View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14915_low_18 (Length: 382)

Name: NF14915_low_18
Description: NF14915
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14915_low_18
NF14915_low_18
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (10-262)||(25175563-25175815)
chr6 (10-262)||(27653983-27654235)
chr6 (10-262)||(16825752-16826006)
chr6 (21-348)||(23153458-23153786)
chr6 (14-347)||(14626045-14626377)
chr6 (14-349)||(1650020-1650352)
chr6 (21-274)||(1657748-1657999)
chr6 (10-274)||(35009439-35009702)
chr6 (21-274)||(15862484-15862734)
chr6 (279-348)||(23148266-23148335)
chr6 (316-381)||(19983159-19983224)
chr6 (316-381)||(35015024-35015089)
chr6 (78-274)||(29665941-29666137)
chr6 (316-381)||(18583640-18583705)
chr6 (189-274)||(27751603-27751688)
chr6 (174-258)||(29605612-29605696)
chr6 (316-348)||(18002395-18002427)
chr6 (316-348)||(23995247-23995279)
chr6 (316-348)||(26090059-26090091)
chr6 (316-347)||(4991396-4991427)
chr6 (176-258)||(18629608-18629691)
chr6 (318-348)||(15742120-15742150)
chr6 (174-252)||(17083204-17083282)
chr6 (332-382)||(21623506-21623556)
chr6 (316-348)||(1657661-1657693)
chr6 (316-348)||(15862789-15862821)
chr6 (316-348)||(18823283-18823315)
chr6 (316-348)||(18839138-18839170)
chr6 (316-348)||(27751742-27751774)
chr6 (316-348)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (10-262)||(25426628-25426880)
chr5 (10-262)||(12374-12626)
chr5 (10-262)||(19499899-19500151)
chr5 (10-262)||(22366481-22366733)
chr5 (10-259)||(18777995-18778244)
chr5 (10-262)||(21073595-21073847)
chr5 (10-348)||(23506965-23507302)
chr5 (10-259)||(43443398-43443647)
chr5 (10-262)||(4199985-4200237)
chr5 (10-348)||(27182471-27182810)
chr5 (10-258)||(27009841-27010089)
chr5 (10-348)||(22053753-22054096)
chr5 (10-348)||(18530988-18531330)
chr5 (62-262)||(29188284-29188483)
chr5 (21-274)||(34939289-34939540)
chr5 (127-274)||(20623085-20623232)
chr5 (127-274)||(21233528-21233675)
chr5 (128-272)||(25900408-25900552)
chr5 (127-274)||(16536313-16536460)
chr5 (127-274)||(37052860-37053007)
chr5 (317-381)||(11584374-11584438)
chr5 (178-267)||(32950862-32950951)
chr5 (316-348)||(16105967-16105999)
chr5 (316-348)||(20623286-20623318)
chr5 (316-348)||(21233442-21233474)
chr5 (316-348)||(25900320-25900352)
chr5 (14-54)||(29190482-29190522)
chr5 (316-348)||(37053061-37053093)
chr5 (176-258)||(21310709-21310792)
chr5 (10-51)||(17471803-17471844)
chr5 (316-348)||(108728-108760)
chr5 (316-348)||(9730278-9730310)
chr5 (316-348)||(16536514-16536546)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (10-262)||(19886661-19886913)
chr2 (15-348)||(462743-463075)
chr2 (10-381)||(20627205-20627576)
chr2 (10-381)||(19794596-19794967)
chr2 (10-381)||(43642848-43643220)
chr2 (10-348)||(8891242-8891581)
chr2 (10-348)||(36982364-36982704)
chr2 (10-274)||(17396653-17396916)
chr2 (10-348)||(24341309-24341652)
chr2 (10-274)||(25265390-25265653)
chr2 (10-224)||(7507894-7508107)
chr2 (254-348)||(22863171-22863267)
chr2 (127-274)||(19689401-19689548)
chr2 (127-274)||(23820187-23820334)
chr2 (127-274)||(14906440-14906587)
chr2 (316-381)||(22275045-22275110)
chr2 (316-381)||(22284278-22284343)
chr2 (127-274)||(20015127-20015274)
chr2 (317-381)||(15633538-15633602)
chr2 (176-258)||(24884850-24884933)
chr2 (316-349)||(19689314-19689347)
chr2 (316-348)||(9652796-9652828)
chr2 (316-348)||(14906354-14906386)
chr2 (316-348)||(23820388-23820420)
chr2 (177-251)||(19669116-19669191)
chr2 (316-347)||(25213372-25213403)
chr2 (332-382)||(43646232-43646282)
chr2 (316-348)||(7507757-7507789)
chr2 (316-348)||(17396567-17396599)
chr2 (316-348)||(20015328-20015360)
chr2 (316-348)||(28031134-28031166)
chr2 (282-348)||(31146073-31146138)
chr2 (316-348)||(33128372-33128404)
chr2 (178-257)||(43646059-43646139)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (10-382)||(41394222-41394593)
chr1 (10-348)||(20931345-20931682)
chr1 (10-262)||(5072388-5072640)
chr1 (10-262)||(18601118-18601370)
chr1 (10-348)||(20913037-20913367)
chr1 (10-348)||(20893551-20893889)
chr1 (10-348)||(37844374-37844714)
chr1 (10-348)||(20445679-20446019)
chr1 (10-348)||(20531444-20531783)
chr1 (10-347)||(22227809-22228146)
chr1 (10-347)||(22232506-22232843)
chr1 (14-262)||(2116258-2116506)
chr1 (76-349)||(45051489-45051759)
chr1 (127-274)||(51452608-51452755)
chr1 (316-381)||(21860334-21860399)
chr1 (316-381)||(44034838-44034903)
chr1 (282-382)||(27675086-27675184)
chr1 (316-381)||(41218728-41218793)
chr1 (316-347)||(15861327-15861358)
chr1 (14-54)||(45051446-45051486)
chr1 (316-348)||(51452809-51452841)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (10-262)||(47357654-47357906)
chr4 (10-381)||(54118135-54118507)
chr4 (10-348)||(13246430-13246769)
chr4 (10-258)||(10644219-10644467)
chr4 (110-348)||(121989-122226)
chr4 (18-274)||(13048221-13048477)
chr4 (10-348)||(15675009-15675352)
chr4 (78-348)||(10104170-10104445)
chr4 (10-234)||(31115629-31115852)
chr4 (10-274)||(26680201-26680463)
chr4 (127-274)||(10488678-10488825)
chr4 (127-274)||(16327926-16328073)
chr4 (211-348)||(33240900-33241043)
chr4 (10-107)||(111395-111492)
chr4 (316-381)||(25119074-25119139)
chr4 (316-381)||(5682395-5682460)
chr4 (242-348)||(31132545-31132657)
chr4 (78-234)||(40885594-40885749)
chr4 (10-54)||(10104450-10104494)
chr4 (316-348)||(14952085-14952117)
chr4 (316-348)||(15135907-15135939)
chr4 (316-348)||(15272211-15272243)
chr4 (316-348)||(16327840-16327872)
chr4 (316-348)||(16609013-16609045)
chr4 (316-348)||(26680517-26680549)
chr4 (316-382)||(41165815-41165881)
chr4 (316-348)||(8045272-8045304)
chr4 (316-348)||(16523146-16523178)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (12-348)||(3508-3843)
scaffold0266 (10-348)||(1124-1462)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (10-348)||(14842487-14842824)
chr3 (10-262)||(55316219-55316471)
chr3 (10-262)||(41270075-41270327)
chr3 (10-348)||(2049810-2050147)
chr3 (10-348)||(12030073-12030410)
chr3 (21-348)||(13838905-13839232)
chr3 (10-382)||(16744007-16744377)
chr3 (10-237)||(16821139-16821366)
chr3 (10-274)||(13975722-13975985)
chr3 (10-311)||(15858986-15859287)
chr3 (10-274)||(45860805-45861068)
chr3 (9-284)||(51158008-51158282)
chr3 (10-274)||(13954890-13955153)
chr3 (10-267)||(15936634-15936890)
chr3 (13-267)||(15938476-15938729)
chr3 (14-349)||(15614838-15615170)
chr3 (211-381)||(19231981-19232154)
chr3 (10-274)||(17912483-17912744)
chr3 (228-348)||(19260749-19260869)
chr3 (127-274)||(2449238-2449385)
chr3 (316-381)||(3992873-3992938)
chr3 (313-382)||(15857129-15857198)
chr3 (316-381)||(55513193-55513258)
chr3 (316-381)||(2844514-2844579)
chr3 (316-371)||(17955861-17955916)
chr3 (316-381)||(54037991-54038056)
chr3 (316-377)||(45581954-45582016)
chr3 (316-381)||(7854305-7854370)
chr3 (10-123)||(47984650-47984763)
chr3 (10-123)||(47993937-47994050)
chr3 (10-123)||(48003224-48003337)
chr3 (10-123)||(48012510-48012623)
chr3 (178-267)||(11986173-11986262)
chr3 (10-51)||(15468555-15468596)
chr3 (316-348)||(2449152-2449184)
chr3 (316-348)||(16261777-16261809)
chr3 (316-348)||(16933869-16933901)
chr3 (316-348)||(17912398-17912430)
chr3 (316-348)||(23492696-23492728)
chr3 (316-348)||(38168237-38168269)
chr3 (316-348)||(53771365-53771397)
chr3 (332-382)||(17205019-17205069)
chr3 (316-382)||(38810875-38810941)
chr3 (174-258)||(6228625-6228710)
chr3 (317-382)||(15550922-15550987)
chr3 (10-51)||(22275209-22275250)
chr3 (316-348)||(11986080-11986112)
chr3 (334-382)||(12031849-12031897)
chr3 (316-348)||(13954804-13954836)
chr3 (316-348)||(14285289-14285321)
chr3 (316-348)||(19947026-19947058)
chr3 (316-348)||(30153265-30153297)
chr3 (316-348)||(33342204-33342236)
chr3 (316-348)||(45861122-45861154)
chr3 (316-348)||(51961031-51961063)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (10-262)||(10989410-10989661)
chr7 (10-381)||(3059966-3060336)
chr7 (10-263)||(2437457-2437710)
chr7 (12-348)||(16211768-16212103)
chr7 (10-348)||(13036938-13037277)
chr7 (10-262)||(13911024-13911277)
chr7 (10-348)||(36052667-36053003)
chr7 (10-258)||(13572676-13572924)
chr7 (15-348)||(11580661-11580997)
chr7 (16-274)||(25292338-25292595)
chr7 (10-267)||(18253842-18254098)
chr7 (10-274)||(47481031-47481294)
chr7 (10-237)||(16478987-16479213)
chr7 (10-274)||(7293017-7293279)
chr7 (10-273)||(13321014-13321278)
chr7 (127-274)||(11516343-11516490)
chr7 (127-274)||(15441564-15441711)
chr7 (127-274)||(30262129-30262276)
chr7 (316-381)||(32493913-32493978)
chr7 (316-377)||(126738-126799)
chr7 (316-381)||(1936884-1936949)
chr7 (153-346)||(295893-296087)
chr7 (316-381)||(111136-111201)
chr7 (282-382)||(13377819-13377917)
chr7 (317-381)||(7283923-7283987)
chr7 (316-348)||(2029244-2029276)
chr7 (316-348)||(7293333-7293365)
chr7 (316-348)||(11516544-11516576)
chr7 (316-348)||(14113903-14113935)
chr7 (316-348)||(15441478-15441510)
chr7 (279-348)||(15709428-15709501)
chr7 (316-348)||(30262043-30262075)
chr7 (316-348)||(42056188-42056220)
chr7 (176-258)||(16914928-16915011)
chr7 (176-258)||(48356808-48356891)
chr7 (332-382)||(13389693-13389743)
chr7 (316-348)||(371417-371449)
chr7 (316-348)||(3049905-3049937)
chr7 (316-348)||(13321334-13321366)
chr7 (316-344)||(15516765-15516793)
chr7 (316-348)||(25124450-25124482)
chr7 (316-348)||(47480944-47480976)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (10-348)||(48598-48935)
scaffold0023 (10-237)||(36093-36320)
scaffold0023 (316-348)||(61122-61154)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (9-348)||(16193643-16193980)
chr8 (10-262)||(30120722-30120974)
chr8 (10-200)||(222753-222943)
chr8 (10-200)||(736376-736566)
chr8 (10-200)||(860271-860461)
chr8 (10-348)||(43373392-43373731)
chr8 (10-262)||(16674392-16674644)
chr8 (10-258)||(21844576-21844824)
chr8 (10-258)||(21851969-21852217)
chr8 (21-348)||(24928716-24929043)
chr8 (10-381)||(16404867-16405235)
chr8 (14-262)||(6774258-6774505)
chr8 (14-262)||(24548986-24549233)
chr8 (21-274)||(17345581-17345832)
chr8 (10-274)||(22907214-22907476)
chr8 (127-274)||(5238203-5238350)
chr8 (127-274)||(24661248-24661395)
chr8 (127-274)||(43685662-43685809)
chr8 (138-200)||(691908-691970)
chr8 (316-381)||(274766-274831)
chr8 (316-381)||(641018-641083)
chr8 (316-381)||(826824-826889)
chr8 (316-381)||(24716729-24716794)
chr8 (316-381)||(39115598-39115663)
chr8 (217-258)||(23226076-23226117)
chr8 (316-348)||(5238404-5238436)
chr8 (316-348)||(22907128-22907160)
chr8 (316-348)||(24385652-24385684)
chr8 (316-348)||(24661162-24661194)
chr8 (316-348)||(43685863-43685895)
chr8 (176-258)||(15933462-15933545)
chr8 (176-258)||(26011658-26011741)
chr8 (217-258)||(22981479-22981520)
chr8 (316-348)||(2545265-2545297)
chr8 (316-348)||(3431176-3431208)
chr8 (316-348)||(22886654-22886686)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-348)||(5990-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-348)||(882-1218)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (10-348)||(12115-12450)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (10-348)||(8878-9215)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (10-237)||(42997-43224)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (21-348)||(171916-172242)
scaffold0001 (21-348)||(177619-177945)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-348)||(41733-42066)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (10-349)||(36836-37176)
scaffold0077 (317-381)||(15334-15398)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (21-348)||(247366-247694)
scaffold0012 (316-348)||(34075-34107)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (10-345)||(19206-19543)
scaffold0195 (10-274)||(21290-21553)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (10-348)||(26340-26678)
scaffold0162 (127-274)||(8180-8327)
scaffold0162 (332-382)||(6884-6934)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (10-348)||(128095-128431)
scaffold0008 (10-237)||(31700-31928)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-338)||(4996-5324)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (10-258)||(35-283)
scaffold0116 (316-381)||(30417-30482)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (10-348)||(123087-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (34-267)||(5552-5785)
scaffold0772 (316-348)||(5846-5878)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (16-348)||(272031-272362)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (10-258)||(64527-64780)
scaffold0026 (10-267)||(107747-108003)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (10-263)||(21115-21367)
scaffold0139 (10-237)||(14086-14312)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (10-267)||(48187-48443)
scaffold0049 (317-377)||(20493-20553)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (10-300)||(148721-149012)
scaffold0025 (10-348)||(8849-9192)
scaffold0025 (254-348)||(146844-146938)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (128-346)||(51110-51328)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-224)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (10-224)||(3722-3936)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (14-237)||(9374-9596)
scaffold0215 (14-237)||(16272-16494)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (128-348)||(89378-89600)
scaffold0028 (223-348)||(107708-107835)
scaffold0028 (316-347)||(130880-130911)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (116-262)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (10-274)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (10-274)||(34460-34724)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (10-274)||(41648-41911)
scaffold0125 (308-348)||(41957-41997)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (14-263)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (10-274)||(13506-13769)
scaffold0132 (316-381)||(42677-42739)
scaffold0132 (316-348)||(13824-13856)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (10-116)||(9-115)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (10-274)||(37066-37328)
scaffold0078 (316-381)||(41632-41697)
scaffold0078 (316-348)||(36980-37012)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-116)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (106-262)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (127-274)||(26911-27058)
scaffold0141 (127-267)||(22656-22796)
scaffold0141 (316-348)||(22857-22889)
scaffold0141 (316-348)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (127-274)||(1582-1729)
scaffold0124 (316-348)||(1496-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (10-107)||(9382-9479)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (316-381)||(80187-80252)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (315-381)||(162045-162111)
scaffold0016 (315-381)||(166131-166197)
scaffold0016 (316-382)||(116417-116483)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (316-381)||(5744-5809)
scaffold0686 (316-381)||(5950-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (316-381)||(31147-31212)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (181-274)||(3360-3453)
scaffold0361 (12-66)||(3210-3264)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (315-381)||(319-385)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (317-381)||(1701-1765)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (317-381)||(94-158)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (317-381)||(19817-19881)
scaffold0122 (317-377)||(24125-24185)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (178-267)||(56106-56195)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (317-381)||(6271-6335)
scaffold0310 (317-354)||(4-41)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (176-258)||(8174-8257)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (316-382)||(1370-1436)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (316-349)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (316-348)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (316-348)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (316-348)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (316-348)||(13285-13317)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (316-348)||(57392-57424)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (316-348)||(55904-55936)
scaffold0032 (316-348)||(108075-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (305-348)||(18015-18058)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (178-224)||(45198-45244)
scaffold0066 (316-348)||(45338-45370)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (332-382)||(35816-35866)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (217-258)||(1546-1587)
scaffold0456 (217-258)||(8691-8732)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (316-348)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (316-348)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (316-348)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (316-348)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (316-348)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (316-348)||(34308-34340)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (316-348)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  208 taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153786
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 318  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 23153756  T
Q  319 attatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23153757 attatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626045
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtga 14626079  T
Q  314 tgatgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
     ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626078 agatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650020
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 1650056  T
Q  313 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 349  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650055 a-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 1650020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  279 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983159
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 19983159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015024
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 35015024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 274
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  177 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583705
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 18583705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 274
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  189 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002395
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995279
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090091
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18629691 - 18629608
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  18629691 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 18629608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742120
Alignment:
Q  318 gattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17083282 - 17083204
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcac 252  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  17083282 tatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcac 17083204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 382
Target Start/End: Original strand, 21623506 - 21623556
Alignment:
Q  332 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  21623506 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 21623556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657661
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 1657661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862821
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823283
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18823283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839138
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18839138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751774
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 27751774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276659
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 32276659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777995
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507302
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |  | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaa 23507263  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507264 atggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443398
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4199985
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||| |||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182471
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 27182512  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27182511 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010089
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053753
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttca 22053798  T
Q  308 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053797 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18530988
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca 18531032  T
Q  308 aaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531031 aaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  62 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 161  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  162 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagc 261  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  228 aaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcc 272  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584438
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 11584438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16105999
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623318
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctta 20623318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233442
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctta 21233442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900320
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctta 25900320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053093
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21310792 - 21310709
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  21310792 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108728
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 108728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730278
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 9730278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536546
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatctta 16536546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463075
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  115 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  215 aattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 314  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 463041  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463042 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627205
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||||||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaa 308  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaa 20627278  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20627277 aatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 20627205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794596
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||| | ||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa-tttaca 19794670  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19794669 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 19794596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642848
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 43642922  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43642921 aaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 43642848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891581
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 8891540  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8891541 aaatgatgatgattatgataaagactaacccctttacctta 8891581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982364
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 306  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 36982406  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982405 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396653
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341309
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||  |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 24341354  T
Q  308 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341353 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- 7508009  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  209 aacatcaattcatgca 224  Q
    | ||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Original strand, 22863171 - 22863267
Alignment:
Q  254 aatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863171 aatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275110
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 22275110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284343
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttt 22284343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633602
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttt 15633602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 24884850 - 24884933
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattc-atgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || |||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24884850 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 24884933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689314
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 19689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652796
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906354
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14906354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820420
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19669191 - 19669116
Alignment:
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttagagca 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |  ||| || |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19669191 gaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagca 19669116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 382
Target Start/End: Original strand, 43646232 - 43646282
Alignment:
Q  332 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  43646232 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 43646282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507757
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 7507757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396567
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 17396567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015360
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttacctta 20015360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031134
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 28031134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146073
Alignment:
Q  282 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttacctta 31146073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128404
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 33128404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 257
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646139
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  43646059 aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt 43646139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394593
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 41394520  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41394521 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttta 41394593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931682
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20931643  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20931644 atgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601118
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||  |||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913367
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       |||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat 20913129  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20913328  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20913329 atgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893551
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||      
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttaca 20893592  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20893591 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844374
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttac 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcac 37844416  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844415 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20446019
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-ac 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | || |||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcac 20445977  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20445978 aaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531783
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || | || |||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 20531742  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20531743 aaatgatgatgattatgataaagactaatttccttacctta 20531783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228146
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||||||| |  || |||||| || ||  ||||||| |||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||    
T  22228008 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22228107  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    | ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22228108 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22228146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232843
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||||||| |  || |||||| || ||  ||||||| |||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||    
T  22232705 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22232804  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    | ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22232805 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22232843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116506
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||| |||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 349
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051759
Alignment:
Q  76 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 175  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat- 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||| ||| |||||  |||  | |||     
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  275 aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 349  Q
    || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 45051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860399
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 21860399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034838
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 44034838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 282 - 382
Target Start/End: Original strand, 27675086 - 27675184
Alignment:
Q  282 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  27675086 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--acgattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcacttt 27675183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 41218728 - 41218793
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  41218728 atgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 41218793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452841
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttacctta 51452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118135
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | || |||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 54118209  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54118208 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 54118135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246769
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13246728  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246729 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644467
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 348
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122226
Alignment:
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 122187  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  122188 atgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
Q  18 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  118 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 217  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  218 tcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675009
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 15675054  T
Q  308 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675053 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104170
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcca--ta 275  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  276 atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
       ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115852
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacata 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacata 31115852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 348
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241043
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 33240999  T
Q  309 a----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33241000 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119074
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 25119074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682395
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttt 5682395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
Q  242 agttagagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 335  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  336 cccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctta 31132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885594
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacata 40885594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952117
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135907
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272211
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609013
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680549
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26680549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41165881 - 41165815
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  41165881 atgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 41165815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045304
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 8045304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523178
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16523178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3508
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaat 3545  T
Q  312 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3544 gaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1462
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 308  Q
      |||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 1422  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1423 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842487
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     | |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 14842526  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842525 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050147
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaa 2050108  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050109 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030073
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaa 12030112  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12030111 atgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839232
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 319  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga 13839203  T
Q  320 ttatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13839204 ttatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744007
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
      ||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 16744080  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16744079 atgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttta 16744007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858986
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttaca 15858990  T
Q  308 aaat 311  Q
    ||||    
T  15858989 aaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861068
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954890
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
Q  13 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  | |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615170
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 15615134  T
Q  313 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 349  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615135 a-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 15615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 211 - 381
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232154
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-aca 307  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 19232080  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19232081 aaatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttt 19232154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 228 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  228 aaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 327  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  328 aagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992938
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 3992938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857129
Alignment:
Q  313 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcacttta 15857129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513258
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 55513258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844579
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttt 2844579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955861
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctcta 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcta 17955861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037991
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 54037991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 377
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 377  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854370
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 7854370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449152
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2449152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261809
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912398
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17912398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492728
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168269
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771397
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 382
Target Start/End: Original strand, 17205019 - 17205069
Alignment:
Q  332 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  17205019 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 17205069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38810941 - 38810875
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  38810941 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 38810875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6228710 - 6228625
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||||| || |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  6228710 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 382
Target Start/End: Original strand, 15550922 - 15550987
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  15550922 tgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 15550987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986080
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 11986080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 382
Target Start/End: Original strand, 12031849 - 12031897
Alignment:
Q  334 aacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  12031849 aacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 12031897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954804
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 13954804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285321
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 14285321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947058
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19947058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153297
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342236
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttacctta 33342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861154
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 45861154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961031
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060336
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  | || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa 3060264  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3060265 atgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttt 3060336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437710
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||| ||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212103
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaat 16212066  T
Q  312 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212067 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036938
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||      
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13036979  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13036978 aaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911024
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||| |||||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36053003
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36052962  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052963 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572924
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580661
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  115 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  215 aattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaa 11580699  T
Q  311 tgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11580698 tgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292338
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
      || |||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  110 taacaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 206  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  207 ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcca 273  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493913
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 32493913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 377
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126799
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttca 126799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936884
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttt 1936884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295893
Alignment:
Q  153 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcac 252  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||| |||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  253 aaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 346  Q
     |||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111136
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttt 111136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 382
Target Start/End: Original strand, 13377819 - 13377917
Alignment:
Q  282 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||    
T  13377819 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 13377916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283923
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttt 7283923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029276
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293365
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctta 7293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516576
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctta 11516576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113903
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14113903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441478
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709501
Alignment:
Q  279 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttacctta 15709501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262043
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctta 30262043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056188
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16915011 - 16914928
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  16915011 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 16914928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 48356808 - 48356891
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  48356808 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt 48356891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 382
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389743
Alignment:
Q  332 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 13389743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371449
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 371449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049937
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321366
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13321366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124482
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480944
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 47480944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48935
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 48896  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48897 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61122
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 61122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193643
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttacca 16193682  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16193681 aatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373392
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||| |||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 43373433  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373432 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844576
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851969
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928716
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 319  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatga 24928745  T
Q  320 ttatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24928744 ttatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404867
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac- 16404941  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16404940 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 16404867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  138 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274831
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 274831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641018
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 641018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826824
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 826824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716729
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttt 24716729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115663
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttt 39115663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238436
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctta 5238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907128
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22907128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385652
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661162
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24661162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685895
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43685895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 15933462 - 15933545
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  15933462 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt 15933545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 26011658 - 26011741
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  26011658 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 26011741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Original strand, 22981479 - 22981520
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22981479 ttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaattt 22981520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545297
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 2545297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431176
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 3431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886686
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttacctta 22886686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 5990
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t 6228  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 6029  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028 gtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 882
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| |    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-t 1120  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaa 921  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12450
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
      |||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12215 --acaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaa 12410  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12411 aattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9215
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaa 9176  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9177 atgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172242
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 320  Q
    | |||||||||||| || || |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 172214  T
Q  321 tatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  172215 tatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177945
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 320  Q
    | |||||||||||| || || |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 177917  T
Q  321 tatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  177918 tatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42066
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 42031  T
Q  314 tgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42032 tgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36836
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||      
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36878  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36877 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15334
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttt 15334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247366
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 318  Q
    |||||||||||||| ||  | |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 247396  T
Q  319 attatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247395 attatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34075
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19543
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 19504  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 345  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19505 aaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26340
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 26380  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26379 aatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6934 - 6884
Alignment:
Q  332 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  6934 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 6884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128095
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-t 128333  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaa 128134  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128133 atgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 4996
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||| ||| || |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 5026  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaaccc 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5025 aatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 35 - 283
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 30417 - 30482
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||    
T  30417 atgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttt 30482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123087
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | || |||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttaca 123129  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  123128 aaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  34 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  134 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  234 aacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5878
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272362
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg 315  Q
    |||||| |||||||||||| ||  | |||| ||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatg 272329  T
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64527
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 64581  T
Q  210 acatc-----aattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
     ||||     |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  64580 tcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21115
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaa 263  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||| || |   ||||||| ||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 377
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20553
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 377  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttca 20553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9192
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgca 9147  T
Q  308 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9148 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttacctta 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Original strand, 146844 - 146938
Alignment:
Q  254 aatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146844 aatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 128 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51110
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  228 aaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 327  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 51129  T
Q  328 aagactaacccccttacct 346  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  51128 aagactaatctccttacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  210 acatcaattcatgca 224  Q
     ||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  209 aacatcaattcatgca 224  Q
    | ||||||||||||||    
T  3921 atcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89378
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  228 aaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatga 325  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga 89401  T
Q  326 taaagactaacccccttacctta 348  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  89400 tgaagactaacccccttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  223 catacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 320  Q
    |||||||| ||| || || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  321 tatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||      
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41911
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 348
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41997
Alignment:
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctta 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaa 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13769
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | ||||||| |  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13606 caacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13704  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13705 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42739
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttacct---ttatctccaactattagctctagcttcacttt 42739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13856
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37066
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||      
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41697
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 41697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36980
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13325
Alignment:
Q  106 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 205  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  206 actaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagca 262  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||| |||||    
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagca 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 267
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22889
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27144
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctta 27144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  227 caaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1496
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80252
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttt 80252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162045
Alignment:
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 162045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166131
Alignment:
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 166131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 116483 - 116417
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  116483 atgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 116417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5744
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 5744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5950
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 5950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31147
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 31147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  181 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 66  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 319
Alignment:
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1765
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 1765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Original strand, 94 - 158
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19817
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 19817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24125
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 377  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttca 24125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 56106
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  56195 aacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6271
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 381  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttt 6271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 4
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 354  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1370
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  1436 atgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcacttta 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193396
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6443
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 878
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9882
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13285
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57392
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttacctta 57392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55936
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108075
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttacctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 348
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18058
Alignment:
Q  305 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45370
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 45370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 382
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35866
Alignment:
Q  332 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  35816 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 35866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttagagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17209
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 17209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5476
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4346
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17304
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttacctta 17304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5581
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34308
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University