View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1498_high_177 (Length: 288)

Name: NF1498_high_177
Description: NF1498
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1498_high_177
NF1498_high_177
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (12-264)||(27593035-27593288)
chr6 (10-269)||(27611015-27611275)
chr6 (12-264)||(27678865-27679118)
chr6 (10-269)||(27718392-27718652)
chr6 (10-269)||(27724858-27725118)
chr6 (10-269)||(27698507-27698767)
chr6 (12-269)||(28781053-28781311)
chr6 (12-269)||(28786192-28786450)
chr6 (12-269)||(28792313-28792571)
chr6 (12-269)||(26802356-26802614)
chr6 (12-269)||(27604720-27604978)
chr6 (12-264)||(27677629-27677882)
chr6 (21-264)||(26646398-26646642)
chr6 (21-264)||(26752366-26752610)
chr6 (15-264)||(27531215-27531465)
chr6 (15-264)||(27706420-27706670)
chr6 (15-264)||(26884082-26884334)
chr6 (33-264)||(27338101-27338333)
chr6 (33-264)||(27398841-27399073)
chr6 (33-254)||(26655918-26656140)
chr6 (33-254)||(26761889-26762111)
chr6 (32-264)||(25579638-25579871)
chr6 (32-264)||(25481661-25481894)
chr6 (32-249)||(26142799-26143017)
chr6 (32-264)||(26055845-26056078)
chr6 (32-264)||(26075815-26076048)
chr6 (12-264)||(31284207-31284460)
chr6 (21-264)||(26622895-26623139)
chr6 (21-264)||(26728873-26729117)
chr6 (69-269)||(27229146-27229347)
chr6 (32-249)||(25538474-25538692)
chr6 (32-264)||(26048764-26048997)
chr6 (32-264)||(26069933-26070166)
chr6 (56-264)||(28234483-28234692)
chr6 (13-264)||(26861535-26861784)
chr6 (13-249)||(26823774-26824011)
chr6 (13-264)||(28242723-28242975)
chr6 (38-167)||(26341975-26342105)
chr6 (44-264)||(28226869-28227090)
chr6 (13-264)||(28139460-28139712)
chr6 (44-264)||(28181033-28181254)
chr6 (13-168)||(28149953-28150108)
chr6 (13-261)||(29825949-29826198)
chr6 (66-179)||(25506978-25507092)
chr6 (13-205)||(26937072-26937265)
chr6 (56-264)||(28185285-28185494)
chr6 (49-204)||(28325460-28325616)
chr6 (35-269)||(26848574-26848809)
chr6 (36-169)||(2184912-2185046)
chr6 (12-141)||(27427621-27427751)
chr6 (15-269)||(28098387-28098642)
chr6 (49-269)||(26635604-26635825)
chr6 (49-269)||(26741570-26741791)
chr6 (44-168)||(28297760-28297885)
chr6 (44-168)||(28514188-28514313)
chr6 (51-267)||(26974968-26975185)
chr6 (36-169)||(2184302-2184436)
chr6 (52-269)||(26959079-26959298)
chr6 (188-267)||(25071575-25071654)
chr6 (188-267)||(27665309-27665388)
chr6 (54-267)||(26949577-26949791)
chr6 (209-269)||(27427816-27427876)
chr6 (44-103)||(27214498-27214557)
chr6 (44-103)||(27234671-27234730)
chr6 (54-102)||(25071741-25071789)
chr6 (188-267)||(27214333-27214412)
chr6 (188-267)||(27234816-27234895)
chr6 (49-103)||(27665169-27665223)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (10-269)||(14369-14628)
scaffold0349 (15-269)||(3439-3695)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (10-264)||(4684-4939)
scaffold0277 (12-269)||(13647-13905)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (12-269)||(7439-7697)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (13-264)||(18679570-18679822)
chr4 (13-264)||(18724088-18724340)
chr4 (13-269)||(18699403-18699660)
chr4 (13-264)||(18655480-18655732)
chr4 (13-264)||(18731507-18731759)
chr4 (13-269)||(5090970-5091227)
chr4 (12-141)||(18073804-18073934)
chr4 (45-141)||(17989088-17989185)
chr4 (209-269)||(17989250-17989310)
chr4 (209-269)||(18073679-18073739)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (21-239)||(268368-268587)
chr1 (12-264)||(28127681-28127935)
chr1 (12-264)||(28164364-28164617)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (90-269)||(10-190)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (20-264)||(29273793-29274038)
chr8 (124-264)||(31903770-31903910)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (44-264)||(34644-34865)
scaffold0038 (13-264)||(42885-43137)
scaffold0038 (44-264)||(27367-27588)
scaffold0038 (49-204)||(116775-116931)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (49-264)||(58334-58550)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (49-170)||(3279701-3279823)
chr2 (49-102)||(17993736-17993789)
chr2 (134-267)||(17993822-17993955)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (12-141)||(59612-59742)
scaffold0003 (209-269)||(59487-59547)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 27593035 - 27593288
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593035 aagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 27593134  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27593135 acacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgat 27593234  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27593235 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtc 27593288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 27611015 - 27611275
Alignment:
Q  10 cgaagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611015 cgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 27611114  T
Q  110 aaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttg 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |    
T  27611115 aaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatgg 27611214  T
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27611215 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgc 27611275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27679118 - 27678865
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27679118 aagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaa 27679019  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  27679018 acacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgat 27678919  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27678918 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtc 27678865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 27718392 - 27718652
Alignment:
Q  10 cgaagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718392 cgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 27718491  T
Q  110 aaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttg 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |    
T  27718492 aaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgg 27718591  T
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  27718592 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgc 27718652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 27724858 - 27725118
Alignment:
Q  10 cgaagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27724858 cgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgataga 27724957  T
Q  110 aaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttg 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |    
T  27724958 aaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgg 27725057  T
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  27725058 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgc 27725118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 27698507 - 27698767
Alignment:
Q  10 cgaagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  27698507 cgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagaga 27698606  T
Q  110 aaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttg 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |    
T  27698607 aaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgg 27698706  T
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  27698707 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgc 27698767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28781311 - 28781053
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||    
T  28781311 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaa 28781212  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  28781211 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 28781112  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28781111 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgc 28781053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28786450 - 28786192
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||    
T  28786450 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaa 28786351  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  28786350 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 28786251  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28786250 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgc 28786192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28792571 - 28792313
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||    
T  28792571 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaa 28792472  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  28792471 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 28792372  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28792371 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgc 28792313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26802614 - 26802356
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  26802614 aagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaa 26802515  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||    
T  26802514 acacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 26802415  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26802414 tcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgc 26802356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Original strand, 27604720 - 27604978
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27604720 aagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaa 27604819  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |  ||    
T  27604820 acacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaat 27604919  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27604920 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgc 27604978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 27677629 - 27677882
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27677629 aagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaa 27677728  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||  |  ||||||||||||| |||    
T  27677729 acacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggat 27677828  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27677829 tcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtc 27677882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26646642 - 26646398
Alignment:
Q  21 ggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaa 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26646642 ggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 26646543  T
Q  120 taaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |   ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26646542 taaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtc 26646443  T
Q  220 agtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  26646442 agtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtc 26646398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26752610 - 26752366
Alignment:
Q  21 ggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaa 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26752610 ggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 26752511  T
Q  120 taaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |   ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26752510 taaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtc 26752411  T
Q  220 agtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  26752410 agtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtc 26752366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Original strand, 27531215 - 27531465
Alignment:
Q  15 aaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-a 113  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |    
T  27531215 aaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaata 27531314  T
Q  114 caggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcc 213  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  27531315 cgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcc 27531414  T
Q  214 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27531415 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtc 27531465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Original strand, 27706420 - 27706670
Alignment:
Q  15 aaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-a 113  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27706420 aaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaaca 27706519  T
Q  114 caggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcc 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||   ||  |  ||||||||||||| ||||||    
T  27706520 caggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcc 27706619  T
Q  214 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||  || ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  27706620 cttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtc 27706670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26884334 - 26884082
Alignment:
Q  15 aaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatg--gacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  26884334 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaa 26884235  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  26884234 tattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggatt 26884135  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  26884134 cccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtc 26884082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 264
Target Start/End: Original strand, 27338101 - 27338333
Alignment:
Q  33 caaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctag 131  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||    
T  27338101 caaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctag 27338200  T
Q  132 attcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcctt 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27338201 actcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagcctt 27338300  T
Q  232 gtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  27338301 gtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtc 27338333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 264
Target Start/End: Original strand, 27398841 - 27399073
Alignment:
Q  33 caaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctag 131  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||    
T  27398841 caaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctag 27398940  T
Q  132 attcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcctt 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27398941 actcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagcctt 27399040  T
Q  232 gtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  27399041 gtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtc 27399073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26656140 - 26655918
Alignment:
Q  33 caaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctag 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |    
T  26656140 caaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctgg 26656041  T
Q  132 attcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcctt 231  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  26656040 attcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagcctt 26655941  T
Q  232 gtagagatttccggtaaaaccgt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  26655940 gtagagattgccggtaaaaccgt 26655918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26762111 - 26761889
Alignment:
Q  33 caaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctag 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |    
T  26762111 caaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctgg 26762012  T
Q  132 attcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcctt 231  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  26762011 attcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagcctt 26761912  T
Q  232 gtagagatttccggtaaaaccgt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  26761911 gtagagattgccggtaaaaccgt 26761889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25579871 - 25579638
Alignment:
Q  32 gcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatccta 130  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||    
T  25579871 gcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccta 25579772  T
Q  131 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcct 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||    ||||||||||||  ||||||||    
T  25579771 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagcct 25579672  T
Q  231 tgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  25579671 tatagagattaccggtaaaagtgttgcgagtgtc 25579638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25481894 - 25481661
Alignment:
Q  32 gcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatccta 130  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| ||||||||    
T  25481894 gcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatccta 25481795  T
Q  131 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcct 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||||    
T  25481794 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagcct 25481695  T
Q  231 tgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  25481694 tatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtc 25481661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26143017 - 26142799
Alignment:
Q  32 gcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatccta 130  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||    
T  26143017 gcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccta 26142918  T
Q  131 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcct 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||||    
T  26142917 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagcct 26142818  T
Q  231 tgtagagatttccggtaaa 249  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  26142817 tatagagattaccggtaaa 26142799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26056078 - 26055845
Alignment:
Q  32 gcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatccta 130  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |    
T  26056078 gcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccca 26055979  T
Q  131 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcct 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||    
T  26055978 gattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagcct 26055879  T
Q  231 tgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  26055878 tatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtc 26055845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26076048 - 26075815
Alignment:
Q  32 gcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatccta 130  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |    
T  26076048 gcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccca 26075949  T
Q  131 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcct 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||    
T  26075948 gattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagcct 26075849  T
Q  231 tgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  26075848 tatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtc 26075815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31284460 - 31284207
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  31284460 aagaaaacgggcaaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaa 31284361  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | || || |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||   | | |||||||||||||||| |||    
T  31284360 acacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggat 31284261  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  31284260 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtc 31284207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26623139 - 26622895
Alignment:
Q  21 ggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaa 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |||||||    
T  26623139 ggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaa 26623040  T
Q  120 taaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtc 219  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||   |   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26623039 taaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtc 26622940  T
Q  220 agtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26622939 agtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtc 26622895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26729117 - 26728873
Alignment:
Q  21 ggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaa 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |||||||    
T  26729117 ggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaa 26729018  T
Q  120 taaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtc 219  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||   |   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26729017 taaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtc 26728918  T
Q  220 agtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26728917 agtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtc 26728873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229146
Alignment:
Q  69 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 167  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  168 catttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggt 267  Q
    | | |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  268 gc 269  Q
    ||    
T  27229147 gc 27229146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25538692 - 25538474
Alignment:
Q  32 gcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatccta 130  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| |||    
T  25538692 gcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattcta 25538593  T
Q  131 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcct 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||  ||||||||    
T  25538592 gattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagcct 25538493  T
Q  231 tgtagagatttccggtaaa 249  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  25538492 tatagagattaccggtaaa 25538474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26048997 - 26048764
Alignment:
Q  32 gcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatccta 130  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||    
T  26048997 gcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccta 26048898  T
Q  131 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcct 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||    |||||||||||| | |||||||    
T  26048897 gattcttccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagcct 26048798  T
Q  231 tgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  26048797 tatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtc 26048764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26070166 - 26069933
Alignment:
Q  32 gcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatccta 130  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||    
T  26070166 gcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccta 26070067  T
Q  131 gattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcct 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||    |||||||||||| | |||||||    
T  26070066 gattcttccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagcct 26069967  T
Q  231 tgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  26069966 tatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtc 26069933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28234692 - 28234483
Alignment:
Q  56 aatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagt 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28234692 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28234593  T
Q  155 gatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgt 254  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  28234592 gatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccat 28234493  T
Q  255 agcgagtgtc 264  Q
    ||||||||||    
T  28234492 agcgagtgtc 28234483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26861784 - 26861535
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||  |||| ||   | |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  26861784 agaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttgcag---ttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaa 26861688  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||  | |||||||||  |||||||||||   |   ||||| ||||||||||  |||    
T  26861687 cacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaatt 26861588  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26861587 cccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagtgtc 26861535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26824011 - 26823774
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  26824011 agaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaa 26823912  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||  ||||| ||  |||||||||||   |   |||||||  ||||||| ||||    
T  26823911 cacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggatt 26823812  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaa 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26823811 cccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaa 26823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28242975 - 28242723
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  28242975 agaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaa 28242876  T
Q  112 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |  |||| | ||||     |||||||||||||||||   |||    
T  28242875 gacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaatt 28242776  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||| | |  |||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  28242775 cccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtc 28242723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Original strand, 26341975 - 26342105
Alignment:
Q  38 ctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattct 136  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| || |||    
T  26341975 ctttgccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactct 26342074  T
Q  137 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 167  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26342075 tcaatggctttgacaagtgattgtgtgattt 26342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28227090 - 28226869
Alignment:
Q  44 cttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 142  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28227090 cttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatg 28226991  T
Q  143 gccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 242  Q
     |||||| |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||     | ||||||| ||| ||||  |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||    
T  28226990 accttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttc 28226891  T
Q  243 cggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| || ||||||||    
T  28226890 cagtaaaaccataacgagtgtc 28226869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28139712 - 28139460
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||||| ||||||||| |  || |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28139712 agaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaa 28139613  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| |  |||| ||||||     | |||||||| || |||| ||||    
T  28139612 cacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggatt 28139513  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||   ||||  |||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  28139512 ccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaaccgaaacgagtgtc 28139460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28181254 - 28181033
Alignment:
Q  44 cttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 142  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28181254 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatg 28181155  T
Q  143 gccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 242  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |  |||| ||||||     ||||||| ||||||||   |||||||||||||  ||||||  | | ||||||||    
T  28181154 gccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttc 28181055  T
Q  243 cggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| || ||||||||    
T  28181054 cagtaaaaccataacgagtgtc 28181033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28150108 - 28149953
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 111  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  28150108 agaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaa 28150009  T
Q  112 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttc 168  Q
     |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28150008 gattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttc 28149953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29826198 - 29825949
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 111  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||   || | ||  ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  29826198 agaaaataggcaaaacgagacgacccttcctcttgacacactcaactatatgcacaagttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaa 29826099  T
Q  112 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
    || ||||||    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||   |||    
T  29826098 aataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaatt 29825999  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagt 261  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  29825998 ttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaaccaaagcgagt 29825949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 179
Target Start/End: Original strand, 25506978 - 25507092
Alignment:
Q  66 acaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa-aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtga 164  Q
    |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  25506978 acaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtga 25507077  T
Q  165 tttcatttcctcttt 179  Q
    |||||| ||||||||    
T  25507078 tttcatctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26937265 - 26937072
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 111  Q
    |||||||||||||||  ||   ||| ||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26937265 agaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaa 26937166  T
Q  112 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtg 205  Q
     ||||| ||   |||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||    ||||||||||||||||||    
T  26937165 tacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggtg 26937072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28185494 - 28185285
Alignment:
Q  56 aatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagt 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28185494 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28185395  T
Q  155 gatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgt 254  Q
    |||| ||| ||||| |  |||| ||||||     ||||||| ||||||||   |||||||||||||  ||||||  | | ||||||||| |||||||  |    
T  28185394 gatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacgat 28185295  T
Q  255 agcgagtgtc 264  Q
    | ||||||||    
T  28185294 aacgagtgtc 28185285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325460
Alignment:
Q  49 agcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 147  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  148 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggt 204  Q
    || |||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggt 28325460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26848809 - 26848574
Alignment:
Q  35 accctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagat 133  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| || ||| ||||  ||||||| ||     
T  26848809 acccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgag 26848710  T
Q  134 tcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgt 233  Q
    |||||||||  |||||  || || |||||||| ||||  || || ||||||   |||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||| || |    
T  26848709 tcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttat 26848610  T
Q  234 agagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    ||||||| || || |||| | | | |||||||||||    
T  26848609 agagattaccagtgaaactgaatctagtgtcggtgc 26848574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2185046 - 2184912
Alignment:
Q  36 ccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagatt 134  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   | || |||||||| || ||||| || ||||    
T  2185046 ccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaaaacagggatgaaaattctggatt 2184947  T
Q  135 cttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttca 169  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  2184946 cttcaatggctttcacaagcgatggtgttatttca 2184912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Original strand, 27427621 - 27427751
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||    
T  27427621 aagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaa 27427720  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaat 141  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27427721 atatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Original strand, 28098387 - 28098642
Alignment:
Q  15 aaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtctt-gtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaa 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||     
T  28098387 aaaataggaaaaacgaagcaacccttt-tcttcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaag 28098485  T
Q  113 acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattc 212  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||   ||||||   || |  ||||||||||||  || ||    
T  28098486 accggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgacaagggattgtgtgattctatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactc 28098585  T
Q  213 ccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |   ||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  28098586 ctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaaccataccgagtgtcggtgc 28098642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635604
Alignment:
Q  49 agcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| |||||   |||   |||||| || |||||||||  |||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26635726  T
Q  148 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggta 247  Q
    ||  || || |||||||||||||  ||| ||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| || |||||     
T  26635725 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtg 26635626  T
Q  248 aaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  26635625 aaaccgaattgagtgtcggtgc 26635604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741570
Alignment:
Q  49 agcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| |||||   |||   |||||| || |||||||||  |||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26741692  T
Q  148 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggta 247  Q
    ||  || || |||||||||||||  ||| ||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| || |||||     
T  26741691 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtg 26741592  T
Q  248 aaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  26741591 aaaccgaattgagtgtcggtgc 26741570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 168
Target Start/End: Original strand, 28297760 - 28297885
Alignment:
Q  44 cttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 142  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28297760 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28297859  T
Q  143 gccttgacaagtgatggtgtgatttc 168  Q
      ||||| |||||||||||| |||||    
T  28297860 tgcttgaaaagtgatggtgttatttc 28297885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28514313 - 28514188
Alignment:
Q  44 cttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 142  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28514313 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28514214  T
Q  143 gccttgacaagtgatggtgtgatttc 168  Q
      ||||| |||||||||||| |||||    
T  28514213 tgcttgaaaagtgatggtgttatttc 28514188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26975185 - 26974968
Alignment:
Q  51 caatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttga 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   |||||| || |||||||||  |||||    
T  26975185 caatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggtaatcctcgagtcttcaatgctcttga 26975086  T
Q  150 caagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaa 249  Q
      || || ||||||||||| |  ||| ||| |||    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||||| ||    
T  26975085 ggagcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaa 26974986  T
Q  250 accgtagcgagtgtcggt 267  Q
    |||| | |||||||||||    
T  26974985 accgaatcgagtgtcggt 26974968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2184436 - 2184302
Alignment:
Q  36 ccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagatt 134  Q
    ||||||| |||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||||| || || |    
T  2184436 ccctttgacttggagtaacgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattctggact 2184337  T
Q  135 cttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttca 169  Q
    |||||||||| || | |||||||| ||| ||||||    
T  2184336 cttcaatggctttcataagtgatgctgttatttca 2184302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26959298 - 26959079
Alignment:
Q  52 aatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt-ga 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |   |||| |||||   |||   |||||| || |||||||||  ||| ||    
T  26959298 aatgaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgagtcttcaatgctctttga 26959199  T
Q  150 caagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaa 249  Q
     ||| || |||||||||||||  ||| ||| |||    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||||| ||    
T  26959198 gaagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaa 26959099  T
Q  250 accgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    || | | |||||||||||||    
T  26959098 actgaatcgagtgtcggtgc 26959079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25071654 - 25071575
Alignment:
Q  188 ttgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggt 267  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  25071654 ttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagctttataaagattaccggtaaaaccgaatcgagtgtcggt 25071575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Original strand, 27665309 - 27665388
Alignment:
Q  188 ttgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggt 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||||    
T  27665309 ttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtgaaaccaaatcgagtgtcggt 27665388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26949791 - 26949577
Alignment:
Q  54 tgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |   ||||||| ||   |||   ||| || |||||||||||   |||||  |    
T  26949791 tgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatattccttagaaaagacgataatggcaattctcgattcttcaattctcttgagga 26949692  T
Q  153 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 252  Q
    |||| ||||||||||| |  ||| | |||||    || ||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  26949691 gtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccggtgaaacc 26949592  T
Q  253 gtagcgagtgtcggt 267  Q
    | | |||||||||||    
T  26949591 gaatcgagtgtcggt 26949577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 269
Target Start/End: Original strand, 27427816 - 27427876
Alignment:
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27427816 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgc 27427876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 27214557 - 27214498
Alignment:
Q  44 cttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagtt 103  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27214557 cttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27214498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 103
Target Start/End: Original strand, 27234671 - 27234730
Alignment:
Q  44 cttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagtt 103  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27234671 cttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25071789 - 25071741
Alignment:
Q  54 tgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  25071789 tgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27214412 - 27214333
Alignment:
Q  188 ttgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggt 267  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||  |||||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  27214412 ttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtcggt 27214333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Original strand, 27234816 - 27234895
Alignment:
Q  188 ttgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggt 267  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||  |||||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  27234816 ttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtcggt 27234895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665223
Alignment:
Q  49 agcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagtt 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 14369 - 14628
Alignment:
Q  10 cgaagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14369 cgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgataga 14467  T
Q  110 aaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttg 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |    
T  14468 aaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgg 14567  T
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  14568 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgc 14628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Original strand, 3439 - 3695
Alignment:
Q  15 aaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatag-ttgatagaaaa- 112  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  3439 aaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaac 3538  T
Q  113 acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||    
T  3539 acaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattc 3638  T
Q  213 ccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  3639 ccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgc 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 264
Target Start/End: Original strand, 4684 - 4939
Alignment:
Q  10 cgaagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  4684 cgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagataga 4783  T
Q  110 aaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttg 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  4784 aaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttg 4883  T
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4884 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtc 4939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Original strand, 13647 - 13905
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||    
T  13647 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaa 13746  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  13747 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 13846  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13847 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgc 13905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7697 - 7439
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||    
T  7697 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaa 7598  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  7597 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 7498  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7497 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgc 7439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 18679570 - 18679822
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18679570 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18679669  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||| ||   |  ||||||||||||||||| ||||    
T  18679670 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18679769  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||    
T  18679770 cctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtc 18679822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 18724088 - 18724340
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18724088 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18724187  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||| ||   |  ||||||||||||||||| ||||    
T  18724188 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18724287  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||    
T  18724288 cccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtc 18724340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 18699403 - 18699660
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18699403 agaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18699502  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||  || ||||| ||   |  ||||||||||||||||| ||||    
T  18699503 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18699602  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||  |||||||| ||||    
T  18699603 cccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgc 18699660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 18655480 - 18655732
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18655480 agaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18655579  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||  || ||||| ||   |  ||||||||||||||||| ||||    
T  18655580 cacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18655679  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||  ||||||||    
T  18655680 cccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtc 18655732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 18731507 - 18731759
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 112  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18731507 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18731606  T
Q  113 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||| ||   |  ||||||||||||||||| ||||    
T  18731607 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18731706  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||  ||||||||    
T  18731707 cccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtc 18731759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 5090970 - 5091227
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  5090970 agaaaataggcaaaaccaggcaaccattttccttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaa 5091069  T
Q  112 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
    |||   ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||  |||||     ||||||||||||||||||  |||    
T  5091070 aacgataatgacaatcttagattcttgaatggccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaatt 5091169  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||| ||   ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5091170 cccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgc 5091227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18073934 - 18073804
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||    
T  18073934 aagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaa 18073835  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaat 141  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18073834 atatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 17989088 - 17989185
Alignment:
Q  45 ttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaat 141  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17989088 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 269
Target Start/End: Original strand, 17989250 - 17989310
Alignment:
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17989250 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgc 17989310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18073739 - 18073679
Alignment:
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18073739 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgc 18073679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 268368 - 268587
Alignment:
Q  21 ggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaa 119  Q
    ||||||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  268368 ggcaaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 268467  T
Q  120 taaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtc 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||   |   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  268468 taaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtc 268567  T
Q  220 agtaagagccttgtagagat 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  268568 agtaagagccttgtagagat 268587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 28127681 - 28127935
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28127681 aagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaa 28127780  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatt-tcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttga 209  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  || |||||| | ||||  |   ||||||||||| |||| ||    
T  28127781 atacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtgga 28127880  T
Q  210 ttcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || || |||||||  ||||||||    
T  28127881 ttcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtc 28127935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 28164364 - 28164617
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-a 110  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28164364 aagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagata 28164463  T
Q  111 aaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgat 210  Q
    | |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| | |||||| | ||||  |   ||||||||||| ||||  ||    
T  28164464 acacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaat 28164563  T
Q  211 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||   ||| ||||| |||||||  || || |||||||  ||||||||    
T  28164564 tcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtc 28164617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 10 - 190
Alignment:
Q  90 gaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaat 188  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  189 tgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgc 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Original strand, 29273793 - 29274038
Alignment:
Q  20 aggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acagga 118  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29273793 aggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagga 29273892  T
Q  119 ataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgt 218  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| | |||||||||  |||||||||||   |   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29273893 ataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgt 29273992  T
Q  219 cagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||  ||||||||    
T  29273993 cagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtc 29274038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31903910 - 31903770
Alignment:
Q  124 aatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagta 223  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    |  || ||||| ||||||| ||||||||| |||  |    
T  31903910 aatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataa 31903811  T
Q  224 agagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31903810 agagctttgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtc 31903770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34865 - 34644
Alignment:
Q  44 cttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatg 142  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34865 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatg 34766  T
Q  143 gccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 242  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||  | |||||||||     
T  34765 gccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagatttt 34666  T
Q  243 cggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  34665 cggtaaaaccatagcgagtgtc 34644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43137 - 42885
Alignment:
Q  13 agaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  43137 agaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaa 43038  T
Q  112 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 211  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |  |||| | ||||     |||||||||||||||||   |||    
T  43037 gacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaatt 42938  T
Q  212 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||| | |  |||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  42937 cccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtc 42885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27588 - 27367
Alignment:
Q  44 cttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 142  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27588 cttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatg 27489  T
Q  143 gccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 242  Q
     |||||| |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||     | ||||||| ||| ||||  |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||    
T  27488 accttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttc 27389  T
Q  243 cggtaaaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    | |||||||| || ||||||||    
T  27388 cagtaaaaccataacgagtgtc 27367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116775
Alignment:
Q  49 agcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 147  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  148 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggt 204  Q
    || |||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggt 116775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 264
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58550
Alignment:
Q  49 agcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 147  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  148 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggta 247  Q
    || |||||||||||| ||||| |  |||| ||||||     ||||||| ||||||||   |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  248 aaaccgtagcgagtgtc 264  Q
    ||||| |||||||||||    
T  58534 aaaccatagcgagtgtc 58550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279701
Alignment:
Q  49 agcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  148 gacaagtgatggtgtgatttcat 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcat 3279701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 102
Target Start/End: Original strand, 17993736 - 17993789
Alignment:
Q  49 agcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 102  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  17993736 agcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 17993789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Original strand, 17993822 - 17993955
Alignment:
Q  134 tcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgt 233  Q
    |||||||||  |||||  || || |||||||||||||  ||||| |||||    |||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||||| || |    
T  17993822 tcttcaatgctcttgaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttat 17993921  T
Q  234 agagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggt 267  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  17993922 agagattaccggtgaaaccatatcgagtatcggt 17993955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 59742 - 59612
Alignment:
Q  12 aagaaaataggcaaaacgaggcaaccctttgtcttgtagcaatgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||    
T  59742 aagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaa 59643  T
Q  112 a-acaggaataaaaatcctagattcttcaat 141  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  59642 atatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 59547 - 59487
Alignment:
Q  209 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtagcgagtgtcggtgc 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  59547 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgc 59487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University