View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1498_low_136 (Length: 338)

Name: NF1498_low_136
Description: NF1498
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1498_low_136
NF1498_low_136
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-322)||(50779-51100)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (1-322)||(27911193-27911514)
chr5 (1-322)||(18510611-18510932)
chr5 (1-322)||(658779-659100)
chr5 (1-322)||(20043745-20044054)
chr5 (74-322)||(31467090-31467340)
chr5 (138-322)||(20505064-20505248)
chr5 (138-296)||(6746305-6746463)
chr5 (160-322)||(25806350-25806512)
chr5 (148-320)||(18467931-18468103)
chr5 (138-296)||(15355736-15355894)
chr5 (138-296)||(31543967-31544125)
chr5 (138-296)||(34478306-34478464)
chr5 (138-283)||(10750932-10751077)
chr5 (138-296)||(23666280-23666439)
chr5 (1-130)||(25806222-25806351)
chr5 (1-145)||(6745829-6745973)
chr5 (1-143)||(10750459-10750601)
chr5 (1-143)||(15356225-15356367)
chr5 (1-143)||(23665807-23665949)
chr5 (1-145)||(31543494-31543638)
chr5 (1-145)||(34478793-34478937)
chr5 (231-311)||(29721638-29721718)
chr5 (138-311)||(13487200-13487370)
chr5 (231-322)||(16545707-16545798)
chr5 (1-144)||(18467445-18467588)
chr5 (231-297)||(16408600-16408666)
chr5 (4-143)||(9788554-9788693)
chr5 (4-143)||(26171463-26171602)
chr5 (4-143)||(29721071-29721210)
chr5 (231-304)||(26174045-26174118)
chr5 (231-311)||(40381383-40381463)
chr5 (196-292)||(42427276-42427372)
chr5 (4-143)||(16408031-16408170)
chr5 (138-311)||(534913-535080)
chr5 (4-69)||(16545136-16545201)
chr5 (4-69)||(42427838-42427903)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-322)||(14788630-14788951)
chr4 (1-296)||(22801960-22802255)
chr4 (1-322)||(47563570-47563891)
chr4 (1-322)||(16454118-16454441)
chr4 (1-296)||(36920721-36921016)
chr4 (138-322)||(22133478-22133662)
chr4 (138-322)||(5099771-5099955)
chr4 (104-322)||(36379144-36379362)
chr4 (138-296)||(22781624-22781782)
chr4 (138-322)||(12401954-12402138)
chr4 (138-296)||(16933035-16933193)
chr4 (138-296)||(9175360-9175518)
chr4 (138-296)||(11007455-11007613)
chr4 (138-322)||(12399679-12399863)
chr4 (138-296)||(22045601-22045760)
chr4 (1-145)||(22133991-22134135)
chr4 (231-322)||(36770496-36770587)
chr4 (165-311)||(10113822-10113968)
chr4 (1-236)||(18536788-18537022)
chr4 (1-145)||(22046089-22046233)
chr4 (138-292)||(34571440-34571591)
chr4 (167-311)||(12740555-12740699)
chr4 (167-311)||(12748761-12748905)
chr4 (1-143)||(22782113-22782255)
chr4 (158-293)||(3577934-3578070)
chr4 (231-311)||(8394685-8394765)
chr4 (1-145)||(11007942-11008086)
chr4 (1-105)||(12402510-12402614)
chr4 (1-145)||(16933522-16933666)
chr4 (178-297)||(26558915-26559034)
chr4 (1-46)||(36379099-36379144)
chr4 (142-322)||(5137271-5137450)
chr4 (4-143)||(5872511-5872650)
chr4 (233-296)||(18536029-18536092)
chr4 (1-143)||(9175848-9175990)
chr4 (3-105)||(12395274-12395376)
chr4 (3-105)||(12400236-12400338)
chr4 (238-311)||(47565625-47565698)
chr4 (231-311)||(7123975-7124055)
chr4 (138-291)||(5206506-5206655)
chr4 (259-322)||(47565681-47565744)
chr4 (4-143)||(52094695-52094834)
chr4 (4-117)||(10113676-10113789)
chr4 (4-69)||(5136788-5136853)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-322)||(80627-80948)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-322)||(53916871-53917192)
chr3 (1-322)||(3315422-3315743)
chr3 (1-322)||(42991039-42991360)
chr3 (1-323)||(28101204-28101526)
chr3 (1-322)||(43422667-43422986)
chr3 (138-322)||(18098029-18098213)
chr3 (138-296)||(11169314-11169472)
chr3 (138-296)||(457120-457278)
chr3 (138-290)||(6064686-6064838)
chr3 (119-322)||(891104-891307)
chr3 (138-296)||(5898625-5898783)
chr3 (138-296)||(10957210-10957368)
chr3 (138-296)||(43227293-43227451)
chr3 (140-296)||(4309394-4309550)
chr3 (138-322)||(23634643-23634824)
chr3 (165-322)||(25634738-25634892)
chr3 (1-143)||(456647-456789)
chr3 (1-145)||(10957697-10957841)
chr3 (1-145)||(11168841-11168985)
chr3 (1-145)||(18098545-18098689)
chr3 (167-322)||(23198950-23199105)
chr3 (138-311)||(29812045-29812215)
chr3 (1-143)||(6065169-6065311)
chr3 (169-311)||(7763473-7763615)
chr3 (1-145)||(4309884-4310028)
chr3 (1-145)||(7769295-7769439)
chr3 (1-145)||(43226817-43226961)
chr3 (1-139)||(27421378-27421516)
chr3 (178-291)||(15824698-15824811)
chr3 (1-145)||(5192390-5192534)
chr3 (1-145)||(23634185-23634329)
chr3 (178-322)||(27421889-27422033)
chr3 (167-293)||(5259163-5259289)
chr3 (231-322)||(4599529-4599620)
chr3 (231-322)||(10210465-10210556)
chr3 (174-314)||(1619711-1619851)
chr3 (1-145)||(5898149-5898293)
chr3 (231-322)||(10057512-10057603)
chr3 (231-322)||(10059734-10059825)
chr3 (231-322)||(10061956-10062047)
chr3 (231-322)||(10064178-10064269)
chr3 (231-322)||(10066400-10066491)
chr3 (138-291)||(32892264-32892414)
chr3 (4-143)||(5259655-5259794)
chr3 (231-322)||(6717776-6717867)
chr3 (4-143)||(23199471-23199610)
chr3 (1-80)||(25634617-25634696)
chr3 (4-143)||(37407385-37407524)
chr3 (1-57)||(1619936-1619992)
chr3 (178-302)||(7769763-7769887)
chr3 (4-143)||(10209897-10210036)
chr3 (4-69)||(4600126-4600191)
chr3 (4-69)||(10056941-10057006)
chr3 (4-69)||(10061385-10061450)
chr3 (4-69)||(10063607-10063672)
chr3 (4-69)||(10065829-10065894)
chr3 (31-68)||(24933175-24933212)
chr3 (234-291)||(27882632-27882689)
chr3 (7-59)||(23409748-23409800)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (1-322)||(28486335-28486656)
chr7 (1-296)||(7471204-7471499)
chr7 (1-296)||(20298085-20298380)
chr7 (1-322)||(24749357-24749678)
chr7 (55-322)||(4293914-4294181)
chr7 (1-314)||(21678829-21679142)
chr7 (73-322)||(9679500-9679749)
chr7 (138-296)||(1048176-1048334)
chr7 (138-296)||(7350538-7350696)
chr7 (138-317)||(44725826-44726005)
chr7 (138-296)||(31157172-31157330)
chr7 (138-296)||(22136046-22136205)
chr7 (138-296)||(40551073-40551232)
chr7 (138-296)||(7093348-7093506)
chr7 (138-296)||(38395227-38395385)
chr7 (165-322)||(24816224-24816381)
chr7 (1-145)||(38394756-38394900)
chr7 (138-293)||(48490580-48490732)
chr7 (1-145)||(1048663-1048807)
chr7 (1-145)||(7093835-7093979)
chr7 (1-145)||(44725345-44725489)
chr7 (138-217)||(36693-36772)
chr7 (1-143)||(7351027-7351169)
chr7 (1-143)||(22135573-22135715)
chr7 (1-143)||(31159078-31159220)
chr7 (1-143)||(40550600-40550742)
chr7 (233-319)||(44011712-44011798)
chr7 (212-296)||(43556-43640)
chr7 (178-314)||(6047761-6047897)
chr7 (167-311)||(47674960-47675104)
chr7 (1-145)||(36220-36364)
chr7 (1-145)||(13289873-13290017)
chr7 (1-59)||(4295401-4295459)
chr7 (231-311)||(6593354-6593434)
chr7 (231-311)||(18390992-18391072)
chr7 (1-145)||(24816744-24816888)
chr7 (142-311)||(1560787-1560955)
chr7 (7-71)||(26213496-26213560)
chr7 (1-69)||(48490098-48490166)
chr7 (7-69)||(6047260-6047322)
chr7 (4-69)||(6593940-6594005)
chr7 (4-69)||(18391578-18391643)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (1-296)||(675-970)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (1-296)||(31736699-31736994)
chr1 (1-319)||(6996345-6996663)
chr1 (1-322)||(29003168-29003489)
chr1 (1-322)||(28997452-28997773)
chr1 (1-322)||(50077991-50078312)
chr1 (6-322)||(31424231-31424547)
chr1 (1-322)||(16429709-16430029)
chr1 (138-296)||(51751271-51751429)
chr1 (138-296)||(16227402-16227560)
chr1 (2-232)||(25250568-25250798)
chr1 (138-296)||(20301365-20301523)
chr1 (138-322)||(28202558-28202742)
chr1 (138-296)||(27338017-27338175)
chr1 (138-296)||(47178596-47178754)
chr1 (138-279)||(28841623-28841764)
chr1 (138-314)||(13126606-13126779)
chr1 (138-289)||(776248-776396)
chr1 (1-145)||(51750798-51750942)
chr1 (166-291)||(50168193-50168318)
chr1 (1-145)||(28841183-28841327)
chr1 (1-145)||(20300892-20301036)
chr1 (1-145)||(51758295-51758439)
chr1 (7-144)||(3805513-3805650)
chr1 (1-145)||(16226929-16227073)
chr1 (238-322)||(25249849-25249933)
chr1 (255-322)||(14099122-14099189)
chr1 (1-145)||(28203073-28203217)
chr1 (1-145)||(8348439-8348583)
chr1 (1-145)||(27338507-27338651)
chr1 (1-143)||(47178123-47178265)
chr1 (167-292)||(31658342-31658467)
chr1 (138-292)||(28222266-28222414)
chr1 (165-214)||(8348039-8348088)
chr1 (8-69)||(16456418-16456479)
chr1 (1-145)||(13127109-13127253)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-322)||(41383469-41383789)
chr8 (138-296)||(18811997-18812155)
chr8 (138-296)||(43080891-43081049)
chr8 (138-296)||(27828274-27828432)
chr8 (167-322)||(21481478-21481633)
chr8 (138-250)||(15069859-15069971)
chr8 (167-311)||(34255328-34255472)
chr8 (243-322)||(15071817-15071896)
chr8 (168-314)||(31577171-31577317)
chr8 (1-145)||(18811524-18811668)
chr8 (1-145)||(15069383-15069527)
chr8 (1-145)||(27827801-27827945)
chr8 (165-311)||(41365835-41365981)
chr8 (182-314)||(17848859-17848991)
chr8 (167-293)||(4732831-4732957)
chr8 (1-145)||(31577668-31577811)
chr8 (1-145)||(43080418-43080562)
chr8 (1-80)||(21481312-21481391)
chr8 (4-143)||(34255839-34255978)
chr8 (4-143)||(4732354-4732493)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (1-322)||(6263351-6263672)
chr2 (86-322)||(31734076-31734312)
chr2 (138-296)||(19503223-19503381)
chr2 (138-296)||(35216857-35217015)
chr2 (138-296)||(36560031-36560189)
chr2 (138-322)||(21519555-21519739)
chr2 (198-322)||(22402266-22402390)
chr2 (1-143)||(35217346-35217488)
chr2 (1-143)||(36560517-36560659)
chr2 (166-291)||(14634841-14634966)
chr2 (178-302)||(28569304-28569428)
chr2 (1-145)||(19503710-19503854)
chr2 (1-145)||(21520068-21520212)
chr2 (172-291)||(42018734-42018853)
chr2 (7-145)||(28569799-28569937)
chr2 (1-105)||(22405344-22405448)
chr2 (181-291)||(41304109-41304219)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-322)||(3631140-3631461)
chr6 (1-296)||(15533825-15534120)
chr6 (138-296)||(26067282-26067440)
chr6 (138-296)||(33310123-33310281)
chr6 (173-322)||(3395245-3395394)
chr6 (1-145)||(25462839-25462983)
chr6 (178-314)||(30444562-30444698)
chr6 (167-303)||(5407907-5408043)
chr6 (167-303)||(5412232-5412368)
chr6 (1-143)||(33309650-33309792)
chr6 (165-278)||(26944449-26944562)
chr6 (1-93)||(3395157-3395249)
chr6 (167-311)||(16568167-16568311)
chr6 (1-143)||(26931939-26932081)
chr6 (3-80)||(17012826-17012903)
chr6 (165-312)||(11137333-11137480)
chr6 (231-311)||(16553943-16554023)
chr6 (231-311)||(16630499-16630579)
chr6 (231-311)||(16652205-16652285)
chr6 (231-322)||(34166151-34166242)
chr6 (1-143)||(5408402-5408544)
chr6 (1-143)||(5412727-5412869)
chr6 (1-145)||(12158012-12158156)
chr6 (1-105)||(12910987-12911091)
chr6 (1-77)||(26944285-26944361)
chr6 (1-143)||(26067771-26067913)
chr6 (1-105)||(12936663-12936767)
chr6 (226-291)||(10456494-10456559)
chr6 (4-69)||(34165580-34165645)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (138-322)||(34792-34976)
scaffold0011 (1-145)||(34311-34455)
[»] scaffold1899 (2 HSPs)
scaffold1899 (138-296)||(858-1016)
scaffold1899 (1-145)||(385-529)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (138-296)||(23360-23519)
scaffold0140 (1-143)||(22887-23029)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (138-322)||(541-719)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (149-231)||(72466-72548)
scaffold0025 (1-145)||(72891-73035)
scaffold0025 (226-296)||(70415-70485)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (167-286)||(115801-115920)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (3-80)||(26329-26406)


Alignment Details
Target: scaffold0005 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 50779 - 51100
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  50779 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 50878  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  50879 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtgatgtgtctca 50978  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50979 ccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtc 51078  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    | || |||||||| ||||||||    
T  51079 tagagaggcggagacaacaata 51100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 27911193 - 27911514
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27911193 acaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 27911292  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27911293 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgacgtgtctca 27911392  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911393 ccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 27911492  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    | || |||||||| ||||||||    
T  27911493 tagagaggcggagacaacaata 27911514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18510932 - 18510611
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  18510932 acaaagtctttggcttatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgcagttcaaca 18510833  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  18510832 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggacgatgaataagatgatgtgtctca 18510733  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18510732 ccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaacactcatgatcagtc 18510633  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  18510632 tggagaggcggaggcaaaaata 18510611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 658779 - 659100
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  658779 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggacctacttgtagagttcaaca 658878  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  658879 aaatcattggtgatttggagaatattgaggcgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 658978  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  658979 ccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaccatcagcctagagaggcggtcgtaagaataatcatgatcagtc 659078  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  659079 tggagaggcggaggcaacaata 659100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 20043745 - 20044054
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| |    
T  20043745 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggcagagtcaaaggccatcatggagcaacttgtggagttcaaaa 20043844  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
     |||| ||| ||| ||| ||||||||            |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20043845 caatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 20043932  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043933 ccttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 20044032  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| ||||| || ||||||||    
T  20044033 tggagaggcgaagacaacaata 20044054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 74 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31467340 - 31467090
Alignment:
Q  74 tcatggaactacttgtggagctcaacaaaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcat--cttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgt 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31467340 tcatggagctacttgtggagctcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgt 31467241  T
Q  172 ttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggaga 271  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  31467240 ttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaacatcatcctggaga 31467141  T
Q  272 ggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31467140 ggcggtggtaagaatactcatgataagtctggacaggcggaggcaacaata 31467090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20505248 - 20505064
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||     
T  20505248 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgaggttgatgcctagtggagtggtggtcgtcta 20505149  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20505148 gagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctcgagaggcggaggcaacaata 20505064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 6746305 - 6746463
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6746305 tgaggatgcgggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttaggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctt 6746404  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6746405 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 6746463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 322
Target Start/End: Original strand, 25806350 - 25806512
Alignment:
Q  160 gtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaaca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25806350 gtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaaca 25806449  T
Q  260 tcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25806450 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctagagaggcggaggcaacaata 25806512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 320
Target Start/End: Original strand, 18467931 - 18468103
Alignment:
Q  148 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacatt 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  18467931 ggtgctatgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtt 18468030  T
Q  248 aaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaa 320  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18468031 aaaaactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatacccatgatcagtctggagaggcggaggcaacaa 18468103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15355894 - 15355736
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15355894 tgaggatgcgggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 15355795  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15355794 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 15355736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 31543967 - 31544125
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31543967 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 31544066  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31544067 tagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 31544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34478464 - 34478306
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  34478464 tgaggatgctggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 34478365  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34478364 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 34478306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 283
Target Start/End: Original strand, 10750932 - 10751077
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  10750932 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 10751031  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaag 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10751032 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 10751077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 23666280 - 23666439
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggt-ggtcgtct 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23666280 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 23666379  T
Q  237 tgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23666380 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcaggatc 23666439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 25806222 - 25806351
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25806222 acaaagtctttggctcattggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 25806321  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagt 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25806322 aaatcattggtgatttggagaacattaagt 25806351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 6745829 - 6745973
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  6745829 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 6745928  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  6745929 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 6745973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 10750459 - 10750601
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  10750459 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 10750558  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  10750559 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 10750601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15356367 - 15356225
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  15356367 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 15356268  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  15356267 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 15356225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 23665807 - 23665949
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  23665807 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 23665906  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  23665907 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 23665949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 31543494 - 31543638
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  31543494 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 31543593  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  31543594 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 31543638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34478937 - 34478793
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  34478937 acaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 34478838  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| | || ||| || |||| ||||||||||    
T  34478837 aaatccttgatgacttggaaaatattgaggtgcaacttgaggatg 34478793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 29721638 - 29721718
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  29721638 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcgg 29721718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 13487200 - 13487370
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | |||||   ||||||||| ||||||||  | ||||||||||   ||||||||| ||  || |||| |||| |     
T  13487200 tgaggatgcgggtactttgatggtgagttgttg---ggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgcttttgatgccttgtagagtggtgttcgtata 13487296  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  13487297 gagagacgttaaacacttaatatcagcttgcagaagcggtgggaagaatactcatggttagtctggagaggcgg 13487370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 16545707 - 16545798
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||    
T  16545707 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtggtaacaata 16545798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 18467445 - 18467588
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||| | |||||||| | | ||  |||| ||||||    
T  18467445 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaatttacggagttcaaca 18467544  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggat 144  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| |||| ||||    
T  18467545 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgtggat 18467588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 16408600 - 16408666
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatca 297  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16408600 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatgatca 16408666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9788693 - 9788554
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | | | |||| |||||||||    
T  9788693 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaa 9788594  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  9788593 tccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 9788554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 26171463 - 26171602
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | | | |||| |||||||||    
T  26171463 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaa 26171562  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  26171563 tccttgatgatttggagaacattaaggtgcaaattgagga 26171602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 29721071 - 29721210
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | | | |||| |||||||||    
T  29721071 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaa 29721170  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  29721171 tccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 29721210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 26174045 - 26174118
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctgga 304  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||| | ||||||||    
T  26174045 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcgatggtgagaatactcatggttagtctgga 26174118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 40381383 - 40381463
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  40381383 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtttggagaggcgg 40381463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42427372 - 42427276
Alignment:
Q  196 tctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcat 292  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  || |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  42427372 tctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtggttgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcgatgggaagaatattcat 42427276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 16408031 - 16408170
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||| |  | ||||| | | | | |||| |||||||||    
T  16408031 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtaaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaa 16408130  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  16408131 tccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 534913 - 535080
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | |||||   |||||||||||   ||||  | ||| ||||||| | |||||||| ||  || |||| ||||||     
T  534913 tgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggaggatgaag---gtgaggtttcttaccttggtaatgatgccttgtagagtggtgatcgtcta 535006  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||||| | || ||||| ||||||    
T  535007 gagagacgttaaacactcaacatcagcctcgagaggcgctgggaataatactcatggttagcctggataggcgg 535080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 16545136 - 16545201
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  16545136 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 16545201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 42427903 - 42427838
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || | |||| |||||||  ||||||||    
T  42427903 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaag 42427838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14788951 - 14788630
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14788951 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 14788852  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14788851 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtgatgtgtctca 14788752  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14788751 ccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtc 14788652  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    | || |||||||| ||||||||    
T  14788651 tagagaggcggagacaacaata 14788630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22802255 - 22801960
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||| ||||||    
T  22802255 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggtcgtcgtggagctacttgtggagttcaaca 22802156  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22802155 aaatcattggtgattttgagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 22802056  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||    
T  22802055 ccttgggagtgatgcctagtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatc 22801960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 47563570 - 47563891
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47563570 acaaagtcgttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaatttaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaaca 47563669  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47563670 aaatcattggtgatttggagagcattgaggtgtgtcttggggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctca 47563769  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47563770 ccttgggattgatacatagtagagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtctagagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtc 47563869  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  47563870 tggagaggcggaggcaacaata 47563891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 16454118 - 16454441
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||| ||||||    
T  16454118 acaaagactttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactaattcaagatggtaaagtcaaaggccaccatagagctaattgtggagttcaaca 16454217  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16454218 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 16454317  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaac--atcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcag 298  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16454318 ccttgggagtgatgcctgttagagcggtggttgtctagagagacgttagacactcaacagatcagcctggagaggcggtggcaagaatactcatgatcag 16454417  T
Q  299 tctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
     ||||| ||| ||| |||||||||    
T  16454418 actggagaggtggaagcaacaata 16454441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36921016 - 36920721
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36921016 acaaagtctttggctcattggcaagtcttaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaaca 36920917  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36920916 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttagggatgcgggtgctctgatggtgtggtgatgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctca 36920817  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||| ||||||||    
T  36920816 ccttgagattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggaggcaacaatattcatgatc 36920721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22133662 - 22133478
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  22133662 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 22133563  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22133562 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaata 22133478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Original strand, 5099771 - 5099955
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  5099771 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 5099870  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  5099871 gagagacattaaacactcaacattagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggtggaggcaaaaata 5099955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 104 - 322
Target Start/End: Original strand, 36379144 - 36379362
Alignment:
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcacct 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  36379144 tcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttaaggatgtgggtggtctgacggtgtaatgttgtttggaggatgaagaagacgatttttctcacct 36379243  T
Q  204 tgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctgg 303  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36379244 tgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaataatactcatgatcagtctgg 36379343  T
Q  304 aaaggcggaggcaacaata 322  Q
    | |||||||||||||||||    
T  36379344 agaggcggaggcaacaata 36379362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22781782 - 22781624
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22781782 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 22781683  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22781682 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22781624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12402138 - 12401954
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12402138 tgaggatgcaggtgcactgatggtgtagtgttttttgctggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcta 12402039  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12402038 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaagcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaata 12401954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16933193 - 16933035
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16933193 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 16933094  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16933093 gagagacgttaaacactcaacattagcttggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 16933035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9175518 - 9175360
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9175518 tgaggatgcgggttctctaatggtgtggtgttgcttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 9175419  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9175418 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 9175360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11007613 - 11007455
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11007613 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttgaaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 11007514  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11007513 gagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 11007455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12399863 - 12399679
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12399863 tgaggatgcaggtgcactgatggtgtggtgttttttgctggatgaagaaggtgatgcgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 12399764  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12399763 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgattagtctggagaggcggagggaacaata 12399679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22045760 - 22045601
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtgg-tcgtct 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22045760 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggttcgtct 22045661  T
Q  237 tgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
     |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22045660 ggagacacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22045601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22134135 - 22133991
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  22134135 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 22134036  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22134035 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 22133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 36770496 - 36770587
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36770496 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcagaggcaacaata 36770587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Original strand, 10113822 - 10113968
Alignment:
Q  165 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagc 264  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || | ||  |||||| || |||||||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10113822 gtgttgttgggagaatgaagaaggtaatgtttccaaccttgtgaatgatgcctagtagagcggtgatcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 10113921  T
Q  265 ttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | ||||||    
T  10113922 ctggagaggtggtgggaagaatacttatggtcagtctgaagaggcgg 10113968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18537022 - 18536788
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  18537022 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggaagagtcgaaggccatcatggagcaacttgcggagttcaaca 18536923  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagt---tgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtc 197  Q
     |||| ||| ||| ||| | || ||||  |    |  | ||||||||||  ||| | || ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18536922 gaatc-ttgatgacttggaaaatattatctctgagggttttgaggatgcaagtgttttggtggt---gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttc 18536827  T
Q  198 tcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtct 236  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||    
T  18536826 tcaccttgtgagtgatgcctggtaaagcgttggtcgtct 18536788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22046233 - 22046089
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  22046233 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 22046134  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22046133 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 22046089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34571591 - 34571440
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | |||||   ||||||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||||| ||  || |||| ||||||     
T  34571591 tgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggaggatgatgaaggtggggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtcta 34571495  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcat 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  34571494 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtgtgaagaatactcat 34571440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12740699 - 12740555
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  12740699 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcct 12740600  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||| ||| ||||  ||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  12740599 ggataggcggtgagaagaatactcatggttagcctggagaggcgg 12740555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12748905 - 12748761
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  12748905 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcct 12748806  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||| ||| ||||  ||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  12748805 ggataggcggtgagaagaatactcatggttagcctggagaggcgg 12748761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22782255 - 22782113
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  22782255 acaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 22782156  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  22782155 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 22782113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3578070 - 3577934
Alignment:
Q  158 tggtgtggtgttgtttgg-aggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactca 256  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||    | |||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  3578070 tggtggggtcttgtttgggagaatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaataatgccttacaacgcggtgatcgtctgaagagacgttaaacactca 3577971  T
Q  257 acatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3577970 acatcagcatggagaggcggtagtaagaatactcatg 3577934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 8394685 - 8394765
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8394685 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 8394765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11008086 - 11007942
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  11008086 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgaatctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 11007987  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||  ||||||||||    
T  11007986 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcgacttgaggatg 11007942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12402614 - 12402510
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||| ||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  12402614 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 12402515  T
Q  101 aaatc 105  Q
    |||||    
T  12402514 aaatc 12402510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16933666 - 16933522
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  16933666 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 16933567  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  16933566 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 16933522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 297
Target Start/End: Original strand, 26558915 - 26559034
Alignment:
Q  178 gatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggt 277  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||  |  ||||| |||||| |  | |||||||||||||||||||||||| || |||| ||      
T  26558915 gatgaagaaggtgatgtctctcacctttggactgatgccttatagagcggcggtcgtttgtacagacattaaacactcaacatcagcctgaagagttgac 26559014  T
Q  278 ggtaagaatactcatgatca 297  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26559015 ggtaagaatactcatgatca 26559034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 36379099 - 36379144
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttact 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36379099 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttact 36379144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 322
Target Start/End: Original strand, 5137271 - 5137450
Alignment:
Q  142 gatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagt-gaagcggtggt-cgtcttga 239  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||   |||||| | |||||||||   |||||| ||||| |||||| ||| || || |  ||||| ||||| ||    
T  5137271 gatgcgggtgctttgatggtgagttgttg---ggaggaaggagaaggtgaggggtctcatcttggtattgattccttgtagatggtgtggttcgtctgga 5137367  T
Q  240 gagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| || |||||||    
T  5137368 gagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaata 5137450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 5872511 - 5872650
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||| | || ||||| | | |  ||||| |||||||||    
T  5872511 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcattcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattaatggagttcaacaaaa 5872610  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  5872611 tccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 5872650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18536092 - 18536029
Alignment:
Q  233 gtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18536092 gtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatgatc 18536029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9175990 - 9175848
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||| | | |||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  9175990 acaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagactcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 9175891  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  9175890 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 9175848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12395376 - 12395274
Alignment:
Q  3 aaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  | || ||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||||    
T  12395376 aaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaa 12395277  T
Q  103 atc 105  Q
    |||    
T  12395276 atc 12395274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12400338 - 12400236
Alignment:
Q  3 aaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  | || ||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||||    
T  12400338 aaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaa 12400239  T
Q  103 atc 105  Q
    |||    
T  12400238 atc 12400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 47565625 - 47565698
Alignment:
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47565625 gagagacgttaaacactcaacatcaacctgaagaggcagtggtaagaatactcatgatcagcctggagaggcgg 47565698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 7123975 - 7124055
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  7123975 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatagttagtctggagaggcgg 7124055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5206655 - 5206506
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||    || |||||| ||||||||  | |||||||| || | |||| ||| ||  | ||||||| ||||     
T  5206655 tgaggatgcgggtgatctgatggtgtcatgtta---gggggatgaggaaggtgacgtttctcacctaggtaatgattccttgtagatcggtggtagtct- 5206560  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactca 291  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  5206559 gatagacagtaaacactcaacatcagcttggaaagacggtgggaagaatactca 5206506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Original strand, 47565681 - 47565744
Alignment:
Q  259 atcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  47565681 atcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatggtcagtttggaaaggcgaaggtaacaata 47565744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 52094834 - 52094695
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  | |||||| |  | ||||| | | |   |||| |||||||||    
T  52094834 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacggagttcaacaaaa 52094735  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  52094734 tccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 52094695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Original strand, 10113676 - 10113789
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||||| | |||    ||| |||||||||    
T  10113676 aagtctttggctcacaggcaattcctaaatcaacaactctactcattcaagacggtggagtcaaaggccatcatggagcgactaacagagttcaacaaaa 10113775  T
Q  104 tcattggtgatttg 117  Q
    || ||| |||||||    
T  10113776 tccttgatgatttg 10113789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 5136788 - 5136853
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  5136788 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 5136853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 80627 - 80948
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  80627 acaaagtctttggctcaacggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 80726  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  80727 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgttctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 80826  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  80827 ccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtc 80926  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  80927 tggagaggcggaggcaacaata 80948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 53917192 - 53916871
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  53917192 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtggagttcaaca 53917093  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  53917092 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgagtgctctgatggtgtggtgttgtttgtaggatgaagaaggtgatgtgtctca 53916993  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53916992 ccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactctacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 53916893  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  53916892 tggagaggcggaggcaaaaata 53916871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 3315422 - 3315743
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  3315422 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttattcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagctacttgtggagttcaaca 3315521  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3315522 aaatcattggtgatttagagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctca 3315621  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3315622 ccttgggaatgatgcttagtggagaggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 3315721  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  3315722 tggagaggcggaggcaagaata 3315743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 42991039 - 42991360
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  || |||| || ||||||||| ||||||    
T  42991039 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaatatggtaaagtcaaaggccttcttggagctgcttgtggagttcaaca 42991138  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42991139 aaatcattgctgatttggagaacattaagttgcgacttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 42991238  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||| | ||||||||| || ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42991239 ccttggaagtgatgcctaatggagcggtgatcatctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcagtggtaagaatactcatgatcagtc 42991338  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  42991339 tggagaggcggaggcaacaata 42991360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28101526 - 28101204
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  28101526 acaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagtaacaactctactcattcaagatggtaaagttaaaggccatcatggagctacttatggagttcaaca 28101427  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28101426 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggttctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 28101327  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28101326 ccttgaaaatgatgcctagtggagcggtggtcatctagagggaagttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 28101227  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaatat 323  Q
    |||| ||||||| |||| |||||    
T  28101226 tggagaggcggatgcaataatat 28101204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43422986 - 43422667
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  43422986 acaaagtctttggctcatcggcaagtcccaaatcaacaactttactcattgga--ttgtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtcgagttcaaca 43422889  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43422888 aaatcattggtgatttgaagaacattgaggtgcatcttgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatctgtctca 43422789  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43422788 ccttgagagtgatgcctagtggaacggtggtcgtatggagagacgataaacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 43422689  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| | ||||||| |||||||    
T  43422688 tggagatgcggaggtaacaata 43422667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18098213 - 18098029
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  18098213 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgtctagtggagcggtggtcgtcta 18098114  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18098113 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtagtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaata 18098029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 11169314 - 11169472
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11169314 tgaggatgcgggagctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 11169413  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11169414 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 11169472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 457120 - 457278
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  457120 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 457219  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  457220 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 457278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6064838 - 6064686
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  6064838 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctg 6064739  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactc 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6064738 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 6064686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 891307 - 891104
Alignment:
Q  119 agaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgccta 218  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  891307 agaacattgaggtgcgtcttgaggatgagggtgctctggtggtgtggtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcgcctttggagtgatgccta 891208  T
Q  219 gtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaac 318  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  891207 gtggagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcgacatcatcttggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtctggagaggcggagacaac 891108  T
Q  319 aata 322  Q
    ||||    
T  891107 aata 891104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 5898625 - 5898783
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  5898625 tgaggatgcaagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtagtcgtctg 5898724  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5898725 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 5898783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10957368 - 10957210
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||     
T  10957368 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtgatcgtctg 10957269  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10957268 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 10957210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 43227293 - 43227451
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||     
T  43227293 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 43227392  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43227393 gagggacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 43227451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 140 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4309550 - 4309394
Alignment:
Q  140 aggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttga 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||  |    
T  4309550 aggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggagtgatgcctagtggagtagtggtcgtctgaa 4309451  T
Q  240 gagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4309450 gagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 4309394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Original strand, 23634643 - 23634824
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||     
T  23634643 tgaggatgcatgtgctctggtggtgtg---ttttttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgtatggtagagcggtggtcgtcta 23634739  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23634740 gagagacgttaaacactcaacatcagcatggagaagaggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaata 23634824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 322
Target Start/End: Original strand, 25634738 - 25634892
Alignment:
Q  165 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||    
T  25634738 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgcctagtg---cggtggtcgtctagagagttgttaaatactcaacatcagc 25634834  T
Q  265 ttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
     | |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||    
T  25634835 ctagagaggcggtgctaagaatactcatggtcagtctggagagacggaggtaacaata 25634892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 456647 - 456789
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  456647 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 456746  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  456747 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 456789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10957841 - 10957697
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  | || ||||||    
T  10957841 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacgaagttcaaca 10957742  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  10957741 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 10957697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 11168841 - 11168985
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  11168841 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaactactctactcattctggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 11168940  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  11168941 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 11168985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18098689 - 18098545
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  18098689 acaaagtctttggctcataggcaattcctaaagcaacaactctacttattcaggatggttgagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 18098590  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  18098589 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 18098545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23199105 - 23198950
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| |||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23199105 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 23199006  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || || |||||||    
T  23199005 ggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggtggtggtaacaata 23198950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 29812045 - 29812215
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | |||||   ||||| ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||  || |||| ||||||     
T  29812045 tgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggaggctgaggaaggtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtacagtggtgttcgtctg 29812141  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  29812142 gagagacgttaaacactcaacatcagtttggagaggcggtcggaagaatactcatggttagcctggagaggcgg 29812215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6065311 - 6065169
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  6065311 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatcgtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 6065212  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  6065211 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 6065169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 311
Target Start/End: Original strand, 7763473 - 7763615
Alignment:
Q  169 tgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttgg 268  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  7763473 tgttgggaggatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagccagg 7763572  T
Q  269 agaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  7763573 agaggcggtggtaacaatactcatggttagtctggagaggcgg 7763615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4310028 - 4309884
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||| | |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  4310028 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaaca 4309929  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  4309928 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 4309884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 7769295 - 7769439
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  |||| || | |    
T  7769295 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagaaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggctatcatggagcaacttacggagttctaaa 7769394  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| |||  || |||| ||| || |||||||||||||||    
T  7769395 aaatccttgatgacgtggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 7769439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 43226817 - 43226961
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| | |||||||| | ||||  | || ||||||    
T  43226817 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacgaagttcaaca 43226916  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  43226917 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 43226961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 27421378 - 27421516
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  27421378 acaaaatctttggctcatcggcaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaaca 27421477  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttg 139  Q
    | ||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||||||||    
T  27421478 agatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttg 27421516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15824811 - 15824698
Alignment:
Q  178 gatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggt 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||  || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |    
T  15824811 gatgaagaaggtgatatttctcacctttggagtgatgccttgtagagagatagtcgtctagagagacattaaacactcaacatcatcttggaggggcgat 15824712  T
Q  278 ggtaagaatactca 291  Q
    || |||||||||||    
T  15824711 gggaagaatactca 15824698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 5192390 - 5192534
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| || | ||||  |||| ||||||    
T  5192390 acaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcattgagcaacttacggagttcaaca 5192489  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  5192490 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 5192534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 23634185 - 23634329
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||| |||||||  |||||||||| |||||||| | | || | ||| ||||||    
T  23634185 acaaagtctttggctcatcggcaatttctaaagcaacaactctagtcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaatttatagagttcaaca 23634284  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  23634285 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 23634329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Original strand, 27421889 - 27422033
Alignment:
Q  178 gatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggt 277  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||    
T  27421889 gatgaagaaggtgttgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggcggtcgtctggagagactttaaacactcaacatcagcatgaaaaggcggt 27421988  T
Q  278 ggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |  ||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||| ||||    
T  27421989 gagaagaatactcatggttagtctgaagaggcagaggcaagaata 27422033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5259289 - 5259163
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| |||||| || ||||||||    ||| ||||||| |||||||||| ||  |  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5259289 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctgaccttggtattgatgccttgtagaatggtgttcatctggagagacattaaacactcaacatcagcct 5259190  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5259189 ggagaggcggtggtaagaatactcatg 5259163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4599620 - 4599529
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||    
T  4599620 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgataatactcatggtcagtctggagaggcggtggtaacaata 4599529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 10210465 - 10210556
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||    
T  10210465 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtggtaacaata 10210556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1619851 - 1619711
Alignment:
Q  174 ggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagagg 273  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||| || ||| ||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  1619851 ggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgattccttgtaaagtggtagttttctagagagacgttaaacactcaacatcagcccagagagg 1619752  T
Q  274 tggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggagg 314  Q
      || |||||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  1619751 cagttgtaagaatactcgtggttagtctgaagaggcggagg 1619711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 5898149 - 5898293
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| ||| | |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  5898149 acaaagtctttggctcatcggcaattcttaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagtcgaagaccatcatggagcaacttacggagttcaaca 5898248  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  5898249 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 5898293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 10057512 - 10057603
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| || |||||||    
T  10057512 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaata 10057603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 10059734 - 10059825
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| || |||||||    
T  10059734 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaata 10059825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 10061956 - 10062047
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| || |||||||    
T  10061956 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaata 10062047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 10064178 - 10064269
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| || |||||||    
T  10064178 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaata 10064269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 10066400 - 10066491
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| || |||||||    
T  10066400 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaata 10066491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Original strand, 32892264 - 32892414
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||| || |||| || |||||    || ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||| ||  ||||||| || |||     
T  32892264 tgaggatgcgggtgctttggtggtttgttgttga---gatgatgaagaaggtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagcggtgctcatctg 32892360  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactca 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||    
T  32892361 gagagacgttaaacactcaacatcagtcaggagaagcggtgggaagaatactca 32892414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5259794 - 5259655
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | | |  ||| |||||||||    
T  5259794 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccttgatggagcaattggcagagttcaacaaaa 5259695  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  5259694 tccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 5259655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 6717776 - 6717867
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| || |||||||    
T  6717776 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcagtggtgagaatacttatggttagtctggagaggcggtggtaacaata 6717867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23199610 - 23199471
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || | |||| |||||||  |||||||| | || ||||| | | | | |||| |||||||||    
T  23199610 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattggcggagttcaacaaaa 23199511  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||  |||||||| || |||| ||||||||    
T  23199510 tccttgatgatttagagaacattgaggtgcaacttgagga 23199471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 25634617 - 25634696
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 80  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25634617 acaaagtctttgactcatcagcaattcctaaagccacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatgga 25634696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 37407385 - 37407524
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||| |  | ||||| | | | | |||| |||||||||    
T  37407385 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaa 37407484  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| | |||||| || |||| ||||||||    
T  37407485 tccttgatgatttggaaaacattgaggtgcaacttgagga 37407524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1619992 - 1619936
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatg 57  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  1619992 acaaagtctttggctcattggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatg 1619936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 302
Target Start/End: Original strand, 7769763 - 7769887
Alignment:
Q  178 gatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggt 277  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||  |||||||    ||| ||||||| ||||||| |||| |||| | | |||||   ||    
T  7769763 gatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggtgtctatctggagagacgttaaacagtcaagatcatcctagagagtctgt 7769862  T
Q  278 ggtaagaatactcatgatcagtctg 302  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  7769863 gggaagaatactcatggtcagtctg 7769887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 10209897 - 10210036
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | | | |||| ||||||| |    
T  10209897 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaga 10209996  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || |||  |||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  10209997 tccttgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10210036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4600191 - 4600126
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  4600191 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 4600126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 10056941 - 10057006
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  10056941 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 10057006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 10061385 - 10061450
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  10061385 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 10061450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 10063607 - 10063672
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  10063607 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 10063672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 10065829 - 10065894
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  10065829 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 10065894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Original strand, 24933175 - 24933212
Alignment:
Q  31 aagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaa 68  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24933175 aagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaa 24933212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27882689 - 27882632
Alignment:
Q  234 tcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactca 291  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27882689 tcttaagagacgttaaacactcagcatcagtttggagaggcggtgcaaagaatactca 27882632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 23409800 - 23409748
Alignment:
Q  7 tctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggt 59  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  23409800 tctttggctcataggcaactccttaagcaacaactctacttatttaagatggt 23409748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 28486335 - 28486656
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28486335 acaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 28486434  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28486435 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagaatgaagaaggtgatgtgtctca 28486534  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28486535 ccttgagattgatgccttgtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 28486634  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  28486635 tggagaggcggaggcaaaaata 28486656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7471499 - 7471204
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7471499 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtaaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 7471400  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7471399 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 7471300  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7471299 ccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 7471204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 20298085 - 20298380
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||    
T  20298085 acaaagtctttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccttcatggagctgcttgtggagttcaaca 20298184  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20298185 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgtgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 20298284  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20298285 ccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaacaatactcatgatc 20298380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 24749357 - 24749678
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24749357 acaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaataactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaaca 24749456  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24749457 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctca 24749556  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24749557 ccttgggattgatgcctagtggagcggttgtcatctggagagacattaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 24749656  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  24749657 tggagaggcggatgcaacaata 24749678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 55 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4294181 - 4293914
Alignment:
Q  55 atggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctc 154  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4294181 atggtaaagtcaaaggccttcatggagctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttggggatgcgggtgctc 4294082  T
Q  155 tgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacact 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4294081 tgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaacttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacattaaacact 4293982  T
Q  255 caacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4293981 caacatcagcctggagaggtggtgacaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaata 4293914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 21678829 - 21679142
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21678829 acaaagtctttggctcatcggcagttcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaaataaaaggcaatcatggagctacttgtggagttcaaca 21678928  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21678929 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtactctgatggcgtagtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 21679028  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  21679029 ccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcatctggagagacgctaaacactcaacatcatccaggagacgcggtggtaagaatactcatgatcagtt 21679128  T
Q  301 tggaaaggcggagg 314  Q
     ||| |||||||||    
T  21679129 cggagaggcggagg 21679142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 73 - 322
Target Start/End: Original strand, 9679500 - 9679749
Alignment:
Q  73 atcatggaactacttgtggagctcaacaaaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtt 172  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  9679500 atcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgagtgttcttatggtgtggtgttgtt 9679599  T
Q  173 tggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagag 272  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||    
T  9679600 tggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttaggagtgatacctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaaaactcaacatcatcctgaagag 9679699  T
Q  273 gtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9679700 gcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggtggaggcaacaata 9679749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1048334 - 1048176
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  1048334 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 1048235  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1048234 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 1048176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7350696 - 7350538
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7350696 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 7350597  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7350596 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 7350538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 44725826 - 44726005
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||     
T  44725826 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctg 44725925  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaa 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44725926 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaagcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaa 44726005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31157330 - 31157172
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  31157330 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 31157231  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31157230 gagagatgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 31157172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 22136046 - 22136205
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggt-ggtcgtct 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22136046 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 22136145  T
Q  237 tgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22136146 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22136205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 40551073 - 40551232
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggt-ggtcgtct 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40551073 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 40551172  T
Q  237 tgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40551173 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 40551232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7093506 - 7093348
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  7093506 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 7093407  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7093406 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 7093348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 38395227 - 38395385
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  38395227 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 38395326  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38395327 gagagaagttaaacactcaacatcagcctggagagacggtggtaagaatactcatgatc 38395385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24816381 - 24816224
Alignment:
Q  165 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagc 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24816381 gtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 24816282  T
Q  265 ttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
     || ||||  ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  24816281 ctgaagagacggtggtaagaatactcatggtcactttggagaggcggaggtaacaata 24816224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 38394756 - 38394900
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  38394756 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 38394855  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  38394856 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 38394900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 293
Target Start/End: Original strand, 48490580 - 48490732
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | |||||   | ||||||| ||||||||  | ||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||     
T  48490580 tgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---gcaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttagtattgatgccttgtggagtggtggtcgtctg 48490676  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatg 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48490677 gagagacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggtgggaagaatactcatg 48490732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1048807 - 1048663
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  1048807 acaaagtctttggcgcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 1048708  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  1048707 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 1048663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7093979 - 7093835
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  7093979 acaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 7093880  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  7093879 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 7093835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 44725345 - 44725489
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||| || | |||| ||||| ||||||    
T  44725345 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagtaacaactctacttattcaggatggtggagtcaaaggccatcatagagcaacttatggagttcaaca 44725444  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  44725445 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 44725489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 36693 - 36772
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcct 217  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36693 tgaggatgtaggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcct 36772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7351169 - 7351027
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||  |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  7351169 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaaca 7351070  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  7351069 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 7351027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 22135573 - 22135715
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  22135573 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 22135672  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  22135673 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 22135715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31159220 - 31159078
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  31159220 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 31159121  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  31159120 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 31159078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 40550600 - 40550742
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  40550600 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 40550699  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  40550700 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 40550742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44011798 - 44011712
Alignment:
Q  233 gtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaaca 319  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  44011798 gtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatggtcagtctggagaggcggaggtaaca 44011712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 43556 - 43640
Alignment:
Q  212 atgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43556 atgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctgcagaggcggtggtaagaataatcatgatc 43640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 314
Target Start/End: Original strand, 6047761 - 6047897
Alignment:
Q  178 gatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggt 277  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||||| || ||||| || ||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6047761 gatgaagtaggtgatgtttctcgccttgtgaatgatgtcttgtagagtggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 6047860  T
Q  278 ggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggagg 314  Q
    || ||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  6047861 ggaaagaatactcaaggtcagtctgaagaggcggagg 6047897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47675104 - 47674960
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||| ||  || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  47675104 gttgttgggaggatgaagaaggtgaggtctctcaacttggtattgattccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcat 47675005  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  47675004 ggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcctggataggcgg 47674960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 36220 - 36364
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  36220 acaaagtctttagctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 36319  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || | || ||||||||||    
T  36320 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtacaacttgaggatg 36364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13290017 - 13289873
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||    
T  13290017 acaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttatggagttcaaca 13289918  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    || || ||| ||| ||| |||| ||  || |||||||||| ||||    
T  13289917 aattccttgatgacttggagaatatggaggtgcatcttgacgatg 13289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 4295459 - 4295401
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggt 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4295459 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 4295401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6593434 - 6593354
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6593434 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcgg 6593354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18391072 - 18390992
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  18391072 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcgg 18390992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24816888 - 24816744
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  | |||||||  |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  24816888 acaaagtctttggctcatctacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggattcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaaca 24816789  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||  ||| ||| ||| |||  |||||| |||||||||| ||||    
T  24816788 aaattcttgatgacttggagatgattaaggtgcatcttgaagatg 24816744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1560955 - 1560787
Alignment:
Q  142 gatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagt-gaagcggtggt-cgtcttga 239  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||   |||||| |  ||||||||   |||||||||||| |||||| ||| || || |  ||||| ||||| ||    
T  1560955 gatgcgggtgctttgatggtgagttgttg---ggaggaaggtgaaggtgaggggtctcaccttggtattgattccttgtagacggtgtggttcgtctgga 1560859  T
Q  240 gagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  1560858 gagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcgg 1560787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 26213496 - 26213560
Alignment:
Q  7 tctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggc 71  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||    
T  26213496 tctttggctcatttgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggc 26213560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 48490098 - 48490166
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  48490098 acaaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 48490166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 6047260 - 6047322
Alignment:
Q  7 tctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  6047260 tctttggctcatacgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 6047322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6594005 - 6593940
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  6594005 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 6593940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18391643 - 18391578
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  18391643 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 18391578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 970 - 675
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  970 acaaagtctttggcttatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggtgctacttgtggagttcaaca 871  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  870 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 771  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  770 ccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31736994 - 31736699
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31736994 acaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 31736895  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31736894 aaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 31736795  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31736794 ccttgggagtgatgcctagtgaagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaacattagcctggagaggcggttgtaagaatactcatgatc 31736699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 6996345 - 6996663
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6996345 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtggagttcaaca 6996444  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6996445 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 6996544  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    | || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6996545 catttggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 6996644  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaaca 319  Q
    | || ||||||||||||||    
T  6996645 tagagaggcggaggcaaca 6996663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29003489 - 29003168
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  29003489 acaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgcaactgcttatggagttcaaca 29003390  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  29003389 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtcaca 29003290  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  29003289 ccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaaaatactcatgatcagtc 29003190  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  29003189 tggagaggcggaggcaacaata 29003168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28997773 - 28997452
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  28997773 acaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgcaactgcttatggagttcaaca 28997674  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  28997673 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgttgatgtttgtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtcaca 28997574  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28997573 ccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaaaatactcatgatcagtc 28997474  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28997473 tggagaggcggaggcaacaata 28997452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 50078312 - 50077991
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  50078312 acaaaatcttgggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagattatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 50078213  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50078212 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttggagatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 50078113  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50078112 ccttgggattgattcctattggagtggttgtcttctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtc 50078013  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  50078012 tggagaggcggaggcaacaata 50077991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31424547 - 31424231
Alignment:
Q  6 gtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaatc 105  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31424547 gtctttggctcatcaacaatttctaaagcaacatatttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatctacttgtggagttcaacaaaatc 31424448  T
Q  106 attggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttg 205  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31424447 attggtgatttggagaacattgaggtgtgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtattgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcatcttg 31424348  T
Q  206 ggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaa 305  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31424347 ggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacacttaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtctggag 31424248  T
Q  306 aggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||||||||||||||    
T  31424247 aggcggaggcaacaata 31424231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 16429709 - 16430029
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16429709 acaaagtctttggctcatcagaaattcctaaagtaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttgtggagttcaaca 16429808  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||| | ||| ||||||| |||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16429809 aaacccttgatgatttggagattattgaggtgcatcttgaggatgcgg-tgctctggtggtgtggtgttgtttggaggatgaaaaaggtgatgtgtctca 16429907  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16429908 ccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcttctggagagaagttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatactcatggtcagtc 16430007  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| ||||||| | |||||||    
T  16430008 tggagaggcggatgtaacaata 16430029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 51751271 - 51751429
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  51751271 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 51751370  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51751371 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 51751429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 16227402 - 16227560
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16227402 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 16227501  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16227502 gagagacgttaaacacttaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 16227560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25250798 - 25250568
Alignment:
Q  2 caaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||   ||||  |||| |||||||    
T  25250798 caaagtctttggctcttcggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttacggagttcaacaa 25250699  T
Q  102 aatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcac 201  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  25250698 aatcattgatgatttggacaacattaagctgcaccttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagggtgaagaatgtgatgtgtctcac 25250599  T
Q  202 cttgggattgatgcctagtgaagcggtggtc 232  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  25250598 cttgagaatgatgcctagtggagcggtggtc 25250568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 20301365 - 20301523
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  20301365 tgaggatgcgggtgctctgatgatgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 20301464  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20301465 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 20301523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28202742 - 28202558
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||     
T  28202742 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaataagttgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgatcttctg 28202643  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28202642 gagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaata 28202558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27338175 - 27338017
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  27338175 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctagtggagcggtggtcgtctg 27338076  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27338075 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatc 27338017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 47178596 - 47178754
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  47178596 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 47178695  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47178696 gagagacgttaaacactcaacatcaacctagagaggcggtggtaagaatactcatgatc 47178754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 279
Target Start/End: Original strand, 28841623 - 28841764
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||     
T  28841623 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcgtagtggagcgatggtcgtctg 28841722  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtgg 279  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  28841723 gcgagacgttaaacacccaacatcagcctggagaggcggtgg 28841764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13126779 - 13126606
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||   ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||     
T  13126779 tgaggatgcgggtgctttggtggtgtgttgttg---ggaggatgaagaaggcgatgtttctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctg 13126683  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggagg 314  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||||    
T  13126682 gagagatgataaacactcaacatcaacttggagaggcggtggtaagaatacttatggttagtctgaagaggcggagg 13126606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Original strand, 776248 - 776396
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | |||||   ||||||||| ||||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||  || |||| |||||||    
T  776248 tgaggatgcgggtgctttggtggtgagttgttg---ggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgatattgatgccttgtagagtggtgttcgtctt 776344  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatact 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  776345 gagagacattaaacactcaacatcagcttggggaggcggtgggaagaatact 776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 51750798 - 51750942
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  51750798 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 51750897  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  51750898 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 51750942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50168318 - 50168193
Alignment:
Q  166 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagct 265  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  50168318 tgttgttgggaggataaagaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcc 50168219  T
Q  266 tggagaggtggtggtaagaatactca 291  Q
    |||| ||| ||| | |||||||||||    
T  50168218 tggaaaggcggtaggaagaatactca 50168193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 28841183 - 28841327
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  28841183 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 28841282  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || || | ||||||||||    
T  28841283 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatg 28841327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 20300892 - 20301036
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  20300892 acaaagtctttggctcatcgtcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 20300991  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| |||  || ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  20300992 aaatccttgaagacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 20301036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 51758295 - 51758439
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||   ||||  |||| ||||||    
T  51758295 acaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagtaacttacggagttcaaca 51758394  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  51758395 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 51758439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3805650 - 3805513
Alignment:
Q  7 tctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaatca 106  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||| |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||||||      
T  3805650 tctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactgtaatcattcaagatggcagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaattc 3805551  T
Q  107 ttggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggat 144  Q
    ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  3805550 ttgatgacttggagaacattgaggtgcatcttgaggat 3805513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 16226929 - 16227073
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  16226929 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 16227028  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  16227029 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 16227073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25249933 - 25249849
Alignment:
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25249933 gagagacgttaaatactaaacatcattctggagaggtggtggtaagaatactaatgatcagtctggagaggcggaggcaacaata 25249849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 255 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14099189 - 14099122
Alignment:
Q  255 caacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14099189 caacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctgaagaggcggaggcaacaata 14099122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28203217 - 28203073
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||| || |||||||| | |||   |||| ||||||    
T  28203217 acaaagtctttgactcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaagccatcatggagcaactgacggagttcaaca 28203118  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  28203117 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 28203073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8348583 - 8348439
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||| |||||| | | ||||  |||| ||||||    
T  8348583 acaaagtctttgggacatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatgtagcaacttacggagttcaaca 8348484  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| | || | | || |||||||||||||||    
T  8348483 aaatctttgatgacttggaaaataatgaggtgcatcttgaggatg 8348439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27338651 - 27338507
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||| | |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  27338651 acaaagtctttgactcattggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaaca 27338552  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| | || ||| || |||| ||||||||||    
T  27338551 aaatccttgatgacttggataatattgaggtgcaacttgaggatg 27338507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 47178123 - 47178265
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  47178123 acaaagtcattggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 47178222  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  47178223 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 47178265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 292
Target Start/End: Original strand, 31658342 - 31658467
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||  || |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||   |    
T  31658342 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcattct 31658441  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcat 292  Q
    ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  31658442 ggagatgcagtggaaagaatactcat 31658467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28222414 - 28222266
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||   ||||  | ||||||||||| | |||||||| ||  || ||||||||| |     
T  28222414 tgaggatgtgggtgctttggtggtgtgttgttg---ggaggatgaag---gtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagtggtggtcgtttg 28222321  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcat 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||  |||  ||||||||||||    
T  28222320 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcagtgtgaagaatactcat 28222266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8348088 - 8348039
Alignment:
Q  165 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  8348088 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgatg 8348039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 16456418 - 16456479
Alignment:
Q  8 ctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||    
T  16456418 ctttggctcataggcaaatcctaaagcaacaactctactcattcaagatgatagagtcaaag 16456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13127253 - 13127109
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||| |||| | ||||   ||||||||   |||||| | | |||| ||||| | ||||    
T  13127253 acaaattctttggctcatcgacaattcttaaagaaacaactatactcattcaatatggcggagtcaaagatcatcatgtagcaacttatggagtttaaca 13127154  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  13127153 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 13127109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 41383469 - 41383789
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41383469 acaaagtctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaaca 41383568  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41383569 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgactgctctgatggtgtggt-ttgtttggaggatgatgaaggtgatgtgtctca 41383667  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  41383668 ccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtt 41383767  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  41383768 tggagaggcggaggcaacaata 41383789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 18811997 - 18812155
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18811997 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctg 18812096  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18812097 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatc 18812155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 43080891 - 43081049
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  43080891 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 43080990  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43080991 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 43081049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 27828274 - 27828432
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27828274 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 27828373  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27828374 gagagacgttaaacactcaacatcaacctggagaggtggtagtaagaatactcatgatc 27828432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 167 - 322
Target Start/End: Original strand, 21481478 - 21481633
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||  |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21481478 gttgtatggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgttgcctgatagagcggtggtcgtcaagagagacgttaaacactcaacatcagcct 21481577  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21481578 ggagaggcgatggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaata 21481633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 250
Target Start/End: Original strand, 15069859 - 15069971
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  15069859 tgaggatgcaggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatggatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcatctg 15069958  T
Q  238 gagagacattaaa 250  Q
     |||||| |||||    
T  15069959 aagagacgttaaa 15069971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34255472 - 34255328
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| |||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34255472 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtggagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 34255373  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  34255372 ggagaggtggtggtaagaatactcatggttagtccggagaggcgg 34255328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 15071817 - 15071896
Alignment:
Q  243 acattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15071817 acattaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaata 15071896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31577317 - 31577171
Alignment:
Q  168 ttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttg 267  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | |||||| ||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  31577317 ttgttgggaggatgaagaatgtgatgtttctcaccttgtgaattatgccttgtagagcggtgttcttctggagagacgttaaacactcaacctcagcctg 31577218  T
Q  268 gagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggagg 314  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31577217 gagaggcggttgtaagaatactcatggtcagtctggagaggcggagg 31577171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 18811524 - 18811668
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  18811524 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 18811623  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  18811624 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 18811668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 15069383 - 15069527
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  15069383 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 15069482  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  15069483 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 15069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 27827801 - 27827945
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  27827801 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 27827900  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  27827901 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 27827945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41365981 - 41365835
Alignment:
Q  165 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagc 264  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||  || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41365981 gtgttgatgggaggatgaagaaggtgaagtctctcaccttggtattgaggccttgtagagtggtgattgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 41365882  T
Q  265 ttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  41365881 ctggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcctggagaggcgg 41365835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 314
Target Start/End: Original strand, 17848859 - 17848991
Alignment:
Q  182 aagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggta 281  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| | |    
T  17848859 aagaaagtgatgtttctcaccttgggaattatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacattcaacatcaccctggagaggcggtcgaa 17848958  T
Q  282 agaatactcatgatcagtctggaaaggcggagg 314  Q
    |||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  17848959 agaatagtcatggtcagtctgaagaggcggagg 17848991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 293
Target Start/End: Original strand, 4732831 - 4732957
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||  || |||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  4732831 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtttagagagacgttaaacactcatcatcagcct 4732930  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatg 293  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4732931 ggagaggcggtgggaagaatactcatg 4732957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31577811 - 31577668
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||| ||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  31577811 acaaagtctttggctcttcggcaattcctaaagcaacaactctac-tattcaagatggtggagtcaatggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 31577713  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    |||||  || ||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  31577712 aaatccatgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 31577668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 43080418 - 43080562
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  43080418 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 43080517  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  43080518 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 43080562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 21481312 - 21481391
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 80  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  21481312 acaaagtctttggctcatcgccaattcctaaagaaacaattttactcattcaagatggtagagtcaaagaccatcatgga 21481391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34255978 - 34255839
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | | | |||| |||||||||    
T  34255978 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaa 34255879  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  34255878 tccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 34255839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 4732354 - 4732493
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | |   |||| |||||||||    
T  4732354 aagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaa 4732453  T
Q  104 tcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  4732454 tccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 4732493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6263672 - 6263351
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||    
T  6263672 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttatggagttcaaca 6263573  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    |||   ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  6263572 aaacagttggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtccctca 6263473  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | || ||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  6263472 ccttgggattgatacctggtggagtggtggtcgtctggagaaacgttaaacactcaacatcaacctgaagagacgatggtaagaatactcatgatcagtc 6263373  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6263372 tggagaggcggaggcaacaata 6263351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 86 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31734312 - 31734076
Alignment:
Q  86 ttgtggagctcaacaaaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaaga 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31734312 ttgtggagttcaacaaaatcattgatgatttgaagaacattaagttgcgtcttgagaatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggataaaga 31734213  T
Q  186 aggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaa 285  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  31734212 aggtgatgtttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcaacctggagatgtggtgataagaa 31734113  T
Q  286 tactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31734112 tactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaata 31734076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19503381 - 19503223
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  19503381 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcagtggtcgtctg 19503282  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503281 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 19503223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35217015 - 35216857
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35217015 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctg 35216916  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35216915 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 35216857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36560189 - 36560031
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  36560189 tgagcatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcgccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 36560090  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36560089 gagagacgttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 36560031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21519739 - 21519555
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||     
T  21519739 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctg 21519640  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  21519639 gagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcattctggagagccggaggcaaaaata 21519555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 322
Target Start/End: Original strand, 22402266 - 22402390
Alignment:
Q  198 tcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatca 297  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22402266 tcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatattcatgatca 22402365  T
Q  298 gtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22402366 gtctggagaggtggaggcaataata 22402390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35217488 - 35217346
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  35217488 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 35217389  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  35217388 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 35217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36560659 - 36560517
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  36560659 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 36560560  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  36560559 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 36560517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14634966 - 14634841
Alignment:
Q  166 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagct 265  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  14634966 tgttgttgggaggatgaagagggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 14634867  T
Q  266 tggagaggtggtggtaagaatactca 291  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||    
T  14634866 tagagaggcggtgggaagaatactca 14634841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28569428 - 28569304
Alignment:
Q  178 gatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggt 277  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| || ||  || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  28569428 gatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgacttgtagagtggtggtcgtctagagagatgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggt 28569329  T
Q  278 ggtaagaatactcatgatcagtctg 302  Q
    || || |||||||||||||||||||    
T  28569328 gggaaaaatactcatgatcagtctg 28569304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19503854 - 19503710
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||  |||| || |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  19503854 acaaagtctttgcctcatcggcaattcctaaagcaatgactctactcattcaggatgatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 19503755  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  19503754 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 19503710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21520212 - 21520068
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   ||||||  ||| ||| || |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  21520212 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaggatggtggagttaaatgccatcatggagcaacttacggagttcaaca 21520113  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  21520112 aaatccttgatgacttggagaatattaaggtgcaacttaaggatg 21520068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42018853 - 42018734
Alignment:
Q  172 ttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggaga 271  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||  | ||    || || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42018853 ttgggggatgaagaaggtgatgtttctcaccttggaaatgatgccttataaatgaatgatcatcttgaaagacattaaacactcaacatcatcctggaga 42018754  T
Q  272 ggtggtggtaagaatactca 291  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  42018753 ggcggtgggaagaatactca 42018734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28569937 - 28569799
Alignment:
Q  7 tctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaacaaaatca 106  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| |||||||||||     
T  28569937 tctttagctcatcgacagatcctaaaacaaaaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatcaacttacggagttcaacaaaatcc 28569838  T
Q  107 ttggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    |||  ||  || |||  |||||| |||||||||||||||    
T  28569837 ttgaagacatgaagactattaaggtgcatcttgaggatg 28569799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22405448 - 22405344
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | | |||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  22405448 acaaagtctttggcttatcagcaattcctaaagcaacgattctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 22405349  T
Q  101 aaatc 105  Q
    |||||    
T  22405348 aaatc 22405344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41304219 - 41304109
Alignment:
Q  181 gaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggt 280  Q
    ||||||||||||   | |||||||| || ||||||||  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||     
T  41304219 gaagaaggtgatgcctttcaccttgtgactgatgccttatagagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaaaatcagcttggagatgcggtggg 41304120  T
Q  281 aagaatactca 291  Q
    |||||||||||    
T  41304119 aagaatactca 41304109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3631461 - 3631140
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |    
T  3631461 acaaagtctttgactcatcaacaattcctaaagcaataactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtagagttcaata 3631362  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3631361 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggatgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 3631262  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtc 300  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3631261 ccttgggggtgatgcctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaacactcaacatcaacctggagaggcggtggtaagaatagtcatgatcagtc 3631162  T
Q  301 tggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |  | ||| |||| ||||||||    
T  3631161 tcaagaggtggagacaacaata 3631140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15534120 - 15533825
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||| || |||    
T  15534120 acaaagtctttggctcattggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaaaccatcatggagctacttgtggagttcgaca 15534021  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctca 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15534020 aaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctca 15533921  T
Q  201 ccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    || || || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| || || || |||||||||||||    
T  15533920 ccatgagagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttatacactcaacatcagcctagagaggcggaggcaacaatactcatgatc 15533825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26067440 - 26067282
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  26067440 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctactggagcggtggtcgtctg 26067341  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26067340 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 26067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 33310123 - 33310281
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  33310123 tgaggatacgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagtggtggtcgtctg 33310222  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33310223 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 33310281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 322
Target Start/End: Original strand, 3395245 - 3395394
Alignment:
Q  173 tggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagag 272  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3395245 tggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagag 3395344  T
Q  273 gtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  3395345 gcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggagacaagaata 3395394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25462983 - 25462839
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  25462983 acaaagtcttaggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 25462884  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  25462883 aaatctttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 25462839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 314
Target Start/End: Original strand, 30444562 - 30444698
Alignment:
Q  178 gatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggt 277  Q
    |||||||||||||||   |||  |||||||| |||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  30444562 gatgaagaaggtgatgattcttgccttgggagtgatgctttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaacatcagcatggagaggcggt 30444661  T
Q  278 ggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggagg 314  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  30444662 gggaagaatattcatggtcagtctgaagaggcggagg 30444698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5408043 - 5407907
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| |||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5408043 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 5407944  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctgg 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5407943 ggagaggcggtggtaagaatactcatggttagtctgg 5407907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5412368 - 5412232
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| |||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5412368 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 5412269  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctgg 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5412268 ggagaggcggtggtaagaatactcatggttagtctgg 5412232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 33309650 - 33309792
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  33309650 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 33309749  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  33309750 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 33309792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Original strand, 26944449 - 26944562
Alignment:
Q  165 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagc 264  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26944449 gtgttgtttaaaggatgaagaaggtgatgtttttcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 26944548  T
Q  265 ttggagaggtggtg 278  Q
     | |||||| ||||    
T  26944549 ctagagaggcggtg 26944562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 3395157 - 3395249
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggag 93  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  3395157 acaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagctactcgtggag 3395249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 16568167 - 16568311
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| |||||| || ||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||| |    
T  16568167 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgttcatctggaaagacgttaaacactcaacatcagcct 16568266  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16568267 ggagaggcggtggtaacaatactcatggttagtctggagaggcgg 16568311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26932081 - 26931939
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  26932081 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 26931982  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  26931981 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 26931939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Original strand, 17012826 - 17012903
Alignment:
Q  3 aaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 80  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17012826 aaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 17012903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 312
Target Start/End: Original strand, 11137333 - 11137480
Alignment:
Q  165 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagc 264  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||      
T  11137333 gtgttgttggtacgatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgccttatagagcggtgatcgtctatagagacgttaaacactcaacatcatt 11137432  T
Q  265 ttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgga 312  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||    
T  11137433 ctggaaaggcggtgggaagaatactcatggttagtctgaagaggcgga 11137480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 16553943 - 16554023
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16553943 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcgg 16554023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 16630499 - 16630579
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16630499 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcgg 16630579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 16652205 - 16652285
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcgg 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16652205 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcgg 16652285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 34166151 - 34166242
Alignment:
Q  231 tcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| || |||||||    
T  34166151 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaata 34166242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5408544 - 5408402
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | | | |||| ||||||    
T  5408544 acaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaaca 5408445  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||| || |||| ||||||||    
T  5408444 aaatccttgatgatttggagatcattgaggtgcaacttgagga 5408402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5412869 - 5412727
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| |  | ||||| | | | | |||| ||||||    
T  5412869 acaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaaca 5412770  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||| || |||| ||||||||    
T  5412769 aaatccttgatgatttggagatcattgaggtgcaacttgagga 5412727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12158012 - 12158156
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||| |||| |||||||  |||||||| | | ||||||   ||||   ||| ||||||    
T  12158012 acaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaagcactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccaccatggagaaacttacagagttcaaca 12158111  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    | ||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  12158112 agatccttgatgatttggagaacattgaggtgcatcttgtggatg 12158156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12911091 - 12910987
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||||| |||||||| | ||||  |||| | ||||    
T  12911091 acaaagtctttggctcattgggaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaaca 12910992  T
Q  101 aaatc 105  Q
    |||||    
T  12910991 aaatc 12910987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 26944285 - 26944361
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcat 77  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  26944285 acaaagtctttggcttatcgacaattcctaaagcgacaactttaataattcaagatggtagagtcaaaggccatcat 26944361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26067913 - 26067771
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| ||||| || | ||||  |||| |||| |    
T  26067913 acaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcattgagcaacttacggagttcaaaa 26067814  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  26067813 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 26067771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12936767 - 12936663
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||  ||| |||||| |||||||| | ||||  |||| | ||||    
T  12936767 acaaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaaca 12936668  T
Q  101 aaatc 105  Q
    |||||    
T  12936667 aaatc 12936663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10456559 - 10456494
Alignment:
Q  226 ggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactca 291  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||  |||||||||||    
T  10456559 ggtgttcgtctggagagacattaaacactcaacatcatcctagagaagtggtgcgaagaatactca 10456494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 34165580 - 34165645
Alignment:
Q  4 aagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaag 69  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  34165580 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 34165645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Original strand, 34792 - 34976
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  34792 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacgttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 34891  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34892 gaaagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaata 34976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 34311 - 34455
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||||| | |||   |||| | ||||    
T  34311 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactccactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactcacggagttaaaca 34410  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  34411 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 34455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 858 - 1016
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  858 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 957  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  958 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 1016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 385 - 529
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  385 acaaagcctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 484  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || || | ||||||||||    
T  485 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatg 529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 23360 - 23519
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggt-ggtcgtct 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23360 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 23459  T
Q  237 tgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23460 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcaggatc 23519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 22887 - 23029
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  22887 acaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaaca 22986  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgagga 143  Q
    ||||| | | ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||    
T  22987 aaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 23029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Original strand, 541 - 719
Alignment:
Q  138 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctt 237  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||   ||||  | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||     
T  541 tgaggatgtgggtgctttgatggtgtgttgttg---ggaggatgaag---gtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctg 634  T
Q  238 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggaaaggcggaggcaacaata 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||  |||| |||||| || |||||||    
T  635 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcttggagaggcggtggtaacaata 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 72548 - 72466
Alignment:
Q  149 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  72548 gtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggatggatgcctagtggagcggtggt 72466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 73035 - 72891
Alignment:
Q  1 acaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggaactacttgtggagctcaaca 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||| | |||||||| | ||||   ||| ||||||    
T  73035 acaaaatctttgactcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacagagttcaaca 72936  T
Q  101 aaatcattggtgatttgtagaacattaagttgcatcttgaggatg 145  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||    
T  72935 aaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 72891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 70485 - 70415
Alignment:
Q  226 ggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 296  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  70485 ggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagttgcggtggtaataatactcatgatc 70415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 115801 - 115920
Alignment:
Q  167 gttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 266  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  115801 gttgttgggaggatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 115900  T
Q  267 ggagaggtggtggtaagaat 286  Q
    |||||||  |||| ||||||    
T  115901 ggagaggcagtgggaagaat 115920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26406 - 26329
Alignment:
Q  3 aaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttacttattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 80  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26406 aaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 26329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University