View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14949_high_13 (Length: 250)

Name: NF14949_high_13
Description: NF14949
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14949_high_13
NF14949_high_13
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (4-140)||(15847117-15847253)
chr8 (1-140)||(35443313-35443452)
chr8 (3-140)||(37933646-37933783)
chr8 (1-140)||(513310-513448)
chr8 (1-140)||(2533274-2533413)
chr8 (1-140)||(35884430-35884569)
chr8 (1-140)||(43806533-43806672)
chr8 (3-140)||(440844-440981)
chr8 (3-140)||(38107103-38107240)
chr8 (1-140)||(3875910-3876049)
chr8 (1-140)||(36400070-36400209)
chr8 (1-140)||(38633710-38633849)
chr8 (1-140)||(22683988-22684127)
chr8 (3-140)||(38208756-38208894)
chr8 (3-140)||(259982-260118)
chr8 (3-140)||(655803-655939)
chr8 (3-140)||(841538-841674)
chr8 (4-140)||(28496355-28496490)
chr8 (1-140)||(1293488-1293627)
chr8 (1-140)||(28707446-28707585)
chr8 (1-140)||(33651843-33651982)
chr8 (14-140)||(41536527-41536653)
chr8 (1-140)||(12010551-12010693)
chr8 (1-140)||(9056338-9056477)
chr8 (1-119)||(23935235-23935353)
chr8 (15-140)||(23972295-23972420)
chr8 (4-135)||(39513344-39513475)
chr8 (3-140)||(4649154-4649291)
chr8 (3-140)||(40301893-40302030)
chr8 (1-140)||(24430571-24430710)
chr8 (1-119)||(7434888-7435006)
chr8 (8-140)||(13797098-13797229)
chr8 (1-119)||(29485289-29485406)
chr8 (3-140)||(36218781-36218917)
chr8 (1-140)||(42988227-42988365)
chr8 (1-119)||(6016207-6016325)
chr8 (75-139)||(24193131-24193195)
chr8 (1-77)||(24193356-24193431)
chr8 (5-64)||(8137180-8137239)
chr8 (101-135)||(8137240-8137274)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-140)||(28650426-28650565)
chr2 (1-134)||(771981-772114)
chr2 (1-140)||(16246193-16246332)
chr2 (1-140)||(27328586-27328725)
chr2 (1-140)||(41500502-41500641)
chr2 (1-140)||(921024-921163)
chr2 (1-140)||(40854611-40854750)
chr2 (1-139)||(17134231-17134369)
chr2 (1-140)||(11949426-11949565)
chr2 (1-140)||(34253144-34253283)
chr2 (1-139)||(36444229-36444367)
chr2 (3-140)||(37838301-37838438)
chr2 (1-133)||(3430631-3430763)
chr2 (4-140)||(33865267-33865403)
chr2 (1-140)||(2314975-2315114)
chr2 (1-140)||(7378965-7379104)
chr2 (1-140)||(9276576-9276715)
chr2 (2-140)||(2056929-2057067)
chr2 (1-140)||(1106559-1106698)
chr2 (1-140)||(2094410-2094549)
chr2 (1-140)||(2456012-2456151)
chr2 (1-140)||(7297234-7297373)
chr2 (1-140)||(8899684-8899822)
chr2 (1-135)||(36211048-36211182)
chr2 (3-140)||(17484550-17484687)
chr2 (4-140)||(19180427-19180562)
chr2 (1-140)||(29737750-29737889)
chr2 (1-140)||(33106969-33107108)
chr2 (1-140)||(43249412-43249551)
chr2 (1-139)||(38751050-38751188)
chr2 (1-140)||(12759750-12759888)
chr2 (1-140)||(42629964-42630103)
chr2 (3-140)||(25087796-25087933)
chr2 (1-119)||(8396572-8396690)
chr2 (1-140)||(37732193-37732332)
chr2 (1-140)||(45124121-45124260)
chr2 (1-100)||(41178059-41178158)
chr2 (3-115)||(37654112-37654224)
chr2 (54-140)||(14630669-14630755)
chr2 (1-119)||(19916008-19916126)
chr2 (1-140)||(9331758-9331897)
chr2 (54-140)||(23671811-23671897)
chr2 (1-51)||(23672962-23673012)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (3-140)||(14717609-14717746)
chr5 (1-140)||(11000728-11000867)
chr5 (3-140)||(6600136-6600273)
chr5 (1-140)||(6739955-6740094)
chr5 (1-140)||(8215902-8216041)
chr5 (1-140)||(27457197-27457336)
chr5 (1-140)||(30297749-30297888)
chr5 (1-140)||(33760470-33760609)
chr5 (1-140)||(39002025-39002164)
chr5 (1-140)||(16095960-16096098)
chr5 (1-140)||(19659501-19659640)
chr5 (1-140)||(38964114-38964252)
chr5 (1-140)||(42993520-42993659)
chr5 (1-139)||(30863255-30863393)
chr5 (1-139)||(41282344-41282482)
chr5 (3-140)||(14952328-14952465)
chr5 (3-140)||(20408537-20408674)
chr5 (1-140)||(3352002-3352141)
chr5 (1-140)||(6251974-6252113)
chr5 (1-140)||(8689574-8689713)
chr5 (1-140)||(26593280-26593419)
chr5 (1-140)||(31710284-31710423)
chr5 (1-140)||(35342182-35342321)
chr5 (1-140)||(39824558-39824697)
chr5 (1-140)||(40074952-40075091)
chr5 (7-140)||(1052541-1052674)
chr5 (1-140)||(4015874-4016013)
chr5 (1-140)||(11692147-11692286)
chr5 (1-140)||(20079258-20079397)
chr5 (1-140)||(23128913-23129052)
chr5 (1-140)||(43166269-43166408)
chr5 (1-140)||(28078405-28078544)
chr5 (3-140)||(27116099-27116236)
chr5 (1-140)||(30208402-30208541)
chr5 (3-140)||(19398193-19398330)
chr5 (1-119)||(26035367-26035485)
chr5 (1-119)||(16752118-16752236)
chr5 (1-140)||(8694868-8695007)
chr5 (3-140)||(11935450-11935586)
chr5 (1-101)||(6331379-6331479)
chr5 (7-119)||(444962-445074)
chr5 (1-140)||(27509980-27510112)
chr5 (96-140)||(6332873-6332917)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-140)||(1469493-1469632)
chr7 (1-140)||(31684134-31684273)
chr7 (1-140)||(47281124-47281263)
chr7 (1-140)||(11476556-11476695)
chr7 (1-140)||(23842307-23842446)
chr7 (1-140)||(30798368-30798507)
chr7 (1-140)||(41113379-41113518)
chr7 (1-139)||(44544411-44544549)
chr7 (1-139)||(47219147-47219285)
chr7 (3-140)||(11050261-11050398)
chr7 (12-140)||(2960640-2960768)
chr7 (1-140)||(35600122-35600261)
chr7 (1-140)||(38427563-38427702)
chr7 (1-140)||(47271983-47272122)
chr7 (1-140)||(47294291-47294430)
chr7 (3-135)||(4923220-4923352)
chr7 (3-139)||(33884323-33884459)
chr7 (1-140)||(8162712-8162851)
chr7 (1-140)||(40851276-40851415)
chr7 (3-140)||(37393998-37394135)
chr7 (1-140)||(30876261-30876400)
chr7 (1-140)||(43968259-43968398)
chr7 (25-140)||(221301-221416)
chr7 (1-140)||(27364339-27364478)
chr7 (1-140)||(43752776-43752915)
chr7 (1-140)||(48628807-48628946)
chr7 (4-139)||(29248347-29248482)
chr7 (1-140)||(45723491-45723630)
chr7 (1-140)||(41139408-41139551)
chr7 (4-140)||(7336065-7336200)
chr7 (1-140)||(30971941-30972080)
chr7 (1-140)||(42979338-42979477)
chr7 (1-119)||(3797544-3797662)
chr7 (1-119)||(27774110-27774228)
chr7 (3-140)||(18353148-18353285)
chr7 (3-119)||(37354284-37354400)
chr7 (1-140)||(47119993-47120134)
chr7 (3-140)||(44800410-44800547)
chr7 (1-140)||(47579086-47579226)
chr7 (1-92)||(40520920-40521011)
chr7 (87-140)||(42888937-42888990)
chr7 (84-140)||(5106127-5106182)
chr7 (1-51)||(39034064-39034114)
chr7 (1-48)||(29739783-29739829)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-140)||(10256239-10256378)
chr6 (3-140)||(30379021-30379158)
chr6 (1-140)||(2707461-2707600)
chr6 (1-140)||(8178249-8178388)
chr6 (1-140)||(12626638-12626777)
chr6 (1-140)||(29050274-29050413)
chr6 (1-139)||(6503720-6503858)
chr6 (1-140)||(1915343-1915482)
chr6 (1-140)||(3408191-3408330)
chr6 (1-140)||(2390267-2390406)
chr6 (3-140)||(17943040-17943177)
chr6 (3-140)||(26393009-26393146)
chr6 (1-140)||(11133875-11134015)
chr6 (1-140)||(9382521-9382660)
chr6 (3-140)||(1077241-1077378)
chr6 (3-140)||(17428272-17428409)
chr6 (1-140)||(26230932-26231071)
chr6 (10-140)||(2598099-2598229)
chr6 (3-140)||(16193314-16193451)
chr6 (5-140)||(3258807-3258942)
chr6 (4-119)||(26936612-26936727)
chr6 (14-120)||(35223919-35224025)
chr6 (1-140)||(6785101-6785237)
chr6 (3-140)||(26196321-26196458)
chr6 (54-140)||(31375972-31376058)
chr6 (3-139)||(25820550-25820686)
chr6 (20-140)||(10931148-10931267)
chr6 (82-140)||(12612971-12613029)
chr6 (61-140)||(12612848-12612927)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (1-140)||(31973593-31973732)
chr4 (1-140)||(42273804-42273943)
chr4 (1-140)||(5227392-5227531)
chr4 (1-140)||(26017425-26017564)
chr4 (1-140)||(28264645-28264784)
chr4 (1-140)||(28812287-28812425)
chr4 (1-140)||(33807780-33807919)
chr4 (4-140)||(49118616-49118752)
chr4 (1-140)||(4544985-4545124)
chr4 (1-140)||(12196471-12196610)
chr4 (1-140)||(17847096-17847234)
chr4 (1-140)||(24458631-24458770)
chr4 (1-140)||(31591078-31591216)
chr4 (1-140)||(48707733-48707872)
chr4 (1-140)||(55517185-55517324)
chr4 (1-139)||(40988635-40988773)
chr4 (3-140)||(23135006-23135143)
chr4 (3-140)||(30467003-30467140)
chr4 (4-140)||(39995167-39995303)
chr4 (1-140)||(8882013-8882152)
chr4 (1-140)||(11795154-11795293)
chr4 (1-140)||(19496102-19496241)
chr4 (1-140)||(33693333-33693472)
chr4 (1-140)||(51371047-51371186)
chr4 (3-140)||(32317957-32318094)
chr4 (3-140)||(48551764-48551901)
chr4 (4-140)||(44490324-44490460)
chr4 (1-140)||(14564798-14564937)
chr4 (1-140)||(28159953-28160092)
chr4 (1-140)||(30141108-30141247)
chr4 (1-140)||(35930042-35930180)
chr4 (5-139)||(32118720-32118854)
chr4 (1-139)||(33174021-33174159)
chr4 (1-139)||(37381848-37381986)
chr4 (2-140)||(48149502-48149640)
chr4 (1-138)||(10588582-10588719)
chr4 (1-140)||(50276138-50276274)
chr4 (1-140)||(2055280-2055419)
chr4 (1-140)||(50542354-50542493)
chr4 (1-140)||(15985012-15985151)
chr4 (1-140)||(31208750-31208885)
chr4 (3-140)||(23553069-23553205)
chr4 (3-140)||(25734223-25734360)
chr4 (1-140)||(9339123-9339265)
chr4 (1-140)||(22298519-22298659)
chr4 (1-140)||(17993017-17993156)
chr4 (1-119)||(24623150-24623268)
chr4 (3-140)||(25730244-25730381)
chr4 (1-140)||(39700047-39700186)
chr4 (1-119)||(19168816-19168934)
chr4 (59-140)||(20534225-20534306)
chr4 (1-119)||(42549643-42549760)
chr4 (1-80)||(56555200-56555279)
chr4 (105-140)||(56555165-56555200)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (1-140)||(21564498-21564637)
chr3 (1-140)||(31122664-31122803)
chr3 (3-140)||(1687655-1687792)
chr3 (1-140)||(1017046-1017185)
chr3 (1-140)||(20086314-20086453)
chr3 (1-140)||(33151698-33151837)
chr3 (3-140)||(35346471-35346608)
chr3 (1-140)||(20813441-20813580)
chr3 (1-140)||(21656520-21656659)
chr3 (1-140)||(38446478-38446617)
chr3 (1-140)||(41250888-41251027)
chr3 (1-140)||(47329175-47329314)
chr3 (3-140)||(32650820-32650957)
chr3 (4-140)||(20760071-20760207)
chr3 (1-140)||(3697148-3697287)
chr3 (1-132)||(12748393-12748524)
chr3 (1-140)||(36314972-36315111)
chr3 (1-140)||(42107099-42107238)
chr3 (3-140)||(50287570-50287707)
chr3 (4-140)||(21890175-21890311)
chr3 (4-140)||(42016878-42017014)
chr3 (5-140)||(26455588-26455723)
chr3 (1-140)||(44798270-44798408)
chr3 (1-140)||(48651250-48651389)
chr3 (1-140)||(51562164-51562303)
chr3 (1-135)||(19664543-19664677)
chr3 (1-134)||(22851998-22852131)
chr3 (3-140)||(40922165-40922302)
chr3 (1-140)||(20913754-20913893)
chr3 (1-140)||(20921872-20922011)
chr3 (1-140)||(27070739-27070878)
chr3 (1-140)||(53196016-53196155)
chr3 (1-139)||(29677478-29677616)
chr3 (1-140)||(1448735-1448871)
chr3 (3-140)||(10618480-10618617)
chr3 (4-140)||(35608131-35608267)
chr3 (1-140)||(37247958-37248097)
chr3 (1-140)||(53925979-53926118)
chr3 (1-140)||(19268523-19268668)
chr3 (1-119)||(50977866-50977984)
chr3 (1-119)||(51080998-51081116)
chr3 (1-140)||(39069728-39069867)
chr3 (1-140)||(52821049-52821188)
chr3 (1-140)||(55164115-55164254)
chr3 (1-140)||(45380260-45380399)
chr3 (3-119)||(51475267-51475383)
chr3 (1-119)||(50364908-50365026)
chr3 (1-140)||(33473239-33473378)
chr3 (1-112)||(28699687-28699798)
chr3 (1-119)||(34019462-34019580)
chr3 (26-140)||(38923998-38924112)
chr3 (30-119)||(42641199-42641288)
chr3 (1-76)||(44152702-44152777)
chr3 (1-63)||(47473232-47473294)
chr3 (98-140)||(44152772-44152814)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (1-140)||(12143074-12143213)
chr1 (1-140)||(23767414-23767553)
chr1 (1-140)||(41106018-41106157)
chr1 (1-140)||(46825533-46825672)
chr1 (3-140)||(49094711-49094848)
chr1 (1-137)||(24204474-24204610)
chr1 (1-140)||(7553016-7553155)
chr1 (1-140)||(19315642-19315781)
chr1 (1-140)||(25988271-25988410)
chr1 (1-140)||(28425363-28425502)
chr1 (1-140)||(33674019-33674158)
chr1 (1-140)||(38473626-38473765)
chr1 (1-140)||(46051452-46051591)
chr1 (3-140)||(37216900-37217037)
chr1 (1-140)||(7651664-7651803)
chr1 (1-140)||(36157678-36157816)
chr1 (1-140)||(49814302-49814441)
chr1 (1-140)||(16705872-16706011)
chr1 (1-140)||(26549390-26549529)
chr1 (1-140)||(33325729-33325868)
chr1 (1-140)||(36781172-36781311)
chr1 (1-139)||(19274561-19274699)
chr1 (1-140)||(23228194-23228333)
chr1 (1-140)||(46095075-46095214)
chr1 (1-140)||(50689945-50690084)
chr1 (3-140)||(45350717-45350852)
chr1 (3-140)||(9962755-9962892)
chr1 (3-140)||(48669396-48669533)
chr1 (4-140)||(5400876-5401011)
chr1 (1-140)||(6711442-6711581)
chr1 (1-140)||(7608766-7608905)
chr1 (1-140)||(18892331-18892470)
chr1 (1-140)||(43396677-43396816)
chr1 (1-139)||(50533385-50533523)
chr1 (3-140)||(26069896-26070033)
chr1 (1-140)||(48802331-48802470)
chr1 (4-140)||(21929526-21929667)
chr1 (3-140)||(45670486-45670623)
chr1 (3-140)||(8141486-8141623)
chr1 (3-140)||(9878784-9878921)
chr1 (3-140)||(21965069-21965206)
chr1 (3-140)||(34971084-34971221)
chr1 (1-140)||(40721344-40721484)
chr1 (1-140)||(52146995-52147134)
chr1 (1-140)||(52349924-52350063)
chr1 (1-119)||(33194672-33194790)
chr1 (4-139)||(18917529-18917664)
chr1 (3-138)||(41982237-41982372)
chr1 (1-140)||(52067651-52067790)
chr1 (3-120)||(9974846-9974963)
chr1 (3-140)||(18782089-18782226)
chr1 (3-119)||(16506809-16506925)
chr1 (3-119)||(48319067-48319183)
chr1 (1-140)||(17983898-17984037)
chr1 (1-103)||(12964648-12964750)
chr1 (1-119)||(30281633-30281751)
chr1 (4-140)||(33714361-33714495)
chr1 (3-140)||(25800648-25800782)
chr1 (39-140)||(44978768-44978868)
chr1 (1-50)||(50099222-50099271)
chr1 (1-52)||(44979276-44979327)
chr1 (1-43)||(32373650-32373692)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (1-140)||(116-255)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-140)||(218887-219027)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (3-140)||(5027-5164)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-140)||(252438-252577)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (3-140)||(13099-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (3-140)||(59608-59745)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (3-140)||(5190-5326)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (3-139)||(11362-11498)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (4-140)||(47967-48103)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (1-119)||(1994-2112)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (59-140)||(599-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (59-140)||(1913-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (59-140)||(3371-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (59-140)||(1877-1958)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (1-51)||(290-340)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-49)||(19783-19831)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 15847117 - 15847253
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847117 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 15847216  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847217 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 15847253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 35443313 - 35443452
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443313 agcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 35443412  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35443413 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 35443452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 37933646 - 37933783
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933646 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37933745  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37933746 actatgctatctacgataagacttgtttgaaacgattc 37933783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 513310 - 513448
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513310 agcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 513408  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513409 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 513448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 2533274 - 2533413
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533274 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 2533373  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2533374 caactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 2533413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35884569 - 35884430
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884569 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 35884470  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35884469 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 35884430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43806672 - 43806533
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43806672 agcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 43806573  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43806572 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 43806533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 440844 - 440981
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  440844 cattatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 440943  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  440944 actatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 440981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 38107103 - 38107240
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107103 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 38107202  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38107203 actatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 38107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 3875910 - 3876049
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875910 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 3876009  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876010 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 3876049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36400209 - 36400070
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400209 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 36400110  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36400109 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 36400070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38633849 - 38633710
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633849 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 38633750  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38633749 caactatgctatctacattagaacttgtttgaaacgattc 38633710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22684127 - 22683988
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22684127 agcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 22684028  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22684027 caactatgatatctacaatatgacttgtttgaaatgattc 22683988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 38208756 - 38208894
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaag-atgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38208756 cattatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaattacc 38208855  T
Q  102 aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38208856 aactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38208894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 259982 - 260118
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  259982 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 260080  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  260081 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 260118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 655939 - 655803
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655939 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 655841  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  655840 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 655803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 841674 - 841538
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841674 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 841576  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  841575 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 841538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28496490 - 28496355
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496490 attatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattagaa-ctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 28496392  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496391 ctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28496355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 1293488 - 1293627
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293488 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattac 1293587  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1293588 caactatgttatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 1293627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28707585 - 28707446
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28707585 agcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 28707486  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28707485 caattatgatatctacaataggatttgtttgaaacgattc 28707446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 33651843 - 33651982
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  33651843 agcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaattac 33651942  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33651943 aaactatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattc 33651982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41536653 - 41536527
Alignment:
Q  14 atttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 113  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41536653 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgctatc 41536554  T
Q  114 tacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41536553 tacaataggacttgtttgaaacgattc 41536527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 12010551 - 12010693
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12010551 agcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaattac 12010650  T
Q  101 caactatgctat---ctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12010651 caactatgctatctactacaataggacttgtttgaaacaattc 12010693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9056477 - 9056338
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9056477 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattac 9056378  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9056377 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattc 9056338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 23935235 - 23935353
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  23935235 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattat 23935334  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23935335 caactatgctatctacaat 23935353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23972420 - 23972295
Alignment:
Q  15 tttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatct 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23972420 tttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatct 23972321  T
Q  115 acaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  23972320 acaatatgacttgtttgaaacgattc 23972295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39513475 - 39513344
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39513475 attatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaa 39513376  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaac 135  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  39513375 ctatgttatctacattaggacttatttgaaac 39513344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 4649154 - 4649291
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   || | || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4649154 cattatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaattacca 4649253  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4649254 attatgctatctacaattggacttgtttgaaacgattc 4649291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40302030 - 40301893
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  40302030 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaattacca 40301931  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40301930 actatgctatctacaatatgacttttttgaaacgattc 40301893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24430710 - 24430571
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||     
T  24430710 agcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaattat 24430611  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24430610 caactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 24430571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 7434888 - 7435006
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7434888 agcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 7434987  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7434988 caactatgttatctacaat 7435006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Original strand, 13797098 - 13797229
Alignment:
Q  8 tccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactat 107  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13797098 tccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaattaccaactat 13797196  T
Q  108 gctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13797197 gctatatacaataggatttgtttgaaacgattc 13797229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 29485289 - 29485406
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485289 agcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 29485387  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  29485388 caactatgttatctacaat 29485406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36218917 - 36218781
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36218917 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaa-gaagcaattatca 36218819  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  36218818 actatattatctacatcatgacttgtttgaaacgattc 36218781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 42988365 - 42988227
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||     
T  42988365 agcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaatataagttaaatgaagcaattat 42988266  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42988265 caactatattatctacaataggactt-tttgaaacgattc 42988227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 6016207 - 6016325
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||  ||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  6016207 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaattac 6016306  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6016307 caactatgctatctacaat 6016325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193131
Alignment:
Q  75 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 24193131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24193431 - 24193356
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaa 77  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24193431 agcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Original strand, 8137180 - 8137239
Alignment:
Q  5 ttatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccag 64  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  8137180 ttatccaccatttgctatgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 135
Target Start/End: Original strand, 8137240 - 8137274
Alignment:
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8137240 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 8137274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28650565 - 28650426
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28650565 agcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattac 28650466  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28650465 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28650426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 772114 - 771981
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  772114 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 772015  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  772014 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 771981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16246332 - 16246193
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246332 agcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 16246233  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246232 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 16246193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 27328586 - 27328725
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328586 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 27328685  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328686 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 27328725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41500641 - 41500502
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41500641 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 41500542  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41500541 caactatgctatgtacaataggacttgtttgaaacgattc 41500502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 921024 - 921163
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  921024 agcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattat 921123  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921124 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 921163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 40854611 - 40854750
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854611 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattac 40854710  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854711 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 40854750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 17134231 - 17134369
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134231 agcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 17134330  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134331 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11949565 - 11949426
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11949565 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 11949466  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949465 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11949426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 34253144 - 34253283
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34253144 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattac 34253243  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253244 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 34253283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36444367 - 36444229
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36444367 agcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 36444268  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36444267 caactatgctatctactataggacttgtttgaaacgatt 36444229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 37838301 - 37838438
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37838301 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattacca 37838400  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37838401 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37838438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3430763 - 3430631
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3430763 agcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 3430664  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3430663 caactatgctatctacaataggacttgtttgaa 3430631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33865403 - 33865267
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865403 attatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 33865304  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33865303 ctatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 33865267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2315114 - 2314975
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2315114 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 2315015  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2315014 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattc 2314975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 7378965 - 7379104
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7378965 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 7379064  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7379065 caactattctatctacattatgacttgtttgaaacgattc 7379104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 9276576 - 9276715
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276576 agcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 9276675  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276676 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 9276715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 2056929 - 2057067
Alignment:
Q  2 gcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 101  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056929 gcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 2057028  T
Q  102 aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2057029 aactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 2057067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1106698 - 1106559
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106698 agcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 1106599  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1106598 caattatgctatctacaataggacttatttgaaatgattc 1106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2094549 - 2094410
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2094549 agcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaattac 2094450  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2094449 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2094410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 2456012 - 2456151
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2456012 agcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 2456111  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2456112 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 2456151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7297373 - 7297234
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  7297373 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaagaagacaattac 7297274  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7297273 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7297234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 8899684 - 8899822
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8899684 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaattac 8899783  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8899784 caactatgctatctacaatatgacttg-ttgaaacgattc 8899822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 36211048 - 36211182
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36211048 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattac 36211147  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 135  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  36211148 aaactatgttatctagaataggacttgtttgaaac 36211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17484687 - 17484550
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17484687 cattatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacca 17484588  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484587 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 17484550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 19180427 - 19180562
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19180427 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattactaa 19180525  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19180526 ctatactatctacaataagacttgtttgaaacgattc 19180562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 29737750 - 29737889
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29737750 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattat 29737849  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29737850 caactatgctatcgacaataggacttgtttgaaacaattc 29737889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33107108 - 33106969
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33107108 agcattatttaccatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 33107009  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33107008 caactatgatatctacaataggactcgtttgaaacgattc 33106969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43249551 - 43249412
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  43249551 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaattac 43249452  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43249451 caactatgctatcatcaataggacttgttcgaaacgattc 43249412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 38751050 - 38751188
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751050 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattac 38751149  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38751150 caactatactatctacattaggacttgtttgaaacgatt 38751188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12759888 - 12759750
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12759888 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-aggcaaatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattac 12759790  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759789 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12759750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 42629964 - 42630103
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  42629964 agcatcatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattat 42630063  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42630064 caattatgctatctatgataggacttgtttgaaacgattc 42630103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25087933 - 25087796
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25087933 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaattatca 25087834  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25087833 actatgttatatacaataagacttgtttgaaacaattc 25087796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8396690 - 8396572
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8396690 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattat 8396591  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8396590 caactatgctatctacaat 8396572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37732332 - 37732193
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37732332 agcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaattac 37732233  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37732232 caactatgttatttacaataagacttgtttgaaacgattc 37732193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 45124121 - 45124260
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45124121 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaattac 45124220  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45124221 caactatgctatctacaataagatttgtttgaaacgattc 45124260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41178158 - 41178059
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41178158 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 41178059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 115
Target Start/End: Original strand, 37654112 - 37654224
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37654112 cattattcatcatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37654211  T
Q  103 actatgctatcta 115  Q
    |||||| ||||||    
T  37654212 actatgttatcta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 14630669 - 14630755
Alignment:
Q  54 ttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14630669 ttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 14630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 19916126 - 19916008
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| | || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19916126 agcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattac 19916027  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19916026 caactatgctatctacaat 19916008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 9331758 - 9331897
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |  ||  ||||||||||||    
T  9331758 agcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaattac 9331857  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9331858 caacaatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 9331897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23671897 - 23671811
Alignment:
Q  54 ttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23671897 ttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacgattc 23671811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23673012 - 23672962
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtggg 51  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23673012 agcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggg 23672962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 14717609 - 14717746
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717609 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14717708  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717709 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 14717746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11000867 - 11000728
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000867 agcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 11000768  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000767 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11000728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6600273 - 6600136
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600273 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 6600174  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600173 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6600136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6740094 - 6739955
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740094 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 6739995  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6739994 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6739955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 8215902 - 8216041
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8215902 agcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattac 8216001  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8216002 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 8216041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27457336 - 27457197
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27457336 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 27457237  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27457236 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 27457197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30297888 - 30297749
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30297888 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctaggagccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaattac 30297789  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297788 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 30297749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33760609 - 33760470
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33760609 agcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattac 33760510  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33760509 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39002164 - 39002025
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002164 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 39002065  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39002064 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacaattc 39002025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16096098 - 16095960
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16096098 agcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaa-gatgagttcaaggaagcaattac 16096000  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16095999 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 16095960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19659640 - 19659501
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19659640 agcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagcaattac 19659541  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19659540 caactatgctatctacaataggacttatttgaaacgattc 19659501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38964252 - 38964114
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964252 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 38964154  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38964153 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38964114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 42993520 - 42993659
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993520 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 42993619  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42993620 caactatgctatctacaataggaattgtttgaaacaattc 42993659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 30863255 - 30863393
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30863255 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattac 30863354  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30863355 caactatgctatctacattatgacttgtttgaaacgatt 30863393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 41282344 - 41282482
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41282344 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 41282443  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41282444 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 41282482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 14952328 - 14952465
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952328 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14952427  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14952428 actatgttatctacaacaagacttgtttgaaacgattc 14952465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 20408537 - 20408674
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20408537 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattacca 20408636  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20408637 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 20408674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3352141 - 3352002
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3352141 agcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattac 3352042  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3352041 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 3352002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 6251974 - 6252113
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6251974 agcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattac 6252073  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6252074 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6252113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 8689574 - 8689713
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8689574 agcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaattac 8689673  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8689674 caactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattc 8689713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26593419 - 26593280
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26593419 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaagaagcaattac 26593320  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26593319 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 26593280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 31710284 - 31710423
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710284 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 31710383  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31710384 caactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattc 31710423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 35342182 - 35342321
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  35342182 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattat 35342281  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35342282 caactatgctatctacaatgagacttgtttgaaacgattc 35342321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 39824558 - 39824697
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39824558 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattac 39824657  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824658 caactatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 39824697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 40074952 - 40075091
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40074952 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaattac 40075051  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40075052 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattc 40075091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 1052541 - 1052674
Alignment:
Q  7 atccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacta 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052541 atccaccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaattaccaacta 1052640  T
Q  107 tgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1052641 tgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 1052674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4016013 - 4015874
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016013 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 4015914  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4015913 caactatgttatctacaataggacttgcttgaaacgattc 4015874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11692286 - 11692147
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11692286 agcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 11692187  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11692186 caactatgctatctgcaatatgacttgtttgaaacgattc 11692147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20079397 - 20079258
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20079397 agcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattac 20079298  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20079297 caactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 20079258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23129052 - 23128913
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23129052 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 23128953  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23128952 caattatgctatctacgatatgacttgtttgaaacgattc 23128913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43166408 - 43166269
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43166408 agcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattac 43166309  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43166308 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 43166269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28078544 - 28078405
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||  || | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28078544 agcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 28078445  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28078444 caactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 28078405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27116236 - 27116099
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27116236 cattatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattacca 27116137  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27116136 actatgctatctacaataggacttgtttaaaatgattc 27116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30208541 - 30208402
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30208541 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 30208442  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30208441 caactatgttatctacaatagaacttgtttgaaatgattc 30208402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19398330 - 19398193
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19398330 cattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaattacca 19398231  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19398230 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaatgattc 19398193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 26035485 - 26035367
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26035485 agcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattac 26035386  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  26035385 caactatggtatctacaat 26035367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 16752118 - 16752236
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752118 agcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 16752217  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  16752218 caactatgttatctacaat 16752236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 8694868 - 8695007
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||     
T  8694868 agcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatgagccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataattat 8694967  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8694968 caattatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 8695007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 11935450 - 11935586
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11935450 cattatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaagtgagtgttaggagccacatttggttc-aaagatgagatcaaggaaacaattacca 11935548  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935549 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11935586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 6331379 - 6331479
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6331379 agcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 6331478  T
Q  101 c 101  Q
    |    
T  6331479 c 6331479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Original strand, 444962 - 445074
Alignment:
Q  7 atccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacta 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  444962 atccaccatttgccacgcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaacta 445061  T
Q  107 tgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||    
T  445062 tgctatctacaat 445074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 27509980 - 27510112
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     ||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27509980 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtcctt-ttagtt------tttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattac 27510072  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  27510073 caactatgcttattacaataggacttgtttgaaacgattc 27510112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 6332873 - 6332917
Alignment:
Q  96 attaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6332873 attaccaactattctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 6332917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1469632 - 1469493
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1469632 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaattac 1469533  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469532 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1469493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31684273 - 31684134
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684273 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 31684174  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684173 caactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31684134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47281263 - 47281124
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281263 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 47281164  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281163 caactatggtatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47281124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11476695 - 11476556
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476695 agcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 11476596  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476595 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11476556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 23842307 - 23842446
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23842307 agcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 23842406  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842407 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 23842446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30798507 - 30798368
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798507 agcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 30798408  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30798407 caactatgctatctacaataggatttgtttgaaacgattc 30798368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 41113379 - 41113518
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41113379 agcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattac 41113478  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41113479 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 41113518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 44544411 - 44544549
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544411 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 44544510  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544511 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 44544549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 47219147 - 47219285
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219147 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 47219246  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219247 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47219285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11050398 - 11050261
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11050398 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattacca 11050299  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11050298 aatatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11050261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2960768 - 2960640
Alignment:
Q  12 ccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgcta 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2960768 ccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgcta 2960669  T
Q  112 tctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960668 tctacaataggacttgtttgaaacgattc 2960640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35600261 - 35600122
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600261 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 35600162  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35600161 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 35600122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38427702 - 38427563
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427702 agcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattac 38427603  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38427602 caactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 38427563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 47271983 - 47272122
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47271983 agcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 47272082  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47272083 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47294430 - 47294291
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294430 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 47294331  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294330 caacgatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47294291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Original strand, 4923220 - 4923352
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4923220 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 4923319  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaac 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4923320 actatgctatccacaataggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 33884323 - 33884459
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884323 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 33884422  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33884423 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 33884459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8162851 - 8162712
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8162851 agcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaattac 8162752  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8162751 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 8162712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 40851276 - 40851415
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40851276 agcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaattac 40851375  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40851376 caactattctacctacaataggacttgtttgaaacgattc 40851415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37394135 - 37393998
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37394135 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactacca 37394036  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394035 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37393998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 30876261 - 30876400
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30876261 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaattac 30876360  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30876361 caactatgctatctacaatagcacttgtttgaaacgattc 30876400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43968398 - 43968259
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43968398 agcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 43968299  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968298 caactacgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 43968259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Original strand, 221301 - 221416
Alignment:
Q  25 ctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggac 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221301 ctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaataggac 221400  T
Q  125 ttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||    
T  221401 ttgtttgaaacgattc 221416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27364478 - 27364339
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27364478 agcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattac 27364379  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27364378 caactatgttatctacaataggatctgtttgaaacgattc 27364339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43752915 - 43752776
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752915 agcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 43752816  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752815 caattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 43752776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 48628807 - 48628946
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  48628807 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaattac 48628906  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628907 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 48628946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 29248347 - 29248482
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29248347 attatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaa 29248446  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29248447 ctatgctatctacaataagacttgtttgaaatgatt 29248482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45723630 - 45723491
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  45723630 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattac 45723531  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
     || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45723530 taattatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgattc 45723491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41139551 - 41139408
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139551 agcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 41139452  T
Q  101 caac----tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41139451 caactatatatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 41139408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 7336065 - 7336200
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7336065 attattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaa 7336164  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7336165 ctatgctatctacaatagaac-tgtttgaaacgattc 7336200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30972080 - 30971941
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  30972080 agcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaattac 30971981  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30971980 caactatgccatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 30971941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 42979477 - 42979338
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  42979477 agcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaattac 42979378  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42979377 caactatgttatctacagtaggacttgtttgaaacgattc 42979338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3797662 - 3797544
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3797662 agcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattat 3797563  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3797562 caactatgctatctacaat 3797544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 27774110 - 27774228
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27774110 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattac 27774209  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27774210 caactatgctatctacaat 27774228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 18353148 - 18353285
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  18353148 cattatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattacca 18353247  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18353248 actatgctatctaccttaggacttgtttgaaacgattc 18353285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 37354400 - 37354284
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37354400 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 37354301  T
Q  103 actatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||    
T  37354300 actatgctatctacaat 37354284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 47119993 - 47120134
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47119993 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaattac 47120092  T
Q  101 caac--tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47120093 caactatatgctctctacaataggacttgtttgaaacgattc 47120134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44800547 - 44800410
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44800547 cattatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattacca 44800448  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44800447 actatgttatctacaacaggacttgtttgaaacaattc 44800410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47579226 - 47579086
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagc-aatta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47579226 agcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaaatta 47579127  T
Q  100 ccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  47579126 ccaattatgctatctataataggacttgtctgaaacaattc 47579086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 40520920 - 40521011
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40520920 agcattatccaccatttgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 140
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42888990
Alignment:
Q  87 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106182
Alignment:
Q  84 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataaga-atgtttgaaacgattc 5106182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 39034064 - 39034114
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtggg 51  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39034064 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggg 39034114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 29739783 - 29739829
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagt 48  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29739783 agcattatccaccatttaccatgcct-aaaagatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 10256239 - 10256378
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256239 agcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 10256338  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256339 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 10256378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 30379021 - 30379158
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379021 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 30379120  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379121 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 30379158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 2707461 - 2707600
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2707461 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaattac 2707560  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2707561 caactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2707600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8178388 - 8178249
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8178388 agcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattac 8178289  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8178288 caactatgctatctacaataggacatgtttgaaacgattc 8178249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 12626638 - 12626777
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12626638 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattac 12626737  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626738 caactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12626777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 29050274 - 29050413
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050274 agcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 29050373  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050374 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 29050413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 6503720 - 6503858
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6503720 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaattac 6503819  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503820 caactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6503858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1915482 - 1915343
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1915482 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 1915383  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1915382 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaactattc 1915343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 3408191 - 3408330
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3408191 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattac 3408290  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3408291 caactatactatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 3408330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 2390267 - 2390406
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390267 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 2390366  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390367 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2390406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 17943040 - 17943177
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17943040 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattacca 17943139  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17943140 attatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 17943177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26393146 - 26393009
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393146 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 26393047  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  26393046 actatgctatctacaatagaagttttttgaaacgattc 26393009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 11133875 - 11134015
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttc-aaggaagcaatta 99  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11133875 agcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaatta 11133974  T
Q  100 ccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11133975 ccatctatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattc 11134015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 9382521 - 9382660
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382521 agcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 9382620  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9382621 caactatgttatctacatcaggacttgtttgaaacgattc 9382660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 1077241 - 1077378
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077241 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1077340  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  1077341 actatgctatctacaacatgacttatttgaaacgattc 1077378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17428409 - 17428272
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428409 cattattcaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 17428310  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428309 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 17428272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26231071 - 26230932
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26231071 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaactac 26230972  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26230971 caactatgttatttacattaggacttgtttgaaacgattc 26230932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2598229 - 2598099
Alignment:
Q  10 caccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgc 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  2598229 caccatttgccatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatga 2598130  T
Q  110 tatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2598129 tatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 2598099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 16193314 - 16193451
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193314 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 16193413  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16193414 actattttatctgcattagaacttgtttgaaacgattc 16193451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3258942 - 3258807
Alignment:
Q  5 ttatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc-aa 103  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3258942 ttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtggtg-ttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaa 3258844  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3258843 ctatggtatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 3258807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 26936612 - 26936727
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26936612 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattatcaa 26936711  T
Q  104 ctatgctatctacaat 119  Q
    ||||||||||||||||    
T  26936712 ctatgctatctacaat 26936727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35224025 - 35223919
Alignment:
Q  14 atttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 113  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35224025 atttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 35223926  T
Q  114 tacaata 120  Q
    |||||||    
T  35223925 tacaata 35223919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6785237 - 6785101
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  6785237 agcattatacaaaatttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca---ac 6785141  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6785140 caattatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 6785101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26196458 - 26196321
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc- 101  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  26196458 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgttg-ttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaattacca 26196360  T
Q  102 aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26196359 aactatgttatctacaataggacttggttgaaccgattc 26196321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 31375972 - 31376058
Alignment:
Q  54 ttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31375972 ttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31376058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25820686 - 25820550
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||  ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25820686 cattatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttggtaccaaacatgagttcaatgaagcaattacca 25820587  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25820586 actatgctatctacgataggaattgtttgaaacgatt 25820550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10931267 - 10931148
Alignment:
Q  20 catgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |    
T  10931267 catgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatta-caactatgctatccacatt 10931169  T
Q  120 aggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  10931168 aggacttgtttgatacgattc 10931148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612971
Alignment:
Q  82 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12612971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12612927 - 12612848
Alignment:
Q  61 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12612927 ccagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 12612848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 31973593 - 31973732
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973593 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 31973692  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31973693 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 31973732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 42273804 - 42273943
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273804 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 42273903  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273904 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42273943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 5227392 - 5227531
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5227392 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattac 5227491  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227492 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 5227531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 26017425 - 26017564
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017425 agcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 26017524  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017525 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 26017564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 28264645 - 28264784
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264645 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 28264744  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264745 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28264784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28812425 - 28812287
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28812425 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggtg-ttaggagccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaattac 28812327  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28812326 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28812287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33807919 - 33807780
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33807919 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattac 33807820  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807819 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33807780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 49118616 - 49118752
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49118616 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 49118715  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118716 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 49118752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4545124 - 4544985
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4545124 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaattac 4545025  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545024 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 4544985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 12196471 - 12196610
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12196471 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattac 12196570  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12196571 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 12196610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17847234 - 17847096
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17847234 agcattatccaccatttgccatgcctaaaa-gatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 17847136  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847135 caattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 17847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24458770 - 24458631
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458770 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 24458671  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24458670 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 24458631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 31591078 - 31591216
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591078 agcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 31591176  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591177 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31591216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48707872 - 48707733
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707872 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 48707773  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48707772 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattc 48707733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 55517324 - 55517185
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  55517324 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattac 55517225  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55517224 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 55517185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 40988635 - 40988773
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  40988635 agcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattat 40988734  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40988735 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 40988773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23135143 - 23135006
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135143 cattagccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 23135044  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135043 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 23135006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30467140 - 30467003
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30467140 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattacca 30467041  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30467040 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 30467003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39995303 - 39995167
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39995303 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 39995204  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39995203 ctatgttatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 39995167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8882152 - 8882013
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8882152 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattat 8882053  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8882052 caactatgctatctagaataggacttgtttgaaacgattc 8882013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11795293 - 11795154
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11795293 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 11795194  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11795193 caactatgctatctagaatatgacttgtttgaaacgattc 11795154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19496241 - 19496102
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496241 agcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 19496142  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19496141 caactatggtatctacaataggacttgtttgaaacaattc 19496102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33693472 - 33693333
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33693472 agcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 33693373  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33693372 caactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattc 33693333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 51371186 - 51371047
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51371186 agcattattcaccatttgccatgtctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattac 51371087  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51371086 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 51371047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 32317957 - 32318094
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32317957 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 32318056  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32318057 actatgttatctacaataggacttgtttgaaatgattc 32318094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48551901 - 48551764
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48551901 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaattacca 48551802  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48551801 accatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 48551764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 44490324 - 44490460
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44490324 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 44490423  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490424 ctatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 44490460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 14564798 - 14564937
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  14564798 agcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaattac 14564897  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14564898 caactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 14564937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28160092 - 28159953
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28160092 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattac 28159993  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28159992 caactatggtatctacaataagacttgtttgaaatgattc 28159953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30141247 - 30141108
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30141247 agcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattac 30141148  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30141147 caactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattc 30141108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 35930042 - 35930180
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35930042 agcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaattac 35930140  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35930141 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 35930180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 32118720 - 32118854
Alignment:
Q  5 ttatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 104  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32118720 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaac 32118819  T
Q  105 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32118820 tatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 32118854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33174159 - 33174021
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33174159 agcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattac 33174060  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33174059 caactatgaaatctacaataagacttgtttgaaacgatt 33174021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 37381848 - 37381986
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37381848 agcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattac 37381947  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37381948 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaatgatt 37381986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 48149502 - 48149640
Alignment:
Q  2 gcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149502 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 48149601  T
Q  102 aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48149602 aactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 48149640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 10588582 - 10588719
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10588582 agcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattac 10588681  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgat 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10588682 caactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgat 10588719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 50276274 - 50276138
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276274 agcattatccaccgtttgccatgcctaaaaaga---ctaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 50276178  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276177 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 50276138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 2055280 - 2055419
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2055280 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattat 2055379  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2055380 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 2055419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 50542493 - 50542354
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50542493 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattac 50542394  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  50542393 caactatgctatctacaataagatttgtttaaaacgattc 50542354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 15985012 - 15985151
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15985012 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattac 15985111  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15985112 caactatgttatctagaatatgacttgtttgaaacgattc 15985151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 31208750 - 31208885
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31208750 agcattatccaccatttatcatgttt----agatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattac 31208845  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31208846 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31208885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 23553069 - 23553205
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23553069 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggtg-ttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 23553167  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23553168 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 23553205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25734360 - 25734223
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25734360 cattatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacgaaagatgagttcaattaagcaattacca 25734261  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25734260 actatgttatctacaataggacttgtttgaaatgattc 25734223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9339265 - 9339123
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaa---gatgagttcaaggaagcaat 97  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9339265 agcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagcaat 9339166  T
Q  98 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9339165 taccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaatgattc 9339123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 22298519 - 22298659
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaa-agatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||    
T  22298519 agcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaatta 22298618  T
Q  100 ccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22298619 ccaattatgctatctacaatagggcttgtttgaaacgattc 22298659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17993156 - 17993017
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17993156 agcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaattac 17993057  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17993056 caactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 17993017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 24623150 - 24623268
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24623150 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 24623249  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24623250 caactatgctatctacaat 24623268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 25730244 - 25730381
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25730244 cattatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaattacca 25730343  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25730344 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 25730381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 39700047 - 39700186
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39700047 agcattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 39700146  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39700147 caattatgttatctataataagacttgtttgaaacgattc 39700186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 19168934 - 19168816
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168934 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattac 19168835  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19168834 caactatgctatctacaat 19168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534306
Alignment:
Q  59 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattc 20534306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 42549760 - 42549643
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42549760 agcattttccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaattac 42549662  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  42549661 caactatgttatctacaat 42549643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 56555279 - 56555200
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagat 80  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  56555279 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 56555200 - 56555165
Alignment:
Q  105 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555200 tatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 56555165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 21564498 - 21564637
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564498 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattac 21564597  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564598 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 21564637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 31122664 - 31122803
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122664 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 31122763  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31122764 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 31122803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 1687655 - 1687792
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687655 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1687754  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687755 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1687792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 1017046 - 1017185
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017046 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 1017145  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017146 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1017185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20086453 - 20086314
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086453 agcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 20086354  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20086353 caagtatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 20086314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 33151698 - 33151837
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33151698 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaattac 33151797  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151798 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33151837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35346608 - 35346471
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346608 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 35346509  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35346508 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 35346471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20813580 - 20813441
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813580 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 20813481  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20813480 caattatgctatctacattatgacttgtttgaaacgattc 20813441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 21656520 - 21656659
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656520 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 21656619  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21656620 caactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 21656659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 38446478 - 38446617
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446478 agcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 38446577  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38446578 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38446617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 41250888 - 41251027
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41250888 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 41250987  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41250988 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattc 41251027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47329314 - 47329175
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47329314 agcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 47329215  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  47329214 caactatgctatctacgatatgacttgttggaaacgattc 47329175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 32650957 - 32650820
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650957 cattatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 32650858  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  32650857 actatgctatctataatagaacttgtttgaaatgattc 32650820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20760207 - 20760071
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760207 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 20760108  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20760107 ctatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 20760071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 3697148 - 3697287
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3697148 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattac 3697247  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3697248 caactatactatctacaataggacttgtttgaaaggattc 3697287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 12748393 - 12748524
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748393 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 12748492  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748493 caactatgctatctacaataggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36315111 - 36314972
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36315111 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaattac 36315012  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36315011 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 36314972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 42107238 - 42107099
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42107238 agcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaattac 42107139  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42107138 caactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42107099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 50287570 - 50287707
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  50287570 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaattacca 50287669  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287670 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 50287707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 21890175 - 21890311
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890175 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 21890274  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21890275 atatgttatctataataggacttgtttgaaacgattc 21890311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 42016878 - 42017014
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42016878 attatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 42016977  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42016978 ctatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 42017014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Original strand, 26455588 - 26455723
Alignment:
Q  5 ttatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 104  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455588 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaac 26455687  T
Q  105 tatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26455688 tatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 26455723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 44798270 - 44798408
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44798270 agcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattac 44798368  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44798369 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 44798408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 48651250 - 48651389
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  48651250 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaattac 48651349  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48651350 caactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 48651389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 51562164 - 51562303
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51562164 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 51562263  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51562264 caactatgttatctacattagaacttgtttgaaacgattc 51562303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 19664543 - 19664677
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19664543 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatgagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 19664642  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664643 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 19664677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22851998 - 22852131
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22851998 agcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 22852097  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22852098 caactatgctatctacaataggacttatttgaaa 22852131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40922302 - 40922165
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40922302 cattatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 40922203  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40922202 actatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgattc 40922165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20913893 - 20913754
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20913893 agcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattat 20913794  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20913793 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 20913754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20922011 - 20921872
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20922011 agcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattat 20921912  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20921911 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 20921872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27070878 - 27070739
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27070878 agcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 27070779  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27070778 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 27070739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 53196016 - 53196155
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  53196016 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataattac 53196115  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53196116 caactatgttatctacaataagacttctttgaaacgattc 53196155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 29677478 - 29677616
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677478 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaaatgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 29677577  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29677578 aaactatgatatctacgataggacctgtttgaaacgatt 29677616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1448871 - 1448735
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1448871 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaattac 1448772  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  1448771 caactatggta---acaataggacttctttgaaacgattc 1448735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10618617 - 10618480
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10618617 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 10618518  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618517 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 10618480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35608267 - 35608131
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35608267 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattaccaa 35608168  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35608167 ttatgctatctacaataggacttatttgaaacgattc 35608131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 37247958 - 37248097
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| || |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37247958 agcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattac 37248057  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248058 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37248097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 53926118 - 53925979
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53926118 agcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattac 53926019  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  53926018 caactatactatctacaatatgacttatttgaaatgattc 53925979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 19268523 - 19268668
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19268523 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattac 19268622  T
Q  101 caacta------tgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||      || |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19268623 caactatgttattgttatctacattaggacttgtttaaaacgattc 19268668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 50977866 - 50977984
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50977866 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 50977965  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50977966 caactatgctatctacaat 50977984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 51080998 - 51081116
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51080998 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 51081097  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51081098 caactatgctatctacaat 51081116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 39069728 - 39069867
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||     
T  39069728 agcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaattat 39069827  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  39069828 caactatgctattaacaatatgacttgtttgaaacgattc 39069867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 52821188 - 52821049
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52821188 agcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaattac 52821089  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52821088 caactatgttatctacaacaggacttgtttaaaacgattc 52821049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 55164254 - 55164115
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  55164254 agcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattag 55164155  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  55164154 caactatgctatctacaatatgacttatttgaaacaattc 55164115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45380399 - 45380260
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  45380399 agcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaattat 45380301  T
Q  100 ccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45380300 caaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 45380260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 51475383 - 51475267
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51475383 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 51475284  T
Q  103 actatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||    
T  51475283 actatgctatctacaat 51475267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 50365026 - 50364908
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50365026 agcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 50364927  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  50364926 caactatgttatctacaat 50364908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33473378 - 33473239
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  33473378 agcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaattac 33473279  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33473278 caactatgttatctacaataaaacttgtttgaaacgattc 33473239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 28699687 - 28699798
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  28699687 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaattat 28699786  T
Q  101 caactatgctat 112  Q
    | |||| |||||    
T  28699787 ctactaagctat 28699798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 34019462 - 34019580
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||     
T  34019462 agcattatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattat 34019561  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34019562 caactatgctatctacaat 34019580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38924112 - 38923998
Alignment:
Q  26 taaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggact 125  Q
    |||| |||||| |||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  38924112 taaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagataagttcaacgaagcaattaccaactattttatctacgataggact 38924013  T
Q  126 tgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||| ||||    
T  38924012 tgtttgaaacaattc 38923998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 42641288 - 42641199
Alignment:
Q  30 aagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 119  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  42641288 aagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacttggctatatacaat 42641199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 44152702 - 44152777
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaa 76  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  44152702 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaa 44152777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 47473232 - 47473294
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagcca 63  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  47473232 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 140
Target Start/End: Original strand, 44152772 - 44152814
Alignment:
Q  98 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44152772 taccaactatgttatctataatatgacttgtttgaaacgattc 44152814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 12143074 - 12143213
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143074 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 12143173  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143174 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12143213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23767553 - 23767414
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767553 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 23767454  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23767453 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 23767414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 41106018 - 41106157
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106018 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 41106117  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106118 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 41106157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 46825533 - 46825672
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825533 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 46825632  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825633 caattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 46825672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 49094848 - 49094711
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094848 cattatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 49094749  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094748 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 49094711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24204610 - 24204474
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24204610 agcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaattac 24204511  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24204510 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 24204474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7553155 - 7553016
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553155 agcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 7553056  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7553055 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7553016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 19315642 - 19315781
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315642 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 19315741  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19315742 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 19315781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25988410 - 25988271
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25988410 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattac 25988311  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988310 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 25988271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28425502 - 28425363
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425502 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 28425403  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28425402 caactatgctatctgcaataggacttgtttgaaacgattc 28425363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 33674019 - 33674158
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33674019 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaattac 33674118  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33674119 cagctatgctatctacaataggacttgtttgacacgattc 33674158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38473765 - 38473626
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473765 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 38473666  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473665 caactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 38473626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 46051452 - 46051591
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46051452 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 46051551  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46051552 caactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattc 46051591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 37216900 - 37217037
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37216900 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattacca 37216999  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37217000 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37217037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 7651664 - 7651803
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7651664 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattat 7651763  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7651764 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7651803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36157816 - 36157678
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36157816 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt-c 36157718  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157717 caattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 36157678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 49814302 - 49814441
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814302 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 49814401  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  49814402 caactatgctatctagaatatgacttatttgaaacgattc 49814441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 16705872 - 16706011
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16705872 agcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 16705971  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16705972 caactatgttatctaaaataagacttgtttgaaacgattc 16706011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 26549390 - 26549529
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26549390 agcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 26549489  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26549490 caactatgctatctacaataggacttgtttaaaacgattc 26549529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 33325729 - 33325868
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33325729 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaattac 33325828  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325829 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33325868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36781311 - 36781172
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781311 agcattatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 36781212  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36781211 caactatgatatctacaataagacttgtttgaaacgattc 36781172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 19274561 - 19274699
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19274561 agcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattac 19274660  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19274661 cagctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 19274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23228333 - 23228194
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228333 agcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 23228234  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23228233 caactatgctatctacaatagtacttgtttgaaacgattc 23228194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 46095214 - 46095075
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46095214 agcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaattac 46095115  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46095114 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 46095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 50689945 - 50690084
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50689945 agcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattac 50690044  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50690045 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 50690084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45350852 - 45350717
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45350852 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattacca 45350753  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45350752 actatgttatctacaatagg--ttgtttgaaacgattc 45350717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 9962755 - 9962892
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9962755 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9962854  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9962855 actatgctatctacaacagaacttgtttgaaacgattc 9962892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48669533 - 48669396
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48669533 cattatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatcacca 48669434  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48669433 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 48669396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 5400876 - 5401011
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5400876 attatccaccatttgc-atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 5400974  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5400975 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattc 5401011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 6711442 - 6711581
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711442 agcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 6711541  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6711542 caactataatgtctacaatatgacttgtttgaaacgattc 6711581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7608905 - 7608766
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  7608905 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaattat 7608806  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7608805 caactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 7608766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 18892331 - 18892470
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18892331 agcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattac 18892430  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18892431 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 18892470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 43396677 - 43396816
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43396677 agcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattat 43396776  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43396777 caactctgctatctacagtaggatttgtttgaaacgattc 43396816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 50533385 - 50533523
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50533385 agcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattac 50533484  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50533485 caactatgttatctataataggacttgtttgaaacgatt 50533523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 26069896 - 26070033
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26069896 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaattacca 26069995  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26069996 actatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 26070033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48802470 - 48802331
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48802470 agcattatccaccatttatcatgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattac 48802371  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48802370 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 48802331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 21929526 - 21929667
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaag-------atgagttcaaggaagcaa 96  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  21929526 attatccaccatttgccat--ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaa 21929623  T
Q  97 ttaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21929624 ttaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 21929667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45670623 - 45670486
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc- 101  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45670623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggtg-ttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 45670525  T
Q  102 aactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670524 aactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 45670486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8141623 - 8141486
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8141623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttggtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaa 8141524  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141523 attatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 8141486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9878921 - 9878784
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878921 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9878822  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9878821 actattttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 9878784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 21965069 - 21965206
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21965069 cattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaattacca 21965168  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21965169 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 21965206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 34971084 - 34971221
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  34971084 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattacca 34971183  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34971184 actatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 34971221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 40721344 - 40721484
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagt-gggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40721344 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaatta 40721443  T
Q  100 ccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40721444 tcaactatgctatctacaataggacttgttggaaacgattc 40721484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 52146995 - 52147134
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52146995 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattac 52147094  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
     ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  52147095 aaactatgctatatacaacatgacttgtttgaaacgattc 52147134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 52350063 - 52349924
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  52350063 agcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaattac 52349964  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52349963 caactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 52349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 33194790 - 33194672
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33194790 agcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 33194691  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33194690 caactatgctatctacaat 33194672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 18917529 - 18917664
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||    
T  18917529 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattattaa 18917628  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18917629 atatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgatt 18917664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41982372 - 41982237
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  41982372 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatca 41982273  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgat 138  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41982272 actatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgat 41982237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 52067790 - 52067651
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52067790 agcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaattac 52067691  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
     || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52067690 aaattatgccatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 52067651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 120
Target Start/End: Original strand, 9974846 - 9974963
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9974846 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 9974945  T
Q  103 actatgctatctacaata 120  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9974946 actatgctatctacaata 9974963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18782226 - 18782089
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18782226 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatgaaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatca 18782127  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  18782126 actatgctatctagaatatgacttgtttgaaatgattc 18782089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16506925 - 16506809
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16506925 cattatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattacca 16506826  T
Q  103 actatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||    
T  16506825 actatgctatctacaat 16506809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 48319183 - 48319067
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48319183 cattatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 48319084  T
Q  103 actatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||| ||||||    
T  48319083 actatgctatatacaat 48319067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17984037 - 17983898
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17984037 agcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattac 17983938  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
     ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17983937 aaactatgttatttacattaggacttggttgaaacgattc 17983898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 12964648 - 12964750
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12964648 agcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 12964747  T
Q  101 caa 103  Q
    |||    
T  12964748 caa 12964750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 30281633 - 30281751
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||  | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30281633 agcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 30281732  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30281733 caactatgctatctacaat 30281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33714495 - 33714361
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33714495 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatgt-aagtggtg-ttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaattatcaa 33714398  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33714397 ctatgttatctacaataggatttgtttgaaacgattc 33714361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 25800648 - 25800782
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaa----gatgagttcaaggaagcaatt 98  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  25800648 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agatttggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaatt 25800741  T
Q  99 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25800742 accaac-atgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 25800782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978768
Alignment:
Q  39 aattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgat 138  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  44978868 aattttaagtggta-ttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacgat 44978770  T
Q  139 tc 140  Q
    ||    
T  44978769 tc 44978768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 50099222 - 50099271
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgg 50  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50099222 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg 50099271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 44979327 - 44979276
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtggga 52  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44979327 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaggggga 44979276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 32373692 - 32373650
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattt 43  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32373692 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 116 - 255
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 215  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  216 cgactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 218887 - 219027
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaa-ttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  218887 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 218986  T
Q  100 ccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218987 ccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 219027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5164 - 5027
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5164 cattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattacca 5065  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5064 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 5027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 252577 - 252438
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  252577 agcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaattac 252478  T
Q  101 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  252477 caactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 252438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 13099 - 13236
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13099 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 13198  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13199 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 13236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 59745 - 59608
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  59745 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 59646  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  59645 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 59608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 5190 - 5326
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5190 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggtg-ttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 5288  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5289 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 5326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 11362 - 11498
Alignment:
Q  3 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  11362 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattacca 11461  T
Q  103 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 139  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11462 actatgctacctacaataggtcttatttaaaacgatt 11498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 47967 - 48103
Alignment:
Q  4 attatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47967 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaa 48066  T
Q  104 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    |||||  || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  48067 ctatgtgatatacaatcggacttgtttaaaacgattc 48103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1994
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggaattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 agcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 2013  T
Q  101 caactatgctatctacaat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2012 caactatgctatctacaat 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Original strand, 599 - 680
Alignment:
Q  59 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattc 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1913
Alignment:
Q  59 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattc 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3371
Alignment:
Q  59 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacgattc 3371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1958
Alignment:
Q  59 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacgattc 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 340 - 290
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtggg 51  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  340 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtggg 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 19783 - 19831
Alignment:
Q  1 agcattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtg 49  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19783 agcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University