View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14944_low_17 (Length: 429)

Name: NF14944_low_17
Description: NF14944
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14944_low_17
NF14944_low_17
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (23-264)||(31786486-31786724)
chr5 (26-264)||(699250-699485)
chr5 (26-264)||(22980893-22981128)
chr5 (26-264)||(12910455-12910690)
chr5 (26-264)||(15992380-15992615)
chr5 (26-264)||(38528077-38528311)
chr5 (23-264)||(22255279-22255517)
chr5 (23-264)||(33908330-33908567)
chr5 (23-264)||(40133482-40133720)
chr5 (26-264)||(19119959-19120194)
chr5 (26-264)||(35504465-35504700)
chr5 (23-264)||(36866859-36867097)
chr5 (26-264)||(7208704-7208938)
chr5 (66-264)||(5830032-5830227)
chr5 (26-264)||(30969164-30969399)
chr5 (26-264)||(31705452-31705686)
chr5 (26-264)||(35511322-35511552)
chr5 (23-264)||(27330401-27330639)
chr5 (48-264)||(13956202-13956415)
chr5 (26-257)||(21088613-21088841)
chr5 (26-264)||(22973922-22974157)
chr5 (26-264)||(39572919-39573146)
chr5 (26-263)||(5837655-5837889)
chr5 (27-236)||(23116090-23116296)
chr5 (26-257)||(36860523-36860752)
chr5 (21-264)||(25500766-25501006)
chr5 (26-263)||(27318330-27318562)
chr5 (26-263)||(35826327-35826558)
chr5 (23-264)||(35933992-35934231)
chr5 (26-264)||(8437066-8437300)
chr5 (23-264)||(8741725-8741964)
chr5 (23-263)||(23954636-23954867)
chr5 (45-264)||(17157871-17158087)
chr5 (26-264)||(9200333-9200559)
chr5 (21-264)||(1429002-1429225)
chr5 (26-264)||(24886204-24886422)
chr5 (23-264)||(7693327-7693556)
chr5 (26-264)||(32563249-32563475)
chr5 (23-264)||(14409181-14409404)
chr5 (26-180)||(14919449-14919603)
chr5 (74-264)||(2888285-2888472)
chr5 (23-264)||(43308500-43308730)
chr5 (26-264)||(22019732-22019958)
chr5 (46-264)||(42342851-42343056)
chr5 (34-256)||(6824329-6824546)
chr5 (31-263)||(15724594-15724822)
chr5 (26-180)||(26268174-26268328)
chr5 (23-168)||(5112247-5112391)
chr5 (149-264)||(25889593-25889705)
chr5 (77-264)||(25669737-25669911)
chr5 (27-261)||(8466845-8467058)
chr5 (27-134)||(28416494-28416601)
chr5 (185-263)||(28416392-28416470)
chr5 (23-81)||(25668746-25668804)
chr5 (228-264)||(43254154-43254190)
chr5 (189-264)||(26269069-26269144)
chr5 (120-171)||(11898148-11898199)
chr5 (26-63)||(11898102-11898139)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (23-264)||(27227330-27227568)
chr1 (26-264)||(15383029-15383264)
chr1 (23-264)||(16415739-16415977)
chr1 (27-264)||(47682339-47682573)
chr1 (26-264)||(2959844-2960079)
chr1 (23-264)||(8222221-8222458)
chr1 (23-264)||(25160725-25160963)
chr1 (26-264)||(238358-238593)
chr1 (26-264)||(51128955-51129190)
chr1 (23-263)||(10181853-10182091)
chr1 (23-264)||(27532826-27533063)
chr1 (23-263)||(27267046-27267282)
chr1 (25-264)||(30326797-30327033)
chr1 (26-264)||(38823310-38823545)
chr1 (27-264)||(4330378-4330612)
chr1 (26-263)||(7078909-7079143)
chr1 (23-264)||(32216148-32216386)
chr1 (26-264)||(10922823-10923058)
chr1 (26-264)||(37451382-37451616)
chr1 (23-261)||(47279282-47279517)
chr1 (23-264)||(15168189-15168427)
chr1 (26-264)||(9902899-9903134)
chr1 (23-264)||(19899613-19899852)
chr1 (23-264)||(15752122-15752360)
chr1 (26-263)||(18422747-18422981)
chr1 (26-263)||(30254519-30254753)
chr1 (23-264)||(34012227-34012460)
chr1 (26-264)||(23999443-23999679)
chr1 (26-264)||(32267130-32267365)
chr1 (23-264)||(39393476-39393715)
chr1 (26-261)||(42721135-42721364)
chr1 (23-263)||(14758134-14758362)
chr1 (26-264)||(27763155-27763391)
chr1 (23-261)||(28769745-28769981)
chr1 (26-264)||(27563750-27563985)
chr1 (26-263)||(28564629-28564861)
chr1 (23-263)||(31621395-31621636)
chr1 (27-264)||(3309244-3309484)
chr1 (23-261)||(40884906-40885141)
chr1 (24-264)||(46931505-46931741)
chr1 (26-263)||(3535028-3535253)
chr1 (23-261)||(41926256-41926484)
chr1 (23-237)||(33725472-33725683)
chr1 (26-261)||(22170807-22171039)
chr1 (59-264)||(1547408-1547602)
chr1 (26-263)||(37618747-37618974)
chr1 (26-264)||(11742213-11742430)
chr1 (122-264)||(48353735-48353873)
chr1 (26-134)||(48620733-48620841)
chr1 (49-246)||(38759652-38759846)
chr1 (122-264)||(1359780-1359919)
chr1 (144-264)||(21289817-21289931)
chr1 (23-74)||(21289765-21289816)
chr1 (217-262)||(31962900-31962945)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (26-264)||(18797402-18797637)
chr7 (27-264)||(27283820-27284054)
chr7 (26-263)||(9355678-9355912)
chr7 (23-264)||(41764929-41765167)
chr7 (26-264)||(30055602-30055837)
chr7 (23-264)||(15612610-15612848)
chr7 (26-263)||(31578916-31579150)
chr7 (23-261)||(5657335-5657570)
chr7 (26-264)||(7334869-7335103)
chr7 (44-257)||(15672617-15672830)
chr7 (26-264)||(37109947-37110184)
chr7 (44-264)||(6546612-6546829)
chr7 (23-263)||(32820905-32821142)
chr7 (26-263)||(11071281-11071512)
chr7 (26-257)||(21991711-21991934)
chr7 (23-264)||(23111262-23111502)
chr7 (26-264)||(10481680-10481915)
chr7 (23-264)||(24211813-24212052)
chr7 (23-263)||(44598738-44598973)
chr7 (26-262)||(37347097-37347329)
chr7 (26-225)||(38258620-38258816)
chr7 (26-264)||(4582994-4583229)
chr7 (47-264)||(12165848-12166053)
chr7 (23-244)||(43686112-43686330)
chr7 (26-263)||(48928149-48928382)
chr7 (26-263)||(10359066-10359300)
chr7 (26-264)||(17842435-17842672)
chr7 (27-264)||(22687315-22687541)
chr7 (26-263)||(32432527-32432761)
chr7 (59-263)||(37703350-37703551)
chr7 (35-261)||(37704241-37704489)
chr7 (23-264)||(8861357-8861595)
chr7 (23-260)||(33688117-33688351)
chr7 (26-264)||(29173615-29173832)
chr7 (59-264)||(46480980-46481182)
chr7 (26-262)||(31520594-31520809)
chr7 (23-264)||(25691395-25691633)
chr7 (70-264)||(26587943-26588126)
chr7 (26-263)||(43925177-43925404)
chr7 (23-262)||(26980395-26980614)
chr7 (26-264)||(12390500-12390716)
chr7 (26-205)||(48928474-48928649)
chr7 (99-264)||(35353256-35353418)
chr7 (26-179)||(27421313-27421465)
chr7 (142-264)||(44411391-44411510)
chr7 (27-140)||(44413351-44413464)
chr7 (27-264)||(32593057-32593273)
chr7 (127-244)||(38053637-38053751)
chr7 (190-264)||(34362029-34362103)
chr7 (23-75)||(26524364-26524416)
chr7 (59-118)||(38053586-38053645)
chr7 (23-65)||(34362149-34362191)
chr7 (44-77)||(35353202-35353235)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (26-263)||(41960940-41961174)
chr2 (26-264)||(4763731-4763966)
chr2 (23-264)||(4167019-4167257)
chr2 (23-264)||(44286046-44286284)
chr2 (21-264)||(2325246-2325478)
chr2 (26-257)||(3177039-3177267)
chr2 (26-263)||(33709101-33709335)
chr2 (26-264)||(37905808-37906045)
chr2 (23-264)||(4478466-4478700)
chr2 (26-264)||(31570602-31570837)
chr2 (22-264)||(41465597-41465836)
chr2 (26-264)||(43648113-43648348)
chr2 (27-264)||(29242013-29242240)
chr2 (26-264)||(19289191-19289426)
chr2 (26-264)||(26357677-26357912)
chr2 (30-264)||(44913766-44914002)
chr2 (26-264)||(11366248-11366484)
chr2 (26-264)||(18494149-18494383)
chr2 (26-223)||(17071646-17071840)
chr2 (23-264)||(33660245-33660474)
chr2 (26-254)||(33550865-33551089)
chr2 (26-234)||(45327820-45328025)
chr2 (26-264)||(4263944-4264180)
chr2 (26-264)||(39167237-39167466)
chr2 (26-264)||(13711564-13711794)
chr2 (26-264)||(27349816-27350041)
chr2 (27-264)||(31861953-31862187)
chr2 (23-264)||(19424510-19424734)
chr2 (26-234)||(36642086-36642293)
chr2 (43-223)||(17054005-17054182)
chr2 (26-264)||(19313952-19314182)
chr2 (52-264)||(35959023-35959227)
chr2 (23-261)||(43770719-43770945)
chr2 (25-264)||(7006806-7007025)
chr2 (26-171)||(33902166-33902311)
chr2 (23-203)||(41463779-41463956)
chr2 (26-264)||(5881639-5881864)
chr2 (121-264)||(19500783-19500923)
chr2 (67-209)||(18258210-18258349)
chr2 (45-101)||(19501768-19501823)
chr2 (23-71)||(41051263-41051311)
chr2 (186-263)||(41051169-41051246)
chr2 (217-264)||(18257406-18257453)
chr2 (217-263)||(41463459-41463505)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (26-264)||(37663617-37663852)
chr4 (26-264)||(55477767-55478002)
chr4 (26-263)||(28002863-28003097)
chr4 (34-264)||(1815409-1815636)
chr4 (26-264)||(19089329-19089564)
chr4 (23-264)||(33341496-33341733)
chr4 (26-261)||(50697342-50697574)
chr4 (26-257)||(17173390-17173618)
chr4 (24-263)||(46888035-46888270)
chr4 (25-263)||(6864134-6864369)
chr4 (26-264)||(25184213-25184448)
chr4 (23-264)||(19440524-19440762)
chr4 (23-264)||(34947971-34948211)
chr4 (26-262)||(36493567-36493799)
chr4 (26-261)||(17167813-17168045)
chr4 (23-250)||(35020925-35021149)
chr4 (26-263)||(25700933-25701168)
chr4 (26-261)||(879427-879659)
chr4 (59-264)||(7703642-7703844)
chr4 (23-263)||(55240982-55241218)
chr4 (26-264)||(23761172-23761406)
chr4 (27-264)||(32912455-32912690)
chr4 (23-264)||(29584076-29584314)
chr4 (59-264)||(47253873-47254075)
chr4 (23-264)||(49376064-49376302)
chr4 (21-264)||(4934089-4934318)
chr4 (26-261)||(27396716-27396948)
chr4 (46-264)||(37775787-37775993)
chr4 (41-264)||(34361367-34361588)
chr4 (30-264)||(42199833-42200066)
chr4 (46-262)||(17272084-17272297)
chr4 (42-264)||(32579562-32579781)
chr4 (26-244)||(38011954-38012169)
chr4 (48-264)||(3042741-3042954)
chr4 (26-264)||(50764830-50765055)
chr4 (23-264)||(33816392-33816647)
chr4 (27-263)||(5047843-5048075)
chr4 (30-263)||(9139349-9139563)
chr4 (23-264)||(37287831-37288063)
chr4 (59-264)||(30002517-30002710)
chr4 (23-264)||(4598089-4598317)
chr4 (26-263)||(32592193-32592418)
chr4 (123-263)||(7152081-7152218)
chr4 (59-205)||(35025531-35025674)
chr4 (154-264)||(39400236-39400343)
chr4 (68-264)||(46883990-46884177)
chr4 (26-180)||(54499194-54499349)
chr4 (158-257)||(4205216-4205312)
chr4 (191-264)||(35025442-35025515)
chr4 (198-261)||(23431824-23431887)
chr4 (124-264)||(26896285-26896423)
chr4 (66-132)||(39398049-39398115)
chr4 (190-233)||(56050191-56050234)
chr4 (235-264)||(38012568-38012597)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (26-264)||(42505925-42506160)
chr3 (26-264)||(26941110-26941345)
chr3 (23-261)||(46297615-46297850)
chr3 (23-261)||(52040775-52041010)
chr3 (23-264)||(39282740-39282978)
chr3 (25-263)||(53229003-53229238)
chr3 (26-264)||(46994511-46994746)
chr3 (26-263)||(33378636-33378870)
chr3 (23-264)||(44891585-44891823)
chr3 (23-264)||(48355029-48355267)
chr3 (26-262)||(34133026-34133259)
chr3 (49-264)||(22622568-22622780)
chr3 (23-264)||(2008021-2008258)
chr3 (26-264)||(24707965-24708202)
chr3 (47-264)||(33698265-33698479)
chr3 (23-261)||(37157795-37158031)
chr3 (23-261)||(37203155-37203391)
chr3 (26-264)||(7327332-7327567)
chr3 (26-264)||(54828551-54828786)
chr3 (23-264)||(22451056-22451294)
chr3 (23-264)||(32373558-32373796)
chr3 (23-264)||(3362341-3362581)
chr3 (26-264)||(4015551-4015785)
chr3 (25-253)||(45174595-45174821)
chr3 (26-262)||(25579830-25580063)
chr3 (26-264)||(40552109-40552344)
chr3 (26-264)||(3655050-3655287)
chr3 (26-264)||(4761498-4761734)
chr3 (25-264)||(11357231-11357450)
chr3 (23-263)||(11466912-11467142)
chr3 (29-263)||(29163912-29164134)
chr3 (26-263)||(24488813-24489047)
chr3 (26-264)||(21009651-21009887)
chr3 (53-263)||(1089811-1090018)
chr3 (26-264)||(47481613-47481849)
chr3 (23-264)||(38591786-38592024)
chr3 (23-264)||(22445915-22446153)
chr3 (23-244)||(43348346-43348563)
chr3 (26-264)||(21193697-21193933)
chr3 (26-264)||(29099446-29099672)
chr3 (26-264)||(43975742-43975973)
chr3 (42-264)||(36012244-36012465)
chr3 (46-264)||(14586530-14586735)
chr3 (26-264)||(44186367-44186586)
chr3 (41-264)||(54505913-54506134)
chr3 (26-167)||(53176145-53176286)
chr3 (23-134)||(51212958-51213069)
chr3 (44-253)||(11835494-11835695)
chr3 (144-261)||(51212624-51212738)
chr3 (26-264)||(27480208-27480464)
chr3 (26-262)||(40936082-40936297)
chr3 (26-180)||(35844417-35844571)
chr3 (26-107)||(20373300-20373381)
chr3 (145-263)||(50475021-50475136)
chr3 (92-222)||(20373136-20373263)
chr3 (121-234)||(11357030-11357140)
chr3 (143-251)||(53811597-53811698)
chr3 (44-78)||(53811695-53811729)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (23-264)||(16446731-16446969)
chr8 (26-262)||(1149490-1149723)
chr8 (26-257)||(36694829-36695057)
chr8 (26-264)||(37970375-37970610)
chr8 (23-264)||(11727120-11727358)
chr8 (23-263)||(27082695-27082932)
chr8 (26-261)||(6098372-6098609)
chr8 (26-263)||(1205026-1205260)
chr8 (52-261)||(4132545-4132750)
chr8 (23-263)||(1953845-1954084)
chr8 (26-264)||(16222962-16223197)
chr8 (26-264)||(43643451-43643686)
chr8 (23-264)||(5299802-5300040)
chr8 (31-264)||(33906316-33906546)
chr8 (23-264)||(38644074-38644312)
chr8 (26-257)||(12876208-12876437)
chr8 (23-264)||(34895063-34895296)
chr8 (26-262)||(9864247-9864480)
chr8 (26-264)||(23854287-23854522)
chr8 (23-264)||(7890813-7891051)
chr8 (25-261)||(39098978-39099211)
chr8 (26-260)||(10555062-10555293)
chr8 (26-264)||(44869596-44869831)
chr8 (30-264)||(35459567-35459798)
chr8 (23-264)||(465938-466166)
chr8 (23-264)||(40862516-40862753)
chr8 (49-264)||(8803672-8803885)
chr8 (26-264)||(30654438-30654674)
chr8 (26-264)||(31933742-31933977)
chr8 (26-244)||(13307722-13307936)
chr8 (25-180)||(41910925-41911080)
chr8 (49-180)||(43025824-43025955)
chr8 (26-132)||(1150090-1150196)
chr8 (121-264)||(1149776-1149912)
chr8 (108-264)||(24823250-24823395)
chr8 (157-264)||(12587812-12587916)
chr8 (153-264)||(35859160-35859268)
chr8 (26-118)||(41362614-41362706)
chr8 (154-264)||(34951913-34952020)
chr8 (26-118)||(34952030-34952122)
chr8 (185-263)||(33198057-33198135)
chr8 (44-118)||(7998411-7998486)
chr8 (181-261)||(18259330-18259410)
chr8 (25-81)||(33197947-33198003)
chr8 (108-164)||(12585297-12585353)
chr8 (136-205)||(7998487-7998553)
chr8 (157-251)||(34463704-34463792)
chr8 (231-260)||(41362723-41362752)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (26-264)||(3879788-3880023)
chr6 (26-264)||(6091031-6091267)
chr6 (26-263)||(7234885-7235118)
chr6 (26-264)||(5627491-5627727)
chr6 (26-263)||(4318672-4318907)
chr6 (23-264)||(20768181-20768417)
chr6 (26-264)||(1945934-1946170)
chr6 (23-264)||(21016967-21017199)
chr6 (23-261)||(33618931-33619162)
chr6 (26-263)||(29182263-29182495)
chr6 (26-263)||(8513333-8513562)
chr6 (46-263)||(33892862-33893067)
chr6 (26-180)||(7055145-7055299)
chr6 (23-180)||(15491712-15491869)
chr6 (23-263)||(6089005-6089237)
chr6 (23-180)||(30353288-30353445)
chr6 (182-263)||(7054622-7054704)
chr6 (23-57)||(18498531-18498565)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (26-264)||(7987-8222)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (27-264)||(12010-12244)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (27-264)||(408279-408512)
scaffold0002 (23-264)||(231-463)
scaffold0002 (23-163)||(94331-94471)
scaffold0002 (181-263)||(93951-94033)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (26-264)||(145865-146101)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (23-264)||(44054-44291)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (23-264)||(154496-154733)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (26-246)||(267384-267602)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (208-264)||(100994-101048)
scaffold0009 (70-111)||(100894-100935)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31786724 - 31786486
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
31786724 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccc 31786625  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
31786624 tacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatg 31786528  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
31786527 ttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcag 31786486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 699250 - 699485
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| | ||||    
699250 catcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccac 699349  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
699350 aaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 699446  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
699447 caagcattactagatgaattactattgattattaatcag 699485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 22980893 - 22981128
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||    
22980893 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcac 22980992  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
22980993 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttg 22981089  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22981090 caatcattactagatgaattattattgatcattaatcag 22981128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 12910455 - 12910690
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
12910455 catcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 12910554  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| |||  ||| ||  ||||| ||||||||||||    
12910555 aaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgt---taaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgttg 12910651  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
12910652 caagcattactagatgaattactattgaacattaatcag 12910690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15992615 - 15992380
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||    
15992615 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgatttgagtgcaacaccccac 15992516  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
15992515 aaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagtccaagatgttg 15992419  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15992418 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 15992380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38528311 - 38528077
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||    
38528311 catcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccac 38528213  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
38528212 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgt---taaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttg 38528116  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38528115 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 38528077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 22255279 - 22255517
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||| |||| ||||| ||     
22255279 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacacca 22255378  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   |||| || |||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
22255379 cacaaagtgtaacacttaaaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 22255475  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
22255476 ttgcaagccttactagatgaattactattgatcattaatcag 22255517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 33908330 - 33908567
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||    
33908330 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccc 33908429  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
33908430 cagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 33908526  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
33908527 ttgcaagcattactagat-aattactattgatcattaatcag 33908567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 40133482 - 40133720
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
40133482 tggcatcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 40133581  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
40133582 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 40133678  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
40133679 ttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcag 40133720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 19119959 - 19120194
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
19119959 catcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacaccccac 19120058  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| ||  || || |||||||||    
19120059 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttg 19120155  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19120156 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 19120194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 35504465 - 35504700
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||    
35504465 catcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctaccatattataagcgtaacaccccac 35504564  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
35504565 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 35504661  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
35504662 caagtattactagatgaattactattgattattaatcag 35504700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 36866859 - 36867097
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
36866859 tggcatcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 36866958  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
36866959 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 36867055  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
36867056 ttgcaaacattactggatgaattactattaatcatgaatcag 36867097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7208938 - 7208704
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| || |||    
7208938 catcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcac 7208840  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
7208839 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattttcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttg 7208743  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
7208742 caagtattactagatgaattattattgatcattaatcag 7208704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 264
Target Start/End: Original strand, 5830032 - 5830227
Alignment:
66 attaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaact 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
5830032 attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaact 5830131  T
166 ctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5830132 ctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 5830227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30969399 - 30969164
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||    
30969399 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcac 30969300  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||| |||| |||| |||||| || ||| | ||||||| ||    
30969299 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgt---taaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctg 30969203  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
30969202 caagtattactagatgagttactattaatcattaatcag 30969164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31705686 - 31705452
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||  | |||    
31705686 catcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcac 31705588  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||    
31705587 aaaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttg 31705491  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31705490 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 31705452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35511552 - 35511322
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||    
35511552 catcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccac 35511453  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| ||     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
35511452 aaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttg 35511361  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
35511360 caagcattactatatgaattactattgatcattaatcag 35511322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 27330401 - 27330639
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
27330401 tggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccc 27330500  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||  |||||| | |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||  |||| |||| || |||  ||||| |||||||||    
27330501 catgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatg 27330597  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27330598 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 27330639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13956415 - 13956202
Alignment:
48 gtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||    
13956415 gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactat 13956316  T
148 cacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 247  Q
    || ||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13956315 catataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 13956219  T
248 tattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||    
13956218 tattgatcattaatcag 13956202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21088841 - 21088613
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
21088841 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccac 21088742  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
21088741 aaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttg 21088645  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcat 257  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||    
21088644 taagcattactagatgaattactattaatcat 21088613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22974157 - 22973922
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| ||||| || |||    
22974157 catcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcac 22974058  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||  | || |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
22974057 aaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 22973961  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22973960 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 22973922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 39572919 - 39573146
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
39572919 catcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccac 39573018  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||  | |||||||||| |||||| |||||||||           |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
39573019 aaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaactctgt-----------taaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 39573107  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39573108 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 39573146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 5837655 - 5837889
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||||||    
5837655 catcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccac 5837754  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||| |||||| || |||||| ||| || ||||||||||||    
5837755 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgt---taaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttg 5837851  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
5837852 caagcattactagatgaattactgttgatcattaatca 5837889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23116296 - 23116090
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
23116296 atcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccaca 23116197  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
23116196 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 23116100  T
227 aagcattact 236  Q
    ||||||||||    
23116099 aagcattact 23116090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 36860523 - 36860752
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgtttt-aagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||    
36860523 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacacccca 36860622  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||    
36860623 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgtt 36860719  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcat 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
36860720 gcaagcattactaaatgaattactattaatcat 36860752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25501006 - 25500766
Alignment:
21 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    |||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
25501006 actgccatcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 25500907  T
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||| ||||| | |||  ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||    
25500906 cccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaaga 25500810  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
25500809 tgttgcaagcattactagatgaaatactgttgatcattaatcag 25500766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27318562 - 27318330
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||    
27318562 catcaaaagtttagttctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 27318463  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||    ||| |  |||||||||    
27318462 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagta--cataagtttaagatgttg 27318368  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
27318367 caaacattactatatgaattactattgatcattaatca 27318330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35826558 - 35826327
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||    
35826558 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactccac 35826460  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||  ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
35826459 aaagtgtaacccttaagattatca--taatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 35826365  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35826364 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 35826327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 35933992 - 35934231
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| ||    
35933992 tggcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacacc 35934091  T
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||   ||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||||||    
35934092 ctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaa---agatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagat 35934188  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
35934189 gttgcaagcattactagttgaattattattgatcattaatcag 35934231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 8437066 - 8437300
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||   || ||||||    
8437066 catcaaaagttcagtcctcattatatcatcaac-catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccac 8437164  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
8437165 aatgtgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 8437261  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8437262 aaaacattactagatgaattactattgatcattaatcag 8437300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8741964 - 8741725
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||    
8741964 tggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacaccc 8741865  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacat-aatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||    
8741864 tacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaat 8741768  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
8741767 gttgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaatcag 8741725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23954867 - 23954636
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
23954867 tggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 23954768  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    || ||||||||||||| ||| ||  ||||| | |||||||    
23954767 cacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgtt----aaaatgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagatg 23954672  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
         | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
23954671 -----aacattacttgatgaattactattgatcattaatca 23954636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17158087 - 17157871
Alignment:
45 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaac 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  |||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
17158087 atagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 17157988  T
145 tatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat 244  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||  ||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
17157987 catcacataatattatcaactctgtttgcatg---ataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 17157891  T
245 tactattgatcattaatcag 264  Q
    || |||||||||||||||||    
17157890 tattattgatcattaatcag 17157871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 9200333 - 9200559
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||    
9200333 catcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccac 9200432  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||         ||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| || ||| || |||||||||    
9200433 aaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttg 9200520  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9200521 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 9200559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1429225 - 1429002
Alignment:
21 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||      
1429225 actggcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac-- 1429128  T
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
                   |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
1429127 ---------------acttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaaga 1429046  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1429045 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 1429002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 24886204 - 24886422
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||           
24886204 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaac------- 24886296  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
24886297 ----------acttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 24886383  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24886384 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 24886422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 7693327 - 7693556
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
7693327 tggcatcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccc 7693426  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||         |||||| |||| | |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| || ||||||    
7693427 cacaaagtgtaacac---------tcacatgatattagcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatg 7693514  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
7693515 ttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcag 7693556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 32563249 - 32563475
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
32563249 catcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccac 32563348  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| ||         |||||| |||||| |||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
32563349 aaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---tatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 32563436  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
32563437 caagaattactagataaattattattgatcattaatcag 32563475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14409404 - 14409181
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
14409404 tggcatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac---- 14409310  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
             || | ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
14409309 ---------tact-cttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatg 14409223  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
14409222 ttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattattcag 14409181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14919603 - 14919449
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| || |||    
14919603 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctcac 14919504  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
14919503 aaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa 14919449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2888472 - 2888285
Alignment:
74 gactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttga 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||   ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||     
2888472 gactacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgc 2888373  T
174 atgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2888372 atgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 2888285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43308730 - 43308500
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||    
43308730 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccc 43308631  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
       ||||||||| |||||| |||        ||||||||||||||  ||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||| || ||||||    
43308630 tgaaaagtgtaacacttaagact--------atatcatcaactcttcttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatg 43308542  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43308541 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 43308500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 22019732 - 22019958
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
22019732 catcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 22019831  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||| ||         |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| || |||||||||    
22019832 aaagtataacac---------tcacatgatatcagcaactctatttgcatgt---taaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttg 22019919  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22019920 taagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 22019958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Original strand, 42342851 - 42343056
Alignment:
46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||           
42342851 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttact-tgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacact------- 42342942  T
146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
      ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
42342943 --cacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatt 42343037  T
246 actattgatcattaatcag 264  Q
    || ||||||||||||||||    
42343038 accattgatcattaatcag 42343056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6824546 - 6824329
Alignment:
34 gttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgta 133  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
6824546 gttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgta 6824447  T
134 atacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcatt 233  Q
    | |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||| ||||   |||||||| ||| ||||| | | ||  ||||| || ||||||||||||||||     
6824446 acacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatc 6824352  T
234 actagatgaattactattgatca 256  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
6824351 actagatgagatactattgatca 6824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Original strand, 15724594 - 15724822
Alignment:
31 aaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagt 130  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| | || ||||||    
15724594 aaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgccccaaagt 15724692  T
131 gtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagc 230  Q
    |||  | |||| ||||||| || |||||| ||||| |||||  ||||   |||||||| |||| |||| ||||||  ||||| ||||| || ||| ||||    
15724693 gtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgt---taaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaagc 15724789  T
231 attactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
15724790 attactagatgaattactattaatcattaatca 15724822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 26268174 - 26268328
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||    
26268174 catcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcac 26268273  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||    
26268274 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaa 26268328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5112391 - 5112247
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
5112391 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-accc 5112293  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctg 168  Q
    ||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
5112292 cacaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaactctg 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 264
Target Start/End: Original strand, 25889593 - 25889705
Alignment:
149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
25889593 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatgaattact 25889689  T
249 attgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||    
25889690 attgatcattaatcag 25889705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 264
Target Start/End: Original strand, 25669737 - 25669911
Alignment:
77 tacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatg 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||| |||    
25669737 tacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacact---------cacatgatatcatcaactctgtttgcatg 25669826  T
177 ttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25669827 ttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 25669911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 261
Target Start/End: Original strand, 8466845 - 8467058
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||            
8466845 atcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaac-------- 8466936  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
             |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||  |   || ||||| ||  |||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||    
8466937 ---------acttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttaca---tattaaaggtg-taacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgc 8467023  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8467024 aagcattactagatgaattactattgatcattaat 8467058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28416601 - 28416494
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||    
28416601 atcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccaca 28416502  T
127 aagtgtaa 134  Q
    ||||||||    
28416501 aagtgtaa 28416494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28416470 - 28416392
Alignment:
185 gatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
28416470 gatgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatca 28416392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Original strand, 25668746 - 25668804
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacac 81  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
25668746 tggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcattagattaacaagaatacac 25668804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254190
Alignment:
228 agcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcag 43254190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 264
Target Start/End: Original strand, 26269069 - 26269144
Alignment:
189 ccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
26269069 ccaaggataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcag 26269144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Original strand, 11898148 - 11898199
Alignment:
120 ccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgttt 171  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
11898148 ccccacaaagtgtaacccttaagaatatcacataacatcatcaactctgttt 11898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 63
Target Start/End: Original strand, 11898102 - 11898139
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatc 63  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
11898102 catcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatc 11898139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27227568 - 27227330
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
27227568 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 27227469  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
27227468 cacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatg 27227372  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27227371 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 27227330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 15383029 - 15383264
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||    
15383029 catcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 15383128  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
15383129 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttg 15383225  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
15383226 caagcattactagatgaattactattgattattaatcag 15383264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 16415739 - 16415977
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
16415739 tggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 16415838  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
16415839 cacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 16415935  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16415936 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcag 16415977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47682573 - 47682339
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||    
47682573 atcaaaagttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctcaca 47682474  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
47682473 aagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgc 47682377  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
47682376 aagcattactaaatgaattactattgatcattaatcag 47682339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 2959844 - 2960079
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||    
2959844 catcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 2959943  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
2959944 aaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 2960040  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2960041 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 2960079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 8222221 - 8222458
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||    
8222221 tggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccc 8222320  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
8222321 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 8222417  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
8222418 ttgcaagcattactagatgaatta-tattgatcattaatcag 8222458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 25160725 - 25160963
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
25160725 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagtgtaacaccc 25160824  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
25160825 cacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 25160921  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
25160922 ttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcag 25160963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 238593 - 238358
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
238593 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 238494  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
238493 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttg 238397  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
238396 caagcattactagatgaattactattaatcatgaatcag 238358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 51128955 - 51129190
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
51128955 catcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccac 51129054  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
51129055 aaagtgtaacaattaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 51129151  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51129152 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 51129190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10182091 - 10181853
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
10182091 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 10181992  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaac-tgtaaatccaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| |||| |||  |||||| | ||||| ||||| ||    
10181991 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgt---taaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaat 10181895  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
10181894 gttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatca 10181853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27533063 - 27532826
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
27533063 tggcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 27532965  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
27532964 cacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 27532868  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27532867 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 27532826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27267282 - 27267046
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||    
27267282 tggcattaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaat-ctaccttgttttgagtgtaacaccc 27267184  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||    
27267183 cacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatg 27267087  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
27267086 ttgcaagcattactagatgaattactattgataattaatca 27267046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30327033 - 30326797
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||    
30327033 gcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacacccca 30326934  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||    
30326933 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgtt 30326837  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
30326836 gcaagcattactagatgaattactattgatcatcaatcag 30326797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 38823310 - 38823545
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||| ||    
38823310 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaac 38823409  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| ||| || |||||| || || ||||||    
38823410 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---tagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttg 38823506  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38823507 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 38823545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 4330378 - 4330612
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
4330378 atcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 4330477  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||    
4330478 aaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgt---taaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgc 4330574  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
4330575 aagcattactagatgaattacaattgatcattaatcag 4330612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7079143 - 7078909
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
7079143 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 7079044  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||    
7079043 aaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatattg 7078947  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7078946 caaacattactagatgaattactattgatcattaatca 7078909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 32216148 - 32216386
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
32216148 tggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 32216247  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
32216248 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 32216344  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
32216345 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcag 32216386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 10922823 - 10923058
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||| ||||| || |||    
10922823 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcac 10922922  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |  || |||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
10922923 aaagtgtaacacttaagactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttg 10923019  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10923020 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 10923058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 37451382 - 37451616
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||| || ||     
37451382 catcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaa 37451480  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
37451481 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 37451577  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37451578 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcag 37451616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 47279282 - 47279517
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||    
47279282 tggcatcgaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcc 47279381  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
47279382 cataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatg 47279478  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
47279479 ttgcaaacattattagatgaattactattgatcattaat 47279517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 15168189 - 15168427
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
15168189 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 15168288  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||    
15168289 cagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatg 15168385  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15168386 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcag 15168427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9903134 - 9902899
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||| ||||||    
9903134 catcaaaagttcaatccacatactatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccac 9903035  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||    
9903034 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctg 9902938  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9902937 caagcactactagatgaattactattgatcattaatcag 9902899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19899852 - 19899613
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||| |||| ||||| |||    
19899852 tggcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccc 19899753  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
19899752 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 19899656  T
223 ttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
19899655 ttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcag 19899613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 15752122 - 15752360
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
15752122 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 15752221  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||| || ||||||| || ||| ||  ||||| ||||||| |    
15752222 cataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgt---taaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaag 15752318  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15752319 ttgcaatttttactagatgaattactattgatcattaatcag 15752360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 18422747 - 18422981
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||| ||||||    
18422747 catcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccac 18422846  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||| |||||||||| | || |  ||||| ||||||||||||    
18422847 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttg 18422943  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18422944 caagcattgctagatgaattactattgatcattaatca 18422981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 30254519 - 30254753
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||| ||| |     
30254519 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctat 30254618  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||    
30254619 aaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttg 30254715  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
30254716 caagcattactagatgaattactattgattattaatca 30254753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34012460 - 34012227
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||    
34012460 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34012361  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||| ||||| ||     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||    
34012360 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatg 34012269  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
34012268 ttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcag 34012227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 23999443 - 23999679
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||| ||    
23999443 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 23999542  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
23999543 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 23999639  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
23999640 caagcattactagatgaatatactattgatcattaatcag 23999679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 32267130 - 32267365
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||    
32267130 catcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactccac 32267229  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||| || ||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||    
32267230 aaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttg 32267326  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
32267327 caagcattactagatgaattactattgaacattaatcag 32267365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 39393476 - 39393715
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |    
39393476 tggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatc 39393575  T
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||| || |||| | |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
39393576 ctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaa---agatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagat 39393672  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39393673 gttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcag 39393715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Original strand, 42721135 - 42721364
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
42721135 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 42721234  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||   ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||    
42721235 aaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgt---taaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttg 42721328  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
42721329 caattattactagattaattactattgatcattaat 42721364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 14758134 - 14758362
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
14758134 tggcatcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 14758233  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || |||         |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
14758234 cagaaa---------ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 14758321  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14758322 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 14758362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27763391 - 27763155
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||| ||||| ||| ||    
27763391 catcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctac 27763292  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||    
27763291 aaagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttg 27763195  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
27763194 caagcattactagataaatatactattgatcattaatcag 27763155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 28769745 - 28769981
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac-gcc 121  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||  |||||  ||    
28769745 tggcatcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacaccc 28769844  T
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
28769845 ccacaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 28769941  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
28769942 gttgcaaacattgctagatgaattactattgatcattaat 28769981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27563985 - 27563750
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | |  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||    
27563985 catcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccac 27563886  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||| | || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
27563885 aaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttg 27563789  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
27563788 caagtattactagatgaattaatattgatcattaatcag 27563750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28564861 - 28564629
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||  |||| ||||      
28564861 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgt 28564762  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||    
28564761 aaagtgtaacactt--aactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttg 28564667  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28564666 caaacattactagatgaattactattgatcattaatca 28564629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31621636 - 31621395
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||    
31621636 tggcatcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaataccc 31621537  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa--taaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    ||  |||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||| |    
31621536 ca-gaagtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaata 31621438  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
31621437 tgttgcaagcattagtagatgaactactattgatcattaatca 31621395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 3309244 - 3309484
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| || |||    
3309244 atcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacctcac 3309343  T
126 aa-----agtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
     |     ||||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
3309344 tacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaaga 3309440  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3309441 tattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 3309484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 40884906 - 40885141
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||   |    
40884906 tggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattc 40885005  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||| | ||||| ||||||  ||||| |||||||||    
40885006 cgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 40885102  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
40885103 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 40885141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 264
Target Start/End: Original strand, 46931505 - 46931741
Alignment:
24 ggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||  || || ||||| |||     
46931505 ggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttg--ttcagcgtaacaccct 46931602  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
46931603 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 46931699  T
224 tgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
46931700 tgcaagcattactagatgaatatattattgatcattaatcag 46931741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 3535028 - 3535253
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||    
3535028 catcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccac 3535127  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||         ||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
3535128 aaagtgtaacactta---------catgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttg 3535215  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3535216 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 3535253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 41926256 - 41926484
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |    
41926256 tggcatcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactc 41926355  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||      ||| | |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||     
41926356 cacaaagtgtaacact------tattaaataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagata 41926446  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41926447 tt-caagcattactagatgaattactattgatcattaat 41926484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33725683 - 33725472
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||    
33725683 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccc 33725584  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  |||||  |||| |||    
33725583 cagaaagtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatg 33725487  T
223 ttgcaagcattacta 237  Q
    |||||| ||||||||    
33725486 ttgcaaacattacta 33725472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Original strand, 22170807 - 22171039
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| ||||||    
22170807 catcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacaccccac 22170906  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| |   ||||| || |||||||||    
22170907 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttg 22171003  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
22171004 caaacattattagataaattactattgatcattaat 22171039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 264
Target Start/End: Original strand, 1547408 - 1547602
Alignment:
59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
1547408 tcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 1547507  T
159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 258  Q
    | |||||||||           ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
1547508 aacaactctgt-----------taaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcatt 1547596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37618974 - 37618747
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtat--catcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||  |||    
37618974 catcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatccc 37618875  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    | ||||||||| |||         || |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
37618874 ataaagtgtaacact---------catataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgt 37618787  T
224 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
37618786 tgcaagcattactagatgaattagtattgaccattaatca 37618747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11742430 - 11742213
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||           
11742430 catcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaac------- 11742339  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              | |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
11742338 ----------aattaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 11742252  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11742251 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 11742213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 264
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353873
Alignment:
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagat 48353830  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
48353831 attgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcag 48353873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Original strand, 48620733 - 48620841
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
48620733 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 48620832  T
126 aaagtgtaa 134  Q
    |||||||||    
48620833 aaagtgtaa 48620841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 246
Target Start/End: Original strand, 38759652 - 38759846
Alignment:
49 tatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatc 148  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||  || | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
38759652 tatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatc 38759751  T
149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 246  Q
    | ||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||| || |||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
38759752 agataatatcaccaactatgtttgcatgt---taaaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1359919 - 1359780
Alignment:
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||| | ||| ||    
1359919 ccacaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaat 1359823  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
1359822 gttgcaagcattactggatgaattactatcgatcattaatcag 1359780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 264
Target Start/End: Original strand, 21289817 - 21289931
Alignment:
144 ctatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaa 243  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| || ||||   ||||||||||||||| |||  |  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
21289817 ctatcacataatatca---actctgtttgcatattaa---agatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaa 21289910  T
244 ttactattgatcattaatcag 264  Q
    ||| |||||||||||||||||    
21289911 ttattattgatcattaatcag 21289931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Original strand, 21289765 - 21289816
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaag 74  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
21289765 tggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Original strand, 31962900 - 31962945
Alignment:
217 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
31962900 aagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatc 31962945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 18797402 - 18797637
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||    
18797402 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcac 18797501  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
18797502 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 18797598  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18797599 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 18797637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 27283820 - 27284054
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||    
27283820 atcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccaca 27283919  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
27283920 aagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 27284016  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27284017 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 27284054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9355912 - 9355678
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
9355912 catcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 9355813  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
9355812 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttg 9355716  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
9355715 caagcattactagatgaattgctattgatcattaatca 9355678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41765167 - 41764929
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
41765167 tggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccc 41765068  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||     
41765067 cagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatt 41764971  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
41764970 ttgcaagcattactggatgaattattattgatcattaatcag 41764929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 30055602 - 30055837
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||| ||| ||    
30055602 catcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccctac 30055701  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
30055702 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 30055798  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30055799 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 30055837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15612848 - 15612610
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
15612848 tggcatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 15612749  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||| |||||| |||||| || ||||||    
15612748 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatg 15612652  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
15612651 ttgcaagcattactagatgaattattgttgatcattaatcag 15612610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31579150 - 31578916
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||| |     
31579150 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctat 31579051  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||    
31579050 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgt---taaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttg 31578954  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31578953 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 31578916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5657570 - 5657335
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||    
5657570 tggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcc 5657471  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
5657470 cacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 5657374  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5657373 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 5657335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 7334869 - 7335103
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
7334869 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 7334968  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    | ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
7334969 agagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaact-agtttgaatgt---taaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttg 7335064  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7335065 caagcattactagatgaattactattaatcattaatcag 7335103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672617
Alignment:
44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |    
15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
144 ctatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataa---tatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
15672730 ctatcacataatatcatcaactctatttgaatgt---taaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagat 15672634  T
241 gaattactattgatcat 257  Q
    |||||||||||||||||    
15672633 gaattactattgatcat 15672617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 37109947 - 37110184
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattcta--ccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||| |||| ||||| ||||    
37109947 catcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacacccc 37110046  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
37110047 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 37110143  T
224 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37110144 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 37110184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 6546612 - 6546829
Alignment:
44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |    
6546612 catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaata 6546711  T
144 ctatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaa 243  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||    
6546712 ttatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaa 6546808  T
244 ttactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||    
6546809 ttactattgatcattaatcag 6546829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32821142 - 32820905
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
32821142 tggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 32821043  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
32821042 cataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 32820946  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
32820945 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattcatca 32820905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 11071281 - 11071512
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
11071281 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 11071380  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||   ||||||   ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
11071381 aaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgt---taaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttg 11071474  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11071475 caaacattactagatgaattactattgatcattaatca 11071512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 21991711 - 21991934
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
21991711 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 21991810  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
21991811 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 21991907  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcat 257  Q
    ||||||     |||||||||||||||||||||    
21991908 caagca-----agatgaattactattgatcat 21991934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 23111262 - 23111502
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttat-tc-taccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| |    
23111262 tggcatcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacac 23111361  T
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
23111362 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaaga 23111458  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
23111459 tgttgaaagcattactagaagaattactattgatcataaatcag 23111502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 10481680 - 10481915
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
10481680 catcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccac 10481779  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||| ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||    
10481780 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctctttgcatgt---caaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttg 10481876  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
10481877 caagtattactagatgaattactattgatcgttaatcag 10481915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 24211813 - 24212052
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||  ||    
24211813 tggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacatcc 24211912  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
     ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||    
24211913 tacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatg 24212009  T
223 ttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24212010 ttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcag 24212052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 44598738 - 44598973
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
44598738 tggcatcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccc 44598837  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| || ||||||    
44598838 cacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatg 44598934  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
44598935 ttacaagcattactagatgaa--actattgatcattaatca 44598973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 37347097 - 37347329
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  | ||||    
37347097 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaaa-ctccac 37347195  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||    
37347196 aaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattg 37347292  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
37347293 caagcattactcgatgaattactattgatcattaatc 37347329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 38258620 - 38258816
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||    
38258620 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 38258719  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
38258720 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 4582994 - 4583229
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
4582994 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 4583093  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||| | ||| ||  ||||| | ||||||||||    
4583094 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttg 4583190  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
4583191 caagcattactggatgaattactattaatcatgaatcag 4583229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 264
Target Start/End: Original strand, 12165848 - 12166053
Alignment:
47 agtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaacta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||             
12165848 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac--------- 12165938  T
147 tcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
12165939 tcacataatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatta 12166035  T
247 ctattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||    
12166036 ctattgatcattaatcag 12166053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 43686112 - 43686330
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
43686112 tggcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 43686211  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
43686212 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 43686308  T
223 ttgcaagcattactagatgaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||    
43686309 ttgcaagcattactggatgaat 43686330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48928382 - 48928149
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||     
48928382 catcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcag 48928284  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||| ||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||    
48928283 aaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 48928187  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48928186 caaacattactagatgaattactattgatcattaatca 48928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10359300 - 10359066
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaa-tctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
10359300 catcaaaagttcagtc-tgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacccca 10359202  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||    
10359201 caaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagatttt 10359105  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
10359104 gcaagcattactaaatgatttactattgatcattaatca 10359066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17842672 - 17842435
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattcta--ccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||| |||| |||||  |||    
17842672 catcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatccc 17842573  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
17842572 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 17842476  T
224 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17842475 tgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcag 17842435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 22687315 - 22687541
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
22687315 atcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 22687414  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||| |||||| |||||||||           ||| |||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
22687415 aagtgtaacactcaagactatctcatgatatcaacaactctgt-----------taaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 22687503  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22687504 aagcattaatagatgaattactattgatcattaatcag 22687541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 32432527 - 32432761
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
32432527 catcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 32432626  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |   || |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||    
32432627 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgca---tattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttg 32432723  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
32432724 caagcattactagatgaattattattaatcatgaatca 32432761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37703551 - 37703350
Alignment:
59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
37703551 tcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatc 37703452  T
159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 258  Q
    ||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
37703451 atcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcatt 37703355  T
259 aatca 263  Q
    |||||    
37703354 aatca 37703350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 261
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704489
Alignment:
35 ttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaa 134  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
135 tacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa----------------------taaagatgccaacgataatatagtaactgtaa 212  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||                      |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
37704341 cacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaa 37704440  T
213 atccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
37704441 gtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcattaat 37704489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 8861357 - 8861595
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
8861357 tggcatcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 8861456  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    | |||||||||| ||| || || ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
8861457 cgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgt---taaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatg 8861553  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
8861554 ttgcatgcattactagatgaaatactattgatcattaatcag 8861595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33688351 - 33688117
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |    
33688351 tggcatcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactc 33688252  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| | | || ||||||| || |||||| |||||||||||| | ||   |||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||    
33688251 cataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagt---taaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 33688155  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
33688154 ttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 29173615 - 29173832
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||           
29173615 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgttac------- 29173707  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
29173708 ----------acttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaaa----tgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 29173793  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
29173794 caagcattactagatgaattactattgatcatgaatcag 29173832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46480980
Alignment:
59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||  | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46481083  T
159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 258  Q
    || |||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
46481082 attaactttgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcatt 46480986  T
259 aatcag 264  Q
    ||||||    
46480985 aatcag 46480980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31520809 - 31520594
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||           
31520809 catcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaac------- 31520718  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
31520717 ----------acttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttg 31520631  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
31520630 caagcattactcgatgaattactattgatcattaatc 31520594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25691633 - 25691395
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||| |||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
25691633 tggcatcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 25691534  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||   ||||||||  |||||||| |||  |  ||||| | ||| |||    
25691533 cacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgt---taaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatg 25691437  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25691436 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcag 25691395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26587943
Alignment:
70 acaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgt 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||    
26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgt 26588027  T
170 ttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
               |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26588026 -----------taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcag 26587943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 43925177 - 43925404
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| || |||    
43925177 catcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcac 43925275  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||       ||  ||||||||||||    
43925276 aacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaata------atacgtccaagatgttg 43925366  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
43925367 caagcattactagatgaattactattaatcatgaatca 43925404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 262
Target Start/End: Original strand, 26980395 - 26980614
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
26980395 tggcatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac---- 26980490  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
                 |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||    
26980491 -------------acttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatg 26980574  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
26980575 ttgcaagtattactagatgaattattgttgatcattaatc 26980614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12390716 - 12390500
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||           
12390716 catcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaac------- 12390624  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||   ||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
12390623 ----------acttaagact--cacataatatcatcaactcagcttgcatgttaa---agatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 12390539  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12390538 caaccattactagatgaattactatttatcattaatcag 12390500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48928649 - 48928474
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| || ||     
48928649 catcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcag 48928551  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagta 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||    
48928550 aaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaaaatgccaacgataaaatagta 48928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 35353256 - 35353418
Alignment:
99 taccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataa 198  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||   ||||| |||||||||    
35353256 taccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaa---agatgtcaacgataa 35353352  T
199 tatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
     ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
35353353 aatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcag 35353418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27421465 - 27421313
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||    
27421465 catcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccac 27421367  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  || |||||| |||||||||||| ||||||    
27421366 aaagtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44411510 - 44411391
Alignment:
142 aactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
44411510 aactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 44411414  T
242 aattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||| |||||| ||||||||||    
44411413 aattaatattgaccattaatcag 44411391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44413464 - 44413351
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
44413464 atcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccaca 44413365  T
127 aagtgtaatactta 140  Q
    |||||||| |||||    
44413364 aagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32593273 - 32593057
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||            
32593273 atcaaaagttcagtc-tcacagtatcatcaattcatcagattatcaaaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaac-------- 32593183  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
             |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||| |    
32593182 ---------acttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttac 32593095  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
32593094 aaatattactagataaattactatggatcattaatcag 32593057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 38053637 - 38053751
Alignment:
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
38053637 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgt---taaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 38053733  T
227 aagcattactagatgaat 244  Q
    || ||||| | |||||||    
38053734 aaacattatttgatgaat 38053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34362103 - 34362029
Alignment:
190 caacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
34362103 caacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcag 34362029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 26524416 - 26524364
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 75  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
26524416 tggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaaga 26524364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 118
Target Start/End: Original strand, 38053586 - 38053645
Alignment:
59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||    
38053586 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataagtgtaac 38053645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 34362191 - 34362149
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcag 65  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
34362191 tggcatcaaaagttcagttcttatagtatcatcaattcatcag 34362149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 77
Target Start/End: Original strand, 35353202 - 35353235
Alignment:
44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagact 77  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
35353202 catagtatcaccaattcatcagattaacaagact 35353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 41960940 - 41961174
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
41960940 catcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 41961039  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
41961040 aaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttg 41961136  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41961137 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 41961174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 4763731 - 4763966
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||    
4763731 catcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccccac 4763830  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||    
4763831 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgt---taaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 4763927  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
4763928 caagcattactagttgaattactattgatcattaatcag 4763966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 4167019 - 4167257
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
4167019 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 4167118  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||    
4167119 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatg 4167215  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
4167216 ttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcag 4167257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 44286046 - 44286284
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
44286046 tggcatcaaaagtttagtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccc 44286145  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||| |||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||    
44286146 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgt---taaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatg 44286242  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
44286243 ttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcag 44286284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2325478 - 2325246
Alignment:
21 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |    
2325478 actggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacac 2325387  T
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
2325386 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaaga 2325290  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
2325289 tgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcag 2325246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 3177039 - 3177267
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
3177039 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccac 3177138  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| |||| |||| ||||||  ||||| |||||||| ||     
3177139 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatatta 3177235  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
3177236 caagcattactagatgaattactatttatcat 3177267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33709335 - 33709101
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||    
33709335 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaaatattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctac 33709236  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
33709235 aaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttg 33709139  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33709138 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 33709101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 37905808 - 37906045
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgta--acgcccc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||  || ||||    
37905808 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacccccc 37905907  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| |||| ||||| |||  |  ||||| ||||||||||    
37905908 acaaagtgtaacacttaaaactatcgcataatatcattaactctgtttgcatgt---taaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgt 37906004  T
224 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
37906005 tgcaagaattactggatgaattactattgatcattaatcag 37906045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 4478466 - 4478700
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-ttttattctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||        
4478466 tggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaa---- 4478561  T
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
     |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||   |||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||    
4478562 -cacaaagtgtaacacttaagtctatcacatgatatcaccaactctgtttccatgt---taaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagat 4478657  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
4478658 gttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcag 4478700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31570837 - 31570602
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||    
31570837 catcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccac 31570738  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |  |||||||||    
31570737 aaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttg 31570641  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
31570640 caagcattgctagatgaattactattgatcattaatcag 31570602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Original strand, 41465597 - 41465836
Alignment:
22 ctggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    |||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
41465597 ctggtatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacc 41465696  T
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
     || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
41465697 tcagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagat 41465793  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
41465794 gttgcaaacattactatatgaattactattgatcattaatcag 41465836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43648348 - 43648113
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| || |||    
43648348 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacac 43648249  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||   |||||||  ||||||||| |||| |  ||||| |||||||||| |    
43648248 aaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttccatgt---taaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcg 43648152  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43648151 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcag 43648113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29242240 - 29242013
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
29242240 atcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 29242141  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||         
29242140 aagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgt---taaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat----- 29242049  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
      | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
29242048 --gaattactagatgaattactattgaacattaatcag 29242013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19289426 - 19289191
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||  |||||    
19289426 catcaaaagttaagttctcacagtatcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccac 19289327  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||| || || |||| ||| || |||||| |||||||| |||    
19289326 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgt---taaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattg 19289230  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19289229 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 19289191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 26357677 - 26357912
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | || ||||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||    
26357677 catcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 26357776  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||    
26357777 aaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttg 26357873  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26357874 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 26357912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Original strand, 44913766 - 44914002
Alignment:
30 aaaagttcaatcctc-atagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac-gccccacaa 127  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||  ||||||||    
44913766 aaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccccacaa 44913865  T
128 agtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgca 227  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||    
44913866 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 44913962  T
228 agcattactag---atgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||||    
44913963 agcattattagaaaatgaattactattaatcatgaatcag 44914002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11366484 - 11366248
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  || | |||| |||   |||| ||| ||    
11366484 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctac 11366385  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
11366384 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 11366288  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
11366287 caagcattactagatgaatatactattgatcattaatcag 11366248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18494383 - 18494149
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  || |||    
18494383 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaaa-cctcac 18494285  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||| || | |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
18494284 aaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 18494188  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18494187 taagcattactagatgaattgctattgatcattaatcag 18494149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17071840 - 17071646
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||    
17071840 catcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 17071741  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
17071740 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33660474 - 33660245
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
33660474 tggcatcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 33660375  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||          ||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||  |||||    
33660374 cacaaagtgtaacac---------ccacatgatatcagcaactttgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatg 33660287  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33660286 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 33660245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33551089 - 33550865
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||    
33551089 catcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccac 33550990  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  || || ||||| ||||||    
33550989 aaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttg 33550894  T
226 caagcattactagatgaattactattgat 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
33550893 caagcattactagatgaataactattgat 33550865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 45327820 - 45328025
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||     
45327820 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcag 45327919  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
45327920 aaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 45328016  T
226 caagcatta 234  Q
    |||||||||    
45328017 caagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4264180 - 4263944
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
4264180 catcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacaccccac 4264081  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatc-acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||  | ||| | |||||||||    
4264080 aaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgtt 4263984  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
4263983 gcaagcattactagatgaaataatattgatcattgatcag 4263944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39167466 - 39167237
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
39167466 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccac 39167367  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||  |||||    
39167366 aaagtgta------acaactatcacataatatcatcaactctgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttg 39167276  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
39167275 ctagcattactagatgaattactattaattatgaatcag 39167237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 13711564 - 13711794
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||     
13711564 catcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttat-----catgttttaagtgtaacaccccat 13711658  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||| || |||||||   |||||||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||    
13711659 aaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaa---agatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttg 13711755  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
13711756 caaacaatactagatgaattactattgatcattaatcag 13711794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27350041 - 27349816
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
27350041 catcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccac 27349943  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| ||         |||||| ||||||  ||||||||||| | ||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| || |||||||||    
27349942 aaagtgtaacac---------tcacatgatatcaggaactctgtttgcaagt---taaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttg 27349855  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27349854 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 27349816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 31861953 - 31862187
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||| |||| ||||| |||||||    
31861953 atcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccaca 31862052  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    ||| || || |||| ||||||  ||||| |||||||| |||     
31862053 aagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaag---gattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgt 31862149  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31862150 agacattactagatgaattactattgatcattaatcag 31862187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19424734 - 19424510
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
19424734 tggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccc 19424635  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||                 || |||||| ||| || || ||||||    
19424634 cacaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgtta-----------------aagatagtacctgcaagtctaagatg 19424552  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19424551 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 19424510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 36642086 - 36642293
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa--ttttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||     
36642086 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccct 36642185  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||  ||||   |||||||||||||||||| |||||| | |||| | ||||||||    
36642186 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgt---taaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgt 36642282  T
224 tgcaagcatta 234  Q
    |||||||||||    
36642283 tgcaagcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17054182 - 17054005
Alignment:
43 tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||     
17054182 tcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaan 17054083  T
143 actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
17054082 actatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 19313952 - 19314182
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
19313952 catcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccac 19314050  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactg---taaatccaagatg 222  Q
    ||||||       ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||| || |||||| ||||||  ||   ||| || ||||||    
19314051 aaagtg-------taacactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatg 19314140  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19314141 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 19314182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 264
Target Start/End: Original strand, 35959023 - 35959227
Alignment:
52 catcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcaca 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||    
35959023 catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcaca 35959121  T
152 taatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 251  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35959122 taatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacatg----tccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 35959214  T
252 gatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||    
35959215 gatcattaatcag 35959227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43770945 - 43770719
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||     
43770945 tggcatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacct 43770846  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||         |||||| |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||    
43770845 cacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatg 43770758  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
43770757 ttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaat 43770719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7007025 - 7006806
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||          
7007025 gcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaac------ 7006932  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
               |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
7006931 -----------acttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgtt 7006846  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
7006845 gcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcag 7006806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 171
Target Start/End: Original strand, 33902166 - 33902311
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||    
33902166 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccac 33902265  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgttt 171  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
33902266 aaagtgtaacacttaatagtatcacataatatcattaactctgttt 33902311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41463956 - 41463779
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||  |||  |||||||| |||||| ||     
41463956 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacct 41463857  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatag 203  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||    
41463856 cacaaaatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 5881639 - 5881864
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  || |||    
5881639 catcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattt-atcataccttgttttaagtgtaatacctcac 5881737  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||         ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||   ||||| |||| |||| ||||||  ||||| || |||||||||    
5881738 aaagtgtaacact---------cacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaa---agatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 5881825  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
5881826 caagcattactagatgaattactattgatcattattcag 5881864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19500923 - 19500783
Alignment:
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||   |||||  |||||||| ||||||  ||||| | |||||    
19500923 cccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaa---agatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaaga 19500827  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19500826 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 19500783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258210
Alignment:
67 ttaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactc 166  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 18258250  T
167 tgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactg 209  Q
    | |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||    
18258249 tctttgcatgt---taaagatcccaacgataaaatagtaactg 18258210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19501823 - 19501768
Alignment:
45 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
19501823 atagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttattctac 19501768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 41051311 - 41051263
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 71  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
41051311 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41051246 - 41051169
Alignment:
186 atgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
41051246 atgccaaggataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatca 41051169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257406
Alignment:
217 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcag 18257406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41463505 - 41463459
Alignment:
217 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
41463505 aagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatca 41463459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37663852 - 37663617
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||| ||||||    
37663852 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccac 37663753  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
37663752 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 37663656  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37663655 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 37663617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 55478002 - 55477767
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||    
55478002 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacaccccac 55477903  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||    
55477902 aacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttg 55477806  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
55477805 caagcattactagatgaattactattaatcattaatcag 55477767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28003097 - 28002863
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
28003097 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 28002998  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
28002997 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 28002901  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28002900 ctaacattactagatgaattactattgatcattaatca 28002863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 264
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815636
Alignment:
34 gttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgta 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
134 atacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcatt 233  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
1815509 acacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacatt 1815605  T
234 actagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
1815606 actagatgaattacaattgatcattaatcag 1815636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19089564 - 19089329
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || | ||||| ||| ||    
19089564 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctac 19089465  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
19089464 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 19089368  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19089367 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 19089329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 33341496 - 33341733
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
33341496 tggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 33341594  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
33341595 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 33341691  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33341692 ttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 33341733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Original strand, 50697342 - 50697574
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||    
50697342 catcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacac 50697440  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttg-aatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
50697441 aaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgtt 50697537  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50697538 gtaagcattactagatgaattactattgatcattaat 50697574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 17173390 - 17173618
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
17173390 catcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 17173489  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
17173490 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 17173586  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcat 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
17173587 caagcatcactagatgaattactatttatcat 17173618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46888270 - 46888035
Alignment:
24 ggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
46888270 ggcatcaaaagttcagtccccatactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccc 46888171  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    |||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
46888170 acaaaacgtaacacttaga-ctatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 46888075  T
224 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46888074 tacaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 46888035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 6864134 - 6864369
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| |||||    
6864134 gcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacacccca 6864233  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||| ||  ||||| | |||||||||    
6864234 caaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgtt 6864330  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6864331 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 6864369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 25184213 - 25184448
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||    
25184213 catccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 25184312  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||   | || || |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
25184313 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaa---ttccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 25184409  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25184410 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 25184448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19440762 - 19440524
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||| |||| ||||| |||    
19440762 tggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacaccc 19440663  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||| ||||||  |||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||    
19440662 cacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 19440566  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19440565 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 19440524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34948211 - 34947971
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||| |||    
34948211 tggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccc 34948112  T
123 cacaaagtgtaa--tacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||    
34948111 cacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaaga 34948015  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
34948014 tgttgcaagcattactagatgaaatactattgatcgttaatcag 34947971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36493799 - 36493567
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  | ||||    
36493799 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccac 36493701  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| |||    
36493700 aaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattg 36493604  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
36493603 caagcattactcgatgaattactattgatcattaatc 36493567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Original strand, 17167813 - 17168045
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
17167813 catcaaaagttcattctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 17167912  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
17167913 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 17168009  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
17168010 caagcatcactagatgaattactatttatcattaat 17168045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35021149 - 35020925
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
35021149 tggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 35021050  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||     
35021049 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagata 35020953  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactat 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
35020952 ttgcaaacattactagatgaattactat 35020925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25701168 - 25700933
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac-gcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
25701168 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccca 25701069  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||   |||||| | ||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||    
25701068 caaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgt---taaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagatttt 25700972  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
25700971 gcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatca 25700933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 879659 - 879427
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||    
879659 catcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 879560  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |  || |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
879559 aaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---agattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 879463  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
879462 caagcattactagatgaattattattgatcattaat 879427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 264
Target Start/End: Original strand, 7703642 - 7703844
Alignment:
59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||    
7703642 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatc 7703741  T
159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 258  Q
    | |||||||||||| | ||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
7703742 agcaactctgtttgcacgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactatttatcatt 7703838  T
259 aatcag 264  Q
    ||||||    
7703839 aatcag 7703844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 55241218 - 55240982
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||     
55241218 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcagat-aagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacct 55241120  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
55241119 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 55241023  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
55241022 ttgcaaacattactagataaattactattaatcattaatca 55240982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 23761172 - 23761406
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||     
23761172 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta-tctaccttgttttaagtgtaacacctcat 23761270  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | | |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||   ||||||| |||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||    
23761271 aaagtgtcacatttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgt---taaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttg 23761367  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
23761368 caagcattactagatgaattattattgatcattaatcag 23761406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32912690 - 32912455
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    ||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||| |||    
32912690 atcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaca 32912591  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
32912590 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 32912494  T
227 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
32912493 aagcattactagatgaatatactattgatcattaatcag 32912455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29584314 - 29584076
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
29584314 tggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacaccc 29584215  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||  |||||| | |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||  |||| |||| || |||  ||||| |||||||||    
29584214 catgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatg 29584118  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29584117 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 29584076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 264
Target Start/End: Original strand, 47253873 - 47254075
Alignment:
59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
47253873 tcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 47253972  T
159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 258  Q
    | |||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47253973 agcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 47254069  T
259 aatcag 264  Q
    ||||||    
47254070 aatcag 47254075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 49376064 - 49376302
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||   || |||    
49376064 tggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacaccc 49376163  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |    
49376164 cacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaag 49376260  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
49376261 ttgaaagcattactaaatgaattactattgatcattaatcag 49376302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4934318 - 4934089
Alignment:
21 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
4934318 actggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacac 4934219  T
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| ||           |    
4934218 ctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaatagtacct-----------a 4934133  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
4934132 tgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcattaatcag 4934089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Original strand, 27396716 - 27396948
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||     
27396716 catcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccat 27396815  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | |||||| || ||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||   |||||||| |||||||||  | ||| || ||| ||||| ||||||    
27396816 aaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttg 27396912  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27396913 caagcattactagatgaattactattgatcattaat 27396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Original strand, 37775787 - 37775993
Alignment:
46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||            
37775787 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac-------- 37775878  T
146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
     |||||| |||||| ||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
37775879 -tcacatgatatcagcaactttgtttgcatgt---taaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatt 37775974  T
246 actattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||    
37775975 actattgatcattaatcag 37775993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34361588 - 34361367
Alignment:
41 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatactta 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
34361588 cctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacactta 34361489  T
141 aaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagat 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
34361488 aagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagat 34361392  T
241 gaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
34361391 gaatatactattgatcattaatcag 34361367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Original strand, 42199833 - 42200066
Alignment:
30 aaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaag 129  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||| ||||||    
42199833 aaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaag 42199932  T
130 tgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaac-tgtaaatccaagatgttgcaa 228  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||    
42199933 tgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaa 42200029  T
229 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
42200030 gcattactagatgaatatactactgttcattaatcag 42200066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 262
Target Start/End: Original strand, 17272084 - 17272297
Alignment:
46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| | |||||| |||    
17272084 tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagact 17272183  T
146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
    ||| ||| |||||| ||||||| |||| |   || |||||||  |||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
17272184 atcgcatgatatcagcaactctatttgca---tattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 17272280  T
246 actattgatcattaatc 262  Q
    |||||||||||||||||    
17272281 actattgatcattaatc 17272297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 32579562 - 32579781
Alignment:
42 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaa 141  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || |||||||||  |||||    
32579562 ctcatagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactcttaa 32579661  T
142 aactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatg 241  Q
     ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||   |||| ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
32579662 gactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatg 32579758  T
242 aattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||    
32579759 aattactattgatcattaatcag 32579781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 38011954 - 38012169
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||     
38011954 catcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccag 38012053  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||   |||| |||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
38012054 aaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgt---taaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 38012150  T
226 caagcattactagatgaat 244  Q
    |||  ||||||||||||||    
38012151 caaatattactagatgaat 38012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Original strand, 3042741 - 3042954
Alignment:
48 gtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| | || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
3042741 gtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactat 3042840  T
148 cacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
3042841 cacataatatcatcaactttgtttgcttgt---taaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactagatgaattag 3042937  T
248 tattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||| |||||||||    
3042938 tattgattattaatcag 3042954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 50764830 - 50765055
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||          ||||||| ||||||    
50764830 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac----------gtgtaacaccccac 50764919  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||| || ||| || | |||||||| |||||| ||||| |||||| | |||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
50764920 aaagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 50765016  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50765017 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 50765055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33816647 - 33816392
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
33816647 tggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 33816548  T
123 cacaaagtgtaatac-----------------ttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagta 205  Q
    || ||||||||||||                 |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||     
33816547 cagaaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtt 33816451  T
206 actgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
      ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33816450 catgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcag 33816392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5048075 - 5047843
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||    
5048075 atcaaaagttcagttcccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaa-tacccgca 5047977  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
5047976 aaatgtaacacttaagactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 5047880  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
5047879 aagttttactagataaattattattgatcagtaatca 5047843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 263
Target Start/End: Original strand, 9139349 - 9139563
Alignment:
30 aaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaag 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
9139349 aaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaag 9139448  T
130 tgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaag 229  Q
    ||||| ||||||                 || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||    
9139449 tgtaacacttaa----------------gataaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 9139529  T
230 cattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
9139530 cattactagacgaattactattgatcattaatca 9139563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 37287831 - 37288063
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |        ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||    
37287831 tggcatcaaaagttcaatcctcataatatcataa--------gattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgcc 37287922  T
122 cc-acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    || ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||    
37287923 cccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttga---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaga 37288019  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
37288020 tgttgcaagcattattagatgaattactattgagcattaatcag 37288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30002710 - 30002517
Alignment:
59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||         ||||| |||||    
30002710 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------cacatgatatc 30002620  T
159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 258  Q
    | |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30002619 agcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 30002523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 4598089 - 4598317
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||| |||    
4598089 tggcatcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgct-tgttttaagtgtaacaccc 4598187  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||         ||||| |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||    
4598188 cacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgttttcatgttaa---agatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatg 4598275  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
4598276 ttgcaagcattattagattaattactattgatcattaatcag 4598317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 32592193 - 32592418
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
32592193 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 32592292  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| ||         ||| || || ||| ||||| |||||| ||||   |||||||| | ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||    
32592293 aaagtgtaacac---------tcatatgatttcagcaactttgtttgcatgt---taaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttg 32592380  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
32592381 aaagcattactaaatgaattactattgatcgttaatca 32592418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7152218 - 7152081
Alignment:
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   | ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||     
7152218 cacaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaa---atatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatt 7152122  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
7152121 ttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatca 7152081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35025674 - 35025531
Alignment:
59 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatc 158  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
35025674 tcatcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 35025575  T
159 atcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagta 205  Q
    ||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||    
35025574 atcaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagta 35025531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 264
Target Start/End: Original strand, 39400236 - 39400343
Alignment:
154 atatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 253  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| || ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
39400236 atatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattga 39400332  T
254 tcattaatcag 264  Q
    |||||||||||    
39400333 tcattaatcag 39400343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46883990
Alignment:
68 taacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactct 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||||  ||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |    
46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaaa-ctatcacataatatcataaatttt 46884080  T
168 gtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||| ||||||| ||   | |||| ||||| ||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46884079 gtttgcatgttaaaaa---ttccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 46883990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 54499349 - 54499194
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-ttttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |    
54499349 catcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacacccta 54499250  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||| |||| |  ||||||||||  |||||||    
54499249 caaagtgtaacttttaagactatcacatgatattagtaactctgtttccatgttaa 54499194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 257
Target Start/End: Original strand, 4205216 - 4205312
Alignment:
158 catcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcat 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
4205216 catcaactctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcat 4205312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025442
Alignment:
191 aacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 35025442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 261
Target Start/End: Original strand, 23431824 - 23431887
Alignment:
198 atatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
23431824 atatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaat 23431887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 264
Target Start/End: Original strand, 26896285 - 26896423
Alignment:
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatcc-aagatg 222  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |    |  ||||||||| ||||||  ||||| ||| || |||    
26896285 acaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaaa----tttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatg 26896380  T
223 ttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
26896381 ttgcaaacattactagatgaatatactattgatcattaatcag 26896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 132
Target Start/End: Original strand, 39398049 - 39398115
Alignment:
66 attaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgt 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| |||||||||||||    
39398049 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgt 39398115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Original strand, 56050191 - 56050234
Alignment:
190 caacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcatt 233  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
56050191 caacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 264
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012597
Alignment:
235 ctagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcag 38012597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42506160 - 42505925
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||| ||||||    
42506160 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccac 42506061  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
42506060 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 42505964  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42505963 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 42505925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26941345 - 26941110
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||  || ||     
26941345 catcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcat 26941246  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
26941245 aaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 26941149  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26941148 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 26941110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 46297850 - 46297615
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
46297850 tggcgtcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 46297751  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
46297750 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatg 46297654  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46297653 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 46297615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 52041010 - 52040775
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
52041010 tggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 52040911  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
52040910 cacatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 52040814  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
52040813 ttgcaaacattactagatgaatgattattgatcattaat 52040775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 39282740 - 39282978
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
39282740 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccc 39282839  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||   |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||    
39282840 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgt---taaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatg 39282936  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39282937 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcag 39282978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 53229238 - 53229003
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
53229238 gcatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactcccca 53229139  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| | |||||||||    
53229138 caaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgtt 53229042  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
53229041 gcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatca 53229003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46994746 - 46994511
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
46994746 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccac 46994647  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||    ||||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||| |||    
46994646 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatg---ctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 46994550  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46994549 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 46994511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33378870 - 33378636
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
33378870 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaa 33378771  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
33378770 gaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttg 33378674  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33378673 caaacattactagatgaattactattgatcattaatca 33378636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 44891585 - 44891823
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
44891585 tggcatcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactc 44891684  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| ||  || || ||||||    
44891685 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatg 44891781  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
44891782 ttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcag 44891823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 48355029 - 48355267
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||   |    
48355029 tggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacatac 48355128  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||||    
48355129 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatg 48355225  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
48355226 ttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaatcag 48355267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 34133026 - 34133259
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
34133026 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 34133125  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
34133126 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 34133222  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
34133223 caagcattactagatgaattactagtaatcatgaatc 34133259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622568
Alignment:
49 tatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||    
22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22622680 acataatatcatcaaatctgtttggatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 22622584  T
249 attgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||    
22622583 attgatcattaatcag 22622568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 2008021 - 2008258
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || | |    
2008021 tggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgt-acactc 2008119  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
2008120 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatg 2008216  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
2008217 ttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaatcag 2008258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24708202 - 24707965
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacactta--atctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
24708202 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccc 24708103  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||    
24708102 acaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagt 24708006  T
224 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
24708005 tgcaagcattattagataaattactattaatcattaatcag 24707965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 264
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698479
Alignment:
47 agtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaacta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
147 tcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 246  Q
    || ||| |||||  |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
33698365 tcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaatta 33698461  T
247 ctattgatcattaatcag 264  Q
     |||||||||||||||||    
33698462 atattgatcattaatcag 33698479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 37157795 - 37158031
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||    
37157795 tggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccc 37157894  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaact-ctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||   |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||| ||    
37157895 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgt---taaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatat 37157991  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
37157992 gtcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaat 37158031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 37203155 - 37203391
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| | |||    
37203155 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccc 37203254  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaact-ctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||   |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||    
37203255 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgt---taaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatat 37203351  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
37203352 atcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaat 37203391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7327567 - 7327332
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| | |||  |||||||| ||||||    
7327567 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacaccccac 7327468  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
7327467 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttg 7327371  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7327370 caagcattactagatgaattactattaatcattaatcag 7327332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 54828786 - 54828551
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||    
54828786 catcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccac 54828687  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||   |||| || ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
54828686 aaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgt---taaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 54828590  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
54828589 caagcattactagataaattactattgatcattaatcag 54828551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 22451056 - 22451294
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||    
22451056 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacaccc 22451155  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||  |||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| |||| |||| ||||||  ||||| |||||||||    
22451156 cagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 22451252  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22451253 ttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcag 22451294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 32373558 - 32373796
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
32373558 tggcatcaaaagttccaccccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 32373657  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |   || |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
32373658 cacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgca---tattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatg 32373754  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
32373755 ttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcag 32373796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 3362341 - 3362581
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacact--taatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgc 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |    
3362341 tggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaattcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacac 3362440  T
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| || |||  |  || ||||| |    
3362441 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaata 3362537  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
3362538 tgttgcaagcattactggatgaattactattgatcattaatcag 3362581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 4015551 - 4015785
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
4015551 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 4015650  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||||   |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
4015651 aaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgt---taaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 4015746  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4015747 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 4015785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Original strand, 45174595 - 45174821
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcccc 123  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |     
45174595 gcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactct 45174694  T
124 acaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgt 223  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| | || |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
45174695 acaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaa---agatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgt 45174791  T
224 tgcaagcattactagatgaattactattga 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
45174792 tgcaagcattactagatgaattactattga 45174821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 25579830 - 25580063
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
25579830 catcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccac 25579929  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |  ||| || |||||| ||||| |||    
25579930 aaagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattg 25580026  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25580027 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 25580063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40552344 - 40552109
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| |||| |||||  |||||    
40552344 catcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatcccac 40552245  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || |||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||    
40552244 aacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttg 40552148  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
40552147 caagcattactagatgaattactattgattattaatcag 40552109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3655287 - 3655050
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||| | ||||    
3655287 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccac 3655188  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||   |||| ||| |||||| |||  |  | ||| ||||||||||||    
3655187 aaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaa---agattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttg 3655091  T
226 caagcattactag--atgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
3655090 caagcattactagatatgaattactattgattattaatcag 3655050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4761734 - 4761498
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac-gcccca 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||  |||||    
4761734 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccccca 4761635  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| || ||| ||||| |||||    
4761634 caaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgtt 4761538  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
4761537 gcaaacattaccagatgaattactattaatcattaatcag 4761498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11357450 - 11357231
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||          
11357450 gcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaac------ 11357357  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
               |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
11357356 -----------acttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgtt 11357271  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11357270 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 11357231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 11466912 - 11467142
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
11466912 tggcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 11467011  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   | ||||| ||||||| || |||||| ||| || || ||||||    
11467012 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgt---ttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatg 11467108  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
11467109 ttgcaa-------tagatgaattactattgatcattaatca 11467142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164134
Alignment:
29 caaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaa 128  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
129 gtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaa 228  Q
    |||||| ||         |||||| |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||    
29164012 gtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaa 29164099  T
229 gcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29164100 gcattactagatgaattactattgatcattaatca 29164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24489047 - 24488813
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| || |||    
24489047 catcaaaagttcagtccccatattatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcac 24488948  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||  | |||| | ||||||||||    
24488947 aaggtgtaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttg 24488851  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
24488850 caagcattactagatgcattactattaatcatgaatca 24488813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21009887 - 21009651
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || | |||| ||||  |||| | | ||    
21009887 catcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctac 21009788  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| || |||||||||    
21009787 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttg 21009691  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
21009690 caagcattactagatgaatatactattgatcattaatcag 21009651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 263
Target Start/End: Original strand, 1089811 - 1090018
Alignment:
53 atcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacg-ccccacaaagtgtaatacttaaaactatcaca 151  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
1089811 atcaatttatcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 1089910  T
152 taatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 251  Q
    ||| |||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
1089911 taacatcaacaactctatttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactatt 1090006  T
252 gatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||    
1090007 gatcattaatca 1090018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 47481613 - 47481849
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||  |||| ||| ||    
47481613 catcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctac 47481712  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |   || |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
47481713 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgca---tattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttg 47481809  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
47481810 caagcattactagatgaatatactattgatcattaatcag 47481849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 38591786 - 38592024
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  |||    
38591786 tggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccc 38591885  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
38591886 cacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttgcatgt---caaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatg 38591982  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
38591983 ttgcaagcattattaaacaaattactattgatcattaatcag 38592024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22446153 - 22445915
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |    
22446153 tggcatcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaac-ac 22446055  T
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
     ||||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||| |   || ||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||    
22446054 tcacaatgtataacactcaagactatcatataatatcatcaactatttttgca---tattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaat 22445958  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
22445957 gttgcaagtattactggatgaattactattgatcattaatcag 22445915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 43348346 - 43348563
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
43348346 tggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 43348444  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |  ||||||    
43348445 cataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatg 43348541  T
223 ttgcaagcattactagatgaat 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
43348542 ttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 21193697 - 21193933
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||     
21193697 catcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccat 21193796  T
126 aaagtgtaatacttaaa-actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||  ||| ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| ||||   ||||||| |  ||||||| |||||| | |||| | |||||||||    
21193797 aaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgtt 21193893  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
21193894 gcaaccattactaaatgaattactattgattattaatcag 21193933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 29099446 - 29099672
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  | || | ||||||||||||| ||||||    
29099446 catctaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccac 29099545  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||         || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||   |||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
29099546 aaagtgtaa---------ctttcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttg 29099633  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
29099634 caagcattactagatgaattaccattgatcattaatcag 29099672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43975973 - 43975742
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| |||||     
43975973 catcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccag 43975874  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaact---ctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||       ||| |||||| ||||||||||||||||    |||||  ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||     
43975873 aaagtg-------taacactatcgcataatatcatcaactatgttgtttacatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatt 43975784  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
43975783 ttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcag 43975742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012465
Alignment:
42 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatactta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||    
36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacactta 36012343  T
141 aaactatcacataatatcatcaactct-gtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactaga 239  Q
    | ||||||| || |||||| ||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
36012344 agactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaa---agatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactaga 36012440  T
240 tgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
36012441 tgaattactattgatcattaatcag 36012465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14586735 - 14586530
Alignment:
46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||            
14586735 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac-------- 14586644  T
146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
     ||  || |||||| ||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
14586643 -tcgtatgatatcaacaactatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagt-acggtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaatt 14586549  T
246 actattgatcattaatcag 264  Q
    |||| ||||||||||||||    
14586548 actactgatcattaatcag 14586530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44186586 - 44186367
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
44186586 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccac 44186487  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||                ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||| |||||| || ||| || |||||||||    
44186486 aa----------------ctatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaa---agatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttg 44186406  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
44186405 caagcattactagataaattactattgatcattaatcag 44186367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Original strand, 54505913 - 54506134
Alignment:
41 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatactta 140  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| | | ||||||||||| |||||    
54505913 cctcatagtatcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacactta 54506012  T
141 aaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagat 240  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
54506013 agactatcacataatatcatctactttatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagat 54506109  T
241 gaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
54506110 gaatatactattgatcattaatcag 54506134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 53176145 - 53176286
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||   |||||| | |||| | ||||    
53176145 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccac 53176244  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactct 167  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||    
53176245 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactct 53176286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 51213069 - 51212958
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
51213069 tggcatcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccc 51212970  T
123 cacaaagtgtaa 134  Q
    ||||||||||||    
51212969 cacaaagtgtaa 51212958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11835695 - 11835494
Alignment:
44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaat-tttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaa 142  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||     
11835695 catagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaag 11835596  T
143 actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatga 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||         ||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
11835595 actatcacatgatatcatcaactctatttgcat---------gatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatga 11835505  T
243 attactattga 253  Q
    |||||||||||    
11835504 attactattga 11835494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51212738 - 51212624
Alignment:
144 ctatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
51212738 ctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaa 51212642  T
244 ttactattgatcattaat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
51212641 ttactattgatcattaat 51212624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27480464 - 27480208
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc--- 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||       
27480464 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccaga 27480365  T
123 -------cac---aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaac----tctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaact 208  Q
           |||    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    | |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  |    
27480364 agtgtaacacccagaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacat 27480268  T
209 gtaaatccaagatg----ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||| ||||| |||    || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
27480267 gtaagtccaaaatgttaattacaaacattactagatgaattactattgattattaatcag 27480208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 40936082 - 40936297
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  | |||||||||||||           
40936082 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatccaacttt-ttttaagtgtaac------- 40936173  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
              |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  || || || |||||||||    
40936174 ----------acttaagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttg 40936260  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
40936261 caagcattactagataaattactattgatcattaatc 40936297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 35844417 - 35844571
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-ttttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||| |    
35844417 catcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacacccta 35844516  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||    
35844517 caaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaa 35844571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20373381 - 20373300
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgtt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
20373381 catcaaaagttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475136
Alignment:
145 tatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat 244  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||| ||| ||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaa---agatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 50475117  T
245 tactattgatcattaatca 263  Q
    || ||||||||||||||||    
50475118 tagtattgatcattaatca 50475136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373136
Alignment:
92 tttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgcca 191  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||    
20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattcca 20373167  T
192 acgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||| ||||||  | ||| |||||||||    
20373166 acgataaaatagtacatataagtccaagatg 20373136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11357030
Alignment:
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||   |||| ||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||    
11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgt---taaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaaga 11357044  T
221 tgttgcaagcatta 234  Q
    ||||||||||||||    
11357043 tgttgcaagcatta 11357030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 53811698 - 53811597
Alignment:
143 actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
53811698 actatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaa---agataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T
243 attactatt 251  Q
    |||||||||    
53811605 attactatt 53811597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 53811729 - 53811695
Alignment:
44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagacta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
53811729 catagtatcatcaattcatcagattaacaagacta 53811695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16446969 - 16446731
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
16446969 tggcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccc 16446870  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||    
16446869 cacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgt---taaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 16446773  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16446772 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 16446731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1149723 - 1149490
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||||||    
1149723 catcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccac 1149624  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
1149623 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 1149527  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1149526 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 1149490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36695057 - 36694829
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
36695057 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 36694958  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
36694957 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttg 36694861  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcat 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
36694860 caagcatcactagatgaattactatttatcat 36694829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37970610 - 37970375
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
37970610 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 37970511  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |  || |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
37970510 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 37970414  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
37970413 caagcattactagatgaattactgttgatcattaatcag 37970375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 11727120 - 11727358
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
11727120 tggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 11727219  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||    
11727220 cacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgt---taaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatg 11727316  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11727317 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 11727358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27082932 - 27082695
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||    
27082932 tggcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccc 27082833  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
27082832 cgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 27082736  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
27082735 ttgcaagcattactagatgaattactacttatcattaatca 27082695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6098609 - 6098372
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||    
6098609 catcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccac 6098510  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgat--aat---atagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |||   ||||||  ||||| |||||||    
6098509 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaaga 6098413  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6098412 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 6098372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 1205026 - 1205260
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||    
1205026 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccac 1205125  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
1205126 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaa---agattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 1205222  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
1205223 caagtattactagatgaattactattgatcattaatca 1205260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132545
Alignment:
52 catcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcaca 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T
152 taatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 251  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4132651 taatatcatcaactatgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 4132555  T
252 gatcattaat 261  Q
    ||||||||||    
4132554 gatcattaat 4132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1954084 - 1953845
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatc-atcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacg-c 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |    
1954084 tggcatcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatc 1953985  T
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   || || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
1953984 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaa---agttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaaga 1953888  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
1953887 ttttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatca 1953845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 16222962 - 16223197
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||| |||||     
16222962 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaa 16223061  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || |   ||||||| |||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
16223062 aaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattt---taaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 16223158  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16223159 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 16223197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43643686 - 43643451
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||    
43643686 catccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 43643587  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||   | || || |||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
43643586 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaa---ttccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 43643490  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43643489 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 43643451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5300040 - 5299802
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||    
5300040 tggcatcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccc 5299941  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| || |||||| ||| | |||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
5299940 cacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgt---taaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 5299844  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5299843 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcag 5299802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 264
Target Start/End: Original strand, 33906316 - 33906546
Alignment:
31 aaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagt 130  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||   ||| |||||    
33906316 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagt 33906415  T
131 gtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagc 230  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
33906416 gtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 33906512  T
231 attactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33906513 attactagatgaattactattgatcattaatcag 33906546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 38644074 - 38644312
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
38644074 tggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactc 38644173  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| ||| || ||||||| || |||||| |||||||||||| | ||   |||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||    
38644174 cataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagt---taaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 38644270  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38644271 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 38644312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 12876208 - 12876437
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||    
12876208 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 12876307  T
126 aaagtgtaatacttaaa-actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
12876308 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 12876404  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcat 257  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||    
12876405 acaggcattactagatgaattactatttatcat 12876437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 34895063 - 34895296
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||    
34895063 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34895162  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||| ||||| ||     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||| || ||||||  ||||| | |||||||    
34895163 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgt---taaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatg 34895254  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
34895255 ttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcag 34895296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 9864247 - 9864480
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
9864247 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 9864346  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||    
9864347 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttg 9864443  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatc 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
9864444 caagcattactagatgaataactagtaatcatgaatc 9864480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23854522 - 23854287
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| || ||     
23854522 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcat 23854423  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
23854422 aaagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 23854326  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23854325 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 23854287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7891051 - 7890813
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||  |||| |||| ||||| |||    
7891051 tggcatcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccc 7890952  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || || |||    
7890951 cacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatg 7890855  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7890854 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 7890813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39099211 - 39098978
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||    
39099211 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatccca 39099112  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||| | | |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||   |||| ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||    
39099111 caaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgtt 39099015  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39099014 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 39098978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10555293 - 10555062
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| || |||    
10555293 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcac 10555194  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||  |||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||| |||    
10555193 aaaacgtaacactt--gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 10555099  T
226 caagcattactagatgaatt--actattgatcattaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
10555098 caagcattactagatgaattacactattgatcattaa 10555062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 44869596 - 44869831
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    |||||    
44869596 catcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgt-cccca 44869694  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||  |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |  ||| |||||||| ||    
44869695 caaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatatt 44869791  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44869792 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 44869831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35459798 - 35459567
Alignment:
30 aaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaag 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||  |||||| |     
35459798 aaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccacagat 35459699  T
130 tgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaag 229  Q
    | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||  | || |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||     
35459698 tataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaa---agatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaa 35459602  T
230 cattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35459601 cattactagatgaattactattgatcattaatcag 35459567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 465938 - 466166
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||    
465938 tggcatcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccc 466037  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| ||         |||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||| ||| || |||||| || ||||||    
466038 cacaaagtgtaacac---------tcacat-atatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatg 466124  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
466125 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 466166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 40862516 - 40862753
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| | |    
40862516 tggcatcaaaagttcagtc-tcatggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactc 40862614  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
40862615 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 40862711  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
40862712 ttgcaagcattactagatgaattactatttgtcataaatcag 40862753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8803885 - 8803672
Alignment:
49 tatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatc 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||    
8803885 tatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatc 8803786  T
149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tac 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
8803785 acataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatac 8803689  T
248 tattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||    
8803688 tattgatcattaatcag 8803672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30654674 - 30654438
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||| ||| ||    
30654674 catcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctac 30654575  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||   |  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
30654574 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaa---tttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 30654478  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
30654477 caagcattactaaatgaatatattattgatcattaatcag 30654438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31933977 - 31933742
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||  |||  || |||    
31933977 catcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcac 31933878  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||| || ||||| |||    
31933877 aaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgt---taaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattg 31933781  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
31933780 cagacattactagatgaattattattgatcattaatcag 31933742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 13307722 - 13307936
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||| ||||||    
13307722 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccac 13307821  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |    || ||||||||| |||||| | |||| | ||||||||||    
13307822 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaaa----tgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttg 13307917  T
226 caagcattactagatgaat 244  Q
    |||||||||| ||||||||    
13307918 caagcattacaagatgaat 13307936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41911080 - 41910925
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
41911080 gcatcaaaaattcagtcaacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 41910981  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
41910980 caaagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaa 41910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 43025824 - 43025955
Alignment:
49 tatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatc 148  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
43025824 tatcatcaattcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatc 43025923  T
149 acataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
43025924 acataatatcatcaactctgattgcatgttaa 43025955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1150196 - 1150090
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||    
1150196 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 1150097  T
126 aaagtgt 132  Q
    |||||||    
1150096 aaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1149912 - 1149776
Alignment:
121 cccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||    
1149912 cccacaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaa---agattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaaga 1149820  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1149819 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 1149776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24823395 - 24823250
Alignment:
108 ttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaac 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||      
24823395 ttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgtt-----------aaagatgccaacgataaaatagtaca 24823307  T
208 tgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
24823306 tgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcag 24823250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 264
Target Start/End: Original strand, 12587812 - 12587916
Alignment:
157 tcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 256  Q
    ||||||||||| |||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12587812 tcatcaactctatttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatca 12587908  T
257 ttaatcag 264  Q
    ||||||||    
12587909 ttaatcag 12587916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 264
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859268
Alignment:
153 aatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg 252  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaa---agatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattg 35859256  T
253 atcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||    
35859257 atcattaatcag 35859268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 41362614 - 41362706
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||    
41362614 catcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaac 41362706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34952020 - 34951913
Alignment:
154 atatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 253  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
34952020 atatcagcaactctgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattga 34951924  T
254 tcattaatcag 264  Q
    |||||||||||    
34951923 tcattaatcag 34951913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 34952122 - 34952030
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac 118  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
34952122 catcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaac 34952030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 263
Target Start/End: Original strand, 33198057 - 33198135
Alignment:
185 gatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
33198057 gatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatca 33198135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Original strand, 7998411 - 7998486
Alignment:
44 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-ttttattctaccatgttttaagtgtaac 118  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
7998411 cataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaac 7998486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 261
Target Start/End: Original strand, 18259330 - 18259410
Alignment:
181 taaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
18259330 taaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaat 18259410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 33197947 - 33198003
Alignment:
25 gcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacac 81  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
33197947 gcatcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacac 33198003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585353
Alignment:
108 ttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaac 164  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
12585297 ttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacataacatcatcaac 12585353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Original strand, 7998487 - 7998553
Alignment:
136 acttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagta 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |   || |||||||||||||||||| ||||||    
7998487 acttaatactatcacataatatcaacaactctgtttcta---tattaaagatgccaacgataaaatagta 7998553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 251
Target Start/End: Original strand, 34463704 - 34463792
Alignment:
157 tcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 251  Q
    ||||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||| || || ||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
34463704 tcatcaactttgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaataatacctataagtcca---tgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 260
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362752
Alignment:
231 attactagatgaattactattgatcattaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
41362723 attactagatgaattactattgatcattaa 41362752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3880023 - 3879788
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
3880023 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccac 3879924  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
3879923 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttg 3879827  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
3879826 caagcattactagatgaattactattgatcatgaatcag 3879788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6091267 - 6091031
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||    
6091267 catcaaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaac 6091168  T
126 aaagtgtaatacttaaa-actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
6091167 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgca---tattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 6091071  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6091070 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 6091031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7235118 - 7234885
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
7235118 catcaaaagttcagtc-tcatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 7235020  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
7235019 aaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgt---taaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 7234923  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7234922 caaacattactagatgaattactattgatcattaatca 7234885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 5627491 - 5627727
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||| ||    
5627491 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 5627590  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
5627591 aaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 5627687  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
5627688 caagcattactaggtgaatatactattgatcattaatcag 5627727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4318907 - 4318672
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-ttttattctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |    
4318907 catcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccta 4318808  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||   |||||||| ||||||| | ||||||   | || |||||||||||    
4318807 taaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgt---taaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgtt 4318711  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4318710 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 4318672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 20768181 - 20768417
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||    
20768181 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcc 20768278  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||    
20768279 cataaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaa---agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtg 20768375  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20768376 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 20768417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 1945934 - 1946170
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||| ||    
1945934 catcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctac 1946033  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||     
1946034 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtta 1946130  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
1946131 caagcattattagatgaatatactattgatcattaatcag 1946170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21017199 - 21016967
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||    
21017199 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccc 21017100  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||| ||||||||| |||      |||  || ||||||    
21017099 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaatatgtcaacgataaaata------gtacgtctaagatg 21017009  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
21017008 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcag 21016967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 33618931 - 33619162
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||        ||||||| |||    
33618931 tggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacca--------gtgtaacaccc 33619022  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa--taaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaaga 220  Q
     | || |||| | |||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |    
33619023 tagaa-gtgtgacacttaagagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaata 33619121  T
221 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33619122 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 33619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 29182263 - 29182495
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaac-gcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
29182263 catcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacaccccca 29182362  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
29182363 taaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggt---taaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgtt 29182459  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||    
29182460 gcaagtattactagatgaattac---tgatcattaatca 29182495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 8513333 - 8513562
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcccca 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||      | ||| |    
8513333 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cacccta 8513426  T
125 caaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| || ||    
8513427 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaa---agatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatctt 8513523  T
225 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8513524 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 8513562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33893067 - 33892862
Alignment:
46 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccacaaagtgtaatacttaaaact 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||            
33893067 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccacaaagtgtaacac-------- 33892976  T
146 atcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 245  Q
     |||||| |||||| |||||| ||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
33892975 -tcacatgatatcagcaactcagtttgcatgt---taaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatt 33892880  T
246 actattgatcattaatca 263  Q
    ||||||||||||||||||    
33892879 actattgatcattaatca 33892862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7055299 - 7055145
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| | | ||    
7055299 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctac 7055200  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
7055199 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaa 7055145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Original strand, 15491712 - 15491869
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
15491712 tggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 15491811  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
15491812 cacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgatatcagcaattctgtttggatgttaa 15491869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 6089005 - 6089237
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttt-attctaccatgttttaagtgtaacgcc 121  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| || ||||| ||||||||      | |     
6089005 tggcatcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cact 6089098  T
122 ccacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagat 221  Q
    | |||| || ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||    
6089099 ctacaaggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaa---agatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaat 6089195  T
222 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
6089196 gttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatca 6089237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30353445 - 30353288
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||  ||    
30353445 tggcatcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcc 30353346  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaa 180  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
30353345 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaa 30353288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7054704 - 7054622
Alignment:
182 aaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 263  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
7054704 aaagattccaacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatca 7054622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 57
Target Start/End: Original strand, 18498531 - 18498565
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaa 57  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18498531 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 7987 - 8222
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || | |||| ||||| ||||||    
7987 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccac 8086  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
8087 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 8183  T
226 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8184 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 8222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 12010 - 12244
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||    
12010 atcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccaca 12109  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||    
12110 aagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgc 12206  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12207 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 12244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 408512 - 408279
Alignment:
27 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccaca 126  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| || ||||    
408512 atcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcaca 408414  T
127 aagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgc 226  Q
    ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
408413 aagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 408317  T
227 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
408316 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 408279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 231 - 463
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||    
231 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacaccc 330  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||      |||  |||||||||    
331 cataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaata------gtacgtccaagatg 421  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
422 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcag 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 94471 - 94331
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    ||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||    
94471 tggcatcaaaagtttggtccccatactatcatcaattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccc 94372  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaa 163  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
94371 cacaaagtgtaacacttaagactattacataatatcatcaa 94331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 94033 - 93951
Alignment:
181 taaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 263  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
94033 taaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatca 93951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 146101 - 145865
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||| ||    
146101 catcaaaagttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 146002  T
126 aaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgttg 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
146001 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgt---taaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttg 145905  T
226 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 264  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
145904 caagcattactaaatgaatatacaattgatcattaatcag 145865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 44054 - 44291
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  || | |||| ||||  |||| |||    
44054 tggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccc 44153  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||    
44154 cacaaagtgtaacactt-aagctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttg 44249  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
44250 ttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaatcag 44291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 154733 - 154496
Alignment:
23 tggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccc 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  || | |||| ||||  |||| |||    
154733 tggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccc 154634  T
123 cacaaagtgtaatacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatg 222  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||    
154633 cacaaagtgtaacactt-aagctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttg 154538  T
223 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
154537 ttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaatcag 154496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 267384 - 267602
Alignment:
26 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaagtgtaacgccccac 125  Q
    ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||    
267384 catcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccac 267483  T
126 aaagtgtaatacttaaa-actatcacataatatcatcaactctgtttgaatgttaataaagatgccaacgataatatagtaactgtaaatccaagatgtt 224  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| |    
267484 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgt---taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgct 267580  T
225 gcaagcattactagatgaatta 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
267581 gcaagaattactagatgaatta 267602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Original strand, 100994 - 101048
Alignment:
208 tgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
100994 tgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta--gatcattaatcag 101048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 111
Target Start/End: Original strand, 100894 - 100935
Alignment:
70 acaagactacacttaatctaattttattctaccatgttttaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaa 100935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University