View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14973_high_1 (Length: 470)

Name: NF14973_high_1
Description: NF14973
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14973_high_1
NF14973_high_1
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (19-466)||(9122-9569)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (19-466)||(21704341-21704788)
chr5 (19-466)||(23393846-23394293)
chr5 (19-466)||(17455690-17456137)
chr5 (19-466)||(24981787-24982234)
chr5 (19-466)||(34053397-34053844)
chr5 (19-466)||(20553252-20553699)
chr5 (19-465)||(13532254-13532691)
chr5 (19-449)||(19465426-19465856)
chr5 (19-465)||(23486880-23487317)
chr5 (19-449)||(43620271-43620701)
chr5 (19-449)||(5299519-5299949)
chr5 (19-449)||(14455989-14456419)
chr5 (19-449)||(34773363-34773793)
chr5 (19-449)||(39353950-39354380)
chr5 (19-449)||(9337408-9337838)
chr5 (19-449)||(23698234-23698664)
chr5 (19-449)||(27621149-27621579)
chr5 (19-449)||(31834934-31835364)
chr5 (19-449)||(37738944-37739374)
chr5 (19-449)||(40391812-40392242)
chr5 (19-449)||(6977260-6977690)
chr5 (19-449)||(22677570-22678000)
chr5 (19-449)||(23297731-23298161)
chr5 (19-449)||(24809370-24809800)
chr5 (19-449)||(30236403-30236833)
chr5 (19-449)||(36591494-36591924)
chr5 (19-449)||(39499864-39500294)
chr5 (19-449)||(42044234-42044664)
chr5 (19-449)||(1120279-1120709)
chr5 (19-449)||(14031496-14031926)
chr5 (19-449)||(14567030-14567460)
chr5 (19-449)||(15741423-15741853)
chr5 (19-449)||(17608516-17608946)
chr5 (19-449)||(17720372-17720802)
chr5 (19-449)||(22147970-22148400)
chr5 (19-449)||(24568542-24568972)
chr5 (19-449)||(27051214-27051644)
chr5 (19-449)||(31420119-31420549)
chr5 (19-449)||(36689152-36689582)
chr5 (19-466)||(11209432-11209870)
chr5 (19-449)||(16002273-16002703)
chr5 (19-449)||(27461616-27462046)
chr5 (19-449)||(31349988-31350418)
chr5 (19-445)||(35216961-35217387)
chr5 (19-419)||(23363580-23363980)
chr5 (19-449)||(24825852-24826282)
chr5 (19-465)||(25113336-25113773)
chr5 (19-465)||(25172427-25172864)
chr5 (19-465)||(26763737-26764173)
chr5 (136-439)||(21200466-21200769)
chr5 (19-466)||(26782700-26783138)
chr5 (300-466)||(31144738-31144905)
chr5 (19-99)||(21200797-21200877)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (19-466)||(13262987-13263434)
chr3 (19-465)||(8997266-8997712)
chr3 (19-465)||(14312727-14313173)
chr3 (19-466)||(9381978-9382425)
chr3 (25-466)||(11207409-11207850)
chr3 (19-466)||(4432236-4432680)
chr3 (19-465)||(1062620-1063057)
chr3 (19-465)||(29934878-29935315)
chr3 (19-465)||(29984032-29984469)
chr3 (113-466)||(1785391-1785744)
chr3 (19-465)||(15652424-15652861)
chr3 (19-449)||(17016260-17016681)
chr3 (19-449)||(7795952-7796382)
chr3 (19-449)||(20674528-20674958)
chr3 (19-449)||(5538352-5538782)
chr3 (19-449)||(6183297-6183727)
chr3 (19-449)||(11273716-11274146)
chr3 (19-449)||(39381160-39381590)
chr3 (19-446)||(19787498-19787925)
chr3 (19-449)||(5580964-5581394)
chr3 (19-449)||(13130746-13131176)
chr3 (19-449)||(14474697-14475127)
chr3 (19-449)||(16392379-16392809)
chr3 (19-449)||(37875537-37875967)
chr3 (19-449)||(37884055-37884485)
chr3 (19-449)||(38203728-38204158)
chr3 (19-449)||(4752795-4753225)
chr3 (19-449)||(5519344-5519774)
chr3 (19-445)||(8783739-8784165)
chr3 (19-449)||(9983219-9983649)
chr3 (19-449)||(10628279-10628709)
chr3 (19-449)||(13373999-13374429)
chr3 (19-449)||(13384593-13385023)
chr3 (19-449)||(23766370-23766800)
chr3 (19-449)||(24384849-24385279)
chr3 (19-449)||(24668946-24669376)
chr3 (19-449)||(28315569-28315999)
chr3 (19-449)||(505501-505931)
chr3 (19-449)||(5867027-5867457)
chr3 (19-449)||(6491677-6492107)
chr3 (19-449)||(12238949-12239379)
chr3 (19-449)||(41692725-41693155)
chr3 (19-449)||(12288311-12288741)
chr3 (19-449)||(16397351-16397781)
chr3 (19-465)||(12754100-12754537)
chr3 (137-465)||(15847488-15847816)
chr3 (69-449)||(29462549-29462929)
chr3 (131-465)||(14908116-14908450)
chr3 (130-466)||(14078757-14079093)
chr3 (19-466)||(16029291-16029726)
chr3 (19-466)||(18123093-18123531)
chr3 (19-466)||(17244627-17245065)
chr3 (131-466)||(11188379-11188714)
chr3 (306-466)||(47541550-47541709)
chr3 (19-466)||(2559475-2559905)
chr3 (131-466)||(19886524-19886857)
chr3 (199-466)||(53058161-53058428)
chr3 (165-466)||(18696336-18696637)
chr3 (310-466)||(21639404-21639560)
chr3 (253-459)||(14952688-14952894)
chr3 (34-116)||(15847409-15847491)
chr3 (199-348)||(5211129-5211278)
chr3 (334-466)||(11221380-11221512)
chr3 (19-98)||(5211016-5211095)
chr3 (19-99)||(14908470-14908550)
chr3 (208-392)||(16306516-16306700)
chr3 (19-99)||(11188276-11188356)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (19-466)||(16745478-16745925)
chr8 (19-465)||(3842015-3842452)
chr8 (19-465)||(22148955-22149392)
chr8 (19-465)||(23791718-23792155)
chr8 (19-451)||(19233855-19234287)
chr8 (19-449)||(19427399-19427829)
chr8 (19-449)||(19137757-19138187)
chr8 (19-449)||(13689936-13690366)
chr8 (19-449)||(30316091-30316521)
chr8 (19-449)||(15782077-15782507)
chr8 (19-449)||(29075217-29075647)
chr8 (19-449)||(29085468-29085898)
chr8 (19-449)||(32079062-32079492)
chr8 (19-449)||(3350001-3350431)
chr8 (19-449)||(9366771-9367201)
chr8 (19-465)||(21297209-21297646)
chr8 (19-449)||(26119387-26119817)
chr8 (19-449)||(36302003-36302433)
chr8 (19-449)||(44490191-44490621)
chr8 (19-449)||(250885-251315)
chr8 (19-449)||(813986-814416)
chr8 (19-445)||(36086999-36087425)
chr8 (132-465)||(45569384-45569717)
chr8 (19-462)||(19941505-19941939)
chr8 (131-465)||(17287601-17287935)
chr8 (131-466)||(15976719-15977054)
chr8 (131-466)||(17014939-17015274)
chr8 (131-466)||(17541927-17542262)
chr8 (131-449)||(22672166-22672484)
chr8 (19-392)||(20257076-20257440)
chr8 (177-466)||(22462896-22463185)
chr8 (301-449)||(6159796-6159944)
chr8 (19-392)||(25164545-25164909)
chr8 (19-272)||(21603729-21603973)
chr8 (19-361)||(19940372-19940705)
chr8 (19-243)||(20260488-20260703)
chr8 (19-243)||(21047118-21047333)
chr8 (131-289)||(18152629-18152787)
chr8 (19-99)||(15976616-15976696)
chr8 (34-99)||(17014851-17014916)
chr8 (34-99)||(17542285-17542350)
chr8 (34-99)||(17287958-17288023)
chr8 (25-98)||(22672069-22672142)
chr8 (25-77)||(22463211-22463263)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (19-466)||(34260-34707)
scaffold0047 (131-466)||(7035-7370)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (19-466)||(14837426-14837873)
chr4 (19-466)||(16315817-16316264)
chr4 (19-465)||(14712142-14712579)
chr4 (141-466)||(15195243-15195568)
chr4 (19-449)||(27816281-27816711)
chr4 (19-449)||(40455695-40456125)
chr4 (19-449)||(5021226-5021656)
chr4 (19-449)||(18131584-18132014)
chr4 (19-449)||(19945673-19946103)
chr4 (19-449)||(22005507-22005937)
chr4 (19-449)||(27665663-27666093)
chr4 (19-449)||(55746587-55747017)
chr4 (19-449)||(27175163-27175594)
chr4 (19-449)||(459653-460083)
chr4 (19-449)||(4989130-4989560)
chr4 (19-449)||(16264955-16265385)
chr4 (19-449)||(17927189-17927619)
chr4 (19-449)||(30927828-30928258)
chr4 (19-449)||(10741933-10742363)
chr4 (19-449)||(10955702-10956132)
chr4 (19-449)||(24649421-24649851)
chr4 (19-449)||(36027381-36027811)
chr4 (19-449)||(49516627-49517057)
chr4 (19-344)||(3380592-3380917)
chr4 (19-449)||(18753825-18754255)
chr4 (19-449)||(18065065-18065495)
chr4 (34-466)||(16852203-16852626)
chr4 (131-466)||(10662581-10662916)
chr4 (131-466)||(10876726-10877061)
chr4 (36-466)||(17245867-17246288)
chr4 (19-171)||(10299762-10299914)
chr4 (293-465)||(16820677-16820849)
chr4 (19-142)||(15198446-15198569)
chr4 (340-466)||(3389259-3389385)
chr4 (19-466)||(14905718-14906156)
chr4 (393-465)||(11470133-11470205)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (19-466)||(28722652-28723099)
chr2 (25-466)||(24416360-24416801)
chr2 (19-393)||(26875999-26876373)
chr2 (19-465)||(19303763-19304200)
chr2 (19-449)||(21163298-21163728)
chr2 (19-449)||(24329100-24329530)
chr2 (19-419)||(19301360-19301751)
chr2 (19-465)||(24802986-24803423)
chr2 (19-449)||(29253251-29253681)
chr2 (19-449)||(4218927-4219357)
chr2 (19-449)||(9764114-9764544)
chr2 (19-449)||(9898924-9899354)
chr2 (19-449)||(11396523-11396953)
chr2 (19-449)||(27230470-27230900)
chr2 (19-449)||(35262035-35262465)
chr2 (19-449)||(35272660-35273090)
chr2 (19-449)||(39171445-39171875)
chr2 (19-449)||(40249640-40250070)
chr2 (19-449)||(43091710-43092140)
chr2 (19-449)||(10276018-10276448)
chr2 (19-449)||(22916211-22916641)
chr2 (19-449)||(34791568-34791998)
chr2 (19-449)||(43353461-43353891)
chr2 (143-466)||(22783011-22783334)
chr2 (131-466)||(24842569-24842911)
chr2 (19-466)||(24723651-24724086)
chr2 (131-466)||(28702606-28702941)
chr2 (225-466)||(24574502-24574743)
chr2 (199-466)||(21137548-21137815)
chr2 (178-440)||(10899909-10900171)
chr2 (360-465)||(22773144-22773249)
chr2 (165-466)||(24303433-24303734)
chr2 (222-449)||(25119754-25119979)
chr2 (137-290)||(22253985-22254138)
chr2 (222-439)||(21919471-21919688)
chr2 (310-466)||(22256759-22256915)
chr2 (34-92)||(22253891-22253949)
chr2 (376-466)||(23185719-23185809)
chr2 (376-466)||(23596982-23597072)
chr2 (19-99)||(23185934-23186014)
chr2 (19-99)||(23597197-23597277)
chr2 (422-466)||(26878510-26878554)
chr2 (286-390)||(24567290-24567394)
chr2 (56-98)||(22783370-22783412)
chr2 (19-93)||(28702970-28703044)
chr2 (223-268)||(22682401-22682446)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (19-466)||(9168639-9169086)
chr7 (19-465)||(18439662-18440099)
chr7 (31-449)||(15879237-15879655)
chr7 (19-449)||(6868645-6869075)
chr7 (19-449)||(9442321-9442751)
chr7 (19-449)||(175948-176378)
chr7 (19-449)||(8003481-8003911)
chr7 (19-449)||(8626403-8626833)
chr7 (19-449)||(9093445-9093875)
chr7 (19-449)||(11003637-11004067)
chr7 (31-449)||(20988127-20988545)
chr7 (19-449)||(458401-458831)
chr7 (19-449)||(2707028-2707458)
chr7 (19-449)||(4221066-4221496)
chr7 (19-449)||(11014246-11014676)
chr7 (19-449)||(17951529-17951959)
chr7 (19-449)||(22098199-22098629)
chr7 (19-449)||(26391509-26391939)
chr7 (19-449)||(1996614-1997044)
chr7 (19-449)||(24743159-24743589)
chr7 (19-449)||(40043519-40043949)
chr7 (19-449)||(26654751-26655181)
chr7 (19-445)||(42874906-42875332)
chr7 (19-307)||(13176050-13176328)
chr7 (131-466)||(13028371-13028706)
chr7 (19-466)||(16311423-16311860)
chr7 (19-466)||(4413411-4413858)
chr7 (34-465)||(13173659-13174081)
chr7 (25-466)||(14171944-14172376)
chr7 (19-466)||(13680621-13681053)
chr7 (19-466)||(13878417-13878855)
chr7 (19-466)||(16547441-16547879)
chr7 (19-466)||(16617783-16618221)
chr7 (208-466)||(21212026-21212284)
chr7 (199-449)||(16408241-16408494)
chr7 (165-440)||(16309168-16309443)
chr7 (298-466)||(15466307-15466475)
chr7 (404-465)||(13175993-13176054)
chr7 (222-449)||(16106479-16106706)
chr7 (205-263)||(16669780-16669838)
chr7 (205-263)||(17644148-17644206)
chr7 (388-449)||(6879287-6879348)
chr7 (34-99)||(16669950-16670015)
chr7 (34-99)||(17644318-17644383)
chr7 (131-212)||(16669846-16669927)
chr7 (131-212)||(17644214-17644295)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (19-463)||(23700-24144)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (19-465)||(3759-4196)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (19-465)||(17609919-17610356)
chr6 (19-466)||(25804098-25804545)
chr6 (19-465)||(22307232-22307669)
chr6 (19-465)||(18553729-18554165)
chr6 (19-449)||(20031262-20031692)
chr6 (19-465)||(11204402-11204840)
chr6 (19-449)||(12718177-12718607)
chr6 (19-449)||(25984507-25984937)
chr6 (25-465)||(22385053-22385484)
chr6 (19-449)||(3670474-3670904)
chr6 (19-449)||(9113834-9114264)
chr6 (19-449)||(12863961-12864391)
chr6 (19-449)||(16958038-16958468)
chr6 (19-449)||(26034450-26034880)
chr6 (19-449)||(26873832-26874262)
chr6 (19-449)||(27350775-27351205)
chr6 (19-449)||(27411515-27411945)
chr6 (19-449)||(32302387-32302817)
chr6 (19-449)||(32963287-32963717)
chr6 (64-440)||(17062705-17063072)
chr6 (19-449)||(27502734-27503164)
chr6 (19-455)||(26042625-26043061)
chr6 (19-449)||(27383167-27383597)
chr6 (19-449)||(27473551-27473981)
chr6 (19-449)||(28252909-28253339)
chr6 (19-449)||(28331658-28332088)
chr6 (19-449)||(34808503-34808933)
chr6 (19-398)||(14054786-14055156)
chr6 (36-466)||(17926078-17926499)
chr6 (19-182)||(17056492-17056646)
chr6 (19-175)||(25723351-25723498)
chr6 (34-466)||(26940694-26941119)
chr6 (165-449)||(17447095-17447379)
chr6 (131-356)||(19450449-19450674)
chr6 (131-356)||(19448455-19448680)
chr6 (404-465)||(25725827-25725888)
chr6 (164-370)||(13137905-13138111)
chr6 (19-76)||(17062643-17062700)
chr6 (380-449)||(6156933-6157002)
chr6 (274-418)||(19874398-19874542)
chr6 (19-97)||(19448355-19448433)
chr6 (19-97)||(19450349-19450427)
chr6 (58-95)||(17447440-17447477)
chr6 (378-463)||(19469237-19469322)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (19-465)||(20874582-20875023)
chr1 (19-465)||(22017590-22018027)
chr1 (19-448)||(7690845-7691274)
chr1 (19-449)||(35639412-35639842)
chr1 (19-449)||(47609309-47609739)
chr1 (19-449)||(4176320-4176750)
chr1 (19-449)||(12615696-12616126)
chr1 (19-449)||(36237803-36238233)
chr1 (19-449)||(38104103-38104533)
chr1 (19-449)||(12739546-12739976)
chr1 (19-449)||(19186223-19186653)
chr1 (19-449)||(21876166-21876596)
chr1 (19-449)||(51630565-51630995)
chr1 (19-445)||(3180619-3181045)
chr1 (19-445)||(5842222-5842648)
chr1 (19-449)||(5641083-5641520)
chr1 (19-449)||(7516292-7516732)
chr1 (164-449)||(38093622-38093907)
chr1 (131-466)||(25449635-25449971)
chr1 (134-466)||(23023250-23023582)
chr1 (131-466)||(21196071-21196406)
chr1 (131-466)||(21125742-21126077)
chr1 (131-466)||(21207191-21207526)
chr1 (19-331)||(18613443-18613746)
chr1 (131-463)||(20943138-20943467)
chr1 (228-466)||(22431342-22431580)
chr1 (131-263)||(17720251-17720383)
chr1 (225-465)||(9345251-9345488)
chr1 (131-232)||(22444931-22445032)
chr1 (131-232)||(22450165-22450266)
chr1 (25-99)||(17720157-17720231)
chr1 (34-95)||(23023159-23023220)
chr1 (19-99)||(22445055-22445135)
chr1 (19-99)||(22450289-22450369)
chr1 (25-99)||(21196426-21196500)
chr1 (34-99)||(20943053-20943118)
chr1 (19-95)||(25449998-25450074)
chr1 (56-104)||(27857100-27857148)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (19-465)||(31563-32000)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (19-465)||(738-1175)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (19-449)||(44561-44982)
scaffold0017 (19-449)||(54864-55285)
scaffold0017 (351-440)||(9459-9548)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (34-465)||(2648-3071)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (19-449)||(38329-38759)
[»] scaffold0925 (1 HSPs)
scaffold0925 (25-449)||(3601-4016)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (19-465)||(166060-166497)
scaffold0011 (131-292)||(66948-67109)
scaffold0011 (359-466)||(66810-66917)
scaffold0011 (58-98)||(67133-67173)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (131-465)||(7-341)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (132-449)||(45129-45446)
scaffold0022 (131-466)||(157516-157851)
scaffold0022 (25-466)||(35717-36149)
scaffold0022 (25-466)||(133777-134209)
scaffold0022 (19-95)||(45518-45594)
scaffold0022 (19-99)||(157416-157496)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (19-272)||(3060-3304)
scaffold0012 (340-465)||(11688-11813)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (19-356)||(1157-1485)
scaffold0211 (208-465)||(904-1159)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (226-465)||(2369-2609)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (19-229)||(1-202)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (178-449)||(53109-53380)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (22-465)||(27043-27477)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (25-466)||(209687-210118)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (137-460)||(1590-1913)
scaffold0498 (19-97)||(1944-2022)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (34-466)||(110993-111416)
[»] scaffold0161 (4 HSPs)
scaffold0161 (131-449)||(11480-11798)
scaffold0161 (131-449)||(16153-16471)
scaffold0161 (19-97)||(11823-11901)
scaffold0161 (19-97)||(16496-16574)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (131-466)||(7046-7380)
scaffold0315 (25-99)||(6953-7027)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (235-466)||(22330-22561)
scaffold0116 (131-238)||(25711-25818)
scaffold0116 (19-99)||(25841-25920)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (131-466)||(47695-48029)
scaffold0084 (19-99)||(47592-47672)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (130-413)||(75641-75925)
scaffold0037 (34-99)||(75554-75619)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (19-353)||(7191-7516)
[»] scaffold0389 (2 HSPs)
scaffold0389 (131-273)||(12331-12473)
scaffold0389 (56-99)||(12268-12311)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (19-252)||(43323-43547)
scaffold0083 (376-466)||(43219-43309)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (284-466)||(1734-1916)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (19-93)||(12458-12532)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (19-263)||(2514-2749)
scaffold0317 (379-466)||(11243-11330)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (19-83)||(114046-114110)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (223-370)||(2823-2970)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (359-466)||(17669-17776)
scaffold0217 (18-99)||(14548-14629)
scaffold0217 (179-263)||(17546-17630)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (400-466)||(235-301)
scaffold0439 (400-466)||(8095-8161)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (19-99)||(3892-3972)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (222-392)||(3180-3350)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (400-466)||(98960-99026)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (131-172)||(20150-20191)


Alignment Details
Target: scaffold0068 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9569 - 9122
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9569 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttag 9470  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9469 aagatttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 9370  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9369 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 9270  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9269 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 9170  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9169 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 21704341 - 21704788
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21704341 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttag 21704440  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704441 aagatttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 21704540  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21704541 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 21704640  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704641 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 21704740  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21704741 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 21704788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23394293 - 23393846
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23394293 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttag 23394194  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  23394193 aagattttgaagactttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagggaact 23394094  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394093 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 23393994  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393993 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 23393894  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23393893 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 23393846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 17455690 - 17456137
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17455690 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 17455789  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17455790 aagatttagaagactttcctttagatggtagagaaatagatttactccttttagaggactcatgttcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 17455889  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  17455890 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttcttagaattttgcta 17455989  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17455990 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 17456089  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17456090 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 17456137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 24981787 - 24982234
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24981787 tcaagcttgttggacaacatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttag 24981886  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  24981887 aagatttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaact 24981986  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24981987 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 24982086  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24982087 acatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttca 24982186  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  24982187 ttttgaacagctcatactgatgaactagcatcagggcctttgcttctc 24982234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 34053844 - 34053397
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34053844 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttag 34053745  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  34053744 aagatttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagagaact 34053645  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34053644 gacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccgtctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 34053545  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34053544 acatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaggtttggaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 34053445  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34053444 tttagaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 34053397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20553699 - 20553252
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  20553699 tcaagtttgttggacagcatagccatcttcacatattgatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggcttggtaggctttgg 20553600  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20553599 aagattttgaagattttcctttagatggtagagcaatagatttactctttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 20553500  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20553499 aacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctgagaatcttgcta 20553400  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20553399 acatgatcaaaagtaacatagctcttcttcagtatttgtagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 20553300  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20553299 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 20553252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 13532254 - 13532691
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13532254 tcaagcttgttagatagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 13532353  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13532354 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgcttattcagacccatttcatgtatcttgagggaact 13532444  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  13532445 gacaagatcctcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatgacagttactttgggtctccatttagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 13532544  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13532545 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 13532644  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  13532645 tcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgcctttgcttct 13532691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19465856 - 19465426
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19465856 tcaagcttgttagatagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagattcactggatttgtaagctttgg 19465757  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19465756 aagatttggaagattttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcaccttgagggaact 19465657  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  19465656 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggtaaacttctcagaatcttgctt 19465557  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19465556 acatgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgcaatctagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 19465457  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  19465456 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 19465426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 23486880 - 23487317
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23486880 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttag 23486979  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  23486980 atga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttctttgaggattcatgctcattcagacccatttcatgaactttgatggaact 23487070  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  23487071 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactc 23487170  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23487171 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 23487270  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||    
T  23487271 tcttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgccttttcttct 23487317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 43620271 - 43620701
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  43620271 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacatattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttag 43620370  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  43620371 aagattttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaact 43620470  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43620471 aacaggatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcgatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttacta 43620570  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43620571 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatctagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 43620670  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  43620671 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 43620701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 5299519 - 5299949
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5299519 tcaagcttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 5299618  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  5299619 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 5299718  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5299719 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 5299818  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5299819 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 5299918  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5299919 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 5299949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 14455989 - 14456419
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14455989 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttgg 14456088  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  14456089 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatagatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 14456188  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  14456189 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 14456288  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14456289 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 14456388  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14456389 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 14456419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34773793 - 34773363
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34773793 tcaagcttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 34773694  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  34773693 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 34773594  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34773593 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 34773494  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34773493 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 34773394  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  34773393 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 34773363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 39354380 - 39353950
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39354380 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 39354281  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  39354280 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 39354181  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39354180 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 39354081  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39354080 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 39353981  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  39353980 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 39353950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9337838 - 9337408
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9337838 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 9337739  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  9337738 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 9337639  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9337638 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 9337539  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9337538 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 9337439  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9337438 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 9337408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23698664 - 23698234
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23698664 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 23698565  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  23698564 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 23698465  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23698464 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 23698365  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23698364 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 23698265  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23698264 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 23698234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27621149 - 27621579
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27621149 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27621248  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  27621249 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 27621348  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27621349 aacaagatcttcaacacttaacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaagacaagcttctcaaaatcttacta 27621448  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27621449 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 27621548  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27621549 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27621579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31835364 - 31834934
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31835364 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 31835265  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  31835264 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 31835165  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31835164 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 31835065  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31835064 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 31834965  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  31834964 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 31834934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 37738944 - 37739374
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37738944 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 37739043  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  37739044 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 37739143  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  37739144 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 37739243  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  37739244 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 37739343  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  37739344 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 37739374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 40392242 - 40391812
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40392242 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 40392143  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  40392142 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 40392043  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40392042 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 40391943  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40391942 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 40391843  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  40391842 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 40391812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6977690 - 6977260
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6977690 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 6977591  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  6977590 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 6977491  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6977490 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 6977391  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  6977390 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 6977291  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  6977290 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 6977260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22678000 - 22677570
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22678000 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 22677901  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  22677900 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 22677801  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22677800 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 22677701  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  22677700 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 22677601  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22677600 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 22677570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23298161 - 23297731
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23298161 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 23298062  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  23298061 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 23297962  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23297961 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 23297862  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23297861 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 23297762  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23297761 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 23297731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24809800 - 24809370
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24809800 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 24809701  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||    
T  24809700 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttaagtgagct 24809601  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  24809600 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 24809501  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24809500 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 24809401  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24809400 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 24809370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 30236403 - 30236833
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30236403 tcaagcttgttggacaacatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 30236502  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  30236503 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 30236602  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30236603 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 30236702  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30236703 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 30236802  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  30236803 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 30236833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 36591494 - 36591924
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36591494 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 36591593  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  36591594 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 36591693  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36591694 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 36591793  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36591794 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 36591893  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  36591894 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 36591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 39499864 - 39500294
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39499864 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 39499963  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  39499964 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 39500063  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39500064 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 39500163  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  39500164 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 39500263  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  39500264 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 39500294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42044664 - 42044234
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42044664 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 42044565  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  42044564 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 42044465  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42044464 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 42044365  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42044364 atatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 42044265  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  42044264 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 42044234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 1120279 - 1120709
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1120279 tcaagcttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 1120378  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     |||||| |||  |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  1120379 cagattttgaagtctttcctttaaatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 1120478  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1120479 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagacccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 1120578  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1120579 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 1120678  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  1120679 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 1120709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14031926 - 14031496
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14031926 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 14031827  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  14031826 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 14031727  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14031726 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 14031627  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14031626 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 14031527  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  14031526 ttctgaaaagttcatactaatgaactagcat 14031496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 14567030 - 14567460
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14567030 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 14567129  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  14567130 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 14567229  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14567230 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 14567329  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14567330 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 14567429  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14567430 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 14567460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15741853 - 15741423
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15741853 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 15741754  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  15741753 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 15741654  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15741653 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 15741554  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15741553 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 15741454  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15741453 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 15741423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17608946 - 17608516
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17608946 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 17608847  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  17608846 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 17608747  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17608746 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 17608647  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17608646 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 17608547  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17608546 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 17608516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17720802 - 17720372
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17720802 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 17720703  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  17720702 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 17720603  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17720602 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 17720503  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17720502 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 17720403  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17720402 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 17720372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22148400 - 22147970
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22148400 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 22148301  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  22148300 aagattttgagatttttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 22148201  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22148200 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 22148101  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22148100 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccaaaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 22148001  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22148000 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 22147970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24568972 - 24568542
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24568972 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 24568873  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  24568872 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 24568773  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24568772 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 24568673  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24568672 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 24568573  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24568572 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 24568542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27051214 - 27051644
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27051214 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27051313  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  27051314 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 27051413  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27051414 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 27051513  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27051514 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 27051613  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27051614 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27051644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31420549 - 31420119
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  31420549 tcaagtttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttag 31420450  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  31420449 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagagaattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 31420350  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31420349 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 31420250  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  31420249 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatcaagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 31420150  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  31420149 ttctgaatagttcatactgatgaactagcat 31420119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36689582 - 36689152
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36689582 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 36689483  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  36689482 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 36689383  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36689382 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 36689283  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36689282 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 36689183  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  36689182 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 36689152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11209870 - 11209432
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |    
T  11209870 tcaagcttgttagaaagcatggccatctttacagactgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttctacagattcactagtcttgtatgctttag 11209771  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |     |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11209770 a-----tgg----ctttcctttatatggtagagcaatagatttactcttctttgaggacttatgctcatttaggctcatttcatgaaccttgagagaact 11209680  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||     
T  11209679 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatattttgctc 11209580  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11209579 acatgatcagaagcaacatagctcttctttagtatttgcagtctagatactaaagtttgaaatcttgagcacatctcttctatactctcatcatccttca 11209480  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  11209479 tcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttctc 11209432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 16002273 - 16002703
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16002273 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatctttatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 16002372  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  16002373 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 16002472  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  16002473 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagtttctcaaaatcttacta 16002572  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16002573 acatgatcagaagcaacatagtttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 16002672  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  16002673 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 16002703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27462046 - 27461616
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27462046 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27461947  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  27461946 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttggaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 27461847  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27461846 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 27461747  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27461746 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 27461647  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27461646 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27461616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31350418 - 31349988
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  31350418 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggctttgg 31350319  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  31350318 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 31350219  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31350218 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 31350119  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31350118 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 31350019  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  31350018 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 31349988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 35217387 - 35216961
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35217387 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 35217288  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  35217287 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 35217188  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35217187 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 35217088  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35217087 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 35216988  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggacta 445  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||    
T  35216987 ttctgaaaagttcatactgatgaacta 35216961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23363980 - 23363580
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23363980 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 23363881  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  23363880 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 23363781  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23363780 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 23363681  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23363680 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 23363581  T
Q  419 t 419  Q
    |    
T  23363580 t 23363580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 24825852 - 24826282
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24825852 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 24825951  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || |     
T  24825952 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagcg 24826051  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24826052 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 24826151  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  24826152 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttattctatactctcatcatccttca 24826251  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24826252 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 24826282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 25113773 - 25113336
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |    
T  25113773 tcaagcttgttggaaagcatgaccatctttatagattgatcttcatcagaatctccgtctggagattctgcttcagattcactagccttgtatgatttag 25113674  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |     |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25113673 a-----tgg----ctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaact 25113583  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  25113582 gacaagatattcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctc 25113483  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25113482 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgtagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttca 25113383  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  25113382 ttttgaacagctcatactgatgaactagcataagtacctttgcttct 25113336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 25172864 - 25172427
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |    
T  25172864 tcaagcttgttggaaagcatgaccatctttatagattgatcttcatcagaatctccgtctggagattctgcttcagattcactagccttgtatgatttag 25172765  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |     |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25172764 a-----tgg----ctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaact 25172674  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  25172673 gacaagatattcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctc 25172574  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25172573 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgtagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttca 25172474  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  25172473 ttttgaacagctcatactgatgaactagcataagtacctttgcttct 25172427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 26763737 - 26764173
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    ||| ||||          
T  26763737 tcaagcttgtttgagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattc-cacaactt-taag------ 26763828  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  |    
T  26763829 -agcttttgatgacttcccttttgatggaagagcaat-gaattacttttcttagaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagtt 26763926  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||     
T  26763927 gacaagatccttaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaagcttctaagtatcttgctc 26764026  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||    
T  26764027 acatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttaaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatgctttcatcatctttca 26764126  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  26764127 ttttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagtctttgcttct 26764173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21200769 - 21200466
Alignment:
Q  136 cctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacac 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || || || ||  |||||||||||| |||||    
T  21200769 cctttagatggtagagcaattgatttactcttcttagaaggctcatgttcatttagacttatctcatgaactttaagagagttgacaagatctttaacac 21200670  T
Q  236 ttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaac 335  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||   || ||||| || |||||||||||||  ||    
T  21200669 ttaaagtgtttagatgtttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggtaagctttatagtatcttgctcacatgatcagaagctac 21200570  T
Q  336 atagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatac 435  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| | | ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  21200569 atagcttttcttcagtatttgaagtctagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgttcaatactttcatcatatttcattttgaacaactcatac 21200470  T
Q  436 tgat 439  Q
    ||||    
T  21200469 tgat 21200466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 26782700 - 26783138
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  26782700 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 26782799  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||  | ||||| |||||  | | ||| || ||||| || ||    
T  26782800 atga---------cttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagcaggctccagttcattaagacttgtcttatgaactttgagagagct 26782890  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||  |||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||     
T  26782891 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttccaaaataacagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctc 26782990  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaa-tttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttc 417  Q
    || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||    
T  26782991 acttgatcagaggctacatagcttttcattagtatttgaagtccag-tacttagagtttgaaatcttgagtaaatttgctcaatactttcatcatctttc 26783089  T
Q  418 attttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  26783090 attttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 26783138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 300 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31144905 - 31144738
Alignment:
Q  300 gcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctct 399  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||  ||| | || |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||     
T  31144905 gcttctgagtatcttgctcacatgatcagaagctacagaacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttgctca 31144806  T
Q  400 atactctcatcatccttcattttgaacagctc-atactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  31144805 atactttcatcatctttcattttgaacagctcaatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 31144738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21200877 - 21200797
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| | | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21200877 tcaagcttgttggagagcatagccatcttatcagtagggtcttcattataatctccatcaggtgattcttcttcagattca 21200797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13263434 - 13262987
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13263434 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcataatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 13263335  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13263334 aagatttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggattt 13263235  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13263234 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 13263135  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13263134 acatgatcagaagtaacatagctcttctttagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 13263035  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13263034 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagagcctttacttctc 13262987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8997712 - 8997266
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8997712 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttga 8997613  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8997612 aagacttagaagactttcctttagatggtagagcaatagatttattcttcttagaggattcatgctcattaagactcatttcatgtaccttgagggaact 8997513  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8997512 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 8997413  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8997412 acatgatcagaagcaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctgctctatactctcatcatccttca 8997313  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  8997312 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattaatgcctttgcttct 8997266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14313173 - 14312727
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14313173 tcaagtttattagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcttgtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttgg 14313074  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14313073 aagatttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgtatcttgagggaact 14312974  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14312973 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaattttgcta 14312874  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14312873 acatgatcagaagtaacatagctattcttcagtatttgcagtctagatactaaagtttgaaatcttgattacatctcctctatactctcatcatccttca 14312774  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14312773 tcttcaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 14312727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9382425 - 9381978
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9382425 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttag 9382326  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  9382325 aagatttggaggacttccctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgaggaaact 9382226  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382225 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 9382126  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382125 acatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 9382026  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9382025 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 9381978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11207850 - 11207409
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11207850 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatt 11207751  T
Q  125 tggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaag 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11207750 tggaagactttcctttagatggtagaacaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagggaactgacaag 11207651  T
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11207650 atcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 11207551  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11207550 ttagaagtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 11207451  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  11207450 acagctcatactgatgacctagcattagggcttttgcttctc 11207409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 4432236 - 4432680
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4432236 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 4432335  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4432336 aagatttagaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 4432435  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  4432436 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttctcagaattttgcta 4432535  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  4432536 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacat---ctctatactctcatcatccttca 4432632  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4432633 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 4432680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 1062620 - 1063057
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1062620 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagattctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 1062719  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1062720 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcatactcatttcatgtaccttgagggaact 1062810  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1062811 gacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 1062910  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    || |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1062911 acgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttaagtacatctcctctatactctcatcatccttca 1063010  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1063011 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 1063057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29935315 - 29934878
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29935315 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcattggccttgtaagctttgg 29935216  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29935215 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 29935125  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29935124 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 29935025  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29935024 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactcaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 29934925  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29934924 tcttcaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 29934878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29984469 - 29984032
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29984469 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcattggccttgtaagctttgg 29984370  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29984369 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 29984279  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29984278 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 29984179  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29984178 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactcaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 29984079  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29984078 tcttcaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 29984032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 113 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1785744 - 1785391
Alignment:
Q  113 ctttggaagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgag 212  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1785744 ctttggaagatttagaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgag 1785645  T
Q  213 ggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1785644 ggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatc 1785545  T
Q  313 ttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1785544 ttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcat 1785445  T
Q  413 ccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1785444 ccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 1785391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15652861 - 15652424
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15652861 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcaggatctccatttggtgactcttcttcagattcactagccttgtaagctttgg 15652762  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652761 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 15652671  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  15652670 gataagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggtagttactttgggtctccatctagaaggaaaacttctcagaatcttgctt 15652571  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
     | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652570 tcgtgatcagaagcaacataactcttcttgagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 15652471  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15652470 tcttgaacaactcatactgatgaactagcattagtgccttagcttct 15652424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 17016260 - 17016681
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016260 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgaatcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 17016359  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17016360 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctactcttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgaactctgagggaact 17016450  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||     
T  17016451 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggaaagcttctcaaaatctagctc 17016550  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016551 acatgatcagaagcaacataactcttcttcaatagttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 17016650  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17016651 tcttgaacagctcatactgatgaactagcat 17016681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7796382 - 7795952
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  7796382 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagattctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggcttttg 7796283  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  7796282 aagattttgaagattttcctttagatggtagagcaatagatttactcttgttagaggtctcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaact 7796183  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7796182 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttcttaaaatcttacta 7796083  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  7796082 acatgatcagaaccaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcttatcatccttca 7795983  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7795982 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 7795952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20674958 - 20674528
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20674958 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 20674859  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20674858 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaact 20674759  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20674758 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 20674659  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20674658 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 20674559  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20674558 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 20674528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5538782 - 5538352
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5538782 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 5538683  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  5538682 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 5538583  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5538582 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 5538483  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5538482 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 5538383  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5538382 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 5538352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6183727 - 6183297
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6183727 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 6183628  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  6183627 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 6183528  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6183527 aacaagatcttcaacacttaaagtatttaaatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 6183428  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6183427 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 6183328  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  6183327 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 6183297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11274146 - 11273716
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11274146 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 11274047  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  11274046 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 11273947  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  11273946 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 11273847  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11273846 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 11273747  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  11273746 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 11273716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 39381160 - 39381590
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39381160 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 39381259  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  39381260 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 39381359  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39381360 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 39381459  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39381460 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 39381559  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  39381560 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 39381590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 446
Target Start/End: Original strand, 19787498 - 19787925
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19787498 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 19787597  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  19787598 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 19787697  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19787698 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 19787797  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19787798 acatgatcagaaacaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 19787897  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactag 446  Q
    || |||| || ||||||||||| |||||    
T  19787898 ttctgaaaagttcatactgatgaactag 19787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5581394 - 5580964
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5581394 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 5581295  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  5581294 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 5581195  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5581194 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 5581095  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  5581094 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatatcttctatactctcatcatctttca 5580995  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5580994 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 5580964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 13130746 - 13131176
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13130746 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 13130845  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  13130846 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 13130945  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13130946 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttccttaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 13131045  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13131046 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 13131145  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  13131146 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 13131176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 14474697 - 14475127
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14474697 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 14474796  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  14474797 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 14474896  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14474897 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 14474996  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  14474997 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatcctcca 14475096  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14475097 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 14475127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16392809 - 16392379
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16392809 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 16392710  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  16392709 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 16392610  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16392609 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 16392510  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16392509 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 16392410  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  16392409 ttctgaaaagttcatactaatgaactagcat 16392379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 37875537 - 37875967
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37875537 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 37875636  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||| || ||    
T  37875637 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgccctttgagtgagct 37875736  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37875737 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggcaaacttctcaaaatcttacta 37875836  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  37875837 acatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcccatcatccttca 37875936  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  37875937 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 37875967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 37884055 - 37884485
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37884055 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 37884154  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||| || ||    
T  37884155 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgccctttgagtgagct 37884254  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37884255 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggcaaacttctcaaaatcttacta 37884354  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  37884355 acatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcccatcatccttca 37884454  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  37884455 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 37884485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 38203728 - 38204158
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38203728 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 38203827  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  38203828 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 38203927  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  38203928 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 38204027  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38204028 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 38204127  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  38204128 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 38204158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 4752795 - 4753225
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4752795 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 4752894  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  4752895 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 4752994  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4752995 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 4753094  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4753095 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 4753194  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  4753195 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 4753225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 5519344 - 5519774
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5519344 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 5519443  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  5519444 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 5519543  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5519544 aacaagatcttcaacacttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 5519643  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5519644 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 5519743  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5519744 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 5519774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 445
Target Start/End: Original strand, 8783739 - 8784165
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8783739 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 8783838  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  8783839 aagactttgaggtccttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 8783938  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  8783939 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 8784038  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8784039 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 8784138  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggacta 445  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||    
T  8784139 ttctgaaaagttcatactgatgaacta 8784165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9983649 - 9983219
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  9983649 tcaagtttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttag 9983550  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  9983549 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 9983450  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9983449 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcattagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 9983350  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  9983349 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 9983250  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9983249 ttctgaatagttcatactgatgaactagcat 9983219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10628709 - 10628279
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  10628709 tcaagtttgttggacaacatagccatcttcatagactgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggcttttg 10628610  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  10628609 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 10628510  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  10628509 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactg 10628410  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  10628409 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 10628310  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| || |||||    
T  10628309 ttctgaatagttcatactgatgaacaagcat 10628279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13374429 - 13373999
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13374429 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 13374330  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  13374329 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 13374230  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  13374229 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatctttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgagggtaagcttctcaaaatcttacta 13374130  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13374129 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 13374030  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  13374029 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 13373999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13385023 - 13384593
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13385023 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 13384924  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  13384923 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 13384824  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  13384823 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatctttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgagggtaagcttctcaaaatcttacta 13384724  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13384723 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 13384624  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  13384623 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 13384593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 23766370 - 23766800
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23766370 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcattagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 23766469  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  23766470 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcgatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 23766569  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23766570 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 23766669  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23766670 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 23766769  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23766770 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 23766800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24385279 - 24384849
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24385279 tcaagtttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 24385180  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  24385179 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcaagctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 24385080  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24385079 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 24384980  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24384979 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 24384880  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24384879 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 24384849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 24668946 - 24669376
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24668946 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 24669045  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  24669046 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 24669145  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24669146 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 24669245  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24669246 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 24669345  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24669346 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 24669376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28315999 - 28315569
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28315999 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttctacagattcactggctttgtaggctttgg 28315900  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  28315899 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 28315800  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  28315799 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 28315700  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28315699 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 28315600  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  28315599 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 28315569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 505931 - 505501
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  505931 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 505832  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || || || || ||    
T  505831 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttaagtgagct 505732  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  505731 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 505632  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  505631 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 505532  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  505531 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 505501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5867457 - 5867027
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  5867457 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttga 5867358  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  5867357 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 5867258  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5867257 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 5867158  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5867157 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 5867058  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5867057 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 5867027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6492107 - 6491677
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  6492107 tcaagtttgttggacaacatagccatcttcacagactgatcttcgtcagactctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttag 6492008  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  6492007 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 6491908  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6491907 aacaagatcctcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 6491808  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  6491807 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 6491708  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  6491707 ttctgaatagttcatactgatgaactagcat 6491677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12239379 - 12238949
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |    
T  12239379 tcaagtttgttggacaacatagccatcttcacagactgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcatcttcagattcactagctttataggctttag 12239280  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||  | ||    
T  12239279 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatatactttgagtaagct 12239180  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12239179 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 12239080  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  12239079 acatgatcagaagcaacatagcttttattcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 12238980  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12238979 ttctgaatagttcatactgatgaactagcat 12238949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 41692725 - 41693155
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41692725 tcaagcttgttggacagcatagccatcttttcagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 41692824  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  41692825 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 41692924  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41692925 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 41693024  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41693025 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 41693124  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  41693125 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 41693155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12288741 - 12288311
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  12288741 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttag 12288642  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  12288641 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcgtttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 12288542  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12288541 aacaagatcctcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 12288442  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  12288441 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 12288342  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12288341 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 12288311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16397781 - 16397351
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |    
T  16397781 tcaagtttgttggacaacatagccatctttatagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtagactttag 16397682  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  16397681 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 16397582  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16397581 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaagttaagcttctcaaaatcttacta 16397482  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16397481 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 16397382  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  16397381 ttctgaatagttcatactaatgaactagcat 16397351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 12754537 - 12754100
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  12754537 tcaagcttgttggaaagcatggccatctttatagattgattttcatcagaatctccttctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttag 12754438  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |     |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  12754437 a-----tgg----ctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaatt 12754347  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||     
T  12754346 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggaaagcttctcaatatctggctc 12754247  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12754246 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttaagtacatctcttctatactctcaccatccttca 12754147  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  12754146 tcttgaatagctcatactgatgaactagcataagtgtctttgcttct 12754100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 137 - 465
Target Start/End: Original strand, 15847488 - 15847816
Alignment:
Q  137 ctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15847488 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctatgaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaacttacaagatcttcaacact 15847587  T
Q  237 taaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15847588 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaaacttctcaaaatcttgctcacatgatcagaagcaaca 15847687  T
Q  337 tagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatact 436  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847688 taactcttcttcagtatttgcattccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatact 15847787  T
Q  437 gatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15847788 gatgaactagcataagtgcctttgcttct 15847816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 69 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29462929 - 29462549
Alignment:
Q  69 atctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttc 168  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29462929 atcttcatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttc 29462830  T
Q  169 ttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatgg 268  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  29462829 ttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatag 29462730  T
Q  269 cagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatac 368  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  29462729 cagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcatactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaac 29462630  T
Q  369 taaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  29462629 tagagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcat 29462549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 131 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14908450 - 14908116
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  14908450 acttccctttagatggtagagcaattgatttactcttcttagcagaatcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 14908351  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  14908350 aacacttaaagtgttaaaatctttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaa 14908251  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||| ||    
T  14908250 gctacatagcttttcttaagtatttgaagtccagaaactagagtatgaaatcttgagtacatttcctcaatacttccatcatctttcattttgaacaact 14908151  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    || ||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  14908150 cacactgatgaacaagcataagagcttttgcttct 14908116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14079093 - 14078757
Alignment:
Q  130 aactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || | ||||||||    
T  14079093 aactttcctttagatggtagagcaatagatttagtcttcttagcagaatcatgctcattaagactaatcttatgaaccttgagagagctcataagatctt 14078994  T
Q  230 caacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcaga 329  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  14078993 caacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaataacagtaactgtaggtctccatctagaaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcaga 14078894  T
Q  330 agtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagc 429  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  14078893 agctacatagcttttcttcaatatttgaagtccaaagactagagtttgaaatcttgagtacattacctcaatactttcatcttctttcatcttgaacaac 14078794  T
Q  430 tcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||| ||| || ||||| | ||| ||||| ||||    
T  14078793 tcatactaatgaacaagcatgatagcgtttgcctctc 14078757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 16029291 - 16029726
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  | ||  ||||         
T  16029291 tcaagcttgttggagagcatagccatcttcttagttggatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagattcaataacttt--aagc----- 16029383  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
      | ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||||| ||||| |  ||||| | |||||| || ||    
T  16029384 --gcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagcaggttcatgttcatttagacttacctcatgaatcttgagagagct 16029481  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||     
T  16029482 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcatcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcatgcaagcttcttagtatcttcctc 16029581  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   ||||    
T  16029582 acatgatcagaagcaacatagcttattttcagtatttgtagtctagagactaaggtttgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatca---ttca 16029678  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | || |||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  16029679 tcttcaacaactcatactgatgaacaagcacgagagcctttgcttctc 16029726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18123531 - 18123093
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  | ||   |||||| |    
T  18123531 tcaagcttgttggaaagcataaccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcagatgattcttcttcagattcaataactttaagagcttttg 18123432  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  |    
T  18123431 atga---------cttcccttttgatggtagagcaatagatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagtt 18123341  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||     
T  18123340 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctc 18123241  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    | |||||||||    ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| | ||| ||| | ||||| || ||||    
T  18123240 agatgatcagagactacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtttgaaatctttagtacatttgctcaatattttcatcgtctttca 18123141  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  18123140 ttttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 18123093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17245065 - 17244627
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||           | ||||      
T  17245065 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccattaggtgattcttctttagattcaac---------aactttaa 17244975  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||    
T  17244974 gagtttttgatgacttccctttagatggtagaacaataaatttactcttcttagcaggctcatgttcattaagacttatctcatgaacttttagagagct 17244875  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| || || | ||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| ||     
T  17244874 tacaagatcttcaacacgtaaagtgtttaaatctttagcttcctcaataacagtaacctttgttctccatcttgcaggtaagcttcttactatcttgctc 17244775  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || |    
T  17244774 acatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttaa 17244675  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  17244674 ttttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 17244627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Original strand, 11188379 - 11188714
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||  ||||| | ||| || ||||  || ||||| || ||  ||||||||||    
T  11188379 acttccctttagatggtagagcaatgaatttactcttcttagaaggttcatattcattaaaacttatctcataaactttgagagagctatcaagatcttc 11188478  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||  |||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  11188479 aacatttgaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttaaaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaa 11188578  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  11188579 gcaacatagcttttcttcagtatttgatgtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 11188678  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||    
T  11188679 catactgatgaacaagcataagaggttttgcttctc 11188714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 306 - 466
Target Start/End: Original strand, 47541550 - 47541709
Alignment:
Q  306 cagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactc 405  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47541550 cagaattttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtcc-gatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactc 47541648  T
Q  406 tcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  47541649 tcatcatccttcatcttgaacagcacaaactgatgaactagcattagggaatttgcttctc 47541709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 2559475 - 2559905
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           | ||||      
T  2559475 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttcttagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaac---------aactttaa 2559565  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  |    
T  2559566 gagtttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatgaatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagtt 2559665  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||     
T  2559666 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcattagcttcctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctc 2559765  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||  |||||||       | | ||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  2559766 acatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttaaagtccag-------agtatgaaatcttgagtgcatttgctcaatact-tcatcatctttca 2559857  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  2559858 ttttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgtttctc 2559905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19886857 - 19886524
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  19886857 acttccctttagatggtagagcaata--tttactcttcttagcatactcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaatatcttc 19886760  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||| |||||| || ||||| || || |||| || ||| | ||| ||| |||| || ||||| || |||||||||||     
T  19886759 aacacttgaagtgtttaaatctctaggttcctcaatagcagtaaccttcggtcgccgtcttgcaggtaagtttcttagtatcttgctcacatgatcagag 19886660  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||    
T  19886659 gctacatagcttttcttcagtatttgaagtccaaaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcttcatctttcattttgaacaact 19886560  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  19886559 catactgatgaacaagcataagagcttttggttctc 19886524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 53058428 - 53058161
Alignment:
Q  199 tcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggca 298  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||| |    
T  53058428 tcatgaactttgagagagctgacaagattttcaacactcaaagtttttaaatctttagcttcctcaatagcagttacctttggtctccatcttgcaggta 53058329  T
Q  299 agcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctc 398  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| | |||    
T  53058328 agcttctaagtatcttactcacatgatcagaggctacataacttttcttcagtatttgaagtccaaaaactagagtctgaaatctttagtacatttgctc 53058229  T
Q  399 tatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||  ||||||||||    
T  53058228 aatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaataagcataagagtttttgcttctc 53058161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18696637 - 18696336
Alignment:
Q  165 cttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctct 264  Q
    ||||||||  || ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||| || || |  | || ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||     
T  18696637 cttcttagctgaatcatgctcattaaaactaatctcatgaaccttgagagagcttatgaaatattcaacactcagagtgtttaaattcttagcttcctca 18696538  T
Q  265 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccag 364  Q
    || | ||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||||     
T  18696537 atagtagtaactttaagtctccatctagtaggtaagcttcttagaatcttgcttacatgatcagaagctacatcacttttcttcagtatttgaagtccat 18696438  T
Q  365 atactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttc 464  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||  |||| || || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  18696437 agactaaagtctgaaatcttgagtacatagcctcaattctttcatcatctttcatcttaaacaactcatactgatgaacaagcattgtagcttttgcttc 18696338  T
Q  465 tc 466  Q
    ||    
T  18696337 tc 18696336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 310 - 466
Target Start/End: Original strand, 21639404 - 21639560
Alignment:
Q  310 atcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcat 409  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  21639404 atcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcat 21639503  T
Q  410 catccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21639504 catctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagcctttgcttctc 21639560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 253 - 459
Target Start/End: Original strand, 14952688 - 14952894
Alignment:
Q  253 ttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagta 352  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||  ||| |||||||| || |||||  | ||||||||| |||  | |||||| ||||| | ||    
T  14952688 ttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctaacaggtaagcttctaagtatcttgttcacatgatcaaaagctaaatagcttttctttaata 14952787  T
Q  353 tttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattag 452  Q
    |||  |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  14952788 tttaaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaatagctcatactgatgaacaagcataag 14952887  T
Q  453 agccttt 459  Q
    |||||||    
T  14952888 agccttt 14952894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 116
Target Start/End: Original strand, 15847409 - 15847491
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagcttt 116  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15847409 agcatggccatctttatagattgatcttcatcagaatctccgtctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgcttt 15847491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 348
Target Start/End: Original strand, 5211129 - 5211278
Alignment:
Q  199 tcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggca 298  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || |||||| |||||| ||| |    
T  5211129 tcatgaactttgagagagctgacaagatcctcagcacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctctatctagcaggta 5211228  T
Q  299 agcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttc 348  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  5211229 agcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttc 5211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 466
Target Start/End: Original strand, 11221380 - 11221512
Alignment:
Q  334 acatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcat 433  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11221380 acatagtttttctttagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcat 11221479  T
Q  434 actgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  11221480 actgatgaacaagtataagagcttttgcttctc 11221512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 5211016 - 5211095
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattc 98  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5211016 tcaagcttgtttgagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattc 5211095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14908550 - 14908470
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||  || | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14908550 tcaagcttgttggagagcattgccatcttcttagtaggatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattca 14908470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16306700 - 16306516
Alignment:
Q  208 ttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctca 307  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || |||||  | || ||||||||  ||| | | ||||| || |    
T  16306700 ttgagagagctgataagatcttcaacacttatagtacttagatccttagcttcctcaatagcagtctccttaggtctccacttagcaagtaagctcctta 16306601  T
Q  308 gaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacat 392  Q
     ||||||  | ||||||||| |||  |||||| | |||||||| || || |||||| | |||| | | ||||| |||||||||||    
T  16306600 taatcttgttcacatgatcataagctacatagtttttcttcagaatctgaagtccaaagactagagtctgaaaccttgagtacat 16306516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 11188276 - 11188356
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || ||||| | |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  11188276 tcaagcttgttggaaagcatggtcatcctctcagtaggatcttcttcagaatcttcatcatgtgattcttcttcagattca 11188356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 16745478 - 16745925
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16745478 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttgg 16745577  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745578 aagatttataagactttcctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 16745677  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745678 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 16745777  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745778 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccaaatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 16745877  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16745878 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 16745925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 3842015 - 3842452
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3842015 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 3842114  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3842115 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 3842205  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3842206 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 3842305  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3842306 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 3842405  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3842406 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 3842452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22149392 - 22148955
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22149392 tcaagcttgttagacaacatagccatcttcacagattgatcttcattagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggtcttgtaagctttgg 22149293  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22149292 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatatattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 22149202  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22149201 gacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatccttagcttccacaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 22149102  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22149101 acatgatcagaagcaacataactcttctttagtatttccagtccagacactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 22149002  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22149001 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 22148955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 23791718 - 23792155
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23791718 tcaagcttgttagacaacatagtcatctttacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagcattgg 23791817  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23791818 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 23791908  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23791909 gacaagatcctcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatgacaagtactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 23792008  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23792009 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtacagatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 23792108  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  23792109 tcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgcctttgcttct 23792155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 19 - 451
Target Start/End: Original strand, 19233855 - 19234287
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  19233855 tcaagcttgttggatagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttag 19233954  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  19233955 aagattttgatgactttcctttagatggtaaagcaatggatctactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaact 19234054  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19234055 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttacta 19234154  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19234155 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 19234254  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcatta 451  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  19234255 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcatta 19234287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 19427399 - 19427829
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  19427399 tcaagcttgttggatagcatagccatcttcatagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcattggctttgtaggctttgg 19427498  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  19427499 aagatcttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaact 19427598  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19427599 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttacta 19427698  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19427699 acatgatcagaagcaacatatcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 19427798  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  19427799 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 19427829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 19137757 - 19138187
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19137757 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 19137856  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  19137857 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 19137956  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19137957 aacaagatcttcaacacttaacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 19138056  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19138057 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 19138156  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  19138157 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 19138187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13690366 - 13689936
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13690366 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 13690267  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  13690266 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 13690167  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  13690166 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 13690067  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13690066 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 13689967  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  13689966 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 13689936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30316521 - 30316091
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30316521 tcaagcttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 30316422  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  30316421 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgcacatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 30316322  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30316321 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 30316222  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30316221 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 30316122  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  30316121 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 30316091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15782507 - 15782077
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15782507 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 15782408  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  15782407 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 15782308  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15782307 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 15782208  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15782207 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 15782108  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15782107 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 15782077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 29075217 - 29075647
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29075217 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 29075316  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  29075317 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 29075416  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29075417 aacaagatcttcaacacttcaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 29075516  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29075517 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 29075616  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  29075617 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 29075647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 29085468 - 29085898
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  29085468 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggctttgg 29085567  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  29085568 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 29085667  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29085668 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 29085767  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29085768 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 29085867  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  29085868 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 29085898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 32079492 - 32079062
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32079492 tcaagcttgttggacagcatagcaatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 32079393  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  32079392 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 32079293  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32079292 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 32079193  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32079192 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 32079093  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  32079092 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 32079062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3350431 - 3350001
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3350431 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 3350332  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  3350331 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 3350232  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3350231 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 3350132  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3350131 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 3350032  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  3350031 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 3350001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 9366771 - 9367201
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9366771 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 9366870  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  9366871 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 9366970  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9366971 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 9367070  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9367071 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 9367170  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9367171 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 9367201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 21297209 - 21297646
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21297209 tcaagcttgttggaaagcatgaccatctttacagattgatcttgatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttag 21297308  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21297309 atga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttccttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaact 21297399  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  21297400 aacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctc 21297499  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21297500 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttca 21297599  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  21297600 tcttcaacagctcatactgatgaactagcataagtgcttttgcttct 21297646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 26119387 - 26119817
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26119387 tcaagcttgttggatagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 26119486  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  26119487 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 26119586  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26119587 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 26119686  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26119687 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 26119786  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  26119787 ttctgaaaatttcatactgatgaactagcat 26119817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 36302003 - 36302433
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36302003 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttgttcagattcactggctttgtaggctttgg 36302102  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  36302103 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 36302202  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36302203 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 36302302  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  36302303 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 36302402  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  36302403 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 36302433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 44490191 - 44490621
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44490191 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 44490290  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  44490291 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 44490390  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44490391 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 44490490  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44490491 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 44490590  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  44490591 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 44490621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 250885 - 251315
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  250885 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 250984  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  250985 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggttccatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 251084  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  251085 aacaagatcttcaacacttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 251184  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  251185 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 251284  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  251285 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 251315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 813986 - 814416
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  813986 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 814085  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  814086 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggttccatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 814185  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  814186 aacaagatcttcaacacttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 814285  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  814286 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 814385  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  814386 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 814416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 445
Target Start/End: Original strand, 36086999 - 36087425
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36086999 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 36087098  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  36087099 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 36087198  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36087199 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 36087298  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36087299 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 36087398  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggacta 445  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||    
T  36087399 ttctgaaaagttcatactgatgaacta 36087425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 132 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 45569717 - 45569384
Alignment:
Q  132 ctttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  45569717 ctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaaaatcttca 45569618  T
Q  232 acacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaag 331  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||    
T  45569617 acactcaatgtgtttagatccttagcttcttcaatggcagtaaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcgcatgatcagaag 45569518  T
Q  332 taacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctc 431  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45569517 caacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctc 45569418  T
Q  432 atactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    ||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  45569417 atactgatgaactagcataagtgtctttgcttct 45569384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 462
Target Start/End: Original strand, 19941505 - 19941939
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| | |         | ||||      
T  19941505 tcaagcttgttggagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagagtctccatcaggtgactcttcttcaaatttaat---------aactttaa 19941595  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     |||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||  || ||    
T  19941596 gagattttgatgacttcccttttgatggtagagcaatagatttactcttgttagcatgctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgaaagagct 19941695  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||| || || | ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||    
T  19941696 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtaaccttagatctccatctagcaggcaagctccttagtatcttgcta 19941795  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  19941796 acatgatcagaagcaacataactctttttcagtatttgtagtccagagactagggtttgaaaccttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttca 19941895  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgct 462  Q
    | ||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||    
T  19941896 tcttgaacaactcatactgatgaataagcataagagcttttgct 19941939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 131 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17287935 - 17287601
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  17287935 acttcccttttgatggtagagcaatggatttactctttttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 17287836  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||     
T  17287835 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagag 17287736  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  17287735 gctacatagcttttcttcagtatttaaagttcagaaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 17287636  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  17287635 catactgatgaacaagcatcagagcttttgcttct 17287601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Original strand, 15976719 - 15977054
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| |  | ||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  15976719 acttccctttagatggtagagtaatgtatttactcttcctagaaggtttatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 15976818  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||     
T  15976819 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagag 15976918  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  15976919 gctacatagcttttcttcagtatttgaagtccataaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 15977018  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||    
T  15977019 catactgatgaacaaccataagagcttttgcttctc 15977054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Original strand, 17014939 - 17015274
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  17014939 acttccctttagatgatagagcaatagatttactcttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 17015038  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  | |  || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  17015039 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcgttcatctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaa 17015138  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  17015139 gctacatagcttttcttcagtatttaaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 17015238  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
     ||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||    
T  17015239 aatactgatgaacaagcataaaagcttttgcttctc 17015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17542262 - 17541927
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  17542262 acttccctttagatgatagagcaatagatttactcttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 17542163  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  | |  || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  17542162 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcgttcatctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaa 17542063  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  17542062 gctacatagcttttcttcagtatttaaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 17541963  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
     ||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||    
T  17541962 aatactgatgaacaagcataaaagcttttgcttctc 17541927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Original strand, 22672166 - 22672484
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  22672166 actttcctcttgatggtagagcaatggatttgcttttcttggaagattcatgttcattaatacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctc 22672265  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  22672266 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaa 22672365  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||| | |||||| ||||||  || ||||| |||| | | ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  22672366 gctacatagattttcttcggtatttaaagcccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatatttcattttaaacagct 22672465  T
Q  431 catactgatggactagcat 449  Q
    |||||||||| || |||||    
T  22672466 catactgatgaacaagcat 22672484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20257440 - 20257076
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           | ||||      
T  20257440 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaac---------aactttaa 20257350  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  | || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||    
T  20257349 gagtttttgatgaattccctttagatggtatatcaatagatttactcttcttaccagactcatgttcattaagacttatctcatgaacttttagagagct 20257250  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||     
T  20257249 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttagtctccatcttgcaggaaagcttcttagtatctttctc 20257150  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacat 392  Q
    |||||||||||||  ||| | || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  20257149 acatgatcagaagctacacaacttttcttcagtatttgaagtctagaaactaaagtctgaaatcatgagtacat 20257076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22463185 - 22462896
Alignment:
Q  177 ctcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttact 276  Q
    |||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| || ||||| ||     
T  22463185 ctcatgttcatttaggcttatctcatgaaccttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagagtttaaatttttagcttcctcaatagcagtaacc 22463086  T
Q  277 ttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaattt 376  Q
    ||  |||||||||||| ||| |||||||| || |||||  | ||||||||||| |  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || | |||    
T  22463085 ttaagtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttggtcacatgatcagatgctacatagcttttcttcagtacttgaagtccagatagtagagttt 22462986  T
Q  377 gaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||    
T  22462985 gaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatcttgaataactcatactgatgaacaagcataagaacttttgcttctc 22462896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 301 - 449
Target Start/End: Original strand, 6159796 - 6159944
Alignment:
Q  301 cttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctcta 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  6159796 cttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcta 6159895  T
Q  401 tactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  6159896 tactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcat 6159944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 392
Target Start/End: Original strand, 25164545 - 25164909
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  25164545 tcaagcttgttggaaagcataaccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 25164644  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  25164645 atga---------cttccctttagatggtagatcaatagatttactctctttaacaggttcatgttcattaagacttatttcatgaactttgagagagct 25164735  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| || ||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||     
T  25164736 gacaagatcttcagcacttaaaatgtttaaatctttagttttctcaatagcagtaacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctc 25164835  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacat 392  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  25164836 acatgatcagaaactacatagcttttcttcagtatttaaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacat 25164909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21603973 - 21603729
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  21603973 tcaagtttgttggaaagcatagccatcttctcagtagaatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 21603874  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  21603873 atga---------cttccctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagcagactcatgttcattaagacttatctcatggactttgagagagct 21603783  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagt 272  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  21603782 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagt 21603729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 361
Target Start/End: Original strand, 19940372 - 19940705
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    ||| ||||          
T  19940372 tcaagcttgttggagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattc-cacaactt-taag------ 19940463  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||    ||    
T  19940464 -agcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttgcttttcttagtcgactcatgttcattaagactaatctcatgaactttgagaacgct 19940562  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||  ||| |||||||| || ||||| ||     
T  19940563 gacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatctttagcttcctcaatatcagtcacctttggtctccatctaacaggtaagcttctgagtatcttgctc 19940662  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtc 361  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19940663 acatgattagaagctacatagcttttcttcagtatttgaagtc 19940705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20260703 - 20260488
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          || ||||      
T  20260703 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca---------aaaactttaa 20260613  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||  |  |    
T  20260612 gagctttagatgacttccctttagatggtagagcaataggtttactcttcttagcaggttcatgttcattaagacttatctcatgaacgttgagatagtt 20260513  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20260512 gacaagatcttcaacacttaaagtg 20260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21047333 - 21047118
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          || ||||      
T  21047333 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca---------aaaactttaa 21047243  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||  |  |    
T  21047242 gagctttagatgacttccctttagatggtagagcaataggtttactcttcttagcaggttcatgttcattaagacttatctcatgaacgttgagatagtt 21047143  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21047142 gacaagatcttcaacacttaaagtg 21047118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18152787 - 18152629
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| |  ||||| || || || ||||| ||    
T  18152787 actttcctcttgatggtagagcaatggatttgcttttcttggaagattcatgttcattaagacttatctcatgaaatttgagagagctcaccagatcctc 18152688  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatc 289  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| |||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  18152687 aacacttagagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttggtctccatc 18152629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 15976616 - 15976696
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15976616 tcaagcttgttggagagcatagccatcgtcttagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 15976696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 17014851 - 17014916
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  17014851 agcatagccatcttctaagtaggatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcctcttcagattca 17014916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17542350 - 17542285
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  17542350 agcatagccatcttctaagtaggatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcctcttcagattca 17542285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17288023 - 17287958
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  17288023 agcatagccatcttctctatatgatcttcatcaggatcttcatcgggtgattcttcttcatattca 17287958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Original strand, 22672069 - 22672142
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattc 98  Q
    ||||| || |||||| ||||||||  || | ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22672069 ttgtttgagagcatatccatcttcttagtaggatcttcatcaaaatccccatcaggtgattcttcttcagattc 22672142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22463263 - 22463211
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatc 77  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  22463263 ttgttggaaagcatagctatcttctcagtattatcttcatcagaatctccatc 22463211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 34707 - 34260
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34707 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttat 34608  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34607 aagattttgaaacctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgagggaact 34508  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34507 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagtttctcagaatctaacta 34408  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34407 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 34308  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34307 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 34260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Original strand, 7035 - 7370
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  7035 acttccctttagatggtagagtaattgatttactcttcttagcaagctcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 7134  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||||    
T  7135 aacacttaaagtgttcaaatatttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacaggatcagaa 7234  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||    
T  7235 gctacatagcttttcttcagtatttgaagtccaaaaactagagtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatcttttattttgaacaact 7334  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||    
T  7335 catactgatcaacaagcatgagagcttttgcttctc 7370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14837873 - 14837426
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14837873 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttat 14837774  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14837773 aagattttgaaacctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgagggaact 14837674  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14837673 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagtttctcagaatctaacta 14837574  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837573 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 14837474  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14837473 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 14837426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 16315817 - 16316264
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16315817 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttag 16315916  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  16315917 aagatttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaact 16316016  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16316017 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 16316116  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16316117 acaagatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttca 16316216  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16316217 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 16316264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14712579 - 14712142
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14712579 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 14712480  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14712479 atga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttctttaaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 14712389  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  14712388 gacatgatcttcaacacttaaagtgttaagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctc 14712289  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14712288 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 14712189  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||    
T  14712188 ttttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgcctttacttct 14712142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 141 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15195568 - 15195243
Alignment:
Q  141 agatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15195568 agatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaa 15195469  T
Q  241 gtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15195468 gtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagc 15195369  T
Q  341 tcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15195368 tcttcttcagtatttgcagttcagatactaaagtttgaaatcttaagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatg 15195269  T
Q  441 gactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15195268 aactagcattagagcctttgcttctc 15195243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27816711 - 27816281
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27816711 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27816612  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  27816611 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttattcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 27816512  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27816511 aagaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 27816412  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27816411 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcagtccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 27816312  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27816311 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27816281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 40456125 - 40455695
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  40456125 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttag 40456026  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  40456025 aagattttgaagactttcctttagatggcaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaact 40455926  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40455925 aacaagatcttcaacacttaacgtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttctcaaaatcttacta 40455826  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  40455825 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttctttaatactctcatcatccttca 40455726  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  40455725 ttctgaatagttcatactgatgaactagcat 40455695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 5021226 - 5021656
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  5021226 tcaagtttgttggacaacatagccatcttcacagactgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttag 5021325  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  5021326 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 5021425  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5021426 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 5021525  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  5021526 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 5021625  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5021626 ttctgaatagttcatactgatgaactagcat 5021656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18132014 - 18131584
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18132014 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 18131915  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  18131914 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 18131815  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18131814 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 18131715  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18131714 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 18131615  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  18131614 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 18131584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19946103 - 19945673
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19946103 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 19946004  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||    
T  19946003 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcgtgcactttgagtgagct 19945904  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19945903 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 19945804  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19945803 acatgatcagaaacaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 19945704  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  19945703 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 19945673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 22005507 - 22005937
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22005507 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 22005606  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  22005607 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 22005706  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22005707 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 22005806  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22005807 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 22005906  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22005907 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 22005937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27665663 - 27666093
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27665663 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27665762  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  27665763 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 27665862  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  27665863 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 27665962  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27665963 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 27666062  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27666063 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27666093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 55747017 - 55746587
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  55747017 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 55746918  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  55746917 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 55746818  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  55746817 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 55746718  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55746717 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 55746618  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  55746617 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 55746587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27175163 - 27175594
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27175163 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27175262  T
Q  119 aagatttggaaaactttccttt-agatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaac 217  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || |    
T  27175263 aagattttgaagtctttccttttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagc 27175362  T
Q  218 tgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttact 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27175363 taacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttact 27175462  T
Q  318 aacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttc 417  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27175463 aacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttc 27175562  T
Q  418 attttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    ||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27175563 attctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27175594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 459653 - 460083
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  459653 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 459752  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  459753 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 459852  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  459853 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 459952  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  459953 acatgattagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 460052  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  460053 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 460083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4989560 - 4989130
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  4989560 tcaagtttgttggacaacatagccatcttcacagactgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttag 4989461  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  4989460 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 4989361  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4989360 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttccccaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 4989261  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4989260 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 4989161  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  4989160 ttctgaatagttcatactgatgaactagcat 4989130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 16264955 - 16265385
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16264955 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 16265054  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| | || ||||| || ||    
T  16265055 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcacgcactttgagtgagct 16265154  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16265155 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 16265254  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16265255 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 16265354  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  16265355 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 16265385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 17927189 - 17927619
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17927189 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 17927288  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  17927289 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 17927388  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17927389 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccaccttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 17927488  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17927489 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 17927588  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17927589 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 17927619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30928258 - 30927828
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30928258 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 30928159  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  30928158 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 30928059  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  30928058 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaaacttctcaaaatcttacta 30927959  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30927958 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 30927859  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  30927858 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 30927828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10742363 - 10741933
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10742363 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 10742264  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  10742263 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 10742164  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10742163 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 10742064  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10742063 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 10741964  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10741963 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 10741933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10956132 - 10955702
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10956132 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 10956033  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  10956032 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 10955933  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10955932 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 10955833  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10955832 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 10955733  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10955732 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 10955702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 24649421 - 24649851
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24649421 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 24649520  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  24649521 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 24649620  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  24649621 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 24649720  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  24649721 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 24649820  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24649821 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 24649851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 36027381 - 36027811
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36027381 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 36027480  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  36027481 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 36027580  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36027581 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 36027680  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36027681 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 36027780  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  36027781 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 36027811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 49516627 - 49517057
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49516627 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 49516726  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  49516727 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 49516826  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49516827 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 49516926  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  49516927 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 49517026  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  49517027 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 49517057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 3380592 - 3380917
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3380592 tcaagtttgttggacaacatagccatcttcaaagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 3380691  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3380692 aagatttagaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcgtgctcattcagactcatttcatgtaccttgaggaaact 3380791  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3380792 gacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 3380891  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctctt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3380892 acatgatcagaagtaacatagctctt 3380917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18754255 - 18753825
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| |    
T  18754255 tcaagtttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcacttgctttaaaggctttag 18754156  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  18754155 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcgtttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 18754056  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18754055 aacaagatcctcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccaccttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 18753956  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18753955 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 18753856  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  18753855 ttctgaatagttcatactgatgaactagcat 18753825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 18065065 - 18065495
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |    
T  18065065 tcaagtttgttggacaacatggccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggcctttg 18065164  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  18065165 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 18065264  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  18065265 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactg 18065364  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18065365 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagaatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 18065464  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| |  ||||||||||| || |||||    
T  18065465 ttctgaataattcatactgatgaacaagcat 18065495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 466
Target Start/End: Original strand, 16852203 - 16852626
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattc-actggccttgtaagctttggaagatttggaaaac 132  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||          | |||||  || ||| ||  ||    
T  16852203 agcatagccatcttctcagtaggatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccac----------aactttgagagcttttgatgac 16852292  T
Q  133 tttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaa 232  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  16852293 ttccctttagatggtagagcaatggatttgcttttcttagatgactcatgttcattaagactaatctcatgaacttttagagagctgacaagatcttcaa 16852392  T
Q  233 cacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagt 332  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||| |||     
T  16852393 cacttaaagtgttcaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctagtaggtaagcttctgagtatcttgctcacatgatcaaaagc 16852492  T
Q  333 aacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctca 432  Q
     |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16852493 tacatagcttttcttcggtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactca 16852592  T
Q  433 tactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16852593 tactgatgaacaagcataagagcctttgcttctc 16852626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10662916 - 10662581
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  10662916 actttcctttagatgggagcgcaatagatttattcttctttgaagactcatgctcatttaggctcatttcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 10662817  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||||| | || |||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  10662816 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctccatagcagtaacctaaggtctccatctagaatgaaaacttctcaatatcttgctcacatgattagaa 10662717  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    | ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || || ||||||| ||    
T  10662716 gcaacatagattttcttcagtatttgaagtccagagactagggtttgaaatcttgagtacatttccacaatactttcatcatcatttatcttgaacaact 10662617  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  10662616 catactgatgaacaagcataagagcctttgcctctc 10662581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10877061 - 10876726
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  10877061 actttcctttagatgggagcgcaatagatttattcttctttgaagactcatgctcatttaggctcatttcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 10876962  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||||| | || |||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  10876961 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctccatagcagtaacctaaggtctccatctagaatgaaaacttctcaatatcttgctcacatgattagaa 10876862  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    | ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || || ||||||| ||    
T  10876861 gcaacatagattttcttcagtatttgaagtccagagactagggtttgaaatcttgagtacatttccacaatactttcatcatcatttatcttgaacaact 10876762  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  10876761 catactgatgaacaagcataagagcctttgcctctc 10876726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 466
Target Start/End: Original strand, 17245867 - 17246288
Alignment:
Q  36 catagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaaacttt 135  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||           | ||||   | |||| ||  ||||     
T  17245867 catagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcatgtgattcttcttcagattcaac---------aactttaagaaattttgatgacttc 17245957  T
Q  136 cctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacac 235  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||  ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  17245958 cctttttatggtagagcaatggatttactctttttggaaggttcatattcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacac 17246057  T
Q  236 ttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaac 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||    
T  17246058 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaggctac 17246157  T
Q  336 atagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatac 435  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| | | ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17246158 atagcttttcttcggtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatac 17246257  T
Q  436 tgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||||||||    
T  17246258 tgatgaacaagcataagagaatttgcttctc 17246288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Original strand, 10299762 - 10299914
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10299762 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatcttcatctggtgattcttcttcaaattcactggccttgtaagctttga 10299861  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttctta 171  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10299862 aagatttggaagacttttatttagatggtagagcaatagatttattcttctta 10299914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16820849 - 16820677
Alignment:
Q  293 aaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacat 392  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16820849 aaggcaagcttatcagaatcttgcttacatgatcaaaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacat 16820750  T
Q  393 ctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  16820749 atcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagcacatactgatgaactagaataagtgcctttgcttct 16820677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15198569 - 15198446
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15198569 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 15198470  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttag 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  15198469 aagatttggaagactttcctttag 15198446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 340 - 466
Target Start/End: Original strand, 3389259 - 3389385
Alignment:
Q  340 ctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgat 439  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3389259 ctctttttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgat 3389358  T
Q  440 ggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||    
T  3389359 gaactagcattaaagcctttgcttctc 3389385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14906156 - 14905718
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||   | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           | ||||      
T  14906156 tcaagcttgttggaaagcataaccatcttctttgtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca---------acaactttaa 14906066  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  14906065 cagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagct 14905966  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||     
T  14905965 gacaagaacttcaacacttaaagtgttcaaatctttaccttccgcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaaccttctaagtattttgctc 14905866  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||| | |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  14905865 acatgatcagaagctacatagcctttcttcagtatttgaagtccataaactagattctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttca 14905766  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || ||||| ||| | ||||||||||    
T  14905765 ttttgaacaactcatactaataaacaagcataagatcttttgcttctc 14905718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 465
Target Start/End: Original strand, 11470133 - 11470205
Alignment:
Q  393 ctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  11470133 ctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattaatgcctttgcttct 11470205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28723099 - 28722652
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28723099 tcaagcttgttagacagtatagccatcttcacataatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 28723000  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28722999 aagatttagaagactttcctttacatggtagagcaatagatttactctttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 28722900  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28722899 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctgagaatcttgcta 28722800  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28722799 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 28722700  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28722699 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 28722652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24416801 - 24416360
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24416801 ttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatt 24416702  T
Q  125 tggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaag 224  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24416701 ttgaagactttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaagactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgaaggaactgacaag 24416602  T
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24416601 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 24416502  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24416501 tcagaagtaacatagctcttcttcaaaatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 24416402  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24416401 acagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 24416360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Original strand, 26875999 - 26876373
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26875999 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttgg 26876098  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26876099 aagatttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 26876198  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26876199 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 26876298  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatc 393  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26876299 acatgatcagatgtaacatagctcttcttcagtatttgtagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatc 26876373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19304200 - 19303763
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19304200 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 19304101  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19304100 aaga---------ctttactttagatggtagagcaatagatctattcttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtacgttgagggaact 19304010  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19304009 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 19303910  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303909 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 19303810  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  19303809 tcttgaacagctcatactgatgaactagtatgagtgcctttgcttct 19303763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21163728 - 21163298
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21163728 tcaagtttgttggacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 21163629  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  21163628 aagattttgaagattttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 21163529  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21163528 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaactcttacta 21163429  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21163428 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 21163329  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  21163328 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 21163298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24329530 - 24329100
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  24329530 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaccggctttgtaggctttgg 24329431  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  24329430 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 24329331  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24329330 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 24329231  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24329230 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 24329131  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24329130 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 24329100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19301751 - 19301360
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19301751 tcaagcttattagacagcatagccattttcacagattgatcttcatcagaatctccatcgggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 19301652  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19301651 aaga---------ctttactttagatggtagagcaatagatctattcttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtacattgagggaact 19301561  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19301560 gacaagatattcaacactcaaagtgtttagatccttagattccacaatggcagtaactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 19301461  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19301460 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 19301361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24803423 - 24802986
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24803423 tcaagcttgttggaaagcattgccatctttatagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttag 24803324  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24803323 atga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttaagggaact 24803233  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  24803232 gacaaaatcttcaacactcaaagtgtttaaatccttggcttcctcaatggcagtcactttaggtttccatctagaaggcaaacttctcaaaatcttgctc 24803133  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24803132 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatctcgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 24803033  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  24803032 tcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttct 24802986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 29253251 - 29253681
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29253251 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 29253350  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  29253351 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 29253450  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29253451 aacaagatcttcaacacttaacgtatttagatccttaacttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 29253550  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29253551 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 29253650  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  29253651 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 29253681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 4218927 - 4219357
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4218927 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 4219026  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  4219027 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 4219126  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4219127 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtcttcatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 4219226  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4219227 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 4219326  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  4219327 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 4219357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9764544 - 9764114
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9764544 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 9764445  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||| | || ||    
T  9764444 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgcgtgagct 9764345  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9764344 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 9764245  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9764244 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 9764145  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9764144 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 9764114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9899354 - 9898924
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9899354 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 9899255  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  9899254 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 9899155  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9899154 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 9899055  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  9899054 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatagtctcatcatccttca 9898955  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9898954 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 9898924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11396953 - 11396523
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11396953 tcaagtttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 11396854  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  11396853 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 11396754  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11396753 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 11396654  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11396653 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 11396554  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  11396553 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 11396523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27230470 - 27230900
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27230470 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27230569  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  27230570 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 27230669  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  27230670 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 27230769  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27230770 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 27230869  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27230870 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27230900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 35262035 - 35262465
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35262035 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 35262134  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  35262135 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 35262234  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  35262235 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 35262334  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35262335 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 35262434  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35262435 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 35262465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 35272660 - 35273090
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35272660 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 35272759  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  35272760 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 35272859  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  35272860 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 35272959  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35272960 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 35273059  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35273060 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 35273090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 39171875 - 39171445
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39171875 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 39171776  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  39171775 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 39171676  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39171675 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 39171576  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  39171575 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 39171476  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  39171475 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 39171445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 40249640 - 40250070
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40249640 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 40249739  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  40249740 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 40249839  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40249840 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 40249939  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  40249940 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactttcatcatccttca 40250039  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  40250040 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 40250070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 43091710 - 43092140
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43091710 tcaagcttgttggacagcatggccatctttacagattgatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 43091809  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |  ||    
T  43091810 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgtgct 43091909  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43091910 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 43092009  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43092010 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 43092109  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  43092110 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 43092140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 10276018 - 10276448
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10276018 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 10276117  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  10276118 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 10276217  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10276218 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 10276317  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10276318 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 10276417  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10276418 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 10276448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22916641 - 22916211
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22916641 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcattagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 22916542  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  22916541 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 22916442  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22916441 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 22916342  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22916341 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 22916242  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22916241 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 22916211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34791998 - 34791568
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34791998 tcaagcttgttggacggcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 34791899  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  34791898 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 34791799  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34791798 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 34791699  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34791698 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 34791599  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  34791598 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 34791568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 43353461 - 43353891
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43353461 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 43353560  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  43353561 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 43353660  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43353661 aacaagatcttcaacacttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 43353760  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43353761 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 43353860  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  43353861 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 43353891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 143 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22783334 - 22783011
Alignment:
Q  143 atggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagt 242  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22783334 atggtagggcaatggatttgcttttcttggaagattcatgttcattgagacttatcttatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagt 22783235  T
Q  243 gtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctc 342  Q
    | ||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| | | | |||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||||||     
T  22783234 gcttaaatctttagcttcctcaatagcagtcaccttaggtctccatctagcaagtaggcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagctt 22783135  T
Q  343 ttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgga 442  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| | |  |||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22783134 ttcttcagtatttgaactccagaaactagagtcagaaatcttgagtacatttgctcaatactttgatcatctttcattttgaacagctcatactgatgaa 22783035  T
Q  443 ctagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  22783034 caagcataagagcctttgcttctc 22783011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Original strand, 24842569 - 24842911
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||    
T  24842569 actttcctttagatggcagagcaatatattttgtcttcttagtagagtcatgctcattgagactcatttcacgaaccttgatagaactcacaagatcttc 24842668  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || |||||  |||||| ||| || ||||| || ||||| || | ||||| ||||    
T  24842669 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctttatctagcaggtaaacttcttagtatcttgctcatatgattagaa 24842768  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctca-------tcatccttcattttg 423  Q
    |  || || || ||||||| |||||| |||||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||       ||||| ||||| |||    
T  24842769 gctacgtaacttttcttcaatatttgaagtccagagactagagtctgaaatcttgtgtacatttcctcaatactttcatcatctttcatctttcatcttg 24842868  T
Q  424 aacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  24842869 aacaactcatactgatgaacaagcatgagagcctttgcctctc 24842911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 24723651 - 24724086
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  24723651 tcaagcttgttagagagcattaccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 24723750  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||| || |||    | || ||  |  |    
T  24723751 atga---------cttcactttagatagaagagcaatagatttactcttcttagcaagctcatgttcatttagacttatctca----ctttaagaaagtt 24723837  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||     
T  24723838 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttactcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggcaagcttcttaatatcttactc 24723937  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||   |||   | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24723938 acatgatcagaagcaacctagcttttcttcagtatttgtagtctaggggctatggtctgaaatcttcagtacatttcctcaatactttcatcatccttca 24724037  T
Q  419 ttttgaacagctcatact-gatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | ||||| |  ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24724038 tcttgaagaattcatactggatgaacaagcatgagagcctttgcttctc 24724086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28702941 - 28702606
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||  |||||||||||||    
T  28702941 acttcccttttgatggtagagcaatgaatttactctttttagaaggttcatgctcattaaggcttatctcatgaactttgagagagttgacaagatcttc 28702842  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| || ||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||     
T  28702841 aacactcaaagtgtttaaatctttaacttcctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagag 28702742  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||| | | ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  28702741 gctacatagcctttctttagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 28702642  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  28702641 catactgataaacaagcataagagcttttgcatctc 28702606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 466
Target Start/End: Original strand, 24574502 - 24574743
Alignment:
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||    
T  24574502 atcttgaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatga 24574601  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    |||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  24574602 tcagaagctacacagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtgtgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcaccatctttcattttga 24574701  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  24574702 acaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 24574743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 466
Target Start/End: Original strand, 21137548 - 21137815
Alignment:
Q  199 tcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggca 298  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || |||||| |||| | |||      
T  21137548 tcatgtacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctctatcttgcaggtg 21137647  T
Q  299 agcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctc 398  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| | |||    
T  21137648 agcttcttagtatcttgctcacatgatcaaaagttacatagtttttcttcagtatttgaagtccataaactaaagtctgaaatcttgagtacatttgctc 21137747  T
Q  399 tatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
     ||||| ||||||    |||||||||||| |||||||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||    
T  21137748 aatactttcatcacatgtcattttgaacaactcatactaatgaacaagcataaaagcttttgcttctc 21137815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10900171 - 10899909
Alignment:
Q  178 tcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactt 277  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  || || | |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| || ||| | ||||    
T  10900171 tcatgctcattgagactgatctcatgaaccttgaaagagctcataagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctctagtttcctcaatagcaataactt 10900072  T
Q  278 tgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttg 377  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||  ||||| |  ||||||| |||||| |||||||| || | | | ||    
T  10900071 taggtctccatctagcaggtaagcttcttagaatcttgctcacatgatcaaaagctacataacctttcttcaatatttgaagtccagagacaagagtctg 10899972  T
Q  378 aaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatg 440  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10899971 aaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatatttcatcttgaacaactcatactgatg 10899909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 465
Target Start/End: Original strand, 22773144 - 22773249
Alignment:
Q  360 tccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagccttt 459  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  22773144 tccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactggcattagtgccttt 22773243  T
Q  460 gcttct 465  Q
    ||||||    
T  22773244 gcttct 22773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24303734 - 24303433
Alignment:
Q  165 cttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctct 264  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||     
T  24303734 cttcttagtagattcatgctcatttagaccaatctcatgtaccttgagagaacttataagatcttcaacacttagagtgtttaaatctttagcttcatca 24303635  T
Q  265 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccag 364  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| || ||| || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||| ||    
T  24303634 ataacagtaactttaggtctccacctagcaggtaagcttctcataagcttgctcacataatcagaagcaacatagtttttcttcagtatttgaggtctag 24303535  T
Q  365 atactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttc 464  Q
    | |  | | | |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||    
T  24303534 agaaaagagtctgaaatcttgagtacatagcctcaatactttcataatatttcatcttgaataattcatactgatgaacaagcataatagcttttgcttc 24303435  T
Q  465 tc 466  Q
    ||    
T  24303434 tc 24303433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25119979 - 25119754
Alignment:
Q  222 aagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaaca 321  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||| |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| || |||    
T  25119979 aagatcttcaatactta--gtgtttaaatctttagattcctcaatagtagtaactttaggtctccacctagcaggtaagcttcttaggatcttgctcaca 25119882  T
Q  322 tgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattt 421  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | | ||||| |||||||||||  |||| || || |||||||| ||||||     
T  25119881 tgatcagaagctacatagcttttcttcagaatttgaagtccagagactagagtctgaaaccttgagtacatagcctcaatgctttcatcatctttcattc 25119782  T
Q  422 tgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    ||||||  ||||||| ||| || |||||    
T  25119781 tgaacaattcatactaatgaacaagcat 25119754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 290
Target Start/End: Original strand, 22253985 - 22254138
Alignment:
Q  137 ctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  22253985 ctttagatggtagagtaatagatttactctttttagtagactcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaacaagatcatcaacact 22254084  T
Q  237 taaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatct 290  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| | || ||||| || || ||||| |||||    
T  22254085 taaagtgtttaaatctttggcttccccaatagcagtcacctttggtcttcatct 22254138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21919688 - 21919471
Alignment:
Q  222 aagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaaca 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  || | ||||| ||||||||| | | ||| || ||| ||| ||||||  | |||    
T  21919688 aagatcttcaacacttagagtgtttagatccgtagcttcctcaataacaatcactttaggtctccatttggcaggtaaacttgtcaaaatcttgttcaca 21919589  T
Q  322 tgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattt 421  Q
    ||||| ||||| ||||||   |||||||| || || |||||||| |||| | | |||||||||||||||||  |||| || || ||||| || || |||     
T  21919588 tgatcggaagttacataggctttcttcagaatctgaagtccagagactagagtctgaaatcttgagtacatagcctcaatgctttcatcctcttttattc 21919489  T
Q  422 tgaacagctcatactgat 439  Q
     ||||| |||||||||||    
T  21919488 cgaacaactcatactgat 21919471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 466
Target Start/End: Original strand, 22256759 - 22256915
Alignment:
Q  310 atcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcat 409  Q
    ||||| || ||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||   |||||| |||| | | ||||||||||||||||| |  || ||| | ||||    
T  22256759 atcttgctcacatgatcagaaactacatatcttttcttcagtatttggcatccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgttcaatattttcat 22256858  T
Q  410 catccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  22256859 catctttcattttgaaaaactcatattgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 22256915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 22253891 - 22253949
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttc 92  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22253891 agcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttc 22253949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23185809 - 23185719
Alignment:
Q  376 tgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  23185809 tgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatctttcagtttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgtttctc 23185719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23597072 - 23596982
Alignment:
Q  376 tgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  23597072 tgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatctttcagtttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgtttctc 23596982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23186014 - 23185934
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23186014 tcaagcttgttggagagcattgccatcttctcagtaggatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattca 23185934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23597277 - 23597197
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23597277 tcaagcttgttggagagcattgccatcttctcagtaggatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattca 23597197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 466
Target Start/End: Original strand, 26878510 - 26878554
Alignment:
Q  422 tgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26878510 tgaacagctcatactgatgaactagcattaaagcctttgcttctc 26878554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 390
Target Start/End: Original strand, 24567290 - 24567394
Alignment:
Q  286 catctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttg 385  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||  | |||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||| | | ||||| ||||    
T  24567290 catctagcaggtaagcttcttagaatcttgttcacacaatcagaagttacataacttttcttcagtatttgaagtctagagactagagtctgaaaccttg 24567389  T
Q  386 agtac 390  Q
    |||||    
T  24567390 agtac 24567394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22783412 - 22783370
Alignment:
Q  56 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattc 98  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22783412 gatcttcatcaaaatccccatcgggtgattcttcttcagattc 22783370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28703044 - 28702970
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttca 93  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  28703044 tcaagcttgttggaaagcatagacatcttctcagtaggatcttcgtcagaatctccatcagataattcttcttca 28702970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 268
Target Start/End: Original strand, 22682401 - 22682446
Alignment:
Q  223 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatgg 268  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22682401 agatcttcaagacttacagtgtttatatccttagcttcctcaatgg 22682446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 9168639 - 9169086
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9168639 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttag 9168738  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  9168739 aagatttggaagactttcctttagatggtagatcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaact 9168838  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9168839 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 9168938  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9168939 acatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttca 9169038  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9169039 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctc 9169086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 18439662 - 18440099
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18439662 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcattagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttgg 18439761  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18439762 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 18439852  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18439853 gataagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 18439952  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    || |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18439953 acgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctatatactctcatcatccttca 18440052  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18440053 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 18440099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15879655 - 15879237
Alignment:
Q  31 gacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||     
T  15879655 gacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttagaaaattttgaag 15879556  T
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15879555 actttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaagatcttc 15879456  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15879455 aacacttaaaatgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaa 15879356  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  15879355 gcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagtt 15879256  T
Q  431 catactgatggactagcat 449  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  15879255 catactgatgaactagcat 15879237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6869075 - 6868645
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6869075 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 6868976  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  6868975 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 6868876  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6868875 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 6868776  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6868775 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 6868676  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  6868675 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 6868645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 9442321 - 9442751
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9442321 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 9442420  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  9442421 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 9442520  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9442521 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 9442620  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9442621 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcaatatttgcagtccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 9442720  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9442721 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 9442751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 175948 - 176378
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  175948 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 176047  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  176048 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 176147  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  176148 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 176247  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  176248 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 176347  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  176348 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 176378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8003911 - 8003481
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8003911 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 8003812  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  8003811 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 8003712  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  8003711 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 8003612  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8003611 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 8003512  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8003511 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 8003481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 8626403 - 8626833
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8626403 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 8626502  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  8626503 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 8626602  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8626603 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 8626702  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8626703 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 8626802  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8626803 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 8626833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 9093445 - 9093875
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9093445 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 9093544  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  9093545 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 9093644  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  9093645 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 9093744  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9093745 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 9093844  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9093845 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 9093875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 11003637 - 11004067
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11003637 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 11003736  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  11003737 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 11003836  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11003837 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 11003936  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11003937 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 11004036  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  11004037 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 11004067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 31 - 449
Target Start/End: Original strand, 20988127 - 20988545
Alignment:
Q  31 gacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaa 130  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||     
T  20988127 gacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaag 20988226  T
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  20988227 tctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttc 20988326  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20988327 aacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaa 20988426  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  20988427 gcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagtt 20988526  T
Q  431 catactgatggactagcat 449  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20988527 catactgatgaactagcat 20988545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 458831 - 458401
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  458831 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 458732  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  458731 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcgatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 458632  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  458631 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 458532  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  458531 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 458432  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  458431 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 458401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2707458 - 2707028
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2707458 tcaaggttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 2707359  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  2707358 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 2707259  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2707258 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 2707159  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2707158 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 2707059  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  2707058 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 2707028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 4221066 - 4221496
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4221066 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 4221165  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  4221166 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 4221265  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  4221266 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttcttaaaatcttacta 4221365  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4221366 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 4221465  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  4221466 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 4221496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 11014246 - 11014676
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11014246 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 11014345  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  11014346 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 11014445  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  11014446 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 11014545  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11014546 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 11014645  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  11014646 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 11014676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17951959 - 17951529
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17951959 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 17951860  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  17951859 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 17951760  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17951759 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagctttctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 17951660  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17951659 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 17951560  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17951559 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 17951529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 22098199 - 22098629
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22098199 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 22098298  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  22098299 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 22098398  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22098399 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 22098498  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22098499 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 22098598  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22098599 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 22098629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26391939 - 26391509
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26391939 tcaagtttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 26391840  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  26391839 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 26391740  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26391739 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 26391640  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26391639 acatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 26391540  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26391539 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 26391509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 1996614 - 1997044
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1996614 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 1996713  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  1996714 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 1996813  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1996814 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 1996913  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1996914 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 1997013  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  1997014 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 1997044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 24743159 - 24743589
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24743159 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 24743258  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  24743259 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 24743358  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24743359 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 24743458  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24743459 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 24743558  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24743559 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 24743589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 40043949 - 40043519
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40043949 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 40043850  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  40043849 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 40043750  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40043749 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 40043650  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40043649 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 40043550  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  40043549 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 40043519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26655181 - 26654751
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26655181 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 26655082  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  26655081 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 26654982  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  26654981 aacaagatcttcaacacttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatctaacta 26654882  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26654881 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 26654782  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26654781 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 26654751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 445
Target Start/End: Original strand, 42874906 - 42875332
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42874906 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 42875005  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  42875006 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 42875105  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42875106 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 42875205  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42875206 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 42875305  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggacta 445  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||    
T  42875306 ttctgaaaagttcatactgatgaacta 42875332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13176328 - 13176050
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13176328 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 13176229  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  13176228 atga---------ctttcctttagattgtagagcaatagatctactcttctttgaggattcatgctcattcaaactcatttcatgaactttgagggaact 13176138  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctca 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13176137 gacaagatcttcaacactt-aagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtcttcatctagaaggaaagcttctca 13176050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13028706 - 13028371
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  13028706 acttccctttagatggtagtgcaatagatttactcttcctagcaggctcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 13028607  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | || |||||||||||     
T  13028606 aacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcgatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcctgctcacatgatcagag 13028507  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  13028506 gctacatagctcttattcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaacc 13028407  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  13028406 catactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 13028371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16311860 - 16311423
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  16311860 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttttcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 16311761  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | || ||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |    
T  16311760 atgaattc---------cctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagtaggctcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagaatt 16311670  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| ||     
T  16311669 gaca-gatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatggcagtaacctttggtctccatcttgcaggtaaacttcttagtatcttgctc 16311571  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||| ||||    
T  16311570 acatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttgaagtctagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttaatcatctttca 16311471  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||    
T  16311470 ttttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagattttgcttctc 16311423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4413858 - 4413411
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   | ||||  | ||||| |    
T  4413858 tcaagcttgttggagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtaattcttcttcagattccacgaccttcaatgcttttg 4413759  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  4413758 aagactttgaagactttcccttagatggaagagcaatggatttgcttttcttgacagattcatgttcattgagactaatctcatgaactttgagagagct 4413659  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| | |||||| || ||||| ||     
T  4413658 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctggcaggtaggcttctgagtatcttgctc 4413559  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||| ||||    
T  4413558 acatgatcagaggctacatagcttttcttcggtatttgaagtccagaaaccagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatattttcatcatctttca 4413459  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||    
T  4413458 ttttgaacaactcatactaatgaacaagcataaaagcttttgcttctc 4413411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13174081 - 13173659
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaaact 133  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    | ||   |||||| || ||         ||    
T  13174081 agcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacaactttaagagcttttgatga---------ct 13173991  T
Q  134 ttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaac 233  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  13173990 tccctttagattgtagagcaatagagttactcttcttagcaggctcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaac 13173891  T
Q  234 acttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagta 333  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||      
T  13173890 acttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaataacagtaaccttaggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagct 13173791  T
Q  334 acatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcat 433  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  13173790 acatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaaaaactcat 13173691  T
Q  434 actgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    || |||| || ||| | ||||| | |||||||    
T  13173690 acagatgaacaagcttaagagcttctgcttct 13173659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 466
Target Start/End: Original strand, 14171944 - 14172376
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatt 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    | ||   | |||| || ||      
T  14171944 ttgttcgaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagactcaacaactttaagaacttttgatga-- 14172041  T
Q  125 tggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaag 224  Q
           ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||    
T  14172042 -------cttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagacgattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaag 14172134  T
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || | ||| || || ||||||||||||| ||| |||||| | || ||||| || ||||||    
T  14172135 atcctcaacacttaaagtgttaaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatctagcaggtaagcttttaagtatctttctcacatga 14172234  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    ||| | |  |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| | | |||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  14172235 tcataggctacatagcttttcttcagtatttgaagtctagaaactagagtctgaaattttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatcttga 14172334  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  14172335 acaactcatactgatgaacgagcataagagcttttgcttctc 14172376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 13680621 - 13681053
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  13680621 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 13680720  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |  ||||| ||||| ||||  || || || || ||||| || ||    
T  13680721 atga---------cttccctttagatggtagagtaatggatttaatcttcctagaaggttcatgttcattaagacatatctcgtgaactttgagagagct 13680811  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||| | ||     
T  13680812 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatatttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggcaagcttcttagtatcctgctc 13680911  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||      ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  13680912 acatgatcag------catagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttca 13681005  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  13681006 ttttgaataactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 13681053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 13878417 - 13878855
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    | ||   |||||| |    
T  13878417 tcaagcttgttggagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacaactttaagagcttttg 13878516  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  |    
T  13878517 atga---------cttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagat 13878607  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || | ||| ||  | ||||||||||| | | | |||||||| || ||||| ||     
T  13878608 gacaagttcttcaacacttaatgtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcaccattggtctccatcttgcaagtaagcttcttagtatcttgctc 13878707  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  13878708 acatgatcagaggcttcatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttca 13878807  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  13878808 ttttgaacaactcatacagatgaacaagcataagagcttttgtttctc 13878855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16547879 - 16547441
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  16547879 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctctataagatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 16547780  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  |||||  |||| ||||| |  ||||| || || || || ||    
T  16547779 atga---------cttcccttttgatggtagagcaatggatttactctttttggaaggttcatgtccattaagacttagctcatgaactttaagagagct 16547689  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||     
T  16547688 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttagtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctc 16547589  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||  | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  16547588 acatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttgaagtccagaaacttgagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttca 16547489  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  16547488 ttttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 16547441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 16617783 - 16618221
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  16617783 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctctataagatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 16617882  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  |||||  |||| ||||| |  ||||| || || || || ||    
T  16617883 atga---------cttcccttttgatggtagagcaatggatttactctttttggaaggttcatgtccattaagacttagctcatgaactttaagagagct 16617973  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||     
T  16617974 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttagtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctc 16618073  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||  | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  16618074 acatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttgaagtccagaaacttgagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttca 16618173  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  16618174 ttttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 16618221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 208 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21212284 - 21212026
Alignment:
Q  208 ttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctca 307  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||| || ||||| |    
T  21212284 ttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcatcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaaacttctta 21212185  T
Q  308 gaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctc 407  Q
    | |||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  21212184 gtatcttactcacttgatcagaagctacatagcttttcttcaatatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttc 21212085  T
Q  408 atcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||    
T  21212084 atcatctttcattttgaacaactcacactgatgaacatgcataagagtttttgcttctc 21212026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 449
Target Start/End: Original strand, 16408241 - 16408494
Alignment:
Q  199 tcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagt---gtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaag 295  Q
    ||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||||||| |  | ||| || || |||| |||||||| ||    
T  16408241 tcatgaaccttgagagagctcataagatcttcaacacttagagtactgtttaaatccctagcttcctcaaaagtagtaaccttaggtcaccatctagcag 16408340  T
Q  296 gcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctc 395  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||| | ||||| | |||||  |||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||    
T  16408341 gtaagcttctcagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagattttctttaatatttaaagtccagagactaaagtctaaaatcttgagtacatttc 16408440  T
Q  396 ctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  16408441 ctcaatactttcatcatctttcatcttgaacaactcatattgatgaacaagcat 16408494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16309443 - 16309168
Alignment:
Q  165 cttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctct 264  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| || || | |||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||     
T  16309443 cttcttagaagattcatgttcatttagaccaatctcatgaaccttgagagagcttataagatcctcaacagttagagtttttaaatccttagcttcctca 16309344  T
Q  265 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccag 364  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||  |||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  16309343 atagcagtaactttaggtctccatctaggatgtaagcttcttagaatcttgttcacatgattagaagctacatattttttctttagtatctgaagtccag 16309244  T
Q  365 atactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatg 440  Q
    | |||| | | | ||| ||| |||||||  |||| || || |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  16309243 agactagagtctaaaaccttaagtacatagcctcaatgctttcatcatctttcatcttgaacaattcatactgatg 16309168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 298 - 466
Target Start/End: Original strand, 15466307 - 15466475
Alignment:
Q  298 aagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcct 397  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||| | | || | | ||||||||||||||||| | ||    
T  15466307 aagcttctaagtatctttctcacatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttgaagtccataaattagagtctgaaatcttgagtacatgtgct 15466406  T
Q  398 ctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  15466407 aaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 15466475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13176054 - 13175993
Alignment:
Q  404 tctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  13176054 tctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtctttgcttct 13175993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16106706 - 16106479
Alignment:
Q  222 aagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaaca 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||| | || || ||||||||| ||| |   ||||| || || ||| |  | |||    
T  16106706 aagatcttcaacacttagagtgtttaaatcattagcttcctcaattgcattcaccttaggtctccatttagcatataagctccttagtatccttttcaca 16106607  T
Q  322 tgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattt 421  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||| || || |||||||| |||| | | ||||| | |||||||||   ||| ||   |||||| ||||||||      
T  16106606 tgatcagaagctacataacttttcttcagaatctgaagtccagagactagagtctgaaaccatgagtacatagtctcaatgtcctcatcctccttcatcc 16106507  T
Q  422 tgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||    
T  16106506 tgaacaactcatactgatgaacaagcat 16106479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16669838 - 16669780
Alignment:
Q  205 accttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctc 263  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  16669838 accttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttaacttcctc 16669780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17644206 - 17644148
Alignment:
Q  205 accttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctc 263  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  17644206 accttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttaacttcctc 17644148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6879348 - 6879287
Alignment:
Q  388 tacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  6879348 tacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcat 6879287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16670015 - 16669950
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16670015 agcatagtcatcttatcagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattca 16669950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17644383 - 17644318
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17644383 agcatagtcatcttatcagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattca 17644318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16669927 - 16669846
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgag 212  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  16669927 acttccctttagatggcagagcaatagatttgttcttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcataaaccttgag 16669846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17644295 - 17644214
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgag 212  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  17644295 acttccctttagatggcagagcaatagatttgttcttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcataaaccttgag 17644214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 23700 - 24144
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23700 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttag 23799  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  23800 aagatttggaggacttccctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgaggaaact 23899  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23900 gacaagatcttcaacactaaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 23999  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24000 acatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 24099  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgctt 463  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24100 ttttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgctt 24144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 3759 - 4196
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3759 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 3858  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 3949  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3950 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 4049  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4050 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 4149  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4150 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 4196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17610356 - 17609919
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17610356 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 17610257  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17610256 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 17610166  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17610165 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 17610066  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17610065 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 17609966  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17609965 tcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 17609919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Original strand, 25804098 - 25804545
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25804098 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcaaagaatgatcttcaacagaatctccatcagttgattcttcttcagattcacttgccttgtaagctttag 25804197  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25804198 aagatttggaagactttcctttagatggtagaacaataaatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagggaact 25804297  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804298 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcaattactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 25804397  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25804398 acatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaggtttgaaatcttgagtacatctcctatatactctcatcatccttca 25804497  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||    
T  25804498 ttttgaacagctcatactgataaactagcataagggcctttgcttctc 25804545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 22307232 - 22307669
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22307232 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttgg 22307331  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307332 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 22307422  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  22307423 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtgtccatctagaatgcaagcttctcagaatcctgcta 22307522  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    || |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307523 acgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 22307622  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  22307623 tcttgaacaactcatactgatgaactagaattagtgtctttgcttct 22307669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 18553729 - 18554165
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18553729 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattggtcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcgctggccttgtaagctttgg 18553828  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18553829 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctatttttctttgaggattc-tgctcattcagactcatttcatgtaccttgagagaact 18553918  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  18553919 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcataatcttgctt 18554018  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554019 acatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcattccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 18554118  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  18554119 tcttgaacagcttatactgatgaactagcatgagtgcctttgcttct 18554165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20031692 - 20031262
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  20031692 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttag 20031593  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20031592 aagattttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctaatttaaactcatttcatgcactttgagtgaact 20031493  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20031492 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttacta 20031393  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20031392 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 20031293  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20031292 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 20031262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 11204402 - 11204840
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11204402 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcactgattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcatattcactggccttgtaagctttgg 11204501  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattc-agactcatttcatgtaccttgagggaac 217  Q
    | ||         |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11204502 atga---------ctttgctttagatagtagagcaatagatctattcttctttgaggattcatgctcattcgagactcatttcgtgtaccttgagggaac 11204592  T
Q  218 tgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttact 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||    
T  11204593 tgacaagatcttcaacactcaaagtgttcagatccttagcttcctcaatggcagtcactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttgct 11204692  T
Q  318 aacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttc 417  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11204693 tacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatattaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttc 11204792  T
Q  418 attttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||    
T  11204793 atcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgccttttcttct 11204840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12718607 - 12718177
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12718607 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagactcactggctttgtaagctttgg 12718508  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  12718507 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatagatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 12718408  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  12718407 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 12718308  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12718307 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 12718208  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12718207 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 12718177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 25984507 - 25984937
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25984507 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 25984606  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  25984607 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 25984706  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25984707 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 25984806  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25984807 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 25984906  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  25984907 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 25984937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 465
Target Start/End: Original strand, 22385053 - 22385484
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatt 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |       
T  22385053 ttgttggaaagcatggccatctttatagattgatcttcatcagaatctccgtctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatg--- 22385149  T
Q  125 tggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaag 224  Q
     ||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22385150 -gg-----tttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaaatgacaag 22385243  T
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  22385244 atcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctcacatga 22385343  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22385344 tcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcacccttcatcttga 22385443  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  22385444 acagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttct 22385484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 3670474 - 3670904
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3670474 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 3670573  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  3670574 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 3670673  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3670674 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 3670773  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3670774 acatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 3670873  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  3670874 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 3670904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9114264 - 9113834
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  9114264 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcagatgattcttcttaagattcactggctttgtaggctttgg 9114165  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  9114164 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 9114065  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9114064 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatctttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 9113965  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9113964 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 9113865  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9113864 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 9113834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 12863961 - 12864391
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12863961 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 12864060  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  12864061 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 12864160  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12864161 aacaagatcttcaaaacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 12864260  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12864261 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 12864360  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12864361 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 12864391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 16958038 - 16958468
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16958038 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 16958137  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||    
T  16958138 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgccctttgagtgagct 16958237  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16958238 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 16958337  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16958338 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 16958437  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  16958438 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 16958468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 26034450 - 26034880
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26034450 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 26034549  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  26034550 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 26034649  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26034650 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 26034749  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26034750 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 26034849  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26034850 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 26034880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 26873832 - 26874262
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26873832 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 26873931  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  26873932 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 26874031  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26874032 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgagtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 26874131  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26874132 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 26874231  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26874232 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 26874262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27350775 - 27351205
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27350775 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27350874  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  27350875 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 27350974  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27350975 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 27351074  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27351075 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 27351174  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27351175 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27351205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27411515 - 27411945
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27411515 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 27411614  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  27411615 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 27411714  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27411715 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 27411814  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27411815 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 27411914  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27411915 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27411945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 32302817 - 32302387
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32302817 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 32302718  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  32302717 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 32302618  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32302617 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 32302518  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32302517 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 32302418  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  32302417 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 32302387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 32963717 - 32963287
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32963717 tcaagcttgttggacaacatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 32963618  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  32963617 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 32963518  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32963517 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 32963418  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32963417 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 32963318  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  32963317 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 32963287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 64 - 440
Target Start/End: Original strand, 17062705 - 17063072
Alignment:
Q  64 tcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttac 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17062705 tcagaatctccatttggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctat 17062795  T
Q  164 tcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctc 263  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  17062796 tcttcttagaggattcatgctaattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacacaaggtgtttagatccttagcttcctc 17062895  T
Q  264 tatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtcca 363  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  17062896 aatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgaagtcca 17062995  T
Q  364 gatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatg 440  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17062996 gatactaaggtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatg 17063072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27502734 - 27503164
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  27502734 tcaagtttgttggacagcatagccatcttcaccgactgatcttcatcagaatctcgatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggcctttg 27502833  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  27502834 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 27502933  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  27502934 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactg 27503033  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  27503034 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagaatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 27503133  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| |  ||||||||||| || |||||    
T  27503134 ttctgaataattcatactgatgaacaagcat 27503164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 455
Target Start/End: Original strand, 26042625 - 26043061
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  26042625 tcaagcttgttagacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggcttttg 26042724  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| || ||    
T  26042725 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcattttgagtgagct 26042824  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  26042825 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactg 26042924  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26042925 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcctgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 26043024  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagc 455  Q
    || |||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  26043025 ttctgaatagttcatactgatgaacaagcattagagc 26043061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27383167 - 27383597
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  27383167 tcaagtttgttggacaacatggccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggcttttg 27383266  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  27383267 aggattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 27383366  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  27383367 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccctagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactg 27383466  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  27383467 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 27383566  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| || |||||    
T  27383567 ttctgaatagttcatactgatgaacaagcat 27383597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 27473551 - 27473981
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  27473551 tcaagtttgttggacaacatggccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggcttttg 27473650  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  27473651 aggattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 27473750  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  27473751 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccctagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactg 27473850  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  27473851 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 27473950  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| || |||||    
T  27473951 ttctgaatagttcatactgatgaacaagcat 27473981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28253339 - 28252909
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28253339 tcaagtttgttggacagcatagccattttcaccgactgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggcttttg 28253240  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  28253239 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 28253140  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  28253139 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactg 28253040  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  28253039 acatgatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 28252940  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| |  ||||||||||| || |||||    
T  28252939 ttctgaataattcatactgatgaacaagcat 28252909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28332088 - 28331658
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28332088 tcaagtttgttggacagcatagccattttcaccgactgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggcttttg 28331989  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  28331988 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 28331889  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  28331888 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactg 28331789  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  28331788 acatgatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttca 28331689  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| |  ||||||||||| || |||||    
T  28331688 ttctgaataattcatactgatgaacaagcat 28331658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34808933 - 34808503
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34808933 tcaagcttgttggacagtatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 34808834  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  34808833 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 34808734  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  34808733 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttaggttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttggaggtaagcttctcaaaatcttacta 34808634  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  34808633 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactgtcatcatccttca 34808534  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||| | ||||||||    
T  34808533 ttctgaaaagttcatactgacgaactagcat 34808503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14055156 - 14054786
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  14055156 tcaagcttgttggaaagcatggccatctttacacactgatcttcatcagaatccccatctggtgattcttcttcagattcactagccttatatgctttag 14055057  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |     |||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||    
T  14055056 a-----tgg----ctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttctttgaggattcatgctcatttaggctcaattcatgaaccttgagagaact 14054966  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||     
T  14054965 tacaagatcttcaacactcaacgtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttacctttggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaattttgctg 14054866  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctc 398  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  14054865 acatgatcagaagcaacataactctttttcagtatttgtagtctagagactaaggtttaaaaccttgagtacatttcctc 14054786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 466
Target Start/End: Original strand, 17926078 - 17926499
Alignment:
Q  36 catagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaaacttt 135  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  | ||   ||||||     || ||    |||||    
T  17926078 catagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcatattcaataactttaagagcttt-----atatg----acttt 17926168  T
Q  136 cctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacac 235  Q
     ||||||||   | ||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||    
T  17926169 actttagatttcatagcaatagatttattcttctttgaagattcatgctcatttagactcatttcatgaactttgagagagctaacaagatctttaacac 17926268  T
Q  236 ttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaac 335  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||| || | ||| |  || ||||||||||||| ||| || |||||||  ||||| || | ||||||||||| |||    
T  17926269 ttaaagtgtttacatctttcgctttctcaatagaagtaaacttaggtctccatctagcaggaaaacttctcaatatcttgctcaaatgatcagaagcaac 17926368  T
Q  336 atagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatac 435  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17926369 ataacttttcttcagtatttgaagtccagagactagggtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatccttcatcttgaataactcatac 17926468  T
Q  436 tgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    | ||| |  ||||| ||||||||||| ||||    
T  17926469 taatgaataagcataagagcctttgcctctc 17926499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Original strand, 17056492 - 17056646
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17056492 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttgg 17056591  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatg 182  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  17056592 aag---------actttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatg 17056646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25723498 - 25723351
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25723498 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttag 25723399  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagagg 175  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25723398 aag---------actttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagagg 25723351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 466
Target Start/End: Original strand, 26940694 - 26941119
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaaact 133  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| || ||         ||    
T  26940694 agcatagccatcttctcagtagggtcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatga---------ct 26940784  T
Q  134 ttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaac 233  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  26940785 tccctttagatggtagagcaattgatttactcttcttagtaggctcctgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaac 26940884  T
Q  234 acttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttac--tttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaag 331  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||||||| || | | | ||   || ||| ||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || | ||||||  |||    
T  26940885 actcaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtaataaccaattaggtgtccatctagcaggtaagcttcttaatatcttgctcaaatgatctaaag 26940984  T
Q  332 taacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctc 431  Q
      |||||  | |||||||||||||| ||| || | |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  26940985 ctacatacttgttcttcagtatttgaagttcataaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcctctttcattttgaacaactc 26941084  T
Q  432 atactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  26941085 atactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 26941119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 165 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17447379 - 17447095
Alignment:
Q  165 cttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctct 264  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  17447379 cttcttagcagaatcatgctcattaagactaatctcataaatcttgagagaactcataagatcttcaacacttagaatgtttaaatccttagcttcctca 17447280  T
Q  265 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccag 364  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| || ||||||  |||||| |||||||    
T  17447279 atagcagtaactttaggtctccatctagcaggtaagcttatcataatcttactcacatgataagaagctacataacttttcttccatatttgaagtccag 17447180  T
Q  365 atactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    | |||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||| || ||||  ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  17447179 agactatagtctgaaatcttgagtacatagcctcaatactttcgtcatttttcttcttgaacaactcatactgatgaacaagcat 17447095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 19450449 - 19450674
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||||    
T  19450449 acttttctttagatggtagagcaatagatttactcttattagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagggctgacaagatcttc 19450548  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  19450549 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctgaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaa 19450648  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttg 356  Q
    |  |||||||   |||||||||||||    
T  19450649 gcgacatagcgtatcttcagtatttg 19450674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 19448455 - 19448680
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||||    
T  19448455 acttttctttagatggtagagcaatagatttactcttattagcaagttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagggctgacaagatcttc 19448554  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  19448555 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctgaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaa 19448654  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttg 356  Q
    |  |||||||   |||||||||||||    
T  19448655 gcgacatagcgtatcttcagtatttg 19448680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 25725888 - 25725827
Alignment:
Q  404 tctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25725888 tctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 25725827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13138111 - 13137905
Alignment:
Q  164 tcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctc 263  Q
    |||||||||  || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| ||    
T  13138111 tcttcttagttgaatcgtgctcgttaagactaatctcatgaaccttgagagaacttataagatcttcaacaattagagtgtttaaatctttagattcttc 13138012  T
Q  264 tatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtcca 363  Q
     || ||| | ||||| |||||  | |||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||    |||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  13138011 aatagcaataactttaggtcttaacctagcaggtaagcttcttagaatcttgctcacatgatcagaaactgcataacttttcttcagtaattgaagtcca 13137912  T
Q  364 gatacta 370  Q
    || ||||    
T  13137911 gagacta 13137905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Original strand, 17062643 - 17062700
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccat 76  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17062643 tcaagcttgttaaacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccat 17062700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 6156933 - 6157002
Alignment:
Q  380 atcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  6156933 atcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcat 6157002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 418
Target Start/End: Original strand, 19874398 - 19874542
Alignment:
Q  274 actttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaa 373  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||| || |||| |||||||| || ||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |     
T  19874398 actttaggtctctatctagcaggtaagattctcaaaatctttctcacattatcagaagcaatataacttttcttcaatatttgaagtccatagactagag 19874497  T
Q  374 tttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    | |||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||| ||||    
T  19874498 tctgaaatcttgagtacatagccttaatactttcatcatctttca 19874542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Original strand, 19448355 - 19448433
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagatt 97  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19448355 tcaagcttgttggagagcattgccatcttctcaattggatcttcatctgaatctccatcaggtgattgttcttcagatt 19448433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Original strand, 19450349 - 19450427
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagatt 97  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19450349 tcaagcttgttggagagcattgccatcttctcaattggatcttcatctgaatctccatcaggtgattgttcttcagatt 19450427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17447477 - 17447440
Alignment:
Q  58 tcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcaga 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17447477 tcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcaga 17447440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 463
Target Start/End: Original strand, 19469237 - 19469322
Alignment:
Q  378 aaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgctt 463  Q
    ||||| ||||||||| | |||  |||| |||||| | || |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  19469237 aaatcctgagtacatttgctcattactttcatcaacttttattttgaacaactcatactgataaactagcataagagcttttgctt 19469322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20875023 - 20874582
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20875023 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcgcagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 20874924  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20874923 aaga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcattctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 20874833  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggca----agcttctcagaatctt 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||    
T  20874832 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcatcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagatagattctcagaatctt 20874733  T
Q  315 actaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatcc 414  Q
     || ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20874732 gcttacatgatcagaagcaacatgactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatcc 20874633  T
Q  415 ttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20874632 ttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttct 20874582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 22017590 - 22018027
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22017590 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcacatattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttgg 22017689  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22017690 atga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtactttgagggaact 22017780  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22017781 gacaagattttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 22017880  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22017881 acataatcagaagcaacataactcttcttaagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 22017980  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  22017981 tattgaacagctcataatgatgaactagcataaatgcctttgcttct 22018027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7691274 - 7690845
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7691274 tcaagcttgttggacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 7691175  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  7691174 aagattttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaact 7691075  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7691074 aacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttacta 7690975  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7690974 acatggtcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 7690875  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagca 448  Q
    || |||| || ||||||||||| |||||||    
T  7690874 ttctgaaaagttcatactgatgaactagca 7690845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 35639842 - 35639412
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35639842 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 35639743  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  35639742 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagct 35639643  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35639642 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 35639543  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35639542 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 35639443  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35639442 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 35639412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 47609739 - 47609309
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47609739 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttgg 47609640  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  47609639 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatagatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 47609540  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  47609539 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 47609440  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47609439 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 47609340  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  47609339 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 47609309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 4176320 - 4176750
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4176320 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 4176419  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  4176420 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggttttatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 4176519  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4176520 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 4176619  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4176620 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 4176719  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  4176720 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 4176750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12616126 - 12615696
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12616126 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 12616027  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  12616026 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 12615927  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12615926 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 12615827  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12615826 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 12615727  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12615726 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 12615696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36238233 - 36237803
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36238233 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 36238134  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  36238133 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 36238034  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36238033 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 36237934  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36237933 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 36237834  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  36237833 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 36237803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 38104103 - 38104533
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38104103 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttgg 38104202  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  38104203 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaaccaatagatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 38104302  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  38104303 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 38104402  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38104403 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 38104502  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  38104503 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 38104533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 12739546 - 12739976
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12739546 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattaatcttcatcagaatctccatcgggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 12739645  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  12739646 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 12739745  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12739746 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 12739845  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12739846 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 12739945  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12739946 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 12739976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 19186223 - 19186653
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19186223 tcaagcttgttggacagcatggccatctttacagattgatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 19186322  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  19186323 aagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 19186422  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19186423 aacaagatcttcaacacttaacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttacta 19186522  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19186523 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 19186622  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  19186623 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 19186653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 21876166 - 21876596
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21876166 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 21876265  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  21876266 aagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 21876365  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21876366 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 21876465  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21876466 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 21876565  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  21876566 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 21876596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 51630995 - 51630565
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51630995 tcaagcttgttggacagcatagcaatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 51630896  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  51630895 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 51630796  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  51630795 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 51630696  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  51630695 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 51630596  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  51630595 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 51630565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 445
Target Start/End: Original strand, 3180619 - 3181045
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3180619 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 3180718  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  3180719 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 3180818  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3180819 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 3180918  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3180919 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 3181018  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggacta 445  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||    
T  3181019 ttctgaaaagttcatactgatgaacta 3181045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 445
Target Start/End: Original strand, 5842222 - 5842648
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5842222 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 5842321  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |||| || ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  5842322 aagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 5842421  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5842422 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 5842521  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5842522 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 5842621  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggacta 445  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||    
T  5842622 ttctgaaaagttcatactgatgaacta 5842648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5641520 - 5641083
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5641520 tcaagcttgttggacagcatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 5641421  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttag-------aggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttga 211  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||       |||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  5641420 aagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactccttttagggtttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttga 5641321  T
Q  212 gggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaat 311  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  5641320 gtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaat 5641221  T
Q  312 cttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatca 411  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5641220 cttactgacatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatca 5641121  T
Q  412 tccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5641120 tccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcat 5641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 7516292 - 7516732
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7516292 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 7516391  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  7516392 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 7516491  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7516492 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttacta 7516591  T
Q  319 ----------acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctca 408  Q
              ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7516592 acatgatcagacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctca 7516691  T
Q  409 tcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7516692 tcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcat 7516732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 164 - 449
Target Start/End: Original strand, 38093622 - 38093907
Alignment:
Q  164 tcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctc 263  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38093622 tcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctc 38093721  T
Q  264 tatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtcca 363  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38093722 aatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatcca 38093821  T
Q  364 gatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  38093822 gaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcat 38093907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25449971 - 25449635
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||    
T  25449971 acttcccttttgatggtagagcaatggatttactctttttggaaggttcatgctcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgataagatcttc 25449872  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaa-ggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcaga 329  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25449871 aacactgaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatggcagtcacttttggtctccatctagaaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcaga 25449772  T
Q  330 agtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagc 429  Q
     |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  25449771 ggctacatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 25449672  T
Q  430 tcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  25449671 tcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 25449635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 134 - 466
Target Start/End: Original strand, 23023250 - 23023582
Alignment:
Q  134 ttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaac 233  Q
    |||||||  ||||||  ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  23023250 ttcctttgaatggtaaggcaatggattttcttttcttggatgactcatgttcattaagactaatctcatgaactttaagagagctgacaagatcttcaac 23023349  T
Q  234 acttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagta 333  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||      
T  23023350 acttagagtgttcaaatctttagcttcctcaatagcagtcaccttaggtctccatctagtaggtaagcttctgagtatcttgcttacatgatcagaagct 23023449  T
Q  334 acatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcat 433  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23023450 acatagcttttcttcagtatttgaattcctgaaactagagtttgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcat 23023549  T
Q  434 actgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  23023550 actgatgaacaagcataagagcctttgcttctc 23023582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21196406 - 21196071
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  21196406 acttccctttagatggtagatcaattgatttactcttcttagcaggctcatgttcatttagagttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 21196307  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || || |||||| ||    
T  21196306 aacacttaaagtgttcaaatctttagcttcctcaatagcagtgaccttacgtctccatctagaaggtaagtttcttagtatcttgctcacgtgatcaaaa 21196207  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| |||||||  |||| | | | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||    
T  21196206 gctacatagcatttcttcagtatttgaagtccaggaactagagtctaaaatcttgagtacatttcctcaatactttcaacatctttcattttgaacaact 21196107  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  21196106 catactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 21196071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21126077 - 21125742
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  21126077 actttccttttgattgtatagcaatggatttgcttttcttgaaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 21125978  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | || || ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  21125977 aacactcaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaggcttctaagtatcttgctcacatgatcagaa 21125878  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  21125877 gctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttcagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 21125778  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  21125777 catactaatgaacaagcataagagcttttgcttctc 21125742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21207526 - 21207191
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  21207526 actttccatttgatagtaaagcaatggatttgcttttcttgaaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 21207427  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | || || ||||||||||||| ||| | |||| | || ||||| || ||||||||||||    
T  21207426 aacactcaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaggcttatgagtatcttgctcacatgatcagaa 21207327  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21207326 gctacatatcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgaatacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagct 21207227  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||    
T  21207226 catattgatgaacaagcataaaagcttttgcttctc 21207191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 331
Target Start/End: Original strand, 18613443 - 18613746
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  18613443 tcaagcttgttggagagcataaccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatatggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 18613542  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| | ||| || ||||| ||||| || || ||    
T  18613543 atga---------ctcccctttagatggcagagcaatggatttactcttcttagcaggctcatgttcatttaaacttatctcatgaacctttagagagct 18613633  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||     
T  18613634 tacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggtaagcttctcagtatcttgctc 18613733  T
Q  319 acatgatcagaag 331  Q
    |||||||||||||    
T  18613734 acatgatcagaag 18613746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 463
Target Start/End: Original strand, 20943138 - 20943467
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattca---------gactcatttcatgtaccttgagggaactgac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |         |||| || ||||| || ||||  || |||||    
T  20943138 actttcctttagatggtagagcaattgatttactcttcttagcagactcatgttcatttactcttctttgactaatctcatgaactttgatagacctgac 20943237  T
Q  222 aagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaaca 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||             || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||    
T  20943238 aagatcttcaacacctaaagtgtttaaatctttagcttca------------accttaggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcaca 20943325  T
Q  322 tgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattt 421  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||| |||    
T  20943326 tgatcagaagtttcttagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttccttt 20943425  T
Q  422 tgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgctt 463  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20943426 tgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgctt 20943467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22431580 - 22431342
Alignment:
Q  228 ttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  22431580 ttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtctcttgctcacatgatca 22431481  T
Q  328 gaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaaca 427  Q
    || |  |||||||| |||||||||||||  |||||||  |||| | | | ||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  22431480 gaggctacatagcttttcttcagtatttaaagtccaggaactagagtctaaaatcttgagtacatttgctcaatactttgatcatctttcattttgaaca 22431381  T
Q  428 gctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
     |||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||    
T  22431380 actcatactgatgaacaagcataaaagcttttgcttctc 22431342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Original strand, 17720251 - 17720383
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  17720251 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcctcttagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 17720350  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctc 263  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17720351 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctc 17720383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 465
Target Start/End: Original strand, 9345251 - 9345488
Alignment:
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    ||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || | ||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  | ||||||    
T  9345251 atctttaacacttagaatgtttaaatccttaacttcctcaatagtagtaactttaggtctccatcaagcaggtaagcttcttagaatcttgttcacatga 9345350  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
       ||||  ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||   | ||||| |||||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||    
T  9345351 ---gaagctacataacttttcttcagtatctgaagtccagagactatggtctgaaaccttgagtacatagcctcaatgctttcatcatcattcatcttga 9345447  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    ||| || |||||||||  | ||||| | ||| |||||||||    
T  9345448 acaacttatactgatgagcaagcataatagcttttgcttct 9345488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22445032 - 22444931
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||    
T  22445032 acttcccttttgatggttgagcaatggatttactcttcttagaggattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaataagatcttc 22444933  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  22444932 aa 22444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22450266 - 22450165
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||    
T  22450266 acttcccttttgatggttgagcaatggatttactcttcttagaggattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaataagatcttc 22450167  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  22450166 aa 22450165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 17720157 - 17720231
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17720157 ttgttggagagcattgccatcttctcagtaggattttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17720231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 95
Target Start/End: Original strand, 23023159 - 23023220
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcaga 95  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23023159 agcatagccatcttctcagtaggatcctcatcagaatctccattcggtgattcttcttcaga 23023220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22445135 - 22445055
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22445135 tcaagcttgttggaaagcatagtcatcttctcagtagaatcttcatcaaaatctccattaggtgattcttcttcagattca 22445055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22450369 - 22450289
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22450369 tcaagcttgttggaaagcatagtcatcttctcagtagaatcttcatcaaaatctccattaggtgattcttcttcagattca 22450289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21196500 - 21196426
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| || ||||| |||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21196500 ttgttggagagcattgccatcttcttagtaggatcttcatctgaacctccatctggtgaatcttcttcagattca 21196426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 20943053 - 20943118
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20943053 agcattgccatcttctcagtaggattttcatctgaatctccattaggtgattcttcttcagattca 20943118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25450074 - 25449998
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcaga 95  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25450074 tcaagcttgttggagagcataaccatcttctcagtgggatcttcgtcagaatctccatcaggtgatttttcttcaga 25449998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 27857100 - 27857148
Alignment:
Q  56 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggc 104  Q
    |||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||    
T  27857100 gatcttcatcagaatctccagcaggagactcttcttcagattcattggc 27857148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 31563 - 32000
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31563 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcacagattgatcttaatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 31662  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31663 atga---------ctttccattagatggtagagcaatagatctattcttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgaaggaact 31753  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31754 gacaagatcttcaacacttaaagtgttaagatccttaacttcctcaatggcagtcactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcta 31853  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31854 acatgatcagaagcaacataactcttcttcaataattgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatatcctctatactctcatcatccttca 31953  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  31954 tcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttct 32000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1175 - 738
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1175 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttag 1076  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1075 atga---------ctttcctttagatggtagagcaatagatctattcttctttgaggattcatgctcattcaaactcatttcatgtactttgagggaact 985  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  984 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttaacttcctcaatagcagttactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 885  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  884 acatgatcagaagaaacataactcttattcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 785  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||    
T  784 tcttgaacagctcatactgattaactagcataagtgtctttgcttct 738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 44982 - 44561
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44982 tcaagcttgttagacaacatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggcgattcttgttcagattcactggccttgtaagctttgg 44883  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44882 atga---------ctttcctttagatggtagagcaataaacttactcttctttgaggacgcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaact 44792  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  44791 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttccttaatggcagtcacttaaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 44692  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44691 acatgatcagaagtaacataactctttttcattatttgcagtccagatattaaagtttgaaatcttgagtacatttcctctatactctcatcatccttca 44592  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44591 ttttgaacagctcatactgatgaactagcat 44561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 55285 - 54864
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55285 tcaagcttgttagacaacatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggcgattcttgttcagattcactggccttgtaagctttgg 55186  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  55185 atga---------ctttcctttagatggtagagcaataaacttactcttctttgaggacgcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaact 55095  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  55094 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttccttaatggcagtcacttaaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctt 54995  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54994 acatgatcagaagtaacataactctttttcattatttgcagtccagatattaaagtttgaaatcttgagtacatttcctctatactctcatcatccttca 54895  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54894 tcttgaacagctcatactgatgaactagcat 54864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 440
Target Start/End: Original strand, 9459 - 9548
Alignment:
Q  351 tatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatg 440  Q
    |||||| |||||||| |||| | | ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9459 tatttgaagtccagagactagagtctgatatcttgagtacatttcctcaatacattcatcatctttcatcttgaacaactcatactgatg 9548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 34 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3071 - 2648
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaaact 133  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||     |||    ||    
T  3071 agcatggccatctttacagactgatcttcatcagaatctccatctggcgattcttcttcagattcacaagccttgtatgctttaga-----tgg----ct 2981  T
Q  134 ttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaac 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2980 ttcctttatatggtagagcaatagatttactcttctttgaggactcatgctcattcagactcatttcatgaaccttgagggaactgacaagatcttcaac 2881  T
Q  234 acttaaagtgttt-agatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagt 332  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||     
T  2880 actcaaagtgttttagatccttagattcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgattagaagc 2781  T
Q  333 aacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctca 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2780 aacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactcacatcatccttcatcttgaacagctca 2681  T
Q  433 tactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  2680 tactgatgaactagcataagtgtctttgcttct 2648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38759 - 38329
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38759 tcaagcttgttggacagcatagccatttttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttgg 38660  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  38659 aagattttgagatctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagct 38560  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  38559 aacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttacta 38460  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38459 acatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 38360  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  38359 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcat 38329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0925 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0925
Description:

Target: scaffold0925; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4016 - 3601
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatt 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |       
T  4016 ttgttggaaagcatggccatctttatagattgatcttcatcagaatctccgtctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatg--- 3920  T
Q  125 tggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaag 224  Q
     ||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3919 -gg-----tttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaaatgacaag 3826  T
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  3825 atcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctcacatga 3726  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3725 tcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcacccttcatcttga 3626  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcat 449  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  3625 acagctcatactgatgaactagcat 3601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 166497 - 166060
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  166497 tcaagcttgttggaaagcatggccatctttacaaactgatcttcatcagaacctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttag 166398  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |     |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  166397 a-----tgg----ctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaact 166307  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  166306 gacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcttcaatggcagtaaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctc 166207  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttca 418  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  166206 tcatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttca 166107  T
Q  419 ttttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  166106 tcttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgcctttgcttct 166060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 67109 - 66948
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  67109 actttccttttgatggtagagcaatggattttcttttcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctc 67010  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctag 292  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||| || ||| | || || |||||||||||||    
T  67009 aacacttaaggtgtttaaatctctagcttcctcaatagcaatcacctttggtctccatctag 66948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 359 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 66917 - 66810
Alignment:
Q  359 gtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctt 458  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  66917 gtccagaaactagagtctgaaatcttgattacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagttcatactgatgaacaagcataagagcctt 66818  T
Q  459 tgcttctc 466  Q
    ||||||||    
T  66817 tgcttctc 66810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 67173 - 67133
Alignment:
Q  58 tcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattc 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  67173 tcttcatcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattc 67133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 131 - 465
Target Start/End: Original strand, 7 - 341
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7 actttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagatcttc 106  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  107 aacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatcagaa 206  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  207 gcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcatcttcaacagct 306  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  307 catactgatgaactagcataagtgcttttgcttct 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 132 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45446 - 45129
Alignment:
Q  132 ctttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttca 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  45446 ctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttca 45347  T
Q  232 acacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaag 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45346 acacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatgttactaacatgatcagaag 45247  T
Q  332 taacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctc 431  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  45246 caacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttc 45147  T
Q  432 atactgatggactagcat 449  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  45146 atactgatgaactagcat 45129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Original strand, 157516 - 157851
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  157516 acttccctttagatggtagagcaattgatttactcttcttagcaggctcatgttcatttagatttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttc 157615  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||| ||    
T  157616 aacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcaaaa 157715  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | ||    
T  157716 gctacatagcttttctttagtatttcaagtccagaaactagagtgtgaaatcttgagtacatttcctcgatactttcattatctttcattttgaaaaact 157815  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  157816 catactaatgaacaagcataagagcttttgcttctc 157851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 466
Target Start/End: Original strand, 35717 - 36149
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatt 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    | ||   |||||| || ||      
T  35717 ttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatga-- 35814  T
Q  125 tggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaag 224  Q
           ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  |||| ||  |||  ||    
T  35815 -------cttccctttatatggtagagcaatggatttactcttccaagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactctgagagagttgagtag 35907  T
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  35908 atcttcaaaacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctcagtatcttgctcacaaga 36007  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    ||||| |   ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  36008 tcagaggctgcatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttga 36107  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||| |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||    
T  36108 acaactcatactgatgaaaaagcataagagcttttgcttctc 36149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 466
Target Start/End: Original strand, 133777 - 134209
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatt 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    | ||   |||||| || ||      
T  133777 ttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatga-- 133874  T
Q  125 tggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaag 224  Q
           ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  |||| ||  |||  ||    
T  133875 -------cttccctttatatggtagagcaatggatttactcttccaagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactctgagagagttgagtag 133967  T
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  133968 atcttcaaaacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctcagtatcttgctcacaaga 134067  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    ||||| |   ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  134068 tcagaggctgcatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttga 134167  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||| |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||    
T  134168 acaactcatactgatgaaaaagcataagagcttttgcttctc 134209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 45594 - 45518
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcaga 95  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45594 tcaagcttgttggacaacatagccatctttacagattgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaga 45518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 157416 - 157496
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  157416 tcaagcttgttggagagcatttccatcttctcagcaggaccttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 157496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3304 - 3060
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3304 tcaagcttgttagacaacatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 3205  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3204 atga---------ctttcctttagatggtagagcaatagacttactcttctttgaggactcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaact 3114  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3113 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagt 3060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 340 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11813 - 11688
Alignment:
Q  340 ctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgat 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11813 ctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatatcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgat 11714  T
Q  440 ggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    | |||||||| || ||||||||||||    
T  11713 gaactagcataagtgcctttgcttct 11688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1157
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  1485 tcaagcttgttggaaagcatggccatctttacagaatgatcttcatcagaatcttcatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttag 1386  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    |     |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1385 a-----tgg----ctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaagactcatgctcatttaggctcatttcatgaaccttgagggaact 1295  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  1294 gacaagattttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttactc 1195  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttg 356  Q
    ||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||    
T  1194 acatgatcagacgctacatgactcttcttcagtatttg 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 208 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 904
Alignment:
Q  208 ttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctca 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1159 ttgagggaactgacaagattttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctca 1060  T
Q  308 gaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctc 407  Q
      |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  1059 atatcttactcacatgatcagacgctacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatctt--gtacatttcttctatactctc 962  T
Q  408 atcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  961 atcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttct 904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 226 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2609 - 2369
Alignment:
Q  226 tcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaa-ggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2609 tcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcacttttggtctccatctagaaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatga 2510  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2509 tcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcacccttcatcttga 2410  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  2409 acagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttct 2369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 202 - 1
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202 tcaagcttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 103  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | |         ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102 atg---------actttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgcttattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 12  T
Q  219 gacaagatctt 229  Q
    |||||||||||    
T  11 gacaagatctt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 53380 - 53109
Alignment:
Q  178 tcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactt 277  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53380 tcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactt 53281  T
Q  278 tgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttg 377  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||||| |||||| || ||| ||||    
T  53280 tgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgcaatccagaaaccaaagtttg 53181  T
Q  378 aaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcat 449  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| || |||||    
T  53180 aaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaataattcatactgatgaacaagcat 53109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27477 - 27043
Alignment:
Q  22 agtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaag 121  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||  ||||||| || |    
T  27477 agtttgtttgagagcattgccatcttttcagttggatcttcatcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacgaccttcaaagcttttgatg 27378  T
Q  122 atttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgac 221  Q
    |         ||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | |||    
T  27377 a---------ctttcctcttgatggtagagcaatggatttgcttttcttggaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagccgac 27287  T
Q  222 aagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||| || || ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||| || |||    
T  27286 aagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatctagcaggtaggcttctgagtatcttgctcaca 27187  T
Q  322 tgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattt 421  Q
    |||||||||   ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27186 tgatcagaatctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattt 27087  T
Q  422 tgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttct 465  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  27086 tgaacagctcatactaatgaacaagcataagagcttttgcttct 27043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 466
Target Start/End: Original strand, 209687 - 210118
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatt 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||  | ||      
T  209687 ttgtttgagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaagcttttaatga-- 209784  T
Q  125 tggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaag 224  Q
           ||||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||    
T  209785 -------ctttcctcttgatggtagagcaatggatttgcttttcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaag 209877  T
Q  225 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatga 324  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || ||||| || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||    
T  209878 atcctcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttaatcaatagcagtcacctttggtctccaactagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatga 209977  T
Q  325 tcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttga 424  Q
    |||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |   ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||    
T  209978 tcagaagctacatagcttttc-tcagtatttgaagtccagaaactagagcctgaaatcttgagtacatttgctcaatgctttcatcatctttcattttga 210076  T
Q  425 acagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  210077 acagctcataatgatgaacaagcataagagcctttgcttctc 210118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1913 - 1590
Alignment:
Q  137 ctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  | |||||| | ||| ||||| || ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1913 ctttagatggaagagcaatagattttgtcttcttagtaggctcatgtttatttagacttatctcatgaaccttgagagagttgacaagatcttcaacact 1814  T
Q  237 taaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaaca 336  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| || |  ||  |||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||    
T  1813 taaaatgtttaaatctttagcttcctcaatagttgtatctttaggtctccatctagcaagtaagcttctcagtatcttactcacatgatcagaagctaca 1714  T
Q  337 tagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatact 436  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1713 tagctcttcttcagtatttgaagttcaaaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatagtttcatcatctttcattttgaacaactcatact 1614  T
Q  437 gatggactagcattagagcctttg 460  Q
     ||| || ||||| ||||||||||    
T  1613 tatgaacaagcataagagcctttg 1590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2022 - 1944
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagatt 97  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2022 tcaagcttgttggaaagcatagtcatcttctcagtaggatctttatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagatt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 111416 - 110993
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagatttggaaaact 133  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     ||||  || |||| || ||         ||    
T  111416 agcatagccatcttctcagtaggatcttcgtcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaaacttttgatga---------ct 111326  T
Q  134 ttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaac 233  Q
    ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||| ||| |||||    
T  111325 ttcctcttgatggtagagcaatgtatttacttttcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaatatcctcaac 111226  T
Q  234 acttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagta 333  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||      
T  111225 acttaaagtgtttaaatctttaggttcctcaatagcagtcacctttggtcttcatctagcaggtaagcttctaagtatcttgttcacatgatcagaagct 111126  T
Q  334 acatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcat 433  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| | |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  111125 acatagattttcttcagtatttgaagtccataaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatattgtcatcatctttcattttgaacagctcat 111026  T
Q  434 actgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  111025 actgatgaacaagcataagagcctttgcttctc 110993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11798 - 11480
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  11798 acttccctttagatggtagagcaataaatttacttttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgagaaagctgacaagatcttc 11699  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||||||| | || || |||||  ||||||||||| ||    
T  11698 aacacttcaagtttttaaatctttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagatccttagtatcttgttaacatgatcataa 11599  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    | ||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||   |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  11598 gcaaagtaactcttcttcggtatttgtagtccagacactagggtttgaaacgttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaact 11499  T
Q  431 catactgatggactagcat 449  Q
    |||||||||| || |||||    
T  11498 catactgatgaacaagcat 11480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16471 - 16153
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16471 acttccctttagatggtagagcaataaatttacttttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgagaaagctgacaagatcttc 16372  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||||||| | || || |||||  ||||||||||| ||    
T  16371 aacacttcaagtttttaaatctttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagatccttagtatcttgttaacatgatcataa 16272  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    | ||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||   |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  16271 gcaaagtaactcttcttcggtatttgtagtccagacactagggtttgaaacgttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaact 16172  T
Q  431 catactgatggactagcat 449  Q
    |||||||||| || |||||    
T  16171 catactgatgaacaagcat 16153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11901 - 11823
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagatt 97  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  11901 tcaagcttgttggagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagagtctccatcaagtgactcttcttctgatt 11823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16574 - 16496
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagatt 97  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  16574 tcaagcttgttggagagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagagtctccatcaagtgactcttcttctgatt 16496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Original strand, 7046 - 7380
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||||||||||||||  ||  | || ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  7046 actttcctttagatgacagcacgattgatttactcttcttagtaggctcatgttcattgagactaatctcatgaactttgagagagctgacaagatcatc 7145  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  7146 aacacttaaattgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatcttgtaggtaaacttcttagtatcttgctcacatgatcagaa 7245  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||  | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  7246 gctacatagcttttctttagtatttgacgtccagaaact-gagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 7344  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  7345 catactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 7380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7027
Alignment:
Q  25 ttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6953 ttgttggagagcattgccatcttctcagtaggatcttcatctgactctccatcaggtgattcttcttcagattca 7027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22561 - 22330
Alignment:
Q  235 cttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaa 334  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||  || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||  ||    
T  22561 cttaaagtgtttaaatttttagcttccttaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagcttcttagtatcttgctaagatgatcataaacaa 22462  T
Q  335 catagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcata 434  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22461 cataacacttcttcagtatttgtagtccagagactaggatttgaaaccttgagtacatttcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcata 22362  T
Q  435 ctgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  22361 ctgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 22330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25818 - 25711
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  25818 acttccctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagcaggcgcatgttcatttagacttatttcatgaaccttgagagagctaacaagatcttc 25719  T
Q  231 aacactta 238  Q
    ||||||||    
T  25718 aacactta 25711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25920 - 25841
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  25920 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcaaagtctccatcaggtgactctt-ttcagattca 25841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 131 - 466
Target Start/End: Original strand, 47695 - 48029
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |  ||||| ||||| |||||  | ||||| || ||||| || || ||| |||| ||    
T  47695 acttccctttagatggcagagcaatggatttactcttcctaaaaggttcatgttcattaagacttctctcatgaactttgagagagctaacatgatcatc 47794  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaa 330  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  47795 aacact-aatgtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaaacttcttagtatcttgctcacatgatcagaa 47893  T
Q  331 gtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagct 430  Q
    |  |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| | | | ||||||| ||||||| | ||| ||||| | |||||| ||||| ||||||| ||    
T  47894 gctacatagcttttcttcaatatttgaagtccagaaactagagtcttaaatcttaagtacatttgctcaatacttttatcatctttcatattgaacaact 47993  T
Q  431 catactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  47994 catactgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 48029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 47592 - 47672
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47592 tcaagcttgttggaaagcatagctatcttctcagtaggatctccatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 47672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 413
Target Start/End: Original strand, 75641 - 75925
Alignment:
Q  130 aactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||   | || ||||||||||    
T  75641 aactttcctttagatggaagagcaatagattttttcttcttagcaaactcatgctcattgagacttatttcatgaaccttgaaatagcttacaagatctt 75740  T
Q  230 caacacttaaa-gtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcag 328  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |  || ||||| |||||  ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||  | |||||||||     
T  75741 caacactcaaaagtgtttaaatctttagcttctttaatagcagtaactttatgtctccatcaagcaggtaagcttatcagaatcttgttcacatgatcat 75840  T
Q  329 aagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatc 413  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||| | | ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||    
T  75841 aagcaacatagattttcttcagtatttgaagtcaagagactagagtctgaaatcatgagtacatttacttaatactttcatcatc 75925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 75554 - 75619
Alignment:
Q  34 agcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    |||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  75554 agcatacccatcttttcatattgatcttcatcagaatctccatcagaggattcttcttcagattca 75619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7516 - 7191
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||   |||||| |    
T  7516 tcaagcttgttagaaagcaaagccatcttcttagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttg 7417  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| |  ||||| || ||    
T  7416 atga---------cttccctttagatggtagagcaatggatttactctttctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaagtttgagagagct 7326  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttacta 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| ||     
T  7325 gacaagattttcaacacttaaagtgtttaaatatttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttctaagtatcttgctc 7226  T
Q  319 acatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtat 353  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  7225 acatgatcagaagctacatagcttttcttcagtat 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 273
Target Start/End: Original strand, 12331 - 12473
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  12331 actttcctttagatggtagagcaattgatttactcttcttagcaggctcatgttcattgagacttatctcatgaacattgagagagctgacaagatcttc 12430  T
Q  231 aacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagtt 273  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  12431 aacacttaaagtgtttaagtctttagcttcctctatagcagtt 12473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Original strand, 12268 - 12311
Alignment:
Q  56 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12268 gatcttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43547 - 43323
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||  ||||||| |    
T  43547 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttcaaagcttttg 43448  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
    | ||         ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  43447 atga---------cttccctttagatggtagagcaatagatttactccttttagtagactcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagct 43357  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcc 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43356 gacaagatcttaaacacttaaagtgtttaaatcc 43323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 43309 - 43219
Alignment:
Q  376 tgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||    
T  43309 tgaaaacttgagtacatttgctcaatactttcatcacctttcattttgaacaactcatactgatcaacaagcataagagcttttgcttctc 43219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 284 - 466
Target Start/End: Original strand, 1734 - 1916
Alignment:
Q  284 tccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatct 383  Q
    ||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | | ||||||||    
T  1734 tccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagctcttcttcggtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatct 1833  T
Q  384 tgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| |||||| || || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  1834 tgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattgtgaacaacttatgctgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Original strand, 12458 - 12532
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttca 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12458 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtgacttttcttca 12532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Original strand, 2514 - 2749
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttgg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||           | ||||      
T  2514 tcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcagaatatccatcaggtgattcttcttcagattca---------acaactttaa 2604  T
Q  119 aagatttggaaaactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaact 218  Q
     || ||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |  ||||| ||||| ||||  || || || || ||||| || ||    
T  2605 gagcttttgatgacttccctttagatggtagagtaatggatttaatcttcctagaaggttcatgttcattaagacatatctcgtgaactttgagagagct 2704  T
Q  219 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  2705 gacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatatttagcttcctc 2749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 466
Target Start/End: Original strand, 11243 - 11330
Alignment:
Q  379 aatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    |||||||||||||| |  || ||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  11243 aatcttgagtacatttggtcaatattttcatcatctttcattttgaacaactcatattaatgaacaagcataagagcttttgcttctc 11330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 114046 - 114110
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtga 83  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  114046 tcaagcttgttagacagcatggccatcttcacagattgatcttcatcagaatctccatctggtga 114110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 370
Target Start/End: Original strand, 2823 - 2970
Alignment:
Q  223 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacat 322  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||| ||| | | ||||| || ||||||||  | ||||    
T  2823 agatcttcgacacttagagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagtcactttaggtcaccatttagcacgtaagctccttagaatcttgttcacat 2922  T
Q  323 gatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatacta 370  Q
    ||||| ||   ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  2923 gatcaaaaactacataacttttcttcagtatttaaagtccagatacta 2970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 359 - 466
Target Start/End: Original strand, 17669 - 17776
Alignment:
Q  359 gtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctt 458  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||    
T  17669 gtccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttactcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttt 17768  T
Q  459 tgcttctc 466  Q
    ||||||||    
T  17769 tgcttctc 17776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Original strand, 14548 - 14629
Alignment:
Q  18 atcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14548 atcaagcttgttggaaagcatagccatcttctcagtaggatcttcatcaaaatcttcatcaagtgattcttcttcagattca 14629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Original strand, 17546 - 17630
Alignment:
Q  179 catgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctc 263  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17546 catgttcattgagacttatctcatgaacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctc 17630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 301 - 235
Alignment:
Q  400 atactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  301 atactttcatcatctttcattttgaacagctcatactaatgaacaagcataagagcctttgcttctc 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 8095
Alignment:
Q  400 atactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  8161 atactttcatcatctttcattttgaacagctcatactaatgaacaagcataagagcctttgcttctc 8095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3972 - 3892
Alignment:
Q  19 tcaagtttgttagacagcatagccatcttcacagaatgatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 99  Q
    ||||| ||||| || | |||||| |||||| ||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3972 tcaagcttgttggaaaacatagctatcttctcattatgatcttcaccagagtctccatcaggtgattcttcttcagattca 3892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3350 - 3180
Alignment:
Q  222 aagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaaca 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | | ||||||| || | ||| || || ||||||||  ||| | | || ||||| ||||||||  | |||    
T  3350 aagatcttcaacacttagagtatttagatcatcaacttcctcaatagaagtcaccttaggtctccacttagcaagtaaacttcttagaatcttgttcaca 3251  T
Q  322 tgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaaatttgaaatcttgagtacat 392  Q
    |||||| |||  |||||||| |||||||  || || |||||| | |||| | ||||||| |||||||||||    
T  3250 tgatcataagctacatagcttttcttcaaaatctgaagtccaaagactagagtttgaaaccttgagtacat 3180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 99026 - 98960
Alignment:
Q  400 atactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatggactagcattagagcctttgcttctc 466  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  99026 atactttcatcatctttcattttgaacacctcatactgatgaacaagcataagtgcttttgcttctc 98960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20191 - 20150
Alignment:
Q  131 actttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttag 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  20191 actttcctttagatggcagagcaatagattttgtcttcttag 20150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University