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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14851_high_1 (Length: 834)

Name: NF14851_high_1
Description: NF14851
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14851_high_1
NF14851_high_1
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (15-816)||(41301520-41302337)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 642; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 642; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 41302337 - 41301520
Alignment:
Q  15 tagggggtaacccgtagaaaaatagggcaggaaaataaatttaatacttcccaaaaaagaaatattttaaattttgggagtaatcgg----------gtg 104  Q
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T  41302337 tagggggtaacccgtagaaaaatagggcaggaaaataaatttaatacttcccaaaaaagaaatattttaaattttgggagtaatcggaaaaccagttgtg 41302238  T
Q  105 tttttcttatagtggaactttctttctttcaagaatctcatcatgattatataacccttagtaaatcatttgtgtgttggtattctattagtgtgcgatg 204  Q
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T  41302237 tttttcttatagtggaactttctttctttcaagagtctcatcatgattatataacccttagtaaatcatttgtgtgttggtattctattagtgtgcgatg 41302138  T
Q  205 ggtcgagaatgagcatataagatttcatatnnnnnnnnnnnccagcttaa-------tacatatttttggaggccaattatatgatgcataaatgagata 297  Q
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T  41302137 ggtcgagaatgagcatataagatttcatataaaaaaac---ccagcttaaatagtaatacatatttttggaggccaattatatgatgcataaatgagata 41302041  T
Q  298 -gatggtcttacattatgcacaaactatttatcattggatcattaaaataattagatatgatgtgatgcgccttattaattcaatggtgaaaaagacatt 396  Q
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T  41302040 cgaaggtcttacattatgcacaaactatttatcattggatcattaaaataattagatatgatgtgatgcgccttattaattcaatggtaaaaaagatatt 41301941  T
Q  397 tgtgtatgatgcaagatcttcttacttatgcatattagacaaaaccatatatgaaaataaatacttgtatattacattttcttatgaggctgactccaat 496  Q
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T  41301940 tgtatatgatgtaagatcttcttacttatgcatattagacaaaaccatatatgaaaataaatacttgtatattacattttcttatgaggctgactccaat 41301841  T
Q  497 ttcaatactccgttcacatatattttgtcttctgaactacatatacaattgtgtttgaataaat-cnnnnnnnnttatctttaactagataagacgaggg 595  Q
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T  41301840 ttcaatactccgttcacatatattttgtcttctgaactacatatacaattgtgtttgaataaataaataaataattatctttaactagataagacgaggg 41301741  T
Q  596 aatgcagttaattctcaacattttctatattgttcgccgtggaagagatttatgactggtttctaagttatagaattatatatactctcacgtcccattt 695  Q
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T  41301740 aatgcagttaattctcaacattttctatattgttcgccgtggaagagatttatgactggtttctaagttatagaattatatatactctcacgtcccattt 41301641  T
Q  696 ctttatgctcaattaatgtgtatttggttcatgacttaggatgcttaactactatagaattgactcttttaaatggatgggaaatgcctttaaactagtt 795  Q
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T  41301640 ctttatgcgcaattaatgtgtatttggttcatgacttaggatgcttaactactatagaattgactcttttaaatggatgggaaatacctttaaacaagtt 41301541  T
Q  796 gtttctattcttccccgttat 816  Q
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T  41301540 gtttctattcttccccgttat 41301520  T

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