View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15009_low_14 (Length: 237)

Name: NF15009_low_14
Description: NF15009
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15009_low_14
NF15009_low_14
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (3-222)||(15388183-15388402)
chr4 (3-222)||(14760111-14760330)
chr4 (3-222)||(14668261-14668480)
chr4 (3-222)||(5009120-5009339)
chr4 (3-222)||(6573103-6573322)
chr4 (3-222)||(17016291-17016510)
chr4 (3-222)||(34185765-34185984)
chr4 (3-222)||(18313983-18314202)
chr4 (3-222)||(24589166-24589385)
chr4 (3-222)||(54836636-54836855)
chr4 (3-211)||(39853893-39854101)
chr4 (3-222)||(14101788-14102007)
chr4 (3-218)||(20335226-20335441)
chr4 (3-222)||(24115907-24116126)
chr4 (3-222)||(27160122-27160341)
chr4 (3-211)||(18797419-18797627)
chr4 (3-222)||(15231117-15231336)
chr4 (3-222)||(36341322-36341541)
chr4 (3-221)||(1903500-1903718)
chr4 (3-222)||(33670605-33670824)
chr4 (3-220)||(15281742-15281959)
chr4 (3-222)||(21972946-21973165)
chr4 (3-222)||(30757005-30757224)
chr4 (3-222)||(31123317-31123536)
chr4 (3-222)||(40102442-40102661)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (3-222)||(27394793-27395012)
chr2 (3-222)||(23125362-23125581)
chr2 (3-222)||(37948656-37948875)
chr2 (3-211)||(27806945-27807153)
chr2 (3-222)||(12658767-12658986)
chr2 (3-222)||(34294385-34294604)
chr2 (3-220)||(27431235-27431452)
chr2 (5-222)||(28885438-28885655)
chr2 (3-222)||(20841144-20841363)
chr2 (3-222)||(39048613-39048832)
chr2 (3-211)||(13933341-13933549)
chr2 (3-222)||(11631978-11632197)
chr2 (3-211)||(257447-257655)
chr2 (3-222)||(40236739-40236958)
chr2 (3-211)||(12590050-12590258)
chr2 (3-222)||(31879517-31879736)
chr2 (3-222)||(39893300-39893519)
chr2 (3-220)||(19453217-19453434)
chr2 (3-222)||(16826132-16826351)
chr2 (3-222)||(16895129-16895348)
chr2 (3-222)||(19413295-19413514)
chr2 (3-222)||(32053034-32053253)
chr2 (3-222)||(34864915-34865134)
chr2 (3-222)||(37380908-37381127)
chr2 (3-222)||(37682689-37682908)
chr2 (3-222)||(37697954-37698173)
chr2 (3-222)||(37928600-37928819)
chr2 (3-211)||(9346780-9346988)
chr2 (3-211)||(21673969-21674177)
chr2 (3-222)||(12713395-12713614)
chr2 (3-201)||(21699965-21700163)
chr2 (3-113)||(31890285-31890395)
chr2 (3-113)||(3785833-3785943)
chr2 (3-113)||(16164820-16164930)
chr2 (3-113)||(22924942-22925052)
chr2 (3-113)||(27119864-27119974)
chr2 (3-113)||(27779574-27779684)
chr2 (3-113)||(27819331-27819441)
chr2 (9-113)||(34158184-34158288)
chr2 (3-72)||(27827841-27827910)
chr2 (125-181)||(12383932-12383988)
chr2 (125-181)||(22949665-22949721)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (3-222)||(22077677-22077896)
chr8 (3-222)||(27605671-27605890)
chr8 (3-222)||(14560855-14561074)
chr8 (3-222)||(18793935-18794154)
chr8 (3-222)||(19691329-19691548)
chr8 (3-222)||(2134026-2134245)
chr8 (3-211)||(19205128-19205336)
chr8 (3-222)||(9357856-9358075)
chr8 (28-211)||(28358743-28358926)
chr8 (3-222)||(29832557-29832776)
chr8 (3-222)||(19677678-19677897)
chr8 (3-222)||(31357759-31357978)
chr8 (3-222)||(33261965-33262184)
chr8 (3-222)||(18712715-18712934)
chr8 (3-222)||(12089489-12089708)
chr8 (3-222)||(31486637-31486856)
chr8 (3-113)||(15770914-15771024)
chr8 (3-90)||(44564347-44564434)
chr8 (9-96)||(21344943-21345030)
chr8 (161-222)||(16286632-16286694)
chr8 (126-211)||(19844409-19844494)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (3-222)||(5593205-5593424)
chr3 (3-222)||(18054455-18054674)
chr3 (3-222)||(18273900-18274119)
chr3 (3-222)||(18289201-18289420)
chr3 (3-222)||(18304502-18304721)
chr3 (3-221)||(4793483-4793701)
chr3 (3-220)||(8286318-8286535)
chr3 (3-228)||(18333817-18334042)
chr3 (3-222)||(6205096-6205315)
chr3 (3-222)||(8299164-8299383)
chr3 (3-222)||(15889553-15889772)
chr3 (3-222)||(21677896-21678115)
chr3 (3-228)||(35883953-35884178)
chr3 (3-222)||(4686848-4687067)
chr3 (3-222)||(4724824-4725043)
chr3 (3-222)||(15737942-15738161)
chr3 (3-222)||(22384426-22384645)
chr3 (3-222)||(29145604-29145823)
chr3 (3-222)||(29661818-29662037)
chr3 (3-211)||(20573691-20573899)
chr3 (3-211)||(32442355-32442563)
chr3 (3-222)||(8214928-8215147)
chr3 (3-222)||(20069233-20069452)
chr3 (3-222)||(48469120-48469339)
chr3 (3-222)||(7076399-7076618)
chr3 (3-222)||(28024475-28024694)
chr3 (3-222)||(28112802-28113021)
chr3 (3-222)||(47026646-47026865)
chr3 (29-222)||(11107226-11107419)
chr3 (3-222)||(5016907-5017126)
chr3 (3-222)||(5606162-5606381)
chr3 (3-222)||(10399337-10399556)
chr3 (3-222)||(28342370-28342589)
chr3 (3-211)||(18245945-18246153)
chr3 (3-222)||(4343524-4343743)
chr3 (3-222)||(4420108-4420327)
chr3 (3-222)||(5470181-5470400)
chr3 (3-222)||(6539590-6539809)
chr3 (3-222)||(7999753-7999972)
chr3 (3-222)||(10646266-10646485)
chr3 (3-222)||(17981797-17982016)
chr3 (3-222)||(18228389-18228608)
chr3 (3-218)||(19697687-19697902)
chr3 (3-222)||(22867696-22867915)
chr3 (3-222)||(22882755-22882974)
chr3 (3-220)||(16621338-16621555)
chr3 (3-222)||(24331356-24331575)
chr3 (3-222)||(31961303-31961522)
chr3 (3-222)||(51785216-51785435)
chr3 (3-113)||(17992779-17992889)
chr3 (3-113)||(31033084-31033194)
chr3 (3-113)||(4627087-4627197)
chr3 (3-113)||(32293930-32294040)
chr3 (3-113)||(5714375-5714485)
chr3 (3-113)||(5725285-5725395)
chr3 (3-113)||(5766973-5767083)
chr3 (123-183)||(15592879-15592939)
chr3 (3-85)||(6963281-6963363)
chr3 (125-183)||(15918749-15918807)
chr3 (125-183)||(20443349-20443407)
chr3 (125-183)||(41440475-41440533)
chr3 (125-181)||(5950772-5950828)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (3-222)||(10913559-10913778)
chr7 (3-211)||(26516032-26516240)
chr7 (3-222)||(2157803-2158022)
chr7 (3-222)||(26438486-26438705)
chr7 (3-222)||(26534563-26534782)
chr7 (3-222)||(2106853-2107072)
chr7 (3-222)||(11421469-11421688)
chr7 (3-222)||(45390449-45390668)
chr7 (3-220)||(16515120-16515337)
chr7 (3-222)||(5131225-5131444)
chr7 (3-222)||(5144030-5144249)
chr7 (3-222)||(22145424-22145643)
chr7 (3-222)||(26271776-26271995)
chr7 (3-222)||(26316538-26316757)
chr7 (3-220)||(10844851-10845068)
chr7 (28-220)||(16044550-16044742)
chr7 (3-220)||(10842684-10842901)
chr7 (3-211)||(31561080-31561288)
chr7 (3-222)||(3448535-3448754)
chr7 (3-222)||(4141936-4142155)
chr7 (3-222)||(4202618-4202837)
chr7 (3-222)||(11444116-11444335)
chr7 (3-222)||(24589224-24589443)
chr7 (3-211)||(16748207-16748415)
chr7 (3-222)||(26666604-26666823)
chr7 (3-201)||(16446696-16446894)
chr7 (73-222)||(9621879-9622028)
chr7 (3-113)||(2776592-2776702)
chr7 (3-113)||(26512386-26512496)
chr7 (3-113)||(26681796-26681906)
chr7 (3-113)||(31127245-31127355)
chr7 (3-113)||(39209829-39209939)
chr7 (3-106)||(45734658-45734761)
chr7 (3-113)||(31087312-31087422)
chr7 (125-181)||(9469590-9469646)
chr7 (135-183)||(16287201-16287249)
chr7 (125-181)||(16393246-16393302)
chr7 (125-181)||(30369758-30369814)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (3-222)||(27022365-27022584)
chr6 (3-222)||(27287112-27287331)
chr6 (3-222)||(29552786-29553005)
chr6 (3-222)||(13295699-13295918)
chr6 (3-222)||(15421068-15421287)
chr6 (3-222)||(22931632-22931851)
chr6 (3-222)||(23854077-23854296)
chr6 (3-222)||(24866945-24867164)
chr6 (3-218)||(27626459-27626674)
chr6 (3-222)||(16677369-16677588)
chr6 (3-222)||(27179685-27179904)
chr6 (3-222)||(27269335-27269554)
chr6 (3-222)||(34461254-34461473)
chr6 (3-222)||(3699312-3699531)
chr6 (3-222)||(4760992-4761211)
chr6 (3-218)||(17089191-17089406)
chr6 (3-222)||(27010960-27011179)
chr6 (9-222)||(26921606-26921819)
chr6 (9-222)||(16753050-16753263)
chr6 (3-222)||(27060735-27060954)
chr6 (3-222)||(29504645-29504864)
chr6 (3-222)||(4528514-4528733)
chr6 (3-222)||(4542522-4542741)
chr6 (3-222)||(4720883-4721102)
chr6 (3-222)||(27488362-27488581)
chr6 (3-222)||(29576243-29576462)
chr6 (3-222)||(30554764-30554983)
chr6 (3-201)||(20171797-20171995)
chr6 (3-201)||(22163996-22164194)
chr6 (3-222)||(16940775-16940994)
chr6 (3-222)||(26113160-26113379)
chr6 (3-222)||(28210683-28210902)
chr6 (3-222)||(4776109-4776328)
chr6 (3-113)||(22455862-22455972)
chr6 (3-150)||(26992096-26992243)
chr6 (3-113)||(14142142-14142252)
chr6 (3-113)||(26775375-26775485)
chr6 (3-113)||(26789154-26789264)
chr6 (3-113)||(27197523-27197633)
chr6 (3-113)||(27251602-27251712)
chr6 (3-113)||(27358858-27358968)
chr6 (3-113)||(27449201-27449311)
chr6 (3-106)||(8902451-8902554)
chr6 (3-106)||(28163836-28163939)
chr6 (3-113)||(13520940-13521049)
chr6 (3-97)||(33373179-33373273)
chr6 (125-181)||(9136223-9136279)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (3-222)||(15655460-15655679)
chr5 (3-222)||(41677944-41678163)
chr5 (3-222)||(11552594-11552813)
chr5 (3-222)||(33295767-33295986)
chr5 (3-222)||(33780728-33780947)
chr5 (3-211)||(40470252-40470460)
chr5 (3-222)||(22995819-22996038)
chr5 (3-222)||(23629209-23629428)
chr5 (3-222)||(24684847-24685066)
chr5 (3-222)||(24973145-24973364)
chr5 (3-222)||(18372236-18372455)
chr5 (3-222)||(31434703-31434922)
chr5 (3-222)||(37355345-37355564)
chr5 (3-220)||(23895447-23895664)
chr5 (3-222)||(3792780-3792999)
chr5 (3-222)||(9320715-9320934)
chr5 (3-222)||(12135414-12135633)
chr5 (3-222)||(18497427-18497646)
chr5 (3-222)||(26483633-26483852)
chr5 (3-222)||(34619757-34619976)
chr5 (3-222)||(43081494-43081713)
chr5 (3-222)||(13321532-13321751)
chr5 (3-222)||(28652481-28652700)
chr5 (3-222)||(30032667-30032886)
chr5 (3-222)||(32592976-32593195)
chr5 (3-222)||(37767693-37767912)
chr5 (3-222)||(5641027-5641246)
chr5 (3-222)||(6877544-6877763)
chr5 (3-222)||(8662177-8662396)
chr5 (3-222)||(24586613-24586832)
chr5 (3-222)||(28956487-28956706)
chr5 (3-222)||(30155270-30155489)
chr5 (3-222)||(30171708-30171927)
chr5 (3-222)||(30937874-30938093)
chr5 (3-222)||(31823109-31823328)
chr5 (3-222)||(33519619-33519838)
chr5 (3-222)||(37668188-37668407)
chr5 (3-222)||(37758222-37758441)
chr5 (3-217)||(22891707-22891921)
chr5 (3-220)||(25203519-25203736)
chr5 (3-220)||(25267674-25267891)
chr5 (3-211)||(15755554-15755762)
chr5 (3-222)||(2514301-2514520)
chr5 (3-222)||(24727208-24727427)
chr5 (3-113)||(13183495-13183605)
chr5 (3-113)||(18125118-18125228)
chr5 (3-112)||(13439385-13439494)
chr5 (3-113)||(9547411-9547521)
chr5 (3-113)||(11326985-11327095)
chr5 (29-113)||(29887925-29888009)
chr5 (3-113)||(33878479-33878588)
chr5 (3-85)||(351917-351999)
chr5 (125-181)||(5440049-5440105)
chr5 (125-181)||(11944246-11944302)
chr5 (125-181)||(15784549-15784605)
chr5 (125-181)||(17957376-17957432)
chr5 (135-183)||(34468900-34468948)
chr5 (125-181)||(36375786-36375842)
chr5 (125-181)||(37000440-37000496)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (3-220)||(3301-3518)
scaffold0089 (84-222)||(43877-44015)
scaffold0089 (149-220)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (3-222)||(9268-9487)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (3-222)||(30525-30744)
scaffold0143 (3-220)||(19304-19521)
scaffold0143 (3-113)||(7301-7411)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (3-211)||(21894554-21894762)
chr1 (3-222)||(3644366-3644588)
chr1 (3-222)||(51641452-51641671)
chr1 (3-217)||(20339106-20339320)
chr1 (3-211)||(10965910-10966118)
chr1 (3-222)||(28588219-28588438)
chr1 (3-211)||(41790115-41790323)
chr1 (3-222)||(10948311-10948530)
chr1 (3-219)||(16204839-16205055)
chr1 (28-220)||(20464212-20464404)
chr1 (3-113)||(28153079-28153189)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-222)||(15813-16032)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (3-217)||(1429-1643)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (3-222)||(22996-23215)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (3-222)||(9254-9473)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (3-222)||(12803-13022)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (3-222)||(11733-11952)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (3-222)||(5984-6203)
scaffold0159 (150-222)||(23111-23183)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (3-222)||(11181-11400)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (3-220)||(9279-9496)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (11-220)||(5484-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (126-222)||(1155-1251)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (126-212)||(43666-43754)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (123-183)||(35165-35225)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (147-208)||(33706-33770)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (125-181)||(29443-29499)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 15388183 - 15388402
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15388183 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaa 15388282  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388283 taggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 15388382  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15388383 gacttgcttttcggtctgtg 15388402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 14760111 - 14760330
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  14760111 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 14760210  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14760211 taggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 14760310  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  14760311 gacttgcttctcggtctgtg 14760330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14668480 - 14668261
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  14668480 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 14668381  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14668380 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaatctct 14668281  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  14668280 gacttgcttctcggtctgtg 14668261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5009339 - 5009120
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  5009339 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 5009240  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5009239 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 5009140  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  5009139 gacttgcttctctgtctgtg 5009120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6573322 - 6573103
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  6573322 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 6573223  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6573222 taggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 6573123  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  6573122 gacttgcttctctgtctgtg 6573103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17016510 - 17016291
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  17016510 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 17016411  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17016410 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 17016311  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  17016310 gacttgcttctcggtctgtg 17016291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 34185765 - 34185984
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  34185765 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 34185864  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34185865 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 34185964  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  34185965 gacttgcttctcggtctgtg 34185984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 18313983 - 18314202
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  18313983 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 18314082  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18314083 taggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 18314182  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  18314183 gacttgcttctctgtctgtg 18314202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 24589166 - 24589385
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  24589166 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 24589265  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24589266 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 24589365  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  24589366 gacttgcttctcagtctgtg 24589385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 54836855 - 54836636
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  54836855 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 54836756  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  54836755 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctct 54836656  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  54836655 gacttgcttctcggtctgtg 54836636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39854101 - 39853893
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  39854101 atcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 39854002  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39854001 taggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 39853902  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  39853901 gacttgctt 39853893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14102007 - 14101788
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  14102007 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 14101908  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  14101907 caggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 14101808  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  14101807 gacttgcttctctgtctgtg 14101788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 20335226 - 20335441
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  20335226 atcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 20335325  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  20335326 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 20335425  T
Q  203 gacttgcttttcggtc 218  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20335426 gacttgcttctcggtc 20335441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24116126 - 24115907
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |    
T  24116126 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacga 24116027  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24116026 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 24115927  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  24115926 gacttgcttctcggtctgtg 24115907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 27160122 - 27160341
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27160122 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27160221  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27160222 caggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 27160321  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  27160322 gacttgcttctctgtctgtg 27160341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 18797419 - 18797627
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18797419 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18797518  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18797519 caggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 18797618  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  18797619 gacttgctt 18797627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15231336 - 15231117
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||    
T  15231336 atcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 15231237  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15231236 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctct 15231137  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  15231136 gacttgtttctcggtctgtg 15231117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 36341322 - 36341541
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |  |    
T  36341322 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattccatacga 36341421  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  36341422 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 36341521  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || || |||||||    
T  36341522 gacttgtttctctgtctgtg 36341541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1903718 - 1903500
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||   ||||| | ||    
T  1903718 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttccatacaa 1903619  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1903618 taggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 1903519  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgt 221  Q
    |||||| || |||||||||    
T  1903518 gacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 33670605 - 33670824
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  33670605 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 33670704  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  33670705 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 33670804  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  33670805 gacttgcttctctgtctgtg 33670824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 15281742 - 15281959
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||    
T  15281742 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 15281841  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15281842 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctct 15281941  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| || ||||||||    
T  15281942 gacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21973165 - 21972946
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  21973165 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 21973066  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  21973065 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 21972966  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  21972965 gacttgcttctctgtctgtg 21972946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30757224 - 30757005
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  30757224 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 30757125  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||     
T  30757124 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctct 30757025  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  30757024 gacttgcttctctgtctgtg 30757005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 31123317 - 31123536
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  31123317 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 31123416  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  31123417 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 31123516  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  31123517 gacttgcttctctgtctgtg 31123536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 40102442 - 40102661
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  40102442 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 40102541  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  40102542 caggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 40102641  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  40102642 gacttgcttctctgtctgtg 40102661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27395012 - 27394793
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27395012 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaa 27394913  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394912 taggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 27394813  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27394812 gacttgcttttcggtctgtg 27394793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 23125362 - 23125581
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  23125362 atcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 23125461  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23125462 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 23125561  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  23125562 gacttgcttctcggtctgtg 23125581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 37948656 - 37948875
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37948656 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37948755  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  37948756 taggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 37948855  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  37948856 gacttgcttctcggtctgtg 37948875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27807153 - 27806945
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27807153 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27807054  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27807053 taggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 27806954  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  27806953 gacttgctt 27806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12658986 - 12658767
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  12658986 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 12658887  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  12658886 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctct 12658787  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  12658786 gacttgcttctcggtttgtg 12658767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34294604 - 34294385
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  34294604 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 34294505  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  34294504 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 34294405  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  34294404 gacttgcttctcggtctgtg 34294385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 27431235 - 27431452
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27431235 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27431334  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| | |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  27431335 taggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctct 27431434  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27431435 gacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28885655 - 28885438
Alignment:
Q  5 caagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataata 104  Q
    |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||    
T  28885655 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaata 28885556  T
Q  105 ggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgga 204  Q
    ||||||||| || |||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28885555 ggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctga 28885456  T
Q  205 cttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  28885455 cttgcttctcggtctgtg 28885438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20841363 - 20841144
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  20841363 atcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 20841264  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  20841263 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 20841164  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  20841163 gacttgcttctcggtctgtg 20841144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 39048613 - 39048832
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  39048613 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 39048712  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39048713 taggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 39048812  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
     |||||||| || |||||||    
T  39048813 tacttgcttctcagtctgtg 39048832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 13933341 - 13933549
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  13933341 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 13933440  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13933441 taggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 13933540  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  13933541 gacttgctt 13933549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 11631978 - 11632197
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  11631978 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 11632077  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  11632078 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 11632177  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  11632178 gacttgcttctctgtctgtg 11632197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 257447 - 257655
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  257447 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 257546  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  257547 caggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 257646  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  257647 gacttgctt 257655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40236958 - 40236739
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  40236958 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattccatacaa 40236859  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  40236858 taggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 40236759  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  40236758 gacttgcttctctgtctgtg 40236739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12590258 - 12590050
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  12590258 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 12590159  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12590158 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 12590059  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  12590058 gacttgctt 12590050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31879736 - 31879517
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  31879736 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 31879637  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  31879636 caggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 31879537  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  31879536 gacttgcttctctgtctgtg 31879517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39893519 - 39893300
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  39893519 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 39893420  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39893419 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 39893320  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  39893319 gacttgcttctctgtctgtg 39893300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 19453217 - 19453434
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||    
T  19453217 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 19453316  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  19453317 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctct 19453416  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| || ||||||||    
T  19453417 gacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 16826132 - 16826351
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  16826132 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 16826231  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  16826232 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 16826331  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  16826332 gacttgcttctctgtctgtg 16826351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16895348 - 16895129
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  16895348 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 16895249  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  16895248 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 16895149  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  16895148 gacttgcttctctgtctgtg 16895129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 19413295 - 19413514
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  19413295 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 19413394  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  19413395 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 19413494  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  19413495 gacttgcttctctgtctgtg 19413514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32053253 - 32053034
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  32053253 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 32053154  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  32053153 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 32053054  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  32053053 gacttgcttctctgtctgtg 32053034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34865134 - 34864915
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  34865134 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 34865035  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  34865034 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 34864935  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  34864934 gacttgcttctctgtctgtg 34864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37381127 - 37380908
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37381127 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37381028  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  37381027 caggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaacctct 37380928  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  37380927 gacttgtttctcggtctgtg 37380908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 37682689 - 37682908
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37682689 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37682788  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  37682789 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 37682888  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  37682889 gacttgcttctctgtctgtg 37682908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 37697954 - 37698173
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37697954 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37698053  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  37698054 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 37698153  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  37698154 gacttgcttctctgtctgtg 37698173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37928819 - 37928600
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37928819 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37928720  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  37928719 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 37928620  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  37928619 gacttgcttctctgtctgtg 37928600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 9346780 - 9346988
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  9346780 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 9346879  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  9346880 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 9346979  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  9346980 gacttgctt 9346988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 21673969 - 21674177
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  21673969 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 21674068  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  21674069 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 21674168  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  21674169 gacttgctt 21674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 12713395 - 12713614
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  12713395 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 12713494  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  12713495 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 12713594  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  12713595 gacttgcttctctgtctgtg 12713614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 21699965 - 21700163
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||    
T  21699965 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 21700064  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 201  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21700065 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 31890285 - 31890395
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  31890285 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaa 31890384  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  31890385 taggctgattc 31890395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3785943 - 3785833
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  3785943 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 3785844  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  3785843 taggctgattc 3785833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16164930 - 16164820
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16164930 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 16164831  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  16164830 taggctgattc 16164820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 22924942 - 22925052
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  22924942 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 22925041  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||||||||||    
T  22925042 taggttgattc 22925052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27119974 - 27119864
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27119974 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27119875  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  27119874 taggctgattc 27119864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27779684 - 27779574
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27779684 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27779585  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  27779584 taggctgattc 27779574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27819441 - 27819331
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27819441 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27819342  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  27819341 taggctgattc 27819331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34158288 - 34158184
Alignment:
Q  9 ggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 108  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| |    
T  34158288 ggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggct 34158189  T
Q  109 gattc 113  Q
    |||||    
T  34158188 gattc 34158184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27827910 - 27827841
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaa 72  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||    
T  27827910 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12383988 - 12383932
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12383988 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22949721 - 22949665
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949721 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22077677 - 22077896
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22077677 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaa 22077776  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077777 taggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 22077876  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22077877 gacttgcttttcggtctgtg 22077896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 27605671 - 27605890
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27605671 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27605770  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27605771 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 27605870  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  27605871 gacttgcttctcggtctgtg 27605890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14561074 - 14560855
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  14561074 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 14560975  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    ||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14560974 taggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 14560875  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  14560874 gacttgcttctcggtctgtg 14560855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18794154 - 18793935
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18794154 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18794055  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18794054 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaacctct 18793955  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18793954 gacttgcttctcggtctgtg 18793935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19691548 - 19691329
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  19691548 atcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 19691449  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  19691448 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctct 19691349  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  19691348 gacttgcttctcggtttgtg 19691329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 2134026 - 2134245
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  2134026 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaa 2134125  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2134126 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 2134225  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2134226 gacttgcttctcggtctgtg 2134245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 19205128 - 19205336
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  19205128 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 19205227  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  19205228 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 19205327  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  19205328 gacttgctt 19205336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9358075 - 9357856
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  9358075 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 9357976  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||     
T  9357975 caggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctct 9357876  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  9357875 gacttgcttctctgtctgtg 9357856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Original strand, 28358743 - 28358926
Alignment:
Q  28 ggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaattt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||| |||||| || |||| |  ||    
T  28358743 ggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagctt 28358842  T
Q  128 gaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 211  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28358843 gaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgctt 28358926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29832776 - 29832557
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  29832776 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 29832677  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  29832676 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctct 29832577  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  29832576 gacttgcttctctgtctgtg 29832557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19677897 - 19677678
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  19677897 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 19677798  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  19677797 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 19677698  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  19677697 gacttgcttctctgtctgtg 19677678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31357978 - 31357759
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  31357978 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 31357879  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| |||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  31357878 cagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 31357779  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  31357778 gacttgcttctctgtctgtg 31357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33262184 - 33261965
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  33262184 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 33262085  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  33262084 caggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 33261985  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  33261984 gacttgcttctctgtctgtg 33261965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18712934 - 18712715
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  18712934 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 18712835  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  18712834 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctct 18712735  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  18712734 gacttgtttctcggtctgtg 18712715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 12089489 - 12089708
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  12089489 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 12089588  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  12089589 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 12089688  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  12089689 gacttgcttctctgtctgtg 12089708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 31486637 - 31486856
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  31486637 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 31486736  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31486737 caggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctct 31486836  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  31486837 gacttgcttctctgtctgtg 31486856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15771024 - 15770914
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  15771024 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 15770925  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  15770924 taggctgattc 15770914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 44564434 - 44564347
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 90  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564434 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 44564347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 21344943 - 21345030
Alignment:
Q  9 ggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcc 96  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  21344943 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 21345030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286632
Alignment:
Q  161 tatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc-cgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 16286632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19844494 - 19844409
Alignment:
Q  126 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 211  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |  || || ||||||| |||||||||    
T  19844494 ttgaaaattggtccacatgtggcagtcatatgagatataaatctggagatgtagttcaatctaccaagaaaacctctgacttgctt 19844409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 5593205 - 5593424
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  5593205 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 5593304  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5593305 caggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 5593404  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  5593405 gacttgcttctctgtctgtg 5593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18054674 - 18054455
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  18054674 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 18054575  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18054574 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 18054475  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18054474 gacttgcttctcggtctgtg 18054455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 18273900 - 18274119
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18273900 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18273999  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18274000 taggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 18274099  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18274100 gacttgcttctcggtctgtg 18274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 18289201 - 18289420
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18289201 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18289300  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18289301 taggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 18289400  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18289401 gacttgcttctcggtctgtg 18289420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 18304502 - 18304721
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18304502 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18304601  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18304602 taggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 18304701  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18304702 gacttgcttctcggtctgtg 18304721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 4793483 - 4793701
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4793483 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4793582  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4793583 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 4793682  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgt 221  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4793683 gacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 8286318 - 8286535
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  8286318 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 8286417  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8286418 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 8286517  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  8286518 gacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18334042 - 18333817
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18334042 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18333943  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18333942 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 18333843  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtgatgctg 228  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  18333842 gacttgcttctcggtctgtggtgctg 18333817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6205315 - 6205096
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  6205315 atcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 6205216  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6205215 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 6205116  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  6205115 gacttgcttctcagtctgtg 6205096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8299383 - 8299164
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  8299383 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 8299284  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    ||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8299283 taggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 8299184  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  8299183 gacttgcttctcggtctgtg 8299164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 15889553 - 15889772
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  15889553 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 15889652  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15889653 taggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 15889752  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15889753 gacttgcttctcggtctgtg 15889772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21678115 - 21677896
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  21678115 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 21678016  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21678015 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 21677916  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  21677915 gacttgcttctcggtctgtg 21677896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35884178 - 35883953
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  35884178 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 35884079  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  35884078 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 35883979  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtgatgctg 228  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  35883978 gacttgcttctcggtctgtggtgctg 35883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4687067 - 4686848
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4687067 atcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4686968  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4686967 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 4686868  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4686867 gacttgcttctcagtctgtg 4686848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4725043 - 4724824
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4725043 atcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4724944  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4724943 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 4724844  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4724843 gacttgcttctcagtctgtg 4724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 15737942 - 15738161
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |     
T  15737942 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacag 15738041  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15738042 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 15738141  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15738142 gacttgcttctcggtctgtg 15738161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22384426 - 22384645
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  22384426 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 22384525  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    ||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  22384526 taggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaacctct 22384625  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  22384626 gacttgcttctcggtctgtg 22384645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 29145604 - 29145823
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  29145604 atcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 29145703  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29145704 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 29145803  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  29145804 aacttgcttctcggtctgtg 29145823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 29661818 - 29662037
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  29661818 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 29661917  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  29661918 taggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 29662017  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  29662018 gacttgcttctcggtctgtg 29662037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 20573691 - 20573899
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||    
T  20573691 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattccatacaa 20573790  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || | || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20573791 taggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 20573890  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  20573891 gacttgctt 20573899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32442563 - 32442355
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  32442563 atcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 32442464  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||  |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  32442463 cagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 32442364  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  32442363 gacttgctt 32442355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8215147 - 8214928
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  8215147 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaa 8215048  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||  || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||     
T  8215047 caggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctct 8214948  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  8214947 gacttgcttctctgtctgtg 8214928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20069452 - 20069233
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |    
T  20069452 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacga 20069353  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20069352 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 20069253  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  20069252 gacttgcttctcagtctgtg 20069233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48469339 - 48469120
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  48469339 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaa 48469240  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48469239 caggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctat 48469140  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || || |||||||    
T  48469139 gacttgtttctctgtctgtg 48469120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7076618 - 7076399
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  7076618 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 7076519  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  7076518 taggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 7076419  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  7076418 gacttgcttctcggtctgtg 7076399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28024694 - 28024475
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||    
T  28024694 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaa 28024595  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28024594 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 28024495  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  28024494 gacttgcttctctgtctgtg 28024475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 28112802 - 28113021
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||    
T  28112802 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaa 28112901  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  28112902 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 28113001  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  28113002 gacttgcttctctgtctgtg 28113021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47026865 - 47026646
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  47026865 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 47026766  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  47026765 taggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 47026666  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  47026665 gacttgcttctctgtctgtg 47026646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 222
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107419
Alignment:
Q  29 gacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||| ||| || || |||| |  |||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  129 aaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 11107419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5017126 - 5016907
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  5017126 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 5017027  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  5017026 caggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 5016927  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  5016926 gacttgcttctctgtctgtg 5016907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 5606162 - 5606381
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  5606162 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 5606261  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  5606262 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 5606361  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  5606362 gacttgcttctctgtctgtg 5606381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10399556 - 10399337
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  10399556 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 10399457  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  10399456 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 10399357  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || || |||||||    
T  10399356 gacttgtttctctgtctgtg 10399337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28342589 - 28342370
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  28342589 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 28342490  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  28342489 taggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 28342390  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  28342389 gacttgcttctctgtctgtg 28342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18246153 - 18245945
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18246153 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18246054  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  18246053 caggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 18245954  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  18245953 gacttgctt 18245945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 4343524 - 4343743
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4343524 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4343623  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  4343624 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 4343723  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4343724 gacttgcttctctgtctgtg 4343743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4420327 - 4420108
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4420327 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4420228  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  4420227 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 4420128  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4420127 gacttgcttctctgtctgtg 4420108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5470400 - 5470181
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  5470400 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 5470301  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  5470300 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 5470201  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  5470200 gacttgcttctctgtctgtg 5470181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 6539590 - 6539809
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  6539590 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 6539689  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  6539690 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 6539789  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  6539790 gacttgcttctctgtctgtg 6539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7999972 - 7999753
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  7999972 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 7999873  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  7999872 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 7999773  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  7999772 gacttgcttctctgtctgtg 7999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10646485 - 10646266
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  10646485 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 10646386  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  10646385 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 10646286  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  10646285 gacttgcttctctgtctgtg 10646266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 17981797 - 17982016
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  17981797 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 17981896  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  17981897 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 17981996  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  17981997 gacttgcttctctgtctgtg 17982016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18228608 - 18228389
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18228608 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18228509  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  18228508 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 18228409  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  18228408 gacttgcttctctgtctgtg 18228389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19697902 - 19697687
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  19697902 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 19697803  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| | ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  19697802 taggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctct 19697703  T
Q  203 gacttgcttttcggtc 218  Q
    |||||| || ||||||    
T  19697702 gacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22867696 - 22867915
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  22867696 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 22867795  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  22867796 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 22867895  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  22867896 gacttgcttctctgtctgtg 22867915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22882755 - 22882974
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  22882755 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 22882854  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  22882855 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 22882954  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  22882955 gacttgcttctctgtctgtg 22882974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 16621338 - 16621555
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||    
T  16621338 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 16621437  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16621438 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctct 16621537  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| || ||||||||    
T  16621538 gacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24331575 - 24331356
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||    
T  24331575 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattccatacaa 24331476  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  24331475 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 24331376  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  24331375 gacttgcttctctgtctgtg 24331356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 31961303 - 31961522
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  31961303 atcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 31961402  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  31961403 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 31961502  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  31961503 gacttgcttctctgtctgtg 31961522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51785435 - 51785216
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  51785435 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 51785336  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  51785335 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 51785236  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  51785235 gacttgcttctctgtctgtg 51785216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 17992779 - 17992889
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  17992779 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 17992878  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||||||||||    
T  17992879 taggttgattc 17992889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 31033084 - 31033194
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  31033084 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataa 31033183  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  31033184 taggctgattc 31033194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4627197 - 4627087
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4627197 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4627098  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  4627097 taggctgattc 4627087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32294040 - 32293930
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  32294040 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 32293941  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  32293940 taggctgattc 32293930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5714485 - 5714375
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  5714485 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 5714386  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  5714385 taggctgattc 5714375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5725395 - 5725285
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  5725395 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 5725296  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  5725295 taggctgattc 5725285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 5766973 - 5767083
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  5766973 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 5767072  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  5767073 taggctgattc 5767083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 15592879 - 15592939
Alignment:
Q  123 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 183  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15592879 aatttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15592939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Original strand, 6963281 - 6963363
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 85  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  ||||||| || || ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6963281 atcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 6963363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15918807 - 15918749
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 183  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15918807 tttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15918749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20443407 - 20443349
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 183  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20443407 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 20443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41440533 - 41440475
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 183  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41440533 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 41440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 5950772 - 5950828
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950772 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 10913559 - 10913778
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  10913559 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 10913658  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10913659 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 10913758  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  10913759 gacttgcttctcggtctgtg 10913778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26516240 - 26516032
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  26516240 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 26516141  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26516140 taggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 26516041  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  26516040 gacttgctt 26516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2158022 - 2157803
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  2158022 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 2157923  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2157922 taggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 2157823  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2157822 gacttgcttctcggtctgtg 2157803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26438705 - 26438486
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  26438705 atcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 26438606  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  26438605 taggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 26438506  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  26438505 gacttgtttctcggtctgtg 26438486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 26534563 - 26534782
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  26534563 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 26534662  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26534663 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 26534762  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  26534763 gacttgcttctcggtttgtg 26534782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 2106853 - 2107072
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  2106853 atcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 2106952  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    ||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2106953 taggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 2107052  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  2107053 gacttgcttctcggtatgtg 2107072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 11421469 - 11421688
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  11421469 atcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 11421568  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11421569 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaccctct 11421668  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  11421669 gacttgcttctcggtctgtg 11421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45390668 - 45390449
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  45390668 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 45390569  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  45390568 caggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 45390469  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  45390468 gacttgcttctctgtctgtg 45390449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 16515120 - 16515337
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||    
T  16515120 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattccatacaa 16515219  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  16515220 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctct 16515319  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  16515320 gacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5131444 - 5131225
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  5131444 atcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 5131345  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5131344 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 5131245  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  5131244 gacttgcttctctgtctgtg 5131225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 5144030 - 5144249
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  5144030 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 5144129  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  5144130 taggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaacctct 5144229  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  5144230 gacttgcttctcggtctgtg 5144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22145643 - 22145424
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  22145643 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 22145544  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  22145543 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctct 22145444  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
     ||||| || ||||||||||    
T  22145443 aacttgtttctcggtctgtg 22145424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 26271776 - 26271995
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  26271776 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaa 26271875  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26271876 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 26271975  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  26271976 gacttgcttctctgtctgtg 26271995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 26316538 - 26316757
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  26316538 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 26316637  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  26316638 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 26316737  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  26316738 gacttgcttctctgtctgtg 26316757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10845068 - 10844851
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  10845068 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 10844969  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10844968 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctct 10844869  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| || ||||||||    
T  10844868 gacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16044742 - 16044550
Alignment:
Q  28 ggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaattt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| | |||||| |||||| |  |||| || ||    
T  16044742 ggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtaactt 16044643  T
Q  128 gaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 220  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16044642 gaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 10842684 - 10842901
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||    
T  10842684 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 10842783  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  10842784 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaacctct 10842883  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
     ||||| || ||||||||    
T  10842884 aacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 31561080 - 31561288
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  31561080 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 31561179  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  31561180 caggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 31561279  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  31561280 gacttgctt 31561288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3448754 - 3448535
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  3448754 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 3448655  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  3448654 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 3448555  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  3448554 gacttgcttctctgtctgtg 3448535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 4141936 - 4142155
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4141936 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4142035  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  4142036 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 4142135  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4142136 gacttgcttctctgtctgtg 4142155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4202837 - 4202618
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4202837 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4202738  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| ||  || || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  4202737 taggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 4202638  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
     |||||||| || |||||||    
T  4202637 aacttgcttctctgtctgtg 4202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11444335 - 11444116
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  11444335 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 11444236  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||     
T  11444235 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctct 11444136  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  11444135 gacttgcttctctgtctgtg 11444116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 24589224 - 24589443
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  24589224 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 24589323  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  24589324 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 24589423  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  24589424 gacttgcttctctgtctgtg 24589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 16748207 - 16748415
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  16748207 atcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 16748306  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     |||||||||| |  |||| |  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  16748307 caggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 16748406  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  16748407 gacttgctt 16748415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 26666604 - 26666823
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |    
T  26666604 atcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacga 26666703  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  26666704 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 26666803  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  26666804 gacttgcttctctgtctgtg 26666823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 16446696 - 16446894
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| | ||    
T  16446696 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttccatacaa 16446795  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 201  Q
    |||  |||||| |  |||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16446796 tagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaacctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621879
Alignment:
Q  73 aagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcggga 172  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  173 gatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 9621879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2776702 - 2776592
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  2776702 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 2776603  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  2776602 taggctgattc 2776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 26512386 - 26512496
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26512386 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26512485  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  26512486 taggctgattc 26512496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 26681796 - 26681906
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26681796 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26681895  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  26681896 taggctgattc 26681906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31127355 - 31127245
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  31127355 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 31127256  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  31127255 taggctgattc 31127245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 39209829 - 39209939
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  39209829 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 39209928  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||||||||||    
T  39209929 taggttgattc 39209939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 45734761 - 45734658
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  45734761 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 45734662  T
Q  103 tagg 106  Q
    ||||    
T  45734661 tagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 31087312 - 31087422
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  31087312 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 31087411  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  31087412 taggctgattc 31087422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9469646 - 9469590
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469646 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Original strand, 16287201 - 16287249
Alignment:
Q  135 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 183  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16287201 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 16287249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 16393246 - 16393302
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 30369758 - 30369814
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369758 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27022584 - 27022365
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27022584 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27022485  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27022484 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 27022385  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  27022384 gacttgcttctcggtctgtg 27022365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 27287112 - 27287331
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27287112 atcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27287211  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||  || |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27287212 taggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 27287311  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  27287312 gacttgcttctcggtctgtg 27287331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29553005 - 29552786
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  29553005 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 29552906  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29552905 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 29552806  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  29552805 gacttgcttctcagtctgtg 29552786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 13295699 - 13295918
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||    
T  13295699 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattccatacaa 13295798  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  13295799 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 13295898  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  13295899 gacttgcttctcggtctgtg 13295918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 15421068 - 15421287
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  15421068 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 15421167  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15421168 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 15421267  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15421268 gacttgcttctcggtctgtg 15421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22931632 - 22931851
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  22931632 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 22931731  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22931732 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 22931831  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  22931832 gacttgcttctcggtctgtg 22931851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 23854077 - 23854296
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  23854077 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 23854176  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23854177 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 23854276  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  23854277 gacttgcttctcggtctgtg 23854296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24867164 - 24866945
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  24867164 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 24867065  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24867064 taggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 24866965  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  24866964 gacttgcttctcggtctgtg 24866945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 27626459 - 27626674
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  27626459 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaa 27626558  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27626559 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 27626658  T
Q  203 gacttgcttttcggtc 218  Q
    ||||||||| ||||||    
T  27626659 gacttgcttctcggtc 27626674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16677588 - 16677369
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  16677588 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 16677489  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16677488 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 16677389  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || || |||||||    
T  16677388 gacttgtttctctgtctgtg 16677369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27179904 - 27179685
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27179904 atcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaa 27179805  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27179804 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 27179705  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  27179704 gacttgcttctcggtctgtg 27179685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 27269335 - 27269554
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27269335 atcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaa 27269434  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27269435 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 27269534  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  27269535 gacttgcttctcggtctgtg 27269554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 34461254 - 34461473
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  34461254 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 34461353  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34461354 caggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 34461453  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  34461454 gacttgcttctcagtctgtg 34461473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3699531 - 3699312
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3699531 atcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 3699432  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3699431 taggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 3699332  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || || |||||||    
T  3699331 gacttgtttctctgtctgtg 3699312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4761211 - 4760992
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4761211 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4761112  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  4761111 taggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 4761012  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4761011 gacttgcttctctgtctgtg 4760992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 17089191 - 17089406
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||    
T  17089191 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccacacaa 17089290  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17089291 taggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 17089390  T
Q  203 gacttgcttttcggtc 218  Q
    ||||||||| ||||||    
T  17089391 gacttgcttctcggtc 17089406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27011179 - 27010960
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27011179 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27011080  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  27011079 taggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 27010980  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  27010979 gacttgcttctctgtctgtg 27010960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26921819 - 26921606
Alignment:
Q  9 ggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 108  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||| |    
T  26921819 ggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggct 26921720  T
Q  109 gattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 208  Q
    ||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921719 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 26921620  T
Q  209 cttttcggtctgtg 222  Q
    ||| ||||||||||    
T  26921619 cttctcggtctgtg 26921606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16753263 - 16753050
Alignment:
Q  9 ggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 108  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |    
T  16753263 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggct 16753164  T
Q  109 gattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 208  Q
    ||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16753163 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttg 16753064  T
Q  209 cttttcggtctgtg 222  Q
     || ||||||||||    
T  16753063 tttctcggtctgtg 16753050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27060954 - 27060735
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  27060954 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 27060855  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  27060854 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctct 27060755  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  27060754 gacttgcttctctgtctgtg 27060735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29504864 - 29504645
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  29504864 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 29504765  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  29504764 caggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctct 29504665  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  29504664 gacttgcttctctgtctgtg 29504645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4528733 - 4528514
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||    
T  4528733 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaa 4528634  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  4528633 caggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 4528534  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4528533 gacttgcttctctgtctgtg 4528514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 4542522 - 4542741
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4542522 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4542621  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  4542622 caggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 4542721  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4542722 gacttgcttctctgtctgtg 4542741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 4720883 - 4721102
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4720883 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4720982  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  4720983 caggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 4721082  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4721083 gacttgcttctctgtctgtg 4721102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27488581 - 27488362
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27488581 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27488482  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  27488481 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 27488382  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  27488381 gacttgcttctctgtctgtg 27488362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29576462 - 29576243
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  29576462 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 29576363  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  29576362 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctct 29576263  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  29576262 gacttgcttctctgtctgtg 29576243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 30554764 - 30554983
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  30554764 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 30554863  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  30554864 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 30554963  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  30554964 gacttgcttctctgtctgtg 30554983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20171995 - 20171797
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  20171995 atcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaa 20171896  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 201  Q
    | ||||||||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20171895 tgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 22163996 - 22164194
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  22163996 atcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaa 22164095  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 201  Q
    | ||||||||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22164096 tgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 16940775 - 16940994
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  16940775 atcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 16940874  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  16940875 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 16940974  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  16940975 gacttgcttctctgtctgtg 16940994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 26113160 - 26113379
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  26113160 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 26113259  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  26113260 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 26113359  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  26113360 gacttgcttctctgtctgtg 26113379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28210902 - 28210683
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  28210902 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 28210803  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  28210802 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 28210703  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  28210702 gacttgcttctctgtctgtg 28210683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4776328 - 4776109
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  4776328 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 4776229  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  4776228 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 4776129  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  4776128 gacttgcttctctgtctgtg 4776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 22455862 - 22455972
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22455862 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaa 22455961  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||||||||||    
T  22455962 taggttgattc 22455972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26992243 - 26992096
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  26992243 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatagaa 26992144  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcgg 150  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||    
T  26992143 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 14142142 - 14142252
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  14142142 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 14142241  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  14142242 taggctgattc 14142252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 26775375 - 26775485
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26775375 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26775474  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  26775475 taggctgattc 26775485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 26789264 - 26789154
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26789264 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26789165  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  26789164 taggctgattc 26789154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27197633 - 27197523
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27197633 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27197534  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  27197533 taggctgattc 27197523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 27251602 - 27251712
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27251602 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27251701  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  27251702 taggctgattc 27251712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 27358858 - 27358968
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27358858 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27358957  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  27358958 taggctgattc 27358968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 27449201 - 27449311
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27449201 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27449300  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  27449301 taggctgattc 27449311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 8902451 - 8902554
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  8902451 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 8902550  T
Q  103 tagg 106  Q
    ||||    
T  8902551 tagg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28163939 - 28163836
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  28163939 atcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 28163840  T
Q  103 tagg 106  Q
    ||||    
T  28163839 tagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 13520940 - 13521049
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||    
T  13520940 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 13521038  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  13521039 taggctgattc 13521049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 33373179 - 33373273
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 97  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33373179 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33373273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 9136223 - 9136279
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136223 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 15655460 - 15655679
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  15655460 atcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 15655559  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    | || |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15655560 tgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 15655659  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15655660 gacttgcttctcggtctgtg 15655679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41678163 - 41677944
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  41678163 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 41678064  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  41678063 taggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 41677964  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  41677963 aacttgcttctcggtctgtg 41677944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11552813 - 11552594
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  11552813 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 11552714  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11552713 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 11552614  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  11552613 gacttgcttctcagtctgtg 11552594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33295986 - 33295767
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  33295986 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 33295887  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33295886 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 33295787  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  33295786 gacttgcttctcggtctgtg 33295767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33780947 - 33780728
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  33780947 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 33780848  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33780847 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 33780748  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  33780747 gacttgcttctcggtctgtg 33780728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 40470252 - 40470460
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  40470252 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 40470351  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40470352 taggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 40470451  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  40470452 gacttgctt 40470460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22995819 - 22996038
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  22995819 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 22995918  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22995919 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 22996018  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  22996019 gacttgcttctcagtctgtg 22996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23629428 - 23629209
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  23629428 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 23629329  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23629328 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 23629229  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  23629228 gacttgcttctcggtctgtg 23629209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 24684847 - 24685066
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  24684847 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 24684946  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24684947 taggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 24685046  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  24685047 gacttgcttctcggtctgtg 24685066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24973364 - 24973145
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  24973364 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaa 24973265  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||     
T  24973264 taggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaacctct 24973165  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  24973164 gacttgcttctcggtctgtg 24973145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 18372236 - 18372455
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  18372236 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 18372335  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  18372336 caggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 18372435  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  18372436 gacttgcttctctgtctgtg 18372455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31434922 - 31434703
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  31434922 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 31434823  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  31434822 taggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 31434723  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  31434722 gacttgcttctctgtctgtg 31434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 37355345 - 37355564
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37355345 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37355444  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  37355445 caggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 37355544  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  37355545 gacttgcttctctgtctgtg 37355564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23895664 - 23895447
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  23895664 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttccatacaa 23895565  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  23895564 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctct 23895465  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| || ||||||||    
T  23895464 gacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3792999 - 3792780
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3792999 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 3792900  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3792899 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 3792800  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  3792799 gacttgcttctctgtctgtg 3792780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9320934 - 9320715
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  9320934 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 9320835  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  9320834 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 9320735  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  9320734 gacttgcttctctgtctgtg 9320715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12135633 - 12135414
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  12135633 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 12135534  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  12135533 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 12135434  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  12135433 gacttgcttctctgtctgtg 12135414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 18497427 - 18497646
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  18497427 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 18497526  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18497527 caggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 18497626  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||| || || |||||||    
T  18497627 gacttgtttctctgtctgtg 18497646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26483852 - 26483633
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  26483852 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 26483753  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  26483752 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 26483653  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  26483652 gacttgcttctctgtctgtg 26483633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34619976 - 34619757
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||    
T  34619976 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaa 34619877  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34619876 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 34619777  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  34619776 gacttgcttctctgtctgtg 34619757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43081713 - 43081494
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  43081713 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 43081614  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  43081613 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 43081514  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  43081513 gacttgcttctcggtctgtg 43081494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 13321532 - 13321751
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  13321532 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 13321631  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  13321632 caggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 13321731  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  13321732 gacttgcttctctgtctgtg 13321751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28652700 - 28652481
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  28652700 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 28652601  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  28652600 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 28652501  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  28652500 gacttgcttctcggtctgtg 28652481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30032886 - 30032667
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  30032886 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 30032787  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||| || | || |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  30032786 taggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 30032687  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  30032686 gacttgcttctctgtctgtg 30032667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 32592976 - 32593195
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||    
T  32592976 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaa 32593075  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32593076 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 32593175  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  32593176 gacttgcttctctgtctgtg 32593195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 37767693 - 37767912
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37767693 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37767792  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  37767793 caggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 37767892  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  37767893 gacttgcttctctgtctgtg 37767912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5641246 - 5641027
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  5641246 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 5641147  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  5641146 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 5641047  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  5641046 gacttgcttctctgtctgtg 5641027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6877763 - 6877544
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||    
T  6877763 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaa 6877664  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  6877663 caggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 6877564  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  6877563 gacttgcttctctgtctgtg 6877544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 8662177 - 8662396
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  8662177 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 8662276  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  8662277 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 8662376  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  8662377 gacttgcttctctgtctgtg 8662396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24586832 - 24586613
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  24586832 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 24586733  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  24586732 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 24586633  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  24586632 gacttgcttctctgtctgtg 24586613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 28956487 - 28956706
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||    
T  28956487 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaa 28956586  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28956587 taggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 28956686  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  28956687 gacttgcttctctgtctgtg 28956706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30155489 - 30155270
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  30155489 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 30155390  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  30155389 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 30155290  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  30155289 gacttgcttctctgtctgtg 30155270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30171927 - 30171708
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||    
T  30171927 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattccatacaa 30171828  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30171827 taggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 30171728  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  30171727 gacttgcttctctgtctgtg 30171708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30938093 - 30937874
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  30938093 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 30937994  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  30937993 taggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 30937894  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  30937893 gacttgcttctcggtctgtg 30937874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 31823109 - 31823328
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  31823109 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 31823208  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  31823209 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 31823308  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  31823309 gacttgcttctctgtctgtg 31823328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33519838 - 33519619
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  33519838 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 33519739  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  33519738 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 33519639  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  33519638 gacttgcttctctgtctgtg 33519619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 37668188 - 37668407
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37668188 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37668287  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  37668288 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 37668387  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  37668388 gacttgcttctctgtctgtg 37668407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37758441 - 37758222
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  37758441 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 37758342  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  37758341 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 37758242  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  37758241 gacttgcttctctgtctgtg 37758222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22891921 - 22891707
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||    
T  22891921 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 22891822  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22891821 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 22891722  T
Q  203 gacttgcttttcggt 217  Q
    |||||| || |||||    
T  22891721 gacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25203736 - 25203519
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||| | ||    
T  25203736 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaa 25203637  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  25203636 taggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctct 25203537  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| || ||||||||    
T  25203536 gacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25267891 - 25267674
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||| | ||    
T  25267891 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaa 25267792  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  25267791 taggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctct 25267692  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| || ||||||||    
T  25267691 gacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 15755554 - 15755762
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  15755554 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 15755653  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  15755654 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 15755753  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  15755754 gacttgctt 15755762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2514520 - 2514301
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||    
T  2514520 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaa 2514421  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  2514420 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 2514321  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  2514320 gacttgcttctctgtctgtg 2514301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24727427 - 24727208
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  24727427 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 24727328  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  24727327 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 24727228  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  24727227 gacttgcttctctgtctgtg 24727208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 13183495 - 13183605
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||    
T  13183495 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttccatacaa 13183594  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  13183595 taggctgattc 13183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 18125118 - 18125228
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  18125118 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 18125217  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  18125218 taggctgattc 18125228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 13439385 - 13439494
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  13439385 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 13439484  T
Q  103 taggttgatt 112  Q
    |||| |||||    
T  13439485 taggctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 9547411 - 9547521
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  9547411 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 9547510  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  9547511 taggctgattc 9547521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11327095 - 11326985
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  11327095 atcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 11326996  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||||||||||    
T  11326995 taggttgattc 11326985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Original strand, 29887925 - 29888009
Alignment:
Q  29 gacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgattc 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||||    
T  29887925 gacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgattc 29888009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33878588 - 33878479
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||    
T  33878588 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 33878490  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  33878489 taggctgattc 33878479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Original strand, 351917 - 351999
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 85  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  ||||||| || || ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  351917 atcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 351999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 5440049 - 5440105
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440049 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 11944246 - 11944302
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 15784549 - 15784605
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784549 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17957432 - 17957376
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957432 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34468948 - 34468900
Alignment:
Q  135 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 183  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34468948 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 34468900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 36375786 - 36375842
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375786 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 37000440 - 37000496
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000440 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3518 - 3301
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  3518 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 3419  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3418 taggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 3319  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  3318 gacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Original strand, 43877 - 44015
Alignment:
Q  84 cattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 183  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43877 cattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 43976  T
Q  184 aacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  43977 aacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtg 44015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 220
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  149 ggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9487 - 9268
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||    
T  9487 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaa 9388  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9387 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 9288  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  9287 gacttgcttctcggtctgtg 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30744 - 30525
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  30744 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 30645  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  30644 caggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 30545  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  30544 gacttgcttctcggtctgtg 30525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19521 - 19304
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||    
T  19521 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaa 19422  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  19421 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctct 19322  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
     ||||| || ||||||||    
T  19321 aacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 7411 - 7301
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  7411 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 7312  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  7311 taggctgattc 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 21894554 - 21894762
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  21894554 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 21894653  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21894654 taggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctct 21894753  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  21894754 gacttgctt 21894762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3644588 - 3644366
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataat-ctttgatgctatcaaaagcttcct-ggcattcattattccacat 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |     
T  3644588 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattccatac 3644489  T
Q  101 aataggttgattcattt-tgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 199  Q
    |||||| |||||| ||| | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644488 aataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 3644389  T
Q  200 tcggacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    || ||||||||| || |||||||    
T  3644388 tctgacttgcttctctgtctgtg 3644366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51641671 - 51641452
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  51641671 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 51641572  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  51641571 caggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 51641472  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  51641471 gacttgcttctctgtctgtg 51641452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 20339106 - 20339320
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||    
T  20339106 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaa 20339205  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20339206 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctct 20339305  T
Q  203 gacttgcttttcggt 217  Q
    |||||||||||||||    
T  20339306 gacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10966118 - 10965910
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  10966118 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 10966019  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| |||||| |  |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  10966018 caggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 10965919  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  10965918 gacttgctt 10965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28588438 - 28588219
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  28588438 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 28588339  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28588338 caggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctct 28588239  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  28588238 gacttgcttctctgtctgtg 28588219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 41790115 - 41790323
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  41790115 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 41790214  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  41790215 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 41790314  T
Q  203 gacttgctt 211  Q
    |||||||||    
T  41790315 gacttgctt 41790323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10948530 - 10948311
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  10948530 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 10948431  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  10948430 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 10948331  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  10948330 gacttgcttctctgtctgtg 10948311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Original strand, 16204839 - 16205055
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||| | ||    
T  16204839 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttccatacaa 16204938  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||     
T  16204939 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaacctct 16205038  T
Q  203 gacttgcttttcggtct 219  Q
    ||||||||| |||||||    
T  16205039 gacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20464404 - 20464212
Alignment:
Q  28 ggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaattt 127  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| |||||| |  |||| |  ||    
T  20464404 ggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagctt 20464305  T
Q  128 gaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 220  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  20464304 gaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgtttctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28153189 - 28153079
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  28153189 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 28153090  T
Q  103 taggttgattc 113  Q
    |||| ||||||    
T  28153089 taggctgattc 28153079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16032 - 15813
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  16032 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 15933  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15932 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctct 15833  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15832 gacttgcttctcggtctgtg 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 1429 - 1643
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||    
T  1429 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaa 1528  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1529 taggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctct 1628  T
Q  203 gacttgcttttcggt 217  Q
    |||||||||||||||    
T  1629 gacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22996 - 23215
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  22996 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 23095  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  23096 taggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 23195  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  23196 gacttgcttctctgtctgtg 23215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9473 - 9254
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  9473 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 9374  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  9373 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 9274  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  9273 gacttgcttctctgtctgtg 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13022 - 12803
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  13022 atcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 12923  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||  || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||     
T  12922 caggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctct 12823  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  12822 gacttgcttctctgtctgtg 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 11733 - 11952
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  11733 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 11832  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  11833 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 11932  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  11933 gacttgcttctctgtctgtg 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 5984 - 6203
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||    
T  5984 atcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaa 6083  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  6084 caggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 6183  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  6184 gacttgcttctctgtctgtg 6203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23111
Alignment:
Q  150 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 23111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11400 - 11181
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  11400 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 11301  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  11300 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctct 11201  T
Q  203 gacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  11200 gacttgcttctctgtctgtg 11181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9496 - 9279
Alignment:
Q  3 atcaagggcctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 102  Q
    ||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||  | || |||||||  ||||| | ||    
T  9496 atcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttccatacaa 9397  T
Q  103 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 202  Q
    |||| |||||| |   ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  9396 taggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaagcctct 9297  T
Q  203 gacttgcttttcggtctg 220  Q
    |||||| || ||||||||    
T  9296 gacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 5484 - 5693
Alignment:
Q  11 cctttcttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttga 110  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || |  | |||||||    
T  5484 ccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttcataccacaggttga 5583  T
Q  111 ttcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgct 210  Q
    ||  |  |||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5584 tttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaacctctgacttgct 5683  T
Q  211 tttcggtctg 220  Q
    | || |||||    
T  5684 tctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1251 - 1155
Alignment:
Q  126 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 222  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1251 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Original strand, 43666 - 43754
Alignment:
Q  126 ttgaaaattggcccgcaggtt-gcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaa-ttcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttt 212  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  43666 ttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaacctctgacttgcttt 43754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 35165 - 35225
Alignment:
Q  123 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 183  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35165 aatttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 35225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33706
Alignment:
Q  147 gcggtcatatgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaaacg-cccgaggaaacctcggacttg 208  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttg 33706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29499 - 29443
Alignment:
Q  125 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 181  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29499 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University