgatacaatgcaaat 19860997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22803275 - 22803210
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  22803275 tcgctaaaaacgtaaaggataaatttgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacg 22803210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30195457 - 30195408
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaa 134  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30195457 attcaaattgatatagtatattgataccatacaaattcgctataaacaaa 30195408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32607548 - 32607503
Alignment:
Q  311 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32607548 aatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 32607503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35175687 - 35175654
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35175687 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 35175654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 35864765 - 35864798
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35864765 cgatattcgttcattcaaattgatagagtacatc 35864798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 36910570 - 36910603
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36910570 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 36910603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 37041052 - 37041019
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37041052 cgatattcattcattcagattgatagagtacatc 37041019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 177
Target Start/End: Original strand, 39917230 - 39917283
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatag 177  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  39917230 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaataaactcacaacatccaagttaatag 39917283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41818510 - 41818477
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41818510 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 41818477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 47733493 - 47733452
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47733493 attcattcaaattgacagagtacattgatacaatataaattc 47733452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 52922921 - 52922954
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52922921 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 52922954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8915006 - 8914974
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8915006 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 8914974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12116176 - 12116132
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12116176 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 12116132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14464588 - 14464544
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14464588 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 14464544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 21533614 - 21533646
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21533614 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 21533646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 22893417 - 22893501
Alignment:
Q  99 agtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaa 183  Q
    |||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| || | || ||||||| |||||    
T  22893417 agtacatcgatataatgttaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaacacacaacaactatgttaatagcataaa 22893501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 27706020 - 27706052
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27706020 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 27706052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 32881164 - 32881196
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32881164 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 32881196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 35499194 - 35499238
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35499194 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaat 35499238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36906366 - 36906302
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  36906366 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacg 36906302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40716630 - 40716562
Alignment:
Q  126 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||  || |||||||| |||||||    
T  40716630 aaaaataaaatggatgaatttgtgaacaaactcacaccatcaatgttaggagcataaaacggcaaagta 40716562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Original strand, 43488395 - 43488427
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacat 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43488395 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacat 43488427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Original strand, 44959780 - 44959878
Alignment:
Q  76 tattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||  ||||    
T  44959780 tattcattcattcaaatcgatagaatacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaataaactcacagcatccaagttaa 44959875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46178708 - 46178672
Alignment:
Q  228 ccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46178708 ccggaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacg 46178672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 47896435 - 47896403
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47896435 cgatattcattgattcaaattgatagagtacat 47896403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 48650539 - 48650571
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48650539 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 48650571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 51487393 - 51487357
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatag 98  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51487393 ataaaaataaaggatattcattcattcaaattgatag 51487357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 54008797 - 54008749
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  54008797 gatattcattcatttaaattgaaagagtaaatctataaaatacaaattc 54008749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 54240518 - 54240482
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagt 101  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54240518 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagt 54240482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 222)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7060783 - 7060483
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  7060783 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaaaatgtgaacaaa 7060684  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7060683 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacgataaagtacctatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctctggatctgca 7060584  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7060583 acgttgatgacgccaaagtaattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacgggaaa 7060484  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  7060483 t 7060483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Original strand, 38943821 - 38944109
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  38943821 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatccgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatatcatcc 38943920  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38943921 atgttaatagcataaaacgacaaagtatttatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcgtgtctccggatctgcaacgttgacaacg 38944020  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38944021 ccaaagtcattgtccttgatcggatctgcacttgctcaaagctattctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 38944109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 36124011 - 36124309
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36124011 aaaaataaacgatattcattctttcaaattgatagagtccatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 36124110  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36124111 cacaacatccatgttaatagcataaatcggcaaagcacatatgcctacaaatatgactatattcatgtctcccgaatactcatgtttccggatctgcaac 36124210  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36124211 gttgacaacgccaaagtcattgtcattgatcgaatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 36124309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28837587 - 28837232
Alignment:
Q  2 ataccaactctgaaggctcatggtgatgaagaaagtaacttttaatttgnnnnnnnnnnn---ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatag 98  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||               ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28837587 ataccaactctgaaggctgatgatgatgaagaaagtaacttttaattttttttatttttttttataaaaataactgatattcattcattcaaattgatag 28837488  T
Q  99 agtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaag 192  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28837487 agtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaataaactcacatcatccatattaat-gcataaaacgacaaag 28837389  T
Q  193 taactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  28837388 taactatgcctacaaatatgactatattcaagtctccgagatattcatttctccggatctgcaacgttgacgacacgaaagtcattgtcattgttcggat 28837289  T
Q  293 atgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
     | |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28837288 cttcacttgctcaaagctaatctttcaacgtgaattaaataaacaccgcactaagac 28837232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 7083475 - 7083777
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  7083475 aaaaataaacgatattcattcactcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaact 7083574  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7083575 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctataaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccagatctgcaac 7083674  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaa----ataaacaccgcactaagacggga 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  7083675 gttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaatatataaacaccgcactaggacggga 7083774  T
Q  354 aat 356  Q
    |||    
T  7083775 aat 7083777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 64 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42198020 - 42197714
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  42198020 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatggatctgtgaacaaact 42197921  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197920 cacaacatccatgtcaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgactaatacgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 42197821  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197820 atttgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcatcgatcggatctgcacttgctcaaagataatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 42197721  T
Q  349 cgggaaa 355  Q
    |||||||    
T  42197720 cgggaaa 42197714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 91 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22757524 - 22757254
Alignment:
Q  91 attgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  22757524 attgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaa-aaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaa 22757426  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcatt 284  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757425 cggctaagtacctatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatttgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcatt 22757326  T
Q  285 gatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22757325 gatcggatctgcatttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacaggaaat 22757254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 477675 - 477973
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  477675 aaaaataaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacattgatacagtacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaacgatgaatctgtgaacaaact 477774  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  477775 cacaacatccatgttaatagcataaaacgtcaaagtacctacgcctacaaatatgactatattcatttcttcggaatactcatgtctccggatctgcaat 477874  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  477875 gttgtagacgccaaagtcattgtcattgattggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 477973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 626211 - 626511
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  626211 ataaaaataaatgaaattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaag 626310  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  626311 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacccatgcctacaaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtcttcagatctgca 626410  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  626411 atgtcgacgacaccaaagtcattgtcattggtcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagtacgggaaa 626510  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  626511 t 626511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51152583 - 51152284
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||  |||||| || |||||||| |||    
T  51152583 ataaaaataaacgatattcat-cattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacttaaaggaagactttgtgaacaaa 51152485  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51152484 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatttgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatatctccggatctgca 51152385  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51152384 acgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaaaacgggaaa 51152285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 66 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31522411 - 31522106
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaa------attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31522411 aaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaagtccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactca 31522312  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggat 250  Q
    || ||||| | ||||||| ||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31522311 caacatccttgttaatagcataaaacggaaaagtacttatgcctgcaaatatgactaatatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtctccggat 31522212  T
Q  251 ctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31522211 ctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacg 31522112  T
Q  351 ggaaat 356  Q
     |||||    
T  31522111 agaaat 31522106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 43244035 - 43244342
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  43244035 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaact 43244134  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||   ||||||||||||||         |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43244135 cacaacatccatgttaatagcataaaccggcaaagtgcttatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaatactcatgtctccgg 43244234  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43244235 atctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatgaaataaacaccgcactaaga 43244334  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  43244335 cgggaaat 43244342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 393928 - 394235
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  393928 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaact 394027  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  394028 cacaacatccatgttaatagcataaaacgggaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 394127  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  394128 ttctgcaacgttgacgacgctaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 394227  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  394228 cgggaaat 394235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 26742126 - 26742424
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||      ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  26742126 aaaaatatacgatattcattcattcaaattgatatagtgcatcgatgcaatacaaatccaaattcgctataaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaact 26742225  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  26742226 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaaatatatatgcctacaaatatgactatattcatgtctccaaaatacccatgtgtccagatctgcaac 26742325  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742326 gttgacgactccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 26742424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6882411 - 6882116
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6882411 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctctgaacaaact 6882312  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||||   |||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  6882311 cacaacatccata---atagcataaaacggcaaagtatttatgtctacaaatatgactatattcaagtctctgttatactcatgtctccggatctgcaac 6882215  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6882214 gttgacgacgacaaagttattgtcattgatcggatctgcacttgctcatagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacggaaaat 6882116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26674809 - 26674532
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  26674809 attcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatctcaattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 26674710  T
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26674709 ataaaacagaaaagtacctatgcctacaaatatgactgtatttatgtctccgaaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 26674610  T
Q  279 gtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  26674609 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataagcacgacactaagacgggaaat 26674532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6912147 - 6911840
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6912147 aaaaataaacgttattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 6912048  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||         |||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  6912047 cacatcatccatgttaatagcataaaacagcaaggtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctctggaatcctcatgtctccgg 6911948  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6911947 atctacaacattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaaga 6911848  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    | ||||||    
T  6911847 caggaaat 6911840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13966010 - 13965720
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  13966010 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattccctaaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaact 13965911  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||| ||||    
T  13965910 cacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtccctatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctacaac 13965819  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965818 gttgacgacgccaaagttattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 13965720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 45350724 - 45351031
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  45350724 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaact 45350823  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45350824 cacaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgg 45350923  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45350924 atctgtaacattgacgacgccaaagtcattgtcattaatcagatctgcacttgatcaaagctaatctttcaacttgagtcaaataaacaccacactaaga 45351023  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  45351024 tgggaaat 45351031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 45360203 - 45360510
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  45360203 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaact 45360302  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45360303 cacaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgg 45360402  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45360403 atctgtaacattgacgacgccaaagtcattgtcattaatcagatctgcacttgatcaaagctaatctttcaacttgagtcaaataaacaccacactaaga 45360502  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  45360503 tgggaaat 45360510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 20887411 - 20887717
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  20887411 aaaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaact 20887510  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatg---------actatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20887511 cacaacatccatgttaatatcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactagtatgactatattcatgtctctggaatactcatgtttccgg 20887610  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20887611 atctgcaacgttgacgatgtcaaagtcattgtcattgatcggatttgcatttgctcaaagctaatctttcaatctgaatc-aataaacatcgcactaaga 20887709  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  20887710 cgggaaat 20887717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25658628 - 25658327
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |    
T  25658628 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgacaaaatacattgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaataatgaatttgtgaacaaactcacaac 25658529  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatga---------ctatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgc 254  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||         ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| |||    
T  25658528 atccatgttgatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgattaatatgactatatttatgtatctggaatactcatgtatccggatgtgc 25658429  T
Q  255 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25658428 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcgttgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacataaatcaaataaacatcgcactaagacggcaa 25658329  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  25658328 at 25658327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 356
Target Start/End: Original strand, 20399569 - 20399864
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      || |||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  20399569 attcattcattcaaattgatagactacatcgatacaatacaaattcaaattcgccaaaagcaaaaaaggatgaatccgtgaacaaactcacaacatccat 20399668  T
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
      |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20399669 ggtaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctctggaatactcgtgtctccagatctgcaacgtt 20399768  T
Q  261 gacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20399769 gacgacgacaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaaactgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 20399864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 354
Target Start/End: Original strand, 11209967 - 11210272
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||      || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  11209967 aaaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatgcaaatccaaattcactaaaaacataaaggatgaatctgtgaacaaact 11210066  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11210067 cacaacatccatgataatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgaccatatttatgtctccggaatactcatgtctccgg 11210166  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11210167 atctgcaacgttgatgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctccactcaatcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 11210266  T
Q  349 cgggaa 354  Q
    ||||||    
T  11210267 cgggaa 11210272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30202505 - 30202198
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  30202505 aaaagtaaacgatattcattcaatcaaattgatagagtacatctatacaatacaaatctaaattcgctagaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaaact 30202406  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatga---------ctatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||         ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  30202405 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagcatctatgcctacaaatatgagtaatatgactatattcaagtctccagaataatcatgtctccgg 30202306  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  30202305 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttcctcaaagctaatttttcaacttgaatcaaataaccactgcactaaaa 30202206  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  30202205 cgggaaat 30202198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 356
Target Start/End: Original strand, 32616526 - 32616820
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  | |||||||     
T  32616526 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactcttaacatccatg 32616625  T
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     |||||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32616626 ctaatagcataaaacggcaaagtgcatatgcctacaaatatgattaatatgactatattcatgtcttcggaataatcatgactccggatctgcaacgttg 32616725  T
Q  262 acgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32616726 acgatgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 32616820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 8517113 - 8517417
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8517113 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaact 8517212  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
     |||  |||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||| || |||||         |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  8517213 aacaatatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacctatgcttataaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaatacttatgtctccag 8517312  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8517313 atctgcaatgttgacgacacaaaagtcattgtcat---tcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctaaatcaaataaacaccacactaaga 8517409  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  8517410 cgggaaat 8517417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8712975 - 8712692
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8712975 aaaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcactaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaaac 8712876  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| ||||||||| ||||||||||    
T  8712875 tcacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctctggatctgcaa 8712784  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    ||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8712783 cgttgacgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaa 8712692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39838060 - 39837755
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39838060 aaaataaacgatattcattcattcaaattgttagagtatatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 39837961  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta-------tat-tcatgtctccggaatactcatgtctccggat 250  Q
    ||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||       ||| |  | ||||| |||||||||||||||| |||    
T  39837960 acaacatccatggtaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattttttctccagaatactcatgtctccagat 39837861  T
Q  251 ctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39837860 ctgcaacgttgacgttgccaaaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagcaaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 39837761  T
Q  351 ggaaat 356  Q
    ||||||    
T  39837760 ggaaat 39837755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19745857 - 19745549
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaag--gatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  19745857 aaaaataaacgatattcaatcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaaatgatgaatttgtga-taaa 19745759  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||         |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19745758 ctcacatcatccatgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaactatgactaagatgactatatttatttctccggaatactcatgtctcc 19745659  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19745658 cgatctgcaacattgacgacgctaaagtcattgtcattaatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaacaaacacctcactaa 19745559  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    ||||||||||    
T  19745558 gacgggaaat 19745549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 19793949 - 19794257
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaag--gatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  19793949 aaaaataaacgatattcaatcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaaatgatgaatttgtga-taaa 19794047  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatga---------ctatattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||         ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19794048 ctcacatcatccatgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaactatgactaagatgactatatttatttctccggaatactcatgtctcc 19794147  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19794148 cgatctgcaacattgacgacgctaaagtcattgtcattaatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaacaaacacctcactaa 19794247  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    ||||||||||    
T  19794248 gacgggaaat 19794257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Original strand, 24611462 - 24611760
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  24611462 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatcc 24611561  T
Q  168 atattaata--gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    || ||||||  ||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||         |||||| |||||||||||||| |||||| | ||| |||||    
T  24611562 atgttaatatagtataaaacggaaaagtatatatgcttacaaatatgactaatatgattatattcaagtctccggaatacttatgtcttcagatttgcaa 24611661  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24611662 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaat-aacaccgcactaagacgagaaat 24611760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Original strand, 44756693 - 44756995
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  44756693 aaaaataaacgatattcattcatccaaattgatagagtacatcggtacaatagaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaatt 44756792  T
Q  158 cacatcatccatattaatagta---taaaacgacaaagtaactatgcctacaa---------atatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctc 245  Q
    |||| ||||||| |||||| ||   ||||||| |||||||  |||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  44756793 cacagcatccatgttaataataatataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatatgacaaatatgactatattcaagtctccggaatactcaagtctc 44756892  T
Q  246 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 345  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44756893 cgaatctgcaacgttgaagacgccaaagtcactgtcattaatcggatctgcacttgctcaatgctgatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 44756992  T
Q  346 aga 348  Q
    |||    
T  44756993 aga 44756995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Original strand, 24568379 - 24568674
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |    
T  24568379 gatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacattc 24568478  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcct--------acaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || ||||||| |||||| | ||||  | |||||||         || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24568479 atgttaatagcataaaatggcaaaacacctatgccacaaatataactaatatgattatattcatgtctccgaaatactcatgtctc-ggatctgcaacgt 24568577  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24568578 tgacgaggccaatgtcattgtcattgatcggatctgcactttctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccccactaagacggaaaat 24568674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5814798 - 5814512
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  5814798 aaaaataaaagacattcattcattcagactgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattagctaaaagaaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 5814699  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5814698 cacaacatccatgttaatagcataaaatggaaaagtatttatgcctacaaatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtctctggatctgcaac 5814599  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    ||||| ||||||||||||      |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5814598 gttgatgacgccaaagtc------attgatcgaatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacg 5814512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50801669 - 50801378
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||      |||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  50801669 aaaagtaaacgatattcatttattcaaattgatagagtgcatcaataaaatacaaatccaaattcgctaaaaataaaaaggctgaatctgtgaacaaact 50801570  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||||    
T  50801569 cacaacatccatgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta-atatatgact-----atattcatgtctccggatctgcaac 50801476  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50801475 gttgacgatgtcaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaaattaatctttcaacctgaatcaaataaacacagcactaagacgggaaa 50801378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Original strand, 7860878 - 7861167
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| || ||    
T  7860878 tcattctttcaaattgatagaatacatcgatacagtacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaagaatgaatctgtaaataaactcacaacatctatgtt 7860977  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcca-- 270  Q
    ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |      
T  7860978 aatagcataaaacggcaaaatatctatgcctacaaatatgac--tattcaagtctctggaacactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacactaaa 7861075  T
Q  271 ------aagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7861076 gtcattaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgcttaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 7861167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 337
Target Start/End: Original strand, 6082111 - 6082366
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  6082111 atatttatttattcaaattgatagagtacatcgataca-tccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 6082209  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      
T  6082210 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgatgccaaa-- 6082307  T
Q  275 cattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
         ||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6082308 ----atcattgaccgaatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaaca 6082366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27395272 - 27394994
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||      |||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| || |||    
T  27395272 atattcattcattcaaattgatagagttcatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatggtgaatatttgaacaaactcacaacagcca 27395173  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | ||||||| |||| | ||| |  ||   ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||    
T  27395172 tgttaatagcataatatgacta--tattcatgtcta---atatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccatgtctgctacattgacgacgc 27395078  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395077 caaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgcttaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 27394994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 63 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39523875 - 39523569
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||| ||   |||| ||| |||||  ||||    
T  39523875 taaaaataaacgatattcattcaatcatattgatagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaataa---ggataaatctgtgagcaaac 39523779  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccg 247  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||         |||| |||||| || ||| ||||||| | ||    
T  39523778 tcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaattacatatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtcttcgaaatgctcatgttttcg 39523679  T
Q  248 gatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgct-taaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39523678 gatctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 39523579  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    |||| |||||    
T  39523578 gacgagaaat 39523569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 56236485 - 56236783
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |    
T  56236485 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacatatccaaaatcgctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaaatt 56236584  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga------atactcatgtctccggatc 251  Q
     |||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||    
T  56236585 tacattatccatgttaatagcataaaacggcaatgtatctatgcctacaaatatgattatattcaagtcaccggaatactcatactcatgtctccggatc 56236684  T
Q  252 tgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    |||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  56236685 tgcaacgttgacgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcgcttgctcaaagttaatctttcaacttgaatcaaataaataccgtattaagacgg 56236778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 53648063 - 53647792
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata-------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||    
T  53648063 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaattacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcataacatcc 53647964  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||                 |||||||| |||| |||||    
T  53647963 atgttaatagcattaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactatatccatgtctccgg-----------------atctgcaatgttggcgacg 53647881  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53647880 ccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaat 53647792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43157213 - 43157008
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  43157213 gatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgtta 43157114  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43157113 atagcataaaacgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctatggaatactcatgtgtccggatctgcaacgttgaggactccaaag 43157014  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  43157013 tcattg 43157008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24100600 - 24100306
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| | |||           
T  24100600 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaatttcgctaaaaacaaaaatgatgaatctatgat------ 24100507  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
     ||| ||||||  ||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||         |||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24100506 -acaacatccacgttaatagcataaaacggcgaagtacttatgcctacagatatgagtaatatgactatatttatgtctcgggattacccatgtctccgg 24100408  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24100407 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccacactaaga 24100308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14346877 - 14346662
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  14346877 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaagaggatgaatccgtgaacaaactcacagc 14346778  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14346777 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctctagaatacacatggctccggatctgcaacgttgac 14346678  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  14346677 gactccaaagtcattg 14346662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 29473996 - 29474211
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  29473996 aaaaataaaagatattcattcattcaaattggtagagtacatcaatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaac 29474095  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | | ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29474096 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagactacacatatgactatatttaagcctccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgac 29474195  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29474196 gactccaaagtcattg 29474211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Original strand, 55600200 - 55600490
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  55600200 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaatctaaaatcactaaaaacaaaaaggataaatttgtgatcaaatt 55600299  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga------atactcatgtctccggatc 251  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||      |||||||||||||||||||    
T  55600300 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatttatgcctacaaatatgattatattcaagttaccggaatactcatactcatgtctccggatc 55600399  T
Q  252 tgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||| |||       |||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  55600400 tgcaacgttgacgacgctaaa------atcattgattggatctgcgcttgctcaaagctaatctttcaagcggaatcaaataaacaccgtactaaga 55600490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 80 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23926471 - 23926272
Alignment:
Q  80 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagta 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |    
T  23926471 cattcgttcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagca 23926372  T
Q  180 taaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23926371 tcaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagtcatgtctctggatctgcaacgttgatgatgccaaagtcattg 23926272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38435044 - 38434830
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  38435044 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgaaaatttgccaaaaataaaaaggatgaatctgtaaacaaactcacatc 38434945  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38434944 atccatgttaatagcataaaatgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtc-ccggatctgcaacgttgac 38434846  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  38434845 gactccaaagtcattg 38434830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 29589040 - 29589244
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  29589040 atattcattcattcaaattgatggagtacattgatgcaatgaaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaattcacatcatccatgttaa 29589139  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| ||||||||||||||||   | || |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29589140 tagcataaaacgacaaagtactaaagcatacacatatgactatatttaagtctccagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgaagactccaaagt 29589239  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  29589240 cattg 29589244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 46728588 - 46728803
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  46728588 aaaaataaatgatattaattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagc 46728687  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  46728688 atccatgttaataatataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctctggaatacccatgtctccgaatttgcaacgttgac 46728787  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    |||  |||||||||||    
T  46728788 gacttcaaagtcattg 46728803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4634728 - 4634514
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  4634728 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacatgctcacatca 4634629  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  4634628 tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatatccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 4634529  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    || ||||||||||||    
T  4634528 acaccaaagtcattg 4634514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9662298 - 9662084
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  9662298 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactcacatca 9662199  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    || ||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  9662198 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 9662099  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  9662098 acgccaaagtcattg 9662084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 50981395 - 50981597
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  50981395 attcattcattcaaattgatatagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaagtatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaata 50981494  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
      ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50981495 tcataaaacaacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctctggaataaccatgcctctggatctacaacgttgatgacgccaaagtca 50981594  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  50981595 ttg 50981597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 12716784 - 12717078
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||       ||||||| || || ||||||| || ||| |||    
T  12716784 ataaaaataaacgatattcatttattcaaattgataaattacatcgatacaatacatattcaaaggcactaaaaataagaatgatgaatctgcgaagaaa 12716883  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||  |||||||||    
T  12716884 ctcacaacatccatattaatagtataaaacaacaaagtatttatgcctacacatatgactatattaaagtctctagaatattcatgtctttggatctgca 12716983  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    |||   |||||||||||      |||||| ||| ||| |||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12716984 acggctacgacgccaaa------gtcattaatcagatctgcacttaatcaaagctaatccttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaa 12717077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24825964 - 24825809
Alignment:
Q  204 acaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatg---tctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcactt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24825964 acaaatatgactatattcaagtctctggaatactcataatttctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcactt 24825865  T
Q  301 gcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24825864 gctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaagaccgcactaagacggaaaat 24825809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27091175 - 27090890
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||  |||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  27091175 aaaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcattaaaaacaaaaaggataaatatgcgaacaaact 27091076  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
     ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |    
T  27091075 tacaacatctatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcttacaaatgtgactatgtttaagtctccagaatactcaagtctccggatctgcctc 27090976  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||| || ||| ||||       ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27090975 gttaacaacgtcaaa------atcattgatcggatctacacttgctcaaagttaatctttcaacctgaataagataaacaccgcactaagac 27090890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 33020608 - 33020810
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||  ||||||| ||||||    
T  33020608 attcattcattcaaattgatagagtacatcgaagtaatataaattccctaaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaattcacgacatccatgttaata 33020707  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33020708 gcataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaataatcatgtctccgaatctacaacgttgatgacgccaaagtca 33020807  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  33020808 ttg 33020810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41487019 - 41486806
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  41487019 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgaaataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaaca 41486920  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  41486919 tccatgttaatagcat-aaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactagatttagatctccggaataaccatgtctccagatctgcaacgtggatg 41486821  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  41486820 acgccaaagtcattg 41486806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 207 - 356
Target Start/End: Original strand, 13586052 - 13586201
Alignment:
Q  207 aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13586052 aatatgattatattcttgtctctggaatactcatgtcttctgatctgcaacgttgactacgccaaaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaa 13586151  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13586152 agctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaat 13586201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 23067527 - 23067731
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  23067527 atattcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 23067626  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| ||| |||   | ||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  23067627 tagcataaaacggcaaggtacaaaggcctacacatatgactatatttaaatatccggaatagccatgtctccgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 23067726  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  23067727 cattg 23067731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 15729659 - 15729864
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  15729659 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaatttgctaacaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacagcatccatgtta 15729758  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    ||||  | ||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  15729759 atagcgtgaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccgaaatacctatgtctccgaatctgcaacattgacgactccaaaa 15729858  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  15729859 tcattg 15729864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 46716562 - 46716777
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |  |||||| |    
T  46716562 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaggctcacaac 46716661  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||     
T  46716662 atccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatatctccggatctgcaacgtggat 46716761  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  46716762 gacgccaaagtcattg 46716777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53904024 - 53903812
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  53904024 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacagca 53903925  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||   |||| ||| |||||| ||||| || |    
T  53903924 tccatgttaatagaataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatatccggaata--aatgtttccagatctgtaacgtggatg 53903827  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  53903826 acgccaaagtcattg 53903812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Original strand, 29576789 - 29577003
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| |   || ||||||||| |    
T  29576789 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgataaagtatatcaatacaatgcaaatttgctaataacaaaaatgatgaatctacaaacaaactcacaac 29576888  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||| | || ||||||||||||| ||| |||   | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29576889 atccctctttatagtataaaacggcaaggtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccggaatattcatgtcttcggatctgcaacgttgac 29576988  T
Q  264 gacgccaaagtcatt 278  Q
    ||||||||| |||||    
T  29576989 gacgccaaaatcatt 29577003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 7242454 - 7242622
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |    
T  7242454 aaaaataaatgatattcatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaataaacttacaac 7242553  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||   | ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  7242554 atccatgttaatagtataaaacgacaaaatacaaaagcctacacatctgactatattcaagtctccgga 7242622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 279
Target Start/End: Original strand, 30469814 - 30470006
Alignment:
Q  87 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30469814 tcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcagatcatccatgttaatagcataaaacg 30469913  T
Q  187 acaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
      ||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30469914 gaaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 30470006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 14542181 - 14542395
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||    
T  14542181 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcatatca 14542280  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||||||||| || || |    
T  14542281 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacatatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaaagtggatg 14542380  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||  |||||||||||    
T  14542381 acaacaaagtcattg 14542395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 54420409 - 54420623
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  54420409 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatgcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaaca 54420508  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||||||   |||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  54420509 tccatgttaatagcataaaacatcaaagtacaaatgcttacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtttccggatctgcaacgtggatg 54420608  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||    
T  54420609 acgtcaaagtcattg 54420623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46268132 - 46267897
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  46268132 aaaaataaacgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatacaaattcgtcaaaaacaacaaggatgaatatgt-aacaaact 46268034  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac---------tatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||         |||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46268033 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttgtgcctacaaatatgactaatgtgaatatagtcatgtctccagaatactcatgtttccgg 46267934  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattg 285  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46267933 atctacaatgttaacgacgccaaagtcattgtcattg 46267897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16992306 - 16992103
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  16992306 atatttattcatt-aaattgatagagtacatcgatacaatgaaaactcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaacctcacaacatccatgttaa 16992208  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||  |||||||   | ||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||    
T  16992207 tagcataaaacagcaaagtattaaagcctacacatatgacaatatttaagtctctggaatacccatgtctccggatctgcaatgtttacgacttcaaagt 16992108  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  16992107 cattg 16992103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42972485 - 42972269
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattca-ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||     
T  42972485 aaaaataaatgatattcaattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaagaggctcacaa 42972386  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
     |||||| ||||||| | |||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  42972385 tatccatgttaatagcacaaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctttggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtgga 42972286  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
     |||| |||||||||||    
T  42972285 tgacgtcaaagtcattg 42972269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 4959242 - 4959457
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |    
T  4959242 aaaaataaatgatattcattcattcatattgataaagtacatcgttacaatgcaaatttgttaaaaacaaaaagaatgaacatgcgaacaaactcacaac 4959341  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    ||| || ||||||| |||||||  |||||||   | | |||||   ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4959342 atcaatgttaatagcataaaactgcaaagtacaaaagtctacacccatgactatattcaagtctacggaatacccatgtctccggatctgcaacgctgac 4959441  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  4959442 gacgccaaagtcattg 4959457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 51646538 - 51646327
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  51646538 aaaaataagtgatattcattcattcaaattgataga-----tcgatgcaatgaaaattcgccaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagc 51646444  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggat---ctgcaacgtt 260  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||   ||||||||||    
T  51646443 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtattaaagcctacacatatgactatatttaagtctctggaatacccatgtcttcggatctgctgcaacgtt 51646344  T
Q  261 gacgacgccaaagtcat 277  Q
    |||||  ||||||||||    
T  51646343 gacgattccaaagtcat 51646327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2945584 - 2945368
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  2945584 aaaaataaatgatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacgatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacagc 2945485  T
Q  164 atccatattaatagtataaaac-gacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    |||||| ||||||  | ||||| | ||| |||   | ||||  | || | |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| |    
T  2945484 atccatgttaataacaaaaaacgggcaaggtacaaaagcctgaacatgttactatattcaagtctccgaaatacctatgtctccggatctgcaatgttaa 2945385  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||||    
T  2945384 cgacgccaaagtcattg 2945368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 37869097 - 37869300
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  37869097 atattcatttattcaaattgatagagtacatctatataatgcaaattcattaaaaacaaaa-ggatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 37869195  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||  ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  37869196 taacataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccgggataaccatgtcttcggatctgcaacgtggatgacgccaaagt 37869295  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  37869296 cattg 37869300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5388946 - 5388746
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  5388946 attcattcatttaaattgatagagtacatcgctacaatacaaattcgttaaaaatataaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgctaata 5388847  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | ||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||   |  |||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  5388846 gcataaaacggaaaagtacataagcctacaaatatgactata--aaaatctctgttatagtcatgtctccggatctacaacgttgatgacgtcaaagtca 5388749  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  5388748 ttg 5388746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 208
Target Start/End: Original strand, 18502496 - 18502646
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18502496 aaaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 18502595  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaa 208  Q
    ||||  |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18502596 cacagaatccatgttaatagcataaaacggcaaaataactatgcctacaaa 18502646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 44374943 - 44375158
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||  || |||||| |  |||||| |    
T  44374943 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaatgatagatctgtgaacaggctcacaac 44375042  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||| |||   ||||||||| |||||||||||||    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |     
T  44375043 atccattttaatagcataaaatggcaaggtagaaatgcctacacatatgactatattttaatctccgggataaccatgtctccggatctgcaacgtgtat 44375142  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  44375143 gacgccaaagtcattg 44375158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Original strand, 29266558 - 29266762
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||| |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  29266558 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctagaaacaaaa-ggatgaaactgtgaacaaact 29266656  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||        ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29266657 cacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagcatctatgc-tacaaatat--------tcaagtctccagaatactcatgtctccggatctgcaac 29266747  T
Q  258 gttgacgacgccaaa 272  Q
    |||||||||||||||    
T  29266748 gttgacgacgccaaa 29266762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29923117 - 29922995
Alignment:
Q  234 tactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaata 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  29923117 tactcatgtttccggatctgcaacattgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcatagctaatctttcaacctgaatcaaata 29923018  T
Q  334 aacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||| |||||||||| ||||    
T  29923017 aacaccgtactaagacggaaaat 29922995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20961883 - 20961679
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |  |||||| ||||||| |||     
T  20961883 atattcatttattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctataagcaaaaaggatgaatctatgaacaggctcacaacatccatgttat 20961784  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  20961783 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgaatatatttaaatctccggaataatcatgtttccgtatctgcaacgtggatgacgtcaaagt 20961684  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  20961683 cattg 20961679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 232 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43278218 - 43278094
Alignment:
Q  232 aatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaa 331  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  43278218 aatactcgtgtctctggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcgttgtcatggatcggatatacacttgctcaaagttaatcttccaacctgaatcaaa 43278119  T
Q  332 taaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  43278118 taaacaccgcactaagacggaaaat 43278094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2448094 - 2447963
Alignment:
Q  222 atgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaac 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2448094 atgtctccggaatactcatgtctctagatctgcaatgttgacgacgccaaagtcattctcattgattgaatctgcacttgctcaaagttaatctttcaac 2447995  T
Q  322 ctgaatcaaataaacaccgcactaagacggga 353  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2447994 ataaatcaaataaacaccgcactaagacggga 2447963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Original strand, 30416295 - 30416426
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaac-aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30416295 aaaaataaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacat 30416394  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30416395 catccatgttaatagcataaaacggcaaagta 30416426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31932705 - 31932434
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      | ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| | ||||    
T  31932705 cgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgacacaatacaaattcaaaatcgttaaaaacaaaaagtatgaatatgcgaacaaactcataacatc 31932606  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||| ||||||| ||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| |||||||| | || |  ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  31932605 catgttaatagcataaaacaatagagtacatatgcctacaaatatgattatattcaagccttcaaaatactcatgtttccggttctgtaacgttgatgac 31932506  T
Q  267 gccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcact 344  Q
     | ||| ||||||  |||||    || | |||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31932505 acaaaattcattg--attga----atctacacttgatcaaaactaatctttttacatgaatcaaataaacaccgcact 31932434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 279
Target Start/End: Original strand, 34115377 - 34115539
Alignment:
Q  117 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  34115377 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaataggctcagaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 34115476  T
Q  217 tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34115477 tatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgttgatgacgccaaaatcattg 34115539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3159418 - 3159154
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||  |||||    
T  3159418 atattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcactaaaaacaaaaaggatgaatctgcaaacaatctcacaatatcca 3159319  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | ||||||| || ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||                 ||||||||||||| |||||    
T  3159318 tgttaatagcatgaaacagcaaagtacttatgcctacaaatatgactatgttcaagtctccgga-----------------tctgcaacgttgatgacgc 3159236  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     ||| ||||||      |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3159235 taaaatcattg------atcggatatgcacttgctcaaagctaacctttcaacctgattcaaataaacatcgcactaagacgggaaat 3159154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Original strand, 23002612 - 23002756
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  23002612 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgct-aaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 23002710  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    ||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  23002711 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 23002756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 46775537 - 46775740
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| |||| || ||||    
T  46775537 atattcattcattcaaattgataaggaatatcgataaaatgcaaattcgctcaaaacaaaaaggctgaatatgcaaacaaactcacaacatctatgttaa 46775636  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||||||||| |   | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  46775637 tagcataaaacgacaaagcacaaaagcctacacatatgattatattcaagtctccggaatact-atgtatccgtatctgcaacgttgatgacgtcaaatt 46775735  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  46775736 cattg 46775740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6408891 - 6408692
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  6408891 aaaaataaatgatattcattcatttaaattgacaaagtacattgatataataaaaatttgataaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaac 6408792  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||  ||||||| | | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||    
T  6408791 atccattttaatagcataaaacagcaaagtaccaaagcctacacagatgactatatttaagtctccggaatacccatgtttccagacctgaaacgttgac 6408692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 9474207 - 9474422
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaac-aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |  |||||| |    
T  9474207 aaaataaaagatattttttcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgagtatgtgaacaggctcacaac 9474306  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||  ||||||| |||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||  |||||||| |||||||||| || ||     
T  9474307 atccacgttaatagcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatatccggaataaccatgtctcaggatctgcaatgtggat 9474406  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||||||||||    
T  9474407 gacgtcaaagtcattg 9474422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 279
Target Start/End: Original strand, 35658251 - 35658414
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  || |  |||||||||||||    
T  35658251 caaattcgctaaaaataaaaatgatgaatttatgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacaacaaagtacataagtttacaaatatgact 35658350  T
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| |  |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35658351 atattaaaatctctggaatagacatgcctccggatctgcaacgttgatgacgtcaaagtcattg 35658414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 279
Target Start/End: Original strand, 52555460 - 52555623
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| |||   ||||||||| ||||||||    
T  52555460 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgttaatagcataaaagtacaaggtacaaatgcctacacatatgact 52555559  T
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  52555560 atatttaaatctccggaatagtcatgtctccgaatctgcaacatggatgacgccaaagtcattg 52555623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7084409 - 7084279
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgataca--------atacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7084409 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaa 7084310  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7084309 ctcacatcatccatgttaatagcataaaacg 7084279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41837781 - 41837510
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||      | |||||||||| || |||||| |  ||| |||||    
T  41837781 aaaaataaacgataattattcattcaaattgatagagtacatcaatacactacaaattcaaagtcgttaaaaacaaagagaatgaatctccgaacaaact 41837682  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| |||| || |||||| |||||    ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  41837681 cacagcatctatgttaata-tataacta-acagagtacttatgcctacaaatgtgactatattcaagtcttcggaatactcatgtctctagatctacaac 41837584  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||    |||| |||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  41837583 gttgacgacgccaaaatcattg--attga----atatccacttgctaaaagctaacattttaacctgaatcaaataaaca 41837510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3673921 - 3673778
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  3673921 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgtaatataaatttgttaaaaataaaaaggacgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaata 3673822  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    | |||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  3673821 gcataaaacggcaaagtacacaagcctacaaatatgactatatt 3673778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 356
Target Start/End: Original strand, 43493141 - 43493248
Alignment:
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43493141 atctgcaaagttgacgactccaaagtcattgtcattgaccagatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacagcactaaga 43493240  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  43493241 tgggaaat 43493248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 244
Target Start/End: Original strand, 4622382 - 4622551
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  4622382 gatattcatttattgaaattgatagagtacattaatacaatgcaaatttgctaaaaacaacgag-atgaatttgcgaacaaactcacatcatccatgtta 4622480  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtct 244  Q
    |||| ||||||||||||||||   | ||||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  4622481 atagcataaaacgacaaagtacgaacgcctacacacatgactatattaaagtctctggaatacccatgtct 4622551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 279
Target Start/End: Original strand, 26576220 - 26576386
Alignment:
Q  113 atacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatg 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||  |||| |||  ||||||   | ||||||| |||||    
T  26576220 atacaaattcaccaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaattcacaacatccatgataataacataatacggtaaagtactaaagcctacacatatg 26576319  T
Q  213 actatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26576320 actatatttgagtctccggaatactcatgtcttcggatctgcatcgttgacgactccaaagtcattg 26576386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11817454 - 11817287
Alignment:
Q  111 caatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata 210  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| |||||  |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||  || ||||||| |||    
T  11817454 caatacaaattcactaaaagcgaaaag-atgaacatgtgaacaaactcacaacatctattttaatagaataaaacggcaaagtacataagcctacatata 11817356  T
Q  211 tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11817355 tgactatattaaaatctccggaatagtcatgcttccggatctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattg 11817287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 56062430 - 56062149
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||| ||| ||||||    
T  56062430 atattcattcattaaaattgatatagtacattcatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaaggattaatatacgaacaaacttacaacatcca 56062331  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    ||||||||| || |||| |||  ||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||     
T  56062330 tattaatagcatgaaacaacatggtacctatgactacaaatatgattatatttaagtctatggaatactcatggctccaagtctgcaacgttgacgacgt 56062231  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||  |||||  |||||    || || ||||||| |||  |||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  56062230 caaatacattg--attga----atctgtacttgctcaaagataatatgtcaacttgaatcaaataaacattgcactaagacgagaaat 56062149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31311916 - 31311700
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||| || ||| ||||| |||    
T  31311916 ataaaaataaatgatattcattcattaaaattgatatagtatat-gatacaatgtaaattcattaaaaacaaagatgatgaatatgcgaacaaact-aca 31311819  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatat--tcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||| | ||||||||||  ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  31311818 acatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacacatgactatatattcaagtctccgaaatacatatgtctccggatctgcaacgt 31311719  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcatt 278  Q
     || |||| ||||||||||    
T  31311718 ggatgacgacaaagtcatt 31311700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 38169836 - 38170043
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa-tacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||| ||| ||| || ||| ||| ||| | ||||||| ||    
T  38169836 gatattaattcattcaaattgatatagcacatcgatccaaatgcaaatttgctaaaaataaaaaagataaatctgcgaacaaattcataccatccatgtt 38169935  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaagta-actatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaa 271  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |  | |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  38169936 aatagcataaaataacaaagtagaaaaagcctacacgtatgactatattcaagtctccggaatactcatgcatcaggatttgcaacgttgatgacgccaa 38170035  T
Q  272 agtcattg 279  Q
    ||||||||    
T  38170036 agtcattg 38170043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40861363 - 40861216
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  40861363 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgttaaaaacgaaaaggatgaatctatgaacaaactcgcatcatccatgttaatagcataaaa 40861264  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    ||||||||||   | || |||| || |||||||||| | |||||||||    
T  40861263 cgacaaagtactaaagcttacacatctgactatatttaagtctccgga 40861216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 1657295 - 1657449
Alignment:
Q  125 taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatg 224  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || | || ||||||| |||||||| |||| ||   |  |||||| ||||||||||||| | |    
T  1657295 taaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcaactatgttaatagcataaaacggcaaaatactgaatcctacacatatgactatatttaag 1657394  T
Q  225 tctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1657395 tctctggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcattg 1657449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15182901 - 15182712
Alignment:
Q  88 caaattgatagagtacatcgatacaata-----caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataa 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||     |||| |||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||     
T  15182901 caaattgatagagtacatcaatataatataattcaaagtcgctaaaaataaaatggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctatattaatagcatac 15182802  T
Q  183 aacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| |||||    
T  15182801 aacgacatagtacatatgcctacaaatgtgaatatattcaagtctctggaatactcatgtttttgaatctgcaacgttaacgacaccaaa 15182712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24789632 - 24789349
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat--------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||  |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||     
T  24789632 atattcgttcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaaaattcaaaatcattaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactgccaacatt 24789533  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||   |  |  |||||| | || ||||||||||||||||||||||     
T  24789532 catgttaatagaataaaacgacaaaatacatatgcctacgaatatgattatattcaaaccaacaaaatacttaagtttccggatctgcaacgttgacgaa 24789433  T
Q  267 gccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |  ||||||||||   ||||    || |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24789432 gtaaaagtcattgg--ttga----atctgcatttgatcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacgagaaat 24789349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Original strand, 24818627 - 24818910
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat--------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||  |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||     
T  24818627 atattcgttcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaaaattcaaaatcattaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactgccaacatt 24818726  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||   |  |  |||||| | || ||||||||||||||||||||||     
T  24818727 catgttaatagaataaaacgacaaaatacatatgcctacgaatatgattatattcaaaccaacaaaatacttaagtttccggatctgcaacgttgacgaa 24818826  T
Q  267 gccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |  ||||||||||   ||||    || |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24818827 gtaaaagtcattgg--ttga----atctgcatttgatcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacgagaaat 24818910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34668632 - 34668506
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  34668632 aaaaataaatgatatttattcatttaaattgataaagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacagc 34668533  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34668532 atccatgttaatag-ataaaacggcaaa 34668506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47466323 - 47466208
Alignment:
Q  104 atcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcct 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||  |||    
T  47466323 atcgatgcaatacaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacataaacct 47466224  T
Q  204 acaaatatgactatat 219  Q
    ||||||||||||||||    
T  47466223 acaaatatgactatat 47466208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 356
Target Start/End: Original strand, 22049168 - 22049365
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||   ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||  | || ||||||||||||||| | |||||    
T  22049168 aaactcacaacatccatgttaataacataaaacagaaaagtatttatgcctacaaatacaactatattcaattatctggaatactcatgtcttctgatct 22049267  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    | ||||||| |||| |||||      |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22049268 gtaacgttggcgactccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgcttaaagttaatcttcaatcctaaataaaataaacaccgcactaagacgtg 22049361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32189372 - 32189210
Alignment:
Q  117 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||   ||||||||| |||||| ||    
T  32189372 aaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaatatcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgatta 32189273  T
Q  217 tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |  |||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32189272 tatttaaatctccggagtaaacacgtctccagatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 32189210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 272
Target Start/End: Original strand, 33288809 - 33289018
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  ||| |  ||||||    
T  33288809 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattaattggatacaccgatacaatacaactttgctaaaaataaaaagaatgaatttaggaacattctcaca 33288908  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||  | |||||||||||| | | |||||  ||||  | |||| ||||  |||||||| |||||| |||    
T  33288909 tcatccatgttaatagaatacaaccacaaagtaa-aaagcctacaaatattattttattcgagtctttgaaatagtcatacctccggatatgcaacattg 33289007  T
Q  262 acgacgccaaa 272  Q
    |||||| ||||    
T  33289008 acgacgtcaaa 33289018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22121898 - 22121612
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc---gctaa-------aaacaaaaaggatgaatttgtgaataa 154  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  22121898 aaaataaacgatattcaatcatttaatttgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaagctaagtcacaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataa 22121799  T
Q  155 actcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgc 254  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||| ||||||    | ||||  ||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||    ||||||||   | ||||  |    
T  22121798 agtcacaacattcatgttaatagcataaaatcgtatagtacttatgcctacaaatacaactatattcaaatctacg---aactcatgttctcagatcaac 22121702  T
Q  255 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||| |    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  22121701 aacgttgacaacgcaaaagtcattg--attaa----atatgcacttgctcaaagctaatatttcaacttgaatcaaataaacaccacattaagacg 22121612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Original strand, 6789559 - 6789674
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaaca-aaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatag 177  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6789559 tcattcaatcaaattaatagagtgcatcactacaatgcaaattcgctaaaaacataaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccatgttaatag 6789658  T
Q  178 tataaaacgacaaagt 193  Q
     ||||||| |||||||    
T  6789659 cataaaacaacaaagt 6789674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 38545821 - 38545904
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttg 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38545821 aaaaataagtgatattcattcattcaaattgatatagtacattgatacagtataaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatttg 38545904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56250617 - 56250439
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaa-ttgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||      |||| ||||||||  || |||| ||||| ||||    
T  56250617 aaaaataaacaatattcatttatttaaaattgataaagtacatcgatataatacaaattcgaaattgctaacaacaaaaataataaattagtgaacaaac 56250518  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaata 235  Q
    | |||| |||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  56250517 ttacataatccatgttaataacataaaacgacaaaatatctatgcatacaaatatgactatattcaagtctccagaata 56250439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28990748 - 28990529
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagta----catcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||     ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||    
T  28990748 aaaaataaacgatactcgttcatttagattgatagagtatatcgatcgatacaatgcaaatccgttaaaaacaaaaacgataaatctgcgaacaaactca 28990649  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   | | || || ||||||  ||||| | |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  28990648 caacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtacaaaagtctgcacatatgataatattaaagtctccagaatacacatgtcttcagatctgcaacgt 28990549  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattg 279  Q
     ||||||| |||| ||||||    
T  28990548 ggacgacgtcaaaatcattg 28990529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12520065 - 12519972
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  12520065 aaaaataaatgatattcatttattcaaatttatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaact 12519972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23964117 - 23963923
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    || | | |||||| ||| ||||||||||    
T  23964117 taaaaataaacgatattcattcattcaaattgagataatacattgatacaatataaatttgctaaaaa----aatggtaaatttgcgaacaaactcacat 23964022  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    | | ||| ||||| | ||||||||||||||||   | | |||||||||||| | |||||| ||||| ||| || |||||| ||  ||||||||||||||    
T  23964021 ctttcatgttaatcgcataaaacgacaaagtacaaaagtctacaaatatgattgtattcaagtctctggagtagtcatgtatctagatctgcaacgttg 23963923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 10680692 - 10680832
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtata 181  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| | ||| |||||| |||   ||    
T  10680692 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttccgaacaaactcataacattcatattcataaccta 10680791  T
Q  182 aaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||| |  ||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  10680792 aaatggtaaaatacataagcctacaaatatgactatattca 10680832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 10894332 - 10894472
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtata 181  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| | ||| |||||| |||   ||    
T  10894332 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttccgaacaaactcataacattcatattcataaccta 10894431  T
Q  182 aaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||| |  ||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  10894432 aaatggtaaaatacataagcctacaaatatgactatattca 10894472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 356
Target Start/End: Original strand, 40198353 - 40198506
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||||      || |||||||||| || |    
T  40198353 tatgcctacaaatatgactatattcaagttttcataatactcatatctccagatttgcaacgttgacgacctcaaa------gtgattgatcggacatac 40198446  T
Q  297 acttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40198447 atttgttcaaagataatctttcaacctgaatcaaataaacaccacactaagacgagaaat 40198506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22621825 - 22621610
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaag-gatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac 214  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||| || ||| | || |||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||     
T  22621825 caaactcgctaaagacaaaaaatgatgaatatgcgaacatacccacaacatccatattaatatcataaaacagcaaagtagc-atgcctacaaatatgat 22621727  T
Q  215 tatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatc 314  Q
    ||| |||| || ||  ||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||      ||| |||||  ||| |||||||| | ||||||||||    
T  22621726 tatgttcaagtatcttgaatacctatgtatttggatctgcaacgttgacgacgtcaaa------gtctttgattagatttgcacttgttaaaaactaatc 22621633  T
Q  315 tttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22621632 tttcaacctgaatcaaataaaca 22621610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37431623 - 37431459
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||| ||||  ||||||| ||||||  || |    
T  37431623 aaaaataaacgatattctttcttttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaaattgctaaaaataaaactgatgaatctgtgaacgaatt 37431524  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||| ||||||| ||||||   |||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37431523 cacaacatccatgttaataacgtaaaacaacaaaatacacatgcctacaaatatgactatattca 37431459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 356
Target Start/End: Original strand, 29268650 - 29268738
Alignment:
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29268650 ccaaattcattgtcattggttggatctgcacttcctcaaagtcaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 29268738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 161
Target Start/End: Original strand, 10665522 - 10665601
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  10665522 ttcattcaaattgttggagtacatcgatacaatacaacttcgctaaaagcaaaaatgatgaatttttgaacaaactcaca 10665601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 161
Target Start/End: Original strand, 10879667 - 10879746
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  10879667 ttcattcaaattgttggagtacatcgatacaatacaacttcgctaaaagcaaaaatgatgaatttttgaacaaactcaca 10879746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47923690 - 47923543
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||  |||| | ||||||| ||    
T  47923690 attcattcaaattgacgaagtatatcaatacaatacaaattcaataaaaataaaaaggatgaatctctgaacaaattcacaaaatccttgttaatagcat 47923591  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctc 228  Q
    |||| |  ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47923590 aaaatggtaaagtagataagcctacaaatatgactatattcaagtctc 47923543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18995621 - 18995455
Alignment:
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| | | | | |||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18995621 atagcataaaacgacaaagtacata-gcctacaaatatgattatattcaagccactgaaatattcatgtttctggatctgcaacgttgacgacgcaaaag 18995523  T
Q  274 tcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    ||||||  |||||    || || ||||| | |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  18995522 tcattg--attga----atctgtacttgatcaaaactaatctttcaac---aatcaaatgaacaccgcacaaagacg 18995455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Original strand, 19885645 - 19885799
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| || |||| ||||    
T  19885645 atattcatttattcaaattgatacagtatatcaatacaatttaaatttgctaaaaacaaaaagaatgaatctgcgaacaaactcacagcagccatgttaa 19885744  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctcc 229  Q
    ||  || || ||||||||||   | ||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  19885745 tatcatgaagcgacaaagtacaaaagcctactcatatgactattttcaagtctcc 19885799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Original strand, 44021260 - 44021463
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| || ||| ||| ||||    
T  44021260 atattcatttattcaaattgatatattatat-gatacaatttaaattcgctaaaaacaaaacagatgaatatgtgaacaaactcgcagcattcatgttaa 44021358  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatac--tcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    | | |||| ||| |||| | || |  | |||| || | |||||||||  |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44021359 ttgcataatacggcaaa-ttacaaaacttacacattttactatattcgagtctctagaatacattcatgtctccggatctgcaacgtggacgacgtcaaa 44021457  T
Q  273 gtcatt 278  Q
    ||||||    
T  44021458 gtcatt 44021463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9549878 - 9549690
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||        || ||||||   ||||| | |    
T  9549878 aaaaataaatgatattcattcattcaaattaatatagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaa-------tatctgtgaactgactcaaagc 9549786  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||| ||| | ||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  9549785 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgtctatacatatgactatatttaaatctccagaataatcatgtctcttgatctgcaacgt 9549690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29257529 - 29257456
Alignment:
Q  206 aaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29257529 aaatatgactatattcaagtattcggaatacacatgtctccgtatctgcaacgttgacgacaccaaagtcattg 29257456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 56172280 - 56172116
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||      ||    |||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  56172280 aaaaataaatgatattcatgtattcaaattgatagactacattgatacaatacaaatataaagtcatagaaaacaaaaaggttgaatctgcgaacaaact 56172181  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  56172180 cacaacatccatgttaataacataaaacgacaatgtacatatgcctacaaatacgattatattca 56172116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17220213 - 17220073
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtata 181  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||| | ||| ||| || |||  |||    
T  17220213 ttcattcaaattgttagagtacgtcgataccatacaaattcgttaaaaattaaaatgatgaatttccgaataaactcataacattcatgttcataacata 17220114  T
Q  182 aaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||| |  ||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  17220113 aaatggtaaaatacataagcctacaaatatgactatattca 17220073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 22066745 - 22066881
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| | ||| ||| || |||   |||||    
T  22066745 attcaaattgttagagtacgtcgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaatgataaatttgcgaacaaactcataacattcatgttcataacctaaaa 22066844  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattc 221  Q
     |  ||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  22066845 tggtaaaatacataagcctacaaatatgactatattc 22066881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3169802 - 3169751
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3169802 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaa 3169751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 144
Target Start/End: Original strand, 50002874 - 50002941
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  50002874 attcattcattcaaatagatatagtacatcgatataatgcgaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 50002941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26625516 - 26625356
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| | ||||| | ||||||| ||    
T  26625516 attcgttcaatttgataaaggacatcaatacaatgtaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaataaattcataacatccttgttaatagcat 26625417  T
Q  181 aaaacgacaaagt-aactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgt 242  Q
      ||| |||||||  | || ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26625416 -taacaacaaagtgcaata-gcctacaaacatgactatattcaagtctccagaatactcatgt 26625356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Original strand, 10715981 - 10716058
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  10715981 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaatacaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatttccgaacaaactca 10716058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Original strand, 10929751 - 10929828
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  10929751 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaatacaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatttccgaacaaactca 10929828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24826106 - 24826002
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgct-aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  24826106 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatagaatacaaatccaaattcgttaaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaac 24826007  T
Q  157 tcaca 161  Q
    | |||    
T  24826006 taaca 24826002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39797418 - 39797263
Alignment:
Q  67 aataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg--ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||   || |  | ||||| | | |||||| ||| ||||||||| ||    
T  39797418 aataaacgatattcattcatttaaattgatagagtatatgtatacaatataaattcaaactcattaaaaaaatgttaaatttgagaacaaactcacaaca 39797319  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    | ||| ||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  39797318 ttcatgttaatatcataaaacggcaaaatatctatgcctacaaatatgattatatt 39797263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 279
Target Start/End: Original strand, 47704121 - 47704229
Alignment:
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcca 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||  ||| | || |||  |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||    
T  47704121 ttaatagcataaaacgacaaagtacataaaccttcgaacatggttatattcaagtcttcggaatactcatatctctggatctgcaacgttgacaacacca 47704220  T
Q  271 aagtcattg 279  Q
    |||||||||    
T  47704221 aagtcattg 47704229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Original strand, 1645293 - 1645344
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1645293 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcactaaaaacaaaaa 1645344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31994485 - 31994274
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagt---acatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatga--atttgtgaat 152  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||  ||||||||||||      | | |||||| |||||||||  || ||  |||    
T  31994485 aaaaataaacgatattcactcattcaaattgataaagttatacatcgactcaatacaaattcaaaatcgttcaaaacagaaaggatgatcatatgctaat 31994386  T
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||| |||||  ||| || ||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||| | ||| |||    
T  31994385 aaaatcacaatatcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcgtacaaatatgattatattcaagccaccaaaatactcatgttttcggttct 31994286  T
Q  253 gcaacgttgacg 264  Q
    ||||||||||||    
T  31994285 gcaacgttgacg 31994274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10710538 - 10710461
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  10710538 ttcattcaaattgttggagtgcgtcgatacaatacaacttcgctaaaagcaaaaatgatgaatttctgaacaaactca 10710461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10924308 - 10924231
Alignment:
Q  82 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  10924308 ttcattcaaattgttggagtgcgtcgatacaatacaacttcgctaaaagcaaaaatgatgaatttctgaacaaactca 10924231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 279
Target Start/End: Original strand, 31601087 - 31601239
Alignment:
Q  127 aaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtc 226  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |   ||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||| |||   ||||||||| |||| |||||||| |  ||    
T  31601087 aaaataaaaaggatgaatatgtgaacaggttcacaacatccatgttaatagcataaagcggcaaggtacaaatgcctacacatataactatatttaaatc 31601186  T
Q  227 tccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| ||||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||    
T  31601187 tccgaaataaccatgtctctgggtctgcaacgtggatgacgtcaaagtcattg 31601239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43002321 - 43002213
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatag 177  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | | |  |||||| |||||||    
T  43002321 ttcatttattcaaaatgaaagagtaaattgatccaataaaaattcgctaaaaaaaaaaaggatggatttgtgaacaaaattaaaggatccattttaatag 43002222  T
Q  178 tataaaacg 186  Q
     ||||||||    
T  43002221 cataaaacg 43002213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 222
Target Start/End: Original strand, 26623933 - 26624031
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  26623933 ctaaaaataaaaaggatgaatcttcaaataaactcacatcattcatgttaatagcatacaatgacataatacatatgtctacaaatatgactatattca 26624031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 279
Target Start/End: Original strand, 38545914 - 38545968
Alignment:
Q  225 tctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  38545914 tctccggaatatccatgtctccggatctgcaacgttgatgacgcaaaagtcattg 38545968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Original strand, 40913429 - 40913513
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattga---tagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40913429 taaaaataaacgatatttattcattcaaattgtgagtagattacatcaatacaatataaatttgctaaaaacaaaaatgatgaat 40913513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46829801 - 46829695
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||||||| ||| ||| ||||||  |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  |    
T  46829801 caaaatcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgcaaacaaactcacaacattcatgttaataacataaaatgacatagtatatatgcctacaaatatggtt 46829702  T
Q  216 atattca 222  Q
    |||||||    
T  46829701 atattca 46829695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 56040450 - 56040565
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||  ||||||||| ||||||  |    
T  56040450 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacagcatccaagt 56040545  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  56040546 taatagcatacaacgacaaa 56040565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12519950 - 12519887
Alignment:
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  12519950 atattcaagtcttcagaatactcatgtctccggatctgcaacatggacgacgctaatgtcattg 12519887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 40198211 - 40198290
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac-aatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatga 142  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  40198211 aaaaataaatgatattctttcattcaaaatgatagagtacatcaatacaaattcaaagtcgttaaaaacaaaaatgatga 40198290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Original strand, 43489304 - 43489363
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaa 134  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  43489304 atattcgttcatttaaattgatagagtacaccgatacgatacaaatttactaaaaacaaa 43489363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45756937 - 45756855
Alignment:
Q  199 tgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccg--gatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  45756937 tgcctgcaaatatgactatattcatgtattcgaaatactgatgtctccgaatatctgcaatgttgacgataccaaagtcattg 45756855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 338
Target Start/End: Original strand, 13169276 - 13169384
Alignment:
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacct 323  Q
    ||||| |||||| |||||| || | |||||||||||||| || |||| |||| |||  |||||    || |||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  13169276 gtctctggaatattcatgtttctgaatctgcaacgttgatgatgccacagtcgttg--attga----atttgcacttgatcaaaactaatctttcaatct 13169369  T
Q  324 gaatcaaataaacac 338  Q
    |||||||||||||||    
T  13169370 gaatcaaataaacac 13169384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 106
Target Start/End: Original strand, 48257427 - 48257469
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48257427 aaaaataaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 48257469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51318243 - 51318177
Alignment:
Q  123 gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  51318243 gctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgaca 51318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1125273 - 1125172
Alignment:
Q  178 tataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    |||||||||||||||||   | || |||| ||||||||||||  | |||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||    
T  1125273 tataaaacgacaaagtattaaagcatacacatatgactatatgtaagtctacggaacattcatgtctctggatcttcaacgttgacgacttcaaaatcat 1125174  T
Q  278 tg 279  Q
    ||    
T  1125173 tg 1125172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 278
Target Start/End: Original strand, 7242614 - 7242651
Alignment:
Q  241 gtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7242614 gtctccggatctgcaacgtggacgacgccaaagtcatt 7242651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 13169114 - 13169171
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  13169114 aaaaataaacgatattcaataattcaaattgataaagtacatcaatacaatataaatt 13169171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32766817 - 32766706
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| || |||  |||    
T  32766817 atattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgcaaagggtgaatctgagaacaaactcacagcacccaagtta 32766722  T
Q  174 atagtataaaacgaca 189  Q
    |||| ||| |||||||    
T  32766721 atagcatacaacgaca 32766706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 36204184 - 36204283
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||   | ||| |||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  36204184 cgatattctttcattcaaattgacagaatacatc---agaat-caacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatccaaatt 36204279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54317827 - 54317767
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaag-gatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  54317827 caaattcgctaaaaacaaaaaatgatgaatttgtgaataaattcacaacat-catattaata 54317767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1532001 - 1531957
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1532001 atctttcaacatgaatcaaataaacaccgcacgaagacaggaaat 1531957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43095938 - 43095818
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||   ||| |||  || ||||||||  ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||| |    
T  43095938 cgatattcattcattcaaattgatagagtatatcacatcagatataaacatccctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaaa 43095839  T
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||||| ||| ||| |||||    
T  43095838 ttaatagcatacaactacaaa 43095818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 279
Target Start/End: Original strand, 46386609 - 46386657
Alignment:
Q  231 gaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46386609 gaatacttatgtatctggatctgcaacgttgacaacgccaaagtcattg 46386657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 51958783 - 51958670
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata----caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata 170  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||    |||| ||| |||||||||||| || ||||||  ||| ||| ||||| ||||||      
T  51958783 atattcatttatttaaattgataaaataaatcgatacaataaattcaaactcgttaaaaacaaaaatgaagaatttacgaacaaattcacaacatccacg 51958684  T
Q  171 ttaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||    
T  51958683 ttaatagtataaaa 51958670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 3171289 - 3171336
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  3171289 atatttattcattcaaattgatatagtacgttgatacaatacaaattc 3171336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12755232 - 12755173
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  12755232 taaaaataaatgatattcaatcattcaaattgacatagtacatagatacaataaaaattc 12755173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 262
Target Start/End: Original strand, 38166186 - 38166217
Alignment:
Q  231 gaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38166186 gaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 38166217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43853759 - 43853716
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43853759 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatcagatacaata 43853716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 56172063 - 56172012
Alignment:
Q  297 acttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  56172063 acttgattaaagataatctttcaaccttaattaaataaacaccgcactaaga 56172012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 56335890 - 56335838
Alignment:
Q  68 ataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  56335890 ataaacgatattcattcattcaaattgatagggt--atcaatacaatacaaattc 56335838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18936107 - 18936065
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18936107 aaaaataaaagatattcattcattcaaattgatagaatacatc 18936065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 106
Target Start/End: Original strand, 24098865 - 24098906
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24098865 aaaaataa-cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 24098906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36700526 - 36700496
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36700526 atattcattcattcaaattgatagagtacat 36700496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2521084 - 2520969
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| || |||  |    
T  2521084 cgatattcattcattcaaatcgatagagtccatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagt 2520989  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  2520988 taatagcatacaacggcaaa 2520969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2624590 - 2624545
Alignment:
Q  311 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2624590 aatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcaacaagacgggaaat 2624545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 4142568 - 4142601
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4142568 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 4142601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 102
Target Start/End: Original strand, 7273609 - 7273638
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273609 cgatattcattcattcaaattgatagagta 7273638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 118
Target Start/End: Original strand, 7579445 - 7579504
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattca---aattgatagagtacatcgatacaatacaa 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7579445 ataaaaataaatgatattcattcattcattcaattgataaagtacatcgatataatacaa 7579504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 106
Target Start/End: Original strand, 10258709 - 10258738
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10258709 attcattcattcaaattgatagagtacatc 10258738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10496641 - 10496612
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10496641 cgatattcattcattcaaattgatagagta 10496612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 19853316 - 19853349
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19853316 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 19853349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 21686046 - 21686079
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21686046 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 21686079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 26633475 - 26633508
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26633475 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 26633508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29965729 - 29965684
Alignment:
Q  311 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29965729 aatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaat 29965684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Original strand, 31444758 - 31444799
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  31444758 attcattcaaattgatatagtgcatcaatacaatacaaattc 31444799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37870166 - 37870085
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| |||  |||| |||| ||||||||||    
T  37870166 tatgcttaaaaacatgactatattcaagtctcctgaatattcatgtcttcgaatctacaatattgatgacgtcaaagtcatt 37870085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 42032322 - 42032355
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42032322 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 42032355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 42914836 - 42914791
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcg 107  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  42914836 ataaaaataaacgatatttattctttcaaattgatagaatacatcg 42914791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 258
Target Start/End: Original strand, 45681764 - 45681825
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45681764 tatgcctataaatatgattatattcaagtcatcagaatactcatgtccccggatctacaacg 45681825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 130
Target Start/End: Original strand, 46386470 - 46386515
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaa 130  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46386470 attcaaattggtagagtatatcgatacaatgcaaaatcgctaaaaa 46386515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 275
Target Start/End: Original strand, 50002978 - 50003055
Alignment:
Q  198 atgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtc 275  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  50002978 atgcctacaactatgactatatttaaatcttcggaataaccatgtctctgaatctgtaacgttgataacgccaaagtc 50003055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4643951 - 4643907
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4643951 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaat 4643907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9284004 - 9283960
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9284004 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 9283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12493636 - 12493604
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12493636 gatattcattcattaaaattgatagagtacatc 12493604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13634419 - 13634387
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13634419 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 13634387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25273976 - 25273932
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25273976 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 25273932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Original strand, 26090760 - 26090828
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaa 190  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  26090760 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtaaacaaattcacagcatccaaattaatagcatacaacgacaa 26090828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27652258 - 27652226
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27652258 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 27652226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 32952546 - 32952578
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32952546 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 32952578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 35964914 - 35964946
Alignment:
Q  232 aatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35964914 aatactcatgcctccggatctgcaacgttgacg 35964946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 36162026 - 36161994
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36162026 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 36161994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 36195023 - 36194991
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36195023 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 36194991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40129938 - 40129898
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaa 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40129938 aaattaatagagtatatcgatacaatacaaattcgttaaaa 40129898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 43154010 - 43154054
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43154010 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 43154054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 43510501 - 43510416
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat-tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||     ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  43510501 cgatattcattcattcaaatcgataaagtacatc----aaatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcaca 43510416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 45032729 - 45032777
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaa-ttgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45032729 atattcattcgttcaaagtttatagagtacatcgatacaatataaattc 45032777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 46990919 - 46990951
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46990919 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 46990951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47417755 - 47417711
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47417755 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 47417711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49410316 - 49410272
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  49410316 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 49410272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 50766508 - 50766552
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  50766508 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 50766552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Original strand, 53616480 - 53616544
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  53616480 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacg 53616544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 53616646 - 53616690
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  53616646 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 53616690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 172)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18344064 - 18343773
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18344064 aaaaataaacgatatttatttattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatc 18343965  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||| | ||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18343964 atccctgttaatagcataaaacggcaaggtacccatgcctacaaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccggatctgcaacgttgac 18343865  T
Q  264 gacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18343864 gacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatc-aataaacaccgcactaagacgggaaat 18343773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 15390906 - 15391213
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  15390906 aaaaataaacgatatttattcattcaacttgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgatcaaact 15391005  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15391006 cacagcatccatattaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccag 15391105  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15391106 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaagataatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 15391205  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  15391206 cgggaaat 15391213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42276822 - 42276515
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  42276822 aaaaataaacaatatgcattctttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaact 42276723  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatat---------gactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42276722 cacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatataattaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccga 42276623  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42276622 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgcttaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 42276523  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  42276522 tgggaaat 42276515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 28677793 - 28678091
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  28677793 aaaaataaacgatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaact 28677892  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  28677893 cacaacatccatgttaatagcataaaacggaaaagtacctatgcctacaaatatgactatatttatgtctctcgaatactcatgtctccatatctgcaac 28677992  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28677993 gttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaat 28678091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 13488188 - 13488497
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13488188 ataaaaataattgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaagataaatttgtgaataaa 13488287  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13488288 ctcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctctggaatcctcatgtctcc 13488387  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13488388 agacctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactaa 13488487  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    ||||||||||    
T  13488488 gacgggaaat 13488497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44517615 - 44517307
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  44517615 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgactctgtgaacaaact 44517516  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44517515 cacaacatccatgttaatagcataaaacggtgaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 44517416  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaa-gtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44517415 atctgcaacgttgacgacgccaaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 44517316  T
Q  348 acgggaaat 356  Q
    |||||||||    
T  44517315 acgggaaat 44517307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 33486690 - 33486991
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  33486690 aaaaaaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaact 33486789  T
Q  158 cacatcatccat----attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctg 253  Q
    |||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33486790 cacagcatccatgttaattaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatat-actatattcatgtatccggaatactcatgtcttcggatctg 33486888  T
Q  254 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggga 353  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33486889 caacattgacgacaccaaagccattgtcattgatcggatttgcatttgctcaaagttaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggga 33486988  T
Q  354 aat 356  Q
    |||    
T  33486989 aat 33486991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45750944 - 45750638
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45750944 aaaataaaagatattcgttcgttcaaattgatagagtacatcaatacaataaaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatttatgaacaaactc 45750845  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 249  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||         ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45750844 acagcatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatataactatatttttgtcttcggaatactcatgtctccgga 45750745  T
Q  250 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45750744 tctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctaaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 45750645  T
Q  350 gggaaat 356  Q
    |||||||    
T  45750644 gggaaat 45750638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14265736 - 14265444
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  14265736 ttcattctttcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatga-tctgtgaacaaactcacaacatccatgt 14265638  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    |||||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14265637 taatagcataaaacagcaaagtgtctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 14265538  T
Q  263 cgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14265537 caacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaaat 14265444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12872073 - 12871789
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  12872073 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccatattcgctaaaaacaaaaaggatggatttatgaacaaact 12871974  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12871973 cacagcatccatgttattagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaagtatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctctggatctgcaac 12871874  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| |||||||||      |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12871873 gttgacgatgccaaagtc------attgatcgaatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaacgcactaaga 12871789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29205735 - 29205445
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29205735 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaataaaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaataaact 29205636  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||| ||      || |||||||||||||||||||||    
T  29205635 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgacta-at--atgactg-----taatcatgtctccggatctgcaac 29205544  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29205543 gttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctgatcattcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 29205445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 81 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27535147 - 27534857
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27535147 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 27535048  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatat---------gactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacga 265  Q
    ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27535047 tagcataaaacggcaaggtacctatgcctacaaatataactaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccggatctgcaacgttgacga 27534948  T
Q  266 cgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27534947 cgctaaagtcattgttattgatcagatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcacactaagacgggaaat 27534857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32879160 - 32878868
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||    
T  32879160 aaaaataaacgataatcattcattcaaattgatttagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcgctaaaaataaaaaggataaatctgcgaacatact 32879061  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32879060 cacatcacccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactatattcaagttttcggaatactcatgtctccggatctacaac 32878961  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||      ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32878960 gttgacgacaccaaagtc------attgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagacggaaaat 32878868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32784546 - 32784239
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||| | || |||||    
T  32784546 aaaaataaactatattcattaattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaattttttaacaaact 32784447  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||| ||| ||||||  ||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32784446 cacaacattcatgttaataacatataacggcaaactacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgg 32784347  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32784346 atctgcaacgttgacgacgctaaagtcattgttattgatcgaatttgcacttgctcaaagctaatctttcagcctgaatcaaataaacaccgcactaaga 32784247  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  32784246 cggaaaat 32784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 45193303 - 45193589
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||     
T  45193303 attcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtaaacaaactcacatcatccatgttaatagc 45193402  T
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||         |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45193403 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctccaaaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 45193502  T
Q  270 aaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45193503 aaaatcattgtcattgatcggatcagcacttgctcaaagctaatctttcaacctgattcaaataaacaccgtactaagacgggaaat 45193589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3233240 - 3232948
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  3233240 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaacggattaatatgtgaacaaa 3233141  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||  ||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||    
T  3233140 ctcacaacactcatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgca 3233049  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3233048 acgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcactttctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacggaaaa 3232949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Original strand, 4882031 - 4882313
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  4882031 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaa-aaaaagaatgaatttgtgaacaaact 4882129  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||  |     ||| |||||||||||||||||||||    
T  4882130 cacagcatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacatatgcctacaaatatgacta-at--atgatt-----atattcatgtctccggatctgcaac 4882221  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4882222 gttgacgatgccaaagtcattatcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagac 4882313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 116 - 348
Target Start/End: Original strand, 4870754 - 4870986
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| | |||| ||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  4870754 caaattcgctaaaaacaaaaggaataaatctatgaacaaactcactgaatccatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctgtaaatatgact 4870853  T
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatct 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |    
T  4870854 atattcatgtctccagaatactcatgtctccggatctacaacgttgacgacgccgaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaattt 4870953  T
Q  316 ttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4870954 ttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaaga 4870986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 37822017 - 37822306
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  37822017 aaaaataaacgatattcattcactcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaaaaaact 37822116  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||  ||     ||  |||||||||||||||||||||    
T  37822117 cacagcatccatgttaatagtataaaacggcaaagtatctatacctacaaatatgacta-at--ataact-----atgttcatgtctccggatctgcaac 37822208  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37822209 gttgacgacaccaaagacattgtcattgatcggatctgcacttgc-tcaaagtaatctttcaacctgaatcaaataaatactgcactaagacgggaaat 37822306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 356
Target Start/End: Original strand, 7995245 - 7995521
Alignment:
Q  76 tattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  7995245 tattcattcatttaaattgatag--tacatcggtacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccat 7995342  T
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
     ||||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7995343 gttaatagcataaaatgataaagtacttatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctcagaatctgcaacgttgacgacgcc 7995434  T
Q  270 aaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7995435 aaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccacactaagacgggaaat 7995521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 116 - 356
Target Start/End: Original strand, 29726309 - 29726558
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata----- 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         
T  29726309 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgact 29726408  T
Q  211 ----tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
        ||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  29726409 aatatgactatcttaaagtctctggaatactcatgtcttcggttctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcag 29726508  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29726509 agctaatctttcaacctgaatcaattaaacaccgcattaagacgggaaat 29726558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 9298085 - 9298377
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||      | || |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9298085 aaaaataaatgatgtttattcatttaagttgatagagtacatcgatactatataaatttaaaatcactgaaaacaaaaaggatgaatctgcgaataaact 9298184  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  9298185 cacaacatccatgttaatagtataaaatgacaaagtacctatgcctataaatatgattatattcaagtctccgaaatactcatatctccggatctgcatc 9298284  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| ||||||      |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9298285 gttgacgatgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagatgggaaat 9298377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51418451 - 51418144
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  51418451 aaaagtaaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaagtttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaact 51418352  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| |||| |  |||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||         |||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  51418351 cacagcatccatgttaacaacataaaatggaaaagtatctatgccagcaaatatgactaatatgcctatattcaagtctccagaatacttctgtctccgg 51418252  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51418251 atctacaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttccacctgaatcaaataaacaccgcacaaaga 51418152  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  51418151 cggaaaat 51418144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 116 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47551489 - 47551255
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47551489 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagcataaaatggcaaagtatctatgcctacaaatatgact 47551390  T
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatct 315  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  47551389 atattcaagtctccagaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgacgtcaaagtc------attgattggatctgcacttgctcaaagctaatct 47551296  T
Q  316 ttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  47551295 ttcaacctaaatcaattaaacacagcactgagacgggaaat 47551255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10627472 - 10627160
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata------caatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaa 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||      ||||| ||||||      |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10627472 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgaaagagtacattcatataaatacaataaaaattcaatttcgctacaaacaaaaaggatgaatctgtgaa 10627373  T
Q  152 taaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatat---------gactatattcatgtctccggaatactcatgt 242  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||         ||||||||| | ||||||  || ||||||||    
T  10627372 caaactcacaacatccatattaatagtctaaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatcactaatatgactatattaaagtctccaaaaaactcatgt 10627273  T
Q  243 ctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 342  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10627272 ctccgaatctgcaacgttgaagacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatc-ttcaacctgaatcaaataaacaccgca 10627174  T
Q  343 ctaagacgggaaat 356  Q
    ||| ||||| ||||    
T  10627173 ctatgacggaaaat 10627160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Original strand, 33938709 - 33938974
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33938709 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatcca 33938808  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | |||||                      ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33938809 tgttaat----------------------atgactacaaatatgattatattcatgtctccgaaatactcatgtctccggatctggaacgttgacgacga 33938886  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33938887 caaagtcattgtcattgattggatctgtacttgctcaaagctaatctttcaacctaaaccaaataagcaccgcactaagacggaaaat 33938974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 278
Target Start/End: Original strand, 12147714 - 12147930
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  12147714 ataaaaatagacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatgaaaattcgctaaaaataaaagggatgaatctgtgaacaaactcaca 12147813  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12147814 tcatccatgttagtagcataaaacgacaaagtactaaagcctacacatatgactatacttaagtctccggaatacccatgtctccggatttgcaacgttg 12147913  T
Q  262 acgacgccaaagtcatt 278  Q
    ||||| |||||||||||    
T  12147914 acgactccaaagtcatt 12147930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42491336 - 42491053
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||   ||| ||||||| |||||| |||||    
T  42491336 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgataaaaa---aaatgatgaatctgtgaacaaact 42491240  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||      |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42491239 cacaacatccatgttaataacataaaacgacaaagta------cctacaaatatgactatcgtcaagtctccggaatactcatgtcttcggatctgcaac 42491146  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     ||||||||| ||| |||||||      ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42491145 attgacgacgtcaacgtcattg------atctgatctgcacttgctcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaat 42491053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26771553 - 26771337
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||     
T  26771553 taaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaaagatgaattaacgaacaaactcacaa 26771454  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26771453 caaccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccgaaatattcatgtcttcggatctgcaacgttga 26771354  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||  |||||| ||||    
T  26771353 cgacatcaaagttattg 26771337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11121422 - 11121207
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  11121422 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatgaaagttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaat 11121323  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||     
T  11121322 atccatgttaatagtataaaacgacaaagtactcaggcctacacatatgactgtatttaaatctccggaatacatatgtctccggatctgcaatgttgaa 11121223  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  11121222 gactccaaagtcattg 11121207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 13969308 - 13969523
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  13969308 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatgcaaattcgcaaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaac 13969407  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||||||   | ||||| | |||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13969408 atccatgttaataacataaaacggcaaagtacaaaagcctatacatattactatattcaagtttccagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 13969507  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||||||||||    
T  13969508 gacgtcaaagtcattg 13969523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 34659309 - 34659524
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |    
T  34659309 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaatttgctaaaaacataaaggatgaatttgcgagcaaactcacaac 34659408  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||||||||  | |||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34659409 atccatgttaatagcataaaatggcaaagtaaaaaagcctacacttatgactatattcaagtctttggaatacccatatctccggatctgcaatgttgac 34659508  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  34659509 gacgccaaagtcattg 34659524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 44513670 - 44513885
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  44513670 aaaaataaaagatattcattcatttaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaactcacaac 44513769  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  |||||||  |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44513770 atccatgttaataacataaaacagcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgac 44513869  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  44513870 gactccaaagtcattg 44513885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 46589594 - 46589379
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  46589594 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatatgtgaacaaactcacatc 46589495  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||   | | ||||| |||||| |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  46589494 atccatgttaataacataaaacgacaaagtactaaagtctacacatatgagtatatttaagtctctgaaatactcatgtgtccggatctgcaacgttgag 46589395  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  46589394 gactccaaagtcattg 46589379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 15276115 - 15276329
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||    
T  15276115 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaaca 15276214  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  15276215 tccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctctggaataatcatgtctccagatctgcaacgtggatg 15276314  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  15276315 acgccaaagtcattg 15276329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 33177277 - 33177481
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  33177277 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatgcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaa 33177376  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    | | |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  33177377 ttgcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccataatactcatgtctccggatttgcaatgttgacgacaccaaagt 33177476  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  33177477 cattg 33177481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8893738 - 8893524
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| | |    
T  8893738 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctaggaacaaactcataac 8893639  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||   | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  8893638 atccatgttaatagcataaaacaacagagtacaaaagcctacacatatgactatattca-atctccggaatacctatgtctccggatctacaacgttgac 8893540  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||||||||||    
T  8893539 gacgtcaaagtcattg 8893524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13152894 - 13152636
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacat--cgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||      ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  13152894 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatatcaatacaatataaatccaaatccgctaaaataaaaaaggatgaatttgtgaacaaa 13152795  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  13152794 ctcacatcatccatgtcaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatacgactataatcatgtctccggaatacttatgtctcttgatctgta 13152695  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaa 320  Q
    ||||||| ||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  13152694 acgttgatgacgccaaagtc------attgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaa 13152636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 44562417 - 44562632
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |    
T  44562417 aaaaataaatgatattcattcagtcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaac 44562516  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||  ||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  44562517 atccatgttaatagcataaaacggcaagatacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtagat 44562616  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  44562617 gacgccaaagtcattg 44562632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 13691448 - 13691645
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  13691448 attcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttaatagcat 13691547  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13691548 aaaacggcaaaatacataagcctacaaatatgactatattaaaatctctggaatagtcatgcctccagatctgcaacgttgatgacgtcaaagtcatt 13691645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2351056 - 2350853
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  2351056 atattcgttcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaatg-atgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 2350958  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||   ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2350957 tagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagctatgccttcggatctgcaacgttgatgacgccaaagt 2350858  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  2350857 cattg 2350853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10305030 - 10304738
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      | |||||||||||| ||||||| ||  || |||||    
T  10305030 aaaaataaaggatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaattcaaaattgataaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaact 10304931  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  10304930 cacaacatccattttaatagcataaaattgcagagtatctatgcatacaaatatgactatattcaagtcttcggaatatccatgtctccgaatctgcaac 10304831  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||    || | ||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10304830 gttgacgatgctaaagtcattg--attga----atctccactttctcaaagctaatatttcaacttgaatcaaataaacaccacactaagacgagaaat 10304738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40992727 - 40992529
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||  |||||| ||||||||||    
T  40992727 attcattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaatatccatgttaatagtat 40992628  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40992627 aaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgattatatttaaatatccggaatattcatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 40992529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 423947 - 424252
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||       |||||||| ||||||| |||| |||||  |||||    
T  423947 aaaaataa-cgatattcattcattcaaatcgataaagtatatcgatataatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaaggacgaatctgtgagcaaact 424045  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||  |||  |||||||||||||||||      
T  424046 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaattctaaggaatactcatgtctcca- 424144  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||   |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  424145 atctgcaacgttgacgacgcctaacccattgtcattgatcgaatctgcacttgtgcaaagttaatctttcaacctagatcaaataaacaccgtactaaga 424244  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  424245 cggaaaat 424252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 279
Target Start/End: Original strand, 33703177 - 33703393
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  33703177 taaaaataaacgatattcattcgtttaaattgatagagtacatcgatacaataaaaaatttctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacag 33703276  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
     |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  33703277 tatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctctggaatatccatgtctacggatctccaacgttga 33703376  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
    || | ||||||||||||    
T  33703377 cggctccaaagtcattg 33703393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 347
Target Start/End: Original strand, 15790930 - 15791227
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |    
T  15790930 aaaaataaaagatattcatttattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaagtatgaatatgtgaaaaaa-t 15791028  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||| ||  |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||         |||| |   |||| ||||| |||||| ||  |    
T  15791029 cacaacatccatgttattaacataaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgactaatatgactgtattaaacactccagaatattcatgtttctag 15791128  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791129 atctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgataagatttgcatttcttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 15791227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38647029 - 38646815
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||| ||    
T  38647029 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaggctcacaaca 38646930  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  38646929 tccatgttaatagcataaaaaggcaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatg 38646830  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  38646829 acgccaaagtcattg 38646815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 355
Target Start/End: Original strand, 25032755 - 25033048
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  25032755 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaa 25032854  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
     ||||| |||| || |||| |  ||| |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |  |||| |  |    
T  25032855 ttcacaacatcaatgttaacaacatagaacatcagagtatctatgcctacaaatatgactatattaacgtctctgaaatattcatgtatttggatttaga 25032954  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||    || |||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  25032955 acgttgatgacgccaaagtcattg--attga----atttgcacttgctcaaagttaatctcacaacctgaatcaaataaacaccacattaagatgggaaa 25033048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34567114 - 34566971
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  34567114 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaata 34567015  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    | |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  34567014 gcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatatt 34566971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23257533 - 23257319
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||| ||    
T  23257533 aaaataaatgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgttaacaggctcacaaca 23257434  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| | |||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |    
T  23257433 tccatgttaatagcacaaaacagcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatctaaatctccggaataatcatgtatccggatctgcaacgtggatg 23257334  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  23257333 acgccaaagtcattg 23257319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26200026 - 26199811
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |    
T  26200026 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgccacaatgaaaattcactaaaaacaaaaagaattaacatgtgaataaactcacaac 26199927  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||  |||||| |||||||||| |||||||    
T  26199926 atccatgttaatagcataaaacaacaaagtattaaagcctacacatatgactatatttaagtctccataatacgtatgtcttcggatctgcatcgttgac 26199827  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    |||  |||||||||||    
T  26199826 gacttcaaagtcattg 26199811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 22344581 - 22344795
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||    
T  22344581 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacatca 22344680  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||   ||||||    | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  22344681 tccatgttaatagcataaaacagtaaagtacaattacctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 22344780  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||    
T  22344781 acgtcaaagtcattg 22344795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49652283 - 49652066
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||    
T  49652283 ataaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaaaggatggatctgtgaacaagctcaca 49652184  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     || |||| ||||||| |||||||  ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||||| | |||  |||||||| |||||||||| || |    
T  49652183 acaaccatgttaatagcataaaacagcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccaggataaccatgtctcaggatctgcaatgtag 49652084  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||||||||||||||||    
T  49652083 atgacgccaaagtcattg 49652066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36621786 - 36621583
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  36621786 atattcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaagaatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatgttaa 36621687  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||| | |||||||   ||||||||| |||||| |||||| |  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  36621686 tagcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgattatatttaaatctctggaata-acatgtctccggatctgcaacgtggatgatgccaaagt 36621588  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  36621587 cattg 36621583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 12967401 - 12967615
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |  |||||| |    
T  12967401 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatagtgcaaatttgctaaaaacaaaaatgataaatctgtgaacaggctcacaac 12967500  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||     
T  12967501 atccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatattta-atctccggaataatcatgtctccagatctacaacgtggat 12967599  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12967600 gacaccaaagtcattg 12967615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 6212583 - 6212797
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  6212583 aaaataaaagatatttattcattcaaattgatagagtatatcgatataatgtaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaaca 6212682  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    |||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |    
T  6212683 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacccatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctacaacgtggatg 6212782  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  6212783 acgccaaagtcattg 6212797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 630462 - 630667
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| || ||||||| |||    
T  630462 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacagactcgcaacatccatgtta 630561  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| |||||  | ||| |||   ||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||| || |||| |||||    
T  630562 atagcataaagtggcaaggtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccaggtctgcaacgtggatgacgtcaaag 630661  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  630662 tcattg 630667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 245
Target Start/End: Original strand, 22031770 - 22031951
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |   || ||| |||||||    
T  22031770 aaaaataattgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcactaaaaataataaggatgaatcttcaaacaaattcacatc 22031869  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctc 245  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||   | | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22031870 attcatattaatatcataaaacgacaaagtacaaaagtctacacatatgattatattcaagtctccggaatactcatgtctc 22031951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 27469386 - 27469591
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||| |||    
T  27469386 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcaatataatgaaaattcgataaaaataaaaaggatgaatccgtaaacaaactcacatcatccatgtta 27469485  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| |||||| |||||||||   | |||||||  |||||||||||| |  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27469486 atagcataaaatgacaaagtattaaagcctacacttatgactatatttaactctctagaatatccatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaag 27469585  T
Q  274 tcattg 279  Q
     |||||    
T  27469586 ccattg 27469591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 38644476 - 38644660
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  38644476 atattcattcatttaaattgatagagtacatcaatataatgcaaatttgctaaaaactaaaaggatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatgttaa 38644575  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    ||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  38644576 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatttttaaatctccggaataaccatgtctctggatctgcaacgt 38644660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52839965 - 52839761
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||  || || ||||||||| ||||||| ||||    
T  52839965 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatgaaaattcactaaaagtaaaaaggatgaatccgtaaacaaactcacaacatccatgttaa 52839866  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||| ||||||| | | || |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  52839865 tagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatacgactatagttaagtttccgaaatacccatgtctccagatttgcaacgttgacgactccaaagt 52839766  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  52839765 cattg 52839761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 50107583 - 50107876
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||      ||||||||||||| | |||||| |  ||| |||||    
T  50107583 aaaaataaacgatatttattaattcaaattgattgagaacatcgatactagacaaattcaatgtcgctaaaaacaaaatg-atgaatctacgaacaaact 50107681  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    | || ||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||| || ||||||||||     
T  50107682 ctcaacatccatgttaaaaggataaaacgacaaagtatgtatgcctacaaatacgactatattcaagccaccgaaatactcatgtttctggatctgcaat 50107781  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaac--taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||    || |||||||| | ||| |  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50107782 gttgacgacacaaaagtcattg--attga----atttgcacttgatcaaagctataatttttcaacataaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 50107875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 348
Target Start/End: Original strand, 40862555 - 40862772
Alignment:
Q  125 taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatg 224  Q
    |||||||||| | ||||||| || ||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   |    
T  40862555 taaaaacaaagatgatgaatctgcgaacaaactcaaaacatccatgttaatagcataaaacgacagagtacttatgcctacaaatatgactatattttag 40862654  T
Q  225 tctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctg 324  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | || | ||| || | |||||||||||||||| |||    
T  40862655 tcttcagaatactcatgtctctggatctgcaacgttgacgacgccaaa------atcattgattgcatttacacctgatcaaaactaatctttcaatctg 40862748  T
Q  325 aatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  40862749 aatcaaataaacatcgctctaaga 40862772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 356
Target Start/End: Original strand, 28399086 - 28399290
Alignment:
Q  146 tgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctc 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||     
T  28399086 tgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactatattcaagtctccgaaatacttaggtctt 28399185  T
Q  246 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 345  Q
    | ||||||||| |||||| | || |||      ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  28399186 cagatctgcaatgttgacaatgcaaaa------gtcattgattggatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacatgaatcaaataaataccgcatta 28399279  T
Q  346 agacgggaaat 356  Q
    |||| ||||||    
T  28399280 agacaggaaat 28399290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10877794 - 10877577
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||| |||||||| |    
T  10877794 taaaaataaatgatattcgtttattcaaattgatagagtatatcaatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatacatctgcgaacaaactcactt 10877695  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    |||| ||  |||||| ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||     
T  10877694 catcgatgctaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactacattcaattctctggaatacacatgtctccagatttacaacgttgc 10877595  T
Q  263 cgac-gccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||||||||||||    
T  10877594 cgacggccaaagtcattg 10877577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45659450 - 45659245
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||| ||||||| |||    
T  45659450 gatattcattcatttaaatcgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaagggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 45659351  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    ||||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||| | |  |||  ||||||  ||||| | ||||||| |||||| || |||| |||||    
T  45659350 atagtataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatacttaaatctttggaataaccatgttttcggatctacaacgtagatgacgtcaaag 45659251  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  45659250 tcattg 45659245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28213489 - 28213279
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||    
T  28213489 gatattcatttattcaaattgataaagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagattcacatcatccatgtta 28213390  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgc------ctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    |||| |||||||| |||| ||   ||||       |||| ||| |||||||||||  |||||||||||  || |||||||||| |||||||| || |||     
T  28213389 atagcataaaacggcaaaatataaatgcatacggatacacatacgactatattcaaatctccggaataaccaagtctccggat-tgcaacgtggatgaca 28213291  T
Q  268 ccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||    
T  28213290 ccaaagtcattg 28213279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29067476 - 29067285
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| ||  ||||| ||||||| ||||||| ||    
T  29067476 attcattcaaatagatagagtacatcaataaaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgataaatctgcgaacaatttcacagcatccatgttaatagcat 29067377  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    ||||||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  29067376 aaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactattttcaagcctccagaatatccatgtctcaggatctgcaa-attaacgacgccaaag 29067285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 14716955 - 14717153
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||   ||||||| ||||    
T  14716955 atattcattcattcaaattgataaagtacatagatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctca---catccatgttaa 14717051  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||    |||||||  | ||||||||||| |  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  14717052 tagcataaaacg-caaagtacaattgcctac--acatgactatatttaaatctccgaaataaccatttctccggatctgcaacgtggatgacgccaatgt 14717148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15698643 - 15698429
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||     |||||| ||    
T  15698643 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaagaaggatgaatatgtgagcctgctcacaaca 15698544  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    || || ||||||| |||||||| |||  ||    |||||||| |||||||||| || |  ||| |||||||  ||||| |  ||||||||||||| || |    
T  15698543 tcaatgttaatagcataaaacggcaacatacaattgcctacacatatgactatttttaaatcttcggaataaccatgtttttggatctgcaacgtggatg 15698444  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  15698443 acgccaaagtcattg 15698429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21326854 - 21326704
Alignment:
Q  129 aacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctc 228  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||     
T  21326854 aacaaaaaggatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctt 21326755  T
Q  229 cggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21326754 cggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 21326704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5844567 - 5844458
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||| |||    
T  5844567 gatattcattaattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcgcaacatccatgtta 5844468  T
Q  174 atagtataaa 183  Q
    |||| |||||    
T  5844467 atagcataaa 5844458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17348042 - 17347886
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||      | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17348042 aaaaataaacgatattcactcatttaaattgatagagtacatcgatataatataaatttaaattctctaaaaacaaaacggatgaatttgtgaacaaact 17347943  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    |||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  17347942 cacaacatcc--gttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctataaatatgacta 17347886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 25278508 - 25278715
Alignment:
Q  67 aataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||     
T  25278508 aataaacgatattaactcattcaaattgatagattataacgataaaatacaaatt-gttaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacata 25278606  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    |||||| |||| ||||||   | || ||   |  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  25278607 catattgatagcataaaatagctaaatacaaaatcctacaaatatgactacattcaagtctctggaatactcatgtcttcagatctgcaacgttaacgac 25278706  T
Q  267 gccaaagtc 275  Q
      |||||||    
T  25278707 atcaaagtc 25278715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37662785 - 37662648
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     ||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  37662785 attcatccattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaaaaaa----ctgaatctgtgaacaaactcacaacattcatgttaata 37662690  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactata 218  Q
    | |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  37662689 gcataaaatgacaaagtacgtaagcctacaaatatgactata 37662648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47392580 - 47392368
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||| |    
T  47392580 aaaaataaatgatattcatttattcaaat--atagagcacatcaatacaatgcaaattcgctaaaagcaaaaaagataaatcagcgaacaaactcacaac 47392483  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||   |||||||||||||||   | || |||| ||||||||||||||| ||||| | |  ||  |||||| ||||||| |||||| |||    
T  47392482 atccatgttaataacgtaaaacgacaaagtacaaaagcatacacatatgactatattcaagtctctgaagaaccaatgtcttcggatctacaacgtggac 47392383  T
Q  264 gacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||||||||||||    
T  47392382 gacgccaaagtcatt 47392368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32301788 - 32301498
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||      | || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  32301788 aaaataaacgacattcattcgttcaaattcatatagtatatcaatacaatacaaatttaaagtcactcaaaacaaaaag-atgaatttgcgaacaaactc 32301690  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    | |||   ||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||| |||| | ||||||||||||     
T  32301689 acatcatccatgttaatagcataaaatagtatagtgcatatggttacaaatatgaccatattcaagtcaccaaaatacttatgttttcggatctgcaaca 32301590  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||| || ||| |||||   |||||    |||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32301589 ttgacgatgcaaaattcattt--attga----ataaacacttgatcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacgagaaat 32301498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 277
Target Start/End: Original strand, 33125543 - 33125693
Alignment:
Q  127 aaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtc 226  Q
    |||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  |     
T  33125543 aaaataaaaaggataaatatgcgaacaaactcacaacgtccatgttaatagcataaaacgacaaaataattatgtctataaatatgactatattcaaatt 33125642  T
Q  227 tccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  33125643 tccggaatactcatatcttcggatttgtaacgttgaagacgccaaagtcat 33125693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17347853 - 17347757
Alignment:
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17347853 tgacaacgccaaagtcattgtcattgatcgaatctgcacttactcaaagctaatctttcaaccttaatcaaataaacactgcactaagacgggaaat 17347757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 900486 - 900376
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||    
T  900486 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattcgctaaaaac-aaaaggatgaatctgcaaacgaactcacaacatccatattaa 900388  T
Q  175 tagtataaaacg 186  Q
    | | ||||||||    
T  900387 ttgcataaaacg 900376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10599333 - 10599167
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata-----caaattcgctaaaaacaaaaagg-atgaatttgtgaataaa 155  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||     |||| ||| ||||||||||| |  |||||| |  ||| |||    
T  10599333 ataaaaagaagcgatatttattcattcaaatttattgagtacatcgatacaataaaattcaaagtcgttaaaaacaaaatgttatgaatctccgaacaaa 10599234  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  10599233 ctcacagcatccatattaatagcatagaacgacaaagtacatatatctacaaatatgactatattca 10599167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 350
Target Start/End: Original strand, 26097697 - 26097960
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||| ||||| ||||| | || ||| |||||||||||||||    
T  26097697 gatattaattcattcaaatcgatagagtagatcgatacaatacaaatttaaagaaactaaaaataaaaaagatga-tctgcgaacaaactcacatcatcc 26097795  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || ||||||| ||||||||  | | ||        ||||    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26097796 atgttaatagcataaaacggtagatta--------taca----tgactatattcaagtcaccggaaaactcatgtctccggatctgcaatgttgacgacg 26097883  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    | |||      |||||| || | || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26097884 caaaa------gtcattaatggaatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaataccgtactaagacg 26097960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Original strand, 30853615 - 30853744
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||  || ||||||||| |    
T  30853615 aaaaataaatgatattcatttattcaaattgatataatacatcgatacaatgcaaattcgct-agaacaaaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaac 30853713  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30853714 atccatattaattgcataaaacaacaaagta 30853744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 11877116 - 11877341
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||      | ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  11877116 aaaaataaacgatattaattcattcatgttgatagaatacgtcgatacaacacatattcaaagttgttaaaaacaaaaagaatgaacttgcgaacaaact 11877215  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat----gtctccggaatactcatgtctccggatctg 253  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||    ||||| |||||| |||||| || ||||||     
T  11877216 cacagcatccatgttaataacataaaacggcaatgtaactacgccaacaaatatgactatatatatttaagtctctggaatattcatgtatctggatcta 11877315  T
Q  254 caacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||    
T  11877316 caactttgatggcgccaaagtcattg 11877341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20413191 - 20413094
Alignment:
Q  117 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac 214  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20413191 aaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgac 20413094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 348
Target Start/End: Original strand, 24114420 - 24114632
Alignment:
Q  126 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    | ||||||| ||||||| ||| || || | |||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||    
T  24114420 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaac----aacatccatgttaatagcatagaatgaaagagtatctatacctacaaatatgattatattaaagt 24114515  T
Q  226 ctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctga 325  Q
    |||   |||| ||||||||  ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||    || |||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  24114516 ctctacaataatcatgtctttggaactgcaacgttgaatacgccgaagtcattg--attga----atctgcacttgctaaacactaatctttcaacttga 24114609  T
Q  326 atcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  24114610 atcaaataaacatcgcattaaga 24114632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1768356 - 1768158
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||| ||||||| ||||    
T  1768356 atattcattcattcaaattgaaatattacatcgatataatg-----tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtggacag-ctcacaacatccatgttaa 1768263  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||  ||||| | ||||||||||| || ||  ||| ||||||    
T  1768262 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacaaatatgactatgtttaaatctcctgaataaccatgtttacggatctgcaatgtggataacgtcaaagt 1768163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 347
Target Start/End: Original strand, 45425207 - 45425427
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||  ||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  45425207 tcgctaaaaatgaaaaggatgaatctgcaaacgaattcatatcatccatgttaatagcataaaacgactaagtgcatatgcctacaaatatgattatatt 45425306  T
Q  221 catgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaa 320  Q
    ||  ||||   |||| ||||||||  |||||| |||| ||  |||||||||       |||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  45425307 caattctctataatattcatgtcttaggatctacaacattatcgacgccaa------cgtcattgattcgatatgcaattgatcaagactaatctttcaa 45425400  T
Q  321 cctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  45425401 catgaataaaataaacaccgcactaag 45425427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38783453 - 38783320
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||     
T  38783453 ctaaaaacaaaaatgataaatttgcgagcaaactcaaaacatccatgttaataatataaaatgacatagtacatatgcctataaatatgactatattcaa 38783354  T
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    | |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38783353 gccatcgaaatactcatgtttccggatctgcaac 38783320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2486369 - 2486144
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||  |||||| | |||||||||       ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||    
T  2486369 ataaaaataaacgatatttattcatttaaattgataaattatttcgatatagtacaaattcaaagtcactaaaaataaaaaagatgaatctgcgaacaaa 2486270  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat---gtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    |||| |  |||||  ||||||| |||||| || | | ||  ||||||||||||||||| |||||||||   |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  2486269 ctcatagtatccacgttaatagcataaaatgatagaatacttatgcctacaaatatgattatattcattaagtctccagaaaattcatgtctccggatct 2486170  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||    
T  2486169 gcaacgttgatgacgtaaaagtcatt 2486144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8224616 - 8224406
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||  |||||||| |||||||  | |||| | ||||||||||| |||||    ||||| | |||||| |||||||      
T  8224616 ataaaaatatacgatattcatttattttaattgatatagtacatttagacaacataaattcgctaataacaa----gatgagtctgtgaacaaactcaa- 8224522  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     |||| |  ||||||  ||||||||||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||  |||||||| |||||    
T  8224521 -catctaagttaataacataaaacgacaaagtataaaagcctgcaaatttgactatattcaaatctccgaaatactcatgcctctagatctgcatcgttg 8224423  T
Q  262 acgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||||||||||||||    
T  8224422 acgacgccaaagtcatt 8224406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23791424 - 23791282
Alignment:
Q  80 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||  || ||||||||    
T  23791424 cattcattcaaattaacagagtacatcgatgcaatacaaaattcgttaaaa-caaaaatgatgaatatgagaacaaactcacaacatttatgttaatagt 23791326  T
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||||||| |||||| |  ||  | ||||||||||||||||||||    
T  23791325 ataaaacaacaaagcacataaacttacaaatatgactatattca 23791282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33001944 - 33001797
Alignment:
Q  83 tcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataa 182  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |   || || || |||||| | || ||||||| ||||    
T  33001944 tcattctaattgatagagtaaatcgataaaatacaaattcactaaaaacaaaatggatgaatctccaaacaagcttacatcaacaatgttaatagcataa 33001845  T
Q  183 aacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccg 230  Q
    || ||||||||   || |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33001844 aatgacaaagtttataagaatacaaatatgactatattcaagtctccg 33001797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33128098 - 33127976
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacat-cgatacaatac-aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||  | ||| ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||    
T  33128098 aaaaataagcgatatgcattcactcaaattgatttagtacattcaatacaaatctaaagtcgttaaaaacaaaaataataaatttgtgaacaaactcaca 33127999  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  33127998 tcatccatattaatagtacaaaa 33127976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13869875 - 13869802
Alignment:
Q  278 tgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    |||||||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13869875 tgtcattgattggatctacacttgttcaaaactaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacgg 13869802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13999399 - 13999132
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| |||||||||||       ||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| | |||    
T  13999399 gatattcatttatttaaattggtaaagtatatcgatagaatacaaattcaaagtcactataaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacgtcc 13999300  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || ||||||  |||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||     |||||||   ||    
T  13999299 atgttaataacataaaacgat---ggaa-tatgcctacaaatatgactatattcaagtctccataatactcatgtctctagat-----acgttgatagcg 13999209  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    ||||||||||||  |||||    || |||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13999208 ccaaagtcattg--attga----atctgcatttgctcaaagttaatcttacaacctgaatcaaataaacatcgtactaagacg 13999132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16141078 - 16141022
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141078 aaaaataaacgatattcattcatccaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 16141022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20411779 - 20411732
Alignment:
Q  309 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20411779 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 20411732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5832546 - 5832465
Alignment:
Q  198 atgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  5832546 atgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataatcatgtctccagatctgcaacgtggatgacgtcaaagtcattg 5832465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 261
Target Start/End: Original strand, 6158838 - 6158902
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6158838 tatgcctacaaatatgactatattcaagtcttcagaatactcatgtcttcggatctgcaatgttg 6158902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8737584 - 8737517
Alignment:
Q  282 attgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8737584 attgattggatctgcacttactcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagac 8737517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10782877 - 10782751
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||      |||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  10782877 aaaaataatcgatattcattcattcgaattgatggagtacatcaatataatattaattcaaaatcgctaaaaacaaaaagaataaaattgtgaacaaact 10782778  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||  ||| ||||||| || ||||||    
T  10782777 cacaatatctatattaaaagcataaaa 10782751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 25689507 - 25689802
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||      |||||||||| |||| |||||||| || ||| ||| |    
T  25689507 aaaaatgaacgatatttattcattcaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaacggatgaatctgggaacaaaat 25689606  T
Q  158 cacatcatccatat--taatagtataaaacgacaaagtaactatg-cctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgc 254  Q
    |||| ||   || |  |||||| |||||| | || ||||  |||| | |  ||| |||||||| || | ||||  | ||||||||||||| | |||||||    
T  25689607 cacaacaaagattttataatagcataaaaaggcagagtatatatgtcttttaaaaatgactatgttaaagtctttgaaatactcatgtcttcagatctgc 25689706  T
Q  255 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    || |||||||||||| |||||||||  |||||    |||||| ||| |  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||    
T  25689707 aatgttgacgacgccgaagtcattg--attga----atatgcgctttcccaaagctaatctatcaacctgaataaaataaacaccacattaaaacggaaa 25689800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29938516 - 29938398
Alignment:
Q  231 gaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaa 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||      |||||| |||| ||||||||  | || ||| ||||||||| | ||||||    
T  29938516 gaatactcatgtctccggatttgcaacgttgataacgccaaagtc------attgattggatctgcacttg-atcaagctattctttcaacataaatcaa 29938424  T
Q  331 ataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||    
T  29938423 ataaacaccgcactaggacgagaaat 29938398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Original strand, 8743909 - 8744018
Alignment:
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |  |||  ||||||  ||||||| |  ||||||||||||||| || ||    
T  8743909 attaatagtataaaatgacaaagtacatatgtctacaaacatgactatatttaattctttggaatatgcatgtcttcatatctgcaacgttgacaacacc 8744008  T
Q  270 aaagtcattg 279  Q
    ||||||||||    
T  8744009 aaagtcattg 8744018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 356
Target Start/End: Original strand, 29551645 - 29551710
Alignment:
Q  291 atatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29551645 atatgcacttgatcaaaactaatatttcaaccttaatcaaataaacaccacactaagaagggaaat 29551710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10265138 - 10265022
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||  || || ||||||| | ||| ||| ||||    
T  10265138 atattcattcattcaaactaacatagtacatcgatataatataaattctttaaaaacaaaaatgatgaatcagtaaacaaactcataacattcatgttaa 10265039  T
Q  175 tagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  10265038 tagtatacaacggcaaa 10265022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21326926 - 21326854
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  21326926 aaattgatagagtacataaatataatgcaaatacgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaagctcaca 21326854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31919278 - 31919162
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||||  ||||    
T  31919278 attcattcattcaaattgatagagtacatcacatcatatacaaacttcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcgcaacatccaagttaa 31919179  T
Q  175 tagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  31919178 tagcatacaacgacaaa 31919162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8937971 - 8937900
Alignment:
Q  151 ataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8937971 ataaactaatatcatccatgtcaatagcataaaacgacagagtaattatgcctataaatatgactatattca 8937900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28666523 - 28666476
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 113  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28666523 aaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 28666476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3101940 - 3101836
Alignment:
Q  237 tcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaac 336  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||    ||||||||||||| |||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  3101940 tcatgtctctgaatctgcaatgttgacgacgccaaagtcat--taattga----atatgcacttgctcaaagttaatatttcaactcgaatcaaataaac 3101847  T
Q  337 accgcactaag 347  Q
    | |||||||||    
T  3101846 atcgcactaag 3101836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Original strand, 15312339 - 15312445
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| || | ||  |||| ||||||||||||||    
T  15312339 caaagtcgttaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaataacataaaacggcataatacatatggctacaaatatgact 15312438  T
Q  216 atattca 222  Q
    || ||||    
T  15312439 atgttca 15312445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30678706 - 30678648
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30678706 aaaaataaacgatattcattccatcaaattgatagaatatatcgatacaatacaaattc 30678648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Original strand, 37684894 - 37684972
Alignment:
Q  200 gcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37684894 gcctacacgtatgactatatttaagtctctaaaatgctcgtgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcatt 37684972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37700623 - 37700545
Alignment:
Q  200 gcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37700623 gcctacacgtatgactatatttaagtctctaaaatgctcgtgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcatt 37700545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 350
Target Start/End: Original strand, 39080816 - 39080870
Alignment:
Q  296 cacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39080816 cacttgctcaaaactaatcttttaacatgaatcaaataaacactgcactaagacg 39080870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46930425 - 46930331
Alignment:
Q  180 taaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || | || |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46930425 taaaacaacatagtacttatgcctacaaacatgactatattcaagttttcgaaatatttatgtctacggatctgcaacgttaacgacgtcaaagt 46930331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48003663 - 48003487
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||      | |||||||||||| ||||||||||| || ||| |    
T  48003663 aaaaataaacgatattcatttattaaaattgatatagta-atcaatacagtacacattcaaagtcgttaaaaacaaaaaagatgaatttgtaaacaaaat 48003565  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaata 235  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||  ||||  || || ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  48003564 cacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaaatacatatgaatataattatgactatattcaaatcttcggaata 48003487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4564828 - 4564747
Alignment:
Q  198 atgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||    
T  4564828 atgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaatgtggatgacaccaaagtcattg 4564747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6788249 - 6788153
Alignment:
Q  117 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||       |||||||||||||||||||    
T  6788249 aaattcgttaaaaacaaaagggatgaatctataaacaaactcacaacatccatattaatagcataaaacagcaa-------atgcctacaaatatgacta 6788157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Original strand, 29551436 - 29551576
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcac-atcatccatatta 173  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||      |||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| | ||| |||  ||    
T  29551436 attcatttaaattgatagattacatcgatacaatacaatttcaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcaaacaaactcactaacattcatgcta 29551535  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac 214  Q
    |||| ||| |||  || ||||  ||||||||||||||||||    
T  29551536 atagcatagaacagcagagtatatatgcctacaaatatgac 29551576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29802863 - 29802794
Alignment:
Q  279 gtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  29802863 gtcattgattggatctgcacttgatcaaaactactctttcaacaagaatcaaataaacaccacactaaga 29802794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29938656 - 29938556
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| | ||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||    
T  29938656 atattcattcatttaagtttatagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaatagaaaggatgaatctgcgaacacactcacaacatcca 29938557  T
Q  169 t 169  Q
    |    
T  29938556 t 29938556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 144
Target Start/End: Original strand, 32538888 - 32538953
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  32538888 tcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattcactaaatacaaagatgatgaat 32538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44915926 - 44915839
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  44915926 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcagatacaa-aca---tcactaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacatca 44915839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27456777 - 27456657
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | |||||  ||| |||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||      
T  27456777 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcacattcgacacaaacatcgttaaaaacgtaaaagatgaatttgcgaacaaactcacaacacccaag 27456678  T
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  27456677 ttaatagcatacaacgacaaa 27456657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 339
Target Start/End: Original strand, 29069725 - 29069785
Alignment:
Q  279 gtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacacc 339  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29069725 gtcattgattgaatatgcacttgatcaaaattaatctttcaatctgaatcaaataaacacc 29069785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 279
Target Start/End: Original strand, 35356250 - 35356437
Alignment:
Q  91 attgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaa 190  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||| || |||||  ||||||||| ||| ||||||| |  ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  35356250 attgatagagtacatcaatataatgcagattcgttaataataaaaa-aatgaatttgcgaacaaactcataaaatccatactaatagcataaaacaacaa 35356348  T
Q  191 agtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||    |   ||||||||||| |||||||||| || || | |||| |||||| | |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  35356349 agctcatgaacctacaaatataactatattcaagtgtctgtaatattcatgttttcggatctgtaatattaacgacaccaaagtcattg 35356437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 349
Target Start/End: Original strand, 2513418 - 2513554
Alignment:
Q  207 aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |   ||||||||||      || ||||||||||  ||| ||    
T  2513418 aatatgattatattcaagtctccataatactcatgttttcgggtctgcaacgttgatggcaataaagtcattg------attggatatgcacccgctcaa 2513511  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2513512 agttaatctttcagtctgaatcaaacaaacaccgcactaagac 2513554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 10188555 - 10188602
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10188555 atattcattcattcaaattaatagagtacattggtacaatacaaattc 10188602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20413097 - 20413054
Alignment:
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgct 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20413097 tgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgct 20413054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12537988 - 12537930
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12537988 ataaaaataaatgatattaatttattcaaattgatagagtacatcaatacaatataaat 12537930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13870021 - 13869970
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaataca 117  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13870021 aaaaataagcgatattca--cattcaaattgatagagtatatcgataaaataca 13869970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17920820 - 17920654
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatag 177  Q
    |||||| ||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||| | || |||||||||  || |||||||||||    
T  17920820 ttcatttattcaaattggctgagtgcatcaatacaatacaaattagttaaaaataaaaagaataaatttataaacaaactcacaaaattcatattaatag 17920721  T
Q  178 tataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtct 244  Q
     |||||    |||||||   ||| |||||||||| || ||||||| || |  ||||||| |||||||    
T  17920720 cataaataagcaaagtacacatgtctacaaatataacaatattcaagtgtaaggaatacacatgtct 17920654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 18569142 - 18569208
Alignment:
Q  123 gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18569142 gctaaaaacataaagcttgaatttgcgaataaactcacaacatccaaattaatagcatataacgaca 18569208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 279
Target Start/End: Original strand, 34039332 - 34039458
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |  || |||| |||||||||||||||||| | || || |||| | ||||||  | || |    
T  34039332 aaactcacatcatccatattaatatcataaagcggcaaagcacataagccttcaaatatgactatattcaagacttcgaaatagttatgtctttgaattt 34039431  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||    
T  34039432 gcaatgttgacgacatcaaattcattg 34039458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Original strand, 34334897 - 34334979
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | |  || |||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  34334897 tatgcctacaaatatgattatattcaagtctccggaatactcgtgttttcatatttgcaacgttgatcacgacaaaggcattg 34334979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 270
Target Start/End: Original strand, 41018544 - 41018705
Alignment:
Q  108 atacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaa 207  Q
    |||||||||||||||  |||| | |||||| | |||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||  ||  | || ||    
T  41018544 atacaatacaaattctttaaatataaaaagaa-gaatatgtgaacaaacacacaacattcatattaatagcataaaacgttaacatacataaacttataa 41018642  T
Q  208 atatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcca 270  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||| |||   |||| |||| |||||||||||||||||    
T  41018643 atatgattatattcaaatctccggaatacacatacatccgaatctacaacgttgacgacgcca 41018705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 171359 - 171294
Alignment:
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatac 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  171359 ttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacatatatgattatattcaagtctccggaatac 171294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 8758099 - 8758062
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8758099 cgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgata 8758062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26535624 - 26535591
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26535624 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 26535591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5856192 - 5856160
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5856192 atattcattcattcaaattgatagagtacatcg 5856160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40646755 - 40646711
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40646755 atctttcaatatgaatcaaataaacaccgcacgaagacgggaaat 40646711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47133190 - 47133076
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||  |||||||||||  ||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||  ||    
T  47133190 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc---agaat-caacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacaacatccaagtt 47133095  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||| ||| |||| ||||    
T  47133094 aatagcatataacggcaaa 47133076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 161
Target Start/End: Original strand, 7337467 - 7337552
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||| | ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  7337467 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaatataaagggtgaatctgcgaacaaactcaca 7337552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8937840 - 8937797
Alignment:
Q  306 aaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8937840 aaactaatctttcaatttgaatcaaataaacaccgcattaagac 8937797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Original strand, 9687035 - 9687102
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  9687035 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgaca 9687102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Original strand, 39927384 - 39927439
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  39927384 tcgctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaaattaata 39927439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40922955 - 40922912
Alignment:
Q  125 taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40922955 taaaaataaaaagtatgaatttgtgaataaactcacaacatcca 40922912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18889341 - 18889271
Alignment:
Q  279 gtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  18889341 gtcattgattgaatatgcacttgatcaaaactaatcttttgacctgaattaaattaacattgcactaagac 18889271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 186
Target Start/End: Original strand, 38520367 - 38520429
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  38520367 ctaaaaacgtaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 38520429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43504189 - 43504111
Alignment:
Q  139 atgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactat 217  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  43504189 atgaatatgcgaacaaactcacataatctatgttcatagcataaaacaacaaagtacatattcctacaaatatgactat 43504111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 11462286 - 11462319
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11462286 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 11462319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 21947422 - 21947455
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21947422 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 21947455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 343
Target Start/End: Original strand, 31427065 - 31427098
Alignment:
Q  310 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31427065 taatctttcaacctgaatcaaataaacactgcac 31427098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 35484195 - 35484228
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35484195 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 35484228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 36894212 - 36894245
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36894212 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 36894245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 263
Target Start/End: Original strand, 39927491 - 39927524
Alignment:
Q  230 ggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39927491 ggaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgac 39927524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 46930538 - 46930482
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  46930538 aaaaataaaagatattcattcttttaaattgataaagtacat-gatacaatacaaatt 46930482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 171562 - 171498
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaagg 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||| | |||||| |||||||    
T  171562 gatattcattcatttaaattgatagagtatattgatattatgcaaatttgttaaaaataaaaagg 171498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8960882 - 8960782
Alignment:
Q  132 aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgg 231  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||||| | || ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  8960882 aaaaaggatgagtttgcgaacaaactaacattattcatgtcaatagcataaaatggcagagtacgtatgtctataaatatgactatattcaagtgtccgg 8960783  T
Q  232 a 232  Q
    |    
T  8960782 a 8960782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 19715891 - 19715935
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19715891 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 19715935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Original strand, 31130422 - 31130490
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  31130422 tcgctaaaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagaatataacgaca 31130490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 277
Target Start/End: Original strand, 35077748 - 35077784
Alignment:
Q  241 gtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35077748 gtctctggatctgcaacgttgacgacgccaaaatcat 35077784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39987535 - 39987499
Alignment:
Q  228 ccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39987535 ccggaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacg 39987499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Original strand, 40163234 - 40163266
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40163234 cgatattcattcattcaaattgatagaatacat 40163266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 41081492 - 41081524
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41081492 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 41081524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 48750483 - 48750451
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48750483 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 48750451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Original strand, 49504399 - 49504431
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacat 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49504399 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacat 49504431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50148455 - 50148411
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  50148455 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 50148411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Original strand, 50165929 - 50165993
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  50165929 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 50165993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 187)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21991129 - 21990822
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21991129 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaact 21991030  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21991029 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactgtatttatgtctccggaatactcatgtctccgg 21990930  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21990929 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatcagcacttgctcaaagctaatctttcaagctgaatcaaataaacaccgcactaaga 21990830  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  21990829 cgggaaat 21990822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45482519 - 45482224
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||    
T  45482519 aaaagtaaacgatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaa---aaaggatgaatctgtgaacaaact 45482423  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45482422 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatacctacaaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 45482323  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45482322 gttgacagcgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaaat 45482224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Original strand, 17473425 - 17473713
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  17473425 gatattcattctttcaaattgatagagtacatcggtacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17473524  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || ||||||| |||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17473525 atgttaataggataaaatggcaaagtacatatgcttacaaatatgactatattcctgtctccggaatactcatgtctctggatctgcgacgttgacgacg 17473624  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17473625 ccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcacaaagacgggaaat 17473713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17579789 - 17579501
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  17579789 gatattcattctttcaaattgatagagtacatcggtacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17579690  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || ||||||| |||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17579689 atgttaataggataaaatggcaaagtacatatgcttacaaatatgactatattcctgtctccggaatactcatgtctctggatctgcgacgttgacgacg 17579590  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17579589 ccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcacaaagacgggaaat 17579501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32741210 - 32740912
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32741210 aaaaataaacgatattcatttattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 32741111  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32741110 cacaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcctacaaatatgactatatttatgtctctggaatactcatgtctccggatttgcaac 32741011  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32741010 gttagcgacgccaaaatcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaatagacaccacactaagacgggaaat 32740912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 66 - 356
Target Start/End: Original strand, 42603435 - 42603730
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  42603435 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaacaaaacggatgaatctgtgaacaaactca 42603534  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || |||| || ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42603535 caacatctatgttaatagcataaaacggcaaagttcctatgcctacaaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgtaacgt 42603633  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42603634 tgacgacatcaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacaggaaat 42603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11833487 - 11833178
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgc------taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11833487 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgcattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaa 11833388  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||         |||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  11833387 ctcacaacatccatattaatagcataaaacggcaaagtatttatgcctataaatatgactaatatgactatatttatgtctctggaatactcatgtcttc 11833288  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11833287 ggatctacaacgttaacgacgcaaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 11833188  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    |||| |||||    
T  11833187 gacgagaaat 11833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Original strand, 17508868 - 17509165
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  17508868 gatattcattcttttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17508967  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatat---------gactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17508968 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactgatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcgacg 17509067  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17509068 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagacggaaaat 17509165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17544346 - 17544049
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  17544346 gatattcattcttttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17544247  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact---------atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17544246 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactgatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcgacg 17544147  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17544146 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagacggaaaat 17544049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 73 - 356
Target Start/End: Original strand, 36719223 - 36719513
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaa-aggatgaatttgtgaataaactcacatcat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36719223 cgatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacat 36719322  T
Q  166 ccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacga 265  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  36719323 ccatgttaatagcataaaacggcgaagtacttatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgaaatactcatgtctccggatctggaacgttgatga 36719422  T
Q  266 cgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  36719423 cgccaaagtcattgtcattgatcagatctgtacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataagcaccccactaagacggaaaat 36719513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9785784 - 9785485
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  9785784 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagggtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaactaaatgaatgaatttgtgaacaaact 9785685  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  9785684 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctctagaatactcatgtttccgg 9785585  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9785584 atctgcaacgttgacgactccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 9785485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 45457210 - 45457517
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45457210 aaaaataaacaatattgattcattcaaattgatagagtacatcgacacagtacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 45457309  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaa---------tatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45457310 cacaacatccatattaatagcataaaacggcaaaatatatatgcctacaaacaggactaatatgactatattcatgtctccagaatactcatgtctccgg 45457409  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45457410 atctgcaacgttgacgactccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaaga 45457509  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    || |||||    
T  45457510 cgagaaat 45457517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 64 - 329
Target Start/End: Original strand, 44482532 - 44482807
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44482532 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaataaact 44482631  T
Q  158 cacatcatccatattaata----gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctg 253  Q
    |||||||||||| ||||||    | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44482632 cacatcatccatgttaatatatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattaatgtctccggaatactcatgtctccggatctg 44482731  T
Q  254 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatca 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  44482732 caacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacctgaatca 44482807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3266841 - 3266546
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      | |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  3266841 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgataaagtacattgatacaatacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaact 3266742  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3266741 cacatc---catgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactatatttaagtctccgaagtactcatgtctccggatctacaac 3266645  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3266644 gttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagacgagaaat 3266546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 48304046 - 48304354
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48304046 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaatttcactaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaact 48304145  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    || | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  48304146 cataacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtcaccggaatactcatgtgtccgt 48304245  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcatt-gatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48304246 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattcgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 48304345  T
Q  348 acgggaaat 356  Q
    ||| |||||    
T  48304346 acgagaaat 48304354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 36578995 - 36579302
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36578995 aaaaataaacgatattcattcgttcaaattgatagagtacattaatataatataaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 36579094  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36579095 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcccacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactaatgtctccgg 36579194  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36579195 atctgcaacattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctacaattgctcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaaga 36579294  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  36579295 cgggaaat 36579302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 1280791 - 1281098
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1280791 aaaaataaacgatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 1280890  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaa---------atatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    || | ||||||| ||||||| |||||| |  ||||||  |||||||||||         |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  1280891 catagcatccatgttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaactatgactaatatgactatattcgtgtctccagaatactcatatctccgg 1280990  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1280991 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgttcggatctgcacttgctcaaaggtaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 1281090  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  1281091 cgggaaat 1281098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41288423 - 41288116
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41288423 aaaaataaacgatattctttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 41288324  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||         |||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  41288323 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttgtgcctgcaaatatgactaatatgactatatttaagtctccgaaatactcatgtatccgg 41288224  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41288223 atctacaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaaga 41288124  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  41288123 cggaaaat 41288116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10094906 - 10094601
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10094906 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtatattaatacaatagaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 10094807  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta--------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggat 250  Q
    ||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||        ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||    
T  10094806 acaacatcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatataacttatttttgtctccgaaatactcatgtctttggat 10094707  T
Q  251 ctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094706 ctgcaacgttaacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 10094607  T
Q  351 ggaaat 356  Q
    ||||||    
T  10094606 ggaaat 10094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36253397 - 36253090
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  36253397 aaaaataaacgatactcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggaagaatctgtgaacaaact 36253298  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  36253297 cacaacatccgtgttaatagcataaaacgacaaaatatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaattcccatgtctccgg 36253198  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  36253197 atctacaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgtcctaaga 36253098  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  36253097 tgggaaat 36253090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 24319875 - 24320184
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  24319875 ataaaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaa 24319974  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||| || ||| |||||||||||||  |    
T  24319975 ctcacaacatccatgttgatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgattaatatgactatattcaagtttccagaatactcatgtcatc 24320074  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24320075 agatctgcaatgttgacgacaccaaagtcattgtcatagatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 24320174  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||    
T  24320175 gacggaaaat 24320184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 76 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26161409 - 26161118
Alignment:
Q  76 tattcattcattcaaattgatagagtacatcgataca-----atacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  26161409 tatttattcattcaaattgatagagtatatcgataaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatg 26161310  T
Q  171 ttaatagta----taaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||||| |    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26161309 ttaatagcacgcataaaacgacaaagtacctaggcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgggatactcatgtctccggatctgcaac 26161210  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26161209 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaatgaaccccgcactaagac 26161118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6667862 - 6667555
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6667862 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagcacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaact 6667763  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  6667762 cacaacatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacatatgcctacaaatatgactagtgtgattatatttatgtctccggaatactcaggtcttcgg 6667663  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  6667662 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatatgcacttgatcaaagccaatctttcaacttgagtcaattaaacaccgcactaaga 6667563  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  6667562 cggaaaat 6667555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 39532629 - 39532936
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  39532629 aaaaataaacgatattaattcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatgtgtgaacaaact 39532728  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatga---------ctatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||         ||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  39532729 cacatcattcatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcatacaaatatgattgaaatgactatattcatgtccccagaatactcatgtttccgg 39532828  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  39532829 atctgcaatgttgacgactccaaagtcattatcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagg 39532928  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  39532929 cgggaaat 39532936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 73 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42645113 - 42644832
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaa------attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  42645113 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaagtctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 42645014  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42645013 catgttaatagcataaaacggcaaattacatatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 42644922  T
Q  267 gccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42644921 gccaaaatcattgtcattgatcggatctgtacttgctcaaagctaatatttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagacggaaaat 42644832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 46025709 - 46025990
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  46025709 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaact 46025808  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||                 ||||||| |||||||||    
T  46025809 cacagcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgactatattcat-----------------gtctccgaatctgcaac 46025891  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46025892 gttgacaacgctaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 46025990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40762055 - 40761748
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||      ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  40762055 aaaaaaaaacgatattcatttattcaaattgatagagtatatcgatacagtacaaatccaaattcgctaaaaaagaaaaggatgaatctgtgaacaaact 40761956  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40761955 catatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcttacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgg 40761856  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  40761855 atctgtaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatatttcaaccttaatcaaataaacaccgcactaata 40761756  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    || |||||    
T  40761755 cgagaaat 40761748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 4621034 - 4621328
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  4621034 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaattcaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaact 4621133  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac--tatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4621134 cacaacattcatgttaatagcataaaatgacaaagtacatatgcctacaaatatgactatatatttaagtctccgaaatactcatgtctccggatctgca 4621233  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    | ||||| ||| |||||      |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4621234 atgttgatgacaccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgttcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaaacgtgaaa 4621327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 277
Target Start/End: Original strand, 37375710 - 37375928
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  37375710 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacat-gatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatatgtgaacaaact 37375808  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37375809 cacagcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgactatattcatgtctcctgaatactcatgtctccagatctgcaac 37375908  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37375909 gttgacgacgccaaagtcat 37375928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5684805 - 5684524
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  5684805 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaactcgctaaaaacaaccaggatgaatgtgtgaacaaacttacagcatccatgttaa 5684706  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  5684705 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctataaatatgactatattcatgtctctggaatagtgttgtctccggatctgtaacgttgacgatgtcaaagt 5684606  T
Q  275 cattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  5684605 aattgacattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaacaaacaccatactaagacggaaaat 5684524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5709855 - 5709574
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  5709855 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaactcgctaaaaacaaccaggatgaatgtgtgaacaaacttacagcatccatgttaa 5709756  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  5709755 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctataaatatgactatattcatgtctctggaatagtgttgtctccggatctgtaacgttgacgatgtcaaagt 5709656  T
Q  275 cattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  5709655 aattgacattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaacaaacaccatactaagacggaaaat 5709574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2623059 - 2622752
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||      | | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  2623059 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatctatataatataaatctaaatttgataaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaact 2622960  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2622959 cacaacattcatgttaatagcataagacgacaaaatacctatgcctacaaatatgactaacattactatattcatgtctccggaatactcatgtcttcgg 2622860  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2622859 atctgcaatgttgacgacgccaaagttattgtcattgattggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaatttgaatcaaataaacaccgcacaaaga 2622760  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  2622759 tgggaaat 2622752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 354
Target Start/End: Original strand, 22747172 - 22747468
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  22747172 cgatattgattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaatttactaaaaacaaaaaggatgattctgtgaacaaactcacatcatc 22747271  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||         |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  22747272 catgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatttctacaaatctgcaac 22747371  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22747372 gttgacgacgccaaattcattgtcaatgatcagatctgcacttgctcagagctaatctttcaaccttaatcaattaaacaccgccctaagacgggaa 22747468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 355
Target Start/End: Original strand, 24988165 - 24988440
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||      |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||| |    
T  24988165 atattcattcatttaaattgatagaatacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatatgaacaaaatcacaacatcta 24988264  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |           |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  24988265 tgttaatagtataaaacgacaaagtatttatgcctacaaatgtta-----------tctccggaatactcatgtatccggatctgcaacgttgacaacac 24988353  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24988354 caaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 24988440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9137407 - 9137125
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||      ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  9137407 aaaaataaacgatattc-ttcattcaaattgatagagtgcatcgacccagtacaaattcaaagttgctaaaaacaaaaaggatgaatttacgaacaaact 9137309  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9137308 cacatcatccatgttaatagcataaaatgacaaagtacttatgtctacaaatatgactaaattcaagtctccggaatacttatgtctccggatctgcaac 9137209  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    |||||||||||||||      |||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9137208 gttgacgacgccaaa------gtcaatgatcgaatatgcactttctcaaagctaatcttttaaccttaatcaaataaacaccacactaag 9137125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 28664610 - 28664902
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28664610 aaaaataaacgatatccatctattcaaattgatagattacatcgatacaatgcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaact 28664709  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||| |||  |||||| |||| ||| |||| || ||||||| | ||||||||||||    |||   || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  28664710 cacagcattcatgctaatagcataagacggcaaaatatctatgccaataaatatgactatt---atg---ccagaatactcatgtctctgaatctgcaac 28664803  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28664804 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacggaaaat 28664902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21603925 - 21603620
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgc------taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  21603925 aaaaattaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcattaaaaagaaaaagggtgaatctgtgaacaaact 21603826  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactat---------attcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||          ||| |||||||||||||| |  ||| |||||    
T  21603825 cacaacatccatgttaatagcgtaaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgactaatatgactacatttatgtctccggaatatt--tgtttccgg 21603728  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21603727 atctgcaacgttgacgacgttaaagtcattgtcattgatcggatctgcactttctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 21603628  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  21603627 cgggaaat 21603620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10574831 - 10574541
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaac-aaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||      ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  10574831 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatataaatctaaattcgctaaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacaaact 10574732  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||| ||  ||| ||     ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  10574731 cacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatgtgcctataaatatgacta-at--atgact-----atatttttgtctccagatctgcaac 10574640  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10574639 gttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacatgaatcaaataaacaccgaactaagacggaaaat 10574541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32643432 - 32643170
Alignment:
Q  67 aataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcac 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  32643432 aataaacgatattcattcattcaagttgatagagtacaccgatacaatataaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcac 32643333  T
Q  161 atcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatc 251  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32643332 atcttccatgttaatagcataaaacggcaagatacttatgcctacaaatatgactaatatgattatattcaagtctccggaatcctcatgtctccggatc 32643233  T
Q  252 tgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatc 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32643232 tgcaacgtggacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgcttaaagctaatc 32643170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27535894 - 27535594
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  27535894 aaaaataaacgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatacaaattcgtcaaaaacaacaaggatgaatatgt-aacaaact 27535796  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||         || |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27535795 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttgtgcctacaaatatgactaatgtgaatatagtcatgtctccagaatactcatgtttccgg 27535696  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  27535695 atctacaatgttaacgacgccaaagtcattgtcattggtcgaacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgagtcaaataaacaccgcacttaga 27535596  T
Q  349 cg 350  Q
    ||    
T  27535595 cg 27535594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 29804360 - 29804562
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  29804360 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacgacatccatgttaata 29804459  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29804460 gcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatatttaaatatccggaatagccatgcctccggatctgcaacgttgatgatgccaaagtca 29804559  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  29804560 ttg 29804562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28015805 - 28015588
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28015805 ataaaaataaaagatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcaca 28015706  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| |||||| |||||| | | |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  28015705 acatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgaatatatttaagcctccagaatacctatgtctccggatctgcaatgttg 28015606  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28015605 acgactccaaagtcattg 28015588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 350
Target Start/End: Original strand, 21954485 - 21954773
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |      |||||||  ||||||||| ||| ||   | |||    
T  21954485 ataaaaataaacgatattcatttattaaaattgatagactacatcgttacaatataaatccaaaattgctaaaatgaaaaaggataaatctgcagacaaa 21954584  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||| | ||||||| ||||||| ||||||||  ||| || ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21954585 ctcagaacatccatgttaatagcataaaacggaaaaatatctatgcctgtaaatatgactatattcaagtgtccggaatactcatgactccggatctgca 21954684  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21954685 acgttgacgacgccaaa------gtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacgacactaagacg 21954773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 772879 - 772674
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||  |||||| |||    
T  772879 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaagctcacaatatccatgtta 772780  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta-tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  772779 atagtataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatttttcat-tctccgaaatactcatgtctctggatcttcaatgttgacgacgccaaa 772681  T
Q  273 gtcattg 279  Q
    |||||||    
T  772680 gtcattg 772674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 21328979 - 21329181
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21328979 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaattcacaacatccatgttaata 21329078  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||||| ||||||    | ||||||||||||||||||||| |  | || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21329079 gcataaaacggcaaagtgcacaagcctacaaatatgactatattaaaatatctggaatagtcatgcccccggatctgcaacgttgataacgccaaagtca 21329178  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  21329179 ttg 21329181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 26017326 - 26017541
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |    
T  26017326 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaac 26017425  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||| || ||||||||  |     
T  26017426 atccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccgaatttgcaacgtgaat 26017525  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  26017526 gacgccaaagtcattg 26017541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49167370 - 49167156
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  49167370 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtatatcaatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacatca 49167271  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  49167270 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatg 49167171  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||| ||||||||||    
T  49167170 acgctaaagtcattg 49167156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 207 - 356
Target Start/End: Original strand, 9719785 - 9719934
Alignment:
Q  207 aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9719785 aatatgattatattcttgtctctggaatactcatgtcttctgatctgcaacgttgactacgccaaaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaa 9719884  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9719885 agctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaat 9719934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47156830 - 47156616
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||    
T  47156830 aaaataaaagatattcattcattcaaattaaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatttgtgaacagactcacaaca 47156731  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  47156730 tccatgttaataacataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatg 47156631  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |  ||||||||||||    
T  47156630 ataccaaagtcattg 47156616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8319751 - 8319546
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||    
T  8319751 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatatagtgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaatagactcacagtatccatgtta 8319652  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| |||||| |||||| ||   |||| | || ||||| |||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8319651 atagcataaaatgacaaattacaaatgcatgcacatatggctatattcaaatctccggaacaaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 8319552  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  8319551 tcattg 8319546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43484011 - 43483819
Alignment:
Q  87 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43484011 tcaaattgatatagttcatctatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacg 43483912  T
Q  187 acaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||   | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  43483911 acaaagtattaaagcctacacatatgactatatttatgtctccggaatacctttgtctccggatctgcaacgttgatgactcaaaagtcattg 43483819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 21552123 - 21552338
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||    
T  21552123 aaaaacaaacgacattcattcatttaaattgatagagtatattgatgtaatacaaatttgctaaaaacaaaagggatgaatctatgaacaaactcacatc 21552222  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  |||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  21552223 atccatgttaataacataaaacagcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccgaaatagtcatgccttcggatctgcaacgttgat 21552322  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  21552323 gacgccaaagtcattg 21552338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29352611 - 29352388
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  29352611 ctaaaaacaaaatggatgaatcagcgaataa-ctcacaacattcatgttaatagtataaaatagaaaagtacatatgcctacaaatatgactatattcaa 29352513  T
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacct 323  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||| || | |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  29352512 gtctttggaatactcatctctccggatctgcaacgttgacgacgcaaaa------gtcattgatcgaatctacacttgcacaaagctaatctttcaacct 29352419  T
Q  324 gaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29352418 gaatcaaataaacatcgcactaagacgggaa 29352388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2532366 - 2532172
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||| |||| || ||||||    
T  2532366 attcaaattgatagagtacatcgatgtaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcacaacatgcatgttaaaagcataaaa 2532267  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||  ||||||  |  |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2532266 cggaaaagtacattagcctacaaatataactatattaaattctccggaatagccatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtcattg 2532172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 38649036 - 38649242
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  38649036 gatattcattcattcaaattagtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgtta 38649135  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtc-tccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    |||| | |||||| |||||||   | || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  38649136 atagcaaaaaacggcaaagtactaaagcttacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtcttccagatctacaatgttgacgactccaaa 38649235  T
Q  273 gtcattg 279  Q
    |||||||    
T  38649236 gtcattg 38649242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 279
Target Start/End: Original strand, 30992490 - 30992706
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  30992490 ataaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaac-aaaaggatgaatatgtgaacagactcaca 30992588  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     |||| || ||||||| |||||||| ||| |||   |||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  30992589 acatctatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcatacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgcctccggatctgcaacgtgg 30992688  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | || | |||||||||||    
T  30992689 atgatgtcaaagtcattg 30992706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 33530153 - 33530358
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  33530153 gatatgcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgtaaattcgctaaaaacaaaagagatgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgtta 33530252  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||  |||| ||| |||| ||   |  ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  33530253 ataacataacacggcaaaatacaaaaacctacacttatgactatattcaagtctccgaaatactcatgtctcaggatctgcaacgttgatgacgccaaat 33530352  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  33530353 tcattg 33530358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 19895363 - 19895567
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  19895363 atattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaataggctcacaacatccatgttaa 19895462  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| || ||||    || ||||  ||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  19895463 tagcataaaacggcacagtacaattgtctacccatatgactatatttaaatctccagaataatcatgtctccgaatctacaacgtggatgacgccaaagt 19895562  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  19895563 cattg 19895567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7986337 - 7986123
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  7986337 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtagatcgatataatacaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaggctcacaaca 7986238  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||  || ||||||||| |  |||||||||||  ||||| | |||||||||||||| || |    
T  7986237 tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacttaggactatatttaaatctccggaataaccatgtattcggatctgcaacgtggatg 7986138  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||    
T  7986137 acgtcaaagtcattg 7986123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 35362786 - 35362990
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||    
T  35362786 gatattcattcatttaaattgatagagtatatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaataaactcacaaaatccatgtta 35362885  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| | |||||| | |||||   | | ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||    
T  35362886 atagca-aaaacggctaagtacaaaaggctacacatatgattatattcaagtctccgaaatatccatgtcttcgaatctgcaacgttgacgacatcaaag 35362984  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  35362985 tcattg 35362990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40775709 - 40775498
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  40775709 aaaataaaagatattcattcatccaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaa---aaaaaggatgaatatgtgaacatgctcacaaca 40775613  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |    
T  40775612 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctctggatctgcaacgtggatg 40775513  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  40775512 acgccaaagtcattg 40775498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 45949372 - 45949562
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||           |    
T  45949372 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacgaat-cgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaactcacatca-----------a 45949459  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45949460 gcataaaacagcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagtcatgcctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 45949559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 352
Target Start/End: Original strand, 15674421 - 15674568
Alignment:
Q  205 caaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||     
T  15674421 caaatatgactatattcatgtctctggaatactcatgttttcgaatctgcaacgttgacaacgccaacgtcattgtcgttgattgaatttgcacttgcta 15674520  T
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15674521 aaagctaatctttcaacctgaataaaataaacaccacactaagacggg 15674568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37593550 - 37593392
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  37593550 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaact 37593451  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37593450 cacaatatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgtctacaaatatgacta 37593392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Original strand, 41748216 - 41748410
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41748216 attcaaattgatatagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaggataaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaa 41748315  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    || |||||||   |  |||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  41748316 cggcaaagtactaaaacctacacatataactatatttaagtctccggaatacccttgtctccagatctgcgatgttgatgactccaaagtcattg 41748410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46918834 - 46918652
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  46918834 atattcattcattcaaattaacagagtatatcgatacaatgcaaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatacatgttaa 46918735  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||| |||||||| |||||||   | ||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  46918734 tagcataaaacggcaaagtacaaaagcctatacatatgactatattcaagtctccaaaatactcatgtctctggatctgcaac 46918652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39707735 - 39707452
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||      ||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||    
T  39707735 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtggatcaatacaatacatatcgaaagtcgctaaaaatgaaaaggatgaatctgcgaacaaact 39707636  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39707635 cacagcatccatgt-aatagcacaaaacggcaaagtatatatgcatacaaatacgattatattcaagtctccggaatactcatgtctccggatatgcaac 39707537  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||| | || | |||||||      |||||| |||| |||||||||| |||  ||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39707536 gttaatgatgtcaaagtc------attgattggatctgcacttgctcaaagttaatacttcaacttgaat-aaataaacactgcactaagac 39707452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 5024730 - 5024939
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgataga----gtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  5024730 gatattcatttattcaaattggtagattgagtacatcgatacaatgaaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccat 5024829  T
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
     ||||||| || |||||||||| ||   | ||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5024830 gttaatagcatgaaacgacaaaatactaaagcctacacatttgactatatttaagtctccagaatacctatgtctccggatctgcaacattgacgactcc 5024929  T
Q  270 aaagtcattg 279  Q
    ||||||||||    
T  5024930 aaagtcattg 5024939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42491137 - 42490934
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  42491137 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgacataatgcaaattcgctaaaaacaaaa-ggataaatttgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 42491039  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||   ||| ||||| |||| |||||||| |  | |||||||||  | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  42491038 tagcataaaacggcaaagtacaaatgtctacacatattactatatttaaatatccggaataaccgtgtctccggatctgcaacgtggatgacgccacagt 42490939  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  42490938 cattg 42490934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47750167 - 47749987
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  47750167 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaacatcaaggatgaatatgtgaacagactcacaacatccatgttaata 47750068  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    | |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  47750067 gcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaataaccatgtctccagatctgcaac 47749987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38273354 - 38273076
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||      ||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  38273354 aaataaacaatatttattcatttaaattgacagagtacattgatacaatataaatccaaagtccttaaaaacaaaaaggatgaatttgctaacaaactca 38273255  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| || |||||| ||||||    
T  38273254 caacatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacatatgccaacaaatatgactatattcaagtctccgaaacactcttgtttctggatctacaacgt 38273155  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttg--cttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 342  Q
    |||||||||||||       ||||| ||||||| || |||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38273154 tgacgacgccaaa------atcatttatcggatctgaacttgctctcaaacctaatctttcaacctgaattaaataaacatcgca 38273076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 279
Target Start/End: Original strand, 22379376 - 22379592
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||     
T  22379376 taaaaataaatgatatacatccattcaaattgataaagtacatcgatgcaatgtaaattctttaaaaacaaaaaagatgaatctaagaacaatctcacaa 22379475  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    || |||| ||||||| |||||||| ||||||||  |  ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22379476 caaccatgttaatagcataaaacggcaaagtaaaaaaacctgcacatatgactatattcaagtctctggaatactcatgtcttcggatctgcaacgttga 22379575  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
     || | |||||||||||    
T  22379576 agatgtcaaagtcattg 22379592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 43806829 - 43807033
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |   ||||| ||||||| ||||    
T  43806829 atattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaagaatgatgaatctgtgaacaggatcacaacatccatgttaa 43806928  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    |||||||||||| |||  ||   |||| |||| ||||||||||||| |  | |||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  43806929 tagtataaaacggcaagatacaaatgcttacacatatgactatatttaaatatccggaatagccatatctccggatctgcaacgtggatgccgccaaagt 43807028  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  43807029 cattg 43807033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34893553 - 34893341
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||      
T  34893553 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatgaaaattcgctaaaaatattaaggatgaatctgtgaacaaactcacaat 34893454  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | | || | |||||   | |||||||||| |||||||||||     
T  34893453 atccatgttaatagcataaaacaacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagcctgcagaata--tacgtctccggatttgcaacgttgag 34893356  T
Q  264 gacgccaaagtcatt 278  Q
    ||| |||||||||||    
T  34893355 gactccaaagtcatt 34893341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 134814 - 135028
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||| ||    
T  134814 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaggctcacaaca 134913  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||| || |||   ||||||||| ||||||||||||| |  | | || ||||  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  134914 tccatgttaataacataaagcgaaaaggtacagatgcctacacatatgactatatttaaatattcgaaataaccatgtctccagatctgcaacgtggatg 135013  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  135014 acgccaaagtcattg 135028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40477152 - 40476938
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||    
T  40477152 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagaacatcaatataatgcaaattcacttaaaacaaaaaggatgaatctgtgaatagactaacaaca 40477053  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||   ||| ||||| |||| |||||||| |  ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| || |    
T  40477052 tccatgttaataacataaaacggcaaagtacaaatgtctacacatattactatatttaaatctccggaataatcatatttccggatctacaacgtggatg 40476953  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||    
T  40476952 acgtcaaagtcattg 40476938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37400046 - 37399829
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||    
T  37400046 ataaaaataaattatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaagctaaatttgtgaacagactcaca 37399947  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     |||| || ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  37399946 acatctatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctcatgaataaccatgtctccgaatttgtaacgtgg 37399847  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | |||| |||||||||||    
T  37399846 atgacgtcaaagtcattg 37399829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11002278 - 11002074
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||||| ||| ||| ||||    
T  11002278 atattcattcattcaaattaaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctatgaacaggctcacaacattcatgttaa 11002179  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  11002178 tagcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgttttcggatctacaacgtgaatgacgccaaagt 11002079  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  11002078 cattg 11002074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 279
Target Start/End: Original strand, 34594217 - 34594405
Alignment:
Q  91 attgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaa 190  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  34594217 attgatagtgtacatcgatgtaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgattaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaa 34594316  T
Q  191 agtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||   |||||||||||| ||||||||||| |    ||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34594317 agtgcatatgcctacaaacatgactatattaaaagttccggaatagtcatgccttcgggtctacaacgttgatgacaccaaagtcattg 34594405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 8611292 - 8611507
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtga-ataaactcacatc 163  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||      |||||| |    
T  8611292 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaatacgctaagaacaaaaaggatgaatatgtgagcctggctcacaac 8611391  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   || |||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||     
T  8611392 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatacctacacatatgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggat 8611491  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||| ||||    
T  8611492 gacgccaaagttattg 8611507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18754140 - 18753985
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||    
T  18754140 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcattgaacagactcacaaca 18754041  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||    
T  18754040 ttcatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgactatatt 18753985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36350581 - 36350399
Alignment:
Q  96 tagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaa 195  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||     
T  36350581 tagagtatatcaatataatacaaattcgtaaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacaacctcacaacatccatgttaatagcataaaatgacaaagtac 36350482  T
Q  196 ctatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
      |  |||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36350481 aaaaacctacacatataaccatattcaagtctccagaatact-atgtctccgaatctgcaacgttgacgacgccaaagccattg 36350399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37714931 - 37714639
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc---gctaa---aaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||   | |||   ||| ||||| ||||||| || ||| |||||    
T  37714931 aaaaataaacgatattcattcatttaaattgaccgagcacattgatacaatacaaattcaaagttaagaaaaataaaaaagatgaatatgcgaacaaact 37714832  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| | ||||  ||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  37714831 cacaacatccatgtaaataacataaaacaaaagagtatatatgcctacaaatatgactatattcacaccaccgaaatactcatgttttcggatttgcaac 37714732  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||      || | ||| |||||| | || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  37714731 gttgacgac------gtaaatgttattgattgaatctgcacttgatcaaaattaatctttcaacctgaatcaaataaacattgcactaagacggaaaat 37714639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39090534 - 39090319
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||      
T  39090534 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgataaagtacgttgatacaaggaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaacctcacaat 39090435  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  |||||| | |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||| | ||||||||| ||||     
T  39090434 atccatgttaatatcataaaatggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtcactgtaatactcatgtctctgaatctgcaacattgat 39090335  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  39090334 gactccaaagtcattg 39090319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5238391 - 5238113
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||      | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5238391 gatatttattcattcaaattgacagagtacatccatacaatacaaattcaaaatcgttaaaaataaaaaggatgaatttgagaacaaactcacatcatcc 5238292  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || ||||||  ||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |  |  ||||||||||| || | || || || |||||| |||    
T  5238291 atgttaataacataaaacgac--agtacatatg-ctacaaatatgactatattcaagccatcaaaatactcatgtttctgtatttgtaa-gttgacaacg 5238196  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
      ||||||||||  |||||    || |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5238195 taaaagtcattg--attga----atctgcatttggttaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaataccgcaccaagacgggaaat 5238113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14708026 - 14707815
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | |    
T  14708026 aaaaataagtgataatcattcattcaaaatgatagagtacattgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaaggatg-acttgtgaacaaactcataac 14707928  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    ||  || |||||| ||||||| | |||||||   | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||||||| | |||    
T  14707927 atttatgttaata-tataaaatggcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcatgtatccagaatac-catgtcttcagatctgcaacatggac 14707830  T
Q  264 gacgccaaagtcatt 278  Q
    || |  |||||||||    
T  14707829 gatgataaagtcatt 14707815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Original strand, 14733748 - 14733947
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  14733748 attcattcattcaaattgatatgatacatcaatgcaatagaaattcg-taaaaacaaaaaggataaatt-gtgaacaaactcacgacatccatgttaata 14733845  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||| | ||||||   || ||||||||||||||||||||| |  | | ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14733846 gcataaaatggcaaagtgcataagcctacaaatatgactatattaaaattttcggaataatcatgcctccggatctgcaatgttgatgacgccaaagtca 14733945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 348
Target Start/End: Original strand, 15017209 - 15017329
Alignment:
Q  229 cggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcatt-gatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaat 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  15017209 cggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacgctaaagtcattgtcattggatcggagttgcacttactcaaagctaatatttcaacctgaat 15017308  T
Q  328 caaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  15017309 caaataaacaccggactaaga 15017329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 279
Target Start/End: Original strand, 23732061 - 23732276
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||  || |||||||||||||||| || ||| |||||||||     
T  23732061 taaaaataaatgatattcattcatttaaattgataaagtacattgatataatgtaaattcgtcaagaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcaca- 23732159  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||   | || |||| |||||| |||||||| || || | |||| || | ||||| |||||||||||| ||    
T  23732160 catcaattttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcatacacatatgattatattcaagtatctgaaatagtcgtttctccagatctgcaacgtgga 23732259  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||||    
T  23732260 cgacgccaaagtcattg 23732276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24470850 - 24470658
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |  |||||| |    
T  24470850 aaaataaaagatattcattcatttaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaac 24470751  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   |||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  24470750 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgccttcacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgttttcggatctgcaa 24470658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24475798 - 24475606
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |  |||||| |    
T  24475798 aaaataaaagatattcattcatttaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaac 24475699  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   |||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  24475698 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgccttcacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgttttcggatctgcaa 24475606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25112954 - 25112672
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||||||| |  ||| |||||    
T  25112954 aaaaataaacgatagtcattcattcaaaatgatagagtacatcgatacaatataaaatcaaagtcgctaaaaataaaaaagatgaatctacgaacaaact 25112855  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||||| | | ||         |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||    
T  25112854 cacatcaacaacat---------aaaacgacaaagtgcttatgcctacaaatatgagtatattcaagtctccggaatactcgtgtctcc-aaactgcaac 25112765  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     |||||||   ||||      || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  25112764 attgacgatatcaaa------gttattgatcggatatgcacttgctcaaagttaatctttcaacttaaatcaaataaacatcgtactaagacgtgaaat 25112672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25531839 - 25531620
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25531839 ctaaaaataaaaatgatgaatttgcgaacaaaccaacaacatccatgttaatagcataaaccaacagagtatctatgcctacaaatatgactatattcaa 25531740  T
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacct 323  Q
    || |   ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||      ||  ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  25531739 gtatgtagaatattcatgtctcaggatcagcaacgttgatgacaccgaagtcattg-----aatttgatttgcacttgctcaaagctaatcattcaacct 25531645  T
Q  324 gaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  25531644 taatcaaataaacaccgcactaaga 25531620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Original strand, 35141341 - 35141499
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  35141341 gatattcattcatttaaactgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgcttaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgtta 35141440  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    ||| |||||||| ||||| ||   | || |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  35141441 ataatataaaacaacaaaatacaaaagcatacatatatgactatattcaagtcttcgga 35141499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9137859 - 9137568
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||      | | | |||||||||| |||||||| || ||| ||||    
T  9137859 aaaaataaaagatatttattcattcaaattgatagagtacatcaatttaataaaaatctaaagttgtttaaaacaaaaaaggatgaatctgcgaacaaac 9137760  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    | ||| ||||||| ||||||| |||||  || ||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  9137759 ttacaacatccatgttaatagcataaatgga-aaagtagttatgcctacaaatatgagcatattcaagtcttcggaatactcatgtatctggatttgcaa 9137661  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||       ||| | |||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9137660 cgttgacgacgccaaa------ttcaataatcatatctgca-ttgctcaaaactaatctttcaaactgaatcaaataaacattgcgctaagacgggaaat 9137568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38277150 - 38277004
Alignment:
Q  204 acaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgct 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| || |||||||    
T  38277150 acaaatatgactatattcaagtctccggaacacccatgactctgtatctgcaacgttgacgacgccaaagtc------attgatcggatttgaacttgct 38277057  T
Q  304 taaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38277056 caaagctaatatttcaacatgaatcaaataaacattgcactaagacgggaaat 38277004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43847337 - 43847238
Alignment:
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43847337 atctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaatctaatctttcaacctgaatcaaataaacacaacactaaga 43847238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 37890168 - 37890372
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||     
T  37890168 gatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatgcaaattcgttaaaaacaaataagatgaatttgcgaacaaactcacatcatccatgttg 37890267  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    | |  ||||||||  ||||||   | | ||| | ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||  |||| || |||||||| |||||||| || |    
T  37890268 acaacataaaacggaaaagtacaaaagtctagacatatgatcatattcaagtcttcggaatacacatg-atccgaatttgcaacgtggacgacgctaatg 37890366  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  37890367 tcattg 37890372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 178
Target Start/End: Original strand, 15674015 - 15674137
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||      ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||    
T  15674015 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgattgagtacatcgataaaatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaagaatgaatatgtgaacaaa 15674114  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  15674115 ctcacaacatccatattaatagt 15674137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43847440 - 43847335
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac------aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43847440 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaataaact 43847341  T
Q  158 cacatc 163  Q
    ||||||    
T  43847340 cacatc 43847335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 25854889 - 25855035
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaac-aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||| |    
T  25854889 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgat--aatgtaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatctgtaaacagactcacaacatccatgt 25854986  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||    ||| |||| |||||||||||||    
T  25854987 taatagcataaaacaacaaagtacaattgcttacacatatgactatatt 25855035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40658044 - 40657841
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| || | ||||| |||     
T  40658044 atattcattcattcaaattgatagggtacatcgatataatgcaaatttcctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacagactcgcaacgtccatgtta- 40657946  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat----gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcca 270  Q
        ||||||||||| ||||   |||| |||| |||||| |||||| ||    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  40657945 ----ataaaacgacagagtacaaatgcatacacatatgattatatttatttaagtctccggaataactatgtctccggatctgcaacgtggataacgcca 40657850  T
Q  271 aagtcattg 279  Q
    |||||||||    
T  40657849 aagtcattg 40657841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16273827 - 16273613
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaag----gatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    ||||||| |||||| |||||||    
T  16273827 aaaaataaaagatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaataaaaaggaatgatgaatatgtgaacaaactca 16273728  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || |||||| | ||  | ||||       ||||||   | ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16273727 cagcatccaca-tatgactata----tttaaagtactaaagcctacacatatgattatatttaagtctccggaatatccatgtctccggatctgcaacgt 16273633  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||  ||| ||||||||    
T  16273632 tgacgagtccagagtcattg 16273613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 35134870 - 35135037
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||||| |    
T  35134870 aaaaataaatgatattcattcattcaaatcaatatagtacatcgatacaatgcaaattcactaaaaa-taaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaac 35134968  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||   | |  |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  35134969 atccatactaataacataaaacgacaaagtacaaaagtttacacatatgactatattcaagtccccgga 35135037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10624251 - 10623977
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||       | ||||||||||| |||||||| ||  || |||    
T  10624251 ataaaaataaacgatattcattcatttaaattgattatgtacatcgatacaagacaaattaaaagttgttaaaaacaaaa-ggatgaatctgcaaacaaa 10624153  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||||||||||| ||||    || |||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||| | | |   ||||||||||| | || |||| ||    
T  10624152 ctcacatcatccatgttaaacagattaaacgacaaagtacatatgtctacaaatacgactttattcaagccactaaaatactcatgttttcgaatctaca 10624053  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||    || || ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10624052 acgttgacgacacaaaagtcattg--attga----atttgtacttgatcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaaca 10623977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23808793 - 23808659
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac------aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||      ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  23808793 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgagagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaatcaaaaaggttgaatctgtgaacaaact 23808694  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
      || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  23808693 --cagcatccatgttaatagaataaaatgacaaagta 23808659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 15123669 - 15123766
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  15123669 ataaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtagatcaatacaaagcaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcgaacaaactca 15123766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31725071 - 31724851
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||      |  | |||||||||| || |||| ||  || |||||     
T  31725071 aaaataaacgatatttattcattcaaattgaaaaagtgcatcgatacaatacaaatttaaagtcattgaaaacaaaaatgacgaatctgcaaacaaactt 31724972  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
      ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | | | ||  ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  31724971 gtatcatccatgttaataacataaaacgacagagtaaatatgcctacaaatatgattatatttaagccaccaaaatactcatgttttcggatcttcaacg 31724872  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| |||| ||| ||||||    
T  31724871 ttgacaacgcaaaattcattg 31724851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8180267 - 8180165
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac------aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  8180267 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattcatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactc 8180168  T
Q  159 aca 161  Q
    |||    
T  8180167 aca 8180165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44681908 - 44681713
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaa-acaaaaag-gatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||| |||| ||||    
T  44681908 aaaaataaatgatatccatccatccaaatggatagagtacatggatacaatgcagattcgttaaaacacaaaaaatgatgaatctgcgaacaaacgcaca 44681809  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
     ||||||| |||||||  |||||||||||||||   | | ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44681808 acatccatgttaatagcttaaaacgacaaagtacaaaagtctacatatatgactatttttaagtctctggaatacccatgtctccgaatctgcaac 44681713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 338
Target Start/End: Original strand, 14657693 - 14657794
Alignment:
Q  231 gaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||      ||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||||    
T  14657693 gaatactcatgtctccggatctgcaacattgatgacgccaaa------gtcattgatcgaatatgcatttgctcaaagttaatctttcaatctgaatcaa 14657786  T
Q  331 ataaacac 338  Q
    ||||||||    
T  14657787 ataaacac 14657794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Original strand, 26638349 - 26638497
Alignment:
Q  126 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgt 225  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  26638349 aaaaacaaaaatgacaaatctgtgaataaactcacaacatccatgttattatcataaaacgacaaagtccttatgcatacaaatatgaatatattcaagt 26638448  T
Q  226 ctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
     |||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| | ||||||    
T  26638449 gtccaaaatactcatgtcttcggatctacaatgttcacgaagtcaaagt 26638497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 278
Target Start/End: Original strand, 25876557 - 25876764
Alignment:
Q  80 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||       ||| || ||||||||||||||||  ||| |||||| ||  |||||| |||    
T  25876557 cattcattcaaattgatagagtatatttatacattacaaattcaaagtacctagaagcaaaaaggatgaatttacgaacaaactcgcagtatccatgtta 25876656  T
Q  174 atagtataaaa---cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcca 270  Q
     ||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||  |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||    
T  25876657 gtagcataaaattacgacaaagtacatatgcctacaaatatgattatattcaagttttcagaatgttcatgtcttcggatctgcaatgttgacaacgtca 25876756  T
Q  271 aagtcatt 278  Q
    || |||||    
T  25876757 aaatcatt 25876764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46881659 - 46881502
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||| |  ||||||| |||||||      |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  46881659 aaaaataaacgatgttcattcatgtaaattgattgagtactttaatacaatgcaaattcaaaattgctaaaaacaaaaatgacgaatttgtgaacaaact 46881560  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
       | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  46881559 tgtaacatccatgttaatagtataaaacgacatagtacatatgcctataaatatgact 46881502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 31254785 - 31254949
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||| || |    ||| |||||    
T  31254785 aaaaataaaggatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatacaaattcaaagttgctaaaaataaaaaggacgattcgacgaacaaact 31254884  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||| |||  |||||||||  |||||  |||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  31254885 cacaacatatatattaataacataaattgacatagtacacatgcctacaaatatgagtatattca 31254949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 356
Target Start/End: Original strand, 27050229 - 27050424
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||| |||| |||||||||||| || ||||   || |||| ||||   |||||||| |||||    
T  27050229 aaactcacatcattcatattaataacataaaacgaaagagtacctatacctacaaatatgcctgtattagagtttccgaaatat--atgtctcctgatct 27050326  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    |||||| |||||||| |||  | ||||  |||||     | |||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27050327 gcaacgctgacgacgtcaacataattg--attgag----tctgcatttgctcaaagctaatctttcgacatgaatcaaataaacaccgcactaagacgag 27050420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 176
Target Start/End: Original strand, 32587196 - 32587311
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacat--cgatacaata-caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcac 160  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  32587196 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgatcgagtacattacaatacaatttcaaagtcactaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcac 32587295  T
Q  161 atcatccatattaata 176  Q
    | ||||||| ||||||    
T  32587296 aacatccatgttaata 32587311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 279
Target Start/End: Original strand, 6646321 - 6646484
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||    
T  6646321 caaactcggtaaaaacaaaaatgatgaatcgacgaataaactcacaacatccatgttaatagcataaaatggtagagtacatatgcctacaaatatgact 6646420  T
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||     ||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||    
T  6646421 atattcaaactaccgaaatactcatatttctggatctgcaacattgacgatgcaaaaatcattg 6646484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 156
Target Start/End: Original strand, 14657575 - 14657673
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaa------attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14657575 aaaaataaaagatattcattaattcaaattgattaagtacattgatacaatacaatttcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaataaac 14657673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 182
Target Start/End: Original strand, 7765531 - 7765656
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaa-ttgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||| ||||| ||| || ||| |||     
T  7765531 aaaaataaacgatattcattaattcaaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtatctaaaaataaataggataaatatgcgaacaaat 7765630  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataa 182  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7765631 tcacaacatccatattaatagcataa 7765656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 194
Target Start/End: Original strand, 28314298 - 28314411
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  28314298 attcgttcaaattgatagagtacatcgttacaatacatatttactaaatataaaaaggatgaatatgcaaacaaactcacaacatccatgtgaatagaat 28314397  T
Q  181 aaaacgacaaagta 194  Q
    |||| | |||||||    
T  28314398 aaaatgtcaaagta 28314411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22751847 - 22751657
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||   || ||| ||| ||||| |    
T  22751847 aaaaataaatgatatt-attcactcaagtttatagagtacatcgatacaatataaattcgttaaaaacaaacaagacgaggctgcgaacaaattcacaac 22751749  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    ||| || ||||||  ||||||||  ||||||   | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |   ||||||| |||||||||    
T  22751748 atctatgttaataacataaaacggtaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaattctccggaaaagctatgtctctggatctgca 22751657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32083681 - 32083598
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaattt 146  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  32083681 taaaaataaatgatatttattaattcaaattgatagagtacgtcgatacaatacaaatttgttaaaaataaacatgatgaattt 32083598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 32312967 - 32312916
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 115  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312967 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 32312916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 111
Target Start/End: Original strand, 48643480 - 48643527
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48643480 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac 48643527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 351
Target Start/End: Original strand, 27704834 - 27705026
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||  |||||||||  | | ||||||||||| | |  || ||||||||||| | |||||||    
T  27704834 aaactcacaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacatatgcctaccgaaaagactatattcaagccatcgaaatactcatgttttcggatct 27704933  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    ||||  |||||||||| ||| || |||  |||||    || ||| | |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27704934 gcaattttgacgacgcaaaattctttg--attga----atctgcgcgtaataaaaactaatctttcaacttgaatcaaataaacactgcattaagacgg 27705026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17222563 - 17222384
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat-----tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || |     ||  |||||||||||||||||||| ||  || | ||||    
T  17222563 aaaaataaatgatatgaattcattcaagttgatagagtacatggatataataaaattgaaagtcattaaaaacaaaaaggatgaatctggaaacatactc 17222464  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcat 240  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  17222463 acatcatccat-ttaatagcat-aaacgaaaaagtatttatgcatataaatatgattatattcaagtctctgaaatactcat 17222384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20206244 - 20206195
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20206244 cgatattcattcattcaaattgacagagtacatcgatacaacacaaattc 20206195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38277264 - 38277208
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  38277264 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacgatataaat 38277208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 5948644 - 5948801
Alignment:
Q  125 taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatg 224  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||   |  |||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  5948644 taaaaacaaaaaagatgaatatgcgaacaaactcaaaacatttttggtaatggcataaaacgacagagtatctatgcttacaagtatgattatattcaag 5948743  T
Q  225 tctccggaatactca---tgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    | |  ||||||||||   |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  5948744 tatatggaatactcatgttgtctccgtatctgcaacgctggcaacgccaaagtcattg 5948801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6496126 - 6496059
Alignment:
Q  282 attgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6496126 attgatcggatctgcacttgttcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacattgcactaagac 6496059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37593326 - 37593279
Alignment:
Q  309 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37593326 ctaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacgggaaat 37593279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 28407722 - 28407837
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  |||||||||||| ||||| | ||| || ||| ||||||||| ||||||  |    
T  28407722 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc----aaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtaaatctgcgaacaaactcacagcatccaagt 28407817  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  28407818 taatagcatacaacggcaaa 28407837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 34871148 - 34871206
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34871148 aaaagtaaacgatattcatttatacaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 34871206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Original strand, 37837253 - 37837377
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||||     
T  37837253 aaaaacaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacag 37837348  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaa 191  Q
    || |||  ||||||| |||||||| ||||    
T  37837349 cacccaagttaatagcataaaacggcaaa 37837377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9934115 - 9934074
Alignment:
Q  238 catgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9934115 catgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcattg 9934074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 9977014 - 9977129
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||  |    
T  9977014 cgatattcattcatttaaattgatagagtacatcagatacaa-aca---ttgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaaaaaattcacaacatccaagt 9977109  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  9977110 taatagcatacaacgacaaa 9977129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43098881 - 43098808
Alignment:
Q  206 aaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  43098881 aaatatgactatattcatgtctacagaatactcatgtctctagctctgcaacattgacaacttcaaagtcattg 43098808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32312906 - 32312810
Alignment:
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||| | ||| |||||||||| ||||    
T  32312906 ttaatagcataaaacgacaaactacataagcctccaaatatgactatattcaagtctccgaaatagtaatgcctctgaatcggcaacgttgatgacg 32312810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 161
Target Start/End: Original strand, 33901983 - 33902085
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat-------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| ||       ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33901983 aaataaacgatattcattcacttaaattgatagaatatattgatacaatacacattcaaaggtcgttaaaaacaaaaaggattaatttgcgaataaactc 33902082  T
Q  159 aca 161  Q
    |||    
T  33902083 aca 33902085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6622842 - 6622795
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  6622842 cgatattcattcattcaaactgatagaatatatcgatacaatacaaat 6622795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17222353 - 17222306
Alignment:
Q  232 aatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17222353 aatacttatgtctccggatctacaacgttgatgacgccaaagtcattg 17222306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5436186 - 5436136
Alignment:
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5436186 attaatagcataaaatggcaaagtatctatgcctacaaatatgactatatt 5436136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 10250185 - 10250246
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  10250185 ttcattcattcaaattgatagagtatat-gatacaacgaaaattcgctaaaaacaaataggat 10250246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 15017107 - 15017165
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15017107 aaaattaaacgatatttattgattcaaattgataaaatacatcgatacaatacaaattc 15017165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 24533553 - 24533611
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24533553 aaaaataaaagatatttattcaatcaaattgatagagtacatcaatataatacaaattc 24533611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Original strand, 26638497 - 26638579
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||    
T  26638497 tatgcatacaaatatgaatatattcaagtgtccaaaatactcatgtcttcggatctacaatgttcacgaagtcaaagtcattg 26638579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 33095790 - 33095848
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  33095790 aaaaataaacgatattcattcattcaaatcgataaaatacatcgatataattcaaattc 33095848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 35306163 - 35306358
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata-----caaattcgctaaaaa-caaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      ||| | | ||||||  |||||| || ||| ||  || |||||||||  |||||    
T  35306163 atattcattcattcaaattaatagagcacatcgatacaataaaatttaaagtggttaaaaataaaaaagaataaatctgcaaacaaactcacactatcca 35306262  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac----tatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
    | |||||||||||||||| || ||||  |   |||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  35306263 tgttaatagtataaaacggcagagtacattcacctataaatatgactctatatattcaagtctccggaatactaatgttttcggatcttcaacgtt 35306358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35911895 - 35911813
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||| || |||||||| |||| || ||| ||||||||| |||||    
T  35911895 attcaaattgatagagaatatcgatgcaatacgaattcactaataataaaaaggaagaatatgcgaaaaaactcacaacatcc 35911813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 37375946 - 37375992
Alignment:
Q  310 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  37375946 taatctttcaacctgaatcaaataaactacgcactaagacggaaaat 37375992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 356
Target Start/End: Original strand, 43256437 - 43256511
Alignment:
Q  282 attgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43256437 attgatggaatatgcacttaattaaagttaatatttcaacttgaatcaaataaacacctcactaagacggaaaat 43256511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14762473 - 14762357
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||      |||||| |||||| |  ||||||||||  || ||||||| | ||||||    
T  14762473 atatttattcattcaaattgatagattacattgatactatacaaattcaaagtcgctataaacaacacagatgaatttgcaaacaaactcataacatcca 14762374  T
Q  169 tattaatagtataaaac 185  Q
    | ||||||| |||||||    
T  14762373 ttttaatagcataaaac 14762357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14810920 - 14810816
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac-aatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |     
T  14810920 cgatatttattcattaaaattgatagagtata-caatacaaatagaaaattgctaaaaataaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatccaaaa 14810822  T
Q  172 taatag 177  Q
    ||||||    
T  14810821 taatag 14810816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15257915 - 15257811
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac-aatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |     
T  15257915 cgatatttattcattaaaattgatagagtata-caatacaaatagaaaattgctaaaaataaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatccaaaa 15257817  T
Q  172 taatag 177  Q
    ||||||    
T  15257816 taatag 15257811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17611681 - 17611648
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17611681 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 17611648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Original strand, 34899412 - 34899526
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||  ||    
T  34899412 gatatttattcattcaaattgatagagtacatc----aaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagtt 34899507  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||| ||| |||| ||||    
T  34899508 aatagcatacaacggcaaa 34899526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 39989843 - 39989900
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  39989843 aaaaataaatgatattcatgcattcaaattgatagagtacgtcaatacaatataaatt 39989900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 102
Target Start/End: Original strand, 15670462 - 15670502
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagta 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15670462 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgattgagta 15670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17230505 - 17230413
Alignment:
Q  123 gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    ||||||||||||||  |||||| || ||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  17230505 gctaaaaacaaaaatcatgaatctgcgaacaacctcacaacatccatgttaatagcataaaatcacaacgtatttatgcctacacatatgact 17230413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35261586 - 35261554
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261586 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 35261554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46881415 - 46881339
Alignment:
Q  280 tcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| | || || ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  46881415 tcattgattgaatttgaacttgatcaaaactaatatttcaacctaaatcaaataaacattgcactaagacggaaaat 46881339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15336086 - 15336051
Alignment:
Q  200 gcctacaaatatgactatattcatgtctccggaata 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15336086 gcctacaaatatgactatattcaagtctccggaata 15336051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35562791 - 35562736
Alignment:
Q  87 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatga 142  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  35562791 tcaaattgacaaagtatatcgatacaatacaaattcgttaaaaacaagaagaatga 35562736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22493254 - 22493204
Alignment:
Q  296 cacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22493254 cacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaagatcgcactaa 22493204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35133254 - 35133212
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35133254 aaaaataaaggatattcattcattcaaattgatagaatacatc 35133212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 35544815 - 35544870
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35544815 aaaaataaactatatttattcattcaaattgatagagt--atcgttacaatacaaatt 35544870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 8001350 - 8001465
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| || |||  |    
T  8001350 cgatattcattcattcaaatcgatagagtgcatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagt 8001445  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  8001446 taatagcatacaacggcaaa 8001465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 12141111 - 12141144
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12141111 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 12141144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17223370 - 17223293
Alignment:
Q  279 gtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||| ||| ||| |||  | ||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  17223370 gtcattgatcagatctgcgcttaatcaaagctagtctttctacctgaatcaaataatcatcgcactaagacaggaaat 17223293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 25286992 - 25287025
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25286992 cgatatttattcattcaaattgatagagtacatc 25287025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 28044560 - 28044593
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28044560 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 28044593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Original strand, 31235613 - 31235678
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  31235613 tcgctaaaaacgtaaagaatgaatttgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacg 31235678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 31481891 - 31481924
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31481891 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 31481924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 225
Target Start/End: Original strand, 39544776 - 39544869
Alignment:
Q  132 aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgt 225  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||||   || |||| |||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  39544776 aaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatccatgttaataacataaaatcgcacagtacctatacctaaaaatttgactatattcatgt 39544869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40993444 - 40993329
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| || |||  |    
T  40993444 cgatattcattcatttaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagt 40993349  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||  ||| |||||||||    
T  40993348 taataacatacaacgacaaa 40993329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46700321 - 46700288
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46700321 cgatattcattcattctaattgatagagtacatc 46700288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 48061709 - 48061676
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48061709 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 48061676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 2843237 - 2843281
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2843237 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 2843281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 10037931 - 10037971
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10037931 atattcattctttcaaattgatagaatacattgatacaata 10037971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 14627875 - 14627919
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14627875 atctttcaatatgaatcaaataaacaccgtactaagacgagaaat 14627919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Original strand, 27706290 - 27706342
Alignment:
Q  92 ttgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  27706290 ttgatagagtatattgatacaatacaaatttgctaaaataaaaaatgatgaat 27706342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31703444 - 31703368
Alignment:
Q  280 tcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| | |||| |||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  31703444 tcattgattgtatatacacttattcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaatactacactaagacggaaaat 31703368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 32116481 - 32116537
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  32116481 tgcacttgatcaaaactaatttttcaacgtgagtaaaataaacaacgcactaagacg 32116537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 342
Target Start/End: Original strand, 32571747 - 32571795
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 342  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32571747 tgcatttgctcaaaactaattttttaacctgaatcaaataaacatcgca 32571795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 121
Target Start/End: Original strand, 43998651 - 43998683
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43998651 aaattgatagagtacatcgatataatacaaatt 43998683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46339298 - 46339234
Alignment:
Q  125 taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||| |||||||    
T  46339298 taaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacgaca 46339234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 165)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10148403 - 10148113
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  10148403 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatacaaatcctaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaact 10148304  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10148303 cacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactatatttaagtctccgaaatactcatgtctccggatctgcaac 10148204  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10148203 gttgacgacgctaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaaga 10148113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 81 - 356
Target Start/End: Original strand, 10338510 - 10338791
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  10338510 attcattcaaattaatagagtacatcaatgcaatagaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 10338609  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10338610 tagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactatatttttgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 10338709  T
Q  275 cattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10338710 cattgttattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 10338791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 2234132 - 2234439
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2234132 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgattatgtgaataaact 2234231  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||         |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  2234232 cacatcatccatattaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctaaaaatatgactaatatgactatattcatgtctttggaatactcatgcctccgg 2234331  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2234332 atctgcaacgttgacgacatcaaattcattgttattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 2234431  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  2234432 cggaaaat 2234439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Original strand, 14600360 - 14600661
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  14600360 aaaaataaacgatatttattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaact 14600459  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  14600460 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatacttatgtctctgg 14600559  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14600560 atctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 14600659  T
Q  349 cg 350  Q
    ||    
T  14600660 cg 14600661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31202915 - 31202618
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  31202915 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgtgaacaaact 31202817  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  31202816 cacaacatccatgttaatagtataaaatggcaaagtacctatgcctacaaataggactatatttatgtctctggaatactcgtgtctctggatctgcgac 31202717  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31202716 gttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgatcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagactggaaat 31202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 73 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11162344 - 11162043
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  11162344 cgatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatatgggaacaaactcacaacatc 11162245  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac------------tatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgc 254  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||            |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11162244 catgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgacgactaatatgattatattcaagtctccggaatactcatatttccggatctgc 11162145  T
Q  255 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11162144 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactgcgacgggaa 11162045  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  11162044 at 11162043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 24790832 - 24791137
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  24790832 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaa--aaaaggatgaatctgtgaacaaact 24790929  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||||         ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  24790930 cacaacatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatatatccggaatactcatgtctctgg 24791029  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  24791030 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgattcaaataaacaccaaactaaga 24791129  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  24791130 cgggaaat 24791137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4757617 - 4757325
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4757617 ataaaactaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaa 4757518  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| ||| |||||||||||||||    
T  4757517 ctcacaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcaagtctccggatctgca 4757426  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4757425 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaaa 4757326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Original strand, 7579527 - 7579824
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  7579527 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaatttgctagaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaaactcacaacatcc 7579626  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| |  |||| |||||||||         |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7579627 atgttaatagcataaaacgtcaaagcatttatgtctacaaatatgagtaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctctggatctgcaacg 7579726  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7579727 ttggcgacgccaaagtcattgtcattaatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 7579824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37613103 - 37612813
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      | |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37613103 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 37613004  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||| ||||||||||||||    
T  37613003 cacatcatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtatccggatctgcaac 37612912  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37612911 gttgaagacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcaattgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 37612813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Original strand, 31407424 - 31407717
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |    
T  31407424 atatccattcattcaaattgatatagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaag-atgaatctgtgaacaaactcacatcat--a 31407520  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31407521 tgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgactccggatctgcaatgt 31407620  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31407621 tgacgaagccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacaggaaat 31407717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 75 - 351
Target Start/End: Original strand, 2024897 - 2025188
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  2024897 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatcca 2024996  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||         |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2024997 tgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgtctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctccggaataatcatgtctccggatctgcaacgt 2025096  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2025097 tgacgatgccagaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 2025188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 30026544 - 30026851
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  30026544 aaaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaact 30026643  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||         |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30026644 cacagtatccatgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatattcatgtctccgg 30026743  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30026744 atctgcaacgttgaagatgccaaagtcattgtcattgatcagacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacatgaatcaaataaacaccgcactaaga 30026843  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  30026844 cgggaaat 30026851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 319
Target Start/End: Original strand, 23970850 - 23971115
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac-aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  23970850 aaaaataaacgatatacattcgttcaaattgatagagtacatcgatacaataccaaatccgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaa 23970949  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctg 253  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  23970950 catccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaaaatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctttggatttg 23971049  T
Q  254 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttca 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  23971050 caacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttca 23971115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 355
Target Start/End: Original strand, 32778645 - 32778925
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  32778645 atattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaattcaaatccaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcgaacaaactcacaacaacca 32778744  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32778745 tattaatagcataaaacggcaaagtacctatggctacaaatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtctccagatctgcaaagttgacgacgc 32778844  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
     |||      |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32778845 aaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagatgggaaa 32778925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 353
Target Start/End: Original strand, 1809901 - 1810188
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  1809901 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa----------acaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaaca 1809990  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatg---------actatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    ||||  ||||||| |||||  | |||||||  ||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1809991 tccaagttaatagcataaagtggcaaagtacatatgcctacaaatatgactagtatgactatattcatgtccccggaatactcatgtctccggatctgca 1810090  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggga 353  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1810091 acgttggcgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatttacacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcgctaagacggga 1810188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 39067352 - 39067658
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||      |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  39067352 aaaaataaacgatattcattcttttaaattgatagagtatatcgatactatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaact 39067451  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    || | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  39067452 cagagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatacaactatattcatgtctccggaata-tcatgtctctgg 39067550  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39067551 atctgcaacgttggcgacgccaaagtcattgtcatcgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacatgaatctaataaacaccgcactaaga 39067650  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  39067651 cggaaaat 39067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41362202 - 41361892
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaa-aggatgaatttgtgaataa 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||| |||| ||||||||| | |||| ||    
T  41362202 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcatttacgctaaaaaaaaaagaggatgaatctatgaacaa 41362103  T
Q  155 actcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctc 245  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||         ||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  41362102 actcacaacatccatgttaatagcataaaacggcagggtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaactctccagaatcctcatgtctc 41362003  T
Q  246 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 345  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41362002 tggatctgcgacgttgacgacaccaaagtcattgacattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 41361903  T
Q  346 agacgggaaat 356  Q
    | |||||||||    
T  41361902 aaacgggaaat 41361892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19720480 - 19720169
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgat----agagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaata 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||| | |    
T  19720480 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgattgatagagtacatcgatacaatacaaatcgaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtggaca 19720381  T
Q  154 aactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtct 244  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19720380 aactcactgcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtgcctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtct 19720281  T
Q  245 ccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcact 344  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  19720280 tcggatctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgttattgatcggacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataattaccgcatt 19720181  T
Q  345 aagacgggaaat 356  Q
    |||||| |||||    
T  19720180 aagacgagaaat 19720169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 13575869 - 13576163
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13575869 ataaaaatagacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacatatccaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaa 13575968  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13575969 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcttaaaaatacgactatattcaagtctcaggaatactcatttctccggatctgca 13576068  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    || |||| || ||||||      ||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  13576069 acattgaagatgccaaa------gtcgttgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaatctgaatctaataaacaccgcactaagacggaaaa 13576162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 43936842 - 43937146
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43936842 aaaaataaacgatatttattcattcgaattgatagagtagatcgatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 43936941  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||         |||| | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  43936942 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctataaatatgactagtatgattgtatttaagtctccggaatcctcatgtcttcgg 43937041  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    || ||||   |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43937042 atatgca---ttgacgacgctaaaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 43937138  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  43937139 cgggaaat 43937146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Original strand, 28296778 - 28297076
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  28296778 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggttgaatctgtgaacaaactc 28296877  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaact-atgcctacaaatatga---------ctatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28296878 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtaccttatgcttacaaatatgaataatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtgtccgg 28296977  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||         |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28296978 atctgcaacgt---------caaagtcattttcattgatcggatctgcagttgctcaaatctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 28297068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 356
Target Start/End: Original strand, 3204472 - 3204754
Alignment:
Q  88 caaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtata 181  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||      ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  3204472 caaattgatatagtatatcgatacaatataaattcaaattcactaaaaacaaaaatgatgaatctttgaacaaactcacatcatccatgttaataacata 3204571  T
Q  182 aaacgacaaagtaactatgcctacaaatat---------gactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3204572 aaacggcaaagtaactatgcc-acaaatataactaacatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgaccacgccaaa 3204670  T
Q  273 gtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3204671 gtcattgtgatttatcggatatgcacttgctcaaagttaatctttcaacttgaatcaaataaacactgcactaagacgagaaat 3204754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9502035 - 9501746
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||  ||||| ||| || |||||    
T  9502035 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaagttcgctaaaaacaaaaagc-tgaatctgtaaacaaact 9501937  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||| ||||||    
T  9501936 cacaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacttattcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatttgcaac 9501845  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9501844 gttgacgaaaccaaagtcgttgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacaaagacgggaaat 9501746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12330036 - 12329787
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac- 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  12330036 caaattcgctaaaaacaaaaaggaagaatctgggaacaaattcacagcatccgtgttaatagcataaaacgacaaagtatctacgcctacaaatatgacc 12329937  T
Q  215 --------tatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
            ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  12329936 aatatgactatatccatgttttcgaaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaa 12329837  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12329836 agctaatttttcaacctaaatcaaataaacaccgcattaagacgggaaat 12329787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 16937007 - 16937222
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16937007 aaaaataaaagatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgcttaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatc 16937106  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16937107 atccatgttaatagcataaaacaacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctctagatctgcaacgttgac 16937206  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16937207 gactccaaagtcattg 16937222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22787952 - 22787652
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa-tacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcac 160  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | ||  |||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22787952 ataaaaataaacgatatttattcattcaaattgatatcg-atata-atacaaatccaagttcgctgaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcac 22787855  T
Q  161 atcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatc 251  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||         ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22787854 agcatccatgttaatagcataaaacagcaaagtagatatgcctacaaatacgattaatatgattatatttatgtctccggaatacccatgtctccggatc 22787755  T
Q  252 tgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22787754 tgcaatgttgacgacgccaaagtcattctcattgatcg--tctgcatttactcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 22787657  T
Q  352 gaaat 356  Q
     ||||    
T  22787656 aaaat 22787652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24700301 - 24699992
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  24700301 aaaaataaacgatat-cattcattcaaattcatagagtacatcgatacaattcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaact 24700203  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaac---gacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctc 245  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||   | ||| |||  ||||||||||||||||||||         |||| | ||||| | |||| || ||||||    
T  24700202 cacaacatccatgttaatagcataaaacagtgccaacgtacatatgcctacaaatatgactaatataaatatattaaagtctctgaaatattcgtgtctc 24700103  T
Q  246 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24700102 cggatctgcaacgttgacgacgacaatgtcaatgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 24700003  T
Q  346 agacgggaaat 356  Q
    | |||||||||    
T  24700002 acacgggaaat 24699992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31308592 - 31308308
Alignment:
Q  87 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||| ||| ||    
T  31308592 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaagttcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatagcatccatgttattagcat 31308493  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaa 271  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||         |||| | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31308492 aaaactgcaaagtatttatgcctacaaatatgactaacatgactatatttaagtctccaaaatattcatatctccggatctgcaacgttgacgacaccaa 31308393  T
Q  272 agtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  31308392 agtcgttgtcattgatcggatctgcacttgttcaaaactattctttcaacctgaattaaataaacatcgtactaaaacgggaaat 31308308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 116 - 356
Target Start/End: Original strand, 37128215 - 37128456
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||        ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  37128215 caaattcattaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacatg-------ttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgact 37128307  T
Q  216 a---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
    |         |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  37128308 aatatgattatattcatgtctctgaaatactcatgtctccggatctgcaa-gttgacgacgccaaagtcattgttattgatcggatctgcacttgctcaa 37128406  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37128407 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaat 37128456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24210690 - 24210408
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||    
T  24210690 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaataaaaattcaaatttgctaaaaacaaaaag-atgaatttgtgaacaaactcacagcatgtatgttaa 24210592  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacga 265  Q
    ||   |||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24210591 taacttaaaacggaaaaatatttatacctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctctggatctgcaacgttgacga 24210492  T
Q  266 cgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24210491 cgccaaagtctttgtgaatgatcggatctacacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaataccgcactaagac 24210408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41996989 - 41996774
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |    
T  41996989 aaaaataaatgatattcattcatttaaattgatcgagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaac 41996890  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||     
T  41996889 atccatgttaatagcataaaacgacaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagctatgtctccggatctgcaacgtggat 41996790  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  41996789 gacgccaaagtcattg 41996774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 12248379 - 12248594
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  12248379 aaaaataaatgatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcgcatc 12248478  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||| ||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  12248479 atccatgttaataacataaaacggcaaaatactaaagcctacacatatgactatatttaagtctctggaatacccatgtctctgaatctgcaaagttgac 12248578  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12248579 gactccaaagtcattg 12248594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Original strand, 32256410 - 32256604
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  32256410 attcaaattgacagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatattaataacataaaa 32256509  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    || |||||||   | ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32256510 cggcaaagtactaaagccgacacatatgactatatttaagtctccggaatacccttgtctccggatctgcaacgttgatgactccaaagtcattg 32256604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44295761 - 44295547
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||    
T  44295761 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacatca 44295662  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  44295661 tccatgttaataggataaaacggcaaagtacaattgcctacatatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 44295562  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||    
T  44295561 acgtcaaagtcattg 44295547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Original strand, 13570429 - 13570701
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||       | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  13570429 aaaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatttaaatttgttaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaact 13570528  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||                 ||||||||||||    
T  13570529 cacaacatccatgttaatagcataaaacggca--gtacctatgcctacaaacatgactatattcatatctc-----------------cggatctgcaac 13570609  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13570610 gttgacgatgccaaagtcattgtaattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccacactaagac 13570701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 14530597 - 14530799
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  14530597 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacagattcattaaaaacaaaaatgatgaatctgtgagcaaactcacaacatccatgttaata 14530696  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14530697 gcataaaacggcaaagtacacaagcctataaatatgactatattaaaatctccggaatagtcatgcctccggatctgcaacgttgatgccgccaaagtca 14530796  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  14530797 ttg 14530799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5526269 - 5526033
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  5526269 aaaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataagttcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaact 5526170  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    | || |||| || ||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||         |||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  5526169 cgcagcatctatgttaatagcataaaacgacaaggtacatatgtctacaaatatgactaatatgaatatattcaagtctccagaattctcatgtctccgg 5526070  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattg 285  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5526069 atctgcaacgttgatgatgccaaagtcattgtcattg 5526033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 3925359 - 3925573
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  3925359 aaaaataaatgatattcattcattcaaatgggtagagtacatcgatacatga-aaatttgctaaaaacaaaactgatgaatctgtgaacaaactcacatc 3925457  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||||||   | ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3925458 atccatgttaataacataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgattatatttaagtctccggaatactcatgtctccaaatctgcaacgttgac 3925557  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  3925558 gactccaaagtcattg 3925573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 8054476 - 8054690
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |    
T  8054476 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacccgctcacaac 8054575  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  ||||||||||||||||||| || ||     
T  8054576 atccattttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaatagccatgtctccggatctgcaa-gtggat 8054674  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  8054675 gacgccaaagtcattg 8054690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9993111 - 9992902
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  9993111 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaaca 9993012  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||| | ||||||| |||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |    
T  9993011 tccgtgttaatagcataaaacagcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtct-cggatctgcaacgtggatg 9992913  T
Q  265 acgccaaagtc 275  Q
    |||||||||||    
T  9992912 acgccaaagtc 9992902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10043195 - 10043003
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  10043195 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaag-ataaatctctgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaa 10043097  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||| |||   ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10043096 cgacaaagta-ctaaagctacacatataactatatttaagtctccggaatacacatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagttattg 10043003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 38545930 - 38546115
Alignment:
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38545930 catccatgttcatagcataaaacggcaaagtatctatgcctactaacatgactatattcaagtctccggaatacttatgtctccggatctgcaacgttga 38546029  T
Q  263 cgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  38546030 cgacgccaaa-tctatgtcattgatcggatatgcatttggtcaaagttaatctttcaatctgaatcaaataaacatcgtactaagac 38546115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2968982 - 2968692
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||| ||||||| | ||| |||||| |||||| ||||     
T  2968982 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacatattcaaagtcgttaaaaacgataagaatgaatctgtgaacaaaca 2968883  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    || ||||||||| ||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||| |  |||||| | |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  2968882 catatcatccatcttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatacggttatattaaag--tccggaatacgcatgtctccagatatgcaat 2968785  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||| ||| |||||      |||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2968784 gctgatgacaccaaa------gtcattgatcggatttgcacttgctcaaagcggatctttcaacctgaatcaaataaataccgcactaagacggaaaat 2968692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5457517 - 5457302
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| |    
T  5457517 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacatgctcacaac 5457418  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    | ||||  |||||| |||||||||||| |||   ||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  5457417 acccatgctaatagcataaaacgacaaggtacaaatggctacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggat 5457318  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||||| ||||    
T  5457317 gacggcaaagttattg 5457302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 12243884 - 12244099
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  12243884 aaaaattagagatattcattcgttcaaactgatagagtacatcgatataatgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaac 12243983  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||   | ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12243984 atccatgttaataacataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatataactatattcaagtctctggaatacccatatctccggaactgcaacattgac 12244083  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    |||  |||||||||||    
T  12244084 gacatcaaagtcattg 12244099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Original strand, 18190532 - 18190675
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18190532 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatattaata 18190631  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    | ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  18190632 gcataaaacgacaaagtacacaagcctacaaatatgactatatt 18190675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15665987 - 15665770
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||  || ||||||||| |    
T  15665987 aaaaataaatgacattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgccaaaaacaaaaaggacgaatctgcaaacaaactcacaac 15665888  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatat--gactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||    | |||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15665887 atccatgttaatagcataaaacggcatagtgcaaaagcctaccaatatgagactatattcaagtctccgaaatacccatgtctccggatctgcaacgctg 15665788  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  15665787 atgacaccaaagtcattg 15665770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 27534093 - 27534295
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  27534093 attcatttatttaaattgaaagagtacatcgatgcaatacaaattcactaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacattcatgttaata 27534192  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27534193 gcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctacggaatagtcacgtttccggatatgcaacgttgatgacgcctaagtca 27534292  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  27534293 ttg 27534295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32062223 - 32062025
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  32062223 attcatttaaaatgatatagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaataaaaaggatcaatgtgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcat 32062124  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||   || || |||||||||||||||||| |  |||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32062123 aaaacgacaaagtgcataagcatacaaatatgactatattaaaatctttggaatagccatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtcattg 32062025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37720268 - 37720075
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||| || ||||||||||||||| ||    
T  37720268 attcattcaaattgatagagtacatcgat-caatgtaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctccgaacaaactcgcagcatccatattaatagcat 37720170  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtc 275  Q
    ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  37720169 aaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctacggaatacctatgtctctggatctgcaacgttgatgaagccaaagtc 37720075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 279
Target Start/End: Original strand, 1215023 - 1215224
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatag 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||     
T  1215023 ttcattcatttaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacaacatcaatgttaataa 1215122  T
Q  178 tataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
     ||||||||||||||||  || ||||||| || | |||| ||| |  |||| |||||| || || ||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1215123 cataaaacgacaaagtacataagcctacatatgtaactacattaaaatctctggaatagtcctgcctcgggatctgcaacgttgatgaggccaaagtcat 1215222  T
Q  278 tg 279  Q
    ||    
T  1215223 tg 1215224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23767185 - 23766971
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||| || |    
T  23767185 aaaaataaacaatattcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaatgaaaattcgctagaataaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcccagc 23767086  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| || ||||   | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23767085 atccatgttagtagcataaaacggcagagtattaaagcctacacatatgactatatttatgcctccgg-atacccatgtttccggatctgcaacgttgac 23766987  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  23766986 gactccaaagtcattg 23766971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 16937950 - 16938160
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||  |||||| |||    
T  16937950 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaagcatgaatctgcgaacaaactcacagaatccatgtta 16938049  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata-----tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    |||  ||||||| ||||||||   | ||||||| |||     |||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16938050 ataccataaaacaacaaagtacaaaagcctacacatatgacttgactatatttaagtcttcggaatacccatatctccggatctgcaacgttgacgacac 16938149  T
Q  269 caaagtcattg 279  Q
     ||||||||||    
T  16938150 aaaagtcattg 16938160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 31712742 - 31712959
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata--caatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31712742 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcaca 31712841  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     ||||||| ||||||  ||||||||   |||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  31712842 gcatccatgttaataacataaaacggtcaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtcaccggaatactgatgtctccatatctgcaacattg 31712941  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||  ||||||||||||    
T  31712942 atgagtccaaagtcattg 31712959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 32104516 - 32104700
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  32104516 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 32104615  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    ||| |||||||| ||| |||   |||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32104616 tagcataaaacggcaaggtacaaatgcatacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgt 32104700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Original strand, 40490253 - 40490467
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  40490253 caaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagtataaaacggcaaaatacctatgcctataaatatgact 40490352  T
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgct------taaaac 309  Q
    | |||  |||||     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||      ||| |     
T  40490353 a-att--tgtct-----atattcatgtctccggatctgcaacattgacgacgctaaagtcattgtcattgatcggatctatacttgctcaaagctaataa 40490444  T
Q  310 taatctttcaacctgaatcaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40490445 taatctttcaacctgaatcaaat 40490467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2629359 - 2629142
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  2629359 aaaaataaatgatattaattcattcaagttgatagagtacatccgatacaatgaaaattagctgaaaacaaaaaggatgaatttatgaacaaactcacaa 2629260  T
Q  163 catccatattaatag--tataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||   |  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||    
T  2629259 catccatgttaatagcatataaaacgacaaagtactaaatcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacacatgtctcc-gatctacaatatt 2629161  T
Q  261 gacgacgccaaagtcattg 279  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  2629160 gaggactccaaagtcattg 2629142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13977857 - 13977643
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||| || ||| |||||||||     
T  13977857 taaaaataaatgatattcattcgttcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcactaaaaacaaaagaaatgaatctgcgaacaaactcacag 13977758  T
Q  163 catccatattaatagtataa--aacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
    |||| || ||||||| ||||  |||| ||| |||   | |||| || |||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13977757 catctatgttaatagcataattaacggcaaggtacaaaagcctgcacatatgattatattcaagtctccagaatactcatatctccggatctgcaacgtt 13977658  T
Q  261 gacgacgccaaagtc 275  Q
    ||||| | |||||||    
T  13977657 gacgatgtcaaagtc 13977643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32921074 - 32920875
Alignment:
Q  80 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagta 179  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  32921074 cattcatgcacattgatagagtacatcaatgcaatacaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctctgaacaaactcacaacatccatgttaatagca 32920975  T
Q  180 taaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
     ||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||| |  | || ||||||   ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32920974 caaaacgacatagtacataagcctacaaacatgactatattaaaatatctggaatagcaatgcctccagatctgcaacgttgatgacgccaaagtcattg 32920875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 16996558 - 16996772
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |  |||||| ||    
T  16996558 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatatgatgcaaattcgctaaaaacaaataggttgaatctgtgaacaggctcacaaca 16996657  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||  ||||| | | ||| |||||||| || |    
T  16996658 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacatatatgactatatttaaatatccggaataaccatgttttcagatttgcaacgtggatg 16996757  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  16996758 acgccaaagtcattg 16996772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32413235 - 32413021
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||| ||    
T  32413235 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatctgaaaaggctcacaaca 32413136  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    | ||| |||||||  |||||||||||||||   ||| |||||  |||||||||||  |  ||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||| || |    
T  32413135 tacatgttaatagcttaaaacgacaaagtacaaatgtctacacgtatgactatatctaaatcttcggaataatcatgtatccggatctataacgtagatg 32413036  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  32413035 acgccaaagtcattg 32413021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 277
Target Start/End: Original strand, 7269150 - 7269346
Alignment:
Q  80 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagta 179  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||  |    
T  7269150 catttattcaaattgatagagttcatcgatacaatacaaattcgataaaaataaaaaggatgaatttgcgaacaaactcatagcatccatgttaatatca 7269249  T
Q  180 taaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    |||||| ||||||||   |  |||||  || | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  7269250 taaaacaacaaagtacaaaaacctactcatgtaactatattcaagtatccggaatacccatgtctccggatctgcaacatggacgacg-caaagtcat 7269346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 277
Target Start/End: Original strand, 7280797 - 7281009
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| | |    
T  7280797 aaaaataaatgatatgcattcattcaaattgatagagttcatcgatacaatactaattcgataaaaagaaaaagaatgaatttgcgaacaaactcataac 7280896  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||   |  | |||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||    
T  7280897 atccatgttaatatcataaaacaacaaagtacaaaaacatacttatatgactatattcaagtatccggaatacccatgtctctagatctgcaacgtggac 7280996  T
Q  264 gacgccaaagtcat 277  Q
    |||| |||||||||    
T  7280997 gacg-caaagtcat 7281009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12357239 - 12357026
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  12357239 aaaaatagacgatattcattcattcaaatttttaaagtacattgata--atacaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaac 12357142  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||  | || ||||  ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||     
T  12357141 atccatgttaatagaataaattggcagagtacataaacctacaaatatgactatattaaagtctccggaatagtcatgcatcctgatctgcaacgttgat 12357042  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||  ||||||| ||||    
T  12357041 gataccaaagttattg 12357026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 11298443 - 11298643
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  11298443 attcatttattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcacttaaaataaaaaggatgaatatatgaacaaactcacaacatccatgttaata 11298542  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | ||||||| ||||||||  ||   |||||||||||||  |||| |  ||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  11298543 gcataaaacaacaaagtacataatactacaaatatgac--tattaaaatcttcagaataaccatgtctccggatatgcaacgtttatgacgccaaagtca 11298640  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  11298641 ttg 11298643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 36545460 - 36545664
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaa-aggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||    
T  36545460 gatattcatttattcaaattgatagagtacatcgata--atgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaggctcacaacatccatgtt 36545557  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||    ||| |||| ||||||||||||| |  || |||||| |  |||||||| ||||||||||||| || |  ||||||    
T  36545558 aatagcataaaacgacaaagtacaattgcttacacatatgactatatttaaatcaccggaacaaccatgtctctggatctgcaacgtggatggagccaaa 36545657  T
Q  273 gtcattg 279  Q
    |||||||    
T  36545658 gtcattg 36545664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Original strand, 18196831 - 18197029
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||| || ||| |||||| || | | ||| ||||| | ||    
T  18196831 attcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcgttaaaaacaaaaggaatcaatctgcgaacaaactcccaacgttcatgttaatcgcat 18196930  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||| |||||||   | | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18196931 aaaacggcaaagtacagaagactacaaatatgactatattaaagtctttggaatagcgatgtctccggatctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattg 18197029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5328392 - 5328183
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||  |||||| ||    
T  5328392 aaaataaatgatattcattcttttaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaa--aaaaggatgaatctgtaaataggctcacaaca 5328295  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||| |||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    |    
T  5328294 ttcatgttaatagtataaaacggcaaagtacaaatgcatacacatataactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgt---gg 5328198  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  5328197 acgccaaagtcattg 5328183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16809291 - 16809094
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||  ||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||  | ||||||  ||    
T  16809291 attcattcaaattgatagagtatat-gatatagtgcaaattcgtaaaaaacaaaaatgatgaatctgcgtacaaactcacatcatctttgttaataacat 16809193  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16809192 aaaacaacaaagtacagaagcctacacatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtttctggatctgcaacgtggacaacgtcaaagtcattg 16809094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 266
Target Start/End: Original strand, 9799678 - 9799881
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||| || ||| |||||||||     
T  9799678 taaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatgcaaatgctctaaaaacaaaaaagaggaatatgcgaacaaactcacaa 9799777  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | || |||   | ||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||| ||||| |  | ||| ||||||||||    
T  9799778 catccatgttaatagcataaaactaaaacgtacaaaagcctacacatatgactatattcaaatctttggaatacccatgttttagaatcagcaacgttga 9799877  T
Q  263 cgac 266  Q
    ||||    
T  9799878 cgac 9799881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 224 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10334462 - 10334342
Alignment:
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacct 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||| ||    
T  10334462 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgatgccaaagtc------attgatcggatctgcatttgctcaaagctaatatttcaatct 10334369  T
Q  324 gaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10334368 gaatcaaataaacaccgcactaagacg 10334342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5990059 - 5989891
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||      
T  5990059 aaaaataaatgacattcattcatttaaattaatatagtacatcaatagaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaat 5989960  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5989959 attcatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccgga 5989891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26538829 - 26538702
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26538829 aaaataaatgataatcattcattcaaattgattgagtacatcgatacaatgcaaatttgctaaaaacaaaatggatgaatttgtgaacaaactcacaaca 26538730  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaag 192  Q
    ||||| | || ||  |||||||||||||    
T  26538729 tccatgtcaacagcgtaaaacgacaaag 26538702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 37129343 - 37129558
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgata-gagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |  ||||||      
T  37129343 aaaataaaagatattcattctttcaaattgaaaagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctatgaacaggctcacaaa 37129442  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
     | ||  ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||     
T  37129443 gttcacgttaatagcataaaacgtcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggat 37129542  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  37129543 gacgccaaagtcattg 37129558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9270453 - 9270276
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||| |    
T  9270453 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaacatcaaggatgaatatgtgaa-agactcacaacatccatgttaaca 9270355  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    | |||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||| | |||||  ||||||||| ||||||||    
T  9270354 gcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcagaataaccatgtctccagatctgca 9270276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 279
Target Start/End: Original strand, 31147512 - 31147711
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||| || ||| ||| ||||  ||||||| |||||||     
T  31147512 tcattcattaaaattaatatagtacatcgttacaatgcaaattcactaaaaa--aaaatgatgaatatgcgaacaaattcactgcatccatgttaatagc 31147609  T
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgga-tctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    |||||| |||||||||   | ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31147610 ataaaatgacaaagtataaaagcctacatatatggttatattcaagtctccgaaatactcatgtctctggattctgcaacgtggacgacgtcaaagtcat 31147709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17019536 - 17019380
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  17019536 gatattcattcattcaaattagtagagtaactcaatacaatacaaagtcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgtta 17019437  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccg 230  Q
    |||| ||||||   |||||||   |  |||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  17019436 atagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgactatcttcaagtctccg 17019380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17549973 - 17549817
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  17549973 gatattcattcattcaaattagtagagtaactcaatacaatacaaagtcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgtta 17549874  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccg 230  Q
    |||| ||||||   |||||||   |  |||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  17549873 atagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgactatcttcaagtctccg 17549817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Original strand, 6219840 - 6220051
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| ||| | | |||||| || ||||||| |||||  |||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||     
T  6219840 ctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaatt-atatcatctatgttaatagcataaagtgacagagtacatatatctacaaatatgactatattcaa 6219938  T
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacct 323  Q
    || | |  ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    || |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6219939 gtatacaaaatactcatgttttcggatctgcaacgttgaagacgccaaaatcattg--attga----atctgcacttgctcaagactaatctttcaacct 6220032  T
Q  324 gaatcaaataaacaccgca 342  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  6220033 gaatgaaataaacatcgca 6220051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18994327 - 18994198
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||| |    
T  18994327 aaaaataaatgataatcattcattcaaattaatagagtacatcgatacattgcaaat-cgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaaatcacaac 18994229  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18994228 atccatgttaatagcataaaacgacatagta 18994198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4928369 - 4928196
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||      | |||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||  ||||||    
T  4928369 atatttattaattcaagttgatagagtacatcaatataatacaaattcaaagtcgttaaaaacaaaaaagatgaatctccgaacaaactcacgacatcca 4928270  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgt 242  Q
      ||||||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4928269 agttaatagtataaaacaacgaaatagttatgcctgcaaatatgactatattcaagtctctggaatactcatgt 4928196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4429514 - 4429221
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacat--cgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||||||      |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||    
T  4429514 aaaataaatgatattcattcattcaaattggcagagtatatatcgatacattacaaattcaaagtcgctaaatacaaaaaggatgaatctgcgaagaaac 4429415  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    ||| ||||||||| |||| |  ||||||   || ||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||  |||||||||    
T  4429414 tcatatcatccatgttaaaaacataaaattgcagagtatatatgcatacaaatatgactatattcaagtatctgaaatactcatgtttcaagatctgcaa 4429315  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||||| |   ||||||||| |  |||||    |||||||||| || |||  |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  4429314 ccttgacaatatcaaagtcatcg--attga----atatgcactttctcaaagttaatctttcaacccaaatcaaataaacaccacagtaacacgagaaat 4429221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Original strand, 15286694 - 15286853
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||    
T  15286694 aaaaataaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatttatacaatacaaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgataaatctatgaacaaac 15286793  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    ||||| |||| || ||||| | |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  15286794 tcacaacatctatgttaatcgcataaaacggcaaaatacctatgcctacaattatgacta 15286853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Original strand, 15467063 - 15467222
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||    
T  15467063 aaaaataaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatttatacaatacaaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgataaatctatgaacaaac 15467162  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    ||||| |||| || ||||| | |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  15467163 tcacaacatctatgttaatcgcataaaacggcaaaatacctatgcctacaattatgacta 15467222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37659306 - 37659226
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37659306 aaaaataaatgatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 37659226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 337
Target Start/End: Original strand, 10951970 - 10952231
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt-----cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||     || |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||| |||||||    
T  10951970 atattcatttattcaaattgataaagtacatcaatataaaataaattaaagtcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactcacaacatccat 10952069  T
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
      |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| | |  ||   ||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  10952070 gataatagcataaaatgacagagtatctatgcctataaatttgactatatttaagcttctaaaatactcagatctccggatatgcaacattgatgacgcc 10952169  T
Q  270 aaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    ||| | ||  | |||||    || |||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10952170 aaaataat--taattga----atttgcacttgatcaaatcgtatctttcaacctgaatcaaataaaca 10952231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 337
Target Start/End: Original strand, 10959975 - 10960236
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt-----cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||     || |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||| |||||||    
T  10959975 atattcatttattcaaattgataaagtacatcaatataaaataaattaaagtcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactcacaacatccat 10960074  T
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
      |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| | |  ||   ||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  10960075 gataatagcataaaatgacagagtatctatgcctataaatttgactatatttaagcttctaaaatactcagatctccggatatgcaacattgatgacgcc 10960174  T
Q  270 aaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    ||| | ||  | |||||    || |||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10960175 aaaataat--taattga----atttgcacttgatcaaatcgtatctttcaacctgaatcaaataaaca 10960236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Original strand, 15237231 - 15237338
Alignment:
Q  87 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| || |||||| |||| || ||||||| |||||||     
T  15237231 tcaaattgatagagtacatcaatagaataaaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgagaacaagctcacaacatctatgttaatagcataaaacc 15237330  T
Q  187 acaaagta 194  Q
    ||||||||    
T  15237331 acaaagta 15237338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 279
Target Start/End: Original strand, 7014188 - 7014350
Alignment:
Q  117 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||  ||||||| ||||||||   |  |||||| |||||||||    
T  7014188 aaattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaataaactcacaacaactatgttaataacataaaacaacaaagtactaaaacctacacatatgacta 7014287  T
Q  217 tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    || | | || || | ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  7014288 taattaagtatctgaaatatccatgtctccgaatctgcaacgttgacggcttcaaagtcattg 7014350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Original strand, 38545476 - 38545536
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38545476 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatataaattc 38545536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 279
Target Start/End: Original strand, 5917510 - 5917632
Alignment:
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactat-gcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  5917510 tcacaacatccatgttaatagcataaaatgacaaagta-caatagcctacacatatgaatatattcaagtctccaaaatacccatgtcttcgggtctgca 5917608  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  5917609 atgctgacgacgccaaagtcattg 5917632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31874457 - 31874319
Alignment:
Q  133 aaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  31874457 aaaaggatgaatatgtgaagaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccgga 31874358  T
Q  233 atactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    | |  ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  31874357 aaaaccatgtct-cggatctgcaacgtggatgacggcaaa 31874319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Original strand, 45310897 - 45310978
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  45310897 taaaaataaatgatattaattcattcaaattgataaagtatatcgatactatacaattttgctaaaaacaaaaatgatgaat 45310978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 356
Target Start/End: Original strand, 1039816 - 1039863
Alignment:
Q  309 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1039816 ctaatctttcaacctggatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 1039863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 356
Target Start/End: Original strand, 7256476 - 7256763
Alignment:
Q  68 ataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||      ||||||| ||||||| |||||| || ||| ||| |||||    
T  7256476 ataaacgatatttattcattcaaattgatcgtgtacattgatgcaaaacaaattcaaagtcgctaaaa-caaaaagaatgaatctgcgaacaaattcaca 7256574  T
Q  162 tcatccatattaatag--tataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
     |||| ||||||| |   ||||| | || | || |  |||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  7256575 acatctatattaacaacatataatatgatagaggacgtatgcctacacatatgactatatttaagtctttggaatactcatgtct-cggatcttcaa-gt 7256672  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| || |||      ||||||||| |||| | |||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  7256673 tgacgatgcaaaa------gtcattgattggatctacacttgataaaaactactatttcaacttgaatcaaataaacaacgcacaaaaacggaaaat 7256763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20993259 - 20992967
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt---cgc---taaaa-acaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||   |||   ||||| | ||||| |||||||  | | | ||||    
T  20993259 aaaaataaactatattcattcattcaaattgatagattgcatcgatataatataaatttaacgcctttaaaacaaaaaaatgatgaatcagcgga-aaac 20993161  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||  ||||| ||   || |||||    
T  20993160 tcacaatatccatgttaatagtataaaataacagagtacatatgcatacaaatatgattatattcaagtattcggaatatccatgtttctaaatttgcaa 20993061  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| | |||| ||||  | |||||    || |||| ||||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  20993060 cgttgacgatgtcaaaatcat--taattga----atctgcatttgctcaaagttaatttttcaaccagaatcaaataaacatcacactaaaacgggaaat 20992967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 186
Target Start/End: Original strand, 26673454 - 26673572
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||      | |||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  26673454 gatatccattcatttaaattgatagagtatatcgatacgatacaaatttaaaatagctaaaaacaaaaaagatgaatctacgaacaaactcacatcatcc 26673553  T
Q  168 atattaatagtataaaacg 186  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  26673554 atgttaataacataaaacg 26673572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 33526698 - 33526566
Alignment:
Q  198 atgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgca 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| | |||      ||| ||||||| || ||||    
T  33526698 atgcatacaaatatgattatattcaagtctccagaatactcatgtcattggatctacaacgttaacgacactaaa------gtcgttgatcgaatctgca 33526605  T
Q  298 cttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaac 336  Q
    |||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33526604 cttgccgaaaaataatctttcatcctgaatcaaataaac 33526566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 356
Target Start/End: Original strand, 10633050 - 10633150
Alignment:
Q  250 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||    || | |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10633050 tctgcaacgttgacgacgcaaaaatcattg--attga----atctacacttgatcaaagctaatctttcaacctgaataaaataaacaccgcactaagac 10633143  T
Q  350 gggaaat 356  Q
    || ||||    
T  10633144 ggaaaat 10633150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 232
Target Start/End: Original strand, 283701 - 283841
Alignment:
Q  86 ttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaac 185  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     ||| |||||||    |||||| ||||||| ||||||     
T  283701 ttcaaaatgatagagtacat-gatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaa----cgaacaaactca-tggatccatgttaatagcataaaat 283794  T
Q  186 gacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    |  |||||||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  283795 ggaaaagtaaaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccgga 283841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 632176 - 632036
Alignment:
Q  86 ttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaac 185  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     ||| |||||||    |||||| ||||||| ||||||     
T  632176 ttcaaaatgatagagtacat-gatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaa----cgaacaaactca-tggatccatgttaatagcataaaat 632083  T
Q  186 gacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    |  |||||||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  632082 ggaaaagtaaaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccgga 632036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 817988 - 817848
Alignment:
Q  86 ttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaac 185  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     ||| |||||||    |||||| ||||||| ||||||     
T  817988 ttcaaaatgatagagtacat-gatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaa----cgaacaaactca-tggatccatgttaatagcataaaat 817895  T
Q  186 gacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    |  |||||||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  817894 ggaaaagtaaaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccgga 817848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27989137 - 27989040
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaa-caaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  27989137 taaaaataaacaatatttatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatataaattaactaaaaataaaaaaggatgaatatgcaaataaactca 27989040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28046439 - 28046342
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaa-caaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28046439 taaaaataaacaatatttatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatataaattaactaaaaataaaaaaggatgaatatgcaaataaactca 28046342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 15288677 - 15288725
Alignment:
Q  237 tcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattg 285  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15288677 tcatgtctctggatttgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattg 15288725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 15469046 - 15469094
Alignment:
Q  237 tcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattg 285  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15469046 tcatgtctctggatttgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattg 15469094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21472015 - 21471849
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||| || ||| |||    
T  21472015 ataaaaataaaagatattctttcattcaagtttatagactatattgatacaatacaaattcaaagtttctaaaaacagaaaggatgaatctgcgaacaaa 21471916  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||| |  |||||| ||||||| ||| || || |  |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21471915 ctcagaatatccatgttaatagaatataatgatagcgtacatatgcctacaaatattactatattca 21471849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3028363 - 3028269
Alignment:
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||||| ||||||  |||||| |||||||||   | | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3028363 catccatgttaataacataaaatgacaaagtacaaaagtctacacatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtctctggatatgcaac 3028269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7291614 - 7291556
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7291614 aaaaataaacgatgttcattcattaaaattgatagagtacatcgatgcattacaaattc 7291556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9627896 - 9627838
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9627896 aaaaataatcaatattcattctttcgaattgatagagtacattgatacaatacaaattc 9627838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10334943 - 10334893
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaat 114  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10334943 aaaaataaacgatatccattcattcaaattgatagagtacattgatacaat 10334893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 204
Target Start/End: Original strand, 12111002 - 12111148
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacat-----cgatac-aatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||   | ||   | |||||    
T  12111002 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgatcgagtacattggcacgatacaaattcaaattcggtaaaaacaaaaatgattgttgtgcacaaaaact 12111101  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgccta 204  Q
     ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12111102 tacaacatcaatgttaatagtataaaacgacaaagtacatatgccta 12111148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21238072 - 21237960
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||  |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  21238072 atattcattcattcaaattgatagaatacatc---ataat-caacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccatgttaa 21237977  T
Q  175 tagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  21237976 taggatacaacgacaaa 21237960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Original strand, 36555746 - 36555832
Alignment:
Q  108 atacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  36555746 atacaatacaaatttgttaaatataaaaaggttgaatttgtgaacaaacgcacaacatccatattaattacataaaacgacagagta 36555832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 31874509 - 31874460
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaat 114  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31874509 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataat 31874460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11725976 - 11725870
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| ||     ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||    
T  11725976 gatattcattcattcaaattgagagattacatc-attcaacac-----cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagtta 11725883  T
Q  174 atagtataaaacg 186  Q
    |||| ||| ||||    
T  11725882 atagcatataacg 11725870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Original strand, 11967996 - 11968044
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11967996 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgacacaa 11968044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 191
Target Start/End: Original strand, 7198003 - 7198112
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatag 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||  |||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  7198003 ttcattcattcaaattgatagaatacatc---agaat-caagatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacaacacccaaattaatag 7198098  T
Q  178 tataaaacgacaaa 191  Q
     ||| |||||||||    
T  7198099 catacaacgacaaa 7198112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Original strand, 14918380 - 14918467
Alignment:
Q  107 gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||||||||||| ||||   || ||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14918380 gatacaatacaatttcgtagaatacaaaaaagatgaaactgtaaataaactcacaacatccgtgttaatagcataaaacgacaaagta 14918467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20082474 - 20082332
Alignment:
Q  105 tcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaa--ctatgcc 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||| || | |||||   ||||      
T  20082474 tcgatacaatacaaatttgctaaaataaaaaaagataaagctgtgaacaaacacacaacatccatattaatcgcataaaatgatagagtaaacatatgaa 20082375  T
Q  203 tacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctc 245  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |  ||||||||||||||||    
T  20082374 tacaaatgtgactatattcaaatatttggaatactcatgtctc 20082332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36261384 - 36261219
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaaca-aaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagta 179  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||| ||| || ||||| ||| |||  || ||||||  |    
T  36261384 attcattcaaatttttagagtacgtcgatacaatacaaattcattgaaaacataaaaggataaatatgtcaacaaacttacaacatatatgttaatatca 36261285  T
Q  180 taaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccg 247  Q
    |||||| | |||| |  || | ||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||    
T  36261284 taaaacta-aaag-acataagtctataaatatgactatattcaagtgttcggaatacacatgtctccg 36261219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Original strand, 589029 - 589075
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  589029 atattcattcattcaaattgataaaatacatcgatataatacaaatt 589075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 624893 - 624847
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  624893 atattcattcattcaaattgataaaatacatcgatataatacaaatt 624847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3028433 - 3028366
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3028433 gatatttattcattcaaattgatagattatattgatac--tacaaattctctaaaaacaaaaagaatgaa 3028366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6833783 - 6833712
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6833783 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacat--------tgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaat 6833712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14186950 - 14186909
Alignment:
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14186950 aaaactaatttttcaacctgaatcaaataaagaccgcactaa 14186909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 19443855 - 19443888
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19443855 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 19443888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19489066 - 19488989
Alignment:
Q  279 gtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| | || |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  19489066 gtcattgattgaatttgcacttgatcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccagactatgacggaaaat 19488989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 119
Target Start/End: Original strand, 35778777 - 35778822
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35778777 gatattcattcattcaaaatgataaagtacatcgatataatacaaa 35778822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Original strand, 41431281 - 41431391
Alignment:
Q  80 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa-tacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||| | | |||||||||||| |||||||  || ||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  41431281 cattcattcaaact--tagagtacatcaatacaaattcaaagttgttaaaaacaaaaatgatgaatacgttaacgaactcacaacatctatattaatagt 41431378  T
Q  179 ataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||||||    
T  41431379 ataaaatgacaaa 41431391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7281914 - 7281838
Alignment:
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7281914 ataaaactgcaaagtatttatgcctacaaacctgactatattcaaatctctggaatactcatgtcttcggatttgca 7281838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9802113 - 9802065
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9802113 gatatttattcgttcaaattggtagggtacatcgatacaatacaaattc 9802065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Original strand, 30568124 - 30568238
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||  |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| || |||  ||    
T  30568124 gatattcattcattcaaattgatagattacatc-at---atacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagtt 30568219  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  30568220 aatagcataaaacggcaaa 30568238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 6314960 - 6314917
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6314960 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagattacatcg 6314917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12964163 - 12964092
Alignment:
Q  206 aaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    |||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||    
T  12964163 aaatatgactatattcaaatctctgaaacactcatgtctccggatttacaacattgacgacgtcgaagtcat 12964092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 161
Target Start/End: Original strand, 16928559 - 16928644
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  16928559 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcaca 16928644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 106
Target Start/End: Original strand, 27498170 - 27498201
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27498170 atattcattcattcaaattgatagagtacatc 27498201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 279
Target Start/End: Original strand, 283833 - 283871
Alignment:
Q  241 gtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  283833 gtctccggatctgcaacgtggacgacgctaaagtcattg 283871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 632044 - 632006
Alignment:
Q  241 gtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  632044 gtctccggatctgcaacgtggacgacgctaaagtcattg 632006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 817856 - 817818
Alignment:
Q  241 gtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  817856 gtctccggatctgcaacgtggacgacgctaaagtcattg 817818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4021206 - 4021160
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  4021206 atattcattcattcaaattgattatgtacatcgatacaatataaatt 4021160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4928195 - 4928141
Alignment:
Q  291 atatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 345  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4928195 atatgcacttgctcaaagctaatatctcaacctgaatcaaacaaacaccacacta 4928141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30261938 - 30261900
Alignment:
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 343  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30261938 aaaactaatctttcaatttgaatcaaataaacaccgcac 30261900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32726636 - 32726606
Alignment:
Q  316 ttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32726636 ttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 32726606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 263
Target Start/End: Original strand, 43192282 - 43192316
Alignment:
Q  229 cggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43192282 cggaatattcatgtctccggatctgcaacgttgac 43192316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7282019 - 7281962
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||| |||||    
T  7282019 aaaaataaacgatattcattcattttaatttatagagtatatcgatataatataaatt 7281962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 7883043 - 7883158
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| || |||  |    
T  7883043 cgatattcattcattcaaatcaatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagt 7883138  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  7883139 taataggatacaacggcaaa 7883158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 9637211 - 9637244
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9637211 cgatattcattcatttaaattgatagagtacatc 9637244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 102
Target Start/End: Original strand, 15596955 - 15596984
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15596955 cgatattcattcattcaaattgatagagta 15596984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 17693415 - 17693448
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17693415 cgatattcattcactcaaattgatagagtacatc 17693448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23230930 - 23230897
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23230930 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 23230897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 348
Target Start/End: Original strand, 35778982 - 35779039
Alignment:
Q  291 atatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  35778982 atatgcacttgatcaaaactattttttcaacctaaataaaataaacaccgaactaaga 35779039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 40211102 - 40211135
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40211102 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 40211135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 40618875 - 40618908
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40618875 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 40618908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41684660 - 41684627
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41684660 cgatattcattcatttaaattgatagagtacatc 41684627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2655958 - 2655914
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2655958 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 2655914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 9619353 - 9619397
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9619353 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 9619397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 102
Target Start/End: Original strand, 14544681 - 14544709
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14544681 gatattcattcattcaaattgatagagta 14544709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14585974 - 14585942
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14585974 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 14585942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 18890491 - 18890523
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18890491 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 18890523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 23851490 - 23851534
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23851490 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 23851534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26912094 - 26912038
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  26912094 aaaaataaacgatattcattcttttaaattgataaagtacaacaatacaatataaat 26912038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Original strand, 33214473 - 33214505
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacat 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33214473 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacat 33214505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37971417 - 37971385
Alignment:
Q  232 aatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37971417 aatactcatgtttccggatctgcaacgttgacg 37971385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 110)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 12481033 - 12481331
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  12481033 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaact 12481132  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12481133 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccggatctgcaac 12481232  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481233 gttgacgacgccaaagtcattttcattgatcggatctgctcttgttcaaagttaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 12481331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 14782809 - 14783103
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14782809 aaaaataatagatattcagtcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 14782908  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  14782909 cacattatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactc----ctccggatctgcaac 14783004  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14783005 gttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcacatctgcacttgctcaaaactaatctttcaatctaaatcaaatatacaccacactaagacgggaaat 14783103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31705632 - 31705325
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  31705632 aaaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattggctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaaact 31705533  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705532 cacaacatctatgttaatagcataaaacaacaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatccatgtctccggaatactcatgtctccgg 31705433  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705432 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 31705333  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    || |||||    
T  31705332 cgagaaat 31705325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23654716 - 23654410
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  23654716 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgtgaacaaact 23654618  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||         |||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  23654617 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaagttacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctcctgaatcctcatgtctccgg 23654518  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654517 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 23654418  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  23654417 cgggaaat 23654410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 354
Target Start/End: Original strand, 1106517 - 1106826
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc----------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaata 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  1106517 aaaaataaacgatattcattcattcagattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctagctaaaaacgaaaaggatgaatttctgaaca 1106616  T
Q  154 aactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtct 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1106617 aactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaacatgattatattcaagtctccggaatactcatgtct 1106716  T
Q  245 ccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcact 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1106717 ccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgtact 1106816  T
Q  345 aagacgggaa 354  Q
    ||||||||||    
T  1106817 aagacgggaa 1106826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 35219567 - 35219874
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35219567 aaaaataaacgatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 35219666  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    || | |||| || ||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||         |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  35219667 cagagcatcaatgttaatagcataaaacggcattgtacctatgcctacaaatatgatcaatatgactatattcaagtctccgaaatactcatgtttccgg 35219766  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35219767 atctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 35219866  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  35219867 cgggaaat 35219874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 23101062 - 23101369
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaa-caaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23101062 aaaaataaacgatattcattcat-caaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatccgctaaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaac 23101160  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccg 247  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||         |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23101161 tcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgactaatatgactatattcacgtctccggaatactcatgtctccg 23101260  T
Q  248 gatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23101261 gatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaataccgcacaaag 23101360  T
Q  348 acgggaaat 356  Q
    |||||||||    
T  23101361 acgggaaat 23101369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 64 - 351
Target Start/End: Original strand, 12653972 - 12654259
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  12653972 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaattccaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaact 12654071  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12654072 cacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaaatacatatgcctacaaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccgaatctgcaac 12654171  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    ||||| |||||||||      |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12654172 gttgatgacgccaaa------gtcattgatcagatctacacttgctcaaaactagtctttcaacctaaatcaaataaacaccacactaagacgg 12654259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30813524 - 30813267
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30813524 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 30813425  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30813424 cacatcatccatgttaatagcataaaacgccaaggtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctctgaaatcctcatgtctccggatctgcaac 30813325  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatct 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||    
T  30813324 gttgacgacgccaaagtcattttcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatct 30813267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 8693325 - 8693615
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8693325 aaaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 8693424  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||||    
T  8693425 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgcaac 8693516  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8693517 gttgacgacaccaaagtcattgtccttgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacggaaaat 8693615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4394237 - 4393930
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  4394237 aaaaatgagcgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaacggatgaatctgtgaacaaact 4394138  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    | || ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4394137 ctcaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctcatgaatactcatgtctccgg 4394038  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4394037 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcagtgatcagatctgcacttgatcaaagttaatctttcaacctgagtcaaataaacaccgcactaaga 4393938  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  4393937 tgggaaat 4393930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 15589779 - 15590069
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  15589779 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaaccaact 15589878  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||||    
T  15589879 cacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacgtatacctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgcaac 15589970  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15589971 attgacgacgccaaagccattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacgggaaat 15590069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 21507508 - 21507798
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21507508 aaaaataaacgatattcattcattcaaactgatagagtacatcaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaact 21507607  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| | ||||||||||||||| |||    
T  21507608 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattaatgtctccggatctgtaac 21507699  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21507700 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatcgacacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaaaacacaccgcactaagacgggaaat 21507798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 23637776 - 23638081
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  23637776 aaaaataaacgacattcattcattcaaattaataaagtacatcgatacaatacaaattcaattttgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaact 23637875  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23637876 cacagtatccatgttaa--gcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgattaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccgg 23637973  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637974 atctgcaacattgacgacgtcaaagtcattgtcatttattggatcagcatttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 23638073  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  23638074 cgggaaat 23638081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 2304492 - 2304799
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  2304492 aaaagtaaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaagataaattagtgaacaaact 2304591  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||||  |||||| ||||||  |||||||| ||||||   | ||||||||||||         |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  2304592 cacaatatccatgttaataacataaaacggcaaagtttttgtgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtatctagaatactcatgtctccgg 2304691  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2304692 atctgcaacgttgacaatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaaga 2304791  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  2304792 cgggaaat 2304799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 356
Target Start/End: Original strand, 4921564 - 4921842
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcat 165  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||    
T  4921564 aaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgataccatacaaactcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacaaactcataacat 4921663  T
Q  166 ccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacga 265  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||| |      |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  4921664 tcatgttaatagcataaaacgacaaaatacatatgtc------tatgactatattcaagtcaccggaatactcatacctctggatctgcaacgttgacga 4921757  T
Q  266 cgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |  ||||      |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4921758 caacaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctggatcaaataaacaccgcagtaagacgggaaat 4921842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Original strand, 6295914 - 6296210
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  6295914 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaatgacgaatccgtgaacaaactcacaacatcca 6296013  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatga---------ctatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    | ||||||  |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||         ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||    
T  6296014 tgttaataacataaaacggcaaagtacttatgtctacaaatatgattaatatgactacattcatgtctccgaagtactcatgtctctggatctgcaatgt 6296113  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6296114 ttaccacgccaaaatcattgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagttaatcttttaacctgaatcaaataaacactgcactaagacggaaaat 6296210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Original strand, 6302724 - 6303020
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  6302724 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaatgacgaatccgtgaacaaactcacaacatcca 6302823  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatga---------ctatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    | ||||||  |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||         ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||    
T  6302824 tgttaataacataaaacggcaaagtacttatgtctacaaatatgattaatatgactacattcatgtctccgaagtactcatgtctctggatctgcaatgt 6302923  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6302924 ttaccacgccaaaatcattgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagttaatcttttaacctgaatcaaataaacactgcactaagacggaaaat 6303020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 340
Target Start/End: Original strand, 29920571 - 29920862
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  29920571 aaaagtaaacgatattcgttcattcaaattgataaagtacatcgatacattacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaact 29920670  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||         |||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  29920671 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtatccatgactacaaatatgactaatataactatattcaagtcttcggaatactcatgtctccag 29920770  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccg 340  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29920771 atctgtaacgttgacgacgataaagtcattgtcattgatcgaatcaacacttactcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccg 29920862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10745017 - 10744814
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  10745017 atattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaattgaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgctaa 10744918  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10744917 tagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccttgtctccggatttgcaacgttgacgactccaaagt 10744818  T
Q  275 catt 278  Q
    ||||    
T  10744817 catt 10744814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20496639 - 20496424
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  20496639 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagcgtacattgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaac 20496540  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  20496539 atccatattaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccggaatacccatctctcaagatatgcaacgttgac 20496440  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20496439 gacaccaaagtcattg 20496424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 171 - 356
Target Start/End: Original strand, 31937187 - 31937381
Alignment:
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31937187 ttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatataattaatatgactatatccatgtctccggaatacttatgtctccggatctgcaacgttg 31937286  T
Q  262 acgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31937287 acgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 31937381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34021036 - 34020834
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34021036 attcattcattcatattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatacatgttaata 34020937  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  34020936 gcataaaacgacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatcatcggaatagtcgtgcctccggatttgcaacgttgattacgccaaagtca 34020837  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  34020836 ttg 34020834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 356
Target Start/End: Original strand, 13871292 - 13871581
Alignment:
Q  76 tattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |      |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  13871292 tattcattcattcaaattgatagtgtacataaatataaaataaatccaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccat 13871390  T
Q  170 attaatagtataaaac-gacaaagtaactatgcctacaaat---------atgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
     ||||||| ||||||| |  ||| ||  |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13871391 gttaatagcataaaactggaaaaatacatatgcctacaaatttgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 13871490  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||      |||||||||| ||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13871491 tgacgacgccaaa------gtcattgatcagatttgcacttgctcaaagcaaatcttccaacctgaatcaaataaacactgcactaagacggaaaat 13871581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2488589 - 2488304
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||  |||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  2488589 aaaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcattaaaaacaaaaaggataaatatgcgaacaaact 2488490  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
     ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |    
T  2488489 tacaacatctatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcttacaaatgtgactatgtttaagtctccagaatactcaagtctccggatctgcctc 2488390  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||| || ||| ||||       ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2488389 gttaacaacgtcaaa------atcattgatcggatctacacttgctcaaagttaatctttcaacctgaataagataaacaccgcactaagac 2488304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 12576159 - 12576364
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||    
T  12576159 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatagatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaggctcacagtatccatgtta 12576258  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| |||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12576259 atagcataaaacgacaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 12576358  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  12576359 tcattg 12576364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 255
Target Start/End: Original strand, 19402506 - 19402712
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19402506 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaact 19402605  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19402606 cacagtatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccgg 19402705  T
Q  249 atctgca 255  Q
    |||||||    
T  19402706 atctgca 19402712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4660895 - 4660723
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaa------attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4660895 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaattccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaact 4660796  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccg 230  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4660795 cacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgattatactcatgtctccg 4660723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 13233787 - 13233991
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  13233787 atattcattaattcaaattgatagagtatatcaatataatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 13233886  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| ||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  13233887 tagcataaaacgacaaaatacagttgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaaat 13233986  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  13233987 cattg 13233991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 23843103 - 23843307
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| |||||||  |||    
T  23843103 atattcattcattcaaattgatagagtacatccatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacatgctcacaacatccatgctaa 23843202  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23843203 tagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacatatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagt 23843302  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  23843303 cattg 23843307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Original strand, 6419618 - 6419819
Alignment:
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgc 254  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||         |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6419618 atccatgttaatagcataaaacgacaaactatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccgaaatactcatgtctccggatctgc 6419717  T
Q  255 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6419718 aactttgacgacgccaaagtcattgtcatcgattgggtctgcacttactcaaagctaatctttcaacctgaaccaaataaacattgcactaagacgggaa 6419817  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  6419818 at 6419819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 275
Target Start/End: Original strand, 5416893 - 5417103
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||| |    
T  5416893 aaaaataaatgatattcattcattcaaattaatagagtacat-gatacaacacaattttgctaaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaactcacaac 5416991  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | || |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  5416992 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcatacacatatgactatattcaagtctccgaaatacccatgtatctggatctgcaacgtggac 5417091  T
Q  264 gacgccaaagtc 275  Q
    ||| ||||||||    
T  5417092 gacaccaaagtc 5417103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19760234 - 19760019
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| |    
T  19760234 aaaaataattgatattcattcactcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgataaaaacaaaaaggataaatatgtgaacaggctcacaac 19760135  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    || ||| ||||||| |||||| | ||| |||   ||| || || ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  19760134 attcatgttaatagcataaaatggcaaggtacaaatgtctgcacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggat 19760035  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  19760034 gacgccaaagtcattg 19760019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31748392 - 31748209
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  31748392 atatttattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaagctcacaacatccatgttaa 31748293  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||  ||| |||||| || |||||||    
T  31748292 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccatatctccgtatttgcaacg 31748209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 8632875 - 8633079
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||| ||| ||||    
T  8632875 atattcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaggctcacaacattcatgttaa 8632974  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| || ||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8632975 tagcatgaaatgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaatgtggatgacgccaaagt 8633074  T
Q  275 cattg 279  Q
     ||||    
T  8633075 aattg 8633079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8644674 - 8644506
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||| |    
T  8644674 aaaaataaatgatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcactaaaaacaagaaagatgaatctgcgaacaaactcacaac 8644575  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  8644574 atccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattaaagtctccgga 8644506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11426381 - 11426172
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||||| |||    
T  11426381 gatattcattcatttaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaggctcacatcatccatgtta 11426282  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact----atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
    |||| ||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||    ||||| |  |||||||||||  ||||| | ||||||| |||||| || ||||||    
T  11426281 atagcataaaacaacaaagtacaaatgcctacacatatgactgactatatttaaatctccggaataaccatgttttcggatctacaacgtggatgacgcc 11426182  T
Q  270 aaagtcattg 279  Q
    ||||||||||    
T  11426181 aaagtcattg 11426172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20845458 - 20845239
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgt-----gaataaactca 159  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |     ||| | |||||    
T  20845458 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatataatacaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatatatgaacagaacagactca 20845359  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||  ||||| || |||| ||||||||    
T  20845358 caacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacaaatatgactatatttaaatatccggaataaccatgtttctggatttgcaacgt 20845259  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattg 279  Q
     || |||||| |||||||||    
T  20845258 ggatgacgccgaagtcattg 20845239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 548541 - 548749
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||    
T  548541 aaaataaatgatattcattgattcaaattgatagagtacatcaatataatgcaaattcgcaaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaaca 548640  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    |||||||      ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || |    
T  548641 tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaactgcctac------gactatatttaaatctccggaataatcatgtctccagatctgcagcgtggatg 548734  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||| ||||    
T  548735 acgccaaagtaattg 548749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 4663488 - 4663703
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  4663488 aaaaataaacaatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaac 4663587  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||| | || ||||   | || |||| ||||||| ||||| | |||||  ||||||  || |||||| ||| ||||| ||||     
T  4663588 atccatgttaatagcataaaatggcatagtactaaagcttacacatatgaccatatttaagtctcaagaatacatatttctccgaatcagcaacattgat 4663687  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4663688 gactccaaagtcattg 4663703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16913761 - 16913564
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat---ttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||| |  |||||| ||||||| |||    
T  16913761 attcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtggtgaacaggctcacaacatccatgtta 16913662  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaa 271  Q
    |||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||||    
T  16913661 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatatccggaataatcatctttccggatctgcaacgtggatgacgccaa 16913564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 892732 - 892515
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || || ||| ||||||||     
T  892732 ataaaaataaataatattcattaattcaaattgatagaatgaattgatacaatacaaatttgttaaaaacaaaaatgatggatctgcgaacaaactcacg 892633  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagta-actatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
     ||||||| |||||| |||||||||| ||| || | ||  | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||     
T  892632 acatccatgttaataatataaaacgataaaatacaata-acttacacatatgactatattcaagtctccgggatactcatgtctccgaatttgcaacgtg 892534  T
Q  261 gacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  892533 gacaacgccaaagtcattg 892515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Original strand, 8978423 - 8978680
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||      || ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||     
T  8978423 attcattcattcaaactgatagagtatattaatacaatacaaattcaaagtcgccaaaaacaaaaaagatgaaattgcgaacaaactcacaacatccatg 8978522  T
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcca 270  Q
    || |||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |    
T  8978523 ttcataacataaaacgacatagtacatatgcctacaaatatgactatattcaaattaccgaaatattcatgt-ttcggatctgcaacgttgacgatgcaa 8978621  T
Q  271 aagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaa 335  Q
    || ||||||  |||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  8978622 aaatcattg--attga----atatgcacttgatcaaaactaatctttcaactttgatcaaataaa 8978680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6127984 - 6127799
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||      ||||||| |||||||||||||||||  || |||||    
T  6127984 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgttaaattataaattcaaagtagctaaaagcaaaaaggatgaatttgcaaacaaact 6127885  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtc 243  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||  | | || ||||||| ||||  || |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  6127884 cacatcatccatgttaaaagcataaaacgggacaatacctatgccgacaagcataactatattcaagtctccagaataatcatgtc 6127799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Original strand, 33541216 - 33541414
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||    
T  33541216 attcattcaaattgttagagtacattaatgcaatataaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcatgacatccatgttaatagcat 33541315  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
     |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||| |  ||||  |||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  33541316 gaaacgacaaagtacataagcctacaaacatgactatattaaaatcttcggaacaaccatgcatccaaatctgaaacgttgatgacaccaaagtcattg 33541414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 15127808 - 15128012
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaac-aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||| ||| ||||| ||||||| |||    
T  15127808 atattcattcattcaaatcgatagagtacattaatacaacgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatcaatctacgaacaaattcacaacatccatgtta 15127907  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||  ||||||| ||| ||||   | ||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||| | | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15127908 ataacataaaacaacagagtacagaagcctacacatatgactatgttcaagtcttcagaatattta-gcctccggatctgcaacgtggacaacgccaaag 15128006  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  15128007 tcattg 15128012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32804694 - 32804526
Alignment:
Q  110 acaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaat 209  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||   | ||||||| ||    
T  32804694 acaatgcaaattggctaaaaacaaaaaggataaatctg-gaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacaacaaagtacaaaagcctacacat 32804596  T
Q  210 atgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    || |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  32804595 ataactatattcaagtctctggaatattcatgtctccgaatctacaacatggacgacaccaaagtcattg 32804526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 340
Target Start/End: Original strand, 1418906 - 1419042
Alignment:
Q  198 atgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||      ||||||||||| || | ||    
T  1418906 atgcctacaaatatgactatattcaagtatccgaaataatcatgtcttcggatttgcagcgttgacgacgccgaa------gtcattgatcgaatctaca 1418999  T
Q  298 cttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccg 340  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1419000 cttgcttaaatctaatctttcaatctaaatcaaataaacaccg 1419042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31804660 - 31804452
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||   || ||| |||||| ||||||||| |    
T  31804660 aaaaataaacgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatataataaaaattcgctagaa--aaaagatataaatatgtgaagaaactcacagc 31804563  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | | ||||    |||| |||||| | ||||| | ||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  31804562 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagtctac----atgattatatttaagtctctgaaatactcatgttttcgaatctgcaacgttgac 31804467  T
Q  264 gacgccaaagtcatt 278  Q
    |   |||||||||||    
T  31804466 ggttccaaagtcatt 31804452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 278
Target Start/End: Original strand, 12651922 - 12652083
Alignment:
Q  117 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||  | ||| |||  |||||| |||||| |||||| ||   |  |||||| |||||||||    
T  12651922 aaattcgataaaaacaaaaatgatgaatttacgaacaaactcgtagcattcatgctaatagcataaaatgacaaattacaaaaacctacacatatgacta 12652021  T
Q  217 tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12652022 tattcaagtctccggaatacctaagtcgtcggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 12652083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 166
Target Start/End: Original strand, 31936287 - 31936395
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac------aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  31936287 aaaaataaacgatattcgttcattcaaattgatagagtacatagatacaatacatatctaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatatgtgaacaaact 31936386  T
Q  158 cacatcatc 166  Q
    |||| ||||    
T  31936387 cacaacatc 31936395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 19402703 - 19402771
Alignment:
Q  288 cggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19402703 cggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 19402771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5146393 - 5146307
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5146393 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 5146307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7049598 - 7049476
Alignment:
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7049598 tcacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaataatcatatctccggatctgcaa 7049499  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| || || | |||||||||||    
T  7049498 cgtggatgatgtcaaagtcattg 7049476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33129981 - 33129855
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||   |||||    
T  33129981 aaaaataaatgatattcattcattcaaat-gatagaatacatcgatataatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatatgaacaaa--tacatc 33129885  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagt 193  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  33129884 atccatgttaataacataaaacgacaaagt 33129855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 904714 - 904521
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||      
T  904714 aaaaataaatgatatatatttattcaaattgatgcagtacatcgatacaattaaagtttgctaaaaacaaaaatgatgaatcggcgaacaaactcacaat 904615  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||   ||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||  |||| ||||||    
T  904614 attcatgttaatagtataaaacgacaaagtacaaaagcctacacggatgactatattcaagtcactggaatacccgtgtctatggatttgcaac 904521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33195042 - 33194825
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgataga-gtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||  |  || ||| |||||     
T  33195042 aaaaataaatgatattcaatcatttaaattgataggtgtacatcgatacaatacaatttctctaaacacaaaattgatgaatccgcaaacaaaatcacaa 33194943  T
Q  163 catccatat-taatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||      |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| |    
T  33194942 catccatatgtaatagcttaatacgacaaagtacaacaacctacacataagactatattcaagtctccagaatacccatgtctccgaatctacaacgtgg 33194843  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||  ||||||||||||    
T  33194842 aagaaaccaaagtcattg 33194825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29285191 - 29284913
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaa-caaaaaggatgaatttgtgaataaactcac 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||       ||| |||| | |||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||    
T  29285191 ataaaaataaacgatatttattcattcaaattgatataataca-------aattcaaaattgctaaaaaacaaaaaggatggatatgcgaacaaactcac 29285099  T
Q  161 atcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
      ||| ||| ||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  29285098 gacattcatgttaataacataaaacggaagagtacatatagctacaaatatgactatattcaagtctctagaatacatatgtcttcatatctgcaacgtt 29284999  T
Q  261 gacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    || |||  |||||||||||  |||||      ||  ||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29284998 gatgacatcaaagtcattg--attga------atcaaca--cttaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaat 29284913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Original strand, 15469926 - 15470069
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa-tacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | | || |||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||    
T  15469926 atattcattcattcaaattgatagggtatatcgatataaattcgaaatcgctaaaaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgtta 15470025  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactat 217  Q
    |||  ||||||||  | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15470026 atatcataaaacggtagagtacatattcctacaaatatgactat 15470069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Original strand, 5527302 - 5527578
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaac--aaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||  |   ||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  5527302 aaaaataaatgatattcattcattcgaattgatagagtacatcaatacaatataaattc---aaagtcgttaaaaaaatgaa-ttgtgaacaaactcaca 5527397  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     |||| || ||| ||| ||||||||||| |||| || | ||||| ||||||| ||||||||  | ||  |||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  5527398 acatctatgttagtagcataaaacgacatagtatctctacctacgaatatgaatatattcaaatatctagaatactcatctctccagacatgcaatgttg 5527497  T
Q  262 acgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||| || ||||       |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  5527498 acggcgtcaaa------atcattgattggatctacacttgttcaaagctaatatttcaacctgaattaaataatcatcgcactaaga 5527578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 347
Target Start/End: Original strand, 16328769 - 16329020
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataa 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||| ||||||||| ||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16328769 aaattgatagagtacatccatacaatacaaattcaaagtcgctataaacaaaaaagatgaatatgcaaacaaacttacaacatccatattaatagcataa 16328868  T
Q  183 aacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtca 282  Q
    ||| ||| ||||  |||| |||| ||||||| |||||| | ||||  | || ||||||      |||||| |||||| |||| || |||||||||||  |    
T  16328869 aacaacagagtacttatgtctactaatatgattatattaaagtctttgcaaaactcat------ggatctacaacgtcgacg-cgtcaaagtcattg--a 16328959  T
Q  283 ttgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    || |    || ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16328960 ttaa----atttgcacttactcaaaactaatctttcaacctaaatcaaataaacacaggactaag 16329020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22530631 - 22530546
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||    
T  22530631 attcattgatttaaatttgtagagtacatcgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcacat 22530546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14731062 - 14730801
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaa-tttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||      |||||||  |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14731062 gatattcattcattcaaattgataacatacatcgatacaatacatattcaaagtcgctaaaat-aaaaagaatgaaatttgcgaacaaactcacatcatc 14730964  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||| ||||||  |||||||  || ||||  ||||||||||||||||| |||||| | | | ||| ||||  ||||| | ||||| ||||| ||| || |     
T  14730963 catgttaataacataaaacatcatagtacatatgcctacaaatatgattatattaaagccaccgaaata--catgttttcggatatgcaatgttaacaat 14730866  T
Q  267 gccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    || |||||| |||  |||||    || |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14730865 gcaaaagtcgttg--attga----atttgcacttgattaaagttaatcattcaacctgaatcaaataaaca 14730801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31395674 - 31395488
Alignment:
Q  92 ttgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||      | |||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||| |||| |  ||||||    
T  31395674 ttgatagagtacatcgatacaatccaaattcaaagttgttaaaaacaaaaaaggatgaatttgaaaa-aatctcacatcatccatgttaaaaacataaaa 31395576  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    ||  | || | ||||||  ||| |||||||||||||||  ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31395575 cgctagagaatctatgctaacacatatgactatattcaattcttcagaaaactcatttctccgaatctgcaacgttgacaacgccaaa 31395488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12156430 - 12156302
Alignment:
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatct 315  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||  |  |||||    ||||||||||| | |||  || |||    
T  12156430 atattcaagtctctggaatacgcatgtctccggatctgcaatattgacgaagtcaaagtcaagg--attga----atatgcacttgttcaaacttagtct 12156337  T
Q  316 ttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12156336 ttcaacctgaatcaaataaataccgcactaagacg 12156302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23588116 - 23588002
Alignment:
Q  80 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagta 179  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||  || ||||| ||||||| |||||  ||    
T  23588116 cattcattcaaattgacatagtacatcgatacaatactaattcgctaaaaataaaaatgataaatttgcaaactaattcacaacatccatgttaatgata 23588017  T
Q  180 taaaacgacaaagta 194  Q
    ||||||  |||||||    
T  23588016 taaaactgcaaagta 23588002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4085143 - 4085087
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4085143 aaaaataaacgatattcattcagtcaaatcgatagagtacatcgatacaatacaaat 4085087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5545126 - 5545062
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaa 128  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  5545126 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgtaaattcgctaaa 5545062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 6419533 - 6419589
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6419533 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgatagactacatcgatacaatacaaat 6419589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 355
Target Start/End: Original strand, 1914993 - 1915146
Alignment:
Q  196 ctatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatg 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||| ||  |||  |||||||||||  ||||||||| |||| |||||  |  |||    || ||    
T  1914993 ctatgcctacaaatatgaatatattcaagtctctataatattcgcgtcctcggatctgcaatattgacgacgtcaaaatcattaac--tga----atttg 1915086  T
Q  296 cacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    |||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1915087 cacttgttcatagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagacgggaaa 1915146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8508406 - 8508295
Alignment:
Q  232 aatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaa 331  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    || |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||    
T  8508406 aatactcatgtttatgggtctgcaacgttgacgacgcaaaagtcattg--attca----atctgcacttgatcaaaactaatcttttaatctgaatcaaa 8508313  T
Q  332 taaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||| |||||||||    
T  8508312 taaacaccacactaagac 8508295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27135547 - 27135342
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgcta-----aaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||   |     |||| ||||| ||||||| |||||| ||| | | | ||||||     
T  27135547 atattcatttattcaaactgatagactaaatcgatataatacaaattcaaaatcaataaaagaaaaatgatgaatatgtgaacaaagtaaaaacatccaa 27135448  T
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
     ||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||| |||||     ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  27135447 gttaatagcataaaataacatagtatctatgcctataaatac----atattcaagtctcttgaatactcgtgtctccggatctgcaacattgatgacgac 27135352  T
Q  270 aaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||    
T  27135351 aaaatcattg 27135342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20430904 - 20430769
Alignment:
Q  125 taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatg 224  Q
    |||||||||||| |||  || ||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||   | |||||| |    
T  20430904 taaaaacaaaaaagatatatatgcaaataaactcacattatccatgttaatagcataaaacgacatagtacatatgcatacaaatatatttgtattcaag 20430805  T
Q  225 tctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
     | ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  20430804 ccaccgaaatactcatgtttccgaatctgcgacgtt 20430769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31680877 - 31680759
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaa-caaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||      ||| |||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| | |||    
T  31680877 atatttattcattcaagttgatagagtatattgatacaatacaaatctaaagtcgttaaaaaacaaaaagaatgaatatatgaacaaactcacaacttcc 31680778  T
Q  168 atattaatagtataaaacg 186  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  31680777 atattaatagcataaaacg 31680759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32458076 - 32457884
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||| ||||| ||| || ||| |  |||| | ||||||| ||||    
T  32458076 atattcattcatttaaattgataaagtgcatcgatataatgcaaattcaataaaaataaataggataaatctgcgaacaggctcataacatccatgttaa 32457977  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaa 271  Q
     || ||||||| ||||||||   |||||| || ||||||| ||    |  ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  32457976 aagcataaaacaacaaagtacaaatgcctgcacatatgaccat----aaatctccagaataatcatgtatccgaatctgcaacgtggatgacgccaa 32457884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 222
Target Start/End: Original strand, 16338044 - 16338142
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||   |||||||| ||||||| ||||||||    
T  16338044 ctaaaaacaaaaaagatgaatctgcaaacaaacttacaacatccatattaatagcataaaacaataaagtactaatgcctactaatatgattatattca 16338142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28943705 - 28943501
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc-----gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||     | ||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||  || ||    
T  28943705 gatattcattcatccaaattgatagagtatattgatataatacaaattcataatgttaaaaacgaaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaaaataca 28943606  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | ||||||  ||||||| ||||||||      |||||| | |||||||||||||  |||   |||||||||||| | | ||| ||||| |||||| |||     
T  28943605 tgttaataacataaaaccacaaagta-----ccctacatacatgactatattcaaatctttagaatactcatgttttcagat-tgcaatgttgacaacgt 28943512  T
Q  269 caaagtcattg 279  Q
    |||||||||||    
T  28943511 caaagtcattg 28943501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1944506 - 1944445
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgct 125  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1944506 aaaaataaatgatattcatttatccaaattgatagagtacattgatacaatacaagttcgct 1944445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 332
Target Start/End: Original strand, 9043784 - 9044055
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||       ||| |||||| ||||| |||| || |||||| |||||    
T  9043784 aaaaattaacgatatttattcaattaaattgatagagtatatcgatacgatacaaaaccaaagtcgttaaaaataaaaatgatggatatgtgaacaaact 9043883  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaac---tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgc 254  Q
    || | ||||||| ||||||  ||||||||  | | ||||   ||| |||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||| || |||| ||     
T  9043884 caaagcatccatgttaatatcataaaacggtaga-taacacatatacctacaaatatgacaatattcaagccaccgaaatactcatgtttctggatttgt 9043982  T
Q  255 aacgttgac-gacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaat 332  Q
    ||||||||  ||| |  |||||||||  |||||    |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9043983 aacgttgatagacacataagtcattg--attga----atatacacttgatcaaaattaatctttcaacctgaatcaaat 9044055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 185
Target Start/End: Original strand, 15985643 - 15985758
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||      |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||  |||| |    
T  15985643 atattcattaatttaaattgatatagtaaatcgatacaatatagattcaaagtcgctaaaaacaaaaag-atgaatctgcgaataaacataccacatcta 15985741  T
Q  169 tattaatagtataaaac 185  Q
    |||||||||||||||||    
T  15985742 tattaatagtataaaac 15985758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 258
Target Start/End: Original strand, 20028441 - 20028569
Alignment:
Q  129 aacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctc 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||  | ||| |||| || |||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20028441 aacaaaaaggatgaatttc-gaacaattttacaacatcaatgttaatagtataaaacggcagaatatatatgcctacaaatatgactatattcaagtccc 20028539  T
Q  229 cggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
     | ||||| |   |||||||||||||||||    
T  20028540 agaaatacgcgaatctccggatctgcaacg 20028569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3359005 - 3358949
Alignment:
Q  282 attgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacac 338  Q
    |||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3359005 attgattggatatgcatttgatcaaaactactctttcaacctgaatcaaataaacac 3358949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 8694088 - 8694160
Alignment:
Q  207 aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  8694088 aatatgactatattcatgtctccggaataaccatgcatctagatctacaacattgaggacgccaaagtcattg 8694160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31297105 - 31296991
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||  |||||||||||  ||||| ||||  || ||| ||||||| |||||||| |||    
T  31297105 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc---agaat-caacatcgctaaaaacgtaaagggtgaaaatgcgaacaaactcaaatcatccaaatt 31297010  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  31297009 aatagcatacaacgacaaa 31296991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3359146 - 3359047
Alignment:
Q  123 gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| || ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3359146 gctaaaaacaaaaggaatgaatttgcgaacaaactcacgacattcatgttaatagcataaagcggcattgtacatatgcctacaaatataactatattca 3359047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 356
Target Start/End: Original strand, 15470147 - 15470198
Alignment:
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15470147 aaaacgaatcttttaacctgaatcaaataaacaccgcactaacacgagaaat 15470198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7870538 - 7870444
Alignment:
Q  126 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    ||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||  || ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  7870538 aaaaacaaaaaggatgaacccacgaacaaactcacatcatccaggttaatagcataaaactgcagagtatgtatgcctacaaatatgattatatt 7870444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 33052972 - 33053087
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  | |||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||  |    
T  33052972 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc----aaatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagt 33053067  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  33053068 taatagcatacaacggcaaa 33053087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15176015 - 15175970
Alignment:
Q  311 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15176015 aatcttttaacctgaatcaaataaacaccgcactaacacgagaaat 15175970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 347
Target Start/End: Original strand, 16339734 - 16339801
Alignment:
Q  280 tcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    |||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  16339734 tcattgattgaatttgcacttactcaaaactaatctttcaaccaaaatcaaataaacacgggactaag 16339801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 161
Target Start/End: Original strand, 32327024 - 32327109
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  32327024 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcaca 32327109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33197665 - 33197610
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaa 130  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33197665 atatacatttattcaaattgattgaatacatcgatacaatgcaaattcactaaaaa 33197610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35039085 - 35039010
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  35039085 caaagtcgttaaaaacaaaaatgataaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacaacaaa 35039010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Original strand, 3610155 - 3610298
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |  |||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||        |||||||| | || |||    
T  3610155 tatgcctataaatatgactatatctaaatctctgaaatactcaagtcttcggatctacaacgttgacaatgtcaa--------tcattgattgaatctgc 3610246  T
Q  297 acttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||   ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3610247 acttgtccaaagctaacttttcaacctgaatcagataaacaccgcactaaga 3610298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 347
Target Start/End: Original strand, 16338213 - 16338255
Alignment:
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16338213 aaaactaatctttcaacctaaatcaaataaacacaggactaag 16338255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 186
Target Start/End: Original strand, 18248802 - 18248864
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  18248802 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcacaatattcatattaatagcataaaacg 18248864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 3913378 - 3913411
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3913378 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 3913411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 11321348 - 11321381
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11321348 cgatatttattcattcaaattgatagagtacatc 11321381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12170754 - 12170721
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12170754 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 12170721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 16360936 - 16360989
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16360936 tgcacttactcaaaactaatttttcaacctaaatcaaataaacacaggactaag 16360989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 21426490 - 21426523
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21426490 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 21426523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 528204 - 528269
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  528204 ctaaaaacataaaagatgaatctgtgaacaaactaacatca--catattaatagcatacaacgacaaa 528269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 606489 - 606457
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  606489 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 606457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 166
Target Start/End: Original strand, 8027948 - 8027992
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8027948 cgctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacatcatc 8027992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22571689 - 22571653
Alignment:
Q  70 aagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22571689 aagcgatattcgttcattcaaattgatagaatacatc 22571653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 106
Target Start/End: Original strand, 29255247 - 29255283
Alignment:
Q  70 aagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29255247 aagcgatattcattcagtcaaattgatggagtacatc 29255283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 29744519 - 29744479
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29744519 atattcattcattcaaattgatagaatacatcagatacaat 29744479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 30608323 - 30608429
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||   ||| |||||||  ||||||||||||||  || || |||||| ||||||  |||||    
T  30608323 attcattcattcaaattgatagagtaaatcagatacaa-aca---tcgttaaaaacgtaaaggatgaatttgcaaacaatctcacaacatccaagttaat 30608418  T
Q  176 agtataaaacg 186  Q
    || ||| ||||    
T  30608419 agcatacaacg 30608429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31984427 - 31984395
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31984427 gatatttattcattcaaattgatagagtacatc 31984395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 102
Target Start/End: Original strand, 34185499 - 34185527
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185499 gatattcattcattcaaattgatagagta 34185527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 195)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 67 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4732526 - 4732230
Alignment:
Q  67 aataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat-------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4732526 aataaacgatattcattaattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaatccaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactca 4732427  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4732426 caacatccatgttaatagcataaaacaacaaaaaatttatgcctacaaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 4732327  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4732326 tgacgacgctaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagataatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 4732230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 65 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44942752 - 44942451
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44942752 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctataaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 44942653  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 249  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44942652 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtcttcgga 44942553  T
Q  250 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44942552 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaagctgaatcaaataaacaccgcactaagac 44942453  T
Q  350 gg 351  Q
    ||    
T  44942452 gg 44942451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4739796 - 4739496
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4739796 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 4739697  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||         |||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  4739696 cacaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtatctatgcctacaaatatgactaatgtgacaatattcaagtcttcagtatactcatgtctccgg 4739597  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4739596 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 4739497  T
Q  349 c 349  Q
    |    
T  4739496 c 4739496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 66 - 356
Target Start/End: Original strand, 10286670 - 10286968
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10286670 aaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactca 10286769  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaact--atgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
     |  |||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10286770 aaatatccatgttaatagcataaaccggcaaagtatctctatgcctacaaatatgactatatttttgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 10286869  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10286870 gttgacaacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 10286968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35333972 - 35333665
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  35333972 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaact 35333873  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35333872 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtcttcggaatactcatgtctccgg 35333773  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35333772 atctgcaacgttgatgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 35333673  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  35333672 cggaaaat 35333665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 9978332 - 9978630
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaataca------aattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  9978332 aaaaataaactatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacacatccaaattcgctaaaaacgaaaagaatgaatatgtgaacaaact 9978431  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9978432 cacatcatccatgttaatatcataaaacggaaaagtacttacgcctacaaatatgacgatatttatgtctctggaatactcatgtctccggatctgcaac 9978531  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9978532 gttgatgacgccaaaatcattgtcattgattggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 9978630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25068308 - 25068012
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25068308 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 25068209  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25068208 cacatcatcagtgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtcttcggaatcctcttgtctccggatctgcaac 25068109  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25068108 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcgaatctgc-tttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaaca-cgcactaagacgggaaat 25068012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33012515 - 33012208
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33012515 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaact 33012416  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33012415 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgccttcaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatatctccgg 33012316  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33012315 atatgcaacgttgacgacgccaaaatcattgtcgttgatcggatttgcacttgatcaaagctaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactaaga 33012216  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  33012215 cgggaaat 33012208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 20560787 - 20561093
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20560787 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 20560886  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta-------tat-tcatgtctccggaatactcatgtctccgga 249  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||       ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20560887 cacaacatccatgttaatagtataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgactaatatgactatattatgtttccggaatacccatgtctccgga 20560986  T
Q  250 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20560987 tttgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctactcttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagat 20561086  T
Q  350 gggaaat 356  Q
    |||||||    
T  20561087 gggaaat 20561093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29543260 - 29542952
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  29543260 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaagaaagaatttgtgaacaaact 29543161  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
     ||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29543160 aacaacatccgtgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaatacccatgtctccgg 29543061  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaat-aaacaccgcactaag 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29543060 atctgcaacgttgatgacgccaaaatcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaaacaccgcactaag 29542961  T
Q  348 acgggaaat 356  Q
    |||||||||    
T  29542960 acgggaaat 29542952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 38384120 - 38384418
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  38384120 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagcacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacgtgtgaacaaact 38384219  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    || | ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  38384220 cagagcatccatgttaatagcctaaaacggcaaggtacctatgcctataaatatgactatatttaagtctccggaatcctcatgtctccggatctgcaat 38384319  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38384320 gttgatgacgccaaagttattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaataaaataaacaccgcactaagacggaaaat 38384418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12705155 - 12704847
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  12705155 ataaaaataaaggatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaa 12705056  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12705055 ctcacaacatccgtgttaatagcataaaacg-caaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgattatattcatgtctccagaatactcatgtctcc 12704957  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12704956 gaatctgcagcgttgacgacgccaaagtcattgtgattgatctgatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaa 12704857  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    ||||||||||    
T  12704856 gacgggaaat 12704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5754748 - 5754448
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5754748 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 5754649  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 249  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5754648 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgaccaatatgactatattcatgtctccggaatacttatgtctccgga 5754549  T
Q  250 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5754548 tctgcaacgttgacgacaccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 5754455  T
Q  350 gggaaat 356  Q
    | |||||    
T  5754454 gagaaat 5754448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 9689639 - 9689946
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  9689639 aaaaataaacgatatacattcatttaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaact 9689738  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctac---------aaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9689739 catagcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatactacaaatatgactatattcatgtctctggaatacttatgtctccgg 9689838  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9689839 atctgcaatgctgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactgaga 9689938  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  9689939 cgggaaat 9689946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15920320 - 15920035
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |    
T  15920320 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcgcaac 15920221  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    ||| || ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15920220 atcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattcaagtcttcgaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgac 15920121  T
Q  264 gacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||      ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15920120 gacgccaaagtc------attgatcggatctgcacttgcacaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaaca-cgcattaagacgggaaat 15920035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36868475 - 36868168
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||      ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||    
T  36868475 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatataatataaatttaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgtacaaact 36868376  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36868375 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatacgactatattcatgtctccagaatactcatgtctcctg 36868276  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36868275 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgaacggatttgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 36868176  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    || |||||    
T  36868175 cgagaaat 36868168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 13878663 - 13878970
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13878663 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatcaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 13878762  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||||||||         |||||||||| | ||||| | | |||||||||| ||||    
T  13878763 cacatcatccatgttaataccataaaacggcaaagtacttatacctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctctgaagtactcatgtccccgg 13878862  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  13878863 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccctactaaaa 13878962  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  13878963 cgggaaat 13878970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 14018788 - 14019095
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14018788 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatcaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 14018887  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||||||||         |||||||||| | ||||| | | |||||||||| ||||    
T  14018888 cacatcatccatgttaataccataaaacggcaaagtacttatacctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctctgaagtactcatgtccccgg 14018987  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  14018988 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccctactaaaa 14019087  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  14019088 cgggaaat 14019095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Original strand, 31908472 - 31908777
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31908472 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 31908571  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 249  Q
    ||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         | ||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  31908572 acagcattcatgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgattatgtttttgtctctggaatacttatgtctccgga 31908671  T
Q  250 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31908672 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaa-ctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 31908770  T
Q  350 gggaaat 356  Q
     ||||||    
T  31908771 aggaaat 31908777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 28261559 - 28261849
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28261559 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgataaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaact 28261658  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| |||||||  |||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||||    
T  28261659 cacaacatccatggtaataacataaaatgacaaagtaccgatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgcaac 28261750  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261751 gttgacgacgcgaaagttattgtcattgatcggatctgctcttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 28261849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 12890771 - 12891079
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12890771 aaaaataaacgatattcattaattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 12890870  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaa----------tatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccg 247  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||          |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||      
T  12890871 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctaaaaaatatgactaatatgactatatttatttctctggaatactcatgtctcta 12890970  T
Q  248 gatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 347  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12890971 gatctacaacgttgacgacaccaaagaaattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagg 12891070  T
Q  348 acgggaaat 356  Q
    ||| |||||    
T  12891071 acgagaaat 12891079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43696335 - 43696028
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  43696335 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatcgatgaacaaact 43696236  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  43696235 cacatcatccatgttaatatcataaaacggcaaagtacatgtgcttacaaatatgactaatatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtcttcgg 43696136  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43696135 atctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgttcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 43696036  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    | ||||||    
T  43696035 caggaaat 43696028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 351
Target Start/End: Original strand, 18089066 - 18089353
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18089066 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 18089165  T
Q  158 cacatcatcca--tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||    
T  18089166 cacaacatccacatattaatagcataaaacggcaaaatacctatgcctgcaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgca 18089257  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18089258 acgctgacgaagccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 18089353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 334
Target Start/End: Original strand, 34416417 - 34416702
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  34416417 aaaaataaacgatattcattcattcgaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaagacgaatctgtgaacaaact 34416516  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
     ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34416517 tacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgg 34416616  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataa 334  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34416617 atctgcaatgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataa 34416702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 11937520 - 11937819
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  11937520 aaaaataaatgatattcatttatccaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaatttcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaactaact 11937619  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta-tattcat-gtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||   | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11937620 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactagtctccagaatactcatgtcttcggatatgca 11937719  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11937720 acgttgacgacgctaaggtcattgtcactgatcggatctgcacttgctcaatactaatctttcaacct-aatcaaataaacaacgcactaagacgggaaa 11937818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 353
Target Start/End: Original strand, 28230751 - 28231055
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||   | || |||||    
T  28230751 aaaaataaacgatattcgttcattcaaattgttagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcactaaacaaact 28230850  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||         ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  28230851 cacagcctccatgttaatagtataaaacagcaaaatacatatgcctacaaatatgattaatatgactatattcatgtctctagaatattcatgtctccag 28230950  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28230951 atctgcaatgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctgatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 28231050  T
Q  349 cggga 353  Q
    |||||    
T  28231051 cggga 28231055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 4603970 - 4604268
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |      |||| ||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  4603970 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaatccgctagaaacaaaaaagatgaatctctgaacaaact 4604069  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||||  |||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4604070 cacaatatccatgttaatagcataaaacggcaaaatatctatgcctacaaatatgactatattcaagtctctagaatact-atgtctctagatctgcaac 4604168  T
Q  258 gttgacgacgccaaa-gtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4604169 gttgacgaagtcaaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctagtctttcaacctgaatcaaataaacaccacactaagacgggaaat 4604268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 356
Target Start/End: Original strand, 11798195 - 11798484
Alignment:
Q  67 aataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcac 160  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||| |||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  11798195 aataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaattcaaattcaaagtcgctaaaaataaaaag-atgaatctgcgaacaaactcac 11798293  T
Q  161 atcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccg-gatctgcaacgt 259  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11798294 aacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctccataatactcatgtctccgaaatctgcaacgt 11798393  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| |||      |||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11798394 tgacgacgcaaaa------gtcattgatcggatctacacctgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaaat 11798484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32314892 - 32314602
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32314892 aaaaataatagatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaaatccaaattcgtttaaaacaaaaaggatgaatt-gtgaacaaac 32314794  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    ||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| | ||||||||||||||||||    
T  32314793 tcaaaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atatttatgtctccggatctgcaa 32314702  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32314701 cgttgacgacgccaaagttattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 32314602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Original strand, 38534960 - 38535266
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38534960 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacat-gatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 38535058  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaa-gtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||  |||| |||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |    
T  38535059 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaatgtacatatgtctacaaatatgattaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtatctag 38535158  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38535159 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcatggatcgaacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 38535258  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  38535259 cgggaaat 38535266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34471423 - 34471126
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat--tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  34471423 aaaaataaacgatatacattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatcctcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcaca 34471324  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatg---------actatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34471323 acatccatgttaatagcataaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctctagatct 34471224  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    ||||||||||| ||||||||      ||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34471223 gcaacgttgacaacgccaaa------gtcattgattggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacatgaatcaaataaataccgcactaaaacggg 34471130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 17267780 - 17268087
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  17267780 aaaaataaacgatattcatttattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaact 17267879  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||| ||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||    
T  17267880 cacaacatacacgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtcttcggaatactcatttctacgg 17267979  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| || |    
T  17267980 atctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaattttttaacctgaatcaaataatcaccacacaaaaa 17268079  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  17268080 cgggaaat 17268087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 43473799 - 43474089
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43473799 aaaagtaaacgatattcattcattcaaatcgatataatacattgatataatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 43473898  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||| |||||||||     
T  43473899 cacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactcatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccagatctgcaat 43473990  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43473991 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 43474089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26491747 - 26491532
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26491747 aaaaacaaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacatt 26491648  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26491647 atccatgttaatagtataacacgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatgcccatgtctccggatctgcaacgttgac 26491548  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  26491547 gactccaaagtcattg 26491532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27096156 - 27095866
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27096156 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatggagtacatagatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 27096057  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     || |  ||   ||| ||| |||||||||||||||||    
T  27096056 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta-----atatgacc---atattcaagtctccggatctgcaac 27095965  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27095964 gttgatgacgctaaagtcattgtcattgatcggatcagtacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacatcgcactacgacgggaaat 27095866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 4426313 - 4426619
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  4426313 aaaaataaacgacattcattcattcaaattcatagagtacatcgatacagtacaaatccaaattcgctaaaaactaaaaggatgaatttatgaacaaact 4426412  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    || | ||||||| ||||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||         |||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  4426413 catagcatccatgttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccg-aatattcatgtatccgg 4426511  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426512 atctgcaacgttgacgatgataaagttattgtcatttatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 4426611  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  4426612 cgggaaat 4426619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32015716 - 32015413
Alignment:
Q  68 ataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||| | |    
T  32015716 ataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaagcaaaaatgttgaatatgtgaacaaacttaaa 32015617  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
     ||||||| ||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||         |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  32015616 acatccatgttaatagcataaaacagcaaagtatttatgcctacaaatatgactaatatgactatattaaagtctctggaatattcatgtctccagatct 32015517  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  32015516 gcaacgttgacgatgccaaagtcattgacattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgtactaagacgga 32015417  T
Q  353 aaat 356  Q
    ||||    
T  32015416 aaat 32015413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Original strand, 13740308 - 13740615
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13740308 aaaaacaaacgatattctttcattcaaattgataaagtacatcaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgagtttgtgaacaaact 13740407  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------------tgactatattcatgtctccggaatactcatgt 242  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||               |||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  13740408 cacagcatccatgttaatactataaaacggcaaagtacctatgcctataaatatgactatattcaatatgactatattcatgtctccgaaatatgcatgt 13740507  T
Q  243 ctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13740508 ctccggatctgcaacgttgacgacgtcaaagtaattgtcattgattggatctgtacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgca 13740607  T
Q  343 ctaagacg 350  Q
    ||||||||    
T  13740608 ctaagacg 13740615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 92 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22597575 - 22597295
Alignment:
Q  92 ttgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  22597575 ttgatagagtacatctatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcataacatccatgttaatagcataaaa 22597476  T
Q  185 cgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtc 275  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||         ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  22597475 cggcaaagtaccaatgcctacaaatatgactaatatgactatatccaagtctccggaatactcatgtctctggatctgcaacattgacgatgtcaaagtc 22597376  T
Q  276 attgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22597375 attatcattgatcggacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 22597295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41798060 - 41797754
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41798060 aaaataaacgatgttcgttcattcaaatt-atagagttcattgatacaatacaaatttaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 41797962  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta-------------tattcatgtctccggaatactcatgtctc 245  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||             |||||| ||||| |||||||||||||||     
T  41797961 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatataactaatatgactatatatattcaagtctctggaatactcatgtctt 41797862  T
Q  246 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  41797861 cggatctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgaacggatctgcacttgctcaaagctaatctt---acctgaatcaaataaacaccacacta 41797765  T
Q  346 agacgggaaat 356  Q
    |||||||||||    
T  41797764 agacgggaaat 41797754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 79 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35354071 - 35353871
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  35354071 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 35353972  T
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35353971 ataaaacaacaaagtacataagcctataaatatgactatattaaaatctccgaaatagtcatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtcatt 35353872  T
Q  279 g 279  Q
    |    
T  35353871 g 35353871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11942835 - 11942584
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||      || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11942835 aaaagtaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacgtcgatataatacaaattcaaattcgcaaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaataaact 11942736  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatg---------actatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| || |||| ||||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11942735 cacaacacccatgttaatagcataaaatggaaaagtacttatgcctacaaatatgtctaatatgactatattcatgtctctggaatactcatgtctccag 11942636  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcactt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11942635 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcactt 11942584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16136545 - 16136322
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16136545 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 16136446  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaat---------atgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16136445 cacattatccatgttaatagcataaaacggcaaagttcctatgcctacaaatatgattaatatgactatattcatatctccggaatactcatgtctccga 16136346  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16136345 atctgcaacgttgacgacgccaaa 16136322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37884096 - 37883884
Alignment:
Q  67 aataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37884096 aataaacgatattcattcattcaaattgatatagtacatcaatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatc 37883997  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37883996 catgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtatctagaatactcatgtctccgtatctgcaacgttgacgac 37883897  T
Q  267 gccaaagtcattg 279  Q
     ||||||||||||    
T  37883896 tccaaagtcattg 37883884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 25622712 - 25622927
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  25622712 aaaaataaatgacattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaac 25622811  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  25622812 atccatgttaatagcataaaacgtcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattaaagtctccggaatactcatgtcttcgaatctgtaacgttgac 25622911  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| |||||||||||    
T  25622912 gacgtcaaagtcattg 25622927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 3397660 - 3397862
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  3397660 attcattcattcaaattgatagagtacattgatgcaatacaaattctttaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacaaccatgttaata 3397759  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |  |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3397760 gcataaaacgacaaagtacataagcatacaaatatgactatattaaaatctccgaaatagccatgtctccggatctgcaatgttgatgacgccaaagtca 3397859  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  3397860 ttg 3397862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34480413 - 34480197
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  34480413 ataaaaataaatgatattcattcgttcaaattgatagagtacaccggtacaatgtaaattcactaagaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcaca 34480314  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34480313 acatccatgttaatagaataaaacgacaaagtacaaaaacctacacatatgactatattcaagtcgccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtgg 34480214  T
Q  262 acgacgccaaagtcatt 278  Q
    | |||||||||||||||    
T  34480213 atgacgccaaagtcatt 34480197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12366304 - 12366099
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || ||||||| |||    
T  12366304 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaacctctcaacatccatgtta 12366205  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| ||||||||| ||||||   | ||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||    
T  12366204 atagcataaaacgaaaaagtactaaagcctacacatatgacaatatttaagtcaccggaatactcatgtctccggatctgcaacattggtgactccaaag 12366105  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  12366104 tcattg 12366099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 207 - 356
Target Start/End: Original strand, 34962888 - 34963037
Alignment:
Q  207 aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  34962888 aatatgactatattcaaatctccagaatcctcatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgataggatctgcacttgctcaa 34962987  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34962988 atctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 34963037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 277
Target Start/End: Original strand, 5071051 - 5071251
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  5071051 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaataacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaata 5071150  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||||| || | ||  || ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5071151 gcataaaacggcataatacataagcctacaaatatgactatattaaaatatccggaatagccatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtca 5071250  T
Q  277 t 277  Q
    |    
T  5071251 t 5071251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Original strand, 43928985 - 43929183
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  43928985 attcattcaaattgatcaagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgttaatagcat 43929084  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43929085 aaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 43929183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Original strand, 2251033 - 2251230
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  2251033 attcattcaaattgatagagtacatcgaagcaatataaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatt-gtgaacaaactcacgacatccatgttaatagcat 2251131  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2251132 aaaactgcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaataaccatgccttcggatctgcaacgttgatgacgccaaagtcattg 2251230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25771890 - 25771676
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  25771890 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatca 25771791  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| || |    
T  25771790 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccagatctgcaacgtggatg 25771691  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||| ||||||    
T  25771690 acgccaaaatcattg 25771676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3390869 - 3390654
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    
T  3390869 aaaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacagtctcacatc 3390770  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||    |||||||| ||||  ||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||     
T  3390769 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatagctatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggat 3390670  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  3390669 gacgccaaagtcattg 3390654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 356
Target Start/End: Original strand, 11580824 - 11581091
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataa 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  11580824 aaattgattgagtacatcgatacaatacaaatttacagtcgctaaaaacaaaaacgatgaatttacggacaaactcacaacatccatgttaatagtacaa 11580923  T
Q  183 aacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtca 282  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| | | |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |    
T  11580924 aacgacaaagtacatatgtctacaaatatgaccatattcaagccacttaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgacacaaaaatcattg--a 11581021  T
Q  283 ttgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||    || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11581022 ttga----atttgcacttgatgaaacctaatctttcaacctgaatcaaataaataccgcactaatacgagaaat 11581091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 27023808 - 27024022
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  27023808 aaaataaaagatatttattcattcaaatcgatagagtacatcgatataatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatca 27023907  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||    |||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  27023908 tccatgttaatagcataaaatggcaaagtacaattgcccacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 27024007  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    || ||||||||||||    
T  27024008 actccaaagtcattg 27024022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28228657 - 28228453
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||| ||||||||  ||    
T  28228657 atattcattcattcaaattgatagagaacatcgatataatgcaaattcactaaaaacaaaaaagattaatttgctaacaaactcacaacatccataacaa 28228558  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28228557 tagcataatacgacaaagtaaaaaagcctacacatatgactatattcaagcctctgaaatactcatgtcttcggatctacaacgtgggcgacgccaaagt 28228458  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  28228457 cattg 28228453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 18141149 - 18141364
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| || || | ||||      
T  18141149 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatgtaatgcaaatttgctaaaaacaaaaatgattaatctgtaaacaagcccacagt 18141248  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  18141249 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggag 18141348  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  18141349 gacgccaaagtcattg 18141364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 279
Target Start/End: Original strand, 31125063 - 31125262
Alignment:
Q  80 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagta 179  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||| ||||||  |    
T  31125063 catttattcaaattgataaagtacattgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgttaaaaaacttacaacatccatgttaatatca 31125162  T
Q  180 taaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31125163 taaaacggcaaagtacataagcctacaaatataactatattaaaatctccggaatagtcatgcctccgaatctgcaacattgatgacgccaaagtcattg 31125262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 356
Target Start/End: Original strand, 7072716 - 7072909
Alignment:
Q  146 tgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctc 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||                 |||||    
T  7072716 tgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatatgactatattcat-----------------gtctc 7072798  T
Q  246 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7072799 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgattggatttgcacttcctcaaaactaatatttcgacctgaatcaaataaacaccgcacta 7072898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 356
Target Start/End: Original strand, 17767227 - 17767521
Alignment:
Q  67 aataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgataca------atacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaata------- 153  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||      || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |           
T  17767227 aataaacgatattcattcatttaaattgatagagtactttgatacattttaaatccaaaatcgctaaaaacaaaaaggaagaatttgcgaacatgcgaac 17767326  T
Q  154 -aactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| ||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||    
T  17767327 aaactcacaacatccatgttaatagcataa---ggcaaagtatctatgcctacaaatatgactatattcaagtctcaataatactcatgtctccggatct 17767423  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggg 352  Q
    ||||||||||||||||  ||      |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  17767424 gcaacgttgacgacgcagaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatcttttaacctaaatcaaataagcaccgtactaagatggg 17767517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 44167381 - 44167594
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||    
T  44167381 aaaataaaagatattcattcattcaa-ttgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaggctcacatca 44167479  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  44167480 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatg 44167579  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||    
T  44167580 acgtcaaagtcattg 44167594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5930859 - 5930674
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  5930859 gatattcatttattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaattcgtgaacatgctcacaacatccatatta 5930760  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    |||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5930759 atagcataaaacgacaaaatacaaatgcctacacatatgaccatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgt 5930674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13269008 - 13268807
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| | ||||||| |||    
T  13269008 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaactcataacatccatgtta 13268909  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||  |||||||  |||||||   | || |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13268908 atatcataaaacagcaaagtacaaaagcttacacatgtgactatattcaagtctctggaatactcatgtccccggatcttcaacgttgaagacgccaaag 13268809  T
Q  274 tc 275  Q
    ||    
T  13268808 tc 13268807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3603420 - 3603216
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  3603420 atattcattcattcaaatttatatagtacttcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 3603321  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||    
T  3603320 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtcttcggatctgcaacatggatgacgtcaaagt 3603221  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  3603220 cattg 3603216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 15673632 - 15673851
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaat-----tgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  15673632 aaaaataaaagatattcattcattcaaattaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctg-aaacaaactc 15673730  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  15673731 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaaatactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatatccatgtctccagatctgcaaca 15673830  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15673831 ttgacgactccaaagtcattg 15673851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 19580670 - 19580885
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |    
T  19580670 aaaaataaatgagattcatccattcaaattgatagagtgcatcgatacaatgaaaatttgctaaaaacaaaaagtttgaatctgtgaacaaactcacaac 19580769  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||  |||||||   | | ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19580770 atccatgttaatagcataaaactgcaaagtactaaagtctacagatatgattatatttaagtctccggaatatccatgtctccggatctgcaacgttgac 19580869  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
     || ||||||||||||    
T  19580870 aactccaaagtcattg 19580885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 4878402 - 4878619
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata--caatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4878402 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcaca 4878501  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     ||||||| ||||||  ||||||||   |||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  4878502 gcatccatgttaataacataaaacggtcaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtcaccggaatactgatgtctccatatctgcaacattg 4878601  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||  ||||||||||||    
T  4878602 atgagtccaaagtcattg 4878619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10589516 - 10589326
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgac 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  10589516 aaattgatagagtatatcgatacaatgaaaatccgctaaaaacgaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggc 10589417  T
Q  189 aaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||   | ||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10589416 aaagtattaaagcctatacatatgactatatttaagtcttcggaatacccttgtctccggatctgcaacgttgatgactccaaagtcattg 10589326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41177303 - 41177089
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  41177303 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtaaatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaaca 41177204  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||||  ||||| | || ||||||||||| || |    
T  41177203 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgaatatatttaaatctccggaataaccatgttttcgaatctgcaacgtggatg 41177104  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  41177103 acgccaaagtcattg 41177089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43567317 - 43567104
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  43567317 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcaatatattgcaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgtgaacaggctcacaaca 43567219  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  43567218 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatg 43567119  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    || ||||||||||||    
T  43567118 acaccaaagtcattg 43567104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20570422 - 20570173
Alignment:
Q  67 aataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcac 160  Q
    ||||| |||||||||| |||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  20570422 aataaacgatattcatccatttaagttgataaaatacattgatacaattcaaattcaaaatcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcac 20570323  T
Q  161 atcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
    | |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20570322 agcatctatgttaatagcataaaacgacaaagtagctatgcttacaactatgactatattcaagtcttcggaatattcatgtctccggatctgtaacgtt 20570223  T
Q  261 gacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctt 316  Q
     ||||||| |||      |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  20570222 aacgacgcaaaa------gtcaatgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctt 20570173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Original strand, 16720516 - 16720724
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16720516 aaaaataaatgatattcattcatgtaaattgatataatacaacgatataatgcaaatttgctaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacagactcacatc 16720615  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||     
T  16720616 atccatgttaatagcataaaatgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaagtctccagaataatcatgtatctggatctgcaacgtggat 16720715  T
Q  264 gacgccaaa 272  Q
    || ||||||    
T  16720716 gaagccaaa 16720724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3465374 - 3465160
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| || |||||| ||    
T  3465374 aaaataaaagatatccattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaagctcacaaca 3465275  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||  ||||| || ||||||||||||| || |    
T  3465274 tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctccgaaataaccatgtttctggatctgcaacgtggatg 3465175  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||| ||||||    
T  3465174 acgccaaaatcattg 3465160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36508377 - 36508160
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattca---aattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||  ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   |||||    
T  36508377 aaaataaaagatattcattcattcattcaattgtaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaagcaaaaaggatgaatctgtgaacaggttcaca 36508278  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |    
T  36508277 acatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccggatctgcaacgtgg 36508178  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||||||||||||||||    
T  36508177 atgacgccaaagtcattg 36508160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11931318 - 11931150
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| ||||||||| |    
T  11931318 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaac 11931219  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgga 232  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  11931218 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtttccgga 11931150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 27191011 - 27191220
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||   ||||||| |||    
T  27191011 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcatggcatccatgtta 27191110  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaat----actcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
    |||| ||||||||  ||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    |  ||||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  27191111 atagcataaaacggtaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgcatgtttccagatctgcaacgtggatgacgcc 27191210  T
Q  270 aaagtcattg 279  Q
    ||||||||||    
T  27191211 aaagtcattg 27191220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 27840825 - 27841034
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||   ||||||| |||    
T  27840825 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcatggcatccatgtta 27840924  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaat----actcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
    |||| ||||||||  ||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    |  ||||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  27840925 atagcataaaacggtaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgcatgtttccagatctgcaacgtggatgacgcc 27841024  T
Q  270 aaagtcattg 279  Q
    ||||||||||    
T  27841025 aaagtcattg 27841034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 279
Target Start/End: Original strand, 7640064 - 7640239
Alignment:
Q  104 atcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcct 203  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||   ||||||    
T  7640064 atcgataaaatgcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcct 7640163  T
Q  204 acaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7640164 acacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 7640239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 267
Target Start/End: Original strand, 8064457 - 8064658
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||    
T  8064457 aaaataaacgatattcattcattcacattgatagagtatat-gatataataaagattcgttaaaaacaaaaagggtgaatctgcgaataaactcacaaca 8064555  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    |   | ||||||| ||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8064556 taagttttaatagcataaaacgacaaagtacataaacttgcaaatatgactatattcaagtcttcgaaataatcatatctccggatctgcaacgttgaag 8064655  T
Q  265 acg 267  Q
    |||    
T  8064656 acg 8064658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 168 - 348
Target Start/End: Original strand, 6431181 - 6431355
Alignment:
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  6431181 atattaatcgcataaaacggcaaagtacatatgcatacaaatatgactatatttaagtctccggaatactcatgtcttcagatctgcaacattgacgacg 6431280  T
Q  268 ccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    | |||      |||||||||| ||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6431281 caaaa------gtcattgatcagatctgcgcttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaatcaacaccgcactaaga 6431355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20036827 - 20036613
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  20036827 aaaaataaatgagatttattcattcaaattgataaactacat-gatacactgcaaattctctaaaaaagaaaaggatgaatccgagaataaactcacaac 20036729  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  ||||||   | ||||||| ||  |||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20036728 atccatgttaatagcataaaacggtaaagtacagaagcctacacattagactatatccaagtctacggaatacccatgtcttcggatctgcaacgttgac 20036629  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    | ||||||||||||||    
T  20036628 ggcgccaaagtcattg 20036613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6090334 - 6090121
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  6090334 aaaataaaagatactcattcattcaaattgaaagagtacatcaatataatgcaaattcgctcaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagattcacaaca 6090235  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    |||||  |||||| |||||||| |||||||   |||| |||| | ||||||||||| |  |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  6090234 tccatgctaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcatacaca-atgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatg 6090136  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    || | ||||||||||    
T  6090135 acactaaagtcattg 6090121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 9715222 - 9715427
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||  | |||    
T  9715222 gatattcatttattcaaattgatagagtacaccgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatctttgtta 9715321  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||  ||| ||||||||||||   | |||||||  | |||||||||||| |||| |||||||   ||||||| |||| | |||||| ||  |||||||||    
T  9715322 ataacatataacgacaaagtacaaaagcctacacgtttgactatattcaagtctgcggaatatctatgtctctggatttacaacgtggagaacgccaaag 9715421  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  9715422 tcattg 9715427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 25237009 - 25237214
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||| |||| ||| || ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  25237009 gatattctttcattcaaattgatagagtatatcgatacaatgcaaattcgttaaaacgtaaatggataaatctgggaacaaactcacaacatccatgtta 25237108  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||  |||||||| |||| ||   | ||||||| |||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||    
T  25237109 ataacataaaacggcaaaatagaaaagcctacacatatgattatatttaagtcccccgaatactcatgtctccgaatttgcaacgttgacgactcaaaag 25237208  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  25237209 tcattg 25237214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40125831 - 40125618
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  40125831 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatagatacaatgaaaatccgttaaaaacaaaaagaatgaatatgtgaacaaactcacatc 40125732  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| |||||||   |||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | || |  | ||||  ||||||| ||||||||||| || |||    
T  40125731 atccatgttaatag--caaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtgtatgaaatatccatgtcttcggatctgcaatgtcgac 40125634  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| | ||| ||||||    
T  40125633 gactctaaaatcattg 40125618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38822515 - 38822303
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||| ||    
T  38822515 aaaataaaagatattcattcattcaaattaa--gagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacatgctcacaaca 38822418  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    | ||| ||||||  || ||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||| | || |    
T  38822417 ttcatgttaataacatgaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacatggatg 38822318  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||    
T  38822317 acgtcaaagtcattg 38822303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 40038977 - 40039269
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgc------taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||| ||||||| |  ||| |||||    
T  40038977 aaaaataaacgatatccattcattcatattgataaagtacatcgatacaataaaaattcaaagtcattaaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaact 40039076  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||| |||  ||||| || |||||||  |||||| | | |  || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  40039077 cacaacgtccatgttaatagcataaaattacaaggtacatatgcttataaatatggttatattaaagccatcgaaatagtcatgtttccggatctgcaac 40039176  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| || || ||||||||||  |||||    || |||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40039177 gttgatgatgcaaaagtcattg--attga----atctgcacttgatcaatactaatttttcaacctgaataaaataaacaccgcactaagacggaaaat 40039269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44441825 - 44441630
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| | |    
T  44441825 aaaaataaatgatatttattgattcaaattgatagaatacattgatacattgcaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatctgcgaacaaactcatagc 44441726  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||   | | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  44441725 atccatgttaatagcttaaaacggcaaagtacaaaagtccacacatatgactatattcaagtctccggaataccaatgtctctgaatctgcaacgt 44441630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 337
Target Start/End: Original strand, 7581761 - 7582029
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaac----aaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    |||  |    ||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  7581761 aaaaataaatgatatttattcattcaaattgataaagtatatcgatacaaaacaaatta---aaagtctctaaaaaatgatgaatctgcgaacaaactca 7581857  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
      |||||| | ||||||| |||||| || | ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  7581858 tttcatccgtgttaatagcataaaatgatagagtatttatgcctacaaatatgattatattgaagtctccagaatattcatgtcttcggatctacaacgt 7581957  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||    || |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7581958 tgacgacgtcaaagtcgttg--attga----atttgcacttgctcaaagataatatttcaacctgaatcaaataaaca 7582029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44589322 - 44589206
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44589322 attcattcaaattgatagaataaatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 44589223  T
Q  175 tagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||| |||||||||||||    
T  44589222 tagcataaaacgacaaa 44589206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29734601 - 29734421
Alignment:
Q  103 catcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact--cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatg 200  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||   | |    
T  29734601 catcgttacaatgaaaattcgctaaaaataaaaaggattaatctgtaaacaaactatcacagcatccatgttaatagtataaaacggcaaagtactaaag 29734502  T
Q  201 cctacaaatatgactatat--tcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
     |||   ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29734501 tctagccatatgactatatatttaagtctccggaatactcatgtctccggatcttcaacgttgacgactccaaagtcattg 29734421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Original strand, 13548573 - 13548855
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac------aaattcgctaaaaac-aaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      ||| | ||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||    
T  13548573 aaaaataaacgatattcattcatttaaattgatatagtacatcgatacaatacgaatttaaaattgctaaaaacaaaaaaggatgaatctacgaacaaac 13548672  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
    ||| |  |||||| ||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||||||  |||   ||| | | | | ||||||||||| | |||||||||||    
T  13548673 tcagagtatccatgttaatagcataaaacggtagagtatatatgcctacaaatataccta---tcaagccactgaaatactcatgt-ttcggatctgcaa 13548768  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||| | || ||||||||||  |||||    || |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13548769 cgttgacaatgcaaaagtcattg--attga----atctgcatttgatcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaaaaccgcattaagac 13548855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25516862 - 25516723
Alignment:
Q  140 tgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactca 239  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||    
T  25516862 tgaatttgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagcca 25516763  T
Q  240 tgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25516762 tgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 25516723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Original strand, 34962647 - 34962777
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  34962647 ataaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacataaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaacaggatgaatgtgtgaacaaa 34962746  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  34962747 cttacagcatccatgttaatagcataaaacg 34962777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 11550334 - 11550412
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatga 142  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11550334 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatga 11550412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19953984 - 19953854
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| | |    
T  19953984 aaaaataaatgatattcattctttcaaattgatagagtatatctatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctccgaacaaactcataac 19953885  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  19953884 atccatgttaatagcctaaaacggcaaagta 19953854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27666003 - 27665838
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaat-ttgtgaataaac 156  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  27666003 aaaaataaacaatattcattcattctaattgatagaatacatttatacaatacaaatttaaaattgctaaaaacaaaaatgatgaatattgcgaacaaac 27665904  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27665903 tcacaacatctatgttaatagtataaaacatcatagtacatatgcctacaaatatgactatattca 27665838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 106697 - 106557
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaattt-gtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||      |||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  106697 atattcattcattcaaattgatagactatatcgaaacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaaactagtgaacaaactcacatcatcc 106598  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaa 208  Q
    || ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  106597 atgttaatagcatgaaacgacaaagtatatatgcctacaaa 106557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 345
Target Start/End: Original strand, 20598360 - 20598617
Alignment:
Q  88 caaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaag-gatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||| ||| |||| || ||    
T  20598360 caaattgatagaaaacaccgatacaatacaaatttaaagtcgctaaaaacaaaaaatgatgaatttgtgaacatgctcacaacatacatgttaaaaggat 20598459  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgt 280  Q
    |||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||| | |  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||     
T  20598460 aaaatga-atagtacatatgcatacaaatatgactatattcaagccaccgaaatattcatgttttcatatcggcaacgttaacgacgcaaaagtcattgg 20598558  T
Q  281 cattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 345  Q
      ||||    || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20598559 --ttga----atctacacttgattaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgaacta 20598617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30933695 - 30933535
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatag-agtacatcgatacaa-tacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  30933695 ataaaaataaacgatattcatttattcaaattgatatcaataca---atacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgattatgtgaacaaactca 30933599  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30933598 caacatccatgttaatagcataaaacggaaaaatatttatgcctataaatatgactatattcat 30933535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4703598 - 4703436
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||||||||||   || |||||    
T  4703598 aaaaataaacgatattcattcatccaaattgacagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgccaaaaacaaaaaggatgaattttcaaacaaact 4703499  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    | || || |||| |||||| ||||||||   | ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  4703498 cgcaacaaccatgttaataatataaaacagtatagtacatatgcttacaaatatgactatatt 4703436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 235
Target Start/End: Original strand, 9207037 - 9207195
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||| ||| ||||||    
T  9207037 attcattcatttgaattgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacatgctcacaacattcatgttaata 9207136  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaata 235  Q
      |||||||| ||||  |   || |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  9207137 acataaaacggcaaaacacaaattcctacacatatgactatatttaaatctccggaata 9207195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31811949 - 31811808
Alignment:
Q  138 gatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatact 237  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31811949 gatgaatctgtaaacaaactcacaacatctatttaaatagcataaaacgacaaagaacgcatacctacaaatatgactatattcaagtctctggaatact 31811850  T
Q  238 catgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  31811849 catgtctctgaatctgcaacgtttacgacatcaaaatcattg 31811808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17792920 - 17792652
Alignment:
Q  68 ataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc-----gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       | ||| || ||| |||||||||| ||| |||  ||||     
T  17792920 ataaacgatattcattaattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgttaaagcataaaagatgaatttgcgaacaaaaacacaa 17792821  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    |||| || ||||||| ||||||    | ||||  ||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  17792820 catctatgttaatagcataaaatagtagagtatatatgcctacaaatatgactatatacaagccactgaaatactcatgttttcggatctgcaa-tttga 17792722  T
Q  263 cgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacac 338  Q
    ||  || ||||||||||  |||||    || |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17792721 cggtgcaaaagtcattg--attga----atctgcatttgatcaaaactaatctttcaacatgaatcaaataaacac 17792652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16570800 - 16570587
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaac-----aaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||   ||||  |     ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16570800 aaaaataaatgatattcattcattcaaattaaaagtgttcattgatacaatacaaatt---taaagtcggtaaaaaaatgatgaatttgcgaacaaactc 16570704  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    ||| |||| || |||||| ||||| |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||   | |    
T  16570703 acaacatctatgttaataatataagacgacatagtacatatacatacaaatatgactatacttaagcctccggaatactcatgtctccagatctatcatg 16570604  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtc 275  Q
    ||||||||| |||||||    
T  16570603 ttgacgacgtcaaagtc 16570587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 348
Target Start/End: Original strand, 20124620 - 20124722
Alignment:
Q  240 tgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacacc 339  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20124620 tgtcttcggatctgaaacgttgacgacgccaaagtca------ttgatcgaatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatgaaataaacacc 20124713  T
Q  340 gcactaaga 348  Q
     ||||||||    
T  20124714 acactaaga 20124722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3527453 - 3527397
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3527453 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 3527397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14826003 - 14825851
Alignment:
Q  68 ataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |||||| |||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  14826003 ataaacgatattccatcattcaatttgatatagtataaggatacaatataaatttgctaaaaataaaaaggatgaatttgcgaacaaattcacaacatcc 14825904  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    || |||||||||||||    ||| |||   | |||||||||||||||||||||    
T  14825903 atgttaatagtataaatatccaacgtacaaaagcctacaaatatgactatatt 14825851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 348
Target Start/End: Original strand, 45694258 - 45694399
Alignment:
Q  201 cctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcactt 300  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||  ||| |||| ||    
T  45694258 cctaaaaatattactatattcaagtctctggaatattcatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgttaaa------gtcattgattagatctgcattt 45694351  T
Q  301 gcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  45694352 gctcaaagataatctttcaacatgagtcaaataaacaccgtactaaga 45694399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 278
Target Start/End: Original strand, 12183006 - 12183214
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcat 165  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||        
T  12183006 aaataaacaatattaattcattcaatttgatagagtatatcaatacaatacaaatttgttaaaaacaaaatagatgaatctgcgaacaaactcaca---- 12183101  T
Q  166 ccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacga 265  Q
     ||| ||||||| |||||||  |||| ||  || | |||||||||||| | ||| || |||| | ||||| | | ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  12183102 acattttaatagcataaaacatcaaaatatgtaagtctacaaatatgattgtatgcaagtcttcagaatagttaagtctctggatctacaacgtttacga 12183201  T
Q  266 cgccaaagtcatt 278  Q
    || ||||||||||    
T  12183202 cgtcaaagtcatt 12183214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27666447 - 27666370
Alignment:
Q  279 gtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| | ||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666447 gtcattgattgaatatgcacttcatcaaaattaatcttttaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 27666370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 213
Target Start/End: Original strand, 11561362 - 11561496
Alignment:
Q  85 attcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||      |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| |||||||     
T  11561362 attcaaattgataaagtatatcgattcgatacaaattcaaagttgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacatccatgttaatagc 11561461  T
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatga 213  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11561462 agaaaacgacaaaatatgtatgcctacaaatatga 11561496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Original strand, 39481189 - 39481288
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  39481189 ataaaaataaatgatattcattcattcaaattaatacattacatcagtataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatgtgtaaacaagctcaca 39481288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 279
Target Start/End: Original strand, 2763285 - 2763411
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    |||| ||||||||  || ||||||||||||||  |||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||| |||||||    
T  2763285 aaacgcacatcatttatgttaatagtataaaataacaatgtacatatgcctataaatatgattatattcaaatctctaaaatactcatgtcttcggatct 2763384  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  2763385 gcaacgttgacaacaacaaagtcattg 2763411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 337
Target Start/End: Original strand, 8027779 - 8027939
Alignment:
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcca 270  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||  |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||    
T  8027779 ttaatagcataaaacggcatagtatctatgcctacaaatatgattatatttaagtatctcgaatactcatgtcttcagatctgtaacattgacgacacca 8027878  T
Q  271 aagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    |||| |||||  ||||    || |||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  8027879 aagttattgt--ttga----atctgcaattgttcaaaactaatttttcaacctaaattaaataaaca 8027939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Original strand, 17304188 - 17304304
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |      | ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||    
T  17304188 aaataaacgatattcatttattcaaattgatataatatatcgatacaatataaatttgaaatcacaaaaaacaaaaatgatgaatatataaataaactca 17304287  T
Q  160 catcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||    
T  17304288 catcatccatattaata 17304304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19904945 - 19904678
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||      |||||||| |||    |||||| ||  || ||||||| |  || ||    
T  19904945 atattcattcatttaaattgatatagtacatcgatataatacaaattcaaaattgctaaaaaaaaa----atgaatatgcaaacaaactcataatattca 19904850  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | ||||||| |||||||| || ||||  | || ||||||| ||||||||||||| | | ||| |||| || ||| |||  |||||||||||||  |||||    
T  19904849 tgttaatagcataaaacggcagagtacatgtgtctacaaacatgactatattcaagcccccgaaatattcgtgtttccatatctgcaacgttggtgacgc 19904750  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
     ||||| || |  |||||    ||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19904749 aaaagttatcg--attga----atatgcacttgatcaaagttaatctttctacctgaatcaaataaacatcgcactaa 19904678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5172236 - 5172026
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||      || |||||||| |||| |||||||||| ||  || |||| | |||||    
T  5172236 gatattcatttattcaagttgataaagtatatcgatacaatacaaattcaaagtcactaaaaac-aaaatgatgaatttgcgagcaatctcataacatcc 5172138  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || |||||   ||||||  ||||||||  || ||||| || |||||| ||||||| || |||  |||  |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  5172137 atgttaatgacataaaaaaacaaagtacataagcctataattatgacaatattcaagtgtccataattttcatgcatccggatctggaacgttgacgacg 5172038  T
Q  268 ccaaagtcattg 279  Q
     |||||||||||    
T  5172037 tcaaagtcattg 5172026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 7071429 - 7071485
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7071429 aaaaaaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaat 7071485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 15786248 - 15786393
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||| |   || |||||||||  |||||| ||||    
T  15786248 atattaattcattcaaattgatagagtacattgatacaatagaaattctctagaaacaaaaatgattaatctccaaacaaactcaca--atccatgttaa 15786345  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    | | |||||||  |||||||  |  || |||||||| |||||||||||    
T  15786346 tggcataaaacatcaaagtacatgagcttacaaataagactatattca 15786393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 348
Target Start/End: Original strand, 20607215 - 20607267
Alignment:
Q  296 cacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20607215 cacttgattaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgaactaaga 20607267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 275
Target Start/End: Original strand, 31262662 - 31262832
Alignment:
Q  102 acatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactat-g 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||   ||| ||||||| ||| || ||| | ||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||| | || |    
T  31262662 acatcaatataatacaaattcgataaaaa---aaatgatgaatctgtaaacaaatttacaacatccatgttaataacattaaacgacaaagta-caatag 31262757  T
Q  201 cctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtc 275  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  31262758 tctacaaacatgactatattcaagtctccagaatactcatgtcttcatatatgcaaagttcacgacgccaaagtc 31262832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 278
Target Start/End: Original strand, 17054728 - 17054936
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||      |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  17054728 gatattcatttatttaaattgatatattacaccgatacaataaaaatttaaagtcgctaaaa-caaaaatgatgaatttgcgaagaaactcttatcatcc 17054826  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacg 267  Q
    || |||| || |||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||| | ||||||| |||||||||| | |    
T  17054827 atgttaaaagcataaaagggtagagtatataagtctacaaatatgactatagtcaagtctcttgaatacttatgt-ttcggatctacaacgttgaccatg 17054925  T
Q  268 ccaaagtcatt 278  Q
    ||||| |||||    
T  17054926 ccaaaatcatt 17054936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 280
Target Start/End: Original strand, 17118571 - 17118698
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||||| || || |    
T  17118571 aaactcacaacattcatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaacgcctacacatatgactatattcaagcttctgaaatacccatgtctacgaatat 17118670  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgt 280  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  17118671 gcaacgttgacaacgtcaaaatcattgt 17118698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Original strand, 22269212 - 22269366
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||| |||||||  |||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||     
T  22269212 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgggtacaaactcacaatatccat-ttaatagcttaaaacgaaaaagtatataagcctacaattatgactacattcaa 22269310  T
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    || ||| |||||| |||  | ||| || || ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  22269311 gtttccagaatacccattccaccgaatttgtaacattgacgacaccaaagtaattg 22269366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27666623 - 27666577
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27666623 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgttacaatacaaatt 27666577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45035428 - 45035274
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcat 165  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||  |||    
T  45035428 aaataaacgataatcattcatgtaaattaataaagtacatcgatataatacaaattagtgaaaaacataaaagatgaatctatgaacaaactcacgacat 45035329  T
Q  166 ccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    |||| ||||||| ||||| |  |||| ||   | |||||||||||| ||||||||    
T  45035328 ccatgttaatagcataaaccagcaaaatacacaagcctacaaatataactatatt 45035274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 279
Target Start/End: Original strand, 11550409 - 11550478
Alignment:
Q  210 atgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||| |||| | ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550409 atgactgtattaaagtctctgtaatacccatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 11550478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 278
Target Start/End: Original strand, 17116133 - 17116289
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||| || |||| || ||| | |   ||||||||| ||||||||||||||    
T  17116133 tcgctaaacacaaaaataatgaatttgcgaacaaattcaaatcatccatgttaaaagcataacacaacataatgtatatgcctaccaatatgactatatt 17116232  T
Q  221 catgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    || ||||||  |||||| |||||| |||||||| ||  ||||| |||||||| |||||    
T  17116233 caagtctccaaaatacttatgtct-cggatctgtaatattgacaacgccaaaatcatt 17116289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 279
Target Start/End: Original strand, 29812430 - 29812498
Alignment:
Q  211 tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  29812430 tgactatatttatgtctctggaatacccatgtcttcggatctgcaacgttgacgattccaaaatcattg 29812498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31271826 - 31271611
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||      |||||  | ||||| ||||||| |   || ||||| |    
T  31271826 aaataaacgatattcgttcattcaaaatgataaagtacattgacacaatacaagttcaaagtcgctaatgataaaaaagatgaatcttcaaacaaactaa 31271727  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | || | ||  ||||||||||||||||||||| |||| || |   ||||||| |||| | || |||| ||||||    
T  31271726 catcatccatgttaatagcataaaatggcataatatatatgcctacaaatatgactatcttcaagttttgagaatacttatgttttcgaatctacaacgt 31271627  T
Q  260 tgacgacgccaaagtc 275  Q
    |||||| | |||||||    
T  31271626 tgacgaggtcaaagtc 31271611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33852335 - 33852158
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata----tta 173  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||  | | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||     |||    
T  33852335 ttcattcatttaaattgatatagtatattaaaaaaatacaaatttgctaaaaacaaataggataaatttgcaagcaaactcacatcattcattcatgtta 33852236  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatc 251  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||   ||||||||| || |||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||    
T  33852235 atagcataaaacgataaagtacataaatctacaaatacgaatatattcaagtctccaaagtactcatgtctctggatc 33852158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39963648 - 39963530
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||| || ||| ||| ||||||    
T  39963648 attcatttcttcaaatagatagagtaaatcgataaaatacaaatttgctaaaaacaaaatggatgaatatccgaacaaactcgcaacattcatgttaata 39963549  T
Q  177 gt---ataaaacgacaaag 192  Q
     |   ||||||||||||||    
T  39963548 ataacataaaacgacaaag 39963530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Original strand, 823860 - 823919
Alignment:
Q  297 acttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  823860 acttgctcaaagctaatttttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaat 823919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Original strand, 7443370 - 7443449
Alignment:
Q  200 gcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7443370 gcctacacatatgattatatttaagtttccggaatacccttatctccggatctgcaacgttgatgactccaaagtcattg 7443449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13547236 - 13547173
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||    
T  13547236 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatatgaatttgctaaaaacaaaattgatgaat 13547173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 280
Target Start/End: Original strand, 17056226 - 17056353
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||   | | ||||| ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||||| ||||| |    
T  17056226 aaactcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgactatattcaagcttctgaaatacccatgtctacggatat 17056325  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgt 280  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  17056326 gcaacgtcgacgacgtcaaaatcattgt 17056353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 280
Target Start/End: Original strand, 17068673 - 17068800
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||   | | ||||| ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||||| ||||| |    
T  17068673 aaactcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgactatattcaagcttctgaaatacccatgtctacggatat 17068772  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgt 280  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  17068773 gcaacgtcgacgacgtcaaaatcattgt 17068800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 349
Target Start/End: Original strand, 26254835 - 26254890
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26254835 tgcacttgctcaaagttaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagac 26254890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2898794 - 2898741
Alignment:
Q  172 taatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2898794 taatagtataaaacgacaaagtacatatgccaacaaatatgactatattaatgt 2898741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11426956 - 11426879
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    |||| |||||||| | |||||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11426956 tatgtctacaaattttactatatttaagtctctagaatactcatgtcttcggatctgcaacattgacgacgtcaaagt 11426879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 349
Target Start/End: Original strand, 15261322 - 15261367
Alignment:
Q  304 taaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15261322 taaaactaacctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacgaagac 15261367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 22651643 - 22651795
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||| |  ||  ||||||||||     
T  22651643 aaaaataaacaatattcattcattcaagttgacaaaatacatcgat-caatataaattcgttaaagataaaaaagatgaatctacgatcaaactcacatt 22651741  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactat 217  Q
    |||||| ||||||  ||||   |||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  22651742 atccatgttaataacataagctgacaaagtatataaacctacaaatatgactat 22651795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31788751 - 31788636
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||  |    
T  31788751 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagt 31788656  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  31788655 taatagcatacaacggcaaa 31788636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Original strand, 11985029 - 11985139
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||| |||||     
T  11985029 aaaaaaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaattcacaa 11985124  T
Q  163 catccatattaatag 177  Q
    ||||||  |||||||    
T  11985125 catccaagttaatag 11985139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 263
Target Start/End: Original strand, 17073162 - 17073355
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||| || ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  17073162 gatattcttttatttaaattgatatattacaccgatacaatacaaatttaaagtcgctaaaa-caaaaatgatgaatttgcgaagaaactcttatcatcc 17073260  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    || |||| || ||||||    | ||||  || | ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  17073261 atgttaaaagcataaaagagtagagtatataagtctacaaatatgactatagtcaagtctcttgaatacttatgt-ttcggatctacaacgttgac 17073355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8809575 - 8809459
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||  || ||||||||  ||| |||| || || ||| ||||||||| ||||||  ||    
T  8809575 gatattcattcattcaaattgatagagtacat--ataagatacaaacatcactaaaaacgtaaaagatggatctgcgaacaaactcacaacatccaagtt 8809478  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  8809477 aatagcatacaacgacaaa 8809459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 115
Target Start/End: Original strand, 16379762 - 16379813
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 115  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16379762 aaaaataaccgatattcatacaatcaaattgatagagtacatcaatacaata 16379813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 25516969 - 25516914
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  25516969 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaat 25516914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 194
Target Start/End: Original strand, 35283030 - 35283149
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||| || ||||||  |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| | ||| |    
T  35283030 atattcatttattcaaattgttagattatatcaatacagtaaaaattcattaaaaataaaaatgttgaatttgtgaacaaactcataacatcaaaattga 35283129  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagta 194  Q
    ||  ||||||| ||||||||    
T  35283130 tatcataaaacaacaaagta 35283149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2550488 - 2550410
Alignment:
Q  200 gcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||    
T  2550488 gcctacaaatcttactatattcatgtcttgagaatactcatctctccggatttgcaatgttgacaacactaaagtcatt 2550410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6510724 - 6510642
Alignment:
Q  274 tcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||  | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  6510724 tcatagtcattgattgaatatgcacttattcaaagctaatttttcaacttgaatcaaataaacattgcactaagacggaaaat 6510642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13113478 - 13113420
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  13113478 aaaaataaacgatatttattcatttaaattgatagaatacatcgatataatataaattc 13113420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Original strand, 15028208 - 15028270
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15028208 tgcacttgattaaatcttatcattcaacctaaatcaaataaacatcgcactaagacggaaaat 15028270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 19382200 - 19382278
Alignment:
Q  149 gaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtct 227  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19382200 gaataaattcaccacatccatgttaatagcataaaacgacatattatctatgcctataaatatgattatattcaagtct 19382278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35220619 - 35220508
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||  |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| || |||  |||||    
T  35220619 attcattcattcaaattgatagagtacatcagataca----aagatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaat 35220524  T
Q  176 agtataaaacgacaaa 191  Q
    || ||| |||||||||    
T  35220523 agcatacaacgacaaa 35220508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Original strand, 45693822 - 45693900
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| | ||  || |||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||    
T  45693822 caaagtcgctaaaaacaaaaatgatgattctgcaaacaaactcacatcatctatgttaatagcataaaatgacaaagta 45693900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 190
Target Start/End: Original strand, 31268790 - 31268899
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||   | ||||||| ||    
T  31268790 attcatttaaactgataaaggacatcaatacaatacaaattcgtgaaaaacaaaaatgaagaatttgcgaacaaactaacaacatatttgttaatagcat 31268889  T
Q  181 aaaacgacaa 190  Q
     |||||||||    
T  31268890 taaacgacaa 31268899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36692169 - 36692054
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   ||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||||||||| || |||  |    
T  36692169 cgatatacattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaagaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacaaccaagt 36692074  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  36692073 taatagcataaaacggcaaa 36692054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 37876411 - 37876444
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876411 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 37876444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 8531447 - 8531515
Alignment:
Q  280 tcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8531447 tcattgattgaatttgcacttgattaaagttattctttaaacatgaatcaaataaacaccgcactaaga 8531515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8781759 - 8781719
Alignment:
Q  309 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8781759 ctaatcttttaacttgaatcaaataaacaccgcactaagac 8781719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 15261120 - 15261160
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15261120 atattcattcattcaaattgatagagtatatcgagacaata 15261160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15439929 - 15439881
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15439929 gatatttattcatttaaattgatagattacatcgatataatacaaattc 15439881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 30923263 - 30923295
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30923263 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 30923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2550381 - 2550330
Alignment:
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2550381 aaaactaaacttttaacctaaatcaaatgaacaccgcactaagacggaaaat 2550330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 14826319 - 14826366
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  14826319 atattcattcattcaaatttatagaatacatcgatataataaaaattc 14826366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 222
Target Start/End: Original strand, 15028071 - 15028151
Alignment:
Q  140 tgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    ||||| || ||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15028071 tgaatatgagaacaaacacacatcatccatgtcaatagcataaaatgaca--gtacatatgcctacaaatatgactatattca 15028151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 272
Target Start/End: Original strand, 17095243 - 17095362
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||   | | ||||| ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||||| ||||| |    
T  17095243 aaactcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgactatattcaagcttctgaaatacccatgtctacggatat 17095342  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    |||||  |||||||| ||||    
T  17095343 gcaacaatgacgacgtcaaa 17095362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Original strand, 17118278 - 17118337
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  17118278 taaaaataaatgatatttattcattcaaattgataaagttcatggatataatacaaattc 17118337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 161
Target Start/End: Original strand, 31193141 - 31193226
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  31193141 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcactaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcaca 31193226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 42105578 - 42105648
Alignment:
Q  208 atatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42105578 atatgattatatttaagtctccggaataaccatgtcttcg-atctgcaacgttgacaactccaaagtcattg 42105648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 4903950 - 4904065
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat-tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||| |||| | |||||||||  ||||| ||||| |  ||| ||||||||| ||||||  |    
T  4903950 cgatattcattcatttaaattgatagagtacatc----aaatataaatattgctaaaaacgtaaaggctgaatctacgaacaaactcacaacatccaagt 4904045  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  4904046 taatagcatacaacgacaaa 4904065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 115
Target Start/End: Original strand, 12553975 - 12554017
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12553975 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcagatacaata 12554017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Original strand, 20607133 - 20607202
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaat 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  20607133 aaattgatagagaacatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaaatgatgaatatgtgaat 20607202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 164
Target Start/End: Original strand, 25508873 - 25508961
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||  ||| |||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  25508873 cgatatttattcattcaaattgatagagtacatc-at---atacaaacatcggtaaaaacataaacgatgaatctgcgaacaaactcacatca 25508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33924000 - 33923885
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    ||| ||||||||||   ||| | ||||| || ||| ||||||||| || |||  |    
T  33924000 cgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagataca----aaaatcgctaaaaaggtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagt 33923905  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  33923904 taatagcataaaacgacaaa 33923885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 5427674 - 5427707
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5427674 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 5427707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 159
Target Start/End: Original strand, 12677256 - 12677339
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||   |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  12677256 cgatattcattcattcaaatcgacagattacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaataaactca 12677339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24520618 - 24520561
Alignment:
Q  94 gatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaa 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  24520618 gatagagtacattgatacaatacgtgttcgctaaaaataaaaaaaatgaatttgtgaa 24520561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36080760 - 36080683
Alignment:
Q  279 gtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| || |||| | |||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  36080760 gtcattaattggatttacacttgatcaaaactactctttcaatttgaatcaaataaacaccgtattaagacgagaaat 36080683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 263
Target Start/End: Original strand, 37614062 - 37614095
Alignment:
Q  230 ggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37614062 ggaatactcatgtctcccgatctgcaacgttgac 37614095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 37994578 - 37994545
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37994578 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 37994545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 38445461 - 38445428
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38445461 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 38445428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 41328034 - 41328005
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41328034 cgatattcattcattcaaattgatagagta 41328005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 10237011 - 10237043
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10237011 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 10237043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Original strand, 12994098 - 12994173
Alignment:
Q  280 tcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| | || ||||||| || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  12994098 tcattgatggaatttgcactt-ctcaaagctaatctttcaactagaatcaaataaacattgcactaagacgagaaat 12994173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24461734 - 24461702
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24461734 cgatattcattcattcaaattgatagaatacat 24461702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 27249147 - 27249191
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27249147 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 27249191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 32448423 - 32448455
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32448423 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 32448455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34600465 - 34600401
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  34600465 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcgcatcatccaagttaatagcatataacg 34600401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36234093 - 36234049
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36234093 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 36234049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36234249 - 36234189
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataa 182  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  36234249 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataa 36234189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41431279 - 41431215
Alignment:
Q  122 cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  41431279 cgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagtatataacg 41431215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 167)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Original strand, 7771475 - 7771774
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  7771475 aaaaataaacgatatttattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaagct 7771574  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7771575 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgattaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 7771674  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7771675 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaaga 7771774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6635715 - 6635408
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6635715 aaaaataaacgattttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 6635616  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    ||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6635615 cacagtatccatgataatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgattatattcaaatctccggaatactcatgtctccgg 6635516  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6635515 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaaga 6635416  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  6635415 cggaaaat 6635408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17331795 - 17331488
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17331795 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 17331696  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||  ||||| ||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17331695 cacatattccatgttaatagcataaaacggcaagatacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccgg 17331596  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17331595 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattggtcggatctgctcttgttcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 17331496  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  17331495 cgggaaat 17331488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 73 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29098238 - 29097949
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  29098238 cgatattcactcattcaaattgatagaatacatcggtacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatttgtgaacaaactcacatcata 29098139  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29098138 catgttaatagcataaaacggcaaggtacatatgcctacaaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctcttgatctgcaacgttgacgac 29098039  T
Q  267 gccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29098038 gccaaaatcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 29097949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 32347377 - 32347675
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac------aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  32347377 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgacagtgtacatcgatacaatacgaattcaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 32347476  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||   ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  32347477 caatacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtagttatgcctacaaatatgactatattcatgttttcggaatactcatgtctccggatctgcaat 32347576  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32347577 gttgacgacgccaaagttattgtcatcgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaattaaataaacaccgtactaagacgggaaat 32347675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6281513 - 6281204
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6281513 ataaaagtaaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaa 6281414  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctcc 246  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6281413 ctcacatcatccatgttaatagcataaaacagcaaaatacatatgcctacaaatatgactaatatgattatattcatgtcttcggaatactcatttctcc 6281314  T
Q  247 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6281313 ggatctgcaacaatgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaa 6281214  T
Q  347 gacgggaaat 356  Q
    ||||||||||    
T  6281213 gacgggaaat 6281204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 17095895 - 17096202
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17095895 aaaaataaacgacattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 17095994  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||         |||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||| |    
T  17095995 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctccgaagtactcatgtttccag 17096094  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17096095 atctgcaccgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaaga 17096194  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  17096195 cgggaaat 17096202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23428652 - 23428412
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23428652 caaattcgctataaacgaaaaggataaatatgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggaaaagtacctatgcctacaaatatgact 23428553  T
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatct 315  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  23428552 atatttatgtctccgaaatactcatgtctccggatctacaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatct 23428453  T
Q  316 ttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23428452 ttctacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaat 23428412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Original strand, 23881770 - 23882070
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  23881770 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgcaaaaaagaaaaaggatgaatttgtggacaaact 23881869  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||         ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23881870 cacaacatccatgttaatagcataaaccgacaaagtatctatgactacaaatatgactaatatgactatatacatgtcaccgaaatactcatgtctccgg 23881969  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23881970 atctacaacattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgtacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 23882069  T
Q  349 c 349  Q
    |    
T  23882070 c 23882070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20483653 - 20483346
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20483653 aaaaataaacgatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 20483554  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||         |||| |||||| |||||||||||||||| | |    
T  20483553 cacaacatccatgttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtcttcggaatactcatgtcttcag 20483454  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  20483453 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgatcaaagctaatctttcaacttgagtcaaataaacaccgtactaaga 20483354  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  20483353 cgggaaat 20483346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 33164123 - 33164429
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||| ||||||||  || || |||||    
T  33164123 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaagggatgaatccgtaaacaaact 33164222  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  || | | |||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33164223 cacatcatccatgttaatagcataaaacggtaaggcatctatgcctacaaatatgactaatatgattatattcaagtctccggaatcctcatgtctccgg 33164322  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33164323 atctgcaacgttgacgacgc-aaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 33164421  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  33164422 cgggaaat 33164429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 74 - 356
Target Start/End: Original strand, 177768 - 178064
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  177768 gatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 177867  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    || |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177868 atgttaatagcctaaaacggcaaagtacctatgcctactaatatggctaatatgaccgtattcaagtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 177967  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  177968 ttgacaacgccaaagtcattgtcattgatcagatctacacttgc-tcaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcaccacgacgggaaat 178064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 65 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27241521 - 27241224
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  27241521 aaaataaactatattcattaattcaaattcatagagtacatcgatacaatagaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 27241422  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  27241421 acaacatccacgttaatagcataaaacggcaaaatacctaggcctacaaatatgactatatttttgtctccggaatacttctgtatccggatctgcaacg 27241322  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  27241321 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgatcaaagctaatctttgaacctgaatcaaacaaacaccatactaaaacgggaaat 27241224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17700020 - 17699713
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17700020 aaaaataaacgatattcattgaatcaaattgatagagtacatcgatacaaaacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 17699921  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||         |||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17699920 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgtctacaaatatgactagtatgactatattcatgtctctggaacactcatttctccgg 17699821  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  17699820 atctgcaacattgacgacgccaaagttattgtcattgatcagatctgtacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacgatgcactaaga 17699721  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  17699720 cgggaaat 17699713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 17732041 - 17732347
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  17732041 aaaaataaatgatattcactcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaagag-atgaatctgtgaacaaact 17732139  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         ||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  17732140 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgattatattcatctctccgaaatactcatgtctacgg 17732239  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17732240 atctgcaaggttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttacacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaaga 17732339  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  17732340 tgggaaat 17732347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 26294728 - 26295018
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  26294728 aaaaataaacggtattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaact 26294827  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||  ||| ||     ||| |||||||||||||||||||||    
T  26294828 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atattcatgtctccggatctgcaac 26294919  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26294920 gttaacgacaccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaaactaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaat 26295018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Original strand, 39531062 - 39531363
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgcta----aaaacaaaaaggatgaatttgtgaata 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39531062 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatatgaatccaaattcgctagctaaaaacgaaaaggatgaatttgtgaaca 39531161  T
Q  154 aactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtct 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39531162 aactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaacatgattatattcaagtctccggaatactcatgtct 39531261  T
Q  245 ccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcact 344  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  39531262 ctggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat--tcattgatcggatctgcactttctcaaagctaatctttcaacccgaatcaaataaacatcgtact 39531359  T
Q  345 aaga 348  Q
    ||||    
T  39531360 aaga 39531363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 6681531 - 6681837
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6681531 aaaaataaacgatattcattcattctaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 6681630  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaa---------tatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
     |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  6681631 tacatcatcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgc-tacaaacatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccga 6681729  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  6681730 atctgcaacgttgacgacaccaaaatcattgtcattgatcggatttgcgcttactcaaaactaatctttcaacctggaacaaataaacatcgcactaaga 6681829  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    || |||||    
T  6681830 cgagaaat 6681837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 356
Target Start/End: Original strand, 2555017 - 2555311
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgc------taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||     
T  2555017 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttcttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatg 2555116  T
Q  171 ttaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||  ||||||||||||||         |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2555117 ttaatagcgtaaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 2555216  T
Q  262 acgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2555217 atgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcactttctcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacaccacactaagacggaaaat 2555311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 11734499 - 11734780
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11734499 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaact 11734598  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| || |||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||                 |||||||||||||    
T  11734599 cacaacaaccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattcaagtct-----------------ccggatctgcaac 11734681  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11734682 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcagttgcgcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaaat 11734780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34431531 - 34431220
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34431531 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaact 34431432  T
Q  158 caca--tca-----tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatg 241  Q
    ||||  |||     ||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||         |||| ||||||| ||||||||||||    
T  34431431 cacaagtcacaatatccaagttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattgatgtctctggaatactcatg 34431332  T
Q  242 tctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgc 341  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34431331 tctccagatctgtaacgttgacgacgac-aagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatc--tcaacctgaatcaaataaacaccgc 34431235  T
Q  342 actaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| ||||||    
T  34431234 actaagacaggaaat 34431220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 39179499 - 39179789
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  39179499 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatttatgaacaaact 39179598  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||     ||||  |    ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  39179599 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatatctacaaatatgacta-----atgtgact---atattcatgtatccggatttgcaac 39179690  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39179691 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctagtctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggatgggaaat 39179789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18654249 - 18653942
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18654249 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagactacattgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaact 18654150  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||         ||||||  | | || ||||| | ||||||| |    
T  18654149 cacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgactaatgtgactatattcaaatattcgaaatacccgtgtctccag 18654050  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18654049 atctgctacattgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaacctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactatga 18653950  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  18653949 tgggaaat 18653942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25962362 - 25962079
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||      |||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||     
T  25962362 cgatatccattcattcaaattgataaagtacatcgataaaatttaaatccaaaatcgctaaaaataaaaaggataaatctgcgaagaaactcacaacatt 25962263  T
Q  167 catattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgac 266  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25962262 catgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgactatattcaagtttccggaatatccatgtctccggatctacaacgttgacgac 25962163  T
Q  267 gccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    || |||      |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25962162 gcaaaa------gtcattgatcagatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacgagaaat 25962079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 74 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28041086 - 28040797
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28041086 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgagtaaactcacatcatcc 28040987  T
Q  168 atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    || ||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| |    
T  28040986 atgttagtagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccataatacacatgtctccgaatctgcaatg 28040887  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28040886 ttgacgacgccaaagtcactgtcattgatcggatttgcacttgctcagagctaatatttaaacctgaatcaaataaacaccacactaaga 28040797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 40564838 - 40565040
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  40564838 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatctatgttaata 40564937  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40564938 gcataaaacgacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtca 40565037  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  40565038 ttg 40565040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 42396162 - 42396473
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||      || |||||||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  42396162 ataaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagaatatatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaagggattaatatgtgaacaaa 42396261  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaa------------atatgactatattcatgtctccggaatactcatgtc 243  Q
    |||||| ||| ||| ||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||            |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42396262 ctcacaacattcatgttaataacataaaacggaaaagtacctatgcctacaacaaatatgactaatatgattatattcatgtctcaagaatactcatgtc 42396361  T
Q  244 tccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 343  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  42396362 tcaggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgat-gaatatgcacttgctcaaagctaatatttgagcatgaatcaaataaacatcgcac 42396460  T
Q  344 taagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||    
T  42396461 taagacgggaaat 42396473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41554933 - 41554718
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |    
T  41554933 aaaaataaaagatatccattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaaactcacaac 41554834  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41554833 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgac 41554734  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||  ||||||||||||    
T  41554733 gattccaaagtcattg 41554718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 116 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42609553 - 42609304
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgact 215  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||   |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  42609553 caaattcgctaaaaagaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaatgacataaaacggcaaagtatttatgcctacaaatatgact 42609454  T
Q  216 a---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaa 306  Q
    |         |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  42609453 aatatgactatatttatgtctccggaatactcctgcctccggatctgcaacgtcgacgacaccaaagtcattgtcattgatcgaatatgcacttgctcaa 42609354  T
Q  307 aactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||    
T  42609353 agctaatctttcaacatgaatcaaataaacatcatactaagacgtgaaat 42609304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3740798 - 3740518
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaagga-tgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||      ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  3740798 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatccaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggaatgaatctatgaacaaact 3740699  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||                 ||||||||    
T  3740698 cacaacatccatgttactagcataaagcggcaaagtacctatgcctataaatatgactatattcatgtatccgga-----------------tctgcaac 3740616  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3740615 attaacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcagttgctcaaagctaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactcagacgggaaa 3740518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 279
Target Start/End: Original strand, 18472392 - 18472609
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  18472392 ataaaaataaatgatattcatttattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaagttcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcaca 18472491  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18472492 tcatccatgttaatagcataaaacaacaaagtactaaagcctacacatatgactatatgtaagtctccggaatactcatgtctccagatctacaacgttg 18472591  T
Q  262 acgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||  |||||||||||    
T  18472592 acgactacaaagtcattg 18472609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 14910344 - 14910559
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |    
T  14910344 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgttagagtacaacgatacaataaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaaaaaactcatagc 14910443  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||   |  |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14910444 atccatgttaatagcataaaacggcaaaatactaaaacctacacatataactatatttaagtctccggaatactcatgtctccggatctgcatcgttgac 14910543  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
     ||  |||||||||||    
T  14910544 aacttcaaagtcattg 14910559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 29310035 - 29310237
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  29310035 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgttaata 29310134  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29310135 gcataaaacggcaaagtagaattgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtca 29310234  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  29310235 ttg 29310237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31646274 - 31646060
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  31646274 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatca 31646175  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  31646174 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 31646075  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    || ||||||||||||    
T  31646074 acaccaaagtcattg 31646060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 33486247 - 33486452
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  33486247 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcgataaaataaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccacgtta 33486346  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33486347 atagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgaccatatttaagtctccagaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacgactccaaag 33486446  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  33486447 tcattg 33486452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 117 - 354
Target Start/End: Original strand, 980739 - 980988
Alignment:
Q  117 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt---aatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata--- 210  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||       
T  980739 aaattcgttaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttgttaatagcataaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatga 980838  T
Q  211 ------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctt 304  Q
          |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  980839 ctaatatgactatattcaagtctccgaaatactcttgtctccagacttgtaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgctcggatctgcacttgctc 980938  T
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  980939 aaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 980988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5378748 - 5378533
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||| |    
T  5378748 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaatcaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaac 5378649  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| |||   || |||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  5378648 atccatgttaatagcataaaacaacaaggtacaaattcctacacatatgactacatttaaatctccggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtggat 5378549  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||||    
T  5378548 gacgccaaagtcattg 5378533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 280
Target Start/End: Original strand, 42505067 - 42505287
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg----ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  42505067 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcagtctctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactca 42505166  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || ||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||  || |||||| ||||||||||||    
T  42505167 caacatccatgttaatagcatgaaacgacagagtatctatgcctacaaatatgactatattaaagtctttgaaatatccacgtctccagatctgcaacgt 42505266  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattgt 280  Q
    | |||||| ||||||||||||    
T  42505267 tcacgacgtcaaagtcattgt 42505287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 356
Target Start/End: Original strand, 12439348 - 12439624
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcg-atacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||   ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  12439348 taaaactaaacgatattcattcattcaacttgataaagtatataatata-aattcaaattcgctaaaaataaaaatgataaatctgtgaacaaactcaca 12439446  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 261  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||                 |||||||||||||| ||||||  |||    
T  12439447 tcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgattata-----------------ctcatgtctccggaactgcaatcttg 12439529  T
Q  262 acgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12439530 acgacgccaaagtcattgtcgttgatcggatcttcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaaaacggaaaat 12439624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28619047 - 28618833
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||    
T  28619047 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtcaacaggctcacatca 28618948  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  28618947 tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatttccgaaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatg 28618848  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  28618847 acgccaaagtcattg 28618833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26294077 - 26293853
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26294077 aaaaataaacgatattcattcattcaaatagatagagtacgtcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaact 26293978  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatg---------actatattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||         |||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||    
T  26293977 cacaacatccatattaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattaaaatctccggaatatttatgtctccgg 26293878  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26293877 atctgcaacgttgacgacgccaaag 26293853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 118 - 356
Target Start/End: Original strand, 3079047 - 3079295
Alignment:
Q  118 aattcgctaaaaacaaaaa-ggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata------ 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||||||||          
T  3079047 aattcgctaaaaacaaaaaaggatgagtctgtgaacaaactcacagcatccatgttaataacataaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgatta 3079146  T
Q  211 ---tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaa 307  Q
       |||||||||| ||||||   ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3079147 atatgactatatttatgtctatcgaacactcatgtcttcagatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaa 3079246  T
Q  308 actaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3079247 gcaaatctttcaactcgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaaat 3079295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34844363 - 34844147
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||     
T  34844363 taaaaagaaacgatattcattaatgcaaattgatagagtacatctatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaa 34844264  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34844263 catccatgttaatagtataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtcgccagaatacccatatctccgggtctgcaacattga 34844164  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| ||||||||||||    
T  34844163 cgactccaaagtcattg 34844147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40775207 - 40774992
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||| |      
T  40775207 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaatttgctaaaaattaaaaggatgaacatgtgaacaaactcagagg 40775108  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  40775107 atctatgttaatagcataaaacgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtttccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgaa 40775008  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  40775007 gactccaaagtcattg 40774992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 6647577 - 6647796
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgat----agagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  6647577 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgattgatagaatacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaataaactca 6647676  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    || ||||||| |||||||  |||||||  ||||||   | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6647677 caacatccatgttaatagcttaaaacggaaaagtacaaaagcctacacatatgactatattaaagtctccggaatatccatgtctccggatctgcaacgt 6647776  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  6647777 tgatgacgccgaagtcattg 6647796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 6886847 - 6887061
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||    
T  6886847 aaaataaaagatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacatca 6886946  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||   ||||| |||||||||||||||| || |    
T  6886947 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccggaattaccatgtatccggatctgcaacgtggatg 6887046  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  6887047 acgccaaagtcattg 6887061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20271151 - 20270945
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaaca-aaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  20271151 gatattcattcattcaaattagtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgtt 20271052  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||   | | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20271051 aatagcataaaacgacaaagtactaaagtctacacatatgactatatttaagtctccgaaatatccatgtctccggatctgcaacgttgaagactccaaa 20270952  T
Q  273 gtcattg 279  Q
    |||||||    
T  20270951 gtcattg 20270945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28501118 - 28500920
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |     
T  28501118 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattcgctgaaaataaaaaggatgaacctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcaa 28501019  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||||   |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  28501018 aaaacgacaaagtacaaacacctacagatatgactatattcatgtctccagaatacccatgtctccggatctgcaacgtggaggacgacaaagtcattg 28500920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37219448 - 37219234
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  37219448 aaaaataaacgaaattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgaaaattcgct-aaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaac 37219350  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||   | ||||||| ||||||||   |  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37219349 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactggttctaagtctccgcaatacacatgtctccggatctgcaacattgac 37219250  T
Q  264 gacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| ||||||||||||    
T  37219249 gactccaaagtcattg 37219234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Original strand, 8811837 - 8812035
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8811837 attcattcaaattgatagagtacattgatacaatgaaagttcgctaaaaacgaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcat 8811936  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8811937 aaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaataccattgtctccagatctgcaacgttgatgactctaaagtcattg 8812035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2415837 - 2415651
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  2415837 atattcattcattcaaattgatagagtatatcgatgtaatgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgttaa 2415738  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcct--acaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2415737 tagcataaaacgacaaagtataaatgcctacacatatatgactatatttatgtcttcggaataatcatgtcttcggatctgcaacgt 2415651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 6074417 - 6074619
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  6074417 attcattcattcacattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttaata 6074516  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | | |||||| || || |  || | ||||||| ||||||||||| |  | || ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6074517 gcacaaaacggcatagaacataagtctacaaacatgactatattaaaatatctggaataaccatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtca 6074616  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  6074617 ttg 6074619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35906714 - 35906500
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |  |||||||||    
T  35906714 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatataatgcaaattcgctaaaaactaaaagtatgaatatgtgaacaggctcacatca 35906615  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||  ||||| ||||||||||||| || || |    
T  35906614 tccatgttaatagcataaaacgacaaaatacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccgaaataaccatgtatccggatctgcaatgtggatg 35906515  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  35906514 acgccaaagtcattg 35906500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 279
Target Start/End: Original strand, 20145902 - 20146102
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||     
T  20145902 tcattcattcaaattgatagagtgtatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaataagaatgaatatgtgaacaaactcacaacatcaatgttaatagc 20146001  T
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  ||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20146002 ataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatcttcggaatagacatgcatctggatctgcaacgttcatgacgccaaagtcatt 20146101  T
Q  279 g 279  Q
    |    
T  20146102 g 20146102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4070995 - 4070782
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |  |||||| ||    
T  4070995 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaaggataaatctatgaagaggctcacagca 4070896  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||   || |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  4070895 tccatgttaatagcataaaacg-caaagtacaaatacctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatg 4070797  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  4070796 acgccaaagtcattg 4070782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8957637 - 8957437
Alignment:
Q  79 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagt 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||| ||||||      
T  8957637 tcattcattccaattgatagagtacatcgatgcaatataagttagctaaaaacaaaaaggatgaatttgtggacaaattcacaacattcatgttaataac 8957538  T
Q  179 ataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    ||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8957537 ataaaacgacaaagtacacaagccaacaaatatgactatattaaaatctccgaaatagccatatctccggatctgcaacgttgatgacgcaaaagtcatt 8957438  T
Q  279 g 279  Q
    |    
T  8957437 g 8957437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7151263 - 7150984
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||      | |||||||||||| |||||||    ||| |||||    
T  7151263 aaaaataaacgatattcattcattaaaatcgatagagtaaattgatacaatacaaattcaaagtcgttaaaaacaaaaaagatgaatccacgaacaaact 7151164  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    ||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7151163 cagtgcaaccatgttaataacataaaacgacaaagtacataaacctacaaacatgactatattcaagtcttcggaatactaatgtctctggatctgcaac 7151064  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 343  Q
    ||||| ||||||||||||      |||||||| || || |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7151063 gttgatgacgccaaagtc------attgatcgaatttgtacttactcaaaaccagtctttcaacctgaatcaaataaacatcgcac 7150984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 279
Target Start/End: Original strand, 17325341 - 17325545
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||  || ||||||| ||    
T  17325341 cgatattcattcattcaaattgatagattacatcgatgcaatacaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtaaacaaact--caacatccatgtt 17325438  T
Q  173 aatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 272  Q
    ||||| |||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  ||| |||| ||||    
T  17325439 aatagcataaaatgacaaagtacataagcctacatatatgactatattaaaatctctggaatagtcatgcctccggatctgtaactatgatgacgacaaa 17325538  T
Q  273 gtcattg 279  Q
    |||||||    
T  17325539 gtcattg 17325545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29154666 - 29154452
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||    
T  29154666 aaaaataaatgatattcatttattcaaattgatagagtatattaatacaatataaattctctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacatactcacatc 29154567  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||   |  |||||| ||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  29154566 atccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaaacctacacatacgattatatttaactctccggaatactcatgtctccggatctgcaacatggat 29154467  T
Q  264 gacgccaaagtcatt 278  Q
    ||| ||||| |||||    
T  29154466 gacaccaaaatcatt 29154452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32387899 - 32387715
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32387899 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacactgcaaattcgttaacaacaaaaaagataaatttgcgaacaaactcacaacatccatattaa 32387800  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    ||  |||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||||||||| || || |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  32387799 taacataaaacgacaaggtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtatctggaacacctatgtctccggatctgcaacgt 32387715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 19645705 - 19645924
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |    
T  19645705 aaaaataaatgatattcattcattcaaatcgata-agtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaac 19645803  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctac------aaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||      | |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  19645804 atccatgttaatagcataaaacgacaaaatacaaatgcctacgtatatacatatgactatattcaaatctccggaataaccatgtcttcggat-tgcaac 19645902  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    || || ||| ||||||||||||    
T  19645903 gtggatgacaccaaagtcattg 19645924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34866878 - 34866669
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaaca-aaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| || ||| |||||||||     
T  34866878 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatatagtgcatcaatacaatgcaaattcgctaaaaaaacaaaaagatgaatatgcgaacaaactcacaa 34866779  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||||   | | ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34866778 catccatgttaatagcaaaaaacgtcaaagtacaaaaggctacacatatggccatattcaagtctccgaaatattcatgtctccggatctgcaacattga 34866679  T
Q  263 cgacgccaaa 272  Q
    ||||| ||||    
T  34866678 cgacgtcaaa 34866669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11858186 - 11858070
Alignment:
Q  238 catgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaaca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11858186 catgtctccggatctgcaacgttgacgacgcctaagtcattg--atcgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaaca 11858089  T
Q  338 ccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11858088 ccgcactaagacgggaaat 11858070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25771057 - 25770839
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgat----acaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||| | ||| || || ||| ||||||    
T  25771057 taaaaataaaggatattcatttattcaaattgatagagtacatcgattgatacaatacaaattcgctaaaaataaaaggtatggatctgcgaacaaactc 25770958  T
Q  159 acatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    |||   | ||| ||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||| | |||||| |||| |  |||| ||||| || || |||||||||     
T  25770957 acaatgttcatcttaatagaataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatgattgtattcaagtcttcataatagtcatgccttcgaatctgcaaca 25770858  T
Q  259 ttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25770857 ttgacgacgccaaagtcat 25770839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15710990 - 15710780
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  15710990 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcaatacaatgcaaattcactaaaaccaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaac 15710891  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgac---tatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 260  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||   | | ||||  |||||||   |||||| |  | ||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  15710890 atccatgttaatagcataaaacaacaaagtacaaaagactacgcatatgactattatatttaaatatccggaatacatatgtctctagatctgcaacgtt 15710791  T
Q  261 gacgacgccaa 271  Q
    || ||||||||    
T  15710790 gatgacgccaa 15710780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 12524345 - 12524547
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  12524345 attcattcatttaaattgatagattatattcaaacaatacaaattcgctaaaaatagagaggatgaatatgtgaacaaactcacaacattcatgttaata 12524444  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||| |||||||||   | |||||||||||||| |||||| | ||||||  || | ||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  12524445 gcataaaatgacaaagtacaaaagcctacaaatatgattatattaaagtctcctaaacaatcatgtctttggatctacaacgttgatgacaccaaagtca 12524544  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  12524545 ttg 12524547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43494132 - 43494020
Alignment:
Q  244 tccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 343  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43494132 tccggatctgcaacattgacgatgtcaaagtcattgtcattgattggatatgcacttgctcaaagttagtctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 43494033  T
Q  344 taagacgggaaat 356  Q
    ||| |||| ||||    
T  43494032 taaaacggaaaat 43494020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 10923803 - 10924013
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | | |||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| |     
T  10923803 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatataatgcaaaattgttaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacg 10923902  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||| |  ||||| |||||  |||   |||||||||||||||| ||      
T  10923903 tctatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgcctatacatatgactatatttaaatctcctgaataaccattcatccggatctgcaacgtggata 10924002  T
Q  265 acgccaaagtc 275  Q
    |||||||||||    
T  10924003 acgccaaagtc 10924013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17218169 - 17218050
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||| || |||||| |    
T  17218169 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaataaaaattcgctaaaaac-gaaaggatgaatctatgaacaatctcacaac 17218071  T
Q  164 atccatattaatagtataaaa 184  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  17218070 atccatgttaataatataaaa 17218050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 279
Target Start/End: Original strand, 39415923 - 39416141
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||      |||  ||| || |||||||||| |   || |||||||    
T  39415923 aaataaacgatatttattcattcaaattgattaagtacatcgatacaatacatattcaaagtcgctggaaa-aagaaggatgaatattcaaacaaactca 39416021  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgt 259  Q
    ||  |||||| ||||||| | |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  39416022 caaaatccattttaatagcaaaaaatgacagagtacatatgcctacaaatatgactatattcatatcatcgaaatactcatgtttccggatctgcagcgt 39416121  T
Q  260 tgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  39416122 tgacgacgcaaaaatcattg 39416141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39591477 - 39591281
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||| | ||||||| ||||||  ||    
T  39591477 attcatttaaattgatagagtacctcaatacaatacaaatttattaaaaataaaaaggttgaatctgcgaacaaactcataacatccatgttaataacat 39591378  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    ||||||||||| ||  || ||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  39591377 aaaacgacaaaatacataagcctacatatatgaatatattaaagtctctggaatactcatgcattcagatccgcaacgttgacgacgtcaaaatcat 39591281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42781468 - 42781337
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  42781468 aaaaataaacgatatttatttattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaaaggatgaatttgttaacaaact 42781369  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42781368 cacaacatccatgttaatagcataaaacgaca 42781337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 35402428 - 35402214
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcc---atattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatatt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||  || |   || ||||||| ||||||| |   ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35402428 ctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatactgcatgttaatagcataaaacaattgagtagatatgcctacaaatatgactatatt 35402329  T
Q  221 catgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaa 320  Q
    || ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| || |||||| ||||||  ||||| || || |||||||| | |||  |||||||||||    
T  35402328 caagtctctggaatactgatgtctctagatctacaacgttgatgatgccaaaatcattg--attgaccgaatctgcacttgttcaaagttaatctttcaa 35402231  T
Q  321 cctgaatcaaataaaca 337  Q
    |||||||||||||||||    
T  35402230 cctgaatcaaataaaca 35402214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3495281 - 3495139
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| || |||| ||||    
T  3495281 atatttattcgttcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacaaccatgttaa 3495182  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactat 217  Q
    ||| |||||||| |||||||   |||| |||| ||||||||||    
T  3495181 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcttacacatatgactat 3495139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37425570 - 37425448
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  37425570 ataaaaataaatgatattcattaattcaaattgatagagtagatcgatacaataagaattcgataaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcaca 37425471  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaa 184  Q
     |||| || ||||||| ||||||    
T  37425470 acatctatgttaatagcataaaa 37425448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6639448 - 6639225
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagta--catcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||      ||||||||| |||||| | |||| || |||||||    
T  6639448 aaaaataaacgatattcattcattcaaattggtagagtatacatcgatacaatataaatttcaaatcgctaaaaataaaaagaaagaatatgcgaataaa 6639349  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||| ||| ||| ||||||  ||||| | | | |  |  |||||| ||||||||||||||||||| |   | | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  6639348 ctcacaacattcatgttaataacataaatcaaaataaaacatatgccgacaaatatgactatattcaagcgacggaaatactcatgtttccggatgtgca 6639249  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  6639248 acgttgacgacgcaaaagtcattg 6639225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17687503 - 17687365
Alignment:
Q  212 gactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaacta 311  Q
    ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||      |||||||||||| ||||| |||  ||    
T  17687503 gactatattcaagttaccagaatactcatgtctccggatctgcaacattgatgacgtcaaagtcattg------atcggatatgcatttgctcaaattta 17687410  T
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17687409 atctttcaatctgaatcaaataaacaccgtactaagatgggaaat 17687365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Original strand, 9034623 - 9034825
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| | || || |||||| |  |||||| ||||||| |||    
T  9034623 gatatccattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaa---aaacggtggatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 9034719  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 273  Q
    || | ||||||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||| |  |||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |  | ||| ||||||    
T  9034720 atggcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatataactatatttaaatctccgaaataaccatgtctttggatctgcaacatgaatgaccccaaag 9034819  T
Q  274 tcattg 279  Q
    ||||||    
T  9034820 tcattg 9034825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28662516 - 28662362
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||| || | |    
T  28662516 aaaaataaacaatattcattcattcaaattgaaagagtacgtcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgagtctatgaacaaacacataac 28662417  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactata 218  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||   | ||||||| |||||||||||    
T  28662416 atccatgttaatagcataaaacggcaaaatactaaagcctacacatatgactata 28662362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32309963 - 32309814
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||| ||| |||||| ||||| ||||||| || ||| |||||    
T  32309963 aaaaataaacgatattgattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaattcaaagtcgttaaaaataaaaaagatgaatctgcgaacaaact 32309864  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaa 207  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32309863 cacaacatccatgttaataggataaaacgacagagtatttatgcctacaa 32309814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Original strand, 39308419 - 39308546
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| | ||||||| || ||| |||||||||    
T  39308419 ataaaaataaatgatattcattcattcaatttgataaagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaa--aaagatgatgaatctgcgaacaaactcaca 39308516  T
Q  162 tcatccatattaatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  39308517 tcatctatattaatagcataaaacggcaaa 39308546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 215 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39915788 - 39915653
Alignment:
Q  215 tatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatc 314  Q
    |||||||| |||||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||      || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39915788 tatattcaagtctctagaatacacatgtctccgaatcttcaacgttgacgacgtcaaagttattg------attggatatgcacttgctcaaagctaatc 39915695  T
Q  315 tttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39915694 tttcaacctgaataaaataaacaccgcactatgacaggaaat 39915653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41358470 - 41358260
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc-----ca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||      |    
T  41358470 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattcgttaaaaacaaaacggatgaatatgcgaacaaactcacaacatcaatttga 41358371  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    | ||||||| || ||||  |||||||   | | ||| | ||||||||||||| | || || ||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||     
T  41358370 tgttaatagcattaaaccgcaaagtacaaaagtctaaacatatgactatattaaagtatctggaataactatgtcttcggatctgtaacgttgacgacgt 41358271  T
Q  269 caaagtcattg 279  Q
    |||||||||||    
T  41358270 caaagtcattg 41358260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 351
Target Start/End: Original strand, 42512764 - 42512939
Alignment:
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||| |    
T  42512764 attaatagcataaaacgacagagtatctatgcctacaaatatgactatattaaagtcttcgaaatattcacgtctccatatctgcaacgttgatgacgtc 42512863  T
Q  270 aaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    |||||||||||      | ||||   |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  42512864 aaagtcattgt------ttggatcaacacttgatcaaagctaatctctcaacctgaatcaaataaataccgtacaaagacgg 42512939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 232 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12215410 - 12215301
Alignment:
Q  232 aatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaa 331  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  12215410 aatactcatgtcgtcggatctgcaacgttgacgacgcaaaagtcattg------atcggatatgcacttgctcaaaactaatctttcaa-ctaaatcaaa 12215318  T
Q  332 taaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12215317 taaacaccgcattaaga 12215301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 356
Target Start/End: Original strand, 17523256 - 17523483
Alignment:
Q  123 gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattca 222  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   |||||| |  |||||  | ||||  ||||| ||  ||||| | ||||||||    
T  17523256 gctaaaaataaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatccaagataatagcaacaaacggaagagtacatatgcttaagaatataattatattca 17523355  T
Q  223 tgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacc 322  Q
     | | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | || |||||||||   |||||    || |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  17523356 agccaccgaaatactcatgttttcggatctgcaacgttgacaatgcaaaagtcatta--attga----atttgcacttgatcaaaactaatctttcgacc 17523449  T
Q  323 tgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17523450 tgaatcaaataaacaccgcaataagacgggaaat 17523483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34874285 - 34874093
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  34874285 atattcattcatttaaattaatagagtgcatcaatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactaacgacatccatgttaa 34874186  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| | |||| | |||||||   | | ||||| | ||||| |||||            |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34874185 tagcaaaaaatggcaaagtataaaagtctacacacatgaccatatt-----------tatactcatgtctccggatatgcaacgttgacgacgccaaagt 34874097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14535283 - 14535066
Alignment:
Q  125 taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatg 224  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||  ||| || ||||||| |||||||| || ||||  |||| ||| |||||||| |||||||| |    
T  14535283 taaaaataaaaaggatgaatctgcaaataaactcgcaaaatcaatgttaataggataaaacggcagagtacatatgtctataaatatgattatattcaag 14535184  T
Q  225 tctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctg 324  Q
     | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    || | |||||| | ||| | |||||||||| | |    
T  14535183 ccacaagaatactcatgtatccggatctgcaacgttgatgacgcaaaagtcattg--attga----atctacacttgatcaaagccaatctttcaatccg 14535090  T
Q  325 aatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  14535089 aatcaaataaacaccgcattaaga 14535066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13161812 - 13161608
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgc------taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||        | ||||||||||| |||||| ||  || |||||    
T  13161812 aaaaataaatgattttcattcactaaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaagtcatttaaaacaaaaagcatgaatctgctaacaaact 13161713  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
     ||| ||| ||| ||||||| ||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13161712 tacaacattcatgttaatagcataaaacggtagaatatctaagcctacaaatatgactatatttaagtctac-gaatactcatgtctccgggtctgctac 13161614  T
Q  258 gttgac 263  Q
    ||||||    
T  13161613 gttgac 13161608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 26905303 - 26905598
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||||      ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  26905303 aaaaataaatgatattcattcattaaaattgatataataccttgatacaatacaaatttatattcgctaaaaacaaaaatggtgaatgtgtgaacaaact 26905402  T
Q  158 cacatcatccatattaata---gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgc 254  Q
    | || ||||||| ||||||   |  |||||| ||| ||||  |||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||  ||||| |    
T  26905403 cgcaacatccatgttaatagccgcctaaaacaacatagtacatatgtctacaagcatgacaatattcaagtctccataatactcatgcatcttgatctac 26905502  T
Q  255 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    ||||||||| || | ||||||||||  |||||    || |||| || || |||  |||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  26905503 aacgttgacaacactaaagtcattg--attga----atctgcatttcctcaaagataatatttccacctgaatcaaataaacaccacattaagacgagaa 26905596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33999984 - 33999870
Alignment:
Q  128 aaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtct 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||  |||||| ||||||   || | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33999984 aaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacattatacatgataataggataaaaatgcatactatctatgcctacaaatatgattatattcaggtct 33999885  T
Q  228 ccggaatactcatgt 242  Q
    | |||||||||||||    
T  33999884 ctggaatactcatgt 33999870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 257
Target Start/End: Original strand, 39530817 - 39531013
Alignment:
Q  66 aaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||      | ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  39530817 aaataaacgatatttattcattcaaattgatagggtatatcgatacagtacatatttaaaatcactaaaaacaaaaaggatgaatataaaaataaactca 39530916  T
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||| ||| |||| || |||||||| ||  |||  ||||||||||||||| | |||||||| |   ||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  39530917 catcat-catgttaacagcataaaacggcatggtacatatgcctacaaatataattatattcaagctaccgaaatactcatgttttcgaatctgcaac 39531013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32309470 - 32309324
Alignment:
Q  204 acaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgct 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||| | |||      |||||||||  ||| ||||||||||    
T  32309470 acaaatatgactatattcaagtcaccggaatattcatgtcttccaatctgtaacgttgacgacacaaaa------gtcattgattcgatttgcacttgct 32309377  T
Q  304 taaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     |||  ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||    
T  32309376 caaagttaatcttacaacctgaatcaaataaatatcgtactaagacggaaaat 32309324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Original strand, 29663028 - 29663087
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29663028 taaaaataagtgatattcactcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattc 29663087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 4726671 - 4726737
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  4726671 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaa 4726737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11647639 - 11647431
Alignment:
Q  76 tattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccat 169  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||| ||||||     
T  11647639 tattcattcacttcaattaatagagtacatcaatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgtacaaactcacaacatccac 11647540  T
Q  170 attaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 269  Q
     |||||| | ||||| |||||| ||  || |||||| ||||| | |||||||| || || | ||||||||||  |||||||||| || ||||| ||| ||    
T  11647539 gttaataatttaaaatgacaaaatacataagcctac-aatataattatattcaagtgtctgaaatactcatgcatccggatctgtaatgttgaagacacc 11647441  T
Q  270 aaagtcattg 279  Q
     |||||||||    
T  11647440 taagtcattg 11647431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 194
Target Start/End: Original strand, 24288641 - 24288756
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata- 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| | || ||| ||||||||| ||||||| ||||||     
T  24288641 ttcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaatacaaattcgtt--aaataaaaatgatgattctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatat 24288738  T
Q  177 gtataaaacgacaaagta 194  Q
    | |||||| |||||||||    
T  24288739 gcataaaatgacaaagta 24288756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24373581 - 24373466
Alignment:
Q  78 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata- 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| | || ||| ||||||||| ||||||| ||||||     
T  24373581 ttcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaatacaaattcgtt--aaataaaaatgatgattctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatat 24373484  T
Q  177 gtataaaacgacaaagta 194  Q
    | |||||| |||||||||    
T  24373483 gcataaaatgacaaagta 24373466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 194
Target Start/End: Original strand, 32390373 - 32390462
Alignment:
Q  105 tcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32390373 tcgatataatgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatccatgttaatagcataaaacgacaaagta 32390462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12891904 - 12891844
Alignment:
Q  288 cggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12891904 cggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctggatcaaataaacaccgcactaaga 12891844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 4726740 - 4726811
Alignment:
Q  208 atatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  4726740 atatgactatatttaaatctccggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtagatgacaccaaagtcattg 4726811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13079537 - 13079450
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  13079537 gatattcattctttcagattgatagagtatactgatacaatgcaaattcgctaacatcaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcaca 13079450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 356
Target Start/End: Original strand, 35275815 - 35275947
Alignment:
Q  218 attcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatcttt 317  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||      || |||| || ||||||| ||| |||| ||||    
T  35275815 attcaagtctccagaataaccatgtctccatatctgcatcgttgacgacgccaaagttattg------attggatctgtacttgctcaaagctaaccttt 35275908  T
Q  318 caacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35275909 caaccggaatcaaataaacatcgcataaagacgggaaat 35275947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37425409 - 37425250
Alignment:
Q  118 aattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaact-atgcctacaaatatgacta 216  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||| | ||| |  |||||  | |||||||    
T  37425409 aattcgataaaaacaaaaatgatgaatatgtgatcaaactcacaacatctatgttaatagtataaaatgataaa-tcactaaaacctac--acatgacta 37425313  T
Q  217 tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37425312 tatttaagtctccggaataaccatgcatccgaatctgcaacgttgaggactccaaagtcattg 37425250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 28423704 - 28423770
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  28423704 aaaaataaatgatattcattcattcaaattgatatagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaa 28423770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Original strand, 39532077 - 39532223
Alignment:
Q  132 aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccgg 231  Q
    ||||| ||||||| || ||  ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  39532077 aaaaacgatgaatctgcgagcaaactcacaacatcaattttaatagcataaaacggtcgagtacatatgcctacaaatatgactatattcaagccaccga 39532176  T
Q  232 aatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcatt 278  Q
    |||||| |||| | || |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  39532177 aatactaatgttttcgaatctgcaaagttaacgacgcaaaagtcatt 39532223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 9196685 - 9196742
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  9196685 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatataaatt 9196742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13007998 - 13007925
Alignment:
Q  203 tacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  13007998 tacatatatgacaatattcaagtctccggaatacccatgactccggatctacaacgttgatgacgcaaaagtca 13007925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 14726265 - 14726380
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||   || ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||  |    
T  14726265 cgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagatacaa-aca---tcactaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagt 14726360  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  14726361 taatattataaaacgacaaa 14726380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 170
Target Start/End: Original strand, 17067441 - 17067553
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||      |||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  17067441 aaaaacaaacgatagtcatttattcaaatggatagagtacattgatgcaatacaaattcgaaactgctaaacacaaaaaggatgaatctacgaacaaact 17067540  T
Q  158 cacatcatccata 170  Q
    |||||||||||||    
T  17067541 cacatcatccata 17067553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Original strand, 28388914 - 28388991
Alignment:
Q  202 ctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  28388914 ctacacatatgattatattcaagtctccggaatacccatatctctggatctgcaacatggacgacaccaaagtcattg 28388991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Original strand, 907658 - 907718
Alignment:
Q  116 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  907658 caaattcgctaaacacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacaatatccatattaata 907718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 356
Target Start/End: Original strand, 26240413 - 26240639
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||| |||||||||||  ||   | || ||| |||||||||||||||||     
T  26240413 ctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcgcaacatctatgttaatagcataaaacgacagtgtgcatgtgtctataaatatgactatattcaa 26240512  T
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacct 323  Q
    | | |   |||||| |||| |  |||  ||||| ||||||||| | || |||||||  |||||    ||||||| ||  | |||  ||||| ||||||||    
T  26240513 gccacgaaaatacttatgtttttggagttgcaaagttgacgacacaaacgtcattg--attga----atatgcatttcatcaaagttaatcgttcaacct 26240606  T
Q  324 gaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  26240607 gaatcaaataaacatcacactaagacggaaaat 26240639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 586207 - 586160
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  586207 aaaactaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac 586160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 32188487 - 32188404
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagta-catcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactca 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| | |||||||    
T  32188487 attcattcatttaaattgatagaataacatcgatgcaatacaaattcgttaaaaataaaaaggatggatctgtggaaaaactca 32188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43494275 - 43494180
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatat 219  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  43494275 ctaaaaacaaaaggcaagaatctgtgaacaaactcacaacatccgtgttaataacataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgaatatat 43494180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1419342 - 1419260
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  1419342 tatgcctacaaatacgactatattcatgttttcgtaatactcatgttttcgggtttgcaacgtcgacgacgcctaaatcattg 1419260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18573530 - 18573480
Alignment:
Q  305 aaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18573530 aaaactaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaaacgagaaa 18573480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38598078 - 38597966
Alignment:
Q  76 tattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||  ||||    
T  38598078 tattcattcattcaaattgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaa 38597983  T
Q  175 tagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||| ||| |||| ||||    
T  38597982 tagcatacaacggcaaa 38597966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Original strand, 8096303 - 8096410
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||   ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||  ||    
T  8096303 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatagatacaa-aca---tcgctaaaaatgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaccacccaagtt 8096398  T
Q  173 aatagtataaaa 184  Q
    ||||| ||||||    
T  8096399 aatagcataaaa 8096410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13080461 - 13080388
Alignment:
Q  203 tacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  13080461 tacatatatgacaatattcaagtctccggaatacccatgactccggatctacaacgttgatgatgcaaaagtca 13080388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 20187388 - 20187496
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| | |||| ||||| || |||||||    
T  20187388 aaactcacaacattcatgtcaatagcataaaaccacagagtatctatgcctacaaatattactatatttaagtctctgaaatattcatg-cttcggatct 20187486  T
Q  253 gcaacgttga 262  Q
    ||||| ||||    
T  20187487 gcaaccttga 20187496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25487829 - 25487768
Alignment:
Q  295 gcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25487829 gcacttgtttaaagttgatctttcaacctgaatcaaataaacaatgcactaagacgggaaat 25487768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 186
Target Start/End: Original strand, 6011942 - 6012052
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   ||| |||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  |    
T  6011942 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagt 6012037  T
Q  172 taatagtataaaacg 186  Q
    |||||| ||||||||    
T  6012038 taatagcataaaacg 6012052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13422215 - 13422107
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcg-atacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||   |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||  ||    
T  13422215 gatattcattcattcaaattgataga-tacatcatatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagtt 13422121  T
Q  173 aatagtataaaacg 186  Q
    ||||| ||||||||    
T  13422120 aatagcataaaacg 13422107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35455484 - 35455381
Alignment:
Q  117 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta 216  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||   |||||||||| || |||  |||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  35455484 aaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctacgaataaacatccatcatccatgttgataacataaaatgacaaagtatataagcctacaaatatgtcta 35455385  T
Q  217 tatt 220  Q
    ||||    
T  35455384 tatt 35455381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Original strand, 10332354 - 10332466
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||  |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||    
T  10332354 atatccattcattcaaattgatagaatacatc---agaat-caacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcacccaagttaa 10332449  T
Q  175 tagtataaaacgacaaa 191  Q
    ||| ||| || ||||||    
T  10332450 tagcatataaagacaaa 10332466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Original strand, 39531636 - 39531698
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||    
T  39531636 tgcacttgattaaagctaatctttcaacctgaatcaaataagcattgtactaagacggaaaat 39531698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 374518 - 374449
Alignment:
Q  280 tcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 349  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  374518 tcattgactggatatgcacttgatcaaagttactctttcaacttgaatcaaacaaacaccgcactaagac 374449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13007513 - 13007480
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007513 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 13007480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13008111 - 13008014
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||| || ||| |||||||||    
T  13008111 aaaaataaatgatattcatactttcagattgatagagtatactgatacaatgcaaattcactaacatcaaaaaagatgaatctgcgaacaaactcaca 13008014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 14082200 - 14082315
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||   |||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||| ||||||| |  |    
T  14082200 cgatatccattcattcaaatcgatagagcacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcccatcatcgaagt 14082295  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  14082296 taatagcatacaacgacaaa 14082315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 185
Target Start/End: Original strand, 17566135 - 17566251
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||      |||||| |||||| |  ||||||||||  || ||||||| | ||||||    
T  17566135 atatttattcattcaaattgatagattacattgatactatacaaattcaaagtcgctataaacaacacagatgaatttgcaaacaaactcataacatcca 17566234  T
Q  169 tattaatagtataaaac 185  Q
    | ||||||| |||||||    
T  17566235 ttttaatagcataaaac 17566251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Original strand, 19200250 - 19200299
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 113  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19200250 aaaaataaacaatattcattcattcaaattaataaagtacatcgatacaa 19200299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4771140 - 4771100
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4771140 cgatattcattcattcaaattgatagagtatatagatacaa 4771100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16575226 - 16575166
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg 123  Q
    ||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16575226 taaaaataaacgatattaatttgtttaaattgatagagtacattgatacaataaaaattcg 16575166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34929760 - 34929708
Alignment:
Q  132 aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa 184  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34929760 aaaaatgatggatttgtgaacaaattcacatcatccatattaatagcataaaa 34929708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 39415553 - 39415609
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  39415553 tgcacttgattaaagctaatctttcaacctgcatcaaataaacatcatactaagacg 39415609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13677554 - 13677511
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13677554 ataaaaataaacgatattcattcattcaagttgatagaatacat 13677511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 346
Target Start/End: Original strand, 20187505 - 20187556
Alignment:
Q  295 gcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20187505 gcacttgcttaaacctagtcttttaacctaaatcaaataaacatcgcactaa 20187556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 193
Target Start/End: Original strand, 26877913 - 26878029
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa-ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||  | | |||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||  |    
T  26877913 cgatattcattcattcgaattgatagagtacatc-at---atacaaacattggtaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagt 26878008  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaagt 193  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  26878009 taatag-atacaacgacaaagt 26878029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Original strand, 39558168 - 39558246
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttg 147  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||      ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  39558168 atattcatccattcaaattaatagagtacattgatataatacaaatccaaagtcgctaaaaactaaaagtatgaatttg 39558246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1409784 - 1409692
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| ||| | ||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  1409784 cgatattcatttattcaaattggtagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacataaaagctgaatctatgaataaattcacaccatcca 1409692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 176
Target Start/End: Original strand, 6012716 - 6012833
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactc 158  Q
    |||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||      |||||||||| |||| | |||||||||  || ||||||    
T  6012716 aaaataaatgataatcattaatttaaattgatagagtacattaatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaatgaatgaatttgcaaacaaactc 6012815  T
Q  159 acatcatccatattaata 176  Q
    ||| |||| || ||||||    
T  6012816 acaacatcaatgttaata 6012833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9406463 - 9406366
Alignment:
Q  160 catcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacg 258  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| |||  ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||| | |||||||||||    
T  9406463 catcatctatgttaatagcataaaaagacggagtacataagcctacaaatatgactatattcaagtcttcataaaactcatgtct-ctgatctgcaacg 9406366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13006501 - 13006443
Alignment:
Q  86 ttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 144  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  13006501 ttcaaattgatagagtatactgatacaatgcaaattccctaacatcaaaaaggatgaat 13006443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Original strand, 17518116 - 17518194
Alignment:
Q  196 ctatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||   || |||||||||||||| | ||||||    
T  17518116 ctatgcctacaaatatgattgtattcaagtcttcagaatactcatgtttctatatttgcaacgttgacgatgtcaaagt 17518194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 354
Target Start/End: Original strand, 19259808 - 19259850
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19259808 atctttcaatatgaatcaaataaacaccgcacgaagacgggaa 19259850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38007641 - 38007533
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||| | ||||| |||||| ||||||||| || |||  |    
T  38007641 cgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgtgaacaaactcacagcacccaagt 38007546  T
Q  172 taatagtataaaa 184  Q
    |||||| ||||||    
T  38007545 taatagcataaaa 38007533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 39915894 - 39915849
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagag--tacatcgatacaatacaaat 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39915894 attcattcaatcaaattgatagagagtacatcgatacaatacaaat 39915849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 8984793 - 8984826
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8984793 cgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 8984826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 9113529 - 9113562
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9113529 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 9113562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13080574 - 13080477
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcaca 161  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| || ||| |||||||||    
T  13080574 aaaaataaatgatattcatactttcagattgatagagtatactgatataatgcaaattcgctaacataaaaaacgatgaatctgcgaacaaactcaca 13080477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 20187288 - 20187345
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20187288 aaaaataaatgatattcatttatttaaattaatagagtacatcgacacactacaaatt 20187345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 24229588 - 24229621
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24229588 cgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 24229621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Original strand, 31254942 - 31254983
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  31254942 attcattcaaattaatagagtacgacgatacaatacaaattc 31254983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34945677 - 34945562
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatat 171  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||| || |||  |    
T  34945677 cgatattctttcattaaaatcgatagagtacatcagatacaa-aca---tcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagt 34945582  T
Q  172 taatagtataaaacgacaaa 191  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  34945581 taatagcatacaacgacaaa 34945562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 374704 - 374656
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc 122  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  374704 gatattcatttattcaatttgatagagtacattgatatactacaaattc 374656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 2057834 - 2057878
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2057834 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 2057878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11867949 - 11867905
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11867949 ataaaaaaaaacgatgttcatttattcaaattgatagagtacatc 11867905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12891943 - 12891895
Alignment:
Q  207 aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12891943 aatatgactatatttaaatctccgaaatacttatgtctccggatctgca 12891895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Original strand, 20257525 - 20257593
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgaca 189  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||| |||||||    
T  20257525 tcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacgaca 20257593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 27266855 - 27266899
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27266855 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 27266899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32755536 - 32755497
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32755536 attcattcaaattgatagagta-atccatacaatacaaatt 32755497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34881801 - 34881757
Alignment:
Q  312 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34881801 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 34881757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34906375 - 34906319
Alignment:
Q  294 tgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  34906375 tgcacttgctcaaagctaaactttcaaccttaatcaaataaacattacactaagacg 34906319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 42609623 - 42609583
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtaca 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42609623 aaaaataaacgatattcattcattcaaattaataaagtaca 42609583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35542 - 35244
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35542 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaact 35443  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35442 cacaacatccatgttaatagcataaaacagtaaagtacatatgcctataaatatgacaatattcaagtctccggaatactcatgtatccggatctgcaac 35343  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35342 gttgacgacgccaaagtcattgtcaatggtcggatttgcacttgctcaaagctaatatttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaat 35244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 12904 - 13206
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac-aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacat 162  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||     
T  12904 aaaaataaatgatattcattaattcaaattaatagagtacaacgatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacaa 13003  T
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaata---------tgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctg 253  Q
    |||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13004 catccatgataatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatatctccggaatactcatgtctacggatctg 13103  T
Q  254 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggga 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13104 caacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacctcactaagacggga 13203  T
Q  354 aat 356  Q
    |||    
T  13204 aat 13206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 31078 - 31111
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31078 cgatattcattcattcaaattgatatagtacatc 31111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 74631 - 74332
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  74631 aaaaataaacgatattcatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaagt 74532  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  74531 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctgtgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtctccgg 74432  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  74431 atctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaactccgtactaaga 74332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Original strand, 3721 - 4028
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3721 aaaagtaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcggtaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 3820  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         |||||| || ||   ||||||||||||||| |    
T  3821 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatatgactaatatgattatattcaagtttctaaaatactcatgtctccag 3920  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3921 atctgcaacgttgacgatgccaaagtcattttcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacctgaattaaataaacaccgcactaaga 4020  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||||||||    
T  4021 cgggaaat 4028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 166
Target Start/End: Original strand, 5877 - 5960
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatc 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5877 aaattgatagaatacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 5960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0536
Description:

Target: scaffold0536; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3362 - 3060
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt------cgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  3362 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaact 3263  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagt-------aactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggat 250  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||       || |||| |||   ||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  3262 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagttgcctacaaatatgacta---atatgactatatttaagtctctgaagtactcatgtctccggat 3166  T
Q  251 ctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 350  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3165 ttgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaaaacg 3066  T
Q  351 ggaaat 356  Q
    ||||||    
T  3065 ggaaat 3060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1350 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1350
Description:

Target: scaffold1350; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1992 - 1734
Alignment:
Q  108 atacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaa-cgacaaagtaactatgcctaca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  1992 atacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagcataaaaacgacaaggtacctatgcctaca 1893  T
Q  207 aatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgca 297  Q
    ||||||| ||         |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1892 aatatgattaataagagtatattcaagtctccggaatcctcatgtatctggatctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgta 1793  T
Q  298 cttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1792 cttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 1734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0432
Description:

Target: scaffold0432; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 2102 - 2326
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |      
T  2102 aaaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatagt 2201  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgc 254  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2202 atccatgttaatagcattaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtctccggatctgc 2301  T
Q  255 aacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  2302 aacattgacgacgccaaagtcattg 2326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Original strand, 2339 - 2381
Alignment:
Q  314 ctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2339 ctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 2381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0999 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0999
Description:

Target: scaffold0999; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2158 - 1900
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacat--cgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||      |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  2158 aaaaataaacgatattcattcactcaaattgatagagtacataccaatacaatacaaatccaaattcgctaaaataaaaaaggatgaatttgtgaacaaa 2059  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgca 255  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  2058 ctcacatcatccatgtcaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatacgactataatcatgtctccggaatacttatgtctctcgatctgca 1959  T
Q  256 acgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaa 320  Q
    ||||||| ||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1958 acgttgatgacgccaaagtc------attgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaa 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 356
Target Start/End: Original strand, 6787 - 7085
Alignment:
Q  68 ataagcgatattcattcatt-caaattgatagagtacatcgatacaatacaaa------ttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcac 160  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6787 ataaacgatattcattcatttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcac 6886  T
Q  161 atcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatc 251  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||         ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6887 aacatccatgttaatagcataaaatggtaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctcaagaatactcatgtctccggatc 6986  T
Q  252 tgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 351  Q
    ||||||||| |||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  6987 tgcaacgttaacgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctccaagctaatcttttaacccgaattaaataaacactgcacttagacgg 7080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 25193 - 25395
Alignment:
Q  77 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25193 attcatttattcaaattgatagaatacatcgctgcaatacagatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaataaactcacaacatccatgttaata 25292  T
Q  177 gtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 276  Q
    | |||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25293 gcataaaatggcaaagtacataggcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagccatgccttcggatctgcaacgttgatgacgccaaaatca 25392  T
Q  277 ttg 279  Q
    |||    
T  25393 ttg 25395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 105492 - 105271
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  105492 aaaaacaaacgacattcattcattcaaattgatatagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcacaac 105393  T
Q  164 atcca------tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaac 257  Q
    |||||      | ||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  105392 atccaggttttttttaatagcataaaacaacaaagtatataagcctacaaatatgactatattaaaatctccgaaatagccatgcctccggatctgcaac 105293  T
Q  258 gttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  105292 gttgatgacgccaaagtcattg 105271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6602 - 6297
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||       |||||||| ||||||| |||| |||||  |||||    
T  6602 aaaaataa-cgatattcattcattcaaatcgataaagtatatcgatataatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaaggacgaatctgtgagcaaact 6504  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccgg 248  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||  |||  |||||||||||||||||      
T  6503 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaattctaaggaatactcatgtctcca- 6405  T
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||   |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  6404 atctgcaacgttgacgacgcctaacccattgtcattgatcgaatctgcacttgtgcaaagttaatctttcaacctagatcaaataaacaccgtactaaga 6305  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
    ||| ||||    
T  6304 cggaaaat 6297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 279
Target Start/End: Original strand, 11896 - 12086
Alignment:
Q  89 aaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgac 188  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  11896 aaattgatagagtacatcgatgtaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacatgctcacatcatccatgttaatagcataaaatgac 11995  T
Q  189 aaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||   ||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11996 aaagtacaaatgcctacgcatgtgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattg 12086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0722 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0722
Description:

Target: scaffold0722; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Original strand, 5194 - 5409
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||| |    
T  5194 aaaaataaatgatattcattcattcaaatttatagagtacatcgatataatacaaatttgctaaaaacaaaaagg-tgaatctgtgaacaggctcacaac 5292  T
Q  164 atcca-tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    ||||| | ||||||| |||||||| ||| |||    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  5293 atccattgttaatagcataaaacggcaaggtacaagtgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtgga 5392  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
     ||||||||||||||||    
T  5393 tgacgccaaagtcattg 5409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36969 - 36755
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||    
T  36969 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaatttgttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacaaca 36870  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||    |||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||  | ||| |||||||||||||||| || |    
T  36869 tccatgttaatagcataaaatggcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccctgtatccggatctgcaacgtggatg 36770  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  36769 acgccaaagtcattg 36755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21060 - 20888
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaa------attcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||    
T  21060 aaaaataaacgattttcattcattcaaattgatagagtacatcgatccaatacaattccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctttaaacaaact 20961  T
Q  158 cacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccg 230  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  20960 cacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatccctacaaatataattatactcatgtctccg 20888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 136754 - 136953
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  136754 atattcattcattcaaattgatagtgtacattgatataatgaaaattcgttaaaaacaaaaa-gataaatttgtgaacacactcacaacatccatgttaa 136852  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    ||| |||||||  ||| |||   | || |||  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  136853 tagcataaaacagcaaggtactgaagcttacgcatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctctggatctgcaacgttgacgactccaaagt 136952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 403902 - 404205
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  403902 aaaaataaacgatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctgaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 404001  T
Q  158 cac-------------atcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccggaata 235  Q
    |||             || |||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||         |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  404002 cacagcatccatgttaataatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacttatgcctacaaatatgattaatatgactatatttatgtctccgaaata 404101  T
Q  236 ctcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaa 335  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||      ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  404102 ctcatgtcttcggatctgcaatgttgacaacgtcaaa------gtcattgatcgaatctgcacatgctcaaagct-atctttcaacctgaatcaaataaa 404194  T
Q  336 caccgcactaa 346  Q
    |||| ||||||    
T  404195 caccacactaa 404205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11434 - 11245
Alignment:
Q  87 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacg 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11434 tcaaattgatagagtacatctatataatgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaa-ttgtgaatagactcacagcatccatattaatagcataaaacg 11336  T
Q  187 acaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
     |||||||    |||||||    ||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  11335 gcaaagtacaattgcctac--gcatgactatactcaaatctctggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgtcaaagtcattg 11245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11659
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| |||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||     
T  11455 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgaaaattcgttaaaataaaaaaggatgaatctgttaacaaactcacaacatccatgttag 11554  T
Q  175 tagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagt 274  Q
    |   |||||| |  ||||||   | ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11555 tgacataaaatggtaaagtattaaagcctacacatatgactatatttaagtctccagaatacccatgtttctggatctgcaacgttgacgactccaaaat 11654  T
Q  275 cattg 279  Q
    |||||    
T  11655 cattg 11659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1379 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold1379
Description:

Target: scaffold1379; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 242 - 135
Alignment:
Q  249 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  242 atctgcaaagttgacgactccaaagtcattgtcattgaccagatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacagcactaaga 143  T
Q  349 cgggaaat 356  Q
     |||||||    
T  142 tgggaaat 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1379; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 346
Target Start/End: Original strand, 927 - 1034
Alignment:
Q  233 atactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||      ||||||| || |||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  927 atactcatgtctccggatctgcaacgttgatgacaccaaagtca------ttgatcgaatctgcagtttctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaat 1020  T
Q  333 aaacaccgcactaa 346  Q
    | ||||||||||||    
T  1021 atacaccgcactaa 1034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1379; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 732 - 905
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||      ||||||||||| || ||||||  |||||| |||||    
T  732 aaaaataaacaatattcata-attcaaattgatagaacacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaagaatgatgaaactgtgaacaaact 830  T
Q  158 cacatcatccatat----taatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctc 228  Q
    |||| ||| ||| |    |||||  |||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  831 cacaacatgcatctgtgttaataacataaaacggcaaaatacttatgtctacaaatatgactatattcaagtctc 905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 9997 - 10163
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatc 163  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  9997 aaaaataaatgatattctttcattcaaattagtagagtaactcaatacaatacaaaatcgataaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaac 10096  T
Q  164 atccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccg 230  Q
    |||||| ||||||| ||||||   |||||||   |  |||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  10097 atccatgttaatagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgactatcttcaagtctccg 10163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Original strand, 846 - 939
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaact 157  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  846 aaaaataaatgatattcatttattcaaatttatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaact 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Original strand, 961 - 1024
Alignment:
Q  216 atattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  961 atattcaagtcttcagaatactcatgtctccggatctgcaacatggacgacgctaatgtcattg 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 26841 - 26873
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26841 gatattcattcattaaaattgatagagtacatc 26873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10377 - 10180
Alignment:
Q  81 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtat 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||  || ||||||| ||    
T  10377 attcattcaaattgatagagtatattaatataatataaattcgttataaacaaaaaggatgaatttgtgaataaattcgcaatatttatgttaataggat 10278  T
Q  181 aaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    |||| || || |||   | | ||| ||||||||||||||| | ||| ||  |||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10277 aaaagga-aaggtacacaagtctataaatatgactatattgaagtccccaaaatagttatgcatccggatctgcaacgttgacgacgtcaaaatcattg 10180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1294 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1294
Description:

Target: scaffold1294; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1006
Alignment:
Q  95 atagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||| |||| ||||||| |   || ||||||||   ||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  1190 atagagtacatcgatataatctaaatttgtcaaaaaccaaaaagatgaatctaccaacaaactcacggtatctatgttaatagcataaaacgacaaagta 1091  T
Q  195 actatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
       | ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1090 caaaagcctacacatatgactatattcaagtcatcggaatacccatgtatgcggatatgcaacattgacgacgtcaaagtcattg 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 151
Target Start/End: Original strand, 1600 - 1676
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1600 atattcattcattcaaattgaaagagtacattgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaa 1676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 279
Target Start/End: Original strand, 9425 - 9541
Alignment:
Q  163 catccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 262  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||    
T  9425 catccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaataaccatgtttccggatctgcaacgtgga 9524  T
Q  263 cgacgccaaagtcattg 279  Q
     ||||||||||||||||    
T  9525 tgacgccaaagtcattg 9541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 136
Target Start/End: Original strand, 48019 - 48091
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa 136  Q
    ||||||||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  48019 aaaaataaatgatatttattctttcaaattgatatagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaa 48091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 277
Target Start/End: Original strand, 91161 - 91285
Alignment:
Q  153 aaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||   | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  91161 aaactcacaacattcatgttaatagcattgaacgacaaagtacaaaagcctacatatatgaccatattcaagtgtccggaatactcatgtcaccgaatct 91260  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcat 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  91261 gcaacgtggacaacgccaaagtcat 91285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 136
Target Start/End: Original strand, 91101 - 91162
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  91101 atatttattcattcaaattgatagagtacattaatacaatgcaaattcactaaaaacaaaaa 91162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 245074 - 244867
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||      |||||| |  |||||| ||    
T  245074 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatatagtacaacgatataatgcaaattcattaaaaacaaatagga-----ctgtgaacaggctcacaaca 244980  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacg 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||    |||||||| ||||  ||| ||| |  ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| || |    
T  244979 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatcgcta-att-aaatctccggaataatcatatctccgaatctacaacgtggatg 244882  T
Q  265 acgccaaagtcattg 279  Q
    |||||||||||||||    
T  244881 acgccaaagtcattg 244867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 93989 - 94111
Alignment:
Q  65 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatca 164  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |       |||||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  93989 aaaataaaagatattaattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgtt-------aaaaggataaatttgtgaacagactcacaaca 94081  T
Q  165 tccatattaatagtataaaacgacaaagta 194  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  94082 tccatgttaataacataaaatgacaaagta 94111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21289 - 21207
Alignment:
Q  197 tatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattg 279  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  21289 tatgcttaaaaatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtctccgaatcggcaacgtcgttgacgccaaaatcattg 21207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 333
Target Start/End: Original strand, 15360 - 15618
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcg------ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatcca 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||       |||||||||||||| || ||| ||  || ||| |  || ||||||    
T  15360 atattcatttattcaaattgatagagtacattgacacattatagattcaatgtcactaaaaacaaaaagaataaatatgcaaacaaatttccaacatcca 15459  T
Q  169 tattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgc 268  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||  ||||| || ||||||||||||| ||| | | ||  ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15460 tattaacagcataaaacaacaaaatacatatgcttataaatatgactataatcaagccaccaaaatgcttctgtttccggatctgcaacgttgacgacgc 15559  T
Q  269 caaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaata 333  Q
     ||| ||||||   ||||    || || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15560 aaaactcattg--gttga----atctgtacttgatcaaaactaatatttcaacctgaatcaaata 15618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 348
Target Start/End: Original strand, 22298 - 22579
Alignment:
Q  62 ataaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatac------aaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaa 155  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||      ||| | | |||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  22298 ataaaaatgaacgatattcattcattcaaattaataaagtacatcgatataatacaattttaaagtaggtaaaaacaaaaaggataaatctgcgaacaaa 22397  T
Q  156 ctcacatcatccatattaatagtataaaac-gacaa--agtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatct 252  Q
    |||  | | ||||||||||||||| ||||| ||  |  |||||  ||||||||||        ||||||| | | ||| ||||||||||| || ||||||    
T  22398 ctcgaagcttccatattaatagtaaaaaacagatgatcagtaaacatgcctacaa--------atattcaagccaccgaaatactcatgtttctggatct 22489  T
Q  253 gcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 348  Q
    | |||||||| ||| | |||||| |||  |||||    || |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  22490 gtaacgttgatgacacaaaagtcgttg--attga----atctgcacttgatcaaaactaatcttacaaccagaatcaaatacacactgcactaaga 22579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0580
Description:

Target: scaffold0580; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Original strand, 470 - 613
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa-tacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| || | | || ||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||    
T  470 atattcattcatttaaatttatagggtatatcgatataaattcgaaatcgctaagaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgtta 569  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactat 217  Q
    |||  |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  570 atatcataaaatggtagagtacatatgcctacaaatatgactat 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Original strand, 8209 - 8352
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa-tacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatatta 173  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| || | | || ||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||    
T  8209 atattcattcatttaaatttatagggtatatcgatataaattcgaaatcgctaagaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgtta 8308  T
Q  174 atagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactat 217  Q
    |||  |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  8309 atatcataaaatggtagagtacatatgcctacaaatatgactat 8352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Original strand, 698 - 742
Alignment:
Q  311 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  698 aatcttttaacatgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaa 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Original strand, 8437 - 8481
Alignment:
Q  311 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 355  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8437 aatcttttaacatgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaa 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 356
Target Start/End: Original strand, 201730 - 202012
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat------tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaac 156  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||      ||| | |||  ||||||||||||||||  || |||     
T  201730 taaaaataaatgatatacattcatttaaattgatagagtaaatcaatacaatacaaattcaaagtcgtttaaagtaaaaaggatgaatttgcaaacaaa- 201828  T
Q  157 tcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaa 256  Q
               || ||||||| |||||||  || || |  |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  201829 ----------tatgttaatagcataaaaccgcagagcatttatgtctaaaaatatgacaatattcaaatctctcgaatactcatgtcactggatctgcaa 201918  T
Q  257 cgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
     |||||| |||||||| ||||||  |||||    || | |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  201919 tgttgacaacgccaaaatcattg--attga----attttcacttgttcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacatcatactaagacgggaaat 202012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 69234 - 69162
Alignment:
Q  63 taaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaa 136  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  69234 taaaaataaactatattcat-cattcaaatttataaaatatatcgatacaatataaattcgctaaaaacaaaaa 69162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Original strand, 53205 - 53238
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53205 cgatattcattcattcaaattgatatagtacatc 53238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4094 - 3942
Alignment:
Q  198 atgcctacaaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  | |||||    ||||| || |||||||||||||||      || |||||| |||| ||||    
T  4094 atgcctacaaatatgactatattcaagtcttcgaaatatccttgtctttaaatctgtaatgttgacgacgccaaa------gttattgattggatctgca 4001  T
Q  298 cttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaat 356  Q
    |||| | |||  |||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  4000 cttgatcaaagataatcttttaatttgaatcaaataaacaccacaataagacgagaaat 3942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4186 - 4142
Alignment:
Q  132 aaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaata 176  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4186 aaaaatgatgaatctgcgaataaactcacaacatccatattaata 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0603 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0603
Description:

Target: scaffold0603; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8021 - 7979
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8021 aaaaaaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 7979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30330 - 30284
Alignment:
Q  75 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  30330 atattcattcattcaaattgataaaatacatcgatataatacaaatt 30284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36057 - 35841
Alignment:
Q  124 ctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatagtataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcat 223  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  || ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||  ||||| || ||||| ||||||| ||      
T  36057 ctaaaaacaaaaagaatgaatatgcaaacaaattcacaacatccatgttaataacataaaacaacaaaatacatatgcttataaatacgactataatcta 35958  T
Q  224 gtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacct 323  Q
    | | ||  ||| ||||||| |   ||||||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||    || || ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  35957 gccaccaaaatgctcatgtttttagatctgcaacgttaacgatgcaaaaatcattg--attga----atctgtacttgatcaaaactaatatttcaacct 35864  T
Q  324 gaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  35863 gaatcaaatagacaccacactaa 35841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 11222 - 11279
Alignment:
Q  64 aaaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatt 121  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11222 aaaaataaatgatattaattcatttaaattgatagagtatatcgatacaataaaaatt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 115
Target Start/End: Original strand, 3838 - 3881
Alignment:
Q  73 cgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3838 cgatattcattcattcaaattgatagagttcatctgatacaata 3881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 346
Target Start/End: Original strand, 3626 - 3692
Alignment:
Q  280 tcattgatcggatatgcacttgcttaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 346  Q
    |||||||| | || || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3626 tcattgattgaatctgtacttgatcaaaactaatatttcaacctgaatcaaatagacaccacactaa 3692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1827 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1827
Description:

Target: scaffold1827; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 152
Target Start/End: Original strand, 781 - 821
Alignment:
Q  112 aatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaat 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  781 aatacaaatttgctaaaaacaaaagggatgaatatgtgaat 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Original strand, 1472 - 1504
Alignment:
Q  74 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1472 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc 1504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35251
Alignment:
Q  121 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaactcacatcatccatattaatag 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||    
T  35307 tcgctaaaaataaaaatgatgaatttgtaaacaaactcataacatccaaattaatag 35251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University