View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14836_low_1 (Length: 1294)

Name: NF14836_low_1
Description: NF14836
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14836_low_1
NF14836_low_1
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (13-718)||(36846352-36847061)
chr1 (713-1061)||(2430223-2430571)
chr1 (715-1064)||(46666431-46666781)
chr1 (716-1063)||(20260086-20260434)
chr1 (714-1063)||(9115561-9115911)
chr1 (716-1064)||(14788446-14788795)
chr1 (711-1062)||(1597337-1597689)
chr1 (717-1063)||(25789487-25789834)
chr1 (711-1064)||(52630496-52630850)
chr1 (718-1064)||(32824644-32824992)
chr1 (715-1064)||(12190176-12190526)
chr1 (719-1064)||(36361506-36361851)
chr1 (713-1064)||(8331737-8332089)
chr1 (718-1061)||(9831872-9832216)
chr1 (716-1063)||(39930181-39930529)
chr1 (715-1064)||(6911208-6911566)
chr1 (715-1064)||(2632576-2632925)
chr1 (719-1060)||(51445083-51445424)
chr1 (715-991)||(3572564-3572841)
chr1 (715-1063)||(38964678-38965027)
chr1 (713-1062)||(39329347-39329683)
chr1 (715-1069)||(4683373-4683727)
chr1 (718-1064)||(50190767-50191113)
chr1 (715-1064)||(5518503-5518852)
chr1 (715-1064)||(5806290-5806625)
chr1 (715-1061)||(35187181-35187529)
chr1 (713-1007)||(6978550-6978845)
chr1 (715-1061)||(48916021-48916368)
chr1 (715-1062)||(32202330-32202660)
chr1 (722-1057)||(13653581-13653917)
chr1 (725-1062)||(37436630-37436966)
chr1 (709-1039)||(52699459-52699789)
chr1 (715-1064)||(29091395-29091739)
chr1 (715-1022)||(49822916-49823203)
chr1 (715-921)||(47037324-47037530)
chr1 (893-1069)||(47031577-47031754)
chr1 (769-1064)||(46960351-46960646)
chr1 (714-1039)||(47677392-47677716)
chr1 (716-872)||(1007663-1007819)
chr1 (722-1018)||(30240782-30241075)
chr1 (717-1064)||(24116338-24116683)
chr1 (718-1060)||(38519064-38519405)
chr1 (40-172)||(36839326-36839458)
chr1 (774-1061)||(1227936-1228225)
chr1 (719-1039)||(31806759-31807071)
chr1 (716-1064)||(17475321-17475658)
chr1 (723-901)||(11014448-11014626)
chr1 (936-1064)||(25473978-25474107)
chr1 (717-881)||(13931885-13932048)
chr1 (715-875)||(19083104-19083264)
chr1 (715-875)||(19130992-19131152)
chr1 (842-1039)||(48462280-48462475)
chr1 (714-875)||(13521234-13521394)
chr1 (722-1064)||(9011167-9011511)
chr1 (719-842)||(52186049-52186172)
chr1 (63-140)||(36835508-36835585)
chr1 (752-901)||(13440281-13440431)
chr1 (717-938)||(20504990-20505213)
chr1 (774-1061)||(29769230-29769526)
chr1 (717-872)||(37261764-37261918)
chr1 (987-1060)||(49627301-49627374)
chr1 (893-992)||(1007566-1007665)
chr1 (715-881)||(19094020-19094186)
chr1 (983-1062)||(52186265-52186344)
chr1 (969-1064)||(45771815-45771910)
chr1 (969-1039)||(45813648-45813718)
chr1 (908-1060)||(37261546-37261699)
chr1 (800-1063)||(3939225-3939486)
chr1 (1010-1064)||(37726805-37726859)
chr1 (745-813)||(3939515-3939583)
chr1 (908-1039)||(19923655-19923787)
chr1 (776-831)||(52276877-52276930)
chr1 (792-880)||(11077963-11078051)
chr1 (948-1061)||(13932103-13932218)
chr1 (786-842)||(37336514-37336570)
chr1 (857-948)||(52186170-52186260)
chr1 (711-812)||(16257003-16257104)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (710-1064)||(40907988-40908342)
chr3 (709-1064)||(8476301-8476657)
chr3 (715-1064)||(26848744-26849094)
chr3 (712-1064)||(11239116-11239469)
chr3 (716-1060)||(47114857-47115202)
chr3 (720-1064)||(33217917-33218262)
chr3 (714-1070)||(44952024-44952381)
chr3 (712-1064)||(48339753-48340106)
chr3 (735-1060)||(31611004-31611330)
chr3 (718-1062)||(1098923-1099267)
chr3 (716-1064)||(6231501-6231850)
chr3 (716-1063)||(9320448-9320797)
chr3 (716-1058)||(28124436-28124779)
chr3 (713-1064)||(20297515-20297867)
chr3 (715-1062)||(20414464-20414812)
chr3 (715-1064)||(24574289-24574647)
chr3 (737-1064)||(46359674-46360002)
chr3 (713-1061)||(43132154-43132502)
chr3 (724-1064)||(53165733-53166073)
chr3 (731-1064)||(10822733-10823066)
chr3 (713-1062)||(31435920-31436269)
chr3 (780-1061)||(43718994-43719271)
chr3 (840-1062)||(29512324-29512546)
chr3 (716-1062)||(12228256-12228601)
chr3 (715-1063)||(28770209-28770557)
chr3 (722-1062)||(26849164-26849492)
chr3 (801-992)||(19532939-19533130)
chr3 (726-1039)||(1246912-1247223)
chr3 (718-1063)||(27822994-27823343)
chr3 (908-1064)||(6832114-6832271)
chr3 (718-1061)||(40584336-40584669)
chr3 (719-891)||(12930945-12931115)
chr3 (713-1061)||(24783934-24784279)
chr3 (715-901)||(2565459-2565644)
chr3 (713-887)||(18460839-18461015)
chr3 (714-899)||(33647701-33647886)
chr3 (773-1057)||(38140425-38140710)
chr3 (719-977)||(32071256-32071508)
chr3 (908-1035)||(49216051-49216179)
chr3 (715-877)||(45826687-45826848)
chr3 (705-778)||(43715297-43715370)
chr3 (715-845)||(27093957-27094088)
chr3 (712-1064)||(28693422-28693780)
chr3 (713-840)||(6831954-6832079)
chr3 (774-848)||(29512631-29512705)
chr3 (713-842)||(28139717-28139846)
chr3 (969-1060)||(6927817-6927908)
chr3 (976-1062)||(32070994-32071080)
chr3 (722-822)||(39932529-39932631)
chr3 (714-812)||(55435390-55435488)
chr3 (985-1059)||(55435652-55435726)
chr3 (914-1057)||(18460582-18460725)
chr3 (981-1039)||(27093776-27093834)
chr3 (755-845)||(33497799-33497889)
chr3 (741-782)||(9320405-9320446)
chr3 (981-1058)||(33650280-33650357)
chr3 (987-1059)||(45826064-45826136)
chr3 (986-1061)||(26085442-26085517)
chr3 (715-762)||(29512704-29512751)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (713-1063)||(38363804-38364155)
chr8 (707-1064)||(37392537-37392895)
chr8 (713-1064)||(35818421-35818773)
chr8 (715-1064)||(32660932-32661283)
chr8 (712-1064)||(25837633-25837986)
chr8 (712-1064)||(16313503-16313856)
chr8 (710-1064)||(12710367-12710722)
chr8 (713-1064)||(38132734-38133087)
chr8 (716-1062)||(18297836-18298183)
chr8 (716-1062)||(18726619-18726967)
chr8 (710-1052)||(1554348-1554692)
chr8 (722-1064)||(3049731-3050074)
chr8 (715-1064)||(26061866-26062216)
chr8 (719-1064)||(26601941-26602286)
chr8 (720-1064)||(7930961-7931306)
chr8 (717-1061)||(42755592-42755937)
chr8 (711-1059)||(10896212-10896560)
chr8 (714-992)||(41228712-41228990)
chr8 (712-1061)||(5020486-5020837)
chr8 (713-1021)||(35394156-35394464)
chr8 (715-1007)||(7317156-7317445)
chr8 (717-1062)||(33444627-33444969)
chr8 (718-1025)||(21137134-21137441)
chr8 (720-1063)||(29421493-29421839)
chr8 (722-1064)||(15226688-15227029)
chr8 (1128-1294)||(7935365-7935531)
chr8 (753-1062)||(19160778-19161088)
chr8 (723-1061)||(41432464-41432804)
chr8 (791-1035)||(6805698-6805946)
chr8 (886-1064)||(40197223-40197402)
chr8 (721-1064)||(43871971-43872314)
chr8 (780-1063)||(31117594-31117874)
chr8 (715-1064)||(16218942-16219290)
chr8 (716-872)||(40197076-40197232)
chr8 (913-1064)||(25899381-25899531)
chr8 (711-887)||(14763926-14764101)
chr8 (717-872)||(25899548-25899702)
chr8 (722-872)||(38437369-38437519)
chr8 (784-1062)||(37981857-37982134)
chr8 (715-832)||(34672289-34672406)
chr8 (913-1064)||(33533589-33533741)
chr8 (1089-1130)||(7935567-7935608)
chr8 (718-757)||(8635664-8635703)
chr8 (948-1064)||(34672083-34672201)
chr8 (1005-1064)||(35394080-35394139)
chr8 (785-1062)||(12649859-12650137)
chr8 (913-1061)||(38437203-38437351)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (715-1064)||(346344-346694)
chr2 (715-1064)||(6171513-6171863)
chr2 (699-1064)||(37533675-37534040)
chr2 (712-1064)||(42674657-42675010)
chr2 (715-1064)||(11071327-11071677)
chr2 (705-1064)||(4559281-4559641)
chr2 (715-1064)||(14777497-14777847)
chr2 (718-1064)||(2050588-2050935)
chr2 (712-1062)||(17965707-17966058)
chr2 (714-1064)||(41729128-41729479)
chr2 (716-1059)||(9733846-9734190)
chr2 (713-1060)||(21737397-21737753)
chr2 (715-1063)||(5770109-5770458)
chr2 (718-1064)||(37192244-37192591)
chr2 (715-1027)||(2521434-2521747)
chr2 (720-1061)||(28311701-28312042)
chr2 (717-1039)||(41750276-41750599)
chr2 (720-1061)||(37233155-37233496)
chr2 (713-1064)||(40950856-40951208)
chr2 (720-1062)||(638318-638660)
chr2 (710-1039)||(34356694-34357022)
chr2 (721-1060)||(26309993-26310335)
chr2 (714-1063)||(20426481-20426830)
chr2 (715-1011)||(39995130-39995435)
chr2 (715-1056)||(45408981-45409322)
chr2 (715-1056)||(27357962-27358303)
chr2 (719-1064)||(18713660-18714005)
chr2 (785-1064)||(23943885-23944165)
chr2 (816-1061)||(13760692-13760938)
chr2 (722-1061)||(3902182-3902521)
chr2 (713-1060)||(45693915-45694262)
chr2 (720-1061)||(14832536-14832877)
chr2 (716-1025)||(1988073-1988382)
chr2 (710-1064)||(40569740-40570097)
chr2 (715-1062)||(39819414-39819768)
chr2 (715-872)||(6571602-6571759)
chr2 (713-1064)||(7007307-7007647)
chr2 (713-1062)||(5002834-5003182)
chr2 (718-923)||(11763374-11763577)
chr2 (714-1039)||(4875523-4875848)
chr2 (731-897)||(14253412-14253578)
chr2 (910-1052)||(11763594-11763737)
chr2 (715-872)||(25454939-25455096)
chr2 (781-1039)||(41297983-41298238)
chr2 (908-1060)||(3254284-3254437)
chr2 (780-1056)||(13539399-13539675)
chr2 (855-1058)||(13790018-13790222)
chr2 (716-887)||(25724925-25725097)
chr2 (715-964)||(1623206-1623454)
chr2 (716-889)||(8868664-8868834)
chr2 (718-829)||(24499400-24499509)
chr2 (715-832)||(14403232-14403349)
chr2 (949-1060)||(1623078-1623188)
chr2 (755-1023)||(4684945-4685211)
chr2 (719-791)||(13760941-13761013)
chr2 (715-900)||(37851744-37851930)
chr2 (795-897)||(3254142-3254245)
chr2 (987-1058)||(14253254-14253325)
chr2 (755-881)||(25625290-25625418)
chr2 (1003-1056)||(2521381-2521434)
chr2 (713-812)||(1723225-1723324)
chr2 (787-897)||(516463-516572)
chr2 (1004-1057)||(36590862-36590915)
chr2 (983-1056)||(45212662-45212735)
chr2 (928-1000)||(14253340-14253413)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (712-1064)||(201648-202000)
scaffold0006 (722-1057)||(143342-143678)
scaffold0006 (752-1039)||(119070-119355)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (710-1064)||(4765554-4765909)
chr5 (713-1064)||(22935909-22936261)
chr5 (714-1060)||(19065503-19065850)
chr5 (715-1064)||(29543014-29543364)
chr5 (715-1074)||(18411921-18412281)
chr5 (713-1071)||(28602271-28602629)
chr5 (737-1060)||(8646412-8646735)
chr5 (719-1061)||(11855658-11856001)
chr5 (715-1064)||(12970529-12970879)
chr5 (715-1062)||(555705-556053)
chr5 (715-1064)||(14206820-14207170)
chr5 (720-1064)||(6091437-6091782)
chr5 (722-1064)||(8406616-8406959)
chr5 (715-1061)||(27481082-27481429)
chr5 (718-1064)||(32535659-32536006)
chr5 (716-1006)||(36703654-36703945)
chr5 (712-1061)||(42012175-42012530)
chr5 (727-1062)||(27480735-27481069)
chr5 (718-1004)||(20962373-20962659)
chr5 (763-1061)||(1664456-1664754)
chr5 (717-1064)||(6930364-6930714)
chr5 (716-1064)||(43346895-43347243)
chr5 (912-1062)||(36703506-36703657)
chr5 (745-1064)||(17251536-17251854)
chr5 (718-1064)||(26637045-26637370)
chr5 (755-1060)||(31583102-31583404)
chr5 (722-1039)||(35348534-35348849)
chr5 (713-891)||(40275751-40275930)
chr5 (720-900)||(41783624-41783805)
chr5 (723-872)||(30899470-30899618)
chr5 (717-888)||(19089718-19089889)
chr5 (983-1064)||(28429450-28429531)
chr5 (986-1058)||(16720957-16721029)
chr5 (715-861)||(16720212-16720356)
chr5 (717-877)||(15200547-15200704)
chr5 (755-824)||(28429664-28429733)
chr5 (908-1064)||(35602968-35603122)
chr5 (717-845)||(3913201-3913327)
chr5 (998-1062)||(40276524-40276587)
chr5 (780-875)||(28023745-28023840)
chr5 (990-1060)||(20962286-20962356)
chr5 (987-1060)||(36978405-36978478)
chr5 (717-828)||(35602824-35602935)
chr5 (755-814)||(36978210-36978269)
chr5 (925-1060)||(30899327-30899463)
chr5 (985-1039)||(27901706-27901760)
chr5 (754-811)||(830058-830115)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (714-1063)||(35488187-35488537)
chr7 (708-1060)||(45045352-45045705)
chr7 (713-1064)||(11329715-11330067)
chr7 (713-1060)||(27248019-27248367)
chr7 (717-1064)||(45265049-45265397)
chr7 (712-1064)||(33378556-33378917)
chr7 (715-1063)||(27213854-27214203)
chr7 (716-1059)||(38543920-38544265)
chr7 (717-1064)||(43948967-43949315)
chr7 (719-1064)||(48341086-48341430)
chr7 (716-1064)||(44565767-44566116)
chr7 (715-1026)||(8419588-8419900)
chr7 (715-1062)||(27419223-27419571)
chr7 (717-1062)||(34930466-34930814)
chr7 (715-1039)||(39553929-39554255)
chr7 (713-1064)||(9946987-9947340)
chr7 (720-1063)||(45448665-45449009)
chr7 (713-1064)||(48313844-48314196)
chr7 (716-1018)||(40212657-40212960)
chr7 (715-1064)||(25924636-25924986)
chr7 (712-1036)||(9814214-9814535)
chr7 (713-1064)||(28904183-28904535)
chr7 (715-1058)||(25097796-25098141)
chr7 (720-1064)||(38396370-38396714)
chr7 (712-1064)||(41632360-41632708)
chr7 (714-1063)||(48160589-48160921)
chr7 (718-1059)||(44819981-44820323)
chr7 (709-948)||(16825347-16825586)
chr7 (717-1060)||(30685993-30686336)
chr7 (718-1060)||(37534105-37534447)
chr7 (715-1058)||(18823890-18824218)
chr7 (719-1063)||(6656476-6656819)
chr7 (709-938)||(25045611-25045838)
chr7 (766-1064)||(45722881-45723170)
chr7 (713-938)||(11000552-11000777)
chr7 (714-972)||(41684020-41684278)
chr7 (716-1061)||(45440637-45440979)
chr7 (800-1064)||(31921811-31922075)
chr7 (718-948)||(6656226-6656454)
chr7 (781-1062)||(40385692-40385974)
chr7 (785-1057)||(22156248-22156520)
chr7 (785-1057)||(22212163-22212435)
chr7 (715-1064)||(5543131-5543479)
chr7 (723-1063)||(43445890-43446229)
chr7 (911-1064)||(17276353-17276508)
chr7 (773-1024)||(38528764-38529012)
chr7 (711-783)||(45723211-45723283)
chr7 (913-1060)||(31598449-31598597)
chr7 (804-967)||(43569773-43569936)
chr7 (755-845)||(10902689-10902779)
chr7 (716-1018)||(47246064-47246366)
chr7 (722-842)||(31598623-31598742)
chr7 (1012-1064)||(16916182-16916234)
chr7 (1002-1057)||(30870944-30870999)
chr7 (754-845)||(30871130-30871221)
chr7 (715-782)||(31921747-31921813)
chr7 (864-1014)||(10902820-10902971)
chr7 (713-791)||(19156613-19156691)
chr7 (753-811)||(20601297-20601355)
chr7 (713-791)||(20756012-20756090)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (716-1064)||(13229989-13230338)
chr4 (716-1062)||(27762899-27763246)
chr4 (714-1064)||(55967998-55968349)
chr4 (715-1064)||(35999412-35999762)
chr4 (711-1064)||(45595994-45596348)
chr4 (716-1057)||(48518891-48519233)
chr4 (715-1064)||(48879051-48879401)
chr4 (712-1064)||(39730289-39730642)
chr4 (714-1064)||(45747794-45748144)
chr4 (713-1073)||(42773665-42774026)
chr4 (715-1062)||(40435628-40435976)
chr4 (715-1064)||(6279920-6280270)
chr4 (712-1064)||(25932167-25932520)
chr4 (712-1064)||(41859043-41859395)
chr4 (712-1064)||(43722990-43723343)
chr4 (715-1064)||(23686513-23686863)
chr4 (713-1064)||(935852-936204)
chr4 (713-1064)||(18405231-18405582)
chr4 (716-1022)||(34049597-34049904)
chr4 (711-1064)||(27555153-27555490)
chr4 (717-1064)||(47670088-47670436)
chr4 (715-1064)||(39835306-39835656)
chr4 (715-1056)||(50672907-50673245)
chr4 (718-1062)||(41744222-41744568)
chr4 (713-1061)||(18931482-18931831)
chr4 (716-1064)||(32953249-32953598)
chr4 (728-1064)||(8321971-8322308)
chr4 (720-1062)||(27942465-27942814)
chr4 (713-1025)||(39498590-39498903)
chr4 (713-1025)||(39501929-39502242)
chr4 (715-977)||(25916034-25916295)
chr4 (769-1056)||(34238007-34238295)
chr4 (834-1064)||(48873747-48873978)
chr4 (717-1063)||(31937870-31938217)
chr4 (712-1063)||(7258691-7259041)
chr4 (715-1064)||(51968505-51968853)
chr4 (715-948)||(30415746-30415978)
chr4 (755-1039)||(52469448-52469734)
chr4 (717-966)||(38414032-38414278)
chr4 (745-1001)||(47426269-47426520)
chr4 (713-973)||(36858375-36858634)
chr4 (721-872)||(10400810-10400961)
chr4 (846-1039)||(36858159-36858351)
chr4 (754-1063)||(38394634-38394943)
chr4 (716-948)||(18405597-18405828)
chr4 (782-1056)||(37014451-37014724)
chr4 (951-1071)||(38413895-38414015)
chr4 (758-880)||(12275953-12276075)
chr4 (815-1063)||(30790275-30790518)
chr4 (754-875)||(22654515-22654638)
chr4 (781-1039)||(48059806-48060065)
chr4 (711-829)||(26165326-26165444)
chr4 (722-1043)||(44309508-44309829)
chr4 (720-776)||(34237424-34237480)
chr4 (969-1064)||(18405129-18405223)
chr4 (908-1061)||(10400973-10401126)
chr4 (956-1058)||(52413959-52414061)
chr4 (719-1021)||(24805088-24805397)
chr4 (986-1063)||(36860027-36860104)
chr4 (715-900)||(18094139-18094325)
chr4 (713-812)||(9327242-9327342)
chr4 (713-812)||(9374001-9374101)
chr4 (979-1026)||(37296473-37296520)
chr4 (1005-1064)||(25916302-25916362)
chr4 (815-972)||(32384492-32384650)
chr4 (983-1064)||(12276178-12276259)
chr4 (915-1039)||(14796314-14796439)
chr4 (781-841)||(54478495-54478555)
chr4 (716-807)||(37296662-37296753)
chr4 (956-1027)||(54478366-54478437)
chr4 (731-812)||(9382297-9382379)
chr4 (1027-1064)||(26165110-26165147)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (715-1064)||(2657422-2657772)
chr6 (715-1064)||(7053569-7053927)
chr6 (716-1064)||(1316741-1317089)
chr6 (713-1061)||(14170740-14171087)
chr6 (719-1064)||(18897643-18897989)
chr6 (723-1062)||(16968649-16968989)
chr6 (793-1064)||(8029025-8029297)
chr6 (715-948)||(7344082-7344315)
chr6 (859-1064)||(10246259-10246465)
chr6 (712-1064)||(6705761-6706101)
chr6 (719-1013)||(345833-346130)
chr6 (717-891)||(10849784-10849959)
chr6 (722-1061)||(14781626-14781955)
chr6 (715-804)||(8029316-8029405)
chr6 (727-901)||(21008035-21008208)
chr6 (948-1039)||(7344727-7344818)
chr6 (948-1058)||(21008212-21008322)
chr6 (713-826)||(8314874-8314987)
chr6 (711-843)||(9760365-9760497)
chr6 (974-1062)||(9762299-9762387)
chr6 (715-902)||(3869391-3869577)
chr6 (1002-1062)||(11570071-11570131)
chr6 (716-752)||(10246222-10246258)
chr6 (809-1039)||(8314641-8314873)
chr6 (986-1064)||(12328065-12328142)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (721-1039)||(28957-29276)
[»] scaffold0662 (1 HSPs)
scaffold0662 (713-1064)||(4188-4542)
[»] scaffold0702 (1 HSPs)
scaffold0702 (713-1064)||(3562-3914)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (717-938)||(23297-23517)
[»] scaffold1480 (1 HSPs)
scaffold1480 (715-887)||(384-556)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (715-887)||(21789-21961)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (915-1039)||(43292-43417)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 625; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 36847061 - 36846352
Alignment:
Q  13 atgaataagtttgtattacctcgtcggcggccataccaggcataggccattggacttgtaagcaggctgtgggaaacgacaagtagaagaaggtagagac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36847061 atgaataagtttgtattacctcgtcggcggccataccaggcataggccattggacttgtaagcaggctgtgggaaacgacaagtagaagaaggtagagac 36846962  T
Q  113 caagaccatg----tttgaaagaggacatggttaaattagtgaataaaatgcaattatctgcaaaataagtaaataaaagaagttattcattagtcagtg 208  Q
    ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36846961 caagaccatgcatgtttgaaagaggacatggttaaattagtgaataaaatgcaattatctgcaaaataagtaaataaaagaagttattcattggtcagtg 36846862  T
Q  209 tgttagcaaagcaagaggaatatcgaatacatggtgctcatgttatattatcaagcactctcttaacaagtttagcctaaggcctcaaaatcaaaagtct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36846861 tgttagcaaagcaagaggaatatcgaatacatggtgctcatgttatattatcaagtactctcttaacaagtttagcctaaggcctcaaaatcaaaagtct 36846762  T
Q  309 tggagagacacacgacactgtatgtataaannnnnnnagattaaaactttcatcacttattgcataaaaatcatattttccacatgaatacattgaagtt 408  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36846761 tggagacacacacgacactgcatgtataaatttttttagattaaaactttcatcacttattgcataaaaatcatattttccacatgaatacattgaagtt 36846662  T
Q  409 caactttcggtatttagacatgagaaaattcacatatcgctcaaatatgaacatcaaaaccaagctttcctttagaacaacaaaaactcctttaattcat 508  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36846661 caactttcgatatttagacatgagaaagttcacatatcgctcatatatgaacatcaaaaccaagctttcctttagaacaacaaaaactcctttaattcat 36846562  T
Q  509 ctaatttagaaccttttcttaccttaagcg-tttttcttcctagcacggaaactctacgatctcacgaagtgcttgcaagagaaaaaagagttagtgctt 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36846561 ctaatttagaaccttttcttaccttaagcgttttttcttcctagcacggaaactctacgatctcacgaagtgcttgcaagagaaaaaagagttagtgctt 36846462  T
Q  608 taggccacacggtgaaaaattgaaggaagagaatggactcaaaaaatctgatgaatatatgtgcgtgagagtaaggggaaaagagggatggtcttattta 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36846461 taggccacacggtgaaaaattgaaggaaaagaatggactcaaaaaatctgatgaatatatgtgcgtgagagtaaggggaaaagagggatggtcttattta 36846362  T
Q  708 taatcttaggg 718  Q
    | |||||||||    
T  36846361 t-atcttaggg 36846352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 713 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 2430571 - 2430223
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2430571 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 2430472  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2430471 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttact 2430372  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2430371 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 2430272  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2430271 aggaacgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 2430223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 46666781 - 46666431
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46666781 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 46666682  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  46666681 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 46666582  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46666581 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaa 46666482  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  46666481 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 46666431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 716 - 1063
Target Start/End: Original strand, 20260086 - 20260434
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260086 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 20260185  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20260186 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 20260285  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260286 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaagcaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaag 20260385  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20260386 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 20260434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 714 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 9115911 - 9115561
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9115911 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcc 9115812  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9115811 ttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 9115712  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9115711 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcca 9115612  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9115611 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 9115561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 716 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 14788795 - 14788446
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14788795 gggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaataataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattatattcccg 14788696  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14788695 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 14788596  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788595 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttgcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatattccaag 14788496  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  14788495 gaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccct 14788446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 711 - 1062
Target Start/End: Original strand, 1597337 - 1597689
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597337 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 1597436  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttta 910  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1597437 tcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaatttttccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagttta 1597536  T
Q  911 cttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 1009  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597537 cctattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 1597636  T
Q  1010 ccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  1597637 tcaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 1597689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 717 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 25789834 - 25789487
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  25789834 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttg 25789735  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25789734 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt 25789635  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25789634 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaagg 25789535  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||  |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  25789534 aatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 25789487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 711 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 52630850 - 52630496
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52630850 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttat 52630751  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttta 910  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  52630750 tctcgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagttta 52630651  T
Q  911 cttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 1009  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52630650 cctattataattcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatatt 52630551  T
Q  1010 ccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  52630550 ccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 52630496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 718 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 32824992 - 32824644
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32824992 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccggaaataaaataataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccggg 32824893  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32824892 tataaattgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctatt 32824793  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32824792 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 32824693  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32824692 aatgttattcctaggaataaatttcgtaaatttgaaacaaacacaccct 32824644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 12190176 - 12190526
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12190176 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattttcgggaataaaatgataggaatgtacatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 12190275  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  12190276 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagttttccta 12190375  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12190376 ttataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 12190475  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  12190476 ggaatgttattcttaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 12190526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 719 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 36361851 - 36361506
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36361851 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggt 36361752  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36361751 ataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg-gggaataaagttcccatggagatgagagtaaattcataaatagtttacctattat 36361653  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36361652 aatccctatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatttttatattccaaggaa 36361553  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  36361552 tgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 36361506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 8332089 - 8331737
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8332089 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttgcaagtttactaaattttattc 8331990  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  8331989 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaaatttcaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 8331890  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331889 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattcc 8331790  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  8331789 aaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 8331737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 718 - 1061
Target Start/End: Original strand, 9831872 - 9832216
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  9831872 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttgg 9831971  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9831972 tataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta 9832071  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9832072 taatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccgagga 9832171  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  9832172 atgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 9832216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 716 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 39930529 - 39930181
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  39930529 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctt 39930430  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39930429 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 39930330  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39930329 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaa 39930230  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39930229 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 39930181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 6911566 - 6911208
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6911566 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgataagaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 6911467  T
Q  815 gggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 906  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6911466 gggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatag 6911367  T
Q  907 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 1005  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6911366 tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattaaaaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatcttta 6911267  T
Q  1006 tattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  6911266 tattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 6911208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 2632925 - 2632576
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2632925 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaataataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 2632826  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2632825 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggt-ggaataaagttcccatggagatgtgaataaattcataaatagtttaccta 2632727  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2632726 ttataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattcgctggaataaaattcccatatttatattctaa 2632627  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  2632626 ggaatgttattcctagaaataaatttagtaaacttgaaacaaatacaccct 2632576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 719 - 1060
Target Start/End: Original strand, 51445083 - 51445424
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |    
T  51445083 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatataaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcttag-t 51445181  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  51445182 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattat 51445281  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51445282 aatccctatttttatggttcctaggaatattataaaggtaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctatatattccaaggaa 51445381  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  51445382 tgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 51445424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 715 - 991
Target Start/End: Original strand, 3572564 - 3572841
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3572564 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 3572663  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  3572664 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 3572763  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa 991  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3572764 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataa 3572841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 715 - 1063
Target Start/End: Original strand, 38964678 - 38965027
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  38964678 agggggtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcttatgtttgttacaagtttacaaaaatttattcct 38964777  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  38964778 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagagaaagggtgggaataaagttcccatggagattggaataaattcataaataatttaccta 38964877  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964878 ttataatccctatttttatggttattaggaatattataaagctatccaaagatatatttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 38964977  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  38964978 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccc 38965027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 713 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 39329683 - 39329347
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39329683 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 39329584  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39329583 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 39329484  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||              || ||||||    
T  39329483 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaa--------------ttttattcc 39329398  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  39329397 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 39329347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 715 - 1069
Target Start/End: Original strand, 4683373 - 4683727
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4683373 agggtgtctttgtttcaatttataattgttgattcccagaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttactaaattttattccc 4683472  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4683473 ggatataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaaggg-gggaataaagttcccatggagatgtgaataaattcataaatagtttaccta 4683571  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4683572 ttataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 4683671  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccctgagta 1069  Q
      |||||||||| ||  |||||||||  || | ||||||||| |||| ||| ||||    
T  4683672 aaaatgttattcttagaaataaatttgataaacttgaaacaatcacatcctaagta 4683727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 718 - 1064
Target Start/End: Original strand, 50190767 - 50191113
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50190767 gtgtgtttgtttcaagatataattgttaatttccggaaataaaatgctaggaatgtatatgcctacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 50190866  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  50190867 tataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaaggtgggaataaagttcccatgaagat-ggaataaattcataaatagtttacctatta 50190965  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50190966 taatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaatcaaacatatttttcctaaattcctcgaaataaaattctcatctttatattctaagga 50191065  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  50191066 atgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 50191113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 5518503 - 5518852
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5518503 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccaggaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 5518602  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||| ||    
T  5518603 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaggaaaaaggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatttatatatag-ttaccta 5518701  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaat-atataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5518702 ttataatccctatttttatggttcctaggaatgttataaagttaaccgaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaa 5518801  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| | || ||||||||| |||||    
T  5518802 ggaatgttattccaatgaataaatttggtaaacttcaaacaaacagaccct 5518852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 5806290 - 5806625
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  5806290 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcct----ttgttacaagtttactaaaatttattcct 5806385  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  5806386 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattttccaag-----------gaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatagtttaccta 5806474  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5806475 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 5806574  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  5806575 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 5806625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 715 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 35187529 - 35187181
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35187529 agggtgtgtttttttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 35187430  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||    
T  35187429 tggtataaaatgttcgtgggaatagaaaaaatttcccaaggagaagggtgggaataaagttcccatggagataagaataagttcataaatagtttaccta 35187330  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35187329 ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaaactaaccaaacatatatttcctaaattctttagaataaaatttccatctttatatttcaa 35187230  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtaca-tttgaaacaaacacac 1061  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  35187229 gaaatattattcctaagaataaatttggtaaactttgaaacaaacacac 35187181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 713 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 6978845 - 6978550
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6978845 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 6978746  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |   |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  6978745 cttcgtataaaatgtttcagggaatagaaaaaatttctcaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 6978646  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 1007  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6978645 tattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttata 6978550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 715 - 1061
Target Start/End: Original strand, 48916021 - 48916368
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  48916021 agggtgtgtttatttcaagttatatttgttgattccagagaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattttc 48916120  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || | ||    
T  48916121 gggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaagataaggatgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcatatgtag-ttgccta 48916219  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata-attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  48916220 ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatattcta 48916319  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  48916320 aggaatgttattcctaagaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 48916368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 715 - 1062
Target Start/End: Original strand, 32202330 - 32202660
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||                  ||||||| |||| |||     
T  32202330 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgatagaaatgtatatgc------------------tactaaaatttaatcct 32202411  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32202412 tggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 32202511  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32202512 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttatattccaa 32202611  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  32202612 ggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 32202660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 722 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 13653917 - 13653581
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13653917 gtttgtttcaagttaaatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatata 13653818  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  13653817 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataat 13653719  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaat-aaaattcccatctttatattccaaggaatg 1019  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13653718 ccctaattttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatg 13653619  T
Q  1020 ttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  13653618 ttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 13653581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 725 - 1062
Target Start/End: Original strand, 37436630 - 37436966
Alignment:
Q  725 tgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaa 824  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  37436630 tgtttcatgttatatttgttgattcacgagaataaaatgataggaatgtatatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattttcggatataaaa 37436729  T
Q  825 tgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccc 924  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||||||     
T  37436730 tgttactgagaatag-aaaattttcccaaagaaaagggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag-ttatctattataatcct 37436827  T
Q  925 tatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat 1023  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37436828 tatttttatggttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaacaccttgaaataaaatttccatatttatattccaaggaatgttat 37436927  T
Q  1024 tcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    || ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  37436928 tcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 37436966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 709 - 1039
Target Start/End: Original strand, 52699459 - 52699789
Alignment:
Q  709 aatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt 808  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52699459 aatcttagggtgcgtttgtttcaagttatattcgtagattcctgggaataaaatgataggaatacacatgcctatgtttgttacaagtttactgaatttt 52699558  T
Q  809 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtt 908  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||    
T  52699559 attcccgggtataaaacgttcctgggaatagaacatttttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcatgagtaatt 52699658  T
Q  909 tacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 1007  Q
    | | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  52699659 t-cctattataattcctattttcatggttcccaggaatattataatgttaagcaaacttattttttctaaataccttggaataaaattctcatctttata 52699757  T
Q  1008 ttccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52699758 ttccaaggaatgttattcctaggaataaattt 52699789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 29091739 - 29091395
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29091739 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgataataaaatgataaaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 29091640  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     ||| ||||| | | |||| |||| ||    
T  29091639 gagtaaaaaatgttcatcggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaaaggtgggaataaagttcccatgga-----gaataaatttacacatag-ttaccta 29091546  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29091545 ttataaaccctatttttatggttcctagtaatattataaagttaaccaaacatattttttataaataccttggaataaaattcccatctttatattttaa 29091446  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  29091445 ggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 29091395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 715 - 1022
Target Start/End: Original strand, 49822916 - 49823203
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  49822916 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt------ 49823009  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
                   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| ||    
T  49823010 ---------------ctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgataataaattcataaataatttaccta 49823094  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49823095 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaacctaaccaaacatattttttctaaattccatggaataaaattcccatctttatattccaa 49823194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 715 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 47037530 - 47037324
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  47037530 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 47037431  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  47037430 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 47037331  T
Q  915 ttataat 921  Q
    |||||||    
T  47037330 ttataat 47037324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 893 - 1069
Target Start/End: Complemental strand, 47031754 - 47031577
Alignment:
Q  893 aaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa 991  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47031754 aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataa 47031655  T
Q  992 aattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccctgagta 1069  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  47031654 aattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaagta 47031577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 769 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 46960646 - 46960351
Alignment:
Q  769 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaa 868  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  46960646 aatgcatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttcccaatgaaaagggtgggaa 46960547  T
Q  869 taaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacat- 966  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||  |   ||  |||| |||||||| | ||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||     
T  46960546 taaagttcccatgaagatgaaataaaatt-gtgtgta-attacctattataaactctatttttaaggttcattggaatattataatgttaaccaaacatc 46960449  T
Q  967 aattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
      |||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  46960448 tttttttctaaatatcttggaataaatttctcatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttgataaatttgaaacaaacacaccct 46960351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 714 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 47677716 - 47677392
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||  |||  |||||  | ||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  47677716 tagggtgtgtttgtttcccgttatatttgtggattcc-gggaataaaatcataaaaatacatatgtttgtgtttgttataaatttactaaattttatttc 47677618  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||   ||  |||| |    
T  47677617 cgggtataaaatgttccattgaatagaaaagttttcccaaaggaaaggatgggaataaagttcccatgaagatgggaataaaattatgtgta-attacat 47677519  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||| |||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47677518 attataatccctatttttaaggttccttagaatattacaaagttaaccaaacatattttttttaaatatcttggaataaaattctcatctttatattcca 47677419  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||    
T  47677418 agaaattttattcctaagaataaattt 47677392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 716 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 1007819 - 1007663
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1007819 gggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgagaataaaatgatatgaatatatatgtctaggtttgttacaagtttactaaattttattcccg 1007720  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1007719 gatataaaatgttcctgggaatagaaaaattttaccaagaaaaagggtgagaataaa 1007663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 722 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 30241075 - 30240782
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  30241075 gtttgtttcaagttatatttgttgatttttggtaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc-ggaata 30240977  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    ||| |||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||  ||  |||| |||||||||    
T  30240976 aaaagttattgggaatagaaaaaaattcccaaagaaaagagtgagaataaagttctcatgaagatgagaataaatttatatgta-attacctattataat 30240878  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  | || |  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  30240877 ccctacttttatggttcttaggaatattataaagttaaccaaacatattttt--ttaaatatttggaataaaatttccatttttatatttcaaggaat 30240782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 717 - 1064
Target Start/End: Original strand, 24116338 - 24116683
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||| ||||| |||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24116338 ggtgtgtttgtttcaggttatatttgtagattcctgagaataaaacgatagaaat--atatgtttatgtttgtcacaagtttactaaattttattcccgg 24116435  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||| | |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||   ||  |||| ||||    
T  24116436 gtataaaacgttcctgtaaataaaaaagaattcccaaagaaaagggagggaataaagctcccatgaagatgagaatatatttatgtgta-attacctatt 24116534  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |  |||| | ||| | ||| |||||||  |||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24116535 ataattcctatttttatggtttccaaaaatattttaatgttaagcaaacatcttttttctatataccttgaaataaaattctcatctttatattctaagg 24116634  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || | || |||||||||||||||    
T  24116635 aatgttattcttaagaataaatttgttaaacttaaaacaaacacaccct 24116683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 718 - 1060
Target Start/End: Original strand, 38519064 - 38519405
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||   |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38519064 gtgtgtttgtttcaagttatatttgtagatttttggaaataaatcaatagaaatacagatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccagg 38519163  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||  |||  |||| ||||    
T  38519164 tataaaatgtttttggga--agaaaaattttcccaaagaaaaggtttgggaataaagttcccat-gaaattaggaaaaattcatgtataaattacctatt 38519260  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| | ||| |||||||  |||| |||||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||||||      
T  38519261 ataatccctatttttatggtttccaagaatattataatgttaaacaaacatcttttttctaaatacattggaataaaattttcatttttatgttccaaaa 38519360  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38519361 aatgttattcctacgaataaatttggtaaatttgaaacaaacaca 38519405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36839458 - 36839326
Alignment:
Q  40 cggccataccaggcataggccattggacttgtaagcaggctgtgggaaacgacaagtagaagaaggtagagaccaagaccatgtttgaaagaggacatgg 139  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36839458 cggccaaaccaggcataggcaactggacttgtaagcaggctgtgggaaaagacaagtagaagaaggtagagaccaagaccatgtttgaaggatgacatgg 36839359  T
Q  140 ttaaattagtgaataaaatgcaattatctgcaa 172  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36839358 ttgaattagtgaatagaatgcaattatctgcaa 36839326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 774 - 1061
Target Start/End: Original strand, 1227936 - 1228225
Alignment:
Q  774 atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaag 873  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||    
T  1227936 atatgcctatgcttgttacaagtttattaaattttattttcaggtataaaatgtttcttggaatagaaaagatttccgaaagaaaaggtcgggaataaag 1228035  T
Q  874 ttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataatttt 972  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| | ||  | | || || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  1228036 ttcccatgaagattagaataaaattatgtagaatt-acctattataatccctatttttaaggttccttgaaatattataaagttcaccaaacatattttt 1228134  T
Q  973 c--ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
       |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  1228135 tttctaaattctttggaataaaattctcatctttatattccaaggaaggttattcatagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacac 1228225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 719 - 1039
Target Start/End: Original strand, 31806759 - 31807071
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||       
T  31806759 tgtgtttgtttcaagttatatttgtagattcctgagaataaaatgatagaaatatacatgcttatgtttgttac--gtttactaaattttattctcgaac 31806856  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||  |||  ||||||    
T  31806857 ataaaacgttcctgggaatagaaaaaaattcccaaataaaagggtggaaataaagttcccatgaagatgagaacaaattcatgtgta-attatctattat 31806955  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    |      ||||||||||||||    |||| ||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||    
T  31806956 a------atttttatggttcccgcaaatattataatgttaagcaaacatattttttctaaataccttagaataaaattttcatctttatgttccaagaaa 31807049  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    | |||||| ||  |||||||||    
T  31807050 tattattcttagaaataaattt 31807071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 716 - 1064
Target Start/End: Original strand, 17475321 - 17475658
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |  | | ||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17475321 gggtatgtttgttacaagttatattcataggttcccgaaaataaaacgatagaaatatatatgtttatgtttgttataagtttactaaattttattcccg 17475420  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||  |||||     || || ||         
T  17475421 ggtataaaatgttcctgggaataaataaaatttcccaaagaaaagagtgggaataaagttccaatagagatgggagtaaatt-----attgtgta----- 17475510  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacat-aattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
       ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||| |||||||   |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||     
T  17475511 ---aatacctatttttatagttcccgggaatatcataatgttaagcaaacatctttttttctaaataccttggaataaaatttccatttttattttccat 17475607  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     ||||||||||| || ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  17475608 agaatgttattcttaggaataaatttgataaacttgaaacgaacacaccct 17475658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 723 - 901
Target Start/End: Original strand, 11014448 - 11014626
Alignment:
Q  723 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 822  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  11014448 tttgtttcaagttatatatgtagattcctgggaataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttaataaattatattcacggatataa 11014547  T
Q  823 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata 901  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | ||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  11014548 aatgtttctgggaatagaaaaaaatttcaaaagaaaagggtggaaataaagttctcatgaagatgagaataaattcata 11014626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 936 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 25474107 - 25473978
Alignment:
Q  936 ttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaata 1034  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25474107 ttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaata 25474008  T
Q  1035 aatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||||    
T  25474007 aatttgataaacttgaaacaaacacaccct 25473978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 717 - 881
Target Start/End: Original strand, 13931885 - 13932048
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13931885 ggtgtgtttgtttgaagttatatttgtagattcctaggaataaaatcataaaaatacatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgg 13931984  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatg 881  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13931985 gtataaaatgttcct-ggaatagaaatgttttcctaaagaaaagggtgggaataaatttcccatg 13932048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 715 - 875
Target Start/End: Original strand, 19083104 - 19083264
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || ||||   ||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19083104 agggtgtgtttgtttcaaattatattcgtagatttttgggaatacaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcac 19083203  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagtt 875  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  19083204 gagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagtt 19083264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 715 - 875
Target Start/End: Original strand, 19130992 - 19131152
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || ||||   ||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19130992 agggtgtgtttgtttcaaattatattcgtagatttttgggaatacaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcac 19131091  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagtt 875  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  19131092 gagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagtt 19131152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 842 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 48462475 - 48462280
Alignment:
Q  842 aaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttccta 941  Q
    ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48462475 aaaatttccgaagaaaa-ggatgggtataaagttcccatggaattgggaataaattcataaatagtt-acctattataatccttatttttatggttccta 48462378  T
Q  942 ggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
      ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  48462377 caaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatat-ttggaatataattctcatctttatactccaaagaatgttattcataaaaataaattt 48462280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 714 - 875
Target Start/End: Complemental strand, 13521394 - 13521234
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||   |||| || |||||||| ||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13521394 tagggtgtgtttgtttctaattatatttgtagatttttggga-tacaatgatagaaatatacatgtctgtgtttgttacaagtttactaaattttattca 13521296  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagtt 875  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  13521295 cgagtataaaatgttcttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagtt 13521234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 722 - 1064
Target Start/End: Original strand, 9011167 - 9011511
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||  |  ||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  9011167 gtttgtttcaagttatattcgtagattcttgaaaataaaatgataggaatatacatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattttc-ggtata 9011265  T
Q  822 aaatg-ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataa 920  Q
    ||| | ||| || |||| |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||||| | || ||| | ||||||||    
T  9011266 aaaggtttcgtgagaatcgaaaatttttcccaaagaaaagggtcggaataaagttcccatagtggtgggaataaattcatgagtaattt-cctattataa 9011364  T
Q  921 tccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca---taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    | | || |||||||||  | ||||||| ||||| | ||| ||||||   |  |||| |||||| | || ||| ||||||  ||||||||| |||| ||||    
T  9011365 ttctta-ttttatggtctccaggaatattataatgttaagcaaacatttttttttttctaaatactttagaagaaaattttcatctttatgttccgagga 9011463  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    || |||||||||| |||||||||  || | || |||||||||||||||    
T  9011464 atattattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaaacacaccct 9011511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 719 - 842
Target Start/End: Original strand, 52186049 - 52186172
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |    ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  52186049 tgtgtttgtttcaagttatatttgttgatttcttataataaaatgatagaaatatatatgtctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgacg 52186148  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaa 842  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  52186149 ataaaatgtttctgggaatagaaa 52186172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36835585 - 36835508
Alignment:
Q  63 tggacttgtaagcaggctgtgggaaacgacaagtagaagaaggtagagaccaagaccatgtttgaaagaggacatggt 140  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36835585 tggacttgtaaggaggatgtgggaaaagacaagtagaagaaggtagagaccaagaccatgtttgaaagaggacatggt 36835508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 752 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 13440431 - 13440281
Alignment:
Q  752 gggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa--aaaatttc 849  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  13440431 gggaatacaatgatagaaatataaatgactatgtttgttagaattttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctgagaatagaaaaaaaaattc 13440332  T
Q  850 ccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata 901  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13440331 caaag-aaaagggtggaaataaagtttccatgaagatgagaataaattcata 13440281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 717 - 938
Target Start/End: Original strand, 20504990 - 20505213
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| |||| | | |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20504990 ggtgcgtttgttttaaattatatttgtagatttctgagaataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcacga 20505089  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaat----agaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    ||||||||| |||||||||||    | |||||||| || |||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||||  || ||||||||   ||   |||     
T  20505090 gtataaaatattcctgggaataagaaaaaaaaattaccaaagaaaaa-ggtgaaaataaagcttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-actaca 20505187  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttc 938  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20505188 tattataatccctatttttatggttc 20505213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 774 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 29769526 - 29769230
Alignment:
Q  774 atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa-gaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  29769526 atatgtctatgtttgttacaaaattactaaattttattctttgacataaaatgttcctggcaatagaacaattttcctaaagaaaaagggtgggaataaa 29769427  T
Q  873 gttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattt 971  Q
    ||| ||||| |||||  || ||||||||   ||  |||| ||||||||||  | ||| || ||||||| | |||| ||||| | |||| ||||||  |||    
T  29769426 gtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-attacctattataatctatgtttctaaggttccttgaaatattataatgttaactaaacatttttt 29769328  T
Q  972 ---tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt-----cctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
       | ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  29769327 ttcttctaaatatcttgaaataaaattcacatctttatattccaaagaatgttattattcatataagaataaatttagtaaacttaaaacaaacacac 29769230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 717 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 37261918 - 37261764
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  | |||||| | ||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37261918 ggtgcgtttgtttcaaattatattcatagattcctgagaataaaattatagaaatatacatgcatatgtttgttacaagtttattaaattttattccc-g 37261820  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
      ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  37261819 acataaaatctttttgggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaaggttgagaataaa 37261764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 987 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 49627374 - 49627301
Alignment:
Q  987 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  49627374 aataaaattcccatctttatattccaagaaatgttattcttaaaaataaatttggtaaatttgaaacaaacaca 49627301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 893 - 992
Target Start/End: Complemental strand, 1007665 - 1007566
Alignment:
Q  893 aaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa 991  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  1007665 aaattcataaatagtt-acctattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagttaatcaaacatatttttcctaaatactttggaataa 1007567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 715 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 19094186 - 19094020
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| | ||| |  || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |     
T  19094186 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgtaaattcctggaaatagaatgatggaaatatgcattcctatgtttgttgcaagtttattaaattttatttct 19094087  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatg 881  Q
     | |||||||||||||||  |||  || ||  |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  19094086 agatataaaatgttcctgataatgaaataacattcccaaagaaaactgtgggaataaagttcccatg 19094020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 983 - 1062
Target Start/End: Original strand, 52186265 - 52186344
Alignment:
Q  983 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | || ||||||| |||||    
T  52186265 ttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattccttaaaataaatttggtaaacttaaaacaaatacacc 52186344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 969 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 45771910 - 45771815
Alignment:
Q  969 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||| |  |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  45771910 tttttctaaataccttggaataaaattctcacctttatgttccaagaaaggttattcatgggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 45771815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 969 - 1039
Target Start/End: Original strand, 45813648 - 45813718
Alignment:
Q  969 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45813648 tttttctaaataccttaaaataaaattcacatctttatatttcaatgaatgttattcctaagaataaattt 45813718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 908 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 37261699 - 37261546
Alignment:
Q  908 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||   |||||||||||  |||| ||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||    
T  37261699 ttacctattataatccatatttttaacgttctttggaatattataatattaaccaaacatcttttttctaaatatctaagaataaaattcacatatttat 37261600  T
Q  1007 attccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    ||||||| |||||||| || ||| |||||||||  || | ||||||||||||||    
T  37261599 attccaatgaatgttaatcataaaaataaatttgataaacttgaaacaaacaca 37261546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 800 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 3939486 - 3939225
Alignment:
Q  800 ctaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattca 899  Q
    |||||||||||||| ||  || |||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  3939486 ctaaattttattcctggaaatgaaatattattgggaatagaaaaaaattccaaagaaaa-gtgtaggaatcaagtttccattaagatgagaataaattca 3939388  T
Q  900 taaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattccc 998  Q
    || || ||| || ||||||||||  |||||||| | |||||   ||||| |||| | ||| |||||||  ||||  |||||  |||  |||||||||| |    
T  3939387 tacatggtt-acctattataatctatatttttaag-ttccttaaaatattataatgttaatcaaacatgttttttttaaatatcttaaaataaaattcac 3939290  T
Q  999 atctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  || | || ||||||||||||||    
T  3939289 ttttttatattccaaagaatgttattcctaaaaatatatttgataaacttaaaacaaacacaccc 3939225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1010 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 37726859 - 37726805
Alignment:
Q  1010 ccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  37726859 ccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtgaacttgaaacaaacacaccct 37726805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 745 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 3939583 - 3939515
Alignment:
Q  745 gattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    |||||| | ||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3939583 gattcctgagaatagaatgatagaaatatacatgcttatgtttgttacaagtttgctaaattttattcc 3939515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 908 - 1039
Target Start/End: Original strand, 19923655 - 19923787
Alignment:
Q  908 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||  |  || || |||| | ||| |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19923655 ttacctattataatccctacttttttggttctcaaaaacattataatgttaaacaaacatattttttctaaatatcttagaataaaattctcatctttat 19923754  T
Q  1007 attccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
     ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19923755 gttctaagaaatgttatttctaaaaataaattt 19923787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 52276930 - 52276877
Alignment:
Q  776 atgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcct 831  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  52276930 atgcctatatttgttacaagtttactaaattttatt--cggatataaaatgttcct 52276877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 792 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 11078051 - 11077963
Alignment:
Q  792 caagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccat 880  Q
    |||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  11078051 caagtttattaaattttatttctggatataacatgtttttgggaatagaaaaattttccaaaaaaaaaaggtgaacataaagttcccat 11077963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 948 - 1061
Target Start/End: Original strand, 13932103 - 13932218
Alignment:
Q  948 tataaagctaaccaaacataattttc--ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtaca 1045  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||   || ||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||  || |    
T  13932103 tataaaattaaccaaacatattttttttctgaataccttgaaataaagtttccatctttatatttcaatgaatgttattccttgaaataaatttgataaa 13932202  T
Q  1046 tttgaaacaaacacac 1061  Q
     |||||||||||||||    
T  13932203 cttgaaacaaacacac 13932218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 786 - 842
Target Start/End: Original strand, 37336514 - 37336570
Alignment:
Q  786 ttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||  ||||||||||||    
T  37336514 ttgttacaagtttactaaattttattctcagatataaaatattattgggaatagaaa 37336570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 857 - 948
Target Start/End: Original strand, 52186170 - 52186260
Alignment:
Q  857 aaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat 948  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||  || |||| |||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  52186170 aaagggtgggaattaagttcacattgagatgtgaataaatttctacatag-ttacctattataatttctatttttatggtttctaagaatat 52186260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 711 - 812
Target Start/End: Original strand, 16257003 - 16257104
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |  |||||||||| |||  ||| || ||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16257003 tctttgggtgtgtttgtttgaagttatatttgtatatttcttggaataaaatcataaaaatatacatttcaatgttttttacaagtttattaaattttat 16257102  T
Q  811 tc 812  Q
    ||    
T  16257103 tc 16257104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-174; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 710 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 40908342 - 40907988
Alignment:
Q  710 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40908342 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta 40908243  T
Q  810 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttt 909  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  40908242 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataattt 40908143  T
Q  910 acttattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 1009  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40908142 acctattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 40908043  T
Q  1010 ccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  40908042 tcaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 40907988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 709 - 1064
Target Start/End: Original strand, 8476301 - 8476657
Alignment:
Q  709 aatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt 808  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8476301 aatctaagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctgtgtttgttacaagtttactaaatttt 8476400  T
Q  809 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtt 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8476401 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtt 8476500  T
Q  909 tacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 1007  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8476501 tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttata 8476600  T
Q  1008 ttccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  8476601 ttccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 8476657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 26849094 - 26848744
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26849094 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 26848995  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26848994 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttaccta 26848895  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26848894 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 26848795  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  26848794 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 26848744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 11239116 - 11239469
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11239116 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttatt 11239215  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11239216 ccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac 11239315  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11239316 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc 11239415  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  11239416 caaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 11239469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 716 - 1060
Target Start/End: Original strand, 47114857 - 47115202
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47114857 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 47114956  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  47114957 agtataaaatgttcctggaaataaaaaaaaattcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 47115056  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115057 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 47115156  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  47115157 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 47115202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 720 - 1064
Target Start/End: Original strand, 33217917 - 33218262
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  33217917 gtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttattaaattttattcccgagta 33218016  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33218017 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattata 33218116  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33218117 atccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaat 33218216  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  33218217 gttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 33218262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 714 - 1070
Target Start/End: Complemental strand, 44952381 - 44952024
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44952381 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcc 44952282  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  44952281 ttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacct 44952182  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcct-aggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44952181 attataatccctatttttat-gttcctaaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 44952083  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccctgagtat 1070  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  44952082 aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaagtat 44952024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 48339753 - 48340106
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48339753 cttaggatgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgatataaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttatt 48339852  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48339853 ccttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac 48339952  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48339953 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc 48340052  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  48340053 taaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 48340106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 735 - 1060
Target Start/End: Original strand, 31611004 - 31611330
Alignment:
Q  735 tataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctggg 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31611004 tataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctggg 31611103  T
Q  835 aatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatg 934  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31611104 aatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatg 31611203  T
Q  935 gttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaat 1033  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31611204 gttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcataagaat 31611303  T
Q  1034 aaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  31611304 aaatttggtaaacttgaaacaaacaca 31611330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 718 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 1099267 - 1098923
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  1099267 gtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatccctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttgg 1099168  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  1099167 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaata-tttacctatta 1099069  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099068 taatccctatttttatggttcctagaaatattataaagctagccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1098969  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  1098968 atgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 1098923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 716 - 1064
Target Start/End: Original strand, 6231501 - 6231850
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231501 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 6231600  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  6231601 ggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaatgaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctat 6231700  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6231701 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatctttatatttcaag 6231800  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  6231801 gaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 6231850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 716 - 1063
Target Start/End: Original strand, 9320448 - 9320797
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320448 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatacttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 9320547  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9320548 ggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaaaggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatagtttacttat 9320647  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattcctt-ggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9320648 tatgatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttaggaataaaattctcatctttatattccaa 9320747  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  9320748 ggaatgttattcctatgaataaatttcataaacttgaaacaaacacaccc 9320797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 716 - 1058
Target Start/End: Original strand, 28124436 - 28124779
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28124436 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccg 28124535  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28124536 ggtataaaatgttcctcggaatataaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacatat 28124635  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28124636 tataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatatttatattccaag 28124735  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaaca 1058  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  28124736 gaatgttaatcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 28124779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 20297867 - 20297515
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20297867 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaaatttattc 20297768  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  20297767 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacc 20297668  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20297667 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagtcaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatattcc 20297568  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  20297567 aaagaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccct 20297515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 715 - 1062
Target Start/End: Original strand, 20414464 - 20414812
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20414464 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttataaatttactaaattttattccc 20414563  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20414564 gggtataaaatgttcttggaaataaaaaaaaattcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 20414663  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20414664 ttataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaatcaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaa 20414763  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  20414764 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 20414812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 24574647 - 24574289
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24574647 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 24574548  T
Q  815 gggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 906  Q
    ||||||||||||        || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24574547 gggtataaaatgataaaatgtttctggaaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag 24574448  T
Q  907 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 1005  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24574447 tttacctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattctcatcttta 24574348  T
Q  1006 tattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  24574347 tatttcaaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 24574289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 737 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 46360002 - 46359674
Alignment:
Q  737 taattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaa 836  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  46360002 taattgttgatttcttggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcttgtgaa 46359903  T
Q  837 tagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggt 936  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  46359902 tagaaaatatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatgat 46359803  T
Q  937 tcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataa 1035  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46359802 tcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataa 46359703  T
Q  1036 atttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||||    
T  46359702 atttgataaacttgaaacaaacacaccct 46359674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 713 - 1061
Target Start/End: Original strand, 43132154 - 43132502
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  43132154 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattctcgagaataaaataataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattt 43132253  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
     |  ||||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||     
T  43132254 tcatgtataaaatgtacctgagaatataaattttttcccaaggaaaagggtgggaatagagttcccacggagatgagattaaattcataaatag-ttacc 43132352  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43132353 tattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattctcatctttatattcc 43132452  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43132453 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 43132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 724 - 1064
Target Start/End: Original strand, 53165733 - 53166073
Alignment:
Q  724 ttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaa 823  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53165733 ttgtttcaagttatatttgttgattcccataaataaaatgataggaatatatatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaa 53165832  T
Q  824 atgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatcc 923  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||      
T  53165833 atgtttctgggaatagaaaattttttccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatat 53165931  T
Q  924 ctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta 1022  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  53165932 ctatttttatgattcctaggaatattataaggttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaatacccatctttatatttcaaggaatgtta 53166031  T
Q  1023 ttcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||| ||  ||||||||   || | ||||||||||||||||||    
T  53166032 ttcttagaaataaattggataaacttgaaacaaacacaccct 53166073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 731 - 1064
Target Start/End: Original strand, 10822733 - 10823066
Alignment:
Q  731 aagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 830  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  10822733 aagttatatttgttgatttccgggaataaaatgatagaagtgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaaaaaattcccgggtataaaatgttcc 10822832  T
Q  831 tgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttt 930  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||||     
T  10822833 tgggaatagaaaaaatttccctaggaaaagggtgggaataaagttttcatggagatgggaataaaatcataaatag-ttatctataataatccctatttg 10822931  T
Q  931 tatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaa 1029  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  10822932 tatggttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattctcatctttatattgtaaggaatgttattcctag 10823031  T
Q  1030 gaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     |||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  10823032 aaataaatttgctaaacttgaaacaaacacaccct 10823066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 713 - 1062
Target Start/End: Original strand, 31435920 - 31436269
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435920 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 31436019  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||| ||||     
T  31436020 ctgggtataaaatgttcctgaaaatagaaaaattttcccaaagaaattggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattctaatgtag-ttacc 31436118  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31436119 tattataatccttatttttatgattccaagaaatattataaaactaaccaaacatgttttttctatataccttggaataaaattcctatctttatattct 31436218  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    || |||||||||| | | |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  31436219 aaagaatgttatttccaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 31436269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 780 - 1061
Target Start/End: Original strand, 43718994 - 43719271
Alignment:
Q  780 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 879  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43718994 ctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggcataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagatccca 43719093  T
Q  880 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaa 978  Q
    |||||||||     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43719094 tggagatgg-----aattcataaataatttacttattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 43719188  T
Q  979 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43719189 ttccttggaataaaattctcaactttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 43719271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 840 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 29512546 - 29512324
Alignment:
Q  840 aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcc 939  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29512546 aaaaaatttcccaaggaaaagggtggaaataaagttcccatagagatgg-aataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcc 29512448  T
Q  940 taggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatt 1038  Q
    || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29512447 tatgaatattataaagctaaccaaacgtatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatgttattcctaggaataaatt 29512348  T
Q  1039 tagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    | ||| ||||||||||||||||||    
T  29512347 tggtaaatttgaaacaaacacacc 29512324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 716 - 1062
Target Start/End: Original strand, 12228256 - 12228601
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12228256 gggtgtgtttgttttaaaatatagttgttaattcctgcgaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttattacaagtttactaaattttattctcg 12228355  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||  ||    
T  12228356 ggtacaaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaa--ggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaaatcatatgtag-ttatcta 12228452  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12228453 ttataatacttatttttatgattcctaagaatatcataaaactaaccaaacatattttttttaaataccttagaataaaattctcatctttatatttcaa 12228552  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
      ||||||||||| ||||||||||||  || | ||| ||||||||||||    
T  12228553 ataatgttattcccaagaataaatttgataaacttgtaacaaacacacc 12228601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 715 - 1063
Target Start/End: Original strand, 28770209 - 28770557
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  28770209 agggtgtgtttctttcaagttatattcgtagattcctgggaataaaaagatagaaatatgcatgtctatgtttggtacaagtttactaaatttgattcct 28770308  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||  |||| ||    
T  28770309 gggtataaaacgttcctagcaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtgggaataaagttctcatgaagatgggaatgatttcatatgta-attaccta 28770407  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||| ||||| | ||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  28770408 ttataatccctatttttatggttcccgataatattataacgttaaacaaacatcatttttctatataccttggaataaaattctcatcattatgttccaa 28770507  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28770508 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaccc 28770557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 722 - 1062
Target Start/End: Original strand, 26849164 - 26849492
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||    
T  26849164 gtttgtttcaagttatatttg---attaccgataataaaatgatagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttact----------cccgggtata 26849250  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatt-tcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataa 920  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||   | | |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  26849251 aaaagtttctgggaatagaaaaaaaaattcaaagaaaaatggtgggaataaagttcctacagagatgagaataaattcataaatagtt-acctattataa 26849349  T
Q  921 tccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg 1019  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  26849350 tctctatttttatggttcctatgaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaataccttgaaataaaatttccatctttatattccaagaaata 26849449  T
Q  1020 ttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  26849450 ttattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacacc 26849492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 801 - 992
Target Start/End: Complemental strand, 19533130 - 19532939
Alignment:
Q  801 taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcat 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  19533130 taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaatttttttccaaggaaaagggtgggaataaagtttccttggagatgggaataaattcat 19533031  T
Q  901 aaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaa 992  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19533030 aaatag-ttacctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaa 19532939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 726 - 1039
Target Start/End: Original strand, 1246912 - 1247223
Alignment:
Q  726 gtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaat 825  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  1246912 gtttgaagctatatttgttgattctcgggaataaaatgatagaaatacatatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaagaataaaat 1247011  T
Q  826 gttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccct 925  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||| || |||| |||  ||||||||||| |    
T  1247012 gttcctggtaatagaaaaaatttccgaaggaaaaaggtgggaat--agttcacatggagatcggaataaattcttatatag-ttatctattataatccat 1247108  T
Q  926 atttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt 1024  Q
    |||||||| || || |||| || |||| || |||||||||||| |||||   ||| | || ||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||    
T  1247109 atttttatagtaccaaggagtattatagagttaaccaaacatatttttctcgaatactttagaataaaattctcatctatttattctaaaaaatgttatt 1247208  T
Q  1025 cctaagaataaattt 1039  Q
    ||||| | |||||||    
T  1247209 cctaaaagtaaattt 1247223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 718 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 27823343 - 27822994
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |  |||   |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  27823343 gtgtgtttgtttcaagttatattcataaatttatgggaataaaatgatagaaatataaatgtctatgtttgctataagtttactaaattttattcccgag 27823244  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||| |||| | | ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||   ||  |||| | |||    
T  27823243 tataaaacgttcatcgaaataggaaaattttcccaaagaaaagggtgggaataaaattctcatgaagatgagaacaaattcatgtgta-attacctgtta 27823145  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca----taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| | ||| |||| |    |  |||| |||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  27823144 taatccatatttttatgatttctaggaatattataatgttaagcaaatattttttttttttctaaataccttaaaataaaattctcatatttatgttcga 27823045  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27823044 aagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 27822994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 908 - 1064
Target Start/End: Original strand, 6832114 - 6832271
Alignment:
Q  908 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6832114 ttacctattataatccttatttttaaggttctttggaatactatgaagttaaccaaacatattttttctaaataccttggaataaaattctcatctttat 6832213  T
Q  1007 attccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6832214 attccaagtaatgttattcttaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaccct 6832271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 718 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 40584669 - 40584336
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||     
T  40584669 gtgtatttgttttaagttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatgcatatgtctatgttttctacaagtttattaaattttattttcgga 40584570  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||||          ||||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   || |  || |||||    
T  40584569 tataaaat----------atagaaaagtttttccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaaattatgtgtaatc-acctatta 40584481  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  40584480 tatttcctatttttaaggttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatatttgaagga 40584381  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  40584380 atgttattcttaggaataaatttgttacacttgaaacaaacacac 40584336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 719 - 891
Target Start/End: Original strand, 12930945 - 12931115
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12930945 tgtgtttgtttcaagttata-ttgtagattgttgggaataaaatcataaaaatgcatatggctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc-ggt 12931042  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaa 891  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12931043 ataaaatgtttatgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaagttcccatagagatgggaa 12931115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 713 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 24784279 - 24783934
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    |||||||||| |||  |||  ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24784279 ttagggtgtgtttgttttaagttataattgtagattttttggaataaaattataaaaatacatatgtca--gtttgttacaagtttactaaattttattc 24784182  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |    |||||||| ||| |  ||||| |||   ||| | ||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||   || || ||     
T  24784181 ctaa-tataaaatattcataagaatataaagttttttcaaagaaaa-gtgtatgaataaagttcccatgaagatgggaataaaattatgtgtaatt-acc 24784085  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaatata-taaagct-aaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24784084 tattataatctttatttttaaggttccttggaatattctaaagtttaaccaaacatattttttttaaataccttagaataaaattctcatctttatattc 24783985  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24783984 caaggaatgttattcttatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 24783934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 715 - 901
Target Start/End: Original strand, 2565459 - 2565644
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||   |||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  2565459 agggtgtgttcgttttaagttatatttgttgattcttaggaataaaataatagaaatatatatacctgtgtttgttacaagtttgttaaattt-atttcc 2565557  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata 901  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  2565558 gggtataaaatgtttcttggaatagaaaattttttccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgagagtaaattcata 2565644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 713 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 18461015 - 18460839
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatat--gcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    ||| |||| |||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461015 ttagggcgtgtttgtttcaagttatatttgttgtttcctaataatgaaataatagaaatatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttat 18460916  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatg 887  Q
    ||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  18460915 tctttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtggaaataaagttctcttggagatg 18460839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 714 - 899
Target Start/End: Original strand, 33647701 - 33647886
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33647701 tagggtgtgtttgtttcaagtaatattcgtagattctcgggaataaaacgttagaaatatacatctctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 33647800  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattca 899  Q
     |||||||||| ||| ||| ||||| |||||| || ||||  ||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||| |||||||    
T  33647801 tgggtataaaacgtttctgagaatataaaaaaatttccaaagaaaagagtggaaataaagtttccttgaagatgagaataaattca 33647886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 773 - 1057
Target Start/End: Original strand, 38140425 - 38140710
Alignment:
Q  773 tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaat--gttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaata 870  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| | ||||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||   ||| ||||  ||||||||| |||||    
T  38140425 tatatgtcaatgtttgttataagtttactataatttattgacgagtataaaatatgttcctaggaatagaaatttttttccaaagaaaagggtgagaata 38140524  T
Q  871 aagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataat 969  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || |||||   || ||| || |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||| | ||| |||||||  |    
T  38140525 aagttcc-atgaagatgagaataagttcatgtgtaatttcct-attataatccttattttttaggttcccaggaatattataatgttaatcaaacatctt 38140622  T
Q  970 tttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || | |||||||||||    
T  38140623 ttttctatataccttggaataaaattcacacctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaattttataaaattgaaacaaac 38140710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 719 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 32071508 - 32071256
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| |    ||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  32071508 tgtgtttgtttgaagttatatttattgatttctaaaaataaaatgatagaaatatatat----atgtttgttacaagtttactaaattttatt-ttgggt 32071414  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    || |||||||| ||| |||||||| | ||||  ||  ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| |||||  ||  ||| |||| ||||||    
T  32071413 atgaaatgttcatggaaatagaaagattttcttaaagaaaagggcgagaataaagtt-acatggagatgagaataaatttgtatgtag-ttacctattat 32071316  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaa 977  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  32071315 aatctttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaa 32071256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 908 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 49216179 - 49216051
Alignment:
Q  908 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||| | ||||| | |||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49216179 ttacctattataatctatatttttaaggttctttggaattttataaggttaaccaaacatattttttctaaataccttggaataaaattcccatctttat 49216080  T
Q  1007 attccaaggaatgttattcctaagaataa 1035  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49216079 attccaaggaacattattcctaagaataa 49216051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 715 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 45826848 - 45826687
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |  || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  45826848 agggtgtgtttgtttcaagttatcgttgtagattccagggaataaaatgatagaaatctgcattcatatgttt-ttacaagtttattaaattttatttca 45826750  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcc 877  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||  |||||| |||||| ||||||||    
T  45826749 tgatataaaatgttcctgggaatagaagaacattcacaaagaaaaggatgggaaaaaagttcc 45826687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 705 - 778
Target Start/End: Original strand, 43715297 - 43715370
Alignment:
Q  705 ttataatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatg 778  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  43715297 ttatactcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgatagaaatgtatatg 43715370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 715 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 27094088 - 27093957
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaa-tgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  ||| | ||||||| || |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||     
T  27094088 agggtgtatttgttttaagttatatgtgtaggttcccggaaaaaaaaatgattgaaatatatatgcctatgtttgttataagtttactatatcttattct 27093989  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 845  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27093988 cgggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaa 27093957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 28693422 - 28693780
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||  |||  ||| | ||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  28693422 cttagagtgtgtttgtttcaagttatattcatagattcccgagaataaaaaaataaaaatatgtatgcttatgtttgttataagtcaattaaattttatt 28693521  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttc-ccaaga----aaaagggt--gggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaat 904  Q
    |  | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| | ||||    ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| | || | ||||||  |    
T  28693522 catgagtataaaacgatcctgagaatagaaaaattttctcaaagaaaagaaaagggtgggggaataaagttctcatgaagatgag-aatatttcatatgt 28693620  T
Q  905 agtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctt 1003  Q
    ||||  | |||||||||   ||||||||||||| |  | |||| ||||| | |||  ||||||  |||| ||| |  ||||| |||||||||| ||||||    
T  28693621 agttgtc-tattataatttttatttttatggtttccggaaatattataatgttaaataaacatcttttttctataaaccttgaaataaaattctcatctt 28693719  T
Q  1004 tatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     |  || |||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28693720 aaagtttcaaggaaaattatttctaggaataaatttagtaaatttgaaacaaacacaccct 28693780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 713 - 840
Target Start/End: Original strand, 6831954 - 6832079
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| | |  ||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6831954 ttagggtgtgtttgtttcaacttatatttgtagattcctggaaataaaatcacaaaaaac-acatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatt- 6832051  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaataga 840  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||    
T  6832052 ccaggtataaaatattcctgggaataga 6832079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 774 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 29512705 - 29512631
Alignment:
Q  774 atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt 848  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29512705 atatgcctacgtttgtttcaagtttactaaattttattcctgagtataaaatgttcatcggaatagaaaaaattt 29512631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 713 - 842
Target Start/End: Original strand, 28139717 - 28139846
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||   ||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  28139717 ttagggtgcgtttgtttcaagttatattcgtatattcttaggaataaaaagatagaaatatacatgcttatgtttgttacaagattagtaaattttattt 28139816  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa 842  Q
     ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28139817 tcggatataaaacgttcttgggaatagaaa 28139846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 969 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 6927908 - 6927817
Alignment:
Q  969 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || | || |||||||||||    
T  6927908 tttttctaaataccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagtaataaatttgataaacttaaaacaaacaca 6927817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 976 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 32071080 - 32070994
Alignment:
Q  976 aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||  || |||| |||||||| ||||    
T  32071080 aaataccttggaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcataggaataaatttgataaatttaaaacaaacccacc 32070994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 722 - 822
Target Start/End: Original strand, 39932529 - 39932631
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatat--gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||||||||||| |  |  ||||  |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  39932529 gtttgtttcaagttatattcataaattcatgggaataaaatgatagaaatgtatatatgtttatgtttgttataagtttactaaattttattcccggata 39932628  T
Q  820 taa 822  Q
    |||    
T  39932629 taa 39932631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 714 - 812
Target Start/End: Original strand, 55435390 - 55435488
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||||||| |  || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  55435390 tagggtgtatttgtttcaagttatttttgtagatacctgggaataaaatgataggaatatgcattctcatgtttgttacaagtttgttaaattttattc 55435488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1059
Target Start/End: Original strand, 55435652 - 55435726
Alignment:
Q  985 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacac 1059  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  55435652 ggaataaaactcccatctttatattcccgggaaagttattcacaagaataaatctagtaaacttgaaacaaacac 55435726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 914 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 18460725 - 18460582
Alignment:
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||| || |  ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| |     
T  18460725 attataatccctgtttttatggttc-tatgaatattataaagttaaccaaatatatttcttttaaataccttgtaatcaaattctcatctttatatttcg 18460627  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    |  |||||||||| ||  |||||||||  || | |||||||||||    
T  18460626 aaaaatgttattcgtagaaataaatttgataaacttgaaacaaac 18460582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 981 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 27093834 - 27093776
Alignment:
Q  981 ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  27093834 ccttgaaataaaattcacatctttatattctaaggaatattatttttaagaataaattt 27093776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 755 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 33497889 - 33497799
Alignment:
Q  755 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 845  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||  || || ||||||||| || ||||| ||||||    
T  33497889 aataaaatgatagaaatatacatgcttatatttgttacaaatttattaaattttattctaggatacaaaatgttcatgagaataaaaaaaa 33497799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 782
Target Start/End: Original strand, 9320405 - 9320446
Alignment:
Q  741 tgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgccta 782  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9320405 tgttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatataccta 9320446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 981 - 1058
Target Start/End: Original strand, 33650280 - 33650357
Alignment:
Q  981 ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaaca 1058  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  33650280 ccttagaataaaattctcatctttagatttcaaataatgttattcataaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 33650357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 987 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 45826136 - 45826064
Alignment:
Q  987 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacac 1059  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  45826136 aataaaactcccattcttatattcccaggaaagttattcctaggaataaatctagtaaactggaaacaaacac 45826064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 986 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 26085517 - 26085442
Alignment:
Q  986 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| || |||| ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  26085517 gaataaaattcatatctttatgttcgaaagaatcttatttctaaaaataaatttagtaaacttgaaacgaacacac 26085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 715 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 29512751 - 29512704
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaat 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  29512751 agggtgtgtttgtttcaagttataatttttaatttctgggaataaaat 29512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 713 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 38364155 - 38363804
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38364155 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 38364056  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  38364055 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 38363956  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38363955 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 38363856  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  38363855 aaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 38363804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 707 - 1064
Target Start/End: Original strand, 37392537 - 37392895
Alignment:
Q  707 ataatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatt 806  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37392537 ataatgttagggtgtatttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaatt 37392636  T
Q  807 ttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37392637 ttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatag 37392736  T
Q  907 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 1005  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37392737 tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 37392836  T
Q  1006 tattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  37392837 tattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 37392895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Original strand, 35818421 - 35818773
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35818421 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 35818520  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  35818521 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 35818620  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35818621 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc 35818720  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  35818721 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 35818773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 32660932 - 32661283
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32660932 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 32661031  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa-gaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32661032 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 32661131  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32661132 attataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 32661231  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32661232 aggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 32661283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 25837986 - 25837633
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25837986 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtacatgcctatgtttgttacaagtttacaaaattttatt 25837887  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25837886 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaaaaaaagggtggcaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttac 25837787  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25837786 ctattataatccctatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 25837687  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  25837686 caaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 25837633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 16313503 - 16313856
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16313503 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 16313602  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  16313603 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataattttc 16313702  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16313703 ctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc 16313802  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  16313803 caaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 16313856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 710 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 12710722 - 12710367
Alignment:
Q  710 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12710722 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaattta 12710623  T
Q  810 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttt 909  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12710622 ttccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagttt 12710523  T
Q  910 acttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 1008  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12710522 acctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaacgaaacatatttttcctacatttcttggaataaaattcccatctttatat 12710423  T
Q  1009 tccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  12710422 tccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 12710367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Original strand, 38132734 - 38133087
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38132734 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 38132833  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38132834 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgtgaataaattcataaatagtttac 38132933  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38132934 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc 38133033  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  38133034 caaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 38133087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 716 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 18298183 - 18297836
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298183 gggtttgtttgtttcaagttataatttttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 18298084  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18298083 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagtttacctat 18297984  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297983 tataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 18297884  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  18297883 gaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 18297836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 716 - 1062
Target Start/End: Original strand, 18726619 - 18726967
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18726619 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccca 18726718  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  18726719 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatggaaataaattcataaatagtttaccta 18726818  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18726819 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattttcatctttatattccaa 18726918  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
      |||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  18726919 ttaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 18726967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 710 - 1052
Target Start/End: Original strand, 1554348 - 1554692
Alignment:
Q  710 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta 809  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554348 atctcagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaatttta 1554447  T
Q  810 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttt 909  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  1554448 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcatacataattt 1554547  T
Q  910 acttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatc-tttata 1007  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1554548 acctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaaactaaccaaccatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttttata 1554647  T
Q  1008 ttccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaa 1052  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  1554648 ttccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaa 1554692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 722 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 3050074 - 3049731
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3050074 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 3049975  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3049974 aaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataat 3049875  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgt 1020  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3049874 ccctatttttatgattcctaggaatattataaagataaccaaacatattttttctaaattccttcgaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgt 3049775  T
Q  1021 tattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  3049774 tattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 3049731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 26062216 - 26061866
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26062216 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatgtatattcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 26062117  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  26062116 tggtataaaatgtccctgggaatagaaaaaaattcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttaccta 26062017  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26062016 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattacaa 26061917  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  26061916 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccct 26061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 259; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 719 - 1064
Target Start/End: Original strand, 26601941 - 26602286
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26601941 tgtgtttgtttcaaattataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgg-t 26602039  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  26602040 ataaaatgttcttgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttagctattat 26602139  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26602140 aatccctatttttatggttccaaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatgtttcaaggaa 26602239  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  26602240 tgttatttctagcaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 26602286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 720 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 7931306 - 7930961
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||    
T  7931306 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgatagaaatgtatatgtatatgtttgttataagtttactaaaatttattccttggta 7931207  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7931206 taaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattata 7931107  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7931106 atccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaat 7931007  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  7931006 gttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 7930961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 717 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 42755937 - 42755592
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       
T  42755937 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgttagttacaagtttactaaaatttattccttt 42755838  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42755837 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgagaataaattcataaatagtttacctatt 42755738  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42755737 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaatatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttcatattccaagg 42755638  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  42755637 aatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 42755592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 711 - 1059
Target Start/End: Original strand, 10896212 - 10896560
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10896212 tctttgggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttactaaaatttat 10896311  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttta 910  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10896312 tccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaaaatc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttta 10896410  T
Q  911 cttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 1009  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10896411 cctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatatt 10896510  T
Q  1010 ccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacac 1059  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10896511 ccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 10896560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 714 - 992
Target Start/End: Original strand, 41228712 - 41228990
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41228712 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttaattcccgggaataaaatggtaggaatgtatatgcctacgtttgttacaagtttactaaattttattcc 41228811  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |    
T  41228812 cgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccgaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagat-agaataaattcataaatagtttacct 41228910  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaa 992  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41228911 attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaa 41228990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 712 - 1061
Target Start/End: Original strand, 5020486 - 5020837
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagga---atgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt 808  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  5020486 cttagagtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcatgggaataaaatgataggaggaatatatatgcatatgtttcttacaagtttactaaagttt 5020585  T
Q  809 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtt 908  Q
    | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |    
T  5020586 actctcgggtataaaatgtttctgtgaatagaaaaattttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataagtag-t 5020684  T
Q  909 tacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 1007  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  5020685 tacctattataatccatatttttatgattccca-gaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttagaataaaattatcatctttata 5020783  T
Q  1008 ttccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||    
T  5020784 ttccaaagaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 5020837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 713 - 1021
Target Start/End: Complemental strand, 35394464 - 35394156
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35394464 ttagggtttgtttgtttcaagttatatttattgattcacgagaataaaatgaaagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 35394365  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||     
T  35394364 ccgggtataaaatgttctacgtaatagaaaaaaatttccaagaaaaatggtgggaataaagttcctaaggagatgggaacaaactcatatatag-ttacc 35394266  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  35394265 tattataatccttatttttatggttcataggaatattataaagttaaccaaacatatttttcttaaataccttggaataaaattctcatctttatatttc 35394166  T
Q  1012 aaggaatgtt 1021  Q
    ||||||||||    
T  35394165 aaggaatgtt 35394156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 715 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 7317445 - 7317156
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7317445 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattttcaaaaataaaatgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc- 7317347  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    || |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  7317346 ggatataaagtgttcctagga-tagaaaaattttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcgtaaatag-ttaccta 7317249  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 1007  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7317248 ttataatccctattttcatggtt-ctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttagaataaaattcacatctttata 7317156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 717 - 1062
Target Start/End: Original strand, 33444627 - 33444969
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33444627 ggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgagaataaaatgataaaaatatatatgtctatgtttgttacaag-ttactaaattttattccc-g 33444724  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||  ||| |||| ||||    
T  33444725 gtataaaatgttcttgggaatagaaaaaattgcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgag-ataatttcatatgtag-ttacctatt 33444822  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    | |||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |     
T  33444823 agaatcactatttgtatgattgctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaataccttgaaataaaattttcatctttatattccatga 33444922  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  33444923 aatgttattcttatgaataaattcagtaaacttgaaacaaacacacc 33444969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 718 - 1025
Target Start/End: Original strand, 21137134 - 21137441
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21137134 gtgtgtttgtttgaagttatatttgttgattcctgagaataaaataatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 21137233  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| | ||| ||||  |||| ||||| |||||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||| |||| |||||    
T  21137234 tataaaatgtttgtgggaatataaatatttttccaaagaaaatggtggaaataaagttctcgtggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctatta 21137332  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  21137333 taatccgtatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttttaaataccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaa 21137432  T
Q  1017 atgttattc 1025  Q
    |||||||||    
T  21137433 atgttattc 21137441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 720 - 1063
Target Start/End: Original strand, 29421493 - 29421839
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29421493 gtgtttgtttcaaattatatttgttgattcatgagaataaaatgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttattaaattttattctcgggta 29421592  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||| |||| |||||||    
T  29421593 taaaatatttctgggaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatttatatgtag-ttacctattata 29421691  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa---aattcccatctttata-ttccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||| ||||||   ||||  |||||||||| ||||||     
T  29421692 atccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaatcaaatatattttttctaaataccttagaataaaacaattttcatctttatatttccaaa 29421791  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  29421792 taatgttattcataggaataaatttcgta-aattaaaacaaacacaccc 29421839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 722 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 15227029 - 15226688
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||   ||||||||| |||  |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15227029 gtttgtttcaagttatattcgtagattcctctgaataaaatcatataaatacatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtata 15226930  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||    | || || |||||||||    
T  15226929 aaatattcctgcgaatagaaaagattcccaaagaaaa-gggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaaattatgtggaatt-acctattataat 15226832  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgt 1020  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | | |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15226831 ccctatttttaaggttccttggatttttataaagttaaccaaacatattttttctaaataccttgaaataaaattctcatctttatattccaaggaaagt 15226732  T
Q  1021 tattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  15226731 tattcctaataataaatttggtaaaattgaaacaaacgcaccct 15226688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1128 - 1294
Target Start/End: Complemental strand, 7935531 - 7935365
Alignment:
Q  1128 tgttgagggaattaatgcggtattacagtgaagatgttataattaagtggtggttgcttgtgagcaaagataggataattacttctcaacaagtttgctt 1227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7935531 tgttgagggaattaatgcggtattacagtgaagatgttataattaagtccgggttgcttgtgaacaaagataggataattacttcgcaacaagtttgctt 7935432  T
Q  1228 ctgtggttgtaattatggtgcttgatcatagttatgttgttgataaattatactccaggtttactcc 1294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||    
T  7935431 ctgtggttgtaattatggtgcttgatcatagttatgttggtgataaattatactacatgttaactcc 7935365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 753 - 1062
Target Start/End: Original strand, 19160778 - 19161088
Alignment:
Q  753 ggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 852  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||  | |||    
T  19160778 ggaataaaataatataaatatatatgcagatgtttgttacaagtttactaaatttcattcccgtgtataaaatattcttgggaatataaaaaaaattcca 19160877  T
Q  853 agaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tata 951  Q
    |  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19160878 aagaaaagggtgggaataaagttgtcatggagatgagaatgaattcatatgta-attacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattata 19160976  T
Q  952 aagctaaccaaacata-attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttga 1050  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||| || || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  || | ||||    
T  19160977 atgctaaccaaacatatttttttctaaataccctgaaataaatttctcatctttatattccaaagaatgttattcttgagaataaatttgataaacttga 19161076  T
Q  1051 aacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||    
T  19161077 aacaaacacacc 19161088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 723 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 41432804 - 41432464
Alignment:
Q  723 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 822  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41432804 tttgttttaagttatattcgtggattcctgggaataaaatgataggaatacacatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattccc-ggtataa 41432706  T
Q  823 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggaga-tgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    || |||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | || ||| | |||||||||    
T  41432705 aacgtttatgggaatagaaaatttttccctagaaaaagggtggaaataaagttcccatggagattgagaataaattcatgagtaattt-cctattataat 41432607  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaac--ataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
     ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||    
T  41432606 tcctatttttatggctcccaagaatattataatgttaagcaaacatatattttttttaaatgccttggaataaaatttccatctttatgtttcaagaaat 41432507  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||||| |||||||||  || | || ||||||||||||    
T  41432506 gttattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaaacacac 41432464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 791 - 1035
Target Start/End: Original strand, 6805698 - 6805946
Alignment:
Q  791 acaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatggga 890  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  6805698 acaagtttactaaattttattcccgagtataatatgttcttgggaatagaaaatttttcctaaagaaaagggtgagaataaagttctcatggagatgaga 6805797  T
Q  891 aaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaatt----ccttg 985  Q
    | |||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||     |||||    
T  6805798 ataaattcataaatagat-acctattaaaatctctattttcatggttcctgggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatatataccttg 6805896  T
Q  986 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataa 1035  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  6805897 gaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcttaaaaataa 6805946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 886 - 1064
Target Start/End: Original strand, 40197223 - 40197402
Alignment:
Q  886 tgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattcctt 984  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40197223 tgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattcctt 40197322  T
Q  985 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||    
T  40197323 agaataaaattcccatctttatattccaaagaatattattcctaggaataaatttggtaaacttgaagcaaacaaaccct 40197402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 721 - 1064
Target Start/End: Original strand, 43871971 - 43872314
Alignment:
Q  721 tgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtat 820  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||  ||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43871971 tgtttgtttcaagttataattatagattcttggaaataaaatcataaaaacatacatgcctatgtttgttacaagtttgttaaattttattcccgggtat 43872070  T
Q  821 aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataa 920  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||  |||  |||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||   |||  |||| ||||||||    
T  43872071 aaaatgttcctgggaatataaatattttttcaaagaaattggtaggaataaagttcatatggagatgggaataaaatcacgtata-attacctattataa 43872169  T
Q  921 tccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg 1019  Q
    |||||||||||  ||||||| | || | ||||| | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  43872170 tccctatttttgaggttccttgaaacattataatgttaaccaaacatcttttttctaaataccttggaataaaatttacatctatatatttcaaggaatg 43872269  T
Q  1020 ttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||  ||||||||| | | | ||||||||||||||||||    
T  43872270 ttattcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacaccct 43872314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 780 - 1063
Target Start/End: Original strand, 31117594 - 31117874
Alignment:
Q  780 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 879  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117594 ctatgtttgttacgattttattaaattttatttccgaatataaaatgttcttcagaatagaaaaaaatttccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 31117693  T
Q  880 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataa---ttttcct 975  Q
    ||| |||      |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    |||| ||    
T  31117694 tggggat------aaattcataaatagtt-acctattataatatctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaagcatatatttttttct 31117786  T
Q  976 aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  31117787 aaatactttgaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaatataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 31117874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 16218942 - 16219290
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | || | || | |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16218942 agggtgcgtttgtttcaaattatattcgtagttttctgggaataaaacgatagaaatatgtatgcctatgtttgttacaagtttactagattttattccg 16219041  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||| ||||| ||||   |||||||  |||||||||| | | ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||    ||  |||| ||    
T  16219042 gggtttaaaacgttctcaggaatag-taaaatttccccaaagaaaaggtgggaataatcttcccatgaagatgggaataaatccacgtgta-attaccta 16219139  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  16219140 ttataatccccattttcatggttcccaagaatattataatgttaaccaaacatcttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttaagttccaa 16219239  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| |||||||||| |||||||||   || | || |||||||||||||||    
T  16219240 ggaacgttattcctaggaataaattggataaacttaaaacaaacacaccct 16219290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 716 - 872
Target Start/End: Original strand, 40197076 - 40197232
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||       
T  40197076 gggtatgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttataagtttactaaaatttattcttt 40197175  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||| |||| ||||||||||||    
T  40197176 gatataaaatgtttctgggaatagaaaaaaaatttcaaggaaaaaggtgggaataaa 40197232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 913 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 25899531 - 25899381
Alignment:
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25899531 tattatattccatatttttaaggttccttggaat-tataatgtcaaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcctatctttatattcca 25899433  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  25899432 aggaatgttattcctaaaaataaatttgttacacttgaaacaaacacaccct 25899381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 711 - 887
Target Start/End: Original strand, 14763926 - 14764101
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||   | |||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14763926 tcttagagtgtgtttgtttcaagttatattcatagttttatgtgaataaaatgatagaaatatacatgcatatgtttgtttcaagtttactaaattttat 14764025  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatg 887  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||  | | | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  14764026 tcacgggtataaaatgttcatgagaatagaaaaaaaattcaatgaaaaa-ggtgggaataaagttcacatgaagatg 14764101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 717 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 25899702 - 25899548
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||  |||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  25899702 ggtgtgtttgtttcaaattatatttgtagattcctgggaataaaatcataaaaatgcatgtgtctatgtttgttgcaagtttattaaattttatttccgg 25899603  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||  |||| |||| |||||||    
T  25899602 gtat-aaatgttcctcggaatagaaaagtttttccaaagaaaatggtgagaataaa 25899548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 722 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 38437519 - 38437369
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    |||||||| |||||||| ||||  ||||| |  ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  38437519 gtttgttttaagttatatttgtatattcctgaaaataaaacgataggaatacatatatctatgtttgttacaagtttacaaaattttattttcgggtata 38437420  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  38437419 aaacgttcctgagaatagaaaatttttcccaaagaaaagggtggaaataaa 38437369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 784 - 1062
Target Start/End: Original strand, 37981857 - 37982134
Alignment:
Q  784 gtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgga 883  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||  || ||||||| |||| |||||||  ||||||  ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  37981857 gtttgtttcaagtttacaaaattt-attcttggatataaaacgttcttgggaattaaaaaaaaatc--aaggaaaagggtggaaataaagttcctatgaa 37981953  T
Q  884 gatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcct--aaatt 980  Q
     ||| ||| ||||| |||  || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | ||| |||||||  ||||  |  ||||     
T  37981954 aatgagaataaatttatatgtaatt-acttgttataatccctatttttatggttcccataaatattataatgttaagcaaacatcttttttttttaaata 37982052  T
Q  981 ccttggaataaaa-ttcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  37982053 ccttggaataaaaattctcatctttatgttc-aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 37982134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 715 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 34672406 - 34672289
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  34672406 agggtgtgtttgtttgaagttgtatttgttgattcctgaaaataaaatgataaaaatatatatgcttacatttattacaagtttaataaattttattctc 34672307  T
Q  815 gggtataaaatgttcctg 832  Q
     | |||||||||||||||    
T  34672306 agatataaaatgttcctg 34672289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 913 - 1064
Target Start/End: Original strand, 33533589 - 33533741
Alignment:
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||| |||| | ||| |||||||  || | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  33533589 tattataattcctatttttaaggttcttgagaatatcataatgttaatcaaacatctttattctaaatacattggaataaaattcacatctttatattca 33533688  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||   | | ||||||||||||||||||    
T  33533689 aaggaataatattcctaggaataaatttgacaaacttgaaacaaacacaccct 33533741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1089 - 1130
Target Start/End: Complemental strand, 7935608 - 7935567
Alignment:
Q  1089 atatattcatgagagttatagttgaatttgattagcgtatgt 1130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7935608 atatattcatgagagttatagttgaatttgattagcgtatgt 7935567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 718 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 8635703 - 8635664
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaat 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8635703 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaggaat 8635664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 948 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 34672201 - 34672083
Alignment:
Q  948 tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt--atattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtaca 1045  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||  || |    
T  34672201 tataaagttaaccaaaaatattttttctaaaaaccttagtataaaatttccatctttttatatttcaaggactgttatttctaaaaataaatttgataaa 34672102  T
Q  1046 tttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     || |||||||||||||||    
T  34672101 cttaaaacaaacacaccct 34672083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1005 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 35394139 - 35394080
Alignment:
Q  1005 atattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  35394139 atattccaaagaatgttattactaagaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 35394080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 785 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 12650137 - 12649859
Alignment:
Q  785 tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggag 884  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| ||| ||| |||||||||  || | |||  ||||  |||||||||||||||||||| |     
T  12650137 tttgttacaagattattaaattttatttctgtgtataaaatattcatggaaatagaaaat-ttacgcaaagaaaatagtgggaataaagttcccatgaaa 12650039  T
Q  885 atgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcct--aaattc 981  Q
    |||  || ||||||| |  ||  | || |||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||| | ||| |||||||  ||||  |  ||||      
T  12650038 atgaaaataaattcacatgtaact-acctattataatctctattttttaagttcctaagaatattataatgttaatcaaacatcttttttttttaaataa 12649940  T
Q  982 cttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
     ||| |||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12649939 tttgaaataaaattcacatcattgtattacaaggattgttattcgtagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 12649859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 913 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 38437351 - 38437203
Alignment:
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||  | ||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||      
T  38437351 tattataattcctatttttatggttcccagaaatactgtagtgttaaacaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaattctcatccttatatt-a 38437253  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||  ||| |||||  ||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  38437252 aaaaaatattatttttaagaatgaatttaataaacttgaaacaaacacac 38437203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 346344 - 346694
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  346344 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 346443  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  346444 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 346543  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346544 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 346643  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  346644 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 6171863 - 6171513
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6171863 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 6171764  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6171763 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 6171664  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6171663 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 6171564  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  6171563 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 6171513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 699 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 37534040 - 37533675
Alignment:
Q  699 tcttatttataatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagttt 798  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37534040 tcttatttgtaaactaagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagttt 37533941  T
Q  799 actaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattc 898  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37533940 actaaattttattcctgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattc 37533841  T
Q  899 ataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattccc 998  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533840 ataaataatttacctattataatccctatttttatggttcccaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattccc 37533741  T
Q  999 atctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37533740 atctttttattccaaggaatgttattcctagaaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 37533675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 42674657 - 42675010
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42674657 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 42674756  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42674757 cccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttac 42674856  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42674857 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattc 42674956  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  42674957 caagaaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 42675010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 11071677 - 11071327
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11071677 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 11071578  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11071577 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttaccta 11071478  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11071477 ttataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaa 11071378  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  11071377 ggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 11071327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 705 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 4559641 - 4559281
Alignment:
Q  705 ttataatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa 804  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4559641 ttatagtcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaagaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttacttta 4559542  T
Q  805 ttttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaat 904  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4559541 ttttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaat 4559442  T
Q  905 agtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctt 1003  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4559441 agtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctt 4559342  T
Q  1004 tatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  4559341 tatattccaaggaatgttattcttagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 4559281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 14777497 - 14777847
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14777497 agggtgtgtttgtttcaatttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 14777596  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14777597 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 14777696  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14777697 ttataatccctatttttatagttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 14777796  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  14777797 ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 14777847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 718 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 2050935 - 2050588
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050935 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 2050836  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  2050835 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctatta 2050736  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050735 taattcctatttttatgattcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 2050636  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  2050635 atgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 2050588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 712 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 17966058 - 17965707
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17966058 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgataataaaatgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttaccaaattttatt 17965959  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17965958 cccgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttac 17965859  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17965858 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 17965759  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  17965758 caaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 17965707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 714 - 1064
Target Start/End: Original strand, 41729128 - 41729479
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41729128 tagggtgtgtttgtttcaagttataattttttattcccgggaataaaatgataggaatggatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattgc 41729227  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  41729228 cagatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacct 41729327  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41729328 attataatccctatttttatggttactaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 41729427  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  41729428 aggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 41729479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 716 - 1059
Target Start/End: Original strand, 9733846 - 9734190
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  9733846 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctt 9733945  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9733946 ggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 9734045  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734046 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 9734145  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacac 1059  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  9734146 gaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacac 9734190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 713 - 1060
Target Start/End: Original strand, 21737397 - 21737753
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21737397 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 21737496  T
Q  813 ccgggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaat 904  Q
    | ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21737497 ctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaat 21737596  T
Q  905 agtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctt 1003  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21737597 agtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatatt 21737696  T
Q  1004 tatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21737697 tatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 21737753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 715 - 1063
Target Start/End: Original strand, 5770109 - 5770458
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5770109 agggtatgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 5770208  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  5770209 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataattttccta 5770308  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5770309 ttataatccctatttttatggttgctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaa 5770408  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  5770409 ggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 5770458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 718 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 37192591 - 37192244
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  37192591 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttgg 37192492  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  37192491 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagattggaataaattcataaatagtttacctatta 37192392  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37192391 taatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaagga 37192292  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  37192291 atgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 37192244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 715 - 1027
Target Start/End: Complemental strand, 2521747 - 2521434
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2521747 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 2521648  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2521647 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 2521548  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2521547 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaa 2521448  T
Q  1014 ggaatgttattcct 1027  Q
    ||||||||||||||    
T  2521447 ggaatgttattcct 2521434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 720 - 1061
Target Start/End: Original strand, 28311701 - 28312042
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28311701 gtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgggaataaaatgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactgaattttattcccgggta 28311800  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  28311801 taaaatgttcctgggaatagaaaatctttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccgtggagatgggaataaattcataaatag-ttacctattata 28311899  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311900 atccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 28311999  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28312000 gttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 28312042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 717 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 41750599 - 41750276
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  41750599 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttg 41750500  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41750499 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt 41750400  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41750399 ataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatatttcaagg 41750300  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  41750299 aatgttattcctaggaataaattt 41750276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 720 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 37233496 - 37233155
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37233496 gtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgggaataaaatgataggaacatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 37233397  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  37233396 taaaatgttcctgggaatagaaaatcgttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatag-ttacctattata 37233298  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37233297 atccttattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 37233198  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37233197 gttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 37233155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Original strand, 40950856 - 40951208
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40950856 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatatatatgcttatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 40950955  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  40950956 cttggtataaaatgttcctgggaatacaaaaaaatttccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 40951055  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40951056 tattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattttcatctttatattcc 40951155  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  40951156 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacataccct 40951208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 720 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 638660 - 638318
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  638660 gtgtttgtttcaagttataattgttgatttccggaaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaggtttactaaattttatttccgggta 638561  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  638560 taaaatgttcctaggaatataaaaaatttcccaaggaaaaggg-gggaataaagttctcatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattata 638462  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  638461 atccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 638362  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | || || ||||||||||    
T  638361 gttattcctaggaataaatttggtaaacttaaatcaaacacacc 638318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 710 - 1039
Target Start/End: Original strand, 34356694 - 34357022
Alignment:
Q  710 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34356694 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaatttta 34356793  T
Q  810 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttt 909  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  34356794 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccacgga-atgggaataaattcataaataattt 34356892  T
Q  910 acttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 1008  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34356893 tcctattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaatttcttggaataaaattcctatc-ttatat 34356991  T
Q  1009 tccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34356992 tccaaggaatgctattcctaagaataaattt 34357022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 721 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 26310335 - 26309993
Alignment:
Q  721 tgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctat--gtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||    
T  26310335 tgtttgtttaaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatatgtttgttagaagtttattaaaatttattccttggt 26310236  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26310235 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat 26310136  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26310135 aatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaccatatttttcctaaatttcttgtaataaaattcccatctttatattccaaggaa 26310036  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    || |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  26310035 tgctattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 26309993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 714 - 1063
Target Start/End: Original strand, 20426481 - 20426830
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20426481 tagggtgtgtttgtttcaaattatatttgttgattcccgggaataaaatgataggaatttatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatccc 20426580  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |    
T  20426581 cggatataaaatgttcctgggaatagaaaatttttcccaaggaaaagggtgagaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatag-ttacct 20426679  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20426680 attataatctctatttttatggttggtaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatacattgaaataaaattcccatctttatattcca 20426779  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  20426780 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaactttaaacaaacacaccc 20426830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 715 - 1011
Target Start/End: Original strand, 39995130 - 39995435
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39995130 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 39995229  T
Q  815 gggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 906  Q
    || |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39995230 ggatataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag 39995329  T
Q  907 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 1005  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39995330 tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaatttccatcttta 39995429  T
Q  1006 tattcc 1011  Q
    ||||||    
T  39995430 tattcc 39995435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 715 - 1056
Target Start/End: Complemental strand, 45409322 - 45408981
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  45409322 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccaagtataaaatgataggaatgtatatgcctatgttttttacaagtttactaaattttattacc 45409223  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||    
T  45409222 gggtataaaatattcatgggaatagaaaaatttacccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatag-ttaccta 45409124  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45409123 ttataatccttatttttatggttcctagaaatattataaatttaatcaaacatatttttgctaaataccttggaataaaattctcatctttatattccaa 45409024  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa 1056  Q
      ||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||    
T  45409023 taaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaa 45408981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 715 - 1056
Target Start/End: Original strand, 27357962 - 27358303
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357962 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccaggtataaaatgatagggatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 27358061  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||    
T  27358062 aggtataaaatattcatgggaatagaaaaatttacccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattcataaatag-ttaccta 27358160  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27358161 ttataatccttatttttatggttcctaggaatattataaatttaatcaaacatatttttgctaaataccttgaaataaaattctcatctttatattccaa 27358260  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa 1056  Q
      ||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||    
T  27358261 taaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaa 27358303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 719 - 1064
Target Start/End: Original strand, 18713660 - 18714005
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713660 tgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcatggtaataaaatgatataaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 18713759  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||| | || ||||||    
T  18713760 ataaaatgttcttggtaataaaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaatttatacgtag-taacctattat 18713858  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18713859 aaaccctatttttatggttcataggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatatcttggaataatattctcatctttatattccaaggaa 18713958  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||   ||||| ||||||||||||    
T  18713959 tgttattcctataaataaatttggtaagcttgaatcaaacacaccct 18714005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 785 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 23944165 - 23943885
Alignment:
Q  785 tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggag 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23944165 tttgttacaagtttactaaattttattctcggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaacgaaaagggtgggaataaagttcccatggag 23944066  T
Q  885 atgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattcct 983  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  23944065 atgagaataaattcataaataatttacctattataatctttatttttatggttcctaggaatattataaaggtaaccaaacatattttttctaaattctt 23943966  T
Q  984 tggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  23943965 tacaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 23943885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 816 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 13760938 - 13760692
Alignment:
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13760938 ggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 13760839  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13760838 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 13760739  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  13760738 gaatgttattcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacac 13760692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 722 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 3902521 - 3902182
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  3902521 gtttgtttcaagttatatttgttctttcctgagaataaaatgatagaaatatatagacatatgtttgttacaagtttactaaattttattctcaggttta 3902422  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  3902421 aaatgttcctgggaatagaaaaaaattcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccttggagatgagaataaattcatatatag-ttacctattataat 3902323  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgt 1020  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3902322 ccctatttttatggttcctgtgaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatatcttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgt 3902223  T
Q  1021 tattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  3902222 tattcctaaaaataaatatggtaaacttgaaacaaacacac 3902182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 713 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 45694262 - 45693915
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45694262 ttagggtgcgtttgtttcaagttatattcgtagatttctgggaataaaatgataggaatacacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 45694163  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | || ||| |     
T  45694162 ccgggtataaaacgttcatgggaatagaaaatttttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaattcatgagtaatttgc- 45694064  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||  ||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45694063 aattataattcctatttttatggttcccaggaatattataatgttaagcaaacatttttttttaaaatgccttggaataaaattctcatctttatgttcc 45693964  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  45693963 aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 45693915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 720 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 14832877 - 14832536
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14832877 gtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctaggaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttaaaagtttactaaattttattcccaggta 14832778  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||  || ||| | |||||||    
T  14832777 taaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaaagaaaagggtgggaataaagttctcattgagatgagaataaatttatacgtaattt-cctattata 14832679  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  14832678 atccttatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaatatctaggaataaaattatcatctttatattttaaggaat 14832579  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||| |   ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14832578 gttattcttggaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 14832536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 716 - 1025
Target Start/End: Complemental strand, 1988382 - 1988073
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1988382 gggtgtgtttgtttgaagttatatttgttgatttctgggaataaaatgatagaaatatacatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccg 1988283  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||| |||| |||    
T  1988282 gatataaaatgttcttgggaatagaaaaattttctcaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcttatatag-ttacctat 1988184  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  1988183 tataatccctatttttttggttccaaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcccaaaaatcttggaataaaattctcatatttatattctaag 1988084  T
Q  1015 gaatgttattc 1025  Q
    |||||||||||    
T  1988083 gaatgttattc 1988073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 710 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 40570097 - 40569740
Alignment:
Q  710 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta 809  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||  || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40570097 atctaagggtgtgtttgtttcaagttataattgtagattcctgggaataaaatcataaaaacatacatgcctatgtttgttacaagtttgttaaatttta 40569998  T
Q  810 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaata---aagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 906  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||     
T  40569997 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatttttcccaaagaaaatggtgggaataaagaagttcccatggaaatgggaataaaatcatgtata- 40569899  T
Q  907 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 1005  Q
     |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||| | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||  ||| | ||    
T  40569898 attacctattataatccctatttttgaggttccttggaacattataatgttaaccaaacatcttttttctaaataccttggaataaaatttacatatata 40569799  T
Q  1006 tattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  40569798 tattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 40569740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 715 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 39819768 - 39819414
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||| ||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39819768 agggcgtgtttgtttcaagttatatttgtagattcctgaaaataaaatcatgaaaatacatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttcattccc 39819669  T
Q  815 gggtataaaat---gttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaata---gtt 908  Q
    ||||||| |||   |||||||||||| ||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||| | ||| ||    |||    
T  39819668 gggtatataataatgttcctgggaattgaaaaaaatttccaaagaaaatggtgggaataaagttctcatgaagatgagagtaaaattatatatgtttgtt 39819569  T
Q  909 tacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 1007  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39819568 tacctaatataatccttatttttaaggttccttggaatattataaagtcaaccaaacatattttttctaaatacctgggaataaaatttccatctttata 39819469  T
Q  1008 ttccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  39819468 ttccaaagaatgttattcctatgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacacc 39819414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 715 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 6571759 - 6571602
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6571759 agggtgtatttgtttaaagttatatttgttgatttccggaaataaaatgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 6571660  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6571659 aggtataaaatgttccggggaatataaaaaatttcccaagaaaaagggtaggaataaa 6571602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 7007647 - 7007307
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| | ||| ||| || | ||||||  |||||||||||||||||||| |     
T  7007647 ttagggtgtgtttatttcaagttatatttgttgattcttggggataaaatgatggaaatatatttgtcaatgtttcatacaagtttactaaattttact- 7007549  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
            ||||||||  ||  |||| |||||  |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||     
T  7007548 --------aaaatgttattgataataaaaaaa--ttcccaaagaaaatggtgggaataaaattaccatggagatgagaataaattcatatgtagtt-acc 7007460  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  7007459 tattatactccctattttaatggttcttaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatactttagaataaaattctcatctttatatttc 7007360  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  7007359 aagaaatgttattcctaataataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccct 7007307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 713 - 1062
Target Start/End: Original strand, 5002834 - 5003182
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   |||||||||||||| | | || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  5002834 ttagggtgcgtttgtttcaagttatatttgtagatttctaagaataaaatgatagaagtatacatgcatatatttgttacaagtttgctaaattttatt- 5002932  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||  || | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||  |||||||   ||   |||     
T  5002933 ccaagtataaaatgtttctgggaatagaaaaaaaattccaaagaatatggtgggaataaagtttccatgaagatatgaatcaattcatgtgta-actacc 5003031  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   |||| || || | |||||||||||  |||  | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5003032 tattataatccatatttttatggttcctgaaaatattaaaatgttaaccaaacatcttttatccaaataccttggaataaaattcgcatctttatattcc 5003131  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  5003132 aaggaatgttattcctataaataaatttggtaaattttaaacaaacacacc 5003182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 718 - 923
Target Start/End: Original strand, 11763374 - 11763577
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
T  11763374 gtgtgttt-tttcaagttatatttgttgtttttcgggaatgaaatgataggaatatatatgtctatgtttgttataaatttactaaattttattctcgga 11763472  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  11763473 cataaaatatttctgggaatagaaaaaatttccaaaggaaaaaggtgggaataaagtttccatgaagatgagaataaattcataaatag-ttacctatta 11763571  T
Q  918 taatcc 923  Q
    ||||||    
T  11763572 taatcc 11763577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 714 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 4875848 - 4875523
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||   || ||||||||||||| |||  || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  4875848 tagggtgcgtttgttttaagttatatttgtagctttttggaaataaaatgatagaaataaatttgtttatgtttgttacaagtttgctaaattttatttt 4875749  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    |   ||||||| ||||  | ||||| ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  || || || |    
T  4875748 caa-tataaaacgttctcgagaataaaaaaaaaatcccaaagaaacgggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaattcatatgtaatt-acat 4875651  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttc-ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||  ||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4875650 attataatccctatttttatggttcctcggcatattataatgttaagaaaacatatttttttctaaatacattggaataaaattcacatctttatattcc 4875551  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  4875550 aaagaatattattcctaagaataaattt 4875523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 731 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 14253578 - 14253412
Alignment:
Q  731 aagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 830  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  14253578 aagttatatttgttgattctcgggaataaaatgatagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttta 14253479  T
Q  831 tgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaatt 897  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||    
T  14253478 tgggaatagaaaaaatttctcaaagaaaagggtgtgaataaaattttcatgaagatgagaataaatt 14253412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 910 - 1052
Target Start/End: Original strand, 11763594 - 11763737
Alignment:
Q  910 acttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 1008  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11763594 acttattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaaattaatcaaacatattttttctagataccttggaataaaattctcatctttatat 11763693  T
Q  1009 tccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaa 1052  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  11763694 tccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaa 11763737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 715 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 25455096 - 25454939
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  25455096 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatacatatgtctatgtttgttacaagtttactaaatttcattctc 25454997  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| || |||||||||    
T  25454996 gagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaaaaaaatggagggaataaa 25454939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 781 - 1039
Target Start/End: Original strand, 41297983 - 41298238
Alignment:
Q  781 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccat 880  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | | |||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||    
T  41297983 tatgtatgttacaagtttattaaattttattcccggatataaaatgtttttagaaataaaaaaaatttcccaaagcaaagggtgtgaataaagttctcat 41298082  T
Q  881 ggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaat 979  Q
    | ||||| ||| | ||||||  |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||  ||||  |||||    
T  41298083 gaagatgagaatatattcatttata-attacctattataatctctattcttatggttccttggaatattataatgttaaacaaacatcttttttttaaat 41298181  T
Q  980 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
     |     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41298182 ac---aaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaaaataaattt 41298238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 908 - 1060
Target Start/End: Original strand, 3254284 - 3254437
Alignment:
Q  908 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  3254284 ttacttattataacccttatttttatggtttctaggaatattatgaagttaaccaaacatattttttctaaataccttagaataaaattctcatttttat 3254383  T
Q  1007 attccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  3254384 attccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca 3254437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 780 - 1056
Target Start/End: Complemental strand, 13539675 - 13539399
Alignment:
Q  780 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 879  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||   ||||||||||||||||||    
T  13539675 ctatgtttgttacaaatttattaaattttattcgcaggtataaaatgtttatgggaatggaaaaaatttctcacagaaactagtgggaataaagttccca 13539576  T
Q  880 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaa 978  Q
    || | ||||||| | ||||||   ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||| | ||| |||||||  |||| |||||    
T  13539575 tgaacatgggaatagattcatgtgta-attatctattataatccttatttttatggtttctgagaatactataatgttaagcaaacatcttttttctaaa 13539477  T
Q  979 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa 1056  Q
    |   || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  | || ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13539476 tattttagaataaaattctcatctttatgttccaagaaatgttatcaccaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaa 13539399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 855 - 1058
Target Start/End: Complemental strand, 13790222 - 13790018
Alignment:
Q  855 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata-aatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataa 952  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  13790222 aaaaacggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaaatcatgtaata--ttacctattataatccctatttttaaggttccttggaatattataa 13790125  T
Q  953 agctaaccaaacataattttcct-aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaa 1051  Q
     | ||| |||||||  ||||  | |||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  || | |||||    
T  13790124 tgttaatcaaacatctttttttttaaataccttagaataaaatttacatctatatatttcaaggaatgttattcctacaaataaatttgataaacttgaa 13790025  T
Q  1052 acaaaca 1058  Q
    |||||||    
T  13790024 acaaaca 13790018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 716 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 25725097 - 25724925
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa-ttttattccc 814  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||   ||||  ||||| |||||||||| |||   ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |     
T  25725097 gggtgcgtttgtttcaagttatctttggaaattcttgggaacaaaatgatagaaatacgtattcctatgtttgttgcaggtttattaaaattttattgct 25724998  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatg 887  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25724997 gggtataaaatgtttctgggaatagaaaaagtttcccaaagaaaagggtgggaataaagttctcatgaagatg 25724925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 715 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 1623454 - 1623206
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||   || |||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1623454 agggtatgtttgttttaaattatatttgttgattcctaagagtaaaataatagaaatatatatgtctatgtt-gttacgagtttattaaatttgattccc 1623356  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    || ||||||||||||||| | | ||| ||| ||| ||||  || | || |||||||||||| | ||| | ||| ||| |||||||||  ||| ||||  |    
T  1623355 ggttataaaatgttcctgagtacagagaaatttttccaaagaacatggcgggaataaagtttcaatgaatatgagaataaattcatatgtag-ttaccaa 1623257  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaat-atataaagctaaccaaac 964  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  1623256 ttataatctctatttttatggttcctacgaataatataaagttaatcaaac 1623206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Original strand, 8868664 - 8868834
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||| |||||| |||  |||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||      
T  8868664 gggtgcgtttgtttcaagttatt-ttgtagattcctaggaataaattgatagaaatacatattcttatgtttgttacaggattagtaaattttattccta 8868762  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatggg 889  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8868763 ggtagaaaatgttcctggg-atag-gaatatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatggg 8868834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 718 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 24499509 - 24499400
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  24499509 gtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcatagaaataaaatgatagaaatatatat--ctatgtttgttataagtttactaaattttattccatgg 24499412  T
Q  818 tataaaatgttc 829  Q
    ||||||||||||    
T  24499411 tataaaatgttc 24499400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 715 - 832
Target Start/End: Original strand, 14403232 - 14403349
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  14403232 agggtgtgtttgtttgaagttgtatttgttgattcctggaaataaaatgataaaaatatacatgcctacatttattacaagtttaataaattttattctc 14403331  T
Q  815 gggtataaaatgttcctg 832  Q
     |||||||||||||||||    
T  14403332 aggtataaaatgttcctg 14403349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 949 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 1623188 - 1623078
Alignment:
Q  949 ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacattt 1048  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||    
T  1623188 ataaagttaaccaaacatatattttctaaatac-ttgaaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattactaggaataaatttagtaaaatt 1623090  T
Q  1049 gaaacaaacaca 1060  Q
    ||||||||||||    
T  1623089 gaaacaaacaca 1623078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 755 - 1023
Target Start/End: Complemental strand, 4685211 - 4684945
Alignment:
Q  755 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtt-cctgggaatagaaaaaatttcc-ca 852  Q
    ||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| || |||| ||||||||||| | | |||||||| ||| ||||| |||||||||||      ||    
T  4685211 aataaaatgatagaaatatacatgtttatgtttgttataaatttattaaattttatttcagagtataaaacgtttcctggcaatagaaaaaaaaaaatca 4685112  T
Q  853 agaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatatataa 952  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||    || ||||||||| | ||||||||||| ||| | ||   |||||    
T  4685111 aagaaaagggtgtgaataaagttcccatgaagatgggaacaaattcatgtgta----acctattataattcatatttttatggatccgaagatattataa 4685016  T
Q  953 agctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat 1023  Q
     | ||| |||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  4685015 tgttaagcaaatatatttttactaaatacctaggaataaaattctcatctttatgttctaaagaatgttat 4684945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 719 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 13761013 - 13760941
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgtta 791  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  13761013 tgtgtttgtttcaagttataattattgattttcgggaataaaatgataggaatatatgtacctatgtttgtta 13760941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 715 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 37851930 - 37851744
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | || |||| | |  ||||||||||||| ||| ||  | | |||||||| || ||||||||||| |||||||  |    
T  37851930 agggtgggtttgtttcaagtaatattcgtagatttctgaaaataaaatgatagaaatataccttcttatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttc 37851832  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaa---aaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcat 900  Q
    |||||||||||||| || |||||||||   |||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  37851831 gggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattccaaag-aaaatggtgagaataaagttcccatgaagatgagaataaattcat 37851744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 795 - 897
Target Start/End: Original strand, 3254142 - 3254245
Alignment:
Q  795 gtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaa 893  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  3254142 gtttactaaattttattctcgcgtacaaaatgtttctgggaatagaaaattttttcccaaaggaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgagaata 3254241  T
Q  894 aatt 897  Q
    ||||    
T  3254242 aatt 3254245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 987 - 1058
Target Start/End: Complemental strand, 14253325 - 14253254
Alignment:
Q  987 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaaca 1058  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  14253325 aataaaattctcatccttatattccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaatttaaaacaaaca 14253254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 755 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 25625418 - 25625290
Alignment:
Q  755 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa--tttccca 852  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  |||   |    
T  25625418 aataaaatgatagaaatatgaatgtctaggtttgttgcaaatttactagattttattctgaggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaatttgaaa 25625319  T
Q  853 agaaaaagggtgggaataaagttcccatg 881  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25625318 aaaaaaaaggtgggaataaagttctcatg 25625290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1056
Target Start/End: Complemental strand, 2521434 - 2521381
Alignment:
Q  1003 ttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa 1056  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  2521434 ttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaa 2521381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 713 - 812
Target Start/End: Original strand, 1723225 - 1723324
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||  |||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1723225 ttagagtgtgtttgtttcaagttatgtttgtatatttccatgaataaaatgatggaaatatacatttcaatgtttgttacaagtttattaaattttattc 1723324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 787 - 897
Target Start/End: Original strand, 516463 - 516572
Alignment:
Q  787 tgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagat 886  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  516463 tgttataattttagtaaattttatttctgggtataaaatgtttttgggaatataaaaaaattccaaag-aaaatggtgagaataaaattcccgtgaagat 516561  T
Q  887 gggaaaaaatt 897  Q
    | ||| |||||    
T  516562 gagaataaatt 516572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1004 - 1057
Target Start/End: Original strand, 36590862 - 36590915
Alignment:
Q  1004 tatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||    
T  36590862 tatattccaacgaatgttattcctaaaaataaatttagtaaacttaaaacaaac 36590915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 983 - 1056
Target Start/End: Complemental strand, 45212735 - 45212662
Alignment:
Q  983 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa 1056  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||  || |||| |||||||    
T  45212735 ttggaataaaattctcatctttacatttcaaagaatgtaattcctaaaaataaatttgataaatttaaaacaaa 45212662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 928 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 14253413 - 14253340
Alignment:
Q  928 ttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccat 1000  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  14253413 ttttatgtttcctaaaaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatattttggaataaaatttccat 14253340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 202000 - 201648
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202000 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 201901  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  201900 tccgggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttac 201801  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  201800 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattcccatctttatattcc 201701  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  201700 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 201648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 722 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 143678 - 143342
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  143678 gtttgtttcaagttaaatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatata 143579  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  143578 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataat 143480  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaat-aaaattcccatctttatattccaaggaatg 1019  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  143479 ccctaattttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatg 143380  T
Q  1020 ttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  143379 ttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 143342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 752 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 119355 - 119070
Alignment:
Q  752 gggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc 851  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  119355 gggaatacaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcatgagtataaaatgttcctgggaatagaaaattttttcc 119256  T
Q  852 aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tat 950  Q
    ||  |||||||||| |||||||||  || | ||||| ||| ||| ||||   ||   ||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||    
T  119255 aaagaaaagggtggaaataaagttttcaggcagatgagaataaa-tcatgtgta-actacctattataatccctattcttaaggttccggggaatattat 119158  T
Q  951 aaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    |  | | ||||||||   |||| ||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  119157 agtgttcaccaaacaccttttttctaaatatc-tgaaataaaattcacatctttatattccaatgaatgttatttttaagaataaattt 119070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 710 - 1064
Target Start/End: Original strand, 4765554 - 4765909
Alignment:
Q  710 atcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta 809  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4765554 atctaagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaatttta 4765653  T
Q  810 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttt 909  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4765654 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttt 4765753  T
Q  910 acttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 1008  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4765754 acctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatat 4765853  T
Q  1009 tccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  4765854 tccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 4765909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Original strand, 22935909 - 22936261
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22935909 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattc 22936008  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  22936009 ccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 22936108  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22936109 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 22936208  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  22936209 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 22936261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 714 - 1060
Target Start/End: Original strand, 19065503 - 19065850
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19065503 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttc 19065602  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19065603 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 19065702  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19065703 attataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatattttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 19065802  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  19065803 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 19065850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 29543014 - 29543364
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29543014 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 29543113  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29543114 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttaccta 29543213  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29543214 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 29543313  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  29543314 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 29543364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 715 - 1074
Target Start/End: Complemental strand, 18412281 - 18411921
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18412281 agggtgtgtttgtttcaagttataattattgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 18412182  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18412181 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaaggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttaccta 18412082  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18412081 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 18411982  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccctgagtattatt 1074  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18411981 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaagttttatt 18411921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 713 - 1071
Target Start/End: Complemental strand, 28602629 - 28602271
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28602629 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 28602530  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  28602529 ccgg-tataaaatgtttctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 28602431  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28602430 tattataatccctatttgtatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattcc 28602331  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccctgagtatt 1071  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  28602330 aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtatt 28602271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 737 - 1060
Target Start/End: Original strand, 8646412 - 8646735
Alignment:
Q  737 taattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaa 836  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8646412 taattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggttataaaatgttcctgggaa 8646511  T
Q  837 tagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggt 936  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8646512 tagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggt 8646611  T
Q  937 tcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaa 1036  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8646612 tcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaa 8646711  T
Q  1037 tttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  8646712 tttagtaaacttgaaacaaacaca 8646735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 719 - 1061
Target Start/End: Original strand, 11855658 - 11856001
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11855658 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggat 11855757  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11855758 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat 11855857  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11855858 aatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaa 11855957  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11855958 tgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 11856001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 12970529 - 12970879
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12970529 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 12970628  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12970629 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcttaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 12970728  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12970729 ttacaatccctatttttatggttcctatgaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 12970828  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  12970829 ggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 12970879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 715 - 1062
Target Start/End: Original strand, 555705 - 556053
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  555705 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 555804  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  555805 tggtataaaatgttccagggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 555904  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  555905 ttataatccctaatttgatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 556004  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  556005 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 556053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 14206820 - 14207170
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14206820 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 14206919  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14206920 tggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 14207019  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14207020 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttatattccaa 14207119  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  14207120 tgaatgttattcctaggaataaattttgtaaacttgaaacaaacacaccct 14207170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 720 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 6091782 - 6091437
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  6091782 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatataaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggta 6091683  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6091682 taaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaaggaaaagagtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattata 6091583  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6091582 attcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaat 6091483  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  6091482 gttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 6091437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 722 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 8406959 - 8406616
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8406959 gtttgtttcaagttataattgttgattttcgagaataaaatgataggaatgtacatgcctatatttgttacaagtttgctaaattttattcccgggtata 8406860  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8406859 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttttcctattataat 8406760  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgt 1020  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8406759 ccctatttttttggttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgt 8406660  T
Q  1021 tattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  8406659 tattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 8406616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 715 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 27481429 - 27481082
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27481429 agggtgtgtttgtttcaagttataatttttgatttttggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 27481330  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27481329 gggtataaaatattcctgagaataaaaaatatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaattcataaatagtttacata 27481230  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27481229 ttataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 27481130  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27481129 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 27481082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 718 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 32536006 - 32535659
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||    
T  32536006 gtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccaggaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttatttcttgg 32535907  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32535906 tataaaatgttattgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta 32535807  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32535806 taacccctatttttatggttcctgagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggattaaaattcccatctttatattccaagga 32535707  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  32535706 atgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 32535659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 716 - 1006
Target Start/End: Complemental strand, 36703945 - 36703654
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  36703945 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattatcgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctt 36703846  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  36703845 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 36703746  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36703745 tataatccctattttgatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattctcatctttat 36703654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 712 - 1061
Target Start/End: Original strand, 42012175 - 42012530
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42012175 cttagggtgtgtttgtttgaagctatatttgttgattctcgggaataaaatgatagaaatacatatgtctatgtttgttacaaatttactaaattttatt 42012274  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| || |||| ||||    
T  42012275 ctcgagtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttccgaaggaaaagggtgggaataaagttcacatggagatcagaataaattcttatatag-ttac 42012373  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaacca----aa--cataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt 1004  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| || || | |    ||  |||| |||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  42012374 ctattataatccatatttttatggttccaaggagtattatatagttacctattataatccatattttttccaaataccttagaacaaaattcccatcttt 42012473  T
Q  1005 atattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
     ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42012474 ttattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 42012530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 727 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 27481069 - 27480735
Alignment:
Q  727 tttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatg 826  Q
    |||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27481069 tttcaagttatatttgttgatttttgagaataaaatgataggaatatgtatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgtgtataaaatg 27480970  T
Q  827 ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatcccta 926  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||  |||    
T  27480969 ttcatgggaatagaaaattttttccaaggaaaa-ggtgagaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatag-ctacctattataatttcta 27480872  T
Q  927 tttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc 1025  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  27480871 tttttatggttcatagaaatattataaagttaaccaagcatattttttctaaataccttgaaataaaattctcatctttatatttcaagaaatattattc 27480772  T
Q  1026 ctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||| ||||||||| ||| | || ||| |||||||||    
T  27480771 ctaaaaataaatttggtaaacttaaaataaacacacc 27480735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 718 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 20962659 - 20962373
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20962659 gtgtgtttgtttcaagttatattcgtagattcttgggaataaaatgataggaatacacgtgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgga 20962560  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| || | || ||| | |||||    
T  20962559 tataaaacgtttctgggaatagaaaatttttcccaaggaaaagggtgggagtaaagttctcatggagatgagaataaattaatgagtaattt-cctatta 20962461  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt 1004  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| | ||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20962460 taattcctatttttatggttcccagaaatattataatgttaagcaaacatattttttttaaatgccttggaataaaattcccatcttt 20962373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 763 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 1664754 - 1664456
Alignment:
Q  763 gataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaaggg 862  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  ||| |||    
T  1664754 gatagaaatctatatgcttatgtttgttacaaattgactaaattttattaccagctataaaatgttcctgagaatagaaattttttcccaaagaaacggg 1664655  T
Q  863 tgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaacca 961  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  1664654 tgggaattaaattcccatggagatgagaataaatttatatgtag-ttacctattataatccctatttttatggttcataagaatattataaagttaacca 1664556  T
Q  962 aacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||  | |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  1664555 aacatattttttctaaataccttgaaataaaattctcatctttatatttcaagaaatattattctcaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 1664456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 717 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 6930714 - 6930364
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatat----gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    |  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6930714 ggtgtgtttatttcaagttatatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatatatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattt 6930615  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
     ||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||  |||||  ||    
T  6930614 tcggatataaaatattattgggaatagaaaaa-tttcccaaagaaaattgtgggaataaagttcccatgaagatggaaataaatttatatctagttatct 6930516  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
     ||||||||| |||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||| |    
T  6930515 -attataatctctatctgtaaggtttctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttttaaataccttaaaataaaattctcatcttgatatttc 6930417  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  || | || |||||||||||||||    
T  6930416 aaggaatgttattcatatgaataaatttgataaacttaaaacaaacacaccct 6930364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 716 - 1064
Target Start/End: Original strand, 43346895 - 43347243
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||| |||  |||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43346895 gggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagattcctgaaaataaaatcataaaaatacatatgtatgtgtttgttacaagtttactaaattttattccca 43346994  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||   ||  |||| |||    
T  43346995 ggtataaattgtttctggcaatagaaaagtttttccaatgaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaaattatgcgta-attacctat 43347093  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| || |  | ||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  43347094 tttaatccctatttttaaggttccttcgaatattacattgttaaccaaactttttttttctaaataccttagaataaacttctcatctttatattccaat 43347193  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||    
T  43347194 aaatgttattcctaagaataaatttcgaaaacttgaaacaaacacaccct 43347243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 912 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 36703657 - 36703506
Alignment:
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  36703657 ttattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttaaattc 36703558  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36703557 caaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacacc 36703506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 745 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 17251854 - 17251536
Alignment:
Q  745 gattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaa 844  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17251854 gattcctgagaataaaatgatagaaatatacatgtttatgtttgttataattttactaaattttattctcgagtataaaatgttcatgataatagaaaaa 17251755  T
Q  845 atttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctagga 944  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||   ||   ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17251754 atttcccaaagaaaatgatgggaataaagtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-actatatattataatccctatttttatggtt-ctagga 17251657  T
Q  945 ata-tataaagctaaccaaacataatttt-cctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagt 1042  Q
    ||| || || | |||||||||||  ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||    
T  17251656 atattaaaatgttaaccaaacatctttttatctaaataccttggaaaaaaattcctatccttatattccaagaaatgttatt-gtaggaataaatttggt 17251558  T
Q  1043 acatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  17251557 aaatttgaaacaaacacaccct 17251536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 718 - 1064
Target Start/End: Original strand, 26637045 - 26637370
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||        
T  26637045 gtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattaatgggaataaaatgatagaattatatatgtctatatttgttacaagtttactaaattttattcc---- 26637140  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
                 ||| |||||||||||||||  |   |||||||||     |||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |  ||  | || |||||    
T  26637141 -------------tggaaatagaaaaaatttctgagagaaaagggtg-----aaagttcctatggatatgagaataaattcaaatgtaact-acctatta 26637221  T
Q  918 taatccctattttt-atggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26637222 taatccatattttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacacattttttctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 26637321  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || | |||||| |||||||||||    
T  26637322 aatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaataaacacaccct 26637370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 755 - 1060
Target Start/End: Original strand, 31583102 - 31583404
Alignment:
Q  755 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 854  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||     
T  31583102 aataaaacgatagaaatatat-tgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaacgttcccaggaatagaaaaaattttccaaa 31583200  T
Q  855 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaa 953  Q
     |||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||     
T  31583201 gaaaaaggtgggaataaagttcccacaaagat-ggaaataattcatatgta-agtacctattataatccctatttttacggttcctgagaatattataat 31583298  T
Q  954 gctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaac 1053  Q
    | ||| | || ||  |||| ||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| | || ||||    
T  31583299 gttaaaccaatat-ttttttctaaatatcttgaaataatatttccatctttatgtttcaaagaatgttattcgtagaaataaatttagtaaacttaaaac 31583397  T
Q  1054 aaacaca 1060  Q
    |||||||    
T  31583398 aaacaca 31583404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 722 - 1039
Target Start/End: Original strand, 35348534 - 35348849
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  35348534 gtttgtttcaa-ttataatcgtagattttcgggaataaaaagatag-aatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattgtatttt-gggtata 35348630  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||  |||| |||||||||    
T  35348631 aaatgtttttgggaatagaaaat-tttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaattcacatgta-attacctattataat 35348728  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca--taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
     | |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||  |||||  |  |||| ||  || ||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  35348729 tcatatttttatggttcccgggaatattataatgttaaaaaaacattttttttttctgtataccttaaaataaaattctcatctttatgttccaatgaat 35348828  T
Q  1019 gttattcctaagaataaattt 1039  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  35348829 gttattcttaagaataaattt 35348849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 713 - 891
Target Start/End: Original strand, 40275751 - 40275930
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgttt-caagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||   ||||||||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40275751 ttagggtgtgttttttttcaagttatatttgtagatttttgggaataaaattataaaaatacatatgtctatgtttgttacaagtttgctaaattttatt 40275850  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaa 891  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40275851 cccagatatgaaatattcctgggaatagaaaagttttcccaaagaaaatgatgggaataaagttcccatgaagatgggaa 40275930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 720 - 900
Target Start/End: Original strand, 41783624 - 41783805
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    |||||| |||||||||||| || | |||||  |||| |||||| |||  |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  41783624 gtgtttatttcaagttatatttatagattcttgggattaaaatcataaaaatgtacacgcatatgtttgttataagtttactaaattttattctcggata 41783723  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcat 900  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||   | | |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||    
T  41783724 taaaatgtttctgaaaatagaaaaaagaattcaaagaaaaaggttgggaataaagtttccataaagatgtgaacaaattcat 41783805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 723 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 30899618 - 30899470
Alignment:
Q  723 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 822  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||  |||| ||| |||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  30899618 tttgtttcaagttatattcgtagattcctaggaacaaa-tgatattaatatacatgcttatgtatgttacaagttttctaaattttattcctggatataa 30899520  T
Q  823 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  30899519 aatattcttgggaatagaaacaattttccaaagaaaagggtgagaataaa 30899470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 717 - 888
Target Start/End: Original strand, 19089718 - 19089889
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||  ||||| ||||||||||  |||| ||| |  |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |     
T  19089718 ggtgcgtttgttttaagttatattcgtaaattcctgggaataaaaaaatagaaatatgcatgtttatgtttgttataagtttattaaattttattcttga 19089817  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgg 888  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  19089818 gtataaaacgtttttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatgatgggtataaagttctcatgaagatgg 19089889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 983 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 28429531 - 28429450
Alignment:
Q  983 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28429531 ttggaataaaattcacatctttatatttcaaggaatgttatttctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 28429450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 986 - 1058
Target Start/End: Original strand, 16720957 - 16721029
Alignment:
Q  986 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaaca 1058  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16720957 gaataaaattcacatttttatattccaatgaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 16721029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 715 - 861
Target Start/End: Original strand, 16720212 - 16720356
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||   ||||||| |||||| ||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  16720212 agggtgtgtttgtttcatgttatattcgtagattcctatgaataaa-tgatagaaatatacatacatatgtttgttgcaagtttactaaattttattatc 16720310  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagg 861  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  16720311 gggtataaaatatt-tttggaatagaacaattttcccaaaaaaaagg 16720356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 717 - 877
Target Start/End: Original strand, 15200547 - 15200704
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | ||||   |  ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| | |    
T  15200547 ggtgcgtttgtttcaagttatatttatagatttttgaaaataaaatgatataaatatatatgtctatgtttgttataaatttattaaattttattctcag 15200646  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcc 877  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| ||||    
T  15200647 gcataaaatgtttctggg-atagaaaaaattcccaaagaaca--ggtgggaataaaattcc 15200704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 755 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 28429733 - 28429664
Alignment:
Q  755 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaa 824  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28429733 aataaaatgatagaaatatacatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgaatataaaa 28429664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 908 - 1064
Target Start/End: Original strand, 35602968 - 35603122
Alignment:
Q  908 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaa-gctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    |||| |||||||  || |||||||| ||||||| |||||||  ||| | |||||||||||  ||||  ||||| | || |||||||||| | ||||||||    
T  35602968 ttacctattatataccatatttttaaggttccttggaatattaaaatgttaaccaaacattttttt--taaatactttagaataaaatttctatctttat 35603065  T
Q  1007 attccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  35603066 attccaaaaaatgttattcctaaaaat-aatttggtacacttgaaccaaacacaccct 35603122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 717 - 845
Target Start/End: Original strand, 3913201 - 3913327
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||| |||| |||||||||||| | || |||||  |||||||||| ||||| ||| || |||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |    
T  3913201 ggtgcgtttatttcaagttatattcgtagattcttgggaataaaacgatagaaatatacatgtgtatgtttattacaaatttactaaattttatt-ccag 3913299  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 845  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  3913300 gtataaaatgtt-ttaggaatagaaaaaa 3913327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 998 - 1062
Target Start/End: Original strand, 40276524 - 40276587
Alignment:
Q  998 catctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40276524 catctttatattc-aaggaatgttattaccaagaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 40276587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 780 - 875
Target Start/End: Complemental strand, 28023840 - 28023745
Alignment:
Q  780 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagtt 875  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  28023840 ctatatttgttacaagttcattaaattttattctcacatataaaatgtgtttgggaatagaaaaaatttctcaaacaaaagggtgagaataaagtt 28023745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 990 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 20962356 - 20962286
Alignment:
Q  990 aaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | || |||||||||||    
T  20962356 aaaatttccatctttatgttccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttaaaacaaacaca 20962286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 987 - 1060
Target Start/End: Original strand, 36978405 - 36978478
Alignment:
Q  987 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  36978405 aataaaattctcatatttatattctaaagaatgttattcctataaataaatttaataaacttgaaacaaacaca 36978478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 717 - 828
Target Start/End: Original strand, 35602824 - 35602935
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    |||| ||||| | |  |||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  35602824 ggtgtgtttgtttgaagttatatttgtagatttttcggaaaaaaatcagaaaaatgcatatgcatatatttgttacaagtttattaaattttatttccga 35602923  T
Q  817 gtataaaatgtt 828  Q
    | ||||||||||    
T  35602924 ggataaaatgtt 35602935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 755 - 814
Target Start/End: Original strand, 36978210 - 36978269
Alignment:
Q  755 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  36978210 aataaaatgatagaaatatatatgtctatgtttgttacaaacttacaaaattttattccc 36978269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 925 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 30899463 - 30899327
Alignment:
Q  925 tatttttatggttcctaggaatata-taaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta- 1022  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||     
T  30899463 tatttttaaggttcgtgagaatataataaagttaaccaaacatcttttttctaaatacattg-aataaatttctcatctttatatttcaaaaaatgttat 30899365  T
Q  1023 ttcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  30899364 ttcttaacaataaattttgtaaacttgaaacaaacaca 30899327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 27901760 - 27901706
Alignment:
Q  985 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  27901760 ggaataaaattcatatctttatattctaaagaatgttgttcttaagaataaattt 27901706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 754 - 811
Target Start/End: Original strand, 830058 - 830115
Alignment:
Q  754 gaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  830058 gaataaaaagatatcaatatatatgaatatgtttgttacaagtttattaaattttatt 830115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 299; Significance: 1e-167; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 714 - 1063
Target Start/End: Original strand, 35488187 - 35488537
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35488187 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 35488286  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35488287 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 35488386  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35488387 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 35488486  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  35488487 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 35488537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 708 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 45045705 - 45045352
Alignment:
Q  708 taatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattt 807  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45045705 taatcatagggtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattt 45045606  T
Q  808 tattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagt 907  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45045605 tatttccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagt 45045506  T
Q  908 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045505 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 45045406  T
Q  1007 attccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  45045405 attccaaggaatattattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 45045352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 11330067 - 11329715
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11330067 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 11329968  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11329967 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 11329868  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11329867 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc 11329768  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  11329767 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 11329715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 713 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 27248367 - 27248019
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248367 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 27248268  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27248267 ccaggtataaaatgttactgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 27248168  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27248167 tattataatccctatttttatagttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattct 27248068  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  27248067 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 27248019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 717 - 1064
Target Start/End: Original strand, 45265049 - 45265397
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45265049 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttatttccgg 45265148  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45265149 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctatt 45265248  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45265249 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 45265348  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  45265349 aatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 45265397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 33378917 - 33378556
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378917 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 33378818  T
Q  812 cccgggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaa 903  Q
    || ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33378817 cctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaa 33378718  T
Q  904 tagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatct 1002  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378717 tagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatct 33378618  T
Q  1003 ttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  33378617 ttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 33378556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 715 - 1063
Target Start/End: Original strand, 27213854 - 27214203
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27213854 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 27213953  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27213954 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttaccta 27214053  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27214054 ttataatccctgtttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 27214153  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27214154 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 27214203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 716 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 38544265 - 38543920
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38544265 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttattacaggtttactaaattttattcccg 38544166  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38544165 ggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttctcaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 38544066  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38544065 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttatattccaag 38543966  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtaca-tttgaaacaaacac 1059  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38543965 gaatgttattcctaagaataaatttagtaaactttgaaacaaacac 38543920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 717 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 43949315 - 43948967
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  43949315 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctta 43949216  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43949215 gtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctatt 43949116  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949115 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 43949016  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  43949015 aatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaatacaccct 43948967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 719 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 48341430 - 48341086
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  48341430 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgg-t 48341332  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48341331 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat 48341232  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48341231 aatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattccc-tctttatattccaaggaa 48341133  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  48341132 tgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 48341086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 716 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 44566116 - 44565767
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44566116 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccggaaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccg 44566017  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  44566016 ggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 44565917  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44565916 tataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaag 44565817  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  44565816 gaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 44565767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 715 - 1026
Target Start/End: Original strand, 8419588 - 8419900
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8419588 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattccc 8419687  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8419688 aggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 8419787  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419788 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaa 8419887  T
Q  1014 ggaatgttattcc 1026  Q
    |||||||||||||    
T  8419888 ggaatgttattcc 8419900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 715 - 1062
Target Start/End: Original strand, 27419223 - 27419571
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27419223 agggtgtgtttgtttcaagttataattgctgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 27419322  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27419323 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 27419422  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27419423 ttataatctctatttttatggtccctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaa 27419522  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  27419523 gaaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 27419571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 717 - 1062
Target Start/End: Original strand, 34930466 - 34930814
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaa-gttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgttt-gttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  34930466 ggtgtgtttgtttcaaagttataattgttgattcctgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgttttgttacaagtttactaaaatttattcct 34930565  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  34930566 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttatcta 34930665  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34930666 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 34930765  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  34930766 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 34930814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 715 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 39554255 - 39553929
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39554255 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 39554156  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39554155 tggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 39554056  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata-attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39554055 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaaaatattttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 39553956  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39553955 aggaatgttattactaagaataaattt 39553929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Original strand, 9946987 - 9947340
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9946987 ttagggtgtgtttgtttaaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 9947086  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  9947087 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagattaaattcataaatagtttacc 9947186  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata-attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9947187 tattacaatccctatttttatggttcctatgaatattataaagctaaccaaacatatttttttctacattccttggaataaaattcccatctttatatta 9947286  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  9947287 caaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 9947340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 720 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 45449009 - 45448665
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45449009 gtgtttgtttcaagttataatttttgattctcgggaataaaatgataggaatgtagatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 45448910  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  45448909 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatagagaggggaataaattcataaatagtttatctattata 45448810  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45448809 atccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttagaataaaattcccatctttatattccaaggaat 45448710  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  45448709 gttattcataggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 45448665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 48314196 - 48313844
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48314196 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttagaagtttactaaattttattc 48314097  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  48314096 ccggatataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaatttataaatagttttcc 48313997  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48313996 tattataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattcc 48313897  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  48313896 aagaaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 48313844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 716 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 40212960 - 40212657
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40212960 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcgcgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccgg 40212861  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  40212860 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttatctat 40212761  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40212760 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcctag 40212661  T
Q  1015 gaat 1018  Q
    ||||    
T  40212660 gaat 40212657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 259; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 25924636 - 25924986
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25924636 agggtatgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 25924735  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25924736 ttgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccccaggaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattcataaatagtttaccta 25924835  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25924836 ttataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 25924935  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  25924936 ggaatgttattcttaggaataaatttggtaaacatgaaacaaacacaccct 25924986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 712 - 1036
Target Start/End: Original strand, 9814214 - 9814535
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9814214 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatg----tgtttgttacaagtttactaaattttatt 9814309  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9814310 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttat 9814409  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  9814410 ctattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaatcaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattgtcatctttatattc 9814509  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaa 1036  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  9814510 caagaaatgttattcctaggaataaa 9814535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Original strand, 28904183 - 28904535
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28904183 ttagggtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccgagaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 28904282  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  28904283 cttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttataagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 28904382  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28904383 tattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattcc 28904482  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28904483 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 28904535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 715 - 1058
Target Start/End: Complemental strand, 25098141 - 25097796
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25098141 agggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattttcgggaataaaatgataggaatgtatatgcccatgtttgttacaagtttactaaattttatttcc 25098042  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25098041 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 25097942  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc-a 1012  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25097941 ttataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 25097842  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaaca 1058  Q
    |  ||| ||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||    
T  25097841 aaaaatattattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaaca 25097796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 720 - 1064
Target Start/End: Original strand, 38396370 - 38396714
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 819  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396370 gtgtttgttccaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattcccgggta 38396469  T
Q  820 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  38396470 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccacggagatgggaataaattcataaataattttcctattata 38396569  T
Q  920 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 1018  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  38396570 atccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatc-ttatattccaatgaat 38396668  T
Q  1019 gttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    | |||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  38396669 gctattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 38396714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 41632360 - 41632708
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41632360 cttaaggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgagaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttattacaagtttactaaaatttatt 41632459  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41632460 ccttggtataaaatgttcttaggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttac 41632559  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41632560 ctattataatccatatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 41632659  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
     |||||||||||||     |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  41632660 aaaggaatgttatt-----gaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 41632708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 714 - 1063
Target Start/End: Original strand, 48160589 - 48160921
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160589 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 48160688  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
                     |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  48160689 -----------------tgggaagagaaaaaatttcc-aaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacct 48160770  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160771 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 48160870  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48160871 aggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 48160921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 718 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 44820323 - 44819981
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||    
T  44820323 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattttcaggaataaaatgatagaaatgtatttgtatgtgtttgttacatgtttattaaaatttattccttgg 44820224  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44820223 tataaaatgttcctcggaacagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta 44820124  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  44820123 tagtccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaatatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattttaagga 44820024  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacac 1059  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  44820023 atgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 44819981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 709 - 948
Target Start/End: Original strand, 16825347 - 16825586
Alignment:
Q  709 aatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16825347 aatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttaattcctaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaattt 16825446  T
Q  809 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtt 908  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16825447 attccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtt 16825546  T
Q  909 tacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat 948  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825547 tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatat 16825586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 717 - 1060
Target Start/End: Original strand, 30685993 - 30686336
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||  ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30685993 ggtgtgtttgtttcaagttataattgtagattcgttggaataaaatcataaaaacatacatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 30686092  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30686093 gtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaaaggtgggaataaagttcctagggagatgggaataaattcataaatag-ttacttatt 30686191  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30686192 ataatcgctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttgcaataaaattttcatctttatattccaagg 30686291  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||||||||  |||||||||  || | || |||||||||||    
T  30686292 aatgttattcctagaaataaatttgataaacttaaaacaaacaca 30686336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 718 - 1060
Target Start/End: Original strand, 37534105 - 37534447
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||  ||  || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37534105 gtgtgtttgtttcatgttataattgtagattcctggaaataaaatcataaaaacatacatgcatatgtttgttacaagtttactaacttttatttccggg 37534204  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37534205 tataaaatatttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgtgaataaattcataaatag-ttacttatta 37534303  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1016  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37534304 taatccctattattatagttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttgaaataaaattctcatctttatattccaagga 37534403  T
Q  1017 atgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    |||||||| |||  |||||||||  || | ||||||||||||||    
T  37534404 atgttatttctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacaca 37534447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 715 - 1058
Target Start/End: Complemental strand, 18824218 - 18823890
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaa-tgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18824218 agggtgtgtttgtttcaagttgtatttgttgatttttgggaataaaatgatagaaaatatatatgcctatgtttgttacaagttcactaaattttattcc 18824119  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |    
T  18824118 cgggtataaaatgtttttgggaatagaaaaattttcccaaggaaaaaggtgggaataaagtt-ccatggagatgggaataaattcataaata-attacct 18824021  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||||||||               ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18824020 attataatccctat---------------gaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttagaataaaattctcatctttatattcca 18823936  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaaca 1058  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  18823935 aagaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 18823890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 719 - 1063
Target Start/End: Original strand, 6656476 - 6656819
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||    
T  6656476 tgtgtttgtttcaagttatatttgttgatttttggaaataaa-tgatatgaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattt-attttcgagt 6656573  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||    
T  6656574 ataaaatgtttctgggaatagaaaagttttcccaatgaaaaatatgggaataaagttcccatggagatgggaataaagtcataaatag-ttacctattat 6656672  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    ||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6656673 aatctatatttttttggttcttagaaatattataaagttaacaaaacatattttttccaaataccttggaataaaattctcatatttctattccaaggaa 6656772  T
Q  1018 tg-ttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  6656773 tgtttattcctaagaataaatttagtaaacttgaaagaaacacaccc 6656819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 709 - 938
Target Start/End: Original strand, 25045611 - 25045838
Alignment:
Q  709 aatcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25045611 aatcttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattctgggga-taaaaagataggaatatatatgcatatgtttgttacaagtttactaaatttt 25045709  T
Q  809 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtt 908  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  25045710 attcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcgtaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaata-at 25045808  T
Q  909 tacttattataatccctatttttatggttc 938  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  25045809 tacatattataatccatattttcatggttc 25045838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 766 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 45723170 - 45722881
Alignment:
Q  766 aggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgg 865  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45723170 aggaatatatatgcctatgtttgtcacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaagaaaaatggtgg 45723071  T
Q  866 gaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaac 964  Q
    |||||||||||||||| | || | || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  45723070 gaataaagttcccatgaaaatagaaataaattcataaatag-ttacctattataatccatatttttatgatttctaggaatattataaagttaattaaac 45722972  T
Q  965 ataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||| |||| |         |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||    
T  45722971 atattttttc---------tggaataaaatttccatctttatatttcaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaataaagacaccct 45722881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 713 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 11000777 - 11000552
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatat-gcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000777 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatatgttgattcctggaaataaaatgatataaatatatatagcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 11000678  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||   || |  |    
T  11000677 cccgggtataaaatattcttgggaatagaaaaattttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgcatatgagaataaattcatatgaag-tcgc 11000579  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttc 938  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  11000578 ctattataatccctatttttatggttc 11000552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 714 - 972
Target Start/End: Original strand, 41684020 - 41684278
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41684020 tagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgagaataatatgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttatttc 41684119  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||  || |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||  ||| |||| |    
T  41684120 cggatataagatgttcttgggaatagaaaattttgcccaaagaaaagagtgggaataaagttctcatggagatgaaaataaatttatatgtag-ttacct 41684218  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataatttt 972  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  41684219 attataatctctatttttatggttcctataaatattataaaattaaccaaacatattttt 41684278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 716 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 45440979 - 45440637
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatg-tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||  ||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45440979 gggtgtgtttgtttcaagttataattgtagattcttgggaataaaatcataaaaaacatacatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 45440880  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||  |||| ||    
T  45440879 gagtataaaatgttcctcggaatataaaaattttcccaaagaaagtagtgggaataaagttctcatggagatgggaaaaaaatcatgtata-attaccta 45440781  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||| | ||| |||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||    
T  45440780 ttataatccctagttttaaggttacttggaatattataatgttaatcaaacat-ctttttttaaatatcttggaataaaatttacatc--tatattctaa 45440684  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  45440683 gaaatgttattactatgaataaatttggta-aactgaaacaaacacac 45440637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 800 - 1064
Target Start/End: Original strand, 31921811 - 31922075
Alignment:
Q  800 ctaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattca 899  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  31921811 ctaaattttattcctgagtataaaatgtttgtgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattca 31921910  T
Q  900 taaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaat--tc 996  Q
    || |||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||    
T  31921911 tatatagt---cctattataatgtctatttttatggttcctagaaatattataaagttaaccatacatattttttctaaataccttggaataaaattctc 31922007  T
Q  997 ccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  31922008 ccatatttatattccaaagaatgttattcatggtaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 31922075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 718 - 948
Target Start/End: Original strand, 6656226 - 6656454
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || |    
T  6656226 gtgtgtttgtttcaagttatatttgttgatttttggaaataaaatgatatgaatatatatacctatgtttgttataagtttactaaa-tttattttcgag 6656324  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    |||||||| || |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||    
T  6656325 tataaaatatttctggaaatagaaaagttttcccaataaaaagggtggaaataaagtttccatggagatgggaataaaatcataaatag-ttacctatta 6656423  T
Q  918 taatccctatttttatggttcctaggaatat 948  Q
    |||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  6656424 taatctgtatttttttggttcctaagaatat 6656454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 781 - 1062
Target Start/End: Original strand, 40385692 - 40385974
Alignment:
Q  781 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaa-aaagggtgggaataaagttccca 879  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  40385692 tatgtttgttagaagtttactgaattttattcctgtctataaaatgtttctgggaatagaaaaaatatcccaaaaagaaatggtgggaataaagttccca 40385791  T
Q  880 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaa 978  Q
    |  |||||| || ||| ||||   ||  | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||  ||||  ||||    
T  40385792 ttaagatggaaataaactcatgtgtaact-acctattataatccatatttttatggttcttaggaatattataatgttaaccaaatatcttttttttaaa 40385890  T
Q  979 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||    
T  40385891 taccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaaatgttattactaagaataaatttgatacacttgaaagagacacacc 40385974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 785 - 1057
Target Start/End: Original strand, 22156248 - 22156520
Alignment:
Q  785 tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgga 883  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  22156248 tttgttacaagtttaataaattttaatcccgcgtataaaacgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtaggaataaagttctcataga 22156347  T
Q  884 gatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattcc 982  Q
    |||| ||| || ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||  | ||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  22156348 gatgagaataagttcatatgta-attacatattataatccatatttttatggttctcgtgaatattatactgttaaacaaacat-ttttttctatatacc 22156445  T
Q  983 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  22156446 ttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac 22156520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 785 - 1057
Target Start/End: Original strand, 22212163 - 22212435
Alignment:
Q  785 tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgga 883  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  22212163 tttgttacaagtttaataaattttaatcccgcgtataaaacgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtaggaataaagttctcataga 22212262  T
Q  884 gatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattcc 982  Q
    |||| ||| || ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||  | ||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  22212263 gatgagaataagttcatatgta-attacatattataatccatatttttatggttctcgtgaatattatactgttaaacaaacat-ttttttctatatacc 22212360  T
Q  983 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  22212361 ttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac 22212435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 5543131 - 5543479
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  | || |||||  |||||||||| ||||  ||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5543131 agggtgcgtttgtt-caagttattttcgtagattcttgggaataaaacgatataaatatacatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 5543229  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
      ||||||||  ||| ||||||||||||   |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||  |||| |    
T  5543230 tcgtataaaactttcttgggaatagaaattttttcccaaagaaaaatagtgggaataaagttcccatgaagatgggaacaaattcatgtgta-attacct 5543328  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| | ||| |||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || ||    
T  5543329 attataatccatatttttatggttcccgggaacattataatgttaagcaaacatcttttttctaaatacctt-gaataaaattctcatctttatgtttca 5543427  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |  |||| ||||| ||  ||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  5543428 aataatgatattcttagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccct 5543479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 723 - 1063
Target Start/End: Original strand, 43445890 - 43446229
Alignment:
Q  723 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 822  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  | ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  43445890 tttgtttcaagttatatttatagattcttgcgaataaaattataaaaatgtatatgcctatatttgttataagtttactaaattttattctcgaatataa 43445989  T
Q  823 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 922  Q
    ||||||| || ||||| ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||   ||  |||| ||||||| |     
T  43445990 aatgttcatgagaataaaaaagttttcccaaagaaaatggtgggaataaagttctcatggagatgagaataaaattatgtgta-attacctattatattt 43446088  T
Q  923 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 1021  Q
    ||||| ||||  |||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  43446089 cctatctttaatgttctttagaatattataatgttaaccaaacat-atttttctaaataccttaaaataaaattcctatctttatattccgataaatgtt 43446187  T
Q  1022 attcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||| ||  ||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  43446188 attcatagaaatcaatttggtacactttaaacaaacaaaccc 43446229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 911 - 1064
Target Start/End: Original strand, 17276353 - 17276508
Alignment:
Q  911 cttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaa-ccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 1008  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |||| | ||| ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  17276353 cttattgtaatccttatttttaaggtttcttggaatattataatgttaaaccaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaatttacatctatatat 17276452  T
Q  1009 tccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  17276453 tccaaggaatgttattcctagaaataaattttgtaaaattgaaacaaacacaccct 17276508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 773 - 1024
Target Start/End: Original strand, 38528764 - 38529012
Alignment:
Q  773 tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||| |||| |||||||    
T  38528764 tatatgcttatgtttgttacaagtttactagattttattcttgggtataaaatgttattgggaatagaataaatat-caaagaaaaa-ggtgagaataaa 38528861  T
Q  873 gttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattt 971  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||| ||   ||  || | ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||| | |||||||||||  |||    
T  38528862 gttctcatgaagatgagaataaatttatgtgta-attgcatattataatccctatttttaaagtttctcagaatattataatgttaaccaaacat-tttt 38528959  T
Q  972 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt 1024  Q
    |  |||||   ||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38528960 ttttaaataagttgaaataaaatttacatttttatattccaagaaatgttatt 38529012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 711 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 45723283 - 45723211
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctat 783  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45723283 tcttacggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgagaataaaatgataggaatatatatgcctat 45723211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 913 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 31598597 - 31598449
Alignment:
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||| |||| | ||| |||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31598597 tattataaatcctatttttatgattcccaggtatattataatgttaaacaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatattcc 31598498  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacaca 1060  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  31598497 aagaaatgttattcccaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca 31598449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 804 - 967
Target Start/End: Original strand, 43569773 - 43569936
Alignment:
Q  804 attttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaa 903  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||  || |||||||||||    
T  43569773 attttattcccgggtataaaatattcttcgaaatataaaaatttacctaagaaaaagggtgggaataaaattcacatgaggatgtaaataaattcataaa 43569872  T
Q  904 tagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata 967  Q
    ||  |||  |||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  43569873 ta-attatctattataatccctatttttatgatttctaaaaatattataaagttaatcaaacata 43569936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 755 - 845
Target Start/End: Original strand, 10902689 - 10902779
Alignment:
Q  755 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 845  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  10902689 aataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatttttggatataaaatgtttttgggaatagaaaaaa 10902779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 716 - 1018
Target Start/End: Original strand, 47246064 - 47246366
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgata--ggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||   | ||||||||||||  | ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  47246064 gggtgcgtttgtttcaaattatatttgtagattcttagaaataaaatgatatagaaatatatatttctatgtttgttacaagtttactgaattttattct 47246163  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    | |||||||||||||| | ||||| |||    |||   ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||   ||   ||  |    
T  47246164 caggtataaaatgttcttaggaattgaattttttttaaaag-aaaagggtgagaataaagttcccatgaatatgagaataaattcatgtgtaaactatct 47246262  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacat-aattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||||| | | |||||||||   |||| |||||| | || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47246263 attataatccctatttttaaggt--ctaggagtattataatgttgaccaaacatctttttttctaaatacttttgaataaaattcacat-tttatattcc 47246359  T
Q  1012 aaggaat 1018  Q
    || ||||    
T  47246360 aaagaat 47246366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 722 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 31598742 - 31598623
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||| |  ||||||| ||||| |||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  31598742 gtttgtttcaagttatattcatagattcctgaaaataaaacgatagaaatacaaatgcttatatttgttacaagtttactaaattttattacaaggtata 31598643  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaa 842  Q
    ||| |||||| ||||||||||    
T  31598642 aaacgttcct-ggaatagaaa 31598623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1012 - 1064
Target Start/End: Original strand, 16916182 - 16916234
Alignment:
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  16916182 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 16916234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1002 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 30870999 - 30870944
Alignment:
Q  1002 tttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30870999 tttatattttaaagaatgttattcttaagaataaatttagtaaatttgaaacaaac 30870944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 754 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 30871221 - 30871130
Alignment:
Q  754 gaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 845  Q
    |||||||||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  30871221 gaataaaatgatagaaatatacatttttatgtttgttacaagtttattaagttttattttcggatatcaaatgtttgtgggaatagaaaaaa 30871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 782
Target Start/End: Original strand, 31921747 - 31921813
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgccta 782  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31921747 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttcatt-tcggaaataaaatgatagaaatatatatgccta 31921813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 1014
Target Start/End: Original strand, 10902820 - 10902971
Alignment:
Q  864 gggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaa 962  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||   ||   | | |||||| || | |||||||| |||||| | |||||| |||| | |||||||    
T  10902820 gggaataaagttcacatgaagatgagaataaattcatgtgtaaactgcctattatgattcatatttttaaggttccaatgaatattataatgttaaccaa 10902919  T
Q  963 acataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  10902920 acatctttttcataaataccttgggctaaaattcacatctttatatcccaag 10902971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 713 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 19156691 - 19156613
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgtta 791  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||  |  |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  19156691 ttaggatgtgtttgtttcaagttatatttgtatattttcaagaataaaatgatagaaatgtacattccaatgtttgtta 19156613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 753 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 20601355 - 20601297
Alignment:
Q  753 ggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||| || |||| |||||||||||    
T  20601355 ggaataaaatgataggaatgtacattctaatgtttgttataaatttattaaattttatt 20601297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 713 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 20756090 - 20756012
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgtta 791  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||  |  |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  20756090 ttaggatgtgtttgtttcaagttatatttgtatattttcaagaataaaatgatagaaatgtacattccaatgtttgtta 20756012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 716 - 1064
Target Start/End: Original strand, 13229989 - 13230338
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13229989 gggtgtgtttgtttcaagttataattttttattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 13230088  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13230089 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 13230188  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230189 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 13230288  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  13230289 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 13230338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 716 - 1062
Target Start/End: Original strand, 27762899 - 27763246
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27762899 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 27762998  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27762999 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaatatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 27763098  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27763099 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaag 27763198  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  27763199 gaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 27763246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 714 - 1064
Target Start/End: Original strand, 55967998 - 55968349
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55967998 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgtctctgtttgttacaagtttactaaattttattcc 55968097  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  55968098 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 55968197  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55968198 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 55968297  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  55968298 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 55968349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 35999762 - 35999412
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35999762 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 35999663  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  35999662 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 35999563  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35999562 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 35999463  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||    
T  35999462 ggaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacaaaccct 35999412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 711 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 45596348 - 45595994
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45596348 tcttagggtgcgtttgtttcaagttataattgttgattttcgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttat 45596249  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttta 910  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45596248 tccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagttta 45596149  T
Q  911 cttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 1009  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45596148 cctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 45596049  T
Q  1010 ccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  45596048 ccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 45595994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 716 - 1057
Target Start/End: Original strand, 48518891 - 48519233
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48518891 gggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccca 48518990  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  48518991 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 48519090  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48519091 tataatacctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcacatctttatattccaag 48519190  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  48519191 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 48519233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 48879401 - 48879051
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  48879401 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 48879302  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  48879301 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 48879202  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48879201 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctacattccttggaataatattcccatctttatattccaa 48879102  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  48879101 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 48879051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 39730289 - 39730642
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39730289 cttagggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 39730388  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39730389 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcacatggagatgggaataaattcataaatagtttac 39730488  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39730489 ctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc 39730588  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  39730589 caaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 39730642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 714 - 1064
Target Start/End: Original strand, 45747794 - 45748144
Alignment:
Q  714 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45747794 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 45747893  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  45747894 cgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggggggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttac-c 45747992  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45747993 attataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 45748092  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  45748093 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 45748144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 713 - 1073
Target Start/End: Complemental strand, 42774026 - 42773665
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42774026 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 42773927  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  42773926 ccgggtataaaatgttcctggggataaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 42773827  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42773826 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatactcc 42773727  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccctgagtattat 1073  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  42773726 aaggaatgttatttctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacgcccttagtgttat 42773665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 715 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 40435976 - 40435628
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40435976 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 40435877  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  40435876 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttaccta 40435777  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435776 ttataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 40435677  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  40435676 ggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 40435628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 6279920 - 6280270
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6279920 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatatgaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 6280019  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6280020 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 6280119  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6280120 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaatatatttttcataaattccttggaataaaattcctatttttatattccaa 6280219  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  6280220 ggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 6280270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 25932520 - 25932167
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25932520 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttatt 25932421  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25932420 ccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac 25932321  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25932320 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattt 25932221  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||||||    
T  25932220 caaggaatgttattcctaggaataaatttgggaaacttgaaacaaacacaccct 25932167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 41859043 - 41859395
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41859043 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttatt 41859142  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41859143 cccaggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac 41859241  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41859242 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttatattc 41859341  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  41859342 caaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 41859395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 43723343 - 43722990
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43723343 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttatt 43723244  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43723243 ccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttac 43723144  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723143 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattc 43723044  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  43723043 caaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 43722990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 23686863 - 23686513
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23686863 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 23686764  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23686763 tggtataaaatatttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 23686664  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23686663 ttataattcatatttttatggttcctaggaatattataaaactaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaa 23686564  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  23686563 ggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 23686513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 936204 - 935852
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936204 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgattggaatatatatccctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 936105  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  936104 ccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcacaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagtttacc 936005  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  936004 tattataatccctatttttatagttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcctatctttatattcc 935905  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  935904 aagaaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 935852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Original strand, 18405231 - 18405582
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18405231 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaattatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 18405330  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  18405331 cttggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaattt-ccaaggaaaagggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 18405429  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  18405430 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcctgagaataaaatttccatctttatattcc 18405529  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  18405530 aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 18405582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 716 - 1022
Target Start/End: Original strand, 34049597 - 34049904
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34049597 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccag 34049696  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  34049697 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttttcctat 34049796  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34049797 tataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 34049896  T
Q  1015 gaatgtta 1022  Q
    ||||||||    
T  34049897 gaatgtta 34049904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 711 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 27555490 - 27555153
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27555490 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttat 27555391  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttta 910  Q
    || |||||||||||                |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27555390 tcgcgggtataaaa----------------aaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattta 27555307  T
Q  911 cttattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27555306 cctattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 27555207  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27555206 caaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 27555153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 717 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 47670436 - 47670088
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  47670436 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctggaaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttg 47670337  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  47670336 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtggaaataaagtttccatgaagatgagaataaattcataaatagtttacctatt 47670237  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47670236 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagataaccaaatatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 47670137  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  47670136 aatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 47670088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 39835306 - 39835656
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39835306 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatataaatgtatatgcatatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 39835405  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39835406 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagattagaataaattcataaatagtttaccta 39835505  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39835506 ttataatccttatttttatgatttctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 39835605  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  39835606 ggaatgttattcatagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 39835656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 715 - 1056
Target Start/End: Original strand, 50672907 - 50673245
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50672907 agggtgtgtttgttttaagtta--attgttgattcc-gggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 50673003  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  50673004 gggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 50673103  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  50673104 ttataatcccta-ttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatatttcaa 50673202  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa 1056  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||    
T  50673203 ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaa 50673245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 718 - 1062
Target Start/End: Original strand, 41744222 - 41744568
Alignment:
Q  718 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg-g 816  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |    
T  41744222 gtgtgtttatttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttatttctttg 41744321  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41744322 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataattagtttacctatt 41744421  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  41744422 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaatg 41744521  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  41744522 aatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 41744568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 713 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 18931831 - 18931482
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18931831 ttagagtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttctgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattc 18931732  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |     
T  18931731 ccgtgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaatttataaataattttcc 18931632  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18931631 tattataatccctatttttatagttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaatttctatctttatattcc 18931532  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||    
T  18931531 aaggaatgttattcctaagaataaatttgataaacttaaaacaaacacac 18931482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 716 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 32953598 - 32953249
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32953598 gggtgtgtttgtctcaagttataattgttgattcccaggaacaaaatgataggaatgtatatgcctatctttgttacaagtttactaaattttattctcg 32953499  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  32953498 ggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagttttcctat 32953399  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32953398 tataatccctatttttatggttccttgaaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaat 32953299  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| ||||| |||  ||||||||   || | |||||||||||| |||||    
T  32953298 gaatattatttctagaaataaattagataaacttgaaacaaacataccct 32953249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 728 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 8322308 - 8321971
Alignment:
Q  728 ttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |    
T  8322308 ttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatat 8322209  T
Q  828 tcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctat 927  Q
    || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8322208 tcttgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctat 8322109  T
Q  928 ttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcc 1026  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8322108 ttttatggttcctatgaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgtaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcc 8322009  T
Q  1027 taagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  8322008 taaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 8321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 720 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 27942814 - 27942465
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgt------tacaagtttactaaattttattcc 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |      || |||||||||||||||||||||    
T  27942814 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttatgtttattataagtttactaaattttattcc 27942715  T
Q  814 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||| |    
T  27942714 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccattgaaatgagaataaattcataaataatttacct 27942615  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||     
T  27942614 attataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttgaaataaaattctcatatttatattcct 27942515  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  27942514 aaaaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 27942465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 713 - 1025
Target Start/End: Complemental strand, 39498903 - 39498590
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39498903 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 39498804  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39498803 cttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaagggtggaaataaagttctcatagagatgggaataaattcataaatagtttacc 39498704  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39498703 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaatatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattcc 39498604  T
Q  1012 aaggaatgttattc 1025  Q
    ||||||||||||||    
T  39498603 aaggaatgttattc 39498590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 713 - 1025
Target Start/End: Complemental strand, 39502242 - 39501929
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39502242 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 39502143  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39502142 cttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaagggtggaaataaagttctcatagagatgggaataaattcataaatagtttacc 39502043  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39502042 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaatatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattcc 39501943  T
Q  1012 aaggaatgttattc 1025  Q
    ||||||||||||||    
T  39501942 aaggaatgttattc 39501929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 715 - 977
Target Start/End: Original strand, 25916034 - 25916295
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25916034 agggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtat--gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 25916131  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25916132 gggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttaccta 25916231  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaa 977  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  25916232 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaatcaaacatattttttctaa 25916295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 769 - 1056
Target Start/End: Original strand, 34238007 - 34238295
Alignment:
Q  769 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaa 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34238007 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcttgggaatagaaacaatttcccaaggaaaagggtgggaa 34238106  T
Q  869 taaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata 967  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34238107 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctattttttttgttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 34238206  T
Q  968 attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa 1056  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||    
T  34238207 tttttcttaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaa 34238295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 834 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 48873978 - 48873747
Alignment:
Q  834 gaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttat 933  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48873978 gaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttat 48873879  T
Q  934 ggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaa 1032  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48873878 ggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctacattccttggaataatattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaa 48873779  T
Q  1033 taaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  48873778 taaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 48873747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 717 - 1063
Target Start/End: Original strand, 31937870 - 31938217
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  |||||||| |||  ||  || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||      
T  31937870 ggtgtgtttgtttcaagttataattgtagatttttgaaaataaaatcataaaaacatacatgcatatgtttgttagaagtttattaaattttattcccaa 31937969  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag-aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || |||    
T  31937970 atataaaatgttcttgggaataaaaaaaattttccaaggaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaacagtt-acctat 31938068  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  31938069 tataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattttcatctttaaattccaag 31938168  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  31938169 gaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 31938217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 712 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 7259041 - 7258691
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||   |||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7259041 cttatggtgcgtttgtttcaagttatattggtagattccttagaataaaatgatag-aatatacatgtctttgtttgttacaagtttactaaattttatt 7258943  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||   ||   |||    
T  7258942 tccgcgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccaaaagaaaagagtgggaataaagttcccatgaatatgggaataaattcatttgta-actac 7258844  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||||  |||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7258843 ttattatagtcctaatttttatggttccttggaatattaaaatgttaaccaaacatcttttattcaaataccttggaataaaattcccatatttatattc 7258744  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  7258743 caaggaatgttattcctgagaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 7258691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 51968853 - 51968505
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| | |||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  51968853 agggtgtgtttgtttcaagttatattcgtaaatttctgggaataaaaagatagaaatatgcatgcctatgtttgttacaagtttgctaaattttattctt 51968754  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||  ||  ||||      
T  51968753 gagtataaaacgttcctgggaatagaaaatgtttcccaaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatggaaataatttcatatgta-attac-- 51968657  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 1012  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | ||| |||||||  |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||  | | |    
T  51968656 attataatccttatttttatggttctcagaaatattataatgttaaacaaacatcttttttctatataccttggaataaaattctcatctttacgtacga 51968557  T
Q  1013 aggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  51968556 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 51968505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 715 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 30415978 - 30415746
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30415978 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgataataaaatgataggaatatatatgtctgtgtttgttacaagtttactaaattttattccc 30415879  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
       |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||  |||||  || || ||||||||||  |||| ||    
T  30415878 aaatataaaatgttctttggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatggtgggaataaaatttccataaagatgaaaataatttcataaata-attaccta 30415780  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat 948  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30415779 ttataatccctatttttatggttcctaagaatat 30415746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 755 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 52469734 - 52469448
Alignment:
Q  755 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 854  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||   ||| |||||    
T  52469734 aataaaatgatagaattgcatatgtctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccggcaataaaatgtttctaggaatagaaatttttttccaag 52469635  T
Q  855 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaa 953  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  52469634 gaaattggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattccaatatag-ttacctattataatctctatatttatggttcataggaatattataaa 52469536  T
Q  954 gctaaccaaacat-aattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc-aaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||   |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52469535 gctaaccaaacatgtttttttctaaatattttggtataaaatttcaatctttatattccaaaggaatgttattcctaagaataaattt 52469448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 717 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 38414278 - 38414032
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |    
T  38414278 ggtgtgtttgtctaaagttatatttgttgattc--gggaataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgtaataagtttactaaattttattccatg 38414181  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
     ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| |||| ||||    
T  38414180 -tataaaatgtttccgggaatataaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatggtaataaattcatatgtag-ttacctatt 38414083  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacat 966  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  38414082 ataattcctatttttatggtttctaagaatattataaagttacccaaacat 38414032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 745 - 1001
Target Start/End: Original strand, 47426269 - 47426520
Alignment:
Q  745 gattcccgggaataaaatgataggaatgt-atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa 843  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  47426269 gattcctgagaataaaatgatatgaatattatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatttcttgatataaaatgttcctggaaatagaaaa 47426368  T
Q  844 aatttcccaag-aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctag 942  Q
    |  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||       |||||||||    
T  47426369 atattatcaagaaaaaagggtggcaataaagttcccatgaagatgaaaataaattcataaatag-ttacctattataatcccta-------ggttcctag 47426460  T
Q  943 gaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatc 1001  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47426461 gaatattataaagttaaccaaatatattttttctaaatacctttgaataaaattcccatc 47426520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 713 - 973
Target Start/End: Original strand, 36858375 - 36858634
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||  |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36858375 ttagggtgtgtttgtttcaagttatattcttagattcccaagaataaaaagatagaaatgcat--gcttatgtttgttacaagtttactaaattttatgc 36858472  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatag---aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttt 909  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||  ||  ||    
T  36858473 ccgggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaaaaaatt--caaataaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataatttcatatgta-att 36858569  T
Q  910 acttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttc 973  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  36858570 acatattataatccctatttttatggtttccgggaatattataatgttaaacaaacatatttttc 36858634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 721 - 872
Target Start/End: Original strand, 10400810 - 10400961
Alignment:
Q  721 tgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtat 820  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10400810 tgtttgtttcaagttatatttgttgatttttgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattcttgggtat 10400909  T
Q  821 aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 872  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  10400910 aaaatattcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaattggtgggaataaa 10400961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 846 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 36858351 - 36858159
Alignment:
Q  846 tttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaa 945  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36858351 tttcccaaagaaaagggtgggaataaaattctcatggagatgggaataaattcatatatag-ttacctgttataatccttatttttatggttcctaggaa 36858253  T
Q  946 ta-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    || || |||| || ||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36858252 tattacaaagttatccaaacatatttttcttaaatacctt-gaatgaaattcccatctgtgtattacaaggaatgttattcttaagaataaattt 36858159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 754 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 38394943 - 38394634
Alignment:
Q  754 gaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-a 852  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||| |||||| ||||| |    
T  38394943 gaataaaacgatgggaatatacatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttatt-cctagtataaaatatttctggaaatataaaaaaattcccaa 38394845  T
Q  853 agaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tata 951  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||||||| || |||||||| | || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||    
T  38394844 agaaaaggggtgggaataaagttctgatagagatggaaataaattcatgagtaattt-cctattataattcctatttttatggttcccaaaaatattata 38394746  T
Q  952 aagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaa 1051  Q
    |   ||| |||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||| ||| || ||  ||||||||| ||| | |||||    
T  38394745 atattaagcaaacatcttttttctaaataccttgaaataaaattctcatatttatgttctaagaaatattagtcttagaaataaatttggtaaacttgaa 38394646  T
Q  1052 acaaacacaccc 1063  Q
    ||||||||||||    
T  38394645 acaaacacaccc 38394634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 716 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 18405828 - 18405597
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||| |||||||| |    |||| ||| |||||||| ||||  ||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |      
T  18405828 gggtgtgtttgttttaagttatattcagagatttccgagaataaaacgatataaatatacatatctatgtttgttacaagtttacaaaattttatttcta 18405729  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||   ||  |||| |||    
T  18405728 ggtataaaatgttcctaggaatagaaaatttttcctaaagaaaagggtgggaataaagttctcattaagatgggaataaatccatgtgta-attacctat 18405630  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaatat 948  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18405629 tataatctctatttttatggttcctagaaatat 18405597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 782 - 1056
Target Start/End: Original strand, 37014451 - 37014724
Alignment:
Q  782 atgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatg 881  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||  || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  37014451 atgtttgttatgagtttattaaattttatatccaggtataacatgttcataggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagagtggaaataaagttctcatg 37014550  T
Q  882 gagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaatt 980  Q
     ||||| ||| ||||||||   || ||| |||| |||||| | |||||||| | || || | |||| ||||| | |||||||||||  |||| ||||||     
T  37014551 aagatgagaataaattcatgtgtaattt-cttactataattcttatttttaagatttct-gaaatattataatgttaaccaaacatcttttttctaaata 37014648  T
Q  981 ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa 1056  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  37014649 tcttcgaataaaattcgcatctttatattccaaaaaatattattcttaggaataaattttgtaaacttgaaacaaa 37014724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 951 - 1071
Target Start/End: Complemental strand, 38414015 - 38413895
Alignment:
Q  951 aaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttga 1050  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||||    
T  38414015 aaagttaaccaaacatattttttctaaataccttggaattaaattctcatctttatattccaaggaatgttatttctaaaattaaatttggtaaacttga 38413916  T
Q  1051 aacaaacacaccctgagtatt 1071  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  38413915 aacaaacacgccctgggtatt 38413895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 758 - 880
Target Start/End: Original strand, 12275953 - 12276075
Alignment:
Q  758 aaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaa 857  Q
    |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||||| | |||||||| | |    
T  12275953 aaaatgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgttcttggaaaaagaaatattttcccaaaaga 12276052  T
Q  858 aagggtgggaataaagttcccat 880  Q
    || |||||||||||| |||||||    
T  12276053 aaaggtgggaataaaattcccat 12276075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 815 - 1063
Target Start/End: Complemental strand, 30790518 - 30790275
Alignment:
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||| | ||     || || |||    
T  30790518 gggtataaaatgtttctgagaatagaaaagtttttccaatgaaaaggatgggaataaagtttccatgaagatggaaataaaattat-----gtgtaatta 30790424  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||  ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30790423 ttataaattctatttttaaggttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaatactttggaataaatttctcatctttatattccaa 30790324  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
     |||||||| |||||  |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  30790323 -gaatgttactcctagaaataaatttgctaaacttgaaacaaacacaccc 30790275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 754 - 875
Target Start/End: Original strand, 22654515 - 22654638
Alignment:
Q  754 gaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tccc 851  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||| ||  |||     
T  22654515 gaataaaatgatagaaatatacatgcctatgtttattacaagttaactaatttttattctcgggtaaaaaatgttattgcgaatagaaaaactttctcca 22654614  T
Q  852 aagaaaaagggtgggaataaagtt 875  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  22654615 aaaaaaaagggtgggaataaagtt 22654638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 781 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 48060065 - 48059806
Alignment:
Q  781 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccat 880  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||    
T  48060065 tatgtttgttacgagtttattaaattttatttttggatataaaatatttatgggaatagaaaaaatttcccaaataaaatggtgggaataaagttctcat 48059966  T
Q  881 ggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata-attttcctaaa 978  Q
      | ||   || ||||||||| |||  |||| ||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| ||||||  |||  |||||||  |||| |||||    
T  48059965 aaaaatataaataaattcatatata-attacctattataattcttatttttataattcctagaaatattataaaattaattaaacatatttttttctaaa 48059867  T
Q  979 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    | | | | |||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  48059866 tacatcgaaataaaattctcatcattatattctaaaaaatattattcgtaagaataaattt 48059806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 711 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26165444 - 26165326
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||  |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26165444 tcttagggtgtgtttgtttcatgttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatgcacatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttat 26165345  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttc 829  Q
    ||  |  ||||||||||||    
T  26165344 tcatgaatataaaatgttc 26165326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 722 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 44309829 - 44309508
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| | |  ||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  44309829 gtttgtttcaagttatattcgtagatttctgaaaataaaacgatagaaatatgcatgtctatgtttgttacaaggttactaaattttatt-cctagtata 44309731  T
Q  822 aaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta----tt 916  Q
    ||| ||||  | |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||    |||||| || ||| || || |||    ||    
T  44309730 aaacgttctagagaatagaaaaaaatttcctaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgaatatg----aaaatttattaat-gtgtaattatctgtt 44309636  T
Q  917 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 1015  Q
    ||||||||||||||||   |||    ||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||  | ||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||     
T  44309635 ataatccctatttttagtattctcgagaatattataatgttaaccatacatatttttcctaaacactttgaaattaaattctcatctttatgttctaaga 44309536  T
Q  1016 aatgttattcctaagaataaatttagta 1043  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  44309535 aatattattcttaaaaataaatttagta 44309508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 720 - 776
Target Start/End: Original strand, 34237424 - 34237480
Alignment:
Q  720 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtata 776  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34237424 gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtata 34237480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 969 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 18405223 - 18405129
Alignment:
Q  969 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |||||||||||||||    
T  18405223 tttttctaaataccttggaataca-ttcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaagaataaatttggcaaacttaaaacaaacacaccct 18405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 908 - 1061
Target Start/End: Original strand, 10400973 - 10401126
Alignment:
Q  908 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 1006  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||| ||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  10400973 ttacctattataatccttatttttatggttccgaggaatattataaa-ctaaccaaacatgttttttctatatatcttggaataaaattctcatttttat 10401071  T
Q  1007 attccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    | | ||| |||||||||| | |  ||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  10401072 acttcaaagaatgttatttccagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacac 10401126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 956 - 1058
Target Start/End: Complemental strand, 52414061 - 52413959
Alignment:
Q  956 taaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaa 1055  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  52414061 taaccaaacatattttttctaattcgcttgaaataaaattcacatctttatattccaagggttgttatttctaagaataaatttggtaaatttgaagcaa 52413962  T
Q  1056 aca 1058  Q
    |||    
T  52413961 aca 52413959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 719 - 1021
Target Start/End: Original strand, 24805088 - 24805397
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||| | | |||||||| || |  ||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||     
T  24805088 tgtgtttgtttcaagttattttcgtagatttctgagaataaaacgaaaaaaatatacatgtttatgtttgttacaaatttactaaattttattttcggga 24805187  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgg-gaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||   ||  |||| |||||    
T  24805188 ataaaacatt-ttgggaatagaaaaaatttcacaaagaaaatggtggaaaataaagttcccatgaatatgggaataaatccatgtgta-attacctatta 24805285  T
Q  918 taatccctatt-------tttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 1009  Q
    || ||||||||       ||||||||||| || |||| ||||| | ||| |||||||  |||| |||||| ||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  24805286 tattccctatttttatggtttatggttcccagtaatattataatgttaagcaaacatcttttttctaaataccttaaagtaaaattcacatctttatgtt 24805385  T
Q  1010 ccaaggaatgtt 1021  Q
    ||||||||||||    
T  24805386 ccaaggaatgtt 24805397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 986 - 1063
Target Start/End: Original strand, 36860027 - 36860104
Alignment:
Q  986 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccc 1063  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  36860027 gaataaaatttccatttttatgttccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 36860104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 715 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 18094325 - 18094139
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | || |||| | |  ||||||||||||| ||| ||  | | |||||||| || ||||||||||| |||||||  |    
T  18094325 agggtgggtttgtttcaagtaatattcgtagatttctgaaaataaaatgatagaaatataccttcttatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttc 18094227  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaa---aaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcat 900  Q
    |||||||||||||| || |||||||||   |||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  18094226 gggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattccaaag-aaaatggtgagaataaagttcccatgaagatgagaataaattcat 18094139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 713 - 812
Target Start/End: Original strand, 9327242 - 9327342
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9327242 ttagggtgtttttatttcaagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataagtttactaaattttatt 9327341  T
Q  812 c 812  Q
    |    
T  9327342 c 9327342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 713 - 812
Target Start/End: Original strand, 9374001 - 9374101
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9374001 ttagggtgtttttatttcaagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataagtttactaaattttatt 9374100  T
Q  812 c 812  Q
    |    
T  9374101 c 9374101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 979 - 1026
Target Start/End: Complemental strand, 37296520 - 37296473
Alignment:
Q  979 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcc 1026  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37296520 ttccttggaataaaattcacatatttatattccaaggaatgttattcc 37296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1005 - 1064
Target Start/End: Original strand, 25916302 - 25916362
Alignment:
Q  1005 atattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtaca-tttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  25916302 atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttagaaacaaacacaccct 25916362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 815 - 972
Target Start/End: Original strand, 32384492 - 32384650
Alignment:
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 913  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||| ||    |  |||| |    
T  32384492 gggtataaaacgttcatggaaacagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaaattcccataaagattggaacaaatttatgtgca-attacct 32384590  T
Q  914 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataatttt 972  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||    
T  32384591 attataatccctaattttatggtttccaggaatattataatgttaagcaaacatactttt 32384650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 983 - 1064
Target Start/End: Original strand, 12276178 - 12276259
Alignment:
Q  983 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaa-cacaccct 1064  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  12276178 ttgaaataaaattcacatctttatattcaaaa-aatgttattcctataaataaatttagtaaacttgaaacaaatcacaccct 12276259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 915 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 14796439 - 14796314
Alignment:
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||| |||||||  |||| |||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14796439 ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa 14796340  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
      ||| |||||||||| |||||||||    
T  14796339 aaaatattattcctaaaaataaattt 14796314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 781 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 54478555 - 54478495
Alignment:
Q  781 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa 841  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  54478555 tatgtttgttataagtttactaaatttcattcatgggtataaaatgttattggaaatagaa 54478495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 716 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 37296753 - 37296662
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattt 807  Q
    ||||| |||||||| | |||||| |  | |||||| || ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37296753 gggtgcgtttgtttaaggttatattcatagattcctggaaataaaatgatagaaatatacatgcttatgtttgttactagtttgctaaattt 37296662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 956 - 1027
Target Start/End: Complemental strand, 54478437 - 54478366
Alignment:
Q  956 taaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcct 1027  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  54478437 taaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcacatatttatatttcaagaaatgctattcct 54478366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 731 - 812
Target Start/End: Original strand, 9382297 - 9382379
Alignment:
Q  731 aagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||| |||||||||||    ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  9382297 aagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataaatttactaaattttattc 9382379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1027 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 26165147 - 26165110
Alignment:
Q  1027 taagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26165147 taagaataaatttagtacactttaaacaaacacaccct 26165110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-155; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 2657772 - 2657422
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657772 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 2657673  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  2657672 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttccta 2657573  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657572 ttataatccatatttttatgattactaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 2657473  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  2657472 ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 2657422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 715 - 1064
Target Start/End: Original strand, 7053569 - 7053927
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7053569 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 7053668  T
Q  815 gggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 906  Q
    ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7053669 gggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatag 7053768  T
Q  907 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 1005  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7053769 tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatattta 7053868  T
Q  1006 tattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  7053869 tattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 7053927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 716 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 1317089 - 1316741
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  1317089 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattccca 1316990  T
Q  816 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1316989 ggtataaaatgttcctgggaataga-aaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctat 1316891  T
Q  916 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1316890 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaa 1316791  T
Q  1015 gaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  1316790 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 1316741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 713 - 1061
Target Start/End: Complemental strand, 14171087 - 14170740
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14171087 ttagggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatctatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 14170988  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  14170987 ctggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt-ccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagat-ggaataaattcataaatagtttacc 14170890  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 1011  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14170889 tattacaatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 14170790  T
Q  1012 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14170789 aaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 14170740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 719 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 18897989 - 18897643
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  18897989 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaagtgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggt 18897890  T
Q  819 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 918  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18897889 ataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat 18897790  T
Q  919 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 1017  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897789 aattcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 18897690  T
Q  1018 tgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  18897689 tgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 18897643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 723 - 1062
Target Start/End: Complemental strand, 16968989 - 16968649
Alignment:
Q  723 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 822  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16968989 tttgtttcaagttataattgttgattcctgagaataaaatgataggaatctatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataa 16968890  T
Q  823 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 922  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16968889 aatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatc 16968790  T
Q  923 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 1021  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16968789 cctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaatgtt 16968690  T
Q  1022 attcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  16968689 attcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 16968649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 793 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 8029297 - 8029025
Alignment:
Q  793 aagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaa 892  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8029297 aagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaat 8029198  T
Q  893 aaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa 991  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8029197 aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataa 8029098  T
Q  992 aattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  8029097 aatttccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 8029025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 715 - 948
Target Start/End: Original strand, 7344082 - 7344315
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344082 agggtgtgttcgtttcaaattataattgtaaatttccgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattccc 7344181  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 914  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7344182 aggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 7344281  T
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat 948  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344282 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat 7344315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 859 - 1064
Target Start/End: Original strand, 10246259 - 10246465
Alignment:
Q  859 agggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagcta 957  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10246259 agggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagcta 10246358  T
Q  958 accaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaac 1057  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  10246359 accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 10246458  T
Q  1058 acaccct 1064  Q
    |||||||    
T  10246459 acaccct 10246465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 712 - 1064
Target Start/End: Original strand, 6705761 - 6706101
Alignment:
Q  712 cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6705761 cttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcattggaataaaatggtagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 6705860  T
Q  812 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||     
T  6705861 cctaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaatgttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataatttcatatgta-ttta- 6705958  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
               ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  6705959 -----------cctgtttttatagttcttaggaatattataaagttaaccaaatatattttttctaaataccttagaataaaattctcatctttatattt 6706047  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||    
T  6706048 caaggaatgttattcctagaaataaaattggtaaacttgaaacaaacataccct 6706101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 719 - 1013
Target Start/End: Original strand, 345833 - 346130
Alignment:
Q  719 tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaa-taaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 817  Q
    ||||||||||| |||||||| | || ||||||  |||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  345833 tgtgtttgttttaagttatattcgtagattcctaggaaataaaatgataggaatacacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgga 345932  T
Q  818 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 917  Q
    ||||||| |||  | |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || ||| | |||||    
T  345933 tataaaacgtttttaggaatagaaaatttttcccaaagaaaagggtgggaataaagttccaatggagatgagaataaattcatgagtaattt-cctatta 346031  T
Q  918 taatccctatttttatgg-ttcct-aggaat-atataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
     ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| | ||| |||||||  |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  346032 aaattcctatttttatggtttcctcaggaatgttataatgttaagcaaacatcttttttctaaatgtcttagaataaaattctcatctttatattccaa 346130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 717 - 891
Target Start/End: Original strand, 10849784 - 10849959
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||||||| | | ||| | ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  10849784 ggtgtgtttgtttcaagttatttttatagattcctgggaataaaatgatagaattatatcttcctatattagttacaagtttagtaacttttcttcctgg 10849883  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaa 891  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10849884 gtgtaaaatgttcctgggaatagaaaaatgttcccaaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaa 10849959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 722 - 1061
Target Start/End: Original strand, 14781626 - 14781955
Alignment:
Q  722 gtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 821  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||||| | || |||||  |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14781626 gtttgtttcaaattatattcgtagattcctgcgattaaaacaataggaatatacatacatatgtttgttacaagtttactaaattttattcctaggtata 14781725  T
Q  822 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 921  Q
    ||||| || ||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||     |||||     ||||||||||| |||||||| | || || || ||||||||     
T  14781726 aaatgctcatgggaatagaaattttttccaaaagaaaagggtgg-----aagtta----ggagatgggaataaattcatgagtaatt-acctattataaa 14781815  T
Q  922 ccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgt 1020  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  14781816 tcctacttttatggttcccaggaatattataatgttaagcaaacatcttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatgttccaatgaatgt 14781915  T
Q  1021 tattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacac 1061  Q
    |||||| | |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  14781916 tattcccaggaataaatttggta-aaatgaaacaaacacac 14781955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 715 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 8029405 - 8029316
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8029405 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa 8029316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 727 - 901
Target Start/End: Original strand, 21008035 - 21008208
Alignment:
Q  727 tttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatg 826  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||    
T  21008035 tttcaagttatatttgttgatttctgggaataaaatgataaaaatatatatgcctctatttgttacaggtttactaaattttattcccgaacatgaaatg 21008134  T
Q  827 ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata 901  Q
    ||| |||||||||||||||  | | || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  21008135 ttcttgggaatagaaaaaaaattcaaacaaaaa-ggtgggaataaagttctcatagagatgggaataaattcata 21008208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 948 - 1039
Target Start/End: Original strand, 7344727 - 7344818
Alignment:
Q  948 tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7344727 tataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatatttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattt 7344818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 948 - 1058
Target Start/End: Original strand, 21008212 - 21008322
Alignment:
Q  948 tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatt 1047  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || | |    
T  21008212 tataaagttaaccaaacatattttttctaaatgccttggaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcataaaaataaatttaataaact 21008311  T
Q  1048 tgaaacaaaca 1058  Q
    |||||||||||    
T  21008312 tgaaacaaaca 21008322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 713 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 8314987 - 8314874
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||| |||  ||  || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314987 ttagggtatgtttgtttcaagttataattctagattcatgagaataaaatcataaaaacatacattcatatgtttgttacaagtttactaaattttattc 8314888  T
Q  813 ccgggtataaaatg 826  Q
    |||  |||||||||    
T  8314887 ccgtatataaaatg 8314874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 711 - 843
Target Start/End: Original strand, 9760365 - 9760497
Alignment:
Q  711 tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat 810  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||  | |||||||||||| | | | || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9760365 tcttagagtgcgtttgtttcaagttatctttgtagactcttgagaataaaatgatcgaattatacatgcctatttttgttataagtttactaaattttat 9760464  T
Q  811 tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa 843  Q
    | | || |||||||||||| || ||||||||||    
T  9760465 ttcaggatataaaatgttcatgagaatagaaaa 9760497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 974 - 1062
Target Start/End: Original strand, 9762299 - 9762387
Alignment:
Q  974 ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  9762299 ctaaatacctttgaataaaattcacatatttataatccaaggaatgttattcctaataataaacttggtaaacttgaaacaaacacacc 9762387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 715 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 3869577 - 3869391
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||| ||| | |||  ||| |||||||| | ||| | |||||||||||       
T  3869577 agggtgtgtttgtttcaagttatttttgtagatttctgggaataaaatgatagaaatatgtattactacgtttgttaaatgttcattaaattttatt--- 3869481  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgg---gaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataa 902  Q
     || |||||||||||   |||||||||||  ||||||||  |||| |||||   |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  3869480 -ggcataaaatgttcaatggaatagaaaagttttcccaaagaaaatggtggtgagaataaagttcccacgaagatgagaataaattcataa 3869391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1002 - 1062
Target Start/End: Original strand, 11570071 - 11570131
Alignment:
Q  1002 tttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacacc 1062  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||    
T  11570071 tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaagacacc 11570131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 716 - 752
Target Start/End: Original strand, 10246222 - 10246258
Alignment:
Q  716 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccg 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10246222 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccg 10246258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 809 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 8314873 - 8314641
Alignment:
Q  809 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaaggg-tgggaataaagttcccatggagatgg-gaaaaaattcataaatag 906  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || |||||  | || |||||||||| ||||| |||| | ||| ||||||| |  ||     
T  8314873 attcccgtatataaaatgtttctggcaatagaaaatttttccaaaaaaaaaatgatgagaataaagtttccatgaagattgagaataaattcaaatgtaa 8314774  T
Q  907 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 1005  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||| | |||| ||||||  |||| ||||||  ||| ||||||||||  ||| | ||    
T  8314773 tt-acctattataatccctatttttaaggttccttgaattattataatgttaactaaacattttttttctaaatatcttagaataaaatttacatgtgta 8314675  T
Q  1006 tattccaaggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
    |||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  8314674 tattgcaagtaatgttaattctaggaataaattt 8314641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 986 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 12328142 - 12328065
Alignment:
Q  986 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  12328142 gaatgaaattcacatctttatatt-caaagaatgttattactagaaataaatttggtaaatttgaaacagacagaccct 12328065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 721 - 1039
Target Start/End: Original strand, 28957 - 29276
Alignment:
Q  721 tgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtat 820  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28957 tgtttgtttcaagttataattgttgattttcgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtat 29056  T
Q  821 aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataa 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29057 aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagttttcctattataa 29156  T
Q  921 tccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg 1019  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  29157 tccctatttttataattcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaaaaatg 29256  T
Q  1020 ttattcctaagaataaattt 1039  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  29257 ttattcataggaataaattt 29276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0662 (Bit Score: 167; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Complemental strand, 4542 - 4188
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagatttctaggaataaaattataaaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 4443  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaa-aaaattcataaatagtttac 911  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||      ||||    
T  4442 ccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaaattaatagtgtaattac 4343  T
Q  912 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca-taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 1009  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4342 ctattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacattttttttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatatt 4243  T
Q  1010 ccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  4242 ccaaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccct 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 166; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 713 - 1064
Target Start/End: Original strand, 3562 - 3914
Alignment:
Q  713 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3562 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagatttctaggaataaaattataaaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 3661  T
Q  813 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 912  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||   ||  ||||     
T  3662 ccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaaattatgtgta-attacc 3760  T
Q  913 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca-taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 1010  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3761 tattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacattttttttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatattc 3860  T
Q  1011 caaggaatgttattcctaagaataaatttagtacatttgaaacaaacacaccct 1064  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  3861 caaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccct 3914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 70; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 717 - 938
Target Start/End: Original strand, 23297 - 23517
Alignment:
Q  717 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 816  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| |||| | | ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23297 ggtgcgtttgttttaaattatatttgtagatttctgagaataaaattatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcacga 23396  T
Q  817 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 916  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   ||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||   ||   ||| ||||    
T  23397 gtataaaatattcctgggaatataaatttttttccaaagaaaacggtgggaataaagtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-actacctatt 23495  T
Q  917 ataatccctatttttatggttc 938  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  23496 ataatccctatttttaaggttc 23517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1480 (Bit Score: 57; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:

Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 715 - 887
Target Start/End: Original strand, 384 - 556
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| || |||| |||||| | ||| |  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  384 agggtgtgtttgtttcaagttatctttgtaaattcctggaaatagaatgatggaaatatgcattcctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcct 483  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatg 887  Q
       ||||||||||||||||||||  || ||  |||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  484 aaatataaaatgttcctgggaatgaaataacattcccaaagaaaattgtgggaataaagttcccatgaagatg 556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 53; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 715 - 887
Target Start/End: Original strand, 21789 - 21961
Alignment:
Q  715 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 814  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||  | |||| |||||| | ||| |  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  21789 agggtgtatttgtttcaagttatctttgtaaattcctcgaaatagaatgatggaaatatgcattcctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcct 21888  T
Q  815 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatg 887  Q
     | ||||||||||||||||| ||  || ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  21889 agatataaaatgttcctgggtatgaaataacattcccaaaaaaaattgtgggaataaagttcccatgaagatg 21961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 915 - 1039
Target Start/End: Original strand, 43292 - 43417
Alignment:
Q  915 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 1013  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||| |||||||  |||| |||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43292 ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa 43391  T
Q  1014 ggaatgttattcctaagaataaattt 1039  Q
      ||| |||||||||| |||||||||    
T  43392 aaaatattattcctaaaaataaattt 43417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University