View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14857_low_7 (Length: 403)

Name: NF14857_low_7
Description: NF14857
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14857_low_7
NF14857_low_7
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (81-401)||(18385249-18385569)
chr8 (81-401)||(6416770-6417090)
chr8 (81-401)||(12501321-12501641)
chr8 (81-398)||(39621754-39622071)
chr8 (155-401)||(29088792-29089039)
chr8 (95-401)||(16888247-16888543)
chr8 (86-384)||(13279410-13279709)
chr8 (86-384)||(16428344-16428643)
chr8 (86-384)||(40557593-40557892)
chr8 (86-384)||(36896221-36896520)
chr8 (89-384)||(22514013-22514309)
chr8 (150-384)||(33441580-33441815)
chr8 (89-157)||(16888412-16888479)
chr8 (86-136)||(33441536-33441586)
chr8 (89-157)||(29088966-29089033)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (81-401)||(18902769-18903089)
chr6 (81-397)||(19420780-19421096)
chr6 (114-401)||(22510483-22510769)
chr6 (89-384)||(4271278-4271574)
chr6 (86-384)||(14175602-14175901)
chr6 (86-384)||(14180138-14180437)
chr6 (86-241)||(19419903-19420058)
chr6 (89-157)||(22510530-22510597)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (86-401)||(2023239-2023554)
chr1 (81-401)||(18410412-18410732)
chr1 (86-401)||(49005068-49005383)
chr1 (88-401)||(32523620-32523933)
chr1 (86-401)||(2840540-2840856)
chr1 (81-401)||(28645428-28645748)
chr1 (86-401)||(38984194-38984510)
chr1 (89-401)||(43642821-43643132)
chr1 (86-401)||(45537064-45537378)
chr1 (86-397)||(24775642-24775952)
chr1 (86-383)||(20274599-20274899)
chr1 (89-401)||(42806917-42807231)
chr1 (86-319)||(21332575-21332808)
chr1 (89-384)||(13496722-13497018)
chr1 (86-384)||(42435848-42436147)
chr1 (86-384)||(32049941-32050240)
chr1 (86-239)||(42806769-42806923)
chr1 (89-228)||(42806845-42806985)
chr1 (86-167)||(24455189-24455270)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (88-401)||(198545-198858)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (81-401)||(40263608-40263928)
chr2 (86-401)||(4651087-4651403)
chr2 (89-401)||(6904630-6904942)
chr2 (86-401)||(42224244-42224560)
chr2 (91-390)||(9616558-9616857)
chr2 (93-401)||(4720359-4720667)
chr2 (86-401)||(3554636-3554944)
chr2 (86-384)||(39122162-39122461)
chr2 (86-384)||(12256318-12256617)
chr2 (84-384)||(42842680-42842981)
chr2 (86-228)||(9616479-9616624)
chr2 (94-239)||(6904490-6904636)
chr2 (89-228)||(6904558-6904698)
chr2 (89-228)||(4720603-4720743)
chr2 (88-192)||(4720712-4720819)
chr2 (161-239)||(4720737-4720818)
chr2 (89-157)||(9616628-9616695)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (89-401)||(36352847-36353159)
chr4 (81-401)||(5944052-5944372)
chr4 (86-401)||(27024163-27024478)
chr4 (90-401)||(34802244-34802554)
chr4 (86-401)||(48426123-48426438)
chr4 (86-401)||(25887599-25887915)
chr4 (89-401)||(48945460-48945772)
chr4 (89-384)||(7509649-7509945)
chr4 (86-384)||(27071214-27071513)
chr4 (86-384)||(9768254-9768554)
chr4 (86-360)||(4943371-4943646)
chr4 (86-384)||(27151300-27151612)
chr4 (89-192)||(48945315-48945419)
chr4 (89-228)||(48945388-48945528)
chr4 (161-239)||(48945315-48945394)
chr4 (89-157)||(34802315-34802382)
chr4 (160-228)||(36353091-36353160)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (86-401)||(1598302-1598617)
chr5 (81-401)||(16478365-16478685)
chr5 (86-401)||(39564857-39565172)
chr5 (86-401)||(22496600-22496917)
chr5 (86-401)||(40830669-40830976)
chr5 (81-401)||(5812178-5812498)
chr5 (86-401)||(22386559-22386875)
chr5 (86-384)||(25336248-25336547)
chr5 (86-384)||(28969208-28969507)
chr5 (86-384)||(22720964-22721263)
chr5 (86-384)||(23107191-23107490)
chr5 (86-384)||(1212338-1212637)
chr5 (86-384)||(16475769-16476068)
chr5 (86-384)||(36789346-36789646)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (81-401)||(34643453-34643773)
chr7 (81-401)||(42049494-42049814)
chr7 (86-401)||(6612844-6613159)
chr7 (84-401)||(21953814-21954132)
chr7 (81-401)||(46804948-46805269)
chr7 (86-401)||(47400401-47400717)
chr7 (86-384)||(35505024-35505323)
chr7 (86-384)||(18784274-18784573)
chr7 (86-360)||(37315770-37316045)
chr7 (86-384)||(42046782-42047081)
chr7 (86-384)||(44045214-44045513)
chr7 (86-360)||(35113540-35113814)
chr7 (329-401)||(9178978-9179050)
chr7 (142-253)||(19296415-19296527)
chr7 (249-328)||(19296259-19296338)
chr7 (89-167)||(19296429-19296507)
chr7 (324-385)||(19296154-19296215)
chr7 (122-190)||(19296559-19296628)
chr7 (194-240)||(19296581-19296627)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (86-401)||(28418002-28418317)
chr3 (86-401)||(4066351-4066666)
chr3 (86-401)||(37964978-37965293)
chr3 (86-401)||(47334050-47334364)
chr3 (86-401)||(23302401-23302717)
chr3 (86-380)||(22398012-22398305)
chr3 (86-400)||(33956836-33957149)
chr3 (86-360)||(23303047-23303322)
chr3 (161-401)||(33955531-33955771)
chr3 (86-401)||(45579741-45580044)
chr3 (162-401)||(3344651-3344892)
chr3 (86-384)||(35350470-35350769)
chr3 (86-384)||(10122346-10122645)
chr3 (86-384)||(38190124-38190423)
chr3 (86-360)||(54610344-54610619)
chr3 (89-384)||(30106848-30107144)
chr3 (86-384)||(26705782-26706080)
chr3 (86-360)||(43844988-43845263)
chr3 (86-384)||(1002678-1002977)
chr3 (84-362)||(44516533-44516812)
chr3 (86-157)||(33955703-33955774)
chr3 (90-157)||(3344825-3344892)
[»] scaffold0088 (4 HSPs)
scaffold0088 (81-401)||(10981-11301)
scaffold0088 (86-401)||(977-1283)
scaffold0088 (86-401)||(24861-25166)
scaffold0088 (86-283)||(8475-8671)
[»] scaffold1289 (1 HSPs)
scaffold1289 (86-401)||(388-693)
[»] scaffold1788 (1 HSPs)
scaffold1788 (120-384)||(1080-1359)
[»] scaffold0368 (3 HSPs)
scaffold0368 (86-239)||(9722-9876)
scaffold0368 (89-228)||(9660-9800)
scaffold0368 (89-173)||(9644-9728)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (286-384)||(11470-11568)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18385569 - 18385249
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18385569 cacagttggttacaatcaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 18385470  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18385469 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 18385370  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18385369 ggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 18385270  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18385269 ttacttaatattaataagata 18385249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Original strand, 6416770 - 6417090
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6416770 cacagttggttacaataaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 6416869  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6416870 aatataattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 6416969  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6416970 ggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 6417069  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6417070 ttacttaatattaataagata 6417090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12501641 - 12501321
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12501641 cacagttggttacaatcaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 12501542  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12501541 aatataattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 12501442  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12501441 tgtccgttacactatgacagtaatctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttatttgttacaaaattata 12501342  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  12501341 ttacttaatattaataagata 12501321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 81 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 39622071 - 39621754
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39622071 cacagttggctacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 39621972  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39621971 aatataattattattcgattaacatttatataatacattaaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaattattttttgaatttt 39621872  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39621871 ggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaaataggttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 39621772  T
Q  381 ttactgaatattaataag 398  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  39621771 ttacttaatattaataag 39621754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 155 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29089039 - 29088792
Alignment:
Q  155 ttgtatgttacaatcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataa 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29089039 ttgtatgttacaatcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttttacggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataa 29088940  T
Q  255 cttgaataaattatattttgaattttggttagttacactatgacagtaacctactaatta-aaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataa 353  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29088939 ctttaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacaggaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataa 29088840  T
Q  354 ttaatttttattcattacaaaattatattactgaatattaataagata 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29088839 ttaatttttattctttacaaaattatattacttaatattaataagata 29088792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 95 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16888543 - 16888247
Alignment:
Q  95 atcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataattattat 194  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16888543 atcaaataattattaatataactattttttcgattaaaatttat--gttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatataattagtat 16888446  T
Q  195 tcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagttacacta 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  16888445 tcgattaacatttatacggtacattaaaaatttggtaggtta--------taataaataacttgaataaattatattttaaattttggtgtgttacacta 16888354  T
Q  295 tgacagtaacctactaattaaaaa-tttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaatatta 393  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  16888353 tgacaggaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatatta-ttaatatta 16888255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13279709 - 13279410
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  13279709 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 13279610  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  13279609 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 13279510  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  13279509 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 13279410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 16428344 - 16428643
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  16428344 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 16428443  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  16428444 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 16428543  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  16428544 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 16428643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 40557593 - 40557892
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  40557593 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 40557692  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  40557693 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 40557792  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  40557793 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 40557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36896520 - 36896221
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||     
T  36896520 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataactattaatc 36896421  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  36896420 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 36896321  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  36896320 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 36896221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 384
Target Start/End: Original strand, 22514013 - 22514309
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaatataa 187  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  22514013 gttacaatcagataatgattaatataattactatttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaa 22514112  T
Q  188 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagt 287  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  22514113 ttagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgt 22514212  T
Q  288 tacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  22514213 tacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 22514309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 384
Target Start/End: Original strand, 33441580 - 33441815
Alignment:
Q  150 aaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataat 248  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33441580 aaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatataattagtattcaattaacatttatatgtaacattaaaaatttggtcggttacaaatttataat 33441679  T
Q  249 aaataacttgaataaattatattttgaattttggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggtta 348  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  33441680 aaataaattaaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacttactaattaaaaaattaattgtattaattaatttttaaggtta 33441779  T
Q  349 tataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  33441780 cataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 33441815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16888479 - 16888412
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  16888479 gttacaatcaaataattattaatataattagt-attcgattaacatttatacggtacattaaaaatttg 16888412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Original strand, 33441536 - 33441586
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaattt 136  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33441536 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaattt 33441586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29089033 - 29088966
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  29089033 gttacaatcaaataattattaatataattagt-attcgattaacatttttacggtacattaaaaatttg 29088966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18903089 - 18902769
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18903089 cacagttggttacaatcaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 18902990  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18902989 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 18902890  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18902889 ggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 18902790  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18902789 ttacttaatattaataagata 18902769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 81 - 397
Target Start/End: Original strand, 19420780 - 19421096
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19420780 cacagttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatattatacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 19420879  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19420880 aatataattattattcgattaacatttatatagtacattaaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 19420979  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19420980 ggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 19421079  T
Q  381 ttactgaatattaataa 397  Q
    ||||| |||||||||||    
T  19421080 ttacttaatattaataa 19421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 114 - 401
Target Start/End: Original strand, 22510483 - 22510769
Alignment:
Q  114 aataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatgg 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22510483 aataattgtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatataa 22510582  T
Q  214 tacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagttacactatgacagtaacctactaatt 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22510583 tacattaaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaatgattttttgaattttggtctgttacactatgatagtaacctactaatt 22510682  T
Q  314 aaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaatattaataagata 401  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22510683 aaaaatttaattatagt-attattttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattacttaatattaataagata 22510769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 89 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4271574 - 4271278
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaatataa 187  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  4271574 gttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaa 4271475  T
Q  188 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagt 287  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  4271474 ttagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgt 4271375  T
Q  288 tacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  4271374 tacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 4271278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 14175602 - 14175901
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  14175602 ttggttataatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 14175701  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  14175702 taattagtattcaattaacatttatatctaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 14175801  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  14175802 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 14175901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 14180138 - 14180437
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  14180138 ttggttataatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 14180237  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  14180238 taattagtattcaattaacatttatatctaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 14180337  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  14180338 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 14180437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19420058 - 19419903
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19420058 ttggttacaatcaaatatttattaatataactattgtttcgattaaaatttatatgttactttaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatat 19419959  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaa 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19419958 aattagtattcgattaacatttatacggtacattaaaaatttgataggttacaaaa 19419903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Original strand, 22510530 - 22510597
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  22510530 gttacaatcaaatgattattaatataattatt-attcgattaacatttatataatacattaaaaatttg 22510597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 2023239 - 2023554
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2023239 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 2023338  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2023339 aattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 2023438  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2023439 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatctaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattact 2023538  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  2023539 taatattaataagata 2023554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Original strand, 18410412 - 18410732
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18410412 cacagttggttacaatcaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 18410511  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18410512 aatataattattattcgattaacatttatatagtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 18410611  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18410612 ggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 18410711  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18410712 ttacttaatattaataagata 18410732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 49005068 - 49005383
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49005068 ttggttacaatcaaataattattaatatagtaattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 49005167  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  49005168 aattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 49005267  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49005268 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagaaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattact 49005367  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  49005368 taatattaataagata 49005383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 88 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32523933 - 32523620
Alignment:
Q  88 ggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataa 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32523933 ggttacaatcaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaatataa 32523834  T
Q  188 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  32523833 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttgatccgt 32523734  T
Q  288 tacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactga 387  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32523733 tacactataacagtaacctactaattaaaattttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattactta 32523634  T
Q  388 atattaataagata 401  Q
    ||||||||||||||    
T  32523633 atattaataagata 32523620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 2840540 - 2840856
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2840540 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttttattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaatat 2840639  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2840640 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 2840739  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  2840740 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttgcaaaattatattaca 2840839  T
Q  386 gaata-ttaataagata 401  Q
     |||| |||||||||||    
T  2840840 taatatttaataagata 2840856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28645748 - 28645428
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28645748 cacagttggctacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 28645649  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28645648 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 28645549  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28645548 ggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 28645449  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  28645448 ttacttaatattaataagata 28645428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38984510 - 38984194
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  38984510 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttttattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaaccaaataattattaatat 38984411  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38984410 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 38984311  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  38984310 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattaca 38984211  T
Q  386 gaata-ttaataagata 401  Q
     |||| |||||||||||    
T  38984210 taatatttaataagata 38984194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 89 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43643132 - 43642821
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataat 188  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43643132 gttacaatcaaataattattattataataattggttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgtt-caatcaaatgattattaatataat 43643034  T
Q  189 tattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagtt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  43643033 tattattcgattaacatttatatgatacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgtt 43642934  T
Q  289 acactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43642933 acactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattaatttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattacttaa 43642834  T
Q  389 tattaataagata 401  Q
    |||||||||||||    
T  43642833 tattaataagata 43642821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 45537064 - 45537378
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45537064 ttggttacaatcaaataattattaatatagtaattatttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 45537163  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  45537164 aattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttcgg-tc 45537262  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45537263 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaaatagtttttaaggttatatgattaatttttattcgttacaaaattatattact 45537362  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  45537363 taatattaataagata 45537378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 86 - 397
Target Start/End: Original strand, 24775642 - 24775952
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24775642 ttggttacaataaaataattattaatataataattgtttcgattaaa-tttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaatat 24775740  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  24775741 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttgataggttacaaaattataataaataacttgaataaattatatttttaattttggtcc 24775840  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24775841 gttacactatgacattaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattaatttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattact 24775940  T
Q  386 gaatattaataa 397  Q
     |||||||||||    
T  24775941 taatattaataa 24775952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 86 - 383
Target Start/End: Original strand, 20274599 - 20274899
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20274599 ttggttacaatcaaataattattaatataactattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatat 20274698  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20274699 aattagtattcgattaacatttatacggaacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 20274798  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaa-tttaattgtagtaattag--tttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatatt 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20274799 gttacactatgacagaaacctactaattaaaaattttaattttagtaattagtttttttaaggttatataattaatttttattcattacaaaattatatt 20274898  T
Q  383 a 383  Q
    |    
T  20274899 a 20274899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 89 - 401
Target Start/End: Original strand, 42806917 - 42807231
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataat 188  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  42806917 gttacaatcaaataattattattataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgatacaatcaaataattattaatatatt 42807016  T
Q  189 tattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagtt 288  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  42807017 tagtattcgattaacatctatacggtacatcaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataatttgaataaattatattttaaattttggtccgtt 42807116  T
Q  289 acactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattag--tttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactg 386  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  42807117 acactatgactgtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattactt 42807216  T
Q  387 aatattaataagata 401  Q
    |||||||||||||||    
T  42807217 aatattaataagata 42807231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 86 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21332808 - 21332575
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21332808 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 21332709  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21332708 aattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 21332609  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332608 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaat 21332575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 89 - 384
Target Start/End: Original strand, 13496722 - 13497018
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaatataa 187  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  13496722 gttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaa 13496821  T
Q  188 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagt 287  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  13496822 ttagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgt 13496921  T
Q  288 tacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  13496922 tacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 13497018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 42435848 - 42436147
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  42435848 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 42435947  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  42435948 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 42436047  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  42436048 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 42436147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 32049941 - 32050240
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  32049941 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 32050040  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  32050041 taattaatattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 32050140  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  32050141 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttgtataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 32050240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Original strand, 42806769 - 42806923
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacatt-aaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42806769 ttggttaaaatcaaataattattagaataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaaattagtacgttacaatcaaataattattaata 42806868  T
Q  185 taattatta-ttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaa 239  Q
     |||||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  42806869 caattattattttgattaaaattt-tatgttactttaaaaaattggtacgttacaa 42806923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Original strand, 42806845 - 42806985
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg-tatgttacaatcaaatgattattaatataa 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42806845 gttacaatcaaataattattaatacaattattattttgattaaaattt-tatgttactttaaaaaattggtacgttacaatcaaataattattattataa 42806943  T
Q  188 ttatt-attcgattaacatttatatggtacattaaaaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42806944 ttattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 42806985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24455270 - 24455189
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa 167  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||    
T  24455270 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaa 24455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 88 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 198858 - 198545
Alignment:
Q  88 ggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataa 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  198858 ggttacaatcaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaatataa 198759  T
Q  188 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  198758 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgt 198659  T
Q  288 tacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactga 387  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  198658 tacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattactta 198559  T
Q  388 atattaataagata 401  Q
    ||||||||||||||    
T  198558 atattaataagata 198545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Original strand, 40263608 - 40263928
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40263608 cacagttggttacaatcaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 40263707  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40263708 aatataattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 40263807  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40263808 tgtccgttacactatgacagtaatctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 40263907  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  40263908 ttacttaatattaataagata 40263928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4651403 - 4651087
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4651403 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttttattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatat 4651304  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  4651303 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataatttgaataaattatattttgaattttggtcc 4651204  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  4651203 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttgcaaaattatattaca 4651104  T
Q  386 gaata-ttaataagata 401  Q
     |||| |||||||||||    
T  4651103 taatatttaataagata 4651087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 89 - 401
Target Start/End: Original strand, 6904630 - 6904942
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataat 188  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  6904630 gttacaatcaaataataattattataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgatacaatcaaataattattaatatatt 6904729  T
Q  189 tattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagtt 288  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  6904730 tagtattcgattaacatctatacggtacatcaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttaaattttggtccgtt 6904829  T
Q  289 acactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaa 388  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6904830 acactatgactgtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattacttaa 6904929  T
Q  389 tattaataagata 401  Q
    |||||||||||||    
T  6904930 tattaataagata 6904942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 42224244 - 42224560
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  42224244 ttggttacaatcaaataattattaatataactattgttttgattaagatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatat 42224343  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  42224344 aattagtattcaattaacatttatacggtacattaaaaatttggtaggttacaaatttataataaataacttgaataaattatattttaaattttggtcc 42224443  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaatt-aaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42224444 gttacactatgacagaaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttgtattcattacaaaattatattac 42224543  T
Q  385 tgaatattaataagata 401  Q
    | |||||||||||||||    
T  42224544 ttaatattaataagata 42224560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 91 - 390
Target Start/End: Original strand, 9616558 - 9616857
Alignment:
Q  91 tacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataatta 190  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9616558 tacaatcaaataattattaataaaattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatataatta 9616657  T
Q  191 ttattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagttac 290  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9616658 gtattcgattaacatttatacggtacattaacaatttggttagttaaaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttac 9616757  T
Q  291 actatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaata 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  9616758 actatgacagtaacctactaattaaaaatgtaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatatcacttaata 9616857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 93 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4720667 - 4720359
Alignment:
Q  93 caatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataattatt 192  Q
    ||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  4720667 caatcaaataataattattataattattgtttcaattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaattaaataattattaatatatttagt 4720568  T
Q  193 attcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagttacac 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |     
T  4720567 attcgattaacatttatacggtacattaaaaatttgataggttacaaaaatataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttaaaa 4720468  T
Q  293 tatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaatatt 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4720467 tataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattacttaatatt 4720368  T
Q  393 aataagata 401  Q
    |||||||||    
T  4720367 aataagata 4720359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3554944 - 3554636
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3554944 ttggttacaatcaaataattattaatataactattttttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatat 3554845  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  3554844 aattagtattcgattaacatttatacggtacattaaaaatttggtagg--------ttataataaataacttgaataaattatattttaaattttggtgc 3554753  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaatt-aaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||     
T  3554752 gttacactatgacaggaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaatttaattat 3554653  T
Q  385 tgaatattaataagata 401  Q
    | |||||||||||||||    
T  3554652 ttaatattaataagata 3554636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39122461 - 39122162
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  39122461 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 39122362  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  39122361 taattagtattcaattaacatttatatataacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 39122262  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  39122261 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 39122162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12256617 - 12256318
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||     
T  12256617 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattactaatc 12256518  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||      
T  12256517 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttggga 12256418  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  12256417 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 12256318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 84 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42842981 - 42842680
Alignment:
Q  84 aattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaa 182  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  42842981 aattggttacaatcagataatgattaataaaattactgtttcgattaaaatttatattttacaatcaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaa 42842882  T
Q  183 tataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttgg 282  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42842881 tctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaattttgttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttaaattttgg 42842782  T
Q  283 ttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatatt 382  Q
        |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  42842781 gacattacactaagacattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaagattatataattaatttttgtttcttacaaaactatatt 42842682  T
Q  383 ac 384  Q
    ||    
T  42842681 ac 42842680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 9616479 - 9616624
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacat--taaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaat 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  9616479 ttggttacaatcaaataattattaatataattattgtttcgattaaaatctatatgttacataaaaaaaattggtacggtacaatcaaataattattaat 9616578  T
Q  184 ataattatt-attcgattaacatttatatggtacattaaaaatttg 228  Q
    | |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9616579 aaaattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 9616624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 239
Target Start/End: Original strand, 6904490 - 6904636
Alignment:
Q  94 aatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacatt-aaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataattatt 192  Q
    |||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6904490 aatcaagtaattattagaataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaaattagtacgttacaatcaaataattattaatacaattatt 6904589  T
Q  193 a-ttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaa 239  Q
    | || |||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6904590 attttgattaaaattt-tatgttactttaaaaaattggtacgttacaa 6904636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Original strand, 6904558 - 6904698
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacatt-aaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataa 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||    
T  6904558 gttacaatcaaataattattaatacaattattattttgattaaaattt-tatgttactttaaaaaattggtacgttacaatcaaataataattattataa 6904656  T
Q  188 ttatt-attcgattaacatttatatggtacattaaaaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6904657 ttattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 6904698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4720743 - 4720603
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacatt-aaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataa 187  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||| || |||| |||||    
T  4720743 gttacaatcaaataatcattgatacaattattgttttgattaaaattt-tatgttactttaaaaaattggtacgttgcaatcaaataataattattataa 4720645  T
Q  188 ttatt-attcgattaacatttatatggtacattaaaaatttg 228  Q
    |||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4720644 ttattgtttcaattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 4720603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4720819 - 4720712
Alignment:
Q  88 ggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttaca---ttaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaata 184  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||   | ||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||    
T  4720819 ggttacaatcaaataattattaatataattattatttcaattaaaatttatatattacatattaaaaaattggtacgttacaatcaaataatcattgata 4720720  T
Q  185 taattatt 192  Q
     |||||||    
T  4720719 caattatt 4720712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4720818 - 4720737
Alignment:
Q  161 gttacaatcaaatgattattaatataattatta-ttcgattaacatttatatggtac--attaaaaatttggtaggttacaa 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||  |||||||| |||||| |||||||    
T  4720818 gttacaatcaaataattattaatataattattatttcaattaaaatttatatattacatattaaaaaattggtacgttacaa 4720737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Original strand, 9616628 - 9616695
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  9616628 gttacaatcaaataattattaatataattagt-attcgattaacatttatacggtacattaacaatttg 9616695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 89 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 36353159 - 36352847
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataat 188  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36353159 gttacaatcaagtaattattaatataataattgtttcgattaaattttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaatataat 36353060  T
Q  189 tattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagtt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36353059 tattattcgattaacatttatatggtacattaaatatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgtt 36352960  T
Q  289 acactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36352959 acactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattacttaa 36352860  T
Q  389 tattaataagata 401  Q
    |||||||||||||    
T  36352859 tattaataagata 36352847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Original strand, 5944052 - 5944372
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5944052 cacagttggttacaataaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 5944151  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5944152 aatataattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 5944251  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5944252 gatccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 5944351  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  5944352 ttacttaatattaataagata 5944372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27024478 - 27024163
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27024478 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaatat 27024379  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27024378 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttaataggttacaaaattaaaataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 27024279  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27024278 gttattatatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttatccgttacaaaattatattact 27024179  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  27024178 taatattaataagata 27024163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 90 - 401
Target Start/End: Original strand, 34802244 - 34802554
Alignment:
Q  90 ttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34802244 ttacaataaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaatataatt 34802343  T
Q  190 attattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagtta 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  34802344 attattcgattaacatttatattgtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaattaattatattttgaattttggtccgtta 34802443  T
Q  290 cactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaat 389  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  34802444 cactatgacagtaacctattaattaaaaatttaattttagtcattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaatt-tattacttaat 34802542  T
Q  390 attaataagata 401  Q
    ||||||| ||||    
T  34802543 attaataggata 34802554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 48426123 - 48426438
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  48426123 ttggttacaataaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttatattaaaaatttgtatgatagaatcaaatgattattaatat 48426222  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48426223 aattattattcaatcaacatttatatggaacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 48426322  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  48426323 gttacaatatgacagtaacatactaattaaaaatttaatagtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaaatatattact 48426422  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  48426423 taatattaataagata 48426438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 25887599 - 25887915
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25887599 ttggttacaatcaaataattattaatataactattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatat 25887698  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||      
T  25887699 aattagtattcgattaacatttatacggtacattaaaaatttgataggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttaaattttggtct 25887798  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaatt-aaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25887799 gttacactataacaagaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattac 25887898  T
Q  385 tgaatattaataagata 401  Q
    | |||||||||||||||    
T  25887899 ttaatattaataagata 25887915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 89 - 401
Target Start/End: Original strand, 48945460 - 48945772
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataat 188  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |    
T  48945460 gttacaatcaaataataattattataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacattacaatcaaataattattaatatatt 48945559  T
Q  189 tattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagtt 288  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||    
T  48945560 tagtattcgattaacaattatatggtacattaaatatttggtagattacaaaattataataaataacttgaataaattacattttaaattttggtctgtt 48945659  T
Q  289 acactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaa 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  48945660 acactataacagtaacctactaattaaaaatttaattatagtaattaatttttaaggttatataattaatttttattctttacaaaattatattacttaa 48945759  T
Q  389 tattaataagata 401  Q
    |||||||||||||    
T  48945760 tattaataagata 48945772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 89 - 384
Target Start/End: Original strand, 7509649 - 7509945
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaatataa 187  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  7509649 gttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaa 7509748  T
Q  188 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagt 287  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  7509749 ttagtattcaattaacatttatatgtaacattaaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgt 7509848  T
Q  288 tacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  7509849 tacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtactaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 7509945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 27071214 - 27071513
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  27071214 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 27071313  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  27071314 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 27071413  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  27071414 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 27071513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9768554 - 9768254
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  9768554 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 9768455  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  9768454 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattaaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttggga 9768355  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaatta-aaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatatta 383  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||    
T  9768354 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaaattaattttattaattaatttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatatta 9768255  T
Q  384 c 384  Q
    |    
T  9768254 c 9768254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 360
Target Start/End: Original strand, 4943371 - 4943646
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  4943371 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 4943470  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  4943471 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 4943570  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaattt 360  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4943571 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaagattatataattaattt 4943646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 27151300 - 27151612
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  27151300 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 27151399  T
Q  185 taattattattcgattaac-------------atttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatatt 271  Q
    |||||| ||||| ||||||             |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27151400 taattagtattcaattaacatttatatgtaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatatt 27151499  T
Q  272 ttgaattttggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattac 371  Q
    |||||||||||   ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  27151500 ttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttac 27151599  T
Q  372 aaaattatattac 384  Q
    |||| ||||||||    
T  27151600 aaaagtatattac 27151612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 192
Target Start/End: Original strand, 48945315 - 48945419
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacatt-aaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataa 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  48945315 gttacaatcaaataattattaatataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaaattggtacgttacaatcaaataattattaatacaa 48945414  T
Q  188 ttatt 192  Q
    |||||    
T  48945415 ttatt 48945419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Original strand, 48945388 - 48945528
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacatt-aaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataa 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  48945388 gttacaatcaaataattattaatacaattattgttttgaataaaattt-tatgttactttaaaaaattggtatgttacaatcaaataataattattataa 48945486  T
Q  188 ttatt-attcgattaacatttatatggtacattaaaaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48945487 ttattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 48945528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Original strand, 48945315 - 48945394
Alignment:
Q  161 gttacaatcaaatgattattaatataattattatt-cgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaa 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  48945315 gttacaatcaaataattattaatataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaaattggtacgttacaa 48945394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Original strand, 34802315 - 34802382
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  34802315 gttacaatcaaatgattattaatataattatt-attcgattaacatttatattgtacattaaaaatttg 34802382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36353160 - 36353091
Alignment:
Q  160 tgttacaatcaaatgattattaatataattatt-attcgattaacatttatatggtacattaaaaatttg 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  36353160 tgttacaatcaagtaattattaatataataattgtttcgattaaattttatatgttacattaaaaatttg 36353091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1598617 - 1598302
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1598617 ttggttactatcaaataattattaatatagtaattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 1598518  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1598517 aattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 1598418  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598417 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattact 1598318  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     | |||||||||||||    
T  1598317 tactattaataagata 1598302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Original strand, 16478365 - 16478685
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16478365 cacagttggttacaataaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 16478464  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16478465 aatataattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 16478564  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16478565 ggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaagattatataattaatttttattcgttacaaaattata 16478664  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16478665 ttacttaatattaataagata 16478685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39565172 - 39564857
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39565172 ttggttacaatcaaataattattaatataataatggttttgattaaaatttatatgttacattaaaattttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 39565073  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39565072 aattattattcaattaacatttatatgatacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 39564973  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39564972 gttacagtatgacagtaacctactaattaaaattttaattgtagtaattaatttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattact 39564873  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  39564872 taatattaataagata 39564857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22496917 - 22496600
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22496917 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaattttgtacgttacaatcaaatgattattaatat 22496818  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  22496817 aatcattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaagttacaaaattataacaaataacttgaataaattatattttaaattttggtct 22496718  T
Q  286 gttaca--ctatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatatta 383  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22496717 gttacactctatgatagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatatta 22496618  T
Q  384 ctgaatattaataagata 401  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  22496617 cttgatattaataagata 22496600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 40830669 - 40830976
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40830669 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 40830768  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40830769 aattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 40830868  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||    
T  40830869 gttacactatgacaataacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatata--------ttattcgttacaaaattatattact 40830960  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  40830961 taatattaataagata 40830976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5812498 - 5812178
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5812498 cacagttggctacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 5812399  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5812398 aatataattattattcgattaacatttatataatacattaaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaattattttttgaatttt 5812299  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5812298 ggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaaataggttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 5812199  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  5812198 ttacttaatattaataagata 5812178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22386875 - 22386559
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22386875 ttggttacaatcaaataattattaatataactattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatat 22386776  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22386775 aattagtattcgattaatatttatacggtacattaaaattttgataggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 22386676  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaatta-aaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22386675 gttacactatgacaggaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgatacaaaattatattac 22386576  T
Q  385 tgaatattaataagata 401  Q
    | |||||||||||||||    
T  22386575 ttaatattaataagata 22386559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 25336248 - 25336547
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  25336248 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 25336347  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  25336348 taattaatattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttataaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 25336447  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  25336448 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 25336547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28969507 - 28969208
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  28969507 ttggttacaatcagataatgattaatataattattgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 28969408  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||       
T  28969407 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgaga 28969308  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  28969307 cgttacactaagacattaacttactaattaaaaaattcattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 28969208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22721263 - 22720964
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||     
T  22721263 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattactaatc 22721164  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||      
T  22721163 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttggga 22721064  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  22721063 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 22720964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23107490 - 23107191
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  23107490 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 23107391  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  23107390 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 23107291  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  23107290 cgttacactaaggcattaacttactaattaaaaaattcattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 23107191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1212637 - 1212338
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  1212637 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 1212538  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  1212537 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 1212438  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || | || ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  1212437 cgttacactaaggcatttacttactaattaaaaaattcattgtattaattagtttttaagattatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 1212338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 16475769 - 16476068
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  16475769 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 16475868  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||      
T  16475869 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactaaataaattatattttgaattttggga 16475968  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||| || |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  16475969 cgttacactaaggcattaacttaataattaaaaaattcattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 16476068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36789646 - 36789346
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttac-aatcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||     
T  36789646 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaatgttacaaatcaaataattattaatc 36789547  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  36789546 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaattagtatagttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 36789447  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaat-taaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatatta 383  Q
     |||||||||   || ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||    
T  36789446 cgttacactaatgcattaacctactaatcaaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatatta 36789347  T
Q  384 c 384  Q
    |    
T  36789346 c 36789346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34643773 - 34643453
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34643773 cacagttggttacaatcaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 34643674  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34643673 aatataattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 34643574  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34643573 ggtctgttacactataacaataaactactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattata 34643474  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  34643473 ttacttaatattaataagata 34643453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Original strand, 42049494 - 42049814
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42049494 cacagttggttacaataaaatcattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 42049593  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42049594 aatataattattattcaattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaatttt 42049693  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42049694 ggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaagattatataattaatttttattcgttacaaaattata 42049793  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  42049794 ttacttaatattaataagata 42049814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 6612844 - 6613159
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6612844 ttggttacaataaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgctacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 6612943  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6612944 aattattattcaatcaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 6613043  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6613044 gttacaatatgacagtaacatactaattaaaaatttaatagtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaaatatattact 6613143  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  6613144 taatattaataagata 6613159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 84 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21954132 - 21953814
Alignment:
Q  84 aattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaat 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21954132 aattggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattataatttatatcttacatcaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattattaat 21954033  T
Q  184 ataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21954032 ataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtatgttacaaaattataataaataatttgaataaattatattttgaattttggt 21953933  T
Q  284 tagttacactatg--acagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatat 381  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  21953932 tcgttacactatgacacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaa-ttttattcgttacaaaattacat 21953834  T
Q  382 tactgaatattaataagata 401  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  21953833 tacttaatattaataagata 21953814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Original strand, 46804948 - 46805269
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46804948 cacagttggctacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattatt 46805047  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46805048 aatataattattattcgattaacatttatataatacattaaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaattattttttgaatttt 46805147  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaatta-gtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattat 379  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46805148 ggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaaataggtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattat 46805247  T
Q  380 attactgaatattaataagata 401  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  46805248 attacttaatattaataagata 46805269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47400717 - 47400401
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||    
T  47400717 ttggttacaatcaaataattattaatataactattatttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttatacgttacaatcaaataattattgatat 47400618  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  47400617 aattagtattcgattaacatttatacggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 47400518  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaatta-aaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47400517 gttacactatgacaagaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttgttcattacaaaattatattac 47400418  T
Q  385 tgaatattaataagata 401  Q
    | |||||||||||||||    
T  47400417 ttaatattaataagata 47400401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 35505024 - 35505323
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  35505024 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 35505123  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  35505124 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 35505223  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  35505224 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 35505323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18784573 - 18784274
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||     
T  18784573 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattactaatc 18784474  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  18784473 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 18784374  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  18784373 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 18784274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37316045 - 37315770
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  37316045 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 37315946  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  37315945 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttggga 37315846  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaattt 360  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37315845 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaagattatataattaattt 37315770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 42046782 - 42047081
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  42046782 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 42046881  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  42046882 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 42046981  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  42046982 cgttacactaaggcattaacttactaattaaaaaattcattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 42047081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44045513 - 44045214
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||     
T  44045513 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattactaatc 44045414  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||      
T  44045413 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttggga 44045314  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  44045313 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 44045214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 360
Target Start/End: Original strand, 35113540 - 35113814
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  35113540 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 35113639  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  35113640 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttg-ttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttggga 35113738  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaattt 360  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35113739 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaattt 35113814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9179050 - 9178978
Alignment:
Q  329 gtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattactgaatattaataagata 401  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9179050 gtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattacttaatattaataagata 9178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19296527 - 19296415
Alignment:
Q  142 ttacattaaaaatttg-tatgttacaatcaaatgattattaatataattatta-ttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaa 239  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| |||||||    
T  19296527 ttacattaaaaatttggtacgttacaatcaaatcattattaatataattagtattttgattaacatttatacgttacatt-aaaatcttgtaagttacaa 19296429  T
Q  240 aattataataaata 253  Q
    ||||||||| ||||    
T  19296428 aattataatgaata 19296415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19296338 - 19296259
Alignment:
Q  249 aaataacttgaataaattatattttgaattttggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgta 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19296338 aaataacttgtataaattatattttaaattttagtccgttacaaaattacaataacatactaattaaaaatttaattgta 19296259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19296507 - 19296429
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  19296507 gttacaatcaaatcattattaatataattagtattttgattaacatttatacgttacattaaaatcttgtaagttacaa 19296429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19296215 - 19296154
Alignment:
Q  324 ttgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  19296215 ttgtagtaattagtgtttgaggttttataattaatttttattcgttagaaaaatatattact 19296154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19296628 - 19296559
Alignment:
Q  122 tttcgattaaaatttatatgttacatta-aaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatataatta 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  19296628 tttcgattaagatttatatgttacattaaaaaattggtacgttacaaacaaataattaataataaaatta 19296559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19296627 - 19296581
Alignment:
Q  194 ttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaa 240  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19296627 ttcgattaagatttatatgttacattaaaaaattggtacgttacaaa 19296581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28418317 - 28418002
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28418317 ttggttacaataaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 28418218  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  28418217 aattattattcaatcaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataatttgaataaattatattttgaattttggtcc 28418118  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28418117 gttacactatgacagtaacatactaattaaaaatttaatagtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaaatatattact 28418018  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  28418017 taatattaataagata 28418002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4066666 - 4066351
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4066666 ttggttacaataaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgctacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 4066567  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4066566 aattattattcaatcaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 4066467  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4066466 gttacaatatgacagtaacatactaattaaaaatttaatagtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaaatatattact 4066367  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  4066366 taatattaataagata 4066351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 37964978 - 37965293
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37964978 ttggttacaataaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgctacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 37965077  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37965078 aattattattcaatcaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtcc 37965177  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37965178 gttacaatatgacagtaacatactaattaaaaatttaatagtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaaatatattact 37965277  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  37965278 taatattaataagata 37965293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47334364 - 47334050
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47334364 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatatatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 47334265  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  47334264 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggta-gttacaaaattataacaattaacttgaataaattatattttcaattttggtcc 47334166  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  47334165 gttacactatgacagtaaccaactaattaaaaatttaattgtagtaattaatttttaaggttatataattaatttttattcgttataaaattatattact 47334066  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  47334065 taatattaataagata 47334050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 23302401 - 23302717
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23302401 ttggttacaatcaaataattattaatataactattatttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaataattattaatat 23302500  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23302501 aattagtattcgattaacatttatacggtacattaaaaatttgataggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtct 23302600  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaatt-aaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23302601 gttacactttaacaggaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaatttttattcgttacaaaattatattac 23302700  T
Q  385 tgaatattaataagata 401  Q
    | |||||||||||||||    
T  23302701 ttaatattaataagata 23302717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 86 - 380
Target Start/End: Original strand, 22398012 - 22398305
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22398012 ttggttacaatcaaataattattaatatagtaattatttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaatcaaatgattattaatat 22398111  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22398112 aattattattcaattaacatttatatgctacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttgg-tc 22398210  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22398211 gttacactatgacagtaacctattaattaaaaatttaattgtagtaaatagtttttaaggttatatgattaatttttattcgttacaaaattata 22398305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 86 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33957149 - 33956836
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  33957149 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttatacgttagaatcaaatgattattaatat 33957050  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  33957049 aattattattcaattgacatttatatg-tacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataactaagttgaataaattatattttgaattttggtcc 33956951  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  33956950 gttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaaattttgttggttacaaaattatattact 33956851  T
Q  386 gaatattaataagat 400  Q
     ||||||||||||||    
T  33956850 taatattaataagat 33956836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 86 - 360
Target Start/End: Original strand, 23303047 - 23303322
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23303047 ttggttacaatcaaataattattaatataactattgtttcgattaaaatttatatgttacgttaaaaatttgtatgttacaatcaaataattattaatat 23303146  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23303147 aattagtattcgattaacatttatacggtacattaaaaatttgataggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtct 23303246  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaatt-aaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaattt 360  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23303247 gttacactttaacaggaacctactaattaaaaaatttaattgtagtaattagtttttaaggttatataattaattt 23303322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33955771 - 33955531
Alignment:
Q  161 gttacaatcaaatgattattaatataattatta-ttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttga 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33955771 gttacaatcaaataattattaatataataattggttcgattaaaatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttga 33955672  T
Q  260 ataaattatattttgaattttggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33955671 ataaattatattttgaattttggtccgttatagtatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagttt-taaggttatataattaatt 33955573  T
Q  360 tttattcattacaaaattatattactgaatattaataagata 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33955572 tttattcgttacaaaattatattacttaatattaataagata 33955531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45580044 - 45579741
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaa-tttgtatgttacaatcaaatgattattaata 184  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  45580044 ttggttacaatcaaataattattaatataattattgtttagattaaaatttatatgttacataaaaaaatttgtacgttacaatcaaatagttaataata 45579945  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||        
T  45579944 taattagtattcgattaacatttatacggtaccttaaaattttggtatgttacaaaattataataaataacttggttaaattatattttgaatttt---- 45579849  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
            ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  45579848 --------tat-acagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattaatttttaaggatatataattaatttttattcgttacaaaattatattat 45579758  T
Q  385 tgaatattaataagata 401  Q
    | |||||||||||||||    
T  45579757 ttaatattaataagata 45579741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 162 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3344892 - 3344651
Alignment:
Q  162 ttacaatcaaatgattattaatataattattatt-cgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaa 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3344892 ttacaatcaaataattattaatataataattatttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtagcttacaaaattataataaataacttgaa 3344793  T
Q  261 taaattatattttgaattttggttagttacactatg--acagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  3344792 taaattatattttgaattttggttcgttacactatgacacagtaacctactagttaaaaatttaattgtagtaattaatttttaaggttatataattaa- 3344694  T
Q  359 ttttattcattacaaaattatattactgaatattaataagata 401  Q
    |||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3344693 ttttatttgttataaaattataatacttaatattaataagata 3344651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35350769 - 35350470
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  35350769 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 35350670  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  35350669 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 35350570  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  35350569 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 35350470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10122645 - 10122346
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  10122645 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 10122546  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  10122545 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttataaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 10122446  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  10122445 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 10122346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38190423 - 38190124
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  38190423 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 38190324  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  38190323 taattaatattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 38190224  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  38190223 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttgtataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 38190124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 360
Target Start/End: Original strand, 54610344 - 54610619
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  54610344 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 54610443  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  54610444 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttggga 54610543  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaattt 360  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54610544 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaattt 54610619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 384
Target Start/End: Original strand, 30106848 - 30107144
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaatataa 187  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30106848 gttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttataataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatataa 30106947  T
Q  188 ttattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagt 287  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  30106948 ttagtattcaattaatatttatatgtaacattaaaactttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgt 30107047  T
Q  288 tacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  30107048 tacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaagtttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 30107144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26706080 - 26705782
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  26706080 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttg-acgttacaaatcaaataattattaatc 26705982  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  26705981 taattagtattcaattaacatttatatataacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 26705882  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  26705881 cgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 26705782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 360
Target Start/End: Original strand, 43844988 - 43845263
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||     
T  43844988 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatc 43845087  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  43845088 taattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttggga 43845187  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaattt 360  Q
     |||||| || | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43845188 cgttacagtaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaattt 43845263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1002977 - 1002678
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||     
T  1002977 ttggttacaatcagataatgattaatataattactgttttgattaaaatttatgttttacaataaaaatttaaacgttacaaatcaaataattattaatc 1002878  T
Q  185 taattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtt 284  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  1002877 taattagtattcaattaacatttatatataacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttggga 1002778  T
Q  285 agttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
     ||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  1002777 cgttacaccaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaaggttatataattaatttttatttgttacaaaactatattac 1002678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 84 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44516812 - 44516533
Alignment:
Q  84 aattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaa 182  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  44516812 aattggttacaatcagataatgattaataaaattactgtttcgattaaaatttatattttacaatcaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaa 44516713  T
Q  183 tataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttgg 282  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44516712 tctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaattttgttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttaaattttgg 44516613  T
Q  283 ttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaattttt 362  Q
        |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44516612 gacattacactaagacattaacctactaattaaaaaattaattgtattaattagtttttaagattatataattaattttt 44516533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33955774 - 33955703
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33955774 ttggttacaatcaaataattattaatataataattggttcgattaaaatttatatggtacattaaaaatttg 33955703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3344892 - 3344825
Alignment:
Q  90 ttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3344892 ttacaatcaaataattattaatataataattatttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttg 3344825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 4)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 81 - 401
Target Start/End: Original strand, 10981 - 11301
Alignment:
Q  81 cacaattggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattatt 180  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10981 cacagttggttacaatcaaataaatattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatcaaatgattata 11080  T
Q  181 aatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11081 aatataattattattagattaacatttatatggtacgttaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttaaatttt 11180  T
Q  281 ggttagttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattata 380  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11181 ggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttttaagtttatataattaatttttatttgttacaaaattata 11280  T
Q  381 ttactgaatattaataagata 401  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  11281 tgacttaatattaataagata 11301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1283 - 977
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1283 ttggttacaatcaaataattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtttgttagaatcaaatgattattaatat 1184  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1183 aattattattcaattaatatttatatgatacattaaaaatttcgtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattacattttgaattttggtca 1084  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1083 gttacattatgacagtaacctgctaatataaaatttaattgtagtaatta---------gttatataattaatttttattcgttacaaaattatattact 993  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  992 taatattaataagata 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25166 - 24861
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25166 ttggttacaatcaaataattattaatataattattatt-caattaacatttatatgctacattaaaaatttgtttgttagaatcaaatgattattaatat 25068  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25067 aattattattcaattaacatttatatgatacattaaaaatttcgtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattacattttgaattttggtca 24968  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24967 gttaaattatgacagtaacctactaatataaaatttaattgtactaatta---------gttatataattaatttttattcgttacaaaattatattact 24877  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  24876 taatattaataagata 24861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8671 - 8475
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8671 ttggttacaatcaaataattattaatataattattatt-caattaacatttatatgctacattaaaaatttgtttgttagaatcaaatgattattaatat 8573  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggt 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8572 aattattattcaattaacatttatatgatacattaaaaatttcgtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggt 8475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1289 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1289
Description:

Target: scaffold1289; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Original strand, 388 - 693
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaatat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  388 ttggttacaatcaaataattattaatataattattatt-caattaacatttatatgctacattaaaaatttgtttgttagaatcaaatgattattaatat 486  T
Q  186 aattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtta 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  487 aattattattcaattaacatttatatgatacattaaaaatttcgtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattacattttgaattttggtca 586  T
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattact 385  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  587 gttaaattatgacagtaacctactaatataaaatttaattgtactaatta---------gttatataattaatttttattcgttacaaaattatattact 677  T
Q  386 gaatattaataagata 401  Q
     |||||||||||||||    
T  678 taatattaataagata 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1788 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1788
Description:

Target: scaffold1788; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1080
Alignment:
Q  120 tgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatg------ 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||          
T  1359 tgtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacat 1260  T
Q  213 ------gta-cattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggttagttacactatgacagtaacc 305  Q
          ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||||    
T  1259 ttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacc 1160  T
Q  306 tactaatta-aaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  1159 tactaattaaaaaaattaattttattaattaatttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9876 - 9722
Alignment:
Q  86 ttggttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacatta-aaaatttgtatgttacaatcaaatgattattaata 184  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9876 ttggttaaaatcaaataattattagaataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaaattagtacgttacaatcaaataattattaata 9777  T
Q  185 taattatta-ttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaa 239  Q
     |||||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9776 caattattattttgattaaaattt-tatgttactttaaaaaattggtacgttacaa 9722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9800 - 9660
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg-tatgttacaatcaaatgattattaatataa 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9800 gttacaatcaaataattattaatacaattattattttgattaaaattt-tatgttactttaaaaaattggtacgttacaatcaaataattattattataa 9702  T
Q  188 ttatt-attcgattaacatttatatggtacattaaaaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9701 ttattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 9660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9728 - 9644
Alignment:
Q  89 gttacaatcaaattattattaatataataattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttacaatcaaat 173  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9728 gttacaatcaaataattattattataattattgtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgatacaatcaaat 9644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 384
Target Start/End: Original strand, 11470 - 11568
Alignment:
Q  286 gttacactatgacagtaacctactaattaaaaatttaattgtagtaattagtttataaggttatataattaatttttattcattacaaaattatattac 384  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  11470 gttacactaaggcattaacctactaattaaaaaattaattgtattaaatagtttttaaggttatataattaatttttgtttgttacaaaactatattac 11568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University