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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF14833_low_4 (Length: 553)
Name: NF14833_low_4
Description: NF14833
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14833_low_4 |
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Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 519; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33495511 - 33494973
Alignment:
| Q |
1 |
ttgttttttatgaatgtttttagttatagtttgtctgttgactgagactaaatttgattatgtgcagaaaaggtgcagatgtaagaggatatatggtatg |
100 |
Q |
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| T |
33495511 |
ttgttttttatgaatgtttttagttatagtttgtctgttgactgagactaaatttgattatgtgcagaaaaggtgcagatgtaagaggatatatggtatg |
33495412 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
33495411 |
gtcgttgtttgacaactttgaatggaatagtggatataatgtaagatttggattatattatgtggatagacagacacttgaacgaattcctaaactttca |
33495312 |
T |
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| Q |
201 |
gttgagtggttttctagtttcctcaacaatactagtgatgataccaacatagaagacttgagcaagcaatatagaagcaaatatgtgacaacaactgctg |
300 |
Q |
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| T |
33495311 |
gttgagtggttttctagtttcctcaacaatactagtgatgataccaacatagaagacttgagcaagcaatatagaagcaaatatgtgacagcaactgctg |
33495212 |
T |
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| Q |
301 |
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400 |
Q |
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| T |
33495211 |
ttgtttaagttatttaaaactgatcatataatgaattgtcaatatcttgacaattgttaacaacatgctatttattattatgggaatgttaagtgaattt |
33495112 |
T |
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| Q |
401 |
tactattaaaataggttgactttctttggatatttcccataccatgctattagcacccagctacttgaagctttagtgcatgtttggaatcatgacgggt |
500 |
Q |
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| T |
33495111 |
tactattaaaataggttgactttctttggatatttaccataccatgctattagcacccagctacttgaagctttagtgcatgtttggaatcatgacgggt |
33495012 |
T |
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| Q |
501 |
ttgacaatgttgacgagccaccgtaattttgttaaactt |
539 |
Q |
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| T |
33495011 |
ttgacaatgttgacgagccaccgtaattttgttaaactt |
33494973 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 434
Target Start/End: Original strand, 33520543 - 33520980
Alignment:
| Q |
1 |
ttgttttttatgaatgtttttagttatagtttgtctgttgactgagactaaatttgattatgtgcagaaaaggtgcagatgtaagaggatatatggtatg |
100 |
Q |
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| T |
33520543 |
ttgttttctatgaatgttttcaattatactttgtttgttgacagaggctaaatttgattatgtgcagaaaaggtgccgatgtaagaggatacatggtatg |
33520642 |
T |
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| Q |
101 |
gtcattgtttgacaactttgaatggaatagtggatataatgtaagatttggattatattatgtggatagacagacacttgaacgaattcctaaactttca |
200 |
Q |
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| T |
33520643 |
gtcattgtttgacaactttgaatggaatagtggatatgataaaaaatttggactttattatgtggatagacagacacttgaacggattcctaaactttca |
33520742 |
T |
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| Q |
201 |
gttgagtggttttctagtttcctcaacaatactagtgatgataccaacatagaagacttgagcaagcaatatagaagcaaatatgtgacaacaactgctg |
300 |
Q |
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| T |
33520743 |
gttgagtggttttctagtttcctcaacaatactagtgatgataccaacatagaagacttgagcaagaagtatagaagcaaatatgt---aacaactgctg |
33520839 |
T |
|
| Q |
301 |
ttgtttaag---ttatttaaaactgatcatataattcattgtcaatat--cttgacaattgttaacaacatgctattta--ttattatgggaatgttaag |
393 |
Q |
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| T |
33520840 |
ttgtctaagttattatttgaaaatgatcatgtaattcattctcaatattaattgataattgttaacaacatactatttattttattaagggaagtttatg |
33520939 |
T |
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| Q |
394 |
tgaattttactattaaaataggttgactttctttggatatt |
434 |
Q |
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| T |
33520940 |
tgaatttcactattaacataggttgattctgtttggatatt |
33520980 |
T |
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