View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14939_high_7 (Length: 346)

Name: NF14939_high_7
Description: NF14939
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14939_high_7
NF14939_high_7
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (58-328)||(28258990-28259260)
chr2 (63-328)||(36757575-36757840)
chr2 (65-328)||(23078284-23078546)
chr2 (14-328)||(21629911-21630229)
chr2 (14-328)||(39482898-39483217)
chr2 (58-323)||(10707070-10707335)
chr2 (14-327)||(13569295-13569612)
chr2 (32-328)||(14698822-14699121)
chr2 (66-328)||(3491772-3492038)
chr2 (14-328)||(33528437-33528751)
chr2 (63-326)||(34388877-34389133)
chr2 (32-328)||(20522203-20522506)
chr2 (14-328)||(33118103-33118419)
chr2 (64-328)||(8040080-8040350)
chr2 (14-328)||(17865170-17865489)
chr2 (14-328)||(31056009-31056329)
chr2 (58-324)||(8389966-8390233)
chr2 (66-328)||(40738865-40739118)
chr2 (34-328)||(34682144-34682446)
chr2 (66-257)||(25398517-25398710)
chr2 (66-257)||(25403655-25403848)
chr2 (75-257)||(25407653-25407837)
chr2 (66-328)||(9296208-9296476)
chr2 (56-246)||(42039564-42039754)
chr2 (14-204)||(10445379-10445574)
chr2 (66-328)||(11098733-11099002)
chr2 (66-308)||(14291510-14291759)
chr2 (58-328)||(2869505-2869776)
chr2 (65-321)||(40014946-40015202)
chr2 (230-325)||(10445283-10445379)
chr2 (56-325)||(15903706-15903974)
chr2 (58-184)||(27149251-27149377)
chr2 (255-328)||(25409842-25409917)
chr2 (58-328)||(2837840-2838113)
chr2 (252-328)||(1344357-1344435)
chr2 (14-142)||(16940207-16940339)
chr2 (14-142)||(17010872-17011004)
chr2 (245-325)||(35397710-35397790)
chr2 (66-141)||(44312613-44312687)
chr2 (66-140)||(32246810-32246883)
chr2 (66-140)||(39811978-39812051)
chr2 (58-142)||(1345538-1345624)
chr2 (281-328)||(42269606-42269655)
chr2 (66-141)||(19344443-19344518)
chr2 (66-141)||(19349301-19349376)
chr2 (273-308)||(11151788-11151823)
chr2 (273-308)||(11690437-11690472)
chr2 (273-308)||(14202604-14202639)
chr2 (273-308)||(29867805-29867840)
chr2 (273-308)||(34139968-34140003)
chr2 (273-308)||(36773498-36773533)
chr2 (273-308)||(39284821-39284856)
chr2 (273-308)||(42362288-42362323)
chr2 (58-112)||(35215596-35215650)
chr2 (58-112)||(35217973-35218027)
chr2 (263-308)||(41586383-41586429)
chr2 (275-308)||(2334616-2334649)
chr2 (275-308)||(4484529-4484562)
chr2 (275-308)||(4503331-4503364)
chr2 (275-308)||(5723453-5723486)
chr2 (275-308)||(45099691-45099724)
chr2 (261-308)||(3278217-3278265)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (58-328)||(7412355-7412624)
chr8 (14-328)||(4455993-4456312)
chr8 (56-328)||(19175567-19175839)
chr8 (58-328)||(31071038-31071312)
chr8 (32-328)||(5702293-5702597)
chr8 (58-328)||(6127235-6127509)
chr8 (14-328)||(23799389-23799707)
chr8 (34-328)||(26403040-26403342)
chr8 (66-328)||(1261763-1262029)
chr8 (34-328)||(19752207-19752506)
chr8 (66-325)||(26287923-26288175)
chr8 (66-325)||(26301180-26301432)
chr8 (66-325)||(26313174-26313426)
chr8 (14-328)||(4696421-4696726)
chr8 (66-328)||(4759880-4760150)
chr8 (66-328)||(33037614-33037881)
chr8 (66-328)||(36979399-36979667)
chr8 (66-328)||(30655668-30655937)
chr8 (86-328)||(3051162-3051404)
chr8 (66-328)||(10688946-10689218)
chr8 (65-328)||(18870367-18870638)
chr8 (66-328)||(18852973-18853243)
chr8 (58-317)||(5990385-5990643)
chr8 (102-321)||(7492993-7493212)
chr8 (66-328)||(6311319-6311589)
chr8 (243-328)||(9054233-9054318)
chr8 (58-328)||(28307575-28307846)
chr8 (64-189)||(9054789-9054914)
chr8 (58-189)||(6813697-6813829)
chr8 (66-141)||(7289915-7289989)
chr8 (58-112)||(9765848-9765902)
chr8 (66-140)||(25328268-25328341)
chr8 (66-141)||(10684252-10684327)
chr8 (56-112)||(18813152-18813208)
chr8 (66-141)||(35745413-35745488)
chr8 (66-140)||(39784813-39784885)
chr8 (63-112)||(24873196-24873245)
chr8 (273-309)||(4743400-4743436)
chr8 (273-308)||(4731594-4731629)
chr8 (273-308)||(15212722-15212757)
chr8 (273-308)||(18106275-18106310)
chr8 (273-308)||(33352086-33352121)
chr8 (273-308)||(43036359-43036394)
chr8 (273-328)||(9765664-9765720)
chr8 (58-112)||(43079873-43079927)
chr8 (58-112)||(43082244-43082298)
chr8 (275-308)||(4733745-4733778)
chr8 (275-308)||(12702837-12702870)
chr8 (275-308)||(17982589-17982622)
chr8 (273-319)||(19491895-19491943)
chr8 (275-308)||(31218193-31218226)
chr8 (275-308)||(44303790-44303823)
chr8 (276-308)||(3303870-3303902)
chr8 (276-308)||(6598908-6598940)
chr8 (276-308)||(6674361-6674393)
chr8 (254-290)||(13204634-13204670)
chr8 (58-117)||(17847785-17847845)
chr8 (72-112)||(18810978-18811018)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (58-327)||(9353146-9353415)
chr5 (58-328)||(14520244-14520514)
chr5 (58-328)||(15464546-15464818)
chr5 (58-328)||(36932161-36932433)
chr5 (32-328)||(11916785-11917086)
chr5 (66-328)||(38219420-38219686)
chr5 (58-328)||(12083990-12084258)
chr5 (14-325)||(17003775-17004090)
chr5 (58-328)||(10281765-10282038)
chr5 (14-328)||(19588713-19589029)
chr5 (66-328)||(35387684-35387950)
chr5 (64-328)||(3880319-3880586)
chr5 (14-328)||(28832226-28832541)
chr5 (14-328)||(31300408-31300726)
chr5 (66-328)||(24135870-24136137)
chr5 (14-328)||(11181645-11181962)
chr5 (66-234)||(38192195-38192365)
chr5 (14-285)||(42127266-42127540)
chr5 (221-328)||(24553340-24553448)
chr5 (58-328)||(7160717-7160986)
chr5 (66-328)||(31180236-31180504)
chr5 (243-328)||(42127183-42127268)
chr5 (66-328)||(30631428-30631697)
chr5 (14-142)||(24553506-24553636)
chr5 (58-189)||(6741866-6741997)
chr5 (66-140)||(15044708-15044781)
chr5 (58-313)||(33030766-33031023)
chr5 (66-141)||(43592301-43592375)
chr5 (66-141)||(43598746-43598820)
chr5 (66-141)||(43604238-43604312)
chr5 (66-141)||(43609730-43609804)
chr5 (66-141)||(31401838-31401913)
chr5 (66-141)||(1457151-1457225)
chr5 (66-141)||(27449836-27449910)
chr5 (75-141)||(27445001-27445066)
chr5 (56-129)||(2630243-2630316)
chr5 (66-139)||(37556613-37556685)
chr5 (66-139)||(37561435-37561507)
chr5 (66-141)||(2785397-2785472)
chr5 (66-141)||(31396981-31397056)
chr5 (58-112)||(4410237-4410291)
chr5 (66-169)||(28807533-28807635)
chr5 (273-308)||(533705-533740)
chr5 (273-308)||(5887613-5887648)
chr5 (273-308)||(19806320-19806355)
chr5 (58-112)||(15552460-15552514)
chr5 (58-112)||(31179381-31179435)
chr5 (58-112)||(31542949-31543003)
chr5 (58-112)||(31545295-31545349)
chr5 (221-285)||(2630407-2630472)
chr5 (275-308)||(13239688-13239721)
chr5 (275-308)||(13342997-13343030)
chr5 (275-308)||(25412698-25412731)
chr5 (275-308)||(36074243-36074276)
chr5 (281-314)||(37439064-37439097)
chr5 (276-308)||(39468749-39468781)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (58-328)||(27974754-27975025)
chr3 (56-328)||(16264362-16264633)
chr3 (14-328)||(21711190-21711506)
chr3 (14-328)||(6794517-6794833)
chr3 (14-328)||(8370291-8370608)
chr3 (56-328)||(32143333-32143607)
chr3 (58-328)||(33386477-33386739)
chr3 (58-328)||(27986258-27986519)
chr3 (16-328)||(1736106-1736423)
chr3 (58-319)||(27452972-27453235)
chr3 (32-328)||(48438197-48438499)
chr3 (66-328)||(26928401-26928666)
chr3 (14-328)||(36029060-36029377)
chr3 (14-328)||(40592584-40592903)
chr3 (56-325)||(35925495-35925759)
chr3 (14-328)||(24694968-24695284)
chr3 (66-328)||(1305970-1306236)
chr3 (14-310)||(30709609-30709912)
chr3 (14-299)||(18552716-18553003)
chr3 (14-325)||(3715805-3716122)
chr3 (56-328)||(25795793-25796066)
chr3 (34-325)||(26298973-26299269)
chr3 (128-328)||(39032357-39032555)
chr3 (36-328)||(47923706-47924006)
chr3 (14-328)||(40844619-40844939)
chr3 (65-328)||(3323493-3323756)
chr3 (14-328)||(37466258-37466579)
chr3 (127-328)||(47649653-47649856)
chr3 (66-328)||(40372602-40372870)
chr3 (14-325)||(3328162-3328476)
chr3 (14-328)||(1417293-1417610)
chr3 (100-328)||(8126686-8126914)
chr3 (66-328)||(2671392-2671661)
chr3 (66-328)||(8477384-8477655)
chr3 (66-328)||(8738869-8739138)
chr3 (66-328)||(9091107-9091376)
chr3 (66-328)||(7167266-7167536)
chr3 (240-328)||(37725871-37725959)
chr3 (156-328)||(25929198-25929370)
chr3 (66-328)||(28503670-28503939)
chr3 (261-328)||(4386779-4386846)
chr3 (14-128)||(39039995-39040114)
chr3 (86-328)||(21353604-21353849)
chr3 (263-328)||(27026925-27026990)
chr3 (263-328)||(27038270-27038335)
chr3 (273-328)||(23392106-23392161)
chr3 (88-328)||(28501503-28501750)
chr3 (70-189)||(4386869-4386988)
chr3 (66-141)||(22173184-22173258)
chr3 (66-140)||(18656457-18656530)
chr3 (276-328)||(23410529-23410581)
chr3 (58-112)||(38210565-38210619)
chr3 (66-141)||(2672919-2672994)
chr3 (66-141)||(2677075-2677150)
chr3 (66-141)||(8512239-8512314)
chr3 (66-141)||(8517119-8517194)
chr3 (66-141)||(32475507-32475580)
chr3 (66-141)||(32480365-32480438)
chr3 (58-138)||(25929435-25929515)
chr3 (273-308)||(5236653-5236688)
chr3 (273-308)||(9581219-9581254)
chr3 (273-308)||(19684086-19684121)
chr3 (273-308)||(29682295-29682330)
chr3 (273-308)||(39153558-39153593)
chr3 (273-308)||(40734434-40734469)
chr3 (273-308)||(44331481-44331516)
chr3 (58-112)||(6063454-6063508)
chr3 (58-112)||(50494194-50494248)
chr3 (275-308)||(5258343-5258376)
chr3 (275-308)||(5260522-5260555)
chr3 (275-308)||(23198136-23198169)
chr3 (275-308)||(23200335-23200368)
chr3 (63-112)||(28413045-28413094)
chr3 (275-308)||(45095101-45095134)
chr3 (64-112)||(6065810-6065858)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (58-328)||(3281722-3281991)
chr1 (58-328)||(13604435-13604706)
chr1 (14-328)||(26644711-26645029)
chr1 (58-328)||(37069784-37070051)
chr1 (71-328)||(21536383-21536639)
chr1 (14-328)||(29651778-29652097)
chr1 (67-328)||(19358653-19358917)
chr1 (67-328)||(19361242-19361506)
chr1 (14-315)||(16124340-16124647)
chr1 (14-328)||(13598365-13598684)
chr1 (14-328)||(47703746-47704066)
chr1 (14-325)||(9476228-9476543)
chr1 (67-294)||(19379917-19380146)
chr1 (14-328)||(19072894-19073214)
chr1 (14-328)||(19120784-19121104)
chr1 (66-328)||(24202578-24202844)
chr1 (34-328)||(32889424-32889722)
chr1 (32-328)||(47098638-47098938)
chr1 (32-328)||(47102652-47102955)
chr1 (113-328)||(40816627-40816842)
chr1 (148-328)||(19366117-19366300)
chr1 (60-327)||(22819444-22819714)
chr1 (32-187)||(27104333-27104486)
chr1 (221-328)||(27104215-27104322)
chr1 (66-328)||(24787170-24787439)
chr1 (235-325)||(9022722-9022813)
chr1 (14-129)||(775639-775757)
chr1 (66-140)||(25445079-25445152)
chr1 (66-140)||(41390603-41390676)
chr1 (66-140)||(41398258-41398331)
chr1 (66-141)||(43988452-43988527)
chr1 (56-186)||(9023794-9023924)
chr1 (66-140)||(39445522-39445594)
chr1 (66-140)||(44023864-44023936)
chr1 (273-308)||(197105-197140)
chr1 (273-308)||(834364-834399)
chr1 (273-308)||(3847318-3847353)
chr1 (273-308)||(10925159-10925194)
chr1 (229-313)||(11031302-11031386)
chr1 (273-308)||(23555462-23555497)
chr1 (273-308)||(30476645-30476680)
chr1 (273-308)||(50167372-50167407)
chr1 (66-140)||(1055002-1055074)
chr1 (71-117)||(9314667-9314713)
chr1 (58-112)||(9459429-9459483)
chr1 (58-112)||(9463256-9463310)
chr1 (58-112)||(16226382-16226436)
chr1 (58-112)||(16231778-16231832)
chr1 (275-308)||(3189267-3189300)
chr1 (275-308)||(3198084-3198117)
chr1 (275-308)||(3206923-3206956)
chr1 (273-314)||(4552834-4552875)
chr1 (275-308)||(13316517-13316550)
chr1 (275-308)||(20762608-20762641)
chr1 (273-319)||(41360838-41360886)
chr1 (273-306)||(44455098-44455131)
chr1 (288-328)||(17345374-17345414)
chr1 (56-112)||(51757745-51757801)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (58-328)||(133092-133363)
scaffold0006 (14-328)||(5650-5969)
scaffold0006 (14-323)||(2459-2773)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (58-328)||(5396484-5396754)
chr4 (14-327)||(36315044-36315359)
chr4 (14-327)||(36329253-36329568)
chr4 (14-328)||(16623106-16623424)
chr4 (14-328)||(10047346-10047665)
chr4 (14-328)||(3777516-3777833)
chr4 (58-328)||(31985446-31985716)
chr4 (14-328)||(5143226-5143544)
chr4 (14-328)||(38152251-38152569)
chr4 (14-327)||(5147644-5147961)
chr4 (32-328)||(5269013-5269305)
chr4 (58-327)||(8689310-8689566)
chr4 (32-328)||(6743228-6743528)
chr4 (14-324)||(24333776-24334093)
chr4 (66-327)||(28468348-28468604)
chr4 (14-328)||(42599387-42599704)
chr4 (14-328)||(25861846-25862152)
chr4 (173-328)||(16628685-16628839)
chr4 (66-328)||(24741962-24742231)
chr4 (66-328)||(29760663-29760932)
chr4 (64-189)||(3796470-3796596)
chr4 (58-313)||(39774133-39774388)
chr4 (14-328)||(54867151-54867463)
chr4 (58-328)||(5112251-5112521)
chr4 (14-178)||(16630642-16630811)
chr4 (58-328)||(1983113-1983383)
chr4 (14-142)||(39245961-39246093)
chr4 (69-328)||(18377384-18377643)
chr4 (229-328)||(3793891-3793993)
chr4 (273-328)||(6542378-6542433)
chr4 (66-141)||(51520479-51520553)
chr4 (66-141)||(56146700-56146774)
chr4 (66-140)||(3814046-3814119)
chr4 (66-140)||(5732687-5732760)
chr4 (37-141)||(34495822-34495931)
chr4 (273-325)||(51336983-51337035)
chr4 (66-129)||(9224408-9224470)
chr4 (66-129)||(9229195-9229257)
chr4 (66-140)||(45347807-45347880)
chr4 (66-140)||(45357286-45357359)
chr4 (273-321)||(4587881-4587929)
chr4 (243-313)||(37782062-37782133)
chr4 (66-140)||(18855749-18855821)
chr4 (273-328)||(48893839-48893896)
chr4 (273-308)||(5429615-5429650)
chr4 (273-308)||(5871756-5871791)
chr4 (273-308)||(13009628-13009663)
chr4 (273-308)||(34570611-34570646)
chr4 (273-308)||(45687380-45687415)
chr4 (273-308)||(48142978-48143013)
chr4 (273-308)||(52082854-52082889)
chr4 (273-308)||(52095559-52095594)
chr4 (58-112)||(16931799-16931853)
chr4 (58-112)||(16934153-16934207)
chr4 (58-112)||(22780383-22780437)
chr4 (58-112)||(22782748-22782802)
chr4 (58-112)||(44599848-44599902)
chr4 (275-308)||(9927656-9927689)
chr4 (275-308)||(13992484-13992517)
chr4 (275-308)||(37740562-37740595)
chr4 (275-308)||(56178835-56178868)
chr4 (56-112)||(11008576-11008632)
chr4 (273-313)||(36463586-36463626)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (58-328)||(43774-44044)
scaffold0087 (58-328)||(36645-36915)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (58-328)||(8230-8502)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (58-328)||(5757291-5757561)
chr6 (58-325)||(21356050-21356318)
chr6 (63-326)||(5572058-5572319)
chr6 (34-328)||(31979498-31979796)
chr6 (14-328)||(31086287-31086603)
chr6 (56-328)||(22709030-22709294)
chr6 (63-299)||(18232864-18233101)
chr6 (64-328)||(21801155-21801421)
chr6 (32-328)||(22963683-22963983)
chr6 (32-328)||(23824410-23824710)
chr6 (64-302)||(4629974-4630211)
chr6 (66-328)||(5674576-5674845)
chr6 (14-328)||(31936554-31936859)
chr6 (14-279)||(10077030-10077295)
chr6 (65-328)||(24435785-24436047)
chr6 (14-328)||(5017309-5017599)
chr6 (56-325)||(14521686-14521957)
chr6 (243-328)||(31076749-31076834)
chr6 (66-141)||(11856996-11857070)
chr6 (66-140)||(14742426-14742499)
chr6 (66-141)||(22010686-22010760)
chr6 (66-140)||(14737566-14737639)
chr6 (66-169)||(28155529-28155632)
chr6 (66-141)||(33335930-33336005)
chr6 (66-141)||(6005439-6005514)
chr6 (284-328)||(21272802-21272846)
chr6 (66-138)||(28184527-28184598)
chr6 (66-141)||(33330433-33330508)
chr6 (66-140)||(6438523-6438595)
chr6 (77-141)||(16838777-16838841)
chr6 (295-328)||(18234334-18234367)
chr6 (63-128)||(27165702-27165767)
chr6 (273-308)||(28137605-28137640)
chr6 (273-308)||(33211382-33211417)
chr6 (58-112)||(12195525-12195579)
chr6 (56-189)||(31076893-31077026)
chr6 (275-308)||(2171729-2171762)
chr6 (276-313)||(3039103-3039140)
chr6 (243-328)||(5385794-5385878)
chr6 (275-308)||(33160552-33160585)
chr6 (221-308)||(33721391-33721479)
chr6 (272-308)||(16568979-16569015)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (58-328)||(2479351-2479620)
chr7 (58-328)||(47263692-47263950)
chr7 (58-302)||(21983298-21983544)
chr7 (14-328)||(29159770-29160091)
chr7 (66-328)||(21639830-21640096)
chr7 (66-328)||(18408785-18409050)
chr7 (58-258)||(44848567-44848767)
chr7 (14-305)||(49091628-49091924)
chr7 (14-328)||(21988874-21989192)
chr7 (66-328)||(18413662-18413926)
chr7 (14-328)||(2647510-2647826)
chr7 (14-323)||(9189825-9190138)
chr7 (66-328)||(21646028-21646294)
chr7 (14-328)||(46516118-46516440)
chr7 (32-328)||(20284072-20284373)
chr7 (14-328)||(2580354-2580673)
chr7 (32-290)||(55931-56195)
chr7 (32-328)||(4796481-4796781)
chr7 (14-328)||(33332263-33332580)
chr7 (16-328)||(23402826-23403141)
chr7 (66-328)||(1533250-1533519)
chr7 (58-328)||(9184987-9185248)
chr7 (36-305)||(35960803-35961078)
chr7 (58-328)||(3047268-3047538)
chr7 (66-328)||(2057987-2058259)
chr7 (66-328)||(20357353-20357622)
chr7 (58-328)||(5817083-5817352)
chr7 (118-325)||(9235398-9235605)
chr7 (252-328)||(44847938-44848014)
chr7 (58-189)||(28617177-28617308)
chr7 (66-140)||(19992335-19992408)
chr7 (66-140)||(24024316-24024389)
chr7 (66-129)||(4866752-4866814)
chr7 (66-141)||(12396933-12397007)
chr7 (66-141)||(16880095-16880169)
chr7 (66-141)||(16884951-16885025)
chr7 (273-328)||(49091918-49091973)
chr7 (66-140)||(31109573-31109646)
chr7 (273-313)||(12098056-12098096)
chr7 (66-141)||(24261311-24261386)
chr7 (66-141)||(24266190-24266265)
chr7 (66-141)||(12406353-12406427)
chr7 (58-112)||(7351662-7351716)
chr7 (272-308)||(41649206-41649242)
chr7 (273-308)||(1113593-1113628)
chr7 (273-308)||(4586097-4586132)
chr7 (273-308)||(31733166-31733201)
chr7 (273-308)||(38671419-38671454)
chr7 (273-308)||(43864180-43864215)
chr7 (273-308)||(47676333-47676368)
chr7 (273-308)||(48489367-48489402)
chr7 (290-328)||(79634-79672)
chr7 (266-308)||(19502114-19502156)
chr7 (58-112)||(31155921-31155975)
chr7 (275-308)||(4178711-4178744)
chr7 (63-112)||(7349288-7349337)
chr7 (275-308)||(24514959-24514992)
chr7 (275-308)||(29990991-29991024)
chr7 (275-308)||(35853851-35853884)
chr7 (275-308)||(39731313-39731346)
chr7 (275-308)||(41317633-41317666)
chr7 (275-308)||(48408739-48408772)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (66-328)||(17761-18027)
scaffold0188 (66-328)||(23854-24120)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (64-328)||(85703-85967)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (14-328)||(10696-11017)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (58-328)||(17277-17535)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (217-321)||(45371-45475)
scaffold0098 (58-128)||(45267-45337)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (56-324)||(23540-23812)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (66-140)||(9632-9705)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (66-129)||(35063-35125)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (66-141)||(14297-14372)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (277-325)||(33384-33432)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (66-140)||(385-457)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (66-141)||(2239-2314)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (66-141)||(148944-149019)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (58-112)||(265-319)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (275-308)||(853-886)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (275-308)||(11360-11393)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (63-112)||(11488-11537)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (275-308)||(114539-114572)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28259260 - 28258990
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28259260 agttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 28259161  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28259160 acacaagaacaagatctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgacccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 28259061  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28259060 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactataaagacactc 28258990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 63 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36757840 - 36757575
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacaca 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||    
T  36757840 ggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaaaagctttcaagcttacaca 36757741  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36757740 agaacaaaacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaatgatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtg 36757641  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757640 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 36757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 65 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23078546 - 23078284
Alignment:
Q  65 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23078546 tccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaag 23078447  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaa 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23078446 aacaagacttaatttctacccatttgtgttacccacactctcaatgatgaaccct-aagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatgatgaa 23078348  T
Q  265 atctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  23078347 atctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagattctcatcacaaagacactc 23078284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 21629911 - 21630229
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21629911 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatcca 21630007  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  21630008 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 21630107  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21630108 aataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 21630206  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21630207 agatcctcactacaaagacactc 21630229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 39482898 - 39483217
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  39482898 agataaacaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatcca 39482995  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttg-tgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  39482996 ctatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttatgtcacccacactctc 39483095  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  39483096 aataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagttttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaag 39483194  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  39483195 agatcctcacaacaaagacactc 39483217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10707335 - 10707070
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10707335 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 10707236  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||     
T  10707235 tacacaagaacaagacctaatttctacccatctgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttct 10707138  T
Q  256 aatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaaga 323  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10707137 aatggtgaaatctaactacccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaaga 10707070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Original strand, 13569295 - 13569612
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13569295 agataatcaatgaaagaaa--ggaataaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 13569392  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatt-tgtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |    
T  13569393 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagtttacacaagaacaagacctaatttctaccctttgtttgtcacccactctcac 13569492  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13569493 aata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttataatgtttcccaacccaag 13569590  T
Q  306 agatcctcactacaaagacact 327  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13569591 agatcctcactacaaagacact 13569612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14699121 - 14698822
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14699121 aaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttac 14699023  T
Q  127 aaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||   ||| ||||| ||    
T  14699022 aaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaat---gaatcctaa-ga 14698927  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaaga 323  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14698926 gaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatagtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagatcctcactacaaaga 14698827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 3491772 - 3492038
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3491772 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 3491871  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  3491872 aacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtg 3491970  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491971 gaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttttccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 3492038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33528751 - 33528437
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||||||    
T  33528751 agataaacaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatcca 33528654  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||    
T  33528653 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagct-----aagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccaaactctc 33528559  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33528558 aataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaag 33528460  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33528459 agatcctcactacaaagacactc 33528437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 63 - 326
Target Start/End: Original strand, 34388877 - 34389133
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacac 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||        ||||||||    
T  34388877 ggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatta--------gcttacac 34388968  T
Q  162 aagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34388969 aagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatg 34389066  T
Q  260 gtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacac 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34389067 gtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacac 34389133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Original strand, 20522203 - 20522506
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20522203 aaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttac 20522302  T
Q  127 aaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    ||| | ||||||||||| ||  ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  20522303 aaaagggttacaagaaattagattataagcttacaaaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaataatgagtcctaa-ga 20522401  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaaga 323  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20522402 aaaaacacaaaaggaagctttttgatcattcaaatggtgaaatctcactacccaagttgtttacaatgcttcccaacccaagagatactcactacaaaga 20522501  T
Q  324 cactc 328  Q
    |||||    
T  20522502 cactc 20522506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 33118103 - 33118419
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  33118103 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatcca 33118200  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctc 206  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||||    
T  33118201 ctatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccctcactctc 33118300  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
       ||||||  || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33118301 ---aatgaa-tcttaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggcgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttccccaacccaag 33118396  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33118397 agatcctcactacaaagacactc 33118419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 64 - 328
Target Start/End: Original strand, 8040080 - 8040350
Alignment:
Q  64 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaa---agagttacaagaaaataacttgcaagcttaca 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  8040080 gtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaagaaattagcttacaagcttaca 8040179  T
Q  161 caagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaa-agagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8040180 caagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcacaat-atgaatcctaagaga-aaaacataaaaggaagctttttgatccttccaa 8040277  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||    
T  8040278 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacttcactacaaagacactc 8040350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 17865170 - 17865489
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |     ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  17865170 agataatcaatgaaagaaa--ggaacaatcacaccaagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatcca 17865267  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttg-tgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |||| |||||    
T  17865268 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacataatttctacctattttatgtcatccacactctc 17865367  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17865368 aataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttctatttgtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 17865466  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  17865467 agatcttcactacaaagacactc 17865489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 31056009 - 31056329
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaa-gattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcc 107  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  31056009 agataagcaatgaaagaaaa-ggaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatcc 31056107  T
Q  108 actatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctct 205  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  31056108 actaagatgaaagtgttacaaaagagttacaataaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactct 31056207  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--c 302  Q
    |   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  31056208 c---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctc 31056303  T
Q  303 aagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  31056304 aagagaacctcactacaaagacactc 31056329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8390233 - 8389966
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  8390233 agttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 8390134  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattc 254  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||  |||    
T  8390133 tgcacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaagaggaagctttttgattcttc 8390036  T
Q  255 caatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 324  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8390035 caatggtaaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagagatcatcactacaaagac 8389966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 40738865 - 40739118
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaaga 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  40738865 ccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagcttgcaagcttacacaaga 40738954  T
Q  166 acaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtga 263  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  40738955 acaagtcttagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaatagtaagcttttgatccttccaatggtga 40739053  T
Q  264 aatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40739054 aatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 40739118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34682446 - 34682144
Alignment:
Q  34 aggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-a 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  34682446 aggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaa 34682347  T
Q  128 aagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagaga 226  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||| ||| ||||||    
T  34682346 aagagttacaagaaattagcttacaggcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcacccactctcacaa-ggtgaatcct-aagaga 34682249  T
Q  227 agacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaa--cccaagagatcctcactacaaaga 323  Q
    | |||||||||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  34682248 aaacacaaaaggaaacattttgatccttcaagtggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaactctcaagagaacctcactacaaaga 34682149  T
Q  324 cactc 328  Q
    |||||    
T  34682148 cactc 34682144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 257
Target Start/End: Original strand, 25398517 - 25398710
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25398517 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 25398616  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtgttac-ccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  25398617 aacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 25398710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 257
Target Start/End: Original strand, 25403655 - 25403848
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25403655 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 25403754  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtgttac-ccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  25403755 aacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 25403848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 257
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407837
Alignment:
Q  75 cctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacc 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcc 25407752  T
Q  174 taatttctacccatttgtgttac-ccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  25407753 tagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 25407837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9296476 - 9296208
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||| ||||    
T  9296476 ccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttatacaa 9296377  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggt 261  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9296376 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggt 9296278  T
Q  262 gaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||| | ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||    
T  9296277 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaatagacactttctacaaagacactc 9296208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42039754 - 42039564
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaag 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  42039754 ctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaagaaaattagcttgcaag 42039655  T
Q  155 cttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  42039654 cttacacaaaaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcacaat-atgaatcct-aagagaaaacataaaaggaagttttt 42039564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10445574 - 10445379
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10445574 agataagcaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 10445477  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctc 204  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10445476 ctattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaatcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctc 10445379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11099002 - 11098733
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  11099002 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaa 11098903  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||  ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  11098902 gaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 11098804  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    || | | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  11098803 tgtactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 11098733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 308
Target Start/End: Original strand, 14291510 - 14291759
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  14291510 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 14291609  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  14291610 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 14291708  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 308  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  14291709 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 14291759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2869776 - 2869505
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaag-agttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||  |||||    
T  2869776 agttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaagaaattagcttaaaagct 2869677  T
Q  157 tacacaagaacaaga-cctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatca 251  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |   || |||||| ||||||||   ||| ||||| ||||| |||| || |||||||||| |||      
T  2869676 caca-aagaacaaaaacctaatttctacccatttttcaagtcacccacactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacactaacggaagctttttgattc 2869582  T
Q  252 ttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2869581 ttccaatggcgaaatctcactacccaatgtgtttacaatgttttccaactcaagagaacctcactacaaagacactc 2869505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 321
Target Start/End: Original strand, 40014946 - 40015202
Alignment:
Q  65 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    ||||||||||| || | || |||||||| || |  |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||| || |||  || || ||| ||    
T  40014946 tccaatatgacatactctgagggagagaacatccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttgcgagaaattagcttaaaaactcacaaaa 40015045  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttg--tgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatgg 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||| ||||||||||   | ||||| || ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40015046 gaacaagacctaatttctactcattttcatgtcacccacactctcaataa---atcctaa-gaaaaatcacaaaaggaagctttttgatccttccaatgg 40015141  T
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaa 321  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40015142 tgaaatctcactatccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcaatacaaa 40015202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10445379 - 10445283
Alignment:
Q  230 cacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10445379 cacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaacctcactacaaagaca 10445283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15903974 - 15903706
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagag-ttacaagaaaataacttgcaag 154  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||  |||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||||||| || ||| ||||    
T  15903974 ctagttcgatccaatatgacctactctgacggagagagaaaatctccaatccactaagataaaagtgatacaaaggggttacaagaaa-tagcttacaag 15903876  T
Q  155 cttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttg-atc 250  Q
    || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   || |||||| ||||||||   ||| ||||  ||||| ||||||||| || |||||  |||    
T  15903875 ctcaca-aagaacaaattctaatttctacccatttttcaagtcacccacactctcaat---gaatcctat-gagaaaacacaaaagaaatcttttttatc 15903781  T
Q  251 attccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15903780 attccaatggtgaaatctcattatccaatgtgtttacaatgtttcctaacccaagagaacctcactacaaagaca 15903706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27149377 - 27149251
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||| || |||  |||||    
T  27149377 agtttggtccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaaggggtaacaagaaattaccttaaaagct 27149278  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacc 184  Q
     ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  27149277 caca-aagaacaagacttaacttctacc 27149251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 255 - 328
Target Start/End: Original strand, 25409842 - 25409917
Alignment:
Q  255 caatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25409842 caatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactc 25409917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2838113 - 2837840
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||       ||||    
T  2838113 agttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagtacaagagct 2838014  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttg-atcat 252  Q
     ||| |||||||  ||||||||| | ||||||| |   || ||||||  |||||||   ||| ||||| ||||| |||| |||||||  ||||  ||| |    
T  2838013 caca-aagaacacaacctaatttttgcccatttttcatgtcacccaccttctcaat---gaatcctaa-gagaaaacactaaaggaatattttttatcct 2837919  T
Q  253 tccaatggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2837918 tccaatggtgaaattctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactc 2837840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1344435 - 1344357
Alignment:
Q  252 ttccaatggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc-caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1344435 ttccaatggtgaaattctcactaccgaagatgtttacaatgtttcccaacctcaagagaacctcactacaaagacactc 1344357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16940339 - 16940207
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     | || ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  16940339 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatcca 16940242  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16940241 ctatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaa 16940207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17011004 - 17010872
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     | || ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  17011004 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatcca 17010907  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17010906 ctatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaa 17010872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 35397710 - 35397790
Alignment:
Q  245 ttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  35397710 ttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtaattacaatgttttccaacccagaagaacctcactacaaagaca 35397790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44312687 - 44312613
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44312687 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 44312613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 32246810 - 32246883
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  32246810 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 32246883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39812051 - 39811978
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  39812051 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 39811978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1345624 - 1345538
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccac-tatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaa 142  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  1345624 agttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccacttaagatgaaagtgatacaaatgagttgcaagaaa 1345538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 328
Target Start/End: Original strand, 42269606 - 42269655
Alignment:
Q  281 tgtttacaatgtttcccaaccc--aagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  42269606 tgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactc 42269655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 19344443 - 19344518
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19344443 ccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 19344518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 19349301 - 19349376
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19349301 ccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 19349376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 11151788 - 11151823
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11151788 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 11151823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11690472 - 11690437
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690472 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 11690437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 14202604 - 14202639
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202604 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 14202639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29867840 - 29867805
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29867840 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 29867805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 34139968 - 34140003
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139968 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 34140003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36773533 - 36773498
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773533 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 36773498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39284856 - 39284821
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284856 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 39284821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42362323 - 42362288
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42362323 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 42362288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 35215596 - 35215650
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35215596 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 35215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 35217973 - 35218027
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35217973 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 35218027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41586429 - 41586383
Alignment:
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaa-tgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41586429 aaatctcactacccaaggtgtttacaactgttttccaacccaagaga 41586383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 2334616 - 2334649
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334616 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 2334649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 4484529 - 4484562
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4484529 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 4484562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 4503331 - 4503364
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503331 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 4503364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 5723453 - 5723486
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723453 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5723486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45099724 - 45099691
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099724 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 45099691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 308
Target Start/End: Original strand, 3278217 - 3278265
Alignment:
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttac-aatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3278217 tgaaatctcactatccaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagaga 3278265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 7412355 - 7412624
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412355 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 7412454  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  7412455 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccct-aagagaagacataaaaggaagcttttgatcctttcaa 7412553  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7412554 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactc 7412624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 4455993 - 4456312
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaa--gattgcta-----gtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatc 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||      ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4455993 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaaaagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 4456090  T
Q  107 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456091 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagctggcaagcttacacaagaacaagacataatttctacccatttgtgttacccactctctc 4456190  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4456191 aatgatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttctaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 4456290  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  4456291 gatcctcactacagagacactc 4456312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 56 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19175839 - 19175567
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaag 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  19175839 ctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcctgcaag 19175740  T
Q  155 cttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattc 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19175739 cttacacaagaacaagacctaacttctacacatttgtgtttcccactctctcaatgatgaaccctaa-gagaagacacaaaaggaaacttttgatccttc 19175641  T
Q  255 caatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19175640 caatagtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagatcctcactacaaagacactc 19175567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31071312 - 31071038
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  31071312 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagct 31071213  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattc 254  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  31071212 tacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttc 31071114  T
Q  255 caatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071113 caatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 31071038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5702597 - 5702293
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5702597 aaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttac 5702498  T
Q  127 aaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  5702497 aaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaaaacctaatttctacccattttgagtcacccacactctcaataatgaatcctaa-ga 5702399  T
Q  225 gaaga-cacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaag 322  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5702398 gaaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagatcctcactacaaag 5702299  T
Q  323 acactc 328  Q
    ||||||    
T  5702298 acactc 5702293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 6127235 - 6127509
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||    
T  6127235 agttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagct 6127334  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattc 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||    
T  6127335 tacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct-aagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttc 6127433  T
Q  255 caatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6127434 caatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactc 6127509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23799707 - 23799389
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  23799707 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatcca 23799610  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |    
T  23799609 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactgtcac 23799510  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    |||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23799509 aata-tgaatcctaagg-gaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctccctactcaaggtgtttacaatgttccccaacccaag 23799412  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  23799411 agatcctctctacaaagacactc 23799389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26403342 - 26403040
Alignment:
Q  34 aggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-a 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26403342 aggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26403243  T
Q  128 aagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagaga 226  Q
    |||||||| | |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||||| | | ||||||    
T  26403242 aagagttataggaaattagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcactcactctcacaat-atgaatcat-aagaga 26403145  T
Q  227 agacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaaga 323  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26403144 aaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaaga 26403045  T
Q  324 cactc 328  Q
    |||||    
T  26403044 cactc 26403040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1262029 - 1261763
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1262029 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 1261930  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  1261929 tacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtg 1261831  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1261830 aaatctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctctacaaagacactc 1261763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19752506 - 19752207
Alignment:
Q  34 aggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19752506 aggaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T
Q  129 agagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt---gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    | | |||||| |||||   |||||| ||| ||||    
T  19752406 tgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactctc---aatgaatcct-aaga 19752311  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaaga 323  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19752310 gaaaacac-aaaggaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttcacaacccaagagaacctcactacaaaga 19752212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 325
Target Start/End: Original strand, 26287923 - 26288175
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaaga 165  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  26287923 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagcttgcaagcttacacaaga 26288013  T
Q  166 acaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaa 264  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26288014 acaagtcctagtttctacccatttgtgttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaa 26288112  T
Q  265 atctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  26288113 atctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagaca 26288175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 325
Target Start/End: Original strand, 26301180 - 26301432
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaaga 165  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  26301180 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagcttgcaagcttacacaaga 26301270  T
Q  166 acaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaa 264  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26301271 acaagtcctagtttctacccatttgtgttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaa 26301369  T
Q  265 atctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  26301370 atctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagaca 26301432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 325
Target Start/End: Original strand, 26313174 - 26313426
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaaga 165  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  26313174 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagcttgcaagcttacacaaga 26313264  T
Q  166 acaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaa 264  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26313265 acaagtcctagtttctacccatttgtgttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaa 26313363  T
Q  265 atctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  26313364 atctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagaca 26313426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4696726 - 4696421
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |     |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  4696726 agataagcaatgaaagaaat--gaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 4696629  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctca 207  Q
    ||||||||||||          |||||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||     
T  4696628 ctatgatgaaag----------agttacaagaaattagcttataagcttacgcaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc- 4696540  T
Q  208 ataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
      | |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4696539 --attgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatctttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 4696443  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4696442 gatcctcactacaaagacactc 4696421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4760150 - 4759880
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  4760150 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 4760051  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  4760050 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 4759952  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg---tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  4759951 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactc 4759880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33037881 - 33037614
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  33037881 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 33037783  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tggt 261  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |  |    
T  33037782 gaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaat 33037684  T
Q  262 gaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  33037683 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacgaagacactc 33037614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 36979399 - 36979667
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  36979399 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 36979498  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||  ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  36979499 gaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 36979597  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg-tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  36979598 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttcccaacctaagagacactctctacaaagacactc 36979667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 30655668 - 30655937
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  30655668 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 30655767  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||  ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  30655768 gaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 30655866  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  30655867 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 30655937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 328
Target Start/End: Original strand, 3051162 - 3051404
Alignment:
Q  86 ggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacc 184  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || | |   |||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  3051162 ggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcataagagctcaca-aagaacaaaacttaatttctacc 3051260  T
Q  185 catttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaaga 280  Q
    ||||| |   || ||  || ||||||||   ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3051261 catttttcatgtcacttacactctcaat---gaatcctaa-gagaaagcacaaaaggaagctttttgatctttccaatggtgaaatctcactacccaaga 3051356  T
Q  281 tgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  3051357 tgtttacaatgtttcccaactcaagagaaccccactacaaagacactc 3051404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10689218 - 10688946
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  10689218 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 10689119  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgt--gttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc---aa 257  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||   || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| | ||   |     
T  10689118 gaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatcctcccccaac 10689020  T
Q  258 tggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |  |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  10689019 taatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 10688946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18870638 - 18870367
Alignment:
Q  65 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacac 161  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||    
T  18870638 tccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacac 18870539  T
Q  162 aagaacaagacctaatttctacccatttgt-gttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-t 258  Q
    ||||||||  ||||  |||||||| || ||  || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |    
T  18870538 aagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaact 18870440  T
Q  259 ggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
      |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  18870439 aatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 18870367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18853243 - 18852973
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacaca 162  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| | | ||||||||||||    
T  18853243 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacaca 18853144  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccatttgt-gttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tg 259  Q
    |||||||  ||||  || ||||| || ||  || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |     
T  18853143 agaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaacta 18853045  T
Q  260 gtgaaat-ctcactacccaagatgtttaca--atgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||| | ||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  18853044 atgaactcctcactacccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 18852973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5990643 - 5990385
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaaga-gttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||  |||||    
T  5990643 agtttggtccaatatgacatattgtgggggagagagcggctctccaatt-actaagatgaaagtgatacaaagatgttacaagaaattagcttaaaagct 5990545  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcat 252  Q
     ||| ||||||| ||||| ||||  |||||||| |   || |||||| || |||||   ||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||| || | |    
T  5990544 caca-aagaacacgacctcattttcacccatttttcaagtcacccacactttcaat---gaatcctaa-gagaaaacactaaagaaagctttttgacctt 5990450  T
Q  253 tccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcacta 317  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5990449 tcgaatggtgaaatctcacaaaccaagatgattacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta 5990385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7493212 - 7492993
Alignment:
Q  102 caatccactatgatgaaagtgttacaaaga-gttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacc 197  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |  ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||| |   || |||    
T  7493212 caatccactaagatgaaagtgatacaaagaagttataagaaattaacataaaagctcacaca-gaacaaaacctaatttctacctgtttttcaagtcacc 7493114  T
Q  198 cactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcc 296  Q
    ||| ||||||||||   | ||||| || || |||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7493113 cacactctcaataa---atcctaa-gaaaaaacactaaaggaagctttttgatccttctaattgtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 7493018  T
Q  297 caacccaagagatcctcactacaaa 321  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  7493017 caatccaagagaacctcactacaaa 7492993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 6311319 - 6311589
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa--ataacttgcaagc-ttacaca 162  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||   || | | ||||| |||||||    
T  6311319 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca 6311417  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct---aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa- 257  Q
    || ||||  ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||  |||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||     
T  6311418 ag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaaaagagaagtcactagaggaagcttttgatccttccaac 6311515  T
Q  258 tggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |  |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  6311516 taatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 6311589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9054318 - 9054233
Alignment:
Q  243 ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  9054318 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattataatgttttccaacccaagagaatctcactacaaaaacactc 9054233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 28307575 - 28307846
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaa-gc 155  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||| | | ||||||||||| ||  ||  || ||    
T  28307575 agttcggtccaaaatgacctactctggggatgagagcagctctccaatccactaagatggaagtaatacacatgggttacaagaaattagttttaaaagc 28307674  T
Q  156 ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttg-atca 251  Q
    | | | |||||||||||||| ||||||| ||||| |   || |||||| |||||| |   ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||     
T  28307675 tcata-aagaacaagacctactttctacacatttctcaagtcacccacactctcact---gaatcctaaa-agaaaacacaaaagaaagcttttttatcc 28307769  T
Q  252 ttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||    
T  28307770 ttccaattgtgaaatctcactacccaaggtgttaacaatgtttcccaacctaagagaaccgtgctacaaagacactc 28307846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9054914 - 9054789
Alignment:
Q  64 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaag-agttacaagaaaataacttgcaagcttacaca 162  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||  ||||  ||| |    
T  9054914 gtccaatatgacctactctggaggagagagcagctctctaatccactaagatgaaagtgatacaaagtggttacaagaaattagcttaaaagcgcaca-a 9054816  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccattt 189  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  9054815 agaacaaaatctaatttctacccattt 9054789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 6813697 - 6813829
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||| |||||   | ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  6813697 agttcggtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagct 6813796  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaa-tttctacccattt 189  Q
     ||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6813797 caca-aagaacaaaacctaattttctacccattt 6813829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7289989 - 7289915
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7289989 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 7289915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9765902 - 9765848
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9765902 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25328341 - 25328268
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  25328341 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 25328268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10684327 - 10684252
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10684327 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 10684252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18813208 - 18813152
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18813208 ctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactat 18813152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 35745413 - 35745488
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35745413 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 35745488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39784885 - 39784813
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  39784885 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 39784813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Original strand, 24873196 - 24873245
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24873196 ggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactat 24873245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 309
Target Start/End: Original strand, 4743400 - 4743436
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagat 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743400 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagat 4743436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4731629 - 4731594
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731629 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 4731594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15212757 - 15212722
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212757 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 15212722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 18106275 - 18106310
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106275 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 18106310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33352121 - 33352086
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33352121 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 33352086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43036394 - 43036359
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036394 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 43036359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9765720 - 9765664
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9765720 acccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcact-caaagacactc 9765664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43079927 - 43079873
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43079927 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 43079873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43082298 - 43082244
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43082298 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 43082244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4733778 - 4733745
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4733778 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 4733745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 12702837 - 12702870
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12702837 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 12702870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17982622 - 17982589
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982622 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 17982589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 319
Target Start/End: Original strand, 19491895 - 19491943
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactaca 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19491895 acccaagatgtttacgatgtttcccaaccctcaagagaacctcactaca 19491943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31218226 - 31218193
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218226 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 31218193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44303823 - 44303790
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44303823 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 44303790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 308
Target Start/End: Original strand, 3303870 - 3303902
Alignment:
Q  276 caagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3303870 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 3303902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6598940 - 6598908
Alignment:
Q  276 caagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598940 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 6598908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6674393 - 6674361
Alignment:
Q  276 caagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6674393 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 6674361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13204670 - 13204634
Alignment:
Q  254 ccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaat 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13204670 ccaacggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaat 13204634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17847845 - 17847785
Alignment:
Q  58 agtttggtccaata-tgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatga 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  17847845 agtttggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactataatga 17847785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18811018 - 18810978
Alignment:
Q  72 tgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18811018 tgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18810978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 58 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9353415 - 9353146
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9353415 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaaagcttgcaagctt 9353316  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9353315 acacaagaacaagatctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccttaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 9353216  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacact 327  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9353215 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacact 9353146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 14520244 - 14520514
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14520244 agttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 14520343  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14520344 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaattatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 14520443  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520444 tggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 14520514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 15464546 - 15464818
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15464546 agttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagct 15464645  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15464646 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctcacaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcc 15464745  T
Q  256 aatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464746 aatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacgatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 15464818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36932433 - 36932161
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  36932433 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagtt 36932334  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaag-agaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc 255  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36932333 tacataagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaaacagaagacacaagaggaagcttttgatccttcc 36932234  T
Q  256 aatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36932233 aatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcatcactataaagacactc 36932161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11917086 - 11916785
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11917086 aaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttac 11916987  T
Q  127 aaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||  ||||||||||| ||    
T  11916986 aaaagagttacaagaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctca-aacgatgaaccctaa-ga 11916889  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 324  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11916888 gaaaacacaaaaggaagtttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaa 11916789  T
Q  325 actc 328  Q
    ||||    
T  11916788 actc 11916785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 38219420 - 38219686
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38219420 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 38219519  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  38219520 aacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtg 38219618  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219619 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 38219686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12084258 - 12083990
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  12084258 agttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattaacttaaaagctt 12084159  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc-a 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  12084158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtcacccactctcacaat-atgaatcct-aagaaaaaacacaaaaggaagctttt-atccttccaa 12084062  T
Q  257 atggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12084061 atggtgaattctcactacccaaggtgtttaaaatgtttaccaacccaagagatcctcactataaagacactc 12083990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17004090 - 17003775
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  17004090 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatcca 17003993  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | || ||||||| |    
T  17003992 ctatgatgaaagtatttcaaaagagttacaaaaaattaacttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttaatttcactcactctcac 17003893  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17003892 aat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaag 17003795  T
Q  306 agatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17003794 agaacctcactacaaagaca 17003775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 10281765 - 10282038
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10281765 agttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 10281864  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||    
T  10281865 tacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactcacaat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttc 10281962  T
Q  255 caatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10281963 caatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcacaaccctcaagagaacctcactacaaagacactc 10282038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 19588713 - 19589029
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |     |||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||  |||||||||    
T  19588713 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacactcaaagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatcca 19588810  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||    
T  19588811 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccctttttgtgtcacccacaatctc 19588910  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    |||   ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19588911 aat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagatttttgatccttccaatggtgaaatctcactgcccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 19589006  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19589007 agatcctcactacaaagacactc 19589029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 35387684 - 35387950
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35387684 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 35387783  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  35387784 aataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagttttagatccttccaatggtg 35387882  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35387883 aaatctcactacccaaggtgattacaatgttttttccaacccaagagaccctctctacaaagacactc 35387950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 328
Target Start/End: Original strand, 3880319 - 3880586
Alignment:
Q  64 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacaca 162  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  3880319 gtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagcttacaca 3880418  T
Q  163 agaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatgg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3880419 agaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcacaat-atgaatcct-aggagaaaaaacaaaaggaagctttttgatccttccaatgg 3880516  T
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3880517 tgaaatctcacaacccaatgtgtttacaatgtttctcaaccctcaagagaacctcactacaaggacactc 3880586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 28832226 - 28832541
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgcta-----gtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  28832226 agataagcaatgaaagaaaca--aacaaacacaccaagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 28832323  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtta---cccactctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |  ||   ||||| ||||    
T  28832324 ctaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataag--tacaaaagaacaagttctaatttctacccatttttcatatcacccacactct 28832421  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 304  Q
    ||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28832422 caat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 28832517  T
Q  305 gagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  28832518 gagaacctcactacaaagacactc 28832541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31300726 - 31300408
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||| | || ||||||||| | || |||||||||    
T  31300726 agataagcaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatcca 31300629  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtta---cccactctc 204  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||   ||||| |||    
T  31300628 ctaagatgaaagtgttataatgagttgcaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttctcatatcacccacactc 31300529  T
Q  205 tcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccca 303  Q
    |||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31300528 tcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagccttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttctcaaccca 31300433  T
Q  304 agagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  31300432 agagaacctcactacaaagacactc 31300408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 24135870 - 24136137
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24135870 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 24135969  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||| ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  24135970 aacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-gtgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtg 24136068  T
Q  263 aaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    || | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  24136069 aactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactttctacaaagacactc 24136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11181962 - 11181645
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattg----ctagtttggtccaatatgacctaatat-gggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |    |||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |  |||||||||    
T  11181962 agataagcaatgaaagaaat--gaacaaacacaccaagatggtaacctagttcggtctaatatgacctactctagggggagagagcaaccctccaatcca 11181865  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttg--tgttacccactctct 205  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || | |  |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||     
T  11181864 ctaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcctaaaagctctcaaatgaacaagacctaatttctacccattttcatgtcacccacactca 11181765  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 304  Q
    ||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11181764 caat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatttcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 11181669  T
Q  305 gagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  11181668 gagaacctcactacaaagacactc 11181645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 38192195 - 38192365
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38192195 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 38192294  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaa 234  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38192295 aacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaa 38192365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42127540 - 42127266
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||    
T  42127540 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatcca 42127443  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt---gtgttacccactctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    | | |||||| ||||    
T  42127442 ctaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctactttctacccatttttcatatcacccacactct 42127343  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgttt 285  Q
    |   |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42127342 c---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgttt 42127266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24553448 - 24553340
Alignment:
Q  221 aagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactaca 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24553448 aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttctaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactaca 24553349  T
Q  320 aagacactc 328  Q
    |||||||||    
T  24553348 aagacactc 24553340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7160986 - 7160717
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagag-ttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||  ||  |||||    
T  7160986 agtttgattcaatatgacctactataggggagagatcagctctccaatccactcagatgaaagtgatacaaaggggttacaaaaaattagatttaaagct 7160887  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccact---ctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcat 252  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |||| | | |  ||||   ||||||||   ||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |    
T  7160886 caca-aagaacaagacttaatttctacatattttt-taagtcactacactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacataaaatgaagctttttgatcct 7160793  T
Q  253 tccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7160792 tccaatgatgaaatctcactgtccaaggtgattacaatgtttcccaatccaagagaacctcactacaaagacactc 7160717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 31180236 - 31180504
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa--ataacttgcaagc-ttacaca 162  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   || | | ||||| |||||||    
T  31180236 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca 31180334  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tg 259  Q
    || ||||  ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |     
T  31180335 ag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccataaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaacta 31180432  T
Q  260 gtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  31180433 atgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 31180504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42127268 - 42127183
Alignment:
Q  243 ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42127268 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtatacaatgtttctcaacccaagagaacctcactacaaagatactc 42127183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 30631428 - 30631697
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa--ataacttgcaagc-ttacaca 162  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   || | | ||||| |||||||    
T  30631428 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca 30631526  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
     ||||||  | ||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  30631527 tgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaa 30631625  T
Q  261 tgaaatc--tcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| ||   ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  30631626 tgaactcctccactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 30631697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24553636 - 24553506
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||||    
T  24553636 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagcc-tccactcca 24553540  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 142  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24553539 ctaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 24553506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 6741866 - 6741997
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaaga-gttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| ||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||    
T  6741866 agttcggttcaatatgacatactctgggggatagagcagctctccaatccattaagatggaagtgatacaaagaagttacaagaaattagcttgcaaact 6741965  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccattt 189  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6741966 caca-aagaacaaaacctaatttctactcattt 6741997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 15044708 - 15044781
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  15044708 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 15044781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33031023 - 33030766
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagag-ttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||| |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | ||| | | |||||||||| || |||  |||||    
T  33031023 agttcggtcaaatatgacatactctgggggagagagcagctctccaattcactaagatgaaagtgatgcaatggggttacaagaaattagcttaaaagct 33030924  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaa-agaga---agacacaaaaggaagcttttgat 249  Q
     ||| |||||||| || |||||||||||||||| |   || || ||| ||||||||   ||| ||||| ||| |   | |||| |||||||||||||  |    
T  33030923 caca-aagaacaaaacataatttctacccatttttcaagtcactcacactctcaat---gaatcctaagagaaattaaaacactaaaggaagctttttgt 33030828  T
Q  250 cattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctc 313  Q
      |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  33030827 tct--caatggtgaaatctcactacccaagatgattacaatatttctcaacccaagagaacctc 33030766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 43592301 - 43592375
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43592301 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 43592375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 43598746 - 43598820
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43598746 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 43598820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 43604238 - 43604312
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43604238 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 43604312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 43609730 - 43609804
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43609730 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 43609804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31401913 - 31401838
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31401913 ccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 31401838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1457225 - 1457151
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1457225 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 1457151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 27449836 - 27449910
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27449836 ccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 27449910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 141
Target Start/End: Original strand, 27445001 - 27445066
Alignment:
Q  75 cctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27445001 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 27445066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 129
Target Start/End: Original strand, 2630243 - 2630316
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 129  Q
    |||||| |||||||||||||||  | || |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2630243 ctagttcggtccaatatgacctgctttgagggagatagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgatacaaa 2630316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37556685 - 37556613
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag 139  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  37556685 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag 37556613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37561507 - 37561435
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag 139  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  37561507 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag 37561435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 2785397 - 2785472
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2785397 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2785472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31397056 - 31396981
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31397056 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 31396981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4410291 - 4410237
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4410291 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactat 4410237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28807635 - 28807533
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagc-ttacacaag 164  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |    
T  28807635 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatg 28807538  T
Q  165 aacaa 169  Q
    |||||    
T  28807537 aacaa 28807533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 533740 - 533705
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  533740 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 533705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 5887613 - 5887648
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5887613 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5887648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19806355 - 19806320
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19806355 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 19806320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15552514 - 15552460
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15552514 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 15552460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 31179381 - 31179435
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31179381 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31179435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31543003 - 31542949
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31543003 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31542949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31545349 - 31545295
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31545349 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31545295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Original strand, 2630407 - 2630472
Alignment:
Q  221 aagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgttt 285  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  2630407 aagagaaaacactaaaggaagctttttgatcctttcaatggtgaaatttcactatcaaagatgttt 2630472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13239721 - 13239688
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239721 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 13239688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13343030 - 13342997
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13343030 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 13342997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25412731 - 25412698
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412731 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 25412698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 36074243 - 36074276
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074243 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 36074276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37439097 - 37439064
Alignment:
Q  281 tgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37439097 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaccctca 37439064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 308
Target Start/End: Original strand, 39468749 - 39468781
Alignment:
Q  276 caagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39468749 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 39468781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27975025 - 27974754
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27975025 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagct 27974926  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27974925 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccattctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcca 27974826  T
Q  257 atggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27974825 atggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagagatcctcactacaaagacactc 27974754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 328
Target Start/End: Original strand, 16264362 - 16264633
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagc 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16264362 ctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagc 16264461  T
Q  156 ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16264462 ttccacaagaacaagacctaatttctacacatttgtgttacccactctctcaatgatgaaccct-aagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcc 16264560  T
Q  256 aatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16264561 aatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcattacaaagacactc 16264633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 21711190 - 21711506
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  21711190 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatcca 21711287  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21711288 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctcaa 21711387  T
Q  209 taatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711388 taatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 21711486  T
Q  309 tcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21711487 tcctcactacaaagacactc 21711506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6794833 - 6794517
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgcta-----gtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6794833 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 6794736  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataa-cttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  6794735 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaattagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgtcacccactctcaca 6794636  T
Q  208 ataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagag 307  Q
    ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6794635 ata-tgaaccctaa-gagaaaatacaaaaggaagcttttgttcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagag 6794538  T
Q  308 atcctcactacaaagacactc 328  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  6794537 aacctcactacaatgacactc 6794517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8370608 - 8370291
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaa--gattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatc 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8370608 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 8370511  T
Q  107 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8370510 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccatttgtgtcacccactctcac 8370411  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8370410 aat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaaacttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 8370313  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8370312 gatcctcactacaaagacactc 8370291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 56 - 328
Target Start/End: Original strand, 32143333 - 32143607
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaag 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  32143333 ctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaag 32143432  T
Q  155 cttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcat 252  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  32143433 cttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatcct 32143531  T
Q  253 tccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32143532 tccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagatcatcactacaaagacactc 32143607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33386739 - 33386477
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||  ||||||||||    
T  33386739 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagctt 33386649  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcca 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33386648 acacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcca 33386549  T
Q  257 atggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386548 atggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactc 33386477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27986519 - 27986258
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||| | |||||||||||    
T  27986519 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaaaagcttgcaagctt 27986429  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27986428 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaata-tcaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcca 27986330  T
Q  257 atggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986329 atggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 27986258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1736423 - 1736106
Alignment:
Q  16 ataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccact 110  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1736423 ataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaatattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccact 1736326  T
Q  111 atgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaa 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  1736325 atgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccaacactctcaa 1736226  T
Q  209 taatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagag 307  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1736225 taatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaatag 1736127  T
Q  308 atcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1736126 atcctcactacaaagacactc 1736106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 319
Target Start/End: Original strand, 27452972 - 27453235
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  27452972 agttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagct 27453071  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattc 254  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27453072 tacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttc 27453170  T
Q  255 caatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27453171 caatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttgccaacccaagagatcctcactaca 27453235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Original strand, 48438197 - 48438499
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  48438197 aaaggaacaaacacaccaagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttac 48438296  T
Q  127 -aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
     |||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  48438297 aaaagagttacaagaaattagcatataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct-aaga 48438395  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaaga 323  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48438396 gaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaa-ccaagagatccttactacaaaga 48438494  T
Q  324 cactc 328  Q
    |||||    
T  48438495 cactc 48438499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26928666 - 26928401
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa--taacttgcaagcttacacaa 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  26928666 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagcttacacaa 26928567  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggt 261  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26928566 gaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaatggt 26928468  T
Q  262 gaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928467 gaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 26928401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 36029060 - 36029377
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |     ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36029060 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccgagattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatcca 36029157  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||      
T  36029158 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcactcactctcaa 36029257  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36029258 aata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 36029355  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36029356 gatcctcactacaaagacactc 36029377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40592903 - 40592584
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| |    
T  40592903 agataagcaatgaaagaaaa-ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcga 40592805  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  40592804 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaaaatctaatttctacccattttgtgtcacccactctcac 40592705  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40592704 aata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 40592607  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40592606 agatcctcactacaaagacactc 40592584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 56 - 325
Target Start/End: Original strand, 35925495 - 35925759
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagc 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | |   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||    
T  35925495 ctagttcggtccaatatgacctaatttgggaggg---gcagttctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagtttataagc 35925591  T
Q  156 ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc 255  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35925592 ttacactagaacaaaacctaatttctacccatttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttcc 35925689  T
Q  256 aatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35925690 aatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagatcctcactacaaagaca 35925759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24695284 - 24694968
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||     
T  24695284 agataaacaatgaaagaaat--gaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccg 24695187  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  24695186 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaacttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 24695087  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    |||   ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24695086 aat---gaatcctaaa-agaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcaccacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 24694991  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24694990 agatcctcactacaaagacactc 24694968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 1305970 - 1306236
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1305970 ccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaag 1306069  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  1306070 aacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtg 1306168  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306169 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 1306236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30709912 - 30709609
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaa--gattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatc 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  30709912 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatc 30709815  T
Q  107 cactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-ttgtgttacccactctc 204  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  30709814 cactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatcttgtgtcacccacactc 30709715  T
Q  205 tcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagct-tttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccca 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30709714 tcaataatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctatttgatcattccaatgatgaaatctcactccccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 30709616  T
Q  304 agagatc 310  Q
    | |||||    
T  30709615 aaagatc 30709609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18553003 - 18552716
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  18553003 agataatcaatgaaagaaa--ggaacaaatacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18552906  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctc 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  18552905 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 18552806  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaag-cttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaa 299  Q
       |||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18552805 ---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaa 18552716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3716122 - 3715805
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |    
T  3716122 agataagcaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatcta 3716025  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |    
T  3716024 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcacccactttcac 3715925  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--ca 303  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  3715924 aata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctca 3715827  T
Q  304 agagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  3715826 agagaacctcactacaaagaca 3715805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 328
Target Start/End: Original strand, 25795793 - 25796066
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaag 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||    
T  25795793 ctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaaattagcttataag 25795892  T
Q  155 cttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcat 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||   |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |    
T  25795893 cttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacataaaaggaagctttttgatcct 25795988  T
Q  253 tccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25795989 tccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacattgtttcccaaccctcaagagagcctcactacaaagacactc 25796066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Original strand, 26298973 - 26299269
Alignment:
Q  34 aggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |     |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26298973 aggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 26299072  T
Q  129 a-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagaga 226  Q
    | ||||||||||||| || |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |   | ||||| ||||    
T  26299073 aagagttacaagaaattagcttataaacttagacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacaatctcaatta---atcctaa-gaga 26299168  T
Q  227 agacacaaaa-ggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 324  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299169 aaacacaaaaaggaagctttttgataattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 26299268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39032555 - 39032357
Alignment:
Q  128 aagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaa 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39032555 aagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacgcaagagcaagatctaatttctatccatttatgtttctcactctctcaatgatgaaccctaa-gagaa 39032457  T
Q  228 gacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacact 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39032456 gacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttaccaacccaagagat-ctcactacaaagacact 39032358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47924006 - 47923706
Alignment:
Q  36 gaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa- 129  Q
    |||||||||||||||||||| |     |||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  47924006 gaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaa 47923907  T
Q  130 gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaa-gaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaa 227  Q
    ||||||||||||| || |||  ||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||||  |||||    
T  47923906 gagttacaagaaattagcttaaaagtttacacaaagagcaaaacctaatttatacccattttgtgtcatccacactctcaataatgaatcctac-gagaa 47923808  T
Q  228 gacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacac 326  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47923807 aacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagattctcactacaaagacac 47923708  T
Q  327 tc 328  Q
    ||    
T  47923707 tc 47923706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 40844619 - 40844939
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||    
T  40844619 agataagcaatgaaagaaat--gaacgaacacaccaagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatcca 40844715  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  40844716 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 40844815  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtga-----aatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaac 300  Q
    |||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |     ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  40844816 aat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtcaggtcaaatctcattactcaaggtgtttacaatgtttctcaac 40844911  T
Q  301 ccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40844912 ccaatagatcctcactacaaagacactc 40844939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3323756 - 3323493
Alignment:
Q  65 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| |||    
T  3323756 tccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaag 3323657  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtgtta---cccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatgg 260  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |  ||   ||||| ||||||||   |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3323656 aacaagtcataatttctacccattgttcatatcacccacactctcaat---gaattctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatgg 3323561  T
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3323560 tgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactataaagacactc 3323493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 37466258 - 37466579
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  37466258 agataagcaatgaaagaaat--gaacaaacacaccaagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatcca 37466355  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt-------gttacccact 201  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |        | |||| |     
T  37466356 ctaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattaatttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcactcacccgca 37466455  T
Q  202 ctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaac 300  Q
    |||||   |||||| |||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37466456 ctctc---aatgaatcctaaa-ataaaacacaaaaggaagcttttcgatctttccaatggtgaaatctcacaacccaaagtgtttacaatgtttcccaac 37466551  T
Q  301 ccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||    
T  37466552 ctaagagaacctcactacaaagacactc 37466579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 127 - 328
Target Start/End: Original strand, 47649653 - 47649856
Alignment:
Q  127 aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagag 225  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  47649653 aaagagttacaagaaattaacttacaagcttccacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcgcaat-atgaatcct-aagag 47649750  T
Q  226 aagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaag 322  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  47649751 aaaacacaaaaggaagctttttgatccttcaaatggtgaaatctaactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaag 47649850  T
Q  323 acactc 328  Q
    ||||||    
T  47649851 acactc 47649856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40372870 - 40372602
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40372870 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 40372771  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tggt 261  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||| || |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |  |    
T  40372770 aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcataat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaat 40372672  T
Q  262 gaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  40372671 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 40372602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3328476 - 3328162
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |     ||||   |||||||||||||||| | | ||||||||||||  | |||||||    
T  3328476 agataagcaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatcca 3328379  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt---gtgttacccactctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    | | |||||| ||||    
T  3328378 ctaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactct 3328279  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaag-cttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 304  Q
    |   |||| | ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3328278 c---aatgtatcct-aagagaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatgctgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaa 3328183  T
Q  305 gagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  3328182 gagaagctcactacaaagaca 3328162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1417610 - 1417293
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  1417610 agataagcaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatcca 1417513  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt---gtgttacccactctct 205  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||| |||||| || |||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    | | |||||| |||     
T  1417512 ctaagaagaaagtgttacaatgagttataagaaattagcttataaacttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactcc 1417413  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 304  Q
    |   |||||| ||| ||||||| ||||||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1417412 c---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaagaaaactttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacctaaagtgtttacaatgtttcccaacccaa 1417317  T
Q  305 gagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    || | |||||||||||||||||||    
T  1417316 gataacctcactacaaagacactc 1417293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 328
Target Start/End: Original strand, 8126686 - 8126914
Alignment:
Q  100 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt--gtgttac 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||    
T  8126686 tccaatccactacgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacttaatttctacccatttttgtgtcac 8126785  T
Q  197 ccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttc 295  Q
    |||| ||||||||   ||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8126786 ccacactctcaat---gaatcttaa-gagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 8126881  T
Q  296 ccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8126882 ccaacccaagaaaacctcactacaaagacactc 8126914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2671661 - 2671392
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  2671661 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagattgcaagcttacacaa 2671562  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    || |||| ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  2671561 gaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 2671463  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  2671462 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 2671392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 8477384 - 8477655
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  8477384 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaa 8477483  T
Q  164 -gaacaagacctaatttctacccatttgtgtt--acccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-t 258  Q
      |||||||||||  |||||||| || |||||   ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |    
T  8477484 taaacaagacctagattctaccctttggtgtttcccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaact 8477582  T
Q  259 ggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
      |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  8477583 aatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 8477655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8739138 - 8738869
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  8739138 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 8739039  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgt-gttacccactctctcaataatgaacccta-aagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| |||  || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| |      
T  8739038 gaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctcacaat-atgaaccctagaagagaagacactagaggaagctttagatcctttcaactaa 8738940  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8738939 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactc 8738869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9091376 - 9091107
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  9091376 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 9091277  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgt-gttacccactctctcaataatgaacccta-aagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| |||  || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| |      
T  9091276 gaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctcacaat-atgaaccctagaagagaagacactagaggaagctttagatcctttcaactaa 9091178  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9091177 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactc 9091107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 7167266 - 7167536
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  7167266 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 7167365  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgt-gttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||  ||||  |||||||| || ||  || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  7167366 gaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 7167464  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg---tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  7167465 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 7167536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 240 - 328
Target Start/End: Original strand, 37725871 - 37725959
Alignment:
Q  240 agcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37725871 agcttttgatcctttcaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttataatgtttccccacccaagagatcctcactacaaagacactc 37725959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25929370 - 25929198
Alignment:
Q  156 ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttg--tgttacccactctctcaataatgaaccctaa-agagaagacacaaaaggaagctttt-gatca 251  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||   ||| |||||| ||| ||||   ||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||||| ||||     
T  25929370 ttacaaaagaacaagacctagtttctactcattttcatgtcacccacactcacaat---gaatcctaagagaaaacacaaaaaaagaagctttttgatcc 25929274  T
Q  252 ttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25929273 ttccgatggtgaaatctcactacccaag-tgtttacaatgttttccaactcaagagaacctcactacaaagacactc 25929198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28503939 - 28503670
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa--ataacttgcaagc-ttacaca 162  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||   || | | ||||| |||||||    
T  28503939 ccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca 28503841  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tg 259  Q
    |||| ||  ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||| |     
T  28503840 agaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaacta 28503742  T
Q  260 gtgaaat-ctcactacccaagatgtttaca--atgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||| | ||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  28503741 atgaactcctcactacccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 28503670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4386846 - 4386779
Alignment:
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4386846 tgaaatctcactactcaaggtgattacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactc 4386779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39040114 - 39039995
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaa--gattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatc 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||     |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  39040114 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatc 39040017  T
Q  107 cactatgatgaaagtgttacaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39040016 cactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 328
Target Start/End: Original strand, 21353604 - 21353849
Alignment:
Q  86 ggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacc 184  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |     |||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21353604 ggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcacaagagctcaca-aagaacacaacctaatttctacc 21353702  T
Q  185 catttgtgttacccactctctca-ataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttg-atcattccaatggtgaaat-ctcactacccaagat 281  Q
    ||||| |  | || |||| | |  | |||||| | ||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||  |    
T  21353703 catttttcatgcc-actcacacttacaatgaatcttaa-gagaaaacactaaaggaaacttttggatccttccaatggtgacattctcactacccaaagt 21353800  T
Q  282 gtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21353801 gtttacgatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactc 21353849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 328
Target Start/End: Original strand, 27026925 - 27026990
Alignment:
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27026925 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccctatccaagagatcctcagtacaaagacactc 27026990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 328
Target Start/End: Original strand, 27038270 - 27038335
Alignment:
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27038270 aaatctcaccacccaaggtgtttacaatgtttccctacccaagagatcctcactacaaaggcactc 27038335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 328
Target Start/End: Original strand, 23392106 - 23392161
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23392106 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactc 23392161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501503
Alignment:
Q  88 agagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa--ataacttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||   || | | ||||| ||||||||||| ||  ||||  |||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctacc 28501652  T
Q  185 catttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaga 280  Q
    | || ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||| |  |||| | |||||||||||||     
T  28501651 ctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaagg 28501553  T
Q  281 tgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  28501552 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 28501503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4386988 - 4386869
Alignment:
Q  70 tatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaaca 168  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||| | ||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||    
T  4386988 tatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaataagataaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaagctcaca-aagaaca 4386890  T
Q  169 agacctaatttctacccattt 189  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  4386889 aaacctaatttctactcattt 4386869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22173258 - 22173184
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22173258 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 22173184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 18656457 - 18656530
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  18656457 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 18656530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Original strand, 23410529 - 23410581
Alignment:
Q  276 caagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23410529 caaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaacctcactacaaagacactc 23410581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38210619 - 38210565
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38210619 agttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactat 38210565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2672994 - 2672919
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2672994 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2672919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2677150 - 2677075
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2677150 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2677075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 8512239 - 8512314
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8512239 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 8512314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 8517119 - 8517194
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8517119 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 8517194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 32475507 - 32475580
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  32475507 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgt-ttacaaagagttacaagaa 32475580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 32480365 - 32480438
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  32480365 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgt-ttacaaagagttacaagaa 32480438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25929515 - 25929435
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaa 138  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  25929515 agttcggtccaatacgacctactctggggg-gagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaa 25929435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 5236653 - 5236688
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236653 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5236688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9581254 - 9581219
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581254 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 9581219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 19684086 - 19684121
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19684086 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 19684121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29682330 - 29682295
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29682330 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 29682295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 39153558 - 39153593
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39153558 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 39153593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40734469 - 40734434
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734469 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 40734434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44331516 - 44331481
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44331516 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 44331481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 6063454 - 6063508
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6063454 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 6063508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 50494248 - 50494194
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50494248 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 50494194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 5258343 - 5258376
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258343 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5258376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 5260522 - 5260555
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5260522 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5260555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 23198136 - 23198169
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198136 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 23198169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 23200335 - 23200368
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200335 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 23200368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Original strand, 28413045 - 28413094
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28413045 ggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 28413094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45095134 - 45095101
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095134 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 45095101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 112
Target Start/End: Original strand, 6065810 - 6065858
Alignment:
Q  64 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6065810 gtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactat 6065858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 3281722 - 3281991
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3281722 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 3281821  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3281822 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaatgatgaaccct-aagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 3281920  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281921 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 3281991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13604706 - 13604435
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  13604706 agttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaaact 13604607  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13604606 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcca 13604507  T
Q  257 atggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13604506 atggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagatactc 13604435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26645029 - 26644711
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaa--gattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatc 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26645029 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 26644932  T
Q  107 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctc 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26644931 cattatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttctcactctctc 26644832  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26644831 aatgatgaaccct-aagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaa 26644733  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  26644732 gatcttcactacaaagacactc 26644711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 37069784 - 37070051
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||    
T  37069784 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa---aatagtttgcaagctt 37069880  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37069881 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactcactcaataatgaaccataaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 37069980  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37069981 tggtgaaatctcattatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 37070051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 71 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21536639 - 21536383
Alignment:
Q  71 atgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaag 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21536639 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaat 21536540  T
Q  171 acctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctca 270  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  21536539 acttaatttctacccgtttgtgttacccactctctcaatgatgaaccct-aagagaagacacaaaaggaagctttcgatccttccaatggtgaaatctta 21536441  T
Q  271 ctacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21536440 ctacccaaggtgtttacaatgttttccaacctaagagatcctcactacaaagacactc 21536383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 29651778 - 29652097
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  29651778 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatcca 29651875  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  29651876 ctatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 29651975  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29651976 aataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaaactttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaa 29652074  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29652075 agatcctcactacaaagacactc 29652097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 67 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19358917 - 19358653
Alignment:
Q  67 caatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19358917 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaaga 19358818  T
Q  166 acaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtga 263  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19358817 acaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtga 19358719  T
Q  264 aatctcactacccaagatgtttacaatg-tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19358718 aatctcactacccaaggtgtttacaatgttttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacactc 19358653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 67 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19361506 - 19361242
Alignment:
Q  67 caatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  19361506 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaaga 19361407  T
Q  166 acaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtga 263  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19361406 acaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtga 19361308  T
Q  264 aatctcactacccaagatgtttacaatg-tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19361307 aatctcactacccaaggtgtttacaatgttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 19361242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16124647 - 16124340
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  16124647 agataagctatgaaagaaaa-ggaacaaacacaccaagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 16124549  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  16124548 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacataagaacaagacctaatttctacccattttgtgttacccacactttc 16124449  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16124448 aataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 16124350  T
Q  306 agatcctcac 315  Q
    ||||||||||    
T  16124349 agatcctcac 16124340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 13598365 - 13598684
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  13598365 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatcca 13598462  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  13598463 ctatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctactcattttgtgtcacccacactctc 13598562  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13598563 aatgatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttgccaacccaag 13598661  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13598662 agatcctcactacaaagacactc 13598684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47704066 - 47703746
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  47704066 agataagcaatgaaagaaa--ggaaaaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 47703969  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  47703968 ctatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcac 47703869  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaag-cttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--ca 303  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  47703868 aat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagtttttttatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctca 47703771  T
Q  304 agagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  47703770 agagaacctcactacaaagacactc 47703746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Original strand, 9476228 - 9476543
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  9476228 agataaacaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatcca 9476325  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||| |    
T  9476326 ctatgatgaaagtattacaaaagagttataagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctatccattttgtgtcactcactctcac 9476425  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    |||  ||||  || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9476426 aat-gtgaa-tcttaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttcaaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccaaag 9476523  T
Q  306 agatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  9476524 agaacctcactacaaagaca 9476543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 67 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19380146 - 19379917
Alignment:
Q  67 caatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  19380146 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaaga 19380047  T
Q  166 acaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtga 263  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19380046 acaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtga 19379948  T
Q  264 aatctcactacccaagatgtttacaatgttt 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19379947 aatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 19379917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 19072894 - 19073214
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaa-gattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcc 107  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19072894 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 19072991  T
Q  108 actatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctct 205  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  19072992 actaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttgtgtcactcacactct 19073091  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--c 302  Q
    ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  19073092 ca--aatgaaccct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctc 19073188  T
Q  303 aagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  19073189 aagagaacctcactacaaagacactc 19073214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 19120784 - 19121104
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaa-gattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcc 107  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19120784 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 19120881  T
Q  108 actatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctct 205  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  19120882 actaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttgtgtcactcacactct 19120981  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--c 302  Q
    ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  19120982 ca--aatgaaccct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctc 19121078  T
Q  303 aagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  19121079 aagagaacctcactacaaagacactc 19121104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24202844 - 24202578
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24202844 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 24202745  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  24202744 aacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtg 24202646  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  24202645 agatctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 24202578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 32889424 - 32889722
Alignment:
Q  34 aggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32889424 aggaacaaacacaccaagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 32889523  T
Q  129 agagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt---gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    | | |||||| |||||   |||||| ||| ||||    
T  32889524 tgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactctc---aatgaatcct-aaga 32889619  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 324  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  32889620 gaaaacacaaaa-gaagcttttgaaccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaaaacctcactacaaagac 32889718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47098938 - 47098638
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47098938 aaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttac 47098839  T
Q  127 aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt--gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    || ||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     | |||||| |||||   |||||| ||| ||||    
T  47098838 aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccattttcacatcacccacactctc---aatgaaacct-aaga 47098743  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaaga 323  Q
     || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47098742 aaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcgctacaaaga 47098643  T
Q  324 cactc 328  Q
    |||||    
T  47098642 cactc 47098638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47102955 - 47102652
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |     |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47102955 aaaggaacaaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccactaagatgaaaatgttac 47102856  T
Q  127 aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttcta--cccatttgtgttacc---cactctctcaataatgaaccctaa 221  Q
    || ||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |  || |   ||| ||||||||   ||| |||||    
T  47102855 aatgagttacaagaaattaacttataagcatacaaaagaacaagtcctaatttctatacccatttttcatatcactcacactctcaat---gaatcctaa 47102759  T
Q  222 agagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaa 320  Q
     || || ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47102758 -gaaaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaa 47102660  T
Q  321 agacactc 328  Q
    ||||||||    
T  47102659 agacactc 47102652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 113 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40816842 - 40816627
Alignment:
Q  113 gatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||      
T  40816842 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctactcatttgtgtcacccacactctcaat-- 40816745  T
Q  212 tgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagaga 308  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40816744 -gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagaga 40816647  T
Q  309 tcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||||||||||||||||||    
T  40816646 acctcactacaaagacactc 40816627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19366300 - 19366117
Alignment:
Q  148 ttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19366300 ttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 19366202  T
Q  246 tgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttaca--atgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19366201 agatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 19366117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 327
Target Start/End: Original strand, 22819444 - 22819714
Alignment:
Q  60 tttggtccaatatgacctaatatggggg-agagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||  |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||   ||||     
T  22819444 tttggtccaatatgacctactctggggggagagagtagccctccaatccaccaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagctttttagctc 22819543  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaa-agagaagacacaaaaggaagctttt-gatcat 252  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| ||||||||   ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |    
T  22819544 aca-aagaataagacataatttctaaccatttttcaagtcacccacactctcaat---gaatcctaagagaaaaaacacaaaaggaagctttttgatcct 22819639  T
Q  253 tccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacact 327  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22819640 tccaatggtgaaatgtaactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacact 22819714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27104486 - 27104333
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27104486 aaaggaacaaacacaccaagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac 27104387  T
Q  127 -aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 187  Q
     |||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104386 aaaagagttacaagaaatt--------agcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 27104333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27104322 - 27104215
Alignment:
Q  221 aagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactaca 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27104322 aagagaaaacacaaaaggaagctttttgattcttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgcttataatgtttcccaacccaagaga-cctcactaca 27104224  T
Q  320 aagacactc 328  Q
    |||||||||    
T  27104223 aagacactc 27104215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24787439 - 24787170
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagc-ttacaca 162  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | ||||| |||||||    
T  24787439 ccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacaca 24787341  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tg 259  Q
    |||||||  ||||  |||||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |     
T  24787340 agaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaacta 24787242  T
Q  260 gtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||| | |||||| |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  24787241 atgaactcctcactgcccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 24787170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9022813 - 9022722
Alignment:
Q  235 aaggaagcttttg-atcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9022813 aaggaagcttttttatccttccaatggtgaaatctcactacgaaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctcactacaaagaca 9022722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 775639 - 775757
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |     | || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  775639 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacatcaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatcca 775736  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa 129  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  775737 ctaagatgaaagtgttacaaa 775757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25445152 - 25445079
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  25445152 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 25445079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 41390603 - 41390676
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  41390603 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 41390676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 41398258 - 41398331
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  41398258 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 41398331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43988527 - 43988452
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43988527 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 43988452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9023924 - 9023794
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaag 154  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| | | || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| ||| || | |  |||    
T  9023924 ctagttcgctccaatatgacctattatggggaatatagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgggatacaataaattagcataaaag 9023825  T
Q  155 cttacacaagaacaagacctaatttctaccca 186  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9023824 ctcaca-aagaataagacctaatttctaccca 9023794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 39445522 - 39445594
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  39445522 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 39445594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44023936 - 44023864
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  44023936 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 44023864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 197105 - 197140
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  197105 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 197140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 834364 - 834399
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  834364 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 834399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 3847318 - 3847353
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3847318 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 3847353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10925194 - 10925159
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925194 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 10925159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11031386 - 11031302
Alignment:
Q  229 acacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaa-tgtttcccaacccaagagatcctc 313  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11031386 acactaaaggaagctttttgatccttccaataatgaa--ctcactacccacggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaacctc 11031302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 23555462 - 23555497
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555462 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 23555497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 30476645 - 30476680
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30476645 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 30476680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 50167372 - 50167407
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167372 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 50167407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1055074 - 1055002
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  1055074 ccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 1055002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 117
Target Start/End: Original strand, 9314667 - 9314713
Alignment:
Q  71 atgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9314667 atgacctactatgggggagagagcagctatccgttccactataatga 9314713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 9459429 - 9459483
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9459429 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9459483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 9463256 - 9463310
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9463256 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9463310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16226436 - 16226382
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16226436 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16226382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16231832 - 16231778
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16231832 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16231778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3189300 - 3189267
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189300 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 3189267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3198117 - 3198084
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3198117 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 3198084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3206956 - 3206923
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3206956 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 3206923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 314
Target Start/End: Original strand, 4552834 - 4552875
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4552834 acccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctca 4552875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 13316517 - 13316550
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316517 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 13316550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20762641 - 20762608
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20762641 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 20762608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41360886 - 41360838
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactaca 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  41360886 acccaagatgtttacgatgtttcccaaccctcaagagaacctcactaca 41360838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44455131 - 44455098
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44455131 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 44455098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17345414 - 17345374
Alignment:
Q  288 aatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17345414 aatgtttctcaactcaagagaacctcactacaaagacactc 17345374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 51757801 - 51757745
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51757801 ctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 51757745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 133363 - 133092
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  133363 agttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaaact 133264  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  133263 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcca 133164  T
Q  257 atggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  133163 atggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaaactc 133092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 5650 - 5969
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  5650 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatcca 5747  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5748 ctatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctactcattttgtgtcacccacactctc 5847  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5848 aatgatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttgccaacccaag 5946  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5947 agatcctcactacaaagacactc 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 323
Target Start/End: Original strand, 2459 - 2773
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  2459 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatcca 2556  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  2557 ctatgatgaaagtgttacaaaagaattataagaaattagcttataagcttacacaagaacaagaactaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 2656  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2657 aatgatgaatcctaa-gataaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacgcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 2755  T
Q  306 agatcctcactacaaaga 323  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2756 agatcctcactacaaaga 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5396754 - 5396484
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5396754 agttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 5396655  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  5396654 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttactcactctctcaatgatgaaccctaaagagaagacacaaaagaaagcttttgattcttccaa 5396555  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396554 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 5396484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36315359 - 36315044
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36315359 agataaacaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 36315262  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36315261 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctcaa 36315162  T
Q  209 taatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315161 taatgaatcct-acgaaaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggttaaatctcactacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 36315063  T
Q  309 tcctcactacaaagacact 327  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  36315062 tcctctctacaaagacact 36315044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36329568 - 36329253
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36329568 agataaacaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 36329471  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36329470 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctcaa 36329371  T
Q  209 taatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36329370 taatgaatcct-acgaaaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggttaaatctcactacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 36329272  T
Q  309 tcctcactacaaagacact 327  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  36329271 tcctctctacaaagacact 36329253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16623424 - 16623106
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16623424 agataagcaatgaaagaaaa-ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatcca 16623326  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  16623325 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctaataagcttacagaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcac 16623226  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16623225 aata-tgaatcctaaa-agaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 16623128  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16623127 gatcctcactacaaagacactc 16623106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 10047346 - 10047665
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  10047346 agataaacaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 10047443  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  10047444 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 10047543  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10047544 aataatgaatcctaa-gacaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 10047642  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  10047643 agatcctcattacaaagacactc 10047665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 3777516 - 3777833
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |     |||| |||||||||| ||||||| | | |||||||| |||| |||||||||    
T  3777516 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatcca 3777613  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  3777614 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaaacttacacaagaacaagatctaatttctacccattttgtgtcacccactctcaca 3777713  T
Q  208 ataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    || ||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3777714 at-atgaatcct-aagagaaaatacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 3777811  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3777812 gatcctcactacaaagacactc 3777833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31985716 - 31985446
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  31985716 agttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagct 31985618  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31985617 tacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgtttcccactctcacaatg-tgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcc 31985519  T
Q  256 aatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31985518 catggtgaaatttcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcaatacaaaaacactc 31985446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 5143226 - 5143544
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5143226 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacactgagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaaccca 5143323  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagtt-acaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||      
T  5143324 ctatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaaaatagcttgcaagcatacacaagaacaagacctaatttctactcattttgtgtcagccactctcag 5143423  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5143424 aata-tgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagcttatgatccttccaatggtgaaatctcactacctaaggtgtttacaaagtttcccaatccaaga 5143522  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5143523 gatcctcactacaaagacactc 5143544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38152569 - 38152251
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38152569 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatcca 38152472  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  38152471 ctatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccaattttgtgtcacccacactctc 38152372  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  38152371 aataatgaatcctaa-gagaaaacacaaatggaagcttttgatccttccaatggtgaattgtcactacccaaggtgtttacaatatttcccatcccaaga 38152273  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38152272 gatcctcactacaaagacactc 38152251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Original strand, 5147644 - 5147961
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |     |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  5147644 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtcca 5147741  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaag-agttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  5147742 ttatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaaggcctaatttctacccattttgtgtcacccattctcac 5147841  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  5147842 aata-tgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagcttatgatccttccaatggtgaaatctcattatccaatgtgtttacaatgtttcccaactcaaga 5147940  T
Q  307 gatcctcactacaaagacact 327  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  5147941 gatccttactacaaagacact 5147961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5269305 - 5269013
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5269305 aaaggaacaaacacaacaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttac 5269206  T
Q  127 aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatt-tgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagag 225  Q
    ||          |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  5269205 aa----------gaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattgtgtgtcacccacactctcaataatgaatcctaa-gag 5269117  T
Q  226 aagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 324  Q
    || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5269116 aaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 5269017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8689566 - 8689310
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||| |||||||||||    
T  8689566 agttcggtccaatatgatctaatatgggggagagg--agctctcctatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaatagcttgcaagctt 8689479  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8689478 acacaagaacaagacctaatttctaccaatttgtgtttcccactctctcaatgatgaaccctaa-gagaagacacaaaaggaaacttttgatccttccaa 8689380  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacact 327  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689379 tggtgaaatctcactatccaaggtgtttaaaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacact 8689310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6743528 - 6743228
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagat--tg--ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6743528 aaaggaacaaacacaccaagatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttaca 6743429  T
Q  128 aa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagag 225  Q
    || ||| ||||| ||| || |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  6743428 aaagagctacaaaaaattagcttata-gcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaataatgaatcctaa-gag 6743331  T
Q  226 aagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6743330 aaaacacaaaaggaagtttttgatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcgctacaaagaca 6743231  T
Q  326 ctc 328  Q
    |||    
T  6743230 ctc 6743228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 324
Target Start/End: Original strand, 24333776 - 24334093
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgcta-----gtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24333776 agataagcaatgaaagaaaga--aacaaacacaccaagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatcca 24333873  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaag-aacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctct 205  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  24333874 ctatgatgaacgtgttacaaaagagttataaaaaattagcttacaagcttacacaagaaaaaaaacctaatttctacccattttgtgtcagccactctca 24333973  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--c 302  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  24333974 caat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctc 24334071  T
Q  303 aagagatcctcactacaaagac 324  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  24334072 aagagaacctcactacaaagac 24334093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28468604 - 28468348
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaaga 165  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |        ||||||  |||||||||||||||| |    
T  28468604 ccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaagaa--------aaaatagtttgcaagcttacacaata 28468513  T
Q  166 acaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtga 263  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28468512 acaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtga 28468414  T
Q  264 aatctcactacccaagatgtttaca--atgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacact 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468413 aatctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacact 28468348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42599704 - 42599387
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagag--cagctatccaatc 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||    
T  42599704 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcagtccaatatgacataatatgggggagagagagcaaccctccaatc 42599607  T
Q  107 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctct 205  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||    
T  42599606 cactaagatgaaaatgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccgcactct 42599507  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttg-atcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 304  Q
    ||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  42599506 caat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagtttttttatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttagaatgtttcccaaccgaa 42599411  T
Q  305 gagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  42599410 gagaacctcactacaaagacactc 42599387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25862152 - 25861846
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  25862152 agataagcaatgaaagaaa--ggaataaacacaccaagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatcca 25862055  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctca 207  Q
    ||||||||||||||||||||          |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  25862054 ctatgatgaaagtgttacaa----------gaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaattcctacccattttgtgtcacccacactctca 25861965  T
Q  208 ataatgaaccctaaagagaaga-cacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    ||   ||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25861964 at---gaatcctaa-gagaaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 25861869  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25861868 agatcctcactacaaagacactc 25861846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16628839 - 16628685
Alignment:
Q  173 ctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcac 271  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16628839 ctaatttctacccattttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctaaa-agaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcac 16628742  T
Q  272 tacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628741 tacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 16628685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 24741962 - 24742231
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  24741962 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 24742061  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    ||||||  ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  24742062 gaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 24742160  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  24742161 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 24742231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 29760663 - 29760932
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  29760663 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctgcaagcttacacaa 29760762  T
Q  164 g-aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tgg 260  Q
    | |||||||||||  |||||||| || ||| || ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |      
T  29760763 gaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacact-atgaaccct-aagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 29760860  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg---tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  29760861 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 29760932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3796596 - 3796470
Alignment:
Q  64 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacaca 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  3796596 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttgcaca 3796497  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccattt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3796496 agaacaagacctaatttctacccattt 3796470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39774388 - 39774133
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagag-ttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||| || |||  |||||    
T  39774388 agttcggtccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaagaaattagcttaaaagct 39774289  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttg--tgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcatt 253  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||| ||||   ||| || ||| |||||||| |  | |||  ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  39774288 cacaaagaaacaagacctaatttctaccaattttcatgtcactcacactctcaatga--atccc--aagagaaaatacaaaaggaagctttttgatcatt 39774193  T
Q  254 ccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctc 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39774192 ccaatggtgaaaactcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaacctc 39774133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 54867151 - 54867463
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  | ||||| |    
T  54867151 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggg-agagagcagcccttcaatcaa 54867247  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaag-agttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| || |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||      
T  54867248 ctatgatgaaaatgttacaaaatagttataagaaattagcttataagcttacacaagaacaatacctaatttctacccattttgtgtcatccacactc-- 54867345  T
Q  207 aataatgaaccctaa-agagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 304  Q
       |||||| ||||| ||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    | |||||||||    
T  54867346 ---aatgaatcctaagagaaaacacaaaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccatagtgtttacaa---cttccaacccaa 54867439  T
Q  305 gagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  54867440 gagattctcactacaaagacactc 54867463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 5112251 - 5112521
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||  || ||    
T  5112251 agttcggtccaatatgatctactttgggggtgagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaact 5112350  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcat 252  Q
     | | || ||| ||||||||||| |||| |||| |   || || ||| ||| ||||   ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |    
T  5112351 cataaaa-aacgagacctaatttgtacctattttttaagtcactcacactcacaat---gaatcctaa-gagaaaacataaaaggaagctttttgatcct 5112445  T
Q  253 tccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5112446 tccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacaacaaagacactc 5112521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16630811 - 16630642
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16630811 agataagcaatgaaagaaaa-ggaacaaacacaccaaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatcca 16630713  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatt 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16630712 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagatctaatt 16630642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1983383 - 1983113
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  1983383 agttcggtccaatatgacctactatgggggagatagcagctctccaatccactaggatcaaagtgatacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagct 1983284  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccattt--gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcatt 253  Q
     ||| |||||||| || ||||||||| || |||    || ||| || |||||   |||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||    
T  1983283 caca-aagaacaaaacataatttctatcctttttcaagtcacctacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacccaaaaggaagcttttttatcctt 1983189  T
Q  254 ccaatggtg-aaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1983188 ccaatggtgaaaatcttactaaccagggtgtttacaatgttacacaacccaagataacctcactacaaagacactc 1983113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Original strand, 39245961 - 39246093
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  39245961 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 39246058  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39246059 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 39246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 328
Target Start/End: Original strand, 18377384 - 18377643
Alignment:
Q  69 atatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaac 167  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||  | |||  ||||| ||| |  |||    
T  18377384 atatgacctactctggaggagagagcagccctccattccactaagatgaaagtgatacaaatgggttataagaaatcagcttaaaagctcacaaagaaac 18377483  T
Q  168 aagacctaatttctacccatttg--tgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaa 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||  ||||   ||| ||||| || || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  18377484 aagccctaatttctacccattttcatgtcacccacacttacaat---gaatcctaa-gaaaaaacacaaaatgaagctttttgatccttccaatggtaaa 18377579  T
Q  265 atctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18377580 atctcattacccaaggggtttacaatgttttccatcccaagagaacctcactacaaatacactc 18377643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3793993 - 3793891
Alignment:
Q  229 acacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  3793993 acacaaaaggaagctttttgatcctttctatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaaccctcaagagaacctcactataaagaca 3793894  T
Q  326 ctc 328  Q
    |||    
T  3793893 ctc 3793891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 328
Target Start/End: Original strand, 6542378 - 6542433
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6542378 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcattacaaagacactc 6542433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 51520479 - 51520553
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  51520479 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 51520553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 56146774 - 56146700
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  56146774 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 56146700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 3814046 - 3814119
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  3814046 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 3814119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 5732687 - 5732760
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  5732687 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 5732760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34495931 - 34495822
Alignment:
Q  37 aacaaacacaccaagattg----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-ga 131  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |     
T  34495931 aacaaacacaccaagatggtaacctagttcggtccaacatgacttactctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgg 34495832  T
Q  132 gttacaagaa 141  Q
    ||||||||||    
T  34495831 gttacaagaa 34495822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51337035 - 51336983
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51337035 acccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaacctcactacaaagaca 51336983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9224470 - 9224408
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 129  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9224470 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 9224408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9229257 - 9229195
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 129  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9229257 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 9229195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45347880 - 45347807
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  45347880 ccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 45347807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45357359 - 45357286
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  45357359 ccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 45357286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4587929 - 4587881
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaa 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4587929 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccatgagaacctcactacaaa 4587881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 313
Target Start/End: Original strand, 37782062 - 37782133
Alignment:
Q  243 ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttac-aatgtttcccaacccaagagatcctc 313  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37782062 ttttgattcttccaataatgaaatctcactacccaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagagcctc 37782133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 18855749 - 18855821
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  18855749 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 18855821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 328
Target Start/End: Original strand, 48893839 - 48893896
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaaccc--aagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  48893839 acccaaggtgtttacaatgtttccaaaccctaaagagaacctcactacaaagacactc 48893896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5429650 - 5429615
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429650 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5429615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5871791 - 5871756
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5871791 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5871756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 13009628 - 13009663
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13009628 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 13009663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 34570611 - 34570646
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34570611 acccaagatgttttcaatgtttcccaacccaagaga 34570646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 45687380 - 45687415
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45687380 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 45687415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48143013 - 48142978
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48143013 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 48142978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 52082854 - 52082889
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52082854 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 52082889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 52095559 - 52095594
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095559 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 52095594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 16931799 - 16931853
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16931799 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16931853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 16934153 - 16934207
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16934153 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16934207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 22780383 - 22780437
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22780383 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 22780437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 22782748 - 22782802
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22782748 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 22782802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 44599848 - 44599902
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44599848 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 44599902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 9927656 - 9927689
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9927656 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 9927689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 13992484 - 13992517
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13992484 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 13992517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37740595 - 37740562
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740595 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 37740562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 56178835 - 56178868
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178835 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 56178868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Original strand, 11008576 - 11008632
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11008576 ctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 11008632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 313
Target Start/End: Original strand, 36463586 - 36463626
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36463586 acccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaacctc 36463626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44044 - 43774
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44044 agttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 43945  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43944 atacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttccactctctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 43845  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43844 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacactc 43774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36915 - 36645
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36915 agttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 36816  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36815 acacaagaacaagacatgatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 36716  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36715 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 36645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8502 - 8230
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8502 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagct 8403  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8402 tacacaagaacaagacctaatttctacgtatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttaatccttcc 8303  T
Q  256 aatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8302 aatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5757561 - 5757291
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5757561 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 5757462  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  5757461 atacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttccactctctctcaataatgaaccctaaagagaagacacggaaggaagcttttgatccttccaa 5757362  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5757361 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctaaatacaaagacactc 5757291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 58 - 325
Target Start/End: Original strand, 21356050 - 21356318
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21356050 agttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaagaaaaataacttgcaagct 21356149  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21356150 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagaaaagacacaaaaggaagcttttgattcttcca 21356249  T
Q  257 atggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21356250 atgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagagatcctcactacaaagaca 21356318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 63 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5572319 - 5572058
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacac 161  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  5572319 ggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacac 5572220  T
Q  162 aagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatgg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5572219 aagaacaagacctaatttctacgcattttgtgtcacccacactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagcttttgatcattccaatag 5572124  T
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacac 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5572123 tgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatccccactacaaagacac 5572058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 31979498 - 31979796
Alignment:
Q  34 aggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  31979498 aggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaa 31979597  T
Q  129 a-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt--gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagag 225  Q
    | ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||   ||| ||||| |||    
T  31979598 aagagttacaagaaattaacttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcacccacactctcaat---gaatcctaa-gag 31979693  T
Q  226 aagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31979694 aaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaaaagaacctcactacaaagaca 31979793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31086603 - 31086287
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     ||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  31086603 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatcca 31086506  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaag-agttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||      
T  31086505 ctatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactc-- 31086408  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31086407 aataatgaatcctaa-gagaaaacataaaaagaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcacaacccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaaga 31086309  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31086308 gatcctcactacaaagacactc 31086287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 328
Target Start/End: Original strand, 22709030 - 22709294
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagc 155  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||    
T  22709030 ctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagcttgcaagc 22709120  T
Q  156 ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcatt 253  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  22709121 ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagtttttgatcctt 22709219  T
Q  254 ccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709220 ccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 22709294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 18232864 - 18233101
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacac 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||  ||||||||||    
T  18232864 ggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatcagcttataagcttacac 18232963  T
Q  162 aagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatgg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18232964 aagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatgg 18233062  T
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18233063 tgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaa 18233101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21801421 - 21801155
Alignment:
Q  64 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacaca 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| |    
T  21801421 gtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaaattatcttataagcttacaaa 21801322  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatgg 260  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  21801321 agaacaagacttaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaa--atgaaccctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatgt 21801225  T
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21801224 tgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactc 21801155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Original strand, 22963683 - 22963983
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22963683 aaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttac 22963781  T
Q  127 aaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt-gttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||| |||||| |    
T  22963782 aaaagagttacaagaaattagcttataaccttacacaa-aacaagccgtaatttctacccattttttgtcactcacactctcaataatgaatcctaaa-a 22963879  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 324  Q
    ||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22963880 gaaaacacaaagggaaatttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagatcttcactacaaagac 22963979  T
Q  325 actc 328  Q
    ||||    
T  22963980 actc 22963983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23824710 - 23824410
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23824710 aaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttac 23824612  T
Q  127 aaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt-gttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||| |||||| |    
T  23824611 aaaagagttacaagaaattagcttataaccttacacaa-aacaagccgtaatttctacccattttttgtcactcacactctcaataatgaatcctaaa-a 23824514  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 324  Q
    ||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23824513 gaaaacacaaagggaaatttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagatcttcactacaaagac 23824414  T
Q  325 actc 328  Q
    ||||    
T  23824413 actc 23824410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 302
Target Start/End: Original strand, 4629974 - 4630211
Alignment:
Q  64 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaag-agttacaagaaaataacttgcaagcttacaca 162  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  4629974 gtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaattaacttataagcttacaaa 4630073  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggt 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4630074 agaacaagacctaatttctacctattttgtgtcacccaaactctcaa--atgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggt 4630170  T
Q  262 gaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccc 302  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4630171 gaaatctcactacccaatgtgtttaaaatgtttcccaaccc 4630211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5674845 - 5674576
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  5674845 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaa 5674746  T
Q  164 g-aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatgg 260  Q
    | |||||||||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  5674745 gaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatgg 5674647  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  5674646 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 5674576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 31936554 - 31936859
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattg-----ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  31936554 agataagcaatgaaagata--ggaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtta---cccactctct 205  Q
    |||  |||||||||||||||          ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||   ||||| ||||    
T  31936652 ctaatatgaaagtgttacaa----------gaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaaatcctaatttctacccatttttcatatcacccacactct 31936741  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 304  Q
    ||||   ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31936742 caat---gaatcctaa-gagaaaacacaaa--gaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 31936835  T
Q  305 gagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  31936836 tagatcctcactacaaagacactc 31936859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10077295 - 10077030
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  10077295 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 10077198  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctc 206  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||      
T  10077197 ctatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactc-- 10077100  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaag 279  Q
       |||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10077099 ---aatgaatcct-aagataaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtcaaatctcactacccaag 10077030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24436047 - 24435785
Alignment:
Q  65 tccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||  ||||||||| ||    
T  24436047 tccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccactaggatgaaaatgttacaaatgaattacaagaaattagcttataagcttacaaaa 24435948  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgtgtt--acccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatgg 260  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||  ||   |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24435947 aaacaagacctaatttctacccatttttatatcacccacattc---ataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatgg 24435852  T
Q  261 tgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24435851 tgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaacctcac-acaaagacactc 24435785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5017599 - 5017309
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| |    
T  5017599 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatcta 5017502  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctca 207  Q
    ||||||||||||||||||||          |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  5017501 ctatgatgaaagtgttacaa----------gaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctca 5017412  T
Q  208 ataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    ||||||||                   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5017411 ataatgaa-------------------aaggaagcttttcgatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 5017331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 325
Target Start/End: Original strand, 14521686 - 14521957
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaag 154  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||| || |||||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| ||| || |     ||    
T  14521686 ctagttcggtccaatatgacctactctcgaggagagagcacctctccaattcaataagatgaaagtgatacaaatgagttacaa-aaattagcacaagag 14521784  T
Q  155 cttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttg-atc 250  Q
    || ||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |   || |||||| ||||||||||   | ||||| ||||| |||  |||||||| ||||  |||    
T  14521785 ctcaca-aagaacacaacctaatttctacacatttttcatgtcacccacactctcaataa---atcctaa-gagaaaacattaaaggaagattttttatc 14521879  T
Q  251 attccaatggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--caagagatcctcactacaaagaca 325  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  14521880 cttccaatggtgaaattctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctaactacaaagaca 14521957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31076834 - 31076749
Alignment:
Q  243 ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  31076834 ttttgatcattccaatggtgaaatctcaatacctaaggtgtttacaaagtttctcaacccaaggcaacgtcactacaaagacactc 31076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 11856996 - 11857070
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11856996 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 11857070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14742499 - 14742426
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14742499 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 14742426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22010760 - 22010686
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22010760 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 22010686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14737639 - 14737566
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14737639 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 14737566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28155632 - 28155529
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagc-ttacacaag 164  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |    
T  28155632 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatttagctttcaagctttacacatg 28155534  T
Q  165 aacaa 169  Q
    |||||    
T  28155533 aacaa 28155529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33336005 - 33335930
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33336005 ccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33335930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 6005439 - 6005514
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6005439 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 6005514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21272846 - 21272802
Alignment:
Q  284 ttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21272846 ttacaatgtttcgcaacccaagagaacctcactacaaagacactc 21272802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 138
Target Start/End: Original strand, 28184527 - 28184598
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 138  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  28184527 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 28184598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33330508 - 33330433
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33330508 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33330433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 6438523 - 6438595
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  6438523 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 6438595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 16838777 - 16838841
Alignment:
Q  77 taatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16838777 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 16838841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Original strand, 18234334 - 18234367
Alignment:
Q  295 cccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18234334 cccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 18234367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 27165702 - 27165767
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaa 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  27165702 ggtccaatatgacctactatgggggacagagtagccctccaatcaactaagatgaaagtgatacaa 27165767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 28137605 - 28137640
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137605 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 28137640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 33211382 - 33211417
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33211382 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 33211417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 12195525 - 12195579
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12195525 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 12195579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31077026 - 31076893
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaag 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |   ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||| ||| || |||   ||    
T  31077026 ctagtttagtccaatatgacctactctctaggagatagcagctctccaatccactaagataaaagtgatacaaatgggttacaataaattagcttaagag 31076927  T
Q  155 cttacacaagaacaagacctaatttctacccattt 189  Q
     | ||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  31076926 ttcaca-aagaacaagacctaatttttatccattt 31076893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 2171729 - 2171762
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171729 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 2171762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Original strand, 3039103 - 3039140
Alignment:
Q  276 caagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctc 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3039103 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctc 3039140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 328
Target Start/End: Original strand, 5385794 - 5385878
Alignment:
Q  243 ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||| || || |||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5385794 tttttatccttctaatggtgaaatctcactacttaaggtgattgcaatgtttcttaacccaa-tgaacctcactacaaagacactc 5385878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 33160552 - 33160585
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33160552 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 33160585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33721479 - 33721391
Alignment:
Q  221 aagagaagacacaaaaggaagcttttg-atcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttac-aatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33721479 aagagaaaacactaaagggagctttttcatcattccaataatgaaatctcacta-caaaggtgtttacaaatgtttcccaacctaagaga 33721391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16569015 - 16568979
Alignment:
Q  272 tacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16569015 tacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga 16568979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 2479351 - 2479620
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2479351 agttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttataagaaaatagcttgcaagctt 2479449  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  2479450 acacaagaacaagacctaatttctacccatgtgtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaagagaagatataaaaggaagcttttgatccttccaa 2479549  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2479550 tggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactataaagacactc 2479620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 47263692 - 47263950
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||| |||||||||||    
T  47263692 agttcggtccaatatgacctaatatgggggagag--cagctctccaatccactatgatgaaagtgttataa----------gaaaatagcttgcaagctt 47263779  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47263780 acacaagaacaagacctaatttctatccatttgtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaatagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 47263879  T
Q  258 tggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  47263880 tggtgaaatctcactacccaaggtatttacaatgtttcccaaccgaagagattctcactacaaagacactc 47263950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 302
Target Start/End: Original strand, 21983298 - 21983544
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa--gagttacaagaaaataacttgcaagc 155  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  21983298 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagcttgcaagc 21983397  T
Q  156 ttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattc 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  21983398 ttacacaagaacaagacctagtttctacccattttgtgtcacccactctcaaaata-tgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagcttatgatccttc 21983496  T
Q  255 caatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21983497 caatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccccaccc 21983544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 29159770 - 29160091
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  29159770 agataagcaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatcca 29159867  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca--tttgtgttacccactctct 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  29159868 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcacccactctca 29159967  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--c 302  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  29159968 caat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatgttgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctc 29160065  T
Q  303 aagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||    
T  29160066 aagagaacctcactataaagacactc 29160091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 21639830 - 21640096
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21639830 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 21639929  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  21639930 aacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtg 21640028  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21640029 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactc 21640096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 18408785 - 18409050
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18408785 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaataacttgcaagcttacacaag 18408884  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtga 263  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||| ||  ||||||||    
T  18408885 aacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaaggaagacacaagaggaagcttaagatccttttaatggtga 18408983  T
Q  264 aatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408984 aatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 18409050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44848767 - 44848567
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44848767 agttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaaagcttgcaagctt 44848668  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44848667 acacaagaataagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatgaactctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 44848568  T
Q  258 t 258  Q
    |    
T  44848567 t 44848567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Original strand, 49091628 - 49091924
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  49091628 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacgcaccaagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatcca 49091725  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatt-tgtgttacccactctctc 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  49091726 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattctgtgtcacccacactctc 49091825  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49091826 cataatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgttttcaatgtttcccaacccaag 49091924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 21988874 - 21989192
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  || || |||||||||    
T  21988874 agataagcaatgaaagaaaa-ggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagag--caactctccaatcca 21988970  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa--gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctct 205  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||      
T  21988971 ctttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagattgcaagcttatacaagaataaaacctagtttctacccattttgtgtcacccactctaa 21989070  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
     |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21989071 aaata-tgaaccctaaagagaaaacaataaaggaagcttatgatccttccaatggtaaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 21989169  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21989170 agatcctcactacaaagacactc 21989192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 18413662 - 18413926
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  18413662 ccaatatggcctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagattgcaagcttacacaag 18413760  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtga 263  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18413761 aacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaaggaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtga 18413859  T
Q  264 aatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413860 aatctcactacccaaggtgtttacattgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 18413926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2647826 - 2647510
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |     | || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||    
T  2647826 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacatcaagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatcca 2647729  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  2647728 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 2647629  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    |||   ||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  2647628 aat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaatgaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgcttaccatgtttcccaacccaag 2647533  T
Q  306 agatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2647532 agatcctcactacaaagacactc 2647510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9190138 - 9189825
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9190138 agataagcaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 9190041  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt---gtgttacccactctc 204  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    | | |||||| |||    
T  9190040 ctaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactc 9189941  T
Q  205 tcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccca 303  Q
    |   ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9189940 t---taatgaatcct-aagagaaaacacacaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 9189845  T
Q  304 agagatcctcactacaaaga 323  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  9189844 agagaaccttactacaaaga 9189825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 21646028 - 21646294
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa-taacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21646028 ccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 21646127  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  21646128 aacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagatttagatccttccaatggtg 21646226  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21646227 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactc 21646294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 46516440 - 46516118
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  46516440 agataaacaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatcca 46516343  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctc-- 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |      
T  46516342 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccattttgtgtcacccacacacac 46516243  T
Q  205 -tcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccc 302  Q
      ||  ||||||  || ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  46516242 tccaccaatgaa-tcttaagagaaaacacaaaatgaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaactc 46516144  T
Q  303 aagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  46516143 aagagatcctcactacaaagacactc 46516118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Original strand, 20284072 - 20284373
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20284072 aaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttac 20284171  T
Q  127 aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtta---cccactctctcaataatgaaccctaaag 223  Q
    || | ||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||   ||||| ||||||||   ||| ||||| |    
T  20284172 aatgcgttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccttttttcatatcacccacactctcaat---gaatcctaa-g 20284267  T
Q  224 agaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaag 322  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20284268 agaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaag 20284367  T
Q  323 acactc 328  Q
    ||||||    
T  20284368 acactc 20284373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 2580354 - 2580673
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaa-aggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcc 107  Q
    |||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||| |     | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2580354 agataagcaatgaaaaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcc 2580453  T
Q  108 actatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt---gtgttacccactctc 204  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    | | |||||| |||    
T  2580454 actaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttttcatatcacccacactc 2580553  T
Q  205 tcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccca 303  Q
    ||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2580554 tc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaaccca 2580649  T
Q  304 agagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  2580650 agagaacctcac-acaaagacactc 2580673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 290
Target Start/End: Original strand, 55931 - 56195
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||  |     |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  55931 aaaggaacaaacacaccaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttac 56029  T
Q  127 aaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  56030 aaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct-aaga 56128  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaat 290  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56129 gaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaat 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4796781 - 4796481
Alignment:
Q  32 aaaggaacaaacacaccaagattgcta-----gtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| ||||||    
T  4796781 aaaggaacaaacacaccaagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttac 4796682  T
Q  127 aaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccactctctcaataatgaaccctaaaga 224  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||  |||||||   ||| ||||| ||    
T  4796681 aaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctcatttatacccattttgtgtcacctacattctcaat---gaatcctaa-ga 4796586  T
Q  225 gaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaaga 323  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796585 gaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagatcctcactacaaaga 4796486  T
Q  324 cactc 328  Q
    |||||    
T  4796485 cactc 4796481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33332580 - 33332263
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |     |||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  33332580 agataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 33332483  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca--tttgtgttacccactctct 205  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| | || ||| ||||    
T  33332482 ctaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctactcatttttgtatcacgcacactct 33332383  T
Q  206 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 304  Q
    |   |||||  ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33332382 c---aatgattcct-aagagaaaacacaaagggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttctcaacccaa 33332287  T
Q  305 gagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  33332286 gagaaccttactacaaaaacactc 33332263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23403141 - 23402826
Alignment:
Q  16 ataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccact 110  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |     | || |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||| |||    
T  23403141 ataagcaatgaaagaaa--ggaacaaacacactaagattgttgacccaattcggtctaatatgacctaatctgagggagtgagcagccctccaatctact 23403044  T
Q  111 atgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg---ttacccactctctca 207  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    | || ||| ||||||    
T  23403043 aagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcacatcactcacactctca 23402944  T
Q  208 ataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaaga 306  Q
    ||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23402943 at---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 23402848  T
Q  307 gatcctcactacaaagacactc 328  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  23402847 gaacctcactacaaagacactc 23402826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1533519 - 1533250
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  1533519 ccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaa 1533420  T
Q  164 g-aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatgg 260  Q
    | |||||||||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  1533419 gaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatgg 1533321  T
Q  261 tgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  1533320 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 1533250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9185248 - 9184987
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagctt 157  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||    
T  9185248 agttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagcttgcaagctt 9185158  T
Q  158 acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtta---cccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcatt 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||   ||||| ||||   ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||    
T  9185157 acacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactct---taatgaatcctaa-gagaaaacacacaaggaagctttttgatcctt 9185062  T
Q  254 ccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9185061 ccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaccttactacaaagatactc 9184987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 305
Target Start/End: Original strand, 35960803 - 35961078
Alignment:
Q  36 gaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa- 129  Q
    |||||||||||||||||||| |     |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35960803 gaacaaacacaccaagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaat 35960902  T
Q  130 gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaaga 229  Q
    |||||| |||||| || |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |  | | | | |||||  |||||  || ||||||| |    
T  35960903 gagttagaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttcatatcacccacactcaaagatgaa-tcttaagagaaaa 35961001  T
Q  230 cacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaag 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35961002 cgcaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 35961078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 3047268 - 3047538
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatggggg-agagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagc 155  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||  ||||    
T  3047268 agttcggtccaatatgacctgctctggggggagagagccgttatccaatccactaatatgaaagtggtacaaatgagttacaagaaatcaacttaaaagc 3047367  T
Q  156 ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt--gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcat 252  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||   ||| | ||| || || |||||||||||||||||| |||| |    
T  3047368 tcaca-aagaacaagacctaatttctacccatttttaagtcacccacactctcaat---gaatcttaa-gataaaacacaaaaggaagctttttgatcct 3047462  T
Q  253 tccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3047463 tccaatgatgaaatctcactacccaagatgattatagtgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactc 3047538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 2057987 - 2058259
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||    
T  2057987 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaa 2058086  T
Q  164 gaacaagacctaatttctacccatttgt--gttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc---aa 257  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||   || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| | ||   |     
T  2058087 gaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatcctcccccaac 2058185  T
Q  258 tggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |  |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  2058186 taatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactc 2058259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20357622 - 20357353
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagc-ttacaca 162  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | ||||| |||||||    
T  20357622 ccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacaca 20357524  T
Q  163 agaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-tg 259  Q
    |||||| | ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |     
T  20357523 agaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaacta 20357425  T
Q  260 gtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
     |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  20357424 atgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactc 20357353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5817352 - 5817083
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagag-ttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  | |   ||||    
T  5817352 agttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgatacaaaggggttacaagaaatttgcataagagct 5817254  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccatttgt---gttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcat 252  Q
     ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |   || || ||| ||||||||   ||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||| |    
T  5817253 caca-aagaacaaaacctaatttctatccatttttcaagtcactcacactctcaat---gaatcctaa-gaaaaaacacaaaaggaagctttttgatcct 5817159  T
Q  253 tccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5817158 tccaatggtgaaatctcactccccaaggtatttacaatgtttcccaaccaaatagaacctcactacaaagacactc 5817083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9235605 - 9235398
Alignment:
Q  118 aagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtta---cccactctctcaataatga 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||   ||| | |||||||    ||    
T  9235605 aagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccgcactctcaac---ga 9235509  T
Q  215 accctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctc 313  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9235508 atcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttgcaatggtgaaatatcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaatctc 9235410  T
Q  314 actacaaagaca 325  Q
    ||||| ||||||    
T  9235409 actacgaagaca 9235398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44848014 - 44847938
Alignment:
Q  252 ttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44848014 ttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 44847938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28617308 - 28617177
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaa-agagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || |||  |||||    
T  28617308 agttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaatggggttacaagaaattagcttaaaagct 28617209  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctacccattt 189  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28617208 caca-aagaacaaaacctaatttctacctattt 28617177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 19992335 - 19992408
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  19992335 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 19992408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24024389 - 24024316
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  24024389 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaatgttacaaga 24024316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Original strand, 4866752 - 4866814
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 129  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4866752 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 4866814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 12396933 - 12397007
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12396933 ccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 12397007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 16880095 - 16880169
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  16880095 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttacaaagagttacaagaa 16880169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 16884951 - 16885025
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  16884951 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttacaaagagttacaagaa 16885025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 328
Target Start/End: Original strand, 49091918 - 49091973
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49091918 acccaaggtgttttcaatgtttcccaacccaagatatcctcagtacaaagacactc 49091973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31109646 - 31109573
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  31109646 ccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 31109573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 313
Target Start/End: Original strand, 12098056 - 12098096
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12098056 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctc 12098096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24261386 - 24261311
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24261386 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24261311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24266265 - 24266190
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24266265 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24266190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 12406353 - 12406427
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 141  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12406353 ccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 12406427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 7351662 - 7351716
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7351662 agttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactat 7351716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 308
Target Start/End: Original strand, 41649206 - 41649242
Alignment:
Q  272 tacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41649206 tacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 41649242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1113628 - 1113593
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1113628 acccaagttgtttacaatgtttcccaacccaagaga 1113593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4586132 - 4586097
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4586132 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 4586097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 31733166 - 31733201
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733166 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 31733201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 38671419 - 38671454
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38671419 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 38671454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43864215 - 43864180
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43864215 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 43864180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Original strand, 47676333 - 47676368
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47676333 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 47676368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48489402 - 48489367
Alignment:
Q  273 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48489402 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 48489367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 328
Target Start/End: Original strand, 79634 - 79672
Alignment:
Q  290 tgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  79634 tgttttccaacccaaaagatcctcactacaaagacactc 79672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19502156 - 19502114
Alignment:
Q  266 tctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502156 tctcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 19502114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 31155921 - 31155975
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31155921 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31155975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4178744 - 4178711
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4178744 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 4178711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Original strand, 7349288 - 7349337
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7349288 ggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 7349337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 24514959 - 24514992
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514959 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 24514992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29991024 - 29990991
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29991024 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 29990991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35853884 - 35853851
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853884 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 35853851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39731346 - 39731313
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39731346 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 39731313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 41317633 - 41317666
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317633 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 41317666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48408772 - 48408739
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48408772 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 48408739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18027 - 17761
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18027 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 17928  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  17927 aacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtg 17829  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17828 aaatctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactc 17761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24120 - 23854
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaag-aaaataacttgcaagcttacacaag 164  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24120 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 24021  T
Q  165 aacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtg 262  Q
    |||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  24020 aacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtg 23922  T
Q  263 aaatctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23921 aaatctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactc 23854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 64 - 328
Target Start/End: Original strand, 85703 - 85967
Alignment:
Q  64 gtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaa 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  85703 gtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaa 85802  T
Q  164 gaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaa-agagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggt 261  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||| |||||  |||| ||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  85803 gagcaagacctaatttctacccattttgtgtctcccactcccacaat-atgaattctaagaga-aaaacacaaaaggaagtttttgatccttccaatggt 85900  T
Q  262 gaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85901 gaaatctcactacccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 85967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 10696 - 11017
Alignment:
Q  14 agataatcaatgaaagaaaaaggaacaaacacaccaagattgct-----agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatcca 108  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10696 agataagcaatgaaagaga--ggaacaaacacaccaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatcca 10793  T
Q  109 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctc 206  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||      
T  10794 ctaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctatctattttgtgtcacccactctcat 10893  T
Q  207 aataatgaaccctaaagagaagaca-caaaaggaagc-ttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacc--c 302  Q
     || ||||| ||| ||||||| |||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  10894 gat-atgaatcct-aagagaaaacagaaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctc 10991  T
Q  303 aagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  10992 aagagaacctcactacaaagacactc 11017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 328
Target Start/End: Original strand, 17277 - 17535
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagct 156  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||    
T  17277 agttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagct 17376  T
Q  157 tacacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||           
T  17377 tacacaagaacaagacctaatttctacctattttgtgtcactcacactct---taatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagtttttga------- 17465  T
Q  256 aatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactc 328  Q
       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17466 ---ggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagatctccactacaaagacactc 17535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Original strand, 45371 - 45475
Alignment:
Q  217 cctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcact 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45371 cctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcacaacccaagagatcctcact 45470  T
Q  317 acaaa 321  Q
    |||||    
T  45471 acaaa 45475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 45267 - 45337
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaa 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45267 agttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 23540 - 23812
Alignment:
Q  56 ctagtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagag-----ttacaagaaaataacttg 150  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||     |||||||||| |  |||     
T  23540 ctagttcggtccaatatgacctactttaggggagaaagaagctatccaattcactaagatgaaagtgatacaaataggttaattacaagaaattttctta 23639  T
Q  151 caagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttg--tgttacccactctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagc--tttt 246  Q
     ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||   ||| |  ||| ||| ||||   ||| ||||| ||||| |||||||| || ||  ||||    
T  23640 gaagctcacaaaa-aacaagatctaatttctacccattttcatgtcagacacactcacaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaatgatgccttttt 23734  T
Q  247 gatcattccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagac 324  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23735 tatccttctaatggtgacatctcactacccaaggtgattacaattttttccaacccaatagaacctcactataaagac 23812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9705 - 9632
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9705 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 9632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 35125 - 35063
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 129  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35125 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 35063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14372 - 14297
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14372 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 14297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33432 - 33384
Alignment:
Q  277 aagatgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 325  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33432 aagatgtttataatgttttccaacccaagagatcgtcactacaaagaca 33384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 385 - 457
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  385 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2314 - 2239
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2314 ccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 149019 - 148944
Alignment:
Q  66 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 141  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  149019 ccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 148944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 319 - 265
Alignment:
Q  58 agtttggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  319 agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 886 - 853
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  886 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 11360 - 11393
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11360 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 11393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Original strand, 11488 - 11537
Alignment:
Q  63 ggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctatccaatccactat 112  Q
    |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11488 ggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactat 11537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 114572 - 114539
Alignment:
Q  275 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  114572 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 114539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University