View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15040_high_14 (Length: 435)

Name: NF15040_high_14
Description: NF15040
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15040_high_14
NF15040_high_14
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (16-417)||(46569696-46570097)
chr4 (136-417)||(26363882-26364163)
chr4 (136-413)||(8665027-8665305)
chr4 (140-402)||(40630616-40630878)
chr4 (136-402)||(50674116-50674382)
chr4 (136-402)||(54882652-54882918)
chr4 (139-402)||(6655588-6655851)
chr4 (136-402)||(55085635-55085902)
chr4 (136-402)||(50262968-50263234)
chr4 (192-402)||(2209340-2209550)
chr4 (136-385)||(12073042-12073290)
chr4 (188-413)||(27417273-27417498)
chr4 (136-413)||(41964037-41964313)
chr4 (140-400)||(46703135-46703394)
chr4 (140-382)||(35662094-35662336)
chr4 (140-384)||(379028-379273)
chr4 (140-395)||(33989501-33989756)
chr4 (136-311)||(8647861-8648036)
chr4 (243-413)||(10071505-10071676)
chr4 (249-413)||(8653220-8653385)
chr4 (175-351)||(33089582-33089758)
chr4 (255-413)||(22883141-22883300)
chr4 (255-413)||(22934805-22934964)
chr4 (145-397)||(26699724-26699979)
chr4 (192-377)||(38811405-38811590)
chr4 (240-342)||(10071963-10072065)
chr4 (233-402)||(3785722-3785891)
chr4 (262-402)||(35370732-35370874)
chr4 (262-402)||(35369834-35369971)
chr4 (250-385)||(47514885-47515021)
chr4 (140-332)||(34112314-34112506)
chr4 (207-402)||(25723557-25723752)
chr4 (141-293)||(12119281-12119432)
chr4 (279-381)||(32091222-32091326)
chr4 (235-331)||(6719289-6719384)
chr4 (231-376)||(22629254-22629399)
chr4 (136-169)||(2209578-2209611)
chr4 (230-319)||(43135810-43135897)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (139-402)||(6960-7223)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (136-417)||(11383603-11383884)
chr8 (136-402)||(42435261-42435527)
chr8 (136-405)||(44353424-44353690)
chr8 (136-402)||(40221376-40221643)
chr8 (178-417)||(22976151-22976389)
chr8 (136-402)||(4283178-4283422)
chr8 (136-337)||(40328476-40328677)
chr8 (175-382)||(2999829-3000037)
chr8 (140-402)||(40585356-40585619)
chr8 (265-395)||(20686456-20686586)
chr8 (201-369)||(3846153-3846321)
chr8 (145-338)||(9633816-9634007)
chr8 (232-348)||(40535538-40535652)
chr8 (209-372)||(3817675-3817840)
chr8 (181-378)||(11136796-11136994)
chr8 (250-324)||(10020150-10020224)
chr8 (231-320)||(10101525-10101613)
chr8 (340-402)||(10239720-10239782)
chr8 (136-189)||(18655246-18655299)
chr8 (210-293)||(40873414-40873497)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (136-418)||(40146877-40147159)
chr5 (136-405)||(213097-213367)
chr5 (136-402)||(38746637-38746903)
chr5 (136-383)||(27015183-27015430)
chr5 (139-417)||(5057666-5057942)
chr5 (136-385)||(28277964-28278214)
chr5 (136-413)||(27637884-27638161)
chr5 (197-413)||(16642209-16642424)
chr5 (143-380)||(316419-316655)
chr5 (214-396)||(35615809-35615992)
chr5 (197-396)||(30802579-30802778)
chr5 (200-397)||(10055040-10055238)
chr5 (140-384)||(4160284-4160527)
chr5 (200-402)||(30792872-30793073)
chr5 (232-400)||(14689774-14689942)
chr5 (140-329)||(33906303-33906491)
chr5 (321-413)||(33906586-33906678)
chr5 (141-290)||(21205927-21206076)
chr5 (141-198)||(16641215-16641272)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (136-413)||(1632002-1632279)
chr2 (136-417)||(45726547-45726827)
chr2 (136-417)||(35447154-35447435)
chr2 (136-385)||(42288380-42288628)
chr2 (140-413)||(17450212-17450485)
chr2 (176-413)||(7450921-7451158)
chr2 (140-385)||(33647817-33648064)
chr2 (140-397)||(24397701-24397952)
chr2 (207-402)||(42261950-42262146)
chr2 (207-402)||(30218374-30218570)
chr2 (228-376)||(40935542-40935690)
chr2 (229-290)||(24197643-24197703)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (140-413)||(34603197-34603470)
chr1 (136-402)||(29135880-29136145)
chr1 (140-413)||(34602613-34602886)
chr1 (136-402)||(13547359-13547625)
chr1 (136-402)||(13549270-13549536)
chr1 (136-405)||(11348327-11348596)
chr1 (141-413)||(19754112-19754384)
chr1 (136-383)||(37167948-37168195)
chr1 (140-413)||(7482504-7482778)
chr1 (136-402)||(37879181-37879447)
chr1 (136-413)||(47255610-47255881)
chr1 (136-402)||(193244-193509)
chr1 (136-398)||(42298245-42298507)
chr1 (136-413)||(19752307-19752583)
chr1 (136-402)||(37033343-37033605)
chr1 (136-381)||(47114825-47115069)
chr1 (136-381)||(28242041-28242286)
chr1 (145-402)||(41135452-41135709)
chr1 (145-397)||(6808083-6808336)
chr1 (145-382)||(9109680-9109918)
chr1 (136-259)||(31925976-31926099)
chr1 (266-413)||(31928208-31928348)
chr1 (262-381)||(22078995-22079107)
chr1 (140-339)||(16216769-16216966)
chr1 (175-252)||(4535783-4535861)
chr1 (250-295)||(3331283-3331328)
chr1 (202-324)||(38747052-38747173)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (136-402)||(49199740-49200007)
chr3 (136-402)||(43404003-43404269)
chr3 (136-413)||(30235745-30236023)
chr3 (136-402)||(43402060-43402326)
chr3 (136-395)||(6095869-6096128)
chr3 (136-413)||(34490833-34491111)
chr3 (136-417)||(54593321-54593603)
chr3 (136-417)||(55302235-55302516)
chr3 (136-402)||(4569583-4569849)
chr3 (136-413)||(47303872-47304149)
chr3 (136-402)||(40912969-40913237)
chr3 (136-402)||(36018482-36018749)
chr3 (140-384)||(46860120-46860365)
chr3 (145-385)||(41819801-41820040)
chr3 (162-413)||(28074238-28074488)
chr3 (141-397)||(5434152-5434410)
chr3 (140-413)||(34795490-34795763)
chr3 (207-402)||(39127191-39127386)
chr3 (214-395)||(26323860-26324042)
chr3 (140-376)||(1683146-1683382)
chr3 (324-402)||(31340499-31340577)
chr3 (140-402)||(35138980-35139250)
chr3 (166-376)||(36796064-36796279)
chr3 (238-293)||(31340448-31340503)
chr3 (233-288)||(1737257-1737311)
chr3 (232-293)||(22859306-22859368)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (136-405)||(6431600-6431869)
chr7 (136-402)||(2361241-2361507)
chr7 (136-413)||(4512660-4512936)
chr7 (136-382)||(2389934-2390180)
chr7 (136-405)||(34310986-34311256)
chr7 (136-400)||(48599604-48599858)
chr7 (136-402)||(29608373-29608634)
chr7 (136-402)||(6360182-6360448)
chr7 (136-413)||(22269595-22269871)
chr7 (219-417)||(32358189-32358387)
chr7 (140-413)||(3258616-3258890)
chr7 (136-413)||(4510818-4511086)
chr7 (136-413)||(4508976-4509244)
chr7 (141-385)||(22328673-22328919)
chr7 (294-402)||(30814397-30814505)
chr7 (136-251)||(8359588-8359703)
chr7 (207-396)||(5116272-5116462)
chr7 (210-324)||(22552782-22552895)
chr7 (268-317)||(37545308-37545357)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (136-402)||(3808978-3809245)
chr6 (136-403)||(2973209-2973477)
chr6 (136-417)||(17762604-17762887)
chr6 (140-417)||(21593283-21593560)
chr6 (138-384)||(5043278-5043523)
chr6 (136-419)||(26830394-26830677)
chr6 (140-398)||(22425099-22425358)
chr6 (136-336)||(603350-603550)
chr6 (136-324)||(17757792-17757982)
chr6 (175-366)||(26800438-26800629)
chr6 (142-402)||(25072817-25073076)
chr6 (133-195)||(5741057-5741119)
chr6 (362-403)||(26661580-26661621)
chr6 (362-403)||(26767551-26767592)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (136-400)||(80553-80817)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (139-402)||(11190-11453)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (136-405)||(18271-18539)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (207-402)||(490785-490981)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (255-413)||(1794-1953)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 417
Target Start/End: Original strand, 46569696 - 46570097
Alignment:
Q  16 caatatggtagttcaaactctccttttattacttaatcacattaccctcattcaccctcaatcttcttgtatttaatagtttgttataaaatgcattata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  46569696 caatatggtagttcaaactctccttttattacttaatcacattaccctcattcaccctcaatcttcttgcatttaatagtttgttataaaaagcattatg 46569795  T
Q  116 ctaatgtaaatgtattatgattcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttcca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46569796 ctaatgtaaatgtattatgattcaataaggaccttctcttttggtttcataagattcacctaagttgttcacaaaagactttccactcatttgtttccca 46569895  T
Q  216 accccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaa 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46569896 accccatgaatctttcccaaaaggcaccaatccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacctaaa 46569995  T
Q  316 gaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttaca 415  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46569996 gaccttcaacatttagtatctaaaaccctaaaatttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttaca 46570095  T
Q  416 ta 417  Q
    ||    
T  46570096 ta 46570097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 136 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26364163 - 26363882
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26364163 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaa 26364064  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  26364063 aaggccccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaggccctcaacctttagtatc 26363964  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26363963 taaaaccctaaaagttccctcccttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttacata 26363882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8665305 - 8665027
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8665305 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 8665206  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8665205 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 8665106  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaac-aaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  8665105 taaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacctaacaaaatgggtcatggagtgctta 8665027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40630878 - 40630616
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40630878 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagg 40630779  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40630778 caccaacccttttcacaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 40630679  T
Q  340 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40630678 accctaaaagtttcatcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 40630616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 50674116 - 50674382
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  50674116 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccat 50674215  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||     
T  50674216 aaggcaccaacccttttcattagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccttaacatttagtatt 50674315  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50674316 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 50674382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 54882918 - 54882652
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  54882918 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacgagactcacccaagtttctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaa 54882819  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54882818 aaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 54882719  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  54882718 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcactaagcttacccaacaaatgagtca 54882652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 139 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6655851 - 6655588
Alignment:
Q  139 actaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaag 238  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6655851 actaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaag 6655752  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6655751 gcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 6655652  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6655651 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagatttaccaagcttacccaacaaatgggtca 6655588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 55085635 - 55085902
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55085635 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacacaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 55085734  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttg-aagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  55085735 aaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaaagcttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtat 55085834  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55085835 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttcattgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 55085902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 50262968 - 50263234
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50262968 ttcactaagggtcttctcttttggtttcacaagagtcaccgaggttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 50263067  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||    
T  50263068 aaggcaccaaccctttttccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtgtc 50263167  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  50263168 taaaaccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaaactttttcaacaaatgggtca 50263234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 192 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2209550 - 2209340
Alignment:
Q  192 gactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatc 291  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2209550 gactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcgtttggttctccaagattcacatc 2209451  T
Q  292 ttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2209450 ttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcatttgctttccatgagattcaccaagcttacccaa 2209351  T
Q  392 caaatgggtca 402  Q
    |||||||||||    
T  2209350 caaatgggtca 2209340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 136 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12073290 - 12073042
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12073290 ttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactcttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccc-aa 12073192  T
Q  236 aaggcaccaaccctttt-cacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12073191 aaggcaccaaccctttttcccaagag-cccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtat 12073093  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 385  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073092 ctaaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattcaccaagctt 12073042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 188 - 413
Target Start/End: Original strand, 27417273 - 27417498
Alignment:
Q  188 aaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattca 287  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27417273 aaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagacaccaacccctttcccaagagccccttcttttggttctccaagattca 27417372  T
Q  288 catcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgc 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27417373 catcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaagcttac 27417472  T
Q  388 ccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  27417473 ccaacaaatgggtcatggagtgctta 27417498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41964313 - 41964037
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41964313 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaa 41964214  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41964213 aag--actaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 41964116  T
Q  336 ta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| | |||||||    
T  41964115 tacataccctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaaactttctcaccaaatgggtcatagagtgctta 41964037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 140 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 46703394 - 46703135
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| |||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46703394 ctaaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctgacaaaagactctccattcatgt-tttcccatccccatgaatcttccccaaaagg 46703296  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46703295 caccaacccttttcccaagagccccctcttttgattctcgaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 46703196  T
Q  340 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  46703195 accctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcctcctcagcaaatgggt 46703135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 140 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35662336 - 35662094
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35662336 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaagaactctccattcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 35662237  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  35662236 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttctccaagattcacatattgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtatctaaa 35662137  T
Q  340 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaag 382  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35662136 atcctaaaagttctctcatttggtgtccatgagattcaccaag 35662094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 140 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 379273 - 379028
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||    
T  379273 ctaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccattctcatgaatcttccccaaaagg 379174  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta-a 338  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |    
T  379173 caccgacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagtccctcaacctttagtatctaca 379074  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagct 384  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  379073 aatcctaaaagttctctcctttggtttccacgagattcaccaagct 379028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33989756 - 33989501
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  33989756 ctaaggatcttctcttttggtttcaaaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaatcccatgaatctctcccaaaagg 33989657  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    |||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33989656 caccaacc-ttctcccaagagccccctattttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatctaaa 33989558  T
Q  340 -accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaa 395  Q
     ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33989557 taccctaaaagttatctgctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaa 33989501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 136 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8648036 - 8647861
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8648036 ttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 8647937  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacc 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8647936 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacc 8647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10071676 - 10071505
Alignment:
Q  243 caacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaacc 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10071676 caacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaacc 10071577  T
Q  343 ctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaac-aaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10071576 ttaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagattacccaacaaaatgggtcatggagtgctta 10071505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 249 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8653385 - 8653220
Alignment:
Q  249 ttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaa 348  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8653385 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 8653286  T
Q  349 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaac-aaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  8653285 gttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacctaacaaaatgggtcatggagtgctta 8653220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33089758 - 33089582
Alignment:
Q  175 ccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttgg 273  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  33089758 ccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcgaccccatgaatctctctccaaaagacaccaaccctctcc-caagagccccctcttttga 33089660  T
Q  274 ttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagtt 351  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33089659 ttctccaagattcacatcttcaaactttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaatacctaaaagtt 33089582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 413
Target Start/End: Original strand, 22883141 - 22883300
Alignment:
Q  255 caagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttcc 353  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22883141 caagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaataccctaaaatttcc 22883240  T
Q  354 ctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||    
T  22883241 ctcatttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggttaaggagtgctta 22883300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 413
Target Start/End: Original strand, 22934805 - 22934964
Alignment:
Q  255 caagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttcc 353  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22934805 caagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaataccctaaaatttcc 22934904  T
Q  354 ctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||    
T  22934905 ctcatttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggttaaggagtgctta 22934964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 397
Target Start/End: Original strand, 26699724 - 26699979
Alignment:
Q  145 gatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcacc 243  Q
    |||| |||||||||||||   |||| |||||  |||||||||| || || | ||||||||| | | | || ||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  26699724 gatcatctcttttagttttctaagactcatctgagttgttcactaatgaatctccactcatgtatctcccgaccccatgaatctcttctgaaaaggcacc 26699823  T
Q  244 aacccttttcacaagagtcccct-cttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-ac 341  Q
    |||||||||  |||||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  |    
T  26699824 aaccctttttccaagatcccccttcatttggctctctaagattcacatcttgaagttttgaacctcaaccaaagatcttcaacctttagtatctaaatgc 26699923  T
Q  342 cctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatg 397  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26699924 cctacaagttccctcatttggtttccatgagattcacaaagcttgctcaacaaatg 26699979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 377
Target Start/End: Original strand, 38811405 - 38811590
Alignment:
Q  192 gactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacat 290  Q
    |||| |||||| || ||||| | |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38811405 gactctccacttatgtgtttcctaacctcatgaatctctccgcaaaagacaccaaccctttcc-caagag-cccctctttgggttctccaagattcacat 38811502  T
Q  291 cttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattca 377  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38811503 cttaaagctttgaacctcacccaaataccctcaacctttagtatctaagtaccctaaaagttccctcctttagtttccatgagattca 38811590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10072065 - 10071963
Alignment:
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10072065 caccaacccttttcacaagagccccctcttttagttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 10071966  T
Q  340 acc 342  Q
    |||    
T  10071965 acc 10071963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3785891 - 3785722
Alignment:
Q  233 caaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||    
T  3785891 caaaaggcaccaacccttttc-caagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaatctcgcctaaagactctcaacctttagt 3785793  T
Q  333 atcta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||| |   | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  3785792 atccatgtatcctaaaagttccatcctttgatttccatgagatccaccaaacttactcaacaaatgggtca 3785722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 262 - 402
Target Start/End: Original strand, 35370732 - 35370874
Alignment:
Q  262 cccctctttt-ggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctt 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35370732 cccctcttttaggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctctcccaaagaccctcaacctttagtatctaaataccttaaaagttccctcctt 35370831  T
Q  360 tggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||    
T  35370832 tgatttccatgagattcatcaagcttactcaatagatgggtca 35370874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 402
Target Start/End: Original strand, 35369834 - 35369971
Alignment:
Q  262 cccctctttt-ggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctccttt 360  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  35369834 cccctcttttaggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa----taaaagttccctccttt 35369929  T
Q  361 ggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
      ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  35369930 aatttccatgagattcatcaagcttactcaacagatgggtca 35369971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 385
Target Start/End: Original strand, 47514885 - 47515021
Alignment:
Q  250 tttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aaccctaaaa 348  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||    
T  47514885 tttcccaagagtccactcttttggttcaccaagattcatatcttgaagctttgaacttcacccgaagaccttcaacctttagtgtttaagtaccctaaaa 47514984  T
Q  349 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 385  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  47514985 gttcactcatttggtttccatgagattccacaagctt 47515021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34112506 - 34112314
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    ||||||||||||  ||||  |||  |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  34112506 ctaaggatcttcagttttgtttttccaagattcatccaagttgctcacagatgactctccactcatgtgttttccaaccccgtgaacctctccccaaaag 34112407  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagt 332  Q
    |||||||||||||||  ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||  | ||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34112406 gcaccaacccttttc-taagagcctcgtctttaggttatccaagattcacaattggacattttgaatctcacacaaagaccctcaatctttagt 34112314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 402
Target Start/End: Original strand, 25723557 - 25723752
Alignment:
Q  207 tgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 305  Q
    ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||  |||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25723557 tgtttcccaaccccacgaagctctctccaaaaggcattaaccattatc-caagagctccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaac 25723655  T
Q  306 ctcac-ccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||| | ||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  25723656 ctccctccaaagac--tcaacatttagtattgaagtaccctaagagttcactcatttggtttccatgaaattcaccaagcttacttaacaaataggtca 25723752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12119432 - 12119281
Alignment:
Q  141 taaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggc 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||| ||||||| || |  ||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  12119432 taaggatcttctcttttggtttcacaagacacacccaaattgctcacaaatgattcaccactaatgtgtttcgcaaccccatgaatcttcccaaaaggga 12119333  T
Q  241 accaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatctt 293  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  12119332 accaaccc-tttcccaagagttcccttttttaattctccaagattcatatctt 12119281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32091326 - 32091222
Alignment:
Q  279 caagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa--accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattc 376  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  32091326 caagattcacatcttgaagttttgaacctcactcaaagaccctcaacatttagtatccaaaataccttaaaaattccctcttttagtttccatgaaattc 32091227  T
Q  377 accaa 381  Q
    |||||    
T  32091226 accaa 32091222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6719384 - 6719289
Alignment:
Q  235 aaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttag 331  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  6719384 aaaggcatcaaccctttcc-caagaatccactcttttagttttccaagattcacatcttgaacctttgaatctcaccctaaaaccttcaacctttag 6719289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 376
Target Start/End: Original strand, 22629254 - 22629399
Alignment:
Q  231 cccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatcttta 330  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||  | || |||||    
T  22629254 cccaaaaggcactaaccattttt-caatattctcctattttggttctccaagattcacatcttgaacttttaaatctcacccagagacactgaaccttta 22629352  T
Q  331 gtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattc 376  Q
    || ||||||   ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  22629353 gtttctaaatttcctaaaagttcactcatttggtttctatgagattc 22629399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2209611 - 2209578
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaaga 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2209611 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaaga 2209578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 319
Target Start/End: Original strand, 43135810 - 43135897
Alignment:
Q  230 ccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacc 319  Q
    ||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||  |||| ||| |||||||||||||    
T  43135810 ccccaaaagacaccaaccctct-ctcaagag-cccctcttttggttcaccatgattcacatttggacactttaaacatcacccaaagacc 43135897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 139 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7223 - 6960
Alignment:
Q  139 actaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaag 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7223 actaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaag 7124  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7123 gcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 7024  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7023 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 136 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11383884 - 11383603
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11383884 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactttccacttatgtatttcccaaccccatgaatcttcctcaa 11383785  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11383784 aaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 11383685  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11383684 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcctaacaaatgggacatggagtgcttacata 11383603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 42435261 - 42435527
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42435261 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccattcatatgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 42435360  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42435361 aagtcaccaacctttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 42435460  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  42435461 taaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccgaacaaatgggtca 42435527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 136 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44353690 - 44353424
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44353690 ttcactaagaatcttttcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaccgatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaa 44353591  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44353590 aaggcaccaaccctcttcacaagagccccctcttttagttctccaagattc---tcttgaagttttaaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 44353494  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatgg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44353493 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgagtcatgg 44353424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40221643 - 40221376
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40221643 ttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacctaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 40221544  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  40221543 aaggcactaacccctttcccaagagccccctattttggttctcgaagattcacatcttgaagttctaaacctcatccaaagaccttccacctttagtatc 40221444  T
Q  336 taaaaccctaaaagtt-ccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40221443 aaaaaccctaaaagttcccctcctatggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggtca 40221376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 178 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22976389 - 22976151
Alignment:
Q  178 agttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttct 277  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  22976389 agttgctcacaatagactcttcactcatgtgttttc-aaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagcctcctcttttggttct 22976291  T
Q  278 ccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattca 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  22976290 ccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactctaaaagttcactcctttggtttcgaagagattca 22976191  T
Q  378 ccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22976190 ctaagcttacccaacaaatgggttatggagtgcttacata 22976151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4283422 - 4283178
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4283422 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaaccaagtttctcacaaaagactttccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaa 4283323  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |                      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4283322 a----------------------agccccctcttttggttctccaagatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 4283245  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4283244 taaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacacaacaaatgggtca 4283178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 136 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40328677 - 40328476
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  40328677 ttcactaaagatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccatccccatgaatcttccctaa 40328578  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  40328577 aaggcaccaacccttttcccaagaaccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctaaatctttagtatc 40328478  T
Q  336 ta 337  Q
    ||    
T  40328477 ta 40328476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 382
Target Start/End: Original strand, 2999829 - 3000037
Alignment:
Q  175 ccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatctt-ccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttgg 273  Q
    |||||||| ||||||  |||| || |||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | | |||||  ||||||||||||    
T  2999829 ccaagttgctcacaattgactctctactcatgtgtttctcatccccatgaatctttccccaaaagacaccaaccatatcc-caagaaccccctcttttgg 2999927  T
Q  274 ttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2999928 ttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaattccctaaaagttctctcctttggtttctatgag 3000027  T
Q  373 attcaccaag 382  Q
    ||||||||||    
T  3000028 attcaccaag 3000037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40585619 - 40585356
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||| | ||| |||| ||| ||||||| |||| |||  | || ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  40585619 ctaaggatcttctcttttggtctaccaatactcacccaaattgctcacaaa-gactctcctttgatgtgttttcaaaccccatgaatctctcaccaaaag 40585521  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
     || ||||||| | || ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||    
T  40585520 acatcaaccctctccaaaagagcccactcttttgattctcaaatattcacatcttgaagctttgaacctcaaccaaagactcttaacctttagtatctaa 40585421  T
Q  339 a-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    | || |||||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||    
T  40585420 atactctaaaagttatttcctttggttttcatgagattaatcaagctcacgcaacaaatgggtca 40585356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 395
Target Start/End: Original strand, 20686456 - 20686586
Alignment:
Q  265 ctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggt 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  20686456 ctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacttcacc-aaagatcctcaacatttagtatctaagtaccctgaaagttccctcctttggt 20686554  T
Q  364 ttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaa 395  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20686555 ttcaatgagattcaccgagcttacccaacaaa 20686586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 369
Target Start/End: Original strand, 3846153 - 3846321
Alignment:
Q  201 ctcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 299  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||    
T  3846153 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaagacaccaactcttttc-caagag-ctcttcttttggttcttcaagattcacattatgaacct 3846250  T
Q  300 ttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aaccctaaaagttccctcctttggtttccat 369  Q
    ||||| ||||| |||  ||| |||| ||||||| || ||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  3846251 ttgaatctcactcaagaaccctcaacctttagtttcaaagtaccctgaaagttttctcctttggtttccat 3846321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Original strand, 9633816 - 9634007
Alignment:
Q  145 gatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcacca 244  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||  || || ||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  9633816 gatcttctcgtttggtttcctaagattcacccaagttgctcacaaatgactctcatcttatgtgtttaccaaccccattaatctctcccaaaaggtacca 9633915  T
Q  245 acccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    ||| ||||||  ||||  || ||||||| || | |||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||    
T  9633916 acctttttca--agagcgccatcttttgattattcaagattcacatttggacactttgaatctcacccaaagacgttcgacctttagtttctaa 9634007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40535652 - 40535538
Alignment:
Q  232 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttag 331  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  40535652 ccaaaaggcatcaacccttt-ctcaagaaccccctcttttggttctaaaagatccacaacttgaaactttgaacc--acccaaagaccatcaatctttag 40535556  T
Q  332 tatctaaa-accctaaaa 348  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40535555 tatctaaataccctaaaa 40535538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Original strand, 3817675 - 3817840
Alignment:
Q  209 ttttccaaccccatgaatcttcc-ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcc--cctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 305  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||     
T  3817675 ttttccaaccccatgaatctttctccaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctaattcttttggttcttcaagaatcccatcttcaacctttgaa- 3817772  T
Q  306 ctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgag 372  Q
     | || || | ||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3817773 tttactcagaaaccctcaacctttagtttctaagtaccctaaaagttttctcctttggtttccatgag 3817840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11136994 - 11136796
Alignment:
Q  181 tgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctcc 279  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| | |||  |||| |||||| || ||||||| |||||||    
T  11136994 tgtttacaaatgactctccactcatgtgttttcctacccaatgaacctctccccaaaaggcatcgaccaatttc-caagagccctctcttttagttctcc 11136896  T
Q  280 aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcac 378  Q
    || ||||| || | ||   |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| | |||   |||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||    
T  11136895 aaaattcatatttggacaatttgaatctcacccaaagacccccaacctttagtttttaagttccctaaaaatctcatcctttagtttccatgagattcac 11136796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10020224 - 10020150
Alignment:
Q  250 tttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaa 324  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  10020224 tttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatattgatcatttgaatctcacctaaagaccctcaa 10020150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Original strand, 10101525 - 10101613
Alignment:
Q  231 cccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacct 320  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  10101525 cccaaaatgcagcaaccctttcc-caagagcctcctcttttggttctccaaggttcacattttgacccattgaatctcactcaaagacct 10101613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10239782 - 10239720
Alignment:
Q  340 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||    
T  10239782 accctaaaagttccctctattgatttccatgagattcgtcaagcttactcaacaaaagggtca 10239720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18655299 - 18655246
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  18655299 ttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcaccgaagttgctcacaa 18655246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40873497 - 40873414
Alignment:
Q  210 tttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatctt 293  Q
    |||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  40873497 tttccacccccatgaatccctacccaaaaggcactaacctttttc-caagaatctcctctcttggttccctaagattcacatctt 40873414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 136 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40147159 - 40146877
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40147159 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 40147060  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40147059 aaggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 40146960  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacatat 418  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40146959 taaaaccctaaaagtttcatcctttggtttccatgagattcaccaagcttaaccaacaaatgggtcatggagtgcttacatat 40146877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 136 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 213367 - 213097
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  213367 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaa 213268  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctcc-aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  213267 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctcccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtat 213168  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatgg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  213167 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttacccaaaaaatgggtcatgg 213097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38746903 - 38746637
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38746903 ttcaataaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcacgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 38746804  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38746803 aaggcaccaacccttttcttaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 38746704  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38746703 taaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgagtca 38746637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27015430 - 27015183
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27015430 ttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgattcttccccaa 27015331  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27015330 aaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 27015231  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  27015230 taaaaccctaaaagttccctcctttgatttccattagattcgccaagc 27015183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 139 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5057942 - 5057666
Alignment:
Q  139 actaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaag 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5057942 actaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaag 5057843  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5057842 gcaccaacctttttcccaaaag-cccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 5057744  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5057743 aaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcacccagc-tctttaacaaatgggtcatggagtgcttacata 5057666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 136 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28278214 - 28277964
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28278214 ttcactaacaatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaatagtctctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 28278115  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccc-tcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  28278114 aaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtat 28278015  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 385  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28278014 ctaaaaccctaaaagtttcctcctttagtttccttgagattcaccaagctt 28277964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Original strand, 27637884 - 27638161
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctct--tttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttcccc 233  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||     
T  27637884 ttcactaaggatcttctctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcataaaagactcttcactcatgtgtttcctaaccccatgaatcttccc- 27637982  T
Q  234 aaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagta 333  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||    
T  27637983 aaaatgcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaa-ctttgaacctcacccaaagattctcaacctttagta 27638081  T
Q  334 tctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||| | |||||||    
T  27638082 tctaaaaccttaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcctttttaacaaatgggtcatagagtgctta 27638161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 413
Target Start/End: Original strand, 16642209 - 16642424
Alignment:
Q  197 tccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttga 295  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16642209 tccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctgtccccaaaaggcaccaaccctttcc-caagag--ccctcttttggttcttcaagattcacttcttga 16642305  T
Q  296 agctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16642306 agctttgaacctcacccaaagaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagtgctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaa 16642405  T
Q  395 atgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  16642406 atgggtcatggagtgctta 16642424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 316655 - 316419
Alignment:
Q  143 aggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggca 241  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||   | || ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  316655 aggattttctcttttggtctcccaagattca-ccaagttgctcacaaa-gactctcttttgatgtgtttcccaaccttatgaatctctccccaaaaggca 316558  T
Q  242 ccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aa 340  Q
    |||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  316557 ccaaccctctcc-caagagcccccccttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaagta 316459  T
Q  341 ccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcacca 380  Q
    |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  316458 caataaaagttctctcctttagtttccatgagattcacca 316419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35615992 - 35615809
Alignment:
Q  214 caaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcaccc 312  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35615992 caactccatgaatctctccccaaaaggcatcacccctttcc-caagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactc 35615894  T
Q  313 aaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaat 396  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||   || ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  35615893 aaagaccctcaacctttagtatctaaatactctaaaagttttttcatttggtttcaaggagattcaccaagcttacgcaacaaat 35615809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30802778 - 30802579
Alignment:
Q  197 tccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttga 295  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||| |||    
T  30802778 tccactcatgtgttttctaaccccatgaatctctccccaaaaggcacaaaccctttcc-caagagcctcctcttttggttctctaagata-acatcatga 30802681  T
Q  296 agctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaa 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  30802680 agctttgaacctcacctaaagaccctcaacctagaatatctaaataccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagcgtactcaacaa 30802581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 397
Target Start/End: Original strand, 10055040 - 10055238
Alignment:
Q  200 actcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagc 298  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10055040 actcatgtgtttcccaaccccgtgaatctctccccataaggcaccaaacctttcc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagc 10055138  T
Q  299 tttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatg 397  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  10055139 tttgaatctcacccaaaaaccttcaatctttagtatccaagtactctaaatgttccatcatttgatttctatgagattcaccaaacttactcaacaaatg 10055238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4160527 - 4160284
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||| |  || || ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4160527 ctaaggatcttctcttttggtttcccaagattcaccctagttgctcacaaatgactctccacttacgtg-ttcccaaccctatgaatctctccccaaaag 4160429  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
     |||  |||| | || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  4160428 acacttaccc-tctcccaagagccccctcttttagttctccaggattcacttctttaaactttgaacatcacccaaa-accctcaaactttagtatctaa 4160331  T
Q  339 a-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagct 384  Q
    | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4160330 ataccctaaatgttctctcatttggtttccatgagattcaccgagct 4160284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30793073 - 30792872
Alignment:
Q  200 actcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagc 298  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| || | | | |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30793073 actcatgtgtttcccaaccccatgaatatctccccaaaaggcaccaacc-ttttcccaa-agccacatattttggttctccaagata-acatcttgaagc 30792977  T
Q  299 tttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatg 397  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  30792976 tttgaacatcacctaaagaccctcaacctttagtatctaattaccctaaaagtttactcatttggtttccatgagattcaccaagcttacttaacaaatg 30792877  T
Q  398 ggtca 402  Q
    |||||    
T  30792876 ggtca 30792872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 232 - 400
Target Start/End: Original strand, 14689774 - 14689942
Alignment:
Q  232 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttag 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | || ||| |     
T  14689774 ccaaaaggcaccaacccttt-cacaagaaccccttcttttggttctccaaaattcacatcttgaaactttgaacatcactcaaagacccttaaccttcac 14689872  T
Q  332 tatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggt 400  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  14689873 tatctaaatgccctaaaagttttctcctttagtttccatgagattcaccaagcctactcaacaaatgggt 14689942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 329
Target Start/End: Original strand, 33906303 - 33906491
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||| || | || |||  | || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33906303 ctaaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcactaa-gtctctcctttgatgtgtttctcaaccccatgaatctctccccaaaag 33906401  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatcttt 329  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  33906402 gcaccaaccctctcc-caagagcccccttttttggttctacaagattcacattttgaggcttcgaacctcactcaaagaccctcaaccttt 33906491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 413
Target Start/End: Original strand, 33906586 - 33906678
Alignment:
Q  321 tcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||    
T  33906586 tcaacctttaatatctaaataccctaaaagttctcttctttggtttc-atgagattcaccaagcttgttcaacaaatgggttaaggagtgctta 33906678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Original strand, 21205927 - 21206076
Alignment:
Q  141 taaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 239  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  || ||||| |||| ||  | ||||| ||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||  |||||     
T  21205927 taaggttcttcacttttagtttcctaaaattcacccaaatttctgacaaatgactcctcactcatgtgtttcccaaccctatgaacctctccgaaaaaga 21206026  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacat 290  Q
    |||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21206027 caccaaccctttcca-aagaaccccatcttttggttctctaagattcacat 21206076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 16641215 - 16641272
Alignment:
Q  141 taaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttc 198  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  16641215 taagtatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgttcacaattgactttc 16641272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Original strand, 1632002 - 1632279
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1632002 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 1632101  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  1632102 aagacaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttccccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatc 1632201  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  1632202 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacacaacaaataggtcatggagtgctta 1632279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45726827 - 45726547
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45726827 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacatgactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatgaatcttccccaa 45726728  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  45726727 aaggcaccaaccctttcc-caagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtatc 45726629  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45726628 taaaaccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttacata 45726547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 417
Target Start/End: Original strand, 35447154 - 35447435
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35447154 ttcactaagtatcttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaa 35447253  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctc-caagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||    
T  35447254 aaggcaccaacccttttcacaagag-cccctcttttggttctctcaagactcacatcttgaagctttgaacctcacacaaatactctcaacctttagtat 35447352  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35447353 ctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttacata 35447435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 385
Target Start/End: Original strand, 42288380 - 42288628
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  42288380 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccc-aa 42288478  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42288479 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 42288578  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 385  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42288579 taaaaccctaaaagttctctcatttggtttccatgagattcacctagctt 42288628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 140 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17450485 - 17450212
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactt-tccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaag 238  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||  ||||  | | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||| |    
T  17450485 ctaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagtttctcacaattgactccttcgctcatgtgtttcccatccccatgaatctttcacaaagg 17450386  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  17450385 gcaccaaccctttcc-caagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaa 17450287  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17450286 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattctctaagtttgcccaacaaatgggtcatgaagtgctta 17450212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 176 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7451158 - 7450921
Alignment:
Q  176 caagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggtt 275  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  7451158 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccataaatcttctccaaaagtcatcaaccctttaccaaagagccccctcttttggtt 7451059  T
Q  276 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagatt 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7451058 ctccaagattcacatcctgaagctttgaacctcacccaaaga-cgccaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctccttttgtttccatgagatt 7450960  T
Q  376 caccaagcttgcccaac-aaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7450959 caccaagcttacccaacaaaatgggtcatggagtgctta 7450921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33648064 - 33647817
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||| ||  | |||| | | ||||| |||| || |||||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  33648064 ctaaggatcttctcttttggttttataagactcgcctaagtagctaacaaatgactctctactcatatgttttccaacctcgtgaatctctcctcaaaag 33647965  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33647964 gcaccaacccttttcccaagagcctcctcttttgattctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaa 33647865  T
Q  339 a-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 385  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33647864 atactctaaaagttctctcctttggtttccatgaaattcaccaagctt 33647817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 140 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24397952 - 24397701
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  24397952 ctaaggatattctcttttggtttcacaagactaacccaaattggtcacaaatgactctccactcatgtgtttaccagcccgatgagtctctccctaaaag 24397853  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  24397852 gcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacacaaagaccgtcaacctttagtatctaa 24397753  T
Q  339 a-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatg 397  Q
    | ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24397752 ataccctaaaag--------tttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaatg 24397701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 207 - 402
Target Start/End: Original strand, 42261950 - 42262146
Alignment:
Q  207 tgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 305  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42261950 tgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctcca-aagagcccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 42262048  T
Q  306 ctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42262049 ctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctcatgagattcaccaagcttgctcaacaaatgggtca 42262146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 402
Target Start/End: Original strand, 30218374 - 30218570
Alignment:
Q  207 tgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 305  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | | ||  || || |  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  30218374 tgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcactaactctctcc-cataagccctcatttttggttgtccaagattcacattttgatgttttgaac 30218472  T
Q  306 ctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  30218473 ctcacccaaagaccctcaacatatagtatctaaataccctaaaagttccctcctttgagttccataatattcaccaagattacccaacgaataggtca 30218570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 376
Target Start/End: Original strand, 40935542 - 40935690
Alignment:
Q  228 ttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatct 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||| | | |||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||| ||||||| || |||| ||    
T  40935542 ttccccaataggcaccaaccctttcc-caagagcctcatcttttggttctcctagattcacatttggacactttgaatctctcccaaaggccctcaacct 40935640  T
Q  328 ttagtatctaa-aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattc 376  Q
    ||||| |||||   ||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  40935641 ttagtttctaagttccctaaacggtctctcctttggtttccatgagattc 40935690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24197703 - 24197643
Alignment:
Q  229 tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacat 290  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24197703 tccccaaaaggcaccaaccctctcc-caagagtcccctcttttggttccccaagattcacat 24197643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 140 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34603470 - 34603197
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603470 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 34603371  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34603370 caccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaa 34603271  T
Q  340 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||    
T  34603270 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaatgggtcatagagtgctta 34603197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 29136145 - 29135880
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29136145 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaaaactctccactcatgt-ttttccaaccccatgaatcttccccaa 29136047  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  29136046 aaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatc 29135947  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29135946 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggtca 29135880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 140 - 413
Target Start/End: Original strand, 34602613 - 34602886
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34602613 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 34602712  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34602713 caccaacccttttaccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaa 34602812  T
Q  340 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||    
T  34602813 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaatgggtcatagagtgctta 34602886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 13547359 - 13547625
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13547359 ttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaattttcctcaa 13547458  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13547459 aaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 13547558  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13547559 taaaactctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccaaacaaatgggtca 13547625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 13549270 - 13549536
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13549270 ttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaattttcctcaa 13549369  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13549370 aaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 13549469  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13549470 taaaactctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccaaacaaatgggtca 13549536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 136 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11348596 - 11348327
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11348596 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaa 11348497  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  11348496 aaggcaccagaccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacccttagtatc 11348397  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatgg 405  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11348396 taaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattcactaagcttacccaacaaatgggtcatgg 11348327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 141 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19754384 - 19754112
Alignment:
Q  141 taaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggc 240  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754384 taaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggc 19754285  T
Q  241 accaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaa 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||    
T  19754284 accaacccttttcacaagagccccctctcttggttttccaagattcaaatcatggtgctttgaacctcacccaaagacccttaacctttagtatctagaa 19754185  T
Q  341 ccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19754184 ccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 19754112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 136 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37168195 - 37167948
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37168195 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 37168096  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  37168095 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatc 37167996  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagc 383  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37167995 taaaactgtaaaagttccctcctttgatttccatgagattccccaagc 37167948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 140 - 413
Target Start/End: Original strand, 7482504 - 7482778
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7482504 ctaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagg 7482603  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccc-tcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  7482604 caccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccgttagtatctaa 7482703  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||  ||||||||||| |||||||||    
T  7482704 aaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaaacttattcactaaatgggtcatagtgtgctta 7482778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 37879181 - 37879447
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37879181 ttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaattttccccaa 37879280  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  37879281 aaggcaccaacctttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagatcctcaacatttagtatc 37879380  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37879381 taaaaccctaacagttccttcctttgatttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 37879447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Original strand, 47255610 - 47255881
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47255610 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactca-ctaagttgctcacaaaagactctccaatcatgtgtttcccaaccc-atgaatcttccccaa 47255707  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47255708 aaggcacca----ttttcccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 47255803  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  47255804 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatgaagtgctta 47255881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 193509 - 193244
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  193509 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactcttcacacatgtgtttcccaaccccatgaatcttccc-aa 193411  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  193410 aaggcaccaaccttttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcaccgaaagaccctcaacctttaatatc 193311  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  193310 taaaaccctaaaagttatctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 193244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 398
Target Start/End: Original strand, 42298245 - 42298507
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42298245 ttcacttaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaa 42298344  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42298345 aaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 42298444  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgg 398  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42298445 taaaaccctaaaagtttcatcctttggttgttatgggattcaccaagcttacccaacaaatgg 42298507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19752583 - 19752307
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  19752583 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatctaagttgctcacaaaatactctccactcatgtgtttcccaactcaatgaatcttccccaa 19752484  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19752483 aaggcaccaacc-ttttcataagagccccatcttttggttctccaagattcacattatgacgcttagaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatc 19752385  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19752384 taaaaccctaaaaattccctcatttggttttcatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 19752307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 37033343 - 37033605
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  37033343 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaacctcatgaatcttcctcaa 37033442  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||        
T  37033443 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag---- 37033538  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  37033539 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcacccagcttactcaacaaaagggtca 37033605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 136 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 47115069 - 47114825
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  47115069 ttcattaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccattcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccc-aa 47114971  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  47114970 aaggtaccaaccctgttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacagcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttaatatc 47114871  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaa 381  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47114870 taaagccttaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaa 47114825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28242286 - 28242041
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| ||    
T  28242286 ttcactaaggatattctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccttatgaatcttccc-aa 28242188  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28242187 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 28242088  T
Q  336 ta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaa 381  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28242087 tacataccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaa 28242041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 41135709 - 41135452
Alignment:
Q  145 gatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcacc 243  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||  ||||||| |||| |||  | || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41135709 gatcttctcttttggtttcctaagactcacccaagtttctcacaaa-gactctcctttgatgtgtttcccaaccccatgaatctctccctaaaaggcacc 41135611  T
Q  244 aacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-acc 342  Q
    |||||| | | ||| |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  41135610 aaccctctcc-caaaatcttcctcttttggttctccaagatccacatcttgaaggtttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaataca 41135512  T
Q  343 ctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  41135511 ttaaaatttccctcctttggtttccatgagattaaccaagcttattcaacaaatgggtca 41135452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6808336 - 6808083
Alignment:
Q  145 gatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcacc 243  Q
    ||||||||||||| ||||  ||  | ||| || ||||| ||||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||     
T  6808336 gatcttctcttttggttttccattactcaccctagttgctcacaaatgactcttcattcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaagacaca 6808237  T
Q  244 aacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaga-ccttcaatctttagtatct-aaaac 341  Q
    ||  || | ||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||     
T  6808236 aaatctctcca--agagcccaatcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacctaaagacccctcaacctttagtatctaaaaaa 6808139  T
Q  342 cctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatg 397  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6808138 tctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatg 6808083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 382
Target Start/End: Original strand, 9109680 - 9109918
Alignment:
Q  145 gatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcacc 243  Q
    |||||||| ||||  |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||   | || ||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || |    
T  9109680 gatcttctattttgatttcccaagactcatccaaattgctcacaaaagactctcatttgatgtgtctcccaacctcatgaatctctccccaaaagacatc 9109779  T
Q  244 aacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta-aaacc 342  Q
    |||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || | |||    
T  9109780 aaccctctcc-catgagtccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaataccctcaacctttagtatttatatacc 9109878  T
Q  343 ctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaag 382  Q
    | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  9109879 ccaaaagtttcatcatttgatttccatgacattcaccaag 9109918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Original strand, 31925976 - 31926099
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31925976 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagtctcacccaagttgctcacaaaagattctccactcacgtgtttcccaaacccatgaatcttccccaa 31926075  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaaga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31926076 aaggcaccaacccttttcacaaga 31926099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 413
Target Start/End: Original strand, 31928208 - 31928348
Alignment:
Q  266 tcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggttt 365  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  31928208 tcttttggttttctaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagactctcaacctttagtatctaa--------aagttccctcctttggttt 31928299  T
Q  366 ccatgagattcaccaagcttgcccaa-caaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31928300 ccatgaaattcaccaagcttacccaatcaaatgggtcatggagtgctta 31928348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22079107 - 22078995
Alignment:
Q  262 cccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 361  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       ||| |||||||||||||| || |||     
T  22079107 cccctcttttggttctttaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactt-------taataccctaaaagttccatcattta 22079015  T
Q  362 gtttccatgagattcaccaa 381  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  22079014 gtttccataagattcaccaa 22078995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 339
Target Start/End: Original strand, 16216769 - 16216966
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||| |||||  ||||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||| | |  ||||||     
T  16216769 ctaaggatcttctcttttaagttttcaaaattcactcaagttgctcacaat-gactctcctctcatgtgtttgccaacac-atgaatttctatccaaaat 16216866  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||| | || ||||||| |||||    
T  16216867 gcaccaacccttttcg-aagagccccctcttttggttcttcaagatatacatcttgaacctttgaatatcacccaaagacccttaacctttagtttctaa 16216965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Original strand, 4535783 - 4535861
Alignment:
Q  175 ccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaaccctttt 252  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4535783 ccaagttgctcacaaacgactatccactcatgtgtttttcaaccccatgaatctattcccaaaagacaccaaccctttt 4535861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3331328 - 3331283
Alignment:
Q  250 tttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttga 295  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3331328 tttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttga 3331283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 324
Target Start/End: Original strand, 38747052 - 38747173
Alignment:
Q  202 tcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 300  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||| || |||||||| |||||||  |||    
T  38747052 tcatgtgttttccaaccctatgaacctctctccaaaaggcaccaaccctttt-tcaagag-cccccgttttggttgtctaagattcatatcttgaccctt 38747149  T
Q  301 tgaacctcacccaaagaccttcaa 324  Q
    |||  ||||| ||||  |||||||    
T  38747150 tgagtctcactcaaatgccttcaa 38747173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 49199740 - 49200007
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatcc-aagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttcccca 234  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49199740 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaacccaagttgctcacaaaagactctccactcatatgtttcccaaccccatgaatcttcccca 49199839  T
Q  235 aaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49199840 aaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtat 49199939  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49199940 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 49200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 43404003 - 43404269
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43404003 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcccaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaa 43404102  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  43404103 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacttttagtatc 43404202  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43404203 taaaaccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagctcacccaacaaatgggtca 43404269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30236023 - 30235745
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30236023 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaacttgctcacaaatgactctccactcttgtgttttccaaccccatgaatattccccaa 30235924  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30235923 aaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 30235824  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaac-aaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30235823 taaaaccctaaaagttctctcctttggtttcattgagattcaccaagcttacccaacaaaatgggtcatggagtgctta 30235745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 43402060 - 43402326
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43402060 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagacttacccaagttgttcacaaatgattctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 43402159  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43402160 aaggcaccaacccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 43402259  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  43402260 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccataagattcaccaagctcacccaacaaatgagtca 43402326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 395
Target Start/End: Original strand, 6095869 - 6096128
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6095869 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 6095968  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6095969 aaggcaccaacccttttcaaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 6096068  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaa 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6096069 taaaaccctaaaagttctctcctctgatttccatgagattcaccaagctttcccaacaaa 6096128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34491111 - 34490833
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  34491111 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaatcttctccaa 34491012  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34491011 aaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 34490912  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaa-caaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||| |||||||    
T  34490911 taaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctttcacaataaaatgggtgatggagtgctta 34490833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 54593603 - 54593321
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54593603 ttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaatcttccccaa 54593504  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  54593503 aaggtaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatc 54593404  T
Q  336 ta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  54593403 tacataccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttcgaacaaatgggtcatggagtgcttacata 54593321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 417
Target Start/End: Original strand, 55302235 - 55302516
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||    
T  55302235 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaacctcatgaatttttcccaa 55302334  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  55302335 aaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacttttagtatc 55302434  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55302435 taaaaccctaaaagtttcctcctttggtttcaatgaaattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttacata 55302516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4569849 - 4569583
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4569849 ttcactaaagatcatctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 4569750  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
     ||||||   |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4569749 taggcacacccccttttcccaagagccccctcttttgattctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 4569650  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4569649 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggtca 4569583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 47304149 - 47303872
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| | |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47304149 ttcactaaggatattctcttttggttttacaagactcacctaagttgctcacaaaa-actctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 47304051  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47304050 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaacatttagtatc 47303951  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaac-aaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  47303950 taaaaccataaaagttctctcctttgatttccatgagattcaccaagcttacccaacaaaatgggtcgtggagtgctta 47303872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40913237 - 40912969
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40913237 ttcactaaggatcttctcttttgctttcacaagactcacccaatttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaa 40913138  T
Q  236 aa-ggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  40913137 aaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctaaacctttagtat 40913038  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagc-ttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40913037 ctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttacccaacaaatgggtca 40912969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36018749 - 36018482
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  36018749 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccattcatgtgtttcccatccccatggatcttccccaa 36018650  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  36018649 aaggcaccaacccttttcccaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatc 36018550  T
Q  336 ta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36018549 tacataccctgaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttatccaacaaatgggtca 36018482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 140 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46860365 - 46860120
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46860365 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccatccctatgaatcttccccaaaagg 46860266  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta-a 338  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  46860265 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaca 46860166  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagct 384  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46860165 taccctaaaagttctctcatttggtttccatgagattcaccaagct 46860120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 145 - 385
Target Start/End: Original strand, 41819801 - 41820040
Alignment:
Q  145 gatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcacca 244  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41819801 gatcttctcttttggtttcataagactcactcaagttgctcacaaatgagtctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccc-aaaaggcacca 41819899  T
Q  245 acccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccct 344  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  41819900 acccttttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaacct 41819999  T
Q  345 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 385  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41820000 aaaagttatctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 41820040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 162 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28074488 - 28074238
Alignment:
Q  162 tcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagt 261  Q
    |||||||| ||| | |||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||     
T  28074488 tcacaagactcacctaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccccatgaatcttccccaaaacgcaccaactatttcc-caagagc 28074390  T
Q  262 cccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28074389 cccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttg 28074290  T
Q  362 gtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  28074289 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatgaagtgctta 28074238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 141 - 397
Target Start/End: Original strand, 5434152 - 5434410
Alignment:
Q  141 taaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||      
T  5434152 taaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaacttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctctccctaaaaaa 5434251  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||| |||||||||    
T  5434252 cactaacccttttcccaagagccccctcttttggttctataagatttacatcttgaagctttaaacctccctcaaagacccttaacttttggtatctaaa 5434351  T
Q  340 -accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatg 397  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5434352 tatcctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatg 5434410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34795763 - 34795490
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||  | |||||| ||| |||  | || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34795763 ctaaggatcttctcttttggtctcccaagactcacccaagtttcttacaaaa-actctcctttgatgtgtatcccaaccccatgaatctctcctcaaaag 34795665  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    |||  || ||| | | | |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  34795664 gcatgaaacctctcc-ctagaaccccctcttctggttctccaagattcagatcttgaagctttgaacatcacccaacgaccatcaacctttagtatctaa 34795566  T
Q  339 a-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    | |||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  34795565 ataccctaaaagatctctcctttggttttcataggattcaccaaacttacccaacaaataagtcatagagtgctta 34795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39127386 - 39127191
Alignment:
Q  207 tgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 305  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39127386 tgtttcccaacctcatgaatctctcccaaaaaggcaccaactctcttc-caagagtcccctattttagttctctaagattcatatcttgaagctttgaac 39127288  T
Q  306 ctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||| |||||| ||   || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  39127287 ctca-ccaaaggccccaaacctttagtatgtaaataccctaaaagttctctccgttgatttccatgagattcactaagcttactcaacaaatgagtca 39127191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 395
Target Start/End: Original strand, 26323860 - 26324042
Alignment:
Q  214 caaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcaccc 312  Q
    ||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26323860 caaccccatgaatctctgctgaaaatgcaccaaccctttcc-caatagccctctcttttgattcttcaagatttacatcttgaagctttgaacttcaccc 26323958  T
Q  313 aaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaa 395  Q
    || |||| |||| |||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  26323959 aatgaccctcaacctttagtatctaaatatcttaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaaacttactcaacaaa 26324042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1683382 - 1683146
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||| ||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  1683382 ctaaggatcttctcttttggtctcacaagactcaccaaagttgctcataaatgattatccactcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaat 1683283  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagc-tttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta 337  Q
    |||||||||| ||||  || |  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  1683282 gcaccaaccc-tttccgaaaaaccttctcttttggttctccaagattcacat-ttgaaacatttgaatctcacccaaagaccctcaacctttagtttcta 1683185  T
Q  338 aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattc 376  Q
    |   ||  ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  1683184 agttccataaatttctctcatttgatttccatgagattc 1683146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 324 - 402
Target Start/End: Original strand, 31340499 - 31340577
Alignment:
Q  324 atctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31340499 atctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccataagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 31340577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Original strand, 35138980 - 35139250
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaag 238  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| ||   | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  35138980 ctaaggatcttctattttggtctcccaagactcattcaagttgctcataaa-gactctcatttgatttgttttccaacctcatgaatctctcctcaaaag 35139078  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccct-cttttggttctccaagattcacatcttg-------aagctttgaacctcacccaaagaccttcaatcttta 330  Q
    ||| ||||||||| |  ||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||| | ||||||| ||||  ||||    
T  35139079 gcatcaaccctttccg-aagaacccatttcttttggttctccaagattcacatcttacatcttaaagttttgaacctcatctaaagaccctcaacgttta 35139177  T
Q  331 gtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  35139178 gtatctaaatacccaaaaagtaccctcctttggtttccatgaaattcaccaagcttacttaacaaatgggtca 35139250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36796279 - 36796064
Alignment:
Q  166 aagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtccc 264  Q
    |||||||| |||||||| | || || |||| ||||||| | ||| | || ||||| ||||||| |||||||||   ||| ||| |||||| |||||||||    
T  36796279 aagattcacccaagttgctaaccaatgactctccactcttgtgtctcccgaccccgtgaatctctccccaaaatcaaccgacctttttca-aagagtccc 36796181  T
Q  265 ctcttttggttctccaaga----ttcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa-aaccctaaaagttccctcctt 359  Q
    ||||||||||||| ||| |    || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||  ||||||    
T  36796180 ctcttttggttcttcaaaagaggtttacatcttgaagctttgaacctcatctaaagaccttcaacctttagtttctaagttccctaaaagttatctcctt 36796081  T
Q  360 tggtttccatgagattc 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  36796080 tgatttccatgagattc 36796064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 31340448 - 31340503
Alignment:
Q  238 ggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatctt 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340448 ggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatctt 31340503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 288
Target Start/End: Original strand, 1737257 - 1737311
Alignment:
Q  233 caaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcac 288  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1737257 caaaagacacgaacccttttc-caagagtccgctcttttggttccccaagattcac 1737311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22859368 - 22859306
Alignment:
Q  232 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctct--tttggttctccaagattcacatctt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  22859368 ccaaaaggcaccaaccattttt-caagagtcccctctcttttacttctccaagattcacatctt 22859306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 136 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6431869 - 6431600
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431869 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaa 6431770  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6431769 aaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 6431670  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatgg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6431669 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttctatgagattcaccaagcttacccaataaatgggtcatgg 6431600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 2361241 - 2361507
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2361241 ttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcatccccaa 2361340  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2361341 aaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgattcttcaagattcacatcttgaaggattgaatctcacccaaagaccctcaatctttagtatc 2361440  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2361441 taaaatcctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcactaagcttgcccaacaaatgggtca 2361507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Original strand, 4512660 - 4512936
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4512660 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatgaatcttccccaa 4512759  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  4512760 aaggcaccaaccctttcc-caagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagaatc 4512858  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||    
T  4512859 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccattaaatgggtcatggagtgctta 4512936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2390180 - 2389934
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390180 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactatccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaa 2390081  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2390080 aagccaccaacccttttcgcaatagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 2389981  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaag 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2389980 taaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaag 2389934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 405
Target Start/End: Original strand, 34310986 - 34311256
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34310986 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaaccttccccaa 34311085  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  34311086 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatc 34311185  T
Q  336 ta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatgg 405  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  34311186 tacataccctaaaagttccttcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaaaaaattggtcatgg 34311256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 136 - 400
Target Start/End: Original strand, 48599604 - 48599858
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  48599604 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgttttttccaaccccatgaatcttccccaa 48599703  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48599704 aaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgg----------ttcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 48599793  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48599794 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 48599858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 29608634 - 29608373
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||     |||    
T  29608634 ttcactaagaatcttctattttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatc-----caa 29608540  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29608539 aaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 29608440  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  29608439 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttatcaacatatgggtca 29608373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 6360182 - 6360448
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  6360182 ttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaatcttcttcaa 6360281  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  6360282 aaggcaccattccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttaatatc 6360381  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6360382 taaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 6360448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22269871 - 22269595
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22269871 ttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcacccaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccctccccatgaatcttccccaa 22269772  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22269771 aaggcaccaactctttcc-caagag-cccctcttttggttctccaagattcacatcttgtagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatc 22269674  T
Q  336 ta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22269673 tacataccctaaatgttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatgaagtgctta 22269595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 219 - 417
Target Start/End: Original strand, 32358189 - 32358387
Alignment:
Q  219 ccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358189 ccatgaattttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 32358288  T
Q  319 cttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32358289 cctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttttcaacaaatgggtcatggagtgcttacata 32358387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 140 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3258890 - 3258616
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3258890 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctaataaaagactctccactcatatgtttcccatccccatgaatcttccccaaaagg 3258791  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta-a 338  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  3258790 caccaacccttttcccaagagccccatctttttgttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaca 3258691  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||| | |||||||    
T  3258690 taccctaaaagttccctcctctggtttccatgagattcaccaagttttttcaccaaatgggtcatagagtgctta 3258616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Original strand, 4510818 - 4511086
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4510818 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 4510917  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  4510918 aaggcaccaaccctttcc-caagagctccctcttttggttctc--------acatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatc 4511008  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  4511009 taaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattaaccaagcttacccaacaaatgggtcatagagtgctta 4511086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 136 - 413
Target Start/End: Original strand, 4508976 - 4509244
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4508976 ttcactaaggatcttatcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 4509075  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  4509076 aaggcaccaaccctttcc-caagagctccctcttttggttctc--------acatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatc 4509166  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  4509167 taaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattaaccaagcttacccaacaaatgggtcatagagtgctta 4509244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 141 - 385
Target Start/End: Original strand, 22328673 - 22328919
Alignment:
Q  141 taaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22328673 taaggatattctcttttagtttcccaagattcacccaagttgctcacaaatgactctctactcatgtttttcccaaccctatgaatctctccccaaaagg 22328772  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22328773 caccaactcttttcctaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacctttagtatctaaa 22328872  T
Q  340 -accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 385  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22328873 taccctaaaagttttctcctttggtttccatgagattcactaagctt 22328919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30814505 - 30814397
Alignment:
Q  294 gaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaaca 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30814505 gaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttaagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaaca 30814406  T
Q  394 aatgggtca 402  Q
    |||||||||    
T  30814405 aatgggtca 30814397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 136 - 251
Target Start/End: Original strand, 8359588 - 8359703
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8359588 ttcactaaggattttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 8359687  T
Q  236 aaggcaccaacccttt 251  Q
    ||||||||||||||||    
T  8359688 aaggcaccaacccttt 8359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5116462 - 5116272
Alignment:
Q  207 tgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 305  Q
    ||||| |||| || |||||||| || |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5116462 tgtttaccaatccaatgaatctctctccaaaaggcaccgaccctctcc-caagagccccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagttttgaac 5116364  T
Q  306 ctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaat 396  Q
     ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  5116363 atcacctaaagaccctcaacctttagtatttaaataccctaaaagtcccctcctttggtatccatgagattcactaaacttgctcatcaaat 5116272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 324
Target Start/End: Original strand, 22552782 - 22552895
Alignment:
Q  210 tttccaaccccatgaatcttc-cccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctc 308  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| || |||    
T  22552782 tttccaaagccatgaatcttttcccaaaaggcaccaaccgtttcca--agagccccctcttttggttctctaagattcacattttgaccctttaaatctc 22552879  T
Q  309 acccaaagaccttcaa 324  Q
    ||||||||||| ||||    
T  22552880 acccaaagaccctcaa 22552895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 317
Target Start/End: Original strand, 37545308 - 37545357
Alignment:
Q  268 ttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||    
T  37545308 ttttggttctccaagattcacatcttaaacctttgaatcttatccaaaga 37545357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 3808978 - 3809245
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3808978 ttcactaaggattttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaa 3809077  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccc-tcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3809078 aaggaaccaacccttttcacaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtat 3809177  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3809178 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgctcaacaaatgggtca 3809245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 136 - 403
Target Start/End: Original strand, 2973209 - 2973477
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2973209 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgttcacaaatgactctgcattcatgtgtttcccaaccccatgaatcttcccaaa 2973308  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2973309 aaagcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatc 2973408  T
Q  336 ta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcat 403  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  2973409 tacaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaaggtctcttaacaaatgggtcat 2973477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 136 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17762887 - 17762604
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatctt--cccc 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  17762887 ttcactaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcccaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctaaccccc 17762788  T
Q  234 aaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagta 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||    
T  17762787 aaaaggcaccaaaccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagccttgaacttcacccaaagatcctcaacctttagta 17762688  T
Q  334 tctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17762687 tctaaaaccctaaaagttctctccttttgtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggccatggagtgcttacata 17762604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 140 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21593560 - 21593283
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21593560 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaaaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaagg 21593461  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  21593460 caccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacatttagtatctaaa 21593361  T
Q  340 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacata 417  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21593360 accctaaaagttctaacctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggttatggagtgcttacata 21593283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 138 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5043523 - 5043278
Alignment:
Q  138 cactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5043523 cactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaaattgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccc-aaaa 5043425  T
Q  238 ggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta 337  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5043424 ggcaccaacccttttcccaagagccctctcttttggttctccaagattctcatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatcta 5043325  T
Q  338 aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagct 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5043324 aaaccctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagct 5043278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 136 - 419
Target Start/End: Original strand, 26830394 - 26830677
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26830394 ttcactaagaatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctgcgctcatctgtttcccaaccccatgaatcttctccaa 26830493  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||  ||||| ||||    
T  26830494 aaggcaccaacctttttcccaagagactcctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttaaaccttactcaaagaccctcagcctttattatc 26830593  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacatatt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  26830594 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatggatcatggagtgcttatatatt 26830677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 140 - 398
Target Start/End: Original strand, 22425099 - 22425358
Alignment:
Q  140 ctaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagg 239  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| | | | |||||| ||  ||| |||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22425099 ctaaggatattctcttttggtttcacaagactaaccgaagttgctcttaaatgactcttcacccatgtgtttcacaaccccatgaatcttccccaaaatg 22425198  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccc--tcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta 337  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22425199 caccaacccttatcccaagaggcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctctgaaccacacccaaagaccctcaacctttagtatcta 22425298  T
Q  338 aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgg 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22425299 aaaccct-aaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttatccaacaaatgg 22425358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 136 - 336
Target Start/End: Original strand, 603350 - 603550
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  603350 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaggacactccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaa 603449  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  603450 aaggcaccaaccctttcctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttactatc 603549  T
Q  336 t 336  Q
    |    
T  603550 t 603550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17757982 - 17757792
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatctt--cccc 233  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  17757982 ttcactgatgatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctaaccccc 17757883  T
Q  234 aaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaa 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17757882 aaaatgcaccaacccttttcacaagagccccctattttggttctccaacattcacatcttcaagctttgaatctcacccaaagaccatcaa 17757792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 175 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26800629 - 26800438
Alignment:
Q  175 ccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggt 274  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  26800629 ccaagttgctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccc-atgaatcttccccaaaaggcaccaacctttttcccaagagccccctcttttggt 26800531  T
Q  275 tctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttc 366  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26800530 tatccatgatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttttctcctttggtttc 26800438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25073076 - 25072817
Alignment:
Q  142 aaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcaca-aaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 239  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||  ||||| ||||||| |||  | || ||||| | ||||| |||||||| | ||||| |||    
T  25073076 aaggatcttctcttttggtttcccaagacctatccaagtt--tcacataaagactctcctttgatgtgtttccaaaccctatgaatctcttcccaagagg 25072979  T
Q  240 caccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa 339  Q
    ||| | |||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25072978 cacaatcccttttc-caagagccccc-ctttgggttctcaaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 25072881  T
Q  340 -accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
     ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  25072880 taccctaaaagttcacttctttgatttccatgagattcatcaagcttactcaacaaatgagtca 25072817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 5741057 - 5741119
Alignment:
Q  133 tgattcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagact 195  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  5741057 tgatttactaaggatcttcactttttgtttctcaagattcacccaaattgctcacaaaagact 5741119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26661621 - 26661580
Alignment:
Q  362 gtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcat 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26661621 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaattggtcat 26661580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26767592 - 26767551
Alignment:
Q  362 gtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcat 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26767592 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaattggtcat 26767551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 136 - 400
Target Start/End: Original strand, 80553 - 80817
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaa 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  80553 ttcactaaggatctactcttttagtttcccaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccgctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaa 80652  T
Q  236 aaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatc 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  80653 aaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcaaatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctctagtatc 80752  T
Q  336 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  80753 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagattttccaacaaatgggt 80817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 139 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11453 - 11190
Alignment:
Q  139 actaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttccccaaaag 238  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11453 actaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaag 11354  T
Q  239 gcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaa 338  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11353 gcaccaaccctttccccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 11254  T
Q  339 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11253 aaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagatttaccaagcttacccaacaaatgggtca 11190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 405
Target Start/End: Original strand, 18271 - 18539
Alignment:
Q  136 ttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagattcatccaagttgttcacaaaagactttccactcatttgttttccaaccccatgaatcttcccc-a 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  18271 ttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcactcaagttgctcacaaataactctccactcatgtgttttc-aacctcatgaatcttccccca 18369  T
Q  235 aaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18370 aaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccgcaacctttagtat 18469  T
Q  335 ctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatgg 405  Q
    |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18470 ctaaaa-cctataagttttctcctttggtttccatgagattcacccagcttacccaacaaatgtgtcatgg 18539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 207 - 402
Target Start/End: Original strand, 490785 - 490981
Alignment:
Q  207 tgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 305  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  490785 tgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctcca-aagagcccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaac 490883  T
Q  306 ctcacccaaagaccttcaatctttagtatcta-aaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtca 402  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  490884 ctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctcatgagattcaccaagcttgctcaacaaatgggtca 490981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 413
Target Start/End: Original strand, 1794 - 1953
Alignment:
Q  255 caagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttcc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  1794 caagagtcccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttggagctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaataccctaaaagttct 1893  T
Q  354 ctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgctta 413  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||| || |  ||||||| ||||| || |||||||    
T  1894 ctcatttggtttccataaaattcaccaagtttacttaacaaataggtcaaggagtgctta 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University