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Alignment Overview

Query: NF14944_high_8 (Length: 467)

Name: NF14944_high_8
Description: NF14944
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14944_high_8
NF14944_high_8
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (23-315)||(31786435-31786724)
chr5 (26-314)||(699250-699535)
chr5 (26-355)||(22980893-22981218)
chr5 (26-314)||(12910455-12910740)
chr5 (23-355)||(40133482-40133810)
chr5 (23-355)||(36866859-36867187)
chr5 (26-315)||(35504465-35504751)
chr5 (26-315)||(38528026-38528311)
chr5 (23-315)||(22255279-22255568)
chr5 (23-315)||(33908330-33908618)
chr5 (26-315)||(15992329-15992615)
chr5 (26-355)||(35511232-35511552)
chr5 (26-315)||(7208653-7208938)
chr5 (26-315)||(19119959-19120245)
chr5 (26-315)||(22973871-22974157)
chr5 (26-315)||(31705401-31705686)
chr5 (26-315)||(39572919-39573197)
chr5 (26-316)||(30969112-30969399)
chr5 (26-315)||(35826275-35826558)
chr5 (66-314)||(5830032-5830278)
chr5 (26-356)||(36860523-36860850)
chr5 (23-315)||(27330401-27330690)
chr5 (27-315)||(23116019-23116296)
chr5 (23-315)||(8741674-8741964)
chr5 (26-315)||(8437066-8437351)
chr5 (23-315)||(35933992-35934282)
chr5 (21-315)||(25500715-25501006)
chr5 (26-356)||(27318237-27318562)
chr5 (26-315)||(5837655-5837941)
chr5 (26-315)||(24886204-24886473)
chr5 (45-315)||(17157820-17158087)
chr5 (23-316)||(7693327-7693608)
chr5 (26-316)||(21088557-21088841)
chr5 (48-279)||(13956187-13956415)
chr5 (74-315)||(2888234-2888472)
chr5 (26-315)||(9200333-9200610)
chr5 (26-315)||(22019732-22020009)
chr5 (26-315)||(32563249-32563526)
chr5 (46-315)||(42342851-42343107)
chr5 (23-315)||(23954591-23954867)
chr5 (23-315)||(14409130-14409404)
chr5 (26-315)||(14919328-14919603)
chr5 (23-315)||(43308449-43308730)
chr5 (149-314)||(25889593-25889755)
chr5 (31-315)||(15724594-15724874)
chr5 (21-280)||(1428983-1429225)
chr5 (77-315)||(25669737-25669962)
chr5 (27-315)||(8466845-8467112)
chr5 (34-254)||(6824331-6824546)
chr5 (26-180)||(26268174-26268328)
chr5 (23-168)||(5112247-5112391)
chr5 (185-315)||(28416340-28416470)
chr5 (228-314)||(43254154-43254240)
chr5 (27-134)||(28416494-28416601)
chr5 (189-315)||(26269069-26269195)
chr5 (23-81)||(25668746-25668804)
chr5 (120-171)||(11898148-11898199)
chr5 (26-63)||(11898102-11898139)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (26-355)||(18797402-18797727)
chr7 (26-315)||(9355626-9355912)
chr7 (23-315)||(15612559-15612848)
chr7 (23-315)||(41764878-41765167)
chr7 (27-309)||(27283820-27284100)
chr7 (26-313)||(30055602-30055886)
chr7 (23-352)||(23111262-23111589)
chr7 (23-315)||(32820853-32821142)
chr7 (23-353)||(24211813-24212140)
chr7 (26-315)||(31578864-31579150)
chr7 (44-315)||(6546612-6546880)
chr7 (26-314)||(37109947-37110234)
chr7 (26-357)||(7334869-7335195)
chr7 (26-350)||(10481680-10482000)
chr7 (26-315)||(4582994-4583280)
chr7 (23-315)||(5657280-5657570)
chr7 (26-315)||(37347097-37347382)
chr7 (44-315)||(15672559-15672830)
chr7 (26-315)||(10359014-10359300)
chr7 (26-354)||(32432527-32432851)
chr7 (26-309)||(11071281-11071558)
chr7 (27-315)||(22687315-22687592)
chr7 (59-315)||(37703298-37703551)
chr7 (26-314)||(17842385-17842672)
chr7 (26-315)||(21991711-21991988)
chr7 (26-358)||(48928055-48928382)
chr7 (26-355)||(29173615-29173922)
chr7 (23-315)||(8861357-8861646)
chr7 (59-315)||(46480929-46481182)
chr7 (47-285)||(12165848-12166074)
chr7 (35-308)||(37704241-37704536)
chr7 (23-316)||(25691343-25691633)
chr7 (26-315)||(31520541-31520809)
chr7 (23-315)||(44598738-44599027)
chr7 (26-315)||(43925177-43925456)
chr7 (70-315)||(26587892-26588126)
chr7 (26-225)||(38258620-38258816)
chr7 (23-244)||(43686112-43686330)
chr7 (23-315)||(26980395-26980667)
chr7 (99-357)||(35353256-35353510)
chr7 (26-314)||(12390450-12390716)
chr7 (142-310)||(44411345-44411510)
chr7 (23-260)||(33688117-33688351)
chr7 (27-315)||(32593007-32593273)
chr7 (26-205)||(48928474-48928649)
chr7 (26-179)||(27421313-27421465)
chr7 (190-297)||(34361996-34362103)
chr7 (242-358)||(38258867-38258982)
chr7 (27-140)||(44413351-44413464)
chr7 (127-244)||(38053637-38053751)
chr7 (23-75)||(26524364-26524416)
chr7 (59-118)||(38053586-38053645)
chr7 (23-65)||(34362149-34362191)
chr7 (44-77)||(35353202-35353235)
chr7 (280-316)||(12166215-12166251)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (23-314)||(27227280-27227568)
chr1 (23-314)||(16415739-16416027)
chr1 (26-315)||(15383029-15383316)
chr1 (23-355)||(32216148-32216476)
chr1 (26-315)||(2959844-2960130)
chr1 (23-355)||(8222221-8222549)
chr1 (27-312)||(47682291-47682573)
chr1 (26-355)||(10922823-10923148)
chr1 (23-314)||(27266995-27267282)
chr1 (23-316)||(25160725-25161016)
chr1 (26-315)||(238307-238593)
chr1 (23-355)||(47279282-47279611)
chr1 (23-314)||(10181802-10182091)
chr1 (23-356)||(15752122-15752451)
chr1 (23-315)||(27532776-27533063)
chr1 (23-365)||(34012128-34012460)
chr1 (27-314)||(4330378-4330662)
chr1 (26-316)||(30254519-30254806)
chr1 (26-316)||(38823310-38823597)
chr1 (26-315)||(7078857-7079143)
chr1 (26-315)||(37451382-37451667)
chr1 (23-315)||(15168189-15168478)
chr1 (23-314)||(19899563-19899852)
chr1 (26-315)||(9902848-9903134)
chr1 (26-316)||(23999443-23999731)
chr1 (23-316)||(39393476-39393767)
chr1 (26-315)||(51128955-51129239)
chr1 (25-309)||(30326751-30327033)
chr1 (26-355)||(32267130-32267455)
chr1 (26-315)||(27763104-27763391)
chr1 (26-315)||(28564577-28564861)
chr1 (23-315)||(14758134-14758414)
chr1 (26-314)||(27563700-27563985)
chr1 (26-316)||(42721135-42721419)
chr1 (23-315)||(28769745-28770035)
chr1 (24-315)||(46931505-46931792)
chr1 (23-315)||(31621342-31621636)
chr1 (27-315)||(3309244-3309536)
chr1 (26-315)||(3535028-3535305)
chr1 (26-315)||(22170807-22171093)
chr1 (59-315)||(1547408-1547653)
chr1 (26-295)||(18422747-18423006)
chr1 (26-315)||(11742162-11742430)
chr1 (23-314)||(41926256-41926537)
chr1 (23-287)||(40884906-40885167)
chr1 (23-315)||(33725405-33725683)
chr1 (122-315)||(48353735-48353924)
chr1 (122-355)||(1359691-1359919)
chr1 (26-281)||(37618729-37618974)
chr1 (144-314)||(21289817-21289981)
chr1 (26-134)||(48620733-48620841)
chr1 (49-246)||(38759652-38759846)
chr1 (217-315)||(31962900-31962999)
chr1 (255-315)||(48620911-48620971)
chr1 (23-74)||(21289765-21289816)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (23-355)||(46297522-46297850)
chr3 (23-314)||(52040722-52041010)
chr3 (23-354)||(39282740-39283067)
chr3 (26-355)||(26941020-26941345)
chr3 (26-313)||(42505876-42506160)
chr3 (25-314)||(53228952-53229238)
chr3 (23-315)||(48355029-48355318)
chr3 (26-357)||(33378543-33378870)
chr3 (49-355)||(22622478-22622780)
chr3 (23-316)||(44891585-44891875)
chr3 (26-315)||(40552058-40552344)
chr3 (26-315)||(24707914-24708202)
chr3 (23-355)||(37157795-37158124)
chr3 (23-355)||(37203155-37203484)
chr3 (47-315)||(33698265-33698530)
chr3 (23-314)||(3362341-3362631)
chr3 (26-357)||(4015551-4015877)
chr3 (26-316)||(7327280-7327567)
chr3 (25-314)||(11357181-11357450)
chr3 (23-315)||(22451056-22451345)
chr3 (23-315)||(2008021-2008316)
chr3 (26-287)||(34133026-34133284)
chr3 (26-285)||(46994490-46994746)
chr3 (26-356)||(21009560-21009887)
chr3 (26-315)||(3654998-3655287)
chr3 (53-316)||(1089811-1090071)
chr3 (26-315)||(4761447-4761734)
chr3 (26-315)||(21193697-21193984)
chr3 (26-315)||(47481613-47481900)
chr3 (23-315)||(32373558-32373846)
chr3 (26-316)||(25579830-25580117)
chr3 (26-315)||(24488761-24489047)
chr3 (23-314)||(22445865-22446153)
chr3 (26-355)||(29099446-29099763)
chr3 (26-355)||(43975652-43975973)
chr3 (41-315)||(54505913-54506185)
chr3 (26-315)||(44186316-44186586)
chr3 (26-269)||(54828546-54828786)
chr3 (46-315)||(14586479-14586735)
chr3 (29-316)||(29163912-29164180)
chr3 (23-287)||(38591786-38592047)
chr3 (42-355)||(36012244-36012556)
chr3 (25-253)||(45174595-45174821)
chr3 (23-315)||(11466912-11467187)
chr3 (23-244)||(43348346-43348563)
chr3 (26-308)||(27480164-27480464)
chr3 (26-315)||(40936082-40936350)
chr3 (144-357)||(51212535-51212738)
chr3 (121-315)||(11356957-11357140)
chr3 (26-167)||(53176145-53176286)
chr3 (23-134)||(51212958-51213069)
chr3 (44-253)||(11835494-11835695)
chr3 (92-315)||(20373062-20373263)
chr3 (26-180)||(35844417-35844571)
chr3 (145-315)||(50475021-50475195)
chr3 (26-107)||(20373300-20373381)
chr3 (143-251)||(53811597-53811698)
chr3 (44-78)||(53811695-53811729)
chr3 (268-315)||(35844577-35844624)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (26-357)||(41960940-41961267)
chr2 (26-355)||(4763731-4764057)
chr2 (23-355)||(4167019-4167347)
chr2 (21-315)||(2325195-2325478)
chr2 (26-315)||(43648062-43648348)
chr2 (26-316)||(26357677-26357964)
chr2 (26-315)||(39167186-39167466)
chr2 (26-315)||(33709049-33709335)
chr2 (30-315)||(44913766-44914053)
chr2 (26-315)||(18494098-18494383)
chr2 (26-315)||(19289140-19289426)
chr2 (27-314)||(29241963-29242240)
chr2 (22-315)||(41465597-41465887)
chr2 (26-355)||(33550760-33551089)
chr2 (26-353)||(3177039-3177362)
chr2 (26-315)||(11366197-11366484)
chr2 (26-315)||(37905808-37906097)
chr2 (26-315)||(31570551-31570837)
chr2 (23-315)||(33660194-33660474)
chr2 (27-315)||(31861953-31862238)
chr2 (23-361)||(19424414-19424734)
chr2 (23-281)||(4478466-4478717)
chr2 (52-315)||(35959023-35959278)
chr2 (23-265)||(44286046-44286285)
chr2 (23-315)||(43770665-43770945)
chr2 (26-315)||(13711564-13711845)
chr2 (26-287)||(27349793-27350041)
chr2 (26-282)||(4263926-4264180)
chr2 (25-315)||(7006755-7007025)
chr2 (26-315)||(5881639-5881915)
chr2 (26-223)||(17071646-17071840)
chr2 (26-234)||(45327820-45328025)
chr2 (26-234)||(36642086-36642293)
chr2 (121-308)||(19500739-19500923)
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chr2 (26-268)||(19313952-19314186)
chr2 (356-446)||(2324557-2324647)
chr2 (26-171)||(33902166-33902311)
chr2 (23-203)||(41463779-41463956)
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chr2 (67-209)||(18258210-18258349)
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chr2 (377-456)||(2337804-2337883)
chr2 (365-456)||(2344686-2344777)
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chr2 (267-315)||(45328028-45328076)
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chr2 (258-303)||(17071601-17071646)
[»] chr8 (49 HSPs)
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[»] chr4 (55 HSPs)
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[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (26-315)||(3879737-3880023)
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[»] scaffold0318 (1 HSPs)
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[»] scaffold0291 (1 HSPs)
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[»] scaffold0022 (1 HSPs)
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[»] scaffold0061 (1 HSPs)
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[»] scaffold0017 (1 HSPs)
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[»] scaffold0008 (1 HSPs)
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[»] scaffold0009 (2 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31786724 - 31786435
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  31786724 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccc 31786625  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31786624 tacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatg 31786528  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31786527 ttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaacttttt 31786435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Original strand, 699250 - 699535
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| | ||||    
T  699250 catcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccac 699349  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  699350 aaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 699446  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  699447 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 699535  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 22980893 - 22981218
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||    
T  22980893 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcac 22980992  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  22980993 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttg 22981089  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  22981090 caatcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt-taaaaagt 22981188  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22981189 cagtttcctgactgcaccatagaagctccc 22981218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Original strand, 12910455 - 12910740
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12910455 catcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 12910554  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| |||  ||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  12910555 aaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgt---taaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgttg 12910651  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12910652 caagcattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 12910740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 40133482 - 40133810
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  40133482 tggcatcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 40133581  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  40133582 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 40133678  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||          
T  40133679 ttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaac-tttttcaaaaa 40133777  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40133778 agtcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 40133810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 36866859 - 36867187
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  36866859 tggcatcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 36866958  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  36866959 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 36867055  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||          
T  36867056 ttgcaaacattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttt-aaaaa 36867154  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36867155 agtcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 36867187  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 35504465 - 35504751
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  35504465 catcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctaccatattataagcgtaacaccccac 35504564  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35504565 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 35504661  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  35504662 caagtattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattgacttttt 35504751  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 38528311 - 38528026
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  38528311 catcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccac 38528213  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  38528212 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaa---agatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttg 38528116  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38528115 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 38528026  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 22255279 - 22255568
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||| |||| ||||| ||     
T  22255279 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacacca 22255378  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||   | || |||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  22255379 cacaaagtgtaacacttaaaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---atattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 22255475  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22255476 ttgcaagccttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 22255568  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 33908330 - 33908618
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||    
T  33908330 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccc 33908429  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  33908430 cagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 33908526  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33908527 ttgcaagcattactagat-aattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 33908618  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15992615 - 15992329
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||    
T  15992615 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgatttgagtgcaacaccccac 15992516  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  15992515 aaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtaccggtaagtccaagatgttg 15992419  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15992418 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 15992329  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35511552 - 35511232
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  35511552 catcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccac 35511453  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| ||     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  35511452 aaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttg 35511361  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||       ||    
T  35511360 caagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttt-aaaaaagt 35511262  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35511261 cagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 35511232  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7208938 - 7208653
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| || |||    
T  7208938 catcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcac 7208840  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  7208839 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattttcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttg 7208743  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  7208742 caagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaacttttt 7208653  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 19119959 - 19120245
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  19119959 catcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacaccccac 19120058  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| ||  || || |||||||||    
T  19120059 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttg 19120155  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19120156 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 19120245  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22974157 - 22973871
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| ||||| || |||    
T  22974157 catcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcac 22974058  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||  | || |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  22974057 aaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 22973961  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22973960 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 22973871  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31705686 - 31705401
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||  | |||    
T  31705686 catcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcac 31705588  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||    
T  31705587 aaaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttg 31705491  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  31705490 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaacttttt 31705401  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 39572919 - 39573197
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  39572919 catcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccac 39573018  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||  | |||||||||| |||||| ||||||||||           ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39573019 aaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaactctgtt-----------aaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 39573107  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39573108 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 39573197  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30969399 - 30969112
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||    
T  30969399 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcac 30969300  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||| |||| |||| |||||| || ||| | ||||||| ||    
T  30969299 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgt---taaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctg 30969203  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  30969202 caagtattactagatgagttactattaatcattaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttt 30969112  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35826558 - 35826275
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||    
T  35826558 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactccac 35826460  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||  ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35826459 aaagtgtaacccttaagattatca--taatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 35826365  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35826364 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 35826275  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 314
Target Start/End: Original strand, 5830032 - 5830278
Alignment:
Q  66 attaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaact 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830032 attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaact 5830131  T
Q  166 ctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagt 265  Q
    ||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5830132 ctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 5830228  T
Q  266 aatcaacaatttaaaaatg-aataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5830229 aatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttt 5830278  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 36860523 - 36860850
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgtttt-aagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  36860523 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacacccca 36860622  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||    
T  36860623 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaa---agatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgtt 36860719  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnng 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||       |    
T  36860720 gcaagcattactaaatgaattactattaatcatgaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaactttttt-aaaaaag 36860818  T
Q  325 tcagttttctgactgcaccgtaaaagctccca 356  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36860819 tcaattttctgactgcaccgtagaagcaccca 36860850  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 27330401 - 27330690
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27330401 tggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccc 27330500  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||  |||||| | |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||  |||| |||| || |||  ||||| |||||||||    
T  27330501 catgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatg 27330597  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27330598 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27330690  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23116296 - 23116019
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  23116296 atcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccaca 23116197  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  23116196 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 23116100  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||        | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23116099 aagcattac--------tgactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 23116019  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8741964 - 8741674
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||    
T  8741964 tggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacaccc 8741865  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataat-atcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||| || || | |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||    
T  8741864 tacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaat 8741768  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8741767 gttgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 8741674  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 8437066 - 8437351
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||   || ||||||    
T  8437066 catcaaaagttcagtcctcattatatcatcaac-catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccac 8437164  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  8437165 aatgtgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 8437261  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8437262 aaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaacttttt 8437351  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 35933992 - 35934282
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| ||    
T  35933992 tggcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacacc 35934091  T
Q  122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||   ||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||||||    
T  35934092 ctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaa---agatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagat 35934188  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||    
T  35934189 gttgcaagcattactagttgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaacttttt 35934282  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25501006 - 25500715
Alignment:
Q  21 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    |||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  25501006 actgccatcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 25500907  T
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||| ||||| | |||  |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||    
T  25500906 cccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaaga 25500810  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  25500809 tgttgcaagcattactagatgaaatactgttgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaacttttt 25500715  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27318562 - 27318237
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  27318562 catcaaaagtttagttctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 27318463  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||    ||| |  |||||||||    
T  27318462 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagta--cataagtttaagatgttg 27318368  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaa-tttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnng 324  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  27318367 caaacattactatatgaattactattgatcattaatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttt-aaaaaag 27318269  T
Q  325 tcagttttctgactgcaccgtaaaagctccca 356  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27318268 tcagttttctgactgcaccatagaaactccca 27318237  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 5837655 - 5837941
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||||||    
T  5837655 catcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccac 5837754  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||| |||||| || |||||| ||| || ||||||||||||    
T  5837755 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgt---taaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttg 5837851  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||    
T  5837852 caagcattactagatgaattactgttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaacctttt 5837941  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 24886204 - 24886473
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||           
T  24886204 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaac------- 24886296  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  24886297 ----------acttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 24886383  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24886384 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 24886473  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17158087 - 17157820
Alignment:
Q  45 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaac 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  |||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  17158087 atagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 17157988  T
Q  145 tatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat 244  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||  ||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157987 catcacataatattatcaactctgtttgcatg---ataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 17157891  T
Q  245 tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||    
T  17157890 tattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgacttttt 17157820  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 7693327 - 7693608
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  7693327 tggcatcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccc 7693426  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||         ||||| |||| | |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||| ||  ||||| || ||||||    
T  7693427 cacaaagtgtaacact---------cacatgatattagcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatg 7693514  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  7693515 ttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttt 7693608  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21088841 - 21088557
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  21088841 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccac 21088742  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  21088741 aaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttg 21088645  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||   |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  21088644 taagcattactagatgaattactattaatcatgaataaataat---caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaagttaattttttt 21088557  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13956415 - 13956187
Alignment:
Q  48 gtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||    
T  13956415 gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactat 13956316  T
Q  148 cacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 247  Q
    || ||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13956315 catataatatcatcaaatttgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 13956219  T
Q  248 tattgattattaatcagtaatcaacaatttaa 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13956218 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 13956187  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2888472 - 2888234
Alignment:
Q  74 gactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttga 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||   ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||     
T  2888472 gactacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgc 2888373  T
Q  174 atgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaaca 273  Q
    |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2888372 atgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaca 2888276  T
Q  274 atttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  2888275 atttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 2888234  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 9200333 - 9200610
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||    
T  9200333 catcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccac 9200432  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||         ||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| || ||| || |||||||||    
T  9200433 aaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttg 9200520  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||| |||||    
T  9200521 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaatttttt 9200610  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 22019732 - 22020009
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  22019732 catcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 22019831  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||| |||         ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||| ||| ||  ||||| || |||||||||    
T  22019832 aaagtataacact---------cacatgatatcagcaactctatttgcatgttaa---agatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttg 22019919  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22019920 taagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaacttttt 22020009  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 32563249 - 32563526
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  32563249 catcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccac 32563348  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||         ||||| |||||| |||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  32563349 aaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttat---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 32563436  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  32563437 caagaattactagataaattattattgatcattaatcagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 32563526  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Original strand, 42342851 - 42343107
Alignment:
Q  46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||           
T  42342851 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttact-tgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacact------- 42342942  T
Q  146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
      ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342943 --cacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatt 42343037  T
Q  246 actattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42343038 accattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 42343107  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23954867 - 23954591
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
T  23954867 tggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 23954768  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    || ||||||||||||| ||| ||  ||||| | |||||||    
T  23954767 cacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgtt----aaaatgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagatg 23954672  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
         | ||||||| |||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23954671 -----aacattacttgatgaattactattg-------atcattaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcataattaacttttt 23954591  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14409404 - 14409130
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  14409404 tggcatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac---- 14409310  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
             || | ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  14409309 ---------tact-cttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatg 14409223  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||    
T  14409222 ttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattattcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaattttt 14409130  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14919603 - 14919328
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| || |||    
T  14919603 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctcac 14919504  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||| |||| || |||    ||| |||||||| |||    
T  14919503 aaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagatattg 14919411  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| |      ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14919410 caatc------agatgaattac-attgatcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 14919328  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43308730 - 43308449
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||    
T  43308730 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccc 43308631  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
       ||||||||| |||||| |||||        ||||||||||||  ||| |||||||   |||| || || |||| |||||| |||||| || ||||||    
T  43308630 tgaaaagtgtaacacttaagactat--------atcatcaactcttcttgcatgttaa---agattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatg 43308542  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  43308541 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaacttttt 43308449  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 149 - 314
Target Start/End: Original strand, 25889593 - 25889755
Alignment:
Q  149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25889593 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatgaattact 25889689  T
Q  249 attgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25889690 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 25889755  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 15724594 - 15724874
Alignment:
Q  31 aaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagt 130  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| | || ||||||    
T  15724594 aaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgccccaaagt 15724692  T
Q  131 gtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagc 230  Q
    |||  | |||| ||||||| || |||||| ||||| |||||  |||||||   ||||| |||| |||| ||||||  ||||| ||||| || ||| ||||    
T  15724693 gtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaa---agatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaagc 15724789  T
Q  231 attactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  15724790 attactagatgaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaacttttt 15724874  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1429225 - 1428983
Alignment:
Q  21 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||      
T  1429225 actggcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac-- 1429128  T
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
                   |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  1429127 ---------------acttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaaga 1429046  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaa---tcaacaatttaaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  1429045 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatattcaacaatttaaa 1428983  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 315
Target Start/End: Original strand, 25669737 - 25669962
Alignment:
Q  77 tacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatg 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25669737 tacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacact---------cacatgatatcatcaactctgtttgcatg 25669826  T
Q  177 ttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatt 276  Q
    ||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25669827 ttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatt 25669923  T
Q  277 taaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  25669924 taaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 25669962  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Original strand, 8466845 - 8467112
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||            
T  8466845 atcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaac-------- 8466936  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
             |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||  || ||||   || ||  |||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  8466937 ---------acttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaa---aggtgt-aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgc 8467023  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8467024 aagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaaacattaaaaataaaattaacttttt 8467112  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6824546 - 6824331
Alignment:
Q  34 gttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgta 133  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6824546 gttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgta 6824447  T
Q  134 atacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcatt 233  Q
    | |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||| ||||   |||||||| ||| ||||| | | ||  ||||| || ||||||||||||||||     
T  6824446 acacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatc 6824352  T
Q  234 actagatgaattactattgat 254  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  6824351 actagatgagatactattgat 6824331  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 26268174 - 26268328
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||    
T  26268174 catcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcac 26268273  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  26268274 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaa 26268328  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5112391 - 5112247
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  5112391 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-accc 5112293  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctg 168  Q
    ||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5112292 cacaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaactctg 5112247  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 185 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28416470 - 28416340
Alignment:
Q  185 gatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 284  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  28416470 gatgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaaag 28416371  T
Q  285 aataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28416370 aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 28416340  T

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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 228 - 314
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254240
Alignment:
Q  228 agcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 43254240  T

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Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28416601 - 28416494
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||    
T  28416601 atcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccaca 28416502  T
Q  127 aagtgtaa 134  Q
    ||||||||    
T  28416501 aagtgtaa 28416494  T

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Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 315
Target Start/End: Original strand, 26269069 - 26269195
Alignment:
Q  189 ccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaata 288  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26269069 ccaaggataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaacc 26269168  T
Q  289 aaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||    
T  26269169 aatcattaagattaaaattaacttttt 26269195  T

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Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Original strand, 25668746 - 25668804
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacac 81  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25668746 tggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcattagattaacaagaatacac 25668804  T

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Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Original strand, 11898148 - 11898199
Alignment:
Q  120 ccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgttt 171  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11898148 ccccacaaagtgtaacccttaagaatatcacataacatcatcaactctgttt 11898199  T

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Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 63
Target Start/End: Original strand, 11898102 - 11898139
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatc 63  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11898102 catcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatc 11898139  T

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Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 18797402 - 18797727
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||    
T  18797402 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcac 18797501  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18797502 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 18797598  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  18797599 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt-aaaaaagt 18797697  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18797698 cagttttctgactgcatcataaaagctccc 18797727  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9355912 - 9355626
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9355912 catcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 9355813  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9355812 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttg 9355716  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9355715 caagcattactagatgaattgctattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 9355626  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15612848 - 15612559
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  15612848 tggcatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 15612749  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  15612748 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatg 15612652  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15612651 ttgcaagcattactagatgaattattgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 15612559  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41765167 - 41764878
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  41765167 tggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccc 41765068  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||     
T  41765067 cagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatt 41764971  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41764970 ttgcaagcattactggatgaattattattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaacctttt 41764878  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 309
Target Start/End: Original strand, 27283820 - 27284100
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  27283820 atcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccaca 27283919  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  27283920 aagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 27284016  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-gaataaaacattaagatcaaaattaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  27284017 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaa 27284100  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Original strand, 30055602 - 30055886
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||| ||| ||    
T  30055602 catcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccctac 30055701  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  30055702 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 30055798  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  30055799 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 30055886  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 352
Target Start/End: Original strand, 23111262 - 23111589
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttat-tc-taccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| |    
T  23111262 tggcatcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacac 23111361  T
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  23111362 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaaga 23111458  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnn 320  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||        
T  23111459 tgttgaaagcattactagaagaattactattgatcataaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaactttttt-aaa 23111557  T
Q  321 nnngtcagttttctgactgcaccgtaaaagct 352  Q
       |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23111558 aaagtcagttttctgactgtaccgtagaagct 23111589  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32821142 - 32820853
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  32821142 tggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 32821043  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  32821042 cataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 32820946  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32820945 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattcatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 32820853  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 353
Target Start/End: Original strand, 24211813 - 24212140
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||  ||    
T  24211813 tggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacatcc 24211912  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
     ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  24211913 tacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatg 24212009  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnn 321  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||         
T  24212010 ttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaa 24212108  T
Q  322 nngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctc 353  Q
      |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24212109 aagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctc 24212140  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31579150 - 31578864
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||| |     
T  31579150 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctat 31579051  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  31579050 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgt---taaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttg 31578954  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31578953 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaacttttt 31578864  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 315
Target Start/End: Original strand, 6546612 - 6546880
Alignment:
Q  44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |    
T  6546612 catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaata 6546711  T
Q  144 ctatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaa 243  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6546712 ttatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaa 6546808  T
Q  244 ttactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  6546809 ttactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 6546880  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Original strand, 37109947 - 37110234
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattcta--ccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||| |||| ||||| ||||    
T  37109947 catcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacacccc 37110046  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  37110047 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 37110143  T
Q  224 tgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  37110144 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 37110234  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 7334869 - 7335195
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  7334869 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 7334968  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    | ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7334969 agagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaacta-gtttgaatgttaa---agattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttg 7335064  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       ||    
T  7335065 caagcattactagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa-ttttttcaaaaaagt 7335163  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
    || ||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  7335164 caatttcctgactgcaccatagaagctcccaa 7335195  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 350
Target Start/End: Original strand, 10481680 - 10482000
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  10481680 catcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccac 10481779  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||| ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  10481780 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctctttgcatgt---caaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttg 10481876  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||       ||    
T  10481877 caagtattactagatgaattactattgatcgttaatcagtaattaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaac-tttttcaaaaaagt 10481975  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaag 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  10481976 cagttttctgactgcaccataaaag 10482000  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 4582994 - 4583280
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4582994 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 4583093  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||| | ||| ||  ||||| | ||||||||||    
T  4583094 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttg 4583190  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4583191 caagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttt 4583280  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5657570 - 5657280
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||    
T  5657570 tggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcc 5657471  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  5657470 cacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 5657374  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacatt-aagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  5657373 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaacttttt 5657280  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 37347097 - 37347382
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  | ||||    
T  37347097 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaaa-ctccac 37347195  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||    
T  37347196 aaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattg 37347292  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37347293 caagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttt 37347382  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672559
Alignment:
Q  44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |    
T  15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
Q  144 ctatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataa---tatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15672730 ctatcacataatatcatcaactctatttgaatgt---taaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagat 15672634  T
Q  241 gaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||    
T  15672633 gaattactattgatcatgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaatttttt 15672559  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10359300 - 10359014
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaa-tctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  10359300 catcaaaagttcagtc-tgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacccca 10359202  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||    
T  10359201 caaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagatttt 10359105  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10359104 gcaagcattactaaatgatttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaacttttt 10359014  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Original strand, 32432527 - 32432851
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  32432527 catcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 32432626  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |   || |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||    
T  32432627 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgca---tattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttg 32432723  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||       ||    
T  32432724 caagcattactagatgaattattattaatcatgaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaactttttt-aaaaaagt 32432822  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctcc 354  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32432823 cagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 32432851  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Original strand, 11071281 - 11071558
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  11071281 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 11071380  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||   ||||||   ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  11071381 aaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgt---taaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttg 11071474  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaa 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  11071475 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 11071558  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Original strand, 22687315 - 22687592
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22687315 atcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 22687414  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||           || |||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  22687415 aagtgtaacactcaagactatctcatgatatcaacaactctgtt-----------aaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 22687503  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  22687504 aagcattaatagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcatacattaagattaaaattaacttttt 22687592  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37703551 - 37703298
Alignment:
Q  59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  37703551 tcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatc 37703452  T
Q  159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattatt 258  Q
    ||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37703451 atcaactatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcatt 37703355  T
Q  259 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37703354 aatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttt 37703298  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17842672 - 17842385
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattcta--ccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||| |||| |||||  |||    
T  17842672 catcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatccc 17842573  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  17842572 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 17842476  T
Q  224 tgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  17842475 tgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 17842385  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 21991711 - 21991988
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21991711 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 21991810  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21991811 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 21991907  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||     |||||||||||||||||    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21991908 caagca-----agatgaattactattga----tcatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacctttt 21991988  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48928382 - 48928055
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||     
T  48928382 catcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcag 48928284  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  48928283 aaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaa---tgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 48928187  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||       ||    
T  48928186 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaa-tttttttaaaaaagt 48928088  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaat 358  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  48928087 caattttctaactgcaccgtagaagctcccaat 48928055  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 29173615 - 29173922
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||           
T  29173615 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgttac------- 29173707  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  29173708 ----------acttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaaa----tgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 29173793  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||       ||    
T  29173794 caagcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac-tttttcaaaaaagt 29173892  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29173893 cagttttctgactgcatcgtagaagctccc 29173922  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 8861357 - 8861646
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  8861357 tggcatcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 8861456  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    | |||||||||| ||| || || ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  8861457 cgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaa---agataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 8861553  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8861554 ttgcatgcattactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaacttttt 8861646  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46480929
Alignment:
Q  59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||  | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46481083  T
Q  159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattatt 258  Q
    || |||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46481082 attaactttgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcatt 46480986  T
Q  259 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46480985 aatcagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaacttttt 46480929  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 285
Target Start/End: Original strand, 12165848 - 12166074
Alignment:
Q  47 agtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaacta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||            
T  12165848 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact-------- 12165939  T
Q  147 tcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 246  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12165940 -cacataatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatta 12166035  T
Q  247 ctattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12166036 ctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704536
Alignment:
Q  35 ttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaa 134  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
Q  135 tacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa----------------------taaagatgccaacgataatatagtaactgtaa 212  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||                      |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37704341 cacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaa 37704440  T
Q  213 atccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaatta 308  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  37704441 gtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttacaaatgaatcaaacattaaaatcaagatta 37704536  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25691633 - 25691343
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||| |||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  25691633 tggcatcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 25691534  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||   ||||||||  |||||||| |||  |  ||||| | ||| |||    
T  25691533 cacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgt---taaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatg 25691437  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25691436 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaatttttt 25691343  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31520809 - 31520541
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||           
T  31520809 catcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaac------- 31520718  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  31520717 ----------acttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 31520631  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31520630 caagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttt 31520541  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 44598738 - 44599027
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  44598738 tggcatcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccc 44598837  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| || ||||||    
T  44598838 cacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatg 44598934  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatc---agtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   | ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| |||||||| |||||    
T  44598935 ttacaagcattactagatgaa--actattgatcattaatcaataataatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaattaatttttt 44599027  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 43925177 - 43925456
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| || |||    
T  43925177 catcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcac 43925275  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||       ||  ||||||||||||    
T  43925276 aacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaata------atacgtccaagatgttg 43925366  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43925367 caagcattactagatgaattactattaatcatgaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 43925456  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26587892
Alignment:
Q  70 acaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgt 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgt 26588027  T
Q  170 ttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatc 269  Q
    |           ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26588026 t-----------aaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 26587938  T
Q  270 aacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26587937 aacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 26587892  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 38258620 - 38258816
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  38258620 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 38258719  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  38258720 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 43686112 - 43686330
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  43686112 tggcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 43686211  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  43686212 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 43686308  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  43686309 ttgcaagcattactggatgaat 43686330  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 26980395 - 26980667
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  26980395 tggcatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac---- 26980490  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
                 |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  26980491 -------------acttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatg 26980574  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  26980575 ttgcaagtattactagatgaattattgttgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 26980667  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 357
Target Start/End: Original strand, 35353256 - 35353510
Alignment:
Q  99 taccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataa 198  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||   ||||| |||||||||    
T  35353256 taccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaa---agatgtcaacgataa 35353352  T
Q  199 tatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaag 298  Q
     ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35353353 aatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaag 35353452  T
Q  299 atcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
    |||||||||||| |||||       |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  35353453 atcaaaattaac-tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccttagaagctcccaa 35353510  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12390716 - 12390450
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||           
T  12390716 catcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaac------- 12390624  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||   ||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  12390623 ----------acttaagact--cacataatatcatcaactcagcttgcatgttaa---agatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 12390539  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12390538 caaccattactagatgaattactatttatcattaatcagtaattgacaatttaaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaactttt 12390450  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44411510 - 44411345
Alignment:
Q  142 aactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411510 aactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 44411414  T
Q  242 aattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaac 310  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44411413 aattaatattgaccattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatgaaacattaagatcataattaac 44411345  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33688351 - 33688117
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |    
T  33688351 tggcatcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactc 33688252  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| | | || ||||||| || |||||| |||||||||||| | ||   |||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  33688251 cataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagt---taaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 33688155  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33688154 ttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32593273 - 32593007
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||            
T  32593273 atcaaaagttcagtc-tcacagtatcatcaattcatcagattatcaaaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaac-------- 32593183  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
             |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  32593182 ---------acttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttac 32593095  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32593094 aaatattactagataaattactatggatcattaatcagcaatcaacaattt-aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaacttttt 32593007  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48928649 - 48928474
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| || ||     
T  48928649 catcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcag 48928551  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagta 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||    
T  48928550 aaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaaaatgccaacgataaaatagta 48928474  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27421465 - 27421313
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||    
T  27421465 catcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccac 27421367  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  || |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27421366 aaagtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34362103 - 34361996
Alignment:
Q  190 caacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataa 289  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  34362103 caacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtcattaacaatttaaaaatgaatca 34362004  T
Q  290 aacattaa 297  Q
    ||||||||    
T  34362003 aacattaa 34361996  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 358
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258982
Alignment:
Q  242 aattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactgca 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||        |||||||||||||||||    
T  38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaaaaatcagttttctgactgca 38258965  T
Q  342 ccgtaaaagctcccaat 358  Q
    ||||| |||||||||||    
T  38258966 ccgtagaagctcccaat 38258982  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44413464 - 44413351
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44413464 atcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccaca 44413365  T
Q  127 aagtgtaatactta 140  Q
    |||||||| |||||    
T  44413364 aagtgtaacactta 44413351  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 38053637 - 38053751
Alignment:
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  38053637 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgt---taaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 38053733  T
Q  227 aagcattactagatgaat 244  Q
    || ||||| | |||||||    
T  38053734 aaacattatttgatgaat 38053751  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 26524416 - 26524364
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 75  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26524416 tggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaaga 26524364  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 118
Target Start/End: Original strand, 38053586 - 38053645
Alignment:
Q  59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||    
T  38053586 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataagtgtaac 38053645  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 34362191 - 34362149
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcag 65  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  34362191 tggcatcaaaagttcagttcttatagtatcatcaattcatcag 34362149  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 77
Target Start/End: Original strand, 35353202 - 35353235
Alignment:
Q  44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagact 77  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35353202 catagtatcaccaattcatcagattaacaagact 35353235  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 316
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166251
Alignment:
Q  280 aaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttt 12166251  T

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Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27227568 - 27227280
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  27227568 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 27227469  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  27227468 cacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatg 27227372  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27227371 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaactttt 27227280  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 16415739 - 16416027
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
T  16415739 tggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 16415838  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  16415839 cacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 16415935  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16415936 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 16416027  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 15383029 - 15383316
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  15383029 catcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 15383128  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15383129 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttg 15383225  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15383226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 15383316  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 32216148 - 32216476
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  32216148 tggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 32216247  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  32216248 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 32216344  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  32216345 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt-aaaaa 32216443  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32216444 agtcagttttctgactgcaccgtagaagctccc 32216476  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 2959844 - 2960130
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  2959844 catcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 2959943  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  2959944 aaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 2960040  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2960041 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 2960130  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 8222221 - 8222549
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||    
T  8222221 tggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccc 8222320  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  8222321 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 8222417  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnn 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||         
T  8222418 ttgcaagcattactagatgaatta-tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaa 8222515  T
Q  322 nngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8222516 aagtcagttttctgactgtaccgtagaagctccc 8222549  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 47682573 - 47682291
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||    
T  47682573 atcaaaagttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctcaca 47682474  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47682473 aagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgc 47682377  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactt 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47682376 aagcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaactt 47682291  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 10922823 - 10923148
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||| ||||| || |||    
T  10922823 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcac 10922922  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |  || |||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  10922923 aaagtgtaacacttaagactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttg 10923019  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||       ||    
T  10923020 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-tttttcaaaagagt 10923118  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10923119 cagttttctgactgcaccatagaagctccc 10923148  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27267282 - 27266995
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||    
T  27267282 tggcattaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaat-ctaccttgttttgagtgtaacaccc 27267184  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  27267183 cacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatg 27267087  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27267086 ttgcaagcattactagatgaattactattgataattaatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 27266995  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 25160725 - 25161016
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  25160725 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagtgtaacaccc 25160824  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  25160825 cacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 25160921  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25160922 ttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaaccttttt 25161016  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 238593 - 238307
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  238593 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 238494  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  238493 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttg 238397  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  238396 caagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaacttttt 238307  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 47279282 - 47279611
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||    
T  47279282 tggcatcgaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcc 47279381  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  47279382 cataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatg 47279478  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||           
T  47279479 ttgcaaacattattagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 47279578  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
      |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47279579 aatcagttttatgactgcaccgtagaagctccc 47279611  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10182091 - 10181802
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  10182091 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 10181992  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaac-tgtaaatccaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| |||| |||  |||||| | ||||| ||||| ||    
T  10181991 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgt---taaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaat 10181895  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10181894 gttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 10181802  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 356
Target Start/End: Original strand, 15752122 - 15752451
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  15752122 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 15752221  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||| || ||||||| || ||| ||  ||||| ||||||| |    
T  15752222 cataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgt---taaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaag 15752318  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||          
T  15752319 ttgcaatttttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaa-ttttttttaaaa 15752417  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccca 356  Q
      ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752418 aatcaattttctgactgcaccgtagaagctccca 15752451  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27533063 - 27532776
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
T  27533063 tggcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 27532965  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  27532964 cacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 27532868  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27532867 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27532776  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34012460 - 34012128
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||    
T  34012460 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34012361  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||| ||||| ||     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||    
T  34012360 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatg 34012269  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||          
T  34012268 ttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttt-aaaaa 34012170  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaataaacaaa 365  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34012169 agtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc-ataaacaaa 34012128  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 314
Target Start/End: Original strand, 4330378 - 4330662
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4330378 atcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 4330477  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  4330478 aaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgt---taaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgc 4330574  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4330575 aagcattactagatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 4330662  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 30254519 - 30254806
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||| ||| |     
T  30254519 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctat 30254618  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  30254619 aaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttg 30254715  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30254716 caagcattactagatgaattactattgattattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttt 30254806  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 38823310 - 38823597
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||| ||    
T  38823310 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaac 38823409  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| ||| || |||||| || || ||||||    
T  38823410 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---tagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttg 38823506  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38823507 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaactttttt 38823597  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7079143 - 7078857
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7079143 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 7079044  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||    
T  7079043 aaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatattg 7078947  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  7078946 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 7078857  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 37451382 - 37451667
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||| || ||     
T  37451382 catcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaa 37451480  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  37451481 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 37451577  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  37451578 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaacttttt 37451667  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 15168189 - 15168478
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
T  15168189 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 15168288  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||    
T  15168289 cagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatg 15168385  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15168386 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 15168478  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19899852 - 19899563
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||| |||| ||||| |||    
T  19899852 tggcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccc 19899753  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  19899752 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 19899656  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19899655 ttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttt 19899563  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9903134 - 9902848
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  9903134 catcaaaagttcaatccacatactatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccac 9903035  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||    
T  9903034 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctg 9902938  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9902937 caagcactactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaacttttt 9902848  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 23999443 - 23999731
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||| ||    
T  23999443 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 23999542  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  23999543 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 23999639  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23999640 caagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttt 23999731  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 39393476 - 39393767
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |    
T  39393476 tggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatc 39393575  T
Q  122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||| || |||| | |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  39393576 ctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaa---agatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagat 39393672  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39393673 gttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaactttttt 39393767  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 51128955 - 51129239
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  51128955 catcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccac 51129054  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  51129055 aaagtgtaacaattaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 51129151  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||    
T  51129152 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagtattaaaat--aaattaacttttt 51129239  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30327033 - 30326751
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||    
T  30327033 gcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacacccca 30326934  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||    
T  30326933 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgtt 30326837  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aataaaacattaagatcaaaattaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  30326836 gcaagcattactagatgaattactattgatcatcaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30326751  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 32267130 - 32267455
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||    
T  32267130 catcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactccac 32267229  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | || ||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  32267230 aaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---atattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttg 32267326  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||       ||    
T  32267327 caagcattactagatgaattactattgaacattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaa-ttttttcaaaaaagt 32267425  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32267426 caatttcctgactgcaccgtagaagctccc 32267455  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27763391 - 27763104
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||| ||||| ||| ||    
T  27763391 catcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctac 27763292  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||    
T  27763291 aaagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttg 27763195  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27763194 caagcattactagataaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 27763104  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28564861 - 28564577
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||  |||| ||||      
T  28564861 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgt 28564762  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  28564761 aaagtgtaacacttaa--ctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttg 28564667  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28564666 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 28564577  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 14758134 - 14758414
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  14758134 tggcatcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 14758233  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || |||         |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  14758234 cagaaa---------ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 14758321  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14758322 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 14758414  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27563985 - 27563700
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | |  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||    
T  27563985 catcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccac 27563886  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||| | || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  27563885 aaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttg 27563789  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27563788 caagtattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaactttt 27563700  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 42721135 - 42721419
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  42721135 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 42721234  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||   ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  42721235 aaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgt---taaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttg 42721328  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42721329 caattattactagattaattactattgatcattaatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaactttttt 42721419  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 28769745 - 28770035
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||  ||||| |||    
T  28769745 tggcatcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacaccc 28769844  T
Q  123 c-acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  28769845 ccacaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 28769941  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  28769942 gttgcaaacattgctagatgaattactattgatcattaattaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 28770035  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Original strand, 46931505 - 46931792
Alignment:
Q  24 ggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||   || ||||| |||     
T  46931505 ggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccct 46931602  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  46931603 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 46931699  T
Q  224 tgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  46931700 tgcaagcattactagatgaatatattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 46931792  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31621636 - 31621342
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||    
T  31621636 tggcatcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaataccc 31621537  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa--taaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    ||  |||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||| |    
T  31621536 ca-gaagtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaata 31621438  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaattt-aaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31621437 tgttgcaagcattagtagatgaactactattgatcattaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 31621342  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Original strand, 3309244 - 3309536
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| || |||    
T  3309244 atcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacctcac 3309343  T
Q  126 aa-----agtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
     |     ||||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  3309344 tacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaaga 3309440  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaga-tcaaaattaacttttt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  3309441 tattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagatttaaaattaacttttt 3309536  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 3535028 - 3535305
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||    
T  3535028 catcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccac 3535127  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||         ||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  3535128 aaagtgtaacactta---------catgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttg 3535215  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  3535216 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaacttttt 3535305  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 22170807 - 22171093
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  22170807 catcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacaccccac 22170906  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| |   ||||| || |||||||||    
T  22170907 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttg 22171003  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22171004 caaacattattagataaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 22171093  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Original strand, 1547408 - 1547653
Alignment:
Q  59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  1547408 tcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 1547507  T
Q  159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattatt 258  Q
    | ||||||||||           |||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1547508 aacaactctgtt-----------aaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcatt 1547596  T
Q  259 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  1547597 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttt 1547653  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 295
Target Start/End: Original strand, 18422747 - 18423006
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||| ||||||    
T  18422747 catcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccac 18422846  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||| |||||||||| | || |  ||||| ||||||||||||    
T  18422847 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttg 18422943  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacatt 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18422944 caagcattgctagatgaattactattg-------atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 18423006  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11742430 - 11742162
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||           
T  11742430 catcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaac------- 11742339  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              | |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  11742338 ----------aattaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 11742252  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11742251 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 11742162  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 41926256 - 41926537
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |    
T  41926256 tggcatcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactc 41926355  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||      ||| | |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||     
T  41926356 cacaaagtgtaacact------tattaaataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagata 41926446  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||    
T  41926447 tt-caagcattactagatgaattactattgatcattaattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaattttt 41926537  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 40884906 - 40885167
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||   |    
T  40884906 tggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattc 40885005  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  40885006 cgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 40885102  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  40885103 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaattagcaatcaataattcaaaaatgaat 40885167  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33725683 - 33725405
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||    
T  33725683 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccc 33725584  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  |||||  |||| |||    
T  33725583 cagaaagtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatg 33725487  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatt-taaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||| |            |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33725486 ttgcaaac------------attactattgatcattaatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaacttttt 33725405  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 122 - 315
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353924
Alignment:
Q  122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagat 48353830  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  48353831 attgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 48353924  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1359919 - 1359691
Alignment:
Q  122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||| | ||| ||    
T  1359919 ccacaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaat 1359823  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnn 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||         
T  1359822 gttgcaagcattactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaattt--tttttttttaac 1359725  T
Q  322 nngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1359724 aagtcagttttctgactgcaccgtagaagatccc 1359691  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37618974 - 37618729
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtat--catcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||  |||    
T  37618974 catcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatccc 37618875  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    | ||||||||| |||         || |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  37618874 ataaagtgtaacact---------catataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgt 37618787  T
Q  224 tgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  37618786 tgcaagcattactagatgaattagtattgaccattaatcaataatcaacaatttaaaa 37618729  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 21289817 - 21289981
Alignment:
Q  144 ctatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaa 243  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| || ||||   ||||||||||||||| |||  |  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21289817 ctatcacataatatca---actctgtttgcatattaa---agatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaa 21289910  T
Q  244 ttactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21289911 ttattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 21289981  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Original strand, 48620733 - 48620841
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  48620733 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 48620832  T
Q  126 aaagtgtaa 134  Q
    |||||||||    
T  48620833 aaagtgtaa 48620841  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 246
Target Start/End: Original strand, 38759652 - 38759846
Alignment:
Q  49 tatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatc 148  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||  || | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  38759652 tatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatc 38759751  T
Q  149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 246  Q
    | ||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||| || |||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38759752 agataatatcaccaactatgtttgcatgt---taaaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Original strand, 31962900 - 31962999
Alignment:
Q  217 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaa-tttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31962900 aagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatcaacaattttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 31962999  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 315
Target Start/End: Original strand, 48620911 - 48620971
Alignment:
Q  255 tattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  48620911 tattgatcattaatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 48620971  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Original strand, 21289765 - 21289816
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaag 74  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21289765 tggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

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Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46297850 - 46297522
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  46297850 tggcgtcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 46297751  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  46297750 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatg 46297654  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  46297653 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt-aaaaa 46297555  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  46297554 agtcagttttttgactgcaccgtagaagctccc 46297522  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52041010 - 52040722
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
T  52041010 tggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 52040911  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  52040910 cacatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 52040814  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52040813 ttgcaaacattactagatgaatgattattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 52040722  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 354
Target Start/End: Original strand, 39282740 - 39283067
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  39282740 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccc 39282839  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||   |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||    
T  39282840 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgt---taaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatg 39282936  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||          
T  39282937 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaaa 39283035  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctcc 354  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39283036 agtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 39283067  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26941345 - 26941020
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||  || ||     
T  26941345 catcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcat 26941246  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  26941245 aaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 26941149  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||| |||||       ||    
T  26941148 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaac-tttttcaaaaaagt 26941050  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26941049 cagttttctgactgcaccgtagaagctccc 26941020  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42506160 - 42505876
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||| ||||||    
T  42506160 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccac 42506061  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  42506060 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 42505964  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  42505963 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 42505876  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 53229238 - 53228952
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  53229238 gcatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactcccca 53229139  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| | |||||||||    
T  53229138 caaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgtt 53229042  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53229041 gcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 53228952  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 48355029 - 48355318
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||   |    
T  48355029 tggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacatac 48355128  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  48355129 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatg 48355225  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48355226 ttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 48355318  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33378870 - 33378543
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
T  33378870 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaa 33378771  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  33378770 gaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttg 33378674  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||       ||    
T  33378673 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaa-ttttttcaaaaaagt 33378575  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33378574 cagtttcctgactgcaccgtagaagctcccaa 33378543  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 49 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622478
Alignment:
Q  49 tatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
Q  149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622680 acataatatcatcaaatctgtttggatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 22622584  T
Q  249 attgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactgcaccgtaaa 348  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||| ||||||||||||||||    
T  22622583 attgatcattaatcagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaact-ttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtaaa 22622485  T
Q  349 agctccc 355  Q
    |||||||    
T  22622484 agctccc 22622478  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 44891585 - 44891875
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  44891585 tggcatcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactc 44891684  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| ||  || || ||||||    
T  44891685 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatg 44891781  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  44891782 ttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttt 44891875  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40552344 - 40552058
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| |||| |||||  |||||    
T  40552344 catcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatcccac 40552245  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || |||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||    
T  40552244 aacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttg 40552148  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40552147 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 40552058  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24708202 - 24707914
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacactta--atctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  24708202 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccc 24708103  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||    
T  24708102 acaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagt 24708006  T
Q  224 tgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  24708005 tgcaagcattattagataaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 24707914  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 37157795 - 37158124
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||    
T  37157795 tggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccc 37157894  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaact-ctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||   |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||| ||    
T  37157895 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgt---taaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatat 37157991  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnn 321  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||         
T  37157992 gtcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaa 37158090  T
Q  322 nngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
      |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37158091 aagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 37158124  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 37203155 - 37203484
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| | |||    
T  37203155 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccc 37203254  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaact-ctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||   |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  37203255 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgt---taaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatat 37203351  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnn 321  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||         
T  37203352 atcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaa 37203450  T
Q  322 nngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
      |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37203451 aagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 37203484  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698530
Alignment:
Q  47 agtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaacta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
Q  147 tcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 246  Q
    || ||| |||||  |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33698365 tcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaatta 33698461  T
Q  247 ctattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  33698462 atattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaacttttt 33698530  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 3362341 - 3362631
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacact--taatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |    
T  3362341 tggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaattcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacac 3362440  T
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| || |||  |  || ||||| |    
T  3362441 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaata 3362537  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3362538 tgttgcaagcattactggatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 3362631  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 4015551 - 4015877
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4015551 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 4015650  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||  ||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  4015651 aaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgttaa---agatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 4015746  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||       ||    
T  4015747 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac-tttttcaaaaaagt 4015845  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  4015846 cagtttcatgactgcaccgtagaagctcccaa 4015877  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7327567 - 7327280
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| | |||  |||||||| ||||||    
T  7327567 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacaccccac 7327468  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  7327467 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttg 7327371  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  7327370 caagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaactttttt 7327280  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11357450 - 11357181
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||          
T  11357450 gcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaac------ 11357357  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
               |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  11357356 -----------acttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgtt 11357271  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11357270 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 11357181  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 22451056 - 22451345
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||    
T  22451056 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacaccc 22451155  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||  |||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||| |||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  22451156 cagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 22451252  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22451253 ttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 22451345  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 2008021 - 2008316
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || | |    
T  2008021 tggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgt-acactc 2008119  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  2008120 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatg 2008216  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcag-------taatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2008217 ttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaatcagtaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 2008316  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 287
Target Start/End: Original strand, 34133026 - 34133284
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34133026 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 34133125  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  34133126 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 34133222  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34133223 caagcattactagatgaattactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaat 34133284  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46994746 - 46994490
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  46994746 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccac 46994647  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||    ||||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||| |||    
T  46994646 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatg---ctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 46994550  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46994549 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatga 46994490  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21009887 - 21009560
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || | |||| ||||  |||| | | ||    
T  21009887 catcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctac 21009788  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||||||||    
T  21009787 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatatttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttg 21009691  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnng 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||       |    
T  21009690 caagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaa-tttttttaaaaaag 21009592  T
Q  325 tcagttttctgactgcaccgtaaaagctccca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21009591 tcagtttcctgactgcaccgtagaaactccca 21009560  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3655287 - 3654998
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||| | ||||    
T  3655287 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccac 3655188  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||   |||| ||| |||||| |||  |  | ||| ||||||||||||    
T  3655187 aaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaa---agattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttg 3655091  T
Q  226 caagcattactagat--gaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-gaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3655090 caagcattactagatatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacatttt 3654998  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 316
Target Start/End: Original strand, 1089811 - 1090071
Alignment:
Q  53 atcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacg-ccccacaaagtgtaatacttaaaactatcaca 151  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1089811 atcaatttatcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 1089910  T
Q  152 taatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 251  Q
    ||| |||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089911 taacatcaacaactctatttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactatt 1090006  T
Q  252 gattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1090007 gatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt 1090071  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4761734 - 4761447
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc-a 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||| |    
T  4761734 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccccca 4761635  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||| || || |||| |||||| || ||| ||||| |||||    
T  4761634 caaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaa---agattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgtt 4761538  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4761537 gcaaacattaccagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 4761447  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 21193697 - 21193984
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||     
T  21193697 catcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccat 21193796  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaa-actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||  ||| ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||   |||| |  ||||||| |||||| | |||| | |||||||||    
T  21193797 aaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgtt 21193893  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21193894 gcaaccattactaaatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 21193984  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 47481613 - 47481900
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||  |||| ||| ||    
T  47481613 catcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctac 47481712  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |   || |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  47481713 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgca---tattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttg 47481809  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47481810 caagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 47481900  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 32373558 - 32373846
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
T  32373558 tggcatcaaaagttccaccccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 32373657  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |   || |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  32373658 cacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgca---tattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatg 32373754  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||||    
T  32373755 ttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaacttttt 32373846  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 25579830 - 25580117
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25579830 catcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccac 25579929  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |  ||| || |||||| ||||| |||    
T  25579930 aaagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattg 25580026  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||    
T  25580027 caagcattactagatgaattactattgatcattaatccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaactttttt 25580117  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24489047 - 24488761
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| || |||    
T  24489047 catcaaaagttcagtccccatattatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcac 24488948  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||  | |||| | ||||||||||    
T  24488947 aaggtgtaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttg 24488851  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  24488850 caagcattactagatgcattactattaatcatgaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaacttttt 24488761  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22446153 - 22445865
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |     
T  22446153 tggcatcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacact 22446054  T
Q  122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    | |||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||   |||| |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||    
T  22446053 c-acaatgtataacactcaagactatcatataatatcatcaactatttttgcatattaa---agataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaat 22445958  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22445957 gttgcaagtattactggatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 22445865  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 29099446 - 29099763
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  | || | ||||||||||||| ||||||    
T  29099446 catctaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccac 29099545  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||         || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||   |||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  29099546 aaagtgtaa---------ctttcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttg 29099633  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||        ||    
T  29099634 caagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttcaaaaaaagt 29099733  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29099734 cagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 29099763  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43975973 - 43975652
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| |||||     
T  43975973 catcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccag 43975874  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtt---tgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||||| |||       ||| |||||||||||||||| ||||   |  |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||     
T  43975873 aaagtgtaacact-------atcgcataatatcatcaactatgttgtttacatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatt 43975784  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||          
T  43975783 ttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaa-ttttttcaaaag 43975685  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43975684 agtcagttttctgactgcaccgtagaaactccc 43975652  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Original strand, 54505913 - 54506185
Alignment:
Q  41 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatactta 140  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| | | ||||||||||| |||||    
T  54505913 cctcatagtatcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacactta 54506012  T
Q  141 aaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagat 240  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  54506013 agactatcacataatatcatctactttatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagat 54506109  T
Q  241 gaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  54506110 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 54506185  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44186586 - 44186316
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  44186586 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccac 44186487  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||                ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||| |||||| || ||| || |||||||||    
T  44186486 aa----------------ctatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaa---agatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttg 44186406  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44186405 caagcattactagataaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacatttt 44186316  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 54828786 - 54828546
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||    
T  54828786 catcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccac 54828687  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||   |||| || ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  54828686 aaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 54828590  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatc 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54828589 caagcattactagataaattactattgatcattaatcagtaatc 54828546  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14586735 - 14586479
Alignment:
Q  46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||           
T  14586735 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact------- 14586643  T
Q  146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
      |  || |||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14586642 --cgtatgatatcaacaactatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagta-cggtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaatt 14586549  T
Q  246 actattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  14586548 actactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaatttttt 14586479  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164180
Alignment:
Q  29 caaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaa 128  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
Q  129 gtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaa 228  Q
    |||||| ||         |||||| |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||    
T  29164012 gtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaa 29164099  T
Q  229 gcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29164100 gcattactagatgaattactattg-------atcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttt 29164180  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 38591786 - 38592047
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  |||    
T  38591786 tggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccc 38591885  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  38591886 cacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttgcatgt---caaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatg 38591982  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 287  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591983 ttgcaagcattattaaacaaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 38592047  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 355
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012556
Alignment:
Q  42 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatactta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacactta 36012343  T
Q  141 aaactatcacataatatcatcaactct-gtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactaga 239  Q
    | ||||||| || |||||| ||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36012344 agactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaa---agatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactaga 36012440  T
Q  240 tgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |  |||||       ||||||||  ||||||    
T  36012441 tgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactg 36012540  T
Q  340 caccgtaaaagctccc 355  Q
    ||||||| ||||||||    
T  36012541 caccgtagaagctccc 36012556  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Original strand, 45174595 - 45174821
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |     
T  45174595 gcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactct 45174694  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| | || |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  45174695 acaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaa---agatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgt 45174791  T
Q  224 tgcaagcattactagatgaattactattga 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45174792 tgcaagcattactagatgaattactattga 45174821  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 11466912 - 11467187
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
T  11466912 tggcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 11467011  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   | ||||| ||||||| || |||||| ||| || || ||||||    
T  11467012 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---ttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatg 11467108  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||       |||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  11467109 ttgcaa-------tagatgaattactattg-------atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaacttttt 11467187  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 43348346 - 43348563
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
T  43348346 tggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 43348444  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |  ||||||    
T  43348445 cataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatg 43348541  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaat 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  43348542 ttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27480464 - 27480164
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc-- 123  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||       
T  27480464 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccaga 27480365  T
Q  124 ------aca-----aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactct----gtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaact 208  Q
          |||     |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |    ||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  |    
T  27480364 agtgtaacacccagaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacat 27480268  T
Q  209 gtaaatccaagatgttg----caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaa 304  Q
    |||| ||||| |||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  27480267 gtaagtccaaaatgttaattacaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaa 27480168  T
Q  305 atta 308  Q
    ||||    
T  27480167 atta 27480164  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 40936082 - 40936350
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  | |||||||||||||           
T  40936082 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatccaacttt-ttttaagtgtaac------- 40936173  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  || || || |||||||||    
T  40936174 ----------acttaagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttg 40936260  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  40936261 caagcattactagataaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaataaatcaatcattaagattgaaattaacttttt 40936350  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 51212738 - 51212535
Alignment:
Q  144 ctatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51212738 ctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaa 51212642  T
Q  244 ttactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactgcacc 343  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||||    
T  51212641 ttactattgatcattaattaaaaatcaacaatttaaaaatgaa------attaagatcaaaattaac-tttttcaaaaatgtcagttttctgactgcacc 51212549  T
Q  344 gtaaaagctcccaa 357  Q
     || ||||||||||    
T  51212548 atagaagctcccaa 51212535  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11356957
Alignment:
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaa---atatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaaga 11357044  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11357043 tgttgcaagcatta--------attactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaacttttt 11356957  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 53176145 - 53176286
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||   |||||| | |||| | ||||    
T  53176145 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccac 53176244  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactct 167  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  53176245 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactct 53176286  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 51213069 - 51212958
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  51213069 tggcatcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccc 51212970  T
Q  123 cacaaagtgtaa 134  Q
    ||||||||||||    
T  51212969 cacaaagtgtaa 51212958  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11835695 - 11835494
Alignment:
Q  44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaat-tttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaa 142  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||     
T  11835695 catagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaag 11835596  T
Q  143 actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatga 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||         ||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11835595 actatcacatgatatcatcaactctatttgcat---------gatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatga 11835505  T
Q  243 attactattga 253  Q
    |||||||||||    
T  11835504 attactattga 11835494  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373062
Alignment:
Q  92 tttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgcca 191  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||    
T  20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattcca 20373167  T
Q  192 acgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaa 291  Q
    ||||||| ||||||  | ||| |||||||||                   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20373166 acgataaaatagtacatataagtccaagatg-------------------aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 20373086  T
Q  292 cattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  20373085 cattaaaatcaaaattaacttttt 20373062  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 35844417 - 35844571
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-ttttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||| |    
T  35844417 catcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacacccta 35844516  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||    
T  35844517 caaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaa 35844571  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 315
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475195
Alignment:
Q  145 tatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat 244  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||| ||| ||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaa---agatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 50475117  T
Q  245 tactattg-------attattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    || |||||       || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  50475118 tagtattgatcattaatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaattttt 50475195  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20373381 - 20373300
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgtt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20373381 catcaaaagttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 53811698 - 53811597
Alignment:
Q  143 actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53811698 actatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaa---agataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T
Q  243 attactatt 251  Q
    |||||||||    
T  53811605 attactatt 53811597  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 53811729 - 53811695
Alignment:
Q  44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagacta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811729 catagtatcatcaattcatcagattaacaagacta 53811695  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 315
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844624
Alignment:
Q  268 tcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 35844624  T

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Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 41960940 - 41961267
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  41960940 catcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 41961039  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  41961040 aaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttg 41961136  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||        |    
T  41961137 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaaaatt 41961235  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41961236 cagtttcctgactgcaccgtagaagctcccaa 41961267  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 4763731 - 4764057
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  4763731 catcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccccac 4763830  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||    
T  4763831 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgt---taaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 4763927  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||       ||    
T  4763928 caagcattactagttgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttttaaaaagt 4764027  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  4764028 cagtttccttactgcaccgtagaagctccc 4764057  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 4167019 - 4167347
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  4167019 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 4167118  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  4167119 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 4167215  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||          
T  4167216 ttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaac-tttttcaaaaa 4167314  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4167315 agtcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 4167347  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2325478 - 2325195
Alignment:
Q  21 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |    
T  2325478 actggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacac 2325387  T
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2325386 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaa---agattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaaga 2325290  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2325289 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 2325195  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43648348 - 43648062
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| || |||    
T  43648348 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacac 43648249  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||   |||||||  ||||||||| |||| |  ||||| |||||||||| |    
T  43648248 aaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttccatgt---taaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcg 43648152  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43648151 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 43648062  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 26357677 - 26357964
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | || ||||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  26357677 catcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 26357776  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||    
T  26357777 aaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttg 26357873  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26357874 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttt 26357964  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39167466 - 39167186
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  39167466 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccac 39167367  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||  |||||    
T  39167366 aaagtgtaaca------actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttg 39167276  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39167275 ctagcattactagatgaattactattaattatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaacttttt 39167186  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33709335 - 33709049
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  33709335 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaaatattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctac 33709236  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  33709235 aaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttg 33709139  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  33709138 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 33709049  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Original strand, 44913766 - 44914053
Alignment:
Q  30 aaaagttcaatcctc-atagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc-acaa 127  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  44913766 aaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccccacaa 44913865  T
Q  128 agtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgca 227  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44913866 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 44913962  T
Q  228 agcattactaga---tgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44913963 agcattattagaaaatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 44914053  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18494383 - 18494098
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  || |||    
T  18494383 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaaa-cctcac 18494285  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||| || | |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  18494284 aaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 18494188  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18494187 taagcattactagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 18494098  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19289426 - 19289140
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||  |||||    
T  19289426 catcaaaagttaagttctcacagtatcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccac 19289327  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| || || |||| ||| || |||||| |||||||| |||    
T  19289326 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgttaa---agattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattg 19289230  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19289229 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttt 19289140  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29242240 - 29241963
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29242240 atcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 29242141  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||         
T  29242140 aagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgt---taaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat----- 29242049  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
      | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29242048 --gaattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 29241963  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 41465597 - 41465887
Alignment:
Q  22 ctggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    |||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  41465597 ctggtatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacc 41465696  T
Q  122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
     || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  41465697 tcagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagat 41465793  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41465794 gttgcaaacattactatatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 41465887  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33551089 - 33550760
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  33551089 catcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccac 33550990  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  || || ||||| ||||||    
T  33550989 aaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttg 33550894  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattga----ttattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnn 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         
T  33550893 caagcattactagatgaataactattgattatttattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttttaaa 33550794  T
Q  322 nngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
       ||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  33550793 aattcagttttctgacagcactgtagaagctccc 33550760  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Original strand, 3177039 - 3177362
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3177039 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccac 3177138  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| |||| |||| ||||||  ||||| |||||||| ||     
T  3177139 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatatta 3177235  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||| |||| |||||       ||    
T  3177236 caagcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaac-tttttcaaaaaagt 3177334  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctc 353  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3177335 cagtttcctgactgcaccgtagaagctc 3177362  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11366484 - 11366197
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  || | |||| |||   |||| ||| ||    
T  11366484 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctac 11366385  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  11366384 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 11366288  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  11366287 caagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 11366197  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 37905808 - 37906097
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgta--acgcccc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||  || ||||    
T  37905808 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacccccc 37905907  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| |||| ||||| |||  |  ||||| ||||||||||    
T  37905908 acaaagtgtaacacttaaaactatcgcataatatcattaactctgtttgcatgt---taaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgt 37906004  T
Q  224 tgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37906005 tgcaagaattactggatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttt 37906097  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31570837 - 31570551
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  31570837 catcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccac 31570738  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |  |||||||||    
T  31570737 aaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttg 31570641  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  31570640 caagcattgctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaacttttt 31570551  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33660474 - 33660194
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  33660474 tggcatcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 33660375  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||          ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||  |||||    
T  33660374 cacaaagtgtaacacc---------cacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatg 33660287  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  33660286 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 33660194  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Original strand, 31861953 - 31862238
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||| |||| ||||| |||||||    
T  31861953 atcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccaca 31862052  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    ||| || || |||| ||||||  ||||| |||||||| |||     
T  31862053 aagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaag---gattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgt 31862149  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31862150 agacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaacttttt 31862238  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19424734 - 19424414
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  19424734 tggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccc 19424635  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||                 || |||||| ||| || || ||||||    
T  19424634 cacaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgtta-----------------aagatagtacctgcaagtctaagatg 19424552  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||          
T  19424551 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaac-tttttcaaaaa 19424453  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaataaa 361  Q
     ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19424452 agtcagtttgatgactgcaccgtagaagctcccattaaa 19424414  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 4478466 - 4478717
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  4478466 tggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaac--- 4478562  T
Q  122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
      ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  4478563 --acaaagtgtaacacttaagtctatcacatgatatcaccaactctgtttccatgttaa---agatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagat 4478657  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4478658 gttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaa 4478717  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Original strand, 35959023 - 35959278
Alignment:
Q  52 catcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcaca 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  35959023 catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcaca 35959121  T
Q  152 taatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 251  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959122 taatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 35959214  T
Q  252 gattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35959215 gatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 35959278  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 265
Target Start/End: Original strand, 44286046 - 44286285
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  44286046 tggcatcaaaagtttagtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccc 44286145  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||| |||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  44286146 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgt---taaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatg 44286242  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagt 265  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44286243 ttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcagt 44286285  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43770945 - 43770665
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||     
T  43770945 tggcatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacct 43770846  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||         ||||| |||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||    
T  43770845 cacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatg 43770758  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43770757 ttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaattagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 43770665  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 13711564 - 13711845
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||     
T  13711564 catcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttat-----catgttttaagtgtaacaccccat 13711658  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||| || |||||||   |||||||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||    
T  13711659 aaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaa---agatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttg 13711755  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | || |||||||| |||||    
T  13711756 caaacaatactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaatttttt 13711845  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27350041 - 27349793
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27350041 catcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccac 27349943  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||         ||||| ||||||  ||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||||||||    
T  27349942 aaagtgtaacact---------cacatgatatcaggaactctgtttgcaagttaa---agattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttg 27349855  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27349854 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 27349793  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4264180 - 4263926
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  4264180 catcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacaccccac 4264081  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatc-acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||  | ||| | |||||||||    
T  4264080 aaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgtt 4263984  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 282  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4263983 gcaagcattactagatgaaataatattgatcattgatcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7007025 - 7006755
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||          
T  7007025 gcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaac------ 7006932  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
               |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  7006931 -----------acttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgtt 7006846  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7006845 gcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgattaaaattaacttttt 7006755  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 5881639 - 5881915
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  || |||    
T  5881639 catcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattt-atcataccttgttttaagtgtaatacctcac 5881737  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||         ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||   ||||| |||| |||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  5881738 aaagtgtaacact---------cacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaa---agatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 5881825  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5881826 caagcattactagatgaattactattgatcattattcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 5881915  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17071840 - 17071646
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  17071840 catcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 17071741  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17071740 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 45327820 - 45328025
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||     
T  45327820 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcag 45327919  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  45327920 aaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 45328016  T
Q  226 caagcatta 234  Q
    |||||||||    
T  45328017 caagcatta 45328025  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 36642086 - 36642293
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa--ttttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||     
T  36642086 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccct 36642185  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||  ||||   |||||||||||||||||| |||||| | |||| | ||||||||    
T  36642186 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgt---taaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgt 36642282  T
Q  224 tgcaagcatta 234  Q
    |||||||||||    
T  36642283 tgcaagcatta 36642293  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19500923 - 19500739
Alignment:
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||   |||||  |||||||| ||||||  ||||| | |||||    
T  19500923 cccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaa---agatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaaga 19500827  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaatta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19500826 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 19500739  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17054182 - 17054005
Alignment:
Q  43 tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  17054182 tcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaan 17054083  T
Q  143 actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17054082 actatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17054005  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 19313952 - 19314186
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19313952 catcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccac 19314050  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactg---taaatccaagatg 222  Q
    ||||||       ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||| || |||||| ||||||  ||   ||| || ||||||    
T  19314051 aaagtg-------taacactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatg 19314140  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19314141 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 19314186  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 356 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2324647 - 2324557
Alignment:
Q  356 aataaacaaacctgaggagctggggcgttgtcatcaatgaaaggggctgctaaacttataaacgatgcctcgccaacaccaaccagactat 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2324647 aataaacaaacctgaggagctggggcgttgtcatcaatgaaaggggctgctaaacttataaacgatgcctcaccaacaccaaccagactat 2324557  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 171
Target Start/End: Original strand, 33902166 - 33902311
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  33902166 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccac 33902265  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgttt 171  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33902266 aaagtgtaacacttaatagtatcacataatatcattaactctgttt 33902311  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41463956 - 41463779
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||  |||  |||||||| |||||| ||     
T  41463956 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacct 41463857  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatag 203  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||    
T  41463856 cacaaaatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 232 - 354
Target Start/End: Original strand, 33902317 - 33902439
Alignment:
Q  232 ttactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttt 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||       || |||||    
T  33902317 ttactagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaaagttagttt 33902416  T
Q  332 tctgactgcaccgtaaaagctcc 354  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  33902417 tctgattgcaccgtagaagctcc 33902439  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41051246 - 41051117
Alignment:
Q  186 atgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 285  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41051246 atgccaaggataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatcaacaattcaaaaatga 41051147  T
Q  286 ataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    || ||||||||| || |||||||| |||||    
T  41051146 atcaaacattaaaattaaaattaatttttt 41051117  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258210
Alignment:
Q  67 ttaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactc 166  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 18258250  T
Q  167 tgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactg 209  Q
    | |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18258249 tctttgcatgt---taaagatcccaacgataaaatagtaactg 18258210  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257355
Alignment:
Q  217 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaacttttt 18257355  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 377 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2337883 - 2337804
Alignment:
Q  377 ggggcgttgtcatcaatgaaaggggctgctaaacttataaacgatgcctcgccaacaccaaccagactatagagaataat 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2337883 ggggcgttgtcatcaatgaaaggtggtgctaaacttataaacgaagcctcgccaacaccaaccagcctatacagaataat 2337804  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 365 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2344777 - 2344686
Alignment:
Q  365 acctgaggagctggggcgttgtcatcaatgaaaggggctgctaaacttataaacgatgcctcgccaacaccaaccagactatagagaataat 456  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2344777 acctgagaagctggggcattgtcatcaataaaaggtgctgctagacttataaacgaagcctctccaacaccaaccagcctatacagaataat 2344686  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41463505 - 41463407
Alignment:
Q  217 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  41463505 aagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 41463407  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19501823 - 19501768
Alignment:
Q  45 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19501823 atagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttattctac 19501768  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 41051311 - 41051263
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 71  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051311 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 41051263  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328076
Alignment:
Q  267 atcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 45328076  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053960
Alignment:
Q  258 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17053960  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071601
Alignment:
Q  258 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17071601  T

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Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16446969 - 16446641
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  16446969 tggcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccc 16446870  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  16446869 cacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaa---agatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 16446773  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||          
T  16446772 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaact-ttttcaaaaa 16446674  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16446673 agtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 16446641  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37970610 - 37970324
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  37970610 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 37970511  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |  || |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  37970510 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 37970414  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37970413 caagcattactagatgaattactgttgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 37970324  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1149723 - 1149398
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  1149723 catcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccac 1149624  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  1149623 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 1149527  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||       ||    
T  1149526 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaa-ttttttcaaaaaagt 1149428  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1149427 caatttcctgactgcaccgtagaagctccc 1149398  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27082932 - 27082643
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  27082932 tggcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccc 27082833  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  27082832 cgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 27082736  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27082735 ttgcaagcattactagatgaattactacttatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttt 27082643  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 11727120 - 11727449
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  11727120 tggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 11727219  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
T  11727220 cacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatg 11727316  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||          
T  11727317 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaaa 11727416  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     |||| |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11727417 tgtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccc 11727449  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43643686 - 43643361
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  43643686 catccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 43643587  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||   | || || |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  43643586 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaa---ttccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 43643490  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       ||    
T  43643489 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact-ttttcaaaaaagt 43643391  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43643390 cagttttctgactgcaccatagaagctccc 43643361  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6098609 - 6098320
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  6098609 catcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccac 6098510  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgat--aat---atagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |||   ||||||  ||||| |||||||    
T  6098509 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaaga 6098413  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6098412 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcatgattaacttt 6098320  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132492
Alignment:
Q  52 catcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcaca 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T
Q  152 taatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 251  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132651 taatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 4132555  T
Q  252 gattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4132554 gatcattaatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaactttt 4132492  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 1205026 - 1205353
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  1205026 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccac 1205125  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  1205126 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 1205222  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||    
T  1205223 caagtattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaactttttt-aaaaaagt 1205321  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1205322 caattttctgactacaccgtagaagctcccaa 1205353  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5300040 - 5299751
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||    
T  5300040 tggcatcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccc 5299941  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| || |||||| ||| | |||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  5299940 cacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgttaa---agataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 5299844  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5299843 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttt 5299751  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 16222962 - 16223249
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||| |||||     
T  16222962 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaa 16223061  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || |   ||||||| |||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  16223062 aaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattt---taaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 16223158  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16223159 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttt 16223249  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 34895063 - 34895348
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||    
T  34895063 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34895162  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||| ||||| ||     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||  ||||| | |||||||    
T  34895163 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaa---agatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatg 34895254  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34895255 ttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttt 34895348  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36695057 - 36694771
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  36695057 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 36694958  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  36694957 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttg 36694861  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||||||    
T  36694860 caagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttt 36694771  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 38644074 - 38644404
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  38644074 tggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactc 38644173  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| ||| || ||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||   ||||| ||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  38644174 cataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaa---agatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 38644270  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||          
T  38644271 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaac-tttttcaaaaa 38644369  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38644370 agtcagtttcatgactgcaccgtaaaagctcccaa 38644404  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1954084 - 1953793
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatc-atcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacg-c 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |    
T  1954084 tggcatcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatc 1953985  T
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   || || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1953984 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaa---agttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaaga 1953888  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1953887 ttttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 1953793  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23854522 - 23854236
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| || ||     
T  23854522 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcat 23854423  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||| || || |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  23854422 aaagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaa---agattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 23854326  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23854325 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 23854236  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7891051 - 7890762
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||  |||| |||| ||||| |||    
T  7891051 tggcatcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccc 7890952  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| || || |||    
T  7890951 cacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatg 7890855  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7890854 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaacttttt 7890762  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Original strand, 33906316 - 33906634
Alignment:
Q  31 aaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagt 130  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||   ||| |||||    
T  33906316 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagt 33906415  T
Q  131 gtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagc 230  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  33906416 gtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 33906512  T
Q  231 attactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||       |||||||    
T  33906513 attactagatgaattactattgatcattaatcagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaac-tttttcaaaaaagtcagtt 33906609  T
Q  331 ttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  33906610 ttctgactgcactgtagaagctccc 33906634  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 12876208 - 12876496
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  12876208 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 12876307  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaa-actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  12876308 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 12876404  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  12876405 acaggcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttt 12876496  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35459798 - 35459516
Alignment:
Q  30 aaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaag 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||  |||||| |     
T  35459798 aaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccacagat 35459699  T
Q  130 tgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaag 229  Q
    | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||  | || |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||     
T  35459698 tataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaa---agatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaa 35459602  T
Q  230 cattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35459601 cattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 35459516  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10555293 - 10554969
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| || |||    
T  10555293 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcac 10555194  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||  |||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||| |||    
T  10555193 aaaacgtaacactt--gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 10555099  T
Q  226 caagcattactagatgaatt--actattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnn 323  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  10555098 caagcattactagatgaattacactattgatcatta---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttttcaaaaaa 10555002  T
Q  324 gtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccca 356  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||||||||    
T  10555001 gtcaattttctgaccgcaccatagaagctccca 10554969  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Original strand, 465938 - 466214
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||    
T  465938 tggcatcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccc 466037  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||         |||||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||| ||| || |||||| || ||||||    
T  466038 cacaaagtgtaacact---------cacata-tatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatg 466124  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  466125 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 466214  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 287
Target Start/End: Original strand, 9864247 - 9864505
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9864247 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 9864346  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||    
T  9864347 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttg 9864443  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9864444 caagcattactagatgaataactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaat 9864505  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8803885 - 8803580
Alignment:
Q  49 tatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatc 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  8803885 tatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatc 8803786  T
Q  149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tac 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  8803785 acataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatac 8803689  T
Q  248 tattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactgcaccgtaa 347  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||       |||| ||| |||||||||||||||    
T  8803688 tattgatcattaatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtaa 8803590  T
Q  348 aagctcccaa 357  Q
    || |||||||    
T  8803589 aaactcccaa 8803580  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39099211 - 39098923
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||    
T  39099211 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatccca 39099112  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||| | | |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||   |||| ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||    
T  39099111 caaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgtt 39099015  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  39099014 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaattaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaattaattttttt 39098923  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 44869596 - 44869882
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    |||||    
T  44869596 catcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgt-cccca 44869694  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||  |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |  ||| |||||||| ||    
T  44869695 caaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatatt 44869791  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  44869792 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 44869882  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31933977 - 31933691
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||  |||  || |||    
T  31933977 catcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcac 31933878  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||| || ||||| |||    
T  31933877 aaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgt---taaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattg 31933781  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31933780 cagacattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaatttttt 31933691  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 40862516 - 40862805
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| | |    
T  40862516 tggcatcaaaagttcagtc-tcatggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactc 40862614  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  40862615 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 40862711  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaattt-aaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  40862712 ttgcaagcattactagatgaattactatttgtcataaatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttt 40862805  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30654674 - 30654388
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||| ||| ||    
T  30654674 catcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctac 30654575  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||   |  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  30654574 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaa---tttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 30654478  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30654477 caagcattactaaatgaatatattattgatcattaatcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaacttttt 30654388  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24823395 - 24823198
Alignment:
Q  108 ttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaac 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||      
T  24823395 ttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgtt-----------aaagatgccaacgataaaatagtaca 24823307  T
Q  208 tgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  24823306 tgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaatt 24823207  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 13307722 - 13307936
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||| ||||||    
T  13307722 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccac 13307821  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |    || ||||||||| |||||| | |||| | ||||||||||    
T  13307822 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaaa----tgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttg 13307917  T
Q  226 caagcattactagatgaat 244  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  13307918 caagcattacaagatgaat 13307936  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 315
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859319
Alignment:
Q  153 aatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 252  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattg 35859256  T
Q  253 attattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35859257 atcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 35859319  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41911080 - 41910925
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41911080 gcatcaaaaattcagtcaacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 41910981  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  41910980 caaagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaa 41910925  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 315
Target Start/End: Original strand, 12587812 - 12587967
Alignment:
Q  157 tcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatta 256  Q
    ||||||||||| |||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12587812 tcatcaactctatttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatca 12587908  T
Q  257 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12587909 ttaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 12587967  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34952020 - 34951862
Alignment:
Q  154 atatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 253  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  34952020 atatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattga 34951924  T
Q  254 ttattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34951923 tcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 34951862  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1149912 - 1149756
Alignment:
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||    
T  1149912 cccacaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaaga 1149820  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149819 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 1149756  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 43025824 - 43025955
Alignment:
Q  49 tatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatc 148  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43025824 tatcatcaattcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatc 43025923  T
Q  149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43025924 acataatatcatcaactctgattgcatgttaa 43025955  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 315
Target Start/End: Original strand, 33198057 - 33198187
Alignment:
Q  185 gatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 284  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33198057 gatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg 33198156  T
Q  285 aataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  33198157 aatcaatcattaagattaagattaacttttt 33198187  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1150196 - 1150090
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  1150196 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 1150097  T
Q  126 aaagtgt 132  Q
    |||||||    
T  1150096 aaagtgt 1150090  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 354
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362845
Alignment:
Q  231 attactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||    
T  41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaa-ttttttcaaaaaagtcagtt 41362821  T
Q  331 ttctgactgcaccgtaaaagctcc 354  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  41362822 tcctgactgcaccatagaagctcc 41362845  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 315
Target Start/End: Original strand, 18259330 - 18259464
Alignment:
Q  181 taaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaa 280  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  18259330 taaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaacaatttaaa 18259429  T
Q  281 aatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| || |||||| || ||||||||| ||||    
T  18259430 aatgaatcaatcattaaaattaaaattaacctttt 18259464  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 41362614 - 41362706
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  41362614 catcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaac 41362706  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 316
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026060
Alignment:
Q  230 cattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttt 43026060  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 34952122 - 34952030
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac 118  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  34952122 catcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaac 34952030  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Original strand, 7998411 - 7998486
Alignment:
Q  44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-ttttattctaccatgttttaagtgtaac 118  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7998411 cataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaac 7998486  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 33197947 - 33198003
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacac 81  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33197947 gcatcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacac 33198003  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585353
Alignment:
Q  108 ttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaac 164  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12585297 ttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacataacatcatcaac 12585353  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Original strand, 7998487 - 7998553
Alignment:
Q  136 acttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagta 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |   || |||||||||||||||||| ||||||    
T  7998487 acttaatactatcacataatatcaacaactctgtttcta---tattaaagatgccaacgataaaatagta 7998553  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 251
Target Start/End: Original strand, 34463704 - 34463792
Alignment:
Q  157 tcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 251  Q
    ||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||| || || ||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34463704 tcatcaactttgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaataatacctataagtcca---tgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

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Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 316
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815688
Alignment:
Q  34 gttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgta 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
Q  134 atacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcatt 233  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1815509 acacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacatt 1815605  T
Q  234 actagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815606 actagatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt 1815688  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 55478002 - 55477715
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  55478002 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacaccccac 55477903  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||    
T  55477902 aacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttg 55477806  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55477805 caagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttt 55477715  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37663852 - 37663568
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||| ||||||    
T  37663852 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccac 37663753  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  37663752 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 37663656  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  37663655 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 37663568  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28003097 - 28002811
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
T  28003097 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 28002998  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  28002997 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 28002901  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28002900 ctaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 28002811  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 357
Target Start/End: Original strand, 6864134 - 6864462
Alignment:
Q  25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| |||||    
T  6864134 gcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacacccca 6864233  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||| ||  ||||| | |||||||||    
T  6864234 caaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgtt 6864330  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnng 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||       |    
T  6864331 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaaaag 6864429  T
Q  325 tcagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6864430 tcagttttctgactgcaccgtagaagctcccaa 6864462  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 33341496 - 33341785
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
T  33341496 tggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 33341594  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  33341595 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 33341691  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33341692 ttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttt 33341785  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35021149 - 35020817
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  35021149 tggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 35021050  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||     
T  35021049 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagata 35020953  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattac----tattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnn 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  35020952 ttgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt-a 35020854  T
Q  319 nnnnngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
         ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35020853 aaagagtcagttttctgactacaccgtagaagctccc 35020817  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 25184213 - 25184538
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  25184213 catccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 25184312  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||   | || || |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  25184313 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaa---ttccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 25184409  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||       ||    
T  25184410 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-tttttcaaaaaagt 25184508  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25184509 cagttttctgactgcaccatagaagctccc 25184538  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19440762 - 19440433
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||| |||| ||||| |||    
T  19440762 tggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacaccc 19440663  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||| ||||||  |||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  19440662 cacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 19440566  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  19440565 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt-aaaaa 19440467  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccca 356  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19440466 agtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccca 19440433  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 879659 - 879332
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  879659 catcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 879560  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |  || |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  879559 aaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---agattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 879463  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  879462 caagcattactagatgaattattattgatcattaataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt-taaaaagt 879364  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  879363 cagttttctgactacaccatagaagctcccaa 879332  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19089564 - 19089280
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || | ||||| ||| ||    
T  19089564 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctac 19089465  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  19089464 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 19089368  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  19089367 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 19089280  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 50697342 - 50697628
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  50697342 catcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacac 50697440  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttg-aatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  50697441 aaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaa---agattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgtt 50697537  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  50697538 gtaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaatttttt 50697628  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34948211 - 34947923
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||| |||    
T  34948211 tggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccc 34948112  T
Q  123 cacaaagtgtaa--tacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||    
T  34948111 cacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaaga 34948015  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34948014 tgttgcaagcattactagatgaaatactattgatcgttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 34947923  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 46888270 - 46887983
Alignment:
Q  24 ggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  46888270 ggcatcaaaagttcagtccccatactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccc 46888171  T
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    |||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46888170 acaaaacgtaacacttaga-ctatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 46888075  T
Q  224 tgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46888074 tacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaacttttt 46887983  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36493799 - 36493514
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  | ||||    
T  36493799 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaaa-ctccac 36493701  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| |||    
T  36493700 aaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattg 36493604  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36493603 caagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttt 36493514  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Original strand, 7703642 - 7703895
Alignment:
Q  59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||    
T  7703642 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatc 7703741  T
Q  159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattatt 258  Q
    | |||||||||||| | |||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7703742 agcaactctgtttgcacgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactatttatcatt 7703838  T
Q  259 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7703839 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 7703895  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32912690 - 32912365
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    ||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||| |||    
T  32912690 atcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaca 32912591  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  32912590 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 32912494  T
Q  227 aagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngt 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||       ||    
T  32912493 aagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaa-ttttttcaaaaaagt 32912395  T
Q  326 cagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32912394 cagtttcctgactgcaccgtaaaagctccc 32912365  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 355
Target Start/End: Original strand, 49376064 - 49376392
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||   || |||    
T  49376064 tggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacaccc 49376163  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |    
T  49376164 cacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaag 49376260  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnn 322  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||          
T  49376261 ttgaaagcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaac-tttttcaaaaa 49376359  T
Q  323 ngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  49376360 agtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 49376392  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25701168 - 25700881
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacg-cccca 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  25701168 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccca 25701069  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||   ||| | ||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||    
T  25701068 caaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaa---agaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagatttt 25700972  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25700971 gcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 25700881  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 17173390 - 17173676
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  17173390 catcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 17173489  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  17173490 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 17173586  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||    
T  17173587 caagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaatttttt 17173676  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 23761172 - 23761457
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||     
T  23761172 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttat-ctaccttgttttaagtgtaacacctcat 23761270  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | | |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||    
T  23761271 aaagtgtcacatttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaa---agataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttg 23761367  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23761368 caagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 23761457  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Original strand, 47253873 - 47254126
Alignment:
Q  59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  47253873 tcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 47253972  T
Q  159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattatt 258  Q
    | |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47253973 agcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 47254069  T
Q  259 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  47254070 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 47254126  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 55241218 - 55240930
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||     
T  55241218 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcagat-aagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacct 55241120  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  55241119 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 55241023  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  55241022 ttgcaaacattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaattttt 55240930  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34361588 - 34361277
Alignment:
Q  41 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatactta 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  34361588 cctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacactta 34361489  T
Q  141 aaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagat 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34361488 aagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagat 34361392  T
Q  241 gaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactg 339  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||       |||||||| |||||||    
T  34361391 gaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac-tttttcaaaaaagtcagtttcctgactg 34361293  T
Q  340 caccgtaaaagctccc 355  Q
    ||||||| ||||||||    
T  34361292 caccgtagaagctccc 34361277  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 17167813 - 17168099
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  17167813 catcaaaagttcattctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 17167912  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  17167913 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 17168009  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||    
T  17168010 caagcatcactagatgaattactatttatcattaattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaatttttt 17168099  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29584314 - 29584025
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  29584314 tggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacaccc 29584215  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||  |||||| | |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||  |||| |||| || |||  ||||| |||||||||    
T  29584214 catgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatg 29584118  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29584117 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 29584025  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 315
Target Start/End: Original strand, 3042741 - 3043005
Alignment:
Q  48 gtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| | || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3042741 gtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactat 3042840  T
Q  148 cacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3042841 cacataatatcatcaactttgtttgcttgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactagatgaattag 3042937  T
Q  248 tattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3042938 tattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 3043005  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 316
Target Start/End: Original strand, 37775787 - 37776045
Alignment:
Q  46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||           
T  37775787 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact------- 37775879  T
Q  146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
      ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775880 --cacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaa---agataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatt 37775974  T
Q  246 actattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37775975 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaactttttt 37776045  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 27396716 - 27397001
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||     
T  27396716 catcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccat 27396815  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | |||||| || ||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||   |||||||| |||||||||  | ||| || ||| ||||| ||||||    
T  27396816 aaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttg 27396912  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27396913 caagcattactagatgaattactattgatcattaat--gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttt 27397001  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 50764830 - 50765107
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||          ||||||| ||||||    
T  50764830 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac----------gtgtaacaccccac 50764919  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||| || ||| || | |||||||| |||||| ||||| |||||| | |||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  50764920 aaagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 50765016  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  50765017 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttt 50765107  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4934318 - 4934040
Alignment:
Q  21 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  4934318 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacac 4934219  T
Q  121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| ||           |    
T  4934218 ctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaatagtacct-----------a 4934133  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaa-tttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactt 312  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4934132 tgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcattaatcagtaatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaactt 4934040  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 356
Target Start/End: Original strand, 32579562 - 32579872
Alignment:
Q  42 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaa 141  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || |||||||||  |||||    
T  32579562 ctcatagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactcttaa 32579661  T
Q  142 aactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatg 241  Q
     ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||   || ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32579662 gactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaa---tgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatg 32579758  T
Q  242 aattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactgca 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||| ||||||    
T  32579759 aattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaa-ttttttcaaaaaagtcagttttctaactgca 32579857  T
Q  342 ccgtaaaagctccca 356  Q
    ||||| || ||||||    
T  32579858 ccgtagaaactccca 32579872  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Original strand, 17272084 - 17272350
Alignment:
Q  46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| | |||||| |||    
T  17272084 tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagact 17272183  T
Q  146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
    ||| ||| |||||| ||||||| |||| || ||||   ||||  |||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17272184 atcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaa---agatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 17272280  T
Q  246 actattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17272281 actattgatcattaatcggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 17272350  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33816647 - 33816341
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  33816647 tggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 33816548  T
Q  123 cacaaagtgtaatac-----------------ttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagta 205  Q
    || ||||||||||||                 |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||     
T  33816547 cagaaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtt 33816451  T
Q  206 actgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaa 305  Q
      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33816450 catgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaa 33816351  T
Q  306 ttaacttttt 315  Q
    ||||||||||    
T  33816350 ttaacttttt 33816341  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Original strand, 42199833 - 42200116
Alignment:
Q  30 aaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaag 129  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||| ||||||    
T  42199833 aaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaag 42199932  T
Q  130 tgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaac-tgtaaatccaagatgttgcaa 228  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  42199933 tgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaa 42200029  T
Q  229 gcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||| |||||||||||||    
T  42200030 gcattactagatgaatatactactgttcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaatc-aaattaacttttt 42200116  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5048075 - 5047750
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  ||    
T  5048075 atcaaaagttcagttcccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccg-ca 5047977  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5047976 aaatgtaacacttaagactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaa---agatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 5047880  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtc 326  Q
    |||  ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||       |||    
T  5047879 aagttttactagataaattattattgatcagtaatcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaa-ttttttcaaaaaagtc 5047781  T
Q  327 agttttctgactgcaccgtaaaagctcccaa 357  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5047780 tgtttcctgactgcaccgtaaaagctcccaa 5047750  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30002710 - 30002466
Alignment:
Q  59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||         ||||| |||||    
T  30002710 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------cacatgatatc 30002620  T
Q  159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattatt 258  Q
    | |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30002619 agcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 30002523  T
Q  259 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30002522 aatcagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 30002466  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 32592193 - 32592470
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32592193 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 32592292  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||         || || || ||| ||||| |||||| |||||||   ||||| | ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||    
T  32592293 aaagtgtaacact---------catatgatttcagcaactttgtttgcatgttaa---agatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttg 32592380  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32592381 aaagcattactaaatgaattactattgatcgttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 32592470  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 37287831 - 37288115
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |        ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||    
T  37287831 tggcatcaaaagttcaatcctcataatatcataa--------gattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgcc 37287922  T
Q  122 cc-acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    || ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  37287923 cccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttga---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaga 37288019  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaga-tcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37288020 tgttgcaagcattattagatgaattactattgagcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaattaacttttt 37288115  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 4598089 - 4598368
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||| |||    
T  4598089 tggcatcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgct-tgttttaagtgtaacaccc 4598187  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||         ||||| |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||    
T  4598188 cacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgttttcatgttaa---agatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatg 4598275  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4598276 ttgcaagcattattagattaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacatttt 4598368  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 9139349 - 9139612
Alignment:
Q  30 aaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaag 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  9139349 aaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaag 9139448  T
Q  130 tgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaag 229  Q
    ||||| ||||||                 || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  9139449 tgtaacacttaa----------------gataaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 9139529  T
Q  230 cattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9139530 cattactagacgaattactattgatcattaatcaataatc--taatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 9139612  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7152218 - 7152029
Alignment:
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   | ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||     
T  7152218 cacaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaa---atatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatt 7152122  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  7152121 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataacttttt 7152029  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 38011954 - 38012169
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||     
T  38011954 catcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccag 38012053  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||   |||| |||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  38012054 aaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgt---taaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 38012150  T
Q  226 caagcattactagatgaat 244  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  38012151 caaatattactagatgaat 38012169  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 315
Target Start/End: Original strand, 39400236 - 39400394
Alignment:
Q  154 atatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 253  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| || ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39400236 atatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattga 39400332  T
Q  254 ttattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39400333 tcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 39400394  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025392
Alignment:
Q  191 aacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaa 290  Q
    |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
Q  291 acattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  35025415 acattaa-atcaaaattaacttttt 35025392  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46883939
Alignment:
Q  68 taacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactct 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||||  ||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |    
T  46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaaa-ctatcacataatatcataaatttt 46884080  T
Q  168 gtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaa 267  Q
    ||||| ||||||| ||   | |||| ||||| ||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46884079 gtttgcatgttaaaaa---ttccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 46883987  T
Q  268 tcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  46883986 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaatttttt 46883939  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Original strand, 4205216 - 4205370
Alignment:
Q  158 catcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattat 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  4205216 catcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcat 4205312  T
Q  258 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||    
T  4205313 gaataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttt 4205370  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 315
Target Start/End: Original strand, 23431824 - 23431941
Alignment:
Q  198 atatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaa 297  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23431824 atatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaa 23431923  T
Q  298 gatcaaaattaacttttt 315  Q
     || ||||||||||||||    
T  23431924 aattaaaattaacttttt 23431941  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 316
Target Start/End: Original strand, 26896285 - 26896475
Alignment:
Q  124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatcc-aagatg 222  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |    |  ||||||||| ||||||  ||||| ||| || |||    
T  26896285 acaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaaa----tttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatg 26896380  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26896381 ttgcaaacattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaactttttt 26896475  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35025674 - 35025531
Alignment:
Q  59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35025674 tcatcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 35025575  T
Q  159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagta 205  Q
    ||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  35025574 atcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagta 35025531  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 315
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012648
Alignment:
Q  235 ctagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 38012648  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 54499349 - 54499194
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-ttttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |    
T  54499349 catcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacacccta 54499250  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||| |||| |  ||||||||||  |||||||    
T  54499249 caaagtgtaacttttaagactatcacatgatattagtaactctgtttccatgttaa 54499194  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 360 - 455
Target Start/End: Original strand, 36798477 - 36798572
Alignment:
Q  360 aacaaacctgaggagctggggcgttgtcatcaatgaaaggggctgctaaacttataaacgatgcctcgccaacaccaaccagactatagagaataa 455  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  36798477 aacaaacctgtgaagctggggcgttatcatcaatgaaaggtgctgcaagacttataaatgaagcctcgccaacaccaacgagcctagagagaataa 36798572  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 132
Target Start/End: Original strand, 39398049 - 39398115
Alignment:
Q  66 attaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgt 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39398049 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgt 39398115  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Original strand, 56050191 - 56050234
Alignment:
Q  190 caacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcatt 233  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  56050191 caacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

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Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3880023 - 3879737
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  3880023 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccac 3879924  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  3879923 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttg 3879827  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3879826 caagcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 3879737  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6091267 - 6090941
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||    
T  6091267 catcaaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaac 6091168  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaa-actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  6091167 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaa---agattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 6091071  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnng 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  6091070 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttt-aaaaaag 6090972  T
Q  325 tcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6090971 taagttttctgactgcaccgtagaagctccc 6090941  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Original strand, 1945934 - 1946260
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||| ||    
T  1945934 catcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctac 1946033  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||     
T  1946034 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtta 1946130  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnng 324  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||       |    
T  1946131 caagcattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttcaaaaaag 1946230  T
Q  325 tcagttttctgactgcaccgtaaaagctcc 354  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1946231 tcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 1946260  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 5627491 - 5627817
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||| ||    
T  5627491 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 5627590  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  5627591 aaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 5627687  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnng 324  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||            
T  5627688 caagcattactaggtgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaa-tttttttaaaaaaa 5627786  T
Q  325 tcagttttctgactgcaccgtaaaagctccc 355  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5627787 tcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 5627817  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 20768181 - 20768468
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||    
T  20768181 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcc 20768278  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||    
T  20768279 cataaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtg 20768375  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20768376 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaacttttt 20768468  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7235118 - 7234830
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
T  7235118 catcaaaagttcagtc-tcatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 7235020  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  7235019 aaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 7234923  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaat---cagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7234922 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 7234830  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21017199 - 21016915
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||    
T  21017199 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccc 21017100  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||| ||||||||| |||      |||  || ||||||    
T  21017099 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaatatgtcaacgataaaata------gtacgtctaagatg 21017009  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21017008 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttt 21016915  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4318907 - 4318626
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  4318907 catcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccta 4318808  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||   ||||| ||||||| | ||||||   | || |||||||||||    
T  4318807 taaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaa---agatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgtt 4318711  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||    
T  4318710 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaa 4318626  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 33618931 - 33619219
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||        ||||||| |||    
T  33618931 tggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacca--------gtgtaacaccc 33619022  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa--taaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
     | || |||| | |||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |    
T  33619023 tagaa-gtgtgacacttaagagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaata 33619121  T
Q  221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattatta---atcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33619122 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaacttttt 33619219  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 29182263 - 29182547
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac-gcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  29182263 catcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacaccccca 29182362  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  29182363 taaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggt---taaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgtt 29182459  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  29182460 gcaagtattactagatgaattac---tgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaattaacttttt 29182547  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33893067 - 33892810
Alignment:
Q  46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||           
T  33893067 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccacaaagtgtaacact------- 33892975  T
Q  146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
      ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33892974 --cacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaa---agatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatt 33892880  T
Q  246 actattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  33892879 actattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaacttttt 33892810  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 8513333 - 8513607
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||      | ||| |    
T  8513333 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cacccta 8513426  T
Q  125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| || ||    
T  8513427 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaa---agatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatctt 8513523  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8513524 gcaagcattactagatgaattactattg-------atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 8513607  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 6089005 - 6089282
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| || ||||| ||||||||      | |     
T  6089005 tggcatcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cact 6089098  T
Q  122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    | |||| || ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||    
T  6089099 ctacaaggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaa---agatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaat 6089195  T
Q  222 gttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  6089196 gttgcaagcattactatatgaattactattg-------atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaatttttt 6089282  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7055299 - 7055145
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| | | ||    
T  7055299 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctac 7055200  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7055199 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaa 7055145  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Original strand, 15491712 - 15491869
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  15491712 tggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 15491811  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15491812 cacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgatatcagcaattctgtttggatgttaa 15491869  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7054704 - 7054533
Alignment:
Q  182 aaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaa 280  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7054704 aaagattccaacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaa 7054605  T
Q  281 aatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttttnnnnnnngtcagttttctgactgcaccgtaaaagctc 353  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||       ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7054604 gatgaatcaaacattaaaatcaaaattaact-ttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtaaaagctc 7054533  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30353445 - 30353288
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||  ||    
T  30353445 tggcatcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcc 30353346  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  30353345 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa 30353288  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33724116 - 33724062
Alignment:
Q  256 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaac 310  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33724116 attaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 57
Target Start/End: Original strand, 18498531 - 18498565
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaa 57  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18498531 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

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Target: scaffold0318 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 316
Target Start/End: Original strand, 12010 - 12295
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  12010 atcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccaca 12109  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||    
T  12110 aagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgc 12206  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12207 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaactttttt 12295  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 408512 - 408228
Alignment:
Q  27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || ||||    
T  408512 atcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcaca 408414  T
Q  127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  408413 aagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 408317  T
Q  227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  408316 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaatttttt 408228  T

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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 231 - 514
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||    
T  231 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacaccc 330  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||      |||  |||||||||    
T  331 cataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaata------gtacgtccaagatg 421  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  422 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 514  T

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Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 94033 - 93899
Alignment:
Q  181 taaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaa 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  94033 taaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcactaatcaacaattt-aa 93935  T
Q  281 aatgaataaaacattaagatcaaaattaactttttt 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  93934 aatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttt 93899  T

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Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 94471 - 94331
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||    
T  94471 tggcatcaaaagtttggtccccatactatcatcaattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccc 94372  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaa 163  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  94371 cacaaagtgtaacacttaagactattacataatatcatcaa 94331  T

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Target: scaffold0291 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 313
Target Start/End: Original strand, 7987 - 8271
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || | |||| ||||| ||||||    
T  7987 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccac 8086  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  8087 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 8183  T
Q  226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  8184 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 8271  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 146101 - 145814
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||| ||    
T  146101 catcaaaagttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 146002  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  146001 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttg 145905  T
Q  226 caagcattactagatgaat-tactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  145904 caagcattactaaatgaatatacaattgatcattaatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaacttttt 145814  T

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Target: scaffold0061 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 44054 - 44342
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  || | |||| ||||  |||| |||    
T  44054 tggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccc 44153  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||    
T  44154 cacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttg 44249  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44250 ttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaacttttt 44342  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 154733 - 154445
Alignment:
Q  23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  || | |||| ||||  |||| |||    
T  154733 tggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccc 154634  T
Q  123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||    
T  154633 cacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttg 154538  T
Q  223 ttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  154537 ttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaacttttt 154445  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 267384 - 267662
Alignment:
Q  26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||    
T  267384 catcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccac 267483  T
Q  126 aaagtgtaatacttaaa-actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| |    
T  267484 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgct 267580  T
Q  225 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagatcaaaattaacttttt 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||         |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  267581 gcaagaattactagatgaatta---------accaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaatttttt 267662  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 274
Target Start/End: Original strand, 100994 - 101058
Alignment:
Q  208 tgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaa 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  100994 tgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta--gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

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Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 111
Target Start/End: Original strand, 100894 - 100935
Alignment:
Q  70 acaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaa 100935  T

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