View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14912_low_1 (Length: 998)

Name: NF14912_low_1
Description: NF14912
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14912_low_1
NF14912_low_1
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (14-723)||(34496754-34497462)
chr3 (14-397)||(27608298-27608680)
chr3 (457-973)||(55199358-55199874)
chr3 (459-950)||(53496902-53497395)
chr3 (460-963)||(42340104-42340606)
chr3 (457-723)||(27608727-27608993)
chr3 (14-359)||(31505615-31505952)
chr3 (469-950)||(2615363-2615834)
chr3 (457-776)||(646994-647306)
chr3 (457-697)||(19117544-19117784)
chr3 (457-733)||(31341549-31341829)
chr3 (462-772)||(2121129-2121439)
chr3 (520-958)||(46007163-46007599)
chr3 (472-807)||(11020020-11020354)
chr3 (460-699)||(27747513-27747751)
chr3 (457-662)||(55213483-55213688)
chr3 (457-644)||(26046864-26047051)
chr3 (591-723)||(24176867-24176999)
chr3 (459-622)||(48227566-48227729)
chr3 (684-928)||(48227305-48227550)
chr3 (727-900)||(647305-647478)
chr3 (457-597)||(24181749-24181893)
chr3 (516-620)||(49525077-49525181)
chr3 (357-414)||(31505309-31505366)
chr3 (768-900)||(27941129-27941261)
chr3 (562-660)||(1702818-1702916)
chr3 (875-978)||(1070855-1070958)
chr3 (474-524)||(1437383-1437433)
chr3 (536-614)||(18720845-18720923)
chr3 (475-568)||(15310817-15310910)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (457-968)||(4395011-4395521)
chr1 (462-982)||(5609177-5609697)
chr1 (457-973)||(48949548-48950064)
chr1 (457-973)||(51113162-51113678)
chr1 (459-950)||(44527123-44527615)
chr1 (458-973)||(25682498-25683013)
chr1 (459-942)||(16816623-16817108)
chr1 (463-966)||(36733548-36734047)
chr1 (457-820)||(44602752-44603110)
chr1 (505-950)||(52109324-52109768)
chr1 (457-908)||(48166149-48166589)
chr1 (457-723)||(2885320-2885590)
chr1 (463-973)||(24538357-24538845)
chr1 (481-718)||(21031251-21031488)
chr1 (457-675)||(14485161-14485373)
chr1 (516-621)||(17371647-17371752)
chr1 (463-588)||(5594266-5594391)
chr1 (460-629)||(4898447-4898616)
chr1 (459-672)||(23332577-23332791)
chr1 (456-516)||(3297023-3297083)
chr1 (553-614)||(23163357-23163418)
chr1 (518-650)||(38678981-38679113)
chr1 (457-511)||(23163419-23163473)
chr1 (219-283)||(51683738-51683802)
chr1 (562-611)||(13075958-13076007)
chr1 (579-628)||(22929755-22929804)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (459-976)||(88403-88920)
chr2 (457-977)||(34695728-34696246)
chr2 (457-977)||(34718140-34718658)
chr2 (459-968)||(12130464-12130973)
chr2 (463-742)||(9710033-9710312)
chr2 (462-818)||(1417819-1418166)
chr2 (457-723)||(26198779-26199045)
chr2 (459-754)||(11291891-11292181)
chr2 (459-770)||(13109698-13110006)
chr2 (458-774)||(14827126-14827441)
chr2 (459-673)||(35158668-35158885)
chr2 (484-756)||(22845600-22845859)
chr2 (546-973)||(44017231-44017658)
chr2 (701-950)||(18345555-18345803)
chr2 (518-671)||(18344179-18344332)
chr2 (467-653)||(25552312-25552498)
chr2 (563-671)||(36445449-36445557)
chr2 (562-643)||(10244499-10244580)
chr2 (751-839)||(9709910-9709998)
chr2 (573-638)||(43293835-43293900)
chr2 (783-887)||(26198626-26198730)
chr2 (499-545)||(43293918-43293964)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (463-976)||(21321371-21321887)
chr4 (465-982)||(49951151-49951668)
chr4 (460-981)||(18441974-18442493)
chr4 (462-948)||(41835141-41835626)
chr4 (463-968)||(28537613-28538120)
chr4 (457-978)||(2064695-2065216)
chr4 (457-967)||(51734796-51735305)
chr4 (457-973)||(51259353-51259870)
chr4 (457-973)||(32576872-32577386)
chr4 (475-958)||(37245694-37246177)
chr4 (467-981)||(55734848-55735368)
chr4 (472-973)||(56065476-56065981)
chr4 (457-976)||(29655490-29656008)
chr4 (457-973)||(49119224-49119727)
chr4 (457-950)||(28426066-28426546)
chr4 (463-786)||(26422432-26422755)
chr4 (462-788)||(44935911-44936237)
chr4 (464-796)||(47226163-47226493)
chr4 (463-976)||(43840155-43840650)
chr4 (463-723)||(24989764-24990023)
chr4 (469-672)||(8754299-8754502)
chr4 (475-629)||(23095405-23095559)
chr4 (457-559)||(10575273-10575375)
chr4 (457-559)||(6753943-6754044)
chr4 (457-574)||(3347351-3347468)
chr4 (459-619)||(51364555-51364710)
chr4 (457-548)||(17374599-17374690)
chr4 (458-613)||(34926171-34926326)
chr4 (562-614)||(40727169-40727221)
chr4 (752-803)||(24990042-24990093)
chr4 (516-591)||(33582916-33582991)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (462-976)||(16731777-16732291)
chr7 (462-976)||(17709911-17710425)
chr7 (457-973)||(9328426-9328941)
chr7 (469-973)||(22289088-22289592)
chr7 (462-968)||(1581467-1581975)
chr7 (462-928)||(16098382-16098851)
chr7 (457-978)||(29200780-29201294)
chr7 (458-968)||(17877260-17877760)
chr7 (464-976)||(30493441-30493952)
chr7 (459-721)||(3601751-3602013)
chr7 (463-723)||(3275131-3275392)
chr7 (457-642)||(33224384-33224569)
chr7 (460-921)||(30824323-30824762)
chr7 (457-640)||(44481267-44481450)
chr7 (457-640)||(24251619-24251799)
chr7 (457-673)||(47580022-47580237)
chr7 (457-610)||(24139221-24139374)
chr7 (456-622)||(35030481-35030643)
chr7 (459-670)||(35013709-35013920)
chr7 (633-713)||(24139138-24139218)
chr7 (529-614)||(6056273-6056358)
chr7 (517-624)||(43782921-43783028)
chr7 (648-728)||(44480892-44480972)
chr7 (516-614)||(28598113-28598211)
chr7 (564-625)||(6216488-6216549)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (462-940)||(25730688-25731166)
chr5 (457-973)||(20204802-20205318)
chr5 (458-973)||(8387933-8388448)
chr5 (467-950)||(4267969-4268456)
chr5 (457-950)||(26597290-26597774)
chr5 (479-976)||(15988593-15989092)
chr5 (459-950)||(27292304-27292794)
chr5 (457-973)||(22767097-22767597)
chr5 (462-916)||(11375351-11375796)
chr5 (485-982)||(27532758-27533256)
chr5 (457-973)||(41940560-41941077)
chr5 (457-926)||(12660210-12660679)
chr5 (459-787)||(32632548-32632875)
chr5 (457-879)||(34652085-34652499)
chr5 (518-702)||(23074950-23075134)
chr5 (457-654)||(30573501-30573698)
chr5 (459-620)||(26076480-26076642)
chr5 (457-723)||(30222662-30222928)
chr5 (768-973)||(30222934-30223139)
chr5 (694-862)||(37448083-37448251)
chr5 (467-650)||(12717679-12717862)
chr5 (467-650)||(12778903-12779086)
chr5 (467-657)||(31908233-31908420)
chr5 (462-533)||(2872262-2872339)
chr5 (885-958)||(16074598-16074671)
chr5 (905-962)||(34653864-34653921)
chr5 (459-522)||(26296365-26296428)
chr5 (679-890)||(42989243-42989454)
chr5 (462-522)||(3308174-3308234)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (458-958)||(15605819-15606319)
chr6 (479-976)||(14680003-14680503)
chr6 (535-973)||(28106986-28107424)
chr6 (459-840)||(11731495-11731873)
chr6 (489-710)||(34104321-34104542)
chr6 (493-873)||(29367915-29368294)
chr6 (457-722)||(27443029-27443285)
chr6 (518-807)||(19690764-19691053)
chr6 (502-888)||(15053044-15053430)
chr6 (467-673)||(21944462-21944668)
chr6 (616-840)||(30801974-30802198)
chr6 (572-650)||(3100415-3100494)
chr6 (463-539)||(3101261-3101336)
chr6 (462-522)||(19690332-19690392)
chr6 (516-646)||(5542541-5542671)
chr6 (904-973)||(11731920-11731989)
chr6 (462-534)||(1992479-1992551)
chr6 (904-968)||(19364217-19364280)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (457-982)||(477880-478405)
chr8 (462-930)||(13414913-13415381)
chr8 (462-968)||(40588559-40589050)
chr8 (552-950)||(23853802-23854200)
chr8 (499-948)||(8450989-8451438)
chr8 (507-965)||(7127078-7127536)
chr8 (475-862)||(185435-185818)
chr8 (457-733)||(598061-598337)
chr8 (463-720)||(11870364-11870621)
chr8 (479-723)||(33642610-33642854)
chr8 (503-768)||(3606607-3606874)
chr8 (457-638)||(36194445-36194626)
chr8 (457-805)||(9496797-9497140)
chr8 (562-909)||(37711990-37712331)
chr8 (463-611)||(28315316-28315463)
chr8 (516-620)||(8670197-8670301)
chr8 (457-514)||(32555081-32555138)
chr8 (474-559)||(34707886-34707971)
chr8 (526-611)||(4275914-4275999)
chr8 (597-659)||(14264970-14265032)
chr8 (670-721)||(42899152-42899204)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (472-958)||(48-538)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (518-804)||(149-434)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (457-722)||(44076-44332)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (499-648)||(20330-20479)
[»] scaffold0252 (1 HSPs)
scaffold0252 (524-620)||(13321-13415)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (459-524)||(26127-26192)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 34496754 - 34497462
Alignment:
Q  14 cacagacatctgcaatgttaccatctgannnnnnngaagaattacatgtattaattcaaccggcaaagggaaaatccaatgaaaattggtttttcctaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34496754 cacagacatctgcaatgttaccattggatttttttgaagaattacatgtattaattcaaccagcaaagggaaaatccaatgaaaattagtttttcctaga 34496853  T
Q  114 aggatgtaaccagcatagtttccttttgcatnnnnnnnctacaatagaatagtttaaagcatcaatataattaacactagataacacggaaatgttctca 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34496854 aggatgtaaccaacatagtttccttttgcataaaaaaactacaatagaatagtttaaagcatcaat-----taacactagataacaaggaaatgttctca 34496948  T
Q  214 ccgttgagctgatgtgcatcacatgggaatatcgttcaacattcataagcttctcaaccttaacagaaccactttttgcaacctgcaaacagaacttttg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34496949 ccgttgagctgatgtgcatcacatgggaatatcgttcaacattcataagcttctcaaccttaacagaaccactttttgcaacctgcaaacagaacttttg 34497048  T
Q  314 ttagcataaccatagcagattgaagtacagaatatgaactatcttgaaaaccacaattaacaaataaaaaggagtggacctaatgttagcactgcttatc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34497049 ttagcataaccatagcagattgaagtacagaatatgaactatcttgaaaaccacaattaacaaataaaaagaagtggacctaatgttagcactgcttatc 34497148  T
Q  414 aa----nnnnnnnnaatcaaagcactatcgaacccannnnnnnnggtcaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaagga 509  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||        |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34497149 aattttttttttttaatcaaagcactatcgaacccagtttttttgaccaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaatacatgaagga 34497248  T
Q  510 taagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt 609  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34497249 taaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt 34497348  T
Q  610 tggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatga 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  34497349 tggaatgtaaagataactgaaaaataatactaggaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctga 34497448  T
Q  710 gtcggactcgaaga 723  Q
    ||||||||||||||    
T  34497449 gtcggactcgaaga 34497462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 397
Target Start/End: Original strand, 27608298 - 27608680
Alignment:
Q  14 cacagacatctgcaatgttaccatctgannnnnnngaagaattacatgtattaattcaaccggcaaagggaaaatccaatgaaaattggtttttcctaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608298 cacagacatctgcaatgttaccatctgatttttttgaagaattacatgtattaattcaaccggcaaagggaaaatccaatgaaaattggtttttcctaga 27608397  T
Q  114 aggatgtaaccagca---tagtttccttttgcatnnnnnnn-ctacaatagaatagtttaaagcatcaatataattaacactagataacacggaaatgtt 209  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||    
T  27608398 aggatgtaaccagcagcatagtttccttttgcataaataaaactacaatagaatagtttaaagcatcaat-----taacactagataacaaggaaatgtt 27608492  T
Q  210 ctcaccgttgagctgatgtgcatcacatgggaatatcgttcaacattcataagcttctcaaccttaacagaaccactttttgcaacctgcaaacagaact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608493 ctcaccgttgagctgatgtgcatcacatgggaatatcgttcaacattcataagcttctcaaccttaacagaaccactttttgcaacctgcaaacagaact 27608592  T
Q  310 tttgttagcataaccatagcagattgaagtacagaatatgaactatcttgaaaaccacaattaacaaataaaaaggagtggacctaat 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608593 tttgttagcataaccatagcagattgaagtacagaatatgaactatcttgaaaaccacaattaacaaataaaaaggagtggacctaat 27608680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 55199874 - 55199358
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55199874 caaagcaaagttaacgattatcattaatcaactagtgatcagtacaagaaggataagaataaaaaatatggtcactagcgcaagaacaggccgccgtagc 55199775  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55199774 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagatgactgaaaaataatactagaaacaatagcataa 55199675  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||  || |||||||||    
T  55199674 aattccgaatcaccatgacccgtagacgatagcgcttgcaccagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgtttccaacaacaaagt 55199575  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||    
T  55199574 gaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttatcagctgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctct 55199475  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  |||| |||| ||||||||  | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  55199474 aacacaacacgcgaaagatgtaatatattgacggtcatgaaacgtggcatccacattgcacgtcaaccacatctcacgcggtttctcccaaactgagttg 55199375  T
Q  957 ttgccttgcactgtatt 973  Q
    ||  |||||||| ||||    
T  55199374 ttagcttgcactttatt 55199358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 459 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 53497395 - 53496902
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatc--attaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53497395 aagcaaatttaactattatctcattaatcaagcaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagc 53497296  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  53497295 taaagtatgagcagccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataattaatactagaaacaatagcatag 53497196  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  53497195 aattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagcaaagt 53497096  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||| | |||| ||||| | ||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  53497095 gaagggcctctagtaaggctactgcctccccctcaaaaactgtcacatttgtccgctgtcattttgtttgagcccgaataaattgcccacaagagtctct 53496996  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  53496995 aacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacggtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcggtcggtttctcccaaact 53496902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 460 - 963
Target Start/End: Original strand, 42340104 - 42340606
Alignment:
Q  460 agcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaa 559  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42340104 agcaaatttaactattatcatttatcaaccaatcttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagccaaagaacaggccgccctatctaa 42340203  T
Q  560 gctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaat 659  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42340204 agtgtgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagatagctgataaataatattagaaacaatagcatagaat 42340303  T
Q  660 tctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaa 759  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  42340304 tctgaatcaccatggcccggagacgacagagcttgcactaaagtagctgagtctgactcgaagacaactcggtcccatctgttcacatctgcaaagtgaa 42340403  T
Q  760 gggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaac 859  Q
     | | ||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42340404 tgacatcgagtagggctattgcctccccctccaacactgtcatatctgcccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgtccacgagagtctctaac 42340503  T
Q  860 acagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttg 959  Q
    |||  ||||||||| ||||| ||| || |   ||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  42340504 acaacacgcaaaagatgtaagatggttgccgacatagaac-caacatccacattgcacttcaaccacgtctcgcacggtttctctcaaactgagttgttg 42340602  T
Q  960 cctt 963  Q
    ||||    
T  42340603 cctt 42340606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 457 - 723
Target Start/End: Original strand, 27608727 - 27608993
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27608727 caaagcaaagttaactattatcattaattaaccagtattcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgctctagc 27608826  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27608827 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcagctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataa 27608926  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 723  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27608927 aattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaaga 27608993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31505952 - 31505615
Alignment:
Q  14 cacagacatctgcaatgttaccatctgannnnnnngaagaattacatgtattaattcaaccggcaaagggaaaatccaatgaaaattggtttttcctaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31505952 cacagacatctgcaatgttaccatctgattttacc-aagaatcacgtgtatcaattcaaccgacaaagggaaaatcaaatgaaaattggtttttc-taga 31505855  T
Q  114 aggatgtaaccagcatagtttccttttgcatnnnnnnnctacaatagaatagtttaaagcatcaatataattaacactagataacacggaaatgttctca 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31505854 aggatgtaaccagcatagttgccttttgcataacaga-ctacaatagaatagtttaaagcatcaat-----taacactaggtaacaaggaaatgttctca 31505761  T
Q  214 ccgttgagctgatgtgcatcacatgggaatatcgttcaacattcataagcttctcaaccttaacagaaccactttttgcaacctgcaaacagaacttttg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31505760 ccgttgagctgatgtgcatcacatgggaatatcgttcaacattcataagcttctcaaccttaacagaaccactttttgcaacctacaaacagaacttttg 31505661  T
Q  314 ttagcataaccatagcagattgaagtacagaatatgaactatcttg 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  31505660 ttagcttaaccatagcagattgaagtacataatacaaactatcttg 31505615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 469 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 2615834 - 2615363
Alignment:
Q  469 aactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagc 568  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||    
T  2615834 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaacgcttaaaataaaaattacggtgactagcccaagaacaggtcgccctagttaaagtatgagc 2615735  T
Q  569 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 668  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2615734 aaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcatctcgaggttggaatgtaaaaataactgataaataatactaaaaacaatatcatagaattctgaatca 2615635  T
Q  669 ccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcga 768  Q
    ||||| |    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||| |||           | ||| ||||| ||||||||| | | ||||    
T  2615634 ccatggcacaaagacgatagagctcgcactagagtagttgagtcggattgaaagacaac----------attttcccatcagcaaagtgaacgacatcga 2615545  T
Q  769 gtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgc 868  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||  |||| | || ||||||||||   | |    
T  2615544 gtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgcccgctgccaattcgtttgagcccgaatgaattgcccacaaaagcctctaacacaacgcac 2615445  T
Q  869 aaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  2615444 aaaaaatgtaatatggttatgatcatgaaacgcggtatccacattgcatttcaaccacgtcttgcacgatttctcccaaact 2615363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 457 - 776
Target Start/End: Original strand, 646994 - 647306
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  646994 caaatcaaaattaactattattattaatcaaccaatgttcaatacaagaaagataaaattcaaaaatacggtgattagtccaagaacaggccgccctaac 647093  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| | |||||    
T  647094 taaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaatttcacctcgaagttggaatgtaaagataactg-------atactataaacaacaacatag 647186  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||    
T  647187 aattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcagactcgaagataactcggtcacatctgttcacatcagcaaagt 647286  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggct 776  Q
    ||| | | ||||||||||||    
T  647287 gaatgacatcgagtaaggct 647306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 457 - 697
Target Start/End: Original strand, 19117544 - 19117784
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19117544 caaagcaaagttaactattatcatcaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcctaagaacaggccgacctagc 19117643  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19117644 taagctatgagcaactatgttcgactgtctcctaacaaacttcacctcaaatttggaatgcaaaaataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataa 19117743  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcac 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  19117744 aattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcac 19117784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 457 - 733
Target Start/End: Original strand, 31341549 - 31341829
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  31341549 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaaccggctgccctaac 31341648  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||     
T  31341649 taaggtatgagcaaccatgtcagtttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatattagaaacaatagtataa 31341748  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagac----gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtc 733  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||    ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||    
T  31341749 aattctgaatcaccatgacccggagacgtaggatagagcttgcactagagtagtggagtcagattcgaagataacccggtc 31341829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 462 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 2121439 - 2121129
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||      
T  2121439 caaaattaactattatcatcaatcaaccaatgtgcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtaactaacccaagaacagaccgccctaactaaag 2121340  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  2121339 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaactttacctcgaagttgagatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcacaaaatta 2121240  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
    ||||| | |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| || | ||| || ||||||||||||  |||| ||||||||| |    
T  2121239 tgaataatcatggcctagagacaatagagcttgcattagagtagttaagtcggactcaaaaacaacacgatcccatctattcatatcagcaaagtgaatg 2121140  T
Q  762 gcctcgagtaa 772  Q
     | ||||||||    
T  2121139 acatcgagtaa 2121129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 520 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 46007599 - 46007163
Alignment:
Q  520 aaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaa 619  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||   || || ||||||||    
T  46007599 aaatacggtgattagcttaagaagatgccgccctagttaaagtatgagcaatcatgttcatttgtcttctaacaaactttaccctaaaattagaatgtaa 46007500  T
Q  620 agataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcg 719  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  46007499 aaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattccgaatcgccatggcccggagacgatatagtttgcactagagtagttgaatcggactcg 46007400  T
Q  720 aagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatt 819  Q
    |||| | | ||  ||||||| |||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |  |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  46007399 aagacacc-cg--cccatctgttcatatcgacaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgtctccccctaaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatt 46007303  T
Q  820 tcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct-aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcact 918  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||   ||||||||||||||||    
T  46007302 tcgtttgagcccgaataaattttccacgagagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaataatggaacacggcatccacattgcact 46007203  T
Q  919 tcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 958  Q
    ||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||    
T  46007202 tcaaccacgtctcgctttgtttttcccaaactgagttgtt 46007163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 472 - 807
Target Start/End: Original strand, 11020020 - 11020354
Alignment:
Q  472 tattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaac 571  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||  |||||  |||    
T  11020020 tattatcattaatcaattaatgttcaatacaagaag-ataagaataaaaaatacagtgactagcccaaggataggttgtcctagctaaaatatgattaac 11020118  T
Q  572 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcacca 671  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11020119 catgttcgcttgtctccaaacaaacttcacatcgaggttgaaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcacagaattctgaatcacca 11020218  T
Q  672 tgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagta 771  Q
    || ||  ||||||||||| ||| |||| |||||| | |||| |||||||||| ||| | || |||| | ||| ||||| |||||| ||  || |||||||    
T  11020219 tggcccggagacgatagaccttacactggagtagttaagtcagactcgaagacaacccagttccatttgttcccatcagcaaagtaaatagcatcgagta 11020318  T
Q  772 aggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttg 807  Q
    | |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11020319 aagctgatgtctccccctccaaaagtgtcatatttg 11020354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 460 - 699
Target Start/End: Original strand, 27747513 - 27747751
Alignment:
Q  460 agcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgcc---ctagc 556  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |   ||||     
T  27747513 agcaaagttaactattat---taatcaaccactgttgagtacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgacta-cccaagaatagaccgtcaacctaga 27747608  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27747609 taaagtatgagcaactatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcatag 27747708  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcacta 699  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||    
T  27747709 aattttgaatcaccatggcccggagacgataaagcctgcacta 27747751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 457 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 55213688 - 55213483
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  55213688 caaagcaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaagaataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaaccggccgccctagt 55213589  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||    
T  55213588 taaagtataagcaaccatgttcgcttttctcctaacaaatttcacctcgaagttggaacgtaaagataactgatatataataccaaaaacaatagcatag 55213489  T
Q  657 aattct 662  Q
    ||||||    
T  55213488 aattct 55213483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 457 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 26047051 - 26046864
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26047051 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatatttaatataagaaggataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaataagccgccctagc 26046952  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaa 644  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26046951 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacgtcacctcaaagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaa 26046864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 591 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 24176999 - 24176867
Alignment:
Q  591 acaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagag 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24176999 acaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataacttataaataatactagatacaatagcttagaattccgaatcaccatgacccagagacgatagag 24176900  T
Q  691 cttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 723  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  24176899 cttgcactagagtagttgtgtcagactcgaaga 24176867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 459 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 48227729 - 48227566
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || || || |||||||||| | |||||||||||    
T  48227729 aagcaaaattaactattatcattaatcaaccattgttcaatacaagaaagataaaaataaaaaatatggcgaataacccaagaacaagtcgccctagcta 48227630  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaaga 622  Q
    |  |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48227629 aagtatgaggaaccatatttgcttgtctcctaacaaatttcacctcgaagttggaatgtaaaga 48227566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 684 - 928
Target Start/End: Complemental strand, 48227550 - 48227305
Alignment:
Q  684 gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga-agggcctcgagtaaggctagtgtc 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||      
T  48227550 gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaactcggttttatccattcacatcagcaaagtgatggggtctcgagtaaggctactgca 48227451  T
Q  783 tccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatat 882  Q
    ||||  ||||| || ||||| ||| ||  ||||  ||||| || |||||| |||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  48227450 tcccactccaatacagtcatgttttcccactgctgtttcgtttaagcccgaataaattgcccgcgagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaacat 48227351  T
Q  883 gattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgt 928  Q
    | ||||| | ||| || |  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  48227350 ggttacggtaatgaaatgcggcatccacattgtacttcaaccacgt 48227305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 727 - 900
Target Start/End: Original strand, 647305 - 647478
Alignment:
Q  727 ctcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattg 826  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  647305 ctcggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctgctgcctccccctccataactgtcatattagcccgctgccatttcgtttg 647404  T
Q  827 agcccggataaattttccacgag-agtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacg 900  Q
    |||||||| ||| || ||  ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  647405 agcccgga-aaaattgcctagagaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacgctcatggaacg 647478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 457 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24181893 - 24181749
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24181893 caaaacaaagttaactattatgattaatcaatcaatgttcaatacaacaaggataaaaattaaaaatatggtgactaacccaagaacaggccgccctagc 24181794  T
Q  557 taagctatgag----caaccatgttcgcttgtctcctaacaaact 597  Q
    |||  | ||||    ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  24181793 taaagtgtgagtaaccaaccgtgttcatttgtctcctaacaaact 24181749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 516 - 620
Target Start/End: Original strand, 49525077 - 49525181
Alignment:
Q  516 tcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaat 615  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||    
T  49525077 tcaaaaatatggtgactagtccaagaacagaccgccctagcaagggtgtgagcagccatgttcgcttgtcgcctaacaaactttacctcaaaattggaat 49525176  T
Q  616 gtaaa 620  Q
    |||||    
T  49525177 gtaaa 49525181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 357 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31505366 - 31505309
Alignment:
Q  357 ttgaaaaccacaattaacaaataaaaaggagtggacctaatgttagcactgcttatca 414  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31505366 ttgacaaccacaattaacaaataaaaaggagtggacctaatattagcactgcttatca 31505309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 768 - 900
Target Start/End: Original strand, 27941129 - 27941261
Alignment:
Q  768 agtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacg 867  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||  |||    
T  27941129 agtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgtccgctgccattttgtttgagtccgaataaattgtcctcgagaatctctaatacaacacg 27941228  T
Q  868 caaaagttgtaatatgattacgatcatggaacg 900  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  27941229 caaaaaatataatatggttacgatcatgaaacg 27941261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 660
Target Start/End: Original strand, 1702818 - 1702916
Alignment:
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaatt 660  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  1702818 tatgagtaatcatattcgcttgtcttctaacaaacttcaccttgaagttcgaatgtaaagataactagtaaataatactaaaaataataaaatagaatt 1702916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 875 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 1070958 - 1070855
Alignment:
Q  875 tgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtatta 974  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| || | || |||||| || |||||    
T  1070958 tgtaagatggttacgatcatggaaggcaacatccacattgcagttcaaccatgtctcgcgcggtttctcctaaactgaggttttaccttgctctctatta 1070859  T
Q  975 tgtc 978  Q
    ||||    
T  1070858 tgtc 1070855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 474 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 1437433 - 1437383
Alignment:
Q  474 ttatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaata 524  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  1437433 ttatcattaatcaagcaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaata 1437383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 18720923 - 18720845
Alignment:
Q  536 ccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 614  Q
    ||||||||| |||||| |||| |   ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18720923 ccaagaacatgccgccatagcaatcgtatgagcaaccatgtgcacttgatgcctaacaaacttcacctcaaagttggaa 18720845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 475 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 15310910 - 15310817
Alignment:
Q  475 tatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagc 568  Q
    |||||||||| || || |||||| |||| | ||||||  | |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15310910 tatcattaattaaacattgttcaatacatgtaggatagaactcaataatacagcgactagtccaagaacaggccgccctagttaacgtatgagc 15310817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 457 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 4395521 - 4395011
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4395521 caaagcaaatttaactattatcgttaatcaactaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 4395422  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4395421 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactataaacaataggatag 4395322  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4395321 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagttggactcgaagataacctggtcccatctattcgcatcagcaaagt 4395222  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4395221 gaagggcctcgagtaaggctagtgcctcccctt-caaaactctcatatttgcccgctgccatttcgattgagcccggataaattgcccacgagagtctct 4395123  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4395122 aacacagcatgcaaaagttgtgatatggttacggtcatggaacgcggcttccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactgagttg 4395023  T
Q  957 ttgccttgcact 968  Q
    ||| ||||||||    
T  4395022 ttgtcttgcact 4395011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 462 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 5609697 - 5609177
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  5609697 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacatgccgccctagctaatg 5609598  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609597 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattc 5609498  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |||||| || |||||||||||    
T  5609497 tgaatcaccatgaccctgagacgatagagtttgcactagagtagatgagtcgaactcgaagacaacccgatctcatctgttcgcaacatcaaagtgaagg 5609398  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
     ||||||||||||||| || |||||| | ||||||| ||||||||| | |||| |||   | ||||||||| |||||||   |  | ||||||||| |||    
T  5609397 acctcgagtaaggctactgcctcccccttcaaaactatcatatttgtccgctgtcatagagtttgagcccgaataaattgctcgtgtgagtctctagcac 5609298  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 961  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5609297 agcacgcgaaagttgtaatatggttacagtcatggaacgcgacatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttgcc 5609198  T
Q  962 ttgcactgtattatgtctgtg 982  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  5609197 ttgcactctattatgcctgtg 5609177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Original strand, 48949548 - 48950064
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48949548 caaagcaaagttaactattatctttaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagc 48949647  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48949648 taagctatgagtaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataa 48949747  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  48949748 aattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagttgaactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagt 48949847  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    |||  || ||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||  | ||| ||||||||    
T  48949848 gaatcgcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactttcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgccaacgggagtctct 48949947  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  |||| |||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||||    
T  48949948 aacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttg 48950047  T
Q  957 ttgccttgcactgtatt 973  Q
    ||  |||||||| ||||    
T  48950048 ttagcttgcactctatt 48950064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 51113678 - 51113162
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51113678 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccagtattcaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactaacccaagaacaggtcgccctagc 51113579  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51113578 taagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgttaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataa 51113479  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  51113478 aactccgaatcaccatggcccagagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagt 51113379  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| | | ||||||||||| | || |||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||| ||||| ||| || ||||  ||||| ||||||||    
T  51113378 gaatgacatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaacggttatatttgctcgttgccatttcgtttgagtccgaatgaattgcccacgggagtctct 51113279  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  |||| |||| ||||||||| | ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  51113278 aacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacggcatccacattgcactttaaccacgtctcacacgatttctcccaaactgagttg 51113179  T
Q  957 ttgccttgcactgtatt 973  Q
    ||  |||||||| ||||    
T  51113178 ttagcttgcactctatt 51113162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 459 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 44527615 - 44527123
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa-tacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  44527615 aagcaaatttaactattatcattaatcaagcaatgttcaatacaaaaaggataataataaaaaaatacggtgattaacccaagaacaggccgccctagtt 44527516  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 657  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  44527515 aaagtatgagcagccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactaataattaatactagaaacaatagcataga 44527416  T
Q  658 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 757  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  44527415 attccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagcaaagtg 44527316  T
Q  758 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 857  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  44527315 aagggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacaagagtctcta 44527216  T
Q  858 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  44527215 acacaacacgcaaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcggtcggtttctcccaaact 44527123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 458 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 25683013 - 25682498
Alignment:
Q  458 aaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  25683013 aaagtaaagttaactattatcattaatcaacaaatgttcaatataagaaagataggaattaaaagtacggtgactaacccaagaacatgcctccctagct 25682914  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 657  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25682913 aaagtatgagcaaccatgctcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttagaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagtataga 25682814  T
Q  658 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 757  Q
    ||||| ||||||  || ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| | | ||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  25682813 attctaaatcactgtggcccggagacgatagagcttgtactagagtagctgagtcaaactcgaagacagcccggtcccatctgttcacattagcaaagtg 25682714  T
Q  758 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 857  Q
    || | | ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  25682713 aatgacatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccagataaattgcccacgggagtctcta 25682614  T
Q  858 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgt 957  Q
    |||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| | |||| |    
T  25682613 acacaacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatgaaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcacacggtttctcccaaattgagttct 25682514  T
Q  958 tgccttgcactgtatt 973  Q
    ||||||||||| ||||    
T  25682513 tgccttgcactctatt 25682498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 459 - 942
Target Start/End: Original strand, 16816623 - 16817108
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||    
T  16816623 aagcaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacgagatggataaggataaaaaatacggtgactagcccaagaataagtcgccctaacta 16816722  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16816723 aagtatgagcaaccatgttctcttctctcctaacaaacttcaccttaaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcgtagaa 16816822  T
Q  659 ttctgaatca---ccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaag 755  Q
    ||| ||||||   ||||| |   |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||||     
T  16816823 ttccgaatcacgtccatggctcggagacggtagaacttgaactagagtagacgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgtttgcatcagcaaaa 16816922  T
Q  756 tgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctc 855  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||   | ||||||||||    
T  16816923 tgaagggcctcgagtaaggctactgcctcccc-tccaaaattgtcatatttgcccactgccattttgattgagctcgaataaattgcacgcgagagtctc 16817021  T
Q  856 taacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttct 942  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||   |||||||||  || ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  16817022 taaaacaatacacaaaagatgtaatatggttacagacatggaacgcggcgtccgcattgcacttcaaccacatctcactcggtttct 16817108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 463 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 36734047 - 36733548
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36734047 aaagttaactattatcattaatcaaccaatattcaatacaagaaggataagaattaaaaatacgatgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagt 36733948  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 662  Q
    |||      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36733947 atg------catgttcgcttgtctcgtaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaataacatagaattat 36733854  T
Q  663 gaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaaggg 762  Q
    |||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||       
T  36733853 gaatcatcatggcccggagacgatatagcttgcactagagttatagagtcagactcgaagacaacccggtcccatttgttcacatcagcaaagtgaataa 36733754  T
Q  763 cctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacaca 862  Q
    | | ||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||| || | || ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36733753 cattgagtaagactactgcctccccctccaaaactgccatatttacccgttgtcattttgtttgagcccgaataaattgtccacgagagtctctaacaca 36733654  T
Q  863 gtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccac--attgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgc 960  Q
      || |||||| ||||| ||| |||   ||||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || |    
T  36733653 acacacaaaaggtgtaagatggttatagtcatgaaacgcggcatccacatattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctccgaaactcagttattac 36733554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 457 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 44603110 - 44602752
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  44603110 caaagcaaagttagttattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacaggccgcccta-- 44603013  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44603012 --ag-tatgagccaccatgttcgcttgtcccctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatag 44602916  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||| ||||| ||||| ||| |||||  |||||    
T  44602915 aattttgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaaggcaacccggtctcatctgttcacatcagtaaagt 44602816  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccattt 820  Q
    ||| | | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  44602815 gaatgacatcgagtaagactaatgtctccccctccaaaattgtcatatttgtttgccgccattt 44602752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 505 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 52109768 - 52109324
Alignment:
Q  505 aaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctc 604  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||     
T  52109768 aaggataagaattaaaaatacggtgactagtccaagaacatgtcgccctatctaaagtatgaacaactatgtttgtttgtctcataacaaactttacctt 52109669  T
Q  605 gaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagta 704  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  52109668 gaagttagaatgtaaagataactgataactaatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggtccggagacaatagagcttgtactagagta 52109569  T
Q  705 gatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatat 804  Q
    ||||| ||  |||| |||| ||| |  |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||   ||||||    
T  52109568 gatgaatcacactcaaagacaac-ccatcccatctgttagcatcagcaaagtgaaggacctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaatgatcatat 52109470  T
Q  805 ttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagc 904  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||  | ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||  | |    
T  52109469 ttgcccgctgccatttcgtttgagcctgaataaattgtccacaggagtctctaacacaacatgcaaaagatataagatgattacggtcatggaacacaac 52109370  T
Q  905 atccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  52109369 gtccacattacacttcaaccacgtctttgtcggtttctcccaaact 52109324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 457 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 48166589 - 48166149
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  48166589 caaaacaaagttaattattat-attaatcaaccaatattcaatacaagaaggataaaaatcaaagatacggtgactagcccaagagtaggccgctctagt 48166491  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  || |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||           ||||||||||    
T  48166490 taaagtacgagcaatcatgttcgtttgtttcctaacaaacttcatcttgaagttgaaatgtaaagataacagataaatat----------aatagcatag 48166401  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||||| ||||||||   |   |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||| || |||||| ||||| ||| | ||||||    
T  48166400 aattctgtatcaccatcgtcccaagactatagagcttgcaatagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgatcccatatattcacataagcaaagt 48166301  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| | | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  48166300 gaatgacatcgagtaaggctattgtctcccactccaaaactgtcatatttgctcgctgccatttcatttgagcccgaataaattgaccacgggagtctct 48166201  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatcc 908  Q
    ||||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  48166200 aacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgtggcatcc 48166149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 457 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 2885590 - 2885320
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaat-caaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctag 555  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2885590 caaagcaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaaatacggtgactagcccaagaacaggtcgccctag 2885491  T
Q  556 ctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaaga----taactgaaaaataatactagaaacaatag 651  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2885490 ctaaagtatgagcaa-catgttcgcttgtatcctaacaaacttcaccacgaagttgaaatgtaaagataattaactgataaataatactagaaacaatag 2885392  T
Q  652 catagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 723  Q
    |||| || || ||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2885391 catataactccgaatcaccatagcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtctgactcgaaga 2885320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 463 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 24538845 - 24538357
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa-tacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| ||||||| |  | |||||| ||      
T  24538845 aaagttaactattatcattaatcaactaatgtttaatacaagaaggataaaaaaaaaaaaatatggtgactagccgaagaacatgttgtcctagcaaaag 24538746  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24538745 tatgagcaatcatgttcgcttgtttcctaacgaacttcacctcaaagttagaatgtaaagataacagataaataatactagaaataatagcgtagaattc 24538646  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
    |||||||| ||||||   ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||          ||||| ||||||||| |    
T  24538645 tgaatcactatgacccgaagcagatagatcttgcactagagtagaagagtcagactcgaaaagaactcggtcc----------catcagcaaagtgaatg 24538556  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    || ||||||||             || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24538555 gcatcgagtaa-------------ccctccaaaactgtcgtatttgcctgctgccaattcgtttgagcccgaataaattatccacgggagtctctaacac 24538469  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 961  Q
    |  || |||||| | |||  || ||||| | || |||||  |||||||||||||| |||  ||| ||||| || |||||||| |||||| || |||| ||    
T  24538468 aacacacaaaagatctaacttggttacggttatagaacgcggcatccacattgcatttcgaccaggtctcacttggtttctctcaaactgagatgttacc 24538369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 481 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 21031488 - 21031251
Alignment:
Q  481 taatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgc 580  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  21031488 taatcaaccaatgttcaatacgagaaggataagaataaaacatacggtaactaacccaaaaacaggctgccctggctaaactatgagcaatcatgttcgc 21031389  T
Q  581 ttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttga 680  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||   |  ||    
T  21031388 ttgtctcctaaaaaacttcacctcgaagttaggatgtaaagataattgataaataatactagaaactataacataaaattccgaatcaccatagtccgga 21031289  T
Q  681 gacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactc 718  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  21031288 gacgatagagcttgcactagaatagctgagtcagactc 21031251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 457 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 14485373 - 14485161
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14485373 caaagaaaagttaaccattatcattaatctaccaataatcaatacaagaaggataagaataaaaaatatgattactagctcaagaacaagccgccctagc 14485274  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||      |||||    
T  14485273 taaagtatgagcaactatgttcgtttgtctcctaatgaacttcaccttaaagttggaatgtaaaaataactgataaacaatactaaaaa------catag 14485180  T
Q  657 aattctgaatcaccatgac 675  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14485179 aattctgaatcaccatgac 14485161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 516 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 17371752 - 17371647
Alignment:
Q  516 tcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaat 615  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17371752 tcaaaaatacggtgactagctcaagaacatgccgccctagctaaggtatgagcgaccatattcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaat 17371653  T
Q  616 gtaaag 621  Q
    ||||||    
T  17371652 gtaaag 17371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 463 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 5594391 - 5594266
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||  |    
T  5594391 aaagttaactattatcattaatcaatcaatatttaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgattagtccaagaacatgccgtcctagttaaagt 5594292  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5594291 atgagcaaccatgttcgcttgtctcc 5594266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 460 - 629
Target Start/End: Original strand, 4898447 - 4898616
Alignment:
Q  460 agcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaa 559  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | || ||||| ||| ||||| |||||||| | | ||| | |||||||||| || |||| ||||    
T  4898447 agcaaagttaaccattatcattagtcaaccaatgtttaatataagaatgatgagaataaaaaatacagcgtctaactcaagaacaggtcggcctaactaa 4898546  T
Q  560 gctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga 629  Q
      ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4898547 agtatgagcaatcatattcgtttgtctcctaacaaactttacatcgaagttgaaatgtaaagacaactga 4898616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 459 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 23332791 - 23332577
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaag-aaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||  ||| | |||||| | | |  |||||||    
T  23332791 aagcaaagttaactattattattaatcaaacaatgttcaatacaagaaaggataaaaataaaaattacggtagctaactcaagaatacgtcatcctagct 23332692  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 657  Q
     |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||  |||| | ||   |||||||||| | |||||||| || |||||||| |||| |    
T  23332691 caagtatgagcaaccatgctcgcttgtcttctaacaaatttcatcttaaagtagaaaaacaaagataactcacaaataataataaaaacaataacataca 23332592  T
Q  658 attctgaatcaccat 672  Q
    ||| |||||||||||    
T  23332591 attttgaatcaccat 23332577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 516
Target Start/End: Original strand, 3297023 - 3297083
Alignment:
Q  456 tcaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaat 516  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3297023 tcaaagcaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaat 3297083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 23163418 - 23163357
Alignment:
Q  553 tagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 614  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  23163418 tagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtcttctaacaaactttatctcgaagttggaa 23163357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 650
Target Start/End: Original strand, 38678981 - 38679113
Alignment:
Q  518 aaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 617  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| | | || | |||||||| |||||| || ||| |||  || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38678981 aaaaatatggtgactagcataagaatatgtcgtcttagctaaggtatgagtaatcatattcatttttcgcctaataaacttcaccttgaagttggaatgt 38679080  T
Q  618 aaagataactgaaaaataatactagaaacaata 650  Q
    |||| || || | |||||||| |||||||||||    
T  38679081 aaagctaccttataaataatattagaaacaata 38679113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23163473 - 23163419
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggata 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23163473 caaagcaaagttaactattattattaatcaatcaatgttcaatacaagaaggata 23163419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Original strand, 51683738 - 51683802
Alignment:
Q  219 gagctgatgtgcatcacatgggaatatcgttcaacattcataagcttctcaaccttaacagaacc 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  51683738 gagctgatgtgcataacatgggaatatcgctcaatattcataagtttttcaacttgaacagaacc 51683802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 611
Target Start/End: Original strand, 13075958 - 13076007
Alignment:
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttg 611  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  13075958 tatgagcagccatgttcgcttgatgcctaacaaacttcacctcaaagttg 13076007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 628
Target Start/End: Original strand, 22929755 - 22929804
Alignment:
Q  579 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactg 628  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  22929755 gcttgtcacctaataaacttcacctcgaagttgaaatttatagataactg 22929804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 459 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 88920 - 88403
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  88920 aagcaaaattaactattatcattaatcaaccaatgctcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 88821  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  88820 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctccaaataaacttcacgttgaagttggaatgtaaagctaactgataaataatactggaaacaatagcatagaa 88721  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 758  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  88720 ttctgaatcaccatgatcttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcaacaaagtga 88621  T
Q  759 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 858  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  88620 agggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccattgccatttcatttgagcccgaataaattgcccgcgagagtctctaa 88521  T
Q  859 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 958  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  88520 cacaacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgtgttgtt 88421  T
Q  959 gccttgcactgtattatg 976  Q
    |||||||||| |||||||    
T  88420 gccttgcactctattatg 88403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 457 - 977
Target Start/End: Original strand, 34695728 - 34696246
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34695728 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgacaagcccaagaacaagccgccctagc 34695827  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  34695828 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactggtaaattatactagaaacaatagcataa 34695927  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||| ||||||    
T  34695928 aattctgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttcccatctattgacatcagcaaagt 34696027  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  34696028 gaatggccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcca--tcgattgagcccgaataaattgcccacgggagtctct 34696125  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  34696126 aacgcaacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgcagtttctcccaaactgagttg 34696225  T
Q  957 ttgccttgcactgtattatgt 977  Q
    || ||||||| | ||||||||    
T  34696226 ttaccttgcattctattatgt 34696246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 457 - 977
Target Start/End: Original strand, 34718140 - 34718658
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34718140 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgacaagcccaagaacaagccgccctagc 34718239  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  34718240 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactggtaaattatactagaaacaatagcataa 34718339  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||| ||||||    
T  34718340 aattctgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttcccatctattgacatcagcaaagt 34718439  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  34718440 gaatggccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcca--tcgattgagcccgaataaattgcccacgggagtctct 34718537  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  34718538 aacgcaacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgcagtttctcccaaactgagttg 34718637  T
Q  957 ttgccttgcactgtattatgt 977  Q
    || ||||||| | ||||||||    
T  34718638 ttaccttgcattctattatgt 34718658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 459 - 968
Target Start/End: Original strand, 12130464 - 12130973
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  12130464 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtaactagctcaagaataggccctcctagcta 12130563  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12130564 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataactgataaataatactagaaataatagcatagaa 12130663  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 758  Q
    ||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  12130664 ttctgaatcaccatgtcccgaagatgatagagcttggactagagtagatgagtcagactcgaagataacccgattccatctatttgcatcagcaaagtga 12130763  T
Q  759 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 858  Q
    || ||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||  || || ||||||||||    
T  12130764 agagcctcaagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttgctcgctgtcatttcgtttgagcccgaataatttgcccgcgggagtctctaa 12130863  T
Q  859 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 958  Q
    ||||  || |||||| |  |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  12130864 cacaacacccaaaagatagaatatggttacggtcatggaacggggcatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcgatttctcccaaattgagttgtt 12130963  T
Q  959 gccttgcact 968  Q
     |||||||||    
T  12130964 accttgcact 12130973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 463 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 9710312 - 9710033
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||  |    
T  9710312 aaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaactaaaaatacggttactagcccaagaacagaccgtcttagctaaagt 9710213  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9710212 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaattgcatagaattat 9710113  T
Q  663 gaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctatt 742  Q
    |||| |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9710112 gaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcaaagtcagactcgaagacaacccggtcccatctatt 9710033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 462 - 818
Target Start/End: Original strand, 1417819 - 1418166
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa-tacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaag 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  1417819 caaagttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaaatacggtgactagcccaagaacagcctgccctagctaaa 1417918  T
Q  561 ctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaatt 660  Q
    ||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1417919 ctatga----------tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcatagaatt 1418008  T
Q  661 ctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaag 760  Q
    ||||||||||||   |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| || |||||| ||||   ||     
T  1418009 ctgaatcaccatagtccagagacaatagagcttgaactagagtagatgagtcagactcgaagacaacccagtcccatctgtttgcatcagcaaatcaaat 1418108  T
Q  761 ggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccat 818  Q
      ||||||||||||||| |||||| || | || ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  1418109 tacctcgagtaaggctactgtctctcccttcataaccgtcatatttgcccgctaccat 1418166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 457 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 26199045 - 26198779
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| || | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | | | |||||||    
T  26199045 caaagcaaagttaattattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaatgataagaataaaaaatgcggtgactagctcaagaagaagtcaccctagc 26198946  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26198945 taaagtatgagaaaccatgttcacttgttacctaacaaacttcacctcaaagttgaaatgtaaagataactggtaaataatactagaaacaatagcatag 26198846  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 723  Q
    ||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26198845 aatttcaattcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggactcgaaga 26198779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 459 - 754
Target Start/End: Original strand, 11291891 - 11292181
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11291891 aagcaaagttatttattatcattaatcaaccaatgttaat-acaggaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaagccgacctagcta 11291989  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  11291990 aagtatgagcaaacatgttcgctcgtctcctaacaaacttcaccttgaagtt-gaatgtatagataactgataaataatactataaacaataacataaaa 11292088  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 754  Q
    || ||||||| |||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | || ||||||||| |||||||||||    
T  11292089 ttttgaatcatcatggcc-gaaaacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaa--ccgttccatctatttgcatcaacaaa 11292181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 459 - 770
Target Start/End: Original strand, 13109698 - 13110006
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||   || | |||||||||||    
T  13109698 aagcaaagttaattattatcgtaaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataagagtaaaaaatacggtgactaaaccaa---catgtcgccctagcta 13109794  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||    
T  13109795 aagtatgaacaactatgttcgtttgtctcctgacaaacttcacctcaacgttggaatgtaaagataactgataaataatactggaaacaatagcttataa 13109894  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 758  Q
    |||  |||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||  |||||||| | ||||||    
T  13109895 ttccaaatcaccatggcccgaagacgatagagcttccactagagtagaagagtcggactcgaagacaaccatgtcccatctgatcgcatcagctaagtga 13109994  T
Q  759 agggcctcgagt 770  Q
    ||||||||||||    
T  13109995 agggcctcgagt 13110006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 458 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14827441 - 14827126
Alignment:
Q  458 aaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  14827441 aaagcaaagttaactaatatcattaatcaactaatgttcaatacaagaagaataagaatagaaaatgcggtgactagcccaagaatatgtcgccctagat 14827342  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 657  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||| |||||||||||    
T  14827341 aaagtatgagcaaccatgttcgtttgt-tcttaactaactttacctcgaagttggaatgtaaagataactaatacataatattataaataatagcataga 14827243  T
Q  658 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 757  Q
    |||  ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| | |||| || || |||| |||||| || |||||||||  ||||  ||||||    
T  14827242 atttcgaatcaccatgacccaaacacgatagagcttgcactagagtagctaagtcagattcaaagacaactcgatctcatctattcatatcagtaaagtg 14827143  T
Q  758 aagggcctcgagtaagg 774  Q
    || | | ||||||||||    
T  14827142 aatgacatcgagtaagg 14827126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 459 - 673
Target Start/End: Original strand, 35158668 - 35158885
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaa-ccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35158668 aagcaaagttaaatattatcattaatcaaaccaatgttcaatataaaaagcataagaataaaaaatacggtgcctagcccaagaacaggccgccctagcg 35158767  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttca--cctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcata 655  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35158768 aaactatgagcaactatgttcgcttgtctcataacaaacttcatgccttgaagttggaatgtaaaaataattgataaataataatagaaacaatagcata 35158867  T
Q  656 gaattctgaatcaccatg 673  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  35158868 gaattctgaatcatcatg 35158885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 484 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 22845859 - 22845600
Alignment:
Q  484 tcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttg 583  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  22845859 tcaaccaaagttcaatacaagaaggataagaataaaaaatatggtgactagcttaagaacaggtcgccctagctaaagtatgagcaa--atgttcgcttg 22845762  T
Q  584 tctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagac 683  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||| | |||          | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22845761 t-tcctaacaaacttcacattgaagttggaaagcaaa----------agataatactagaaacaatagcctagaattctgaatcaccatgatctggagac 22845673  T
Q  684 gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22845672 gatagagcttgcactagagtagattagttggactcgaagacaacccggtcccatctgttcgcatcagcaaagt 22845600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 546 - 973
Target Start/End: Original strand, 44017231 - 44017658
Alignment:
Q  546 gccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaa 645  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44017231 gccgccctagttaaagtatgagcaactatgtttacttgtctcctaacacacttcatatcgaagttagaatgaaaagataactgataaataatacaagaaa 44017330  T
Q  646 caatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgc 745  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||     ||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||| |||| |||| ||| | ||| |    
T  44017331 caatggcatataattcttaatgaccatgtttcggagacgatagagcttgcactaaagtaacggagtcagactcgaagacaacttggtctcatatgttcac 44017430  T
Q  746 atcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttcca 845  Q
    || | ||| ||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||   ||||||||| |||||||  |||    
T  44017431 attagcaacgtgaatggcatcgagtaaggttgttgtctccccctccaaaactgtcatatttgcacggtgtcattttatttgagcccgaataaattgccca 44017530  T
Q  846 cgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctccc 945  Q
    || ||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||| | | |||||  |||||  | || | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |     
T  44017531 cgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaagatggtcatgatcacagaacgcggaattcgcattgcacttcaaccatgtctcgctcggcttcttca 44017630  T
Q  946 aaactaagttgttgccttgcactgtatt 973  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  44017631 aaacttagctgttaccttgcactttatt 44017658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 701 - 950
Target Start/End: Original strand, 18345555 - 18345803
Alignment:
Q  701 agtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtc 800  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  18345555 agtagatgagtcggattcgaagacaattcgatcccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctc-aaaactgtc 18345653  T
Q  801 atatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacg 900  Q
    ||||||| | | | |||||||| |||||  |  |||||||  |||||  |||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18345654 atatttgtccgttaccatttcgtttgagttcaaataaattacccacggaagtctctaacacaacacgcaaaagaagtaatatggttacgctcatggaacg 18345753  T
Q  901 tagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
    | || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  18345754 ttgcgtccacattgcacttcaaccatgtctcgttcggtttcttccaaact 18345803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 518 - 671
Target Start/End: Original strand, 18344179 - 18344332
Alignment:
Q  518 aaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 617  Q
    ||||||||| ||| ||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18344179 aaaaatacgatgattagtctaacaacaggccgccctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaatttcaccttgaagttggaatgt 18344278  T
Q  618 aaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcacca 671  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18344279 aaagataactgataattaatactagaaacaatatcatagaattctaaatcacca 18344332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 467 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 25552498 - 25552312
Alignment:
Q  467 ttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatga 566  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |  |||| ||||  |||||    
T  25552498 ttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactaacctaagaacaggtcttcctaactaaagtatga 25552399  T
Q  567 gcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagca 653  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||  || ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25552398 gcaaccatgttcacttgtctcttaacaaatttcatcttaaaattgaaatgtaaaaataactgataaataatattagaaataatagca 25552312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 563 - 671
Target Start/End: Original strand, 36445449 - 36445557
Alignment:
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 662  Q
    ||||||||| ||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| | || |||| ||     
T  36445449 atgagcaactatgttcgtttgttgtttaataaacttcacctcgaagttggaatgtaaagagaattgaaaaataatatgagaaacaacaacaaagaactcg 36445548  T
Q  663 gaatcacca 671  Q
    |||||||||    
T  36445549 gaatcacca 36445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 643
Target Start/End: Original strand, 10244499 - 10244580
Alignment:
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaga 643  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  10244499 tatgagcaatcatgttcacttgccgcttaataaacttcacctcgaagttggaatctaaagctaactcagaaataatactaga 10244580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 9709998 - 9709910
Alignment:
Q  751 caaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaat 839  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  9709998 caaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaataaat 9709910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 43293900 - 43293835
Alignment:
Q  573 atgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataata 638  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  43293900 atgttcgcttgtcgcctaataagcttcacctcgaggttgaaatgtaaagataattgagcaataata 43293835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 783 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 26198730 - 26198626
Alignment:
Q  783 tccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatat 882  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||   |||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||||| || |||||    
T  26198730 tccccctccaaaactgtcatatttgttcgctaccattttatttgagctcgaataaattgcccacatgagtctctaacacagcacacaaaagatgcaatat 26198631  T
Q  883 gatta 887  Q
    |||||    
T  26198630 gatta 26198626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 43293964 - 43293918
Alignment:
Q  499 tacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacag 545  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43293964 tacaagaaggataaagataaaaaatacggtgactagtccaagaacag 43293918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 463 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 21321887 - 21321371
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21321887 aaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagt 21321788  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaa-acaatagcatagaattc 661  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  21321787 atgagcaaccatgatcgcttgtctcttaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagctaactgataaataatattggaacacaataacatagaattc 21321688  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagc--ttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaa 759  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  21321687 tgaatcaccatgaccctgagacaatagagcaattgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagaaaagtgaa 21321588  T
Q  760 gggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaac 859  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  21321587 gggcctcgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaatttcccgcgagagtctctaat 21321488  T
Q  860 acagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttg 959  Q
    |||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  21321487 acaacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcaacatccacattgcacttcaaccacgtttcgctcgatttctcccaaactgtgttgttg 21321388  T
Q  960 ccttgcactgtattatg 976  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21321387 ccttgcactctattatg 21321371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 465 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 49951668 - 49951151
Alignment:
Q  465 agttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctat 564  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49951668 agttaactattatcattaatcaactaatgttcaatacaataaggataagaataaaaaatacaatgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtat 49951569  T
Q  565 gagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctga 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49951568 gagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattctga 49951469  T
Q  665 atcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcc 764  Q
    ||||||| | ||   ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  49951468 atcaccacggcccgaagatgataaagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcc 49951369  T
Q  765 tcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagt 864  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||     
T  49951368 tcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattggccgcgagaatctctaacacagc 49951269  T
Q  865 acgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttg 964  Q
    | ||||||| ||||||||| || || |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  49951268 atgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctccaaaactgagttgttaccttg 49951169  T
Q  965 cactgtattatgtctgtg 982  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  49951168 cactctattatgcctgtg 49951151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 460 - 981
Target Start/End: Original strand, 18441974 - 18442493
Alignment:
Q  460 agcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaa 559  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18441974 agcaaaattaactattatcaataatgaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaa 18442073  T
Q  560 gctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaat 659  Q
      ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18442074 aatatgagcaaccattttcgtttgtctcataacaaacttcaccttgaagttggaatataaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaat 18442173  T
Q  660 tctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaa 759  Q
    ||||||||||||||  |   |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||||| || ||||||| |    
T  18442174 tctgaatcaccatgggccaaagacgatatagcttgcact--agtagatgagtcgcactcgaaaataacccggttccatctgttcgcaacagcaaagtgta 18442271  T
Q  760 gggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaac 859  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||    
T  18442272 gggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgcttccatttcgtttgagcccgaataaattgcccatgggagtctctaac 18442371  T
Q  860 acagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttg 959  Q
    |||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  18442372 acaacacgcaaaagttgtaatatggttgcggtcatggaacgcgacatccgcattgcacttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaacagagttgtta 18442471  T
Q  960 ccttgcactgtattatgtctgt 981  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  18442472 ccttgcactctattttgtctgt 18442493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 462 - 948
Target Start/End: Original strand, 41835141 - 41835626
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  41835141 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgt-caatacaagaaagataagaataaaaaatatagtgactagcccaagaacaggccgccctatctaaac 41835239  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41835240 tatgaggaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaaattggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataggattc 41835339  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||||    
T  41835340 cgaatcaccatggcccggagacgatagcgtttgcactagagtagatgaatcgaactcgaagacaacccggtcccatctgtttgcatccgcaaaatgaagg 41835439  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    | |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  41835440 gtctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaactgtcatatttgccagctgtcattttgtttgagcccgaataaattgtctgcgagagtctctaacac 41835539  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaa 948  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41835540 aacacgcaaaagttgtaatatggttacgttcaaggaacgtggcatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcgatttctcccaaa 41835626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 463 - 968
Target Start/End: Original strand, 28537613 - 28538120
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa--tacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaag 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||      
T  28537613 aaagttaactattatcattaatcaaccaatattcaatataagaaggataagaataaaaaaaatatggtgactagtccaaggacaggccgccctagctata 28537712  T
Q  561 --ctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28537713 tactatgagcaaccatgttcgcttgtcttctaccaaacttcacctcgaagttggaatgtaatgataactgattaataatactagaaacaatagcatagaa 28537812  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 758  Q
    || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28537813 ttttgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactaaagtagatgagtcggacttgaacacaacccggtcccatctgttcgcatcaacaaagtga 28537912  T
Q  759 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 858  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||  | ||||||||||    
T  28537913 agggcctcgagtaaggctactgcctccccctc--aaactatcatattttcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgtgggagtctctaa 28538010  T
Q  859 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 958  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  28538011 cacaacacgcaaaatatgtaatatggttacgatcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacgtctcgttcggtttctcccaaactgaattgtt 28538110  T
Q  959 gccttgcact 968  Q
     |||||||||    
T  28538111 accttgcact 28538120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 457 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 2065216 - 2064695
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  2065216 caaaacaaagttaattattatcatcaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgctaccctagc 2065117  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  2065116 taaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatat 2065017  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||   |||||| ||| ||||| ||||||    
T  2065016 aatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttgggctagagtagatgagtccgactcaaagacaacccgactccatctgttctcatcagcaaagt 2064917  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  2064916 gaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatactgtcatatttgcccgctgtcattttgtttgagcccgaataaattatccgcgggagtctct 2064817  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2064816 aacacaacacgcagaggatgtaatatggttacggtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttg 2064717  T
Q  957 ttgccttgcactgtattatgtc 978  Q
    || ||||||||| |||| ||||    
T  2064716 ttaccttgcactctattttgtc 2064695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 457 - 967
Target Start/End: Original strand, 51734796 - 51735305
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  51734796 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaatcaaagatacggtaattagcccaagaacaggccgccctagc 51734895  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  51734896 taaagtatgagcaaccatgttcacttgtcacctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataacagataaataatactagaaacaatatcatag 51734995  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  51734996 aattatgaatcaccatggtccagagacgatagagcttgcactagagtagaggagcctgactcgaagacaactc-gtcctatctattcacatcagcaaagt 51735094  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||| ||||||| || |||  |||||||    
T  51735095 gaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcacgctgtcatttcgtttaagcccgaataaattgtcaacggaagtctct 51735194  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  || |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  51735195 aacacaacacacaaaagatgtaagatggttacaatcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcgctcggtttcgcccaaactgagatg 51735294  T
Q  957 ttgccttgcac 967  Q
    || | ||||||    
T  51735295 ttacattgcac 51735305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Original strand, 51259353 - 51259870
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  51259353 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagttttcaatacaaaaaggataataataaaaaatacggtgactagcccaaaaataggccgccctagc 51259452  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  51259453 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaataacataa 51259552  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| | ||  || || || ||||||    
T  51259553 aattctgaatcaccatggcccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacctggtccgaactgatcccaacagcaaagt 51259652  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtct-ccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctc 855  Q
    ||| | | ||||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  51259653 gaatgacatcgagtaaggcaactgcctcccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgagagtctc 51259752  T
Q  856 taacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagtt 955  Q
    |||||||  |  | |||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  51259753 taacacaacatacgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcagttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaaactgagtt 51259852  T
Q  956 gttgccttgcactgtatt 973  Q
    |||  |||||||| ||||    
T  51259853 gttagcttgcactctatt 51259870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Original strand, 32576872 - 32577386
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32576872 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaaacaaaaatacagtgactagcccaagaacaggctgccctagc 32576971  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32576972 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatcgcatag 32577071  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| | ||||||| | ||  ||||| ||||||    
T  32577072 aattctgaatcaccatgtcccgctgacgattgagcttgcactagagtagcagagtcagactcgaagacaacccagtcccatatgtttacatcagcaaagt 32577171  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
     ||  ||  ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || || || || |||||    
T  32577172 aaatagcagcgagtaaggctagtacctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaa-ttgccccgggaatctct 32577270  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  ||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32577271 aacacaacacgcaaaagatgtaagatggttaaggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctc-ctcggtttctcccaaactgagttg 32577369  T
Q  957 ttgccttgcactgtatt 973  Q
    || ||||||||| ||||    
T  32577370 ttaccttgcactatatt 32577386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 475 - 958
Target Start/End: Original strand, 37245694 - 37246177
Alignment:
Q  475 tatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccat 574  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  37245694 tatcattaatcaactaatgtgcaatacaagaaggataagagttaaaaatgcggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagcaaccat 37245793  T
Q  575 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatga 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37245794 gttcgattgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgg 37245893  T
Q  675 ccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaagg 774  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||  || ||||||||||    
T  37245894 cccagagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgaagacaacccggtcccatctgttcacataagcaaagtgaatagcatcgagtaagg 37245993  T
Q  775 ctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagt 874  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||  | ||| | |     
T  37245994 ctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgtgcccgaataaatttccctcgggagtctctaacacaacatgcagagga 37246093  T
Q  875 tgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 958  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37246094 tgtaagacgattacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 37246177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 467 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 55735368 - 55734848
Alignment:
Q  467 ttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatga 566  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  55735368 ttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgagaattaaaaatatggtgattagatcaaaaacagaccgccctagctaaactatga 55735269  T
Q  567 gcaaccatgttcgcttgt------ctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaatt 660  Q
    |||||||| || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55735268 gcaaccatatttgcttgtagttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgaaatgttaagataactgatcaataatactagaaacaatagcatagaatt 55735169  T
Q  661 ctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaag 760  Q
    |||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  55735168 ctgaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcactagagtagatgaatcggactcgaaaataacccggttccatgtgttcgcaacaacaaagtgaag 55735069  T
Q  761 ggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaaca 860  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| | |||||   || | ||||||||||||    
T  55735068 ggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgctcgcttccatttcgtttgagcccgaacaaattgctcatgggagtctctaaca 55734969  T
Q  861 cagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgc 960  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  55734968 caacacgcaaaagatgtaatatggttgagatcatggagcgcgacatccacattgcacttcaaccacatctcgctcggtttctcccaaaccgagttgttac 55734869  T
Q  961 cttgcactgtattatgtctgt 981  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  55734868 cttgcactctattttgtctgt 55734848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 472 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 56065981 - 56065476
Alignment:
Q  472 tattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaac 571  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56065981 tattatcattaatcaatcagtgtttaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactagcccaaatataggccgccctagctaagctatgagcaac 56065882  T
Q  572 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc----tgaatc 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    | ||||    
T  56065881 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatc 56065782  T
Q  668 accatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcg 767  Q
    ||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||    
T  56065781 accatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcg 56065682  T
Q  768 agtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacg 867  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||| |||  |||    
T  56065681 agtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaaaacaacacg 56065582  T
Q  868 caaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcac 967  Q
    | |||| ||||||||| | ||| ||||| |||    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  56065581 cgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacgacatccacattgcacttcaaccacgtctcacacagtttctcccaaactgagttgttagcttgcac 56065482  T
Q  968 tgtatt 973  Q
    | ||||    
T  56065481 tctatt 56065476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 457 - 976
Target Start/End: Original strand, 29655490 - 29656008
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  29655490 caaagcagagttaactattattattaatcaatcaatgttcaataaaagaatgataagaataaaaaatgcggtgattagccaaagaacaggtcgccctagc 29655589  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29655590 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagtggaaatgtaaagatagctgataaataatactagaaacaataacatag 29655689  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  29655690 aattctgaatcaccatggcccgaagatgatagagcttgcactagagtagcgtagtcagactcgaagacaacacggttccatctgttcacatcagcaaagt 29655789  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| | | ||||||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||    
T  29655790 gaatgacatcgagtaaggctactgcctctccctccaaaacagtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacgggagcctct 29655889  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  |  |||||| ||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| || |     
T  29655890 aacacaaca-acaaaagatgtaagagggttacgatcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctcactcggtttcttccaaactgagata 29655988  T
Q  957 ttgccttgcactgtattatg 976  Q
    || ||||||| | |||||||    
T  29655989 ttaccttgcattctattatg 29656008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Original strand, 49119224 - 49119727
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  49119224 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgtttaatacaagaaggataagaattaaaaatacagtgactagcccaagagcaggccaccttagc 49119323  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  49119324 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttctcctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatcgcatat 49119423  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||||| ||| |||||| ||    |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  49119424 aattctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagt 49119523  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    |||  ||  |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |              || |||||    
T  49119524 gaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccgaa-------------ggaatctct 49119610  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||    
T  49119611 aacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcgcttggtttatcccaaactgggttg 49119710  T
Q  957 ttgccttgcactgtatt 973  Q
    || |||| |||| ||||    
T  49119711 ttaccttacactctatt 49119727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 457 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 28426546 - 28426066
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  28426546 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgtttaatacaagaaggataagaattaaaaatacagtgactagcccaagagcaggccaccttagc 28426447  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  28426446 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttctcctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatcgcatat 28426347  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||||| ||| |||||| ||    |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  28426346 aattctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagt 28426247  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    |||  ||  |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |              || |||||    
T  28426246 gaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccgaa-------------ggaatctct 28426160  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
    ||||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  28426159 aacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcgcttggtttatcccaaact 28426066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 463 - 786
Target Start/End: Original strand, 26422432 - 26422755
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |    
T  26422432 aaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaataggccgccgtagttaaagt 26422531  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 662  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26422532 atgagcaaccatgtttgtctgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactaaaaacaatcgcatagaattct 26422631  T
Q  663 gaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaaggg 762  Q
    ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||  ||||| |||||| ||  |    
T  26422632 gaatcactatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactcgaagacaacccgatcccatctgtttacatcagcaaagtaaatag 26422731  T
Q  763 cctcgagtaaggctagtgtctccc 786  Q
    | ||||||||||||| || |||||    
T  26422732 catcgagtaaggctactgcctccc 26422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 462 - 788
Target Start/End: Original strand, 44935911 - 44936237
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |    
T  44935911 caaagttaactattatcattaatcaatcaatattcaatacaagaaggataaaaaaaaaaaatacggtgactaacccaagaacatgccgtcatagctaaac 44936010  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44936011 tatgagcaaccatgttcgcttgtctgctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataataatagaaacaataacatagaattc 44936110  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
    | ||||||| || ||   | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |  ||||| || |||| | |||||| ||||    
T  44936111 taaatcaccgtggcccgaaaacgatagagtttgcactagagtaaatgagtcggactcgaacacaacccaatttcatctgtttgcattagcaaagtaaagg 44936210  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctcccct 788  Q
      |||||||||||||| || |||||||    
T  44936211 atctcgagtaaggctattgcctcccct 44936237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 464 - 796
Target Start/End: Original strand, 47226163 - 47226493
Alignment:
Q  464 aagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagcta 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| ||  |||    
T  47226163 aagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaagataagaataaaaaatacggtgattagcccaagaaaatgtcgccctagtta--cta 47226260  T
Q  564 tgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctg 663  Q
    | ||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  47226261 taagcaatcatgtttgcttgtcgcctaacattcttcactttgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcatataaatctg 47226360  T
Q  664 aatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggc 763  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  47226361 aatcaccatggcctgaagacgatagagcttgctctaaagtagatgagtcggactcgaacacaactcgatctcatctgttcgcatcagcaaagtgaaaagc 47226460  T
Q  764 ctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaac 796  Q
    |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||    
T  47226461 ctcgagtaagactattacctccccctccaaaac 47226493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 463 - 976
Target Start/End: Original strand, 43840155 - 43840650
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||| | ||||||| |||  |    
T  43840155 aaagttaactattatcgttaatcaaataattttcaatacatgaaagataagaataaaaaatacgatgattaattcaagaacagactgccctagttaaagt 43840254  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 662  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||     
T  43840255 atgaacaaccatgttcgtttgtttcctaaccaacttcactttaaagttggaat-------------------aatactagaaacaatagcatagaattcc 43840335  T
Q  663 gaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaaggg 762  Q
    |||||||||||  |   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| | ||| ||||| ||||||||| ||    
T  43840336 gaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcattagagtagctgagtcgaactcgaagacaaaccggtctcatttgttcacatcagcaaagtgaatgg 43840435  T
Q  763 cctcgagtaaggctagt-gtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    | |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43840436 catcgagtaaaggttgttgtctccccctccaacactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgaccccgaataaattgtccacgggagtctctaacac 43840535  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 961  Q
    |  ||||||||| ||||| ||| ||| | |||| |||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  43840536 aaaacgcaaaagatgtaagatggttatgctcatagaacgcggcatccacgttgaacttcaaccacgtctcgtgcggtctctcccaaactaagttgttgtc 43840635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 463 - 723
Target Start/End: Original strand, 24989764 - 24990023
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||   | |||||| |||  |    
T  24989764 aaagttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatacaaaaagaataagaataaaaagtacggtgattagctcaaaaacatatcaccctagataaagt 24989863  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 662  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  24989864 ataagcaaccgtgttcgtttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaac-ataacatagaatttt 24989962  T
Q  663 gaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 723  Q
    |||||||| || ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24989963 gaatcaccgtggcccagagacggtagagcttgcactagagtagctgagtcagactcaaaga 24990023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 469 - 672
Target Start/End: Original strand, 8754299 - 8754502
Alignment:
Q  469 aactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagc 568  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||  || ||||    
T  8754299 aactattatcattaatcaaataatgttgaatacaagaaaaataagaataaaaaatacggtgactatccaaagaacagaccgctctatctaaagtacgagc 8754398  T
Q  569 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 668  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  8754399 aaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactaaaaacaatagtatagaattccaaatca 8754498  T
Q  669 ccat 672  Q
    ||||    
T  8754499 ccat 8754502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 475 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 23095559 - 23095405
Alignment:
Q  475 tatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccat 574  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||    
T  23095559 tatcattaatcaactaatgtgcaatacaaaaatgataagaattaaaaatgcggtgactagcccaagaacaggccaccctagctaaaatatgagtaatcat 23095460  T
Q  575 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23095459 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga 23095405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 457 - 559
Target Start/End: Original strand, 10575273 - 10575375
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10575273 caaagcaaagttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatatggtgactagcccaaaaacaggccgccctagc 10575372  T
Q  557 taa 559  Q
    |||    
T  10575373 taa 10575375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 457 - 559
Target Start/End: Original strand, 6753943 - 6754044
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  6753943 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactag-ccaagaacaggccaccttagc 6754041  T
Q  557 taa 559  Q
    |||    
T  6754042 taa 6754044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 3347468 - 3347351
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || || |||||  |||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  3347468 caaagcaaagttaacgattatcattaatcaactaatgtccaatataagaaatataagaataaaaaatacgaggactagtccatgaacatcccgccctagc 3347369  T
Q  557 taagctatgagcaaccat 574  Q
    |||  |||||||||||||    
T  3347368 taaaatatgagcaaccat 3347351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 459 - 619
Target Start/End: Original strand, 51364555 - 51364710
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaat-caaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||  |||||||  ||||  |||||||||    
T  51364555 aagcaaaattatctattatcattaatcaaccaatgttcaatacaacaacaataaaaataaaaaaatacggtgac--gcccaagggcaggttgccctagct 51364652  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaa 619  Q
    ||  |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  51364653 aaagtatgagcaacaatattcgtttgtcttctaacaaacttcac----aagttggaatgtaa 51364710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 457 - 548
Target Start/End: Original strand, 17374599 - 17374690
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggcc 548  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17374599 caaagtaaatttaactattatcattaatcaactaatgttaaatacaagaatgataagaacaaaaaatacggtaactatcccaagaacaggcc 17374690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 613
Target Start/End: Original strand, 34926171 - 34926326
Alignment:
Q  458 aaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||| ||| ||| ||    
T  34926171 aaagtaaagttaattattatcataaatcaaccaatattcaatgcaaaaatgataagaataaaaaatacggtgattaacccaaaaataggtcgctctaact 34926270  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgga 613  Q
    ||  |||| ||||| || || |||||| || | | |||||||||||| ||||||||    
T  34926271 aaagtatgggcaactatatttgcttgtttcatgaaaaacttcacctcaaagttgga 34926326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 40727221 - 40727169
Alignment:
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 614  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40727221 tatgagcaactatgctcgcttgacgcctaacaaacttcacctcaaagttggaa 40727169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 803
Target Start/End: Original strand, 24990042 - 24990093
Alignment:
Q  752 aaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcata 803  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24990042 aaagtgaatgacatcgagtaaggctactgtctccacttccaaaactgtcata 24990093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 33582991 - 33582916
Alignment:
Q  516 tcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaa 591  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |   | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33582991 tcaaatatacgatgactagcccaagaacaagccgccttagcaagagtgtgagcagccatgttcgcttgtcgcctaa 33582916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 462 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 16732291 - 16731777
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  16732291 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagtccgccctagctaaag 16732192  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16732191 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattc 16732092  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||| |    
T  16732091 tgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcagagtgaatg 16731992  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||  || || || ||||||||||    
T  16731991 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgggaatctctaacac 16731892  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 961  Q
    |  | ||||||| ||||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16731891 aacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttacc 16731792  T
Q  962 ttgcactgtattatg 976  Q
    ||||||| |||||||    
T  16731791 ttgcactctattatg 16731777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 462 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 17710425 - 17709911
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  17710425 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagtccgccctagctaaag 17710326  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17710325 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattc 17710226  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||| |    
T  17710225 tgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcagagtgaatg 17710126  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||  || || || ||||||||||    
T  17710125 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgggaatctctaacac 17710026  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 961  Q
    |  | ||||||| ||||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17710025 aacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttacc 17709926  T
Q  962 ttgcactgtattatg 976  Q
    ||||||| |||||||    
T  17709925 ttgcactctattatg 17709911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Original strand, 9328426 - 9328941
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||    
T  9328426 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcccaagaataggacgtcgtagc 9328525  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  9328526 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaaacgcatag 9328625  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  9328626 aattctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactccaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagt 9328725  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    |||  ||  |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||| || ||||||| ||| || || |||||    
T  9328726 gaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatattttcccgttgccatttcgtttgagctcgaataaattgtcc-cgggaatctct 9328824  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9328825 aacacaacacgcaaatgatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttg 9328924  T
Q  957 ttgccttgcactgtatt 973  Q
    || ||||||||| ||||    
T  9328925 ttaccttgcactctatt 9328941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 469 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 22289592 - 22289088
Alignment:
Q  469 aactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagc 568  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22289592 aactattatcattaatcaactagtgttcaatataagaaggataaaaataaaaaatacggtaactagttcaagaacaggccgccctagctaagctatgagc 22289493  T
Q  569 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22289492 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacatcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattctgaatca 22289393  T
Q  669 ccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcga 768  Q
    ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||| || |  ||||||||| ||| ||||    
T  22289392 ccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacagcccggtcccatttgttcccaacggcaaagtgaatggcatcga 22289293  T
Q  769 gtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgc 868  Q
    ||||||| |    |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||| || ||||  ||||| || |||||||||||  ||||    
T  22289292 gtaaggcaaccacctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtctgagtccgaatgaattgcccacgggaatctctaacacaacacgc 22289193  T
Q  869 aaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcact 968  Q
     |||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  22289192 gaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttaaaccacgtctcacgcggcttctcccaaactgagttgttagcttgcact 22289093  T
Q  969 gtatt 973  Q
     ||||    
T  22289092 ctatt 22289088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 462 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 1581975 - 1581467
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| || ||||||| |    
T  1581975 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaaaaataagcctccttagctaaac 1581876  T
Q  562 tatgagcaacc-atgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaatt 660  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  1581875 tatgagcaccccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatattataaacaatggcatagaatt 1581776  T
Q  661 ctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaag 760  Q
      |||||||||||  |  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1581775 tcgaatcaccatggtccggagacgatagagtttgcattagtgtagatgagttggactccaatagaacccgatctcatctgttcgcatcagcaaagtgaag 1581676  T
Q  761 ggcctcgagtaaggctagtgtct-ccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaac 859  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||| || |||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||||||||| |    
T  1581675 ggcctcgagtaaggctactgcatcccccctcaaaaactataatatttgccctctgccatttcgtttgagcccggataaactatccgctggagtctctagc 1581576  T
Q  860 acagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttg 959  Q
    |||  ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  1581575 acaacacgcaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacatctcgctcagtttctcccaaactgagttgtta 1581476  T
Q  960 ccttgcact 968  Q
    | |||||||    
T  1581475 cgttgcact 1581467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 462 - 928
Target Start/End: Complemental strand, 16098851 - 16098382
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa---tacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16098851 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaaaaatacggtgactagctcatgaacaggccgccctagcta 16098752  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16098751 aaatatgagcaaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataactaatactagaaacaatatcatagaa 16098652  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 758  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||| |||| |||    
T  16098651 ttctgaatcaccatggcccggagacgatggagcttgtactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatttgttagcatcagcaaattga 16098552  T
Q  759 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 858  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||| || ||||||| |||||||||||   | | |||||||| ||||||||| |||||||  | | | ||||||||||    
T  16098551 agggcctctagtaaggctactacctctccctccaaaattgtcatatttgttcgtttccatttcgtttgagcccgaataaattgcctatgggagtctctaa 16098452  T
Q  859 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgt 928  Q
    ||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||    
T  16098451 cacaacacgcaaaagaagtaatatggttacggtcatggaacgatgcgtccacattgcacttcaaccacgt 16098382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 457 - 978
Target Start/End: Original strand, 29200780 - 29201294
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29200780 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaag-ataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagc 29200878  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29200879 taaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatag 29200978  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || | |||||| ||| ||||| ||||||    
T  29200979 aattctgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgaagacaacccgtttccatctgttcacatcagcaaagt 29201078  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttc--cacgagagtct 854  Q
    ||| | | || |||||   |  |  |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |  |||  ||||||    
T  29201079 gaatgacatcaagtaaacatgctacctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgtcatttcgtttgagcccgaataaactggccacacatgagtct 29201178  T
Q  855 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 954  Q
    |||| |||  | ||||||| | |||||||         |||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||     
T  29201179 ctaatacaacatgcaaaagatataatatg--------gatggaaagcggcatcaacattgcacttcaaccacgtctcgtgcggtttctcccaaactgagc 29201270  T
Q  955 tgttgccttgcactgtattatgtc 978  Q
    | || |||||||||||||| ||||    
T  29201271 tattaccttgcactgtattttgtc 29201294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 458 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 17877760 - 17877260
Alignment:
Q  458 aaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||    
T  17877760 aaagcaaagttaactattatcattaattaatcaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaataacatgccgtcctacct 17877661  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 657  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17877660 aaagtatgagcaaccatggtcgcttgtctcataacaaacttcacctcgaaattgaaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataga 17877561  T
Q  658 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 757  Q
    |||  ||||||||||||||   | ||||||||||||||||          ||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||||||    ||||||    
T  17877560 attacgaatcaccatgacccataaacgatagagcttgcac----------gagtcagactcgaagacaacccgattccatctgttcgcatttgtaaagtg 17877471  T
Q  758 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 857  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||||| || || || || ||| | |||||| ||    
T  17877470 aagggccttgagtaaggctacttcctccccctccaatactgtcatatttccccgctgcgatttcgtttgagcacgaatgaacttcccatgggagtctata 17877371  T
Q  858 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgt 957  Q
    || |   |||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17877370 acgccacacgcaacaaatgtaatatggttacaatcatggaacgcgacatccacattgcatttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaattgagttgt 17877271  T
Q  958 tgccttgcact 968  Q
    | |||||||||    
T  17877270 taccttgcact 17877260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 464 - 976
Target Start/End: Original strand, 30493441 - 30493952
Alignment:
Q  464 aagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagcta 563  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  30493441 aagttaactattatcagtaatcaacaaatattcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagta 30493540  T
Q  564 tgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctg 663  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30493541 tgaacaaccatgtttggttgtctcctaacaaacttcactatgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatagcataaaattctg 30493640  T
Q  664 aatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggc 763  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||  |||| | ||||||| | |    
T  30493641 aatcaccatggcccgaagacgatagagcttgcactagagtaattgagtcggactcgaagacaacctggtctcatctgttcatatcagctaagtgaacgac 30493740  T
Q  764 ctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacag 863  Q
     || |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||| |||| | |||||||||     
T  30493741 atcaagtaaggctactgcctcccc-tccaaaactgtcatacttgtctgctgccatttcgtttgagcctgagtaaattgcccatgagaatttctaacacaa 30493839  T
Q  864 tacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcctt 963  Q
     ||||||||  |||||  || ||||  |||||||| |   |||||| ||||||||| | |||||| ||| ||| ||||| |||||||  ||||||  |||    
T  30493840 cacgcaaaatatgtaagttggttacagtcatggaatgcgacatccatattgcactttaaccacgtttcgttcgatttcttccaaactgtgttgttatctt 30493939  T
Q  964 gcactgtattatg 976  Q
    ||||| |||||||    
T  30493940 gcactttattatg 30493952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 459 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 3602013 - 3601751
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3602013 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatgcaagaaggataagaataaaaaatacggtgacaagcccaacaacagcccgccctagcta 3601914  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3601913 aactatgagcaaccatgttcgattgtctcctaacaaacttcacctcgaatttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataaaa 3601814  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaa 721  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3601813 ttctgaatcaccatggtccagagacgataaagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaa 3601751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 463 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 3275392 - 3275131
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct-aagc 561  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3275392 aaagttaattattatcattaatcaaacactgtttaatataagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcctaagaacaggccgccctagcttaagc 3275293  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  3275292 tatgatcaaccatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaatta 3275193  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 723  Q
    ||||||| | || ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3275192 tgaatcatcgtggcctagagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaaga 3275131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 457 - 642
Target Start/End: Original strand, 33224384 - 33224569
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33224384 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaatacaagaatgataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctaga 33224483  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactag 642  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33224484 taagttatgagcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactag 33224569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 460 - 921
Target Start/End: Original strand, 30824323 - 30824762
Alignment:
Q  460 agcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaa 559  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  |||    
T  30824323 agcaaagttaact-ttatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaagataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacagaccacc-taattaa 30824420  T
Q  560 gctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaat 659  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30824421 ggtatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaacttcacttcaaagttggaatgtaaagataactgataaataagactagaaacaataacatagaat 30824520  T
Q  660 tctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaa 759  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||                   ||||||||| |||  | |||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  30824521 tctgaatcaccatgacccagagacgatagagcatgc-------------------actcgaagacaacctgatcccatctgttcgcattagaaaagtgaa 30824601  T
Q  760 gggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctg-ccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 858  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||  | |||| |  |||   || |||||| ||||||| | | ||  |||||||||    
T  30824602 gggcctcgagtaaggctactgcctccc--ttcaaaactgtcatatttatccgctgtctttttttttttagcccgaataaattattcgcggcagtctctaa 30824699  T
Q  859 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttca 921  Q
    ||||  | ||||||| |||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30824700 cacaacatgcaaaagatgtaatatgactacagtcatgaaatgtagcatccacattgcacttca 30824762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 457 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 44481450 - 44481267
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44481450 caaagcaaagttaactattatcattaatcaacccatgttcaatacaagatggataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 44481351  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatact 640  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44481350 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgaaatgtaaagataactggtaaataatact 44481267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 457 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 24251799 - 24251619
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24251799 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaag---gataagaattaaaaatacggtgactagctcaagaacaggccgccctagc 24251703  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatact 640  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24251702 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatact 24251619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 457 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 47580237 - 47580022
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  47580237 caaaacaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgagaat-aaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgtcttaac 47580139  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    | |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  47580138 tgaagaatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaccaaacttcacctcgaagttggaatataaagataactgataaataatactagatccaatagcatag 47580039  T
Q  657 aattctgaatcaccatg 673  Q
     | ||||||||||||||    
T  47580038 gactctgaatcaccatg 47580022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 457 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 24139374 - 24139221
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24139374 caaaacaaaattaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 24139275  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagtt 610  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24139274 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagtt 24139221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 456 - 622
Target Start/End: Original strand, 35030481 - 35030643
Alignment:
Q  456 tcaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctag 555  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||   || |||||| | ||||||| || |||||||||  || ||||    
T  35030481 tcaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatactagaaagatat--at-aaaaatccagtgactaacc-aagaacaggttgctctag 35030576  T
Q  556 ctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaaga 622  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35030577 ctaaagtatgagcaattatgttcgcttgtctcttcgcaaacttcacctcaaagttggaatgtaaaga 35030643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 459 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 35013920 - 35013709
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| |   | |||||| |||| | ||||||  | ||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  35013920 aagcaaaatcaactaatatcattaattacatattgttcaatacatggaggatagaactcaaaaacacggcgactagccgaagaataggtcgccctagcta 35013821  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  || |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| |  |||||||| ||||| |||||| || ||    
T  35013820 aagtacgagcgaccatatttgcttgtctcctaataaacttcaacttgaaattggaatgtaaaactaacttagcaataatacaagaaataatagcctaaaa 35013721  T
Q  659 ttctgaatcacc 670  Q
    ||  ||||||||    
T  35013720 tttagaatcacc 35013709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 633 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 24139218 - 24139138
Alignment:
Q  633 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcg 713  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24139218 ataatactagaaacaatagcataaaatttcaaatcaacatgacccggagacgacagagcttgcactagagtagctgagtcg 24139138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 614
Target Start/End: Original strand, 6056273 - 6056358
Alignment:
Q  529 gactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 614  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  6056273 gactaggccaagaacatgccgccctagcaatcgtatgaacaaccatgttcgcttgacgcccaacaaacttcacctcaaagttggaa 6056358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 517 - 624
Target Start/End: Original strand, 43782921 - 43783028
Alignment:
Q  517 caaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatg 616  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    |||||||| || | |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||    
T  43782921 caaaaacatggtgactagcccatgaaccggccgccctcgctaaagagtgagcaactatatccgcttgtcgccgaataaactttacctcgaagttggaatg 43783020  T
Q  617 taaagata 624  Q
    || |||||    
T  43783021 tagagata 43783028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 648 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 44480972 - 44480892
Alignment:
Q  648 atagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataact 728  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||  | ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  44480972 atagcataaaattccgaatcaccatgacccggagacgataacgtttgcagtagagtagcggagtcggactcgaagacaact 44480892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 516 - 614
Target Start/End: Original strand, 28598113 - 28598211
Alignment:
Q  516 tcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 614  Q
    ||||||| | || |||||| | ||||| | ||||||||||| |   |||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28598113 tcaaaaacatggcgactaggctaagaatatgccgccctagcaatcgtatgagcagccatgtttgcttgacgcctgacaaacttcacctcaaagttggaa 28598211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 6216549 - 6216488
Alignment:
Q  564 tgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataa 625  Q
    |||||||  |||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6216549 tgagcaagtatgttcgcttgtcgacaaataaacttcacctcaaagttggaatgtatagataa 6216488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 462 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 25731166 - 25730688
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25731166 caaatttaactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaag 25731067  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25731066 tatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaacttcacctggaagttggaatgtaaatataactgataaataatactagaaacaataacatagaattc 25730967  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25730966 ttaatcaccatgaccctgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcagtcccatctgttcgcatcagcaaagtgaagg 25730867  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| || || ||| |||||||||    
T  25730866 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagctcgaataaatttcccgcgtgagactctaacac 25730767  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggttt 940  Q
    |  |||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25730766 aacacgtgaaaattgtaatatggttacggtcatggaacgcggaatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcggttt 25730688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 20205318 - 20204802
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  20205318 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatacgttgactggcccaagaataggctgccctagc 20205219  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20205218 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctagaagttggaatgtaaagataactgatatataatactagaaacaatagcatag 20205119  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  20205118 aattttgaatcaccatgacccggagaggatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcaacaacaaagt 20205019  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  20205018 gaatggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcctggataaatttcccgcgggagtctct 20204919  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    | ||||  | | ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| ||||     
T  20204918 agcacaaaatgtaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcatttggtttctcccaaactgagtta 20204819  T
Q  957 ttgccttgcactgtatt 973  Q
    || |||| |||| ||||    
T  20204818 ttaccttacactctatt 20204802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 458 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 8388448 - 8387933
Alignment:
Q  458 aaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8388448 aaagcaatgttaactattatcattaatcaaccagtgtttaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaaaccaccctagct 8388349  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8388348 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcccctcgaagttggaatgtaaagaaaactgaaaaataatactggaaacaatagcataaa 8388249  T
Q  658 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 757  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |  |||||||    
T  8388248 attctgaatcaccatggcctggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaaccgcaaagtg 8388149  T
Q  758 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 857  Q
    || ||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| | || ||||  |||||||||||||||    
T  8388148 aatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaatgaattgcccacgagagtctcta 8388049  T
Q  858 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgt 957  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||  | ||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  8388048 acacaacacgcgaaagatgtaatattttaacggtcatgaaacgcggcatccacattgtacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccagactgagttgt 8387949  T
Q  958 tgccttgcactgtatt 973  Q
    |  |||||||| ||||    
T  8387948 tagcttgcactctatt 8387933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 467 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 4268456 - 4267969
Alignment:
Q  467 ttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaat----caaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |    
T  4268456 ttaactattatcattaatcaaacaatgctcaatacaagaaggataataataaaaaaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccctagataaagt 4268357  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4268356 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgagaattaatactagaaacaatagcatagaattcc 4268257  T
Q  663 gaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaaggg 762  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  4268256 gaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagaaaacccggtcccacctgttagcatcagcaaagtgaaggg 4268157  T
Q  763 cctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacaca 862  Q
    |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4268156 cctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcctgaataaattgcccacgagagtctctaacaca 4268057  T
Q  863 gtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
      ||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||  || ||||| |||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  4268056 acacgcaaaagatgtaatatggttacaatcaagaaacgcggcgtccacgttgcactttaaccatgactcgttcggtttctcccaaact 4267969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 457 - 950
Target Start/End: Original strand, 26597290 - 26597774
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      
T  26597290 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaatcaaatatacggtgattagtccaagaacaggctgcccta-- 26597387  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26597388 -------tgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataattgaaaaataatactagaaacaataacataa 26597480  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |  ||||||    
T  26597481 aattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatctattcccaactgcaaagt 26597580  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  26597581 gaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaattgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgtccacgggagtctct 26597680  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
    ||||||  |||| |||| ||||||||| | | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||    
T  26597681 aacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgatgatcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtcttacacgatttctcccaaact 26597774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 479 - 976
Target Start/End: Original strand, 15988593 - 15989092
Alignment:
Q  479 attaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa--tacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgt 576  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15988593 attaatcaactaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaaaatatggtgactagcccaatagcaggccgccttagctaaagtatgagcaaccatgt 15988692  T
Q  577 tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgacc 676  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  15988693 ctgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgtaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggcc 15988792  T
Q  677 ttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggct 776  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  15988793 tgaagacgatagagattgcactagagtagctgagacggacttgaagacaacccggtcccatatgttcgcatcagcaaagtaaagggcctcgagtaaggtt 15988892  T
Q  777 agtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttg 876  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||   | ||| ||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  15988893 actgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgctcgcgaaagtctctgacataacacgcaaaagttg 15988992  T
Q  877 taatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtattatg 976  Q
    ||||||| || || ||||||||||   |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  15988993 taatatggttgcggtcatggaacgcgacatccatatttcacttcaacaacgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatg 15989092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 459 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 27292794 - 27292304
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27292794 aagcaaatttaactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgtc-ccctagcta 27292696  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  27292695 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctgataaacttcactttgaagttggaatgtaaagataactgataattaatactagaaacaatagcataaaa 27292596  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 758  Q
    |||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  27292595 ttccaaatcaccatggcctggagacgatagagtttgcactagagcagatgagtcgaactcgaagacaacccggtcccatctgttatcatcagcaaagtga 27292496  T
Q  759 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 858  Q
    ||||| || |||||||||| || |||||| | ||||||  | ||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27292495 agggcatctagtaaggctattgcctcccccttcaaaacaataatatttgtccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacgagagtctctaa 27292396  T
Q  859 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
    ||||  | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  27292395 cacaacatgcaaaatatgtaatatggttactatcatggaacgtgacatccacattgcacttcaaccatgactcgttcggtttctcccaaact 27292304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Original strand, 22767097 - 22767597
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22767097 caaaacaaagttaactattatcattcatcaaccaatgttcaacacaagaagaataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccttagc 22767196  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||| ||||||    
T  22767197 taaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga----------------caatcgcatag 22767280  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  22767281 aattctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcaaactcgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagt 22767380  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    |||  ||  |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||  || || || |||||    
T  22767381 gaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccccgggaatctct 22767480  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22767481 aacacaacacgcaaaagatgtaagatgattactgtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttg 22767580  T
Q  957 ttgccttgcactgtatt 973  Q
    || ||||||||| ||||    
T  22767581 ttaccttgcactctatt 22767597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 462 - 916
Target Start/End: Original strand, 11375351 - 11375796
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  11375351 caaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgaatagcccaagaacaggccgccctagctaaag 11375450  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||          ||||||||    
T  11375451 tatgagcaactatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcggagttggaatgtaaagataactcataaataatacgaga---------gtagaattc 11375541  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
     |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||  |||| ||||||    
T  11375542 cgaatcaccatggaccggagacgatagagcttgcactagaatagatgaatcagactcaaagacaacccggtcccatatatttgcatccgcaaaatgaagg 11375641  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||   |  ||||||||||||||||    
T  11375642 gcctcgagtaaggctactgtctccccctccaaaactgtcatatttactcgctgccatttcgtttgagtccgaataaatcacctgcgagagtctctaacac 11375741  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgca 916  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11375742 aacatgcaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacgcagcatccacattgca 11375796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 485 - 982
Target Start/End: Original strand, 27532758 - 27533256
Alignment:
Q  485 caaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgt 584  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  27532758 caaccattgttcaatacgagaaggataagaataaaaaatacagtgattagcccaagaacatgtcaccctagctaaagtataagtaaccatgttcgcttgt 27532857  T
Q  585 ctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27532858 ctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatacttgaaacaatagcaaagaattctgaatcaccatgacccggagacg 27532957  T
Q  685 atagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctc 784  Q
    ||| ||  ||||||| || ||   ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | |||| ||| |||| || |||    
T  27532958 ataaagtctgcactaaagaagcaaagtcggactcgaaaacaacccggtcccatctattcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaagctattgcctc 27533057  T
Q  785 cccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgc-aaaagttgtaatatg 883  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||  ||    
T  27533058 cccctccaaaactgttatattttcctgctaccatttcgtttgagcccgaataaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcaaaaagatgtaaactg 27533157  T
Q  884 attacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtattatgtctgtg 982  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||  | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  27533158 gttacgatcatggaacgcgacatccacattacacttcagtcgcgtctcgcgcgatttctcccaaactaaactattaccttgcactatattctgtctgtg 27533256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 457 - 973
Target Start/End: Original strand, 41940560 - 41941077
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa-tacggtgactagcccaagaacaggccgccctag 555  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || | |||||    
T  41940560 caaagcaaagttaacaactatcattaatcaaccaatgttcaataaaagaaggataagaataaaaaaatacggtgactagcccaataacaagcagtcctag 41940659  T
Q  556 ctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcata 655  Q
    ||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  41940660 ctaaagtattagcaatcatgttctcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataaccggtaaataatactagaaacaatagcata 41940759  T
Q  656 gaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaag 755  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||| ||| | |||||    
T  41940760 gaattctgaatcacaatggtccagagacgatagagtttgcactagagtagttgagtcggactcgaagacaacccggtccagt-tgttcacatgagcaaag 41940858  T
Q  756 tgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcct-gctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 854  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||   || ||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  41940859 tgaatgacattgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttttctatatgtcatttcgtttgagctcgaataaatttcccacgggagtct 41940958  T
Q  855 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 954  Q
     ||||||   || |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||    
T  41940959 ttaacactacacacaaaagatgtaagatagttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccacatctcgctcggtttctcccaaattgggt 41941058  T
Q  955 tgttgccttgcactgtatt 973  Q
    || | ||||||||| ||||    
T  41941059 tgataccttgcactctatt 41941077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 457 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 12660679 - 12660210
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| | ||||| || ||||| ||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  12660679 caaagcaaaaataactattatcattaatcaatcaatgtttaatacaaaaaagataaaaataaaaaatatgttgattagctcaagaacaggccgtcctagc 12660580  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12660579 taaagtatgagcagtcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcagctcgaagttagaatgtaaacataactgaaaaataatactagaaacaatatcatag 12660480  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||| | ||| ||| | ||||||    
T  12660479 aattctgaatcaccgtggcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgacgataacacggtctcatttgttcacattagcaaagt 12660380  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| | | ||||||||| ||| || |||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||||||    
T  12660379 gaatgacatcgagtaagactactgcctcccgctctaacactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgtccatgaaagtctct 12660280  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccac 926  Q
    ||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12660279 aacacaacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccac 12660210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 459 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 32632875 - 32632548
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32632875 aagcaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatccaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgcc-tagcta 32632777  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  32632776 aagtatgggcaactatgttcgcttgtctcataataaacgtcacctcgaagttagaatgtaaagataacaaataaataatattagaaacaatgtcatagaa 32632677  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 758  Q
    ||||||||||| ||| |   ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||   ||||||||| ||||  ||| |||    
T  32632676 ttctgaatcactatggctcggagacgataaagcttacactaaagtagatgagtcagactcaaagacaacccggtttaatctattcgtatcagtaaaatga 32632577  T
Q  759 agggcctcgagtaaggctagtgtctcccc 787  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||    
T  32632576 aaggcctcgagtaaggttattgtctcccc 32632548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 457 - 879
Target Start/End: Original strand, 34652085 - 34652499
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||  |||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||     
T  34652085 caaagcaaatgtaactattgtccttaatcaaccaatattcaatacaagaaagataagaataaaaaatacggtgactaacccaagaataagccatcctagt 34652184  T
Q  557 taagctat--gagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 654  Q
    |||  |||  ||||||||||||||||||||||    ||||||     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34652185 taaagtatatgagcaaccatgttcgcttgtct----acaaac-----ctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaataacat 34652275  T
Q  655 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 754  Q
    | ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||| ||||  ||||    
T  34652276 ataattctgaatcaccatggcccagagacggtagagcttgcactagagtagtcgagtcgggctcgaagacaacccgatcccatctgttcacatcggcaaa 34652375  T
Q  755 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 854  Q
    ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  34652376 gtgaatggcatcgagtaaggttattatctccccttacaacactgtcatatttgctcgctgcc-ttttgtttgagaccggataaattgcccacgggagtct 34652474  T
Q  855 ctaacacagtacgcaaaagttgtaa 879  Q
    ||||||||  || |||||| |||||    
T  34652475 ctaacacaacacacaaaagatgtaa 34652499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 518 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 23075134 - 23074950
Alignment:
Q  518 aaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23075134 aaaaatacggtgactagcccaagaacatgtcgtcctagctaaactatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttaaagttggaatgt 23075035  T
Q  618 aaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagag 702  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |   |||||||| ||||||||||||||    
T  23075034 aaacataactgataaataatactataaacaataacatagaattatgaatcaccatggaccgaagacgataaagcttgcactagag 23074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 457 - 654
Target Start/End: Original strand, 30573501 - 30573698
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  30573501 caaaacaaagttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactaacccaaaaacagaccgccttagc 30573600  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 654  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30573601 taaaatatgaacaaccatgttcgcttgtcttctaacaaatttcacctcaaaattaaaatataaagataactgataaataatactaaaaacaatagcat 30573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 459 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 26076642 - 26076480
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct- 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  ||||  ||     
T  26076642 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatacagtgattatcccaagaacaggctaccctgacta 26076543  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 620  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26076542 aaaatatgagcaaccatgtttgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaa 26076480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 457 - 723
Target Start/End: Original strand, 30222662 - 30222928
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaa-tcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa-tacggtgactagcccaagaacaggccgcccta 554  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| |||| || |||||| || |||||| |||||| | ||||| |||| | | ||   ||||||||||||||||||    
T  30222662 caaaggaaaggtaagtattatcattaaatcaatcaatgttcaatataagaagaataagactaaaaaaatacgctaattatgtcaagaacaggccgcccta 30222761  T
Q  555 gctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 654  Q
      |||  ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||||||||||    
T  30222762 attaaagtatgagcaatcatgtttgcatgtctcttaacaaacttcacatcaaagttagaatgtaaagataattgataa--aattctataaacaatagcat 30222859  T
Q  655 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 723  Q
    ||||||| |||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  30222860 agaattccgaatcaccgtgacccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcagattcgaaga 30222928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 768 - 973
Target Start/End: Original strand, 30222934 - 30223139
Alignment:
Q  768 agtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacg 867  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||| | |||| ||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||||||  |||    
T  30222934 agtaaagctactgtctccctctccaaaactgtcaaattcgcttgctgcaaattcgtttgagcccgaataaattgcccatggaagtctctaacacaacacg 30223033  T
Q  868 caaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcac 967  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||   | ||||  ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  30223034 caaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcgacgtccatgttgcactttgaccacgtctcgcacggtttctcccaaacagagttgttaccttgcac 30223133  T
Q  968 tgtatt 973  Q
    | ||||    
T  30223134 tctatt 30223139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 694 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 37448251 - 37448083
Alignment:
Q  694 gcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaa 793  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | | |||||||||||||  | |||||||| |||    
T  37448251 gcactagagtagttgaattgaactcgaagacaacccggttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctaccgcctcccctttcaa 37448152  T
Q  794 aactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacaca 862  Q
     |||||||| |||||  |||||||||| | ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  37448151 cactgtcatgtttgcacgctgccattttgtttgagtccgaatacattgtccacgagagtctctaacaca 37448083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 467 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 12717862 - 12717679
Alignment:
Q  467 ttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatga 566  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||   ||| ||| | |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  12717862 ttaactaatatcattaatcaataattgttcattacaagtaggagaaatctcacaaacatggtgactagatcaagaacgggccgccctcgctaaggtatga 12717763  T
Q  567 gcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaata 650  Q
    |||||||| ||||||||||  | || |||||||| ||  || ||| ||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  12717762 gcaaccatattcgcttgtcgtcgaataaacttcatcttaaaattgaaatgtaaaactaactcaaaaataatatgagaaacaata 12717679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 467 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 12779086 - 12778903
Alignment:
Q  467 ttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatga 566  Q
    ||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||| |||| ||   ||| ||| | |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  12779086 ttaactaatattattaatcaataattgttcattacaagtaggagaaatctcacaaacatggtgactagatcaagaacgggccgccctcgctaaggtatga 12778987  T
Q  567 gcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaata 650  Q
    |||||||| ||||||||||  | || |||||||| ||  || ||| ||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  12778986 gcaaccatattcgcttgtcgtcgaataaacttcatcttaaaattgaaatgtaaaactaactcaaaaataatatgagaaacaata 12778903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 657
Target Start/End: Original strand, 31908233 - 31908420
Alignment:
Q  467 ttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatga 566  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||   |||||||| ||||||| | || ||  | ||| | ||  |||  |||||    
T  31908233 ttaattattatcatcaattaaccaatgtttaatacaagaaggataaaaa---aaaatacgatgactagactaaaaatcgaccgtcttaattaaagtatga 31908329  T
Q  567 gcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 657  Q
    ||||||||||| | || ||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  31908330 gcaaccatgtttgtttatcgactaacaaacttcatctcaaagttgaaatgtgaagataactgataaataatattataaacaatagcataga 31908420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 533
Target Start/End: Original strand, 2872262 - 2872339
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtg------ttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgacta 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2872262 caaagttaactattatcattaatcaaccaatggcaatgttcaatacaagaaggataaaaatcaaaaatacggtgacta 2872339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 885 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 16074671 - 16074598
Alignment:
Q  885 ttacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 958  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16074671 ttacgttcatggaacgcggcatccacattgcactttgaccacgtctcgcacggtttctcctaaactaagttgtt 16074598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 905 - 962
Target Start/End: Original strand, 34653864 - 34653921
Alignment:
Q  905 atccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcct 962  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34653864 atccacattgcacttcaaccacgtctcgtgcggtttctcccaaacttagttgttgcct 34653921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 459 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 26296428 - 26296365
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa 522  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  26296428 aagcaaatttaactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa 26296365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 679 - 890
Target Start/End: Original strand, 42989243 - 42989454
Alignment:
Q  679 gagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctag 778  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| ||||| || |||||| | | ||||||||   |      
T  42989243 gagacgataaagtttgcattagagtagttgagacggacacgaagataactcgattgcatctgttcacatcatcatagtgaatgacatcgagtaatattcc 42989342  T
Q  779 tgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgta 878  Q
    || || ||| | ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||   ||||  |||||||||  ||  ||||||||| || |    
T  42989343 tgcctaccccttcaaagttgtcatatttgtctgctgctatttcgcttgagccggaataaattagtcacggaagtctctaaaccaacacgcaaaagatgaa 42989442  T
Q  879 atatgattacga 890  Q
    ||||| ||||||    
T  42989443 atatggttacga 42989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 522
Target Start/End: Original strand, 3308174 - 3308234
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa 522  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  3308174 caaagttaactattatcattaatcgatcaatgttcaatacaagaaggagaaaaataaaaaa 3308234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 458 - 958
Target Start/End: Original strand, 15605819 - 15606319
Alignment:
Q  458 aaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 557  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15605819 aaagcaaaattaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataataaatatggtgactagcccaagaataagccgccctagct 15605918  T
Q  558 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 657  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15605919 aaagcatgagcaaccatgttcgcttgtctgctaacaaaattcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagt 15606018  T
Q  658 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 757  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15606019 gttctgaatcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatttgttcccatcaacaaagtg 15606118  T
Q  758 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 857  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |||| ||  ||| | |||||||||    
T  15606119 aatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatgttttcccgctgccattttgtttgagcccgaataagttgcccatgggagtctcta 15606218  T
Q  858 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgt 957  Q
    |||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  15606219 acacaacacgaaaaagatgtaatatggttacgatcgtgaaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgtgcggtttctcccaaactgagttgt 15606318  T
Q  958 t 958  Q
    |    
T  15606319 t 15606319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 479 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 14680503 - 14680003
Alignment:
Q  479 attaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttc 578  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  14680503 attaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgaaaataaaaaatacggtgactagcctgagaacaggccgccctagttaaagtatgagcaaccatgttc 14680404  T
Q  579 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgacctt 678  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||      
T  14680403 gcatgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattttgaatcaccactgcccg 14680304  T
Q  679 gagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctag 778  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  14680303 gagatgatagagcttgcaatagagtagacgagtcggaatcaaagacaactcggttccatctgtttgcatcagcagagtgaagggcctcgagtaaggctac 14680204  T
Q  779 tgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaatt---ttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagtt 875  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||   |||||||     || || ||||||||||||||  | ||||||| |    
T  14680203 tgcctccccctccaatactgtcatattttcccgctgccatttcatttgagccataataaattgcccgccgcgggagtctctaacacaacatgcaaaagat 14680104  T
Q  876 gtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtattat 975  Q
    ||||| || || || ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  14680103 gtaatgtggttgcggtcatggaacgcggtatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattat 14680004  T
Q  976 g 976  Q
    |    
T  14680003 g 14680003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 535 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 28107424 - 28106986
Alignment:
Q  535 cccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaat 634  Q
    |||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28107424 cccaagaacaagttgccctagctaaagtatgagcaaccatgtttggttgtctcctaacaaactacagctcgaagttggaatgtaaagataactaataaat 28107325  T
Q  635 aatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcc 734  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||  | |||    
T  28107324 aatactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaagacaacgtgatcc 28107225  T
Q  735 catctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccgga 834  Q
    |||||||||  ||   ||||||||| ||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| | |    
T  28107224 catctattcatatttgcaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatctgtccgctgccatttcgtttgagcctgaa 28107125  T
Q  835 taaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgct 934  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||  || | |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||| |    
T  28107124 taaattgtccacgggagtctctaacacaacacacgaaagatgtaagatggttacgatcatggaacgtggcttcctcgttgcacttcaaccacgtctcgtt 28107025  T
Q  935 cggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtatt 973  Q
     ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  28107024 tggtttctcccaaactgagatgttaccttgcactctatt 28106986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 459 - 840
Target Start/End: Original strand, 11731495 - 11731873
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 558  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11731495 aagcaaagctaactattatcattaatcaacgaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatatggtgactagcccaagagcaggctgccctagcta 11731594  T
Q  559 agctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 658  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11731595 aagtatgagcaaccatgttcgcttgcctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaatattactagaaacagtagcatagaa 11731694  T
Q  659 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 758  Q
     || ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| |||  | ||| || | ||| ||||| ||||||||    
T  11731695 ctccgaaccaccatggcccggagacaatagagcttgcactatattgaaagagtcggactcgaagacaacctgttcctatatgttctcatcagcaaagtga 11731794  T
Q  759 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaatt 840  Q
    || | ||||||  |||||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11731795 agagtctcgag--aggctgctgcctcccc-tccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccggataaatt 11731873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 489 - 710
Target Start/End: Original strand, 34104321 - 34104542
Alignment:
Q  489 cagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcc 588  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34104321 cagtgttcaatacgagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccatagctaagctatgagcaaccatgtttgcttgtctcc 34104420  T
Q  589 taacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatag 688  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  34104421 taacaaacttcacctcgaagttcgaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggtccggagacgatag 34104520  T
Q  689 agcttgcactagagtagatgag 710  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  34104521 cgcttgcactagagtagctgag 34104542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 493 - 873
Target Start/End: Original strand, 29367915 - 29368294
Alignment:
Q  493 gttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc-tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaa 591  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||||  |||  ||||  ||||||| | ||||||| ||||   |||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  29367915 gttcaatacaagaacgataagtataaaaaatagtgtggttagcgtaagaacatgtcgccctaactaaaagtatgaataactatgttcgcttgtttcctaa 29368014  T
Q  592 caaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagc 691  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  29368015 caaactttaccttgaagttggaaggtaaagataactgataactaatactagaagcaatagcatagaattacgaatcactatgacccggagacgatagagc 29368114  T
Q  692 ttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttcc 791  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  29368115 ttgcactatagtagatgagtcggactcgaaaacagttaggtcccatctattagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggatattgcctccccctcc 29368214  T
Q  792 aaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaag 873  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||  |||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  29368215 aaaactgtcatatttatccgctgccatttcttttgag--cgaataaattgtccacgagagtctcaaacacaacacgcaaaag 29368294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 457 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 27443285 - 27443029
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27443285 caaagcaaagttaactattatcattaatcaa-----------tagaagaaggatatgaatcaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagc 27443197  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt---tggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagca 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27443196 taagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaaacttcacctcaaagttggtggaatgtaaagataactgaaatataatactagaaacaatagca 27443097  T
Q  654 tagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaag 722  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  27443096 taaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc-tgcactagagtagctgagtccaactcgaag 27443029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 518 - 807
Target Start/End: Original strand, 19690764 - 19691053
Alignment:
Q  518 aaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 617  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  19690764 aaaaatacagtgactagcccaagaacaggtcgcccttgcaaaaacatgagcaatcatgttcgcttgtttcctaacaaacttcacctcaaagtttaaatgt 19690863  T
Q  618 aaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggact 717  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  19690864 aaagataactgataaataatactagaaacaatgacatagaattccaaatcaccatgactcagagacgatagagcttgcactaaagtagctgagtcagact 19690963  T
Q  718 cgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttg 807  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | | |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19690964 cgaagacaactcggtcacatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaggctattgcctccccttccaaaacggtcatatttg 19691053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 502 - 888
Target Start/End: Original strand, 15053044 - 15053430
Alignment:
Q  502 aagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcac 601  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15053044 aagaaggataagaattaaaaatacggtgattaacctaggaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgtttgcttgtcttctaacaaacttcac 15053143  T
Q  602 ctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactaga 701  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||| | ||||||||||    
T  15053144 ctcgaaattggaatgtaaatataattgataaataatattataagcaacagcatagaattccgaatcaccatggcccgaagacgatagcgtttgcactaga 15053243  T
Q  702 gtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtca 801  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||   ||| ||| | ||| | ||| ||| | ||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||    
T  15053244 gtagctgagtcggactcgaagacaaccttgtctcattttttcacgtcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatca 15053343  T
Q  802 tatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattac 888  Q
    ||||| || |||| ||| | | ||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15053344 tatttacccgctgtcatcttgtttgagcccgaataaattgtccactgaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttac 15053430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 467 - 673
Target Start/End: Original strand, 21944462 - 21944668
Alignment:
Q  467 ttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatga 566  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  || || ||| ||||  |||||    
T  21944462 ttaacaattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcacaagaacctgctgctctaactaaagtatga 21944561  T
Q  567 gcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 666  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21944562 gcaacaatgatcgcttgtcttttaacaaacttcacatcgaagttggaatataaaaataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 21944661  T
Q  667 caccatg 673  Q
     ||||||    
T  21944662 taccatg 21944668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 616 - 840
Target Start/End: Original strand, 30801974 - 30802198
Alignment:
Q  616 gtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcgga 715  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| |   || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  30801974 gtaaagttatctgataaataatactagaaacaataacatagaattccaagtcaccatggctcggaaacgatagagcttgcactaaagtagctgaatcgga 30802073  T
Q  716 ctcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgc 815  Q
    |||||||| |||   ||||||| | ||| ||||  |||||| || ||| || |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  30802074 ctcgaagacaacctagtcccattttttcacatctgcaaagtaaatggcatctagtaaggctactgcctcccccaccaaaactgtcatatttgcccgctgc 30802173  T
Q  816 catttcgattgagcccggataaatt 840  Q
    ||||| | || |||||| |||||||    
T  30802174 cattttgtttaagcccgaataaatt 30802198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 3100494 - 3100415
Alignment:
Q  572 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt-aaagataactgaaaaataatactagaaacaata 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3100494 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagttggaatgtaaaagataactgataaataatactataaacaata 3100415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 463 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3101336 - 3101261
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaa 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3101336 aaagttaactattatcattaatcaacaa-tgttcaatacaacaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaa 3101261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 522
Target Start/End: Original strand, 19690332 - 19690392
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaa 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  19690332 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaa 19690392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 516 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 5542671 - 5542541
Alignment:
Q  516 tcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaat 615  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  || |||| |||||    
T  5542671 tcaaaaacatggtgactagaccaagaatatgccgccctagcaagtgtatgagcaaccatgttcgcttgtcgcctagcaaactttatgtcaaagtcggaat 5542572  T
Q  616 gtaaagataactgaaaaataatactagaaac 646  Q
    || ||| ||||  | |||||||| |||||||    
T  5542571 gtgaagctaacatagaaataatattagaaac 5542541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 973
Target Start/End: Original strand, 11731920 - 11731989
Alignment:
Q  904 catccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtatt 973  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  11731920 catctacattgcacttccaccacgtctcgctcagtttctcccaagctgagttgttaccttgcactatatt 11731989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 534
Target Start/End: Original strand, 1992479 - 1992551
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactag 534  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || | |  ||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  1992479 caaagttaactattataattaatcaaccaatattaaatctaagaaggataagaataaaaaatatgatgactag 1992551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 968
Target Start/End: Original strand, 19364217 - 19364280
Alignment:
Q  904 catccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcact 968  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19364217 catccacaatgcactttaaccac-tctcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcact 19364280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 457 - 982
Target Start/End: Original strand, 477880 - 478405
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  477880 caaaacaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgattagcccaagaacaggacgccctagc 477979  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||     
T  477980 taaggtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatattagaaacaatatcataa 478079  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 756  Q
    ||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  478080 aataccgaatcaccataacccggagacgatagagcttgcactagagtagtagagtcagattcgaagataacccggtcccatctattcacattagcaaagt 478179  T
Q  757 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 856  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||  ||| |  | |||||    
T  478180 gaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccattttgtttgagcccggataaattgaccatggaaatctct 478279  T
Q  857 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 956  Q
    ||||||  || |||||| ||| | ||| ||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | || ||    
T  478280 aacacaacacacaaaagatgttagatggttgtggtcatggaacgttgcatccacattacacttcaaccacatctcgcttggtttctcccaaattgagatg 478379  T
Q  957 ttgccttgcactgtattatgtctgtg 982  Q
    || ||||| ||| |||| || |||||    
T  478380 ttaccttggactctattttgcctgtg 478405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 462 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 13415381 - 13414913
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  13415381 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaag 13415282  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13415281 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctagcaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactaaaaacaatagcataaaattc 13415182  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
     ||||||||||| ||  | ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||  ||||  |||||    
T  13415181 agaatcaccatggcccggggacgatataccttgcactagagtagaagaatcggactcaaagacaactcgatcccatctgtttgcatccgcaaaaggaagg 13415082  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| |     
T  13415081 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgaaagtctctaaaaa 13414982  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtct 930  Q
    |  || |||||||||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13414981 aacacacaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacacgacatccacattgcacttcaaccacgtct 13414913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 462 - 968
Target Start/End: Original strand, 40588559 - 40589050
Alignment:
Q  462 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40588559 caaagttaactattatcattaatcaactaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaag 40588658  T
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40588659 tatgtgcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatagcatagaattc 40588758  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
     |||||| |||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||  ||||  |||||    
T  40588759 agaatcatcatggcccggggacgatagagtttacactagagtagatgaatcagactcaaagacaacccggtctcatctgtttgcatccgcaaaacgaagg 40588858  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||          | ||   ||      
T  40588859 gcctcgagtacggctactgcctccccctccaaaactgttatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaatt----------gcctgctac-- 40588946  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 961  Q
       | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40588947 ---aagcaaaagttgttatatggttacgttcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcactcggtttctcccaaactgagttgttacc 40589043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 552 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 23854200 - 23853802
Alignment:
Q  552 ctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatag 651  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  23854200 ctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaagttcaccttgaagttggaatgtaaagataacggataactaatactagaaacaatag 23854101  T
Q  652 catagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaac 751  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  23854100 catagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagttgatgagtcggactcgaagacaactcagtctcatctgttagcatcaac 23854001  T
Q  752 aaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagag 851  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||    
T  23854000 aaagtgaatggcctcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatttttccgctgtcatttcgtttgaacccgaataaattgcccacgggag 23853901  T
Q  852 tctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 950  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23853900 tctctaacataacacgcaaaagatgtaatatagttacggtcatggaacgcggcgtccacatcgcacttcaaccacgtctcgttcggtttctcccaaact 23853802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 499 - 948
Target Start/End: Original strand, 8450989 - 8451438
Alignment:
Q  499 tacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaactt 598  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8450989 tacaagaaggataaggataaaaaatacggtgactagcctaagacagggccgccctaactagagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcntaacaaactt 8451088  T
Q  599 cacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcact 698  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8451089 cacctcgaagtttgaatgtaaagataactgatanataatactagacacaataacataaaattccgaatcaccatgacctggagacgataaagcttgcact 8451188  T
Q  699 agagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactg 798  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| |||| || |||||| ||||| ||||    
T  8451189 aaagtagatgagtcagactcgaagacaacccggtcccatccgttcacatcagcgaagtgaatggaatcgagtaaagctactgcctccccctccaacactg 8451288  T
Q  799 tcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaa 898  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  8451289 tcatatttgcccgcttcctttttgtttgagcccgaataaattgtccacaagagtctctaacacaacatccaaaagatgtaaaatggttacggtcatggaa 8451388  T
Q  899 cgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaa 948  Q
    ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8451389 cgcggcatccacattacacttcaaccacgtctcgcacggtttctcccaaa 8451438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 507 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 7127536 - 7127078
Alignment:
Q  507 ggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcga 606  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7127536 ggataagaattaaaaatgcggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcaa 7127437  T
Q  607 agttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtaga 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||     
T  7127436 agttggaatgtaaagataactgataaataatacttgaaacaataacatagaatactaaatcaccatggcccggagacgaaagagcttgcactaaagtagc 7127337  T
Q  707 tgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatattt 806  Q
      |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  7127336 atagtcagactcgaaggcaacccggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactacctccccctccaaaactttcatattt 7127237  T
Q  807 gcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcat 906  Q
    ||| | | |||||||  ||| || || |||||||| || |||||||||||||||||  | ||| | | ||||| | | ||||| ||||||||||  ||||    
T  7127236 gcccgtttccatttcatttgtgcacgaataaatttcccccgagagtctctaacacaacatgcagaggatgtaagacggttacgttcatggaacgcggcat 7127137  T
Q  907 ccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgc 965  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7127136 ccacattccacttcaaccatgtctcgctcggcttctcccaaactaagttgttaccttgc 7127078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 475 - 862
Target Start/End: Original strand, 185435 - 185818
Alignment:
Q  475 tatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccat 574  Q
    |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||    
T  185435 tatcattaattaaccaatgtgcaatacaagaaggataagaattaaaaatgcggtgactatcc-aagatcaggtcgccctagctaaactatgaccaactat 185533  T
Q  575 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  185534 gttcgcttgtctcctaacaaactacacctcgaatgtg-aatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgg 185632  T
Q  675 ccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaagg 774  Q
     |  ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  185633 tccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgtagacaacccggttccatctattcacatcaacaaagtgaatagtatcgagtaagg 185732  T
Q  775 ctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacaca 862  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||    
T  185733 ctacttcctcccc-tccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgagcccagataaatttccctcg-gagtctcttacaca 185818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 457 - 733
Target Start/End: Original strand, 598061 - 598337
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  598061 caaagcaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcctaagaacagaccgccttagc 598160  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 656  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  598161 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaatttcaccacgaagttgaaatgtaaagataactaataaataatactagaaacaatagcatag 598260  T
Q  657 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtc 733  Q
    || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||| |||||    
T  598261 aacttcgaatcaccatgacctgaagacgatagagcttgcactagagtagctaagtccgacttgaagacaacccggtc 598337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 463 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 11870621 - 11870364
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  11870621 aaagttaactattattattaaccaacaaatgttcaatacaagtaggataagaataaaaaatatggtgattagcccaagaacaggttgccctagctaaagt 11870522  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11870521 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaaatcc 11870422  T
Q  663 gaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcga 720  Q
    ||||||||||| |   ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  11870421 gaatcaccatggctccgagacaatagagcttgcacaagagtagctgagtcagactcga 11870364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 479 - 723
Target Start/End: Original strand, 33642610 - 33642854
Alignment:
Q  479 attaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttc 578  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  33642610 attaatcaactaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccaccctagctaaagtatgaacaaccatgttc 33642709  T
Q  579 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgacctt 678  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||      
T  33642710 gcttgtctcctaacaaacttcgccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatatcattgaattctgaatcaccatggcccg 33642809  T
Q  679 gagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 723  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  33642810 gagacgacagagcttgcattagagtagatgagttggacttgaaga 33642854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 503 - 768
Target Start/End: Original strand, 3606607 - 3606874
Alignment:
Q  503 agaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggc--cgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttca 600  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3606607 agaatgataagaattaaaaatacggtgactagcctaagaacaggcgtcaccctagctaaagtatgaacaaccatattcgcttgtctcctaacaaacttca 3606706  T
Q  601 cctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactag 700  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||     
T  3606707 cctcgaagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattccaagtcaccatgaccctgagacgatagagtttgtactaa 3606806  T
Q  701 agtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcga 768  Q
    ||| | ||||||||||| ||| | |||| ||| |||||| ||| |||||| ||| |||| ||| ||||    
T  3606807 agttgttgagtcggacttgaaaacaacttggttccatctgttcacatcaagaaattgaatggcatcga 3606874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 457 - 638
Target Start/End: Original strand, 36194445 - 36194626
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||    
T  36194445 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaattaaaaatacggtgactagctcaagaacatgtcaccctagc 36194544  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataata 638  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||  || ||||||||    
T  36194545 taaactatgagcaaccatgttttcttgtctcctaacaaacttcatctcgaaattgaaatataaagataatcgataaataata 36194626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 457 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 9497140 - 9496797
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaag-gataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctag 555  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||  || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9497140 caaagcaaaattaattattatcattaatcaatcaatgttca--accagaaaagataagaataaaaaatacggtgactagtccaagaacaggccgccctag 9497043  T
Q  556 ctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcata 655  Q
    ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||| || || || |||||||  ||| ||||||| ||||    
T  9497042 ctaaagtataagcaactatgttcgcttgtctcctaataaacttcactctgaagttgggatgtaaatatcacagataaataatgttagcaacaataacata 9496943  T
Q  656 gaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaag 755  Q
    ||||||  | ||||||||||    ||||||||||| ||||||||   | | ||| | |||||| |||| ||| |||||||||   ||| |||||||||||    
T  9496942 gaattccaagtcaccatgactcgaagacgatagagattgcacta---tggctgaattggactcaaagacaacacggtcccat-agttcacatcaacaaag 9496847  T
Q  756 tgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatt 805  Q
    |||| | | || |||||||||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  9496846 tgaatgtcatcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatt 9496797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 562 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 37712331 - 37711990
Alignment:
Q  562 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 661  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37712331 tatgagcaaccatgtttgcatgtctcttaacagacttcacatcgaagttagaatgtaaagataactcataaataatactagaaacaatagcatagtattc 37712232  T
Q  662 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 761  Q
    |||||||||||| ||   |||| ||||||||| |||||||||||  | |||  ||| |||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  37712231 tgaatcaccatgtcc-gaagacaatagagcttacactagagtagcagggtcaaactagaagataacctgatctcatctgttcacatcaacaaagtgaatg 37712133  T
Q  762 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 861  Q
    ||    | ||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||| |  |||||||  ||||  |||| ||||||||    
T  37712132 gc----attaaagctactacctcccctt-caaaactgtcatattttcccgctgtcatttcgttttagctcaaataaattgcccacacgagtttctaacac 37712038  T
Q  862 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatcca 909  Q
    |  ||||||||  ||||| || |||||  |||||| ||| | ||||||    
T  37712037 aacacgcaaaaaatgtaagataattacagtcatggtacgcaacatcca 37711990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 463 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 28315463 - 28315316
Alignment:
Q  463 aaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagct 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |    
T  28315463 aaagttaactattatcattaatcaattaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaa-acggcgactagcccaggaacagaccgccctagctaaaat 28315365  T
Q  563 atgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttg 611  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28315364 atgagcaaccatgtttgcttatctgctaacaaacttcgcctcgaagttg 28315316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 516 - 620
Target Start/End: Original strand, 8670197 - 8670301
Alignment:
Q  516 tcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc-tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 614  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  8670197 tcaaagatacggtgactagtccaagaacaggccgccctag-taagagtgtgagcaaccatgtttgtttgtcgcctaacaaactttacctcaaagttggga 8670295  T
Q  615 tgtaaa 620  Q
    ||||||    
T  8670296 tgtaaa 8670301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 32555138 - 32555081
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataaga 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  32555138 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaataaaagaaggataaga 32555081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 559
Target Start/End: Original strand, 34707886 - 34707971
Alignment:
Q  474 ttatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaa 559  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  | ||||| ||||||| ||||||||    
T  34707886 ttatcattaatcaatcaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatacgatgactaatctaagaataggccgctctagctaa 34707971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 526 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4275999 - 4275914
Alignment:
Q  526 ggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttg 611  Q
    ||||||||||| |||||| || | ||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  4275999 ggtgactagcctaagaaccggtcaccctaactaaattatgagcaaccatactcgcttgtcgcctaataaacttcacctcaaagttg 4275914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 597 - 659
Target Start/End: Original strand, 14264970 - 14265032
Alignment:
Q  597 ttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaat 659  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  14264970 ttcacctcgaagttggaacgtatagctaactgatcaataatacaagaaacaataacatggaat 14265032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 670 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 42899204 - 42899152
Alignment:
Q  670 catgaccttgagacgatagagcttgcact--agagtagatgagtcggactcgaa 721  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  42899204 catgaccttgagacgatagag-ttgcattggagagtagatgagtcggactcgaa 42899152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 227; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 472 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 538 - 48
Alignment:
Q  472 tattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaac 571  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  538 tattatcattaatcaatcagtgtttaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactagcccaaatataggccgccctagctaagctatgagcaac 439  T
Q  572 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc----tgaatc 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    | ||||    
T  438 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatc 339  T
Q  668 accatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcg 767  Q
    ||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||    
T  338 accatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcg 239  T
Q  768 agtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacg 867  Q
    |||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||| |||  |||    
T  238 agtaaggcaactgcctccccctcccaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaaaacaacacg 139  T
Q  868 caaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 958  Q
    | |||| |   ||||| | ||| ||||| |||    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||    
T  138 cgaaagatngtatatgttgacggtcatgaaacacgacatccacattgcacttcaaccacgtctcacacagtttctcccaaactgagttgtt 48  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 163; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 518 - 804
Target Start/End: Original strand, 149 - 434
Alignment:
Q  518 aaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  149 aaaaatacggtgactagcccaagaacaagtcgtcctagttaaagtatgagcaaccgtgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttggaatgt 248  T
Q  618 aaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggact 717  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  249 aaggataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaattaccatgacctggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggact 348  T
Q  718 cgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatat 804  Q
    |||| |||| | | |||||| | || |||||| |||| | ||||||||| |  ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  349 cgaaaataattggatcccatttgtttgcatcagcaaaataaagggcctccaacaaggctactacctcccc-tccaaaactgtcatat 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 457 - 722
Target Start/End: Original strand, 44076 - 44332
Alignment:
Q  457 caaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44076 caaagcaaagttaactattatcattaatcaa-----------tagaagaaggatatgaatcaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagc 44164  T
Q  557 taagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt---tggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagca 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44165 taagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaaacttcacctcaaagttggtggaatgtaaagataactgaaatataatactagaaacaatagca 44264  T
Q  654 tagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaag 722  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  44265 taaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc-tgcactagagtagctgagtccaactcgaag 44332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 499 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20479 - 20330
Alignment:
Q  499 tacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaactt 598  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20479 tacaagaatgataagaataaaaaatacgatgactagcccaagaacaggttgccctagctaaagtatgagtaatcatattcgcttgtctcctaacaaactt 20380  T
Q  599 cacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaa 648  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20379 cacctcaaagttgacatgtaaagataactgataaataatactagaaacaa 20330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0252 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0252
Description:

Target: scaffold0252; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 524 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 13415 - 13321
Alignment:
Q  524 acggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  13415 acggtgactagcccaagaacaggccgccctagc-aagag-tgagcagccatgttcgcttgtcgtctaacaaactttacctcaaagttgggatgtaaa 13321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 524
Target Start/End: Original strand, 26127 - 26192
Alignment:
Q  459 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcattacaagaaggataagaatcaaaaata 524  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26127 aagcaaagttaaccattatcattaatcgaacaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaata 26192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University